View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1529_low_23 (Length: 321)

Name: NF1529_low_23
Description: NF1529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1529_low_23
NF1529_low_23
[»] chr8 (97 HSPs)
chr8 (1-292)||(37605477-37605769)
chr8 (94-292)||(37609945-37610143)
chr8 (37-292)||(21696081-21696338)
chr8 (5-292)||(29758789-29759068)
chr8 (63-292)||(41245210-41245440)
chr8 (5-292)||(24387091-24387370)
chr8 (7-292)||(270239-270513)
chr8 (7-292)||(645407-645681)
chr8 (7-292)||(831142-831416)
chr8 (5-292)||(24930497-24930778)
chr8 (7-275)||(16203737-16203997)
chr8 (15-157)||(41244135-41244277)
chr8 (37-194)||(21192231-21192389)
chr8 (39-200)||(21199652-21199814)
chr8 (37-200)||(23835741-23835904)
chr8 (37-200)||(39448301-39448465)
chr8 (47-200)||(31195763-31195917)
chr8 (171-292)||(20480328-20480448)
chr8 (5-200)||(37655125-37655326)
chr8 (171-292)||(20568649-20568772)
chr8 (171-292)||(20574842-20574965)
chr8 (171-292)||(20655406-20655528)
chr8 (172-292)||(22908866-22908986)
chr8 (171-292)||(20648821-20648943)
chr8 (210-292)||(16195120-16195202)
chr8 (172-290)||(24107970-24108087)
chr8 (38-151)||(22498832-22498945)
chr8 (36-151)||(23116349-23116464)
chr8 (171-292)||(25121197-25121319)
chr8 (8-290)||(24547724-24547994)
chr8 (172-292)||(24718799-24718920)
chr8 (172-290)||(13664019-13664138)
chr8 (172-290)||(13723294-13723413)
chr8 (171-284)||(21679856-21679971)
chr8 (171-292)||(16416915-16417037)
chr8 (171-292)||(28543591-28543713)
chr8 (38-195)||(33612545-33612703)
chr8 (38-151)||(22312191-22312304)
chr8 (38-142)||(33170786-33170890)
chr8 (13-290)||(3432959-3433228)
chr8 (172-290)||(22007862-22007981)
chr8 (13-290)||(22089826-22090096)
chr8 (38-200)||(23153288-23153451)
chr8 (13-285)||(16874326-16874591)
chr8 (38-151)||(45560747-45560860)
chr8 (13-290)||(224545-224815)
chr8 (180-290)||(700958-701069)
chr8 (13-290)||(738168-738438)
chr8 (13-290)||(862063-862333)
chr8 (13-290)||(15320442-15320712)
chr8 (13-290)||(15500811-15501081)
chr8 (13-290)||(5236700-5236968)
chr8 (5-81)||(22008139-22008215)
chr8 (171-285)||(38532303-38532419)
chr8 (7-81)||(19994802-19994876)
chr8 (7-81)||(20480092-20480166)
chr8 (7-81)||(22323102-22323175)
chr8 (180-290)||(24662630-24662740)
chr8 (7-81)||(24719077-24719151)
chr8 (7-81)||(25120938-25121012)
chr8 (180-290)||(43684317-43684427)
chr8 (171-283)||(19994543-19994656)
chr8 (185-285)||(43374970-43375071)
chr8 (13-81)||(22909146-22909214)
chr8 (13-81)||(24108245-24108313)
chr8 (13-60)||(13664317-13664364)
chr8 (13-60)||(13723592-13723639)
chr8 (171-292)||(17730847-17730969)
chr8 (13-290)||(21853279-21853548)
chr8 (5-97)||(25294488-25294582)
chr8 (5-97)||(25756477-25756571)
chr8 (7-81)||(16416736-16416810)
chr8 (177-290)||(22322819-22322933)
chr8 (8-81)||(23509418-23509491)
chr8 (171-285)||(18768155-18768271)
chr8 (171-284)||(22737271-22737387)
chr8 (180-290)||(272586-272696)
chr8 (180-290)||(643153-643263)
chr8 (180-290)||(828959-829069)
chr8 (13-290)||(16675709-16675978)
chr8 (185-290)||(6775615-6775721)
chr8 (13-273)||(21845891-21846143)
chr8 (38-151)||(24238066-24238177)
chr8 (90-151)||(11543088-11543149)
chr8 (13-89)||(272778-272854)
chr8 (13-81)||(642995-643063)
chr8 (13-81)||(828801-828869)
chr8 (132-285)||(25294581-25294738)
chr8 (132-285)||(25756570-25756727)
chr8 (104-200)||(23148480-23148577)
chr8 (7-60)||(43375207-43375260)
chr8 (7-81)||(17731117-17731193)
chr8 (13-89)||(24662822-24662898)
chr8 (38-81)||(28543397-28543440)
chr8 (111-151)||(18043091-18043131)
chr8 (232-292)||(39448211-39448271)
chr8 (13-53)||(43684159-43684199)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-292)||(60060-60350)
scaffold0068 (206-292)||(46817-46902)
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (1-292)||(27185217-27185508)
chr5 (7-292)||(4863759-4864044)
chr5 (1-292)||(35792635-35792914)
chr5 (37-200)||(23492527-23492691)
chr5 (37-200)||(32967652-32967816)
chr5 (1-131)||(21661268-21661398)
chr5 (37-200)||(37189608-37189772)
chr5 (5-285)||(24226859-24227148)
chr5 (37-292)||(7727102-7727356)
chr5 (37-200)||(13793654-13793818)
chr5 (38-200)||(21615537-21615700)
chr5 (37-200)||(28888440-28888607)
chr5 (13-292)||(11213105-11213375)
chr5 (13-292)||(16534813-16535083)
chr5 (38-200)||(19860758-19860921)
chr5 (178-292)||(21649493-21649607)
chr5 (171-292)||(24184596-24184718)
chr5 (172-292)||(25192499-25192619)
chr5 (1-290)||(1221233-1221516)
chr5 (1-290)||(22884685-22884967)
chr5 (172-260)||(24470960-24471048)
chr5 (13-290)||(110486-110756)
chr5 (8-290)||(22367986-22368261)
chr5 (172-292)||(1170044-1170165)
chr5 (38-151)||(11964473-11964586)
chr5 (173-292)||(11582532-11582652)
chr5 (8-290)||(19498301-19498575)
chr5 (171-292)||(21392844-21392966)
chr5 (15-290)||(43445256-43445527)
chr5 (171-290)||(20710793-20710913)
chr5 (171-290)||(28258256-28258376)
chr5 (175-284)||(19404239-19404350)
chr5 (171-292)||(23453605-23453728)
chr5 (171-292)||(23465110-23465233)
chr5 (172-290)||(23510647-23510766)
chr5 (13-290)||(4201469-4201738)
chr5 (8-290)||(10779681-10779956)
chr5 (13-290)||(11341142-11341411)
chr5 (38-200)||(20455577-20455740)
chr5 (172-290)||(23513453-23513572)
chr5 (176-292)||(21652785-21652902)
chr5 (1-60)||(18779795-18779854)
chr5 (180-290)||(20615277-20615387)
chr5 (13-290)||(24595007-24595276)
chr5 (180-290)||(37051649-37051759)
chr5 (185-292)||(17473272-17473380)
chr5 (8-290)||(25425123-25425397)
chr5 (180-290)||(21234909-21235019)
chr5 (8-81)||(28258021-28258093)
chr5 (171-285)||(3672647-3672763)
chr5 (180-290)||(21074991-21075102)
chr5 (180-290)||(23327618-23327728)
chr5 (171-283)||(5452209-5452323)
chr5 (171-292)||(11338250-11338371)
chr5 (7-81)||(21392624-21392698)
chr5 (13-81)||(24470736-24470804)
chr5 (180-290)||(21933663-21933773)
chr5 (180-290)||(21939833-21939943)
chr5 (180-290)||(35580919-35581029)
chr5 (180-290)||(37010667-37010777)
chr5 (7-81)||(1170321-1170395)
chr5 (185-290)||(7424347-7424452)
chr5 (7-81)||(11582340-11582414)
chr5 (13-54)||(25211623-25211664)
chr5 (13-54)||(25275775-25275816)
chr5 (13-284)||(27008518-27008781)
chr5 (8-290)||(9732170-9732443)
chr5 (13-89)||(21933855-21933931)
chr5 (13-89)||(21940025-21940101)
chr5 (8-60)||(23510416-23510468)
chr5 (13-81)||(35580761-35580829)
chr5 (13-89)||(37010859-37010935)
chr5 (7-81)||(21653052-21653126)
chr5 (8-81)||(10852-10925)
chr5 (255-292)||(24473191-24473228)
chr5 (8-81)||(29192321-29192394)
chr5 (13-89)||(21075184-21075260)
chr5 (180-290)||(11015-11125)
chr5 (5-84)||(5452429-5452513)
chr5 (180-282)||(25901837-25901939)
chr5 (185-290)||(18779498-18779603)
chr5 (209-290)||(29192122-29192203)
chr5 (7-60)||(17473573-17473626)
chr5 (7-81)||(23453378-23453454)
chr5 (7-81)||(23460622-23460698)
chr5 (7-81)||(23464883-23464959)
chr5 (13-61)||(7424109-7424156)
chr5 (13-89)||(25902021-25902097)
chr5 (13-81)||(37051491-37051559)
chr5 (13-60)||(21235131-21235178)
chr5 (232-291)||(23492722-23492781)
chr5 (13-53)||(20615119-20615159)
[»] chr1 (74 HSPs)
chr1 (1-292)||(5675990-5676281)
chr1 (1-292)||(35053325-35053616)
chr1 (13-292)||(41217948-41218227)
chr1 (7-292)||(37845855-37846140)
chr1 (7-292)||(20444236-20444520)
chr1 (7-292)||(20929969-20930247)
chr1 (7-292)||(20530000-20530285)
chr1 (5-292)||(44036289-44036569)
chr1 (125-291)||(20526725-20526891)
chr1 (38-200)||(38035101-38035264)
chr1 (37-200)||(13378241-13378405)
chr1 (8-290)||(22226480-22226753)
chr1 (5-290)||(22352622-22352900)
chr1 (37-197)||(36357820-36357981)
chr1 (37-170)||(19601703-19601836)
chr1 (1-290)||(15862823-15863099)
chr1 (36-285)||(37235353-37235606)
chr1 (172-292)||(9785623-9785743)
chr1 (172-292)||(21858210-21858330)
chr1 (37-200)||(21193689-21193853)
chr1 (176-292)||(22250343-22250459)
chr1 (171-292)||(21716858-21716980)
chr1 (171-292)||(35523809-35523931)
chr1 (171-284)||(2422368-2422482)
chr1 (63-150)||(8539490-8539577)
chr1 (63-150)||(8604729-8604816)
chr1 (171-292)||(22407584-22407706)
chr1 (39-151)||(5769744-5769856)
chr1 (171-292)||(49966301-49966423)
chr1 (172-292)||(41210699-41210820)
chr1 (172-282)||(18506010-18506121)
chr1 (38-200)||(5471863-5472027)
chr1 (38-151)||(20821477-20821590)
chr1 (38-151)||(41213197-41213310)
chr1 (8-290)||(45050185-45050455)
chr1 (1-81)||(2422733-2422813)
chr1 (171-290)||(20895083-20895203)
chr1 (8-285)||(17147279-17147549)
chr1 (13-290)||(22034351-22034620)
chr1 (171-285)||(51657720-51657835)
chr1 (38-150)||(22144923-22145035)
chr1 (7-81)||(9785899-9785973)
chr1 (185-290)||(22365421-22365527)
chr1 (171-283)||(27673505-27673619)
chr1 (7-81)||(49966077-49966151)
chr1 (180-290)||(51451274-51451384)
chr1 (171-228)||(2422531-2422588)
chr1 (1-81)||(22250622-22250702)
chr1 (171-285)||(22836645-22836761)
chr1 (180-290)||(7641983-7642093)
chr1 (7-81)||(20895390-20895464)
chr1 (7-81)||(22407894-22407968)
chr1 (8-81)||(35935166-35935239)
chr1 (13-81)||(22365184-22365252)
chr1 (180-290)||(17003486-17003596)
chr1 (13-290)||(20826614-20826883)
chr1 (13-81)||(17003328-17003396)
chr1 (171-285)||(20956361-20956477)
chr1 (13-61)||(21651623-21651671)
chr1 (22-290)||(41392964-41393223)
chr1 (13-290)||(18602436-18602705)
chr1 (185-290)||(18061000-18061105)
chr1 (185-290)||(21651327-21651432)
chr1 (7-81)||(20956627-20956703)
chr1 (7-81)||(22836911-22836987)
chr1 (180-290)||(22029358-22029469)
chr1 (13-81)||(51451116-51451184)
chr1 (13-290)||(5073693-5073962)
chr1 (8-81)||(7642176-7642249)
chr1 (7-60)||(21857977-21858030)
chr1 (246-290)||(20122050-20122094)
chr1 (13-61)||(29137323-29137370)
chr1 (13-81)||(27673285-27673355)
chr1 (232-292)||(38035010-38035070)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-292)||(12684-12975)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (1-292)||(6877927-6878218)
chr2 (2-292)||(22861973-22862263)
chr2 (7-292)||(8886631-8886916)
chr2 (15-292)||(25600459-25600737)
chr2 (5-288)||(15631885-15632168)
chr2 (64-292)||(27260130-27260359)
chr2 (5-292)||(22282614-22282894)
chr2 (5-290)||(22273381-22273659)
chr2 (7-292)||(43644359-43644635)
chr2 (5-285)||(19434861-19435146)
chr2 (37-200)||(25304089-25304253)
chr2 (37-172)||(4795-4930)
chr2 (37-200)||(23822998-23823162)
chr2 (37-200)||(23824942-23825106)
chr2 (37-200)||(23832077-23832241)
chr2 (38-200)||(19658471-19658634)
chr2 (7-200)||(24088851-24089047)
chr2 (37-200)||(19670620-19670783)
chr2 (37-200)||(24296062-24296226)
chr2 (38-194)||(43641348-43641505)
chr2 (185-292)||(9654212-9654319)
chr2 (171-292)||(269841-269963)
chr2 (171-292)||(22691334-22691456)
chr2 (171-292)||(22695981-22696103)
chr2 (8-290)||(21140376-21140651)
chr2 (171-278)||(4449627-4449735)
chr2 (13-290)||(3800495-3800765)
chr2 (5-254)||(22692786-22693028)
chr2 (5-254)||(22697433-22697675)
chr2 (171-291)||(36892094-36892215)
chr2 (8-290)||(21275909-21276184)
chr2 (1-290)||(12643409-12643690)
chr2 (13-290)||(24687051-24687321)
chr2 (13-290)||(34822702-34822971)
chr2 (171-285)||(22581324-22581440)
chr2 (171-285)||(28972694-28972810)
chr2 (171-292)||(7320141-7320264)
chr2 (13-290)||(12726557-12726826)
chr2 (171-292)||(24572775-24572898)
chr2 (38-151)||(18534351-18534464)
chr2 (38-147)||(24272580-24272689)
chr2 (8-290)||(8942145-8942420)
chr2 (38-165)||(22137341-22137468)
chr2 (171-292)||(24966951-24967073)
chr2 (8-290)||(12637547-12637822)
chr2 (13-290)||(14907822-14908090)
chr2 (172-285)||(721125-721240)
chr2 (13-290)||(23773041-23773310)
chr2 (180-290)||(20013785-20013895)
chr2 (180-290)||(23818842-23818952)
chr2 (8-290)||(24827952-24828218)
chr2 (7-81)||(36892360-36892434)
chr2 (185-285)||(461406-461507)
chr2 (180-290)||(5889679-5889790)
chr2 (7-81)||(25877618-25877692)
chr2 (8-60)||(24832618-24832670)
chr2 (180-290)||(11232635-11232745)
chr2 (180-290)||(22514482-22514592)
chr2 (180-290)||(28777083-28777193)
chr2 (172-285)||(20628783-20628897)
chr2 (8-58)||(25211379-25211429)
chr2 (13-89)||(5889872-5889948)
chr2 (13-89)||(11232827-11232903)
chr2 (13-89)||(22514674-22514750)
chr2 (13-89)||(28777275-28777351)
chr2 (173-285)||(22787428-22787542)
chr2 (7-60)||(461161-461214)
chr2 (8-81)||(19888362-19888435)
chr2 (230-290)||(25877335-25877395)
chr2 (13-290)||(17397979-17398248)
chr2 (180-290)||(19888162-19888272)
chr2 (171-221)||(25877423-25877473)
chr2 (7-60)||(9654512-9654565)
chr2 (7-60)||(20629039-20629092)
chr2 (7-81)||(22581588-22581664)
chr2 (15-60)||(24966720-24966765)
chr2 (13-81)||(20013627-20013695)
chr2 (13-81)||(23818684-23818752)
chr2 (7-83)||(31830-31908)
chr2 (232-292)||(23822907-23822967)
chr2 (232-292)||(23824851-23824911)
chr2 (232-292)||(23831986-23832046)
[»] chr7 (102 HSPs)
chr7 (1-291)||(3893582-3893872)
chr7 (5-292)||(112683-112973)
chr7 (5-292)||(45453642-45453928)
chr7 (7-292)||(26071651-26071937)
chr7 (7-292)||(26095438-26095724)
chr7 (13-292)||(12753380-12753659)
chr7 (1-292)||(1938157-1938446)
chr7 (5-292)||(32495941-32496221)
chr7 (5-292)||(15761756-15762032)
chr7 (39-292)||(3058582-3058825)
chr7 (71-292)||(125391-125604)
chr7 (37-200)||(15913912-15914076)
chr7 (100-292)||(2027151-2027335)
chr7 (37-200)||(13388488-13388652)
chr7 (5-285)||(9058024-9058313)
chr7 (8-292)||(369388-369665)
chr7 (37-167)||(13376195-13376324)
chr7 (172-292)||(7291511-7291631)
chr7 (8-290)||(18255209-18255484)
chr7 (173-292)||(142285-142405)
chr7 (185-292)||(2192082-2192189)
chr7 (171-292)||(12249499-12249621)
chr7 (171-292)||(44863899-44864021)
chr7 (171-291)||(12545099-12545220)
chr7 (13-290)||(2436136-2436401)
chr7 (5-290)||(15952481-15952759)
chr7 (175-292)||(11285871-11285989)
chr7 (171-292)||(13867460-13867582)
chr7 (171-292)||(15823796-15823918)
chr7 (38-151)||(20587140-20587253)
chr7 (173-292)||(47288433-47288553)
chr7 (38-200)||(8565058-8565221)
chr7 (22-151)||(9322594-9322726)
chr7 (13-290)||(26010578-26010848)
chr7 (38-151)||(28718978-28719091)
chr7 (13-290)||(10988119-10988388)
chr7 (13-285)||(13757086-13757351)
chr7 (171-284)||(49049195-49049310)
chr7 (172-285)||(11582233-11582347)
chr7 (180-290)||(15442946-15443056)
chr7 (185-290)||(15926038-15926144)
chr7 (7-80)||(15824105-15824178)
chr7 (185-285)||(36051335-36051436)
chr7 (5-57)||(123000-123052)
chr7 (13-60)||(2192380-2192427)
chr7 (13-60)||(7291283-7291330)
chr7 (7-81)||(142062-142136)
chr7 (7-81)||(11285641-11285715)
chr7 (7-81)||(13867688-13867762)
chr7 (185-290)||(15525871-15525977)
chr7 (172-285)||(16210438-16210552)
chr7 (171-259)||(16571511-16571601)
chr7 (171-259)||(16594061-16594151)
chr7 (7-81)||(44863637-44863711)
chr7 (175-285)||(13273402-13273514)
chr7 (171-285)||(15629426-15629542)
chr7 (12-290)||(42057550-42057820)
chr7 (180-290)||(7821590-7821700)
chr7 (180-290)||(7828901-7829011)
chr7 (13-60)||(16480610-16480657)
chr7 (180-290)||(27102934-27103044)
chr7 (180-290)||(27110282-27110392)
chr7 (180-290)||(27175282-27175392)
chr7 (180-290)||(38785026-38785136)
chr7 (7-81)||(11582535-11582609)
chr7 (172-285)||(13038497-13038611)
chr7 (7-81)||(13038809-13038883)
chr7 (185-290)||(13912500-13912605)
chr7 (185-290)||(16480323-16480428)
chr7 (185-290)||(18981294-18981399)
chr7 (171-285)||(10862248-10862365)
chr7 (1-49)||(2024954-2025002)
chr7 (13-81)||(7821432-7821500)
chr7 (13-81)||(7828743-7828811)
chr7 (13-81)||(15518445-15518513)
chr7 (13-89)||(27103126-27103202)
chr7 (13-89)||(27110474-27110550)
chr7 (13-81)||(27175124-27175192)
chr7 (13-89)||(38785218-38785294)
chr7 (7-81)||(12545404-12545479)
chr7 (13-290)||(25293665-25293934)
chr7 (105-151)||(4483318-4483364)
chr7 (7-81)||(47288170-47288244)
chr7 (8-81)||(16416970-16417043)
chr7 (13-61)||(18981590-18981638)
chr7 (180-282)||(11514788-11514890)
chr7 (180-290)||(16417133-16417243)
chr7 (180-282)||(30263519-30263621)
chr7 (7-60)||(36051089-36051142)
chr7 (13-81)||(11514630-11514698)
chr7 (13-89)||(15443138-15443214)
chr7 (13-61)||(15925800-15925847)
chr7 (13-44)||(3055222-3055253)
chr7 (38-89)||(4483269-4483320)
chr7 (1-81)||(12249771-12249853)
chr7 (208-290)||(13571525-13571607)
chr7 (13-60)||(16210211-16210258)
chr7 (13-60)||(30263732-30263779)
chr7 (95-164)||(19066193-19066262)
chr7 (7-81)||(49049452-49049528)
chr7 (7-80)||(13273171-13273246)
chr7 (13-81)||(13912701-13912769)
[»] chr4 (91 HSPs)
chr4 (1-285)||(8873884-8874168)
chr4 (13-292)||(21960951-21961231)
chr4 (13-292)||(12901155-12901435)
chr4 (5-292)||(109978-110255)
chr4 (15-292)||(16521294-16521563)
chr4 (154-292)||(34393690-34393828)
chr4 (37-200)||(34197649-34197813)
chr4 (5-292)||(15211835-15212116)
chr4 (13-292)||(5684286-5684557)
chr4 (44-195)||(27959560-27959712)
chr4 (37-200)||(37958541-37958705)
chr4 (125-292)||(25120505-25120663)
chr4 (37-200)||(12245736-12245900)
chr4 (7-284)||(14899969-14900247)
chr4 (37-172)||(15852829-15852964)
chr4 (39-201)||(41167417-41167580)
chr4 (172-290)||(9294179-9294297)
chr4 (171-292)||(44054575-44054697)
chr4 (172-292)||(7133832-7133953)
chr4 (172-292)||(53909153-53909274)
chr4 (8-290)||(19999026-19999301)
chr4 (171-292)||(44345480-44345602)
chr4 (1-81)||(44054347-44054427)
chr4 (5-281)||(41257749-41258033)
chr4 (208-292)||(8373044-8373128)
chr4 (173-292)||(33738920-33739040)
chr4 (8-290)||(26678543-26678817)
chr4 (38-151)||(10238967-10239080)
chr4 (175-283)||(13751686-13751795)
chr4 (8-290)||(14994699-14994970)
chr4 (8-286)||(47355824-47356095)
chr4 (13-290)||(22355948-22356217)
chr4 (170-292)||(45460340-45460463)
chr4 (173-290)||(10642842-10642960)
chr4 (38-151)||(5372228-5372341)
chr4 (41-151)||(47469867-47469977)
chr4 (174-290)||(54119646-54119763)
chr4 (13-285)||(14950524-14950787)
chr4 (172-290)||(18167448-18167566)
chr4 (178-292)||(53706173-53706288)
chr4 (13-105)||(12837898-12837992)
chr4 (180-290)||(10487333-10487443)
chr4 (172-285)||(13245106-13245220)
chr4 (180-290)||(16329308-16329418)
chr4 (7-81)||(16366361-16366435)
chr4 (7-81)||(44345259-44345333)
chr4 (7-81)||(53909431-53909505)
chr4 (38-147)||(50223696-50223805)
chr4 (13-81)||(9293953-9294021)
chr4 (13-81)||(10642615-10642683)
chr4 (8-290)||(15274144-15274418)
chr4 (12-290)||(26337988-26338258)
chr4 (175-292)||(18495790-18495909)
chr4 (222-292)||(30233927-30233998)
chr4 (171-292)||(43282770-43282893)
chr4 (1-54)||(7134088-7134141)
chr4 (8-60)||(8372972-8373024)
chr4 (171-273)||(13811032-13811136)
chr4 (171-285)||(15043593-15043709)
chr4 (171-285)||(15110715-15110831)
chr4 (8-60)||(15138165-15138217)
chr4 (7-81)||(33738657-33738731)
chr4 (13-290)||(13049548-13049817)
chr4 (185-290)||(15288394-15288499)
chr4 (185-290)||(15295504-15295609)
chr4 (15-60)||(7848856-7848901)
chr4 (8-81)||(18246689-18246762)
chr4 (9-81)||(18496065-18496138)
chr4 (7-81)||(43283043-43283119)
chr4 (8-60)||(18167216-18167268)
chr4 (8-81)||(30236147-30236222)
chr4 (187-281)||(52266864-52266960)
chr4 (257-292)||(18294545-18294580)
chr4 (13-81)||(52267125-52267195)
chr4 (7-60)||(54119911-54119964)
chr4 (13-81)||(10487175-10487243)
chr4 (13-61)||(15288633-15288680)
chr4 (13-61)||(15295800-15295847)
chr4 (13-89)||(16329500-16329576)
chr4 (15-47)||(16521233-16521265)
chr4 (25-81)||(53706465-53706521)
chr4 (104-151)||(24237478-24237525)
chr4 (171-226)||(30235942-30235997)
chr4 (230-292)||(821495-821557)
chr4 (7-81)||(13244787-13244861)
chr4 (108-150)||(17213378-17213420)
chr4 (209-290)||(18246881-18246962)
chr4 (7-81)||(13811287-13811363)
chr4 (38-110)||(17377011-17377083)
chr4 (8-81)||(45460611-45460686)
chr4 (7-51)||(53706515-53706559)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (5-292)||(18775704-18775991)
chr6 (13-292)||(16105059-16105339)
chr6 (8-292)||(18128776-18129065)
chr6 (7-292)||(31626933-31627219)
chr6 (66-292)||(16083970-16084197)
chr6 (1-218)||(25745761-25745978)
chr6 (100-292)||(23151848-23152040)
chr6 (5-292)||(1554343-1554619)
chr6 (5-292)||(19984588-19984866)
chr6 (13-183)||(22428676-22428846)
chr6 (37-192)||(18383172-18383328)
chr6 (37-200)||(33323337-33323501)
chr6 (12-290)||(15861242-15861506)
chr6 (37-200)||(16889227-16889390)
chr6 (7-290)||(16238868-16239144)
chr6 (189-292)||(22430925-22431028)
chr6 (38-151)||(34965471-34965584)
chr6 (8-290)||(1659096-1659366)
chr6 (47-172)||(17790652-17790776)
chr6 (8-290)||(11214644-11214918)
chr6 (172-292)||(35017065-35017185)
chr6 (185-292)||(16827259-16827366)
chr6 (66-200)||(35137430-35137565)
chr6 (171-291)||(18397585-18397706)
chr6 (13-290)||(4989407-4989677)
chr6 (172-290)||(18825144-18825262)
chr6 (172-290)||(18843205-18843323)
chr6 (172-292)||(18004356-18004477)
chr6 (171-291)||(32897382-32897503)
chr6 (185-265)||(18741123-18741203)
chr6 (8-290)||(23976074-23976349)
chr6 (173-292)||(18431294-18431414)
chr6 (208-292)||(18569283-18569367)
chr6 (5-150)||(22846613-22846767)
chr6 (171-285)||(28196172-28196288)
chr6 (13-290)||(14627994-14628263)
chr6 (171-292)||(25646210-25646332)
chr6 (8-290)||(33315964-33316239)
chr6 (8-290)||(1651335-1651605)
chr6 (47-151)||(16134814-16134918)
chr6 (170-292)||(22866826-22866949)
chr6 (171-292)||(15736564-15736686)
chr6 (38-151)||(19852796-19852909)
chr6 (171-285)||(25368748-25368865)
chr6 (171-285)||(15738907-15739023)
chr6 (13-290)||(16650628-16650898)
chr6 (171-292)||(13622497-13622619)
chr6 (7-81)||(18422229-18422303)
chr6 (7-81)||(25646518-25646592)
chr6 (7-81)||(35017303-35017377)
chr6 (38-151)||(23220223-23220336)
chr6 (187-290)||(17343668-17343772)
chr6 (13-81)||(18004635-18004703)
chr6 (13-81)||(18825420-18825488)
chr6 (13-290)||(16557398-16557668)
chr6 (13-290)||(26088345-26088614)
chr6 (16-81)||(18843481-18843546)
chr6 (13-89)||(16827454-16827530)
chr6 (13-290)||(29870857-29871127)
chr6 (180-290)||(10487548-10487658)
chr6 (13-290)||(16230091-16230360)
chr6 (180-290)||(16377669-16377779)
chr6 (180-290)||(16384993-16385103)
chr6 (180-290)||(27655469-27655580)
chr6 (185-290)||(18088096-18088202)
chr6 (13-81)||(10487390-10487458)
chr6 (171-290)||(13016170-13016290)
chr6 (13-89)||(16377861-16377937)
chr6 (13-89)||(16385185-16385261)
chr6 (13-61)||(22227282-22227330)
chr6 (13-53)||(32896498-32896538)
chr6 (185-290)||(19609171-19609276)
chr6 (185-290)||(22227025-22227131)
chr6 (250-292)||(25745716-25745758)
chr6 (7-60)||(13622805-13622858)
chr6 (8-61)||(17343868-17343921)
chr6 (7-60)||(18740877-18740930)
chr6 (8-81)||(25174061-25174134)
chr6 (8-89)||(27655662-27655743)
chr6 (13-290)||(23993671-23993940)
chr6 (86-131)||(16374954-16374999)
chr6 (13-61)||(18088393-18088440)
chr6 (209-290)||(25174253-25174334)
chr6 (11-81)||(15738685-15738757)
chr6 (86-131)||(31162441-31162486)
chr6 (236-292)||(16889135-16889191)
chr6 (13-61)||(19608933-19608980)
[»] chr3 (116 HSPs)
chr3 (1-292)||(318997-319288)
chr3 (13-292)||(12351228-12351508)
chr3 (1-292)||(8630331-8630622)
chr3 (13-291)||(7852304-7852582)
chr3 (5-260)||(50113543-50113798)
chr3 (7-292)||(19230549-19230835)
chr3 (13-292)||(2048564-2048835)
chr3 (5-292)||(33340338-33340618)
chr3 (1-292)||(19945120-19945401)
chr3 (13-292)||(5227221-5227490)
chr3 (13-292)||(23491009-23491281)
chr3 (7-284)||(47786274-47786541)
chr3 (13-292)||(10737062-10737331)
chr3 (13-292)||(51159861-51160136)
chr3 (1-292)||(16259537-16259816)
chr3 (37-200)||(48420192-48420356)
chr3 (37-200)||(15874685-15874849)
chr3 (8-290)||(14846045-14846318)
chr3 (37-194)||(55442249-55442409)
chr3 (37-165)||(12490249-12490377)
chr3 (37-200)||(11330484-11330648)
chr3 (37-169)||(18008645-18008777)
chr3 (38-285)||(38812384-38812634)
chr3 (7-200)||(14060717-14060913)
chr3 (172-292)||(17957718-17957838)
chr3 (8-292)||(17913634-17913909)
chr3 (38-151)||(5229607-5229720)
chr3 (172-292)||(25057502-25057622)
chr3 (171-292)||(14297151-14297273)
chr3 (171-292)||(14302778-14302900)
chr3 (173-292)||(35122342-35122462)
chr3 (38-149)||(47983419-47983531)
chr3 (38-149)||(47992706-47992818)
chr3 (38-149)||(48001993-48002105)
chr3 (38-149)||(48011279-48011391)
chr3 (1-290)||(49230705-49230987)
chr3 (171-284)||(53899912-53900026)
chr3 (172-292)||(13816167-13816288)
chr3 (8-290)||(16819407-16819682)
chr3 (171-285)||(22145663-22145777)
chr3 (8-273)||(15939861-15940119)
chr3 (172-292)||(19572154-19572275)
chr3 (171-292)||(14294081-14294204)
chr3 (171-292)||(14299708-14299831)
chr3 (170-292)||(40938383-40938506)
chr3 (13-290)||(44227930-44228200)
chr3 (171-292)||(11062419-11062541)
chr3 (171-292)||(17099367-17099489)
chr3 (120-290)||(18905182-18905343)
chr3 (8-290)||(15613564-15613834)
chr3 (8-290)||(15469851-15470120)
chr3 (171-282)||(17523802-17523914)
chr3 (171-292)||(14522690-14522813)
chr3 (172-290)||(15860531-15860650)
chr3 (13-290)||(27839210-27839480)
chr3 (38-194)||(9592236-9592393)
chr3 (171-292)||(11198955-11199078)
chr3 (13-290)||(16745554-16745822)
chr3 (171-285)||(30205107-30205222)
chr3 (171-292)||(16183393-16183519)
chr3 (38-151)||(41660136-41660249)
chr3 (13-290)||(30151839-30152108)
chr3 (7-81)||(6148457-6148531)
chr3 (8-290)||(15574545-15574815)
chr3 (1-81)||(30204883-30204961)
chr3 (208-291)||(6148225-6148309)
chr3 (8-290)||(12265874-12266146)
chr3 (171-285)||(17138119-17138235)
chr3 (7-81)||(11813329-11813403)
chr3 (7-81)||(19572430-19572504)
chr3 (171-250)||(14287747-14287828)
chr3 (171-285)||(12951705-12951821)
chr3 (171-285)||(15516388-15516504)
chr3 (13-81)||(25057276-25057344)
chr3 (13-81)||(30141388-30141456)
chr3 (39-131)||(33370914-33371005)
chr3 (171-285)||(39654569-39654685)
chr3 (13-290)||(8269785-8270054)
chr3 (13-290)||(8276896-8277165)
chr3 (13-290)||(8305705-8305974)
chr3 (5-60)||(19262622-19262677)
chr3 (7-81)||(16183665-16183739)
chr3 (171-290)||(11883652-11883773)
chr3 (8-81)||(17957996-17958069)
chr3 (8-81)||(23081748-23081821)
chr3 (8-60)||(18905361-18905413)
chr3 (180-290)||(1469036-1469146)
chr3 (173-285)||(12562868-12562983)
chr3 (180-290)||(18909353-18909463)
chr3 (13-290)||(53769163-53769432)
chr3 (7-81)||(17099107-17099181)
chr3 (7-81)||(22145882-22145956)
chr3 (7-57)||(45581332-45581382)
chr3 (13-89)||(1469228-1469304)
chr3 (180-290)||(55315057-55315167)
chr3 (172-230)||(11813520-11813578)
chr3 (8-81)||(2450910-2450983)
chr3 (8-81)||(18909190-18909263)
chr3 (8-81)||(22273545-22273618)
chr3 (180-290)||(2450710-2450820)
chr3 (185-290)||(13977017-13977124)
chr3 (180-290)||(22273708-22273818)
chr3 (13-290)||(45859522-45859791)
chr3 (85-131)||(11517010-11517056)
chr3 (5-81)||(12951474-12951555)
chr3 (180-290)||(13956185-13956297)
chr3 (13-81)||(13956388-13956456)
chr3 (13-81)||(13977221-13977289)
chr3 (13-81)||(41268744-41268812)
chr3 (13-81)||(55314884-55314952)
chr3 (1-81)||(11062691-11062773)
chr3 (38-81)||(14523006-14523049)
chr3 (38-81)||(17536606-17536649)
chr3 (180-290)||(41268903-41269013)
chr3 (47-81)||(12774900-12774934)
chr3 (7-60)||(15860829-15860882)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (15-292)||(13579-13856)
scaffold0396 (8-290)||(15943-16218)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (13-292)||(4627-4907)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (1-292)||(19875-20168)
scaffold0195 (1-292)||(17791-18084)
scaffold0195 (37-292)||(8038-8294)
scaffold0195 (37-292)||(13427-13683)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (1-292)||(236667-236958)
scaffold0009 (5-292)||(270617-270897)
scaffold0009 (87-131)||(255963-256007)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (7-292)||(6038-6324)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (7-292)||(3117-3402)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (7-292)||(5725-6010)
scaffold0383 (1-292)||(863-1141)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-289)||(248927-249218)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (13-292)||(7930-8210)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (7-292)||(3151-3437)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (8-273)||(27067-27333)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (8-285)||(14171-14449)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (13-292)||(8574-8856)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (7-290)||(138197-138480)
scaffold0021 (171-290)||(87097-87217)
scaffold0021 (171-292)||(10319-10442)
scaffold0021 (7-81)||(76779-76853)
scaffold0021 (171-255)||(77039-77124)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (42-292)||(2010-2261)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-221)||(56425-56645)
scaffold0051 (216-292)||(58899-58976)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (1-292)||(571-855)
scaffold0269 (185-292)||(15004-15111)
scaffold0269 (7-81)||(3444-3518)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (5-292)||(32576-32856)
scaffold0184 (175-292)||(34011-34128)
scaffold0184 (13-81)||(33780-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (5-292)||(39988-40268)
scaffold0078 (175-292)||(38716-38833)
scaffold0078 (13-81)||(38996-39064)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (5-292)||(197488-197765)
scaffold0004 (38-151)||(84943-85056)
scaffold0004 (38-151)||(26081-26194)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (5-292)||(2516-2797)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (5-292)||(54137-54414)
scaffold0032 (1-290)||(109467-109749)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (5-292)||(11420-11695)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (7-289)||(145030-145304)
scaffold0025 (7-289)||(147289-147563)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (5-292)||(129584-129864)
scaffold0008 (171-292)||(21314-21436)
scaffold0008 (7-81)||(21054-21128)
scaffold0008 (7-81)||(28644-28718)
scaffold0008 (171-208)||(28903-28940)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (5-292)||(217134-217413)
scaffold0003 (8-81)||(5682-5755)
scaffold0003 (180-290)||(5845-5955)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (7-292)||(4983-5260)
scaffold0266 (7-81)||(12788-12862)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (17-292)||(4134-4402)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-292)||(48974-49242)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (71-292)||(70781-71003)
scaffold0037 (171-290)||(26110-26230)
scaffold0037 (6-75)||(66322-66391)
scaffold0037 (7-81)||(26416-26490)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (37-292)||(106310-106564)
scaffold0022 (8-290)||(6534-6809)
scaffold0022 (38-150)||(130410-130522)
scaffold0022 (8-167)||(58936-59096)
scaffold0022 (171-283)||(108305-108419)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (5-292)||(7478-7757)
scaffold0498 (5-48)||(7319-7362)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-292)||(3680-3971)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (24-292)||(41222-41483)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (47-292)||(1-238)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (104-290)||(52661-52838)
scaffold0018 (104-290)||(56613-56790)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (37-200)||(71759-71923)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-147)||(37960-38094)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (37-290)||(4743-4996)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (172-292)||(27678-27798)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (8-285)||(4341-4611)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (37-200)||(7144-7308)
scaffold0095 (232-292)||(7054-7114)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (37-200)||(78313-78477)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (37-292)||(117990-118249)
scaffold0016 (7-81)||(163827-163901)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (171-292)||(23083-23205)
scaffold0124 (180-290)||(2960-3070)
scaffold0124 (13-89)||(3152-3228)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (13-151)||(68823-68963)
scaffold0031 (144-292)||(69394-69543)
scaffold0031 (170-292)||(30730-30853)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (37-197)||(78207-78363)
scaffold0028 (8-290)||(128888-129161)
scaffold0028 (185-290)||(90270-90373)
scaffold0028 (7-81)||(90600-90674)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (37-200)||(33993-34157)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (178-292)||(11310-11424)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (175-292)||(17307-17424)
scaffold0315 (1-60)||(17064-17123)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (176-292)||(38871-38988)
scaffold0034 (172-292)||(78208-78329)
scaffold0034 (229-292)||(44512-44575)
scaffold0034 (1-60)||(77913-77972)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (172-292)||(40255-40375)
scaffold0106 (7-81)||(40024-40098)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (8-285)||(56-325)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (8-290)||(14800-15073)
scaffold0225 (8-167)||(28321-28479)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (38-200)||(25092-25255)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (8-290)||(51532-51805)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (171-292)||(32238-32360)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (8-290)||(9311-9586)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (171-292)||(7448-7570)
scaffold0338 (7-81)||(7224-7298)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (8-290)||(106500-106775)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (171-292)||(71836-71958)
scaffold0001 (13-81)||(72106-72174)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (40-200)||(4555-4715)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (5-151)||(3242-3393)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (176-292)||(779-896)
scaffold0692 (7-81)||(1046-1120)
[»] scaffold0011 (10 HSPs)
scaffold0011 (171-291)||(256293-256414)
scaffold0011 (172-285)||(124681-124795)
scaffold0011 (7-81)||(256560-256634)
scaffold0011 (177-285)||(193275-193384)
scaffold0011 (185-285)||(76082-76183)
scaffold0011 (216-290)||(262900-262975)
scaffold0011 (7-60)||(125014-125067)
scaffold0011 (7-60)||(72033-72086)
scaffold0011 (7-60)||(76414-76467)
scaffold0011 (7-60)||(192999-193052)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (171-290)||(15248-15368)
scaffold0251 (13-61)||(15552-15599)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (181-292)||(18962-19074)
scaffold0234 (13-58)||(19255-19300)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (171-285)||(6727-6842)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (171-292)||(6745-6867)
scaffold0480 (7-81)||(7013-7087)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (37-200)||(23906-24063)
scaffold0138 (172-290)||(14649-14768)
scaffold0138 (7-81)||(15006-15080)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (178-290)||(28547-28660)
scaffold0116 (7-81)||(28253-28327)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (174-292)||(2225-2344)
scaffold0673 (10-81)||(3707-3778)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (171-292)||(4497-4619)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (8-290)||(1171-1446)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (38-200)||(212-375)
scaffold0786 (38-200)||(5267-5430)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (38-200)||(3800-3963)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (38-195)||(14097-14255)
scaffold0346 (7-59)||(15833-15885)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (171-291)||(2073-2195)
scaffold0092 (7-79)||(1846-1920)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (45-151)||(55920-56026)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (173-292)||(13125-13245)
scaffold0359 (13-81)||(13434-13502)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (171-292)||(6537-6660)
scaffold0589 (7-83)||(6310-6388)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (13-290)||(29856-30126)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (13-290)||(34838-35108)
scaffold0023 (8-290)||(155739-156010)
scaffold0023 (185-290)||(829-934)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (171-292)||(94976-95098)
scaffold0044 (180-290)||(66825-66935)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (171-285)||(2859-2975)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (171-285)||(20353-20469)
scaffold0150 (171-285)||(27182-27298)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-290)||(17476-17745)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (7-81)||(18077-18151)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (177-285)||(1845-1954)
scaffold1140 (7-60)||(1529-1582)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (185-290)||(3077-3183)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (7-81)||(31230-31304)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (171-290)||(145583-145706)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (172-285)||(5999-6112)
scaffold0407 (7-81)||(6310-6384)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (180-290)||(25566-25676)
scaffold0141 (180-290)||(21311-21421)
scaffold0141 (13-81)||(21153-21221)
scaffold0141 (13-81)||(25408-25476)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (7-81)||(31016-31090)
scaffold0049 (22-60)||(44639-44677)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (185-285)||(27902-28003)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (8-60)||(21-73)
[»] scaffold2147 (2 HSPs)
scaffold2147 (172-242)||(958-1029)
scaffold2147 (7-81)||(728-802)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (180-290)||(37952-38062)
scaffold0076 (13-81)||(37794-37862)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (185-285)||(6539-6640)
scaffold0218 (7-60)||(6831-6884)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (171-285)||(6038-6154)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (13-81)||(20906-20974)
scaffold0039 (172-230)||(20691-20749)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (104-151)||(4531-4578)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (246-290)||(4502-4546)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (87-131)||(12285-12329)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (171-273)||(7252-7356)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (13-53)||(24878-24918)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 97)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 37605477 - 37605769
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtc-gtcacattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37605477 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtctgtcaccttcgatgcaacaaaaat 37605576  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaaca 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37605577 atcatatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaaataaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggaca 37605676  T
Q  200 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605677 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 37605769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 292
Target Start/End: Original strand, 37609945 - 37610143
Alignment:
Q  94 aaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgca 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37609945 aaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaaataaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgca 37610044  T
Q  194 tgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610045 tggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 37610143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Original strand, 21696081 - 21696338
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21696081 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacacccgttttacataatct 21696180  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaa 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||     
T  21696181 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaaactcaacatgactatgatgcatggacacgtaacaagactcgataatgcaacatcaatccacag 21696280  T
Q  235 ttttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21696281 tattcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 21696338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 29758789 - 29759068
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  | || |    
T  29758789 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaaatcacattg 29758888  T
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgta 203  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||    
T  29758889 tatgtaagggttcacacccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatgaacatgta 29758979  T
Q  204 acaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29758980 acaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatgttgttcatctccacatcatttg 29759068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 292
Target Start/End: Original strand, 41245210 - 41245440
Alignment:
Q  63 atcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaaccctttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41245210 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccatttt 41245309  T
Q  163 acaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacac 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |    
T  41245310 acaactacaatttcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggactactc 41245409  T
Q  262 ccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  41245410 ccaattatattgattatctccataacatttg 41245440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24387370 - 24387091
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||| |  |||| |||||   || |||    
T  24387370 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaa-aaggtcgtcacctctgatggaacaactcaacatc 24387272  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||    
T  24387271 gtatgtaagggctcacccctgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgt 24387181  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24387180 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 24387091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 270239 - 270513
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||||    
T  270239 aataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgtat 270337  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
     |||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  270338 -taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaaca 270427  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  270428 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttg 270513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 645681 - 645407
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||||    
T  645681 aataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgtat 645583  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
     |||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  645582 -taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagatcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaaca 645493  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  645492 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcaacatcatttg 645407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 831416 - 831142
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||||    
T  831416 aataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgtat 831318  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
     |||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  831317 -taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaaca 831228  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  831227 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttg 831142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24930778 - 24930497
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  24930778 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 24930679  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||         ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24930678 gtatgtaagggttcacccccgctttacataatctctgaagtaaaagagctcaactcttttacaac---------aacacgagtatgatgcatggacatgt 24930588  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930587 aacaagactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 24930497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16203997 - 16203737
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgta 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| | |||   | ||||||    
T  16203997 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggatcaattcacatcgta 16203898  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||     
T  16203897 tgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaat 16203807  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgtt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16203806 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtt 16203737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 41244135 - 41244277
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41244135 tcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatt 41244234  T
Q  115 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41244235 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc 41244277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21192389 - 21192231
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21192389 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcaccttaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 21192290  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcat 194  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  21192289 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcat 21192231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21199814 - 21199652
Alignment:
Q  39 acacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21199814 acacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaagctcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcact 21199715  T
Q  139 gaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21199714 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 21199652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 23835741 - 23835904
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23835741 tgacacataaatgcatgtggtaccgaa-cacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagattttacacccgtcttacataatca 23835839  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23835840 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 23835904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39448465 - 39448301
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39448465 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtgtgtaagatttcacaccagtcttacataatct 39448366  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaacta-caatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  39448365 ccgaagtaaaagagctcaacctttttacgactaccagactcaacatgactatgatgcatggacat 39448301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31195917 - 31195763
Alignment:
Q  47 atgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 146  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31195917 atgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatctccgaagtaaa 31195818  T
Q  147 agagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  31195817 agagctcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 31195763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 20480328 - 20480448
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20480328 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcac-attttcaccacaatatataggacaacacctaattata 20480426  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  20480427 ttgttcatctccacaacatttg 20480448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37655326 - 37655125
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  37655326 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtgccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaac 37655227  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    
T  37655226 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagcacccctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggac 37655127  T
Q  199 at 200  Q
    ||    
T  37655126 at 37655125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20568772 - 20568649
Alignment:
Q  171 aatctcaacacga-ttatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20568772 aatctcaacacgacttatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaatta 20568673  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20568672 tattgatcatctccacaacatttg 20568649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20574965 - 20574842
Alignment:
Q  171 aatctcaacacga-ttatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20574965 aatctcaacacgacttatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaatta 20574866  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20574865 tattgatcatctccacaacatttg 20574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20655528 - 20655406
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20655528 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 20655429  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  20655428 attgatcatctccacaacatttg 20655406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22908986 - 22908866
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22908986 atctcaacacgactatgatgcatggacatatacaaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatat 22908887  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  22908886 tgttcatctccacaacatttg 22908866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20648943 - 20648821
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  20648943 aatctcaacttgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatatagaacaactcccaattat 20648844  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  20648843 attgatcatctccacaacatttg 20648821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16195202 - 16195120
Alignment:
Q  210 ctcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16195202 ctcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttg 16195120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24108087 - 24107970
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24108087 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacac-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatat 24107989  T
Q  272 tgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24107988 tgttcatctccacatcatt 24107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22498945 - 22498832
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22498945 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 22498846  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  22498845 cgaagtaaaagagt 22498832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23116464 - 23116349
Alignment:
Q  36 ttgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23116464 ttgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatc 23116365  T
Q  136 tccgaagtaaaagagt 151  Q
     |||||||||||||||    
T  23116364 accgaagtaaaagagt 23116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 25121197 - 25121319
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25121197 aatctcaacacgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattat 25121296  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  25121297 attgattatctccacaacatttg 25121319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 24547724 - 24547994
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || |||| |    
T  24547724 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgca 24547822  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||||||       
T  24547823 tgtaaggggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtgta 24547909  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24547910 aggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 24547994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24718920 - 24718799
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24718920 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattata 24718821  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  24718820 ttgattatctccacaacatttg 24718799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13664138 - 13664019
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13664138 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 13664039  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | ||||||||| ||||    
T  13664038 ttgattatctccacaacatt 13664019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13723413 - 13723294
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13723413 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 13723314  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | ||||||||| ||||    
T  13723313 ttgattatctccacaacatt 13723294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Original strand, 21679856 - 21679971
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||    
T  21679856 aatctcaacacggctatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagatgacaacttccaaata 21679955  T
Q  269 tattgttcatctccac 284  Q
    ||||||||||||||||    
T  21679956 tattgttcatctccac 21679971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 16416915 - 16417037
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16416915 aatctccacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgtgacaattatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 16417014  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  16417015 attgattatctccacaacatttg 16417037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 28543591 - 28543713
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||  |||    
T  28543591 aatctcgacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattatcaccacaatatagaggacaacttccacatat 28543690  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  28543691 attgatcatctccacaacatttg 28543713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33612703 - 33612545
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33612703 gacatatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 33612604  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatg 195  Q
    |||||||||||||  || |||||||| | ||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  33612603 cgaagtaaaagagcacatcccttttaaagctacaagactcaacatgaatatgatgcatg 33612545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 22312191 - 22312304
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22312191 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcatcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 22312290  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  22312291 cgaagtaaaagagt 22312304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 33170786 - 33170890
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33170786 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 33170885  T
Q  138 cgaag 142  Q
    |||||    
T  33170886 cgaag 33170890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3433228 - 3432959
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  3433228 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 3433129  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  3433128 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 3433039  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  3433038 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 3432959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22007981 - 22007862
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22007981 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 22007882  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | |||| |||| ||||    
T  22007881 ttgattatcttcacaacatt 22007862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22090096 - 22089826
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  22090096 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 22089997  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||   ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  22089996 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacagaaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 22089906  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22089905 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 22089826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23153451 - 23153288
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    | || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23153451 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatggtgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 23153352  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| | ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23153351 cgaagtaaaagagtatatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 23153288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16874591 - 16874326
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  16874591 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 16874492  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  16874491 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 16874402  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  16874401 tcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca 16874326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 45560860 - 45560747
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  45560860 gacacatacatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattttacacccgtcttacattatcac 45560761  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    |||| |||||||||    
T  45560760 cgaattaaaagagt 45560747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 224815 - 224545
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  224815 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 224716  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  224715 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagcaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 224626  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  224625 tcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 224545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 701069 - 700958
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  701069 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 700970  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||    
T  700969 ctccacatcatt 700958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 738438 - 738168
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  738438 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 738339  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  738338 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagcaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 738249  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  738248 tcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 738168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 862333 - 862063
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  862333 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 862234  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  862233 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagcaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 862144  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  862143 tcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 862063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15320712 - 15320442
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  15320712 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 15320613  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  15320612 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 15320522  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  15320521 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt 15320442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15501081 - 15500811
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  15501081 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 15500982  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  15500981 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 15500891  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  15500890 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt 15500811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 5236700 - 5236968
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaa 110  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | ||||| | |||   || |||| ||||||    
T  5236700 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgcatgtaa 5236798  T
Q  111 gatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaaga 209  Q
    |  | |||  | | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | ||    
T  5236799 ggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaagga 5236887  T
Q  210 ctcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  5236888 ctcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 5236968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22008215 - 22008139
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  22008215 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22008139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 38532303 - 38532419
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  38532303 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttctaccacaatataaaggacaacttccaaata 38532402  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  38532403 tattgatcatctccaca 38532419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19994876 - 19994802
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19994876 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 19994802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 20480092 - 20480166
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20480092 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaatgtcgtcac 20480166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22323175 - 22323102
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  22323175 aataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcac 22323102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24662740 - 24662630
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24662740 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 24662641  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  24662640 tccacaacatt 24662630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24719151 - 24719077
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24719151 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 24719077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 25120938 - 25121012
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25120938 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 25121012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 43684317 - 43684427
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  43684317 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 43684416  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  43684417 tccacaacatt 43684427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19994656 - 19994543
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||    
T  19994656 aatctcaacccgactataatgcatggacatgtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactat 19994557  T
Q  270 attgttcatctcca 283  Q
    |||| | |||||||    
T  19994556 attgattatctcca 19994543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43375071 - 43374970
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  43375071 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 43374972  T
Q  284 ca 285  Q
    ||    
T  43374971 ca 43374970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22909214 - 22909146
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  22909214 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22909146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24108313 - 24108245
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  24108313 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 24108245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13664364 - 13664317
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664364 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 13664317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13723639 - 13723592
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723639 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 13723592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17730969 - 17730847
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  17730969 aatctcaacacgactatgatgcatagacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaccccacaattttc-ccacaatatagaggacaacttccaaata 17730871  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  17730870 tattgatcatctccacaacatttg 17730847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21853548 - 21853279
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  21853548 actcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 21853449  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  21853448 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 21853359  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21853358 tcgataatgcgacagcaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 21853279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 25294488 - 25294582
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25294488 caaataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 25294582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 25756477 - 25756571
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25756477 caaataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 25756571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 16416736 - 16416810
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16416736 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcac 16416810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22322933 - 22322819
Alignment:
Q  177 aacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgtt 275  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22322933 aacacgactatgatgcatggacatgtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 22322834  T
Q  276 catctccacatcatt 290  Q
     | ||||||| ||||    
T  22322833 tacctccacaacatt 22322819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 23509418 - 23509491
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  23509418 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 23509491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18768271 - 18768155
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  18768271 aatcccaacacgactatggtgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 18768172  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18768171 tatttatcatctccaca 18768155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22737387 - 22737271
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatt 267  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |    
T  22737387 aatctcaacatgactatgatgcatgaacatgtagcaaagactcgataatgtgacatcacctcaacaattttcaccaccatatagaggacaacttccaaat 22737288  T
Q  268 atattgttcatctccac 284  Q
    |||||| ||||||||||    
T  22737287 atattgatcatctccac 22737271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 272696 - 272586
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  272696 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 272598  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  272597 ctccacaacatt 272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 643153 - 643263
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  643153 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 643251  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  643252 ctccacaacatt 643263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 828959 - 829069
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  828959 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 829057  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  829058 ctccacaacatt 829069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16675978 - 16675709
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  ||||||    
T  16675978 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 16675879  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  16675878 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 16675789  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  16675788 tcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 16675709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6775721 - 6775615
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  6775721 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 6775622  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  6775621 caacatt 6775615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21846143 - 21845891
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  21846143 actcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 21846044  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  21846043 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagaat-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 21845954  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattg 273  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845953 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattg 21845891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 24238066 - 24238177
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    || |||||||| ||| |    
T  24238066 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcagctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcgtatgtacgatttcgt--ccatcttacattatcgc 24238163  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  24238164 cgaagtaaaagagt 24238177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 151
Target Start/End: Original strand, 11543088 - 11543149
Alignment:
Q  90 caacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  11543088 caacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaaataaaagagt 11543149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 272854 - 272778
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  272854 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 272778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 642995 - 643063
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  642995 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 643063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 828801 - 828869
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  828801 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 828869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 285
Target Start/End: Original strand, 25294581 - 25294738
Alignment:
Q  132 aatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa--caagactcgataatgcgacaaca- 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  ||   ||||||| | ||||| | | ||     
T  25294581 aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaacaatgcaatatcac 25294680  T
Q  228 atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
     ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  25294681 ctcataattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccaca 25294738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 285
Target Start/End: Original strand, 25756570 - 25756727
Alignment:
Q  132 aatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa--caagactcgataatgcgacaaca- 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  ||   ||||||| | ||||| | | ||     
T  25756570 aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaacaatgcaatatcac 25756669  T
Q  228 atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
     ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  25756670 ctcataattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccaca 25756727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 200
Target Start/End: Original strand, 23148480 - 23148577
Alignment:
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  || |||||||||| | ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23148480 tatgtaagattttacacccgtcttacattatcaccgaagttaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 23148577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 43375260 - 43375207
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43375260 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 43375207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17731193 - 17731117
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  17731193 aataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 17731117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24662898 - 24662822
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  24662898 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 24662822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Original strand, 28543397 - 28543440
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28543397 gacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 28543440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18043131 - 18043091
Alignment:
Q  111 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18043131 gatttcacacccgtcttacattatcatcgaagtaaaagagt 18043091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39448271 - 39448211
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39448271 caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttg 39448211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 43684159 - 43684199
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 53  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43684159 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatg 43684199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 60060 - 60350
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  60060 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 60159  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  60160 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatatcaacacgaatatgatgcatgaacat 60259  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  60260 gtaaaaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaa-tatattgttcatctccacatcatttg 60350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 292
Target Start/End: Original strand, 46817 - 46902
Alignment:
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46817 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaa-tatattgttcatctccacatcatttg 46902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27185508 - 27185217
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27185508 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 27185409  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27185408 tcgtatgtaagatttcacacacgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatgcatgaacat 27185309  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27185308 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacaacatttg 27185217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 4863759 - 4864044
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4863759 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 4863858  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4863859 gtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatggacatgtaata 4863958  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4863959 aaactcaataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 4864044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35792914 - 35792635
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   ||    
T  35792914 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaa 35792816  T
Q  99 tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
     |||| |||||||   |||| ||    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||    
T  35792815 catcgcatgtaaggggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagtcggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggac 35792729  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792728 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 35792635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 23492527 - 23492691
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492527 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 23492626  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| || ||||||||||| ||||    
T  23492627 ccgaagtaaaagagttcaacctttttacaactacaagacttaacatgactatgatgcatggacat 23492691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32967816 - 32967652
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32967816 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 32967717  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32967716 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 32967652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21661398 - 21661268
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21661398 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 21661299  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21661298 tcgtatgtaagatttcacaccagtcttacat 21661268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37189772 - 37189608
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  37189772 tgacacataaatgcaagtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttcacacccgtcttacataatca 37189673  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37189672 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacagctacaagactcaacatgattatgatgcatggacat 37189608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24227148 - 24226859
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24227148 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtcgtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaac 24227049  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||||||    
T  24227048 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaacccttttacagctacaagactcaacatgaccatgatgcatgaac 24226949  T
Q  199 atgtaa--caagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||  ||   ||||||||| ||||| | | ||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||    
T  24226948 atacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataattttcacgacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccaca 24226859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Original strand, 7727102 - 7727356
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7727102 tgacacgtaaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatct 7727201  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaat-ctcaacacgattatgatgcatgaacat---gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcac 232  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||   |||| ||  ||| | ||||| || ||   | |    
T  7727202 ccgaagtaaaatagctcaacccctttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatactgtaagaa--ctcaacaatgcaaccac---ctc 7727296  T
Q  233 aattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  7727297 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttg 7727356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 13793654 - 13793818
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  13793654 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatataagatctcacacccgtcttacataatca 13793753  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  13793754 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaaccacaagactcaacatgactatgatgcatgaacat 13793818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 21615537 - 21615700
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21615537 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatcac 21615636  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21615637 cgaagtaaaagagttcaactcttttacagctacaagactcaacatgattatgatgcatggacat 21615700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 28888440 - 28888607
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cat--tcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataa 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888440 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcatcatcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataa 28888539  T
Q  134 tctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  28888540 tctccgaagtaaaagagttcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 28888607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11213375 - 11213105
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||||||||||    
T  11213375 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag 11213276  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11213275 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttacagccaca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaatac 11213186  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11213185 tagataatgcgaca-caatcacaattttcaacacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcacaacatcatttg 11213105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 16534813 - 16535083
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaa 110  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | ||||| | |||   || |||| ||||||    
T  16534813 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgcatgtaa 16534911  T
Q  111 gatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaaga 209  Q
    |  | |||  | | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16534912 ggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtaacaaga 16535000  T
Q  210 ctcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16535001 cttgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 16535083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 19860758 - 19860921
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19860758 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccccaaggtcgtcaccttcgatacaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcac 19860857  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19860858 cgaagtaaaagagctcaactcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 19860921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Original strand, 21649493 - 21649607
Alignment:
Q  178 acacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttca 277  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21649493 acacgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttca 21649592  T
Q  278 tctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||    
T  21649593 tctccacatcatttg 21649607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24184718 - 24184596
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24184718 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 24184619  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  24184618 attgatcatctccacaacatttg 24184596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25192619 - 25192499
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25192619 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaacacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatat 25192520  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25192519 tgttcatctccacatcatttg 25192499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1221516 - 1221233
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| ||||||| || |||||| ||    |     
T  1221516 tttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagttcgtcacctttcgatgccacttgcac 1221417  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    |||| |||||||   ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||    
T  1221416 atcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggac 1221326  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1221325 atgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 1221233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22884967 - 22884685
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | || ||||| ||    |     
T  22884967 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttttgatgccacttgcac 22884868  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    ||||  ||||||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||    
T  22884867 atcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggac 22884778  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22884777 atgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 22884685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 260
Target Start/End: Original strand, 24470960 - 24471048
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaaca 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24470960 atctcaacacgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaaca 24471048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 110756 - 110486
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||||||||||    
T  110756 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag 110657  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  110656 -gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttacagcaaca--------tcgactatgatgcatggacatgtataaggac 110567  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  110566 tcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 110486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22368261 - 22367986
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | ||||| | |||   || ||||||    
T  22368261 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgta 22368163  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||  | ||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||     
T  22368162 tgtaaggct-cacccctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtat 22368073  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22368072 aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 22367986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1170165 - 1170044
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  1170165 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattata 1170066  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  1170065 ttgattatctccacaacatttg 1170044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 11964473 - 11964586
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |    
T  11964473 gacacatacatgcatgtggtaccaaaccacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcaaacccgtattacattatcac 11964572  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  11964573 cgaagtaaaagagt 11964586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 11582532 - 11582652
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11582532 tctccacacgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatat 11582631  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || | ||||||||| ||||||    
T  11582632 tgattatctccacaacatttg 11582652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 19498301 - 19498575
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||||||    
T  19498301 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtat 19498400  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||| ||| ||||||       
T  19498401 gtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgtatggacatgtgta 19498490  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19498491 aggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 19498575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 21392844 - 21392966
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  21392844 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattat 21392943  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  21392944 attgattatctccacaacatttg 21392966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43445527 - 43445256
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||||||||||      
T  43445527 tcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaaggg 43445428  T
Q  114 ttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
     ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||  ||  |||   ||||  || ||||||||||| | |||||  | |||||    
T  43445427 ctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttattacagcaa---caac--gactatgatgcatggatatgtataaggactc 43445335  T
Q  213 gataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  43445334 gataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 43445256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 20710793 - 20710913
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  20710793 aatctgaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattat 20710892  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  20710893 attgattatctccacaacatt 20710913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 28258256 - 28258376
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28258256 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 28258355  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | | ||||||| ||||    
T  28258356 attgattacctccacaacatt 28258376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 284
Target Start/End: Original strand, 19404239 - 19404350
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatatt 272  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  19404239 tcaacacgactatgatgcacggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatt 19404338  T
Q  273 gttcatctccac 284  Q
    ||||||||||||    
T  19404339 gttcatctccac 19404350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 23453605 - 23453728
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaag-actcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  23453605 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 23453704  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23453705 tattgatcatctccacaacatttg 23453728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 23465110 - 23465233
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaag-actcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  23465110 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 23465209  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23465210 tattgatcatctccacaacatttg 23465233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Original strand, 23510647 - 23510766
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23510647 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattata 23510746  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | ||||||||| ||||    
T  23510747 ttgattatctccacaacatt 23510766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4201738 - 4201469
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||  ||    | |||| |||||||    
T  4201738 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgtcacttgcacatcgaatgtaag 4201639  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  4201638 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaaggac 4201549  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  4201548 tcgataatgcgacaacaatcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 4201469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10779956 - 10779681
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||||||    
T  10779956 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtat 10779857  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||      
T  10779856 gtaag-gctcacacctgccttacaataatct-caaagtaaaagagctcaacccttttacagcaaca--------tcgactatgatgcatggacatgtata 10779767  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10779766 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatatatgataacacccaattatattgattatctccacaacatt 10779681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 11341142 - 11341411
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  11341142 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 11341241  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  11341242 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 11341331  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    || |||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  11341332 tcaataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 11341411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20455740 - 20455577
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  20455740 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgttacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttacattatcac 20455641  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaaccct--tttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20455640 cgaagtaaaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgattatgatgcatggacat 20455577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Original strand, 23513453 - 23513572
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23513453 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 23513552  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | || |||||| ||||    
T  23513553 ttgattatatccacaacatt 23513572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21652902 - 21652785
Alignment:
Q  176 caacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgt 274  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21652902 caacatgactataatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattga 21652803  T
Q  275 tcatctccacatcatttg 292  Q
    | || |||||| ||||||    
T  21652802 ttatttccacaacatttg 21652785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18779854 - 18779795
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779854 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 18779795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 20615277 - 20615387
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20615277 acgactatgatgcatggacatgtgtaaagactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 20615376  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  20615377 tccacaacatt 20615387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 24595007 - 24595276
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  24595007 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 24595106  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||   ||||     ||||||||||| |||||||  | |||    
T  24595107 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa---caac-----tatgatgcatggacatgtataaggac 24595196  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  24595197 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 24595276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 37051649 - 37051759
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  37051649 acgactatgatgcatggacatgtgcaaagactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 37051748  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  37051749 tccacaacatt 37051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17473380 - 17473272
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  17473380 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 17473281  T
Q  284 catcatttg 292  Q
    || ||||||    
T  17473280 caacatttg 17473272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 25425123 - 25425397
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  |    
T  25425123 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgatt 25425222  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||      
T  25425223 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtata 25425312  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaac-aatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  25425313 aggactcgataatgcgacaacaaatcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 25425397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21235019 - 21234909
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21235019 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 21234920  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  21234919 tccacaacatt 21234909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 28258021 - 28258093
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  28258021 ataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcac 28258093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 3672647 - 3672763
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  3672647 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgatatcacatcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaagta 3672746  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  3672747 tattgatcatctccaca 3672763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21075102 - 21074991
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21075102 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 21075003  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  21075002 ctccacaacatt 21074991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 23327618 - 23327728
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23327618 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 23327716  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  23327717 ctccacaacatt 23327728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5452323 - 5452209
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||  |    
T  5452323 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaaca 5452224  T
Q  269 tattgttcatctcca 283  Q
    ||||| |||||||||    
T  5452223 tattgatcatctcca 5452209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11338371 - 11338250
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||   |||  |||    
T  11338371 aatctcaacatgactatgatgcatcgacatgtacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaa-ttccatatat 11338273  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11338272 attgatcatctccacaacatttg 11338250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 21392624 - 21392698
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  21392624 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaactcaaggtcgtcac 21392698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 24470736 - 24470804
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  24470736 actcatgtcatgatatgcacctattgacccatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 24470804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21933773 - 21933663
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21933773 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 21933675  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  21933674 ctccacaacatt 21933663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21939943 - 21939833
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21939943 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 21939845  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  21939844 ctccacaacatt 21939833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 35580919 - 35581029
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35580919 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 35581017  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  35581018 ctccacaacatt 35581029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37010777 - 37010667
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37010777 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 37010679  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  37010678 ctccacaacatt 37010667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1170395 - 1170321
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1170395 aataagactcatgtcatgatattcacctattgatacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 1170321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Original strand, 7424347 - 7424452
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  7424347 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 7424445  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  7424446 caacatt 7424452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 11582340 - 11582414
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  11582340 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 11582414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25211664 - 25211623
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211664 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25211623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25275816 - 25275775
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25275816 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25275775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Original strand, 27008518 - 27008781
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  27008518 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgaggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 27008617  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||   |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  27008618 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagtaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 27008707  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27008708 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccac 27008781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9732443 - 9732170
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||||||    
T  9732443 ataagactcatgttatgatatgcacttattaacacatagatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtat 9732344  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||  | | ||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||       
T  9732343 gtaag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-tatcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgta 9732255  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  9732254 atgactcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 9732170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21933931 - 21933855
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  21933931 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 21933855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21940101 - 21940025
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  21940101 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 21940025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 23510416 - 23510468
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23510416 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgttgtacc 23510468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 35580761 - 35580829
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  35580761 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 35580829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 37010935 - 37010859
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  37010935 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 37010859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21653126 - 21653052
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  21653126 aataagactcgtgtcatgatatgcacttatcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatgtcctcaaggtcgtcac 21653052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 10852 - 10925
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  10852 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 292
Target Start/End: Original strand, 24473191 - 24473228
Alignment:
Q  255 acaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24473191 acaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 24473228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 29192394 - 29192321
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  29192394 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 29192321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21075260 - 21075184
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  21075260 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 21075184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 11015 - 11125
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  11015 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 11113  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  11114 ctccacaacatt 11125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5452513 - 5452429
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt 84  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5452513 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacatt 5452429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25901939 - 25901837
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25901939 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 25901841  T
Q  279 ctcc 282  Q
    ||||    
T  25901840 ctcc 25901837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18779603 - 18779498
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  18779603 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatatatgacgacaaccaattatattgattatctcca 18779505  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  18779504 caacatt 18779498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29192203 - 29192122
Alignment:
Q  209 actcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  29192203 actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 29192122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17473626 - 17473573
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17473626 aataagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtacc 17473573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 23453378 - 23453454
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23453378 aataagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23453454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 23460622 - 23460698
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23460622 aataagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23460698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 23464883 - 23464959
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23464883 aataagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 7424109 - 7424156
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7424109 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 7424156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25902097 - 25902021
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |   ||||||||||| |||||||    
T  25902097 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctataaggtcgtcaccttcgatg 25902021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 37051491 - 37051559
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  37051491 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37051559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21235178 - 21235131
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  21235178 actcatgttatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtacc 21235131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Original strand, 23492722 - 23492781
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23492722 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattt 23492781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 20615119 - 20615159
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 53  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20615119 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatg 20615159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 74)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5676281 - 5675990
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  5676281 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccgtatcacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaaca 5676182  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5676181 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctctgaagtaagagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatgaacat 5676082  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5676081 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 5675990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 35053325 - 35053616
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  35053325 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 35053424  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35053425 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcataagtaaaagagttcaacccttctacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacat 35053524  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35053525 gtaacaagactcaataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttg 35053616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 41217948 - 41218227
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41217948 actcatgtcatgatatgcacctatcgatagatatatacatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 41218047  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41218048 gttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaatagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgcaacaagactc 41218147  T
Q  213 gataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41218148 gataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacattatttg 41218227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37846140 - 37845855
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||    
T  37846140 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgaatcaaacacatcgtat 37846041  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  37846040 gtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcagcccttttacaactacaatttcaacatgactatgatgcatggacatgtaaca 37845941  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37845940 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttg 37845855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 20444236 - 20444520
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| | |||| | ||| |||    
T  20444236 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgaatcaaacacatcttat 20444335  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20444336 gtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaaca 20444435  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20444436 ag-ctttataatgcgacaacaatcataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttg 20444520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 20929969 - 20930247
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgt 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||||    
T  20929969 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgtaacaactcaacatcgt 20930068  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||         ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20930069 atgtaagggttcacccccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaaccattttacaac---------aacacgactatgatgcatggacatgtaa 20930159  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20930160 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 20930247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 20530000 - 20530285
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaca-ttcgatgcaacaaaaatatcgta 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  || |||||| |  ||||||| | |||| | ||| ||    
T  20530000 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcgtcccccttcgatgaatcaaacacatctta 20530099  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20530100 tgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaac 20530199  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20530200 aag-ctttataatgcgacaacaatcataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttg 20530285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44036569 - 44036289
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |  |||| |||||   || |||    
T  44036569 caaataagactcatgtcatgatatgcacttactgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctctgatggaacaactcaacatc 44036470  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  | ||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||  ||||||    
T  44036469 gtatgtaagggtccacccctgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatagacatgt 44036379  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036378 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatgtataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 44036289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 291
Target Start/End: Original strand, 20526725 - 20526891
Alignment:
Q  125 cttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgaca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20526725 cttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccattttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaca 20526824  T
Q  225 acaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20526825 acaatcacaactttctccacaatatataggacaccacccagttatattgttcatctccacatgattt 20526891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38035264 - 38035101
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38035264 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgttttacataatctc 38035165  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  38035164 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcgacatgactatgatgcatgcacat 38035101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13378405 - 13378241
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13378405 tgacacctaaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 13378306  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13378305 ccgaagtaaaagagcttaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 13378241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 22226480 - 22226753
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| | ||||||||    
T  22226480 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatg 22226578  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||| |||||||  |     
T  22226579 taagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgtataag 22226669  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22226670 gactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 22226753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Original strand, 22352622 - 22352900
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || |||    
T  22352622 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatc 22352720  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||         ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22352721 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaagagagctcaacccttttacaac---------aacacgactatgatgcatggacatgt 22352811  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22352812 ataaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 22352900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36357981 - 36357820
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36357981 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcactccagtcttacataatct 36357882  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaa 197  Q
    | ||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  36357881 ctgaagtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgaa 36357820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Original strand, 19601703 - 19601836
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19601703 tgacatataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatca 19601802  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac 170  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19601803 acgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac 19601836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15863099 - 15862823
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| | |    
T  15863099 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacaca 15863001  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||         ||| ||||||||||| ||||    
T  15863000 tcgtatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaacaaca--------tcgactatgatgcatggacat 15862913  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  15862912 gtataaggactcgataatgcgacaacaatcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgaatatctccacaacatt 15862823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37235606 - 37235353
Alignment:
Q  36 ttgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37235606 ttgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatttaagatttcacatccgtcttacataatc 37235507  T
Q  136 tccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa--caagactcgataatgcgacaaca-atca 231  Q
     ||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||  ||   ||||||||| ||||| | | ||  |||    
T  37235506 accgaagtaaaagagctcaaccattttatagctacaagactcaacatgattatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaagatcacctca 37235407  T
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
     ||||||||| || || || ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  37235406 taattttcacaacaatttaaaggacaacttccaaatatattgatcatctccaca 37235353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9785743 - 9785623
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9785743 atctcaacacgactatgatgtatggacatgtgacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacactcaattatat 9785644  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  9785643 tgttcctctccacatcatttg 9785623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 21858210 - 21858330
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21858210 atctcatcacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatat 21858309  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  21858310 tgtttacctccacatcatttg 21858330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 21193689 - 21193853
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21193689 tgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggttgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 21193788  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  |  | |||||||| |||| || ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21193789 ccgaagtaaaagagcacccctcttttacagctacaaaactcaacatgactatgatgcatggacat 21193853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22250459 - 22250343
Alignment:
Q  176 caacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgtt 275  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22250459 caacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggactacacccaattatattgtt 22250360  T
Q  276 catctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||    
T  22250359 catctccacatcatttg 22250343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 21716858 - 21716980
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21716858 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 21716957  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  21716958 attgctcatctccacaacatttg 21716980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35523931 - 35523809
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35523931 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 35523832  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  35523831 attgatcatctccacaacatttg 35523809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2422482 - 2422368
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2422482 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattat 2422383  T
Q  270 attgttcatctccac 284  Q
    |||| | ||||||||    
T  2422382 attgattatctccac 2422368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8539577 - 8539490
Alignment:
Q  63 atcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8539577 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 8539490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8604816 - 8604729
Alignment:
Q  63 atcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8604816 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 8604729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22407706 - 22407584
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22407706 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 22407607  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  22407606 attgattatctccacaacatttg 22407584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5769856 - 5769744
Alignment:
Q  39 acacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcc 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5769856 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcacc 5769757  T
Q  139 gaagtaaaagagt 151  Q
    |||||||||||||    
T  5769756 gaagtaaaagagt 5769744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 49966301 - 49966423
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  49966301 aatctcaacactactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattat 49966400  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  49966401 attgattatctccacaacatttg 49966423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 41210699 - 41210820
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  41210699 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattata 41210798  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  41210799 ttgattatctccacaacatttg 41210820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 282
Target Start/End: Original strand, 18506010 - 18506121
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18506010 atctcaacacaactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattata 18506109  T
Q  271 ttgttcatctcc 282  Q
    ||| | ||||||    
T  18506110 ttgattatctcc 18506121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5472027 - 5471863
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac---attcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataat 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5472027 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccccat--gatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattat 5471930  T
Q  135 ctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    | ||||| ||||||||| |  | | ||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  5471929 caccgaaataaaagagtacccctcatttacaacttcaagactcaacatgactatgatgcatggacat 5471863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 20821477 - 20821590
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  20821477 gacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacgcccgtcttacattatcgc 20821576  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  20821577 cgaagtaaaagagt 20821590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 41213310 - 41213197
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  41213310 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatacaataaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcat 41213211  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  41213210 cgaagtaaaagagt 41213197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 45050185 - 45050455
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| |||| | ||||| | |||   || |||| |    
T  45050185 ataagactcatgttatgatatgcacttgttgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccgatgga-caagtcaacatcgca 45050283  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||||||       
T  45050284 tgtaaggggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtgta 45050370  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45050371 aggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 45050455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2422813 - 2422733
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2422813 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcac 2422733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20895203 - 20895083
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  20895203 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattat 20895104  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  20895103 attgattatctccacaacatt 20895083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 17147279 - 17147549
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  |    
T  17147279 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgatt 17147378  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||      
T  17147379 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtata 17147468  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  17147469 aggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca 17147549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 22034351 - 22034620
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  22034351 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 22034450  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  22034451 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 22034540  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22034541 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 22034620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51657835 - 51657720
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||    
T  51657835 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatat 51657736  T
Q  270 attgttcatctccaca 285  Q
    |||| |||||||||||    
T  51657735 attgatcatctccaca 51657720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22145035 - 22144923
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |    
T  22145035 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaaaatttcacactcgtcttacattatcac 22144936  T
Q  138 cgaagtaaaagag 150  Q
    |||||||||||||    
T  22144935 cgaagtaaaagag 22144923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 9785973 - 9785899
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9785973 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 9785899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Original strand, 22365421 - 22365527
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22365421 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcca 22365520  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  22365521 caacatt 22365527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 283
Target Start/End: Original strand, 27673505 - 27673619
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgta-acaagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  27673505 aatctcaacacgactatgatgcatgaacatgtagtaaagactcgataatgcgacaccacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaata 27673604  T
Q  269 tattgttcatctcca 283  Q
    ||||| |||||||||    
T  27673605 tattgatcatctcca 27673619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 49966077 - 49966151
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49966077 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 49966151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 51451274 - 51451384
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51451274 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 51451373  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  51451374 tccacaacatt 51451384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2422588 - 2422531
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422588 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa 2422531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22250702 - 22250622
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  22250702 tttccaaatatgacacatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22250622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22836761 - 22836645
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  22836761 aatctcaacacgactatgatgcatgaacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcataattttcacaacaatatagaggacaacttccaaata 22836662  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  22836661 tattgatcatttccaca 22836645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7642093 - 7641983
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7642093 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatgat 7641995  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  7641994 ctccacaacatt 7641983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20895464 - 20895390
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  20895464 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 20895390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22407968 - 22407894
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22407968 aataagacttatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 22407894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35935239 - 35935166
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  35935239 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 35935166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 22365184 - 22365252
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  22365184 actcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22365252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 17003486 - 17003596
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17003486 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 17003584  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  17003585 ctccacaacatt 17003596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20826883 - 20826614
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  ||||||    
T  20826883 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 20826784  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  20826783 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 20826694  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  20826693 tcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 20826614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 17003328 - 17003396
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  17003328 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 17003396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20956477 - 20956361
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| || ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||    
T  20956477 aatcttaacacgattatgatgcatggacatgtagcaaagacttgataatgcgccatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaata 20956378  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20956377 tattgatcatctccaca 20956361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21651671 - 21651623
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651671 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 21651623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 41392964 - 41393223
Alignment:
Q  22 atgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgtatgtaagatttcaca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||  ||||   || |||| |||||||   ||||     
T  41392964 atgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacc 41393061  T
Q  120 cccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataat 218  Q
     | | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||    
T  41393062 tctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataat 41393151  T
Q  219 gcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||| |||||| | ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41393152 gcgacaacaattcacaa-tctcaactcagtatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 41393223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18602705 - 18602436
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  18602705 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 18602606  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  18602605 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-cgtcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 18602516  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  18602515 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 18602436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18061105 - 18061000
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  18061105 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggactacacccaattatattgattatatcca 18061007  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  18061006 caacatt 18061000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21651432 - 21651327
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  21651432 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 21651334  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  21651333 caacatt 21651327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20956703 - 20956627
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  20956703 aataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 20956627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22836987 - 22836911
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  22836987 aataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 22836911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 22029358 - 22029469
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacc-caattatattgttca 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  22029358 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgatta 22029456  T
Q  278 tctccacatcatt 290  Q
    |||||||| ||||    
T  22029457 tctccacaacatt 22029469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 51451116 - 51451184
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  51451116 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 51451184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5073962 - 5073693
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  ||||||    
T  5073962 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 5073863  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| |||||||||||  |||||   | |||    
T  5073862 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggtcatgtgtaatgac 5073773  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  5073772 tcgataatgcgacaccaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 5073693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7642249 - 7642176
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  7642249 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7642176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 21857977 - 21858030
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21857977 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtacc 21858030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20122094 - 20122050
Alignment:
Q  246 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  20122094 atatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 20122050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 29137323 - 29137370
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29137323 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 29137370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 27673285 - 27673355
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcactta--ttgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  27673285 actcatgtcatgatatgcacctagtttgacacatatatgcatgtggtaccaactcacttcaagggcgtcac 27673355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38035070 - 38035010
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38035070 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 38035010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 12684 - 12975
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12684 tttccaaataggactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 12783  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12784 tcgtatgtaagatttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaagccttttatgactacaatctcaacacgactatgatgcatggacat 12883  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 12975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 6877927 - 6878218
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  6877927 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatttggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 6878026  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  6878027 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacaa 6878126  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6878127 gtaacaagactcgataatgcgaccacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcctttg 6878218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 22861973 - 22862263
Alignment:
Q  2 ttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatat 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22861973 ttccaaataagaatcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacgagatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 22862072  T
Q  102 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatg 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  22862073 cgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacaactataatgcatggacatg 22862172  T
Q  202 taacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22862173 taacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgtttatctccacatcatttg 22862263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 8886631 - 8886916
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8886631 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 8886730  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  8886731 gtaagagttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatacatggacatgtaaca 8886830  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8886831 agactcgataatgcgataacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 8886916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 25600459 - 25600737
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatt 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25600459 tcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccatattacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatt 25600558  T
Q  115 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25600559 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacgagactatgatgcatggacatgtaacaagactcga 25600658  T
Q  215 taatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  25600659 taatgcgacaacaatccacaatttttaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatttg 25600737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Original strand, 15631885 - 15632168
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||  |   || ||| |    
T  15631885 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgactcaaaaatgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcacctttgatgcctcttgaacatcat 15631984  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15631985 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagcttaacccttttacaactacaaatacaacacgactatgatgcatggacatgtaa 15632084  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatca 288  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15632085 taagactcgataatgcgacaacaatcacaattctcaacacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatca 15632168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 292
Target Start/End: Original strand, 27260130 - 27260359
Alignment:
Q  64 tcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaaccctttta 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27260130 tcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 27260229  T
Q  164 caactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacc 262  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  27260230 caactacaaacacaacatgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcc 27260329  T
Q  263 caattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27260330 caattatattgaccatctccacaacatttg 27260359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 22282614 - 22282894
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  22282614 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 22282713  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||    
T  22282714 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaact---------acacgactatgatgcatggacatgt 22282804  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22282805 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccataatatataggacagcacctaattatattgttcatctccacatcatttg 22282894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Original strand, 22273381 - 22273659
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  22273381 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 22273480  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||| |         ||| ||||||||||| ||||||    
T  22273481 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctcttaagtaaaagagctcaactcttttacaactata---------cgactatgatgcatggacatgt 22273571  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273572 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 22273659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43644635 - 43644359
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||| |||| || | |||  | |||||||    
T  43644635 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacgcatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcaccttcgttgaatcaagcacatcgtat 43644536  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| || |||||||    
T  43644535 gtaagggttcacacccgcctcacataatcttcgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacttgtaaca 43644445  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644444 aaactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 43644359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19435146 - 19434861
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatc 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19435146 caaataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatc 19435047  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatg 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||     
T  19435046 gtacgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagt-aaagagctcaaccctttttcaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacata 19434948  T
Q  202 taa--caagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
     ||   ||||||||| ||||| | | ||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  19434947 caagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccaca 19434861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 25304089 - 25304253
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25304089 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccttcttacataatct 25304188  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  25304189 ccgaagtaaaatagcttaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 25304253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4930 - 4795
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4930 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacccccgtcttacataatct 4831  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa 172  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4830 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23823162 - 23822998
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23823162 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatct 23823063  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||||    
T  23823062 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaaaatgactatgatgcatggacat 23822998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23825106 - 23824942
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23825106 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatct 23825007  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||||    
T  23825006 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaaaatgactatgatgcatggacat 23824942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23832241 - 23832077
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23832241 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatct 23832142  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||||    
T  23832141 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaaaatgactatgatgcatggacat 23832077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 19658471 - 19658634
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19658471 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctt 19658570  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19658571 cgaagtaaaagagctcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 19658634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24089047 - 24088851
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24089047 aataagactcgtgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgt 24088948  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||||||| ||||    
T  24088947 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgacgtaaaagagctcaacccttttacaactacaaaacccaacatgactatgatgcatggacat 24088851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19670783 - 19670620
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19670783 tgacacataaatgcatgtggtgccgaatctcctcaaggtcgtcaccttcgatgcatcaagac-atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 19670685  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19670684 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 19670620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24296226 - 24296062
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  24296226 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaactaaaacatcgtatgtaagatttcacccaagtcttacataatct 24296127  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  24296126 ccgaagtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 24296062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Original strand, 43641348 - 43641505
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43641348 gacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaataaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcac 43641447  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcat 194  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  43641448 cgaagtaaaagagctcaacccttttacggctacaagactcaacatgactatgatgcat 43641505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9654319 - 9654212
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9654319 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatatagagcaacacccaattatattgttcatctccac 9654220  T
Q  285 atcatttg 292  Q
    ||||||||    
T  9654219 atcatttg 9654212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 269841 - 269963
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  269841 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 269940  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||    
T  269941 attgatcacctccacaacatttg 269963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22691456 - 22691334
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22691456 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattat 22691357  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  22691356 attgatcatctccacaacatttg 22691334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22696103 - 22695981
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22696103 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattat 22696004  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  22696003 attgatcatctccacaacatttg 22695981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 21140376 - 21140651
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattc-gatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||| ||    | |||||||    
T  21140376 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtat 21140475  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||  | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||         ||| |||||||||||||||||||      
T  21140476 gtaaggct-cacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacat--------cgactatgatgcatgaacatgtata 21140565  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21140566 agaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 21140651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4449735 - 4449627
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  4449735 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgtaacgagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattat 4449636  T
Q  270 attgttcat 278  Q
    |||| ||||    
T  4449635 attgatcat 4449627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3800765 - 3800495
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  3800765 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 3800666  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||   ||||     ||||||||||| |||||||  | |||    
T  3800665 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa---caac-----tatgatgcatggacatgtataaggac 3800576  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  3800575 tcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 3800495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 22692786 - 22693028
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatc 102  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || |||    
T  22692786 caaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatc 22692884  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  22692885 gtatgtaagggttcacccccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgt 22692975  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatatagg 254  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||    
T  22692976 ataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg 22693028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 22697433 - 22697675
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatc 102  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || |||    
T  22697433 caaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatc 22697531  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  22697532 gtatgtaagggttcacccccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgt 22697622  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatatagg 254  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||    
T  22697623 ataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg 22697675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36892215 - 36892094
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  36892215 aatctcaacacaactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattat 36892116  T
Q  270 attgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  36892115 attgattatctccacaacattt 36892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21276184 - 21275909
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattc-gatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||| ||    | |||||||    
T  21276184 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtat 21276085  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||  | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||          ||| ||||||||||| |||||||      
T  21276084 gtaaggct-cacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacgt--------cgactatgatgcatggacatgtata 21275995  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21275994 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 21275909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12643690 - 12643409
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    |     
T  12643690 tttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcac 12643591  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    |||| |||||||   || |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||    
T  12643590 atcgaatgtaagggctcgcacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggac 12643501  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||   | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12643500 atgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 12643409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24687321 - 24687051
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  24687321 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaactttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 24687222  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  24687221 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacaacaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 24687131  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  24687130 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 24687051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 34822702 - 34822971
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  34822702 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 34822801  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  34822802 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 34822891  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34822892 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 34822971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22581440 - 22581324
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca-agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||    
T  22581440 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacagagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatata 22581341  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22581340 tattgatcatctccaca 22581324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 28972694 - 28972810
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||    
T  28972694 aatctcaacacgactatgatgcatagacatgtaacaaagactcgataatgcgacaccaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacatccatata 28972793  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28972794 tattgatcatctccaca 28972810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 7320141 - 7320264
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  7320141 aatctcaacacgactatgatacatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 7320240  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||    
T  7320241 tattgataatctccacaacatttg 7320264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 12726557 - 12726826
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  12726557 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 12726656  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  12726657 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 12726746  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12726747 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 12726826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24572898 - 24572775
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||    
T  24572898 aatctcaacatgactatgatgcatgaacatgtaacaaagactcgataatgcgataacacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatata 24572799  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24572798 tattgatcatctccacaacatttg 24572775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 18534351 - 18534464
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  18534351 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaacgtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattgcacactcgtcttacattatcac 18534450  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  18534451 cgaagtaaaagagt 18534464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 24272580 - 24272689
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  24272580 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatcac 24272679  T
Q  138 cgaagtaaaa 147  Q
    ||||||||||    
T  24272680 cgaagtaaaa 24272689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 8942145 - 8942420
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  |    
T  8942145 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcacttggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgatt 8942244  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||      
T  8942245 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtata 8942334  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8942335 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 8942420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22137468 - 22137341
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  22137468 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccatcttacattatcac 22137369  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttaca 165  Q
    |||| ||||||||  || ||||||||||    
T  22137368 cgaaataaaagagcacatcccttttaca 22137341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 24966951 - 24967073
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24966951 aatctcaacacgactatgattcatggacatgtatacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattat 24967050  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  24967051 attgattatctccacaacatttg 24967073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12637822 - 12637547
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| ||    
T  12637822 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaat 12637723  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||      
T  12637722 gtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtata 12637633  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacc-caattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12637632 aggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggataacaccaccattatattgattatctccacaacatt 12637547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14908090 - 14907822
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaa 110  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | ||||| | |||   || |||| ||||||    
T  14908090 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgcatgtaa 14907992  T
Q  111 gatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaaga 209  Q
    |  | |||  | | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | ||    
T  14907991 ggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaagga 14907903  T
Q  210 ctcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14907902 ctcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 14907822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Original strand, 721125 - 721240
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| |||    
T  721125 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcactacacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatat 721224  T
Q  270 attgttcatctccaca 285  Q
    |||| |||||||||||    
T  721225 attgatcatctccaca 721240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 23773041 - 23773310
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  23773041 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 23773140  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  23773141 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 23773230  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  23773231 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcgacaacatt 23773310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 20013785 - 20013895
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20013785 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 20013884  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  20013885 tccacaacatt 20013895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 23818842 - 23818952
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23818842 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 23818941  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  23818942 tccacaacatt 23818952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24828218 - 24827952
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||| | |||||  ||||   || ||||||    
T  24828218 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggttgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgta 24828120  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||          |  |||||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||||          ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  24828119 tgtaag---------gctccttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttatacaa---------gaactcgactatgatgcatggacatgtata 24828038  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24828037 agaactcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 24827952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 36892434 - 36892360
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36892434 aataagactcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 36892360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Original strand, 461406 - 461507
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  461406 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 461505  T
Q  284 ca 285  Q
    ||    
T  461506 ca 461507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5889790 - 5889679
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5889790 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 5889691  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  5889690 ctccacaacatt 5889679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25877692 - 25877618
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  25877692 aataagactcatatcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 25877618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24832670 - 24832618
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24832670 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 24832618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11232745 - 11232635
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11232745 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 11232647  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  11232646 ctccacaacatt 11232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22514592 - 22514482
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22514592 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 22514494  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  22514493 ctccacaacatt 22514482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28777193 - 28777083
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28777193 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 28777095  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  28777094 ctccacaacatt 28777083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20628897 - 20628783
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||| | ||||||||||| | |||||||||||    
T  20628897 atcttaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattata 20628798  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  20628797 ttgattatctccaca 20628783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Original strand, 25211379 - 25211429
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggta 58  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211379 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggta 25211429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5889948 - 5889872
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  5889948 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 5889872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11232903 - 11232827
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  11232903 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 11232827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22514750 - 22514674
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  22514750 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 22514674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28777351 - 28777275
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  28777351 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 28777275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22787542 - 22787428
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||    
T  22787542 tctcaacacgactatgatgcatggatatgttgcaaagactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatata 22787443  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| |||||||||||    
T  22787442 ttgatcatctccaca 22787428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 461161 - 461214
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  461161 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 461214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19888435 - 19888362
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  19888435 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 19888362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25877395 - 25877335
Alignment:
Q  230 cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  25877395 cacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 25877335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17398248 - 17397979
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  17398248 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 17398149  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  17398148 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catccattttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 17398059  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  17398058 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaacatt 17397979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19888272 - 19888162
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  19888272 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 19888174  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  19888173 ctccacaacatt 19888162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25877473 - 25877423
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcg 221  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25877473 aatctccacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgacaatgcg 25877423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9654565 - 9654512
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9654565 aataagactcatggcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtacc 9654512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20629092 - 20629039
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20629092 aataagactcttgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 20629039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22581664 - 22581588
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  22581664 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacataaatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 22581588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 24966720 - 24966765
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24966720 tcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 24966765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 20013627 - 20013695
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  20013627 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 20013695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 23818684 - 23818752
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  23818684 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 23818752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31908 - 31830
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacat 83  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  31908 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcacat 31830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23822967 - 23822907
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23822967 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 23822907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23824911 - 23824851
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23824911 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 23824851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23832046 - 23831986
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23832046 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 23831986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 102)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 3893582 - 3893872
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3893582 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 3893681  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3893682 tcgtatgtaagagttcacacctgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacat 3893781  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3893782 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatatatgacaacacccatttatattgttcatctccacaacattt 3893872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 112973 - 112683
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtc---acattcgatgcaacaaaaatat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||    
T  112973 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattaacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 112874  T
Q  102 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatg 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  112873 cgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaatccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatgaacatg 112774  T
Q  202 taacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112773 taacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacatcacccaattatattgttcatctccacatcatttg 112683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45453928 - 45453642
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||    
T  45453928 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcatcaccttcgatgcaacaaaa---tcgt 45453832  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  45453831 atgtaagatttcacatccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaa 45453732  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaac-acccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453731 caagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacttcccaattatattgttcatctccacatcatttg 45453642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26071937 - 26071651
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26071937 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 26071838  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  26071837 gtaagatttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaa 26071738  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26071737 ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttg 26071651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26095724 - 26095438
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26095724 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 26095625  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  26095624 gtaagatttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaa 26095525  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26095524 ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttg 26095438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 12753380 - 12753659
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12753380 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatttaaga 12753479  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12753480 tttcacacccgtcttacataatttccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactc 12753579  T
Q  213 gataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12753580 gataatgcgacaacaattcacaa-tttcaccacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 12753659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1938446 - 1938157
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| || ||||  | ||| | |    
T  1938446 tttctaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctttgatgata-aaacaca 1938348  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  1938347 tcgtatgtaagggttcacacccaccttacataatctccgaagtaaaagagttcaactcttttacaactacaatctcaacaagactatgatgcatggacat 1938248  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938247 gtaataagactcgataatgcgacaacaat-tcaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 1938157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32496221 - 32495941
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  32496221 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 32496122  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||    
T  32496121 gtatgtaagggttcacccccgcgttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgt 32496031  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32496030 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 32495941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15762032 - 15761756
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||    
T  15762032 caaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgt 15761934  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15761933 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaact---------acacgactatgatgcatggacatgtaa 15761843  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15761842 caagactcgataatgcgacaacaatcacaa-tttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcctcatcatttg 15761756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 3058582 - 3058825
Alignment:
Q  39 acacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  3058582 acacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttatataatctcc 3058680  T
Q  139 gaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaatttt 238  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058681 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaatttt 3058771  T
Q  239 caccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058772 ctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatcatttg 3058825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 292
Target Start/End: Original strand, 125391 - 125604
Alignment:
Q  71 aaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaacta 169  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  125391 aaggtcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggtttacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacta 125490  T
Q  170 caatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||         ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  125491 ca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattat 125581  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  125582 attgttcatctccacatcctttg 125604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15914076 - 15913912
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914076 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 15913977  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  15913976 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 15913912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 2027151 - 2027335
Alignment:
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaaca 199  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| |||||||| || |||    
T  2027151 atcgtatgtaagggttcacccccgacttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcgtggaca 2027241  T
Q  200 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaa-ttttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027242 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 2027335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 13388488 - 13388652
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13388488 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacagaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtattacataatca 13388587  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13388588 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactataagactcaacatgactatgatgcatggacat 13388652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9058313 - 9058024
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9058313 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaac 9058214  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||  ||||||  || ||||||||||| ||    
T  9058213 atcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaacccttttaaagctacaagactcaacttgactatgatgcatggac 9058114  T
Q  199 atgtaa--caagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||  ||   ||||||||| ||||| | | ||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  9058113 atacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccaca 9058024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 292
Target Start/End: Original strand, 369388 - 369665
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||||||    
T  369388 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtat 369487  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||      
T  369488 gtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacat--------cgactatgatgcatggacatgtata 369577  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369578 aagactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 369665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 13376195 - 13376324
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13376195 tgacacataaatgcatatggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcaca-ccgtcttacataatca 13376293  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaac 167  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13376294 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 13376324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 7291511 - 7291631
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7291511 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatat 7291610  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  7291611 tgttcatctccacaacatttg 7291631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18255484 - 18255209
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || ||||||    
T  18255484 ataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgta 18255386  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||         ||||||| ||||||||||| |||||||      
T  18255385 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagcgcttagcccttttacaac---------aacacgactatgatgcatggacatgtata 18255295  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  18255294 aggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatccccacaacatt 18255209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 142285 - 142405
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  142285 tctcaacacggctatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatat 142384  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  142385 tgttcatctccacatcatttg 142405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2192189 - 2192082
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2192189 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacagcaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 2192090  T
Q  285 atcatttg 292  Q
    | ||||||    
T  2192089 aacatttg 2192082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12249621 - 12249499
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||    
T  12249621 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaactaccaaatat 12249522  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  12249521 attgatcatctccacaacatttg 12249499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 44863899 - 44864021
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44863899 aatctcaacacgactatgatgcatggacatatacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 44863998  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  44863999 attgattatctccacagcatttg 44864021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12545220 - 12545099
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  12545220 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattat 12545121  T
Q  270 attgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  12545120 attgattatctccacaacattt 12545099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 2436136 - 2436401
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||| || ||||  | ||| | |||  |||||||     
T  2436136 actcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaaaaaggtcgtcacctttgatgata-aaacacatcacatgtaagg 2436234  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
      |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||         ||| ||||||||||| |||||||  | |||||    
T  2436235 ggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaacaacat--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactc 2436322  T
Q  213 gataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  2436323 gataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 2436401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15952759 - 15952481
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||     
T  15952759 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaagtctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatca 15952660  T
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
     |||||||   ||||| | | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||        ||| ||||||||||| ||||||    
T  15952659 aatgtaagggctcacatctgccttacaataatctca-aagtaaaagagttcaacc-ttttacaacaacaa--------cgactatgatgcatggacatgt 15952570  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15952569 ataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 15952481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Original strand, 11285871 - 11285989
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattg 273  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||| |||||||    
T  11285871 tcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggagaacttccaaatatattg 11285970  T
Q  274 ttcatctccacatcatttg 292  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  11285971 atcatctccacaacatttg 11285989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13867582 - 13867460
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  13867582 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacttcaatatatagaacaacacccaattat 13867483  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  13867482 attgattatctccacaacatttg 13867460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15823918 - 15823796
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15823918 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaattaacaatcttcacctcaatataaaggacaacacccaattat 15823819  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  15823818 attgattatctccacaacatttg 15823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20587253 - 20587140
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20587253 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactcatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 20587154  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    |||| |||||||||    
T  20587153 cgaaataaaagagt 20587140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 47288433 - 47288553
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  47288433 tctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatat 47288532  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || | ||||||||| ||||||    
T  47288533 tgattatctccacaacatttg 47288553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8565221 - 8565058
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8565221 gacaaatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaataaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 8565122  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||    | ||||||||||  ||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  8565121 cgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagtctcaacatgactatgatccatgaacat 8565058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9322726 - 9322594
Alignment:
Q  22 atgatatgcacttatt---gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcac 118  Q
    |||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9322726 atgatatgcacttaatccggacacatatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcac 9322627  T
Q  119 acccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  9322626 acccgtcttacattatcactgaagtaaaagagt 9322594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26010848 - 26010578
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  26010848 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtgccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 26010749  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  26010748 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttacagcaacat--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 26010658  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26010657 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 26010578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 28718978 - 28719091
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  28718978 gacacatatatgcatgtggtaccaagtcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatatcacatgtaagatttcacacctgtcttacattatcac 28719077  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||| ||||    
T  28719078 cgaagtaaacgagt 28719091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 10988119 - 10988388
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  10988119 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 10988218  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  10988219 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaaggac 10988308  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10988309 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 10988388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 13757086 - 13757351
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  13757086 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 13757185  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  13757186 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atccattttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 13757275  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  13757276 tcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca 13757351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49049310 - 49049195
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||   ||| ||    
T  49049310 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaactcacaatttccaccacaatataaaggacaactttcaaata 49049211  T
Q  269 tattgttcatctccac 284  Q
    | ||| ||||||||||    
T  49049210 tgttgatcatctccac 49049195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11582347 - 11582233
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  11582347 atctcaactcgactatgatgcatggacatgtataaagactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattata 11582248  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  11582247 ttgattatctccaca 11582233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15443056 - 15442946
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15443056 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 15442957  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  15442956 tccacaacatt 15442946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Original strand, 15926038 - 15926144
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15926038 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcca 15926137  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  15926138 caacatt 15926144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15824178 - 15824105
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca 80  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15824178 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 15824105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Original strand, 36051335 - 36051436
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  36051335 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 36051434  T
Q  284 ca 285  Q
    ||    
T  36051435 ca 36051436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 123000 - 123052
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123000 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 123052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2192427 - 2192380
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2192427 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 2192380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 7291283 - 7291330
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7291283 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 7291330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 142062 - 142136
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  142062 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcaacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 142136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 11285641 - 11285715
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  11285641 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaattaactcaaggtcgtcac 11285715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13867762 - 13867688
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13867762 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 13867688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15525977 - 15525871
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15525977 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacgattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcca 15525878  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  15525877 caacatt 15525871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Original strand, 16210438 - 16210552
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16210438 atctcaactcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattata 16210537  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  16210538 ttgattatctccaca 16210552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16571601 - 16571511
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaac 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16571601 aatctcaacacaaatatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaac 16571511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Original strand, 16594061 - 16594151
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaac 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16594061 aatctcaacacaaatatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaac 16594151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 44863637 - 44863711
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44863637 aataagactcatgtcatgatattcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 44863711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 13273402 - 13273514
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatatt 272  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  13273402 tcaacacgactatgatgcatggacatataacaaagactcgataatgcgacattacttcacaactttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatt 13273501  T
Q  273 gttcatctccaca 285  Q
    | |||||||||||    
T  13273502 gatcatctccaca 13273514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 15629426 - 15629542
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||    
T  15629426 aatctcaacgcgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacgtcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaactttcaaata 15629525  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  15629526 tattgatcatttccaca 15629542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42057820 - 42057550
Alignment:
Q  12 aactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaa 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  |||||    
T  42057820 aactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaa 42057721  T
Q  111 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaaga 209  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | ||    
T  42057720 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatga 42057631  T
Q  210 ctcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  42057630 ctcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 42057550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 7821590 - 7821700
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7821590 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 7821688  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  7821689 ctccacaacatt 7821700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 7828901 - 7829011
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7828901 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 7828999  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  7829000 ctccacaacatt 7829011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16480657 - 16480610
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16480657 actcatgtcatgatatgcacttattgatacataaatgcatgtggtacc 16480610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27103044 - 27102934
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27103044 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 27102946  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  27102945 ctccacaacatt 27102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27110392 - 27110282
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27110392 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 27110294  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  27110293 ctccacaacatt 27110282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 27175282 - 27175392
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27175282 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 27175380  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  27175381 ctccacaacatt 27175392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38785136 - 38785026
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38785136 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 38785038  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  38785037 ctccacaacatt 38785026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11582609 - 11582535
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||    
T  11582609 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcatttcagggtcgtcac 11582535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13038611 - 13038497
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13038611 atctcaactcgactatgatgcttgaacatgtatagggactcaataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccgattata 13038512  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  13038511 ttgattatctccaca 13038497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13038883 - 13038809
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||    
T  13038883 aataaaactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatttcagggtcgtcac 13038809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13912605 - 13912500
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13912605 tatgatgcatggacatgtataatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcca 13912507  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  13912506 caacatt 13912500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16480428 - 16480323
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16480428 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcca 16480330  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  16480329 caacatt 16480323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18981399 - 18981294
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  18981399 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 18981301  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  18981300 caacatt 18981294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10862365 - 10862248
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaa-ttttcaccacgatatataggacaacacccaatt 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||| |    
T  10862365 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaatactcgataatgcgacatcacctcacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaat 10862266  T
Q  268 atattgttcatctccaca 285  Q
    | |||| |||||||||||    
T  10862265 acattgatcatctccaca 10862248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 2024954 - 2025002
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatg 49  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2024954 tttccaaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatg 2025002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 7821432 - 7821500
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  7821432 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7821500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 7828743 - 7828811
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  7828743 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7828811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15518513 - 15518445
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  15518513 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 15518445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27103202 - 27103126
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  27103202 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 27103126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27110550 - 27110474
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  27110550 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 27110474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 27175124 - 27175192
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  27175124 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27175192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38785294 - 38785218
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  38785294 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 38785218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12545479 - 12545404
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc-ggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12545479 aataagacttatgtcatgatatgcaccaattgacacatatatgcatgtggtaccaaaatcacctcaaggtcgtcac 12545404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25293934 - 25293665
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  25293934 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 25293835  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  25293834 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 25293745  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  25293744 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaacatt 25293665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 151
Target Start/End: Original strand, 4483318 - 4483364
Alignment:
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4483318 atgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagt 4483364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 47288170 - 47288244
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||    
T  47288170 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatcccaaggttgtcac 47288244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 16416970 - 16417043
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  16416970 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16417043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18981638 - 18981590
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18981638 actcatgctatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 18981590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Original strand, 11514788 - 11514890
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11514788 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 11514886  T
Q  279 ctcc 282  Q
    ||||    
T  11514887 ctcc 11514890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 16417133 - 16417243
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  16417133 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 16417231  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  16417232 ctccacaacatt 16417243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30263621 - 30263519
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  30263621 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 30263523  T
Q  279 ctcc 282  Q
    ||||    
T  30263522 ctcc 30263519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 36051089 - 36051142
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36051089 aataagactcatgttatgttatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 36051142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 11514630 - 11514698
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  11514630 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctacaaggtcgtcac 11514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15443214 - 15443138
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  15443214 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 15443138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 15925800 - 15925847
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15925800 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 15925847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 44
Target Start/End: Original strand, 3055222 - 3055253
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacat 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3055222 actcatgtcatgatatgcacttattgacacat 3055253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Original strand, 4483269 - 4483320
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4483269 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacgtcaaggtcgtcaccttcgatg 4483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12249853 - 12249771
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  12249853 tttcgaaataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacttcaaagtcgtcac 12249771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Original strand, 13571525 - 13571607
Alignment:
Q  208 gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  13571525 gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataagacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 13571607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 16210211 - 16210258
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16210211 actcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcacgtggtacc 16210258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 30263779 - 30263732
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30263779 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtacc 30263732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Original strand, 19066193 - 19066262
Alignment:
Q  95 aaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttac 164  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||  || |||||||||    
T  19066193 aaaacatcctatgtaagatttcacgtccgtcttacattttcgccgaagtaaaagagcacaccccttttac 19066262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 49049528 - 49049452
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  49049528 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 49049452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 13273171 - 13273246
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca 80  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  13273171 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtca 13273246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13912769 - 13912701
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  13912769 actcatgctatgatatgcacttacggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 13912701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 91)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8874168 - 8873884
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8874168 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 8874069  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8874068 tcttatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccatttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacat 8873969  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873968 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 8873884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21961231 - 21960951
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21961231 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 21961132  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21961131 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactc 21961032  T
Q  213 gataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21961031 gataatgcaacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcttgattatattgatcatctccacatcatttg 21960951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12901435 - 12901155
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12901435 actcatgtcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaata 12901336  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901335 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaactttactatgatgcatggacatgtaacaagactc 12901236  T
Q  213 gataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12901235 gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacatcatttg 12901155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 109978 - 110255
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||    
T  109978 caaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ataaaacacatcgt 110076  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  110077 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaact---------acacgactatgatgcatggacatgtaa 110167  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110168 taagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 110255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 16521294 - 16521563
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||| | ||||| | |||   || ||||||||||||     
T  16521294 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagccaacatcgtatgtaagg 16521392  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16521393 gttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtaacaagactc 16521483  T
Q  213 gataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521484 gataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 16521563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 292
Target Start/End: Original strand, 34393690 - 34393828
Alignment:
Q  154 aacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatatag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34393690 aacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatatag 34393789  T
Q  254 gacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393790 gacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 34393828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34197813 - 34197649
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34197813 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 34197714  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  34197713 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 34197649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 15211835 - 15212116
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaa-ggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatat 101  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||  || || |||||| |  |||| |||||   || ||    
T  15211835 caaataagactcatgttatgatatgcacttattgagacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaaggacgtcacctctgatggaacaactcaacat 15211934  T
Q  102 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatg 201  Q
    ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||    
T  15211935 cgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatg 15212025  T
Q  202 taacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15212026 taacaagactcgataatgcgacaacaattacaattttatccacaatatataggacaacatccgattatattgttcatcttcacatcatttg 15212116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5684557 - 5684286
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||||||||||    
T  5684557 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtgataccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag 5684458  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| | |||         ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5684457 gactcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagctcaactcttttacagccaca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaagac 5684368  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684367 tcgataatgcgacaacaatcacaattttgtccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 5684286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 27959560 - 27959712
Alignment:
Q  44 taaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27959560 taaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagattttacacccgtcttacataatctccgaagt 27959659  T
Q  144 aaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatg 195  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  27959660 aaaagagttcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatg 27959712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37958705 - 37958541
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37958705 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcatcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 37958606  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  37958605 ctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 37958541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25120663 - 25120505
Alignment:
Q  125 cttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgaca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120663 cttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaca 25120573  T
Q  225 acaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120572 acaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 25120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12245900 - 12245736
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12245900 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatca 12245801  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  12245800 ccgaagtaaaagagctaaacccttttacaaatacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 12245736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 14899969 - 14900247
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  14899969 aataagactcatgtcatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacctccgatgcaacaaaaacatcgt 14900068  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgta 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||| |||| ||    
T  14900069 atgtaagatttcacatccgtcttacaaaatcaccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaagactc-acatgactatgatgcatggacatata 14900167  T
Q  204 ac-aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
     | ||||||||| ||||| ||| | ||| ||| |||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||||||    
T  14900168 gcaaagactcgacaatgcaacatc-atctcaa-tttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccac 14900247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15852964 - 15852829
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  15852964 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaaaaaaaacatcgtatgtaagatttcaccaaagtcttacataatct 15852865  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa 172  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15852864 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 15852829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41167580 - 41167417
Alignment:
Q  39 acacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcc 138  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41167580 acacacaaatacatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgtaacaaaaacatcgtatgtgagatttcacacccgtcttacataatcacc 41167481  T
Q  139 gaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatg 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||| || ||||||||||| |||||    
T  41167480 gaagtaaaagagctcaacccttttacaaccacaagagtcaacatgactatgatgcatggacatg 41167417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Original strand, 9294179 - 9294297
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9294179 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatat 9294278  T
Q  272 tgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9294279 tgttcatctccacatcatt 9294297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 44054575 - 44054697
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44054575 aatctcagcacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 44054674  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  44054675 attgatcatctccacaacatttg 44054697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7133953 - 7133832
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7133953 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattata 7133854  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7133853 ttgttcatctccacatcatttg 7133832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53909274 - 53909153
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  53909274 atcttaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattata 53909175  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  53909174 ttgattatctccacaacatttg 53909153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 19999026 - 19999301
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattc-gatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| ||| ||||| ||    | |||||||    
T  19999026 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtat 19999125  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||      
T  19999126 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtata 19999215  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  19999216 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 19999301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 44345480 - 44345602
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  44345480 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattat 44345579  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  44345580 attgattatctccacatcatttg 44345602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 44054347 - 44054427
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44054347 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggccgtcac 44054427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41258033 - 41257749
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  41258033 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaat 41257934  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacc-cttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaa 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||  || || |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |    
T  41257933 atcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactgaagtagaagag--caccctcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgga 41257836  T
Q  198 catgtaa--caagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 281  Q
    |||  ||   ||||||||| ||||| | | ||  ||| ||||||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  41257835 catacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataattttcacaacaatataaaggataacttccaattatattgatcatctc 41257749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 292
Target Start/End: Original strand, 8373044 - 8373128
Alignment:
Q  208 gactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8373044 gactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcttcacatcatttg 8373128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 33738920 - 33739040
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33738920 tctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatat 33739019  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || | ||||||| | ||||||    
T  33739020 tgattatctccaaaacatttg 33739040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 26678543 - 26678817
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| ||    
T  26678543 ataagactcgtgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcatctttcgatgccacttgcacatcgaat 26678642  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||       
T  26678643 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagaatc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgta 26678732  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26678733 aggactcgataatgcgacaacaatcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 26678817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10239080 - 10238967
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  10239080 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacacatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatcac 10238981  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    | ||||||||||||    
T  10238980 caaagtaaaagagt 10238967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13751795 - 13751686
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattg 273  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  13751795 tcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattg 13751696  T
Q  274 ttcatctcca 283  Q
     |||||||||    
T  13751695 atcatctcca 13751686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 14994699 - 14994970
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || ||||||    
T  14994699 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgta 14994797  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| |     ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  14994798 tgtaaggggtcactcg----ttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtata 14994884  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  14994885 agaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatatagattatctccacaacatt 14994970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 47355824 - 47356095
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||  |    
T  47355824 ataagactcatgttatgatatgaacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgatt 47355923  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||      
T  47355924 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtata 47356013  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacat 286  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  47356014 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacat 47356095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22356217 - 22355948
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  22356217 actcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 22356118  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  22356117 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 22356028  T
Q  211 tcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22356027 tcgataatgcgacaacagttcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattggttatctccacaacatt 22355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45460463 - 45460340
Alignment:
Q  170 caatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45460463 caatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaatta 45460364  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||||    
T  45460363 tattgattatctctacaacatttg 45460340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 290
Target Start/End: Original strand, 10642842 - 10642960
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10642842 tctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 10642941  T
Q  272 tgttcatctccacatcatt 290  Q
    || | ||||||||| ||||    
T  10642942 tgattatctccacaacatt 10642960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5372341 - 5372228
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  5372341 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagacttcacacccgtcttacattatcac 5372242  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  5372241 cgaagtaaaagagt 5372228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 47469977 - 47469867
Alignment:
Q  41 acataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccga 140  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  47469977 acatatatgcatgtggtaccaaataaccccaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccga 47469878  T
Q  141 agtaaaagagt 151  Q
    |||||||||||    
T  47469877 agtaaaagagt 47469867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54119763 - 54119646
Alignment:
Q  174 ctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatatt 272  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  54119763 ctcaacacgactatgatacatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 54119664  T
Q  273 gttcatctccacatcatt 290  Q
    | | ||||||||| ||||    
T  54119663 gattatctccacaacatt 54119646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 14950524 - 14950787
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  14950524 actcatgatatgatatgcacttattgacccataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 14950623  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |         ||||||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  14950624 ggctcatacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagc---------aacacgactatgatgcatggacatgtataaggac 14950712  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14950713 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca 14950787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Original strand, 18167448 - 18167566
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  18167448 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattata 18167546  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | ||||||||| ||||    
T  18167547 ttgattatctccacaacatt 18167566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53706288 - 53706173
Alignment:
Q  178 acacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttc 276  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  53706288 acacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaataataatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 53706189  T
Q  277 atctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| ||||||    
T  53706188 atctccacaacatttg 53706173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12837992 - 12837898
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgta 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12837992 actcatgtcatgatatgcacctatatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgta 12837898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 10487333 - 10487443
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10487333 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 10487432  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  10487433 tccacaacatt 10487443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Original strand, 13245106 - 13245220
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| | |||||||||||    
T  13245106 atctcaactcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgaaacccaattata 13245205  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  13245206 ttgattatctccaca 13245220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16329418 - 16329308
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16329418 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 16329319  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  16329318 tccacaacatt 16329308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16366435 - 16366361
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16366435 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 16366361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 44345259 - 44345333
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  44345259 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcac 44345333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 53909505 - 53909431
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  53909505 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 53909431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 50223805 - 50223696
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  50223805 gacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcatcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgttagatttcatacccgtcttacattatcac 50223706  T
Q  138 cgaagtaaaa 147  Q
    ||||||||||    
T  50223705 cgaagtaaaa 50223696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 9293953 - 9294021
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  9293953 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 9294021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 10642615 - 10642683
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  10642615 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 10642683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15274418 - 15274144
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||| ||||| || |||||| ||    | ||||  |    
T  15274418 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggttgtcaccttccgatgccacttgcacatcgatt 15274319  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   |||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||       
T  15274318 gtaagggctcacacctaccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgta 15274229  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15274228 atgactcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 15274144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 26337988 - 26338258
Alignment:
Q  12 aactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaa 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | | || ||||||    
T  26337988 aactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaa 26338087  T
Q  111 gatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaaga 209  Q
    |   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | ||    
T  26338088 gggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataagga 26338177  T
Q  210 ctcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26338178 ctcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 26338258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18495909 - 18495790
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatatt 272  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  18495909 tcaacacgacgatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatctttccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatt 18495810  T
Q  273 gttcatctccacatcatttg 292  Q
    | |||||| |||| ||||||    
T  18495809 gatcatcttcacaacatttg 18495790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30233998 - 30233927
Alignment:
Q  222 acaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  30233998 acaacaatccacaattttcacctcgatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttg 30233927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43282893 - 43282770
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  43282893 aatctcaacacgactatgatgcattgacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatataaaggacaacttccaaata 43282794  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  43282793 tattgatcacctccacaacatttg 43282770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 7134141 - 7134088
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 54  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7134141 tttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 7134088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 8372972 - 8373024
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8372972 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 8373024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13811136 - 13811032
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  13811136 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacattacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 13811037  T
Q  269 tattg 273  Q
    |||||    
T  13811036 tattg 13811032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 15043593 - 15043709
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||    
T  15043593 aatctcaacacaactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaata 15043692  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15043693 tattgatcatctccaca 15043709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15110831 - 15110715
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||    
T  15110831 aatctcaacactactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaata 15110732  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15110731 tattgatcatctccaca 15110715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15138217 - 15138165
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15138217 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 15138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 33738657 - 33738731
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33738657 aataagactcatgtcatgatatgcatgtatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcac 33738731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13049817 - 13049548
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  13049817 actcatgctatgatatgcacttatggacatataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 13049718  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  13049717 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 13049628  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  13049627 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 13049548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15288499 - 15288394
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||  | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  15288499 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 15288401  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  15288400 caacatt 15288394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15295609 - 15295504
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||  | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  15295609 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 15295511  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  15295510 caacatt 15295504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 7848856 - 7848901
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7848856 tcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 7848901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 18246689 - 18246762
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  18246689 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 18246762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18496138 - 18496065
Alignment:
Q  9 taaaactcatgtcatgatatgcactta-ttgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  18496138 taaaactcatgtcatgatgtgcacctagttgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 18496065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 43283119 - 43283043
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  43283119 aataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 43283043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 18167216 - 18167268
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18167216 ataagactcatgttatgatttgcacttattgacgcataaatgcatgtggtacc 18167268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 30236222 - 30236147
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcactta--ttgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30236222 ataagactcatgtcatgatgtgcacctaatttgacacatatatggatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 30236147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 52266960 - 52266864
Alignment:
Q  187 tgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 281  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||| ||||||| |||||||    
T  52266960 tgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggataacttccaaatatattgatcatctc 52266864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18294580 - 18294545
Alignment:
Q  257 aacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18294580 aacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 18294545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 52267195 - 52267125
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  52267195 actcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 52267125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 54119964 - 54119911
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  54119964 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatctggtacc 54119911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 10487175 - 10487243
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  10487175 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10487243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15288680 - 15288633
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15288680 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 15288633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15295847 - 15295800
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15295847 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 15295800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16329576 - 16329500
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  16329576 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 16329500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 47
Target Start/End: Original strand, 16521233 - 16521265
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaa 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521233 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaa 16521265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 53706521 - 53706465
Alignment:
Q  25 atatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  53706521 atatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtactagatcacctcagggtcgtcac 53706465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 151
Target Start/End: Original strand, 24237478 - 24237525
Alignment:
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24237478 tatgtaagatttcacgcacgtcttacattatcgccgaagtaaaagagt 24237525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30235997 - 30235942
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaac 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  30235997 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaac 30235942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 821557 - 821495
Alignment:
Q  230 cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  821557 cacaattttcacctcaatatatacgacaacatccaattatattgattatcttcacaacatttg 821495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 13244787 - 13244861
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||  ||| |||||||||    
T  13244787 aataagactcatgccatgatatccacctattgacacatatatgcatgtgggaccaaatcatttcagggtcgtcac 13244861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17213420 - 17213378
Alignment:
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17213420 taagatttcacacccgtcttacattttcgccgaagtaaaagag 17213378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 290
Target Start/End: Original strand, 18246881 - 18246962
Alignment:
Q  209 actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  18246881 actcgataatgcgacaaaaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 18246962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13811363 - 13811287
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  13811363 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 13811287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17377083 - 17377011
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaa 110  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||    |||||||||||| |||| |||||||    
T  17377083 gacacatatatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcacccatgatgcaacaaaagtatcatatgtaa 17377011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45460686 - 45460611
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45460686 ataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacgtatatgcatgcggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 45460611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 53706559 - 53706515
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgca 51  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  53706559 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgca 53706515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 18775704 - 18775991
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||||    
T  18775704 caaataagacttatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcgatacaacaaagacatcgt 18775803  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  18775804 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacaactataatgcatggacatgtaa 18775903  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18775904 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttg 18775991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 16105059 - 16105339
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16105059 actcatgtcatgatatgtacttattgacacataaatgcatgtggtaccggataacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 16105158  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16105159 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatgcatggacatgtaacaagactc 16105258  T
Q  213 gataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16105259 gataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttg 16105339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 292
Target Start/End: Original strand, 18128776 - 18129065
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac-----attcgatgcaacaaaaatatc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||     ||||||||| ||   || |||    
T  18128776 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatcacctccagttcgtcaccttcgattcgatgccacttgaacatc 18128875  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18128876 gtatgtaagatttcacacctgtcttacataatcttcgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgt 18128975  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18128976 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttg 18129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 31626933 - 31627219
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  31626933 aataagactcatgtcatgatatgcacctatagacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatat 31627032  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31627033 gtaagatttcacacatgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacgactacattctcaacacgactatgatgcatggacatgtaaca 31627132  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31627133 agactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgatcatctccacaacatttg 31627219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 66 - 292
Target Start/End: Original strand, 16083970 - 16084197
Alignment:
Q  66 acctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttaca 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16083970 acctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 16084069  T
Q  166 actacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacaccca 264  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16084070 actacaatctcaacaagactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactccca 16084169  T
Q  265 attatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16084170 attatattgatcatctccacatcatttg 16084197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25745978 - 25745761
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  25745978 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcagttattgacacataaattcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccctcgatgcaacaaaaaca 25745879  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  25745878 tcgtatgtaagagttcacacctgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatcatgcatggacat 25745779  T
Q  201 gtaacaagactcgataat 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25745778 gtaacaagactcgataat 25745761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Original strand, 23151848 - 23152040
Alignment:
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaaca 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23151848 atcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggaca 23151947  T
Q  200 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23151948 tgtaacaagactcgataatgcgacaataatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatactgttcatctccacatcatttg 23152040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 1554343 - 1554619
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||    
T  1554343 caaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgt 1554441  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1554442 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaact---------acacgactatgatgcatggacatgtaa 1554532  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1554533 caagactcgataatgcgacaacaatcacaa-tttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccgcatcatttg 1554619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19984866 - 19984588
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||    
T  19984866 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcg 19984767  T
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgta 203  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| |||||||    
T  19984766 tatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaact---------acacgactatgatgcatggacatgta 19984676  T
Q  204 acaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19984675 acaagactagataattcgacaacaatcacaa-tttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatttccacatcatttg 19984588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 22428676 - 22428846
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22428676 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtacga 22428775  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22428776 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttgaacccttttacaactacaaactcaacacga 22428846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18383328 - 18383172
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18383328 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 18383229  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgc 192  Q
    | ||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  18383228 ctgaagtaaaagagctaaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgc 18383172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 33323337 - 33323501
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33323337 tgacacataaatgcatttggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataattt 33323436  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||||| | | || ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33323437 ccgtagtaaaaaagctcaacccttttacaattgcaaaactcaacatgactatgatgcatggacat 33323501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 15861242 - 15861506
Alignment:
Q  12 aactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  | ||| | ||||||||||||    
T  15861242 aactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgata-aaacacatcgtatgtaag 15861340  T
Q  112 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagact 211  Q
       |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||         ||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  15861341 gggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagccgaattcttttacaacaacat--------cgactatgatgcatggacatgtataaagact 15861428  T
Q  212 cgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15861429 cgataatgcgacaacaatcacaa-tttcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 15861506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16889390 - 16889227
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889390 tgacacataagtgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgcatcaacac-atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 16889292  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  16889291 ccgaagtaaaatcgctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 16889227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 16238868 - 16239144
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaa-ggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||  || ||||||||| | |||||  | ||| | ||||||    
T  16238868 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacatatatgcatgtggtacaaaatctccaaaaaggtcgtcacctccgatgata-aaacacatcgta 16238966  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  16238967 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtata 16239057  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa--tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  16239058 aggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgattatctccacaacatt 16239144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 292
Target Start/End: Original strand, 22430925 - 22431028
Alignment:
Q  189 atgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatca 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430925 atgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaatttaaaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatca 22431024  T
Q  289 tttg 292  Q
    ||||    
T  22431025 tttg 22431028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 34965471 - 34965584
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  34965471 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacattatcac 34965570  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  34965571 cgaagtaaaagagt 34965584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1659366 - 1659096
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| | ||||||||    
T  1659366 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatg 1659268  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||         ||| ||||||||||| |||||||  |     
T  1659267 taaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaacaaca--------tcgactatgatgcatggacatgtataag 1659180  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1659179 gactcgataatgtgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 1659096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17790776 - 17790652
Alignment:
Q  47 atgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17790776 atgcatgtggtaccgaatcacctctaggtcgtcaccttcgatgcatcaacac-atcgtatataagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 17790678  T
Q  147 agagtccaacccttttacaactacaa 172  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||    
T  17790677 agagctcaacccttttacaactacaa 17790652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 11214644 - 11214918
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacc-tcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||| | ||||| |  ||| | |||||||    
T  11214644 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtat 11214742  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||         |||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  11214743 gtaagggttcacccccgctttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccattttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgtataa 11214833  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
      |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  11214834 gtactctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaacatt 11214918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35017185 - 35017065
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35017185 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatat 35017086  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || | ||||||||| ||||||    
T  35017085 tgattatctccacaacatttg 35017065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16827366 - 16827259
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16827366 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccac 16827267  T
Q  285 atcatttg 292  Q
    ||||||||    
T  16827266 atcatttg 16827259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35137565 - 35137430
Alignment:
Q  66 acctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttaca 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  35137565 acctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatcttcgtagtaaaagagctcaacccttttaca 35137466  T
Q  166 actac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||| | || ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  35137465 actgcaaaactcaacatgactatgatgcatggacat 35137430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Original strand, 18397585 - 18397706
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  18397585 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattat 18397684  T
Q  270 attgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||| | ||| ||||| |||||    
T  18397685 attgattatccccacaacattt 18397706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 4989407 - 4989677
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||||||||||    
T  4989407 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag 4989506  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||         ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  4989507 -gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaaca--------tcgactatgatgcatggacatgtataaggac 4989596  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  4989597 tcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 4989677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18825262 - 18825144
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18825262 atctcaacacaactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaaacacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatat 18825163  T
Q  272 tgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||    
T  18825162 tattcatctccacatcatt 18825144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18843323 - 18843205
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  18843323 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacgacaaacacaattttctccacaatatataggacgacacccaattataa 18843224  T
Q  272 tgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18843223 tgttcatctccacatcatt 18843205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18004477 - 18004356
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18004477 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattata 18004378  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  18004377 ttgattatctccacaacatttg 18004356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Original strand, 32897382 - 32897503
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  32897382 aatctcaacacaactatgatgcacggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaatttt 32897481  T
Q  270 attgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  32897482 attgatcatctccacaacattt 32897503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 18741123 - 18741203
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaa 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18741123 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaa 18741203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 23976074 - 23976349
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| ||    
T  23976074 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaat 23976173  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||      
T  23976174 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtata 23976263  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23976264 aggactcgataatgcggcaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 23976349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 18431294 - 18431414
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18431294 tctcaacacaactatgatacatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatat 18431393  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || | ||||||||| ||||||    
T  18431394 tgattatctccacaacatttg 18431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 292
Target Start/End: Original strand, 18569283 - 18569367
Alignment:
Q  208 gactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  18569283 gactcgataatgcgacaacaatcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttg 18569367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 150
Target Start/End: Original strand, 22846613 - 22846767
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaa- 98  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22846613 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtagtaccaaatcaccgcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaac 22846712  T
Q  99 ---tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 150  Q
        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22846713 atcgatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 22846767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28196288 - 28196172
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  28196288 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaacactccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 28196189  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28196188 tattgatcatctccaca 28196172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14628263 - 14627994
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  14628263 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 14628164  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  14628163 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaaggac 14628074  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14628073 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 14627994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25646332 - 25646210
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  25646332 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaatttt 25646233  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  25646232 attgattatctccacaacatttg 25646210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33316239 - 33315964
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| ||||||| | |||   || |||| |    
T  33316239 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcgatgga-caagtcaacatcgca 33316141  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||     
T  33316140 tgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacat--------cgactatgatgcatggacatgtat 33316051  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  33316050 aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 33315964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1651605 - 1651335
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || |||| |    
T  1651605 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 1651507  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||         |||| ||| ||||||||||| ||||||       
T  1651506 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgtgta 1651420  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaac-aatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1651419 aggactcgataatgcgacaacaaatcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacaacatt 1651335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Original strand, 16134814 - 16134918
Alignment:
Q  47 atgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 146  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16134814 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcttcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 16134913  T
Q  147 agagt 151  Q
    |||||    
T  16134914 agagt 16134918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 292
Target Start/End: Original strand, 22866826 - 22866949
Alignment:
Q  170 caatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  22866826 caatctcaacacgactatgatgcctggacatgtaacaagactcaataatgcgaaatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 22866925  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     |||| ||||||||||| ||||||    
T  22866926 aattgatcatctccacaacatttg 22866949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15736686 - 15736564
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15736686 aatctcaacacaactattatgcatggacatgtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattat 15736587  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  15736586 attgttcatctccacaacatttg 15736564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 19852796 - 19852909
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  19852796 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatcat 19852895  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    |||| |||||||||    
T  19852896 cgaaataaaagagt 19852909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25368865 - 25368748
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaa-ttttcaccacgatatataggacaacacccaatt 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||| |    
T  25368865 aatctcaacacgactatgatgcatgaacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaat 25368766  T
Q  268 atattgttcatctccaca 285  Q
    |||||| |||||||||||    
T  25368765 atattgatcatctccaca 25368748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 15738907 - 15739023
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  15738907 aatcccaacacgattatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttttaccacaatatagaggacaacttccaaata 15739006  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15739007 tattgatcatctccaca 15739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16650898 - 16650628
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  16650898 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 16650799  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  16650798 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 16650708  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  16650707 tcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt 16650628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13622619 - 13622497
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13622619 aatctcaacatgactatgatgcatgaacatgtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattat 13622520  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  13622519 attgattatctccacaacatttg 13622497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 18422229 - 18422303
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18422229 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 18422303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25646592 - 25646518
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  25646592 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 25646518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35017377 - 35017303
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  35017377 aataagactcatgtcatgatatgcacatattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 35017303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 23220223 - 23220336
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |    
T  23220223 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgttatccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttatattatcac 23220322  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
     |||||||||||||    
T  23220323 tgaagtaaaagagt 23220336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17343772 - 17343668
Alignment:
Q  187 tgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17343772 tgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca 17343673  T
Q  286 tcatt 290  Q
     ||||    
T  17343672 acatt 17343668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18004703 - 18004635
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  18004703 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18004635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18825488 - 18825420
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  18825488 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18825420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16557668 - 16557398
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  16557668 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 16557569  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  16557568 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 16557478  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  16557477 tcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt 16557398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 26088345 - 26088614
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | |||| |||||||    
T  26088345 actcatgttatgatatgcacttatggacgcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 26088444  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  26088445 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 26088534  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26088535 tcgataatgcaacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 26088614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18843546 - 18843481
Alignment:
Q  16 catgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  18843546 catgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18843481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16827530 - 16827454
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  16827530 actcatgtcaagatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 16827454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29871127 - 29870857
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  29871127 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 29871028  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  29871027 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 29870938  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacc-caattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  29870937 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt 29870857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 10487548 - 10487658
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10487548 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 10487646  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  10487647 ctccacaacatt 10487658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 16230091 - 16230360
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  16230091 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 16230190  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  16230191 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 16230280  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  16230281 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 16230360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16377779 - 16377669
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16377779 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 16377681  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  16377680 ctccacaacatt 16377669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16385103 - 16384993
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16385103 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 16385005  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  16385004 ctccacaacatt 16384993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27655580 - 27655469
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27655580 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 27655481  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
     |||||| ||||    
T  27655480 ttccacaacatt 27655469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18088202 - 18088096
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  18088202 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 18088103  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  18088102 caacatt 18088096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 10487390 - 10487458
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  10487390 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10487458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13016290 - 13016170
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| | | | ||||||||    
T  13016290 aatctcaacactactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattat 13016191  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | | ||||||| ||||    
T  13016190 attgattacctccacaacatt 13016170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16377937 - 16377861
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  16377937 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 16377861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16385261 - 16385185
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  16385261 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 16385185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22227330 - 22227282
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22227330 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 22227282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 32896498 - 32896538
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896498 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 32896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Original strand, 19609171 - 19609276
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  19609171 tatgatgcatcgacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 19609269  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  19609270 caacatt 19609276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22227131 - 22227025
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||| |  | | | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  22227131 tatgatgcatggacatgtataaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 22227032  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  22227031 caacatt 22227025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25745758 - 25745716
Alignment:
Q  250 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25745758 ataggacaacacccaattatattgttcatctacacatcatttg 25745716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13622858 - 13622805
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13622858 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 13622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17343921 - 17343868
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17343921 ataagactcatgttatgatatgcacttattgactcgtaaatgcatgtggtaccg 17343868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 18740877 - 18740930
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18740877 aataagactcatgtcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtacc 18740930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 25174061 - 25174134
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  25174061 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 25174134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27655743 - 27655662
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  27655743 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 27655662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 23993671 - 23993940
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  23993671 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 23993770  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||| | | |||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  23993771 ggctcacacctgccttacaataat-ttcaaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 23993860  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23993861 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 23993940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Original strand, 16374954 - 16374999
Alignment:
Q  86 gatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16374954 gatgtaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 16374999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18088440 - 18088393
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18088440 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 18088393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 290
Target Start/End: Original strand, 25174253 - 25174334
Alignment:
Q  209 actcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  25174253 actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccacaacatt 25174334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 15738685 - 15738757
Alignment:
Q  11 aaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  15738685 aaactcatgtcatcatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaacgtcgtcac 15738757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31162486 - 31162441
Alignment:
Q  86 gatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31162486 gatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttgacatccgtcttacat 31162441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16889191 - 16889135
Alignment:
Q  236 tttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16889191 tttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttg 16889135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 19608933 - 19608980
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19608933 actcatgctatgatatacacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 19608980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 116)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 319288 - 318997
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  319288 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 319189  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  319188 tcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatttccgaagtaaaagagttcaacccttttacgactacaatctcaacacgactatgatacatggacat 319089  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  319088 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatttccacatcatttg 318997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12351508 - 12351228
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12351508 actcacgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtactggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 12351409  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatg-atgcatgaacatgtaacaagact 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12351408 tttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaccactatgaatgcatggacatgtaacaagact 12351309  T
Q  212 cgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351308 cgataattcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 12351228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 8630331 - 8630622
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||   || |    
T  8630331 tttctaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgccacttgaaca 8630430  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  8630431 tcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggatat 8630530  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630531 gtaacaagactcgataatgcaacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 8630622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Original strand, 7852304 - 7852582
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7852304 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatacatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatccaacaaaaacatcgtatgtaaga 7852403  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7852404 tttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactc 7852503  T
Q  213 gataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852504 gataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattt 7852582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 50113798 - 50113543
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  50113798 caaataagactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaataaaaacatcgt 50113699  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  50113698 atgtaagatttcacacccgtcttgcataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatgggcatgtac 50113599  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaaca 260  Q
     | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  50113598 aaggactcgataatgcaacaacaatccacaattt-cacctcaatatataggacaaca 50113543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 19230549 - 19230835
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgta 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||  || |||||||| || ||||| | |||| | ||||||    
T  19230549 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatctccaaaacgtcgtcacctttcgatgaatcaaacacatcgta 19230648  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  19230649 tgtaagggttcacacccaccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaacataactatgatgcatggacatgtaac 19230748  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230749 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 19230835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 2048564 - 2048835
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||    
T  2048564 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaactcacatcgtatgtaag 2048663  T
Q  112 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagact 211  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2048664 ggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaagact 2048754  T
Q  212 cgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048755 cgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 2048835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 33340338 - 33340618
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  33340338 caaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 33340437  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||    
T  33340438 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatgtacatgt 33340528  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33340529 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 33340618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 19945120 - 19945401
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  | ||| | |    
T  19945120 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgata-aaacaca 19945218  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||  |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||    
T  19945219 tcgtatgtaagggttcaaaaccaccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacat 19945309  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945310 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 19945401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 5227221 - 5227490
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaa-ggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||| | || |||||||||    
T  5227221 actcatgttatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaaaaaggtcgtcacattcgatgata-aaacacattgtatgtaag 5227319  T
Q  112 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagact 211  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5227320 ggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagag-ccaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaacaagact 5227409  T
Q  212 cgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5227410 cgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttg 5227490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 23491009 - 23491281
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgtatgtaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||||||||||    
T  23491009 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaa 23491108  T
Q  111 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||         |||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  23491109 gggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagcacaacctttttacaact---------acacgactatgatgcatggacatgtaaaaaaac 23491199  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23491200 tagataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 23491281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47786541 - 47786274
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47786541 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtgttactatatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgt 47786442  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  47786441 atgtaagatttcacatccgtcttacataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-ctcaacatgactatgatgcatggacatgtaa 47786343  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47786342 caagactcgataatgcgacaacaat-----------ccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccac 47786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 10737062 - 10737331
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||| ||| |||||||  | ||| | ||||||||||||     
T  10737062 actcatgttatgatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgccaccttcgatgata-aaacacatcgtatgtaagg 10737160  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10737161 gttcacacccgccttacataatctctgaagtagaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtcacaagactc 10737251  T
Q  213 gataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10737252 gataatgcgacaacaataacaattttctccacaatatataggacaacacccaattgtattgttcatcttcacatcatttg 10737331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51160136 - 51159861
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgtatgtaag 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||    
T  51160136 actcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaactcacatcgtatgtaag 51160037  T
Q  112 at----ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  51160036 gaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaataa 51159946  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159945 gactcgataatgcgacaccaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 51159861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 16259537 - 16259816
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aa 98  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   ||    
T  16259537 tttccaaataagacccatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaa 16259635  T
Q  99 tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
     |||| |||||||   |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||    
T  16259636 catcgcatgtaaggggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggac 16259722  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259723 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 16259816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 48420192 - 48420356
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48420192 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 48420291  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  48420292 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgacaatgatgcatggacat 48420356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 15874685 - 15874849
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15874685 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 15874784  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||| ||||    
T  15874785 ctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactttgatgcatggacat 15874849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14846318 - 14846045
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| | ||||||||    
T  14846318 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatg 14846220  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||| |||||||  |     
T  14846219 taagggttcaccccccccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgtataag 14846129  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14846128 gactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 14846045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 55442409 - 55442249
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtc---acattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55442409 tgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgccttacataa 55442310  T
Q  134 tctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcat 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  55442309 tctccgaagtaaaagagttcaaccattttacaactacaaactcaacatgactatgatgcat 55442249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12490377 - 12490249
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12490377 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcatctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 12490278  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttaca 165  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12490277 ccgaagtaaaagagctcaacccttttaca 12490249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11330648 - 11330484
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11330648 tgacacataaatgcatgtggtaccgagtcacctcaaggttgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacatgtcttacataatct 11330549  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11330548 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 11330484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18008777 - 18008645
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18008777 tgacgcataaatgcatgtggtactgaatcacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 18008678  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaacta 169  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18008677 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacta 18008645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38812634 - 38812384
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38812634 gacacatatatgcatgtcgtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttcac-cccgtcttacataatctc 38812536  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa--caagactcgataatgcgacaaca-atcaca 233  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||| ||||  ||   ||||||||| ||||| | | ||  ||| |    
T  38812535 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactactagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaagatcacctcata 38812436  T
Q  234 attttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  38812435 attttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccaca 38812384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14060913 - 14060717
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  14060913 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacgtatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaatatcga 14060814  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  14060813 atgtaagagttcacccccatcttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 14060717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17957838 - 17957718
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17957838 atctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatat 17957739  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17957738 tgttcatgtccacatcatttg 17957718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17913909 - 17913634
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||||     
T  17913909 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtac 17913810  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||||    
T  17913809 gtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagcttaacccttttacagccaca---------cgactatgatgcatggacatgtaac 17913720  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17913719 aagactagataatgcgaca-caatcacaattgtcaacacaatatataggacgacatccaattatattgttcatctccacaacatttg 17913634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5229720 - 5229607
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5229720 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 5229621  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  5229620 cgaagtaaaagagt 5229607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 25057502 - 25057622
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25057502 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatat 25057601  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  25057602 tgttcatctctacaacatttg 25057622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 14297151 - 14297273
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14297151 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 14297250  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14297251 attgatcatctccacaacatttg 14297273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 14302778 - 14302900
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14302778 aatctcaactcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 14302877  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14302878 attgatcatctccacaacatttg 14302900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 35122342 - 35122462
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35122342 tctcaactcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatat 35122441  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  35122442 tgatcatctccacaacatttg 35122462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Original strand, 47983419 - 47983531
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatct 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47983419 gacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataatat 47983518  T
Q  137 ccgaagtaaaaga 149  Q
    |||||||||||||    
T  47983519 ccgaagtaaaaga 47983531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Original strand, 47992706 - 47992818
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatct 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47992706 gacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataatat 47992805  T
Q  137 ccgaagtaaaaga 149  Q
    |||||||||||||    
T  47992806 ccgaagtaaaaga 47992818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Original strand, 48001993 - 48002105
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatct 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48001993 gacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataatat 48002092  T
Q  137 ccgaagtaaaaga 149  Q
    |||||||||||||    
T  48002093 ccgaagtaaaaga 48002105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Original strand, 48011279 - 48011391
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatct 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48011279 gacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataatat 48011378  T
Q  137 ccgaagtaaaaga 149  Q
    |||||||||||||    
T  48011379 ccgaagtaaaaga 48011391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 49230705 - 49230987
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||| ||||||| | |||||||| ||    |     
T  49230705 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaacgtcgtcacctttcgatgccacttgcac 49230804  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
    |||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||    
T  49230805 atcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggac 49230894  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  49230895 atgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 49230987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 53900026 - 53899912
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  53900026 aatctcaactcgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattat 53899927  T
Q  270 attgttcatctccac 284  Q
    |||| ||||||||||    
T  53899926 attgatcatctccac 53899912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 13816167 - 13816288
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13816167 atctcaacacgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattata 13816266  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  13816267 ttgattatctccacaacatttg 13816288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 16819407 - 16819682
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || | |||| ||    | |||| ||    
T  16819407 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcaatgccacttgcacatcgaat 16819506  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    |||||   ||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||        ||| |||||||||||||||||||      
T  16819507 gtaagggctcacacctgccttgcaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatgaacatgtata 16819597  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  16819598 aggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 16819682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22145777 - 22145663
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  22145777 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgataacaatccacaattttcacctcaatatataggac-acacccaattat 22145679  T
Q  270 attgttcatctccaca 285  Q
    |||| | |||||||||    
T  22145678 attgattatctccaca 22145663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15940119 - 15939861
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||  | |||   || ||||||    
T  15940119 ataagactcatgttatgatatgaacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgataga-caagtcaacatcgta 15940021  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||         |||||||| |||||||||||  ||||||      
T  15940020 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaaaagttcagcccttttacaa---------caacacgactatgatgcatgggcatgtata 15939930  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattg 273  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  15939929 aggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatgtatatgacaacacccaattatattg 15939861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19572275 - 19572154
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19572275 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattata 19572176  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||| ||||||    
T  19572175 ttgattatctccacaacatttg 19572154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 14294081 - 14294204
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  14294081 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaata 14294180  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14294181 tattgatcatctccacaacatttg 14294204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 14299708 - 14299831
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  14299708 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaata 14299807  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14299808 tattgatcatctccacaacatttg 14299831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 292
Target Start/End: Original strand, 40938383 - 40938506
Alignment:
Q  170 caatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  40938383 caatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaccaatttacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 40938482  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||    
T  40938483 tattgatcatctccataacatttg 40938506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 44227930 - 44228200
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||||||||||    
T  44227930 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag 44228029  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||         ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  44228030 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttacagcaacat--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 44228120  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44228121 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 44228200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11062541 - 11062419
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||    
T  11062541 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatat 11062442  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11062441 attgatcatctccacaacatttg 11062419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 17099367 - 17099489
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17099367 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 17099466  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  17099467 attgattatctccacaacatttg 17099489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18905343 - 18905182
Alignment:
Q  120 cccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatg 219  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||    
T  18905343 cccgccttacataatctccaaagtaaaagagcccaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtataaggactcaataatg 18905253  T
Q  220 cgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  18905252 cgaaaacaatcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 18905182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 15613564 - 15613834
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || |||| |    
T  15613564 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 15613662  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||         |||| ||| ||||||||||| ||||||       
T  15613663 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgtgta 15613749  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaac-aatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15613750 aggactcgataatgcgacaacaaatcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattaatcatctccacaacatt 15613834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15470120 - 15469851
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||  | ||||| | |||   || ||||||    
T  15470120 ataagacttatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcatctccgatgga-caagtcaacatcgta 15470022  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  15470021 tgtaaggggtcactcc----ttacataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtata 15469935  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15469934 agaactcgataatgcgacaataatcacaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 15469851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17523914 - 17523802
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  17523914 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattat 17523815  T
Q  270 attgttcatctcc 282  Q
    |||| ||||||||    
T  17523814 attgatcatctcc 17523802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14522813 - 14522690
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca-agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||    
T  14522813 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacagagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatata 14522714  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14522713 tattgatcatctccacaacatttg 14522690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15860650 - 15860531
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15860650 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 15860551  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | ||||||||| ||||    
T  15860550 ttgattatctccacaacatt 15860531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 27839210 - 27839480
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  27839210 actcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 27839309  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  27839310 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaaggac 27839399  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27839400 tcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatt 27839480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9592393 - 9592236
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9592393 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatgtgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 9592294  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcat 194  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  9592293 cgaagtaaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatgcat 9592236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11199078 - 11198955
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  11199078 aatcgcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagacttgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 11198979  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  11198978 tattgatcatctccacaacatttg 11198955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16745822 - 16745554
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || | |||| ||    | |||| |||||||    
T  16745822 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcaatgccacttgcacatcgaatgtaag 16745723  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |         ||||||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  16745722 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagc---------aacacgactatgatgcatggacatgtgtaaggac 16745634  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  16745633 tcgataatgcgacaaccatcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 16745554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 30205107 - 30205222
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  30205107 aatctgaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattat 30205206  T
Q  270 attgttcatctccaca 285  Q
    |||| | |||||||||    
T  30205207 attgattatctccaca 30205222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16183519 - 16183393
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgat----atataggacaacacccaa 265  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    ||||||||||||||||||    
T  16183519 aatctcaacccgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttacacctcaatcaatatataggacaacacccaa 16183420  T
Q  266 ttatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||    
T  16183419 ttatattgattatctccacatcatttg 16183393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 41660136 - 41660249
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  41660136 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacctgtcttacattatcac 41660235  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    |||| |||||||||    
T  41660236 cgaaataaaagagt 41660249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 30151839 - 30152108
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  30151839 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 30151938  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  30151939 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 30152028  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  30152029 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 30152108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6148531 - 6148457
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6148531 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 6148457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 15574545 - 15574815
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   ||  ||| |    
T  15574545 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagttaaagtcgca 15574643  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| ||    ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||||||       
T  15574644 tgtaaggggtcactcc----ttacataattttcgaagtaaaagagccggactcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtgta 15574730  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15574731 aggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt 15574815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 30204883 - 30204961
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30204883 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacac--aaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 30204961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6148309 - 6148225
Alignment:
Q  208 gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  6148309 gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatgtaggacaacacccaattatattgattatctccacaacattt 6148225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12266146 - 12265874
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || |||| |    
T  12266146 ataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 12266048  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||         ||| |||||| |||| |||||||      
T  12266047 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttaaaacaaca--------tcgactatgattcatggacatgtata 12265960  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |  | | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12265959 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 12265874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 17138119 - 17138235
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    
T  17138119 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaataaagactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaacta 17138218  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17138219 tattgatcatctccaca 17138235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 11813329 - 11813403
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11813329 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 11813403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19572504 - 19572430
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  19572504 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 19572430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 250
Target Start/End: Original strand, 14287747 - 14287828
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatata 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  14287747 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatata 14287828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 12951705 - 12951821
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  12951705 aatctcgacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcatctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaata 12951804  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12951805 tattgatcatctccaca 12951821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 15516388 - 15516504
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  15516388 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagacttgataatgcgacatcaactcaaaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaata 15516487  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15516488 tattgatcatctccaca 15516504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 25057276 - 25057344
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  25057276 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcac 25057344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 30141388 - 30141456
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  30141388 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 30141456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33371005 - 33370914
Alignment:
Q  39 acacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33371005 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatggtgcaacaaaaa-atcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 33370914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 39654569 - 39654685
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  39654569 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaata 39654668  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  39654669 tattgatcatctccaca 39654685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8270054 - 8269785
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | | || |||||||    
T  8270054 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaag 8269955  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  8269954 ggctcacatctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 8269865  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  8269864 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 8269785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8277165 - 8276896
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | | || |||||||    
T  8277165 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaag 8277066  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  8277065 ggctcacatctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 8276976  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  8276975 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 8276896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8305974 - 8305705
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | | || |||||||    
T  8305974 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaag 8305875  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  8305874 ggctcacatctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtataaggac 8305785  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  8305784 tcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 8305705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19262677 - 19262622
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19262677 caaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 19262622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16183739 - 16183665
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16183739 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcac 16183665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11883773 - 11883652
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  11883773 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacactttccacaacaatataaaggacaacttccaaata 11883674  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  11883673 tattgatcatctccacaacatt 11883652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17958069 - 17957996
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  17958069 ataagactcatgtcatgagatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 17957996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23081821 - 23081748
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  23081821 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 23081748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18905413 - 18905361
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18905413 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 18905361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1469146 - 1469036
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1469146 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 1469048  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  1469047 ctccacaacatt 1469036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12562983 - 12562868
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcac-aattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||| ||   |||| |||    
T  12562983 tctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagattcgataatgcgacaacacttcacaaattttcaccacaatatagaggaaaaattccaaatat 12562884  T
Q  270 attgttcatctccaca 285  Q
    |||| |||||||||||    
T  12562883 attgatcatctccaca 12562868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 18909353 - 18909463
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18909353 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 18909451  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  18909452 ctccacaacatt 18909463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 53769163 - 53769432
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  53769163 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 53769262  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  53769263 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 53769352  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  53769353 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 53769432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 17099107 - 17099181
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  17099107 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggttgtcac 17099181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22145956 - 22145882
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22145956 aataagactcgtgtcatcacatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaattacctcaaggtcgtcac 22145882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 45581332 - 45581382
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 57  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581332 aataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 45581382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1469304 - 1469228
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  1469304 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 1469228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 55315057 - 55315167
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  55315057 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 55315155  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  55315156 ctccacaacatt 55315167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Original strand, 11813520 - 11813578
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11813520 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatc 11813578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2450983 - 2450910
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  2450983 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 2450910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 18909190 - 18909263
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  18909190 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 18909263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 22273545 - 22273618
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  22273545 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22273618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2450820 - 2450710
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  2450820 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 2450722  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  2450721 ctccacaacatt 2450710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13977124 - 13977017
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcac-cacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcc 282  Q
    ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13977124 tatgatgcatggacatgtgtaacgactcgataatgcgacaacaattctcaatgtcaactcaatatatataggacaacacccaattatattgattatctcc 13977025  T
Q  283 acatcatt 290  Q
    ||| ||||    
T  13977024 acaacatt 13977017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 22273708 - 22273818
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  22273708 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 22273806  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  22273807 ctccacaacatt 22273818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 45859522 - 45859791
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtca-cattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||| | |||||||| ||    | ||||  ||||||    
T  45859522 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaag 45859621  T
Q  112 atttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||        |||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  45859622 ggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaatgac 45859711  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  45859712 tcgataatgcgacaacaattctcaa-tctcaactcaatatataggacaacatccaattatattgattatcttcacaacatt 45859791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11517056 - 11517010
Alignment:
Q  85 cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11517056 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgttttacat 11517010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Original strand, 12951474 - 12951555
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtca---tgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12951474 caaataagactcatgtcaacatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacttcaaggtcgtcac 12951555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13956297 - 13956185
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcac-cacgatatataggacaacacccaattatattgttca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  13956297 acgactatgatgcatggacatgtgtaacgactcgataatgcgacaacaattctcaatgtcaactcaatatatataggacaacacccaattattttgatta 13956198  T
Q  278 tctccacatcatt 290  Q
    |||||||| ||||    
T  13956197 tctccacaacatt 13956185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13956456 - 13956388
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  13956456 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 13956388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13977289 - 13977221
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  13977289 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 13977221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 41268744 - 41268812
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  41268744 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 41268812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 55314884 - 55314952
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  55314884 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 55314952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11062773 - 11062691
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| || |  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11062773 tttcaaaataagactcatgtcctgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccgtttcacttcaaggtcgtcac 11062691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14523049 - 14523006
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14523049 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 14523006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17536649 - 17536606
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17536649 gacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 17536606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 41268903 - 41269013
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||| | | |||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  41268903 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacatttctcaatct-caactcaatacataggacaacacccaattatattgattat 41269001  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  41269002 ctccacaacatt 41269013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12774934 - 12774900
Alignment:
Q  47 atgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12774934 atgcatgtggtaccgggtcacctcaaggtcgtcac 12774900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15860882 - 15860829
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15860882 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatgtgcatgttgtacc 15860829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13579
Alignment:
Q  15 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatt 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13856 tcatgtcatgatatacacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatt 13757  T
Q  115 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13756 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagattcga 13657  T
Q  215 taatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656 taatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 13579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 15943 - 16218
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || ||||||    
T  15943 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtatcaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgta 16041  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| ||||||       
T  16042 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtgta 16132  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  16133 aggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaacatt 16218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 4627 - 4907
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4627 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatatgtaaga 4726  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4727 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaaactc 4826  T
Q  213 gataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4827 gataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttg 4907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 19875 - 20168
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaca--ttcgatgcaacaaaaa 98  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19875 tttccaaataagactcatatcatgatatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgccttcgatgcaacaaaaa 19974  T
Q  99 tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19975 catcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacacttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggac 20074  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 20168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 17791 - 18084
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaca--ttcgatgcaacaaaaa 98  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  17791 tttccaaataagactcatatcatgatatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgccttcgatgcaacaaaaa 17890  T
Q  99 tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  17891 catcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacacttttacaactacaatctcaacatgactatgatgcatggac 17990  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17991 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 18084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8038
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8294 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttagataatct 8195  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaat 235  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8194 ccgaagtaaaagagttcaacctatttacaacaacaaactctacatgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaatccacaat 8095  T
Q  236 tttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8094 tttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 8038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13427
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13683 tgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttagataatct 13584  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaat 235  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13583 ccgaagtaaaagagttcaacctatttacaacaacaaactctacatgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaatccacaat 13484  T
Q  236 tttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13483 tttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttg 13427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 236667 - 236958
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||   || |    
T  236667 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccttatcacctctaggtcgtcaccttcgatgctactttaaca 236766  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  236767 tcgtatgtaagatttcacacctttcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacat 236866  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  236867 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaatttccaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcttttg 236958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 270617 - 270897
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  270617 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 270716  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||    
T  270717 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatgaacatgt 270807  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  270808 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctccatatcatttg 270897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 256007 - 255963
Alignment:
Q  87 atgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  256007 atgcaacaaaaacatcaaatgtaagatttcatacccgtcttacat 255963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 6038 - 6324
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6038 aataaaactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtat 6137  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  6138 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgattcatgaacatgtacaa 6237  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6238 ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttg 6324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 3117 - 3402
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3117 aataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 3216  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3217 gtaaaatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaaca 3316  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3317 agactcgataatgcgacaacaatctcaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttg 3402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 5725 - 6010
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5725 aataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 5824  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5825 gtaaaatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaaca 5924  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5925 agactcgataatgcgacaacaatctcaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttg 6010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 863 - 1141
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  | ||| | |    
T  863 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgata-aaacaca 961  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    | |||||||||   |||| ||    ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||         ||| ||||||||||| ||||    
T  962 ttgtatgtaaggggtcactcc----ttacataatatccgaagtaaaagagccgaactcttttacaacaacat--------cgactatgatgcatggacat 1049  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1050 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 249218 - 248927
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtc---acattcgatgcaacaaaa 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  249218 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 249119  T
Q  98 atatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaa 197  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  249118 acatcttatgtaagagttcacacccgtcttacataatctcctaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatgga 249019  T
Q  198 catgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  249018 catgtaacaagactcgataatgcaacaaaaatcacaattttctccacaatatataagacaacacccaattatattgttcattcccacatcat 248927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 7930 - 8210
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7930 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 8029  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8030 tttcacaaccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcattgacatgtaacaagactc 8129  T
Q  213 gataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  8130 gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttg 8210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 3151 - 3437
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3151 aataagactcgtggcatgatatgcacctattgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 3250  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  3251 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttttcaactacaaactcaacaagactatgatgcatggacatgtaaca 3350  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3351 agactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatatccacaacatttg 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 27067 - 27333
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27067 ataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtagtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatg 27166  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |     
T  27167 taagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatgcatggacatgtacaag 27266  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattg 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27267 gactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattg 27333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 14171 - 14449
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14171 ataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatg 14270  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |     
T  14271 taagatttgacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagaattcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatgcatggacatgtacaag 14370  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14371 gactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccaca 14449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 8574 - 8856
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  8574 actcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggccgtcacctccgattcaacaaaaacatcgtatgtaa 8673  T
Q  111 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8674 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacaagactatgatgcatggacatgtaacaagac 8773  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8774 tcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttg 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 138480 - 138197
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  138480 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 138381  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||       
T  138380 gtaatatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacag 138281  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  138280 ggactcgataatgcgacaacaatccacaa-tttcacttcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt 138197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 87097 - 87217
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  87097 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattat 87196  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  87197 attgattatctccacaacatt 87217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 10319 - 10442
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||    
T  10319 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgttacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatata 10418  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  10419 tattgatcatctccacaacatttg 10442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 76779 - 76853
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  76779 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 76853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Original strand, 77039 - 77124
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatatagga 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  77039 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga 77124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2261 - 2010
Alignment:
Q  42 cataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2261 cataaatgcatgtggtaccggatcacctcaagatcgtcaccttcgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 2162  T
Q  142 gtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttca 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2161 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactctacatgactatgatgcatgaacatgtaacaagactctataatgcgacaacaatccacaattttca 2062  T
Q  241 ccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  2061 ccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcgacaacatttg 2010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 56425 - 56645
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56425 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcaccaaaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaaca 56524  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  56525 tcgtatgtaagaattcaaacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatgcatgggcat 56624  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcg 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  56625 gtaacaagactcgataatgcg 56645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 58899 - 58976
Alignment:
Q  216 aatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  58899 aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgatcatctccgcatcatttg 58976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 571 - 855
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   ||    
T  571 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaa 670  T
Q  99 tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
     ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||         ||| ||||||||||| |     
T  671 catcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaaccaca---------cgactatgatgcatggag 761  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  762 atggaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Original strand, 15004 - 15111
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004 tatgatgcatggagatggaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 15103  T
Q  285 atcatttg 292  Q
    ||||||||    
T  15104 atcatttg 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 3444 - 3518
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3444 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32856 - 32576
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  32856 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 32757  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||    
T  32756 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgt 32666  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32665 agcaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttg 32576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Original strand, 34011 - 34128
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgt 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34011 tcaacacgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgt 34110  T
Q  275 tcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  34111 tcatctccacaacatttg 34128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 33780 - 33848
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  33780 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 33848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40268
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  39988 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 40087  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||    
T  40088 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgt 40178  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40179 agcaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttg 40268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38833 - 38716
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgt 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38833 tcaacacgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgt 38734  T
Q  275 tcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  38733 tcatctccacaacatttg 38716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 39064 - 38996
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  39064 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 38996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 197765 - 197488
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||    
T  197765 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatacatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaagacatcgt 197667  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||     |||||| |||| ||||||||    
T  197666 atgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca----caac-----tatgatacatggacatgtaa 197576  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197575 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 197488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 84943 - 85056
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  84943 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 85042  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  85043 cgaagtaaaagagt 85056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 26081 - 26194
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  26081 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctaaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacacgtcttacattatcac 26180  T
Q  138 cgaagtaaaagagt 151  Q
    ||||||||||||||    
T  26181 cgaagtaaaagagt 26194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2797 - 2516
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatg--cacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aata 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |  |||| |||||   || |    
T  2797 caaataagactcatgtcatgatatgtgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctctgatggaacaactcaaca 2698  T
Q  101 tcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||    
T  2697 tcgtatgtaagggttcacccccgtcttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacat 2607  T
Q  201 gtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2606 gtaacaagactcg-taatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 54137 - 54414
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||    
T  54137 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcactttcgatgata-aaacacatcgt 54235  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |         ||| ||||||||||| |||||||     
T  54236 atgtaagggttcacacccagcttacataatctctgaagtaaaagagctcaacctttttacaactata---------cgactatgatgcatggacatgtag 54326  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54327 taagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 54414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 109749 - 109467
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   ||    
T  109749 tttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaa 109651  T
Q  99 tatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaac 198  Q
     ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||         ||| ||| |||||||||| |||    
T  109650 catcgtatgtaagggttcacccccgtcttacataatctccgaagtaaaagagatcaaccattttacaac---------aactcgactatgatgcataaac 109560  T
Q  199 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  109559 atgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 109467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11695 - 11420
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| | |||||    
T  11695 caaataagactcatgtcatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgt 11597  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||    
T  11596 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagaacc--acccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaa 11508  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11507 caagactcgataatgcaacaacaatcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttg 11420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Original strand, 145030 - 145304
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgta 105  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||   | ||||||    
T  145030 aataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaactcacatcgta 145129  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||||||     
T  145130 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaat 145220  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145221 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcat 145304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Original strand, 147289 - 147563
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgta 105  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  |||||| |||| ||||||| |||||   | ||||||    
T  147289 aataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcaccttcgatggaacaactcacatcgta 147388  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| | ||||||     
T  147389 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggatatgtaat 147479  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147480 aagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcat 147563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 129864 - 129584
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  || ||| |||| | ||||| |||||   || ||     
T  129864 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcttcacctccgatggaacaactcaacatt 129765  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||         || |||| ||||||||||| ||||||    
T  129764 gtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaac---------aatacgactatgatgcatggacatgt 129674  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129673 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 129584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 21314 - 21436
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaac-aatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattat 21413  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  21414 attgatcatctccacaacatttg 21436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 21054 - 21128
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21054 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 21128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 28644 - 28718
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  28644 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtgccaaatctcctcaaggtcgtcac 28718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 208
Target Start/End: Original strand, 28903 - 28940
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaag 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28903 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaag 28940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 217413 - 217134
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || |||    
T  217413 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatc 217314  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||         ||| ||||||| ||| | ||||    
T  217313 gtatgtaagggttcac-cccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaattaca---------cgactatgatgtatggatatgt 217224  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  217223 aacaagactcgataatgcgacaacaatcataattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 217134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5755
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  5682 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 5845 - 5955
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  5845 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 5943  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  5944 ctccacaacatt 5955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5260 - 4983
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||  ||| |||||    
T  5260 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtaaacatcgt 5162  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    |||||||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||         ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5161 atgtaagggttcactgccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaacccttttaccac---------aacacgactatgatgcatggacatgtaa 5071  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5070 taagactcgacaatgcgacaataatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 4983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12862 - 12788
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  12862 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 12788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4402 - 4134
Alignment:
Q  17 atgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaagatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || ||||||||||||  |    
T  4402 atgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggt 4303  T
Q  115 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcga 214  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4302 tcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aacacgactatgatgcatggatatgtaacaagactcga 4212  T
Q  215 taatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211 taatgcgacaagaatcacaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttg 4134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 49242 - 48974
Alignment:
Q  17 atgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaagatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   || ||||||||||||  |    
T  49242 atgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggt 49143  T
Q  115 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcga 214  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49142 tcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aacacgactatgatgcatggatatgtaacaagactcga 49052  T
Q  215 taatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051 taatgcgacaagaatcacaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttg 48974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 71003 - 70781
Alignment:
Q  71 aaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  71003 aaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatggaagatttcacacctatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac 70904  T
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||| |||||||| ||||    
T  70903 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaagtttctcctcaatatataggataacacccatttat 70804  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  70803 attaatcatctccacaacatttg 70781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26230 - 26110
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26230 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattat 26131  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  26130 attgattatctccacaacatt 26110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 66391 - 66322
Alignment:
Q  6 aaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggt 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66391 aaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggt 66322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26490 - 26416
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26490 aataagactcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 26416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 106564 - 106310
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106564 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 106465  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaatcacaa 234  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||  |  || ||||| | ||||   |||  | | |||    
T  106464 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgtatgaacatacagtaaggactcaaaaatg---caatcacctcaa 106368  T
Q  235 ttttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  106367 ttttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttg 106310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6809 - 6534
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || ||||||    
T  6809 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgta 6711  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  6710 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa---------caactcgactatgatgcatggaaatgtata 6620  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6619 aggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 6534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Original strand, 130410 - 130522
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  130410 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacaccggtcttacgttatcac 130509  T
Q  138 cgaagtaaaagag 150  Q
    |||||||||||||    
T  130510 cgaagtaaaagag 130522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 59096 - 58936
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||||||||||| | |||||  ||||   || ||| ||    
T  59096 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaattttaaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatctta 58998  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaac 167  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  58997 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 58936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 283
Target Start/End: Original strand, 108305 - 108419
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||   | || ||    
T  108305 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaatttccaccacaatataaaggacaatttctaaata 108404  T
Q  269 tattgttcatctcca 283  Q
    ||||| |||||||||    
T  108405 tattgatcatctcca 108419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 7478 - 7757
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||  |||||| |||| |  |||| | |||   || |||    
T  7478 caaataagactcatgtcatgatatgtacttgttgacacataaatgcatgtcgtaccaaatctccaaaaggtcatcacctctgatgga-caagtcaacatc 7576  T
Q  103 gtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgt 202  Q
    |||| ||||  ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||         ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7577 gtatataagggttcaccccagccttacataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaac---------aacacgactatgatgcatggacatgt 7667  T
Q  203 aacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7668 aacaagactcgataatacgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatatagttcatctccacatcatttg 7757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7362
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaat 48  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaat 7362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3971 - 3680
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgt 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3971 aataatactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgt 3872  T
Q  105 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |    
T  3871 atgtaagatttcacacccgtcttatataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacataca 3772  T
Q  204 a--caagactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |   ||||||||| ||||| | | ||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  3771 agtaaagactcgacaatgcaagatcatctcataattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttg 3680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 41222 - 41483
Alignment:
Q  24 gatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgtatgtaagatttcacacc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| ||||    || ||||||||||||  ||||| ||    
T  41222 gatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacagctcaacatcgtatgtaagggttcacccc 41321  T
Q  122 cgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcg 221  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  41322 tgccttacataatctacgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatagaaatgtaaaaagactcgataatgcg 41412  T
Q  222 acaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41413 acaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttaatctccacatcatttg 41483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 292
Target Start/End: Original strand, 1 - 238
Alignment:
Q  47 atgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaa-atatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaa 145  Q
    ||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1 atgcatgtggtaccaaatctccaaaagctcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaa 100  T
Q  146 aagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacg 245  Q
    || ||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  101 aaaagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccaca 191  T
Q  246 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  192 atatataggacaactcccagttatattgttcatctccacatcatttg 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 52838 - 52661
Alignment:
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgta 203  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||    
T  52838 tatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgta 52748  T
Q  204 acaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52747 acaagactcgataatgtgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 52661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 56790 - 56613
Alignment:
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgta 203  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||    
T  56790 tatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca---------cgactatgatgcatggacatgta 56700  T
Q  204 acaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56699 acaagactcgataatgtgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 56613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 71923 - 71759
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71923 tgacgcataaatgcctgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacaaccgtcttacataatct 71824  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactac-aatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  71823 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaaactcaacatgactatgatgcatggacat 71759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 37960 - 38094
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaaga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37960 actcatgtcatgatatgcacatatcgacacgtacatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 38059  T
Q  113 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38060 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaa 38094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4996 - 4743
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4996 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacctt-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcatacataatct 4898  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa--caagactcgataatgcgacaacaatcaca 233  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||  ||   | ||||| ||||||| |  ||  || ||    
T  4897 ccgaagtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgaacatacaagtaaggactcaataatgcaatcac-ctc-ca 4800  T
Q  234 attttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4799 attttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatt 4743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 27678 - 27798
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27678 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatat 27777  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27778 tgttcatctccacatcatttg 27798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 4341 - 4611
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || ||||||    
T  4341 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgta 4439  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  4440 tgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtata 4530  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4531 aggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca 4611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7308 - 7144
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7308 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtgtgtaagatttcacaccagtcttacataatct 7209  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaacta-caatctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  7208 ccgaagtaaaagagctcaacctttttacgactaccagactcaacatgactatgatgcatggacat 7144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7114 - 7054
Alignment:
Q  232 caattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7114 caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttg 7054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 78477 - 78313
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  78477 tgacacataaatgcatgtggtactgaatcacctcaaggttgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 78378  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||  | ||||||||||| ||||    
T  78377 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacacctacaagactcaacataactatgatgcatggacat 78313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 118249 - 117990
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  118249 tgacacatatatgcatgtggtactgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacagccatcttacataatca 118150  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa--caagactcgataatgcgacaaca-atcac 232  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||  ||   ||||||||| ||||| | | ||  |||     
T  118149 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcattgacatacaagtaaagactcgacaatgcaagatcatctcat 118050  T
Q  233 aattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  118049 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttg 117990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 163827 - 163901
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  163827 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 163901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23205 - 23083
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23205 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattat 23106  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23105 attgttcatctccacatcatttg 23083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3070 - 2960
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  3070 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattat 2972  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  2971 ctccacaacatt 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3228 - 3152
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatg 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  3228 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 3152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 68823 - 68963
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  68823 actcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaa 68922  T
Q  111 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68923 gatttcacacccgtcttacataatctcccaagtaaaagagt 68963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 292
Target Start/End: Original strand, 69394 - 69543
Alignment:
Q  144 aaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcacc 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  69394 aaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaacc 69493  T
Q  243 acgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  69494 acaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttg 69543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 292
Target Start/End: Original strand, 30730 - 30853
Alignment:
Q  170 caatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  30730 caatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 30829  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  30830 tattgatcatctccacaacatttg 30853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Original strand, 78207 - 78363
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  78207 tgacacataaatgcatgtggta-----tcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatct 78301  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaa 197  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||    
T  78302 ccgaagtaaaagagctgaacccttttacaactacaagactcaacataactatgatgcatgaa 78363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 128888 - 129161
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaa--aaatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   || |||| |    
T  128888 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 128986  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag-agtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaa 204  Q
    ||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||         ||| ||||||||||| |||||||     
T  128987 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagaagccgaactcttttacaacgaca--------tcgactatgatgcatggacatgtat 129074  T
Q  205 caagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
     | ||||||||||||||||||||| | ||||| |  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  129075 aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 129161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 90373 - 90270
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 284  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  90373 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaatc--cacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccac 90276  T
Q  285 atcatt 290  Q
    | ||||    
T  90275 aacatt 90270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 90674 - 90600
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  90674 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatttggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 90600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 33993 - 34157
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  33993 tgacacataaatacatgtggtaccgaatcacctcaaagtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaacatttcacacctgtcttacataatca 34092  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||||||||| ||||    
T  34093 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacagctacaagactcaacatgactttgatgcatggacat 34157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11424 - 11310
Alignment:
Q  178 acacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttca 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11424 acacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaaaaatcacaattttctccacaatatataggacaagacccaattatattgttca 11325  T
Q  278 tctccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||||    
T  11324 tctccacatcatttg 11310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Original strand, 17307 - 17424
Alignment:
Q  175 tcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgt 274  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17307 tcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcccaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgt 17406  T
Q  275 tcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17407 tcatctccacatcatttg 17424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 17064 - 17123
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064 tttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 17123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Original strand, 38871 - 38988
Alignment:
Q  176 caacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgt 274  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38871 caacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgt 38970  T
Q  275 tcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38971 tcatctccacatcatttg 38988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 78208 - 78329
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  78208 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 78307  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  78308 ttgattatctccacatcatttg 78329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 292
Target Start/End: Original strand, 44512 - 44575
Alignment:
Q  229 tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44512 tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 44575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 77913 - 77972
Alignment:
Q  1 tttccaaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77913 tttccaaataagactcatatcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtacc 77972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 40255 - 40375
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40255 atctcatcacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatat 40354  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  40355 tgttcatctacacaacatttg 40375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 40024 - 40098
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  40024 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcagggttgtcac 40098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 56 - 325
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaa-ggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||  || ||||||||| | |||||  | ||| | |||||||    
T  56 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaattctccaaaaaggtcgtcacctccgatgata-aaacacatcgtat 154  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  155 gtaagggttcacccccgccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtataa 245  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 285  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  246 ggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 14800 - 15073
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| | ||||||||    
T  14800 ataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggaaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatg 14898  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||| |||||||  |     
T  14899 taagggttcacccccaccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaa---------caactcgactatgatgcatggacatgtataag 14989  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14990 gactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 15073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 28321 - 28479
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||||||| | |||||  | ||| | ||||||||    
T  28321 ataagactcatgatatgatattcatttattgacacataaatgcatgtggcaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgata-aaacacatcgtatg 28419  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaac 167  Q
    ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  28420 taagggttcacccccgccttacataatctccgaattaaaagagctcaacccttttacaac 28479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25255 - 25092
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25255 gacacatatatgcatgtggtacaaaatcacctcaaggtcgtcaccttaaatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcac 25156  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  25155 cgaagtaaaagagcacacctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggacat 25092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 51532 - 51805
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||  |||||| |||| | |||||  | ||| | ||||||||    
T  51532 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcacgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccgatgata-aaacacatcgtatg 51630  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||||| |||||  |     
T  51631 taagggttcacccccgcctgacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgaatatgatgcatgaaaatgtataag 51721  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    || || |||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  51722 gaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 51805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 32238 - 32360
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32238 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 32337  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  32338 attgatcatctccacaacatttg 32360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9586 - 9311
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgca-acaaaaatatcgtat 106  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| |||| | ||||| | |    |||||| |||    
T  9586 ataagactcatgttatgatatgcactttttgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccgatggacatgtcaatatcatat 9487  T
Q  107 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaaca 206  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  9486 gtaagggttcaaccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtataa 9396  T
Q  207 agactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  9395 ggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacagcacccaattatattgattatctccacaacatt 9311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 7448 - 7570
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7448 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattat 7547  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||| | ||||||    
T  7548 attgatcatctccaaaacatttg 7570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 7224 - 7298
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  7224 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtactaaatcacctcaaggtcgtcac 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 106500 - 106775
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || ||| ||    
T  106500 ataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcata 106598  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  106599 tgtaagggatcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtata 106689  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  106690 aggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt 106775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 71958 - 71836
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  71958 aatctcatcacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattctcaattttcaccacaatatataggataactcccaattat 71859  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  71858 attgatcatctccacaacatttg 71836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 72174 - 72106
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72174 actcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4715
Alignment:
Q  40 cacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccg 139  Q
    ||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4555 cacataaatacaagtggtactgaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgcatcaacac-atcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatctctg 4653  T
Q  140 aagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||| ||||    
T  4654 aagtaaaagagcccaacccttttacaactacaagactcagcatgactatgatgcatggacat 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 3242 - 3393
Alignment:
Q  5 caaataaaactcatgt---catgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaat 99  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  3242 caaataagactcatgtgaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctctaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaac 3341  T
Q  100 atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3342 attgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatcaccgaagtataagagt 3393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 896 - 779
Alignment:
Q  176 caacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgt 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  896 caacacgactatgatgcatggacatgtaacaagattcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattga 797  T
Q  275 tcatctccacatcatttg 292  Q
    | | ||||||| ||||||    
T  796 ttacctccacaacatttg 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1120 - 1046
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1120 aataagactcatgtcataatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 10)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 256414 - 256293
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  256414 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 256315  T
Q  270 attgttcatctccacatcattt 291  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  256314 attgattatctccacaacattt 256293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 124795 - 124681
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  124795 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 124696  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  124695 ttgattatctccaca 124681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 256634 - 256560
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  256634 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 256560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 285
Target Start/End: Original strand, 193275 - 193384
Alignment:
Q  177 aacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgtt 275  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  193275 aacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 193374  T
Q  276 catctccaca 285  Q
     |||||||||    
T  193375 tatctccaca 193384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 76183 - 76082
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  76183 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggatgacacccaattatattgattatctcca 76084  T
Q  284 ca 285  Q
    ||    
T  76083 ca 76082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262900
Alignment:
Q  216 aatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||    
T  262975 aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatt 262900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 125067 - 125014
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  125067 aataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc 125014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 72086 - 72033
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  72086 aataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtacc 72033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 76467 - 76414
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  76467 aataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtacc 76414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 192999 - 193052
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  192999 aataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtacc 193052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15368 - 15248
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15368 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 15269  T
Q  270 attgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  15268 attgattatctccacaacatt 15248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15599 - 15552
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccg 61  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15599 actcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccg 15552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19074 - 18962
Alignment:
Q  181 cgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19074 cgattatgatacatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatg 18975  T
Q  280 tccacatcatttg 292  Q
    |||||||||||||    
T  18974 tccacatcatttg 18962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 19300 - 19255
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggta 58  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  19300 actcatgtcatgatatgcacctatcgccacatatatgcatgtggta 19255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6842 - 6727
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  6842 aatctcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattat 6743  T
Q  270 attgttcatctccaca 285  Q
    |||| |||||||||||    
T  6742 attgatcatctccaca 6727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6867 - 6745
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6867 aatctcaacccgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgctacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattat 6768  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  6767 attgattatctccacatcatttg 6745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7087 - 7013
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7087 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaataacctcaaggtcgtcac 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24063 - 23906
Alignment:
Q  37 tgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       || ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24063 tgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctccat------accttcgatgcatcaacac-atcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 23971  T
Q  137 ccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23970 tcgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgtacat 23906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14768 - 14649
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  14768 atctcaacacaactatgatgcatggacaagtataaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattata 14669  T
Q  271 ttgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||| | ||||||||| ||||    
T  14668 ttgattatctccacaacatt 14649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15080 - 15006
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||| |||| |||||||||    
T  15080 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacaaaatcatctcagggtcgtcac 15006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Original strand, 28547 - 28660
Alignment:
Q  178 acacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttc 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28547 acacgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 28646  T
Q  277 atctccacatcatt 290  Q
    ||||||||| ||||    
T  28647 atctccacaacatt 28660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 28253 - 28327
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28253 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 28327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2344 - 2225
Alignment:
Q  174 ctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatatt 272  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2344 ctcaacccgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatatt 2245  T
Q  273 gttcatctccacatcatttg 292  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  2244 gattatctccacatcatttg 2225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3778 - 3707
Alignment:
Q  10 aaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3778 aaaactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 4497 - 4619
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4497 aatctcaactcgactacgatggatggacatgtaataagactcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattat 4596  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
     ||| ||||||||||| ||||||    
T  4597 tttgatcatctccacaacatttg 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1171
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatg 107  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| | ||||||||    
T  1446 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatg 1348  T
Q  108 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa 207  Q
    ||||  ||||| |    |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||         |||| ||| |||||||||||||||| ||  |     
T  1347 taagggttcactc----cttacataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaa---------caactcgactatgatgcatgaacatatataag 1261  T
Q  208 gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattt---tc---accacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||   ||   | | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1260 gactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 212 - 375
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  212 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 311  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||| ||||  |||| || || ||||||||||| ||||    
T  312 cgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaagactcagcatgactatgatgcatggacat 375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 5267 - 5430
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5267 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 5366  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||| ||||  |||| || || ||||||||||| ||||    
T  5367 cgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaagactcagcatgactatgatgcatggacat 5430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 3800 - 3963
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3800 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcac 3899  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatgaacat 200  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||||| ||||  |||| || || ||||||||||| ||||    
T  3900 cgaaataaaagagcacatcccttttacaaccacaagactcaccatgactatgatgcatggacat 3963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14255 - 14097
Alignment:
Q  38 gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 137  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  14255 gacagatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgttacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatcac 14156  T
Q  138 cgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaa-tctcaacacgattatgatgcatg 195  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||    
T  14155 cgaagtaaaagagtacccctcttttacaacttcaagactcaacatgactatgatgcatg 14097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 15885 - 15833
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtac 59  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15885 aataagactcacgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtac 15833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Original strand, 2073 - 2195
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  2073 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagattcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 2172  T
Q  269 tattgttcatctccacatcattt 291  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  2173 tattgatcatctccacaacattt 2195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 1846 - 1920
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcactta--ttgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtc 79  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  1846 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagtttgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtc 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Original strand, 55920 - 56026
Alignment:
Q  45 aaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagta 144  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  55920 aaatgcatgtggtacaaaatcccctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagta 56019  T
Q  145 aaagagt 151  Q
    |||||||    
T  56020 aaagagt 56026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13245 - 13125
Alignment:
Q  173 tctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatat 271  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13245 tctcaacactactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatat 13146  T
Q  272 tgttcatctccacatcatttg 292  Q
    || | ||||| ||| ||||||    
T  13145 tgattatctcaacaacatttg 13125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13502 - 13434
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  13502 actcatgtcatgatatgaacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 13434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 6537 - 6660
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  6537 aatctcaacacaactatgatacatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 6636  T
Q  269 tattgttcatctccacatcatttg 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  6637 tattgatcatctccacaacatttg 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6388
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttatt--gacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacat 83  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  6310 aataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcacat 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 29856 - 30126
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  29856 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 29955  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||        ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  29956 ggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaactcttttacagcaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 30046  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  30047 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 30126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 34838 - 35108
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | ||||||||||||    
T  34838 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag 34937  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||| | | |||         ||| ||||||||||| |||||||  | |||    
T  34938 ggctcacacctgccttacaataatatc-gaagtaaaagagttcaatccttttatagcaacat--------cgactatgatgcatggacatgtataaggac 35028  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  35029 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 35108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 156010 - 155739
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaa--aatatcgta 105  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||   || |||| |    
T  156010 ataagactcatgttatgatctgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagtcaacatcgca 155912  T
Q  106 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac 205  Q
    ||||||   |||| ||    |||||||||||| |||||||||||| |  |  ||||||||||         ||| ||| ||||||||||| |||||||      
T  155911 tgtaaggggtcactcc----ttacataatctctgaagtaaaagagccggattcttttacaac---------aactcgactatgatgcatggacatgtata 155825  T
Q  206 aagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  155824 agaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 155739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 934 - 829
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  934 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcca 836  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  835 caacatt 829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 94976 - 95098
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattat 269  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||    
T  94976 aatctccacacgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattat 95075  T
Q  270 attgttcatctccacatcatttg 292  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  95076 attgattatctccacaacatttg 95098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 66935 - 66825
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| | |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  66935 acgactatgatgcatggacatgtctaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 66837  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  66836 ctccacaacatt 66825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2975 - 2859
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  2975 aatctcaacacgactatgatgcatagacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 2876  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2875 tattgatcatctccaca 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 20353 - 20469
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  20353 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 20452  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  20453 tattgatcatatccaca 20469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Original strand, 27182 - 27298
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||    
T  27182 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaata 27281  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  27282 tattgatcatatccaca 27298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17745 - 17476
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacatt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaag 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| || |||||| ||    | |||| |||||||    
T  17745 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaag 17646  T
Q  112 atttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagtccaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagac 210  Q
       ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||        ||| ||||||||||| ||||||   | |||    
T  17645 ggctcacacctgccttacaataatctca-aagtaaaagagtc-atcccttttacaacaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtgtaaggac 17556  T
Q  211 tcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  17555 tcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaatgatattgatcatctccacaacatt 17476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 18077 - 18151
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18077 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 285
Target Start/End: Original strand, 1845 - 1954
Alignment:
Q  177 aacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgtt 275  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1845 aacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 1944  T
Q  276 catctccaca 285  Q
     |||||||||    
T  1945 tatctccaca 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1582
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  1529 aataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtacc 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3183 - 3077
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  3183 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgattatctcca 3084  T
Q  284 catcatt 290  Q
    || ||||    
T  3083 caacatt 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 31230 - 31304
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  31230 aataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 31304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 145583 - 145706
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaac-aagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacaccca-at- 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||     
T  145583 aatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaaagacttgataatgcgacatcaattcacgattttcaccacaatatagaggacaacttccatata 145682  T
Q  267 tatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  145683 tatattgatcatctccacaacatt 145706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6112 - 5999
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattata 270  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||  | ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6112 atctcaacacgagtatgatccatggacatgtataaggactcgc-aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 6014  T
Q  271 ttgttcatctccaca 285  Q
    ||| | |||||||||    
T  6013 ttgattatctccaca 5999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6384 - 6310
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  6384 aataagactcatgtcatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 25566 - 25676
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||| || |  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25566 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaatcaccatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 25665  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  25666 tccacaacatt 25676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 21311 - 21421
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatc 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||| ||||||||| || |  | | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21311 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgataacaatcaccatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 21410  T
Q  280 tccacatcatt 290  Q
    |||||| ||||    
T  21411 tccacaacatt 21421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 21153 - 21221
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  21153 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccatatctcaacaaggtcgtcac 21221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 25408 - 25476
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  25408 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 25476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 31016 - 31090
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  31016 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 31090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Original strand, 44639 - 44677
Alignment:
Q  22 atgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44639 atgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtacc 44677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28003 - 27902
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  28003 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctcca 27904  T
Q  284 ca 285  Q
    ||    
T  27903 ca 27902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 73 - 21
Alignment:
Q  8 ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 242
Target Start/End: Original strand, 958 - 1029
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcacc 242  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  958 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacc 1029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 728 - 802
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  728 aataagactcatgtcatggtatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctaaaggtcgtcac 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 37952 - 38062
Alignment:
Q  180 acgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37952 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 38050  T
Q  279 ctccacatcatt 290  Q
    ||||||| ||||    
T  38051 ctccacaacatt 38062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 37794 - 37862
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  37794 actcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6640 - 6539
Alignment:
Q  185 tatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacgatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 283  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  6640 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgattatctcca 6541  T
Q  284 ca 285  Q
    ||    
T  6540 ca 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6831
Alignment:
Q  7 aataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 60  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6884 aataagactcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtacc 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 6038
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||    
T  6154 aatctcaacacgactatgatgcatggacaggtagcaaagactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaata 6055  T
Q  269 tattgttcatctccaca 285  Q
    ||||| | |||||||||    
T  6054 tattgataatctccaca 6038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20974 - 20906
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 81  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20974 actcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 20906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20749 - 20691
Alignment:
Q  172 atctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatc 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20749 atctcaacacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatc 20691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 151
Target Start/End: Original strand, 4531 - 4578
Alignment:
Q  104 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 151  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4531 tatgtaagatttcacgtccgtcttacattatctccgaagtaaaagagt 4578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Original strand, 4502 - 4546
Alignment:
Q  246 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  4502 atatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 4546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 131
Target Start/End: Original strand, 12285 - 12329
Alignment:
Q  87 atgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacat 131  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12285 atgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccatcttacat 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 7252 - 7356
Alignment:
Q  171 aatctcaacacgattatgatgcatgaacatgtaacaa-gactcgataatgcgacaaca-atcacaattttcaccacgatatataggacaacacccaatta 268  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| ||    
T  7252 aatctcaacacgacaatgatgcatggacatagagcaaagactcgataatgcgacatcaccccacaatttccacaacaatataaaggacaacatccaaata 7351  T
Q  269 tattg 273  Q
    |||||    
T  7352 tattg 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24918 - 24878
Alignment:
Q  13 actcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 53  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24918 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatg 24878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University