View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15312_low_4 (Length: 478)

Name: NF15312_low_4
Description: NF15312
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15312_low_4
NF15312_low_4
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-460)||(2325392-2325844)
chr2 (1-190)||(33551000-33551189)
chr2 (1-191)||(17071751-17071941)
chr2 (1-191)||(17054110-17054300)
chr2 (4-191)||(19424645-19424832)
chr2 (1-190)||(37905709-37905897)
chr2 (4-188)||(36641988-36642174)
chr2 (4-188)||(3176941-3177125)
chr2 (12-190)||(26357577-26357755)
chr2 (15-196)||(19289351-19289527)
chr2 (4-192)||(29242155-29242343)
chr2 (4-188)||(33660385-33660569)
chr2 (4-191)||(4264094-4264281)
chr2 (12-151)||(43648270-43648409)
chr2 (4-192)||(4166920-4167108)
chr2 (4-151)||(4478408-4478556)
chr2 (4-192)||(31570751-31570939)
chr2 (19-196)||(13711458-13711635)
chr2 (4-191)||(27349956-27350143)
chr2 (4-190)||(33902068-33902252)
chr2 (4-190)||(19313852-19314037)
chr2 (19-191)||(11366413-11366585)
chr2 (12-190)||(4763628-4763809)
chr2 (4-188)||(43770856-43771039)
chr2 (4-192)||(39167380-39167568)
chr2 (4-151)||(33709249-33709396)
chr2 (5-188)||(41463868-41464051)
chr2 (12-195)||(18494305-18494476)
chr2 (4-93)||(45327817-45327906)
chr2 (12-91)||(41960939-41961018)
chr2 (4-191)||(5881533-5881724)
chr2 (4-188)||(44285951-44286135)
chr2 (4-190)||(44913662-44913849)
chr2 (4-190)||(41465509-41465687)
chr2 (4-119)||(7006938-7007053)
chr2 (21-89)||(31861953-31862021)
chr2 (1-190)||(35958909-35959085)
chr2 (45-90)||(41051263-41051308)
chr2 (15-87)||(19501768-19501839)
chr2 (142-193)||(19093410-19093461)
chr2 (142-190)||(31861895-31861943)
chr2 (129-192)||(41960881-41960944)
chr2 (145-191)||(39788580-39788626)
chr2 (142-190)||(22963400-22963448)
chr2 (142-190)||(22998029-22998077)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (1-194)||(1204922-1205115)
chr8 (2-190)||(10555205-10555393)
chr8 (1-191)||(1150107-1150297)
chr8 (12-181)||(37970532-37970701)
chr8 (4-191)||(27082843-27083030)
chr8 (1-192)||(43643597-43643788)
chr8 (1-190)||(12876108-12876297)
chr8 (5-190)||(13307622-13307807)
chr8 (4-192)||(36694971-36695159)
chr8 (4-190)||(6098523-6098709)
chr8 (12-193)||(34894963-34895144)
chr8 (4-176)||(11727037-11727209)
chr8 (4-192)||(38643975-38644163)
chr8 (5-192)||(16222860-16223047)
chr8 (12-191)||(16446888-16447067)
chr8 (13-178)||(23854445-23854610)
chr8 (4-188)||(465843-466027)
chr8 (4-190)||(5299951-5300137)
chr8 (1-191)||(30654585-30654775)
chr8 (3-177)||(31933890-31934064)
chr8 (4-164)||(34952036-34952196)
chr8 (4-190)||(41362517-41362700)
chr8 (4-194)||(9864143-9864333)
chr8 (1-127)||(1149634-1149760)
chr8 (1-188)||(7890959-7891137)
chr8 (15-192)||(40862416-40862593)
chr8 (1-191)||(8803819-8803998)
chr8 (4-190)||(33906223-33906397)
chr8 (15-100)||(35459727-35459812)
chr8 (4-117)||(39099124-39099237)
chr8 (4-190)||(44869495-44869683)
chr8 (4-90)||(41910993-41911079)
chr8 (4-90)||(1953994-1954081)
chr8 (12-64)||(4132698-4132750)
chr8 (5-86)||(43025805-43025886)
chr8 (4-82)||(7998401-7998480)
chr8 (66-190)||(4133077-4133199)
chr8 (129-190)||(15009241-15009302)
chr8 (129-192)||(24823402-24823465)
chr8 (35-90)||(33197948-33198003)
chr8 (134-189)||(35459833-35459888)
chr8 (145-189)||(3858849-3858893)
chr8 (153-193)||(39099263-39099303)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (4-188)||(699152-699336)
chr5 (4-193)||(24886099-24886290)
chr5 (4-189)||(22980794-22980979)
chr5 (1-178)||(27318473-27318650)
chr5 (4-197)||(5112302-5112495)
chr5 (4-191)||(1429134-1429321)
chr5 (4-191)||(9200232-9200419)
chr5 (4-193)||(8741875-8742065)
chr5 (1-195)||(22974068-22974262)
chr5 (12-192)||(38528234-38528413)
chr5 (4-191)||(39572818-39573005)
chr5 (4-193)||(14919517-14919707)
chr5 (4-190)||(15724490-15724674)
chr5 (4-194)||(19119855-19120045)
chr5 (4-190)||(22019632-22019818)
chr5 (4-192)||(12910348-12910541)
chr5 (4-189)||(32563150-32563335)
chr5 (4-176)||(30969313-30969485)
chr5 (1-192)||(35826470-35826660)
chr5 (4-192)||(27330304-27330490)
chr5 (1-189)||(31705598-31705785)
chr5 (4-190)||(14409316-14409501)
chr5 (4-177)||(26268087-26268260)
chr5 (7-192)||(36860421-36860606)
chr5 (4-188)||(5837557-5837741)
chr5 (4-188)||(25500915-25501099)
chr5 (4-190)||(7693230-7693416)
chr5 (4-190)||(31786635-31786821)
chr5 (4-190)||(36866762-36866948)
chr5 (12-190)||(35511474-35511652)
chr5 (5-192)||(8466743-8466929)
chr5 (12-190)||(23116219-23116397)
chr5 (4-190)||(40133385-40133571)
chr5 (16-160)||(22255211-22255356)
chr5 (5-178)||(33908245-33908418)
chr5 (12-151)||(7208861-7208999)
chr5 (12-182)||(43308649-43308819)
chr5 (4-151)||(17158020-17158166)
chr5 (4-119)||(23954778-23954894)
chr5 (12-111)||(15992537-15992636)
chr5 (4-119)||(21088755-21088870)
chr5 (1-127)||(35504428-35504554)
chr5 (5-119)||(6824469-6824585)
chr5 (4-177)||(8436979-8437151)
chr5 (4-151)||(28416516-28416663)
chr5 (35-151)||(25668689-25668804)
chr5 (4-197)||(35933895-35934082)
chr5 (53-188)||(11898004-11898139)
chr5 (93-192)||(13956423-13956522)
chr5 (19-148)||(42342775-42342902)
chr5 (1-136)||(5829955-5830081)
chr5 (106-190)||(26317775-26317859)
chr5 (113-190)||(16004474-16004552)
chr5 (105-150)||(22255615-22255660)
chr5 (136-187)||(13380498-13380549)
chr5 (142-191)||(36055874-36055923)
chr5 (20-68)||(13956367-13956415)
chr5 (142-193)||(22616491-22616542)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (1-188)||(15752027-15752214)
chr1 (1-193)||(32267027-32267219)
chr1 (12-191)||(2959743-2959922)
chr1 (1-192)||(15382927-15383118)
chr1 (4-194)||(48620629-48620819)
chr1 (12-191)||(18422646-18422825)
chr1 (4-194)||(11742345-11742534)
chr1 (12-189)||(10922724-10922901)
chr1 (4-192)||(16415639-16415828)
chr1 (19-180)||(28564790-28564951)
chr1 (3-194)||(37618885-37619080)
chr1 (3-191)||(30254419-30254606)
chr1 (4-190)||(38823210-38823396)
chr1 (4-191)||(10182002-10182189)
chr1 (4-190)||(31621547-31621733)
chr1 (4-190)||(42721035-42721221)
chr1 (4-189)||(14758038-14758223)
chr1 (5-184)||(47279191-47279370)
chr1 (1-192)||(8222125-8222313)
chr1 (19-164)||(9903063-9903208)
chr1 (4-190)||(7079057-7079254)
chr1 (1-190)||(30326943-30327132)
chr1 (12-193)||(34012379-34012560)
chr1 (12-161)||(51128884-51129033)
chr1 (12-188)||(28769651-28769826)
chr1 (4-188)||(41926161-41926345)
chr1 (4-177)||(4330288-4330463)
chr1 (3-190)||(23999343-23999530)
chr1 (13-188)||(27763314-27763487)
chr1 (4-151)||(32216090-32216237)
chr1 (1-191)||(19899760-19899950)
chr1 (4-193)||(39393376-39393566)
chr1 (19-164)||(37451308-37451452)
chr1 (22-190)||(3309144-3309311)
chr1 (4-195)||(1547278-1547461)
chr1 (4-174)||(27532975-27533144)
chr1 (4-193)||(15168082-15168278)
chr1 (4-188)||(27563899-27564084)
chr1 (4-190)||(27227479-27227657)
chr1 (4-188)||(33725594-33725778)
chr1 (4-193)||(3534925-3535114)
chr1 (12-188)||(46931406-46931585)
chr1 (4-190)||(47682488-47682673)
chr1 (23-190)||(27267212-27267376)
chr1 (4-202)||(238507-238703)
chr1 (4-158)||(40884841-40884995)
chr1 (42-190)||(21289661-21289816)
chr1 (12-100)||(25160718-25160806)
chr1 (12-91)||(22170806-22170885)
chr1 (129-193)||(22170747-22170811)
chr1 (108-191)||(30254853-30254936)
chr1 (4-100)||(38759615-38759715)
chr1 (142-190)||(43579242-43579290)
chr1 (60-93)||(1359933-1359966)
chr1 (142-191)||(13876919-13876968)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (16-193)||(7884-8061)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (4-193)||(25701082-25701271)
chr4 (16-192)||(55477928-55478108)
chr4 (12-190)||(19089486-19089664)
chr4 (16-188)||(34948134-34948306)
chr4 (1-193)||(35021057-35021249)
chr4 (4-188)||(36493713-36493897)
chr4 (12-191)||(37663774-37663951)
chr4 (1-191)||(879570-879760)
chr4 (1-191)||(25184112-25184302)
chr4 (4-194)||(29584225-29584413)
chr4 (4-190)||(28003011-28003197)
chr4 (1-190)||(19440670-19440860)
chr4 (4-188)||(27396618-27396802)
chr4 (4-194)||(38011850-38012040)
chr4 (17-189)||(4597994-4598165)
chr4 (3-191)||(42199728-42199916)
chr4 (1-192)||(32912602-32912793)
chr4 (4-165)||(23761097-23761257)
chr4 (4-188)||(17167715-17167899)
chr4 (4-188)||(17173292-17173476)
chr4 (1-192)||(34361514-34361704)
chr4 (4-190)||(55241130-55241315)
chr4 (4-127)||(4934227-4934351)
chr4 (5-192)||(9139245-9139430)
chr4 (4-195)||(39397913-39398095)
chr4 (4-176)||(5047990-5048162)
chr4 (1-193)||(50697239-50697430)
chr4 (4-188)||(47253751-47253926)
chr4 (20-190)||(49375966-49376137)
chr4 (1-187)||(6864038-6864224)
chr4 (4-193)||(32579441-32579632)
chr4 (4-190)||(7703517-7703695)
chr4 (15-193)||(50764732-50764905)
chr4 (4-165)||(54499262-54499425)
chr4 (4-188)||(33341397-33341584)
chr4 (4-193)||(30002657-30002838)
chr4 (12-160)||(46888190-46888338)
chr4 (4-187)||(32592096-32592279)
chr4 (4-189)||(37775670-37775853)
chr4 (4-188)||(33816558-33816742)
chr4 (4-82)||(1815409-1815487)
chr4 (62-191)||(37287732-37287862)
chr4 (1-194)||(3042607-3042808)
chr4 (60-191)||(35025669-35025800)
chr4 (85-194)||(4205112-4205221)
chr4 (108-192)||(7152235-7152319)
chr4 (129-192)||(17272009-17272072)
chr4 (106-192)||(4396324-4396410)
chr4 (4-91)||(17272067-17272150)
chr4 (132-188)||(52516599-52516655)
chr4 (106-190)||(53124287-53124371)
chr4 (142-192)||(2704510-2704560)
chr4 (142-192)||(38812260-38812310)
chr4 (136-188)||(20097485-20097537)
chr4 (142-184)||(52195645-52195687)
chr4 (142-190)||(38811813-38811861)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (12-196)||(30055495-30055680)
chr7 (12-192)||(18797302-18797480)
chr7 (4-190)||(5657481-5657667)
chr7 (4-190)||(31520724-31520909)
chr7 (4-190)||(37346997-37347183)
chr7 (12-190)||(27283719-27283897)
chr7 (4-191)||(21991610-21991797)
chr7 (1-192)||(32821050-32821241)
chr7 (12-190)||(7334769-7334947)
chr7 (4-190)||(8861260-8861446)
chr7 (4-165)||(29173540-29173701)
chr7 (4-189)||(48928564-48928748)
chr7 (12-191)||(31579072-31579256)
chr7 (1-189)||(38258521-38258709)
chr7 (4-194)||(12390630-12390820)
chr7 (12-194)||(24211712-24211894)
chr7 (16-190)||(37109847-37110021)
chr7 (16-192)||(17842598-17842774)
chr7 (4-176)||(22687228-22687400)
chr7 (4-190)||(15612759-15612944)
chr7 (4-150)||(44413379-44413525)
chr7 (4-188)||(25691544-25691729)
chr7 (4-192)||(9355826-9356014)
chr7 (4-188)||(27421380-27421563)
chr7 (4-191)||(32432431-32432613)
chr7 (4-190)||(4582894-4583080)
chr7 (4-189)||(33688262-33688446)
chr7 (4-192)||(41765078-41765266)
chr7 (41-192)||(26524364-26524515)
chr7 (4-163)||(26980325-26980484)
chr7 (12-192)||(10481576-10481758)
chr7 (4-191)||(43686015-43686201)
chr7 (4-190)||(6546494-6546680)
chr7 (4-174)||(48928297-48928466)
chr7 (4-188)||(11071182-11071367)
chr7 (4-164)||(12165753-12165913)
chr7 (20-188)||(23111167-23111335)
chr7 (4-190)||(10359214-10359400)
chr7 (60-190)||(34362205-34362334)
chr7 (19-151)||(38053500-38053624)
chr7 (4-81)||(37704241-37704318)
chr7 (4-72)||(15672762-15672830)
chr7 (4-90)||(44598741-44598827)
chr7 (39-151)||(35353122-35353235)
chr7 (4-101)||(43925166-43925262)
chr7 (4-89)||(32593189-32593273)
chr7 (142-192)||(40381938-40381988)
chr7 (4-57)||(37703498-37703551)
chr7 (4-46)||(26588084-26588126)
chr7 (52-90)||(34362150-34362188)
chr7 (135-188)||(8299192-8299245)
chr7 (142-190)||(23402371-23402419)
chr7 (95-150)||(37704182-37704238)
chr7 (110-162)||(44598367-44598419)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (12-190)||(20373303-20373481)
chr3 (12-192)||(48354930-48355110)
chr3 (12-191)||(3655209-3655388)
chr3 (7-190)||(37203058-37203241)
chr3 (3-194)||(47481509-47481700)
chr3 (1-191)||(26941256-26941446)
chr3 (4-193)||(35844314-35844504)
chr3 (1-191)||(40552255-40552445)
chr3 (12-190)||(51212988-51213166)
chr3 (4-191)||(11466814-11467001)
chr3 (8-190)||(37157699-37157880)
chr3 (12-191)||(7327489-7327669)
chr3 (4-175)||(11357363-11357535)
chr3 (4-180)||(29099356-29099532)
chr3 (12-144)||(42506082-42506214)
chr3 (4-191)||(52040921-52041109)
chr3 (4-190)||(4015451-4015637)
chr3 (4-188)||(46297761-46297945)
chr3 (12-192)||(4761656-4761838)
chr3 (5-191)||(44186501-44186687)
chr3 (4-192)||(21193595-21193783)
chr3 (4-192)||(22450957-22451145)
chr3 (4-194)||(53229151-53229342)
chr3 (4-194)||(33378784-33378971)
chr3 (18-177)||(40935995-40936154)
chr3 (19-192)||(21009816-21009992)
chr3 (4-190)||(27480378-27480564)
chr3 (4-194)||(34132922-34133112)
chr3 (12-192)||(39282642-39282821)
chr3 (4-151)||(3362283-3362432)
chr3 (4-190)||(45174494-45174683)
chr3 (4-188)||(54828700-54828883)
chr3 (3-190)||(54505799-54505985)
chr3 (12-188)||(24708122-24708295)
chr3 (5-162)||(53176074-53176230)
chr3 (4-150)||(2007964-2008110)
chr3 (7-189)||(25579731-25579913)
chr3 (4-188)||(43975887-43976068)
chr3 (4-190)||(44891498-44891674)
chr3 (4-187)||(22446063-22446247)
chr3 (12-192)||(46994668-46994837)
chr3 (4-193)||(32373460-32373647)
chr3 (4-164)||(24488961-24489121)
chr3 (4-87)||(29163912-29163995)
chr3 (4-119)||(43348320-43348434)
chr3 (4-119)||(14586669-14586784)
chr3 (16-148)||(38591727-38591863)
chr3 (4-69)||(33698265-33698330)
chr3 (4-79)||(11835626-11835702)
chr3 (12-67)||(22622725-22622780)
chr3 (152-194)||(53175710-53175752)
chr3 (106-190)||(33698183-33698263)
chr3 (142-192)||(40640634-40640684)
chr3 (124-193)||(55343403-55343472)
chr3 (133-189)||(29163839-29163895)
chr3 (142-194)||(32180747-32180799)
chr3 (7-74)||(36012244-36012312)
chr3 (4-63)||(1089811-1089870)
chr3 (38-106)||(53811695-53811769)
chr3 (142-188)||(53818509-53818555)
chr3 (136-189)||(11835737-11835790)
chr3 (106-147)||(41585408-41585449)
chr3 (143-187)||(4556543-4556587)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (4-194)||(4318820-4319011)
chr6 (5-191)||(8513232-8513419)
chr6 (4-190)||(7235033-7235218)
chr6 (4-174)||(15491631-15491801)
chr6 (1-192)||(1945831-1946023)
chr6 (3-192)||(5627389-5627578)
chr6 (4-188)||(29182165-29182349)
chr6 (12-191)||(7055221-7055400)
chr6 (5-191)||(3879938-3880124)
chr6 (14-190)||(33618834-33619010)
chr6 (6-190)||(33893003-33893186)
chr6 (4-164)||(21017110-21017270)
chr6 (1-136)||(6091178-6091313)
chr6 (4-189)||(20768087-20768268)
chr6 (5-188)||(6088910-6089094)
chr6 (4-188)||(30353356-30353540)
chr6 (59-194)||(18498429-18498565)
chr6 (142-198)||(19631741-19631797)
chr6 (142-198)||(11084152-11084208)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (4-191)||(133-320)
scaffold0002 (20-164)||(94398-94542)
scaffold0002 (1-136)||(408425-408559)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (19-188)||(43959-44128)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-188)||(146014-146199)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (19-188)||(154659-154828)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (4-188)||(11908-12095)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (5-142)||(267331-267469)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (106-191)||(42347-42432)
scaffold0009 (129-196)||(100815-100882)
scaffold0009 (5-46)||(100894-100935)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (141-190)||(12137-12186)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 2325392 - 2325844
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2325392 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttga--------tgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtaca 2325483  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttatatta 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2325484 aacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattttccttttatatta 2325583  T
Q  201 atcgttttgatctttaaatttgcttcgattacaccaattaatttggataattttccattaatttgtttgtttgtaagagagggagagacatcttatattt 300  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325584 atcgttttgatccttaaattcgctttgattacaccaattaatttggataattttccattaatttgtttgtttgtaagagagggagagacatcttatattt 2325683  T
Q  301 atctcaccttgtacaga-nnnnnnnngcattacactttaattaatggatcgaggtaatttaaccatataatttttctttcttcatgtttttcatctttac 399  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2325684 atctcaccttgtacagatttttttttgcattacactttaattaatggatcgaggtaatttaaccatataatttttttttcttcatgtttttcatctttag 2325783  T
Q  400 tcttgcaatcaattatagttcagctttgttccatttaacagatggtaatacatgtctcacc 460  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  2325784 tcttgcaatcaattatagtgcaactttgttccatttaagagggggtaatacatgtctcacc 2325844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 33551000 - 33551189
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33551000 acgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtaca 33551099  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  33551100 aacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 33551189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 17071751 - 17071941
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  17071751 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtaca 17071850  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     | |||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17071851 aataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 17054110 - 17054300
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||| ||||||    
T  17054110 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtaca 17054209  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     |||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17054210 aacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17054300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 19424645 - 19424832
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || | ||    
T  19424645 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaac 19424744  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19424745 aatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcct 19424832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37905897 - 37905709
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37905897 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 37905798  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     ||  |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  37905797 aacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 37905709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36642174 - 36641988
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa--ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacag 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  36642174 cttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaa 36642075  T
Q  102 acaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    ||| || ||||||||||   ||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  36642074 acagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 36641988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3177125 - 3176941
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3177125 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 3177026  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | | | ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  3177025 agttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 3176941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26357755 - 26357577
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |    
T  26357755 aaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggat 26357656  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26357655 gttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcc 26357577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Original strand, 19289351 - 19289527
Alignment:
Q  15 gtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19289351 gtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgtt 19289450  T
Q  115 actcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttat 196  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19289451 actcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcat-----tgacttcaccatagaattttccttttat 19289527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 29242155 - 29242343
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||    
T  29242155 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaac 29242254  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||||||| || || |||| | |||||||||| |||||||||| | ||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29242255 agtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 29242343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 33660385 - 33660569
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  33660385 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 33660484  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | | ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||   || ||||||||||| ||||||    
T  33660485 agttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 4264094 - 4264281
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4264094 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaac 4264193  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | |||| |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||    
T  4264194 agtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcct 4264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 43648270 - 43648409
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||    
T  43648270 aaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggt 43648369  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43648370 gttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 43648409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4167108 - 4166920
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  4167108 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaac 4167009  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||||||||||  | |||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||    
T  4167008 agtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 4166920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4478556 - 4478408
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  4478556 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaa 4478457  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4478456 caatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 4478408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 31570751 - 31570939
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || | |     
T  31570751 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaat 31570850  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | |||||||||||| |  ||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31570851 agtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcctt 31570939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13711635 - 13711458
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  13711635 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactc 13711536  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttat 196  Q
    |  ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13711535 acaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttcattttat 13711458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 27349956 - 27350143
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27349956 cttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 27350054  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaa-gtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | || |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  | |||   || |||||||||||||||||||||    
T  27350055 agtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaatattattttaatgacttcaccataaaattttcct 27350143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902068
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaac 33902153  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||    
T  33902152 agtggggtattactcactacattttttatgt--tagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttcc 33902068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19314037 - 19313852
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  19314037 cttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaat 19313939  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |  |||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  19313938 agtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 11366413 - 11366585
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | | || | ||||||||    
T  11366413 gataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactc 11366512  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  || | ||||||||| |||||||||    
T  11366513 attacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcct 11366585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4763809 - 4763628
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4763809 aaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 4763710  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatag---tgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||| |||| || || || |||||   |||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||    
T  4763709 gttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcc 4763628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 43770856 - 43771039
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  43770856 cttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaac 43770955  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  43770956 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 39167380 - 39167568
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39167380 cttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 39167479  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | || |||||||||||  | | || ||||  |||  |||||||||||  | |||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  39167480 agtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcctt 39167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 33709249 - 33709396
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  33709249 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaac 33709348  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    | ||| |||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33709349 agtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 33709396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Original strand, 41463868 - 41464051
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||    
T  41463868 ttaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaaca 41463967  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
     || |||||||||||  ||| || |||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  41463968 gtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 18494305 - 18494476
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||    
T  18494305 aaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggt 18494392  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttta 195  Q
    ||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  18494393 gttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttcctttta 18494476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 45327906 - 45327817
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45327906 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41961018 - 41960939
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41961018 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5881724 - 5881533
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  5881724 cttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaac 5881626  T
Q  104 aatggggtgttactcaataca-----tttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||||||||||||||  |||      || |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||    
T  5881625 agtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaataaaattttcct 5881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44286135 - 44285951
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||| ||    
T  44286135 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaac 44286036  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | || | | || |||   ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  44286035 agtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattcgcatgacttcaccgtataatttt 44285951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44913849 - 44913662
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactat-gaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| | |||| |    
T  44913849 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaa 44913750  T
Q  103 caa-tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||| || |||||||||||  |||||| ||||  || |||||||||||||| | ||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||    
T  44913749 caagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttcac-ataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41465687 - 41465509
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||| ||          
T  41465687 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgataccagcgt------ 41465594  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
      | ||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  41465593 --tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 7006938 - 7007053
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||  | |||||| ||    
T  7006938 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaac 7007037  T
Q  104 aatggggtgttactca 119  Q
    | |||| |||||||||    
T  7007038 agtgggatgttactca 7007053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31862021 - 31861953
Alignment:
Q  21 taaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  31862021 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35959085 - 35958909
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| |||||| ||||||    
T  35959085 acgcttataacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcattgtaca 35958999  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     ||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||   || |||||| |||| ||||||||    
T  35958998 aacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcatcatagaattttcc 35958909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 90
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051308
Alignment:
Q  45 gttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 90  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 41051308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 19501768 - 19501839
Alignment:
Q  15 gtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 87  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501768 gtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19093461 - 19093410
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19093461 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccataaaattttccttt 19093410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31861943 - 31861895
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31861943 ttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 31861895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41960944 - 41960881
Alignment:
Q  129 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  41960944 tgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttcaccatagaattttcctt 41960881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 191
Target Start/End: Original strand, 39788580 - 39788626
Alignment:
Q  145 acttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  39788580 acttcactagaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcct 39788626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22963448 - 22963400
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  22963448 ttaactttaccagaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcc 22963400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 22998029 - 22998077
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  22998029 ttaactttaccagaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcc 22998077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1205115 - 1204922
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1205115 acgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 1205016  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
     ||| ||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1205015 aacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttcctttt 1204922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 10555205 - 10555393
Alignment:
Q  2 cgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacag 101  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  10555205 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaa 10555304  T
Q  102 acaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  10555305 acagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 10555393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 1150107 - 1150297
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  1150107 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgttgtaca 1150206  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  1150207 aacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 1150297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 37970532 - 37970701
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  37970532 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggt 37970631  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccata 181  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37970632 gttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccata 37970701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 27082843 - 27083030
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||    
T  27082843 cttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaac 27082942  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||    
T  27082943 agtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcct 27083030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 43643597 - 43643788
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  43643597 acgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtaca 43643696  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43643697 aacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 43643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12876297 - 12876108
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12876297 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 12876198  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     ||| | ||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |||| |||||| ||||||||    
T  12876197 aacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13307807 - 13307622
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  13307807 ttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaata 13307708  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     || |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  13307707 gtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 36694971 - 36695159
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36694971 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 36695070  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||    
T  36695071 agtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcctt 36695159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 6098523 - 6098709
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6098523 cttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 6098622  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  6098623 agtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttcc 6098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34895144 - 34894963
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||| ||| ||| ||    
T  34895144 aaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagt 34895045  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34895044 gttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccttt 34894963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11727209 - 11727037
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |     
T  11727209 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaat 11727110  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttca 176  Q
    | |||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||    
T  11727109 agtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 11727037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38644163 - 38643975
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |  ||| ||    
T  38644163 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaac 38644064  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  38644063 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16223047 - 16222860
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  16223047 ttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaact 16222948  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     |||||   |||||| || |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||||    
T  16222947 gtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcctt 16222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 16446888 - 16447067
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || | |||| ||| ||||||    
T  16446888 aaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggt 16446987  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16446988 gttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 16447067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 23854445 - 23854610
Alignment:
Q  13 aggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |||||    
T  23854445 aggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtg 23854544  T
Q  113 ttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcacc 178  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  23854545 ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 23854610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 466027 - 465843
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  466027 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaac 465928  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  465927 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttcaccataaaatttt 465843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 5299951 - 5300137
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  5299951 cttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 5300050  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | | | ||| |||| |  ||| || ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5300051 agtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 30654585 - 30654775
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||    
T  30654585 acgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaaca 30654684  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  30654685 aacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcct 30654775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 31933890 - 31934064
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | |    
T  31933890 gcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaa 31933989  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcac 177  Q
     | |||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  31933990 gagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcac 31934064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 34952036 - 34952196
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34952036 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 34952135  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
    | |||| |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34952136 agtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcatt 34952196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41362700 - 41362517
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |     
T  41362700 cttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactatacaaat 41362601  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||||| ||||||| | |||   ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  41362600 agtggggtgttactcactacattt-ttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9864333 - 9864143
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9864333 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 9864234  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||||||    
T  9864233 agtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctttt 9864143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 1149634 - 1149760
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1149634 acgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtaca 1149733  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacattt 127  Q
     ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  1149734 aacagtgggttgttactcattacattt 1149760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 7890959 - 7891137
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  7890959 acgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtaca 7891058  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
     ||  ||| |||||         |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  7891059 aacggtggagtgtt---------atttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 7891137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40862593 - 40862416
Alignment:
Q  15 gtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtt 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  40862593 gtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatgag-actgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgtt 40862495  T
Q  115 actcaataca-tttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||||||| ||| ||||||||||    
T  40862494 actcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattttcctt 40862416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8803819 - 8803998
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||       | ||||||||||||||||| | ||||    
T  8803819 acgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctaca 8803911  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     | | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    || ||||||||||| |||||||||    
T  8803912 aatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat----atgacttcaccatagaattttcct 8803998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33906397 - 33906223
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||            || | ||    
T  33906397 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt------------tataaac 33906310  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||| |||||| |||| || | ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  33906309 agtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttcc 33906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 35459727 - 35459812
Alignment:
Q  15 gtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35459727 gtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtaca 35459812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 39099124 - 39099237
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |     
T  39099124 cttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaag 39099223  T
Q  104 aatggggtgttact 117  Q
    | ||||||||||||    
T  39099224 agtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44869683 - 44869495
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |    
T  44869683 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaa 44869584  T
Q  103 caatggggtgttactc----aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    || |||||  | ||||    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||| |||||| || ||||||||    
T  44869583 cagtgggg-atcactcacaaaatactttta--atgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattcttataatttcaccgtagaattttcc 44869495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 41910993 - 41911079
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 90  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41910993 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatg 41911079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 1953994 - 1954081
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgat-gatactatgaggactgaacttttgatg 90  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1953994 cttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatg 1954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 4132698 - 4132750
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 64  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132698 aaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43025886 - 43025805
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  43025886 ttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaactttt 43025805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7998480 - 7998401
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 82  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  7998480 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 190
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133199
Alignment:
Q  66 tactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |  ||| ||||||| ||  ||| | ||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgcta--gtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  166 gcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
      || |||| |||||||||||||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaattttcc 4133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15009302 - 15009241
Alignment:
Q  129 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  15009302 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 15009241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 192
Target Start/End: Original strand, 24823402 - 24823465
Alignment:
Q  129 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  24823402 tgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcctt 24823465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 33198003 - 33197948
Alignment:
Q  35 gtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 90  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33198003 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatg 33197948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 189
Target Start/End: Original strand, 35459833 - 35459888
Alignment:
Q  134 ttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  35459833 ttatagtattaactttacgaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 35459888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3858893 - 3858849
Alignment:
Q  145 acttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  3858893 acttcactagaaaagtcattcgtattatttcaccataaaattttc 3858849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 193
Target Start/End: Original strand, 39099263 - 39099303
Alignment:
Q  153 agaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39099263 agaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 39099303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 699336 - 699152
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  699336 cttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaac 699237  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | |||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  699236 agtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttcaccataaaatttt 699152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24886290 - 24886099
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24886290 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 24886191  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac--gagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24886190 agtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaattttccttt 24886099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22980979 - 22980794
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  22980979 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaac 22980880  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    | |||||| ||||||| |  |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22980879 agtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcataaaattttc 22980794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 27318473 - 27318650
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  27318473 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtaca 27318572  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcacc 178  Q
     ||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27318573 aacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcacc 27318650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 5112302 - 5112495
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  5112302 cttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 5112401  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttata 197  Q
    | |||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5112402 agtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttccttgtata 5112495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 1429134 - 1429321
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  1429134 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaac 1429233  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||  ||| ||||||||||| | |||||||    
T  1429234 agtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttcaccatagatttttcct 1429321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9200419 - 9200232
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  9200419 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaac 9200320  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
      ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||||||||||||||||||||    
T  9200319 tgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcct 9200232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 8741875 - 8742065
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  8741875 cttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaac 8741974  T
Q  104 aat-ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    ||| |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8741975 aatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 8742065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22974068 - 22974262
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  22974068 acgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtaca 22974167  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttta 195  Q
     ||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22974168 aacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcctttta 22974262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 38528234 - 38528413
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  38528234 aaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggt 38528332  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38528333 gttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 38528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39573005 - 39572818
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  39573005 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaac 39572906  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||| ||||||||||  |||||| | || ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  39572905 agtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 39572818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 14919517 - 14919707
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  14919517 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaac 14919616  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca-cgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    | || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | | |||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14919617 agtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttccttt 14919707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15724674 - 15724490
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  15724674 cttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaac 15724577  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15724576 agtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19120045 - 19119855
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19120045 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 19119946  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | ||||||||||||    ||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19119945 agtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctttt 19119855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22019818 - 22019632
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22019818 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaac 22019719  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  22019718 aatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttcaccatagaaatttcc 22019632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12910541 - 12910348
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc-----agtgta 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     | ||||    
T  12910541 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgta 12910442  T
Q  99 cagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    || ||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12910441 caaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 12910348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32563335 - 32563150
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32563335 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagac 32563236  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    | ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||   || ||||||||||| |||||||    
T  32563235 agtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 30969313 - 30969485
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  30969313 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaat 30969412  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttca 176  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||    
T  30969413 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgacttca 30969485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 35826470 - 35826660
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35826470 acgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtaca 35826568  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35826569 aacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35826660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27330490 - 27330304
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  27330490 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaac 27330391  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | |  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27330390 agtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 27330304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 31705598 - 31705785
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31705598 acgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtaca 31705696  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
     ||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   || ||||||||||| |||||||    
T  31705697 aacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 14409316 - 14409501
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||   |     
T  14409316 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaag 14409414  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  14409415 agtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26268260 - 26268087
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||    
T  26268260 cttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaac 26268161  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcac 177  Q
    | ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  26268160 agtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 26268087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36860606 - 36860421
Alignment:
Q  7 aaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  36860606 aaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 36860507  T
Q  107 ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||  | | ||||||||||| ||||||||||    
T  36860506 ggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 36860421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5837741 - 5837557
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  5837741 cttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaac 5837642  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||    
T  5837641 agtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatgaattcaccgtagaatttt 5837557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 25500915 - 25501099
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  25500915 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaac 25501014  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | || ||||||| |||  ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  25501015 agtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7693416 - 7693230
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| || ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||    
T  7693416 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaac 7693317  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  7693316 agtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcc 7693230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 31786635 - 31786821
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||    
T  31786635 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaac 31786734  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||   | |||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||    
T  31786735 agtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36866948 - 36866762
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  36866948 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaac 36866849  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  | | ||||||||||| ||||||||    
T  36866848 agtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 35511474 - 35511652
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||    
T  35511474 aaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagt 35511573  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||||||||  |||||||    
T  35511574 gttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttcaccataggattttcc 35511652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8466929 - 8466743
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||| |      
T  8466929 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtaca-aag 8466831  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||||| |||  ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||    
T  8466830 agggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattttcctt 8466743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 23116219 - 23116397
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||    
T  23116219 aaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggt 23116318  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||    
T  23116319 gctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40133571 - 40133385
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |     
T  40133571 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaat 40133472  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||||||||| | ||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||    
T  40133471 agtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22255356 - 22255211
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtta 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||    
T  22255356 taggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgtta 22255257  T
Q  116 ctcaataca-tttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagt 160  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  22255256 ctcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagt 22255211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33908418 - 33908245
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||    
T  33908418 ttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca 33908319  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcacc 178  Q
     ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||    
T  33908318 gtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgacttcacc 33908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 7208861 - 7208999
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||    
T  7208861 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggt 7208959  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||  | ||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  7208960 gttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcac 7208999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 43308649 - 43308819
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| | ||||    
T  43308649 aaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggt 43308747  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac-gagaaaagtcattcgcataacttcaccataa 182  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43308748 gttattcattacatttttgatgttataatgttaactttactaaaaaaagtcattctcatgacttcaccataa 43308819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 17158020 - 17158166
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  17158020 cttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaac 17158118  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
      ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17158119 ggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 23954778 - 23954894
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagt-gtacaga 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || | ||| | |    
T  23954778 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaa 23954877  T
Q  103 caatggggtgttactca 119  Q
    || ||||||||||||||    
T  23954878 cagtggggtgttactca 23954894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 15992537 - 15992636
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15992537 aaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 21088755 - 21088870
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21088755 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 21088854  T
Q  104 aatggggtgttactca 119  Q
    | |||||||| |||||    
T  21088855 agtggggtgtcactca 21088870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35504554 - 35504428
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||   ||||    
T  35504554 acgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcataca 35504455  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacattt 127  Q
     ||  || ||||||||||| |||||||    
T  35504454 aacggtgaggtgttactcattacattt 35504428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 6824469 - 6824585
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactga--acttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  6824469 ttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaa 6824568  T
Q  103 caatggggtgttactca 119  Q
    || ||| ||||||||||    
T  6824569 cagtggagtgttactca 6824585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8437151 - 8436979
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8437151 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatgg-ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 8437053  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcac 177  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  || | ||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||| |||||||    
T  8437052 aatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcac 8436979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 28416516 - 28416663
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||||  || |||||| ||    
T  28416516 cttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaac 28416615  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    | |||| |||||||||  | | || |||| ||||||||||||||||||    
T  28416616 agtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668689
Alignment:
Q  35 gtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgt 134  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||  ||| || ||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  135 tatagtgttaacttcac 151  Q
    || ||||||||||||||    
T  25668704 ta-agtgttaacttcac 25668689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35934082 - 35933895
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaat-tagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| || |           
T  35934082 cttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact------- 35933990  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttata 197  Q
     | || |||||||||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||  | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35933989 aagtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcctattata 35933895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898004
Alignment:
Q  53 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   | | |||||||||||| | || || ||||| |||| | ||||||| ||     
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  153 agaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgacttcaccctaaaatttt 11898004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 192
Target Start/End: Original strand, 13956423 - 13956522
Alignment:
Q  93 agtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  13956423 agtgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttcctt 13956522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42342902 - 42342775
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||   |  ||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||    
T  42342902 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactc 42342805  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaactt 148  Q
    |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  42342804 acaacatttttgatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5830081 - 5829955
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5830081 acgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatt---------gatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtaca 5829991  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgtta 136  Q
     ||  | |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  5829990 aacggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Original strand, 26317775 - 26317859
Alignment:
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||    
T  26317775 tggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcc 26317859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004552
Alignment:
Q  113 ttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtc-attcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22255660 - 22255615
Alignment:
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22255660 atggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 22255615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13380549 - 13380498
Alignment:
Q  136 atagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattt 187  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13380549 atagggttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattt 13380498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 36055874 - 36055923
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  36055874 ttaacttcacaagaaaagtcattctcatgacatcaccataaaattttcct 36055923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Original strand, 13956367 - 13956415
Alignment:
Q  20 ataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatac 68  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13956367 ataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22616542 - 22616491
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22616542 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccttt 22616491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15752214 - 15752027
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15752214 acgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtaca 15752115  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
     ||| || ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15752114 aacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32267219 - 32267027
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32267219 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtaca 32267120  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  32267119 aacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttccttt 32267027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2959922 - 2959743
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |    
T  2959922 aaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggat 2959823  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  2959822 gttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 2959743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15383118 - 15382927
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||    
T  15383118 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtaca 15383019  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  15383018 aacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcctt 15382927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 48620819 - 48620629
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48620819 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 48620720  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | ||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48620719 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttcctttt 48620629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18422825 - 18422646
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  18422825 aaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggt 18422726  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||| |||||||||    
T  18422725 gttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcct 18422646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 11742345 - 11742534
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11742345 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 11742443  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | |||||||||||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11742444 agtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaaattttcctttt 11742534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10922901 - 10922724
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  10922901 aaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 10922802  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
     ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10922801 cttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgatttcaccataaaattttc 10922724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16415828 - 16415639
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||    
T  16415828 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaac 16415729  T
Q  104 a-atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |  | |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  16415728 atttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcctt 16415639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 28564790 - 28564951
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||    
T  28564790 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactc 28564889  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccat 180  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||  ||||||||||||||    
T  28564890 attacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccat 28564951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 37618885 - 37619080
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgata--ctatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  37618885 gcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttaca 37618984  T
Q  101 gacaatggggtgtt--actcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
     ||| |||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37618985 aacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcctttt 37619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30254606 - 30254419
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30254606 gcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 30254507  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    || | | || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  30254506 cagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38823396 - 38823210
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |     
T  38823396 cttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaat 38823297  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  38823296 agtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 10182002 - 10182189
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  10182002 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 10182101  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||| ||||||| || || |||| | |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  10182102 agtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 31621547 - 31621733
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||| |     
T  31621547 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaat 31621646  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |  |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  31621647 agcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 31621733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42721221 - 42721035
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||    
T  42721221 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaac 42721122  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||||| || |||| | ||| ||||| | ||||||||| | |||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  42721121 agtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14758223 - 14758038
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  14758223 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 14758124  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    | | | ||| |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  14758123 agttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttc 14758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47279370 - 47279191
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||    
T  47279370 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaaca 47279271  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaa 184  Q
     ||||||||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  47279270 gtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccaaaaaa 47279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8222313 - 8222125
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||      
T  8222313 acgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgta-- 8222216  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||    
T  8222215 -acggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttcctt 8222125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Original strand, 9903063 - 9903208
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  9903063 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactc 9903162  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  9903163 actacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 9903208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 7079057 - 7079254
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7079057 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaac 7079156  T
Q  104 -----------aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
               | ||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  7079157 agtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccataaaattttcc 7079254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30326943 - 30327132
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||    
T  30326943 acgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtaca 30327042  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     ||  | |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||   || ||||||| ||| ||||||||    
T  30327043 aacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 34012379 - 34012560
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||| ||| ||| ||    
T  34012379 aaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagt 34012478  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34012479 gttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttccttt 34012560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51129033 - 51128884
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||    
T  51129033 aaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagt 51128934  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtc 161  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51128933 gttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28769826 - 28769651
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||  | ||||    
T  28769826 aaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggt 28769728  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||   || ||||||||||| ||||||    
T  28769727 gttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaatttt 28769651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41926345 - 41926161
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||| ||    
T  41926345 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaac 41926246  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | |||| | ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||  | |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  41926245 agtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4330463 - 4330288
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||    
T  4330463 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaac 4330364  T
Q  104 aat-ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtg-ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcac 177  Q
    | | ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  4330363 attgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataacttcac 4330288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23999530 - 23999343
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  23999530 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 23999431  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     | |||||||||||||  || |||| | ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  23999430 tagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcc 23999343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 27763314 - 27763487
Alignment:
Q  13 aggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| || || |||||    
T  27763314 aggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtg 27763412  T
Q  113 ttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  27763413 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac-aaaaaaatcattcttataactttaccataaattttt 27763487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32216237 - 32216090
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  32216237 cttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaac 32216138  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32216137 agtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcac 32216090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19899760 - 19899950
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||    
T  19899760 acgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctaca 19899859  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     ||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   || ||||||||||| |||||||||    
T  19899860 aacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39393566 - 39393376
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||| |    
T  39393566 cttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaa 39393467  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||||  || |||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  39393466 caatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttccttt 39393376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37451452 - 37451308
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||     
T  37451452 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactt 37451354  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37451353 attacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatt 37451308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3309311 - 3309144
Alignment:
Q  22 aaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaat 121  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||||      
T  3309311 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcaca 3309213  T
Q  122 acatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  3309212 acacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1547461 - 1547278
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||        ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||    
T  1547461 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga--------tactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaac 1547370  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttta 195  Q
    | ||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1547369 agtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctttta 1547278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 27532975 - 27533144
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |     
T  27532975 cttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaag 27533073  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataactt 174  Q
    | |||| |||||| ||  | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27533074 agtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15168278 - 15168082
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca--gt-----g 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||     |    
T  15168278 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacg 15168179  T
Q  97 tacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  15168178 tacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattttccttt 15168082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 27563899 - 27564084
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  27563899 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaac 27563998  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac-gagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||| |||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  | |||| |||||  |||||||||||| || ||||||    
T  27563999 agtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaatcattttcataacttcaccgtagaatttt 27564084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 27227479 - 27227657
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  27227479 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaac 27227578  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | || ||||      | ||||||| | |||   ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  27227579 agtgaggtg------agtacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 27227657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 33725594 - 33725778
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    | | |     
T  33725594 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccaaagaaat 33725693  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||| ||||||    
T  33725694 agtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3535114 - 3534925
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  3535114 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaac 3535015  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    | |  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  || ||||||  ||| |||||||||||    
T  3535014 agtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattttccttt 3534925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 46931585 - 46931406
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  | |||| ||| ||||||    
T  46931585 aaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggt 46931486  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac---gagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  46931485 attactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaaaaattcattcttataacttcaccatagaatttt 46931406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 47682488 - 47682673
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||  |    
T  47682488 cttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagc 47682587  T
Q  104 aatggg-gtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||| ||||||||||  |||||| | |||   ||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  47682588 agtgggagtgttactcacaacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgacttcaccataaaattttcc 47682673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 190
Target Start/End: Original strand, 27267212 - 27267376
Alignment:
Q  23 aaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaata 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||| ||||| ||    
T  27267212 aaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcacta 27267311  T
Q  123 catttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  27267312 cattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca-catataattttcc 27267376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 238507 - 238703
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  238507 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 238606  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttatattaat 202  Q
    | | || |||||||||  |||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||  | | ||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  238607 agt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttttc-tttatattaat 238703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40884995 - 40884841
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40884995 cttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 40884896  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaa 158  Q
    | ||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  40884895 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289661
Alignment:
Q  42 cttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacattt-------atgatgt 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||        | |||     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  135 tatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25160806 - 25160718
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25160806 aaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtaca 25160718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22170885 - 22170806
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 91  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22170885 aaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22170811 - 22170747
Alignment:
Q  129 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  22170811 tgatgttatagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatgatttcaccatagaattttccttt 22170747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30254936 - 30254853
Alignment:
Q  108 gggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||||||| |||||||||    
T  30254936 gggtgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattttcct 30254853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 38759715 - 38759615
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgagga----ctgaacttttgatgtcagtgtac 99  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||| || || ||    ||||||||||||||||| |||||    
T  38759715 cttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgtcactgtac 38759616  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  38759615 a 38759615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43579290 - 43579242
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  43579290 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43579242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 93
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1359966
Alignment:
Q  60 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtca 1359966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Original strand, 13876919 - 13876968
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  13876919 ttaacttcaccataaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcct 13876968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8061 - 7884
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtta 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  8061 taggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtta 7962  T
Q  116 ctcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  7961 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttttcttt 7884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 25701082 - 25701271
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25701082 cttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 25701181  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    | | |||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25701182 agtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttccttt 25701271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Original strand, 55477928 - 55478108
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaa----tggggt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    ||| ||    
T  55477928 taggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagt 55478027  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55478028 gttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 55478108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 19089486 - 19089664
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  19089486 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggt 19089585  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  19089586 gttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 34948134 - 34948306
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtta 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||    
T  34948134 taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgtta 34948233  T
Q  116 ctcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    ||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34948234 ctcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 34948306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 35021057 - 35021249
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | || ||||||    
T  35021057 acgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtaca 35021156  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
     ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35021157 aacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccttt 35021249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 36493713 - 36493897
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36493713 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 36493812  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  36493813 aatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 37663774 - 37663951
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  37663774 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 37663873  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||||| |||| || | ||||  ||||||||||||||  | |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  37663874 gttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 37663951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 879570 - 879760
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  879570 acgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtaca 879669  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  879670 aacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgacttcaccttaaaattttcct 879760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25184302 - 25184112
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  25184302 acgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtaca 25184203  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     ||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  25184202 aacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 25184112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 29584225 - 29584413
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  29584225 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaac 29584324  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | || |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  29584325 agtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctttt 29584413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 28003011 - 28003197
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28003011 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaac 28003110  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||| ||  |||| | |||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  28003111 agtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 19440670 - 19440860
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19440670 acgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtaca 19440769  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataac-ttcaccataaaattttcc 190  Q
     ||  ||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  19440770 aacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactttcaccatagaattttcc 19440860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27396802 - 27396618
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  27396802 cttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaac 27396703  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | | ||||||||||||  ||| || | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  27396702 agtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 27396618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38012040 - 38011850
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  38012040 cttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaac 38011941  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | ||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  38011940 agtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctttt 38011850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4598165 - 4597994
Alignment:
Q  17 aggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttac 116  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  4598165 aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttac 4598066  T
Q  117 tcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  4598065 tcacaacactt-tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccataaaattttc 4597994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42199916 - 42199728
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |    
T  42199916 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaa 42199817  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||  || | ||||||||| | |||||||    
T  42199816 taatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagatttttcct 42199728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 32912602 - 32912793
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||    
T  32912602 acgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctaca 32912701  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     | | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  32912702 aatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 32912793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23761257 - 23761097
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  23761257 cttaaaacaaggtag-ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaac 23761159  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattc 165  Q
    | || |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  23761158 agtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattc 23761097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17167899 - 17167715
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  17167899 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaac 17167800  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  17167799 agtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17167715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17173476 - 17173292
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  17173476 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaac 17173377  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  17173376 agtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17173292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 34361514 - 34361704
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  34361514 acgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctaca 34361612  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  34361613 aacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 34361704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 55241130 - 55241315
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  55241130 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 55241228  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||||   ||| || ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  55241229 agtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 4934227 - 4934351
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4934227 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaac 4934326  T
Q  104 aat-ggggtgttactcaatacattt 127  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4934327 aatgggggtgttactcactacattt 4934351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9139430 - 9139245
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||     
T  9139430 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacg 9139331  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     |||||||||||||| |  |||| | ||| ||||  ||||||||||| | |||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9139330 gtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttcctt 9139245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39398095 - 39397913
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||         |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39398095 cttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatt---------gatgatactgagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaac 39398005  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttta 195  Q
    ||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  39398004 aatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttccattta 39397913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 5047990 - 5048162
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| ||    
T  5047990 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaac 5048089  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttca 176  Q
    | || |||  |||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  5048090 agtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataacttca 5048162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50697430 - 50697239
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50697430 acgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtaca 50697332  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
     ||  | |||||||||||  || |||| | ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||   || |||||||| || |||||||||||    
T  50697331 aacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttccttt 50697239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47253926 - 47253751
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  47253926 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaac 47253835  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  47253834 aatggg-tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49376137 - 49375966
Alignment:
Q  20 ataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactca 119  Q
    ||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||    
T  49376137 ataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactca 49376038  T
Q  120 atacatttatgatgttatagtgttaacttcacgag-aaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
      ||| || ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  49376037 cgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 49375966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6864224 - 6864038
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  6864224 acgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtaca 6864125  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattt 187  Q
     | | | || ||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  6864124 aaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgacatcaccatacaattt 6864038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32579632 - 32579441
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacag-- 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||       
T  32579632 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatgag-actaaacttttgatggcaccgtacaaca 32579534  T
Q  102 -acaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
     ||| ||||||| |||||| | || || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32579533 aacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctcagaacttcaccataaaattttccttt 32579441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7703695 - 7703517
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  7703695 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaac 7703604  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||    
T  7703603 agtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaacatagaattttcc 7703517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50764905 - 50764732
Alignment:
Q  15 gtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtt 114  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  50764905 gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtt 50764806  T
Q  115 actcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||||  ||| || ||||||  ||||||||||||||  | |||||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  50764805 actcacaacacttttgatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgactt---cataaaattttccttt 50764732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 54499262 - 54499425
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagt-gtacag 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||     
T  54499262 cttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaa 54499361  T
Q  102 acaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattc 165  Q
    ||  ||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54499362 acggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33341584 - 33341397
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  33341584 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaac 33341486  T
Q  104 aatggggtgttact--caata--catttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||| ||  ||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  33341485 agtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 30002657 - 30002838
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||        ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30002657 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat--------gatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaac 30002748  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    | || |||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| |||||   || ||||||||||| | |||||||||    
T  30002749 agtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccatagagttttccttt 30002838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 46888190 - 46888338
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||| | | ||||||    
T  46888190 aaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggt 46888289  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagt 160  Q
     ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  46888290 attactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagt 46888338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32592279 - 32592096
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  32592279 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaac 32592180  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattt 187  Q
    | ||| |||||||||   ||| || ||||  | ||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||| |||||||||    
T  32592179 agtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaataaaattt 32592096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37775853 - 37775670
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| || |||||| ||    
T  37775853 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaac 37775756  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    | ||||||||||||||  |||||| | || |||||||| ||||||||| | |||| |||||   || |||||||| || |||||||    
T  37775755 agtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcaccgtagaattttc 37775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 33816558 - 33816742
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||| | |     
T  33816558 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaat 33816657  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | || |||| |||||| |||| || ||||| || | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||| | |||| ||||||    
T  33816658 agtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttaagcatataatttt 33816742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1815487 - 1815409
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815487 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37287862 - 37287732
Alignment:
Q  62 atgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca-cgagaaaagt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| | | | ||||||    
T  37287862 atgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagt 37287763  T
Q  161 cattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  37287762 cattctcattacttcaccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3042808 - 3042607
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg--------atactatgaggactgaacttttgatgtc 92  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||        ||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  3042808 acgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtc 3042709  T
Q  93 agtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | |||| | ||  |||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||   || | ||||||||| ||||||||||    
T  3042708 attgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgatttcaccatagaattttcctt 3042609  T
Q  193 tt 194  Q
    ||    
T  3042608 tt 3042607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Original strand, 35025669 - 35025800
Alignment:
Q  60 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaag 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||     
T  35025669 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaa 35025768  T
Q  160 tcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||  ||| |||||| |||| |||||||||    
T  35025769 tcattttcatgacttcagcatagaattttcct 35025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205112
Alignment:
Q  85 ttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaa 184  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||| ||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  185 ttttcctttt 194  Q
    ||||||||||    
T  4205121 ttttcctttt 4205112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 7152235 - 7152319
Alignment:
Q  108 gggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7152235 gggtgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcctt 7152319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17272072 - 17272009
Alignment:
Q  129 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17272072 tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 17272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4396410 - 4396324
Alignment:
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||| ||||||||||    
T  4396410 tggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcctt 4396324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17272150 - 17272067
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 91  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  17272150 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatgt 17272067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52516655 - 52516599
Alignment:
Q  132 tgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  52516655 tgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 52516599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 53124371 - 53124287
Alignment:
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   || |||||| |||| ||||||||    
T  53124371 tggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataattttcc 53124287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2704560 - 2704510
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2704560 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctt 2704510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Original strand, 38812260 - 38812310
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38812260 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 38812310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Original strand, 20097485 - 20097537
Alignment:
Q  136 atagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  20097485 atagggttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 20097537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 52195645 - 52195687
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaa 184  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52195645 ttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttcaccataaaa 52195687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38811861 - 38811813
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  38811861 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38811813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30055680 - 30055495
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  30055680 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 30055581  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca-cgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttat 196  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30055580 gttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttccttttat 30055495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18797480 - 18797302
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18797480 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 18797381  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18797380 gttactcattacattttttatgt--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 18797302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 5657481 - 5657667
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  5657481 cttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaac 5657580  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5657581 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 31520724 - 31520909
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31520724 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 31520822  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  31520823 aatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaattttcc 31520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37347183 - 37346997
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37347183 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 37347084  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  37347083 aatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccataaaattttcc 37346997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27283897 - 27283719
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||    
T  27283897 aaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggt 27283798  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  27283797 gttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21991797 - 21991610
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  21991797 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaac 21991698  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | |||||||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  21991697 agtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcct 21991610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 32821050 - 32821241
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  32821050 acgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtaca 32821149  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32821150 aacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 32821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7334947 - 7334769
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  7334947 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 7334848  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||    
T  7334847 gttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgacttcaccgtagaattttcc 7334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8861446 - 8861260
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  8861446 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaac 8861347  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8861346 agtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8861260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29173701 - 29173540
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29173701 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 29173602  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattc 165  Q
    | ||| ||||||||||  ||| || ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29173601 agtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 48928564 - 48928748
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |     
T  48928564 cttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaat 48928662  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    | ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48928663 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttc 48928748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 31579072 - 31579256
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgta-----cagacaat 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||      | ||| |    
T  31579072 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagt 31579171  T
Q  107 ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  31579172 ggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcct 31579256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38258709 - 38258521
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38258709 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtaca 38258610  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
     ||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||   || |||||||| || |||||||    
T  38258609 aacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttc 38258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 12390630 - 12390820
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||    
T  12390630 cttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaac 12390729  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  12390730 agtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattttcctttt 12390820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24211894 - 24211712
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || | ||| | ||||    
T  24211894 aaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggt 24211795  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  24211794 gttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcttttt 24211712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37110021 - 37109847
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtta 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  37110021 taggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgtta 37109922  T
Q  116 ctcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  37109921 ctcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Original strand, 17842598 - 17842774
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgtta 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  17842598 taggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgtta 17842697  T
Q  116 ctcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  17842698 ctcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcctt 17842774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22687400 - 22687228
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||| ||    
T  22687400 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaac 22687301  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttca 176  Q
    | ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22687300 agtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttca 22687228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 15612759 - 15612944
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || | |||| ||    
T  15612759 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaac 15612858  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15612859 actggggtgttactcataacactt-tgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 44413379 - 44413525
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  44413379 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagtgtacaaac 44413478  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca 150  Q
    | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44413479 attggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttca 44413525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 25691544 - 25691729
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||| || |||||| ||    
T  25691544 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaac 25691643  T
Q  104 aatggggt-gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | || |||  |||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25691644 agtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 25691729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 9355826 - 9356014
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  9355826 cttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaac 9355925  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | |||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9355926 agtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcctt 9356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 27421380 - 27421563
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27421380 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 27421478  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  27421479 agtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32432613 - 32432431
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32432613 cttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaac 32432514  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||     |||||||||||||||| |||||| |||||  | | ||||||||||| |||||||||    
T  32432513 aatggggtgttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 32432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4583080 - 4582894
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |     
T  4583080 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaat 4582981  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||    
T  4582980 agtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 33688262 - 33688446
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || || ||| ||    
T  33688262 cttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaac 33688361  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    | | || |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33688362 agtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctcataacttcaccatataattttc 33688446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 41765078 - 41765266
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||    
T  41765078 cttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaac 41765177  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||| |||||| |||| || ||||| |||||| || |||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  41765178 agtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttcctt 41765266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524515
Alignment:
Q  41 tcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagt 140  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| ||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  141 gttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 26524515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26980484 - 26980325
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  26980484 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaac 26980385  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcat 163  Q
      ||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  26980384 cgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10481758 - 10481576
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaat-gggg 110  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  10481758 aaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtggggg 10481659  T
Q  111 tgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca-cgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||    
T  10481658 tgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattctcctaactttaccatagaattttcctt 10481576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43686201 - 43686015
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  43686201 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaac 43686102  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | | ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||    
T  43686101 agt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 43686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6546680 - 6546494
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   | | |||||||||||| | |||||| |     
T  6546680 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaat 6546581  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||||||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  6546580 agtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 48928297 - 48928466
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |     
T  48928297 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaat 48928395  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataactt 174  Q
    | ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  48928396 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11071367 - 11071182
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11071367 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaac 11071268  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagt-cattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||| |||||||||  || |||| ||||| ||||||  |||||| || | |||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  11071267 agtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaatttt 11071182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12165913 - 12165753
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  12165913 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaac 12165814  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
    | ||||||||||||||  ||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12165813 agtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23111335 - 23111167
Alignment:
Q  20 ataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactca 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||    
T  23111335 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactca 23111236  T
Q  120 atacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||| | ||||||    
T  23111235 caatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcaccacagaatttt 23111167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 10359214 - 10359400
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattga-gtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | |    
T  10359214 cttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcactgtataaa 10359312  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     | | || ||||||||| |||| || ||||| ||||   |||| || || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10359313 tagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362334
Alignment:
Q  60 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaag 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  160 tcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttcc 34362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38053624 - 38053500
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||    
T  38053624 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgac--------actatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactc 38053533  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    | ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  38053532 attacattttttatgttatagtattaacttcac 38053500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 37704318 - 37704241
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaa 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704318 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 15672762 - 15672830
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatg 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15672762 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44598827 - 44598741
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 90  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  44598827 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatg 44598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35353235 - 35353122
Alignment:
Q  39 agtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaa-cttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttat 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||  ||  ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||    
T  35353235 agtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctat 35353136  T
Q  138 agtgttaacttcac 151  Q
    |||||| |||||||    
T  35353135 agtgttgacttcac 35353122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 43925262 - 43925166
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacag 101  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43925262 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtacag 43925166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 32593189 - 32593273
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 89  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32593189 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgat 32593273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40381988 - 40381938
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  40381988 ttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttcctt 40381938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 37703498 - 37703551
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatga 57  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  37703498 cttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 26588084 - 26588126
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgt 46  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26588084 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 90
Target Start/End: Original strand, 34362150 - 34362188
Alignment:
Q  52 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 90  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34362150 tgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatg 34362188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8299245 - 8299192
Alignment:
Q  135 tatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  8299245 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 23402371 - 23402419
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23402371 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcgccatagaattttcc 23402419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37704238 - 37704182
Alignment:
Q  95 tgtacagacaatggggtgttactcaataca-tttatgatgttatagtgttaacttca 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  37704238 tgtacaaacaatggggtgttactcactacatttttttatgctatagtgttaacttca 37704182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44598419 - 44598367
Alignment:
Q  110 gtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtca 162  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44598419 gtgttactcacaacatttttgatattatagtattaacttcacgagaagagtca 44598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 20373303 - 20373481
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  20373303 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 20373402  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  20373403 gttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaattttcc 20373481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 48355110 - 48354930
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  48355110 aaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggt 48355011  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48355010 gttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 48354930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 3655209 - 3655388
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  3655209 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggt 3655308  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |  | ||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  3655309 gttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcct 3655388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37203241 - 37203058
Alignment:
Q  7 aaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  37203241 aaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 37203142  T
Q  107 ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  37203141 ggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47481700 - 47481509
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |    
T  47481700 gcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaa 47481601  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  47481600 cagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttcctttt 47481509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26941256 - 26941446
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26941256 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattataca 26941355  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     ||| |||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  26941356 aacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcct 26941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35844504 - 35844314
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  35844504 cttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaa 35844405  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    || || |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35844404 cagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttccttt 35844314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 40552255 - 40552445
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40552255 acgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 40552354  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     ||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  40552355 aacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 40552445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 51212988 - 51213166
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  51212988 aaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccattgtacaaacagtggggt 51213087  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  51213088 gttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11467001 - 11466814
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  11467001 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaac 11466902  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  11466901 agtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcct 11466814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37157880 - 37157699
Alignment:
Q  8 aaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  37157880 aaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtaca-acagtg 37157782  T
Q  108 gggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  37157781 gggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 7327489 - 7327669
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  7327489 aaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagt 7327588  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtg-ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7327589 gttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcct 7327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 11357363 - 11357535
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  11357363 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaac 11357462  T
Q  104 aat-ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttc 175  Q
    | | ||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  11357463 agtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29099532 - 29099356
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  29099532 cttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaac 29099433  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccat 180  Q
    | ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  29099432 agtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccat 29099356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 42506082 - 42506214
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  42506082 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 42506181  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgtta 144  Q
     ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  42506182 attactcattacaattttgatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 52040921 - 52041109
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||    
T  52040921 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaac 52041020  T
Q  104 a-atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |  ||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||    
T  52041021 atttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacctcagaattttcct 52041109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4015637 - 4015451
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| | | | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  4015637 cttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaac 4015538  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | | ||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4015537 agttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 46297761 - 46297945
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  46297761 cttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaac 46297860  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  46297861 agtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 4761656 - 4761838
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||    
T  4761656 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagt 4761755  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac--gagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4761756 gttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcctt 4761838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 44186501 - 44186687
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  44186501 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaaca 44186600  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
      |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |   |||||| |||| |||||||||    
T  44186601 gcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaattttcct 44186687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21193783 - 21193595
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  21193783 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaac 21193684  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  21193683 agtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcctt 21193595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22451145 - 22450957
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||| ||    
T  22451145 cttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaac 22451046  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | || |||| |||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22451045 agtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 22450957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 53229151 - 53229342
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  53229151 cttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaac 53229250  T
Q  104 aatg-gggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | || ||||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||  ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  53229251 attgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgacttcaccttaaaatttttctttt 53229342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 33378784 - 33378971
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  33378784 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaat 33378883  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | ||||||  |||||| |||| || ||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  33378884 attggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagtcattctcataactttgccatagaattttcctttt 33378971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40936154 - 40935995
Alignment:
Q  18 ggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttact 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  40936154 ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttact 40936055  T
Q  118 caatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcac 177  Q
    |   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  40936054 cgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 40935995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 21009816 - 21009992
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| | | |||||||||||||    
T  21009816 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactc 21009915  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcac---gagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    | ||||||| |||||||||||||| || |||||    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21009916 attacatttttgatgttatagtgtcaaattcacaaaaaaaaaaatcattcttataacttcaccataaaattttcctt 21009992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 27480378 - 27480564
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  27480378 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaac 27480477  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||| || || |||||| || | || ||||||||||||||| |||| || | |||  |||||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  27480478 aattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaattttcc 27480564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34133112 - 34132922
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34133112 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 34133013  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||||||    
T  34133012 agtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctttt 34132922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39282821 - 39282642
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||    
T  39282821 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggt 39282722  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     |||||| | ||| || ||||||||||||||||| || |  |||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39282721 attactc-acacagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 39282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3362432 - 3362283
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattga--gtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  3362432 cttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaa 3362333  T
Q  102 acaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    | | |||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3362332 atagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcac 3362283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45174683 - 45174494
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| |    
T  45174683 cttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaa 45174584  T
Q  103 caatggggtgttactcaat--acatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    || ||  ||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  45174583 cagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattctcacaacttcaccataaaattttcc 45174494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 54828700 - 54828883
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  |||  | ||    
T  54828700 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaac 54828799  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
      |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || | |||| | |||   || ||||||||||||||||||    
T  54828800 ggtggggtgttactcattacattt-ttatgttatagtgttaactttaccaaaaaaattatttttatgacttcaccataaaatttt 54828883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54505985 - 54505799
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || | |    
T  54505985 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaa 54505887  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||     |||||| |||||||||||||    
T  54505886 taatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattcttgcgacttcatcataaaattttcc 54505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 24708122 - 24708295
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattga--gtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggg 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| || |    
T  24708122 aaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgag 24708219  T
Q  110 gtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||||||| | || || ||||||||  |||||||| |||  | ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  24708220 gtgttactcactgcagttttgatgtta-cgtgttaacatca--aaaaaagtcattttgataacttcaccataaaatttt 24708295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 53176230 - 53176074
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  53176230 ttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaaca 53176131  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtca 162  Q
     | ||   ||||| |  |||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  53176130 gt-ggacattacttacaacatttttgatgttatgatgttaacttcatcagaaaagtca 53176074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2008110 - 2007964
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||    
T  2008110 cttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaac 2008011  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca 150  Q
    | ||||||||||||||  ||| || | | | ||||||||||||||||    
T  2008010 agtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25579913 - 25579731
Alignment:
Q  7 aaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | || || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | | | |    
T  25579913 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagt 25579814  T
Q  107 ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
     |  ||||| |||  ||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25579813 agaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataacttaaccataaaattttc 25579731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 43975887 - 43976068
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||| |     
T  43975887 cttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaat 43975986  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43975987 agtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttc---aaaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 43976068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44891674 - 44891498
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |         ||    
T  44891674 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------ac 44891584  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | |||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||    
T  44891583 agtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgacttcaccgtataattttcc 44891498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 22446063 - 22446247
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatga-ggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||| |    
T  22446063 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtaca-a 22446161  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca-cgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattt 187  Q
     | |||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  22446162 aagtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattt 22446247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 46994668 - 46994837
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||    
T  46994668 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta----------tgt 46994757  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||  |  |||||||| || ||||||||||    
T  46994758 gttactcattacattt-tgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttacgacttcaccgtagaattttcctt 46994837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32373647 - 32373460
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||| || |||||| ||    
T  32373647 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaac 32373548  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |  | || ||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |   |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  32373547 a--gtggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgacttcatcatagaatttcccttt 32373460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 24488961 - 24489121
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  24488961 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaac 24489060  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
    | |||  |||||||||  |||||| | ||  |||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  24489061 agtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcatt 24489121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 29163995 - 29163912
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 87  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29163995 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 43348434 - 43348320
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || |  ||| ||    
T  43348434 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccactaaacaaac 43348336  T
Q  104 aatggggtgttactca 119  Q
    | ||||||||| ||||    
T  43348335 agtggggtgttgctca 43348320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 14586669 - 14586784
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||| |||| | |     
T  14586669 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaat 14586768  T
Q  104 aatggggtgttactca 119  Q
    | || |||||||||||    
T  14586769 agtgaggtgttactca 14586784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38591863 - 38591727
Alignment:
Q  16 taggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtac----agacaatggggt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||    | |||||| | |    
T  38591863 taggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagat 38591764  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaactt 148  Q
    |||||||  || | || ||||||||||||||||||||    
T  38591763 gttactccctataattttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33698330 - 33698265
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatact 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33698330 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 11835626 - 11835702
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaa-attagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactg 79  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11835626 cttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 22622725 - 22622780
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgata 67  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22622725 aaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53175752 - 53175710
Alignment:
Q  152 gagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53175752 gagaaaagtcattctcataacttcaccataaaattttcctttt 53175710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698183
Alignment:
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcactagaga----attctcatgacttcaccatagaattttcc 33698183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Original strand, 40640634 - 40640684
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40640634 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 40640684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 55343403 - 55343472
Alignment:
Q  124 atttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttt 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||    
T  55343403 atttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccttt 55343472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29163895 - 29163839
Alignment:
Q  133 gttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||   || |||||||||||||||||||    
T  29163895 gttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccataaaattttc 29163839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 32180747 - 32180799
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  32180747 ttaacttcactagaaaagtcattctcataacttcaccgtacaattttcatttt 32180799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36012312 - 36012244
Alignment:
Q  7 aaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgag 74  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  36012312 aaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1089870 - 1089811
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgat 63  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||| |||||||    
T  1089870 cttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 53811695 - 53811769
Alignment:
Q  38 tagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgagg------actgaacttttgatgtcagtgtacagacaat 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  53811695 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaacaat 53811769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 53818509 - 53818555
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53818509 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccataaaatttt 53818555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Original strand, 11835737 - 11835790
Alignment:
Q  136 atagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  11835737 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 41585408 - 41585449
Alignment:
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  41585408 tggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4556587 - 4556543
Alignment:
Q  143 taacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  4556587 taacttcacgagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 4556543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 4318820 - 4319011
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  4318820 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaa 4318919  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    || ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4318920 cagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctttt 4319011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8513419 - 8513232
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8513419 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 8513320  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  8513319 agtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 7235033 - 7235218
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  7235033 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcaccgtacaaac 7235131  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    | ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7235132 agtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 7235218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15491801 - 15491631
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |     
T  15491801 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaat 15491702  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataactt 174  Q
    | ||||||||||||||  ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15491701 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1946023 - 1945831
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  1946023 acgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctaca 1945924  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttca-cgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  || |||||||| || ||||||||||    
T  1945923 aacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcctt 1945831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5627578 - 5627389
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  5627578 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaa 5627479  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcctt 192  Q
     | |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||| || ||||||||||    
T  5627478 tagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcctt 5627389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29182349 - 29182165
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||| | ||    
T  29182349 cttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaac 29182250  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29182249 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttt 29182165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 7055221 - 7055400
Alignment:
Q  12 aaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggt 111  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | | || |||    
T  7055221 aaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggt 7055320  T
Q  112 gttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    |||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  7055321 gttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcct 7055400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 3879938 - 3880124
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagaca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  3879938 ttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaaca 3880037  T
Q  105 atggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
     | ||||||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  3880038 gtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcct 3880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618834
Alignment:
Q  14 ggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||     
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgc 33618911  T
Q  114 tactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    |||||| |||| || |||||  |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  33618910 tactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgacttcaccgtagaattttcc 33618834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 33893003 - 33893186
Alignment:
Q  6 taaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaa 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||||| | |     
T  33893003 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatag 33893101  T
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||  || |||| |||||| ||||||||    
T  33893102 tggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcc 33893186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 21017110 - 21017270
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |     
T  21017110 cttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaat 21017209  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||  || | |||||||||||| | ||||||||||    
T  21017210 aatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcatt 21017270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 6091178 - 6091313
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  6091178 acgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtaca 6091277  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgtta 136  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  6091278 aacaatggtgtgttactcactacattttttatgtta 6091313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20768268 - 20768087
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||    
T  20768268 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact-aacaaac 20768172  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttc 189  Q
    ||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20768171 aat-ggatgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6089094 - 6088910
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaa-ttagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||| ||    
T  6089094 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaac 6088995  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||| ||||||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  6088994 agtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 30353356 - 30353540
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| || |||||| ||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | || | | ||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498429
Alignment:
Q  59 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatgggg-tgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| |||| |||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  158 agtcattcgcataacttcaccataaaattttcctttt 194  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactatagatttttcctttt 18498429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19631797 - 19631741
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttatat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19631797 ttaacttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttccttgtatat 19631741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 11084152 - 11084208
Alignment:
Q  142 ttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttatat 198  Q
    ||||||| || |||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11084152 ttaactttaccagaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccttttatat 11084208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 133
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagac 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  320 cttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 221  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    | ||| ||||||||||  |||||| | ||  || |||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||    
T  220 agtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 94398 - 94542
Alignment:
Q  20 ataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactca 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  94398 ataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactca 94497  T
Q  120 atacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcatt 164  Q
     |||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  94498 ctacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 94542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 408425 - 408559
Alignment:
Q  1 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtaca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  408425 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttaca 408523  T
Q  101 gacaatggggtgttactcaatacatttatgatgtta 136  Q
     ||  |  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  408524 aacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44128 - 43959
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  44128 gataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactc 44029  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |  ||||||||||| ||||||    
T  44028 attacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 146014 - 146199
Alignment:
Q  3 gcttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacaga 102  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |    
T  146014 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaa 146113  T
Q  103 caatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
     |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| || | |||| ||||||  || |||||||| || ||||||    
T  146114 taatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccgtagaatttt 146199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 154659 - 154828
Alignment:
Q  19 gataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtacagacaatggggtgttactc 118  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  154659 gataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactc 154758  T
Q  119 aatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |  ||||||||||| ||||||    
T  154759 attacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12095 - 11908
Alignment:
Q  4 cttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtg-tacaga 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || || |||| |    
T  12095 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaa 11996  T
Q  103 caat-ggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtca-ttcgcataacttcaccataaaatttt 188  Q
    |||| |||||||||||||  ||| || | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  11995 caatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 267469 - 267331
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcagtgtac-agac 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| || ||||| | ||    
T  267469 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtacaaaac 267370  T
Q  104 aatggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgt 142  Q
    | | || ||||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  267369 agttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42432 - 42347
Alignment:
Q  106 tggggtgttactcaatacatttatgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcct 191  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42432 tggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcct 42347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 100882 - 100815
Alignment:
Q  129 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttccttttat 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  100882 tgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccttttat 100815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  5 ttaaaataaggtaggataaaattagattgagtgtagtcttgt 46  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Original strand, 12137 - 12186
Alignment:
Q  141 gttaacttcacgagaaaagtcattcgcataacttcaccataaaattttcc 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  12137 gttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcatagaattttcc 12186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University