View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1531_1D_low_34 (Length: 263)

Name: NF1531_1D_low_34
Description: NF1531_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1531_1D_low_34
NF1531_1D_low_34
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (5-263)||(22084035-22084292)
chr8 (10-263)||(17669220-17669472)
chr8 (10-263)||(17675872-17676124)
chr8 (10-263)||(21915220-21915472)
chr8 (10-239)||(5534089-5534318)
chr8 (10-263)||(20019590-20019842)
chr8 (10-239)||(28454986-28455215)
chr8 (10-263)||(20013514-20013765)
chr8 (10-263)||(19111430-19111682)
chr8 (10-263)||(19117721-19117973)
chr8 (14-239)||(8354417-8354642)
chr8 (10-239)||(22123035-22123264)
chr8 (10-239)||(29123312-29123541)
chr8 (10-239)||(16882822-16883051)
chr8 (10-215)||(18865582-18865787)
chr8 (10-215)||(18855187-18855392)
chr8 (10-169)||(22115370-22115529)
chr8 (10-239)||(22048173-22048402)
chr8 (10-239)||(19496617-19496846)
chr8 (20-239)||(20527676-20527895)
chr8 (10-133)||(22122072-22122195)
chr8 (20-239)||(18065558-18065777)
chr8 (10-169)||(20023578-20023737)
chr8 (20-240)||(26934836-26935056)
chr8 (61-169)||(19905793-19905901)
chr8 (128-169)||(22124296-22124337)
chr8 (20-89)||(23845443-23845512)
chr8 (200-239)||(22124368-22124407)
chr8 (194-240)||(23845595-23845641)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (5-263)||(36884380-36884637)
chr4 (10-263)||(19779940-19780192)
chr4 (10-260)||(18024078-18024327)
chr4 (10-263)||(12475223-12475475)
chr4 (5-263)||(15362336-15362593)
chr4 (10-239)||(17961975-17962204)
chr4 (5-239)||(15148682-15148916)
chr4 (5-263)||(15383139-15383396)
chr4 (5-239)||(22194846-22195080)
chr4 (10-263)||(4772300-4772552)
chr4 (10-263)||(8048146-8048398)
chr4 (10-263)||(8054759-8055011)
chr4 (10-263)||(23954351-23954603)
chr4 (10-263)||(23961013-23961265)
chr4 (5-263)||(16231487-16231744)
chr4 (10-239)||(8385061-8385290)
chr4 (10-239)||(8391716-8391945)
chr4 (10-239)||(14074057-14074286)
chr4 (10-239)||(15256835-15257064)
chr4 (10-239)||(17808640-17808869)
chr4 (10-218)||(12481897-12482105)
chr4 (5-263)||(18295829-18296086)
chr4 (10-239)||(17089628-17089857)
chr4 (10-219)||(29040549-29040758)
chr4 (10-239)||(20115369-20115598)
chr4 (20-239)||(14268118-14268337)
chr4 (14-239)||(14298482-14298707)
chr4 (10-239)||(40478374-40478603)
chr4 (52-239)||(7900863-7901050)
chr4 (5-239)||(14305097-14305331)
chr4 (10-239)||(26284558-26284787)
chr4 (10-239)||(40471701-40471930)
chr4 (52-239)||(51493510-51493697)
chr4 (52-239)||(15321786-15321973)
chr4 (10-239)||(6873026-6873255)
chr4 (10-239)||(18071395-18071624)
chr4 (10-169)||(17810569-17810728)
chr4 (10-169)||(14757072-14757231)
chr4 (10-121)||(17991319-17991430)
chr4 (20-237)||(9271764-9271981)
chr4 (20-239)||(23838660-23838879)
chr4 (20-239)||(14679189-14679408)
chr4 (52-140)||(386046-386134)
chr4 (20-239)||(14685397-14685617)
chr4 (52-235)||(35170859-35171042)
chr4 (20-169)||(16956310-16956459)
chr4 (52-169)||(30234870-30234987)
chr4 (43-239)||(12522311-12522507)
chr4 (20-240)||(53433603-53433823)
chr4 (20-239)||(12349234-12349453)
chr4 (10-169)||(19941804-19941963)
chr4 (10-169)||(23081885-23082044)
chr4 (126-239)||(12299664-12299777)
chr4 (43-239)||(41385428-41385624)
chr4 (10-169)||(27710042-27710201)
chr4 (20-239)||(55795685-55795903)
chr4 (20-239)||(35614166-35614384)
chr4 (194-239)||(386166-386211)
chr4 (20-169)||(9556827-9556976)
chr4 (194-240)||(16956484-16956530)
chr4 (194-259)||(30235012-30235076)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (5-263)||(26889660-26889917)
chr3 (10-263)||(37615596-37615848)
chr3 (10-260)||(14672849-14673098)
chr3 (10-263)||(418205-418457)
chr3 (10-263)||(6598923-6599175)
chr3 (10-263)||(6605603-6605855)
chr3 (10-263)||(26788454-26788706)
chr3 (10-263)||(26794044-26794296)
chr3 (10-239)||(5106533-5106762)
chr3 (10-263)||(10845933-10846184)
chr3 (10-239)||(48423596-48423825)
chr3 (10-239)||(48430374-48430603)
chr3 (10-219)||(16634099-16634308)
chr3 (10-219)||(16640709-16640918)
chr3 (10-219)||(43161374-43161583)
chr3 (10-219)||(43167611-43167820)
chr3 (10-239)||(1332710-1332938)
chr3 (54-263)||(10153428-10153636)
chr3 (10-263)||(31422202-31422454)
chr3 (10-239)||(16623704-16623933)
chr3 (10-238)||(53380001-53380228)
chr3 (10-238)||(53386653-53386880)
chr3 (10-263)||(16747488-16747740)
chr3 (10-263)||(16758220-16758472)
chr3 (10-263)||(13250924-13251176)
chr3 (10-263)||(13257570-13257822)
chr3 (10-239)||(16489319-16489548)
chr3 (52-263)||(5221609-5221819)
chr3 (10-239)||(23704418-23704647)
chr3 (10-239)||(23722874-23723103)
chr3 (10-239)||(23741330-23741559)
chr3 (10-239)||(41201447-41201676)
chr3 (10-239)||(15726581-15726810)
chr3 (10-239)||(20057052-20057281)
chr3 (10-239)||(20063690-20063919)
chr3 (52-239)||(5149659-5149846)
chr3 (10-239)||(15691927-15692156)
chr3 (10-169)||(41091996-41092155)
chr3 (10-169)||(14499625-14499784)
chr3 (10-169)||(30066246-30066405)
chr3 (10-239)||(3690847-3691076)
chr3 (10-169)||(11070368-11070527)
chr3 (10-169)||(11165179-11165338)
chr3 (20-239)||(10904455-10904674)
chr3 (20-239)||(10911127-10911346)
chr3 (20-239)||(10003865-10004084)
chr3 (98-239)||(10010512-10010653)
chr3 (10-140)||(22642988-22643118)
chr3 (10-169)||(15825961-15826120)
chr3 (10-169)||(17710241-17710400)
chr3 (10-169)||(19809326-19809485)
chr3 (20-239)||(24188004-24188223)
chr3 (10-140)||(55023174-55023304)
chr3 (52-239)||(839473-839660)
chr3 (10-169)||(15991753-15991912)
chr3 (20-239)||(55149205-55149424)
chr3 (20-239)||(7985933-7986152)
chr3 (20-169)||(4710596-4710744)
chr3 (10-95)||(22670536-22670621)
chr3 (20-239)||(6608707-6608926)
chr3 (20-240)||(17252716-17252936)
chr3 (10-169)||(410400-410559)
chr3 (10-169)||(1145201-1145360)
chr3 (52-169)||(10236086-10236202)
chr3 (20-240)||(12891632-12891852)
chr3 (20-239)||(12482656-12482875)
chr3 (20-259)||(13321180-13321418)
chr3 (10-169)||(15343255-15343414)
chr3 (10-169)||(15349898-15350057)
chr3 (10-89)||(15361069-15361148)
chr3 (10-169)||(15397552-15397711)
chr3 (10-169)||(15404143-15404302)
chr3 (43-169)||(28350844-28350970)
chr3 (20-169)||(4291069-4291218)
chr3 (20-239)||(5201451-5201670)
chr3 (10-169)||(8720805-8720964)
chr3 (10-169)||(9072692-9072851)
chr3 (10-89)||(15337810-15337889)
chr3 (20-239)||(15584379-15584598)
chr3 (20-239)||(15591037-15591256)
chr3 (20-239)||(20723228-20723447)
chr3 (116-169)||(13315943-13315996)
chr3 (20-239)||(5419964-5420183)
chr3 (20-239)||(5426362-5426581)
chr3 (194-240)||(4290998-4291044)
chr3 (194-240)||(10236227-10236273)
chr3 (194-240)||(13316021-13316067)
chr3 (194-240)||(15825890-15825936)
chr3 (194-240)||(30777057-30777103)
chr3 (198-239)||(15360920-15360961)
chr3 (198-239)||(15404330-15404371)
chr3 (195-240)||(15991938-15991983)
chr3 (194-235)||(16333404-16333445)
chr3 (194-239)||(19809256-19809301)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (5-262)||(59105-59361)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (10-263)||(30731-30983)
scaffold0044 (10-263)||(72548-72800)
scaffold0044 (10-239)||(8286-8515)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-262)||(139272-139528)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (10-263)||(40523011-40523263)
chr7 (10-263)||(9510662-9510914)
chr7 (10-263)||(18164323-18164575)
chr7 (5-260)||(60321-60575)
chr7 (10-239)||(14331013-14331242)
chr7 (10-239)||(21909-22138)
chr7 (10-239)||(8201724-8201953)
chr7 (10-239)||(14337597-14337826)
chr7 (11-239)||(15022356-15022585)
chr7 (14-240)||(11366426-11366652)
chr7 (10-239)||(18176331-18176560)
chr7 (10-239)||(18183003-18183232)
chr7 (10-239)||(14655066-14655295)
chr7 (10-263)||(44786124-44786376)
chr7 (10-263)||(44792765-44793017)
chr7 (11-263)||(12703038-12703311)
chr7 (10-238)||(15155819-15156047)
chr7 (10-239)||(15162470-15162699)
chr7 (10-239)||(16406944-16407173)
chr7 (10-239)||(13684689-13684918)
chr7 (10-239)||(13691304-13691533)
chr7 (10-239)||(20702641-20702870)
chr7 (10-239)||(32767901-32768130)
chr7 (10-169)||(11238621-11238780)
chr7 (10-169)||(11231934-11232093)
chr7 (10-169)||(33404-33563)
chr7 (10-169)||(70415-70574)
chr7 (52-170)||(1347803-1347921)
chr7 (104-263)||(49051574-49051732)
chr7 (10-169)||(74523-74683)
chr7 (52-169)||(12704350-12704467)
chr7 (20-235)||(4318205-4318420)
chr7 (20-239)||(14953424-14953643)
chr7 (20-239)||(14959390-14959609)
chr7 (20-169)||(14148866-14149015)
chr7 (52-238)||(11547959-11548145)
chr7 (52-238)||(11554555-11554741)
chr7 (43-239)||(18531471-18531667)
chr7 (52-239)||(11262555-11262742)
chr7 (52-235)||(12692726-12692909)
chr7 (20-239)||(18553192-18553411)
chr7 (20-239)||(18584960-18585179)
chr7 (20-240)||(6016831-6017051)
chr7 (43-239)||(25038893-25039089)
chr7 (20-239)||(8706222-8706441)
chr7 (20-239)||(8719638-8719857)
chr7 (20-239)||(23519614-23519833)
chr7 (52-169)||(9410241-9410358)
chr7 (126-239)||(10875755-10875867)
chr7 (20-90)||(44408019-44408089)
chr7 (126-239)||(10869675-10869787)
chr7 (20-90)||(26420353-26420423)
chr7 (194-239)||(26420226-26420271)
chr7 (10-57)||(1245671-1245718)
chr7 (194-259)||(9410152-9410216)
chr7 (132-169)||(13570190-13570227)
chr7 (194-239)||(44408171-44408216)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (10-263)||(22062531-22062783)
chr5 (10-263)||(27663439-27663691)
chr5 (10-263)||(27670079-27670331)
chr5 (10-263)||(41097872-41098124)
chr5 (10-263)||(17706580-17706832)
chr5 (10-263)||(22265149-22265401)
chr5 (10-239)||(41769469-41769698)
chr5 (10-263)||(23584344-23584596)
chr5 (10-239)||(27615572-27615801)
chr5 (10-239)||(41776043-41776272)
chr5 (18-239)||(27608966-27609187)
chr5 (10-239)||(25107011-25107240)
chr5 (10-239)||(25166104-25166333)
chr5 (10-263)||(34294202-34294454)
chr5 (5-263)||(40707326-40707582)
chr5 (5-263)||(40713968-40714224)
chr5 (10-219)||(16355092-16355301)
chr5 (10-219)||(16361751-16361960)
chr5 (10-219)||(34565085-34565294)
chr5 (10-219)||(34571740-34571949)
chr5 (10-263)||(23610106-23610358)
chr5 (10-263)||(23841502-23841754)
chr5 (54-263)||(24471941-24472149)
chr5 (10-239)||(15001328-15001557)
chr5 (10-239)||(14994685-14994914)
chr5 (10-239)||(19992110-19992339)
chr5 (10-239)||(1692086-1692315)
chr5 (10-239)||(18038317-18038546)
chr5 (10-239)||(27686978-27687207)
chr5 (10-238)||(22334467-22334695)
chr5 (10-239)||(22327813-22328042)
chr5 (10-239)||(27516979-27517207)
chr5 (10-239)||(27523616-27523844)
chr5 (5-239)||(37293128-37293362)
chr5 (5-239)||(37286425-37286659)
chr5 (52-239)||(25406652-25406839)
chr5 (52-239)||(22133225-22133412)
chr5 (52-239)||(22139917-22140104)
chr5 (52-239)||(22588321-22588508)
chr5 (10-239)||(17284293-17284522)
chr5 (10-239)||(29477604-29477833)
chr5 (10-239)||(41294084-41294313)
chr5 (10-239)||(37544268-37544498)
chr5 (10-239)||(29471009-29471238)
chr5 (10-169)||(15236430-15236589)
chr5 (98-239)||(33726086-33726227)
chr5 (20-239)||(21294923-21295142)
chr5 (43-239)||(23336971-23337167)
chr5 (43-239)||(25535215-25535411)
chr5 (125-239)||(20776115-20776229)
chr5 (20-169)||(15441614-15441763)
chr5 (52-235)||(14359511-14359694)
chr5 (10-169)||(19768645-19768804)
chr5 (10-169)||(19775241-19775400)
chr5 (10-169)||(23250237-23250396)
chr5 (22-240)||(22325588-22325806)
chr5 (20-239)||(29316645-29316864)
chr5 (20-238)||(22410258-22410476)
chr5 (20-239)||(21667466-21667685)
chr5 (20-239)||(24554761-24554979)
chr5 (52-169)||(25808178-25808295)
chr5 (20-235)||(22258133-22258347)
chr5 (10-89)||(24020637-24020716)
chr5 (194-240)||(25808320-25808366)
chr5 (194-235)||(15441788-15441829)
chr5 (196-240)||(24020508-24020552)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (10-263)||(20215578-20215830)
chr1 (10-239)||(46156970-46157199)
chr1 (10-263)||(44844532-44844785)
chr1 (5-263)||(51334957-51335214)
chr1 (10-219)||(43078687-43078896)
chr1 (5-263)||(51328322-51328580)
chr1 (10-239)||(41478226-41478456)
chr1 (10-240)||(18599755-18599985)
chr1 (52-239)||(21828941-21829128)
chr1 (52-239)||(21844454-21844641)
chr1 (10-239)||(16345424-16345653)
chr1 (10-239)||(16352072-16352301)
chr1 (10-169)||(1011020-1011179)
chr1 (20-239)||(47659444-47659663)
chr1 (10-239)||(41355937-41356166)
chr1 (10-239)||(41348500-41348729)
chr1 (23-239)||(19063747-19063963)
chr1 (23-239)||(19111637-19111853)
chr1 (20-239)||(21438021-21438240)
chr1 (20-239)||(23763438-23763657)
chr1 (20-169)||(20524875-20525024)
chr1 (56-239)||(19104980-19105163)
chr1 (10-169)||(33385873-33386032)
chr1 (10-169)||(33392517-33392676)
chr1 (20-239)||(44756332-44756552)
chr1 (20-240)||(50887412-50887632)
chr1 (10-169)||(21806850-21807009)
chr1 (20-239)||(27898319-27898538)
chr1 (20-239)||(43062936-43063155)
chr1 (20-239)||(49334799-49335018)
chr1 (20-239)||(18625935-18626153)
chr1 (10-169)||(21835663-21835822)
chr1 (128-239)||(33394074-33394185)
chr1 (52-169)||(8305433-8305550)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (10-263)||(9466-9718)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (10-263)||(6980863-6981115)
chr6 (10-263)||(20649443-20649695)
chr6 (5-263)||(20060854-20061111)
chr6 (10-263)||(2869786-2870037)
chr6 (10-263)||(2876401-2876652)
chr6 (11-263)||(4233149-4233400)
chr6 (10-239)||(12762929-12763158)
chr6 (10-239)||(8229115-8229344)
chr6 (10-239)||(18931304-18931533)
chr6 (10-239)||(29587329-29587558)
chr6 (10-239)||(29593470-29593699)
chr6 (10-237)||(14059266-14059493)
chr6 (10-263)||(30597422-30597674)
chr6 (10-219)||(30637780-30637988)
chr6 (10-239)||(27327706-27327935)
chr6 (10-239)||(27388446-27388675)
chr6 (43-239)||(18194207-18194403)
chr6 (43-239)||(30694590-30694786)
chr6 (52-239)||(1538636-1538823)
chr6 (52-239)||(1544735-1544922)
chr6 (10-239)||(28258104-28258332)
chr6 (10-239)||(28264728-28264956)
chr6 (10-239)||(28336853-28337081)
chr6 (10-239)||(28343477-28343705)
chr6 (20-237)||(8797420-8797637)
chr6 (54-239)||(17031098-17031283)
chr6 (10-239)||(26130695-26130925)
chr6 (10-239)||(27429933-27430162)
chr6 (20-239)||(20801984-20802202)
chr6 (52-239)||(17037027-17037214)
chr6 (20-235)||(22331671-22331886)
chr6 (20-241)||(25595012-25595233)
chr6 (20-169)||(34832952-34833101)
chr6 (43-239)||(16372086-16372282)
chr6 (115-239)||(28287584-28287707)
chr6 (20-239)||(28314799-28315018)
chr6 (10-169)||(25117741-25117900)
chr6 (20-239)||(27185937-27186156)
chr6 (20-239)||(27207773-27207992)
chr6 (20-239)||(27241236-27241455)
chr6 (20-239)||(27263084-27263303)
chr6 (20-169)||(14098924-14099073)
chr6 (52-169)||(34369665-34369782)
chr6 (10-169)||(25111138-25111297)
chr6 (10-169)||(14472567-14472726)
chr6 (20-239)||(16551680-16551899)
chr6 (20-239)||(16577054-16577273)
chr6 (20-239)||(16618107-16618326)
chr6 (20-239)||(16628236-16628455)
chr6 (52-235)||(19808758-19808941)
chr6 (20-239)||(32564902-32565121)
chr6 (52-165)||(3708174-3708287)
chr6 (126-239)||(17016688-17016801)
chr6 (10-169)||(24314729-24314888)
chr6 (10-169)||(31316742-31316901)
chr6 (54-169)||(22759149-22759263)
chr6 (43-169)||(4168222-4168348)
chr6 (194-259)||(3708316-3708380)
chr6 (52-169)||(4208902-4209019)
chr6 (52-169)||(23276970-23277087)
chr6 (43-91)||(31164529-31164577)
chr6 (10-89)||(24290723-24290802)
chr6 (198-259)||(4168134-4168194)
chr6 (198-259)||(4208814-4208874)
chr6 (194-239)||(25111068-25111113)
chr6 (194-239)||(25117671-25117716)
chr6 (21-90)||(34295728-34295797)
chr6 (194-239)||(34298457-34298502)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (10-263)||(22320636-22320888)
chr2 (10-263)||(22326789-22327041)
chr2 (10-263)||(26877218-26877470)
chr2 (10-239)||(27216293-27216522)
chr2 (10-239)||(16986171-16986400)
chr2 (10-239)||(28431562-28431791)
chr2 (10-239)||(13306239-13306468)
chr2 (10-219)||(9340530-9340739)
chr2 (10-219)||(9489164-9489373)
chr2 (10-219)||(9608425-9608634)
chr2 (10-263)||(27617500-27617752)
chr2 (10-239)||(19489574-19489803)
chr2 (10-263)||(24913614-24913866)
chr2 (10-263)||(16997254-16997506)
chr2 (10-263)||(17003887-17004139)
chr2 (20-239)||(29233756-29233975)
chr2 (20-239)||(29347055-29347274)
chr2 (51-239)||(27599491-27599679)
chr2 (14-239)||(1843310-1843535)
chr2 (10-239)||(23171265-23171494)
chr2 (10-239)||(23582522-23582751)
chr2 (91-239)||(16922759-16922907)
chr2 (52-239)||(12829297-12829484)
chr2 (10-169)||(10101295-10101454)
chr2 (92-263)||(16928560-16928730)
chr2 (20-239)||(10866599-10866818)
chr2 (20-239)||(10873766-10873985)
chr2 (10-106)||(16980563-16980659)
chr2 (10-87)||(29282434-29282511)
chr2 (10-90)||(16928832-16928912)
chr2 (10-169)||(41604381-41604540)
chr2 (10-169)||(41610278-41610437)
chr2 (52-169)||(37318572-37318689)
chr2 (52-235)||(27197116-27197299)
chr2 (10-169)||(13970019-13970178)
chr2 (20-239)||(21138931-21139150)
chr2 (10-169)||(45057075-45057234)
chr2 (20-240)||(30970639-30970859)
chr2 (20-239)||(24503337-24503556)
chr2 (43-169)||(24872090-24872216)
chr2 (43-169)||(24879975-24880101)
chr2 (20-239)||(21146949-21147168)
chr2 (18-169)||(24715009-24715160)
chr2 (20-169)||(27369599-27369748)
chr2 (20-169)||(27376109-27376258)
chr2 (52-240)||(19645669-19645857)
chr2 (20-239)||(24640621-24640839)
chr2 (126-239)||(44380959-44381071)
chr2 (126-239)||(44387629-44387741)
chr2 (194-240)||(24880126-24880172)
chr2 (194-240)||(41604565-41604611)
chr2 (194-240)||(41610462-41610508)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (10-239)||(10586-10815)
scaffold0052 (10-239)||(57008-57237)
scaffold0052 (14-239)||(706-931)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (10-261)||(108974-109224)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (10-219)||(38951-39160)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (10-263)||(67712-67964)
scaffold0028 (52-239)||(41764-41951)
scaffold0028 (52-239)||(57271-57458)
scaffold0028 (10-169)||(7301-7460)
scaffold0028 (10-138)||(23363-23491)
scaffold0028 (194-240)||(13755-13801)
scaffold0028 (194-240)||(23283-23329)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (10-239)||(26869-27098)
scaffold0109 (20-90)||(43667-43737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-239)||(307323-307553)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (10-239)||(125763-125992)
scaffold0029 (43-239)||(105561-105757)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (10-239)||(38269-38498)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-239)||(76314-76543)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (10-239)||(57201-57430)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (10-169)||(12719-12878)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (20-169)||(3536-3685)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (52-170)||(3005-3123)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-169)||(3069-3218)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (10-169)||(12741-12900)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (20-239)||(14200-14419)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (20-239)||(242284-242503)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (52-239)||(58110-58297)
scaffold0004 (10-169)||(78511-78671)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (10-92)||(61180-61262)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (54-169)||(8571-8686)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (20-239)||(29867-30086)
scaffold0138 (20-90)||(41863-41933)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (52-235)||(9571-9754)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (52-169)||(10474-10591)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (20-239)||(24635-24854)
scaffold0256 (20-90)||(19792-19862)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (10-169)||(74293-74452)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (20-259)||(36916-37153)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (20-239)||(9016-9235)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (20-239)||(3738-3957)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (21-239)||(5459-5677)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (98-239)||(32050-32190)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (20-169)||(411-560)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (126-239)||(22431-22544)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (52-140)||(17424-17512)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (132-169)||(4052-4089)
scaffold0149 (132-169)||(8483-8520)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (198-259)||(14831-14891)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (194-239)||(19411-19456)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22084292 - 22084035
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22084292 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22084193  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22084192 gaacaaccttagtttgggagttgaggggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 22084093  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22084092 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 22084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 17669220 - 17669472
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17669220 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17669319  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17669320 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 17669419  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17669420 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 17669472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 17675872 - 17676124
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17675872 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17675971  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17675972 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 17676071  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17676072 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 17676124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 21915220 - 21915472
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21915220 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 21915319  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21915320 accttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 21915419  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21915420 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccccaactgataatgagacctagtga 21915472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 5534089 - 5534318
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5534089 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 5534188  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5534189 accttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 5534288  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5534289 tgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccc 5534318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 20019590 - 20019842
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20019590 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20019689  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20019690 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatcag 20019789  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||||||||||    
T  20019790 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaaccccta-attggtaatgagacctagtga 20019842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28455215 - 28454986
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28455215 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 28455116  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28455115 agctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgggagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcgatctg 28455016  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28455015 tgtcgcactttttgatcaagagtgaacccc 28454986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 20013514 - 20013765
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20013514 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20013613  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  20013614 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtt-gtgcgatcag 20013712  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||||||||||    
T  20013713 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaaccccta-attggtaatgagacctagtga 20013765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19111682 - 19111430
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19111682 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19111583  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  19111582 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 19111483  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  19111482 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 19111430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19117973 - 19117721
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19117973 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19117874  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  19117873 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 19117774  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  19117773 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 19117721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 8354417 - 8354642
Alignment:
Q  14 ttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagct 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8354417 ttcgaccttttcagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagct 8354516  T
Q  114 tagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtc 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||    
T  8354517 tagtttgggagttgagtggtattcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtc 8354616  T
Q  214 gcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  8354617 gcacgtgttgatcaagagtgaacccc 8354642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 22123035 - 22123264
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22123035 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaaca 22123134  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  22123135 acattagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgtttgagtgtttgtgcgatctg 22123234  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  22123235 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 22123264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29123541 - 29123312
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29123541 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 29123442  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29123441 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29123342  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29123341 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 29123312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 16882822 - 16883051
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || || |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  16882822 gtgtttagacctttttagttggaccttggatgccttagagtgtctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaaca 16882921  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16882922 acactagtttgggagatgagcggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16883021  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16883022 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 16883051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18865787 - 18865582
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18865787 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18865688  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  18865687 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 18865588  T
Q  210 tgtcgc 215  Q
    ||||||    
T  18865587 tgtcgc 18865582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18855392 - 18855187
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18855392 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18855293  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18855292 acactagtgtgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18855193  T
Q  210 tgtcgc 215  Q
    ||||||    
T  18855192 tgtcgc 18855187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 22115370 - 22115529
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22115370 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22115469  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22115470 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 22115529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22048402 - 22048173
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  22048402 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaaca 22048303  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  22048302 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtataaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 22048203  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22048202 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 22048173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19496846 - 19496617
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  | || |||| | ||| |||||||||||    |||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  19496846 gtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 19496747  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  19496746 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 19496647  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  19496646 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 19496617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20527895 - 20527676
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  20527895 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20527796  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20527795 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20527696  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  20527695 tttgatcaagagtgaacccc 20527676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 22122072 - 22122195
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22122072 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgaattggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22122171  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggt 133  Q
    |  |||||||||||| ||||||||    
T  22122172 acattagtttgggagatgagtggt 22122195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18065777 - 18065558
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18065777 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18065678  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18065677 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagttcagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18065578  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  18065577 tttgatcaggagtgaacccc 18065558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 20023578 - 20023737
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||    || |||||||    
T  20023578 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaaca 20023677  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  20023678 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaagaaccctcgcctcgcgag 20023737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 26934836 - 26935056
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  26934836 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 26934935  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  26934936 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 26935035  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||| ||||||||    
T  26935036 ttggatcaagagagaaccccc 26935056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19905901 - 19905793
Alignment:
Q  61 acctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcg 160  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  ||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19905901 acctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcg 19905802  T
Q  161 cctcgcgag 169  Q
    |||||||||    
T  19905801 cctcgcgag 19905793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 22124296 - 22124337
Alignment:
Q  128 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22124296 agtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 22124337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 23845443 - 23845512
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagg 89  Q
    ||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23845443 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 239
Target Start/End: Original strand, 22124368 - 22124407
Alignment:
Q  200 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22124368 gtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagcgaacccc 22124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 23845595 - 23845641
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  23845595 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 23845641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 36884380 - 36884637
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  36884380 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 36884479  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36884480 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 36884579  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  36884580 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 36884637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 19779940 - 19780192
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19779940 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19780039  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19780040 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 19780139  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  19780140 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 19780192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 18024078 - 18024327
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18024078 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccagaaca 18024177  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18024178 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 18024277  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctag 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  18024278 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctag 18024327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12475475 - 12475223
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12475475 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 12475376  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12475375 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 12475276  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  12475275 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 12475223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15362593 - 15362336
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  15362593 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccga 15362494  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15362493 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgcttgtgcg 15362394  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15362393 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 15362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 17961975 - 17962204
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17961975 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17962074  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17962075 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaactcgtttatgtgtttatgcgatctg 17962174  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17962175 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 17962204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15148916 - 15148682
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15148916 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15148817  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15148816 aaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15148717  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15148716 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 15148682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 15383139 - 15383396
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15383139 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15383238  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15383239 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15383338  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  15383339 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtgaacccctat-ctggtaatgagacctagtga 15383396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22195080 - 22194846
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22195080 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22194981  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22194980 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattttgtgtttgtgcg 22194881  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22194880 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 22194846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4772552 - 4772300
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4772552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcctttgagtacctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 4772453  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4772452 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttggctatgtgtttgtgcgatctg 4772353  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  4772352 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 4772300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 8048146 - 8048398
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8048146 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 8048245  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8048246 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatcag 8048345  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||||||||||    
T  8048346 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaaccccta-attggtaatgagacctagtga 8048398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 8054759 - 8055011
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8054759 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 8054858  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8054859 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatcag 8054958  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||||||||||    
T  8054959 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaaccccta-attggtaatgagacctagtga 8055011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23954603 - 23954351
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23954603 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23954504  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23954503 accttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 23954404  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23954403 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 23954351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23961265 - 23961013
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23961265 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23961166  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23961165 accttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 23961066  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23961065 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 23961013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 16231487 - 16231744
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16231487 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 16231586  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231587 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtatagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 16231686  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  | || |||||||||||||||||    
T  16231687 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtaaacccctat-ctggtaatgagacctagtga 16231744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8385290 - 8385061
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8385290 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 8385191  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8385190 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 8385091  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  8385090 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 8385061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8391945 - 8391716
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8391945 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 8391846  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8391845 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 8391746  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  8391745 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 8391716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14074286 - 14074057
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14074286 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14074187  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14074186 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 14074087  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  14074086 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 14074057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15257064 - 15256835
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15257064 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15256965  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15256964 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 15256865  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15256864 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 15256835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17808869 - 17808640
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17808869 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17808770  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17808769 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 17808670  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  17808669 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 17808640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12482105 - 12481897
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12482105 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 12482006  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12482005 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 12481906  T
Q  210 tgtcgcact 218  Q
    |||||||||    
T  12481905 tgtcgcact 12481897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18296086 - 18295829
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18296086 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 18295987  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  18295986 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 18295887  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  18295886 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 18295829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 17089628 - 17089857
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17089628 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17089727  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17089728 agcttagtttgtgagtggagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 17089827  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  17089828 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 17089857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 29040549 - 29040758
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  29040549 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 29040648  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29040649 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 29040748  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  29040749 tgtcgcactt 29040758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20115598 - 20115369
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20115598 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20115499  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20115498 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 20115399  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  20115398 tgtcggacgtgttgatcaagagcgaacccc 20115369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 14268118 - 14268337
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14268118 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 14268217  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| | |    
T  14268218 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcgcat 14268317  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14268318 gttgattaagagtgaacccc 14268337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 14298482 - 14298707
Alignment:
Q  14 ttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagct 113  Q
    ||||||||||||||||| || |||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  14298482 ttcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaacaagtt 14298581  T
Q  114 tagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtc 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  14298582 tattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcgatctgtgtc 14298681  T
Q  214 gcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||    
T  14298682 gcacgtgttgatctagagtgaacccc 14298707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40478603 - 40478374
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  40478603 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 40478504  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40478503 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40478404  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40478403 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 40478374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 7900863 - 7901050
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7900863 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 7900962  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7900963 gaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 7901050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 14305097 - 14305331
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |||  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  14305097 gtttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaaccca 14305196  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  14305197 gaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcg 14305296  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    || |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  14305297 atatgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccc 14305331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 26284558 - 26284787
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  26284558 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgtcttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 26284657  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  26284658 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 26284757  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26284758 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 26284787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40471930 - 40471701
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  40471930 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 40471831  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40471830 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40471731  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40471730 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 40471701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 51493510 - 51493697
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51493510 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 51493609  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  51493610 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 51493697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 15321786 - 15321973
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15321786 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 15321885  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  15321886 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtaattgcttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaatagtgaacccc 15321973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 6873026 - 6873255
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  6873026 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 6873125  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  6873126 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 6873225  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| | || |||| ||||| |||||||    
T  6873226 tgtcgcccgtgctgatcaagagggaacccc 6873255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18071624 - 18071395
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  18071624 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 18071525  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18071524 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18071425  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18071424 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccc 18071395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17810728 - 17810569
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17810728 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17810629  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17810628 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 17810569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 14757072 - 14757231
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14757072 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14757171  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14757172 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgccttgcgag 14757231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 121
Target Start/End: Original strand, 17991319 - 17991430
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17991319 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17991418  T
Q  110 agcttagtttgg 121  Q
    | ||||||||||    
T  17991419 accttagtttgg 17991430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Original strand, 9271764 - 9271981
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  ||   |||| ||||||||  |||||||    
T  9271764 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagcctgaacccagaacaactttagttt 9271863  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||| |  ||||||  ||| | ||||||||||||||||||     
T  9271864 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagtatgaccagaatgtaggttgtttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacg 9271962  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacc 237  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  9271963 tattgatcaagagtgaacc 9271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23838879 - 23838660
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  23838879 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23838780  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23838779 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23838680  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  23838679 tttgatcaagagtgaacccc 23838660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14679408 - 14679189
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||      
T  14679408 ctttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtag 14679309  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14679308 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14679209  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  14679208 tttgatcaagagtgaacccc 14679189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Original strand, 386046 - 386134
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  386046 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgcc 386134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14685617 - 14685397
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||  |||||||  ||| ||     
T  14685617 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggataagattgaacctagaacaacattatttg 14685518  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcag-gatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||   || | |  |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  14685517 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacg 14685418  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  14685417 ttttgatcaagagtgaacccc 14685397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35171042 - 35170859
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     
T  35171042 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtag 35170943  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
    | ||||||| |||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  35170942 gaactctcgtctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 35170859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 16956310 - 16956459
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  16956310 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggctagattagacccagaacaactttagttt 16956409  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16956410 gggaattgtttcgtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 16956459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 30234870 - 30234987
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  |||  | || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  30234870 cctgaacatacctagtaatgattatggattaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaa 30234969  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | |  |||||||||||||    
T  30234970 gaatcctcgcctcgcgag 30234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12522507 - 12522311
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||  |||||||  |||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  12522507 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacctagaacaacattagttggggagttggcttgtactcgccat 12522408  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||||| ||    ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  12522407 ggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttctagtttggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 12522311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53433823 - 53433603
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  53433823 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 53433724  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  53433723 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 53433624  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||| ||||||||    
T  53433623 ttggatcaagagagaaccccc 53433603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 12349234 - 12349453
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  12349234 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12349333  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12349334 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12349433  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  12349434 tttgatcaggagtgaacccc 12349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 19941804 - 19941963
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  19941804 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 19941903  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19941904 actttagtttggaaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19941963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23082044 - 23081885
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || || ||||    
T  23082044 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaaaaca 23081945  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23081944 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 23081885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 12299664 - 12299777
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  12299664 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 12299763  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||||    
T  12299764 caagagtgaacccc 12299777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 41385428 - 41385624
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || ||||   | |||||||||||    
T  41385428 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccat 41385527  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  41385528 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 41385624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27710201 - 27710042
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || || ||||    
T  27710201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgagcatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 27710102  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  27710101 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 27710042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55795903 - 55795685
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  55795903 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 55795804  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |   ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  55795803 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagcagttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 55795705  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  55795704 tttgatcaagagtgaacccc 55795685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35614384 - 35614166
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| |||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||  |||   |||  |||||||  |||||||    
T  35614384 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtaggactagattaaacctagaacaactttagttt 35614285  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  35614284 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 35614186  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  35614185 tttgatcaagagtgaacccc 35614166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 386166 - 386211
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  386166 gtgtttgtgcgatatgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 386211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9556976 - 9556827
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||   |||  ||||  ||||||| |||||||     
T  9556976 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaaccttagttg 9556877  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  9556876 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 16956484 - 16956530
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  16956484 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 16956530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Original strand, 30235012 - 30235076
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30235012 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttcagatcaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 30235076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26889917 - 26889660
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26889917 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 26889818  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26889817 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 26889718  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26889717 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 26889660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37615848 - 37615596
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37615848 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 37615749  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37615748 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 37615649  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  37615648 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 37615596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 14672849 - 14673098
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14672849 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccagaaca 14672948  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14672949 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 14673048  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctag 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  14673049 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctag 14673098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 418457 - 418205
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  418457 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 418358  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  418357 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 418258  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  418257 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 418205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6599175 - 6598923
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6599175 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 6599076  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6599075 accttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaatctg 6598976  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  6598975 tgtcgcacttgttgattaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 6598923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6605855 - 6605603
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6605855 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 6605756  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6605755 accttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaatctg 6605656  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  6605655 tgtcgcacttgttgattaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 6605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 26788454 - 26788706
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26788454 gtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26788553  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26788554 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 26788653  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26788654 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 26788706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 26794044 - 26794296
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26794044 gtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26794143  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26794144 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 26794243  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26794244 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 26794296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 5106533 - 5106762
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5106533 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggagcccagaaca 5106632  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5106633 accttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 5106732  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5106733 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 5106762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 10845933 - 10846184
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10845933 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 10846032  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10846033 accttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcgatctg 10846131  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10846132 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactagtaatgagacctagtga 10846184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48423825 - 48423596
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48423825 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 48423726  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48423725 agctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcgatctg 48423626  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  48423625 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 48423596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48430603 - 48430374
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48430603 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 48430504  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48430503 agctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcgatctg 48430404  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  48430403 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 48430374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16634308 - 16634099
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16634308 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 16634209  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16634208 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 16634109  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  16634108 tgtcgcactt 16634099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16640918 - 16640709
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16640918 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 16640819  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16640818 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 16640719  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  16640718 tgtcgcactt 16640709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43161583 - 43161374
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43161583 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 43161484  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43161483 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 43161384  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  43161383 tgtcgcactt 43161374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43167820 - 43167611
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43167820 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 43167721  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43167720 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 43167621  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  43167620 tgtcgcactt 43167611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 1332710 - 1332938
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1332710 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 1332809  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1332810 agcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 1332908  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| ||| ||| |  ||||||||||||    
T  1332909 tgtcgcgctttttggtccagagtgaacccc 1332938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 263
Target Start/End: Original strand, 10153428 - 10153636
Alignment:
Q  54 tgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10153428 tgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaaga 10153527  T
Q  154 actctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatga 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  10153528 actctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatga 10153626  T
Q  254 gacctagtga 263  Q
    ||||||||||    
T  10153627 gacctagtga 10153636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 31422202 - 31422454
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31422202 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 31422301  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31422302 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 31422401  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31422402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 31422454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 16623704 - 16623933
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16623704 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16623803  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16623804 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16623903  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16623904 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccc 16623933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 53380001 - 53380228
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  53380001 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53380100  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53380101 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53380199  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccc 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53380200 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaaccc 53380228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 53386653 - 53386880
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  53386653 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53386752  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53386753 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53386851  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccc 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53386852 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaaccc 53386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 16747488 - 16747740
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||    
T  16747488 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagaaagcccagaaca 16747587  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747588 accttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 16747687  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  16747688 tgtcgcacttgtagattaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 16747740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 16758220 - 16758472
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | | |||||||    
T  16758220 gtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagataaagcccagaaca 16758319  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758320 accttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 16758419  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  16758420 tgtcgcacttgttgattaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 16758472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13251176 - 13250924
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13251176 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 13251077  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  13251076 agcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 13250977  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  13250976 tgtcgcactcgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 13250924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13257822 - 13257570
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13257822 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 13257723  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  13257722 agcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 13257623  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  13257622 tgtcgcactcgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 13257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 16489319 - 16489548
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16489319 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16489418  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16489419 actttagtttgggagatgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16489518  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  16489519 tgtcgcacgtgctgatcaagagtgaacccc 16489548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5221819 - 5221609
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5221819 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgacacggcgagtaa 5221720  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaat 251  Q
    | |||||||||||||||| |||  ||||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||    
T  5221719 gaactctcgcctcgcgagcacagccaggatatagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaat 5221621  T
Q  252 gagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||    
T  5221620 gagacctagtga 5221609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 23704418 - 23704647
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23704418 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23704517  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23704518 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23704617  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23704618 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 23704647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 23722874 - 23723103
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23722874 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23722973  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23722974 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23723073  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23723074 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 23723103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 23741330 - 23741559
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23741330 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23741429  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23741430 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23741529  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23741530 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 23741559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 41201447 - 41201676
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41201447 gtgtttcaacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41201546  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  41201547 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 41201646  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41201647 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 41201676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 15726581 - 15726810
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||    
T  15726581 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacccagaaca 15726680  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15726681 acactagtttgggagataagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15726780  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15726781 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 15726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 20057052 - 20057281
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  20057052 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 20057151  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  20057152 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 20057251  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  20057252 tgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccc 20057281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 20063690 - 20063919
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  20063690 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 20063789  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  20063790 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 20063889  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  20063890 tgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccc 20063919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 5149659 - 5149846
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5149659 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 5149758  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5149759 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 5149846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 15691927 - 15692156
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15691927 gtgtttcgacctttttagtttgaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15692026  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | || | | ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15692027 acactagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcataacctgaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15692126  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15692127 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 15692156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 41091996 - 41092155
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41091996 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggagcagagggaacccagaaca 41092095  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41092096 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 41092155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14499784 - 14499625
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14499784 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14499685  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14499684 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 14499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30066405 - 30066246
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  30066405 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 30066306  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30066305 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 30066246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3691076 - 3690847
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| ||| |||||||||||    |||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  3691076 gtgtttcgacctttttagttaaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 3690977  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  3690976 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 3690877  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3690876 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 3690847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11070527 - 11070368
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  11070527 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 11070428  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11070427 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 11070368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 11165179 - 11165338
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||    
T  11165179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 11165278  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11165279 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 11165338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10904674 - 10904455
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10904674 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtacctagacatacctagatatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10904575  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10904574 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10904475  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  10904474 gttgatcatgagtgaacccc 10904455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10911346 - 10911127
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10911346 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10911247  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10911246 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10911147  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10911146 gttgatcaagagtgaacccc 10911127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10004084 - 10003865
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10004084 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacttcagttt 10003985  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |    
T  10003984 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10003885  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10003884 gttgatcaagagtgaacccc 10003865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10010653 - 10010512
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt 197  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||     
T  10010653 gaacccagaacaacttcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 10010554  T
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10010553 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 10010512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 22642988 - 22643118
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||    
T  22642988 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagacttaacccagaaca 22643087  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22643088 acactagtttgggagttgagttgtactcgcc 22643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15826120 - 15825961
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || || |||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  | || |||||||    
T  15826120 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 15826021  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15826020 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 15825961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 17710241 - 17710400
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  17710241 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 17710340  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17710341 actttagtttgggaattgaatggtactcgccaaggcaagtaagaactctcgcctcgcgag 17710400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19809485 - 19809326
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||   | || |||||||    
T  19809485 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaggttggacccagaaca 19809386  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19809385 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 19809326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24188223 - 24188004
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24188223 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24188124  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24188123 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24188024  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  24188023 tttgatcaagagtgaacccc 24188004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 55023304 - 55023174
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  55023304 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 55023205  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    |   |||||||| || |||||||||||||||    
T  55023204 acactagtttggaagatgagtggtactcgcc 55023174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 839660 - 839473
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  839660 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttggggagttgacttgaactcgccatggcgagtag 839561  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  839560 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 839473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15991753 - 15991912
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | |  || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  | || || ||||    
T  15991753 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcgtttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccaaaaca 15991852  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15991853 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgag 15991912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55149424 - 55149205
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  55149424 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 55149325  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  55149324 ggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 55149225  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  55149224 tttgatcaagagtgaacccc 55149205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7986152 - 7985933
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  7986152 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacttagtaatgattaggaaggaatgtaagacaagattgaacctagaacaacattagttt 7986053  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7986052 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagcattttcagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7985953  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  7985952 tttgatcaagagtgaacccc 7985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4710744 - 4710596
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  4710744 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtagggcaagattagac-cagaacaactttagttt 4710646  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4710645 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgag 4710596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 22670536 - 22670621
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcaga 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22670536 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcaga 22670621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6608926 - 6608707
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  6608926 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 6608828  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  6608827 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatccgtgtcgcacc 6608728  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | | ||| |||||||||||||    
T  6608727 tttcgatcaagagtgaacccc 6608707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 17252716 - 17252936
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  17252716 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 17252815  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  17252816 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 17252915  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||||||||||||    
T  17252916 ttggatcaagagtgaaccccc 17252936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 410400 - 410559
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  410400 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacgcagaaca 410499  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  410500 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 410559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 1145201 - 1145360
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  1145201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 1145300  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1145301 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 1145360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 10236086 - 10236202
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  10236086 cctgaacatacctagtaatgattagga-tgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaa 10236184  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | ||||||||||||||||    
T  10236185 gaactctcgcctcgcgag 10236202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12891852 - 12891632
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  12891852 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 12891753  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12891752 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 12891653  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||| ||||||||    
T  12891652 ttggatcaagagagaaccccc 12891632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12482875 - 12482656
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  12482875 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12482776  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12482775 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12482676  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  12482675 tttgatcaggagtgaacccc 12482656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13321418 - 13321180
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   || |||||||||  |||||||    
T  13321418 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaattcagaacaacattagttt 13321319  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | | |  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| | |||| |    |  ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13321318 ggaactagtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcactttcaagttgaagtgtaatgagtgcttgtgcgatatgtgtcgcacgt 13321219  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
     | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13321218 ttggatcaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 13321180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15343255 - 15343414
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || || ||||    
T  15343255 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 15343354  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  15343355 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 15343414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15349898 - 15350057
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  15349898 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 15349997  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  15349998 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcacctcgcgag 15350057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15361148 - 15361069
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15361148 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaattaatgtagg 15361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15397552 - 15397711
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||      
T  15397552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15397651  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15397652 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 15397711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15404143 - 15404302
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||      
T  15404143 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15404242  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15404243 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 15404302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 28350844 - 28350970
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||  |   |||||||||    
T  28350844 ccttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttggggagttggcttcaactcgccat 28350943  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  28350944 ggcgagtagatactctcgcctcgcgag 28350970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4291218 - 4291069
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    ||  |||||||  || ||||    
T  4291218 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacctagaacaacttttgttt 4291119  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4291118 gggaattgtttggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 4291069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5201670 - 5201451
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5201670 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5201571  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5201570 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcacctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5201471  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  5201470 tttgatcaggagtgaacccc 5201451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 8720805 - 8720964
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  8720805 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 8720904  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  8720905 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgag 8720964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 9072692 - 9072851
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  9072692 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 9072791  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  9072792 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgag 9072851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15337889 - 15337810
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15337889 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 15584379 - 15584598
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  15584379 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15584478  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15584479 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15584578  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  15584579 tttgatcaagagtgaacccc 15584598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 15591037 - 15591256
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  15591037 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15591136  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15591137 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15591236  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  15591237 tttgatcaagagtgaacccc 15591256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20723447 - 20723228
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  20723447 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20723348  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || || ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  20723347 ggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 20723248  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  20723247 tttgatcaagagtgaacccc 20723228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Original strand, 13315943 - 13315996
Alignment:
Q  116 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13315943 gtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaataactctcgcctcgcgag 13315996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 5419964 - 5420183
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5419964 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5420063  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | || || | | |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  5420064 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagca-agtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 5420162  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  5420163 ttttgatcaagagtgaacccc 5420183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 5426362 - 5426581
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5426362 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5426461  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | || || | | |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  5426462 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagca-agtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 5426560  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  5426561 ttttgatcaagagtgaacccc 5426581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4291044 - 4290998
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  4291044 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 4290998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 10236227 - 10236273
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  10236227 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 10236273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 13316021 - 13316067
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  13316021 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 13316067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15825936 - 15825890
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  15825936 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 15825890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 30777057 - 30777103
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  30777057 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 30777103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15360961 - 15360920
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  15360961 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 15360920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 239
Target Start/End: Original strand, 15404330 - 15404371
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  15404330 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 15404371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 15991938 - 15991983
Alignment:
Q  195 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  15991938 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 15991983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16333445 - 16333404
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16333445 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 16333404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19809301 - 19809256
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  19809301 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacatttggatcaagagtgaacccc 19809256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 59105 - 59361
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  59105 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 59204  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59205 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 59304  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  59305 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtg 59361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30983 - 30731
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30983 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 30884  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30883 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 30784  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  30783 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 30731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 72548 - 72800
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  72548 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 72647  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  72648 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 72747  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  72748 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 72800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8515 - 8286
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || |  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  8515 gtgtttcgacttttttagttggaccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 8416  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||  |  || ||  |||||||||| |||||    
T  8415 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcaatctg 8316  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8315 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 139528 - 139272
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  139528 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 139429  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139428 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 139329  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  139328 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtg 139272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 40523011 - 40523263
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40523011 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 40523110  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40523111 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 40523210  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  40523211 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 40523263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 9510662 - 9510914
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9510662 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 9510761  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9510762 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttatgcgatctg 9510861  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  9510862 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 9510914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 18164323 - 18164575
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18164323 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18164422  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18164423 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 18164522  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  18164523 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 18164575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 60321 - 60575
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  60321 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 60420  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60421 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcg 60520  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  60521 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctag 60575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14331242 - 14331013
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14331242 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14331143  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14331142 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatcag 14331043  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14331042 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 14331013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22138 - 21909
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22138 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22039  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22038 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 21939  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  21938 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 21909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 8201724 - 8201953
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8201724 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 8201823  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8201824 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 8201923  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  8201924 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 8201953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14337826 - 14337597
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14337826 gtgtttcgacctttttagttgaattttttatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14337727  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14337726 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatcag 14337627  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14337626 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 14337597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15022585 - 15022356
Alignment:
Q  11 tgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15022585 tgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaa 15022486  T
Q  111 gcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtg-tttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15022485 gcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgttttgtgcgatctg 15022386  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15022385 tgtcgcactttttgatccagagtgaacccc 15022356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11366652 - 11366426
Alignment:
Q  14 ttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagct 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  11366652 ttcgacctttttagttggaccttgtgtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaacaagtt 11366553  T
Q  114 tagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtc 213  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366552 tatgttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgaagttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtc 11366453  T
Q  214 gcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11366452 gcacttgttgatcaagagtgaaccccc 11366426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18176560 - 18176331
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18176560 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18176461  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18176460 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18176361  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18176360 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccc 18176331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18183232 - 18183003
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18183232 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18183133  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18183132 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18183033  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18183032 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccc 18183003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 14655066 - 14655295
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14655066 gtgttttgacctgtttagttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14655165  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  14655166 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcatagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14655265  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14655266 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 14655295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 44786124 - 44786376
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44786124 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccagaaca 44786223  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  44786224 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 44786323  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  44786324 tgtcgcacctgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 44786376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 44792765 - 44793017
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44792765 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccagaaca 44792864  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  44792865 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 44792964  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  44792965 tgtcgcacctgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 44793017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 12703038 - 12703311
Alignment:
Q  11 tgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12703038 tgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaa 12703137  T
Q  111 gcttagtttgggagttgagtggta----------------------ctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttg 188  Q
     |||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  12703138 ccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggaagagcttg 12703237  T
Q  189 tttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  12703238 tttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 12703311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 15155819 - 15156047
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15155819 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15155918  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15155919 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15156018  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccc 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15156019 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaaccc 15156047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 15162470 - 15162699
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15162470 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaggaca 15162569  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15162570 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15162669  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  15162670 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 15162699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 16406944 - 16407173
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||  | |   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16406944 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgtcatagggtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16407043  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16407044 acgttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16407143  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16407144 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 16407173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13684918 - 13684689
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  13684918 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13684819  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13684818 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13684719  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  13684718 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccc 13684689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13691533 - 13691304
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  13691533 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13691434  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13691433 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13691334  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  13691333 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccc 13691304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 20702641 - 20702870
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20702641 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 20702740  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  20702741 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 20702840  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20702841 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 20702870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32768130 - 32767901
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  32768130 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 32768031  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  32768030 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 32767931  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32767930 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 32767901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 11238621 - 11238780
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11238621 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11238720  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11238721 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 11238780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 11231934 - 11232093
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11231934 gtgtttcgacctttttagttggacctcgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaataaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11232033  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11232034 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 11232093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33563 - 33404
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  33563 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 33464  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33463 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 33404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 70415 - 70574
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  70415 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 70514  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70515 atactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 70574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1347921 - 1347803
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1347921 cctgaacatgcctagtatttattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtga 1347822  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagt 170  Q
    | |||||||||||||||||    
T  1347821 gaactctcgcctcgcgagt 1347803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49051732 - 49051574
Alignment:
Q  104 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||   |  ||||||||||    
T  49051732 agaaaaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgc 49051633  T
Q  204 gatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  49051632 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 49051574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 74523 - 74683
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactc-agaac 108  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||    
T  74523 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccccagaac 74622  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  74623 aatactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 74683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 12704350 - 12704467
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12704350 cctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 12704449  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | ||||||||||||||||    
T  12704450 gaactctcgcctcgcgag 12704467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 4318205 - 4318420
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||  |||| ||||||||   ||||||    
T  4318205 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtaggacaagattgaacccagaacaacactagttt 4318304  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||| ||| | |   ||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  4318305 gggaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaatggagtgtcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcacgt 4318404  T
Q  220 gttgattaagagtgaa 235  Q
     ||||| |||||||||    
T  4318405 tttgatcaagagtgaa 4318420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14953643 - 14953424
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  14953643 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14953544  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | | ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  14953543 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtggtttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgtacgt 14953444  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  14953443 tttgatcaagagtgaacccc 14953424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14959609 - 14959390
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  14959609 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14959510  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14959509 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcagattggagtgttttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 14959410  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  14959409 tttgatcaagagtgaacccc 14959390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14149015 - 14148866
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  14149015 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttt 14148916  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  14148915 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactcccgcctcgcgag 14148866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 11547959 - 11548145
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||     
T  11547959 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtag 11548058  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccc 238  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11548059 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaaccc 11548145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 11554555 - 11554741
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||     
T  11554555 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtag 11554654  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccc 238  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11554655 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaaccc 11554741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18531667 - 18531471
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||  | |||| | |||||||||||    
T  18531667 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgaaacttgacttgtactcgccat 18531568  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  18531567 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcatgagtgaacccc 18531471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11262742 - 11262555
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||     
T  11262742 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtag 11262643  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  11262642 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 11262555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12692909 - 12692726
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||     
T  12692909 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtag 12692810  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  12692809 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 12692726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 18553192 - 18553411
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  ||||||| |||||  ||||||     
T  18553192 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaactcaaaacaacattagttg 18553291  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18553292 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18553391  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  18553392 tttgatcaggagtgaacccc 18553411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 18584960 - 18585179
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18584960 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18585059  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18585060 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18585159  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  18585160 tttgatcaggagtgaacccc 18585179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 6016831 - 6017051
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  6016831 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 6016930  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  6016931 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 6017030  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||| ||||||||    
T  6017031 ttggatcaagagagaaccccc 6017051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 25038893 - 25039089
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||    
T  25038893 ccttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccat 25038992  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25038993 ggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 25039089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8706441 - 8706222
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  8706441 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8706342  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8706341 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8706242  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  8706241 tttgatcaggagtgaacccc 8706222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8719857 - 8719638
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  8719857 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8719758  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8719757 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8719658  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  8719657 tttgatcaggagtgaacccc 8719638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 23519614 - 23519833
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  23519614 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgccttaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 23519713  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  23519714 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 23519813  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  23519814 tttgatcaagagtgaacccc 23519833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9410358 - 9410241
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  9410358 cctgaacatacctagtaatgattaagaatgaatgtagggcaagattagacccaaaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaa 9410259  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | | ||||||||||||||    
T  9410258 ggattctcgcctcgcgag 9410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10875867 - 10875755
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  10875867 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 10875769  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||||    
T  10875768 caagagtgaacccc 10875755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 44408019 - 44408089
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44408019 ctttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 44408089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10869787 - 10869675
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  10869787 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtacagaatgtagatgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 10869689  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||| ||||||||    
T  10869688 caagaatgaacccc 10869675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26420423 - 26420353
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26420423 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 26420353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26420271 - 26420226
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  26420271 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 26420226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 57
Target Start/End: Original strand, 1245671 - 1245718
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  1245671 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaa 1245718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9410216 - 9410152
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9410216 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggaccaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 9410152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13570227 - 13570190
Alignment:
Q  132 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13570227 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 13570190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 44408171 - 44408216
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  44408171 gtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 44408216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 22062531 - 22062783
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22062531 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22062630  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22062631 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 22062730  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22062731 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 22062783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 27663439 - 27663691
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27663439 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27663538  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27663539 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 27663638  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27663639 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 27663691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 27670079 - 27670331
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27670079 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27670178  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27670179 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 27670278  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27670279 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 27670331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 41097872 - 41098124
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  41097872 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccagaaca 41097971  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41097972 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 41098071  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  41098072 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 41098124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 17706580 - 17706832
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17706580 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagcacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 17706679  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17706680 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 17706779  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17706780 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 17706832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22265401 - 22265149
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22265401 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgagcattcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22265302  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22265301 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 22265202  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22265201 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 22265149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41769698 - 41769469
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  41769698 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccagaaca 41769599  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41769598 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 41769499  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41769498 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 41769469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23584596 - 23584344
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23584596 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23584497  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23584496 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaacgaaattgtttttgtgtttgtgcgatctg 23584397  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23584396 tgtcgcacttgttgatcaagagtg-atcccctaactggtaatgagacctagtga 23584344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27615801 - 27615572
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27615801 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27615702  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27615701 accttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtaaaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctg 27615602  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27615601 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 27615572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41776272 - 41776043
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    
T  41776272 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacctagaaca 41776173  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41776172 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 41776073  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41776072 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 41776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27609187 - 27608966
Alignment:
Q  18 acctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagt 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  27609187 acctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaaccttaat 27609088  T
Q  118 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27609087 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 27608988  T
Q  218 ttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  27608987 ttgttgatcaagagtgaacccc 27608966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25107240 - 25107011
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25107240 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 25107141  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25107140 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 25107041  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  25107040 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 25107011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25166333 - 25166104
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25166333 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 25166234  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25166233 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 25166134  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  25166133 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 25166104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 34294202 - 34294454
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  34294202 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcacagggaacccagaaca 34294301  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294302 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 34294401  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  34294402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 34294454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40707582 - 40707326
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40707582 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40707483  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40707482 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40707384  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  40707383 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 40707326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40714224 - 40713968
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40714224 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40714125  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40714124 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40714026  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  40714025 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 40713968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16355301 - 16355092
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16355301 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 16355202  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16355201 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 16355102  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  16355101 tgtcgcactt 16355092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16361960 - 16361751
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16361960 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 16361861  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16361860 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 16361761  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  16361760 tgtcgcactt 16361751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34565294 - 34565085
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34565294 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 34565195  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34565194 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 34565095  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  34565094 tgtcgcactt 34565085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34571949 - 34571740
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34571949 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 34571850  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34571849 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 34571750  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  34571749 tgtcgcactt 34571740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23610358 - 23610106
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23610358 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccagaaca 23610259  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23610258 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcgatctg 23610159  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23610158 tgtcgcacttgatgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 23610106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23841754 - 23841502
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23841754 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccagaaca 23841655  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23841654 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcgatctg 23841555  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23841554 tgtcgcacttgatgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 23841502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 263
Target Start/End: Original strand, 24471941 - 24472149
Alignment:
Q  54 tgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24471941 tgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagt 24472040  T
Q  154 actctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatga 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  24472041 actctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatga 24472139  T
Q  254 gacctagtga 263  Q
    ||||||||||    
T  24472140 gacctagtga 24472149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 15001328 - 15001557
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15001328 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15001427  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  15001428 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtatttgtgcgatctg 15001527  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15001528 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 15001557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 14994685 - 14994914
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14994685 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14994784  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14994785 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14994884  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  14994885 tgtcccacgtgttgatcaaaagtgaacccc 14994914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19992339 - 19992110
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19992339 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19992240  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || |||||| ||||||||||    
T  19992239 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcgatctg 19992140  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  19992139 tgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccc 19992110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 1692086 - 1692315
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1692086 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 1692185  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1692186 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 1692285  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  1692286 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 1692315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 18038317 - 18038546
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| || | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  18038317 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgctctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaaca 18038416  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18038417 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18038516  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  18038517 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 18038546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 27686978 - 27687207
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27686978 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 27687077  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27687078 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27687177  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27687178 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 27687207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 22334467 - 22334695
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22334467 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22334566  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22334567 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactatcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22334666  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccc 238  Q
     ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22334667 agtcgcacgtgttgatctagagtgaaccc 22334695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 22327813 - 22328042
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22327813 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 22327912  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22327913 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22328012  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22328013 agtcgcacgtgttgatctagagtgaacccc 22328042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27517207 - 27516979
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27517207 gtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccagaaca 27517108  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  27517107 agcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 27517009  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27517008 tgtcgcacttgttgatctagagtgaacccc 27516979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27523844 - 27523616
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27523844 gtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccagaaca 27523745  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  27523744 agcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 27523646  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27523645 tgtcgcacttgttgatctagagtgaacccc 27523616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 37293128 - 37293362
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |    
T  37293128 gttttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37293227  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37293228 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37293327  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  37293328 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 37293362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 37286425 - 37286659
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |    
T  37286425 gttttgtgttttgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37286524  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37286525 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37286624  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  37286625 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 37286659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25406839 - 25406652
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25406839 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 25406740  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25406739 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 25406652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22133412 - 22133225
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133412 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 22133313  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22133312 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 22133225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22140104 - 22139917
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22140104 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 22140005  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22140004 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 22139917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22588508 - 22588321
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22588508 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaactcagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccaaggcgagtaa 22588409  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||||||||||| || |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22588408 gaactctcgcctcgcaagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 22588321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17284522 - 17284293
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17284522 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17284423  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  17284422 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccataatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 17284323  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17284322 tgtcccacgtgttgatcaagagtgaacccc 17284293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 29477604 - 29477833
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||    
T  29477604 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29477703  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29477704 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29477803  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29477804 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 29477833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 41294084 - 41294313
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| || || |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41294084 gtgtttcgacccttttagttggactttggatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41294183  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  41294184 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacttgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 41294283  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  41294284 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 41294313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37544498 - 37544268
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  37544498 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 37544399  T
Q  110 agcttagtttgggagt-tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  37544398 acatcagtttgggagaatcagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatct 37544299  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  37544298 gtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 37544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 29471009 - 29471238
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||    
T  29471009 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29471108  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29471109 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29471208  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29471209 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 29471238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15236430 - 15236589
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15236430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15236529  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15236530 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 15236589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33726227 - 33726086
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt 197  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||     
T  33726227 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 33726128  T
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33726127 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 33726086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 21294923 - 21295142
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  21294923 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21295022  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21295023 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21295122  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  21295123 tttgatcaagagtgaacccc 21295142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 23336971 - 23337167
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  23336971 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaactttagtttggaaattgaatggtactcgccat 23337070  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   |   |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  23337071 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggattgcctggagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 23337167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25535411 - 25535215
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||    
T  25535411 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccat 25535312  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25535311 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 25535215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20776229 - 20776115
Alignment:
Q  125 ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20776229 ttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcaccttttga 20776130  T
Q  225 ttaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||    
T  20776129 tcaagagtgaacccc 20776115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 15441614 - 15441763
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||     
T  15441614 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttg 15441713  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15441714 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgag 15441763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 14359511 - 14359694
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||  ||||  |||||||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||     
T  14359511 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacctagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtag 14359610  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
    | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  14359611 gaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 14359694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19768804 - 19768645
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  19768804 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 19768705  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19768704 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19768645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19775400 - 19775241
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  19775400 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 19775301  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19775300 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19775241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23250396 - 23250237
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  23250396 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 23250297  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23250296 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 23250237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 22325588 - 22325806
Alignment:
Q  22 ttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgg 121  Q
    ||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  |||  |||| |||||||   |||||||||    
T  22325588 ttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggaaaagattgaacccagaacagcattagtttgg 22325687  T
Q  122 gagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgt 221  Q
     | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  22325688 aacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttt 22325787  T
Q  222 tgattaagagtgaaccccc 240  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  22325788 ggatcaagagtgaaccccc 22325806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29316864 - 29316645
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  29316864 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 29316765  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  29316764 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 29316665  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  29316664 tttgatcaggagtgaacccc 29316645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Original strand, 22410258 - 22410476
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  22410258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22410357  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| |  | |||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22410358 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22410457  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccc 238  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  22410458 tttgatcaagagtgaaccc 22410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 21667466 - 21667685
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  21667466 ctttttagttagaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 21667565  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  21667566 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgattgtgcgatctgtgtcgcacct 21667665  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  21667666 tttgatcaggagtgaacccc 21667685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24554979 - 24554761
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24554979 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24554880  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24554879 ggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24554780  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  24554779 -ttgatcaagagtgaacccc 24554761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 25808178 - 25808295
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || ||||||||  || |||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||    
T  25808178 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaacttttgtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaa 25808277  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | ||||||||||||||||    
T  25808278 gaactctcgcctcgcgag 25808295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 22258133 - 22258347
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  22258133 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22258232  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22258233 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22258331  T
Q  220 gttgattaagagtgaa 235  Q
     ||||| |||||||||    
T  22258332 tttgatcaagagtgaa 22258347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24020716 - 24020637
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  24020716 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagg 24020637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 25808320 - 25808366
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  25808320 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 25808366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Original strand, 15441788 - 15441829
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  15441788 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 15441829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24020552 - 24020508
Alignment:
Q  196 gtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  24020552 gtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 24020508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 20215578 - 20215830
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20215578 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20215677  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20215678 accttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 20215777  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20215778 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccccaactggtaatgagacctagtga 20215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 46156970 - 46157199
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46156970 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 46157069  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46157070 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 46157169  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  46157170 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 46157199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 44844532 - 44844785
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||     
T  44844532 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatataggatcagagggaacccagaacg 44844631  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaa-tcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44844632 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaacccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatct 44844731  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  44844732 gtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 44844785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 51334957 - 51335214
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  51334957 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 51335056  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  51335057 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 51335156  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  51335157 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 51335214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43078896 - 43078687
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43078896 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 43078797  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078796 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 43078697  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  43078696 tgtcgcactt 43078687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 51328322 - 51328580
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacc-tgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  51328322 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtaccctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccc 51328421  T
Q  104 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||    
T  51328422 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgc 51328521  T
Q  204 gatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  51328522 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 51328580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 41478226 - 41478456
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41478226 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 41478325  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  41478326 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccaagaatgtaattgcttgagtgtttgtgcgatct 41478425  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41478426 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 41478456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 18599755 - 18599985
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||| || ||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  18599755 gtgttttgacatttttagttggatcttggatgccctagagtgccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 18599854  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||   |||||||||||||||    
T  18599855 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgaatgtttgtgcgatctg 18599954  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  18599955 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaaccccc 18599985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21829128 - 21828941
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21829128 cctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccttggcgagtaa 21829029  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| ||||  || ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  21829028 gaactctcgcctcgcgagcacaactagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccc 21828941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21844641 - 21844454
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21844641 cctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccttggtgagtaa 21844542  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  21844541 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccc 21844454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 16345424 - 16345653
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||    |||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  16345424 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 16345523  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16345524 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16345623  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16345624 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 16345653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 16352072 - 16352301
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||    |||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  16352072 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 16352171  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16352172 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16352271  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16352272 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 16352301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1011179 - 1011020
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  1011179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 1011080  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1011079 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 1011020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 47659663 - 47659444
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| |||  ||||||||||||||||||||| || | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  47659663 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 47659564  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  47659563 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 47659464  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  47659463 gttgatcaagagtgaacccc 47659444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 41355937 - 41356166
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  | || |||| | ||| |||||||||||    |||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  41355937 gtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 41356036  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  41356037 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 41356136  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41356137 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 41356166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 41348500 - 41348729
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  | || |||| | ||| |||||||||||    |||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  41348500 gtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 41348599  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  41348600 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 41348699  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41348700 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 41348729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19063963 - 19063747
Alignment:
Q  23 tttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttggg 122  Q
    |||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||||     
T  19063963 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19063864  T
Q  123 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 222  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19063863 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19063764  T
Q  223 gattaagagtgaacccc 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19063763 gatcaagagtgaacccc 19063747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19111853 - 19111637
Alignment:
Q  23 tttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttggg 122  Q
    |||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||||     
T  19111853 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19111754  T
Q  123 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 222  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19111753 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19111654  T
Q  223 gattaagagtgaacccc 239  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19111653 gatcaagagtgaacccc 19111637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21438240 - 21438021
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  21438240 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21438141  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21438140 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21438041  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  21438040 tttgatcaagagtgaacccc 21438021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23763657 - 23763438
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  23763657 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23763558  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23763557 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23763458  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  23763457 tttgatcaagagtgaacccc 23763438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 20524875 - 20525024
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  | |||||  |||||||    
T  20524875 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctataacaacattagttt 20524974  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20524975 ggaagttgattggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgag 20525024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19105163 - 19104980
Alignment:
Q  56 aacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtac 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19105163 aacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaac 19105064  T
Q  156 tctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  19105063 tctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaaaagtgaacccc 19104980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 33385873 - 33386032
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  33385873 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33385972  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  33385973 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 33386032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 33392517 - 33392676
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  33392517 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33392616  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  33392617 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 33392676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44756552 - 44756332
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagt-attgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtt 118  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||    
T  44756552 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagtt 44756453  T
Q  119 tgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  44756452 gggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 44756353  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| | |||||||||||    
T  44756352 ttttgatcaggagtgaacccc 44756332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 50887412 - 50887632
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  50887412 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 50887511  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  50887512 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 50887611  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||| ||||||||    
T  50887612 ttggatcaagagagaaccccc 50887632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 21806850 - 21807009
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  21806850 gtgtttcgacctttttagttggacattgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacccagaaca 21806949  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21806950 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 21807009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 27898319 - 27898538
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27898319 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27898418  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27898419 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 27898518  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  27898519 tttgatcaggagtgaacccc 27898538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 43062936 - 43063155
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  43062936 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 43063035  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  43063036 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 43063135  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  43063136 tttgatcaggagtgaacccc 43063155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49335018 - 49334799
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  49335018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 49334919  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  49334918 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 49334819  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  49334818 tttgatcaggagtgaacccc 49334799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 18625935 - 18626153
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18625935 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18626034  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18626035 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18626133  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  18626134 tttgatcaagagtgaacccc 18626153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21835822 - 21835663
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    ||  ||||||    
T  21835822 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacctagaaca 21835723  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21835722 actttagtatgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 21835663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33394185 - 33394074
Alignment:
Q  128 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatta 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  33394185 agtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatca 33394086  T
Q  228 agagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||    
T  33394085 ggagtgaacccc 33394074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8305550 - 8305433
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||    
T  8305550 cctgaatatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtctcgtactcgccatggcgagtaa 8305451  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  8305450 gaattcttgcctcgcgag 8305433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 9466 - 9718
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9466 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 9565  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9566 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcacctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 9665  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  9666 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6981115 - 6980863
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6981115 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 6981016  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6981015 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 6980916  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  6980915 tgtcgcacttgttgatcgagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 6980863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 20649443 - 20649695
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20649443 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20649542  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20649543 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaatttgtttatgtgtttatgcgatctg 20649642  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20649643 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 20649695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20061111 - 20060854
Alignment:
Q  5 gtttggtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20061111 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 20061012  T
Q  105 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 204  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20061011 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccaaggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 20060912  T
Q  205 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20060911 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 20060854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 2869786 - 2870037
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2869786 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcc-ttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 2869884  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2869885 accttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 2869984  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  2869985 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactagtaatgagacctagtga 2870037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 2876401 - 2876652
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2876401 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcc-ttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 2876499  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876500 accttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 2876599  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  2876600 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactagtaatgagacctagtga 2876652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 4233149 - 4233400
Alignment:
Q  11 tgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4233149 tgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgtctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaa 4233248  T
Q  111 gcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgt 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4233249 ccttattttgggagttgagtggtactcgtcatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgt 4233348  T
Q  211 gtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  4233349 gtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 4233400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12763158 - 12762929
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12763158 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccagaaca 12763059  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12763058 agcttagtttgggagttgagaggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 12762959  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12762958 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 12762929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8229344 - 8229115
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8229344 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 8229245  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8229244 agcttagtttgtgagttgagtggttctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 8229145  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  8229144 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 8229115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18931533 - 18931304
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18931533 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18931434  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18931433 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 18931334  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  18931333 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 18931304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 29587329 - 29587558
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29587329 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 29587428  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29587429 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 29587528  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  29587529 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 29587558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 29593470 - 29593699
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29593470 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 29593569  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29593570 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 29593669  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  29593670 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 29593699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 14059266 - 14059493
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14059266 gtgtttcgaccctttttgttgaaccttgtatacctttgagtgcccgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14059365  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14059366 agcttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcgatctg 14059465  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacc 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  14059466 tgtcgcacttgttaatcaagagtgaacc 14059493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30597674 - 30597422
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30597674 gtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctgaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaaggaacccagaaca 30597575  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30597574 accttggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaatatggaattgtttatgtgtttgtgcgatctg 30597475  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  30597474 tgtcgcacttgatgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 30597422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 30637780 - 30637988
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30637780 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 30637879  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30637880 agcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgagtatgtgtttgtgcgatctg 30637978  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  30637979 tgtcgcactt 30637988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 27327706 - 27327935
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27327706 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27327805  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27327806 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27327905  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  27327906 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccc 27327935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 27388446 - 27388675
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27388446 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27388545  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27388546 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27388645  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  27388646 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccc 27388675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 18194207 - 18194403
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18194207 cctttagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccac 18194306  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18194307 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccc 18194403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30694786 - 30694590
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30694786 ccttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccat 30694687  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  30694686 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagggtgaacccc 30694590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 1538636 - 1538823
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1538636 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 1538735  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1538736 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 1538823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 1544735 - 1544922
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1544735 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 1544834  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1544835 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 1544922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 28258104 - 28258332
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  28258104 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 28258203  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||    
T  28258204 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctg 28258302  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28258303 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 28258332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 28264728 - 28264956
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  28264728 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 28264827  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||    
T  28264828 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctg 28264926  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28264927 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 28264956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 28336853 - 28337081
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  28336853 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 28336952  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||    
T  28336953 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctg 28337051  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28337052 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 28337081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 28343477 - 28343705
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  28343477 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 28343576  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||    
T  28343577 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctg 28343675  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28343676 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 28343705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8797637 - 8797420
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  8797637 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 8797538  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8797537 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgcgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 8797438  T
Q  220 gttgattaagagtgaacc 237  Q
    |||||| |||||||||||    
T  8797437 gttgatcaagagtgaacc 8797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17031283 - 17031098
Alignment:
Q  54 tgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||  |||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17031283 tgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggatagaacccaaaacaacattagtttgggaattgagtggtactcgccatggcgagtaaga 17031184  T
Q  154 actctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  17031183 actctcgcctcgcgagcacaaacagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccc 17031098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26130925 - 26130695
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26130925 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26130826  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||      ||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||    
T  26130825 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactttcgtctcgcgagctagcccaggatgtagtttgtttgagtgtttgtacgatct 26130726  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  26130725 gtgtcgcacgtgtggatcaagagcgaacccc 26130695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 27429933 - 27430162
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  27429933 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 27430032  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27430033 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27430132  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  27430133 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccc 27430162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20802202 - 20801984
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  |||||||    
T  20802202 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 20802103  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||      
T  20802102 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacga 20802004  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  20802003 gttgatcaagagtgaacccc 20801984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 17037027 - 17037214
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||  |||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |    
T  17037027 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggattgaacccagaacaacattagtttgggaattaagtggtacttgccatgacgagtga 17037126  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||  ||| ||| |  ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  17037127 gaactctcgcctcgcgagcacatccagaatgtaggttgtttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 17037214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22331886 - 22331671
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  22331886 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacgttagttt 22331787  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22331786 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22331687  T
Q  220 gttgattaagagtgaa 235  Q
     ||||| |||||||||    
T  22331686 tttgatcaagagtgaa 22331671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 25595012 - 25595233
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  25595012 ctttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtaggacgagattggacccagaacaactttagttt 25595111  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||| || | |    |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  25595112 gggaattgttgggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25595211  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccccc 241  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  25595212 tttgatcaagagtgaacccccc 25595233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34833101 - 34832952
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  34833101 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 34833002  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34833001 gggaattgtgtggtactcgctatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 34832952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16372282 - 16372086
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  16372282 ccttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccat 16372183  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16372182 ggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 16372086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28287707 - 28287584
Alignment:
Q  115 agtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcg 214  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28287707 agttggggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcg 28287609  T
Q  215 cacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||    
T  28287608 catgtgttgatcaagagtgaacccc 28287584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28315018 - 28314799
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  28315018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 28314920  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28314919 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacc 28314820  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  28314819 ttttgatcaagagtgaacccc 28314799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25117900 - 25117741
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||  | || |||||||    
T  25117900 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagtgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25117801  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25117800 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgag 25117741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27186156 - 27185937
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27186156 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27186058  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27186057 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27185958  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  27185957 ttttgatcaagagtgaacccc 27185937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27207992 - 27207773
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27207992 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27207894  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27207893 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27207794  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  27207793 ttttgatcaagagtgaacccc 27207773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 27241236 - 27241455
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27241236 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27241334  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27241335 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27241434  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  27241435 ttttgatcaagagtgaacccc 27241455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 27263084 - 27263303
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27263084 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27263182  T
Q  120 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27263183 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27263282  T
Q  219 tgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  27263283 ttttgatcaagagtgaacccc 27263303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14099073 - 14098924
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  14099073 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagttt 14098974  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14098973 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgag 14098924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 34369665 - 34369782
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||  | |||| | |||||||||||||||||||     
T  34369665 cctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgtaatttgacttgtactcgccatggcgagtat 34369764  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34369765 gtactctcgcctcgcgag 34369782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25111297 - 25111138
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  | || || ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||  | || |||||||    
T  25111297 gtgtttggacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagcgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25111198  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25111197 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgag 25111138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14472726 - 14472567
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  14472726 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 14472627  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | ||||||| || | |||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  14472626 accttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgag 14472567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 16551680 - 16551899
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16551680 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16551779  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16551780 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16551879  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  16551880 tttgatcaggagtgaacccc 16551899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16577273 - 16577054
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16577273 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16577174  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16577173 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16577074  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  16577073 tttgatcaggagtgaacccc 16577054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 16618107 - 16618326
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16618107 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16618206  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16618207 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16618306  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  16618307 tttgatcaggagtgaacccc 16618326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 16628236 - 16628455
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16628236 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16628335  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16628336 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16628435  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  16628436 tttgatcaggagtgaacccc 16628455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19808941 - 19808758
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||   ||||  |||||||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||     
T  19808941 cctggacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagtttgaacctagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtag 19808842  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
    | ||||||||||| |||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19808841 gaactctcgcctcacgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttgatcaagagtgaa 19808758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 32564902 - 32565121
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  32564902 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 32565001  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  32565002 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 32565101  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  32565102 tttgatcaggagtgaacccc 32565121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 165
Target Start/End: Original strand, 3708174 - 3708287
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  3708174 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaa 3708273  T
Q  152 gtactctcgcctcg 165  Q
    | | ||||||||||    
T  3708274 ggattctcgcctcg 3708287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 17016688 - 17016801
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  17016688 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 17016787  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||||    
T  17016788 caagagtgaacccc 17016801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 24314729 - 24314888
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |  |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||     || |||||||    
T  24314729 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgctttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 24314828  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24314829 actttagtttgggaattgtttagtactcaccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 24314888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 31316742 - 31316901
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |    | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||   ||     || |||||||    
T  31316742 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtatgcctgaacatgcctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 31316841  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  31316842 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 31316901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22759263 - 22759149
Alignment:
Q  54 tgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||| |     
T  22759263 tgaacatacctagtattgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt-ggttttgtctggtacttgccatggcgagtagga 22759165  T
Q  154 actctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||||||||||||    
T  22759164 actctcgcctcgcgag 22759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4168348 - 4168222
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  4168348 ccttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccat 4168249  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4168248 ggcgattaaggattctcgcctcgcgag 4168222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Original strand, 3708316 - 3708380
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  3708316 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 3708380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4209019 - 4208902
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||    
T  4209019 cctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatggcgattaa 4208920  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | | ||||||||||||||    
T  4208919 ggattctcgcctcgcgag 4208902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 23276970 - 23277087
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | | |    ||||||||||||||||||||    
T  23276970 cctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacatcattagtttggaactagtcccgtactcgccatggcgagtaa 23277069  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | | ||||||||||||||    
T  23277070 gaattctcgcctcgcgag 23277087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Original strand, 31164529 - 31164577
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggat 91  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31164529 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggat 31164577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 24290723 - 24290802
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagg 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |      || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24290723 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcttcagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 24290802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4168194 - 4168134
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4168194 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttcgatcaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 4168134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4208874 - 4208814
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4208874 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 4208814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25111113 - 25111068
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  25111113 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 25111068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25117716 - 25117671
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  25117716 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 25117671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 34295728 - 34295797
Alignment:
Q  21 tttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    |||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34295728 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtagga 34295797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 34298457 - 34298502
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  34298457 gtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 34298502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 22320636 - 22320888
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22320636 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22320735  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22320736 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 22320835  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22320836 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 22320888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 22326789 - 22327041
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22326789 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22326888  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22326889 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 22326988  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22326989 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 22327041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 26877218 - 26877470
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26877218 gtgtttcgacctttttagttggaccttgtatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26877317  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26877318 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 26877417  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26877418 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 26877470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27216522 - 27216293
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  27216522 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacg 27216423  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27216422 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 27216323  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  27216322 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 27216293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16986400 - 16986171
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16986400 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16986301  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16986300 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 16986201  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  16986200 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 16986171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 28431562 - 28431791
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28431562 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 28431661  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28431662 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 28431761  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  28431762 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 28431791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 13306239 - 13306468
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13306239 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgccttcgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 13306338  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13306339 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 13306438  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  13306439 tgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 13306468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9340739 - 9340530
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9340739 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 9340640  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9340639 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 9340540  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  9340539 tgtcgcactt 9340530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9489373 - 9489164
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9489373 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 9489274  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9489273 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 9489174  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  9489173 tgtcgcactt 9489164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9608634 - 9608425
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9608634 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 9608535  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9608534 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 9608435  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  9608434 tgtcgcactt 9608425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27617752 - 27617500
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27617752 gtgtttcaacctttttagtcgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27617653  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   |  ||||||||||||||||    
T  27617652 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgcgatctg 27617553  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27617552 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 27617500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 19489574 - 19489803
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||    
T  19489574 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacctacctagtattgtttaggaacgaatttaggatcagagggaacccataaca 19489673  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19489674 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttttgcgatccg 19489773  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19489774 tgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccc 19489803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 24913614 - 24913866
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24913614 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 24913713  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24913714 acactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgaagttgcttgtgtgtttgtgcgatctg 24913813  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  24913814 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 24913866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16997506 - 16997254
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16997506 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccagaaca 16997407  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  16997406 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 16997307  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  16997306 tgtcgcacctgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 16997254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17004139 - 17003887
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17004139 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctaatattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccagaaca 17004040  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||||||    
T  17004039 agcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcgatctg 17003940  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  17003939 tgtcgcacctgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 17003887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29233975 - 29233756
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29233975 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29233876  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29233875 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29233776  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  29233775 gttgatcaagggtgaacccc 29233756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29347274 - 29347055
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29347274 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29347175  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29347174 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29347075  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  29347074 gttgatcaagggtgaacccc 29347055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27599679 - 27599491
Alignment:
Q  51 acctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599679 acctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagta 27599580  T
Q  151 agtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    || |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  27599579 agaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccc 27599491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1843535 - 1843310
Alignment:
Q  14 ttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagct 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  1843535 ttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacctagaacaagtt 1843436  T
Q  114 tagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtc 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  1843435 tattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcttcgcgagcacaaccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcgatctgtgtc 1843336  T
Q  214 gcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||    
T  1843335 gcacgtgttgatctagagtgaacccc 1843310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23171494 - 23171265
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23171494 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23171395  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23171394 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23171295  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  23171294 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 23171265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23582751 - 23582522
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23582751 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23582652  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23582651 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23582552  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  23582551 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccc 23582522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16922907 - 16922759
Alignment:
Q  91 tcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtt 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16922907 tcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgat 16922808  T
Q  191 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  16922807 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccc 16922759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12829484 - 12829297
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12829484 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaa 12829385  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12829384 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacatgttgatcaagagtgaacccc 12829297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 10101295 - 10101454
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  10101295 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 10101394  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10101395 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 10101454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16928730 - 16928560
Alignment:
Q  92 cagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgttt 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |    
T  16928730 cagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcct 16928631  T
Q  192 atgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccccta-ctagtaatgagacctagtga 263  Q
      |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  16928630 gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaa--cccctagctggtaatgagacctagtga 16928560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10866818 - 10866599
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10866818 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10866719  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10866718 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10866619  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10866618 gttgatcaagagtgaacccc 10866599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10873985 - 10873766
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10873985 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10873886  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10873885 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10873786  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10873785 gttgatcaagagtgaacccc 10873766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16980659 - 16980563
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcaga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16980659 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaga 16980563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 29282434 - 29282511
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgta 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29282434 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgta 29282511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16928912 - 16928832
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16928912 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 16928832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 41604381 - 41604540
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  41604381 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41604480  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41604481 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 41604540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 41610278 - 41610437
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  41610278 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41610377  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41610378 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 41610437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37318689 - 37318572
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||    || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  37318689 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaa 37318590  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
    | ||||||||||||||||    
T  37318589 gaactctcgcctcgcgag 37318572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27197299 - 27197116
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  ||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     
T  27197299 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtag 27197200  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
    | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  27197199 gaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 27197116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 13970019 - 13970178
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  13970019 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 13970118  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  13970119 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 13970178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 21138931 - 21139150
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||  |||| |||||||   |||||||    
T  21138931 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgacaagattgaacccagaacagctttagttt 21139030  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21139031 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21139130  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  21139131 tttgatcaagagtgaacccc 21139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 45057075 - 45057234
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  45057075 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 45057174  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  45057175 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 45057234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 30970639 - 30970859
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  30970639 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 30970738  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  30970739 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30970838  T
Q  220 gttgattaagagtgaaccccc 240  Q
     | ||| ||||| ||||||||    
T  30970839 ttggatcaagagagaaccccc 30970859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24503556 - 24503337
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24503556 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24503457  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    |  |||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||  |||   || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24503456 gaaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactttcatattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24503357  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | ||| |||||||    
T  24503356 tttgatcaggagcgaacccc 24503337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 24872090 - 24872216
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  24872090 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 24872189  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24872190 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 24872216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 24879975 - 24880101
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  24879975 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 24880074  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24880075 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 24880101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 21146949 - 21147168
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||||| |   |||||||    
T  21146949 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtaggacaagattgaacccagaatagctttagttt 21147048  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21147049 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21147148  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  21147149 tttgatcaagagtgaacccc 21147168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24715160 - 24715009
Alignment:
Q  18 acctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagt 117  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || ||||||||  |||||    
T  24715160 acctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagt 24715061  T
Q  118 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24715060 ttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 24715009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27369748 - 27369599
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27369748 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27369649  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27369648 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 27369599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27376258 - 27376109
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27376258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27376159  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27376158 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 27376109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 240
Target Start/End: Original strand, 19645669 - 19645857
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||    
T  19645669 cctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagtattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaa 19645768  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    | | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||    
T  19645769 gaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaaccccc 19645857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 24640621 - 24640839
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  24640621 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgccagaacaaacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 24640720  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24640721 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacctccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24640819  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  24640820 tttgatcaagagtgaacccc 24640839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 44380959 - 44381071
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  44380959 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgat 44381057  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||||    
T  44381058 caagagtgaacccc 44381071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 44387629 - 44387741
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  44387629 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgat 44387727  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||||    
T  44387728 caagagtgaacccc 44387741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 24880126 - 24880172
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  24880126 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 24880172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 41604565 - 41604611
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  41604565 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 41604611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 41610462 - 41610508
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  41610462 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaaccccc 41610508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10815 - 10586
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10815 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 10716  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10715 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctg 10616  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10615 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 10586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 57237 - 57008
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  57237 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 57138  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  57137 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctg 57038  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  57037 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccc 57008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 706 - 931
Alignment:
Q  14 ttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagct 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||       
T  706 ttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaacac 805  T
Q  114 tagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  806 tagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtc 905  T
Q  214 gcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  906 gcacgtgttgatcaagagtgaacccc 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Original strand, 108974 - 109224
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  108974 gtgtttcgaccttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 109073  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  109074 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcacctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcgatctg 109173  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagt 261  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  109174 tgtcgcacttgttaatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagt 109224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39160 - 38951
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39160 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 39061  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39060 agcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcgatctg 38961  T
Q  210 tgtcgcactt 219  Q
    ||||||||||    
T  38960 tgtcgcactt 38951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 67964 - 67712
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  67964 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 67865  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  67864 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 67765  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagacctagtga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  67764 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtga 67712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41951 - 41764
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41951 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacccagaacaacactagtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaa 41852  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41851 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 41764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 57458 - 57271
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57458 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 57359  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  57358 gaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtggtgatcaagagtgaacccc 57271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7460 - 7301
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   | || || ||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  | || |||||||    
T  7460 gtgtttcgacctttttagttagaccttaagtgccattgagtgcctgaacgtacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 7361  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7360 actttagtttgggaattgtttggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23491 - 23363
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  | || |||||||    
T  23491 gtgtttcgacctttttagttataccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 23392  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcg 138  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  23391 actttagtttgggaattgtttggtactcg 23363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13801 - 13755
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  13801 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 13755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23329 - 23283
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaaccccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  23329 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccc 23283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27098 - 26869
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||    
T  27098 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 26999  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  26998 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacctgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 26899  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  26898 tgtcgcacgtgttgatccagagtgaacccc 26869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 43737 - 43667
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43737 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 43667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 307553 - 307323
Alignment:
Q  10 gtgtttcgaccttttt-agttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  307553 gtgtttcgaccttttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaac 307454  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 208  Q
    ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  |||||||||||||||    
T  307453 aacactaatttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatct 307354  T
Q  209 gtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  307353 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 307323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 125763 - 125992
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  125763 gtgtttcaacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 125862  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||| | |   ||  ||||||||||||||||    
T  125863 gcactggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctg 125962  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  125963 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 125992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 105561 - 105757
Alignment:
Q  43 ccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 142  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  105561 ccttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataacagcactggtttgggagttgagtggtactcgccat 105660  T
Q  143 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | |   ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  105661 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccc 105757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38498 - 38269
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  38498 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaaca 38399  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  38398 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 38299  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  38298 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 38269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Original strand, 76314 - 76543
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  76314 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaaca 76413  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  76414 acatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 76513  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  76514 tgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccc 76543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 57430 - 57201
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  | ||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| |||||||    
T  57430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 57331  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 209  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  57330 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 57231  T
Q  210 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  57230 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccc 57201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12878 - 12719
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  12878 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 12779  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12778 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 12719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 3536 - 3685
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||   |||||     
T  3536 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtta 3635  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3636 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3123 - 3005
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3123 cctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacgttagtttgggaattgagtggtactcgccatggcgagtaa 3024  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagt 170  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3023 gaactctcgcctcgcgagt 3005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3218 - 3069
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||    || |||||||| ||||||||    
T  3218 ctttttagttggaccttgagtgcccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattagacccagaacaaccttagttt 3119  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3118 gggaattgtttggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12900 - 12741
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || || |||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||  | || |||||||    
T  12900 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 12801  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12800 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 12741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14419
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  14200 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 14299  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14300 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14399  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  14400 tttgatcaagagtgaacccc 14419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 242503 - 242284
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  242503 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaacattagttg 242404  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  242403 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 242304  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  242303 tttgatcaagagtgaacccc 242284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 58110 - 58297
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||     
T  58110 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtag 58209  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  58210 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccc 58297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 78671 - 78511
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgta-ggatcagagggaactcagaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||   |||  | || ||||||    
T  78671 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaagattggacccagaac 78572  T
Q  109 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    ||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78571 aactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 78511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 61262 - 61180
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatc 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61262 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatc 61180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Original strand, 8571 - 8686
Alignment:
Q  54 tgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagt 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||  |||| ||||||||  |||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||     
T  8571 tgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacccagaacaacattaggttggaacttgacttgtactcgccatggcgagtaaga 8670  T
Q  154 actctcgcctcgcgag 169  Q
    ||||||||||||||||    
T  8671 actctcgcctcgcgag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 29867 - 30086
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  |||||||  ||| ||     
T  29867 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattatttg 29966  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  29967 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30066  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  30067 tttgatcaagagtgaacccc 30086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 41863 - 41933
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41863 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 41933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9754 - 9571
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||     
T  9754 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttggggagttggcctgtactcgccatggcgagtag 9655  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaa 235  Q
     ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  9654 atactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaa 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10591 - 10474
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||     
T  10591 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttggggagttggcttgaactcgccatggcgagtag 10492  T
Q  152 gtactctcgcctcgcgag 169  Q
     |||||||||||||||||    
T  10491 atactctcgcctcgcgag 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 24635 - 24854
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||  ||||  |||| ||  ||||||     
T  24635 ctttttagttggaccttgagtaccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaataacattagttg 24734  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  24735 gggagttggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttctagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 24834  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24835 gttgatcaagagtgaacccc 24854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19862
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtagga 90  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  19792 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagga 19862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 74452 - 74293
Alignment:
Q  10 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||||    
T  74452 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 74353  T
Q  110 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  74352 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 74293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37153 - 36916
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||   |||  |||| |||||||   |||| ||    
T  37153 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacccagaacagcattagctt 37054  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  37053 ggaacttgacttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 36954  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
     ||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  36953 tttgatcaagagtgaa--cccctaatggtaatgagaccta 36916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9235 - 9016
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  9235 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 9136  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  9135 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 9036  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  9035 tttgatcaggagtgaacccc 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 3738 - 3957
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  3738 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 3837  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  3838 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 3937  T
Q  220 gttgattaagagtgaacccc 239  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  3938 tttgatcaggagtgaacccc 3957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 5459 - 5677
Alignment:
Q  21 tttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttg 120  Q
    |||||||||| ||||||  | || || ||| ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||  ||||  | |||||  |||| |||    
T  5459 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacctaaaacaacattaggttg 5558  T
Q  121 ggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttg 220  Q
    | | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||  || | |   ||  |||||||||||||||| ||||||| |     
T  5559 gaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcactaccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtt 5658  T
Q  221 ttgattaagagtgaacccc 239  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  5659 ttgatcatgagtgaacccc 5677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 32050 - 32190
Alignment:
Q  98 gaactcagaacaagcttagtttgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtg 196  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | || ||| ||||    
T  32050 gaacccagaacaaccttagtt-gggagattgagtggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtt-tttgtgtg 32147  T
Q  197 tttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||    
T  32148 tttgtgcgatctgtgtcgcaccatttgatcaagagtggacccc 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 560 - 411
Alignment:
Q  20 ctttttagttgaaccttgtatacccttaagtacctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||   ||| |||||||   |||||||    
T  560 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtaggattagattaaacccagaacatcattagttt 461  T
Q  120 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  460 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcacgag 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22544 - 22431
Alignment:
Q  126 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  22544 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 22445  T
Q  226 taagagtgaacccc 239  Q
     |||||||||||||    
T  22444 caagagtgaacccc 22431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Original strand, 17424 - 17512
Alignment:
Q  52 cctgaacatacctagtattgattaggaattaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||||  ||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||    
T  17424 cctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgcc 17512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4089 - 4052
Alignment:
Q  132 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4089 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgag 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8520 - 8483
Alignment:
Q  132 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 169  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8520 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgag 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Original strand, 14831 - 14891
Alignment:
Q  198 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccccctactagtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14831 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccctta-tggtaatgagaccta 14891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 19411 - 19456
Alignment:
Q  194 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccc 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19411 gtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccc 19456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University