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Alignment Overview

Query: NF15328_low_1 (Length: 606)

Name: NF15328_low_1
Description: NF15328
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15328_low_1
NF15328_low_1
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (1-435)||(37748628-37749062)
chr3 (467-593)||(10505948-10506074)
chr3 (467-593)||(44894064-44894190)
chr3 (472-593)||(47669264-47669385)
chr3 (470-593)||(4773246-4773369)
chr3 (470-593)||(45307016-45307139)
chr3 (467-593)||(8474170-8474296)
chr3 (467-593)||(29818177-29818303)
chr3 (472-593)||(10506272-10506393)
chr3 (472-593)||(26318506-26318627)
chr3 (472-593)||(39664508-39664629)
chr3 (473-593)||(21569069-21569189)
chr3 (470-593)||(4757817-4757940)
chr3 (470-593)||(39664187-39664310)
chr3 (472-593)||(5900747-5900868)
chr3 (472-589)||(21969634-21969751)
chr3 (472-589)||(21992070-21992187)
chr3 (473-593)||(54107908-54108028)
chr3 (470-589)||(1994496-1994615)
chr3 (470-593)||(18464780-18464903)
chr3 (467-590)||(22201616-22201739)
chr3 (470-593)||(22201940-22202063)
chr3 (470-593)||(24428891-24429014)
chr3 (470-593)||(26318185-26318308)
chr3 (470-593)||(29818501-29818624)
chr3 (470-593)||(42592108-42592231)
chr3 (470-593)||(44317539-44317662)
chr3 (470-593)||(54752487-54752610)
chr3 (471-593)||(11256427-11256549)
chr3 (467-593)||(12203875-12204001)
chr3 (470-591)||(16931932-16932053)
chr3 (472-593)||(21568751-21568872)
chr3 (472-593)||(39241363-39241484)
chr3 (472-593)||(42591789-42591910)
chr3 (472-593)||(45306837-45306958)
chr3 (470-593)||(1994172-1994295)
chr3 (470-593)||(1999331-1999454)
chr3 (478-593)||(4773566-4773681)
chr3 (470-593)||(13866023-13866146)
chr3 (470-593)||(27801813-27801936)
chr3 (470-593)||(49528152-49528275)
chr3 (470-593)||(51509122-51509245)
chr3 (478-593)||(53716305-53716420)
chr3 (467-593)||(47303340-47303466)
chr3 (472-593)||(12791500-12791621)
chr3 (472-593)||(15986240-15986361)
chr3 (472-593)||(32633389-32633510)
chr3 (472-593)||(44893745-44893866)
chr3 (472-593)||(54108226-54108347)
chr3 (470-593)||(47669583-47669706)
chr3 (470-593)||(53716617-53716740)
chr3 (480-593)||(7681447-7681561)
chr3 (470-584)||(15986567-15986681)
chr3 (470-593)||(22152169-22152294)
chr3 (479-593)||(27801501-27801615)
chr3 (472-593)||(18464461-18464582)
chr3 (472-589)||(22151850-22151967)
chr3 (472-593)||(24428572-24428693)
chr3 (472-593)||(46152620-46152741)
chr3 (470-593)||(5900426-5900549)
chr3 (472-593)||(16931611-16931732)
chr3 (467-593)||(41835250-41835376)
chr3 (472-593)||(54752168-54752289)
chr3 (470-578)||(28985512-28985620)
chr3 (470-593)||(4757497-4757620)
chr3 (470-593)||(11256106-11256229)
chr3 (467-584)||(15790679-15790796)
chr3 (472-593)||(28986466-28986586)
chr3 (486-593)||(8473865-8473972)
chr3 (470-589)||(12203554-12203673)
chr3 (470-593)||(47303022-47303145)
chr3 (470-593)||(21969953-21970078)
chr3 (470-593)||(21992389-21992514)
chr3 (502-592)||(41834961-41835051)
chr3 (480-585)||(7163463-7163568)
chr3 (467-593)||(51509443-51509567)
chr3 (470-582)||(30681752-30681864)
chr3 (470-576)||(19883581-19883686)
chr3 (472-593)||(39951362-39951483)
chr3 (479-589)||(15791434-15791542)
chr3 (470-593)||(20963549-20963672)
chr3 (470-586)||(30681032-30681148)
chr3 (534-593)||(39241682-39241741)
chr3 (519-593)||(46152937-46153008)
chr3 (472-553)||(42853251-42853331)
chr3 (522-588)||(39951682-39951748)
chr3 (479-589)||(44316639-44316748)
chr3 (479-589)||(49529084-49529194)
chr3 (491-548)||(43839984-43840041)
chr3 (479-568)||(43844384-43844473)
chr3 (545-593)||(32633143-32633191)
chr3 (479-589)||(13866928-13867038)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (470-593)||(21515-21638)
scaffold0115 (470-593)||(22477-22600)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (472-593)||(6356770-6356891)
chr7 (472-593)||(10526316-10526437)
chr7 (470-589)||(21391193-21391312)
chr7 (472-593)||(19681819-19681940)
chr7 (472-593)||(44332843-44332964)
chr7 (470-593)||(4155601-4155724)
chr7 (470-593)||(6356609-6356732)
chr7 (470-593)||(48626066-48626189)
chr7 (472-593)||(48626387-48626508)
chr7 (470-590)||(36673978-36674098)
chr7 (470-593)||(10526634-10526757)
chr7 (479-593)||(33716600-33716714)
chr7 (467-593)||(41453329-41453455)
chr7 (468-593)||(31637944-31638069)
chr7 (472-593)||(35147013-35147134)
chr7 (485-593)||(36423693-36423801)
chr7 (470-593)||(17749938-17750061)
chr7 (470-593)||(35146702-35146825)
chr7 (470-593)||(41453008-41453131)
chr7 (467-593)||(6356286-6356412)
chr7 (467-593)||(7909287-7909412)
chr7 (472-593)||(1114059-1114180)
chr7 (472-593)||(8542504-8542625)
chr7 (472-593)||(16867712-16867833)
chr7 (472-593)||(34037235-34037356)
chr7 (472-593)||(41192009-41192130)
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chr7 (470-593)||(31075517-31075640)
chr7 (479-593)||(8937173-8937287)
chr7 (472-593)||(4931597-4931718)
chr7 (472-593)||(21391514-21391635)
chr7 (472-593)||(31638267-31638388)
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chr7 (470-593)||(28286120-28286243)
chr7 (470-587)||(8542828-8542945)
chr7 (472-593)||(28286441-28286562)
chr7 (472-592)||(7579197-7579317)
chr7 (470-593)||(6357089-6357212)
chr7 (470-593)||(8936852-8936975)
chr7 (491-593)||(17359205-17359307)
chr7 (472-593)||(41751655-41751776)
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chr7 (472-589)||(36282791-36282908)
chr7 (472-589)||(41891971-41892088)
chr7 (489-589)||(28298147-28298247)
chr7 (486-593)||(7909490-7909597)
chr7 (470-593)||(41191686-41191808)
chr7 (479-593)||(43247427-43247542)
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chr7 (470-553)||(29276878-29276961)
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chr7 (472-527)||(36423790-36423845)
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chr7 (544-593)||(40673329-40673378)
chr7 (472-593)||(28263501-28263622)
chr7 (477-593)||(28264612-28264728)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (470-593)||(32753497-32753620)
chr6 (467-593)||(5937813-5937939)
chr6 (470-593)||(35167493-35167616)
chr6 (472-593)||(6235926-6236047)
chr6 (470-593)||(2517326-2517449)
chr6 (470-593)||(6137701-6137824)
chr6 (474-593)||(18053277-18053396)
chr6 (467-593)||(34994380-34994506)
chr6 (472-593)||(9046091-9046212)
chr6 (472-593)||(26600362-26600483)
chr6 (472-593)||(32753182-32753303)
chr6 (470-593)||(978418-978541)
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chr6 (470-593)||(21856558-21856681)
chr6 (478-593)||(34890968-34891083)
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chr6 (470-592)||(9046411-9046533)
chr6 (467-593)||(14276399-14276525)
chr6 (467-593)||(31237746-31237872)
chr6 (472-593)||(21856879-21857000)
chr6 (474-593)||(5311150-5311269)
chr6 (470-593)||(25176666-25176789)
chr6 (470-593)||(26957285-26957408)
chr6 (479-593)||(32993339-32993453)
chr6 (472-593)||(5310831-5310952)
chr6 (472-593)||(5938137-5938258)
chr6 (470-593)||(3423173-3423296)
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chr6 (470-593)||(6532195-6532318)
chr6 (470-593)||(17244667-17244790)
chr6 (467-593)||(5639497-5639623)
chr6 (479-593)||(21540301-21540415)
chr6 (467-593)||(31247116-31247242)
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chr6 (472-593)||(18052961-18053082)
chr6 (470-593)||(32993018-32993141)
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chr6 (472-593)||(34994704-34994825)
chr6 (470-593)||(31247440-31247563)
chr6 (470-593)||(6236245-6236368)
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chr6 (479-593)||(26600671-26600785)
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chr6 (472-568)||(34517277-34517373)
chr6 (470-593)||(24744645-24744767)
chr6 (472-539)||(35167833-35167900)
chr6 (472-546)||(25180219-25180293)
chr6 (521-593)||(3423494-3423566)
chr6 (470-585)||(27829297-27829411)
chr6 (520-579)||(3035933-3035992)
chr6 (542-593)||(25176981-25177032)
chr6 (472-571)||(34251559-34251656)
chr6 (472-589)||(6229651-6229767)
chr6 (517-593)||(7270679-7270755)
chr6 (479-589)||(17245588-17245698)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (467-593)||(1651895-1652021)
chr8 (467-593)||(1740271-1740397)
chr8 (472-593)||(15048404-15048525)
chr8 (472-593)||(27473395-27473516)
chr8 (472-593)||(33296008-33296129)
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chr8 (471-593)||(1739952-1740074)
chr8 (467-593)||(11173958-11174084)
chr8 (472-593)||(1432136-1432257)
chr8 (472-593)||(1869939-1870059)
chr8 (472-593)||(7535157-7535278)
chr8 (472-593)||(45276920-45277041)
chr8 (470-593)||(1646504-1646627)
chr8 (470-593)||(5434903-5435026)
chr8 (467-593)||(7949412-7949538)
chr8 (472-593)||(33819790-33819911)
chr8 (470-593)||(1646830-1646953)
chr8 (470-593)||(1870259-1870382)
chr8 (472-589)||(22763261-22763378)
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chr5 (472-593)||(32288400-32288521)
chr5 (472-593)||(36440524-36440645)
chr5 (469-593)||(25182977-25183101)
chr5 (470-593)||(32288081-32288204)
chr5 (470-593)||(35569778-35569901)
chr5 (486-593)||(9989647-9989754)
chr5 (470-576)||(1140106-1140212)
chr5 (472-593)||(24040411-24040532)
chr5 (470-587)||(27185877-27185994)
chr5 (479-590)||(2182955-2183066)
chr5 (488-593)||(2183267-2183372)
chr5 (472-593)||(39325679-39325800)
chr5 (479-593)||(35570104-35570218)
chr5 (479-593)||(11315970-11316084)
chr5 (495-585)||(11316286-11316376)
chr5 (472-593)||(25567312-25567433)
chr5 (486-593)||(29198971-29199078)
chr5 (467-589)||(31756630-31756752)
chr5 (470-536)||(19128434-19128500)
chr5 (518-584)||(34264413-34264479)
chr5 (479-593)||(34264672-34264790)
chr5 (472-542)||(33817659-33817729)
chr5 (472-589)||(19185512-19185629)
chr5 (470-506)||(34264354-34264390)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
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[»] scaffold0182 (2 HSPs)
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[»] scaffold0019 (2 HSPs)
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[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (480-593)||(45769-45882)
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[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (470-593)||(20754-20877)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
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scaffold0340 (470-593)||(18597-18720)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
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[»] scaffold0186 (2 HSPs)
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[»] scaffold0003 (4 HSPs)
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scaffold0003 (479-593)||(113405-113519)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (470-593)||(15772-15895)
scaffold0072 (472-589)||(15458-15575)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (469-593)||(6319-6440)
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[»] scaffold0225 (2 HSPs)
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[»] scaffold0260 (1 HSPs)
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[»] scaffold0001 (2 HSPs)
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scaffold0001 (517-589)||(147168-147240)
[»] scaffold0526 (2 HSPs)
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scaffold0526 (472-500)||(4084-4112)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37749062 - 37748628
Alignment:
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    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37749062 tttgattcatttctatatatttctatccttatccttcttccatagaaaattggggtgatataaaatattttctgaagggtagttttattttatttatgga 37748963  T
Q  101 taaagcgtaaatttggaatacactgttgtgtgattattttaaagccacgttaaatttcttgtattggagataacaatgagggttttccatcttttcaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37748962 taaagcgtaaatttggaatacactgttgtgtgattattttaaagccacgttaaattgcttgtattggagataacaatgagggttttccatcttttcaact 37748863  T
Q  201 taataataattcattgaatttcatgttacgttgtttcacacaaactataaataatactcctaataataataaattactcttttttcaggcaatataattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37748862 taataataattcattgaatttcatgttacgttgtttcacacaaactataaataatactcctaataataataaattactcttttttcaggcaatataattt 37748763  T
Q  301 tgtcttaaaaattgagaatgatgcacatagtattaattagacaatataattgtnnnnnnnnttaatactaaattaaaaatgacaatagtctagcacaaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37748762 tgtcttaaaaattgagaatgatgcacatagtattaattagacaatataattgtaaaaaaaattaatactaaattaaaaatgacaatagtctagcacaaac 37748663  T
Q  401 tcgaaacatcgcaattgtgtgtgatttttaagaag 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37748662 tcggaacatcgcaattgtgtgtgatttttaagaag 37748628  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 10505948 - 10506074
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10505948 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatt 10506047  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10506048 actacatttagtcctttctgttagttt 10506074  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44894190 - 44894064
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44894190 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggacctctaagtttctcaccgtt 44894091  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44894090 actacatttagtcttttatgttagttt 44894064  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 47669264 - 47669385
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47669264 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 47669363  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47669364 atttagtcctttctgttagttt 47669385  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 4773246 - 4773369
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4773246 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 4773345  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||| |||||||||    
T  4773346 atatttagtcctttttgttagttt 4773369  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 45307139 - 45307016
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45307139 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 45307040  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  45307039 acatttagtcatttttgttagttt 45307016  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8474296 - 8474170
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8474296 ggttaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatgaccgtt 8474197  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8474196 actacatttagtcctttctgttagttt 8474170  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 29818177 - 29818303
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  29818177 ggttaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaaataaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 29818276  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  29818277 actacatttagtcctttctgttagttt 29818303  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10506393 - 10506272
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10506393 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 10506294  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10506293 atttagtcctttctgttagttt 10506272  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26318627 - 26318506
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26318627 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttactac 26318528  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  26318527 atttagtcttttctgttagttt 26318506  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 39664629 - 39664508
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39664629 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 39664530  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  39664529 atttagtcttttctgttagttt 39664508  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 473 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21569189 - 21569069
Alignment:
Q  473 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactaca 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21569189 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactaca 21569090  T
Q  573 tttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  21569089 tttagtcttttctgttagttt 21569069  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4757940 - 4757817
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4757940 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 4757841  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4757840 acatttagtcctttctgttagttt 4757817  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 39664187 - 39664310
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39664187 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 39664286  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  39664287 acatttagtcatttctgttagttt 39664310  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5900868 - 5900747
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5900868 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 5900769  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5900768 atttagtcctttctgttagttt 5900747  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 21969634 - 21969751
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21969634 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21969733  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||| |||||    
T  21969734 atttagtcctttttgtta 21969751  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 21992070 - 21992187
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21992070 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21992169  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||| |||||    
T  21992170 atttagtcctttttgtta 21992187  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 473 - 593
Target Start/End: Original strand, 54107908 - 54108028
Alignment:
Q  473 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactaca 572  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54107908 attacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactaca 54108007  T
Q  573 tttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  54108008 tttagtcatttctgttagttt 54108028  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1994615 - 1994496
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1994615 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 1994516  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1994515 acatttagtcctttctgtta 1994496  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18464903 - 18464780
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464903 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 18464804  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  18464803 acatttagtcatttctattagttt 18464780  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 467 - 590
Target Start/End: Original strand, 22201616 - 22201739
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22201616 ggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaaataaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgtt 22201715  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttag 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22201716 actacatttagtcctttctgttag 22201739  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22202063 - 22201940
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22202063 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggttact 22201964  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  22201963 acatttaatcatttctgttagttt 22201940  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24429014 - 24428891
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24429014 ttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 24428915  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  24428914 acatttagtcttttatgttagttt 24428891  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 26318185 - 26318308
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26318185 ttaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 26318284  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  26318285 acatttagtcatttctgttagttt 26318308  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 29818624 - 29818501
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29818624 ttaattacctttttgatcttctaattatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 29818525  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29818524 acatttagtcctttctgttagttt 29818501  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 42592231 - 42592108
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42592231 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttact 42592132  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42592131 acatttagtcctttctgttagttt 42592108  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44317662 - 44317539
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44317662 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttact 44317563  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  44317562 atatttcgtcctttctgttagttt 44317539  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 54752610 - 54752487
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  54752610 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttact 54752511  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  54752510 acatttagtcctttctgttagttt 54752487  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11256549 - 11256427
Alignment:
Q  471 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11256549 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttacta 11256450  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  11256449 aatttagtcctttttgttagttt 11256427  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12204001 - 12203875
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12204001 ggttaaattaccgttttggtcccctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 12203902  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12203901 actacatttagtcctttctgatagttt 12203875  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 470 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 16932053 - 16931932
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16932053 ttaattacctttttggtcctctaactttttaattggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttact 16931954  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagt 591  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  16931953 acatttagtcttttctgttagt 16931932  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 21568751 - 21568872
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21568751 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 21568850  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  21568851 atttagtcatttctgttagttt 21568872  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 39241363 - 39241484
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39241363 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 39241462  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  39241463 atttagtcatttctgttagttt 39241484  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 42591789 - 42591910
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  42591789 aattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgttactac 42591888  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42591889 atttagtcctttctgttagttt 42591910  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 45306837 - 45306958
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  45306837 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 45306936  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45306937 atttagtcctttctgttagttt 45306958  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 1994172 - 1994295
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  1994172 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttgct 1994271  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1994272 acatttagtcctttctgttagttt 1994295  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 1999331 - 1999454
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  1999331 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttgct 1999430  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1999431 acatttagtcctttctgttagttt 1999454  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4773681 - 4773566
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4773681 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgttactacatttag 4773582  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    |||||| |||||||||    
T  4773581 tcctttatgttagttt 4773566  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 13866023 - 13866146
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13866023 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgttact 13866122  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  13866123 atatttcgtcctttctgttagttt 13866146  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27801936 - 27801813
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27801936 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaattaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 27801837  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27801836 acatttagtcctttctgttagttt 27801813  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 49528152 - 49528275
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49528152 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctagctaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttact 49528251  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  49528252 atatttcgtcctttctgttagttt 49528275  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 51509122 - 51509245
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  51509122 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttcct 51509221  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  51509222 acatttagtcctttatgttagttt 51509245  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Original strand, 53716305 - 53716420
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  53716305 cttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactatatttgg 53716404  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||    
T  53716405 tcctttctgttagttt 53716420  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 47303466 - 47303340
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  47303466 ggtttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaagtaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcaccgtt 47303367  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47303366 actacatttagtcatttctgttagttt 47303340  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12791621 - 12791500
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12791621 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcaccgttactac 12791522  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  12791521 atttagtcttttctgttagttt 12791500  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 15986240 - 15986361
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15986240 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcccctagctaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactgc 15986339  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15986340 atttagtcctttctgttagttt 15986361  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 32633510 - 32633389
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32633510 aattatctttttggtcctctaactatttaattgttatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 32633411  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  32633410 atttagtcctttatgttagttt 32633389  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 44893745 - 44893866
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44893745 aattatctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 44893844  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  44893845 atttagtcatttctgttagttt 44893866  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 54108347 - 54108226
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  54108347 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcagtgttattac 54108248  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  54108247 atttagtcatttctgttagttt 54108226  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 47669706 - 47669583
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47669706 ttaattatctttttggtcctctaactatttatttggtatcggattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 47669607  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  47669606 acatttagtccttactgttagttt 47669583  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 53716740 - 53716617
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  53716740 ttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcatcattact 53716641  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  53716640 acatttagtcatttatgttagttt 53716617  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 480 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7681561 - 7681447
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7681561 ttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacattcagt 7681462  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  7681461 cctttctgttagttt 7681447  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 470 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 15986681 - 15986567
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15986681 ttaattaactttttggtcctctaattatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 15986582  T
Q  570 acatttagtcctttc 584  Q
    |||||||||||||||    
T  15986581 acatttagtcctttc 15986567  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22152294 - 22152169
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactat--ttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  22152294 ttaattacctttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctgagtttctcactgtta 22152195  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  22152194 ctacatttagtcgtttctgttagttt 22152169  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 27801501 - 27801615
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |    
T  27801501 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactagatttatt 27801600  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  27801601 cctttctgttagttt 27801615  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 18464461 - 18464582
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18464461 aattacatttttgctcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 18464560  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18464561 atttagtcctttatgttagttt 18464582  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 22151850 - 22151967
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  22151850 aattacatttttggtcctataactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttactac 22151949  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22151950 atttagtcctttttgtta 22151967  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 24428572 - 24428693
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  24428572 aattatctttttggtcctctaactattcaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactac 24428671  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  24428672 atttagtcatttctattagttt 24428693  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 46152620 - 46152741
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  46152620 aattacatctttggtcctctaactatttaattggcatcgaattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatcactac 46152719  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46152720 atttagtcctttctgttagttt 46152741  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 5900426 - 5900549
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5900426 ttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 5900525  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  5900526 acatttagtcatttctattagttt 5900549  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 16931611 - 16931732
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaatt-ggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16931611 aattacatttttggtcctctaactatttaatttggta-cggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttacta 16931709  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16931710 catttagtcctttctgttagttt 16931732  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41835376 - 41835250
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41835376 ggttaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatattgaattagttctttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 41835277  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41835276 actacatttagtcctttctattagttt 41835250  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 54752168 - 54752289
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  54752168 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtataagattggtcctgtaactaaaaattgatttatttcggtcatataagtttctcaccgttactac 54752267  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  54752268 atttgatcctttctgttagttt 54752289  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 578
Target Start/End: Original strand, 28985512 - 28985620
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  28985512 ttaattacccttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttatt 28985611  T
Q  570 acatttagt 578  Q
    |||||||||    
T  28985612 acatttagt 28985620  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 4757497 - 4757620
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4757497 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggaatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccattact 4757596  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  4757597 acatttattcttttctgttagttt 4757620  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 11256106 - 11256229
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  11256106 ttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaaataatttatttcgatcctttaagtttctcatcgttact 11256205  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  11256206 acatttagtcctttttgatagttt 11256229  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 584
Target Start/End: Original strand, 15790679 - 15790796
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  15790679 ggttaaattatctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttccatcccttaagtttctcaccgtt 15790778  T
Q  567 actacatttagtcctttc 584  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15790779 actacatttagtcctttc 15790796  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28986586 - 28986466
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  28986586 aattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta- 28986488  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  28986487 atttagtcatttctattagttt 28986466  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 486 - 593
Target Start/End: Original strand, 8473865 - 8473972
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  8473865 tcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcactgttactacatttagtcatttct 8473964  T
Q  586 gttagttt 593  Q
    ||||||||    
T  8473965 gttagttt 8473972  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Original strand, 12203554 - 12203673
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12203554 ttaattaccttttttatcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattggtatatttcggtcctctaagtttctcactgttact 12203653  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  12203654 acatttagtcttttctgtta 12203673  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 47303022 - 47303145
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47303022 ttaattacttttttgatcatctaactatttaattggtattgaatcagtcctctaattaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 47303121  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  47303122 acatttagtcatttctgttagttt 47303145  T

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Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21970078 - 21969953
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactat--ttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  21970078 ttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgtta 21969979  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  21969978 ctacatttagtcatttctgttagttt 21969953  T

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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21992514 - 21992389
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactat--ttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  21992514 ttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgtta 21992415  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  21992414 ctacatttagtcatttctgttagttt 21992389  T

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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 502 - 592
Target Start/End: Original strand, 41834961 - 41835051
Alignment:
Q  502 ttggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagtt 592  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41834961 ttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttaatcctttctgttagtt 41835051  T

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Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 480 - 585
Target Start/End: Original strand, 7163463 - 7163568
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtc 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7163463 ttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactacatttagtc 7163562  T
Q  580 ctttct 585  Q
    ||||||    
T  7163563 ctttct 7163568  T

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Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 51509567 - 51509443
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  51509567 ggttaaattacatttttg-tcctccaactatttaattggtattggattagtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtt 51509470  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51509469 actacatttagtcttttctgttagttt 51509443  T

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Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 30681864 - 30681752
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  30681864 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtaacagtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgttacc 30681765  T
Q  570 acatttagtcctt 582  Q
    | |||| ||||||    
T  30681764 atatttcgtcctt 30681752  T

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Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 470 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 19883686 - 19883581
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19883686 ttaattaccttttta-tcctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcacagttact 19883588  T
Q  570 acattta 576  Q
    |||||||    
T  19883587 acattta 19883581  T

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Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 39951362 - 39951483
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||     
T  39951362 aattacccttttgatcatctgactatttaattggtatcggattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcatcgttactat 39951461  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  39951462 atttagttctttatgttagttt 39951483  T

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Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15791542 - 15791434
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac---attt 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15791542 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggat-----ctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactacaatattt 15791448  T
Q  576 agtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||| ||||    
T  15791447 agtcctttccgtta 15791434  T

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Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 20963672 - 20963549
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||    
T  20963672 ttaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctctgttact 20963573  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
     | |||||||||||| ||||||||    
T  20963572 tcttttagtcctttccgttagttt 20963549  T

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Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 586
Target Start/End: Original strand, 30681032 - 30681148
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||  | |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  30681032 ttaattacatttttggtcatctaactatttaattggtaacggtttggttctctaactaaaaaaatatttattttggtcctctaactttatcaccgttacc 30681131  T
Q  570 acatttagtcctttctg 586  Q
    | |||| ||||||||||    
T  30681132 atatttcgtcctttctg 30681148  T

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Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 534 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 39241741 - 39241682
Alignment:
Q  534 gatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241741 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttt 39241682  T

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Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 519 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 46153008 - 46152937
Alignment:
Q  519 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46153008 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcac---tactacatttagtcatttatgttagttt 46152937  T

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Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Original strand, 42853251 - 42853331
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42853251 aattacctttttggtc-tctatctatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatgtgggtcctctaa 42853331  T

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Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 522 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 39951748 - 39951682
Alignment:
Q  522 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39951748 taactaaaaattgatttatttcaattctctaagtttttcaacgttattacatttagtcatttctgtt 39951682  T

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Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Original strand, 44316639 - 44316748
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||||||| ||||||    
T  44316639 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgatttattt-ggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 44316737  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    |||||| ||||    
T  44316738 cctttccgtta 44316748  T

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Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 49529194 - 49529084
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||||||| ||||||    
T  49529194 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 49529095  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    |||||| ||||    
T  49529094 cctttccgtta 49529084  T

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Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 548
Target Start/End: Original strand, 43839984 - 43840041
Alignment:
Q  491 taactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 548  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43839984 taactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcc 43840041  T

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Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 479 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 43844473 - 43844384
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| || |||||||    
T  43844473 tttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctctccgttac 43844384  T

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Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 593
Target Start/End: Original strand, 32633143 - 32633191
Alignment:
Q  545 gtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32633143 gtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttt 32633191  T

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Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 13867038 - 13866928
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||||||| |||| |    
T  13867038 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctcagttactacttttaat 13866939  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    |||||| ||||    
T  13866938 cctttccgtta 13866928  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 21515 - 21638
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21515 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 21614  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  21615 acatttagtcctttttgttagttt 21638  T

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Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22600 - 22477
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  22600 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactattact 22501  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22500 acatttagtcctttctgttagttt 22477  T

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Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 6356770 - 6356891
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6356770 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 6356869  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6356870 atttagtcctttctgttagttt 6356891  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 10526316 - 10526437
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10526316 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 10526415  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10526416 atttagtcctttctgttagttt 10526437  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Original strand, 21391193 - 21391312
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21391193 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgctact 21391292  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21391293 acatttagtcttttctgtta 21391312  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19681940 - 19681819
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19681940 aattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 19681841  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  19681840 atttagtcatttctcttagttt 19681819  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44332964 - 44332843
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44332964 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 44332865  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44332864 atttagtcctttctgttagttt 44332843  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 4155601 - 4155724
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4155601 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttact 4155700  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  4155701 atatttcgtcctttctgttagttt 4155724  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6356732 - 6356609
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6356732 ttaattacctttttggtcctataactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 6356633  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6356632 acatttagtcctttctgttagttt 6356609  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 48626066 - 48626189
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48626066 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 48626165  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  48626166 acatttagtcctttctgttagttt 48626189  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 48626508 - 48626387
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  48626508 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctgaccgttgctac 48626409  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48626408 atttagtcctttctgttagttt 48626387  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 590
Target Start/End: Original strand, 36673978 - 36674098
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36673978 ttaattacctttatggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 36674077  T
Q  570 acatttagtcctttctgttag 590  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36674078 acatttagtcctttctgttag 36674098  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10526757 - 10526634
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10526757 ttaattatcttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 10526658  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  10526657 acatttagtcatttctgttagttt 10526634  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 33716600 - 33716714
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33716600 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 33716699  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||    
T  33716700 catttctgttagttt 33716714  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41453455 - 41453329
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41453455 ggttaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 41453356  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41453355 actacatttagtcatttctgttagttt 41453329  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 468 - 593
Target Start/End: Original strand, 31637944 - 31638069
Alignment:
Q  468 gtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  31637944 gtttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgaaccactaagtttctcaccgtta 31638043  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  31638044 ctacatttagtcatttctgttagttt 31638069  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 35147134 - 35147013
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35147134 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 35147035  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35147034 atttagtcctttctgttagttt 35147013  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 485 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 36423801 - 36423693
Alignment:
Q  485 gtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36423801 gtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtcctttc 36423702  T
Q  585 tgttagttt 593  Q
    |||||||||    
T  36423701 tgttagttt 36423693  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 17749938 - 17750061
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17749938 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 17750037  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  17750038 acatttagtcatttatgttagttt 17750061  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 35146702 - 35146825
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35146702 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 35146801  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  35146802 acatttagtcatttctgttagttt 35146825  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 41453008 - 41453131
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41453008 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 41453107  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  41453108 acatttagtcatttctgttagttt 41453131  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 6356286 - 6356412
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6356286 ggtttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttaccgtt 6356385  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6356386 actacatttagtcatttttgttagttt 6356412  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 7909287 - 7909412
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7909287 ggtttaattacttttttg-tcctttaactatttaattggtatcagattggttttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 7909385  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7909386 actacatttagtcctttctgttagttt 7909412  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 1114059 - 1114180
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||     
T  1114059 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacacagttactaa 1114158  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1114159 atttagtcctttctgttagttt 1114180  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 8542504 - 8542625
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8542504 aattacctttttcgtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgttactac 8542603  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8542604 atttagtcctttctgttagttt 8542625  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 16867712 - 16867833
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||    
T  16867712 aattacctttttggtcctctaactatataattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttcttactgttactac 16867811  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16867812 atttagtcatttctgttagttt 16867833  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34037356 - 34037235
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34037356 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatatgattagtcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatctccgttactgc 34037257  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  34037256 atttagtcctttttgttagttt 34037235  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41192130 - 41192009
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41192130 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactac 41192031  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  41192030 atttagtcttttctgttagttt 41192009  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 19681498 - 19681621
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19681498 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttgccgttact 19681597  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  19681598 acatttattcctttctgttagttt 19681621  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31075640 - 31075517
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31075640 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 31075541  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  31075540 acatttagtcctttctgtttgttt 31075517  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8937287 - 8937173
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8937287 tttttggtcctctaactatttaattagtatcagatttgtcctctaattaaaagttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 8937188  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  8937187 cctttctgttagttt 8937173  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4931718 - 4931597
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4931718 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgaattatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 4931619  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4931618 attcagtcctttctgttagttt 4931597  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21391635 - 21391514
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  21391635 aattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactac 21391536  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21391535 atttagtcctttctgttagttt 21391514  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31638388 - 31638267
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  31638388 aattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttctcatcgttactac 31638289  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  31638288 atttagtcctttctattagttt 31638267  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 472 - 584
Target Start/End: Original strand, 8416490 - 8416602
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  8416490 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgttactac 8416589  T
Q  572 atttagtcctttc 584  Q
    |||||||| ||||    
T  8416590 atttagtcatttc 8416602  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1114492 - 1114369
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1114492 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 1114393  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  1114392 acatttactcttttctgttagttt 1114369  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 7578875 - 7578998
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  7578875 ttaattacttttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaatgttact 7578974  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  7578975 tcatttagtcatttctgttagttt 7578998  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 28286120 - 28286243
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  28286120 ttaattatatttttggtcttctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatcgttact 28286219  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  28286220 acatttagtcatttctgttagttt 28286243  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8542945 - 8542828
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||    
T  8542945 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtgact 8542846  T
Q  570 acatttagtcctttctgt 587  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  8542845 acatttaatcctttctgt 8542828  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28286562 - 28286441
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28286562 aattacatttttggtcctctaactttttaattggtatcggattagtcctttaactaaaaattgattgatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 28286463  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  28286462 atttagttctttatattagttt 28286441  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 7579317 - 7579197
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  7579317 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcatctaattttctcaccgttactac 7579218  T
Q  572 atttagtcctttctgttagtt 592  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  7579217 atttagtcctttattttagtt 7579197  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6357212 - 6357089
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6357212 ttaattacatttttgatcctctaattatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacagttact 6357113  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  6357112 acatttagtcatttctgttagttt 6357089  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 8936852 - 8936975
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  8936852 ttaattatctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacttttact 8936951  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  8936952 acatttagtcatttctgttagttt 8936975  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 491 - 593
Target Start/End: Original strand, 17359205 - 17359307
Alignment:
Q  491 taactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttag 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17359205 taactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttag 17359304  T
Q  591 ttt 593  Q
    |||    
T  17359305 ttt 17359307  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 41751655 - 41751776
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41751655 aattatctttttggtcctttaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgacttatttcggtcctctaagtttctaaccgttactac 41751754  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  41751755 atttaatcctttttgttagttt 41751776  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 488 - 593
Target Start/End: Original strand, 28297840 - 28297945
Alignment:
Q  488 ctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgt 587  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28297840 ctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagttctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttctgt 28297939  T
Q  588 tagttt 593  Q
    ||||||    
T  28297940 tagttt 28297945  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 36282791 - 36282908
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  36282791 aattacatttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactac 36282890  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||| ||| |||| ||||    
T  36282891 atttggtcttttccgtta 36282908  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 41891971 - 41892088
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | |  ||||||||    
T  41891971 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttctttcggtcccttaagtttcttaatgttactac 41892070  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41892071 atttagtcctttctgtta 41892088  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 489 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28298247 - 28298147
Alignment:
Q  489 tctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28298247 tctaactatttaattggtatcagatttaccctctaattaaaaattgatttatttcgattctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 28298148  T
Q  589 a 589  Q
    |    
T  28298147 a 28298147  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7909597 - 7909490
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7909597 tcctctaactatttaattgatattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttagtacatttagtcatttct 7909498  T
Q  586 gttagttt 593  Q
    ||||||||    
T  7909497 gttagttt 7909490  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 41191686 - 41191808
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  41191686 ttaattaccttttta-tcctctaactatttagttgatattggattggtcctctaactaaaaattggtttatttcagttctctaagtttctcaccgttact 41191784  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41191785 acatttagtcctttctgttagttt 41191808  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 43247427 - 43247542
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  43247427 ttttttgtcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactacatttact 43247526  T
Q  579 -cctttctgttagttt 593  Q
     ||||||| |||||||    
T  43247527 ccctttctattagttt 43247542  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 468 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 17363685 - 17363562
Alignment:
Q  468 gtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||    
T  17363685 gtttaattatatttttggttctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtt--tcaatgtta 17363588  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  17363587 ctacatttagtcatttctgttagttt 17363562  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29277790 - 29277671
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  29277790 ttaattacctttttggtcctctaactatttatttggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgttacc 29277691  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  29277690 atatttcgtcctttctgtta 29277671  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41752081 - 41751974
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| | ||||||| ||||||    
T  41752081 tcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctatctgttaccatatttagttctttct 41751982  T
Q  586 gttagttt 593  Q
    ||||||||    
T  41751981 gttagttt 41751974  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 491 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27739090 - 27738989
Alignment:
Q  491 taactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttag 590  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  27739090 taactatttatttggtatcagattgatcccctaactaaaaattgatttatttcggtccttttagtttctcaccgttactatatttaat-ctttctgttag 27738992  T
Q  591 ttt 593  Q
    |||    
T  27738991 ttt 27738989  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 8417381 - 8417285
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  8417381 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttctcaccgttac 8417285  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 467 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 36283656 - 36283533
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatta-atcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgt 565  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||| ||    
T  36283656 ggttaaattacattttttgttctctaactatttaattggtatcggatttgatcctctaactaaaaattgatttatttccgtcccttaaatttctcactgt 36283557  T
Q  566 tactacatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  36283556 tactacatttagtcatttttgtta 36283533  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 500 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 32946758 - 32946669
Alignment:
Q  500 aattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32946758 aattggtatcagattggtactctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttttcactgttagtacatttagtcctttctgtta 32946669  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 40673015 - 40673134
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||||  || || ||||||| |||  ||||||    
T  40673015 ttaattacatttttg-tcctctatctatttaattggtatc---ttgatcctctaactaaaatttaatttatttgagttctgtaagtttttcattgttact 40673110  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40673111 acatttagtcctttctgttagttt 40673134  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 593
Target Start/End: Original strand, 36423391 - 36423495
Alignment:
Q  489 tctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtt 588  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| | || ||| || |||||||||    
T  36423391 tctaactatttaattggcattagattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcactgttgccacttttggttctttctgtt 36423490  T
Q  589 agttt 593  Q
    |||||    
T  36423491 agttt 36423495  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36674174 - 36674095
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674174 aattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcgggttagtc--ttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 36674095  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 470 - 553
Target Start/End: Original strand, 29276878 - 29276961
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29276878 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 29276961  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41893513 - 41893403
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  41893513 ttttttgtcctttaactatttaattaatatcggattggtcatctaactaaaaatttatttatttcgattccttaagtttttcaccgttactacatttaat 41893414  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    | |||| ||||    
T  41893413 cttttccgtta 41893403  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 33717005 - 33716926
Alignment:
Q  495 tatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatt 574  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||    
T  33717005 tatttaattgatatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcggtcatttaagtttctcattgttactacatt 33716926  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 36423845 - 36423790
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaacta 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  36423845 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaacta 36423790  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 38447779 - 38447695
Alignment:
Q  469 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 557  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  38447779 tttaattatctttttggtcctctaactatttaattgatattagattgatcc----attaaaaattgatttatttcagtcccttaagttt 38447695  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 40673378 - 40673329
Alignment:
Q  544 ggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  40673378 ggtcctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttatgttagttt 40673329  T

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Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 28263501 - 28263622
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||| |  ||||||| ||    
T  28263501 aattacttttttgatcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtaccttaaatttcttcccgttaccac 28263600  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
     ||||||| |||| ||||||||    
T  28263601 ctttagtcgtttccgttagttt 28263622  T

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Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28264728 - 28264612
Alignment:
Q  477 cctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacattta 576  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  ||  || | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||   |||||||| ||||    
T  28264728 cctttttagtccattaactatttaattagtatcaatttggtcttttaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctctatgttactactttta 28264629  T
Q  577 gtcctttctgttagttt 593  Q
     |||||||  |||||||    
T  28264628 atcctttccattagttt 28264612  T

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Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 32753620 - 32753497
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32753620 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 32753521  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32753520 acatttagtcctttctgttagttt 32753497  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 5937813 - 5937939
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5937813 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgattctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 5937912  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5937913 actacatttagtcatttctgttagttt 5937939  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 35167493 - 35167616
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35167493 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 35167592  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  35167593 acatttagtcatttctgttagttt 35167616  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 6235926 - 6236047
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6235926 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctataattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactgc 6236025  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6236026 atttagtcctttctgttagttt 6236047  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2517449 - 2517326
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2517449 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 2517350  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  2517349 acatttaatcctttctgttagttt 2517326  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6137824 - 6137701
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6137824 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 6137725  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  6137724 acatttagtcctttttgttagttt 6137701  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 474 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18053396 - 18053277
Alignment:
Q  474 ttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacat 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18053396 ttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcaccgttactacat 18053297  T
Q  574 ttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18053296 ttagtcctttctattagttt 18053277  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 34994380 - 34994506
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34994380 ggtttaattacctttttggtcctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 34994479  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34994480 actatatttagtcctttctgttagttt 34994506  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 9046091 - 9046212
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9046091 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttgtcaccgttactac 9046190  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  9046191 atttagtcttttctgttagttt 9046212  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 26600362 - 26600483
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600362 aattatctttttggtcctctaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 26600461  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  26600462 atttagtcatttctgttagttt 26600483  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 32753182 - 32753303
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32753182 aattacatttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattac 32753281  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  32753282 atttagtcatttctgttagttt 32753303  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 978418 - 978541
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  978418 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 978517  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  978518 acatttagtcatttctgttagttt 978541  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7271076 - 7270953
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  7271076 ttaattgcctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcatcgttact 7270977  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  7270976 atatttagtcctttctattagttt 7270953  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15933003 - 15932880
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15933003 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 15932904  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15932903 acatttagtcctttctgttagttt 15932880  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 21856558 - 21856681
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21856558 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 21856657  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21856658 acatttagtcctttctgttagttt 21856681  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34891083 - 34890968
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34891083 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 34890984  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    || |||||||||||||    
T  34890983 tcttttctgttagttt 34890968  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 2517002 - 2517128
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  2517002 ggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgactgtt 2517101  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2517102 actacatttagtcttttctgttagttt 2517128  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 470 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 9046533 - 9046411
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  9046533 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccgctaagtttctcaccgctact 9046434  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagtt 592  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9046433 acatttagtcctttctgttagtt 9046411  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 14276399 - 14276525
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14276399 ggtttaattacctttttggtcctctacctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttacttcggtcctctaaatttctcaccgtt 14276498  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14276499 actacatttagtcctttgtattagttt 14276525  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 31237746 - 31237872
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31237746 ggttaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 31237845  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31237846 actacatttagtcatttctgttagttt 31237872  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21857000 - 21856879
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21857000 aattacctttttggtcctctaagtatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 21856901  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21856900 atttagtcctttctgttagttt 21856879  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 474 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5311269 - 5311150
Alignment:
Q  474 ttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacat 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  5311269 ttacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttactacat 5311170  T
Q  574 ttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  5311169 ttagtcctttatgttagttt 5311150  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 25176666 - 25176789
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  25176666 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattatggtcctctaagtttctcaccgttact 25176765  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25176766 acatttagtcctttctgttagttt 25176789  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26957408 - 26957285
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26957408 ttaattatctttttggtcatctaactatttaattggtattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttttcaccgttact 26957309  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26957308 acatttagtcctttctgttagttt 26957285  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 32993453 - 32993339
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32993453 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgtttctacatttagt 32993354  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  32993353 cctttctgttagttt 32993339  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 5310831 - 5310952
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  5310831 aattatctttttggtcctctaactatttaattgatatcagagtagtcctataactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactac 5310930  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5310931 atttagtcctttctgttagttt 5310952  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5938258 - 5938137
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  5938258 aattacctttttggtcatctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattactac 5938159  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5938158 atttagtcctttctgttagttt 5938137  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 3423173 - 3423296
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3423173 ttaattaccattttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 3423272  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  3423273 acatttagtcttttctattagttt 3423296  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 6137382 - 6137504
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6137382 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaat-gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 6137480  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  6137481 acatttagtcttttctgttagttt 6137504  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 6532195 - 6532318
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6532195 ttaattaccttttttgtcctctaactatttaatttgtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaaatttctcaccgttact 6532294  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  6532295 acatttagtgatttctgttagttt 6532318  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 17244667 - 17244790
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17244667 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttatt 17244766  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| ||| |||||||||||||    
T  17244767 atatttcgtcatttctgttagttt 17244790  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5639623 - 5639497
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5639623 ggttaaattacatttttgatcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttcttaccgtt 5639524  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5639523 actacatttagtcctttttgttagttt 5639497  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21540415 - 21540301
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  21540415 tttttggtcctttaactatttaattggtatcagattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactacatttaat 21540316  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||    
T  21540315 catttctgttagttt 21540301  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 31247116 - 31247242
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31247116 ggttaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtgttctaagtttctcaccgtt 31247215  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  31247216 actacatttaatcttttctgttagttt 31247242  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 24744334 - 24744454
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  24744334 aattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttcacaccgttactgc 24744432  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24744433 atttagtcatttctgttagttt 24744454  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 472 - 584
Target Start/End: Original strand, 7438809 - 7438921
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  7438809 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactac 7438908  T
Q  572 atttagtcctttc 584  Q
    ||||||| |||||    
T  7438909 atttagttctttc 7438921  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31238193 - 31238070
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31238193 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggt-ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcttaagtttttcaccgttac 31238095  T
Q  569 tacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  31238094 tacatttagtcatttctgttagttt 31238070  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 7269956 - 7270077
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7269956 aattacttttttaatcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcaccgttactac 7270055  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  7270056 atttagtcatttctgttagttt 7270077  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 18052961 - 18053082
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18052961 aattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 18053060  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  18053061 atttagtcatttatgttagttt 18053082  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 32993018 - 32993141
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  32993018 ttaattaccttcttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaagtaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattgttact 32993117  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  32993118 acatttggtcctttctgttagttt 32993141  T

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Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 34518137 - 34518020
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||    
T  34518137 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctcaaactaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcatcgttactac 34518038  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34518037 atttagtcctttccgtta 34518020  T

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Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 34890649 - 34890770
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||    
T  34890649 aattacctttttgttcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctcaaagtttctcactgttattac 34890748  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  34890749 atttagtcttttctgttagttt 34890770  T

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Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34994825 - 34994704
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  34994825 aattacctttttagtcatctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactgc 34994726  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  34994725 atttagtcttttatgttagttt 34994704  T

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Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31247563 - 31247440
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  31247563 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcagtcctcttaagtttttcaccgttac 31247464  T
Q  569 tacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  31247463 taca-ttagtcatttctgttagttt 31247440  T

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Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6236368 - 6236245
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  6236368 ttaattacttttttggtcccctaactatttaattgatatttgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaacagttact 6236269  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  6236268 aaatttaatcctttctgttagttt 6236245  T

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Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10412948 - 10412833
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10412948 ttaattatctttttggtcttttaactatttagttggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 10412849  T
Q  570 acatttagtcctttct 585  Q
    | |||||||| |||||    
T  10412848 atatttagtcatttct 10412833  T

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Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26600785 - 26600671
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26600785 ttttttgtcctctaactatttagttggtattggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 26600686  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||    
T  26600685 catttctgttagttt 26600671  T

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Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 6228733 - 6228855
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6228733 ttaattacctttttagtcctctaattatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcc-ctaagtttatcaccgttact 6228831  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| ||| |||||||| ||||    
T  6228832 atatttcgtcatttctgtttgttt 6228855  T

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Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29261389 - 29261279
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29261389 tttttagtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatgtcggtcccttaagtttctcactgttactacatttagt 29261290  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    |||||| ||||    
T  29261289 cctttccgtta 29261279  T

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Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 7270400 - 7270281
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  7270400 ttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcgaattgatcctctaactaaaaattaattttttttggttctctaaatttctcatcgttact 7270301  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  7270300 acatttagtcttttctgtta 7270281  T

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Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 29260536 - 29260652
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||    
T  29260536 aattacctttctggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctcaaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctca-cattactac 29260634  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  29260635 atttagtcatttccgtta 29260652  T

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Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 472 - 567
Target Start/End: Original strand, 15932735 - 15932830
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||    
T  15932735 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcatcgtta 15932830  T

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Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 467 - 589
Target Start/End: Original strand, 15286345 - 15286467
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  15286345 ggttaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctgactaaaaattgatttatttcaatcccttaagtttctcaccgtt 15286444  T
Q  567 actacatttagtcctttctgtta 589  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||    
T  15286445 actgcatttagtcatttccgtta 15286467  T

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Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 520 - 593
Target Start/End: Original strand, 26957015 - 26957088
Alignment:
Q  520 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26957015 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactacatttagtcctttatgttagttt 26957088  T

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Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Original strand, 34517277 - 34517373
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  34517277 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgttac 34517373  T

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Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24744767 - 24744645
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||| |||| |    
T  24744767 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatta-attggtcctctaactaaaaattgatttatttccattctttaagtttctcactgttatt 24744669  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  24744668 acatttagtcttttctattagttt 24744645  T

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Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35167900 - 35167833
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgattta 539  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35167900 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgattta 35167833  T

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Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 472 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25180293 - 25180219
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggt 546  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180293 aattacctttctggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 25180219  T

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Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 521 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 3423566 - 3423494
Alignment:
Q  521 ctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3423566 ctaattaaaaattggtttatttcggtcctctaattttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttt 3423494  T

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Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27829411 - 27829297
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  27829411 ttaattacctttt-ggtcctccaactatttaattggtaacagtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgttacc 27829313  T
Q  570 acatttagtcctttct 585  Q
    | |||| ||| |||||    
T  27829312 atatttcgtcatttct 27829297  T

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Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 579
Target Start/End: Original strand, 3035933 - 3035992
Alignment:
Q  520 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtc 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  3035933 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactacatttagtc 3035992  T

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Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 542 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25177032 - 25176981
Alignment:
Q  542 tcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25177032 tcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 25176981  T

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Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 472 - 571
Target Start/End: Original strand, 34251559 - 34251656
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34251559 aattacctttttaatcctctaattatttagttggtatcggattagtcctg--actaaaaattaatttatttcgatcctctaagtttctcatcgttactac 34251656  T

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Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6229767 - 6229651
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | ||||||||    
T  6229767 aattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcc-ctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactac 6229669  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
     |||||||||||| ||||    
T  6229668 ttttagtcctttccgtta 6229651  T

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Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 593
Target Start/End: Original strand, 7270679 - 7270755
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  7270679 tcctctaattaaaaattgatttattttgatcttttaagtttcttaccgttactatatttagtcttttttgttagttt 7270755  T

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Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17245698 - 17245588
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||||||| ||||||    
T  17245698 tttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 17245599  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    | |||| ||||    
T  17245598 cttttccgtta 17245588  T

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Target: chr8 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1652021 - 1651895
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1652021 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 1651922  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1651921 actacatttagtcctttttgttagttt 1651895  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1740397 - 1740271
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1740397 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 1740298  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1740297 actacatttagtcctttttgttagttt 1740271  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 15048404 - 15048525
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15048404 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttactac 15048503  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15048504 atttagtcctttctgttagttt 15048525  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27473516 - 27473395
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27473516 aattacctttttggtcctctaacaatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 27473417  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  27473416 atttagtcatttctgttagttt 27473395  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33296129 - 33296008
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33296129 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 33296030  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  33296029 atttagtcttttctgttagttt 33296008  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 473 - 593
Target Start/End: Original strand, 37569320 - 37569440
Alignment:
Q  473 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactaca 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37569320 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactaca 37569419  T
Q  573 tttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  37569420 tttagtcatttctgttagttt 37569440  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15048846 - 15048723
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Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15048846 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 15048747  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  15048746 acatttagtcatttctgttagttt 15048723  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34470991 - 34470868
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  34470991 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgttgct 34470892  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34470891 acatttagtcctttctgttagttt 34470868  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Original strand, 1739952 - 1740074
Alignment:
Q  471 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  1739952 taattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttatta 1740051  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1740052 catttagtcctttctgttagttt 1740074  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11174084 - 11173958
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11174084 ggttaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 11173985  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11173984 actacatttagtcttttatgttagttt 11173958  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 1432136 - 1432257
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1432136 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1432235  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  1432236 atttaatcatttctgttagttt 1432257  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 1869939 - 1870059
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1869939 aattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttctcaccgttactac 1870037  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1870038 atttagtcctttctgttagttt 1870059  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7535278 - 7535157
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7535278 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactac 7535179  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  7535178 atttaatcctttatgttagttt 7535157  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 45277041 - 45276920
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45277041 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 45276942  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  45276941 atttagtcttttctgttagttt 45276920  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 1646504 - 1646627
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1646504 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 1646603  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  1646604 atatttagtcatttctgttagttt 1646627  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 5434903 - 5435026
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5434903 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctacctaaaatttgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttact 5435002  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5435003 acatttagtcctttctgttagttt 5435026  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 7949412 - 7949538
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7949412 ggttaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 7949511  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7949512 actacatttagtcctttctgttagttt 7949538  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 33819790 - 33819911
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33819790 aattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 33819889  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  33819890 atttagtcatttctattagttt 33819911  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1646953 - 1646830
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1646953 ttaattacctttttcgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 1646854  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  1646853 acatttagtcctttttgttagttt 1646830  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1870382 - 1870259
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  1870382 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagatagatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaaagttact 1870283  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  1870282 acatttagtcatttctgttagttt 1870259  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22763378 - 22763261
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22763378 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactac 22763279  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  22763278 atttagtcttttccgtta 22763261  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 480 - 593
Target Start/End: Original strand, 38588600 - 38588713
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtc 579  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38588600 ttttcgtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtc 38588699  T
Q  580 ctttctgttagttt 593  Q
     |||||||||||||    
T  38588700 atttctgttagttt 38588713  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 468 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 40660335 - 40660210
Alignment:
Q  468 gtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40660335 gtttaattacctttttggtcctctaactatttagttgttatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 40660236  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40660235 ctatatttagtcttttctgttagttt 40660210  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15872066 - 15871945
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15872066 aattacatttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcctctaaataaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 15871967  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  15871966 atttagtcttttttgttagttt 15871945  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 45077648 - 45077527
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45077648 aattacctttttggtcctctaactatttgattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttactac 45077549  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  45077548 atttagtcatttctattagttt 45077527  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 467 - 595
Target Start/End: Original strand, 33295736 - 33295864
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  33295736 ggtttaatgacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtattctaagtttgtcaccgtt 33295835  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagtttca 595  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33295836 attacatttagtcatttctgttagtttca 33295864  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 5152538 - 5152660
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  5152538 ttaattacctttttgatcctctaactgtttaattggtatcagattggtcctctgactaaaaattgatttattt-ggtcctctaagtttctcattgttact 5152636  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5152637 acatttagtcctttctgttagttt 5152660  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 27473075 - 27473197
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27473075 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca-cgttact 27473173  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  27473174 acatttaatcatttctgttagttt 27473197  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 38589034 - 38588915
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38589034 ttaattatttttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 38588935  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  38588934 agatttagtcctttatgtta 38588915  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 45276600 - 45276723
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45276600 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttact 45276699  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||| | |||||||    
T  45276700 acatttagtcatttatattagttt 45276723  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 553
Target Start/End: Original strand, 45077224 - 45077307
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45077224 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 45077307  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 40048504 - 40048378
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  40048504 ggtttaattacctttttgatcctctagttatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgttttattttgatcctctaagtttctcaccgtt 40048405  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40048404 actacatttagtcttttctgttagttt 40048378  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5152978 - 5152858
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5152978 aattacctttttg-tcctctgactgtttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattac 5152880  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  5152879 atttagttttttctgttagttt 5152858  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5435345 - 5435224
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5435345 aattatctttttggtcctctaactatataattggtatcggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 5435246  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||  || |||||||||    
T  5435245 atttagtcacttttgttagttt 5435224  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 585
Target Start/End: Original strand, 40659988 - 40660101
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40659988 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcatctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgttactac 40660087  T
Q  572 atttagtcctttct 585  Q
    |||||||| |||||    
T  40660088 atttagtcttttct 40660101  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 480 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44595038 - 44594925
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtc 579  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44595038 tttttgtcctctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaaccgttactacatttagtc 44594939  T
Q  580 ctttctgttagttt 593  Q
     |||| ||||||||    
T  44594938 atttcggttagttt 44594925  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 11707753 - 11707876
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  11707753 ttaattatctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttgtttcgatcctctaagtttctcactgttaat 11707852  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  11707853 acatttagtcatttctcttagttt 11707876  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 15871624 - 15871747
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  15871624 ttaattacctttttggtcctttaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaaatttctcactgttact 15871723  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  15871724 acatttagtcatttatgttagttt 15871747  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 491 - 593
Target Start/End: Original strand, 27669440 - 27669542
Alignment:
Q  491 taactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttag 590  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27669440 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcactgttagtacatttagtcctttctgttag 27669539  T
Q  591 ttt 593  Q
    |||    
T  27669540 ttt 27669542  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24666125 - 24666006
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  24666125 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctttaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgttacc 24666026  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  24666025 atatttcgtcctttctgtta 24666006  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 44594604 - 44594727
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||    
T  44594604 ttaattacatttttggtcctctaattatttaattgctattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttatattcgttact 44594703  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  44594704 acatttagttatttctgttagttt 44594727  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27669851 - 27669745
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  27669851 tcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcgat-ctttaagtttcacactgttactacatttagtcatttct 27669753  T
Q  586 gttagttt 593  Q
    ||||||||    
T  27669752 gttagttt 27669745  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11920217 - 11920136
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11920217 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttgggtcctctaa 11920136  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 479 - 568
Target Start/End: Original strand, 22762525 - 22762614
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  22762525 tttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcaccgttac 22762614  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 567
Target Start/End: Original strand, 7534845 - 7534942
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  7534845 ttaattacctttttggtcttctaattatttagttgatatcggattagtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgtta 7534942  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 24652826 - 24652905
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24652826 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcct 24652905  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 33820061 - 33819975
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttgg-tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 555  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  33820061 ttaattacctttttttatcctctaactatttaattggtatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcagtcttctaagt 33819975  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Original strand, 15740616 - 15740735
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |  |||||||     
T  15740616 ttaattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttccgttacc 15740715  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  15740716 acttttagtcctttccgtta 15740735  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12643963 - 12643891
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttattt 542  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643963 ttaattatctttttggtcctctaactatttaatttgtatcgatttggtcctctaactaaatattgatttattt 12643891  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15741679 - 15741607
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttattt 542  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  15741679 ttaattacctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaattttgatttattt 15741607  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 517 - 589
Target Start/End: Original strand, 24652902 - 24652974
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  24652902 tcctttaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcaccgttaccatatttcgtcctttctgtta 24652974  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 535 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18298611 - 18298553
Alignment:
Q  535 atttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18298611 atttattttggtcctctaagtttctcacaattactacatttagtcatttctgttagttt 18298553  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 40048072 - 40048185
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||        || ||||||||    
T  40048072 aattacttttttgataatctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattaatttattttgattctcta--------actgttactac 40048163  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  40048164 atttagtcatttctgttagttt 40048185  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 506
Target Start/End: Original strand, 11920079 - 11920115
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggt 506  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11920079 ttaattacatttttggtcctctaactatttatttggt 11920115  T

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Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 46850119 - 46849993
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46850119 ggttaaattatctttttggtcatctaactattaaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 46850020  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  46850019 actacatttagtcctttctgttagttt 46849993  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19088786 - 19088665
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  19088786 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 19088687  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  19088686 atttagtcatttctgttagttt 19088665  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 53259583 - 53259462
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53259583 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 53259484  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  53259483 atttagtcatttctgttagttt 53259462  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25269447 - 25269324
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25269447 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 25269348  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25269347 acatttagtcctttctgttagttt 25269324  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 30683529 - 30683652
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30683529 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 30683628  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  30683629 acatttagtcatttctgttagttt 30683652  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 44991282 - 44991405
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44991282 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 44991381  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  44991382 acatttagtcatttctgttagttt 44991405  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 24898189 - 24898315
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24898189 ggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 24898288  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898289 actacatttagtcctttctgttagttt 24898315  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 43734286 - 43734412
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43734286 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 43734385  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43734386 actacatttagtcctttatgttagttt 43734412  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 14985336 - 14985457
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14985336 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccattactac 14985435  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14985436 atttagtcctttctgttagttt 14985457  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16038239 - 16038118
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16038239 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 16038140  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16038139 atttagtcatttctgttagttt 16038118  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 39448933 - 39448812
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39448933 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 39448834  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  39448833 atttagtcatttttgttagttt 39448812  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 53751347 - 53751226
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53751347 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 53751248  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  53751247 atttagtcatttctgttagttt 53751226  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 50769268 - 50769145
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50769268 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttact 50769169  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  50769168 acatttagtcatttcttttagttt 50769145  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Original strand, 42855343 - 42855465
Alignment:
Q  471 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42855343 taattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggagtggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttacta 42855442  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42855443 catttagtcctttctgttagttt 42855465  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 8591974 - 8592095
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8591974 aattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 8592073  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8592074 atttagtcctttctgttagttt 8592095  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 468 - 593
Target Start/End: Original strand, 19088342 - 19088467
Alignment:
Q  468 gtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19088342 gtttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggaatgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttaataccgtta 19088441  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19088442 ctacatttagtcctttctgttagttt 19088467  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21763626 - 21763505
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21763626 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 21763527  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  21763526 atttaatcctttctgttagttt 21763505  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25182257 - 25182136
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25182257 aattatctttttggtcttctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 25182158  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  25182157 atttagtcatttctgttagttt 25182136  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 55022289 - 55022409
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  55022289 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactac 55022388  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  55022389 attta-tcctttctgttagttt 55022409  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 15477648 - 15477771
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15477648 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaacattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttact 15477747  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  15477748 acatttagtccattctgttagttt 15477771  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 16037797 - 16037920
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16037797 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttact 16037896  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16037897 acatttagtcctttctgttagttt 16037920  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 38339939 - 38339816
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  38339939 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcacactgttact 38339840  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  38339839 acatttaatcctttctgttagttt 38339816  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 53750905 - 53751028
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  53750905 ttaattacctttttagtcctctaactattaaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 53751004  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  53751005 acatttagtcctttctgttagttt 53751028  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 472 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 53995380 - 53995269
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53995380 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgcattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 53995281  T
Q  572 atttagtccttt 583  Q
    ||||||||||||    
T  53995280 atttagtccttt 53995269  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 6711975 - 6712089
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6711975 tttttggccctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 6712074  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    ||||| |||||||||    
T  6712075 cctttatgttagttt 6712089  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 43734724 - 43734610
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43734724 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttattacatttagt 43734625  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  43734624 cctttctgttagttt 43734610  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15478090 - 15477969
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15478090 aattacctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattaatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 15477991  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  15477990 atttagtcttttctgttagttt 15477969  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 38339497 - 38339618
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38339497 aattacctttttggtcctctaactatttaactggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcctctaagtttctcaccgttgctac 38339596  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  38339597 atttagtcctttcggttagttt 38339618  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 52557532 - 52557411
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52557532 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttactac 52557433  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52557432 atttagtcctttctgttagttt 52557411  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 6505540 - 6505663
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6505540 ttaattacatttttgatcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 6505639  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6505640 acatttagtcctttctgttagttt 6505663  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8592416 - 8592293
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8592416 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 8592317  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  8592316 acatttagtcctttctgtttgttt 8592293  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 14985778 - 14985655
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  14985778 ttaattacctttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcactgttact 14985679  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14985678 acatttagtcctttctgttagttt 14985655  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 43566381 - 43566504
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43566381 ttaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 43566480  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||    
T  43566481 acaattagtcatttctattagttt 43566504  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 46849672 - 46849795
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  46849672 ttaattacctttttcgtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttact 46849771  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  46849772 atatttagtcctttctgttagttt 46849795  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 53994937 - 53995060
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  53994937 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 53995036  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  53995037 acatttagtcttttctattagttt 53995060  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 20888143 - 20888269
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  20888143 ggttaaattaccttttaggtactctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 20888242  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20888243 actgcatttagtcatttctgttagttt 20888269  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 624124 - 624003
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  624124 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttactac 624025  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  624024 atttagtcctttctgttagttt 624003  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 4513361 - 4513252
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4513361 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 4513262  T
Q  572 atttagtcct 581  Q
    ||||||||||    
T  4513261 atttagtcct 4513252  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 12817811 - 12817932
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12817811 aattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcactgttactac 12817910  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  12817911 atttagccctttctattagttt 12817932  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24898636 - 24898513
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  24898636 ttaattactttttttgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccgttact 24898537  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24898536 acatttagtcctttctgttagttt 24898513  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 39448491 - 39448614
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39448491 ttaattatctgtttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 39448590  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  39448591 acatttagtcctttttgttagttt 39448614  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 52557090 - 52557213
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  52557090 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttcttactgttact 52557189  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  52557190 acatttagtcttttctgttagttt 52557213  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 30683966 - 30683852
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  30683966 tttttggtcctctaaatatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcgcaccgttattacatttagt 30683867  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  30683866 cctttctgttagttt 30683852  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1433716 - 1433595
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  1433716 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaattttctcactgttactac 1433617  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  1433616 atttagtcttttctattagttt 1433595  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37206872 - 37206751
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  37206872 aattaccttttttgttctctaactatttaattgatatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttttcatcgttactac 37206773  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  37206772 atttaatcttttctgttagttt 37206751  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44991723 - 44991602
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  44991723 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactgaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 44991624  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  44991623 atttagtcttttttgttagttt 44991602  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 8398034 - 8398157
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||    
T  8398034 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaactttctcattgttact 8398133  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  8398134 acatttagtcatttctattagttt 8398157  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 36122436 - 36122559
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  36122436 ttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttttgtcatctaagtttttcactgttact 36122535  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  36122536 acatttaatcctttatgttagttt 36122559  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 37206431 - 37206553
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37206431 ttaattacctttt-gatcctctaactattcagttgatatcagattaatcctctagttaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgttact 37206529  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37206530 acatttagtcctttctgttagttt 37206553  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44957804 - 44957681
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||    
T  44957804 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcaaattggtcctttaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacatttact 44957705  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  44957704 acatttagtcctttctattagttt 44957681  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 50768824 - 50768947
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50768824 ttaattacctttttgatcctttaactatttaattggtatcgaattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 50768923  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  50768924 acatttagtactttctattagttt 50768947  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 23756250 - 23756124
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23756250 ggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 23756151  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  23756150 actatatttagtcatttctgttagttt 23756124  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33091903 - 33091777
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  33091903 ggttaaattacatttttagtcctctaactatttaattagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcatctaagtttctcaccgtt 33091804  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33091803 actacatttagtcatttctgttagttt 33091777  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 44957401 - 44957515
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  44957401 tttttggtcctctaactattttattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactgcatttagt 44957500  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    ||||| |||||||||    
T  44957501 cctttatgttagttt 44957515  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 49136086 - 49135976
Alignment:
Q  468 gtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49136086 gtttaattactttttttatcgtctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtta 49135987  T
Q  568 ctacatttagt 578  Q
    |||||||||||    
T  49135986 ctacatttagt 49135976  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 480 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41752253 - 41752140
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtc 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  41752253 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattcatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatgtagtc 41752154  T
Q  580 ctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||    
T  41752153 ctttctgttagttt 41752140  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41878303 - 41878183
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41878303 aattacttttttggtcctctaactatataattggaatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattgcggtcctctaagtttctcactgttactac 41878204  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  41878203 a-ttagtcctttctgctagttt 41878183  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 42855784 - 42855663
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42855784 aattacctttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 42855685  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  42855684 atttagtcttttctgttagttt 42855663  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 1433274 - 1433397
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  1433274 ttaattatctttttggtcctctaactatttcattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggttctctaagtttctcatcgttatt 1433373  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1433374 acatttagtcctttctgttagttt 1433397  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6712408 - 6712287
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  6712408 ttaattacctttttggtc-tctaactatttaattggtaatggattgatcctctaactacaaattgatttatttcggtcctctaaattt-tcactgttact 6712311  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6712310 acatttagtcctttctgttagttt 6712287  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 21763183 - 21763306
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  21763183 ttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctccaggtttttcaccgttact 21763282  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  21763283 acatttagtcatttctgtttgttt 21763306  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 33091456 - 33091579
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  33091456 ttaattacctttttggtcctctaactatttaatcagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccattact 33091555  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  33091556 gcatttagtcttttctgttagttt 33091579  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 474 - 593
Target Start/End: Original strand, 41877867 - 41877985
Alignment:
Q  474 ttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacat 573  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  41877867 ttacctttttggtcatctaattatttagttggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcactgttactacat 41877965  T
Q  574 ttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41877966 ttagtcctttctgttagttt 41877985  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 50508902 - 50508781
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  50508902 aattatctttttggttttctaattatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgttactgc 50508803  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  50508802 atttagtcttttctgttagttt 50508781  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 623682 - 623805
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  623682 ttaattatatttttggtcctttaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgttttattttggtcctataagtttcttaccgttact 623781  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  623782 acatttagtcctttctgttagttt 623805  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12818245 - 12818130
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  12818245 ctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtgctctaactaaaacttgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttactacatttag 12818146  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    |||||| |||||||||    
T  12818145 tcctttttgttagttt 12818130  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 36122877 - 36122757
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  36122877 aattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattga-ttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 36122779  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  36122778 atttagtcatttctattagttt 36122757  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44125915 - 44125794
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  44125915 aattacatttttggtcatctaactatttaattggtgtcggattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttattac 44125816  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  44125815 atttagtcatttctgttagttt 44125794  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 47602948 - 47603065
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  47602948 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcactgttactac 47603047  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  47603048 atttagtcctttccgtta 47603065  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 47603806 - 47603710
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  47603806 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttac 47603710  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Original strand, 19508423 - 19508538
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  19508423 ctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaacaattgatttatgtcggccctctaagtttctcactgtgactacatttag 19508522  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    || |||||||||||||    
T  19508523 tcatttctgttagttt 19508538  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 23755421 - 23755544
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||    
T  23755421 ttaattaacttattcgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttcttatcgttact 23755520  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  23755521 acatttagtcctttatgttagttt 23755544  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 25181815 - 25181938
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| |    
T  25181815 ttaattacatttttggtcctctaactatttagtttgtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgttatt 25181914  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  25181915 acatttagtcatttctgttagttt 25181938  T

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Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 44125625 - 44125748
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  44125625 ttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtattaaattggttctctaactaaaaattgatttttttcggttttctaagtttctcaccgttact 44125724  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  44125725 acatttaatcatttctgttagttt 44125748  T

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Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 499 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19508831 - 19508737
Alignment:
Q  499 taattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508831 taattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctccaagtttctcacccttactacatttagtcctttctgttagttt 19508737  T

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Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 41751821 - 41751942
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||    
T  41751821 ttaattacctttttg-tcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggt-ctttaagtttctcactgttact 41751918  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  41751919 acatttagtctttactgttagttt 41751942  T

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Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 565
Target Start/End: Original strand, 52692029 - 52692122
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgt 565  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  52692029 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 52692122  T

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Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 52692884 - 52692768
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  52692884 aattacctttttggtcctttagctatttaattgctatc-gattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgttactac 52692786  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  52692785 atttagtcatttccgtta 52692768  T

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Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 470 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 55022506 - 55022424
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55022506 ttaattatctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctctaa 55022424  T

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Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 503 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 43566792 - 43566702
Alignment:
Q  503 tggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43566792 tggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcttttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttt 43566702  T

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Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 517 - 593
Target Start/End: Original strand, 53259188 - 53259264
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53259188 tcctctaactaaaaattaattaatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagttt 53259264  T

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Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 555
Target Start/End: Original strand, 31214167 - 31214250
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 555  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31214167 aattacatttttgatcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctcaaagt 31214250  T

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Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 522 - 593
Target Start/End: Original strand, 50508512 - 50508583
Alignment:
Q  522 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  50508512 taactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttt 50508583  T

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Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43734971 - 43734941
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatc 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734971 tttttggtcctctaactatttaattggtatc 43734941  T

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Target: chr2 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 7469166 - 7469292
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7469166 ggttaaattacctttttggccctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 7469265  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7469266 actacatttagtcttttctgttagttt 7469292  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 467 - 589
Target Start/End: Original strand, 8173885 - 8174007
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8173885 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 8173984  T
Q  567 actacatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8173985 actacatttagtcctttctgtta 8174007  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 10991856 - 10991977
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10991856 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttttcaccgttactac 10991955  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  10991956 atttagtcatttctgttagttt 10991977  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 24138073 - 24138194
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24138073 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttactac 24138172  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24138173 atttagtcctttctgttagttt 24138194  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 24371970 - 24372093
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24371970 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 24372069  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  24372070 acatttagttctttctgttagttt 24372093  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33470370 - 33470247
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33470370 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 33470271  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33470270 acatttagtcctttctgttagttt 33470247  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24372412 - 24372291
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24372412 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 24372313  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24372312 atttagtcatttctgttagttt 24372291  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 13193435 - 13193312
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13193435 ttaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 13193336  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  13193335 acatttagtcttttctattagttt 13193312  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 19815704 - 19815830
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19815704 ggtttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 19815803  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19815804 actacatttagtcctttctgttagttt 19815830  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 13192993 - 13193114
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13192993 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 13193092  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  13193093 atttagtcttttctgttagttt 13193114  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 29472247 - 29472368
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29472247 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttattttggtcctctaagtttctcaccgttcctac 29472346  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29472347 atttagtcctttctgttagttt 29472368  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 12860383 - 12860506
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12860383 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 12860482  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12860483 acatttagtcctttctgttagttt 12860506  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 15405759 - 15405882
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15405759 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 15405858  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  15405859 acatttagtcatttctgttagttt 15405882  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 38333127 - 38333004
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38333127 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 38333028  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  38333027 acatttagtcatttctattagttt 38333004  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41474529 - 41474406
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  41474529 ttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctgagtttctcactgttact 41474430  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41474429 acatttagtcctttctgttagttt 41474406  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 469 - 593
Target Start/End: Original strand, 2147887 - 2148012
Alignment:
Q  469 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaat-tgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2147887 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaaaatgatttatttcgggcctctaagtttctcaccgtta 2147986  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2147987 ctacatttagtcctttctgttagttt 2148012  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 15744462 - 15744583
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  15744462 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaactgttactac 15744561  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15744562 atttagtcctttctgttagttt 15744583  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34735788 - 34735667
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||     
T  34735788 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttactat 34735689  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34735688 atttagtcctttctgttagttt 34735667  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 38332709 - 38332830
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38332709 aattacatttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 38332808  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38332809 atttagtcctttctgttagttt 38332830  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 7495983 - 7496106
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7495983 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 7496082  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  7496083 atatttagtcctttctgttagttt 7496106  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7496426 - 7496303
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7496426 ttaattacatttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 7496327  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7496326 acatttagtcctttctgttagttt 7496303  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Original strand, 34735354 - 34735469
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34735354 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcgaattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttag 34735453  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||    
T  34735454 tcctttctattagttt 34735469  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 30898751 - 30898625
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  30898751 ggtttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcaccgtt 30898652  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30898651 actacatttagtcatttctgttagttt 30898625  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19816149 - 19816028
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  19816149 aattacctttttggtcctcaaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcagaccattactac 19816050  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  19816049 atttagtcctttctgctagttt 19816028  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17052499 - 17052376
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17052499 aattacatgtttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccnttactac 17052400  T
Q  572 atttagtcctttctgttagtttca 595  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  17052399 atttagtcatttctgttagtttca 17052376  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 26181703 - 26181826
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26181703 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggaattggattggtccactaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 26181802  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  26181803 acatatattcctttctgttagttt 26181826  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 29472689 - 29472566
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  29472689 ttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattgatcctctaacaaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttact 29472590  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  29472589 acatttagtcatttctgttagttt 29472566  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8174330 - 8174209
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  8174330 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctttaaatttctcaccgtttctac 8174231  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  8174230 atttagtcatttctgttagttt 8174209  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 470 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 15744894 - 15744785
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15744894 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 15744795  T
Q  570 acatttagtc 579  Q
    ||||||||||    
T  15744794 acatttagtc 15744785  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19847765 - 19847642
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19847765 ttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 19847666  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19847665 acatttagtcctttctgttagttt 19847642  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 8444822 - 8444948
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8444822 ggtttaattacctttttggtcttctaactatttagttgatatcggattggttatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 8444921  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8444922 actacatttagtcatttctgttagttt 8444948  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16305471 - 16305349
Alignment:
Q  471 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  16305471 taattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcaatcctctaagtttctcaccgttacta 16305372  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  16305371 catttagtcttttttgttagttt 16305349  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 577
Target Start/End: Original strand, 17032598 - 17032703
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17032598 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgttactac 17032697  T
Q  572 atttag 577  Q
    ||||||    
T  17032698 atttag 17032703  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26182145 - 26182024
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  26182145 aattacatttttggtcctttaattatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggccctctaagtttctcactgttactac 26182046  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26182045 atttagtcctttctgttagttt 26182024  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15406200 - 15406080
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  15406200 aattacctttttg-tcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttactac 15406102  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  15406101 atttaatcttttctgttagttt 15406080  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 577
Target Start/End: Original strand, 17050934 - 17051039
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17050934 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgttactac 17051033  T
Q  572 atttag 577  Q
    ||||||    
T  17051034 atttag 17051039  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 36713593 - 36713714
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  36713593 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttatgtcctctaaatttctcagtgttactac 36713692  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  36713693 atttagtcttttctgttagttt 36713714  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 472 - 584
Target Start/End: Original strand, 8962365 - 8962477
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  8962365 aattatctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccctcaagtttctcaccgttactac 8962464  T
Q  572 atttagtcctttc 584  Q
    |||||||| ||||    
T  8962465 atttagtcttttc 8962477  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2148333 - 2148210
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2148333 ttaaatacattttttgtcatttaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcatcgttact 2148234  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  2148233 acatttagtcatttctgttagttt 2148210  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 472 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 8445234 - 8445127
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8445234 aattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattagcactctaattaaaaattgatttacttcggtcctctaagtttatcacagttactac 8445135  T
Q  572 atttagtc 579  Q
    ||||||||    
T  8445134 atttagtc 8445127  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 480 - 593
Target Start/End: Original strand, 16305037 - 16305151
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaa-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16305037 tttttgtcctctaactatttaattggtatcggatttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattactacatttagt 16305136  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
     ||||||||||||||    
T  16305137 tctttctgttagttt 16305151  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 517 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12860767 - 12860691
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860767 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 12860691  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24138954 - 24138830
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  24138954 ttaattacctttttggtattctaactatttaattggtatcaaattagtactttaattaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgttact 24138855  T
Q  570 acatttagtc-ctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  24138854 acatttagtctttttctgttagttt 24138830  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 517 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10992251 - 10992175
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10992251 tcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 10992175  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 41474087 - 41474208
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  41474087 aattacatttttggtcttctaactatttaattggtatcggatcggtcctgtaattaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 41474186  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  41474187 atttagtcttttatgttagttt 41474208  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 497 - 593
Target Start/End: Original strand, 42834452 - 42834548
Alignment:
Q  497 tttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42834452 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactattactacatttagtcttttctgttagttt 42834548  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 467 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 7469608 - 7469509
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  7469608 ggtttaattacctttttggttctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcagtcgtctaagtttctcatcgtt 7469509  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 8963262 - 8963166
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  8963262 aattacttttttggttctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgttac 8963166  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 36714024 - 36713909
Alignment:
Q  478 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttag 577  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  36714024 ctttttggttctctaactatttaattggtattgaattggtcctcaaactaaaaattgatttattttcgtcatctaggtttctcaccgttaccacacttag 36713925  T
Q  578 tcctttctgttagttt 593  Q
    || |||||||| ||||    
T  36713924 tcatttctgtttgttt 36713909  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 14138 - 14261
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14138 ttaattacctgtttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 14237  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14238 acatttagtcctttctgttagttt 14261  T

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Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 14580 - 14459
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14580 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctatgtttctcaccgttactac 14481  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14480 atttagtcctttctgttagttt 14459  T

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Target: chr1 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16024344 - 16024221
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16024344 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 16024245  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16024244 acatttagtcctttctggtagttt 16024221  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44323107 - 44322984
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44323107 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 44323008  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  44323007 acatttagtcatttctgttagttt 44322984  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 9006191 - 9006317
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9006191 ggtttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttatcaccgtt 9006290  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  9006291 agtacatttagtcctttctgttagttt 9006317  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27548114 - 27547993
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27548114 aattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 27548015  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27548014 atttaatcctttctgttagttt 27547993  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 468 - 593
Target Start/End: Original strand, 49643672 - 49643797
Alignment:
Q  468 gtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtta 567  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49643672 gtttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 49643771  T
Q  568 ctacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  49643772 ctacatttagtcctttctgttagttt 49643797  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 23476344 - 23476467
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23476344 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttact 23476443  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23476444 acatttagtcctttctgttagttt 23476467  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1763119 - 1762998
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1763119 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactac 1763020  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  1763019 atttagtcatttctgttagttt 1762998  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12481504 - 12481383
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12481504 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 12481405  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12481404 atttagtcctttctgttagttt 12481383  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 35612527 - 35612406
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35612527 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttatcactgttactac 35612428  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35612427 atttattcctttctgttagttt 35612406  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 12127060 - 12127183
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12127060 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtttct 12127159  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12127160 acatttagtcctttctgttagttt 12127183  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 12481062 - 12481185
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12481062 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 12481161  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12481162 acatttagtcctttctgttagttt 12481185  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 472 - 591
Target Start/End: Original strand, 16023902 - 16024021
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16023902 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 16024001  T
Q  572 atttagtcctttctgttagt 591  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  16024002 atttagtcttttctgttagt 16024021  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 26707199 - 26707322
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26707199 ttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatcggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctccccgttact 26707298  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  26707299 acatttagtcatttctgttagttt 26707322  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37576628 - 37576505
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  37576628 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgttact 37576529  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  37576528 acatttagtcttttctgttagttt 37576505  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 49140146 - 49140269
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49140146 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 49140245  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  49140246 acatttagtcatttctcttagttt 49140269  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 45843567 - 45843441
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45843567 ggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 45843468  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45843467 actacatttagtcatttctgttagttt 45843441  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 25995789 - 25995910
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25995789 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttactac 25995888  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25995889 atttagtcctttctgttagttt 25995910  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26723246 - 26723125
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26723246 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttattac 26723147  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  26723146 atttaatcctttctgttagttt 26723125  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 37304033 - 37304154
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  37304033 aattacctttttggtcctctaaccatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgttactat 37304132  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37304133 atttagtcctttctgttagttt 37304154  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 45053134 - 45053013
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  45053134 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcagtgttactac 45053035  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45053034 atttagtcctttctgttagttt 45053013  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 49140587 - 49140467
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  49140587 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaa-ttgatttatttcggtcctataagtttctcactgttactac 49140489  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49140488 atttagtcctttctgttagttt 49140467  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 27547672 - 27547795
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27547672 ttaattacctttttggtcttttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttaat 27547771  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  27547772 acatttagtcctttctgttggttt 27547795  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 35612085 - 35612208
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  35612085 ttaattacctttttggtcctctaagtatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcactgttact 35612184  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  35612185 acatttagtcctttcttttagttt 35612208  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 20306002 - 20306128
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  20306002 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttcccaccgtt 20306101  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20306102 attacatttagtcatttctgttggttt 20306128  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37304466 - 37304352
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37304466 tttttggccctctaactatttaattggtatcggattgatcctataactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 37304367  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    ||||| |||||||||    
T  37304366 cctttatgttagttt 37304352  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 38000489 - 38000615
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  38000489 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 38000588  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38000589 actacatttagtcctttctattagttt 38000615  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 3089347 - 3089468
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3089347 aattaccttttgggtcctctaactatttaattggcatcggattggtactctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattac 3089446  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3089447 atttagtcctttctgttagttt 3089468  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4330282 - 4330161
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  4330282 aattaccttttttgtcctctaattatttaattggtatcggattaaccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttactac 4330183  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  4330182 atttagtcctttctcttagttt 4330161  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6798252 - 6798131
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  6798252 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttactac 6798153  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  6798152 atttagtcctttatgttagttt 6798131  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 37576186 - 37576307
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||     
T  37576186 aattacctttttggtcctttaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttatcaaagttactaa 37576285  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37576286 atttagtcctttctgttagttt 37576307  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 593
Target Start/End: Original strand, 37585695 - 37585819
Alignment:
Q  469 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  37585695 tttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttat 37585794  T
Q  569 tacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  37585795 tatatttagtcatttctgttagttt 37585819  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 6797810 - 6797933
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6797810 ttaattacttttttggttctctaactatttaattgatatcagattgatcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 6797909  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  6797910 ccatttagtcatttctgttagttt 6797933  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 8762844 - 8762726
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  8762844 aattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcggtactac 8762745  T
Q  572 atttagtcctttctgttag 590  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8762744 atttagtcctttctgttag 8762726  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2064656 - 2064535
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  2064656 aattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgttactac 2064557  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  2064556 atttaatcatttctgttagttt 2064535  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 4696887 - 4697008
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4696887 aattatctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctataactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttactac 4696986  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4696987 atttagtcctttctgttagttt 4697008  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 23476786 - 23476665
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |    
T  23476786 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttacttc 23476687  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  23476686 atttagtcttttctgttagttt 23476665  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 470 - 590
Target Start/End: Original strand, 8760275 - 8760395
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  8760275 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgaccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttttcagtgttact 8760374  T
Q  570 acatttagtcctttctgttag 590  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  8760375 acatttagtcatttatgttag 8760395  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 1762677 - 1762800
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  1762677 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttaca 1762776  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || ||| |||||||||    
T  1762777 acatttaatcatttatgttagttt 1762800  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 20306449 - 20306326
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  20306449 ttaattacctctttggtcctctaactagttaattggtatcagattgatcctccaactaaagattgatttattttggtcctttaagtttctcactgttact 20306350  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  20306349 acatttagtcctttctattagttt 20306326  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 38127712 - 38127835
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38127712 ttaattacctttttggttctctaactatttaattggtttcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgttact 38127811  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  38127812 atatttagtccttgctgttagttt 38127835  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 45052693 - 45052816
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  45052693 ttaattatctttttgatcttcaaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactgttact 45052792  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  45052793 acatttaatcatttctgttagttt 45052816  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 23598077 - 23598198
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23598077 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaaatttctcaccgttactac 23598176  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  23598177 atttagtcatttttgttagttt 23598198  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 49644115 - 49643994
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    || |||||||    
T  49644115 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaattaaaaattgatttaattcggtcctctaagtttccatccattactac 49644016  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49644015 atttagtcctttctgttagttt 49643994  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 472 - 583
Target Start/End: Original strand, 10831136 - 10831247
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  10831136 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttccttaagtttttcaccgttactac 10831235  T
Q  572 atttagtccttt 583  Q
    ||||||||||||    
T  10831236 atttagtccttt 10831247  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31704060 - 31703941
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||||    
T  31704060 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggacctataagtttctcactgttact 31703961  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31703960 acatttagtcctttctgtta 31703941  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12127506 - 12127377
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaat---cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcacc 563  Q
    |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12127506 ggttaaattacattttttatcctctaactatttaattggtatcggattagttctcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgacc 12127407  T
Q  564 gttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12127406 gttactacatttagtcatttctgttagttt 12127377  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 37284740 - 37284854
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37284740 tttttggtcctctaactatttaattgatatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttactacatttagt 37284839  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    | ||| |||||||||    
T  37284840 cttttttgttagttt 37284854  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37586143 - 37586017
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37586143 ggttaaattatcttttttgtcatctaactacttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttttcaccgtt 37586044  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37586043 actacatttagtcatttatgttagttt 37586017  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 46593675 - 46593559
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||     
T  46593675 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct-taagtttctcactgttactat 46593577  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  46593576 atttagtcatttccgtta 46593559  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9006635 - 9006515
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  9006635 aattatctttttggtcttctaactatttaatcgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttggatcctccaagtttctcacc-ttactac 9006537  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9006536 atttagtcctttctgttagttt 9006515  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13109272 - 13109191
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13109272 aattacctttttagtcctctaactatttaattggtatccgattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13109191  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 34967167 - 34967050
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  34967167 aattacatttttgattctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccattaagtttctcaccgttactat 34967068  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  34967067 atttagtcatttccgtta 34967050  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 46592817 - 46592934
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||| |    
T  46592817 aattacctttttggccctctaactatttaattgatatcagattgatcctctaactaaaaaatgatttatttcgatcccttaagtttctcactgttactgc 46592916  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  46592917 atttagtcatttccgtta 46592934  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 517 - 593
Target Start/End: Original strand, 31703664 - 31703740
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31703664 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 31703740  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Original strand, 32047746 - 32047865
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||     
T  32047746 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaacttcatcaccgttacc 32047845  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    | |||| || ||||||||||    
T  32047846 atatttcgttctttctgtta 32047865  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 479 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 5537242 - 5537132
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||    
T  5537242 tttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagattctcactgttactacatttagt 5537143  T
Q  579 cctttctgtta 589  Q
    | |||| ||||    
T  5537142 catttccgtta 5537132  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 37285172 - 37285062
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||    
T  37285172 aattacatttttggtcctttaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgattctctaaatttctcacaattactac 37285073  T
Q  572 atttagtcctt 582  Q
    |||||||||||    
T  37285072 atttagtcctt 37285062  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 34966308 - 34966425
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||| |    
T  34966308 aattacctttttggacctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaacttgatttatttcagtcccttaagtttctcactgttactgc 34966407  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  34966408 atttagtcttttatgtta 34966425  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 472 - 592
Target Start/End: Original strand, 39486207 - 39486327
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |    
T  39486207 aattatctttttggttctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcgtttaagtttctcacatttactgc 39486306  T
Q  572 atttagtcctttctgttagtt 592  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  39486307 atttggtcttttctgttagtt 39486327  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 472 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 37467665 - 37467554
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  37467665 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttaggtcccttaagtttctcactgttactac 37467566  T
Q  572 atttagtccttt 583  Q
    |||  |||||||    
T  37467565 attcggtccttt 37467554  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 39486638 - 39486516
Alignment:
Q  471 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  39486638 taattacttttttaatcatctaactatttaattggtattgaattgttcctctaactaaaaattgatttatttccgttttctaagttttttaccgttacta 39486539  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  39486538 catttagtcctttcagttagttt 39486516  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 5536403 - 5536520
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||| |||||||||    
T  5536403 aattacatttttggccctctaactatttaattggtatcggattggtcctctacctaaaatttgatttatttgggtctcttaagtttctcatcgttactac 5536502  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5536503 atttagtcctttccgtta 5536520  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 467 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 10832036 - 10831935
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10832036 ggttaaattacttttttggtcctctaactatttaactggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 10831937  T
Q  567 ac 568  Q
    ||    
T  10831936 ac 10831935  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 467 - 589
Target Start/End: Original strand, 28884017 - 28884139
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  28884017 ggtttaattacctttttggtcctctaattatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcactgtt 28884116  T
Q  567 actacatttagtcctttctgtta 589  Q
    || | ||||  || |||||||||    
T  28884117 accatatttcatcatttctgtta 28884139  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Original strand, 13183771 - 13183852
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183771 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtattgaattagtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13183852  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4697244 - 4697157
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttat 559  Q
    ||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4697244 aattacctttttaattcgctatctatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttat 4697157  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28884870 - 28884751
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||     
T  28884870 ttaattgcttttttggtcctctaactatttaattggttacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttagtcctctaactttatcactgttacc 28884771  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  28884770 atatttcgtcctttctgtta 28884751  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 467 - 540
Target Start/End: Original strand, 46289324 - 46289397
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttat 540  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  46289324 ggtttaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttat 46289397  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 517 - 589
Target Start/End: Original strand, 49837421 - 49837493
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49837421 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttccgtta 49837493  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 32048629 - 32048510
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||     
T  32048629 ttaattacttttttggtcctctaactatttatttgataacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttatttttgtcctctaactttatcacagttacc 32048530  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    | ||||  ||||||||||||    
T  32048529 atatttcatcctttctgtta 32048510  T

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Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 526 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27400815 - 27400748
Alignment:
Q  526 taaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27400815 taaaaattgatttattttgttcctctaaatttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttt 27400748  T

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Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 49838830 - 49838756
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtc 547  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49838830 aattacctttttgg-cctttaattatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtc 49838756  T

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Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 496 - 589
Target Start/End: Original strand, 37466831 - 37466922
Alignment:
Q  496 atttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  37466831 atttaattggtatcggattactgctctaactaaaaattgatttatttccgtc--ccaagtttttcattgttactacatttagtcttttctgtta 37466922  T

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Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 514
Target Start/End: Original strand, 45843323 - 45843366
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatt 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45843323 ttaattacctttt-gatcctctaactatttaattggtatcggatt 45843366  T

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Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 46289446 - 46289402
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcag 511  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  46289446 ggttaaattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcag 46289402  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 72765 - 72888
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  72765 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 72864  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  72865 acatttattcctttctgttagttt 72888  T

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Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73085
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  73208 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 73109  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  73108 acatttagtcctttctgttagttt 73085  T

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Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 38958727 - 38958850
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38958727 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 38958826  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  38958827 acatttagtcatttctgttagttt 38958850  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 38959170 - 38959051
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38959170 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 38959071  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  38959070 acatttagtcctttttgtta 38959051  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27186318 - 27186197
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27186318 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgttactac 27186219  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27186218 atttagtcctttctgttagttt 27186197  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 36440203 - 36440326
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  36440203 ttaattacctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttatt 36440302  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  36440303 acatttagtcatttctgttagttt 36440326  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 39325415 - 39325538
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39325415 ttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 39325514  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  39325515 acatttaatcctttctgttagttt 39325538  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 9989328 - 9989449
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9989328 aattacttttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 9989427  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  9989428 atttagtcatttctgttagttt 9989449  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 16860308 - 16860429
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Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16860308 aattatctttttggtcctctaactatttaatcggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 16860407  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16860408 atttagtcttttctgttagttt 16860429  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37424709 - 37424589
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37424709 aattacctttttggtcctctaactatttaattg-tattggattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 37424611  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37424610 atttagtcctttctgttagttt 37424589  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 19184600 - 19184723
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19184600 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgttact 19184699  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  19184700 atatttcgtcctttctgttagttt 19184723  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 24040088 - 24040211
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24040088 ttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttact 24040187  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  24040188 acatttagtcctttctattagttt 24040211  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 37424265 - 37424388
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  37424265 ttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgttact 37424364  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37424365 acatttagtcctttctgttagttt 37424388  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 32288521 - 32288400
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32288521 aattacctttttgatcctctaactatttaattgatattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcactgttaatac 32288422  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  32288421 atttagtcatttctgttagttt 32288400  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 36440645 - 36440524
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||     
T  36440645 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactataactat 36440546  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36440545 atttagtcctttctgttagttt 36440524  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25183101 - 25182977
Alignment:
Q  469 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |    
T  25183101 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagcttctcaatgttgc 25183002  T
Q  569 tacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  25183001 tatatttagtcctttctgttagttt 25182977  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 32288081 - 32288204
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  32288081 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttact 32288180  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  32288181 acatttagtcatttctattagttt 32288204  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 35569778 - 35569901
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35569778 ttaattacctttttggtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 35569877  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  35569878 acatttaatcttttctgttagttt 35569901  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 486 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9989754 - 9989647
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9989754 tcctctacctatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttct 9989655  T
Q  586 gttagttt 593  Q
    ||||||||    
T  9989654 gttagttt 9989647  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 1140212 - 1140106
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1140212 ttaattgcctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1140113  T
Q  570 acattta 576  Q
    |||||||    
T  1140112 acattta 1140106  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24040532 - 24040411
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  24040532 aattacttttttggtcctctaactatttaattagtatcggattgatcctctaactaaaaattgacttatttcagtcctttaagtttctcaccgttcctac 24040433  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24040432 atttagtcatttctgttagttt 24040411  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Original strand, 27185877 - 27185994
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  27185877 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacttttact 27185976  T
Q  570 acatttagtcctttctgt 587  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  27185977 acatttagtccttcctgt 27185994  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 479 - 590
Target Start/End: Original strand, 2182955 - 2183066
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2182955 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgtcgtctaagtttctcaccgttactacatttagt 2183054  T
Q  579 cctttctgttag 590  Q
    ||||| ||||||    
T  2183055 cctttatgttag 2183066  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 488 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2183372 - 2183267
Alignment:
Q  488 ctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgt 587  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2183372 ctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggttctgtaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctat 2183273  T
Q  588 tagttt 593  Q
    ||||||    
T  2183272 tagttt 2183267  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 39325800 - 39325679
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  39325800 aattacatttttagtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttattac 39325701  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  39325700 atttagtactttctgttagttt 39325679  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 35570218 - 35570104
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35570218 ttttttgtcctctaactatttaattggtatttgattactcctctaactaaaaattgatttattttagtcttctaagtttctcaccgttactacatttagt 35570119  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |  ||||||||||||    
T  35570118 cacttctgttagttt 35570104  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 11315970 - 11316084
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  11315970 ttttttgtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcttactattactacatttagt 11316069  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||    
T  11316070 catttctgttagttt 11316084  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 495 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11316376 - 11316286
Alignment:
Q  495 tatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11316376 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttct 11316286  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25567433 - 25567312
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  25567433 aattacttttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaaattgatttattttgatcctttaagtttttcaccgttactac 25567334  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  25567333 atttagtcttttctgttagttt 25567312  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 593
Target Start/End: Original strand, 29198971 - 29199078
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttct 585  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29198971 tcctctaactatttaattgatattaaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgattctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttct 29199070  T
Q  586 gttagttt 593  Q
    ||||||||    
T  29199071 gttagttt 29199078  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 467 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31756752 - 31756630
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  31756752 ggtttaattacctttttggtctcctaactatttaattggtaacggtttagtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgtt 31756653  T
Q  567 actacatttagtcctttctgtta 589  Q
    || | |||| ||| |||||||||    
T  31756652 accatattttgtcatttctgtta 31756630  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 19128500 - 19128434
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgat 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19128500 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgat 19128434  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 518 - 584
Target Start/End: Original strand, 34264413 - 34264479
Alignment:
Q  518 cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34264413 cctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttc 34264479  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34264790 - 34264672
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgattta----tttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatt 574  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  34264790 tttttggtcctccaactatttaattggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttaattatttcggtcctctaagtttctcattgttattacatt 34264691  T
Q  575 tagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  34264690 tagtcatttctgttggttt 34264672  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 33817729 - 33817659
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttattt 542  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33817729 aattacctttttgattctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaatttatttattt 33817659  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19185629 - 19185512
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | ||||||||    
T  19185629 aattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactac 19185530  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
     |||||||||||| ||||    
T  19185529 ttttagtcctttccgtta 19185512  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 506
Target Start/End: Original strand, 34264354 - 34264390
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggt 506  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34264354 ttaattacctttttgatcctctaactatttaattggt 34264390  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 81861 - 81984
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  81861 ttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 81960  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  81961 acatttagtcctttctgttagttt 81984  T

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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 479 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 90876 - 90782
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacat 573  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  90876 tttttcgtcctctaactatttagttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacat 90782  T

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Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 544 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 82231 - 82182
Alignment:
Q  544 ggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82231 ggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 82182  T

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Target: scaffold0182 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 593
Target Start/End: Original strand, 19708 - 19834
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 566  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19708 ggttaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgtt 19807  T
Q  567 actacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19808 actacatttagtcatttctgttagttt 19834  T

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Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 469 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 20156 - 20032
Alignment:
Q  469 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20156 tttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattattttttgtcctctaagtttctcaccgttac 20057  T
Q  569 tacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  20056 tacatttagtcatttctgttagttt 20032  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 50922 - 50800
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactattt-aattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  50922 aattacatttttggtcctctaactattttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttacta 50823  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  50822 catttagtcatttctgttagttt 50800  T

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Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Original strand, 50479 - 50598
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50479 ttaattatctttttggtcctctacctatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 50578  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50579 acatttagtcctttctgtta 50598  T

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Target: scaffold0037 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 480 - 593
Target Start/End: Original strand, 45769 - 45882
Alignment:
Q  480 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtc 579  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45769 ttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggttactacatttagtc 45868  T
Q  580 ctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||    
T  45869 ctttctgttagttt 45882  T

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Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 56583 - 56460
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56583 ttaattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 56484  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  56483 acatttagtcatttctgttagttt 56460  T

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Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 63708 - 63585
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  63708 ttaattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 63609  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  63608 acatttagtcatttctgttagttt 63585  T

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Target: scaffold0220 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 20754 - 20877
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  20754 ttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacactgttact 20853  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20854 acatttagtcctttctgttagttt 20877  T

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Target: scaffold0340 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18399
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18285 tttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcttctaagtttctcaccgctactacatttagt 18384  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||||||||    
T  18385 cctttctgttagttt 18399  T

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Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18720 - 18597
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  18720 ttaattacatttttggtcctttaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcactgttact 18621  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  18620 acatttagtcttttctgttagttt 18597  T

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Target: scaffold0221 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8874 - 8752
Alignment:
Q  471 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttacta 570  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  8874 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgttctctaagtttctcaccgttacta 8775  T
Q  571 catttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  8774 catttagtcttttctgttagttt 8752  T

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Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 8434 - 8554
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |     
T  8434 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgat-ctttaactaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcactgttacaat 8532  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  8533 atttagtattttctgttagttt 8554  T

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Target: scaffold0186 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 593
Target Start/End: Original strand, 24167 - 24288
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  24167 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttattac 24266  T
Q  572 atttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24267 atttagtcatttctgttagttt 24288  T

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Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24609 - 24490
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24609 ttaattacatttttggtactctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttact 24510  T
Q  570 acatttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  24509 acatttagtcatttctgtta 24490  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 474 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 349515 - 349401
Alignment:
Q  474 ttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacat 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  349515 ttacctttttggtcccctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcacttttactacat 349417  T
Q  574 ttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  349416 ttagtcctttctgtta 349401  T

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Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 349085 - 349199
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  349085 ttttttgtcctctaactatttaattagtattagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtttttacatttagt 349184  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    | |||||||||||||    
T  349185 catttctgttagttt 349199  T

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Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 113813 - 113690
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  113813 ttaattacatttttggtcctctaactatttaagtgctatcagattggtcctgtaactaaaaattgatttctttcggtcatctaaatttctcactgttact 113714  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  113713 acatttagtcatttctgttagttt 113690  T

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Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 479 - 593
Target Start/End: Original strand, 113405 - 113519
Alignment:
Q  479 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagt 578  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |    
T  113405 tttttggtcctctaactgtttaattggtatccgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcatcgttagtaaatttatt 113504  T
Q  579 cctttctgttagttt 593  Q
    |||||| ||||||||    
T  113505 cctttccgttagttt 113519  T

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Target: scaffold0072 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15895 - 15772
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  15895 ttaattacttttttgatcctctaactatttaactggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatgact 15796  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  15795 acatttaatcccttctgttagttt 15772  T

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Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 15458 - 15575
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 571  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  15458 aattaccttttttatcctctaactattcaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttattttggtcatttaagtttctcactgttactac 15557  T
Q  572 atttagtcctttctgtta 589  Q
    |||||||| |||||||||    
T  15558 atttagtcatttctgtta 15575  T

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Target: scaffold0246 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 469 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6440 - 6319
Alignment:
Q  469 tttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttac 568  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6440 tttaattacctttt--gtcctttaactaattaattggtatcgtattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6344  T
Q  569 tacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6343 tacatttagtcatttctgttagttt 6319  T

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Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 517 - 593
Target Start/End: Original strand, 6048 - 6124
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6048 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcattgttactatatttagtcatttctgttagttt 6124  T

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Target: scaffold0225 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 9785 - 9908
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 569  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||    
T  9785 ttaattgcctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatccgttact 9884  T
Q  570 acatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  9885 acttttagtcctttccgttagttt 9908  T

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Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11006 - 10916
Alignment:
Q  467 ggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 557  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  11006 ggtttaattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagttt 10916  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 519 - 593
Target Start/End: Original strand, 14243 - 14317
Alignment:
Q  519 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  14243 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttgctatatttagtcatttctgttagttt 14317  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 584
Target Start/End: Original strand, 144039 - 144137
Alignment:
Q  486 tcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  144039 tcctctaactatttaattggtatcatattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaaatttctcaccgttactacttttagtcttttc 144137  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 517 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 147240 - 147168
Alignment:
Q  517 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactacatttagtcctttctgtta 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  147240 tcctcgaactaaaaattgatttatttcggtccgttaagtttctcatcgttactatatttagtcatttccgtta 147168  T

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Target: scaffold0526 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0526
Description:

Target: scaffold0526; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 500
Target Start/End: Original strand, 4033 - 4063
Alignment:
Q  470 ttaattacctttttggtcctctaactattta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4033 ttaattacctttttggtcctctaactattta 4063  T

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Target: scaffold0526; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 4084
Alignment:
Q  472 aattacctttttggtcctctaactattta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4112 aattacctttttggtcctctaactattta 4084  T

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