View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15340_low_3 (Length: 518)

Name: NF15340_low_3
Description: NF15340
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15340_low_3
NF15340_low_3
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (53-518)||(3098-3560)
scaffold0165 (53-518)||(7161-7624)
scaffold0165 (197-283)||(28028-28113)
scaffold0165 (368-479)||(27858-27969)
[»] chr1 (136 HSPs)
chr1 (45-518)||(22131159-22131627)
chr1 (45-518)||(48602840-48603309)
chr1 (228-486)||(38801494-38801753)
chr1 (228-494)||(27250828-27251094)
chr1 (70-276)||(41781814-41782020)
chr1 (230-494)||(22532028-22532291)
chr1 (198-486)||(21477369-21477656)
chr1 (231-494)||(34509540-34509802)
chr1 (228-482)||(20134938-20135191)
chr1 (226-494)||(20847253-20847502)
chr1 (227-494)||(50210312-50210583)
chr1 (76-218)||(1925728-1925870)
chr1 (76-218)||(20924742-20924884)
chr1 (71-214)||(41388597-41388740)
chr1 (78-218)||(33796911-33797051)
chr1 (70-218)||(39244493-39244641)
chr1 (70-218)||(39248048-39248196)
chr1 (70-218)||(20229581-20229729)
chr1 (70-218)||(21406740-21406888)
chr1 (75-218)||(16376032-16376176)
chr1 (76-218)||(1010112-1010255)
chr1 (76-218)||(52638930-52639073)
chr1 (198-335)||(13213144-13213282)
chr1 (226-430)||(21714300-21714501)
chr1 (199-335)||(16361654-16361791)
chr1 (46-281)||(23967314-23967558)
chr1 (231-428)||(21788208-21788403)
chr1 (226-482)||(22468813-22469066)
chr1 (199-309)||(21840374-21840485)
chr1 (226-428)||(42865378-42865578)
chr1 (199-335)||(29776386-29776523)
chr1 (200-309)||(16275712-16275822)
chr1 (200-335)||(14295834-14295970)
chr1 (200-335)||(20454840-20454975)
chr1 (373-486)||(45574994-45575108)
chr1 (198-284)||(431465-431551)
chr1 (198-309)||(15860339-15860451)
chr1 (371-494)||(31612209-31612332)
chr1 (226-428)||(6151601-6151801)
chr1 (317-432)||(20916073-20916187)
chr1 (200-285)||(20915999-20916084)
chr1 (200-323)||(45575183-45575307)
chr1 (371-494)||(13988763-13988885)
chr1 (371-494)||(21923434-21923556)
chr1 (379-486)||(14295658-14295765)
chr1 (75-207)||(42911750-42911890)
chr1 (228-411)||(22831566-22831744)
chr1 (198-284)||(27161833-27161919)
chr1 (198-284)||(29297843-29297929)
chr1 (198-284)||(40388899-40388985)
chr1 (197-323)||(16758372-16758494)
chr1 (198-267)||(31612022-31612091)
chr1 (371-494)||(21475230-21475352)
chr1 (371-494)||(22123211-22123333)
chr1 (371-494)||(23593878-23594000)
chr1 (375-498)||(27161601-27161724)
chr1 (371-494)||(29298034-29298156)
chr1 (226-430)||(20091638-20091837)
chr1 (197-283)||(21896572-21896657)
chr1 (198-284)||(22123438-22123523)
chr1 (231-437)||(18182274-18182474)
chr1 (89-207)||(14238699-14238832)
chr1 (226-486)||(33680754-33681024)
chr1 (198-264)||(40129323-40129389)
chr1 (379-494)||(13213005-13213119)
chr1 (201-284)||(21706912-21706995)
chr1 (201-284)||(21711454-21711537)
chr1 (231-411)||(22449447-22449622)
chr1 (399-494)||(29776613-29776707)
chr1 (197-283)||(16368601-16368686)
chr1 (223-335)||(21341864-21341977)
chr1 (223-335)||(21346728-21346841)
chr1 (226-283)||(20248029-20248086)
chr1 (226-283)||(22922185-22922242)
chr1 (399-494)||(21346886-21346980)
chr1 (226-279)||(21753795-21753848)
chr1 (211-323)||(41050313-41050424)
chr1 (132-205)||(48519945-48520018)
chr1 (211-323)||(50622222-50622335)
chr1 (415-494)||(432953-433031)
chr1 (383-494)||(16275507-16275616)
chr1 (226-285)||(21022333-21022392)
chr1 (75-195)||(48519847-48519975)
chr1 (197-323)||(50686366-50686493)
chr1 (374-494)||(21711608-21711728)
chr1 (226-283)||(52928287-52928344)
chr1 (352-486)||(22237512-22237644)
chr1 (211-323)||(50614394-50614507)
chr1 (399-482)||(16361836-16361918)
chr1 (399-494)||(21342022-21342115)
chr1 (399-494)||(21707092-21707186)
chr1 (226-267)||(21709757-21709798)
chr1 (221-283)||(26064679-26064743)
chr1 (242-411)||(3473103-3473268)
chr1 (155-207)||(19675540-19675592)
chr1 (226-266)||(21161499-21161539)
chr1 (379-475)||(21840666-21840761)
chr1 (352-486)||(52928074-52928206)
chr1 (228-283)||(22237376-22237431)
chr1 (231-270)||(24783366-24783405)
chr1 (212-283)||(35261352-35261423)
chr1 (226-267)||(21172790-21172831)
chr1 (226-267)||(21312906-21312947)
chr1 (352-411)||(21896433-21896491)
chr1 (82-138)||(4597107-4597163)
chr1 (70-138)||(20241556-20241624)
chr1 (155-207)||(20241616-20241668)
chr1 (371-411)||(20248184-20248224)
chr1 (352-411)||(21753933-21753990)
chr1 (251-322)||(47190410-47190481)
chr1 (226-395)||(8761827-8761991)
chr1 (379-482)||(20454670-20454772)
chr1 (374-479)||(40389056-40389161)
chr1 (441-494)||(21026649-21026702)
chr1 (226-267)||(36819584-36819625)
chr1 (251-315)||(52954602-52954666)
chr1 (273-336)||(16361772-16361836)
chr1 (352-402)||(16368471-16368520)
chr1 (371-411)||(22922046-22922086)
chr1 (352-402)||(26064824-26064873)
chr1 (251-329)||(21043552-21043630)
chr1 (211-283)||(22118543-22118617)
chr1 (27-78)||(23967252-23967303)
chr1 (226-276)||(17678898-17678948)
chr1 (356-482)||(21161607-21161729)
chr1 (371-411)||(431655-431696)
chr1 (251-284)||(16059468-16059501)
chr1 (231-267)||(16080691-16080728)
chr1 (444-481)||(16368393-16368430)
chr1 (273-329)||(45575089-45575146)
chr1 (223-284)||(4596999-4597062)
chr1 (223-284)||(19675588-19675651)
chr1 (223-280)||(20241664-20241723)
chr1 (336-376)||(21022398-21022438)
chr1 (482-518)||(29764535-29764571)
chr1 (352-402)||(35261264-35261313)
[»] chr4 (157 HSPs)
chr4 (50-518)||(17048388-17048851)
chr4 (226-486)||(14053408-14053669)
chr4 (228-494)||(12902514-12902779)
chr4 (228-486)||(17046242-17046501)
chr4 (198-476)||(23374470-23374748)
chr4 (228-494)||(44052585-44052851)
chr4 (226-494)||(7798529-7798796)
chr4 (228-494)||(7893459-7893725)
chr4 (228-494)||(22636192-22636457)
chr4 (228-494)||(16377620-16377885)
chr4 (228-494)||(16240068-16240334)
chr4 (50-215)||(631330-631495)
chr4 (316-494)||(15551662-15551839)
chr4 (70-218)||(20160445-20160593)
chr4 (70-267)||(20157731-20157917)
chr4 (70-218)||(20163223-20163371)
chr4 (319-494)||(3096141-3096315)
chr4 (76-218)||(14954766-14954908)
chr4 (75-218)||(10712244-10712387)
chr4 (75-218)||(10926014-10926157)
chr4 (70-218)||(15224426-15224574)
chr4 (76-218)||(5757504-5757647)
chr4 (76-218)||(9555919-9556062)
chr4 (76-218)||(12487074-12487217)
chr4 (76-218)||(14758001-14758144)
chr4 (76-218)||(33741769-33741912)
chr4 (76-218)||(4561899-4562042)
chr4 (226-428)||(13569255-13569454)
chr4 (226-428)||(44675384-44675584)
chr4 (312-490)||(16270338-16270515)
chr4 (226-428)||(12569768-12569967)
chr4 (225-428)||(15125206-15125407)
chr4 (226-428)||(23843230-23843430)
chr4 (375-494)||(52873466-52873585)
chr4 (200-312)||(14971106-14971219)
chr4 (200-335)||(23803631-23803766)
chr4 (75-207)||(37018300-37018432)
chr4 (200-335)||(51464148-51464283)
chr4 (226-428)||(15121965-15122165)
chr4 (198-335)||(19242417-19242554)
chr4 (76-162)||(25689292-25689378)
chr4 (197-283)||(52243512-52243598)
chr4 (200-335)||(19618504-19618641)
chr4 (200-335)||(12610654-12610789)
chr4 (200-309)||(15369723-15369833)
chr4 (372-486)||(15369918-15370032)
chr4 (371-494)||(50222482-50222604)
chr4 (234-424)||(15093536-15093723)
chr4 (125-323)||(13592423-13592621)
chr4 (200-309)||(15367395-15367505)
chr4 (372-486)||(15371102-15371216)
chr4 (200-309)||(15373231-15373341)
chr4 (198-284)||(20149574-20149660)
chr4 (197-283)||(43198868-43198954)
chr4 (198-284)||(44102000-44102086)
chr4 (374-494)||(12450-12569)
chr4 (373-486)||(15367591-15367704)
chr4 (373-486)||(16223433-16223546)
chr4 (198-283)||(39706610-39706695)
chr4 (371-494)||(7641325-7641447)
chr4 (371-494)||(15118495-15118617)
chr4 (371-494)||(15355468-15355591)
chr4 (371-494)||(18215417-18215540)
chr4 (371-494)||(18239562-18239684)
chr4 (371-494)||(44615185-44615307)
chr4 (371-494)||(44773230-44773352)
chr4 (371-494)||(52312407-52312529)
chr4 (371-494)||(54798853-54798976)
chr4 (198-284)||(12596-12682)
chr4 (197-279)||(14928058-14928140)
chr4 (372-486)||(15373383-15373497)
chr4 (372-486)||(15402603-15402717)
chr4 (198-280)||(52312216-52312298)
chr4 (371-494)||(1837652-1837774)
chr4 (371-494)||(8574966-8575088)
chr4 (371-494)||(44929023-44929146)
chr4 (89-207)||(3484747-3484876)
chr4 (75-207)||(16997226-16997366)
chr4 (75-207)||(35812636-35812776)
chr4 (197-283)||(14167-14252)
chr4 (197-283)||(12288527-12288612)
chr4 (371-468)||(14038555-14038652)
chr4 (76-162)||(27533400-27533486)
chr4 (372-494)||(51464011-51464131)
chr4 (198-284)||(14280061-14280144)
chr4 (200-284)||(54799082-54799166)
chr4 (135-218)||(17809723-17809806)
chr4 (372-494)||(12610849-12610969)
chr4 (230-311)||(15705148-15705230)
chr4 (228-297)||(16270486-16270556)
chr4 (228-284)||(52873570-52873626)
chr4 (427-494)||(7088832-7088899)
chr4 (75-207)||(14548411-14548551)
chr4 (231-411)||(16488259-16488433)
chr4 (372-494)||(23803408-23803528)
chr4 (228-284)||(3096093-3096149)
chr4 (228-284)||(12773839-12773895)
chr4 (228-284)||(14038459-14038515)
chr4 (200-284)||(18215645-18215729)
chr4 (200-263)||(15375517-15375580)
chr4 (374-494)||(14280215-14280335)
chr4 (399-494)||(6899818-6899913)
chr4 (211-323)||(53082430-53082543)
chr4 (379-482)||(14970868-14970970)
chr4 (400-494)||(44102140-44102233)
chr4 (215-323)||(14825204-14825314)
chr4 (226-411)||(16348844-16349024)
chr4 (226-284)||(14157596-14157654)
chr4 (226-284)||(14164301-14164359)
chr4 (352-411)||(14927915-14927973)
chr4 (251-323)||(22353586-22353659)
chr4 (371-494)||(39706387-39706511)
chr4 (352-411)||(43198729-43198787)
chr4 (155-207)||(15042327-15042379)
chr4 (155-207)||(15112045-15112097)
chr4 (155-207)||(25090441-25090493)
chr4 (368-411)||(12773910-12773953)
chr4 (76-123)||(17807517-17807564)
chr4 (379-482)||(19618333-19618435)
chr4 (226-272)||(12423457-12423503)
chr4 (379-486)||(22353740-22353847)
chr4 (222-323)||(15791426-15791529)
chr4 (226-267)||(22634677-22634718)
chr4 (226-411)||(16357132-16357312)
chr4 (166-218)||(25689349-25689401)
chr4 (231-267)||(36134226-36134262)
chr4 (75-138)||(25090386-25090449)
chr4 (166-217)||(27533457-27533508)
chr4 (368-402)||(46640641-46640675)
chr4 (223-276)||(13813482-13813535)
chr4 (371-423)||(29267517-29267570)
chr4 (221-283)||(46640734-46640798)
chr4 (226-411)||(5339157-5339338)
chr4 (371-411)||(14157753-14157793)
chr4 (371-411)||(14164458-14164498)
chr4 (352-409)||(12288389-12288445)
chr4 (75-138)||(15042371-15042433)
chr4 (75-138)||(15111991-15112053)
chr4 (352-409)||(52243375-52243431)
chr4 (221-323)||(14853149-14853253)
chr4 (124-162)||(17809745-17809783)
chr4 (374-479)||(20149731-20149836)
chr4 (352-411)||(14028-14086)
chr4 (251-284)||(16997392-16997425)
chr4 (251-284)||(26045609-26045642)
chr4 (251-284)||(26050790-26050823)
chr4 (226-267)||(28569697-28569737)
chr4 (251-284)||(35812577-35812610)
chr4 (251-323)||(37018458-37018530)
chr4 (155-195)||(13592584-13592624)
chr4 (273-312)||(14971018-14971058)
chr4 (223-284)||(15042268-15042331)
chr4 (223-284)||(15112093-15112156)
chr4 (221-284)||(15355653-15355717)
chr4 (223-284)||(25090489-25090552)
chr4 (482-518)||(37838849-37838885)
chr4 (482-518)||(42597578-42597614)
[»] chr8 (154 HSPs)
chr8 (43-518)||(44384923-44385396)
chr8 (228-486)||(5866381-5866640)
chr8 (228-494)||(21254978-21255244)
chr8 (228-494)||(21249140-21249406)
chr8 (228-486)||(45131103-45131362)
chr8 (231-494)||(17140671-17140938)
chr8 (226-486)||(21389557-21389818)
chr8 (211-494)||(21490733-21491017)
chr8 (226-486)||(21778883-21779144)
chr8 (228-494)||(18818508-18818773)
chr8 (70-276)||(23913655-23913861)
chr8 (231-494)||(23406139-23406401)
chr8 (229-486)||(21396087-21396345)
chr8 (229-486)||(21790580-21790838)
chr8 (228-494)||(18879330-18879593)
chr8 (200-486)||(13597724-13598011)
chr8 (228-494)||(20535965-20536230)
chr8 (89-335)||(16413636-16413882)
chr8 (228-494)||(7372535-7372800)
chr8 (198-486)||(13508192-13508479)
chr8 (325-486)||(16199751-16199912)
chr8 (70-218)||(21828613-21828761)
chr8 (228-482)||(23648300-23648557)
chr8 (75-218)||(18863244-18863387)
chr8 (227-494)||(22626493-22626758)
chr8 (125-312)||(32121443-32121630)
chr8 (76-218)||(30940676-30940818)
chr8 (312-494)||(21919099-21919279)
chr8 (70-218)||(21386717-21386865)
chr8 (312-494)||(31971097-31971279)
chr8 (70-218)||(21410309-21410457)
chr8 (70-218)||(21804801-21804949)
chr8 (227-490)||(22874825-22875083)
chr8 (70-218)||(14398422-14398568)
chr8 (76-217)||(21973156-21973298)
chr8 (76-217)||(21977247-21977389)
chr8 (296-494)||(21924027-21924222)
chr8 (76-218)||(22111320-22111463)
chr8 (76-218)||(43251200-43251343)
chr8 (199-335)||(14409726-14409862)
chr8 (314-494)||(28649143-28649325)
chr8 (200-335)||(26223618-26223753)
chr8 (198-309)||(17612374-17612486)
chr8 (226-428)||(16184473-16184673)
chr8 (199-304)||(4083702-4083808)
chr8 (297-494)||(6759088-6759280)
chr8 (231-428)||(23777000-23777194)
chr8 (372-494)||(41598086-41598207)
chr8 (228-428)||(19898849-19899047)
chr8 (371-494)||(16092441-16092564)
chr8 (226-428)||(20466206-20466406)
chr8 (198-335)||(19937372-19937509)
chr8 (200-335)||(25484591-25484726)
chr8 (371-494)||(26225390-26225513)
chr8 (371-494)||(45290838-45290961)
chr8 (226-411)||(21162242-21162424)
chr8 (226-411)||(21168915-21169097)
chr8 (227-335)||(18678321-18678430)
chr8 (199-284)||(19895972-19896057)
chr8 (371-494)||(4542516-4542638)
chr8 (371-494)||(5853435-5853557)
chr8 (371-494)||(19896162-19896284)
chr8 (371-494)||(26219613-26219736)
chr8 (200-284)||(41597896-41597980)
chr8 (226-428)||(19982845-19983045)
chr8 (198-284)||(15203601-15203687)
chr8 (371-494)||(1484299-1484421)
chr8 (371-490)||(14823671-14823789)
chr8 (227-314)||(18717531-18717619)
chr8 (371-494)||(20046338-20046460)
chr8 (371-494)||(20403124-20403246)
chr8 (198-284)||(45291066-45291152)
chr8 (371-494)||(15203374-15203496)
chr8 (221-335)||(22965468-22965583)
chr8 (371-494)||(22001651-22001772)
chr8 (211-323)||(24352752-24352866)
chr8 (379-494)||(4483187-4483300)
chr8 (65-195)||(5760107-5760237)
chr8 (197-283)||(983722-983807)
chr8 (82-284)||(18833030-18833240)
chr8 (226-411)||(30643473-30643653)
chr8 (226-329)||(38855488-38855591)
chr8 (399-494)||(14409587-14409681)
chr8 (228-297)||(21919250-21919320)
chr8 (372-494)||(25484411-25484531)
chr8 (226-283)||(6520111-6520168)
chr8 (226-396)||(377025-377189)
chr8 (379-479)||(22965608-22965707)
chr8 (228-284)||(31971056-31971112)
chr8 (372-486)||(17612217-17612332)
chr8 (371-486)||(23760948-23761062)
chr8 (75-207)||(42819111-42819251)
chr8 (228-329)||(23761116-23761216)
chr8 (211-315)||(17439790-17439896)
chr8 (227-283)||(21673397-21673453)
chr8 (211-323)||(28397280-28397394)
chr8 (212-323)||(22525290-22525403)
chr8 (226-276)||(22873581-22873631)
chr8 (368-482)||(26355806-26355919)
chr8 (379-480)||(26223821-26223921)
chr8 (228-284)||(16092604-16092660)
chr8 (226-411)||(16410428-16410609)
chr8 (211-323)||(20502377-20502491)
chr8 (231-283)||(21673458-21673510)
chr8 (226-274)||(24755511-24755559)
chr8 (211-323)||(40493250-40493364)
chr8 (228-283)||(26355978-26356033)
chr8 (293-430)||(17354105-17354240)
chr8 (226-276)||(19259863-19259913)
chr8 (352-494)||(6520249-6520390)
chr8 (226-411)||(22010846-22011028)
chr8 (226-396)||(17926902-17927066)
chr8 (371-411)||(21673608-21673648)
chr8 (211-323)||(22995573-22995687)
chr8 (230-297)||(28649298-28649366)
chr8 (368-494)||(38855350-38855474)
chr8 (211-283)||(2419186-2419260)
chr8 (379-478)||(32121634-32121732)
chr8 (352-479)||(983515-983641)
chr8 (211-315)||(22419696-22419800)
chr8 (125-174)||(5760200-5760249)
chr8 (199-244)||(15070536-15070581)
chr8 (352-411)||(20498448-20498506)
chr8 (221-323)||(20533685-20533789)
chr8 (77-138)||(37515145-37515206)
chr8 (227-309)||(4483052-4483136)
chr8 (345-428)||(24755584-24755667)
chr8 (125-180)||(6102834-6102889)
chr8 (156-195)||(32121441-32121480)
chr8 (245-283)||(20498329-20498367)
chr8 (231-411)||(20856608-20856785)
chr8 (231-382)||(16861534-16861681)
chr8 (352-411)||(21285481-21285539)
chr8 (211-323)||(22963688-22963802)
chr8 (211-323)||(22984015-22984129)
chr8 (89-137)||(32121396-32121444)
chr8 (371-402)||(17267180-17267211)
chr8 (273-335)||(18678277-18678340)
chr8 (371-402)||(24352926-24352957)
chr8 (346-411)||(15611640-15611705)
chr8 (157-207)||(19929982-19930032)
chr8 (251-284)||(6102780-6102813)
chr8 (379-476)||(16413471-16413567)
chr8 (251-284)||(22253479-22253512)
chr8 (251-284)||(26225619-26225652)
chr8 (251-311)||(35027104-35027164)
chr8 (251-283)||(16799257-16799289)
chr8 (251-283)||(19155203-19155235)
chr8 (482-518)||(23478199-23478235)
chr8 (251-323)||(23944228-23944299)
chr8 (251-283)||(26219518-26219550)
chr8 (251-283)||(29763914-29763946)
chr8 (155-195)||(37515198-37515238)
chr8 (251-323)||(37515299-37515371)
[»] chr5 (144 HSPs)
chr5 (158-518)||(22107688-22108046)
chr5 (202-494)||(21808488-21808780)
chr5 (226-494)||(19660934-19661202)
chr5 (228-486)||(21293076-21293335)
chr5 (209-494)||(21729163-21729449)
chr5 (202-494)||(22074750-22075041)
chr5 (228-494)||(8286942-8287209)
chr5 (228-494)||(24493325-24493591)
chr5 (230-486)||(37723660-37723917)
chr5 (228-494)||(23390595-23390860)
chr5 (228-494)||(13095251-13095517)
chr5 (228-494)||(21997633-21997898)
chr5 (228-487)||(25431151-25431410)
chr5 (228-494)||(13025067-13025333)
chr5 (227-494)||(24528976-24529242)
chr5 (228-494)||(25421287-25421554)
chr5 (227-494)||(9077710-9077974)
chr5 (228-494)||(1096225-1096489)
chr5 (70-218)||(11230505-11230653)
chr5 (78-218)||(18355609-18355749)
chr5 (70-218)||(11224693-11224841)
chr5 (70-218)||(11220107-11220255)
chr5 (70-218)||(11228516-11228664)
chr5 (37-162)||(22108009-22108134)
chr5 (76-218)||(40724190-40724332)
chr5 (70-218)||(15237409-15237556)
chr5 (90-218)||(11226546-11226674)
chr5 (75-218)||(20295235-20295379)
chr5 (70-218)||(10752576-10752722)
chr5 (199-309)||(38619218-38619329)
chr5 (199-335)||(23064255-23064391)
chr5 (226-428)||(23201112-23201312)
chr5 (200-335)||(36314279-36314415)
chr5 (200-335)||(41095900-41096035)
chr5 (226-428)||(21873007-21873206)
chr5 (371-494)||(10775819-10775942)
chr5 (371-494)||(22412083-22412206)
chr5 (70-162)||(24767898-24767990)
chr5 (200-335)||(31060772-31060907)
chr5 (76-162)||(19473315-19473401)
chr5 (228-411)||(18770185-18770366)
chr5 (70-162)||(20911531-20911623)
chr5 (226-428)||(14078902-14079102)
chr5 (198-284)||(11581571-11581657)
chr5 (198-284)||(20918317-20918403)
chr5 (223-428)||(22032072-22032275)
chr5 (200-312)||(17517467-17517580)
chr5 (198-283)||(21329813-21329898)
chr5 (371-494)||(2154757-2154879)
chr5 (371-494)||(32027290-32027412)
chr5 (371-494)||(42245508-42245630)
chr5 (368-494)||(10733083-10733208)
chr5 (198-285)||(22411893-22411980)
chr5 (198-284)||(29329640-29329726)
chr5 (226-430)||(26703829-26704030)
chr5 (226-430)||(26973562-26973763)
chr5 (371-494)||(29329831-29329953)
chr5 (379-486)||(36314484-36314591)
chr5 (202-284)||(14047831-14047913)
chr5 (216-309)||(20807047-20807141)
chr5 (198-284)||(24066896-24066982)
chr5 (198-284)||(32027099-32027185)
chr5 (371-494)||(11581342-11581465)
chr5 (197-329)||(21502429-21502560)
chr5 (371-494)||(29345877-29345999)
chr5 (371-494)||(29348350-29348472)
chr5 (371-494)||(39245033-39245155)
chr5 (198-284)||(18319321-18319408)
chr5 (371-494)||(264911-265033)
chr5 (371-494)||(20908909-20909031)
chr5 (371-494)||(20918091-20918212)
chr5 (371-494)||(29350823-29350945)
chr5 (379-494)||(39363290-39363403)
chr5 (198-283)||(10776004-10776090)
chr5 (372-494)||(31060967-31061087)
chr5 (236-336)||(20902247-20902348)
chr5 (211-283)||(20027257-20027329)
chr5 (226-411)||(21366845-21367026)
chr5 (226-382)||(23511853-23512006)
chr5 (352-494)||(19668781-19668920)
chr5 (371-482)||(21565445-21565555)
chr5 (197-255)||(26012359-26012417)
chr5 (226-311)||(21877287-21877371)
chr5 (226-311)||(21887042-21887126)
chr5 (211-283)||(27989245-27989317)
chr5 (372-491)||(20806888-20807005)
chr5 (399-494)||(23064436-23064530)
chr5 (290-428)||(23571893-23572029)
chr5 (352-494)||(21329596-21329732)
chr5 (226-283)||(22959847-22959904)
chr5 (374-494)||(36154923-36155043)
chr5 (401-486)||(40725782-40725867)
chr5 (228-283)||(21565291-21565346)
chr5 (211-323)||(22178497-22178611)
chr5 (228-283)||(19668646-19668700)
chr5 (397-478)||(17517322-17517402)
chr5 (399-484)||(20902163-20902247)
chr5 (242-411)||(17919326-17919489)
chr5 (371-411)||(20027118-20027158)
chr5 (226-411)||(20805304-20805485)
chr5 (211-323)||(26740921-26741035)
chr5 (226-266)||(33896074-33896114)
chr5 (422-494)||(38619382-38619453)
chr5 (211-283)||(26733105-26733179)
chr5 (211-261)||(22142531-22142581)
chr5 (325-430)||(23501517-23501621)
chr5 (374-479)||(24067009-24067114)
chr5 (371-484)||(26012142-26012255)
chr5 (82-136)||(33896167-33896221)
chr5 (441-494)||(21502255-21502308)
chr5 (251-335)||(40725607-40725691)
chr5 (379-451)||(18418508-18418580)
chr5 (166-218)||(19473292-19473344)
chr5 (371-411)||(22143951-22143991)
chr5 (371-411)||(22959708-22959748)
chr5 (223-323)||(23469545-23469647)
chr5 (227-309)||(39363155-39363239)
chr5 (167-218)||(20911508-20911559)
chr5 (166-267)||(24767837-24767927)
chr5 (226-276)||(1859276-1859326)
chr5 (226-276)||(20766726-20766776)
chr5 (226-267)||(17410258-17410299)
chr5 (375-479)||(18319189-18319293)
chr5 (251-323)||(21732204-21732276)
chr5 (251-323)||(21809855-21809927)
chr5 (221-284)||(2154984-2155048)
chr5 (371-411)||(21502335-21502375)
chr5 (228-260)||(23571851-23571883)
chr5 (226-265)||(23501636-23501675)
chr5 (371-402)||(27989115-27989146)
chr5 (155-206)||(33896122-33896173)
chr5 (379-430)||(41095696-41095747)
chr5 (251-323)||(16227255-16227326)
chr5 (226-267)||(21885466-21885506)
chr5 (226-267)||(23458355-23458396)
chr5 (226-267)||(23462616-23462657)
chr5 (251-323)||(25574741-25574813)
chr5 (226-267)||(26172253-26172293)
chr5 (444-481)||(27989036-27989073)
chr5 (251-283)||(15796195-15796227)
chr5 (482-518)||(17010844-17010880)
chr5 (273-312)||(18418376-18418416)
chr5 (482-518)||(19076340-19076376)
chr5 (251-283)||(25575974-25576006)
[»] chr7 (200 HSPs)
chr7 (125-518)||(14257914-14258307)
chr7 (202-494)||(26211725-26212018)
chr7 (228-494)||(10588792-10589061)
chr7 (230-494)||(34200541-34200808)
chr7 (228-494)||(11996126-11996393)
chr7 (228-494)||(9508945-9509211)
chr7 (76-276)||(20487186-20487386)
chr7 (228-494)||(12698588-12698853)
chr7 (249-494)||(28505397-28505629)
chr7 (228-454)||(13032514-13032741)
chr7 (312-494)||(16386347-16386529)
chr7 (48-213)||(18301663-18301828)
chr7 (70-218)||(12705233-12705381)
chr7 (70-218)||(13919069-13919217)
chr7 (70-218)||(39721625-39721773)
chr7 (125-335)||(24274789-24275001)
chr7 (67-218)||(25927815-25927968)
chr7 (70-218)||(2530728-2530876)
chr7 (70-218)||(2832771-2832919)
chr7 (222-486)||(10063925-10064189)
chr7 (70-218)||(15083555-15083703)
chr7 (76-218)||(45170605-45170747)
chr7 (317-486)||(27847937-27848106)
chr7 (75-411)||(16579188-16579514)
chr7 (317-494)||(15754986-15755164)
chr7 (228-392)||(15755152-15755317)
chr7 (70-218)||(1859398-1859546)
chr7 (70-218)||(18425044-18425192)
chr7 (70-218)||(26291756-26291904)
chr7 (75-411)||(16586149-16586474)
chr7 (198-494)||(38227210-38227503)
chr7 (76-218)||(71341-71484)
chr7 (76-218)||(75450-75593)
chr7 (76-218)||(16907785-16907928)
chr7 (76-218)||(18282755-18282898)
chr7 (226-430)||(18155003-18155204)
chr7 (150-266)||(15605818-15605934)
chr7 (76-218)||(32498-32641)
chr7 (76-218)||(12718057-12718200)
chr7 (76-218)||(12722968-12723111)
chr7 (76-218)||(16113630-16113773)
chr7 (76-218)||(16116783-16116926)
chr7 (76-218)||(18278792-18278935)
chr7 (226-428)||(9703016-9703215)
chr7 (226-428)||(19649653-19649853)
chr7 (199-335)||(13869090-13869226)
chr7 (373-486)||(40443292-40443405)
chr7 (228-483)||(15144143-15144396)
chr7 (371-494)||(44116405-44116528)
chr7 (227-329)||(3564565-3564668)
chr7 (226-482)||(15211207-15211460)
chr7 (198-348)||(38898646-38898796)
chr7 (226-430)||(24054218-24054419)
chr7 (228-329)||(40443209-40443311)
chr7 (70-163)||(7519669-7519762)
chr7 (200-335)||(16495104-16495240)
chr7 (164-283)||(15082252-15082370)
chr7 (226-428)||(17138225-17138425)
chr7 (373-486)||(13647225-13647339)
chr7 (198-284)||(20110260-20110346)
chr7 (198-283)||(47831521-47831606)
chr7 (200-335)||(13647026-13647162)
chr7 (371-494)||(18456511-18456634)
chr7 (371-494)||(20110452-20110575)
chr7 (198-335)||(13831118-13831255)
chr7 (200-309)||(42376304-42376414)
chr7 (198-284)||(44116257-44116343)
chr7 (200-335)||(16213324-16213461)
chr7 (371-494)||(11972393-11972515)
chr7 (371-494)||(14949265-14949387)
chr7 (228-315)||(16402713-16402801)
chr7 (371-494)||(32125388-32125510)
chr7 (371-494)||(41522814-41522936)
chr7 (371-494)||(41525276-41525398)
chr7 (371-494)||(48273288-48273411)
chr7 (75-207)||(16585087-16585227)
chr7 (226-428)||(32216713-32216912)
chr7 (373-494)||(3564463-3564584)
chr7 (197-283)||(12256137-12256222)
chr7 (197-283)||(22072712-22072798)
chr7 (371-494)||(15376856-15376978)
chr7 (371-494)||(16409956-16410078)
chr7 (371-494)||(21189738-21189860)
chr7 (226-428)||(12186771-12186971)
chr7 (226-411)||(14429639-14429819)
chr7 (251-392)||(16461338-16461478)
chr7 (198-281)||(18456699-18456782)
chr7 (197-283)||(16220034-16220119)
chr7 (198-284)||(17062204-17062290)
chr7 (269-392)||(16461233-16461355)
chr7 (230-306)||(28505626-28505703)
chr7 (371-494)||(456218-456340)
chr7 (199-283)||(16056049-16056133)
chr7 (371-494)||(16232417-16232539)
chr7 (371-494)||(20385266-20385388)
chr7 (371-494)||(24702135-24702257)
chr7 (371-494)||(24704585-24704707)
chr7 (371-494)||(27216757-27216879)
chr7 (379-486)||(16495309-16495416)
chr7 (197-283)||(2282566-2282651)
chr7 (198-284)||(29329248-29329334)
chr7 (371-494)||(11393430-11393552)
chr7 (200-284)||(48273098-48273182)
chr7 (75-195)||(14257823-14257951)
chr7 (372-494)||(3386232-3386352)
chr7 (215-335)||(3386095-3386215)
chr7 (399-494)||(13869271-13869365)
chr7 (75-207)||(20585135-20585275)
chr7 (399-497)||(38898517-38898614)
chr7 (371-479)||(15082039-15082147)
chr7 (211-323)||(17017694-17017808)
chr7 (371-494)||(18640169-18640291)
chr7 (228-284)||(27848096-27848152)
chr7 (228-283)||(67490-67545)
chr7 (75-138)||(32300747-32300810)
chr7 (372-490)||(13831272-13831388)
chr7 (269-338)||(16461180-16461250)
chr7 (400-486)||(19486851-19486937)
chr7 (212-323)||(9177905-9178017)
chr7 (76-136)||(12714353-12714413)
chr7 (211-323)||(16091528-16091641)
chr7 (371-486)||(16219821-16219935)
chr7 (228-283)||(18005395-18005450)
chr7 (211-323)||(20220427-20220541)
chr7 (228-283)||(44013928-44013983)
chr7 (226-276)||(11858333-11858383)
chr7 (375-452)||(18427433-18427510)
chr7 (223-323)||(9033587-9033689)
chr7 (211-323)||(15008776-15008889)
chr7 (379-482)||(16213530-16213632)
chr7 (352-411)||(18005531-18005590)
chr7 (226-283)||(811449-811507)
chr7 (352-411)||(2280299-2280357)
chr7 (375-490)||(26356141-26356258)
chr7 (375-490)||(26358593-26358710)
chr7 (352-411)||(44014064-44014122)
chr7 (371-494)||(67644-67767)
chr7 (231-411)||(2759899-2760076)
chr7 (211-323)||(14044478-14044591)
chr7 (211-323)||(14354508-14354621)
chr7 (211-323)||(18203581-18203695)
chr7 (75-203)||(12466481-12466617)
chr7 (197-283)||(12901039-12901125)
chr7 (75-138)||(14183867-14183930)
chr7 (211-283)||(14323140-14323214)
chr7 (226-269)||(15605547-15605590)
chr7 (352-411)||(16056214-16056272)
chr7 (151-206)||(16461505-16461560)
chr7 (223-323)||(48990961-48991062)
chr7 (89-168)||(14933112-14933199)
chr7 (89-168)||(15356547-15356634)
chr7 (89-168)||(15360661-15360748)
chr7 (251-312)||(19486962-19487024)
chr7 (352-494)||(47831687-47831829)
chr7 (226-267)||(12317914-12317955)
chr7 (231-276)||(15580468-15580513)
chr7 (374-494)||(17062058-17062177)
chr7 (371-411)||(811310-811350)
chr7 (231-267)||(14933051-14933087)
chr7 (155-195)||(14933118-14933158)
chr7 (231-267)||(15356486-15356522)
chr7 (155-195)||(15356553-15356593)
chr7 (231-267)||(15360600-15360636)
chr7 (155-195)||(15360667-15360707)
chr7 (156-195)||(24274787-24274826)
chr7 (155-206)||(32300802-32300853)
chr7 (346-411)||(12321923-12321988)
chr7 (227-323)||(1868234-1868331)
chr7 (226-267)||(9752035-9752076)
chr7 (251-323)||(11525841-11525913)
chr7 (251-323)||(11772530-11772602)
chr7 (226-267)||(14152280-14152321)
chr7 (89-138)||(15082374-15082423)
chr7 (441-494)||(22072882-22072935)
chr7 (155-207)||(14183823-14183875)
chr7 (368-411)||(16461130-16461174)
chr7 (89-137)||(24274742-24274790)
chr7 (371-402)||(14044651-14044682)
chr7 (371-402)||(14354681-14354712)
chr7 (273-335)||(16213442-16213505)
chr7 (455-494)||(18430692-18430731)
chr7 (368-402)||(1868180-1868214)
chr7 (352-402)||(15008685-15008734)
chr7 (227-322)||(16995968-16996065)
chr7 (368-402)||(20220373-20220407)
chr7 (251-284)||(131132-131165)
chr7 (441-482)||(811239-811280)
chr7 (352-411)||(12255998-12256056)
chr7 (251-284)||(14183764-14183797)
chr7 (125-162)||(15605889-15605926)
chr7 (222-267)||(16275300-16275344)
chr7 (251-284)||(20585301-20585334)
chr7 (399-480)||(24275090-24275170)
chr7 (251-284)||(38519144-38519177)
chr7 (251-323)||(42461721-42461793)
chr7 (444-484)||(2280226-2280266)
chr7 (223-267)||(3271602-3271646)
chr7 (251-283)||(14162025-14162057)
chr7 (482-518)||(14273335-14273371)
chr7 (368-396)||(22072857-22072885)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (228-494)||(10522-10790)
[»] chr2 (142 HSPs)
chr2 (228-494)||(23072048-23072315)
chr2 (228-494)||(23654485-23654752)
chr2 (228-494)||(38213-38481)
chr2 (70-276)||(9784394-9784600)
chr2 (230-486)||(23103502-23103758)
chr2 (228-486)||(21900560-21900819)
chr2 (228-494)||(23060269-23060535)
chr2 (228-494)||(23040288-23040555)
chr2 (228-494)||(8946413-8946679)
chr2 (234-494)||(22738278-22738537)
chr2 (228-490)||(22731337-22731598)
chr2 (228-494)||(22336882-22337137)
chr2 (309-486)||(20308945-20309122)
chr2 (70-218)||(1282772-1282920)
chr2 (70-218)||(31344522-31344669)
chr2 (76-218)||(41531579-41531721)
chr2 (76-218)||(30345590-30345732)
chr2 (164-309)||(38967084-38967230)
chr2 (225-437)||(22741119-22741329)
chr2 (76-218)||(24629053-24629196)
chr2 (76-218)||(27380006-27380149)
chr2 (76-218)||(27384052-27384195)
chr2 (76-218)||(27601181-27601324)
chr2 (76-218)||(10102227-10102370)
chr2 (76-218)||(24648744-24648887)
chr2 (125-335)||(32215253-32215482)
chr2 (164-283)||(24367446-24367565)
chr2 (353-486)||(19671710-19671844)
chr2 (197-309)||(299076-299189)
chr2 (112-218)||(12902090-12902196)
chr2 (371-494)||(24529672-24529795)
chr2 (226-428)||(24679936-24680137)
chr2 (226-411)||(45678310-45678493)
chr2 (211-335)||(43137012-43137136)
chr2 (226-437)||(22758874-22759083)
chr2 (200-334)||(25615970-25616105)
chr2 (198-284)||(6725701-6725787)
chr2 (389-494)||(23659940-23660045)
chr2 (198-284)||(23712383-23712469)
chr2 (375-494)||(23076344-23076464)
chr2 (371-494)||(18808840-18808962)
chr2 (371-494)||(23135487-23135609)
chr2 (371-494)||(23712156-23712278)
chr2 (371-494)||(24367670-24367793)
chr2 (371-494)||(24905776-24905898)
chr2 (371-494)||(24908251-24908373)
chr2 (371-494)||(26505276-26505398)
chr2 (371-494)||(26507754-26507876)
chr2 (371-494)||(39682210-39682332)
chr2 (371-494)||(45029997-45030119)
chr2 (226-428)||(22799291-22799490)
chr2 (226-428)||(24673319-24673520)
chr2 (198-284)||(21177717-21177803)
chr2 (197-283)||(23713204-23713290)
chr2 (371-494)||(24898339-24898461)
chr2 (371-494)||(24900822-24900944)
chr2 (371-494)||(24903299-24903421)
chr2 (197-284)||(7679337-7679424)
chr2 (226-428)||(23019871-23020070)
chr2 (226-428)||(40622375-40622575)
chr2 (379-494)||(43137204-43137318)
chr2 (198-276)||(24643328-24643406)
chr2 (371-494)||(571294-571416)
chr2 (371-494)||(6725892-6726014)
chr2 (200-284)||(19671602-19671686)
chr2 (371-494)||(23709675-23709797)
chr2 (371-494)||(24643093-24643216)
chr2 (371-494)||(28576996-28577118)
chr2 (371-494)||(32039641-32039763)
chr2 (372-494)||(38967272-38967393)
chr2 (227-335)||(23130634-23130743)
chr2 (227-335)||(23133101-23133210)
chr2 (371-494)||(21155203-21155325)
chr2 (75-207)||(17306187-17306327)
chr2 (197-323)||(22413414-22413538)
chr2 (379-494)||(23130768-23130881)
chr2 (379-494)||(23133235-23133348)
chr2 (379-494)||(34402665-34402778)
chr2 (197-283)||(8049-8134)
chr2 (75-205)||(36838904-36839042)
chr2 (226-309)||(22105099-22105183)
chr2 (197-283)||(18787219-18787304)
chr2 (228-297)||(23076247-23076317)
chr2 (425-494)||(23285818-23285887)
chr2 (234-411)||(21318819-21318992)
chr2 (226-411)||(21327750-21327931)
chr2 (226-411)||(25963896-25964076)
chr2 (227-297)||(23657592-23657663)
chr2 (198-265)||(32452243-32452310)
chr2 (231-411)||(37524444-37524620)
chr2 (372-494)||(298914-299034)
chr2 (199-253)||(19795848-19795902)
chr2 (380-494)||(22105319-22105431)
chr2 (379-482)||(32215082-32215184)
chr2 (226-411)||(22812093-22812273)
chr2 (211-323)||(23004516-23004630)
chr2 (226-274)||(23031128-23031176)
chr2 (211-283)||(23791004-23791078)
chr2 (211-283)||(24697843-24697917)
chr2 (226-281)||(25175598-25175653)
chr2 (379-478)||(25616087-25616185)
chr2 (197-279)||(10822939-10823020)
chr2 (228-270)||(20322402-20322444)
chr2 (211-282)||(24688606-24688679)
chr2 (221-283)||(20520470-20520534)
chr2 (352-411)||(22134388-22134446)
chr2 (371-411)||(7910-7950)
chr2 (371-411)||(23713064-23713104)
chr2 (155-207)||(24514974-24515026)
chr2 (371-411)||(25175754-25175794)
chr2 (371-411)||(28405881-28405921)
chr2 (155-207)||(28653714-28653766)
chr2 (227-323)||(43947604-43947702)
chr2 (75-138)||(24514919-24514982)
chr2 (227-335)||(34402803-34402913)
chr2 (352-411)||(7679462-7679520)
chr2 (375-479)||(18787012-18787116)
chr2 (226-267)||(19691922-19691963)
chr2 (226-267)||(24735181-24735222)
chr2 (226-263)||(28405738-28405775)
chr2 (211-323)||(25108648-25108761)
chr2 (211-283)||(18547262-18547336)
chr2 (352-479)||(22413247-22413372)
chr2 (441-484)||(23708726-23708769)
chr2 (75-138)||(28653758-28653821)
chr2 (156-195)||(32215445-32215484)
chr2 (226-276)||(24716828-24716878)
chr2 (352-411)||(10822796-10822854)
chr2 (226-267)||(22134526-22134567)
chr2 (89-138)||(24367393-24367442)
chr2 (318-393)||(23657640-23657713)
chr2 (371-402)||(24697792-24697823)
chr2 (211-309)||(21237502-21237602)
chr2 (251-284)||(17306353-17306386)
chr2 (251-323)||(21115513-21115585)
chr2 (371-400)||(23004653-23004682)
chr2 (373-402)||(23207183-23207212)
chr2 (267-335)||(32215209-32215278)
chr2 (89-138)||(38967031-38967080)
chr2 (251-284)||(39828272-39828305)
chr2 (482-518)||(34492389-34492425)
chr2 (482-518)||(37379421-37379457)
[»] chr3 (233 HSPs)
chr3 (70-391)||(14670449-14670778)
chr3 (70-391)||(14681971-14682300)
chr3 (50-518)||(16795875-16796360)
chr3 (228-494)||(13210426-13210693)
chr3 (228-494)||(12398965-12399231)
chr3 (228-494)||(20698534-20698801)
chr3 (228-494)||(17487613-17487878)
chr3 (228-494)||(17499095-17499360)
chr3 (228-494)||(23083460-23083725)
chr3 (228-497)||(43840689-43840957)
chr3 (227-494)||(40213819-40214085)
chr3 (230-494)||(25476484-25476745)
chr3 (200-485)||(23274415-23274700)
chr3 (228-494)||(18438291-18438556)
chr3 (70-267)||(14665037-14665223)
chr3 (70-267)||(14668193-14668379)
chr3 (228-494)||(14972615-14972876)
chr3 (70-214)||(15464486-15464630)
chr3 (48-215)||(12852887-12853054)
chr3 (76-218)||(15964337-15964479)
chr3 (76-218)||(15968261-15968403)
chr3 (76-218)||(15972185-15972327)
chr3 (76-218)||(37440211-37440353)
chr3 (70-219)||(12339088-12339236)
chr3 (228-482)||(30029591-30029844)
chr3 (70-218)||(19774954-19775102)
chr3 (70-218)||(8489761-8489906)
chr3 (156-312)||(13543677-13543833)
chr3 (70-214)||(16750919-16751063)
chr3 (70-218)||(4589487-4589635)
chr3 (164-335)||(12120050-12120220)
chr3 (312-494)||(13442115-13442296)
chr3 (140-335)||(46821903-46822098)
chr3 (317-494)||(11424858-11425033)
chr3 (75-392)||(10542852-10543158)
chr3 (76-206)||(4107985-4108116)
chr3 (76-206)||(4111837-4111968)
chr3 (76-218)||(11069460-11069603)
chr3 (76-218)||(14498717-14498860)
chr3 (76-218)||(22321056-22321199)
chr3 (76-218)||(22336111-22336254)
chr3 (76-218)||(27410218-27410361)
chr3 (76-218)||(28949114-28949257)
chr3 (351-478)||(12510929-12511057)
chr3 (70-218)||(17317702-17317850)
chr3 (76-218)||(7109088-7109231)
chr3 (76-218)||(7113023-7113166)
chr3 (76-218)||(15616766-15616909)
chr3 (76-218)||(55022257-55022400)
chr3 (199-335)||(8499262-8499398)
chr3 (226-430)||(15878213-15878415)
chr3 (312-494)||(26686729-26686909)
chr3 (76-218)||(11166103-11166246)
chr3 (349-486)||(24340830-24340968)
chr3 (199-335)||(15412173-15412309)
chr3 (199-335)||(27164994-27165130)
chr3 (199-311)||(53301812-53301925)
chr3 (164-283)||(38962219-38962338)
chr3 (226-430)||(23408182-23408383)
chr3 (373-486)||(43550630-43550744)
chr3 (371-494)||(24153307-24153430)
chr3 (198-309)||(44494511-44494623)
chr3 (200-335)||(50242569-50242704)
chr3 (209-335)||(10556739-10556865)
chr3 (197-283)||(10901484-10901570)
chr3 (296-480)||(14572417-14572600)
chr3 (198-284)||(24153492-24153578)
chr3 (269-400)||(10542634-10542764)
chr3 (122-218)||(5222761-5222857)
chr3 (229-428)||(15067438-15067635)
chr3 (228-315)||(26683111-26683199)
chr3 (200-335)||(28194440-28194575)
chr3 (371-494)||(29172726-29172849)
chr3 (371-494)||(38962034-38962157)
chr3 (198-284)||(16283181-16283267)
chr3 (198-284)||(17447024-17447110)
chr3 (197-283)||(52524045-52524131)
chr3 (371-494)||(13151934-13152056)
chr3 (371-494)||(13154399-13154521)
chr3 (371-494)||(16454424-16454546)
chr3 (371-494)||(17446797-17446919)
chr3 (371-494)||(17463075-17463197)
chr3 (371-494)||(34159223-34159345)
chr3 (200-283)||(14234200-14234283)
chr3 (296-480)||(14576942-14577124)
chr3 (226-428)||(16369153-16369352)
chr3 (198-284)||(8898800-8898886)
chr3 (211-335)||(17736951-17737075)
chr3 (226-382)||(855892-856046)
chr3 (371-494)||(28848754-28848876)
chr3 (200-335)||(43550807-43550943)
chr3 (372-494)||(45577981-45578102)
chr3 (269-392)||(10542747-10542869)
chr3 (371-494)||(6469277-6469395)
chr3 (371-490)||(8898991-8899109)
chr3 (221-312)||(15076272-15076364)
chr3 (371-494)||(16282954-16283076)
chr3 (371-494)||(45607050-45607172)
chr3 (371-494)||(55500839-55500961)
chr3 (75-207)||(2842665-2842805)
chr3 (65-195)||(14440973-14441104)
chr3 (379-494)||(55476397-55476510)
chr3 (75-207)||(18700873-18701016)
chr3 (371-494)||(9707750-9707872)
chr3 (371-494)||(10247866-10247988)
chr3 (226-411)||(11862548-11862729)
chr3 (371-494)||(21618345-21618468)
chr3 (198-282)||(24340990-24341074)
chr3 (371-494)||(36166494-36166617)
chr3 (198-283)||(41123601-41123683)
chr3 (198-265)||(53071011-53071078)
chr3 (197-279)||(17661195-17661276)
chr3 (372-494)||(28194592-28194712)
chr3 (374-494)||(7781490-7781609)
chr3 (226-396)||(11849070-11849235)
chr3 (231-428)||(12172556-12172748)
chr3 (399-494)||(8499443-8499537)
chr3 (372-494)||(10556882-10557004)
chr3 (226-428)||(14878681-14878880)
chr3 (399-494)||(15412354-15412448)
chr3 (399-494)||(27165175-27165269)
chr3 (76-162)||(30065372-30065459)
chr3 (231-284)||(13442077-13442130)
chr3 (371-494)||(15977409-15977534)
chr3 (198-283)||(42386139-42386224)
chr3 (352-486)||(15470809-15470941)
chr3 (226-411)||(18384096-18384277)
chr3 (399-494)||(53301650-53301744)
chr3 (228-297)||(11425009-11425079)
chr3 (372-494)||(17737135-17737255)
chr3 (400-486)||(37642372-37642458)
chr3 (372-494)||(44494708-44494828)
chr3 (211-280)||(22110671-22110740)
chr3 (401-486)||(22147632-22147717)
chr3 (226-283)||(32307426-32307483)
chr3 (211-323)||(315851-315965)
chr3 (226-411)||(322347-322528)
chr3 (226-324)||(15467625-15467722)
chr3 (226-411)||(19726082-19726263)
chr3 (371-494)||(41123787-41123909)
chr3 (75-180)||(43890243-43890356)
chr3 (399-494)||(12119868-12119962)
chr3 (111-174)||(14067289-14067352)
chr3 (228-283)||(16097116-16097171)
chr3 (227-281)||(606643-606697)
chr3 (371-488)||(9512825-9512939)
chr3 (125-207)||(14441067-14441149)
chr3 (221-323)||(15206676-15206780)
chr3 (372-494)||(50242721-50242841)
chr3 (209-283)||(12377688-12377764)
chr3 (292-428)||(23077642-23077776)
chr3 (373-478)||(46822161-46822265)
chr3 (227-323)||(15245764-15245862)
chr3 (227-283)||(37251442-37251498)
chr3 (211-323)||(13919097-13919211)
chr3 (352-488)||(49668178-49668310)
chr3 (226-276)||(16909626-16909676)
chr3 (125-207)||(43890183-43890265)
chr3 (226-279)||(1644993-1645046)
chr3 (352-411)||(9520782-9520840)
chr3 (226-283)||(12174566-12174623)
chr3 (397-478)||(12567477-12567557)
chr3 (397-478)||(13543942-13544022)
chr3 (226-267)||(14572365-14572406)
chr3 (226-267)||(23053391-23053432)
chr3 (231-276)||(26196732-26196777)
chr3 (135-195)||(13520978-13521038)
chr3 (155-207)||(35353358-35353410)
chr3 (226-269)||(2898108-2898151)
chr3 (352-482)||(16097214-16097341)
chr3 (75-138)||(35353303-35353366)
chr3 (211-309)||(15264869-15264969)
chr3 (125-195)||(15565301-15565371)
chr3 (75-137)||(19884859-19884921)
chr3 (211-329)||(43925691-43925809)
chr3 (227-335)||(55476262-55476372)
chr3 (226-267)||(327452-327493)
chr3 (226-267)||(7793637-7793678)
chr3 (226-267)||(9512686-9512727)
chr3 (226-267)||(9520661-9520702)
chr3 (352-411)||(12174427-12174485)
chr3 (231-276)||(12496019-12496064)
chr3 (251-335)||(22147808-22147892)
chr3 (226-267)||(49668390-49668431)
chr3 (155-207)||(10562476-10562528)
chr3 (223-323)||(10562524-10562626)
chr3 (242-411)||(11298711-11298876)
chr3 (371-411)||(14234382-14234422)
chr3 (336-428)||(15051369-15051461)
chr3 (371-411)||(16103685-16103725)
chr3 (159-207)||(42353683-42353731)
chr3 (371-411)||(42386323-42386363)
chr3 (371-411)||(52523906-52523946)
chr3 (242-276)||(3403258-3403292)
chr3 (156-202)||(19884816-19884862)
chr3 (168-218)||(30065432-30065482)
chr3 (251-312)||(37642541-37642603)
chr3 (158-207)||(5214723-5214772)
chr3 (76-113)||(5220536-5220573)
chr3 (226-267)||(20461787-20461828)
chr3 (371-479)||(22110461-22110569)
chr3 (226-267)||(23077780-23077821)
chr3 (352-411)||(32307564-32307622)
chr3 (371-411)||(1644849-1644889)
chr3 (89-137)||(13543632-13543680)
chr3 (221-284)||(21618218-21618282)
chr3 (251-323)||(32404427-32404499)
chr3 (221-284)||(36166324-36166388)
chr3 (223-284)||(43890124-43890187)
chr3 (75-138)||(5214643-5214706)
chr3 (227-283)||(9577452-9577510)
chr3 (75-138)||(10562421-10562484)
chr3 (231-274)||(14872290-14872333)
chr3 (273-335)||(15076205-15076268)
chr3 (273-335)||(22147720-22147783)
chr3 (242-276)||(12852837-12852871)
chr3 (226-267)||(15482452-15482494)
chr3 (352-402)||(43925845-43925894)
chr3 (273-334)||(46822123-46822185)
chr3 (89-138)||(12120224-12120273)
chr3 (125-162)||(13543679-13543716)
chr3 (457-494)||(14234472-14234509)
chr3 (230-267)||(14577135-14577172)
chr3 (251-284)||(18700814-18700847)
chr3 (251-284)||(42353624-42353657)
chr3 (166-207)||(44269408-44269449)
chr3 (223-285)||(44269445-44269509)
chr3 (125-162)||(46821921-46821958)
chr3 (273-312)||(13543837-13543877)
chr3 (223-284)||(14441145-14441208)
chr3 (155-195)||(15565298-15565338)
chr3 (223-284)||(35353406-35353469)
chr3 (482-518)||(35961785-35961821)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (228-494)||(2499-2766)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (228-494)||(31823-32089)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (228-486)||(46750-47009)
scaffold0064 (226-276)||(65022-65072)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (228-494)||(13251-13519)
[»] chr6 (179 HSPs)
chr6 (228-486)||(35245340-35245600)
chr6 (228-494)||(20638382-20638649)
chr6 (228-494)||(1561058-1561325)
chr6 (70-276)||(22074502-22074708)
chr6 (85-276)||(2076871-2077062)
chr6 (226-486)||(22831262-22831517)
chr6 (228-486)||(16920737-16920996)
chr6 (227-484)||(11185267-11185526)
chr6 (228-494)||(22780326-22780591)
chr6 (231-494)||(29060300-29060562)
chr6 (228-486)||(28496578-28496836)
chr6 (228-486)||(29808989-29809247)
chr6 (228-494)||(17287895-17288160)
chr6 (82-518)||(22805370-22805789)
chr6 (312-518)||(19773797-19774003)
chr6 (226-494)||(25629454-25629719)
chr6 (70-218)||(23414289-23414437)
chr6 (228-482)||(25611840-25612093)
chr6 (228-482)||(25603502-25603755)
chr6 (75-284)||(19773988-19774204)
chr6 (70-218)||(1643894-1644042)
chr6 (70-218)||(31478558-31478706)
chr6 (156-323)||(34963068-34963235)
chr6 (317-494)||(20361059-20361236)
chr6 (156-312)||(23992125-23992281)
chr6 (70-218)||(16623738-16623886)
chr6 (76-218)||(14471603-14471745)
chr6 (238-494)||(20076470-20076722)
chr6 (76-218)||(11566251-11566394)
chr6 (76-218)||(12619416-12619559)
chr6 (76-218)||(22862335-22862478)
chr6 (76-218)||(23394457-23394600)
chr6 (76-218)||(8243222-8243365)
chr6 (76-218)||(23989309-23989452)
chr6 (226-430)||(19872873-19873075)
chr6 (296-494)||(18409926-18410126)
chr6 (317-494)||(19303639-19303814)
chr6 (226-430)||(19862731-19862933)
chr6 (226-430)||(22432002-22432204)
chr6 (226-430)||(22438552-22438754)
chr6 (226-437)||(22335052-22335261)
chr6 (226-437)||(25642342-25642551)
chr6 (311-494)||(20593615-20593795)
chr6 (226-428)||(15894602-15894801)
chr6 (75-169)||(27556065-27556159)
chr6 (76-188)||(16759626-16759739)
chr6 (212-335)||(8227706-8227830)
chr6 (200-335)||(19848283-19848419)
chr6 (76-218)||(19869978-19870122)
chr6 (76-162)||(22948506-22948592)
chr6 (76-162)||(22952462-22952548)
chr6 (76-162)||(23870950-23871036)
chr6 (76-162)||(23874906-23874992)
chr6 (198-284)||(1595255-1595341)
chr6 (200-309)||(4642962-4643072)
chr6 (211-335)||(3852341-3852465)
chr6 (198-310)||(30676979-30677092)
chr6 (371-494)||(1595446-1595568)
chr6 (371-494)||(2291323-2291445)
chr6 (371-494)||(18334735-18334857)
chr6 (371-494)||(19004943-19005065)
chr6 (371-494)||(24422444-24422566)
chr6 (371-494)||(33861691-33861813)
chr6 (198-284)||(20557263-20557349)
chr6 (197-283)||(23019122-23019208)
chr6 (371-494)||(19859062-19859184)
chr6 (371-494)||(33864175-33864297)
chr6 (133-284)||(17742849-17743001)
chr6 (197-283)||(25644057-25644143)
chr6 (371-494)||(8054926-8055048)
chr6 (226-411)||(18906866-18907046)
chr6 (371-494)||(26924783-26924905)
chr6 (198-303)||(25754554-25754660)
chr6 (371-494)||(1541054-1541176)
chr6 (226-411)||(18692092-18692273)
chr6 (226-428)||(31165006-31165201)
chr6 (379-494)||(3852160-3852273)
chr6 (379-494)||(25754715-25754828)
chr6 (197-283)||(19668091-19668176)
chr6 (197-283)||(20108855-20108940)
chr6 (198-263)||(18456445-18456510)
chr6 (371-494)||(12742214-12742336)
chr6 (226-411)||(16523564-16523745)
chr6 (70-195)||(19656762-19656888)
chr6 (387-494)||(22782139-22782246)
chr6 (226-411)||(21740212-21740398)
chr6 (227-480)||(16965428-16965672)
chr6 (76-162)||(18918006-18918092)
chr6 (352-482)||(19652080-19652208)
chr6 (198-263)||(18461605-18461670)
chr6 (226-283)||(22081044-22081101)
chr6 (124-205)||(23538215-23538296)
chr6 (374-494)||(25688401-25688521)
chr6 (401-493)||(8227611-8227703)
chr6 (82-195)||(15705985-15706106)
chr6 (371-494)||(20557035-20557158)
chr6 (198-284)||(16448858-16448945)
chr6 (227-297)||(19303790-19303861)
chr6 (197-283)||(9100888-9100973)
chr6 (432-494)||(16496204-16496266)
chr6 (125-207)||(17105321-17105403)
chr6 (130-207)||(19656625-19656702)
chr6 (227-284)||(20593574-20593631)
chr6 (374-494)||(25714319-25714439)
chr6 (226-283)||(27333441-27333498)
chr6 (226-283)||(27394181-27394238)
chr6 (373-482)||(34963266-34963374)
chr6 (124-200)||(16759708-16759784)
chr6 (228-284)||(20361226-20361282)
chr6 (226-411)||(21830621-21830801)
chr6 (75-195)||(17742750-17742878)
chr6 (379-478)||(19848116-19848214)
chr6 (227-276)||(16960334-16960383)
chr6 (352-494)||(22080824-22080963)
chr6 (211-267)||(13019222-13019278)
chr6 (125-205)||(15705942-15706022)
chr6 (228-283)||(19651944-19651999)
chr6 (152-207)||(27126610-27126665)
chr6 (379-482)||(30676871-30676973)
chr6 (226-267)||(4738854-4738895)
chr6 (352-411)||(20109021-20109079)
chr6 (226-411)||(22408472-22408654)
chr6 (372-411)||(13019394-13019433)
chr6 (226-285)||(15041803-15041861)
chr6 (231-411)||(18180254-18180430)
chr6 (81-195)||(20182317-20182440)
chr6 (124-175)||(20182402-20182453)
chr6 (124-175)||(22153538-22153589)
chr6 (81-195)||(22153551-22153674)
chr6 (226-265)||(31155695-31155734)
chr6 (374-479)||(16448682-16448787)
chr6 (251-323)||(16492921-16492993)
chr6 (226-267)||(17803975-17804016)
chr6 (125-178)||(19656746-19656799)
chr6 (226-267)||(27325902-27325943)
chr6 (161-218)||(27416500-27416557)
chr6 (349-482)||(31155505-31155634)
chr6 (211-323)||(33442778-33442892)
chr6 (349-436)||(4186251-4186339)
chr6 (349-436)||(4738706-4738794)
chr6 (352-479)||(19668257-19668383)
chr6 (166-218)||(22948563-22948615)
chr6 (166-218)||(22952519-22952571)
chr6 (211-323)||(23076462-23076576)
chr6 (166-218)||(23871007-23871059)
chr6 (166-218)||(23874963-23875015)
chr6 (75-138)||(7825378-7825441)
chr6 (379-478)||(23992329-23992427)
chr6 (230-264)||(18926656-18926690)
chr6 (75-137)||(27126658-27126720)
chr6 (349-482)||(4185929-4186058)
chr6 (226-267)||(4186118-4186159)
chr6 (155-203)||(7825433-7825481)
chr6 (223-284)||(18452962-18453025)
chr6 (226-411)||(21766448-21766628)
chr6 (89-137)||(23992080-23992128)
chr6 (352-411)||(25644224-25644281)
chr6 (221-284)||(25714185-25714249)
chr6 (211-323)||(35007881-35007994)
chr6 (441-484)||(23019377-23019420)
chr6 (125-179)||(17105288-17105342)
chr6 (172-218)||(18917983-18918029)
chr6 (260-309)||(18929236-18929286)
chr6 (132-162)||(27416523-27416553)
chr6 (273-334)||(34963228-34963290)
chr6 (352-411)||(23019289-23019347)
chr6 (125-162)||(23992127-23992164)
chr6 (125-162)||(34963070-34963107)
chr6 (482-518)||(15174352-15174388)
chr6 (482-518)||(18913775-18913811)
chr6 (482-518)||(18937033-18937069)
chr6 (251-283)||(19362199-19362231)
chr6 (223-284)||(19656566-19656629)
chr6 (155-195)||(19656695-19656735)
chr6 (444-484)||(20109112-20109152)
chr6 (251-283)||(23528417-23528449)
chr6 (251-283)||(23538324-23538356)
chr6 (221-284)||(25656521-25656585)
chr6 (182-218)||(27556159-27556195)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (228-486)||(5235-5494)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (228-497)||(11539-11809)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (228-494)||(33878-34145)
scaffold0175 (228-494)||(30-295)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (228-494)||(168077-168343)
scaffold0011 (228-494)||(51670-51935)
scaffold0011 (211-323)||(38391-38505)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (228-486)||(1705-1966)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (228-494)||(15562-15830)
scaffold0114 (227-382)||(7049-7201)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (70-276)||(6407-6613)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (228-494)||(31915-32183)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (228-494)||(4468-4734)
[»] scaffold0023 (15 HSPs)
scaffold0023 (243-494)||(119646-119897)
scaffold0023 (125-335)||(17935-18145)
scaffold0023 (371-494)||(94308-94430)
scaffold0023 (198-284)||(44160-44246)
scaffold0023 (231-428)||(38644-38838)
scaffold0023 (371-494)||(44351-44473)
scaffold0023 (226-284)||(40409-40467)
scaffold0023 (226-283)||(101286-101343)
scaffold0023 (227-283)||(100099-100155)
scaffold0023 (371-411)||(101404-101444)
scaffold0023 (371-411)||(100278-100318)
scaffold0023 (156-195)||(18108-18147)
scaffold0023 (371-411)||(40351-40391)
scaffold0023 (273-335)||(17891-17954)
scaffold0023 (89-137)||(18144-18192)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (50-376)||(224-547)
scaffold0484 (357-518)||(550-709)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (228-494)||(4606-4871)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (228-494)||(8236-8501)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (228-486)||(1040-1303)
scaffold0106 (371-491)||(15340-15460)
scaffold0106 (398-486)||(7192-7280)
scaffold0106 (198-284)||(15522-15608)
scaffold0106 (251-323)||(19923-19995)
[»] scaffold0046 (6 HSPs)
scaffold0046 (226-494)||(1750-2019)
scaffold0046 (226-494)||(4305-4574)
scaffold0046 (228-494)||(28169-28436)
scaffold0046 (432-494)||(11252-11314)
scaffold0046 (251-323)||(26342-26414)
scaffold0046 (251-323)||(17193-17265)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (228-494)||(12969-13233)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (228-494)||(8628-8893)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (228-486)||(51336-51596)
scaffold0032 (125-207)||(63454-63536)
scaffold0032 (87-137)||(63535-63585)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (230-486)||(174523-174780)
scaffold0021 (312-494)||(121607-121788)
scaffold0021 (228-284)||(121566-121622)
scaffold0021 (198-323)||(136661-136784)
scaffold0021 (352-481)||(136491-136619)
scaffold0021 (376-481)||(145199-145304)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (228-486)||(16036-16296)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (228-494)||(1608-1873)
scaffold0016 (78-218)||(208187-208327)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (228-494)||(4932-5196)
[»] scaffold0292 (6 HSPs)
scaffold0292 (228-494)||(3227-3492)
scaffold0292 (270-494)||(143-365)
scaffold0292 (75-195)||(4329-4449)
scaffold0292 (228-308)||(10264-10345)
scaffold0292 (125-207)||(4412-4494)
scaffold0292 (223-284)||(4490-4553)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (237-494)||(39679-39935)
scaffold0080 (223-428)||(18879-19081)
scaffold0080 (197-283)||(20121-20206)
scaffold0080 (226-276)||(16788-16838)
scaffold0080 (371-401)||(20072-20102)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (227-494)||(17316-17586)
scaffold0056 (252-428)||(14252-14425)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (228-490)||(128506-128769)
scaffold0031 (70-218)||(36685-36833)
scaffold0031 (226-430)||(65960-66161)
scaffold0031 (226-267)||(53343-53384)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (200-486)||(18134-18419)
scaffold0247 (198-335)||(2411-2547)
scaffold0247 (399-494)||(2272-2366)
[»] scaffold0601 (3 HSPs)
scaffold0601 (27-188)||(8093-8254)
scaffold0601 (124-207)||(8041-8124)
scaffold0601 (231-284)||(7982-8037)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (45-215)||(8167-8337)
scaffold0142 (198-284)||(16483-16569)
scaffold0142 (400-494)||(16710-16803)
scaffold0142 (242-276)||(8117-8151)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (309-486)||(1156-1333)
scaffold0598 (228-284)||(1315-1372)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (58-215)||(25173-25330)
scaffold0124 (199-312)||(38562-38676)
scaffold0124 (399-486)||(38363-38450)
scaffold0124 (226-411)||(42384-42566)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (226-490)||(16703-16962)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (238-494)||(340046-340299)
scaffold0003 (371-494)||(158593-158716)
scaffold0003 (161-218)||(70804-70861)
scaffold0003 (132-162)||(70808-70838)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (270-486)||(20707-20924)
scaffold0088 (228-323)||(10072-10168)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (230-494)||(3249-3509)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (76-218)||(14686-14828)
scaffold0141 (356-494)||(39361-39499)
scaffold0141 (228-323)||(37105-37200)
[»] scaffold0012 (5 HSPs)
scaffold0012 (78-218)||(189976-190116)
scaffold0012 (200-275)||(225209-225284)
scaffold0012 (352-411)||(225335-225393)
scaffold0012 (226-259)||(5021-5054)
scaffold0012 (226-267)||(25245-25286)
[»] scaffold0494 (4 HSPs)
scaffold0494 (125-335)||(12581-12791)
scaffold0494 (379-482)||(12410-12512)
scaffold0494 (156-195)||(12754-12793)
scaffold0494 (98-137)||(12790-12829)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (227-494)||(27634-27899)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (349-494)||(1147-1292)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (70-218)||(11354-11502)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (70-218)||(36563-36711)
scaffold0109 (125-211)||(1059-1145)
scaffold0109 (156-195)||(1108-1147)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (75-218)||(73893-74036)
scaffold0013 (198-283)||(30043-30128)
scaffold0013 (371-479)||(30235-30343)
scaffold0013 (226-267)||(2947-2988)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (75-218)||(90-234)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (227-494)||(33055-33318)
scaffold0120 (227-494)||(45687-45950)
scaffold0120 (227-494)||(17428-17690)
scaffold0120 (312-494)||(15955-16135)
scaffold0120 (228-296)||(15914-15983)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (67-218)||(20778-20933)
scaffold0293 (211-284)||(17234-17309)
[»] scaffold0029 (7 HSPs)
scaffold0029 (76-218)||(66098-66240)
scaffold0029 (76-218)||(62182-62324)
scaffold0029 (70-218)||(79925-80074)
scaffold0029 (200-334)||(11070-11205)
scaffold0029 (290-428)||(12578-12714)
scaffold0029 (226-267)||(10482-10523)
scaffold0029 (379-482)||(11187-11289)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (312-494)||(6223-6404)
scaffold0647 (228-284)||(6389-6445)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (226-430)||(69547-69749)
scaffold0004 (211-323)||(332048-332163)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (76-218)||(5673-5816)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (76-218)||(11811-11954)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (76-218)||(33260-33403)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (76-218)||(67875-68018)
scaffold0061 (75-207)||(19617-19757)
[»] scaffold0486 (3 HSPs)
scaffold0486 (70-218)||(9235-9384)
scaffold0486 (76-207)||(8117-8256)
scaffold0486 (251-284)||(8282-8315)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (76-218)||(59293-59436)
scaffold0028 (371-494)||(136577-136699)
scaffold0028 (371-494)||(139046-139168)
scaffold0028 (371-494)||(141515-141637)
scaffold0028 (371-494)||(143984-144106)
scaffold0028 (371-491)||(134108-134227)
scaffold0028 (352-488)||(132545-132677)
scaffold0028 (226-267)||(132462-132503)
[»] scaffold0034 (9 HSPs)
scaffold0034 (223-392)||(116665-116835)
scaffold0034 (197-283)||(32252-32338)
scaffold0034 (269-392)||(116923-117044)
scaffold0034 (269-390)||(116818-116938)
scaffold0034 (310-395)||(117025-117108)
scaffold0034 (371-411)||(32437-32477)
scaffold0034 (75-138)||(116562-116625)
scaffold0034 (155-207)||(116617-116669)
scaffold0034 (444-484)||(32510-32550)
[»] scaffold0278 (6 HSPs)
scaffold0278 (41-195)||(7112-7274)
scaffold0278 (251-394)||(7342-7482)
scaffold0278 (227-283)||(5393-5449)
scaffold0278 (293-395)||(7486-7585)
scaffold0278 (133-207)||(7245-7316)
scaffold0278 (371-411)||(5547-5587)
[»] scaffold0101 (3 HSPs)
scaffold0101 (226-430)||(9125-9327)
scaffold0101 (198-284)||(1568-1654)
scaffold0101 (374-479)||(1436-1541)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (303-494)||(3285-3478)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (199-309)||(10380-10491)
scaffold0454 (379-475)||(10672-10767)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (199-309)||(8849-8960)
scaffold0363 (379-476)||(9141-9237)
[»] scaffold0145 (7 HSPs)
scaffold0145 (312-490)||(32783-32960)
scaffold0145 (349-494)||(38637-38783)
scaffold0145 (312-454)||(32317-32458)
scaffold0145 (371-494)||(9645-9768)
scaffold0145 (228-297)||(32276-32346)
scaffold0145 (228-297)||(32742-32812)
scaffold0145 (228-284)||(38561-38617)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (227-430)||(19735-19935)
scaffold0139 (211-329)||(38162-38281)
scaffold0139 (371-402)||(38297-38328)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (351-494)||(39736-39880)
scaffold0026 (317-494)||(25742-25918)
scaffold0026 (228-284)||(25696-25752)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (198-310)||(161396-161509)
scaffold0007 (372-494)||(161233-161355)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (199-312)||(11165-11279)
scaffold0461 (399-486)||(11391-11478)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (226-430)||(15841-16042)
scaffold0297 (226-430)||(10683-10882)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (226-484)||(193086-193341)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (228-422)||(10055-10247)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (226-428)||(35083-35282)
scaffold0042 (250-310)||(24403-24464)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (226-428)||(16513-16713)
scaffold0096 (349-420)||(20885-20957)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (199-309)||(38966-39077)
scaffold0074 (70-145)||(51300-51375)
scaffold0074 (399-494)||(38801-38895)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (112-218)||(4443-4549)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (226-430)||(36208-36409)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (198-335)||(500820-500958)
scaffold0001 (352-482)||(160570-160697)
scaffold0001 (372-494)||(85723-85845)
scaffold0001 (228-279)||(160434-160485)
scaffold0001 (232-315)||(204642-204724)
scaffold0001 (397-480)||(501001-501083)
scaffold0001 (269-334)||(85820-85885)
scaffold0001 (281-335)||(85862-85915)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (226-430)||(7979-8180)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (228-352)||(1-126)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (226-430)||(17989-18191)
scaffold0043 (231-267)||(77448-77483)
[»] scaffold0819 (2 HSPs)
scaffold0819 (371-494)||(4110-4233)
scaffold0819 (226-276)||(1876-1926)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (198-329)||(1310-1440)
scaffold0530 (352-494)||(1133-1274)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (125-267)||(29251-29382)
scaffold0205 (155-195)||(29248-29288)
scaffold0205 (104-138)||(29222-29256)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (200-335)||(1352-1488)
scaffold0184 (379-486)||(1176-1283)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (70-162)||(10395-10487)
scaffold0166 (166-267)||(10334-10424)
[»] scaffold0228 (5 HSPs)
scaffold0228 (310-494)||(4350-4530)
scaffold0228 (310-494)||(11932-12112)
scaffold0228 (310-494)||(21884-22064)
scaffold0228 (226-284)||(21843-21901)
scaffold0228 (226-267)||(18907-18949)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (226-428)||(18619-18819)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (226-428)||(3494-3694)
scaffold0149 (226-428)||(7925-8125)
scaffold0149 (379-484)||(29836-29940)
scaffold0149 (251-335)||(29726-29811)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (198-284)||(11769-11855)
scaffold0394 (371-494)||(11960-12083)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (223-428)||(10244-10447)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (226-411)||(281077-281260)
scaffold0005 (215-323)||(14395-14505)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (195-276)||(1-82)
scaffold0327 (228-323)||(3596-3690)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (228-331)||(20425-20529)
scaffold0305 (355-392)||(20553-20590)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (226-428)||(14416-14615)
scaffold0081 (226-428)||(38856-39055)
scaffold0081 (226-428)||(23432-23631)
scaffold0081 (223-323)||(4971-5072)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (231-428)||(5852-6047)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (198-284)||(52294-52380)
scaffold0075 (197-283)||(53865-53950)
scaffold0075 (352-411)||(53726-53784)
[»] scaffold0111 (7 HSPs)
scaffold0111 (226-428)||(32199-32396)
scaffold0111 (75-207)||(20014-20154)
scaffold0111 (82-132)||(7050-7100)
scaffold0111 (82-132)||(14169-14219)
scaffold0111 (166-211)||(7093-7138)
scaffold0111 (166-211)||(14212-14257)
scaffold0111 (251-284)||(19955-19988)
[»] scaffold2014 (2 HSPs)
scaffold2014 (197-281)||(752-836)
scaffold2014 (352-476)||(919-1041)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (197-281)||(8378-8462)
scaffold0507 (352-476)||(8173-8295)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (371-494)||(20644-20766)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (226-428)||(21968-22169)
scaffold0210 (226-428)||(29860-30061)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (371-494)||(44806-44929)
scaffold0122 (198-277)||(47042-47121)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (371-494)||(40297-40419)
scaffold0044 (226-267)||(12693-12735)
scaffold0044 (226-267)||(18977-19019)
[»] scaffold0697 (2 HSPs)
scaffold0697 (198-284)||(6308-6394)
scaffold0697 (371-411)||(6499-6540)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (227-428)||(1093-1292)
scaffold0261 (200-308)||(15412-15521)
scaffold0261 (372-494)||(15563-15683)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (227-430)||(23599-23798)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (228-324)||(1147-1244)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (228-428)||(1634-1833)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (356-494)||(75313-75451)
scaffold0049 (228-323)||(77612-77707)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (75-207)||(13917-14057)
scaffold0452 (251-284)||(13858-13891)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (226-428)||(4971-5170)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (125-211)||(10656-10742)
scaffold0546 (89-137)||(10609-10657)
scaffold0546 (156-195)||(10654-10693)
[»] scaffold0022 (7 HSPs)
scaffold0022 (374-494)||(116328-116449)
scaffold0022 (197-281)||(44322-44405)
scaffold0022 (197-281)||(78043-78126)
scaffold0022 (231-411)||(73947-74123)
scaffold0022 (211-323)||(129209-129323)
scaffold0022 (352-402)||(78208-78257)
scaffold0022 (221-284)||(116188-116252)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (371-494)||(13289-13411)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (371-494)||(37718-37840)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (226-393)||(2030-2193)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (230-430)||(178657-178853)
scaffold0020 (352-494)||(15876-16017)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (227-335)||(4913-5020)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (226-376)||(48662-48810)
scaffold0102 (228-281)||(19011-19064)
scaffold0102 (371-411)||(19166-19206)
scaffold0102 (441-482)||(19236-19277)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (223-396)||(2582-2752)
scaffold0158 (223-396)||(6248-6418)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (371-494)||(13844-13966)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (197-280)||(10281-10364)
scaffold0078 (368-407)||(10426-10465)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (226-491)||(4276-4536)
[»] scaffold0207 (9 HSPs)
scaffold0207 (125-207)||(15545-15627)
scaffold0207 (132-195)||(15689-15752)
scaffold0207 (229-283)||(2959-3013)
scaffold0207 (125-195)||(15623-15693)
scaffold0207 (125-195)||(15656-15726)
scaffold0207 (352-411)||(2821-2879)
scaffold0207 (125-195)||(15590-15660)
scaffold0207 (125-195)||(15722-15792)
scaffold0207 (251-283)||(15487-15519)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (125-239)||(801-914)
scaffold0058 (125-186)||(886-947)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (352-484)||(6704-6833)
scaffold0556 (228-283)||(6568-6623)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (198-258)||(31868-31928)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (228-486)||(23987-24255)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (352-482)||(45900-46027)
scaffold0125 (228-283)||(46108-46163)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (231-411)||(46910-47085)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (155-218)||(28796-28859)
scaffold0019 (89-138)||(28755-28804)
scaffold0019 (125-162)||(28799-28836)
[»] scaffold1662 (2 HSPs)
scaffold1662 (125-207)||(633-715)
scaffold1662 (155-195)||(678-718)
[»] scaffold0621 (6 HSPs)
scaffold0621 (197-283)||(8186-8271)
scaffold0621 (226-283)||(1863-1920)
scaffold0621 (226-283)||(6280-6337)
scaffold0621 (352-411)||(8352-8410)
scaffold0621 (371-411)||(6436-6476)
scaffold0621 (441-494)||(6506-6557)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (125-207)||(19274-19356)
scaffold0203 (251-283)||(19216-19248)
[»] scaffold0476 (4 HSPs)
scaffold0476 (229-329)||(12512-12611)
scaffold0476 (352-494)||(12647-12788)
scaffold0476 (226-276)||(5349-5399)
scaffold0476 (226-276)||(6544-6594)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (226-411)||(7311-7491)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (226-411)||(21705-21886)
scaffold0037 (380-494)||(81978-82091)
scaffold0037 (226-283)||(22986-23043)
scaffold0037 (352-486)||(22774-22905)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (211-283)||(117942-118014)
scaffold0010 (228-283)||(129655-129710)
scaffold0010 (352-411)||(129791-129848)
scaffold0010 (251-284)||(419-452)
scaffold0010 (251-284)||(6787-6820)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (211-323)||(106051-106165)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (372-494)||(5-125)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (197-283)||(8389-8474)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (221-323)||(2417-2521)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (211-323)||(103908-104019)
scaffold0040 (155-205)||(102311-102361)
scaffold0040 (75-138)||(102353-102416)
scaffold0040 (251-284)||(10911-10944)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (228-329)||(14971-15071)
scaffold0008 (371-482)||(14805-14916)
scaffold0008 (226-267)||(1665-1705)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (231-411)||(4190-4365)
[»] scaffold0420 (4 HSPs)
scaffold0420 (211-283)||(13998-14072)
scaffold0420 (211-283)||(6544-6618)
scaffold0420 (371-402)||(6414-6445)
scaffold0420 (371-402)||(13868-13899)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (226-276)||(1018-1068)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (125-207)||(26-108)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (197-283)||(271-356)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (234-411)||(2265-2433)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (368-486)||(10645-10762)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (221-283)||(12311-12373)
scaffold0413 (371-411)||(12472-12512)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (231-379)||(14849-14992)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (197-281)||(1681-1774)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (352-407)||(971-1024)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (211-323)||(1431-1545)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (211-283)||(16379-16451)
scaffold0357 (368-479)||(16209-16320)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (371-494)||(6510-6633)
scaffold0333 (371-494)||(13890-14013)
scaffold0333 (226-283)||(6354-6411)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (215-323)||(22014-22124)
[»] scaffold0628 (4 HSPs)
scaffold0628 (352-488)||(2908-3040)
scaffold0628 (352-411)||(3284-3342)
scaffold0628 (226-267)||(3422-3463)
scaffold0628 (226-267)||(7982-8023)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (350-411)||(28946-29006)
scaffold0211 (228-283)||(29085-29140)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (352-488)||(31985-32117)
scaffold0150 (226-267)||(31864-31905)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (371-486)||(12842-12956)
scaffold0138 (249-283)||(12709-12743)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (230-276)||(1002-1048)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (231-276)||(17422-17467)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (211-281)||(24839-24911)
scaffold0123 (371-402)||(25012-25043)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (371-411)||(31-71)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (211-283)||(2114-2186)
scaffold0737 (371-402)||(1984-2015)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (155-207)||(10704-10756)
scaffold0301 (76-138)||(10650-10712)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (227-323)||(56001-56099)
scaffold0077 (136-180)||(20943-20987)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (231-411)||(156-332)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (226-413)||(1585-1768)
scaffold0104 (226-413)||(9268-9451)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (226-408)||(1665-1842)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (226-411)||(650-830)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (226-267)||(3440-3481)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (226-267)||(66702-66743)
scaffold0036 (242-411)||(68648-68811)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (251-322)||(4874-4945)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (226-411)||(6586-6766)
scaffold0412 (226-267)||(14036-14077)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (296-411)||(1316-1430)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (171-219)||(6426-6474)
scaffold0299 (226-267)||(6470-6510)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (228-276)||(66291-66338)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (226-395)||(19486-19650)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (254-323)||(14365-14434)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (346-411)||(29-94)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (254-323)||(12360-12429)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (211-324)||(2136-2251)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (227-323)||(8636-8734)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (296-382)||(8360-8445)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (226-276)||(33306-33356)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (346-411)||(27306-27371)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (226-267)||(9125-9165)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (457-494)||(6222-6259)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (251-323)||(10411-10483)
scaffold0107 (251-283)||(35952-35984)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (482-518)||(10340-10376)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (482-518)||(7987-8023)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (251-283)||(1666-1698)


Alignment Details
Target: scaffold0165 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 53 - 518
Target Start/End: Original strand, 3098 - 3560
Alignment:
Q  53 taagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataatt 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3098 taagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgataatt 3197  T
Q  153 catcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatat 252  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198 cgttaacaacttagcaacacatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgtgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatat 3297  T
Q  253 gcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctc 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  3298 gcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaa-tttgagctaaagctc 3394  T
Q  353 caacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395 catcgtggtgagtacaaagcttcagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgacttcttaaacaacttaattcgacaacctctta 3493  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3494 tattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 3560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 53 - 518
Target Start/End: Original strand, 7161 - 7624
Alignment:
Q  53 taagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataatt 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7161 taagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgataatt 7260  T
Q  153 catcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatat 252  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7261 cgttaacaacttagcaacacatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgtgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatat 7360  T
Q  253 gcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctc 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  |||||    |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  7361 gcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaaaggttattgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaa-tttgagctaaagctc 7458  T
Q  353 caacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7459 catcgtggtgagtacaaagcttcagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactagacttcttaaacaacttaattcgacaacctctta 7557  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7558 tattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 7624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28113 - 28028
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28113 actttgactcgacaa-tgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 28028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27969 - 27858
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  ||| |||| |||| |  | || ||||||||||| |||||||| ||    
T  27969 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataat 27871  T
Q  467 ttggaacatcatc 479  Q
    |||||||||||||    
T  27870 ttggaacatcatc 27858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 136)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 45 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22131627 - 22131159
Alignment:
Q  45 caacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcataga 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22131627 caacatcataagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagatgacagctcaacaactcataga 22131528  T
Q  145 tgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacc 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131527 tgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacc 22131428  T
Q  245 tcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaat 344  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||      
T  22131427 tcttatattcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaa-tttgagc 22131331  T
Q  345 taatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgaca 443  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||   |      
T  22131330 taaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcataat--catc 22131234  T
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22131233 atctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 22131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 45 - 518
Target Start/End: Original strand, 48602840 - 48603309
Alignment:
Q  45 caacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcataga 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48602840 caacatcataagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcagcaactcataga 48602939  T
Q  145 tgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacc 244  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48602940 tgataattcattaacagcttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacc 48603039  T
Q  245 tcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||    |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||      
T  48603040 tcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaaaggttattgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaa-tttgagc 48603137  T
Q  345 taatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgaca 443  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | |||||||||| | ||||   |      
T  48603138 taaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatcataat--catc 48603234  T
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48603235 atctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 48603309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 38801753 - 38801494
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38801753 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 38801654  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38801653 ccatcgctaattttgagttaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgcttatgcatggactcgacctctta 38801554  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38801553 aacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 38801494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27251094 - 27250828
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27251094 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctaggacatcaagccc 27250995  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27250994 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaatgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccctatcaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 27250896  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27250895 aacatcttaattcgacaatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 27250828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41782020 - 41781814
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41782020 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 41781921  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41781920 ctcatggatgataattcatcaacaacagctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaaattagacctcttatatgtatgtggtaccaatac 41781821  T
Q  270 agggcat 276  Q
    |||||||    
T  41781820 agggcat 41781814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 230 - 494
Target Start/End: Original strand, 22532028 - 22532291
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22532028 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagtccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccc 22532127  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    |||| |||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22532128 atcggtaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 22532225  T
Q  428 acaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532226 acatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 22532291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 198 - 486
Target Start/End: Original strand, 21477369 - 21477656
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  21477369 ctttgactcgacaaatgcgactcaaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttga 21477468  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477469 gtattattatac-tccagggcatcaagcccctatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 21477565  T
Q  397 tg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    || ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  21477566 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacattttca 21477656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 231 - 494
Target Start/End: Original strand, 34509540 - 34509802
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  34509540 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggaccca 34509639  T
Q  330 tcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34509640 tcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaa 34509737  T
Q  429 caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34509738 catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaactta 34509802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 482
Target Start/End: Original strand, 20134938 - 20135191
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  20134938 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttacagggcatcaagccc 20135037  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||   |||  ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  20135038 ccatcgctaa--atgatctaaagctccaacgtgttgagtataaagctccagggcatcaagcccccaactatgaaatgctgatgcatggactcgacctctt 20135135  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  20135136 aaacatcttaattcgacaacctcttata-tagtccaataatttggaacatcatcatc 20135191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20847502 - 20847253
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20847502 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaata------------------cgctatttaagtattaatatacttccagggcatcaagcc 20847421  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20847420 ccaatcgctaa-tttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctt 20847322  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20847321 aaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 20847253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 50210583 - 50210312
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatc-aagccccatctctatttgagtattaatatac-ttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||      
T  50210583 gactatgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatactttcgagggcatcaaac 50210484  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50210483 ccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctc 50210386  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa----catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  50210385 ttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactta 50210312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1925870 - 1925728
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1925870 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 1925771  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1925770 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 1925728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20924884 - 20924742
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20924884 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 20924785  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20924784 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 20924742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41388740 - 41388597
Alignment:
Q  71 catgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaac 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41388740 catgaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaac 41388641  T
Q  171 tcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatg 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  41388640 tcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatg 41388597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Original strand, 33796911 - 33797051
Alignment:
Q  78 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33796911 atcgtataatcttcataggtacttctttaataacacatgggtggaagacaactcgacaactcatagatgataatttatcaacaacttaacaactcatgga 33797010  T
Q  178 tgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33797011 tgataattcatcaacaacgactttgactcgacaattgcgac 33797051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39244641 - 39244493
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39244641 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 39244542  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39244541 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 39244493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39248196 - 39248048
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39248196 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 39248097  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39248096 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 39248048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20229729 - 20229581
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20229729 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggcggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 20229630  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20229629 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 20229581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 21406740 - 21406888
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21406740 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacagctcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 21406839  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21406840 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttaactcgacaaatgcgac 21406888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16376176 - 16376032
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16376176 aacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactca 16376077  T
Q  174 tggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16376076 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 16376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 1010112 - 1010255
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1010112 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 1010211  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  1010212 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 1010255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 52638930 - 52639073
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52638930 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 52639029  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  52639030 ggatgataattcatcaacaacgacattgactcgacatatgcgac 52639073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13213282 - 13213144
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  13213282 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttga 13213183  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  13213182 gtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 13213144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 21714300 - 21714501
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  21714300 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 21714398  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  21714399 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 21714495  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  21714496 taaaca 21714501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 16361654 - 16361791
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  16361654 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 16361753  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  16361754 tattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 16361791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 281
Target Start/End: Original strand, 23967314 - 23967558
Alignment:
Q  46 aacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaac--------aac 137  Q
    ||||||||||  ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||        |||    
T  23967314 aacatcataaacaacataacaacatcataaacatcgtataatcttcataagtacttcattaacaacacatatgtagaagacaactcaactacttaacaac 23967413  T
Q  138 tcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaac 237  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  23967414 tcatggatgacaattcagcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggc-aatgcaacttcgacttgactatgcaac 23967512  T
Q  238 ttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||   | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967513 tttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 23967558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21788403 - 21788208
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21788403 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccat 21788305  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    || | |||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21788304 cg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtactaagctccagggtat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatagactcgatctcttaaa 21788208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22469066 - 22468813
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  22469066 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 22468968  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| || || | ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| ||||    
T  22468967 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgggtactaagctccagggcat-gagcccccaacaaatatatgctaatgcatggactcgatctct 22468870  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    |||||| ||||||   |||||||| |||| || |||||  |||||||||||| |||||    
T  22468869 taaacatcttaatcaaacaacctcgtata-tagtccaaaaatttggaacatcttcatc 22468813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 21840374 - 21840485
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21840374 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 21840473  T
Q  298 tattaatatact 309  Q
    ||||||||||||    
T  21840474 tattaatatact 21840485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42865578 - 42865378
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  42865578 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 42865480  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
     |||||||| | |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  42865479 tccatcgct-agtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 42865382  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  42865381 taaa 42865378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 29776386 - 29776523
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  29776386 tttgactcgacacatgtgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 29776485  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  29776486 tattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 29776523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16275822 - 16275712
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16275822 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 16275723  T
Q  299 attaatatact 309  Q
    |||||||||||    
T  16275722 attaatatact 16275712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14295970 - 14295834
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14295970 ttgactcgacaaatgtgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 14295871  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  14295870 attattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 14295834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20454975 - 20454840
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20454975 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 20454876  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  20454875 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 20454840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 45575108 - 45574994
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa-caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45575108 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 45575009  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||| ||||    
T  45575008 acatcatcatattca 45574994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 431465 - 431551
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  431465 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 431551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15860451 - 15860339
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  15860451 ctttgactcgacaaatgtgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttga 15860352  T
Q  297 gtattaatatact 309  Q
    |||| ||||||||    
T  15860351 gtatcaatatact 15860339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 31612209 - 31612332
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31612209 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttata-taatccaataatttg 31612307  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  31612308 gaacttcatcatcttaatcaactta 31612332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 6151601 - 6151801
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  6151601 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcaaggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 6151699  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  6151700 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctct 6151797  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  6151798 taaa 6151801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 317 - 432
Target Start/End: Original strand, 20916073 - 20916187
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtct 416  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20916073 catcaagccccaatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggact 20916171  T
Q  417 cgacctcttaaacaac 432  Q
    | ||||||||||||||    
T  20916172 caacctcttaaacaac 20916187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 285
Target Start/End: Original strand, 20915999 - 20916084
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca 285  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20915999 ttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagcccca 20916084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45575307 - 45575183
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| ||||||||||    
T  45575307 ttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctattatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtttcaatcgctatttgagt 45575208  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||| |||||||||||  |||||||    
T  45575207 attattatacttccagagcatcaag 45575183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 13988763 - 13988885
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13988763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 13988860  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  13988861 gaacttcatcatcttaatcaactta 13988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21923556 - 21923434
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21923556 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 21923459  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  21923458 gaacttcatcatcttaatcaactta 21923434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 379 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14295765 - 14295658
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14295765 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 14295666  T
Q  479 catcttca 486  Q
    ||||||||    
T  14295665 catcttca 14295658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 42911750 - 42911890
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42911750 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaa 42911849  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  42911850 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 42911890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22831744 - 22831566
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| |||  || |||    
T  22831744 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcagggcat-gagcccc 22831649  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||| | |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22831648 catcg-ttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 22831566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27161919 - 27161833
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161919 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgattatgcaacttagatctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 27161833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 29297843 - 29297929
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29297843 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgtaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 29297929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 40388899 - 40388985
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40388899 ctttgactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaggacatcaagcccc 40388985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 323
Target Start/End: Original strand, 16758372 - 16758494
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttga 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||| |  | |    
T  16758372 actttgactcgacaaatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaaacc----ctcaacgtaa 16758467  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16758468 gtattaatatacttccagggcatcaag 16758494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 267
Target Start/End: Original strand, 31612022 - 31612091
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612022 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 31612091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21475352 - 21475230
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21475352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 21475255  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  21475254 gaacttcatcatcttaatcaactta 21475230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 22123333 - 22123211
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22123333 gctccagggcatcaagcccccaacaacgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 22123236  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||    
T  22123235 gaacttcatcatcttaatctactta 22123211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23594000 - 23593878
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23594000 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 23593903  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  23593902 gaacttcatcatcttaatcaactta 23593878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 375 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27161724 - 27161601
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaac 473  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27161724 cagggcatccagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttata-taatccaataatttggaac 27161626  T
Q  474 atcatcatcttcatcaacttaaaca 498  Q
     ||||||||  ||||||||||||||    
T  27161625 ttcatcatcaacatcaacttaaaca 27161601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 29298034 - 29298156
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29298034 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 29298131  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     ||| |||||||||| |||||||||    
T  29298132 aaacttcatcatcttaatcaactta 29298156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20091837 - 20091638
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| || | |||  || |    
T  20091837 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcaaggcat-gagcc 20091742  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||| |  | |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||    
T  20091741 cccaac-attattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacttct 20091644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21896657 - 21896572
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21896657 actttgactcgacaa-tgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatgtgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 21896572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22123523 - 22123438
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22123523 ctttgcctcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggca-caagcccc 22123438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18182474 - 18182274
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  18182474 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacatggcat-gagccccaac---attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 18182380  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaac 429  Q
    |  | |||||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | || || |||||||||    
T  18182379 c-attattttgagcaaatgctccttcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaac 18182282  T
Q  430 aacttaat 437  Q
    | ||||||    
T  18182281 atcttaat 18182274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14238832 - 14238699
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac-----------tcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 177  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238832 ttcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 14238733  T
Q  178 tg----ataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14238732 tgatatataattcatcaacaacgactttgactcg 14238699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 486
Target Start/End: Original strand, 33680754 - 33681024
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  33680754 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaacgta-ataagtattaatatacttccagggcatcaagcc 33680852  T
Q  326 cccatc--------gctaatttt-----gaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaa-gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |        |||||   |     | || ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33680853 cccaacataattgagctaaagctccagggcatcaagcccccaacgtggtga--gcaaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 33680950  T
Q  412 agtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
     | | | || |||| ||| |||||   | || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680951 ggacacaacatctt-aaccacttagaacaaccacctcttatataagtccaataatttggaacatcatcatcttca 33681024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 264
Target Start/End: Original strand, 40129323 - 40129389
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129323 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 40129389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13213119 - 13213005
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  13213119 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 13213021  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  13213020 catcttaatcaactta 13213005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 284
Target Start/End: Original strand, 21706912 - 21706995
Alignment:
Q  201 tgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21706912 tgactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaatccaacgcatcaagcccc 21706995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 284
Target Start/End: Original strand, 21711454 - 21711537
Alignment:
Q  201 tgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21711454 tgactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaatccaacgcatcaagcccc 21711537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22449622 - 22449447
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |     
T  22449622 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggaatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccctaa 22449527  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22449526 c-attattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 22449447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 29776613 - 29776707
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29776613 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 29776707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16368686 - 16368601
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16368686 actttgactcgacaa-tgcgacttcgacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 16368601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Original strand, 21341864 - 21341977
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag-tattaatatacttccaggacatc 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  21341864 actcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccccaacgctatttgagatattaatatac-tccagagcatc 21341962  T
Q  321 aagtccccatcgcta 335  Q
    ||| ||| |||||||    
T  21341963 aagcccctatcgcta 21341977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Original strand, 21346728 - 21346841
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag-tattaatatacttccaggacatc 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  21346728 actcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccccaacgctatttgagatattaatatac-tccagagcatc 21346826  T
Q  321 aagtccccatcgcta 335  Q
    ||| ||| |||||||    
T  21346827 aagcccctatcgcta 21346841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 20248029 - 20248086
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20248029 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 20248086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22922242 - 22922185
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22922242 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 22922185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 21346886 - 21346980
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21346886 aatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 21346980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Original strand, 21753795 - 21753848
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21753795 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaa 21753848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41050424 - 41050313
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||||    
T  41050424 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatatact 41050327  T
Q  310 tccaggacatcaag 323  Q
    |||||| |||||||    
T  41050326 tccagggcatcaag 41050313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Original strand, 48519945 - 48520018
Alignment:
Q  132 aacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgact 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  48519945 aacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaactttgact 48520018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50622335 - 50622222
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  50622335 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 50622238  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  50622237 cttccagggcatcaag 50622222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 494
Target Start/End: Original strand, 432953 - 433031
Alignment:
Q  415 ctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  432953 ctcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 433031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 383 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16275616 - 16275507
Alignment:
Q  383 caagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  16275616 caagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgac-agctcttgta-taatccaataatttagaacttcatcatc 16275519  T
Q  483 ttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||    
T  16275518 ttaatcaactta 16275507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 21022333 - 21022392
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21022333 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgaggcccca 21022392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 195
Target Start/End: Original strand, 48519847 - 48519975
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactc--------aacaactcatagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||        |||||||||| ||||| || || |||||||| |||    
T  48519847 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacctaa 48519946  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48519947 caactcatggatgacaattcatcaacaac 48519975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 323
Target Start/End: Original strand, 50686366 - 50686493
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatt 293  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |  | ||    
T  50686366 actttgactcgacaa-tgcgacttcaacttgactatgcaacctagacctcttaatcatgtatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtgtt 50686463  T
Q  294 tgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  50686464 taagtattaatatacttccagggcatcaag 50686493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Original strand, 21711608 - 21711728
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | ||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  21711608 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 21711706  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  21711707 cttcatcatcttaatcaactta 21711728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52928344 - 52928287
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  52928344 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaatctagggcatcaagccc 52928287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Original strand, 22237512 - 22237644
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||  ||| |||||||||   | ||||||||||    
T  22237512 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacgatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacaacttagaacaacaacctctt 22237608  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22237609 atacaagtccaataatttgaaacatcatcatcttca 22237644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50614507 - 50614394
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  50614507 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccagtccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 50614410  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  50614409 cttccagggcatcaag 50614394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 482
Target Start/End: Original strand, 16361836 - 16361918
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||    
T  16361836 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcatcatc 16361918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 21342022 - 21342115
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||    
T  21342022 aatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttgg-acttcatcatcttaatcaactta 21342115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 21707092 - 21707186
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21707092 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgta-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 21707186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 21709757 - 21709798
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21709757 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 21709798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Original strand, 26064679 - 26064743
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26064679 caacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 26064743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3473268 - 3473103
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |  | ||||||    
T  3473268 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacaattattttg 3473173  T
Q  342 aattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |   || |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3473172 agcaaaagctccatcgtggtgaggacaaagctccagggtat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 3473103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 19675540 - 19675592
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  19675540 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 19675592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 21161499 - 21161539
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21161499 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 21161539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 475
Target Start/End: Original strand, 21840666 - 21840761
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacat 475  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||||||    
T  21840666 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctttta-aatagtccaataatttggaacat 21840761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 52928206 - 52928074
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||  ||||| |||||||   | ||||||||||    
T  52928206 ccaacgtggtgag--caaaggctctagggcaccaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctctt 52928110  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  52928109 atataagtccaataatttggaacatcaccatcttca 52928074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 22237376 - 22237431
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22237376 actatacaacttagacctcttatatgaatgtggtacaaatccagggcatcaagccc 22237431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24783405 - 24783366
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783405 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 24783366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35261423 - 35261352
Alignment:
Q  212 atgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35261423 atgcgacttcaatttgacttcgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 35261352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 21172790 - 21172831
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172790 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 21172831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 21312906 - 21312947
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21312906 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 21312947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21896491 - 21896433
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21896491 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcat 21896433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4597163 - 4597107
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4597163 tataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 4597107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 138
Target Start/End: Original strand, 20241556 - 20241624
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20241556 tcataaacatcatataatcctcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 20241624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 20241616 - 20241668
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  20241616 tcaacaacttaacaactcatggacgacaactcatcaacaacgactttgactcg 20241668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 20248184 - 20248224
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20248184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 20248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 21753933 - 21753990
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21753933 ccaacgtggtgag--caaggctctagggcatcaagcccccaacaatggatgctaatgcat 21753990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 322
Target Start/End: Original strand, 47190410 - 47190481
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  47190410 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggcatcaa 47190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8761991 - 8761827
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  8761991 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagaccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcc 8761896  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    |||| |  | |||||||  ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  8761895 cccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcat-gagcccccaaca 8761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20454772 - 20454670
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||    
T  20454772 gcatcaagccccaatcgctgaatgttaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacattat 20454674  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  20454673 catc 20454670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 479
Target Start/End: Original strand, 40389056 - 40389161
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  40389056 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 40389154  T
Q  473 catcatc 479  Q
    | |||||    
T  40389155 cttcatc 40389161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 441 - 494
Target Start/End: Original strand, 21026649 - 21026702
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21026649 acaacctctcatattagtccaataatttggaacatcatcatcgtcaacaactta 21026702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36819625 - 36819584
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36819625 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 36819584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52954666 - 52954602
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccagg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  52954666 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagg 52954602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 336
Target Start/End: Original strand, 16361772 - 16361836
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaa 336  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  16361772 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagtcccaatcgctaa 16361836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16368520 - 16368471
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368520 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 16368471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22922086 - 22922046
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22922086 gctccagggcatcaagcccctaacaatgaatgttaatgcat 22922046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 26064824 - 26064873
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064824 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 26064873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21043630 - 21043552
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  21043630 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaact-tatttgagcataaatacactcccagggcatcaagccccca 21043552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 22118543 - 22118617
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22118543 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatcaagggcatcaagccc 22118617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Original strand, 23967252 - 23967303
Alignment:
Q  27 cataaacaaccttataaacaacatcataagtaacttgacaacgtcatgaaca 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  23967252 cataaacaacctcataaacaacatcataagcaacataacaacgtcataaaca 23967303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17678948 - 17678898
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17678948 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagagcat 17678898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 482
Target Start/End: Original strand, 21161607 - 21161729
Alignment:
Q  356 cgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatat 454  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||    ||||| || || |     
T  21161607 cgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgacatcttaaacatcttaa----acaacttcgta-aa 21161701  T
Q  455 taatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  21161702 tagtccaataatttggaacatcatcatc 21161729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 431655 - 431696
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  431655 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcat 431696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16059501 - 16059468
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16059501 atgcatgtggtaccaattcagggcatcaagcccc 16059468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16080728 - 16080691
Alignment:
Q  231 atgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16080728 atgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 16080691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 16368430 - 16368393
Alignment:
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcat 481  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16368430 acctcttatataaatccaataatttggaacatcatcat 16368393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45575146 - 45575089
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||    
T  45575146 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 45575089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4597062 - 4596999
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4597062 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtatcaatccagggcatcaagcccc 4596999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 19675588 - 19675651
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19675588 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccc 19675651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Original strand, 20241664 - 20241723
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag 280  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20241664 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaag 20241723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Original strand, 21022398 - 21022438
Alignment:
Q  336 attttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctcca 376  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21022398 attttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctcca 21022438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29764571 - 29764535
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29764571 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 29764535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35261313 - 35261264
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35261313 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcctccaacaatgaatg 35261264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 157)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 50 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17048851 - 17048388
Alignment:
Q  50 tcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgata 149  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  17048851 tcataagcaatttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtataatacaactcagcaactcatagatgata 17048752  T
Q  150 attcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 249  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048751 attcgttaacaacttaacaactcgtggatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 17048652  T
Q  250 tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatg 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||  ||| |    
T  17048651 tatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-atgcccccatcgctaa-tttgagctaaag 17048555  T
Q  350 ctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctc 448  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||   |  | |||    
T  17048554 ctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcataat--catcatctc 17048458  T
Q  449 ttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17048457 ttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 17048388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 226 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14053669 - 14053408
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  14053669 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagc 14053570  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14053569 ccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctct 14053470  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14053469 taaacaacttaattcgacaacctcttacattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 14053408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 12902514 - 12902779
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12902514 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccttcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 12902613  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902614 catcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 12902712  T
Q  428 acaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12902713 acatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 12902779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 17046242 - 17046501
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  17046242 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccc 17046341  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  17046342 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccctcaactatgaatgttaatgcatggactcgacctctta 17046441  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17046442 aacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 17046501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 198 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23374748 - 23374470
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttga 296  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  23374748 ctttgactcgataaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatataaatgtggtaccaatacggggcatcaagccccaatcgctatttga 23374649  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374648 gtattattatacttccagggcatcaagccccaatcgcta-ttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 23374550  T
Q  397 tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatc 476  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23374549 tgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaactcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatc 23374470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 44052585 - 44052851
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44052585 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaggacatcaagcccccatcgatatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 44052684  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  44052685 ccatcgct-attttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcgtagattcgacctctt 44052783  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052784 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 44052851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 226 - 494
Target Start/End: Original strand, 7798529 - 7798796
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7798529 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagc 7798628  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    ||||||||||  | ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  7798629 ccccatcgct--tattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagagcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctc 7798726  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7798727 ttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaactta 7798796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 7893459 - 7893725
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7893459 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 7893558  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7893559 ccatcgctaa--ttgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 7893656  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7893657 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 7893725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 22636192 - 22636457
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22636192 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 22636291  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  22636292 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagcacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 22636389  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22636390 agacatcttaattcaacaacctcttata-taatccaataatttggaaaatcatcatcttcatcaactta 22636457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16377885 - 16377620
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16377885 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 16377786  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  16377785 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagcttcagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 16377688  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16377687 aaacatcttaaatcgacaacctcttaca-taatccaataatttggaacttcattatcttcatcaactta 16377620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16240334 - 16240068
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc-cccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16240334 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcaagctcccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 16240235  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  | |||  ||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||    
T  16240234 ccatcgcta--tctgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccatcaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgtt 16240137  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16240136 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatctaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 16240068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 631495 - 631330
Alignment:
Q  50 tcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgata 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  631495 tcataagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatgata 631396  T
Q  150 attcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgc 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  631395 attcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatgc 631330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 316 - 494
Target Start/End: Original strand, 15551662 - 15551839
Alignment:
Q  316 acatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtc 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15551662 acatcaagcccccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 15551760  T
Q  416 tcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15551761 tcgacctattaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 15551839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20160593 - 20160445
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160593 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaattcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 20160494  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20160493 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 20160445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20157917 - 20157731
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20157917 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttatttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 20157818  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||           |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20157817 ctcatggatgataattcatcaacaacgagtttgactcgacaaatg-----------cgacaatgtaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 20157731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20163371 - 20163223
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163371 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacataggtagaagacaacccgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 20163272  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20163271 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaacgcgac 20163223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 319 - 494
Target Start/End: Original strand, 3096141 - 3096315
Alignment:
Q  319 tcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcg 418  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3096141 tcaagcccccatcgctaattt-gagctaatgcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcg 3096239  T
Q  419 acctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3096240 acctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattattctaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 3096315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14954908 - 14954766
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14954908 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaacttatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 14954809  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14954808 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 14954766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Original strand, 10712244 - 10712387
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10712244 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtaaaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcgt 10712343  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10712344 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 10712387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Original strand, 10926014 - 10926157
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10926014 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtaaaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcgt 10926113  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10926114 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 10926157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 15224426 - 15224574
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15224426 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 15224525  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  15224526 ctcatggatgataattcatcaacagcgaccttgactcgacaaatgcgac 15224574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5757647 - 5757504
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5757647 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 5757548  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  5757547 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 5757504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 9555919 - 9556062
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9555919 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 9556018  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  9556019 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 9556062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 12487074 - 12487217
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12487074 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12487173  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  12487174 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 12487217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14758144 - 14758001
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14758144 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14758045  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  14758044 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 14758001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 33741769 - 33741912
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33741769 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 33741868  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  33741869 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 33741912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4562042 - 4561899
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4562042 acatcgtataatcctcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttgacaactcat 4561943  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4561942 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 4561899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 13569255 - 13569454
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  13569255 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 13569352  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  13569353 cccatcgctaa-tttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 13569450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 44675384 - 44675584
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  44675384 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 44675482  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  44675483 cccatcgttaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 44675580  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  44675581 taaa 44675584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 312 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16270515 - 16270338
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16270515 cagggcatcaagcccccatctcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 16270418  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16270417 tggactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaa 16270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 12569768 - 12569967
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  12569768 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 12569866  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||  |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  12569867 cccatcgtta--tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggtat-aagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 12569963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 225 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15125407 - 15125206
Alignment:
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  15125407 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagc 15125309  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  15125308 ccccatcgttaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggaat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctc 15125211  T
Q  424 ttaaa 428  Q
    |||||    
T  15125210 ttaaa 15125206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 23843230 - 23843430
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  23843230 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 23843328  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||   ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  23843329 cccatcgttaa-tttgagccaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 23843426  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  23843427 taaa 23843430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 375 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 52873585 - 52873466
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaac 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52873585 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaac 52873487  T
Q  474 atcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52873486 atcatcatcttcatcaactta 52873466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14971219 - 14971106
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14971219 ttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 14971120  T
Q  299 attaatatacttcc 312  Q
    |||| |||||||||    
T  14971119 attattatacttcc 14971106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23803766 - 23803631
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23803766 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcattaagcccctatcactatttgagt 23803667  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  23803666 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 23803631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 37018300 - 37018432
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37018300 aacatcatataatcttcataagtacttcatgaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcat 37018399  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  37018400 ggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 37018432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51464283 - 51464148
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  51464283 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagt 51464184  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  51464183 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 51464148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15122165 - 15121965
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  15122165 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 15122067  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  15122066 cccattg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 15121969  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  15121968 taaa 15121965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Original strand, 19242417 - 19242554
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |    
T  19242417 ctttgactcgacaaatgtgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaa 19242516  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  19242517 gtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 19242554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 25689292 - 25689378
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689292 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 25689378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52243598 - 52243512
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52243598 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 52243512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19618641 - 19618504
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatc-tctatttgag 297  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  19618641 ttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcggctatttgag 19618542  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||    
T  19618541 tattattatacttccagagcatcaaaccccaatcgcta 19618504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 12610654 - 12610789
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagt 298  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12610654 ttgactcgagaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccttatcgctatttgagt 12610753  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  12610754 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 12610789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 15369723 - 15369833
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15369723 ttgactcaacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 15369822  T
Q  299 attaatatact 309  Q
    |||| ||||||    
T  15369823 attattatact 15369833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 372 - 486
Target Start/End: Original strand, 15369918 - 15370032
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  15369918 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgga 15370017  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||| ||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttca 15370032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 50222604 - 50222482
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50222604 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 50222507  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  50222506 gaacttcatcatcttaatcaactta 50222482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 424
Target Start/End: Original strand, 15093536 - 15093723
Alignment:
Q  234 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  15093536 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccctcatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagccaccatcgc 15093633  T
Q  334 taattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  15093634 taa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 15093723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13592621 - 13592423
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||  | ||||||||| | ||    
T  13592621 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacgactcatcaacaacgactttgactcaac-aatgcgacttcgac 13592523  T
Q  225 tcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatca 321  Q
    | ||||||||||||||  | |||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13592522 ttgactatgcaactta-tcatcttaatcatgcatgtgataccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttgagtattaatatactcccagggcatca 13592425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 15367395 - 15367505
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15367395 ttgactcaacaaatgcgtctccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttgagt 15367494  T
Q  299 attaatatact 309  Q
    |||| ||||||    
T  15367495 attattatact 15367505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 372 - 486
Target Start/End: Original strand, 15371102 - 15371216
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  15371102 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgga 15371201  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||| ||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttca 15371216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 15373231 - 15373341
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagt 298  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15373231 ttgactcaacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccttatcgctatttgagt 15373330  T
Q  299 attaatatact 309  Q
    |||| ||||||    
T  15373331 attattatact 15373341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 20149574 - 20149660
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20149574 ctttgactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 20149660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43198954 - 43198868
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43198954 actttgactcgacaaatgcgacttcaactcgactatgcaacttagacctcatatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 43198868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 44102000 - 44102086
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44102000 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 44102086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 12569 - 12450
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12569 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaa 12472  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  12471 cttcatcatcttaatcaactta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 373 - 486
Target Start/End: Original strand, 15367591 - 15367704
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15367591 tccagagcattaagcccccaacaaagaatgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 15367690  T
Q  473 catcatcatcttca 486  Q
    ||||| ||||||||    
T  15367691 catcaacatcttca 15367704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 373 - 486
Target Start/End: Original strand, 16223433 - 16223546
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16223433 tccagagcattaagcccccaacaaagaatgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 16223532  T
Q  473 catcatcatcttca 486  Q
    ||||| ||||||||    
T  16223533 catcaacatcttca 16223546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39706695 - 39706610
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39706695 ctttgactcgacaaatgcgaccctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 39706610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7641447 - 7641325
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7641447 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 7641350  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  7641349 gaacttcatcatcttaatcaactta 7641325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15118617 - 15118495
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15118617 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 15118520  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  15118519 gaacttcatcatcttaatcaactta 15118495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15355591 - 15355468
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  15355591 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaaatcgactacctcttata-taatccaataatttg 15355493  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||    
T  15355492 gaacttcaacatcttaatcaactta 15355468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18215540 - 18215417
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  18215540 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcata-taatccaataatttg 18215442  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     ||| |||||||||| |||||||||    
T  18215441 aaacttcatcatcttaatcaactta 18215417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18239684 - 18239562
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18239684 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 18239587  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  18239586 gaacttcatcatcttaatcaactta 18239562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 44615185 - 44615307
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44615185 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 44615282  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  44615283 gaacttcatcatcttaatcaactta 44615307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44773352 - 44773230
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44773352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 44773255  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  44773254 gaacttcatcatcttaatcaactta 44773230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 52312407 - 52312529
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52312407 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 52312504  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  52312505 gaacttcatcatcttaatcaactta 52312529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 54798976 - 54798853
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  54798976 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 54798878  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  54798877 gaacttcatcatcttaatcaactta 54798853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12682 - 12596
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  12682 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggaatcaagcccc 12596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14928140 - 14928058
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa 279  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14928140 actttgactcgacaaatgcaactccaactcgactacgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaa 14928058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 372 - 486
Target Start/End: Original strand, 15373383 - 15373497
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |    
T  15373383 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgaa 15373482  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||| ||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttca 15373497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 372 - 486
Target Start/End: Original strand, 15402603 - 15402717
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  15402603 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgcaaatgcatggactcgacttcttaaccatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgga 15402702  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||| ||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttca 15402717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 280
Target Start/End: Original strand, 52312216 - 52312298
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag 280  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52312216 ctttgactcaacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaag 52312298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1837774 - 1837652
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1837774 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 1837677  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  1837676 gaacttcatcatcttaatcaactta 1837652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8575088 - 8574966
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8575088 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatccacaacctcttata-taatccaatgctttg 8574991  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| || ||||||    
T  8574990 gaacctcatcatcttaattaactta 8574966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44929146 - 44929023
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44929146 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgctaatccatggattcgacctcttaaacatctttaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 44929048  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  44929047 gaacttcatcatcttaatcaactta 44929023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 3484747 - 3484876
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac-----------tcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 177  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3484747 ttcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacaacttaacaactcatggatgataattcaacaacaacttaacagctcatgga 3484846  T
Q  178 tgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3484847 tgataattcatcaacaacgactttgactcg 3484876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 16997226 - 16997366
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac--------tcatagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||        |||| ||||  || |||||||||||||||    
T  16997226 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacctaacaactcatggatgtcaactcatcaacaacttaa 16997325  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16997326 caactcatggatgacaactcattaacaacgactttgactcg 16997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35812776 - 35812636
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  35812776 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacttaacaattcatggatgacaactcatcaacaacttaa 35812677  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  35812676 caactcatggatgacgactcatcaacaacgactttgactcg 35812636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14252 - 14167
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14252 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccc 14167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12288612 - 12288527
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288612 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 12288527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 468
Target Start/End: Original strand, 14038555 - 14038652
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgattt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14038555 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataattt 14038652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 27533400 - 27533486
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27533400 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacgcaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaac 27533486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 51464131 - 51464011
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  51464131 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 51464034  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  51464033 acttcatcatcttaatcaactta 51464011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 14280061 - 14280144
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14280061 ctttgactcgacaaatgcgactctaa---gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 14280144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54799166 - 54799082
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54799166 ttgacttgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatgcagggcatcaagcccc 54799082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 17809723 - 17809806
Alignment:
Q  135 aactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17809723 aactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 17809806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 12610849 - 12610969
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  12610849 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctattgta-taatccaataatttgga 12610946  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  12610947 acttcatcatcttaatcaactta 12610969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Original strand, 15705148 - 15705230
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15705148 tatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagtattaatatacttc 15705230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16270556 - 16270486
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16270556 actatgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagggcatcaagcccccatctctatttgag 16270486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52873626 - 52873570
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873626 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 52873570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 427 - 494
Target Start/End: Original strand, 7088832 - 7088899
Alignment:
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7088832 aacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaactta 7088899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 14548411 - 14548551
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14548411 aacatcatataattttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttagcaactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 14548510  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  14548511 caactcaaggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 14548551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16488433 - 16488259
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  16488433 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggaatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 16488338  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||||||    
T  16488337 c-attattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccaacgaatgtatgctaatgcat 16488259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23803528 - 23803408
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||| |||| |||||||    
T  23803528 ctccagagcatcaagcccacaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taattcaataatttgga 23803431  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  23803430 acttcatcatcttaatcaactta 23803408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 3096093 - 3096149
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3096093 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcgtcaagcccc 3096149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 12773839 - 12773895
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12773839 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 12773895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 14038459 - 14038515
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038459 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 14038515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18215729 - 18215645
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18215729 ttgactcgacaaatacgactccgacttgacattgcaaattagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 18215645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 15375517 - 15375580
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15375517 ttgactcaacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 15375580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Original strand, 14280215 - 14280335
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  14280215 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 14280313  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  14280314 cttcatcatcttaatcaactta 14280335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 6899818 - 6899913
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6899818 aatgctaatgcatggattcgacctcttaaacattttaattcgaaaacctcttata-taattcaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 6899913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53082543 - 53082430
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  53082543 aatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 53082446  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  53082445 cttccagggcatcaag 53082430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14970970 - 14970868
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  14970970 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatcgactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 14970872  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  14970871 catc 14970868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 494
Target Start/End: Original strand, 44102140 - 44102233
Alignment:
Q  400 atgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44102140 atgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaaatcgacaaactcttgta-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 44102233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Original strand, 14825204 - 14825314
Alignment:
Q  215 cgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  14825204 cgacttcaacttgactatgcaacctacacctattaatcatgcatgtggtaccaatgcagggcatcaagccctcaact-tatttgagtattaatatacttt 14825302  T
Q  312 caggacatcaag 323  Q
    |||| |||||||    
T  14825303 cagggcatcaag 14825314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16349024 - 16348844
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  16349024 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagc---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 16348929  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16348928 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 16348844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 14157596 - 14157654
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  14157596 cgactatgcaacttagacctcttatatacatgtggtatcaatccggggcatcaagcccc 14157654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 14164301 - 14164359
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  14164301 cgactatgcaacttagacctcttatatacatgtggtatcaatccggggcatcaagcccc 14164359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14927973 - 14927915
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14927973 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 14927915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 22353586 - 22353659
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  22353586 atgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaag 22353659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 39706511 - 39706387
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctctt-atattaatccaatgattt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | |||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  39706511 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataattt 39706413  T
Q  469 ggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  39706412 ggaacatcatcatcttaatcaactta 39706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43198787 - 43198729
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198787 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 43198729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15042379 - 15042327
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15042379 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 15042327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 15112045 - 15112097
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15112045 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 15112097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 25090441 - 25090493
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  25090441 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 25090493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 411
Target Start/End: Original strand, 12773910 - 12773953
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12773910 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 12773953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 123
Target Start/End: Original strand, 17807517 - 17807564
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaa 123  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17807517 acatcgtaaaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaa 17807564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19618435 - 19618333
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | || | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || ||||||  |||||||||| ||    
T  19618435 gcatcaagccccaatcactcaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaatagtttggaacattat 19618337  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  19618336 catc 19618333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Original strand, 12423457 - 12423503
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12423457 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatttggtaccaattcagg 12423503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 379 - 486
Target Start/End: Original strand, 22353740 - 22353847
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt-aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgattt-ggaacatc 476  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||    
T  22353740 gcatcaagccccaatcactgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaatttgac--cctcttatattaatcgaataatttgggaatatc 22353837  T
Q  477 atcatcttca 486  Q
    ||||| ||||    
T  22353838 atcatattca 22353847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 323
Target Start/End: Original strand, 15791426 - 15791529
Alignment:
Q  222 aactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggaca 318  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15791426 aacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccatggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggca 15791524  T
Q  319 tcaag 323  Q
    |||||    
T  15791525 tcaag 15791529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22634718 - 22634677
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634718 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 22634677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16357312 - 16357132
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||| |    
T  16357312 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagc---attacagtattaatatacttttagggcat-aagcc 16357217  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
     ||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16357216 tccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 16357132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 25689349 - 25689401
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25689349 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 25689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36134262 - 36134226
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134262 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 36134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 25090386 - 25090449
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25090386 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacaagtggatagaagacaactcaacaact 25090449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 27533457 - 27533508
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  27533457 acaactcatggatgataattcatcgacaacgactttgactcgacgaatgcga 27533508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 46640675 - 46640641
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640675 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 46640641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13813535 - 13813482
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13813535 actcgacaatgcaaccaaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 13813482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 423
Target Start/End: Original strand, 29267517 - 29267570
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  29267517 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctc 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46640798 - 46640734
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46640798 caacttgaccatgcaacttagacctcttaatcatgcatatggtaccaatccagggcatcaagccc 46640734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5339338 - 5339157
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  5339338 cgacaatgcaacctaaaccttttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcc 5339243  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||| ||  ||| |||||| ||||||||   ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5339242 cccaacaattatttagagctaaagctccatcgtggtgatgacaaggctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 5339157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 14157753 - 14157793
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14157753 gctccagggcatcaagccctcaacaatgtatgctaatgcat 14157793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 14164458 - 14164498
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14164458 gctccagggcatcaagccctcaacaatgtatgctaatgcat 14164498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12288445 - 12288389
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgc 409  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12288445 ccaacgtggtgag--caaaggctccagagcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgc 12288389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15042433 - 15042371
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15042433 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatag-agacaactcaacaact 15042371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 15111991 - 15112053
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15111991 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatag-agacaactcaacaact 15112053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52243431 - 52243375
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgc 409  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52243431 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccataaatgaatgctaatgc 52243375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14853253 - 14853149
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggac 317  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||| ||| |||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  14853253 caacttgactatgtaacttaaacctcttaatcatgtatgaggtaccaatctagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggc 14853155  T
Q  318 atcaag 323  Q
    ||||||    
T  14853154 atcaag 14853149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 162
Target Start/End: Original strand, 17809745 - 17809783
Alignment:
Q  124 gacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17809745 gacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 17809783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 479
Target Start/End: Original strand, 20149731 - 20149836
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| | || || ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  20149731 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgataaactcttgta-taatccaataatttggaa 20149829  T
Q  473 catcatc 479  Q
    | |||||    
T  20149830 cttcatc 20149836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14086 - 14028
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14086 ccaacgtggtgag--caaaggctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgtgaatgcat 14028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 16997392 - 16997425
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16997392 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 16997425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26045642 - 26045609
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26045642 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 26045609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26050823 - 26050790
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26050823 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 26050790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28569737 - 28569697
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28569737 cgacaatgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 28569697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35812610 - 35812577
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35812610 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 35812577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 37018458 - 37018530
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  37018458 atgcatgtgttaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactctcagggcatcaag 37018530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13592624 - 13592584
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  13592624 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 13592584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14971058 - 14971018
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14971058 gcatcaagccccaatctctatttgagtattattatacttcc 14971018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15042331 - 15042268
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15042331 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatgaagcccc 15042268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 15112093 - 15112156
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15112093 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcataaagcccc 15112156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15355717 - 15355653
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15355717 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccc 15355653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 25090489 - 25090552
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  25090489 actcgacaatgcaacttcgacttcttaattatgcatgtggtatcaatcaagggcatcaagcccc 25090552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 37838885 - 37838849
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37838885 cttcaacaacttaaacaacattaacaacttaagactc 37838849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 42597614 - 42597578
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42597614 cttcaacaacttaaacaacattaacaacttaagactc 42597578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 154)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 44385396 - 44384923
Alignment:
Q  43 aacaacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttc-tttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcat 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44385396 aacaacatcataagcaacttgacaacatcatgaacatcgtataatcttcataggtactccctttaataacacatgggtagaagacaactcaacaacacat 44385297  T
Q  142 agatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttag 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385296 agatgataattcattaacaacttaacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgacttgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttag 44385197  T
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||| ||| ||||    
T  44385196 acctcttatatgcatgtggtaccaattaagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctcaatcgttaa-tttg 44385099  T
Q  342 aattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcg-acctcttaaacaacttaattc 439  Q
    |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |  |||      
T  44385098 agctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgaatgctaatgcatggactcgaatctcttaaacatcacaat-- 44385002  T
Q  440 gacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
     |  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44385001 catcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacagcttaagactc 44384923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 5866640 - 5866381
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5866640 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 5866541  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5866540 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 5866441  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5866440 aacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 5866381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 21254978 - 21255244
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  21254978 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccc 21255077  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21255078 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 21255176  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21255177 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 21255244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 21249140 - 21249406
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  21249140 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccc 21249239  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  21249240 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcggcctctta 21249338  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21249339 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 21249406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 45131362 - 45131103
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45131362 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatagagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 45131263  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45131262 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 45131163  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45131162 aacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 45131103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 231 - 494
Target Start/End: Original strand, 17140671 - 17140938
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctctt-atatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctattt-gagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17140671 atgcaacttagacctctttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 17140770  T
Q  328 catcgctaatttt-gaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  17140771 catcgctaatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatactaatgtatggactcgacctctta 17140870  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17140871 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 17140938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 226 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21389818 - 21389557
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  21389818 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagc 21389719  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21389718 cgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctct 21389619  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21389618 taaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttggaacatcatcatcttca 21389557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 211 - 494
Target Start/End: Original strand, 21490733 - 21491017
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatact 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  21490733 aatgcgactctaactcgactatgcaacttagaccttttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatact 21490832  T
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgc 409  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21490833 tccagggcatcaagccacaatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaacgaatgctaatgc 21490931  T
Q  410 atagtctcgacctctt-aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21490932 atggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaattcaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 21491017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 226 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21779144 - 21778883
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  21779144 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagc 21779045  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21779044 cgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctct 21778945  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21778944 taaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttggaacatcatcatcttca 21778883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18818773 - 18818508
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18818773 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 18818674  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  18818673 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 18818576  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818575 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 18818508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 23913655 - 23913861
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913655 tcataaacatcatgtaatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaaattaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 23913754  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913755 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 23913854  T
Q  270 agggcat 276  Q
    |||||||    
T  23913855 agggcat 23913861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 231 - 494
Target Start/End: Original strand, 23406139 - 23406401
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc-cccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  23406139 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcagcaagcacccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccacca 23406238  T
Q  330 tcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23406239 tcgctaa--ttgagctaaggctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaa 23406336  T
Q  429 caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406337 catcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 23406401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 229 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21396345 - 21396087
Alignment:
Q  229 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |    
T  21396345 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtgccaatacagggcattaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgc 21396246  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21396245 catcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcataaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 21396146  T
Q  428 acaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21396145 acaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacatcatcatcttca 21396087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 229 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21790838 - 21790580
Alignment:
Q  229 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |    
T  21790838 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtgccaatacagggcattaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgc 21790739  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21790738 catcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcataaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 21790639  T
Q  428 acaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21790638 acaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacatcatcatcttca 21790580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18879593 - 18879330
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  18879593 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcca 18879494  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  18879493 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt 18879396  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879395 aaacatcttaat--gacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 18879330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 200 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13598011 - 13597724
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13598011 ttgactcgacaaatgtgactccaactcaattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagccccaatcactatttgagt 13597912  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg 398  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13597911 attattatacttccagggcatcaagccccagtcgctaa-tttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactg 13597813  T
Q  399 -aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
     ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  13597812 aaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacgtcaacatcttca 13597724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 20535965 - 20536230
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20535965 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 20536064  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||    
T  20536065 ccatcgctaattaagc--taaagctccaacgtggtgagtacaaagctctagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctctt 20536162  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||| |||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536163 agacatcttaattcaacaatctcttata-taattcaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 20536230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16413882 - 16413636
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 188  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16413882 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaataactcatgtatgataattcat 16413783  T
Q  189 taacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatc 287  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  16413782 caacaacgactttgactcgac-aatgcaacttcaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatc 16413684  T
Q  288 tctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16413683 gctatttgagtattattataattccagagcatcaagtcccaatcgcta 16413636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 7372535 - 7372800
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa-gccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7372535 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaatcccccatcgctgtttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 7372634  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||  ||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||| |||||||    
T  7372635 ccatcaata--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagtgcatcaagcccccaacaatgaaatgttgatgcatggactcaacctctt 7372732  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372733 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 7372800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 198 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13508479 - 13508192
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcc-ccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||  |||||||    
T  13508479 ctttgactcgacaaatgcgactctgattcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcctctatcgttatttga 13508380  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  13508379 gtattactatac-tccagggcatcaagcccctatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacac 13508283  T
Q  397 tg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    || ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  13508282 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacgtcaacatcttca 13508192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 325 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16199912 - 16199751
Alignment:
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16199912 ccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctct 16199813  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16199812 taaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 16199751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21828761 - 21828613
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21828761 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 21828662  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21828661 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 21828613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 482
Target Start/End: Original strand, 23648300 - 23648557
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctctta----tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23648300 actatgcaacttagacctcttaattatatgcatgtggtacaaatacaaggcatcaagcccccatcgctaattgagtattaatagacttccagggcatcaa 23648399  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacc 421  Q
    | ||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||    
T  23648400 gcccccatcgctaatt--gagctaaagctccaatgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactgtgaaatgctaatgcatggactcgacc 23648497  T
Q  422 tcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  23648498 tcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-tagtccaataatttggaacatcatcatc 23648557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18863387 - 18863244
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18863387 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcat 18863288  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18863287 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 18863244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Original strand, 22626493 - 22626758
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  | ||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  22626493 gactatgcaacatagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccccatcgcta--taagtattattatacttccagggcatcaagcc 22626590  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  22626591 cccatcgcta--tttgagctaaagctcaatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctct 22626688  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg-gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22626689 taaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttgaaaacatcatcatcttcatcaactta 22626758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 125 - 312
Target Start/End: Original strand, 32121443 - 32121630
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  32121443 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcctcaacaacgactttgactcgac-aatgcaacttcaac 32121541  T
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32121542 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttcc 32121630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30940818 - 30940676
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30940818 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 30940719  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30940718 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 30940676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21919279 - 21919099
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||  |||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21919279 cagggcatcaaacccccatcgcta--tttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccgcaacaatgaatgctaatgcat 21919182  T
Q  412 agtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21919181 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 21919099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 21386717 - 21386865
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21386717 tcataaacatcgtataatctttataagtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcaaagatgataatttatcaacaacttaacaa 21386816  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21386817 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 21386865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Original strand, 31971097 - 31971279
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971097 cagggcatcaaacccccatcgctaaatt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 31971195  T
Q  412 agtctcgacctctt-aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971196 ggactcgatctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 31971279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 21410309 - 21410457
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21410309 tcataaacatcatataatcgtcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataaatcatcgacaacttaacaa 21410408  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21410409 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 21410457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 21804801 - 21804949
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21804801 tcataaacatcatataatcgtcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataaatcatcgacaacttaacaa 21804900  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21804901 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 21804949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 227 - 490
Target Start/End: Original strand, 22874825 - 22875083
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22874825 gactatgcaacatagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccgtcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcc 22874922  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    | ||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  22874923 ctcatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctc 22875017  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    ||||| | ||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22875018 ttaaatatcttaaatcaacaacctcttata-tagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaa 22875083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14398568 - 14398422
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14398568 tcataaacatcgtataatcttcatatgtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactca--gatgataattcatcaacaacttaacaa 14398471  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14398470 ttcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 14398422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21973298 - 21973156
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21973298 acatcgtataatcttcataggtacttcttcaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 21973199  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcga 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21973198 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcga 21973156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21977389 - 21977247
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21977389 acatcgtataatcttcataggtacttcttcaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 21977290  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcga 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21977289 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcga 21977247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 296 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21924222 - 21924027
Alignment:
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21924222 agtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaatt--gagctaaagctccaacttgttgcgtacaaagctccagggcattaagcccc-aaca 21924126  T
Q  396 atgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924125 atgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttaca-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 21924027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 22111320 - 22111463
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22111320 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22111419  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  22111420 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 22111463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 43251200 - 43251343
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43251200 acatcgtacaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 43251299  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  43251300 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 43251343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14409862 - 14409726
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  14409862 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 14409763  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  14409762 tattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 14409726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 314 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28649325 - 28649143
Alignment:
Q  314 ggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcata 412  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28649325 ggacatcaagcccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 28649228  T
Q  413 gtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa----catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  28649227 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactta 28649143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 26223618 - 26223753
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26223618 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 26223717  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  26223718 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 26223753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17612486 - 17612374
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  17612486 ctttgactcgacaaatgcgactccaattcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttga 17612387  T
Q  297 gtattaatatact 309  Q
    |||| ||||||||    
T  17612386 gtatcaatatact 17612374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 16184473 - 16184673
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |    
T  16184473 cgacaatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttatttgagtattaatattcttccagggcat-aagcc 16184571  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  16184572 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 16184669  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  16184670 taaa 16184673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 304
Target Start/End: Original strand, 4083702 - 4083808
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  4083702 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgtaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 4083801  T
Q  298 tattaat 304  Q
    |||||||    
T  4083802 tattaat 4083808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 297 - 494
Target Start/End: Original strand, 6759088 - 6759280
Alignment:
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||   ||||  ||| |||||| |||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6759088 gtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtattgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaaca 6759182  T
Q  396 atgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6759183 atgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttgg-acatcatcatcttcatcaactta 6759280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23777194 - 23777000
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  23777194 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcatta-ttgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccat 23777097  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23777096 cgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23777000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 41598086 - 41598207
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41598086 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttata-taatccaataatttgga 41598184  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  41598185 acttcatcatcttaatcaactta 41598207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 19898849 - 19899047
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  19898849 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgcgcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccc 19898947  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||| ||| |||||   ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  19898948 catcgttaa-tttgagcgaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctctta 19899045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16092564 - 16092441
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  16092564 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatagtttg 16092466  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16092465 gaacatcatcatcttcatcaactta 16092441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20466406 - 20466206
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |  |||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  20466406 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcctccaacattatttttgtattaatatactttcagggcat-aagcc 20466308  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  20466307 cccatcgctaattt-gagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctct 20466210  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  20466209 taaa 20466206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19937509 - 19937372
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  19937509 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaaacccctatcgctatttga 19937410  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  19937409 gtattattatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 19937372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25484726 - 25484591
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25484726 ttgactcgacaaatacgactccaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccttatcgctatttgagt 25484627  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  25484626 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 25484591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26225513 - 26225390
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26225513 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 26225415  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  26225414 gaacttcatcatcttaatcaactta 26225390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 45290961 - 45290838
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45290961 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 45290863  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||    
T  45290862 gaacttcaacatcttaatcaactta 45290838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21162424 - 21162242
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || ||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |    
T  21162424 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgggtattaatatacttccaaggcat-aagcc 21162327  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21162326 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 21162242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21169097 - 21168915
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  21169097 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatacatggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 21169000  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21168999 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 21168915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18678430 - 18678321
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  18678430 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatctctatttgagtattattatacttccagagcatcaagcc 18678331  T
Q  326 cccatcgcta 335  Q
    || |||||||    
T  18678330 ccaatcgcta 18678321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Original strand, 19895972 - 19896057
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19895972 tttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 19896057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4542638 - 4542516
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4542638 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 4542541  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  4542540 gaacttcatcatcttaatcaactta 4542516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5853557 - 5853435
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5853557 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 5853460  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  5853459 gaacttcatcatcttaatcaactta 5853435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 19896162 - 19896284
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19896162 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 19896259  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  19896260 gaacttcatcatcttaatcaactta 19896284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 26219613 - 26219736
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26219613 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 26219711  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||| | |||||||||    
T  26219712 gaacttcatcatcataatcaactta 26219736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 41597896 - 41597980
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41597896 ttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 41597980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 19982845 - 19983045
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  19982845 cgactatgcaacttagacctcttataggcatgtggtaccaattcagggcctgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 19982943  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  || ||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  19982944 cccatcgttaa-tttgagctagtgctccatcgtgttgactactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcaatctct 19983041  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  19983042 taaa 19983045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15203687 - 15203601
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15203687 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 15203601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 1484299 - 1484421
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1484299 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 1484396  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  1484397 gaacttcatcatcttaatcaactta 1484421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 490
Target Start/End: Original strand, 14823671 - 14823789
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14823671 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 14823768  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  14823769 gaacttcatcatcttaatcaa 14823789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18717619 - 18717531
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18717619 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatctctatttgagtattattatacttccag 18717531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20046460 - 20046338
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20046460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 20046363  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20046362 gaacttcatcatcttaatcaactta 20046338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 20403124 - 20403246
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20403124 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 20403221  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20403222 gaacttcatcatcttaatcaactta 20403246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45291152 - 45291066
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45291152 ctttgacttgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 45291066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15203496 - 15203374
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15203496 gctcctgggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 15203399  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  15203398 gaacttcatcatcttaatcaactta 15203374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Original strand, 22965468 - 22965583
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa-gccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  22965468 caactcgattatgcaacttagacctcttgtatgcatgtggtaccaatacggagcatcaaggccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcat 22965567  T
Q  320 caagtccccatcgcta 335  Q
    |||| ||| |||||||    
T  22965568 caagccccaatcgcta 22965583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 22001651 - 22001772
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22001651 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatgttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 22001747  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  22001748 gaacttcatcatcttaatcaactta 22001772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 24352752 - 24352866
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  24352752 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatata 24352850  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  24352851 cttccagggcatcaag 24352866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 4483187 - 4483300
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  4483187 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 4483284  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  4483285 catcttaatcaactta 4483300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 5760107 - 5760237
Alignment:
Q  65 caacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagat-gataattcatcaacaact 163  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||  ||   |||||||||    
T  5760107 caacatcataaacatcgtataatcttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaact-aacaactcatggatagaagataactcaacaact 5760205  T
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5760206 taacaactcatggatgacaattcatcaacaac 5760237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 983807 - 983722
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  983807 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccaggacatcaagccc 983722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 284
Target Start/End: Original strand, 18833030 - 18833240
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18833030 tataatctgcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaactca 18833129  T
Q  174 tggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacag 271  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||   | |||||   ||||||||||||||||| ||     
T  18833130 tggatgacaactcatcaacaacaactttgacttggc-aatgcaacttcgacttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatcca- 18833227  T
Q  272 ggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||    
T  18833228 ggcatcaagcccc 18833240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30643653 - 30643473
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  30643653 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcc 30643558  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30643557 cccaac-attattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagttccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 30643473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38855591 - 38855488
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  || || |||||||||||||||||||| |||||||     
T  38855591 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatccagggcatcaagccctcaac-gtaattaagtattaatatacttccagggcatcaagc 38855493  T
Q  325 cccca 329  Q
    |||||    
T  38855492 cccca 38855488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 14409681 - 14409587
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14409681 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 14409587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21919320 - 21919250
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatc-aagccccatctctatttgag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21919320 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaaacccccatcgctatttgag 21919250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25484531 - 25484411
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||    
T  25484531 ctccagagcatcaagcccacaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttaga 25484434  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  25484433 acttcatcatcttaatcaactta 25484411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 6520111 - 6520168
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6520111 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 6520168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 396
Target Start/End: Original strand, 377025 - 377189
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| || | |||  || |    
T  377025 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcaaggcat-gagcc 377120  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||| |  | |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  377121 cccaac-attattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 377189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 479
Target Start/End: Original strand, 22965608 - 22965707
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22965608 gcatcaagccccaatcactgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcggcaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 22965706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 31971056 - 31971112
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31971056 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaaacccc 31971112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 17612332 - 17612217
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  17612332 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttataatagtccaataatttgg 17612233  T
Q  471 aacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||| ||||||||    
T  17612232 aacatcaacatcttca 17612217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23761062 - 23760948
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||| |||||||||   | | |||||||||||| | |||||| ||||||    
T  23761062 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacaaaacatctt-aacaacttagaacaataacctcttatataagtccaataatttgg 23760964  T
Q  471 aacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||    
T  23760963 aacatcatcatcttca 23760948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42819251 - 42819111
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  42819251 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacatgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 42819152  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||    
T  42819151 caactcatggatgacaactcatcaacaacaacttggactcg 42819111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23761216 - 23761116
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |  | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23761216 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctatggcatcaagccctaaatgta-ataagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 23761118  T
Q  328 ca 329  Q
    ||    
T  23761117 ca 23761116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17439896 - 17439790
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  17439896 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccaggacatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatata 17439798  T
Q  308 cttccagg 315  Q
    ||||||||    
T  17439797 cttccagg 17439790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 21673397 - 21673453
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21673397 gactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 21673453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 28397280 - 28397394
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  28397280 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgaggattaatata 28397378  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || ||||| |||||||    
T  28397379 ctcccagggcatcaag 28397394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 22525290 - 22525403
Alignment:
Q  212 atgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatac 308  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  22525290 atgcgacttcgacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatatac 22525388  T
Q  309 ttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||| |||||||    
T  22525389 ttccagggcatcaag 22525403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22873631 - 22873581
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22873631 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 22873581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26355919 - 26355806
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| ||| | |||   | ||||||||||| || | |||||| |||    
T  26355919 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatctt-aaccatttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatt 26355821  T
Q  468 tggaacatcatcatc 482  Q
    |||||||||||||||    
T  26355820 tggaacatcatcatc 26355806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 480
Target Start/End: Original strand, 26223821 - 26223921
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  26223821 gcatcaagccccaatcgctgaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 26223919  T
Q  479 ca 480  Q
    ||    
T  26223920 ca 26223921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16092660 - 16092604
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16092660 actatgcaacttagacatgttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 16092604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16410609 - 16410428
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  16410609 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgaatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattat---agtattaatatactttcagggcat-aagcc 16410514  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16410513 cccaacagttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 16410428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20502491 - 20502377
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  20502491 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatata 20502393  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || ||||| |||||||    
T  20502392 ctcccagggcatcaag 20502377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 21673458 - 21673510
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21673458 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 21673510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 24755511 - 24755559
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24755511 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 24755559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40493364 - 40493250
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  40493364 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtgataccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatata 40493266  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||| ||| |||||||    
T  40493265 cttcaagggcatcaag 40493250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26356033 - 26355978
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26356033 actatgcaacttaaacctcttgtatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 26355978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17354240 - 17354105
Alignment:
Q  293 ttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  |||||| |    
T  17354240 ttgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcat-gagccccta 17354144  T
Q  393 ac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaaca 430  Q
    || |||| |||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  17354143 acaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaaca 17354105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19259913 - 19259863
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19259913 cgactatgcaacttagacctcttatatgcacgtggtaccaattcagggcat 19259863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Original strand, 6520249 - 6520390
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctct 449  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | |||||||||    
T  6520249 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccgacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctct 6520345  T
Q  450 tatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6520346 taaatatatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 6520390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22011028 - 22010846
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  22011028 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagc---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 22010933  T
Q  326 cccatc-gctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| | | | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22010932 cccaacagtttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccctaacaaatgtatgctaatgcat 22010846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17927066 - 17926902
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  17927066 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcctccagc---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 17926971  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17926970 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 17926902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 21673608 - 21673648
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673608 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 21673648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 22995573 - 22995687
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  22995573 aatgcgacttctacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatttggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatata 22995671  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || ||||| |||||||    
T  22995672 ctcccagggcatcaag 22995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28649366 - 28649298
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28649366 tatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatccgggacatcaagcccccatcgctatttgag 28649298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38855474 - 38855350
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgat 466  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  38855474 aaagctccagtgcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacataacaactt-aacttcttataaacaacaacctcttatat--atccaataat 38855378  T
Q  467 ttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38855377 ttggaacatcatcatcttaatcaactta 38855350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2419260 - 2419186
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2419260 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttatacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccc 2419186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 478
Target Start/End: Original strand, 32121634 - 32121732
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  32121634 gcatcaagctccaatcactgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaactcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 32121732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 983641 - 983515
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctct 449  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  ||| |||| |||| |  | || ||||||    
T  983641 ccaacgtggtgag--caaagactccagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctct 983545  T
Q  450 tatattaatccaatgatttggaacatcatc 479  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  983544 tataaaaatccaataatttggaacatcatc 983515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22419800 - 22419696
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta-tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatac 308  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  22419800 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttat-cttcttaatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatatac 22419703  T
Q  309 ttccagg 315  Q
    |||||||    
T  22419702 ttccagg 22419696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 174
Target Start/End: Original strand, 5760200 - 5760249
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5760200 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcat 5760249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Original strand, 15070536 - 15070581
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacc 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15070536 tttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacc 15070581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 20498448 - 20498506
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20498448 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcat 20498506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20533789 - 20533685
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggaca 318  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||| |||| |||||||||||     ||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  20533789 caacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtatcaatccaggacatcaagcccccaacgtatataagtattaatatacttccagggca 20533690  T
Q  319 tcaag 323  Q
    |||||    
T  20533689 tcaag 20533685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 37515145 - 37515206
Alignment:
Q  77 catcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37515145 catcgtataatcttcataagcaatacattaacaacacatggatagaagacaactcaacaact 37515206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 4483052 - 4483136
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4483052 gactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatact 4483136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Original strand, 24755584 - 24755667
Alignment:
Q  345 taatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24755584 taatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 24755667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6102889 - 6102834
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 180  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6102889 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaaaaacttaacaactcatggatga 6102834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Original strand, 32121441 - 32121480
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32121441 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 32121480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 283
Target Start/End: Original strand, 20498329 - 20498367
Alignment:
Q  245 tcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20498329 tcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 20498367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20856785 - 20856608
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||   |  ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  20856785 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatgagccccca--acagtttaagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 20856689  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||  ||| |||||| ||| |||||  |||  |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20856688 caattattttgagctaaagctccatcgttgtgaggacaagactccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 20856608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16861681 - 16861534
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  16861681 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 16861586  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcat 382  Q
    |  | |||||||  ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16861585 caattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcat 16861534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 21285481 - 21285539
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21285481 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagccctcagcaatgaatgctaatgcat 21285539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22963802 - 22963688
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || || |||||||| |||||||||    
T  22963802 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaaaccctcaact-tatttgagaattaatata 22963704  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || | ||| |||||||    
T  22963703 ctcctagggcatcaag 22963688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 22984015 - 22984129
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||    
T  22984015 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatatggtaccaatccagggcatcaagcccttaact-tatttgagcattaatata 22984113  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || | ||| |||||||    
T  22984114 ctcctagggcatcaag 22984129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 32121396 - 32121444
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32121396 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaacaac 32121444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17267211 - 17267180
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267211 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 17267180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18678340 - 18678277
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  18678340 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 18678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Original strand, 24352926 - 24352957
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24352926 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 24352957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15611705 - 15611640
Alignment:
Q  346 aatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15611705 aatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 15611640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19930032 - 19929982
Alignment:
Q  157 aacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||    
T  19930032 aacaacttgacaactcatggataacaacttattaacaacgactttgactcg 19929982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6102813 - 6102780
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6102813 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 6102780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16413567 - 16413471
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatc 476  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  |  |||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  16413567 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaattaaatgacctctta-aatagtccaataatttggaacatc 16413471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22253512 - 22253479
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22253512 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 22253479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26225652 - 26225619
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26225652 atgcatgtggtaccaattcagggcatcaagcccc 26225619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35027164 - 35027104
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  35027164 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaaat-tatttgagcattaatatacttc 35027104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 16799257 - 16799289
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16799257 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 16799289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19155235 - 19155203
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19155235 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 19155203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 23478199 - 23478235
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23478199 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 23478235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23944299 - 23944228
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23944299 atgcatgtggtaccaaca-agggcatcaagtccccaaagtatttaagtattaatatacttccagggcatcaag 23944228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 26219518 - 26219550
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26219518 atgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccc 26219550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29763946 - 29763914
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29763946 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 29763914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Original strand, 37515198 - 37515238
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  37515198 tcaacaacttaacaactcatgaatgacaattcatcaacaac 37515238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 37515299 - 37515371
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  37515299 atgcatgtggtaccagtccagggcatcaagcccccaacgtatttgagcattaatatactcctagggcatcaag 37515371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 144)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 158 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22108046 - 22107688
Alignment:
Q  158 acaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatg 257  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108046 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatg 22107947  T
Q  258 tggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacg 357  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||    
T  22107946 tggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcg 22107849  T
Q  358 tggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatatta 456  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107848 tggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatagactcgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatatta 22107750  T
Q  457 atccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22107749 gtccaataatttggaacatcattatcttcaaaaacttagacaacatcaacaacttaagactc 22107688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21808780 - 21808488
Alignment:
Q  202 gactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtat 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21808780 gactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtat 21808681  T
Q  301 taatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21808680 taatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa 21808582  T
Q  401 tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21808581 ggctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 21808488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 226 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19661202 - 19660934
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19661202 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagc 19661103  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19661102 ccccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccatggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacctct 19661004  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19661003 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 19660934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21293335 - 21293076
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21293335 actatgctacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 21293236  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21293235 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaattcatggactcgacctctta 21293136  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21293135 aacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 21293076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 209 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21729449 - 21729163
Alignment:
Q  209 caaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatata 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21729449 caaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatata 21729350  T
Q  308 cttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccc-aacaatgaatgctaa 406  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  21729349 cttccagggcatcaaacccccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccaaggcatcaagccccccaacaatgacggctaa 21729251  T
Q  407 tgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21729250 tgcatgaactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 21729163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 202 - 494
Target Start/End: Original strand, 22074750 - 22075041
Alignment:
Q  202 gactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtat 300  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  22074750 gactcgacaaatgtgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtagcaatacagggcatcaagcccccatcactatctgagtat 22074849  T
Q  301 taatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074850 taatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa-tttgagctaatactcaaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 22074948  T
Q  401 tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca-tcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22074949 tgctaatgcatggactcgacctcttaagcatct--attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattcttcaacaactta 22075041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8287209 - 8286942
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  8287209 actatacaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcct 8287110  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  8287109 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgggtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 8287011  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287010 aaacatcataattcgacaaccacttatattagtccagtaatttggaacatcatcatcttcatcaactta 8286942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 24493325 - 24493591
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24493325 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 24493424  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  24493425 ccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 24493522  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24493523 aaacatcttatttcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 24493591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 230 - 486
Target Start/End: Original strand, 37723660 - 37723917
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37723660 tatgcagcttagacatcttatatgcatgtggtactaatacagggcatcaagcccccatcgctattcgagtattaatatacttccagggcatcaagccccc 37723759  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37723760 atcgctaattttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaa 37723859  T
Q  429 caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  37723860 caacttaattcgacaacctcttaatttagtccaataatttggaacttcaacatcttca 37723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23390860 - 23390595
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23390860 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccattacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagccc 23390761  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||| || | |  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  23390760 ccatcactgaat--gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 23390663  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390662 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 23390595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 13095251 - 13095517
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13095251 actatccaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 13095350  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  ||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||    
T  13095351 ccatcgcta--tttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctctt 13095448  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13095449 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 13095517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21997898 - 21997633
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  21997898 actatacaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacatggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagccc 21997799  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  | | |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  21997798 ccatcgcta--tttgagctcaagctccatcatgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 21997701  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997700 aaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 21997633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 228 - 487
Target Start/End: Original strand, 25431151 - 25431410
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  25431151 actatgcaacttagacctcttacatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccc 25431250  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  25431251 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggccatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 25431348  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcat 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  25431349 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataaattggaaacatcatcatcttcat 25431410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 13025067 - 13025333
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc-cccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13025067 actatccaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagctctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 13025166  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||| |||  |||||  ||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||    
T  13025167 ccatcacta--tttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctctt 13025264  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13025265 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 13025333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Original strand, 24528976 - 24529242
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  24528976 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcc 24529075  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  24529076 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtattaagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctct 24529173  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529174 taaacatcttaaatcgacaaactcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaactta 24529242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 25421287 - 25421554
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatc-aagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag-tc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  25421287 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaggacatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 25421386  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||||||||||  ||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  25421387 cccatcgctaa--ttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcataaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctct 25421484  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421485 taaacatcataattcgacaacctcttata-taatccaataaattggaaacatcatcatcttcatcaactta 25421554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Original strand, 9077710 - 9077974
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9077710 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta--taagtattaatatacttccagggcatcaagcc 9077807  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  9077808 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctct 9077905  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||   | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077906 taaacatcttagaacaacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 9077974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 1096225 - 1096489
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  1096225 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttaagtattaatatactttcagggcatcaag-cc 1096322  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  ||| |||||| | || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  1096323 ccatcgcta--tttgagctaaagctccatcatgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 1096420  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1096421 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcaacatcttcatcaactta 1096489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 11230505 - 11230653
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11230505 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11230604  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11230605 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 11230653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Original strand, 18355609 - 18355749
Alignment:
Q  78 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355609 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 18355708  T
Q  178 tgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18355709 tgataattcatcaacaacgacttcgactcgacaaatgcgac 18355749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 11224693 - 11224841
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11224693 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11224792  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11224793 atcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 11224841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 11220107 - 11220255
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11220107 tcataaacatcgtataatcttcatagctacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11220206  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11220207 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 11220255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 11228516 - 11228664
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11228516 tcataaacatcgtataatcttcctaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11228615  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11228616 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 11228664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22108134 - 22108009
Alignment:
Q  37 cttataaacaacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa 136  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108134 cttataaacaacatcataaacaacctgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa 22108035  T
Q  137 ctcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22108034 ctcatagatgataattcatcaacaac 22108009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40724332 - 40724190
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40724332 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 40724233  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  40724232 gatgataattcatcaacaacgactttgacttgacagatgcgac 40724190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15237556 - 15237409
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15237556 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 15237457  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15237456 ctcatggatgataattca-tcacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 15237409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Original strand, 11226546 - 11226674
Alignment:
Q  90 tcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatt 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11226546 tcatagctacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatc 11226645  T
Q  190 aacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  11226646 aacaacgatcttgactcgacaaatgcgac 11226674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Original strand, 20295235 - 20295379
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20295235 aacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactca 20295334  T
Q  174 tggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20295335 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 20295379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 10752576 - 10752722
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10752576 tcataaacatcgtataatcttcgtatgtacttctttaacaacatataggtagaagacaactcgacaactca--gatgataattcatcgacaacttaacaa 10752673  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10752674 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 10752722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 38619218 - 38619329
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38619218 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 38619317  T
Q  298 tattaatatact 309  Q
    ||||||||||||    
T  38619318 tattaatatact 38619329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 23064255 - 23064391
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  23064255 tttgactcgacaaatgcggctccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 23064354  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  23064355 tattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 23064391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 23201112 - 23201312
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  23201112 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttaagtattaatatacttccagtgcat-aagcc 23201210  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  23201211 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 23201308  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  23201309 taaa 23201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 36314279 - 36314415
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36314279 ttgactcgacaaatgtgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 36314378  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  36314379 attattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 36314415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41096035 - 41095900
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41096035 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagt 41095936  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  41095935 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 41095900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 21873007 - 21873206
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  21873007 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 21873104  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  21873105 cccattgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 21873202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 10775942 - 10775819
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10775942 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 10775844  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  10775843 gaacttcatcatcttaatcaactta 10775819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 22412083 - 22412206
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22412083 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 22412181  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  22412182 gaacttcatcatcttaatcaactta 22412206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24767990 - 24767898
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24767990 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcacagatgataattcatcaacaac 24767898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 31060772 - 31060907
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  31060772 ttgactcgacaaatgcgacttcaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaaacccctatcgctatttgagt 31060871  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  31060872 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 31060907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19473401 - 19473315
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473401 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 19473315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18770366 - 18770185
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |||    
T  18770366 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcccc 18770268  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18770267 catcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 18770185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20911623 - 20911531
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20911623 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactaatagatgataattcatcaacaac 20911531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 14078902 - 14079102
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  14078902 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcggggcatgagccctcatcgttagttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 14079000  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  14079001 cccatcgttaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcat-gagcccccaacacatgtatgctaatgcatggactcgatctct 14079098  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  14079099 taaa 14079102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11581657 - 11581571
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11581657 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 11581571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20918403 - 20918317
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20918403 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 20918317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 428
Target Start/End: Original strand, 22032072 - 22032275
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  |    
T  22032072 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-ga 22032170  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacc 421  Q
    | |||||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| | |    
T  22032171 gcccccatcg-ttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagccctcaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc 22032268  T
Q  422 tcttaaa 428  Q
    |||||||    
T  22032269 tcttaaa 22032275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17517580 - 17517467
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||  |||||||||    
T  17517580 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtctcaatcgttatttgagt 17517481  T
Q  299 attaatatacttcc 312  Q
    |||| |||||||||    
T  17517480 attattatacttcc 17517467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21329898 - 21329813
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21329898 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctgttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 21329813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2154879 - 2154757
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2154879 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 2154782  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  2154781 gaacttcatcatcttaatcaactta 2154757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 32027290 - 32027412
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32027290 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 32027387  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  32027388 gaacttcatcatcttaatcaactta 32027412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 42245630 - 42245508
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42245630 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 42245533  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  42245532 gaacttcatcatcttaatcaactta 42245508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 10733208 - 10733083
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgat 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10733208 aaagctcaagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataat 10733111  T
Q  467 ttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10733110 ttggaacttcatcatcttaatcaactta 10733083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Original strand, 22411893 - 22411980
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22411893 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcaactatacaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccca 22411980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 29329640 - 29329726
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29329640 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaatccagggcatcaagcccc 29329726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 26703829 - 26704030
Alignment:
Q  226 cgactatgcaactta-gacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  26703829 cgactatgcaacttaagacctcttatatgcttgtggtaccaatttagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagc 26703927  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | ||| | |||    
T  26703928 ccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctc 26704023  T
Q  424 ttaaaca 430  Q
    |||||||    
T  26704024 ttaaaca 26704030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 26973562 - 26973763
Alignment:
Q  226 cgactatgcaactta-gacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  26973562 cgactatgcaacttaagacctcttatatgcttgtggtaccaatttagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagc 26973660  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | ||| | |||    
T  26973661 ccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctc 26973756  T
Q  424 ttaaaca 430  Q
    |||||||    
T  26973757 ttaaaca 26973763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 29329831 - 29329953
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  29329831 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttc 29329928  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  29329929 gaacttcatcatcttaatcaactta 29329953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 379 - 486
Target Start/End: Original strand, 36314484 - 36314591
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36314484 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 36314583  T
Q  479 catcttca 486  Q
    ||||||||    
T  36314584 catcttca 36314591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 284
Target Start/End: Original strand, 14047831 - 14047913
Alignment:
Q  202 gactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14047831 gactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 14047913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20807141 - 20807047
Alignment:
Q  216 gactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20807141 gactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtagtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagtattaatatact 20807047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 24066896 - 24066982
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24066896 ctttgactcaacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 24066982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 32027099 - 32027185
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32027099 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccc 32027185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11581465 - 11581342
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11581465 gctcaagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaagtcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttata-taatccaataatttg 11581367  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  11581366 gaacttcatcatcttaatcaactta 11581342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21502560 - 21502429
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttga 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |   ||  | |    
T  21502560 actttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagaccttttagatgcatgtggtaccaatccagggcatcaatccctctacgta-ataa 21502462  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21502461 gtattaatatacttccagggcatcaagccccca 21502429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 29345877 - 29345999
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29345877 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 29345974  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  29345975 gaacttcatcatcttaatcaactta 29345999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 29348350 - 29348472
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29348350 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 29348447  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  29348448 gaacttcatcatcttaatcaactta 29348472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 39245033 - 39245155
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39245033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-agtatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 39245130  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  39245131 gaacttcatcatcttaatcaactta 39245155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18319408 - 18319321
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaac-tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319408 ctttgactcgacaaatgcgactccaacattgactatgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 18319321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 265033 - 264911
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  265033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 264936  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  264935 gaacttcatcatcttaatcaactta 264911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 20908909 - 20909031
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20908909 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 20909006  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20909007 gaacttcatcatcttaatcaactta 20909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20918212 - 20918091
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  20918212 gctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcat-gactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatagtttg 20918116  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20918115 gaacttcatcatcttaatcaactta 20918091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 29350823 - 29350945
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29350823 gctcctgggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 29350920  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  29350921 gaacttcatcatcttaatcaactta 29350945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 39363290 - 39363403
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  39363290 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 39363387  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  39363388 catcttaatcaactta 39363403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10776090 - 10776004
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaac-tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10776090 ctttgactcgacaaatgcgactccaacattgactatgcaacttagaccttctatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 10776004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 31060967 - 31061087
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  31060967 ctccagagcatcaagctcccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 31061064  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  31061065 acttcatcatcttaatcaactta 31061087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20902348 - 20902247
Alignment:
Q  236 acttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  20902348 acttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 20902249  T
Q  335 aa 336  Q
    ||    
T  20902248 aa 20902247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20027329 - 20027257
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20027329 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 20027257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21367026 - 21366845
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21367026 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattat---agtattaatatactttcagggcat-aagcc 21366931  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21366930 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 21366845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 382
Target Start/End: Original strand, 23511853 - 23512006
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  || |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  23511853 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgtta-ttgaatattaatatacttccagggcat-aagcc 23511950  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcat 382  Q
    ||||||  ||| |||||  ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  23511951 cccatctttaa-tttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagggcat 23512006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Original strand, 19668781 - 19668920
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||| |||||||||   | |||||||||||    
T  19668781 ccaacgtggtgag--caaggctctagggcatcaagcccccaagaatgaatgctaatgcatggacacaacatctt-aacaacttagaacaacaacctctta 19668877  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19668878 aataagtccaataatttggaacatcatcatcatcatcaactta 19668920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 482
Target Start/End: Original strand, 21565445 - 21565555
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||   ||||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  21565445 gctccagggcgtcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggtcacaacatctt-aacaacttagaacgacaacctcttaaataagtccaataatttgg 21565543  T
Q  471 aacatcatcatc 482  Q
    ||||||||||||    
T  21565544 aacatcatcatc 21565555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26012417 - 26012359
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012417 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 26012359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 21877287 - 21877371
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  21877287 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttc 21877371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 21887042 - 21887126
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  21887042 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttc 21887126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27989317 - 27989245
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27989317 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 27989245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 20807005 - 20806888
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  20807005 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 20806908  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaac 491  Q
    |  |||||||||| ||||||    
T  20806907 aattcatcatcttaatcaac 20806888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 23064436 - 23064530
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23064436 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaccccatcatcttaatcaactta 23064530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 428
Target Start/End: Original strand, 23571893 - 23572029
Alignment:
Q  290 tatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccc 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  23571893 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaattta-agctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 23571989  T
Q  390 ccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    | ||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  23571990 caaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 23572029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21329732 - 21329596
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||    |||| |  |   |||||||||||    
T  21329732 ccaacgtggtgag--caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaact----caacctcttagaacaacctctta 21329639  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21329638 tataaattcaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 21329596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22959904 - 22959847
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22959904 cgactgtgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 22959847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36155043 - 36154923
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || || |||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  36155043 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 36154945  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  36154944 cttcatcatcttaatcaactta 36154923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 401 - 486
Target Start/End: Original strand, 40725782 - 40725867
Alignment:
Q  401 tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40725782 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 40725867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 21565291 - 21565346
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21565291 actatgcaacttagacctcttatatgcttgtggtaccaatccagggcatcaagccc 21565346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22178611 - 22178497
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |  | ||| ||||||||||||    
T  22178611 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcagcaagccctcaac-gtgtttaagtattaatata 22178513  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  22178512 cttccagggcatcaag 22178497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 19668646 - 19668700
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19668646 actatgcaacttagacctcttatatgcat-tggtaccaatccagggcatcaagccc 19668700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17517402 - 17517322
Alignment:
Q  397 tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||| ||||||||    
T  17517402 tgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctctta-aatagtccaataatttgaaacatcat 17517322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 20902247 - 20902163
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20902247 aatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctctta-aatagtccaataatttggaacttcatcatctt 20902163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17919489 - 17919326
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |  | |||| |    
T  17919489 acctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacatttattt-g 17919396  T
Q  342 aattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17919395 agttaatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgaatgctaatgcat 17919326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20027158 - 20027118
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20027158 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 20027118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 20805304 - 20805485
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || || |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  20805304 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagccctcagc---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 20805399  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20805400 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcaagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 20805485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26741035 - 26740921
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  26741035 aatgcgacttcgacttgactatccaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatata 26740937  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  26740936 cttccagggcatcaag 26740921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33896114 - 33896074
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33896114 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 33896074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 494
Target Start/End: Original strand, 38619382 - 38619453
Alignment:
Q  422 tcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38619382 tcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatcaaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 38619453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26733179 - 26733105
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26733179 aatgcgactccaacttgactatgcaacttaatcctcataatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 26733105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 261
Target Start/End: Original strand, 22142531 - 22142581
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggt 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22142531 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcatatatgcatgtggt 22142581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 325 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23501621 - 23501517
Alignment:
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  23501621 ccccatcgcta-ttttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctc 23501524  T
Q  424 ttaaaca 430  Q
    |||||||    
T  23501523 ttaaaca 23501517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 479
Target Start/End: Original strand, 24067009 - 24067114
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  24067009 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 24067107  T
Q  473 catcatc 479  Q
    | |||||    
T  24067108 cttcatc 24067114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 371 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26012255 - 26012142
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26012255 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttg 26012157  T
Q  470 gaacatcatcatctt 484  Q
    |||||||||||||||    
T  26012156 gaacatcatcatctt 26012142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33896221 - 33896167
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa 136  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33896221 tataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagataactcaacaa 33896167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21502308 - 21502255
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21502308 acaacctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 21502255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 335
Target Start/End: Original strand, 40725607 - 40725691
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  40725607 atgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 40725691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 451
Target Start/End: Original strand, 18418508 - 18418580
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  18418508 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta 18418580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19473344 - 19473292
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19473344 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 19473292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 22143951 - 22143991
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22143951 gctccagggcatcaagccctcaacaatgaatgctaatgcat 22143991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22959748 - 22959708
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959748 gctcaagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 22959708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Original strand, 23469545 - 23469647
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  23469545 actcgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcttct-tatttgagcataaatacactcccagggcat 23469643  T
Q  320 caag 323  Q
    ||||    
T  23469644 caag 23469647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 39363155 - 39363239
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  39363155 gactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatact 39363239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20911559 - 20911508
Alignment:
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20911559 caactaatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 20911508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24767927 - 24767837
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24767927 acaactcacagatgataattcatcaacaacgactttgactcatcaaatgcgaca-----------atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatca 24767839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1859326 - 1859276
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1859326 cgactatgcaaccaaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 1859276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 20766726 - 20766776
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20766726 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 20766776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 17410258 - 17410299
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17410258 cgacaatgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaat 17410299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18319293 - 18319189
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaac 473  Q
    ||||||||||||||| ||||  | || || |||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  18319293 cagggcatcaagccctcaactttaaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttggaac 18319195  T
Q  474 atcatc 479  Q
     |||||    
T  18319194 ttcatc 18319189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21732276 - 21732204
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21732276 atgcatgtggtaccaatcctgggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggcatcaag 21732204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21809927 - 21809855
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21809927 atgcatgtggtaccaatcctgggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggcatcaag 21809855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2155048 - 2154984
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2155048 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 2154984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21502375 - 21502335
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21502375 gctccagggcatcaagcccttaacaatgaatgctaatgcat 21502335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 260
Target Start/End: Original strand, 23571851 - 23571883
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23571851 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtgg 23571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23501675 - 23501636
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23501675 cgactatgcaacttaaaactcttatatgcatgtggtacca 23501636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27989146 - 27989115
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989146 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 27989115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33896173 - 33896122
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactc 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  33896173 tcaacaatttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactc 33896122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41095747 - 41095696
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaaca 430  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  41095747 gcatcaagcctccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaaca 41095696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 16227255 - 16227326
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16227255 atgcatgtggtaccaac-cagggcatcaagccctcaact-tatttgagcataaatatactcccaggacatcaag 16227326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21885506 - 21885466
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21885506 cgacaatgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 21885466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 23458355 - 23458396
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23458355 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 23458396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 23462616 - 23462657
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23462616 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 23462657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25574813 - 25574741
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  25574813 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcataaatacactcccagggcatcaag 25574741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 26172253 - 26172293
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26172253 cgacaatgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 26172293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27989073 - 27989036
Alignment:
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcat 481  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27989073 acctcttatataaatccaataatttggaacatcatcat 27989036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 15796195 - 15796227
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15796195 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 15796227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 17010844 - 17010880
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17010844 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 17010880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 312
Target Start/End: Original strand, 18418376 - 18418416
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18418376 gcatcaagccccaatctctatttgagtattattatacttcc 18418416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 19076340 - 19076376
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19076340 cttcaacaacttaaacaacattaacaacttaagactc 19076376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25576006 - 25575974
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25576006 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 25575974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 200)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 125 - 518
Target Start/End: Original strand, 14257914 - 14258307
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  14257914 acaacttaacaactcatggatgacaattcctcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggc-aatgcaacttcgac 14258012  T
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14258013 ttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgataattgagtattaatatacttccagggcatcaag 14258112  T
Q  324 tccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaag-cccccaac-aatg-aatgctaatgcatagtctcgac 420  Q
     |||||||||  | |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| || | ||||||    
T  14258113 cccccatcgc--aatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcatgccccccaacaaatgaaatgctaatgtatggactcgac 14258210  T
Q  421 ctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14258211 ctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagacaacatcaacaacttaagactc 14258307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 202 - 494
Target Start/End: Original strand, 26211725 - 26212018
Alignment:
Q  202 gactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtatt 301  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26211725 gactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatcgctatttgagtatt 26211824  T
Q  302 aatatacttccaggacatcaagtcccc-atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 400  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211825 aatatacttccagggcatcaaggcccccatcgctaatct-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 26211923  T
Q  401 tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca-tcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26211924 tgctaatgcatggactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattcttcaacaactta 26212018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 10588792 - 10589061
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10588792 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacatggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 10588891  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgct---aatgcatagtctcgacctc 423  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||    
T  10588892 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctgctaatgcatggactcgacctc 10588990  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10588991 ttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcgacaactta 10589061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 230 - 494
Target Start/End: Original strand, 34200541 - 34200808
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctattt-gagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||     
T  34200541 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccaaggcatcaaaccct 34200640  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt-a 426  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  34200641 catcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 34200740  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34200741 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 34200808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11996393 - 11996126
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11996393 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 11996294  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  11996293 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagagcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacctctta 11996195  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11996194 aaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 11996126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 9508945 - 9509211
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  9508945 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcatgcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaaccc 9509044  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  9509045 ccatcgct-attttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 9509143  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509144 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 9509211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 76 - 276
Target Start/End: Original strand, 20487186 - 20487386
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20487186 acatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 20487285  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  20487286 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaattcaactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatatggtatcaattcagggca 20487385  T
Q  276 t 276  Q
    |    
T  20487386 t 20487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 12698588 - 12698853
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcc-ccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||    
T  12698588 actatgcaacttagacctcttataagcatgtggtaccaatacagggcatcaagccgccatcactatttgagtattaatatacttccaaggaatcaagccc 12698687  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12698688 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccaggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctctt 12698785  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698786 agacatcttaattcaacaaccttttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 12698853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 249 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28505629 - 28505397
Alignment:
Q  249 atatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  28505629 atatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaa 28505530  T
Q  348 tgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacct 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||              |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505529 tgctccaacgtggtgagtacaaagctccaggg--------------caatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacct 28505444  T
Q  448 cttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28505443 cttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatctta 28505397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 454
Target Start/End: Original strand, 13032514 - 13032741
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13032514 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtgttaccaatacaaggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 13032613  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  13032614 ccattgct-attttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 13032712  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatat 454  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13032713 aaacatcttaattcgacaacctcttatat 13032741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16386529 - 16386347
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386529 cagggcatcaagcccccatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtaaaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 16386430  T
Q  412 agtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16386429 ggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 16386347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 18301663 - 18301828
Alignment:
Q  48 catcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatga 147  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18301663 catcataagcaacttaacaacgtcatgaacatcgtgtaatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcatagatga 18301762  T
Q  148 taattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  18301763 taattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaat 18301828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12705381 - 12705233
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12705381 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 12705282  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12705281 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 12705233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13919217 - 13919069
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13919217 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 13919118  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  13919117 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacagatgcgac 13919069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 39721625 - 39721773
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39721625 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaa 39721724  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39721725 ctcatggatgataattcattaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 39721773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Original strand, 24274789 - 24275001
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  24274789 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcctcaacaacgactttgactcgac-aatgcaacttcaac 24274887  T
Q  225 tcgactat--gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatca 321  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  24274888 tcaactatgcgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatca 24274987  T
Q  322 agtccccatcgcta 335  Q
    |||| | |||||||    
T  24274988 agtctcaatcgcta 24275001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25927968 - 25927815
Alignment:
Q  67 acgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatc--aacaactt 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  25927968 acgtcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaaaaaaactt 25927869  T
Q  165 aacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25927868 aacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 25927815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2530876 - 2530728
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530876 tcataaacatcgtataatcttcatgggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcttagatgataattcatcaacaacttaacaa 2530777  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2530776 ttcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 2530728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2832919 - 2832771
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832919 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 2832820  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2832819 atcatggatgataattcatcaacaacgactttgacttgacaaatgcgac 2832771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 10064189 - 10063925
Alignment:
Q  222 aactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  10064189 aacttgactatgcaacttaatcctctaatcatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttc-agggcat 10064091  T
Q  320 caagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcg 418  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||    
T  10064090 caagcccctatcgctaatt--gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcg 10063993  T
Q  419 acctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  10063992 acttcttaaacatcttcattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacaccttca 10063925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 15083555 - 15083703
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15083555 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgatatttcatcgacaacttaacaa 15083654  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15083655 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 15083703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45170747 - 45170605
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45170747 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 45170648  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45170647 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 45170605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 317 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 27848106 - 27847937
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtct 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  27848106 catcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagcttcagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggact 27848007  T
Q  417 cgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27848006 cgacctcttaaacaacttaattcggcaacctcttatactagtccaataatttggaacatcatcatcttca 27847937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 411
Target Start/End: Original strand, 16579188 - 16579514
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16579188 aacatcatataatcttcataagcacttcgataacaacacctgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 16579287  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtacc 264  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||                    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||    
T  16579288 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa--------------------tgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtacc 16579367  T
Q  265 aatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtga 363  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| |||    
T  16579368 aatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttga 16579465  T
Q  364 gtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcat 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16579466 gtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 16579514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 317 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15755164 - 15754986
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtct 416  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  15755164 catcaagcccccatcgttaattttgaggtaatgcaccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggatt 15755065  T
Q  417 cgacctctt-aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15755064 cgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttggaacatcatcatcttcaacaactta 15754986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 228 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15755317 - 15755152
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15755317 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 15755218  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15755217 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggcgagtacaaacctccaaggcatcaagccccca 15755152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1859546 - 1859398
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1859546 tcataaacatcgtataaccttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcgtagatgataattcatcgacaacttaacaa 1859447  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  1859446 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacagatgcgac 1859398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 18425044 - 18425192
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18425044 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 18425143  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18425144 ctcatggatgataactcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 18425192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 26291756 - 26291904
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26291756 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 26291855  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26291856 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 26291904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16586474 - 16586149
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16586474 aacatcatataatcttcatcagcacttcgataacaacacctgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 16586375  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtacc 264  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||                    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||    
T  16586374 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa--------------------tgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtacc 16586295  T
Q  265 aatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtga 363  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| |||    
T  16586294 aatccagg-catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttga 16586198  T
Q  364 gtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcat 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16586197 gtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 16586149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 494
Target Start/End: Original strand, 38227210 - 38227503
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgag 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||     |||| |||    
T  38227210 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcattttttaccaatccagggcatcaagcccccaacgtatt-gag 38227308  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaat 397  Q
      | ||||  || ||||| ||||||| || || |  ||  |||||  ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227309 cgtaaataggctcccagggcatcaagccctcaact-ta--tttgagctatagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaat 38227405  T
Q  398 g-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38227406 gaaattctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatctactta 38227503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 71484 - 71341
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  71484 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 71385  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  71384 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 71341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 75593 - 75450
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  75593 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 75494  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  75493 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 75450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16907928 - 16907785
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16907928 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 16907829  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16907828 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 16907785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 18282755 - 18282898
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18282755 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 18282854  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  18282855 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 18282898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18155204 - 18155003
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  18155204 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 18155106  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  18155105 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 18155009  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  18155008 taaaca 18155003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15605934 - 15605818
Alignment:
Q  150 attcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 249  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605934 attcatcaacaactcaaaaactcatggatgataattcatcaacaacgaatttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 15605835  T
Q  250 tatgcatgtggtaccaa 266  Q
    |||||||||||||||||    
T  15605834 tatgcatgtggtaccaa 15605818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 32498 - 32641
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32498 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 32597  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  32598 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 32641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 12718057 - 12718200
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12718057 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaatacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12718156  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  12718157 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 12718200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 12722968 - 12723111
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12722968 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaatacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12723067  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  12723068 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 12723111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 16113630 - 16113773
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16113630 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 16113729  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16113730 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 16113773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 16116783 - 16116926
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16116783 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 16116882  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16116883 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 16116926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 18278792 - 18278935
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18278792 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 18278891  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||    
T  18278892 ggatgataattcatcaacaacgaccttgacttgacatatgcgac 18278935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 9703016 - 9703215
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  9703016 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 9703113  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  9703114 cccatcgctaa-tttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 9703211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19649853 - 19649653
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  19649853 cgactatgcaacttagacctcttatatccatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 19649755  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  19649754 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 19649657  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  19649656 taaa 19649653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 13869090 - 13869226
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13869090 tttgactcgacaaatgcgacttcaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 13869189  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  13869190 tattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 13869226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 373 - 486
Target Start/End: Original strand, 40443292 - 40443405
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  40443292 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaaccttttatattagtccaataatttggaa 40443391  T
Q  473 catcatcatcttca 486  Q
     |||||||||||||    
T  40443392 tatcatcatcttca 40443405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 15144396 - 15144143
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15144396 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagtattaatatacttccagggcatcaaatcc 15144298  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaa-gctccagggcatcaagccccca--acaatg-aatgctaatgcatagtctcgacct 422  Q
     ||||||||   ||||  ||| |||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||   | ||| ||| |||||||||   |||||| |    
T  15144297 tcatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttga--gcaaaggctccagggcatctagcccccatcgctatgaaatactaatgcatgaactcgacat 15144203  T
Q  423 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatct 483  Q
    |||||||  ||| |  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15144202 cttaaacctctttaaacaacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatct 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 44116405 - 44116528
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44116405 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttg 44116503  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  44116504 gaacttcatcatcttaatcaactta 44116528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3564668 - 3564565
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3564668 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcc 3564569  T
Q  326 ccca 329  Q
    ||||    
T  3564568 ccca 3564565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 482
Target Start/End: Original strand, 15211207 - 15211460
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||  || |    
T  15211207 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggcaccaatacagggcatgagcccccaacgttatttgaatattaatatacttccagggcat-gagcc 15211305  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  15211306 cccatcgttaa-tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacttatgtatgctaatgcatggactctaactct 15211403  T
Q  425 t-aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    | ||||| ||||||   |  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15211404 taaaacatcttaat--catcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatc 15211460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38898796 - 38898646
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  38898796 ctttgactcgacaaatgcaactccaacttgactatgcaacttagacttcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttga 38898697  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaat 348  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  38898696 gtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttgagaattaat 38898646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 24054218 - 24054419
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  24054218 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcc 24054316  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||||| |||  |||||  ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| | ||    
T  24054317 cccatctcta--tttgagctaaagctccatcgcgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatcact 24054413  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  24054414 taaaca 24054419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 40443209 - 40443311
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40443209 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 40443308  T
Q  327 cca 329  Q
    |||    
T  40443309 cca 40443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7519762 - 7519669
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaact 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7519762 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaact 7519669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 16495104 - 16495240
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  16495104 ttgactcgacaaatgtgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaaacccctatcgctatttgagt 16495203  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  16495204 attattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 16495240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15082370 - 15082252
Alignment:
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15082370 taacaactcatggatgataattcatca-caacgactttgactcgacaagtgcgactccgacttgagtatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 15082272  T
Q  264 caatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  15082271 caatccaggacatcaagccc 15082252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17138425 - 17138225
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  17138425 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 17138327  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  17138326 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctct 17138229  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  17138228 taaa 17138225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 486
Target Start/End: Original strand, 13647225 - 13647339
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa-caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13647225 tccaaggcattaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 13647324  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||| ||||    
T  13647325 acatcatcatattca 13647339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 20110260 - 20110346
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20110260 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 20110346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 47831521 - 47831606
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47831521 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 47831606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 13647026 - 13647162
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13647026 ttgactcgacaaatgcgactctaacccgactatgcaacttagacctattatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagt 13647125  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| ||||||||||   ||||||| ||| |||||||    
T  13647126 attattatacttccaaagcatcaagccccaatcgcta 13647162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18456634 - 18456511
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18456634 gctccagggcatcaagcccctaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 18456536  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  18456535 gaacttcatcatcttaatcaactta 18456511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 20110452 - 20110575
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20110452 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 20110550  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20110551 gaacttcatcatcttaatcaactta 20110575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Original strand, 13831118 - 13831255
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13831118 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatacaacttagacctcttatatgcatgtgttaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttga 13831217  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  13831218 atattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 13831255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42376414 - 42376304
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  42376414 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagaccttttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagt 42376315  T
Q  299 attaatatact 309  Q
    |||||||||||    
T  42376314 attaatatact 42376304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 44116257 - 44116343
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44116257 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 44116343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 16213324 - 16213461
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctcta-tttgag 297  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  16213324 ttgactcgacaaatgtgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctattttgag 16213423  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  16213424 tattattatacttccggagcatcaagccccaatcgcta 16213461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 11972393 - 11972515
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11972393 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 11972490  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  11972491 gaacttcatcatcttaatcaactta 11972515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 14949387 - 14949265
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14949387 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 14949290  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  14949289 gaacttcatcatcttaatcaactta 14949265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16402801 - 16402713
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccagg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16402801 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagg 16402713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 32125388 - 32125510
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32125388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 32125485  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  32125486 gaacttcatcatcttaatcaactta 32125510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 41522814 - 41522936
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41522814 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 41522911  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  41522912 gaacttcatcatcttaatcaactta 41522936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 41525276 - 41525398
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41525276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 41525373  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  41525374 gaacttcatcatcttaatcaactta 41525398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 48273288 - 48273411
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  48273288 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 48273386  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  48273387 gaacttcatcatcttaatcaactta 48273411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 16585087 - 16585227
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16585087 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 16585186  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  16585187 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 16585227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32216912 - 32216713
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| || || | ||| ||| |    
T  32216912 cgactatgcaacttagacctctt-tatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaaaatattttcaaggcat-aagcc 32216815  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  32216814 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttaagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 32216717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3564584 - 3564463
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  3564584 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttaga 3564486  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  3564485 acttcatcatcttcatcaactta 3564463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12256222 - 12256137
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12256222 actttgactcgacaa-tgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 12256137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 22072712 - 22072798
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22072712 acttcgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggaatcaagccc 22072798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15376978 - 15376856
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15376978 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 15376881  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  15376880 gaacttcatcatcttaatcaactta 15376856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 16409956 - 16410078
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16409956 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacgtctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 16410053  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  16410054 gaacttcatcatcttaatcaactta 16410078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21189860 - 21189738
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21189860 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 21189763  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  21189762 gaacttcatcatcttaatcaactta 21189738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 12186771 - 12186971
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  12186771 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatttagggcatgagcctccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 12186869  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  12186870 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctctagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctct 12186967  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  12186968 taaa 12186971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 14429639 - 14429819
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  14429639 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattat---agtattaatatactttcagggcat-aagcc 14429734  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14429735 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaatgtatgctaatgcat 14429819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16461478 - 16461338
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatg 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||  ||  ||| |    
T  16461478 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaacgctatttgagtactaatatactttcagggcatcaagccctcatcgctaatt--gagctaaag 16461381  T
Q  350 ctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16461380 cttcaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagccccca 16461338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18456782 - 18456699
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18456782 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagatcttttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagc 18456699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16220119 - 16220034
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16220119 actttgactcgacaaatgtgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa-ccagggcatcaagccc 16220034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17062290 - 17062204
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17062290 ctttgactcgacaaatgcgaatccgacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 17062204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16461355 - 16461233
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgc 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||  ||||| |    
T  16461355 cagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgttttgagtac 16461258  T
Q  368 aaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16461257 aaagctccagggcatcaagccccca 16461233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28505703 - 28505626
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505703 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatat 28505626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 456218 - 456340
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  456218 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 456315  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  456316 gaacttcatcatcttaatcaactta 456340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Original strand, 16056049 - 16056133
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16056049 tttgactcgagaaatgcgactcgaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 16056133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 16232417 - 16232539
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16232417 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 16232514  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  16232515 gaacttcatcatcttaatcaactta 16232539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20385388 - 20385266
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20385388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 20385291  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20385290 gaacttcatcatcttaatcaactta 20385266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 24702135 - 24702257
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24702135 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24702232  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24702233 gaacttcatcatcttaatcaactta 24702257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 24704585 - 24704707
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24704585 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24704682  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24704683 gaacttcatcatcttaatcaactta 24704707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 27216757 - 27216879
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27216757 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 27216854  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  27216855 gaacttcatcatcttaatcaactta 27216879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 379 - 486
Target Start/End: Original strand, 16495309 - 16495416
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16495309 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 16495408  T
Q  479 catcttca 486  Q
    ||||||||    
T  16495409 catcttca 16495416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2282651 - 2282566
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2282651 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 2282566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29329334 - 29329248
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29329334 ctttgacttgacaaaggcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 29329248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11393552 - 11393430
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11393552 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 11393455  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||    
T  11393454 gaactccatcatcttaatcaactta 11393430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 48273098 - 48273182
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48273098 ttgacttgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatgtgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 48273182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 195
Target Start/End: Original strand, 14257823 - 14257951
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactc--------aacaactcatagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14257823 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaattcgtcaacaacttaa 14257922  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  14257923 caactcatggatgacaattcctcaacaac 14257951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 3386232 - 3386352
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  3386232 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatgaactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 3386329  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  3386330 acttcatcatcttaatcaactta 3386352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 335
Target Start/End: Original strand, 3386095 - 3386215
Alignment:
Q  215 cgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttcca 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3386095 cgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatacatgtgatactaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tcca 3386193  T
Q  314 ggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |  ||||||| ||| |||||||    
T  3386194 gagcatcaagcccctatcgcta 3386215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 13869271 - 13869365
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13869271 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 13869365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 20585135 - 20585275
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20585135 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacatgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 20585234  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  20585235 caactcatggatgacaactcatcaacaatgactttgactcg 20585275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 399 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38898614 - 38898517
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaac 497  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  38898614 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcaccatcttaatcaacttaaac 38898517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15082147 - 15082039
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  15082147 gctccagggcatcaagccccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttg 15082049  T
Q  470 gaacatcatc 479  Q
    |||| |||||    
T  15082048 gaacttcatc 15082039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17017808 - 17017694
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  17017808 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatata 17017710  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  17017709 cttccagggcatcaag 17017694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 18640169 - 18640291
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  18640169 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaactctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-tagtccaataatttg 18640266  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || | |||||||||| |||||||||    
T  18640267 gaccttcatcatcttaatcaactta 18640291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27848152 - 27848096
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27848152 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagcccc 27848096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 67490 - 67545
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  67490 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 67545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 32300747 - 32300810
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32300747 aacatcgtataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 32300810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 490
Target Start/End: Original strand, 13831272 - 13831388
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  13831272 ctccagagcatcaagcctccaaccaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 13831369  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaa 490  Q
    || |||||||||| |||||    
T  13831370 acttcatcatcttaatcaa 13831388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16461250 - 16461180
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaatt 338  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16461250 cagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatt 16461180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19486937 - 19486851
Alignment:
Q  400 atgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19486937 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 19486851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9178017 - 9177905
Alignment:
Q  212 atgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta-tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatact 309  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||| |||||||||    
T  9178017 atgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatatgcatgtggtacaaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtactaatatact 9177919  T
Q  310 tccaggacatcaag 323  Q
    |||||| |||||||    
T  9177918 tccagggcatcaag 9177905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 12714353 - 12714413
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12714353 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaa 12714413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 16091528 - 16091641
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatac 308  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||    
T  16091528 aatgcgacttcaacttgactatgcaactta-acttcttaatcatgcatgtggtagcaatacagggcatcaagccctcaatgtatttaagtattaatatac 16091626  T
Q  309 ttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||| |||||||    
T  16091627 ttccagggcatcaag 16091641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16219935 - 16219821
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||||||||   | |||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  16219935 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacaacttagaacaacaacctcttatataagtcgaataatttgg 16219837  T
Q  471 aacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||    
T  16219836 aacatcatcatcttca 16219821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 18005395 - 18005450
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18005395 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccc 18005450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20220541 - 20220427
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatac 308  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    | | ||| |||||||||||||    
T  20220541 aatgcgacttcaacttgattatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaatgtgtttaagtattaatatac 20220442  T
Q  309 ttccaggacatcaag 323  Q
    ||||| | |||||||    
T  20220441 ttccaaggcatcaag 20220427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 44013928 - 44013983
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44013928 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 44013983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 11858333 - 11858383
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11858333 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 11858383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 18427433 - 18427510
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttat 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18427433 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat 18427510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9033689 - 9033587
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9033689 actcgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatataatcccaggacat 9033591  T
Q  320 caag 323  Q
    ||||    
T  9033590 caag 9033587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15008889 - 15008776
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  15008889 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttagatctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 15008792  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  15008791 cttccagggcatcaag 15008776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Original strand, 16213530 - 16213632
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  16213530 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaatgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 16213628  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  16213629 catc 16213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 18005531 - 18005590
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005531 ccaacgtggtgagcaaaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 18005590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 811507 - 811449
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc-aatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  811507 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaaatccaaggcatcaagccc 811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2280357 - 2280299
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280357 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 2280299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26356258 - 26356141
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaat---tcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26356258 cagggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttgg 26356161  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  26356160 aacttcatcatcttaatcaa 26356141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26358710 - 26358593
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaat---tcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26358710 cagggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttgg 26358613  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  26358612 aacttcatcatcttaatcaa 26358593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 44014064 - 44014122
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014064 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 44014122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 67644 - 67767
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  67644 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttg 67742  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  67743 gaacatcatcatcttaatcaactta 67767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Original strand, 2759899 - 2760076
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  2759899 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 2759994  T
Q  331 c-gctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    | | | ||||| |   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2759995 cagtttattttaagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 2760076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 14044478 - 14044591
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  14044478 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttacacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 14044575  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  14044576 cttccagggcatcaag 14044591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 14354508 - 14354621
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  14354508 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttacacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 14354605  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  14354606 cttccagggcatcaag 14354621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 18203581 - 18203695
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||| || ||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||    
T  18203581 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaaccattcatgtggtaccaatccaaggcatcaagtcctcaac-gtatttaagtattaatata 18203679  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  18203680 cttccagggcatcaag 18203695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12466617 - 12466481
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        |||  |||| || ||||| |||||||||    
T  12466617 aacatcatataatcctaataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatgtatgacaactcatccacaacttaa 12466518  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttga 203  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  12466517 caactcatggatgacaactcatcaacaatgactttga 12466481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 12901039 - 12901125
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactat-gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12901039 actttgactcgacaa-tgcgacctcaacttgactattgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcgagccc 12901125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14183930 - 14183867
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14183930 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 14183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 14323140 - 14323214
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14323140 aatgcgacatcaacttgactatgcaacttacacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 14323214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15605590 - 15605547
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605590 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15605547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 16056214 - 16056272
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16056214 ccaacgtggtgagcg-aaggctacagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 16056272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16461560 - 16461505
Alignment:
Q  151 ttcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactc 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  16461560 ttcattaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactc 16461505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Original strand, 48990961 - 48991062
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatc 320  Q
    |||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48990961 actcgactatgcaactta-acttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaatccttcaatgtatttaagtattaatatacttccaggacatc 48991059  T
Q  321 aag 323  Q
    |||    
T  48991060 aag 48991062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14933199 - 14933112
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaaca 168  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14933199 ttcataagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaaca 14933112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15356634 - 15356547
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaaca 168  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15356634 ttcataagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaaca 15356547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15360748 - 15360661
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaaca 168  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15360748 ttcataagtactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaaca 15360661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19487024 - 19486962
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19487024 atgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttcc 19486962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Original strand, 47831687 - 47831829
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctct 449  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | |||||||||    
T  47831687 ccaacgtggtgag--caaaggctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctct 47831783  T
Q  450 t-atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47831784 taatatatatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 47831829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 12317914 - 12317955
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12317914 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 12317955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Original strand, 15580468 - 15580513
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15580468 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtagcattacagggcat 15580513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17062177 - 17062058
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  17062177 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggatt-gacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgta-taatccaataatttgaaa 17062080  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  17062079 cttcatcatcttaatcaactta 17062058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 811350 - 811310
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811350 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 811310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14933087 - 14933051
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14933087 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14933051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14933158 - 14933118
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14933158 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 14933118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15356522 - 15356486
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356522 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 15356486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15356593 - 15356553
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15356593 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15356553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15360636 - 15360600
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360636 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 15360600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15360707 - 15360667
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15360707 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15360667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Original strand, 24274787 - 24274826
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24274787 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 24274826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Original strand, 32300802 - 32300853
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactc 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  32300802 tcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactc 32300853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12321988 - 12321923
Alignment:
Q  346 aatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12321988 aatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 12321923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1868331 - 1868234
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctat-ttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||   || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1868331 gactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatctagggcattaagccc--tcaacatattaagtattaatatacttccagggcatcaag 1868234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9752076 - 9752035
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9752076 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 9752035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11525913 - 11525841
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  11525913 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcataaatatactcccagggcatcaag 11525841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11772602 - 11772530
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  11772602 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcctagggcatcaag 11772530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14152321 - 14152280
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14152321 cgacaatgcaacttagaccttttatatgcatgtggtaccaat 14152280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15082423 - 15082374
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15082423 ttcataagtacttcattaataacacatggatagaagacaactcaacaact 15082374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 441 - 494
Target Start/End: Original strand, 22072882 - 22072935
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22072882 acaacctcttatatatatccaatagtttggaacatcatcatcttaatcaactta 22072935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14183875 - 14183823
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||    
T  14183875 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactaatcaaaaacgactttgactcg 14183823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16461174 - 16461130
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16461174 aaagctccagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcat 16461130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 24274742 - 24274790
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24274742 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaacaac 24274790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Original strand, 14044651 - 14044682
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044651 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 14044682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Original strand, 14354681 - 14354712
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354681 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 14354712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 16213442 - 16213505
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  16213442 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 16213505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 494
Target Start/End: Original strand, 18430692 - 18430731
Alignment:
Q  455 taatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18430692 taatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 18430731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1868214 - 1868180
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1868214 aaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaatg 1868180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15008734 - 15008685
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008734 ccaacgtggtgagta-aaggcttcagggcatcaagcccccaacaatgaatg 15008685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 322
Target Start/End: Original strand, 16995968 - 16996065
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  16995968 gactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaaaccctaaacttatttgagcataaatatactcccagggcatcaa 16996065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20220407 - 20220373
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20220407 aaagctccaggtcatcaagcccccaacaatgaatg 20220373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 131165 - 131132
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  131165 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 131132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 811280 - 811239
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  811280 acaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatcatc 811239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12256056 - 12255998
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  12256056 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccatcactgaatgcgaatgcat 12255998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14183797 - 14183764
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14183797 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 14183764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15605926 - 15605889
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15605926 acaactcaaaaactcatggatgataattcatcaacaac 15605889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 267
Target Start/End: Original strand, 16275300 - 16275344
Alignment:
Q  222 aactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16275300 aactcgacaatgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16275344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 20585301 - 20585334
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20585301 atgcatgtggtaccaattcagggcatcaagcccc 20585334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 480
Target Start/End: Original strand, 24275090 - 24275170
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca 480  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  24275090 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacgtcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacataatca 24275170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 38519144 - 38519177
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38519144 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 38519177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 42461721 - 42461793
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  42461721 atgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccccatct-tatttgagcataaatacactcccagggcatcaag 42461793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2280266 - 2280226
Alignment:
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2280266 acctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatctt 2280226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 267
Target Start/End: Original strand, 3271602 - 3271646
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3271602 actcgacaatgcaaccaaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 3271646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14162057 - 14162025
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14162057 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 14162025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 14273335 - 14273371
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14273335 cttcaacaacttaaacaacattaacaacttaagactc 14273371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 396
Target Start/End: Original strand, 22072857 - 22072885
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072857 aaagctccagggcatcaagcccccaacaa 22072885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 10790 - 10522
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10790 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 10691  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  10690 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 10591  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10590 aaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 10522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 142)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23072315 - 23072048
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23072315 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 23072216  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23072215 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctctagagcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 23072116  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23072115 aacaacttaattcgaaaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 23072048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23654752 - 23654485
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23654752 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 23654653  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccc-aacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  23654652 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagccccccaacaatgaatgctagtgcatggactcgacctctt 23654554  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23654553 aaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 23654485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38481 - 38213
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38481 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 38382  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  38381 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaag-ccccaacaatgaatgctaatgcatggactccacctctta 38283  T
Q  426 aaacaac-ttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38282 aaacaacataaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 38213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 9784394 - 9784600
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784394 tcataaacatcatataaacttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagaaaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 9784493  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784494 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 9784593  T
Q  270 agggcat 276  Q
    |||||||    
T  9784594 agggcat 9784600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 230 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23103758 - 23103502
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  23103758 tatgcagcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtagtaatatactttcagggcatcaagccccc 23103659  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23103658 atcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaag-ccccaacaatgagtgctaatgcatggactcgacctcttaaa 23103560  T
Q  429 caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23103559 caacttaattcgacaacctcttaaattagtccaatattttggaacatcatcatcttca 23103502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21900819 - 21900560
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  21900819 actatgcaacttagacctcttaaatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccc 21900720  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  21900719 ccatcgctaaatt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctctt 21900621  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21900620 aaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 21900560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 23060269 - 23060535
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23060269 actatgcaacttacacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 23060368  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23060369 ccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 23060466  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23060467 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 23060535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23040555 - 23040288
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc-cccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23040555 actatgcaacttagacctcttatatgcatatgttaccaatacagggcatcaagctcccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 23040456  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  23040455 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaaatttcaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgcactcgacctctt 23040357  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040356 aaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 23040288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 8946413 - 8946679
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8946413 actatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcattaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagccc 8946512  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  8946513 ccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagtccctaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 8946610  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8946611 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 8946679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 22738537 - 22738278
Alignment:
Q  234 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  22738537 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagcccccatcgctaattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatca 22738438  T
Q  333 ctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaa 431  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||| ||| |||     
T  22738437 ctaa--ttgagttaaagctccaacgtgttgagtacagagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggatccgaccttttagacat 22738340  T
Q  432 cttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22738339 cttaattcaacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttgatcaactta 22738278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 228 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22731598 - 22731337
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||    
T  22731598 actatgcaactaagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggtatcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttcaagggcaccaagccc 22731499  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||    
T  22731498 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgtt 22731401  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    | ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22731400 agacatctttattcaacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaa 22731337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 22336882 - 22337137
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22336882 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagtattaatatacttccagggcatcaag-cc 22336979  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||  | |||||  ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  22336980 ccatcgc--aatttgagctaaagctccattgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 22337077  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337078 aaacttcttaattcgacaacctcttat---------ataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 22337137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 309 - 486
Target Start/End: Original strand, 20308945 - 20309122
Alignment:
Q  309 ttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatg 408  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20308945 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatg 20309044  T
Q  409 catagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20309045 catggactcgacatcttaaacaacttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcatcatcttca 20309122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 1282772 - 1282920
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1282772 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaacttatagatgataattcatcgacaacttaacaa 1282871  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1282872 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 1282920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 31344522 - 31344669
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31344522 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatc-acaacttaacaa 31344620  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31344621 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 31344669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41531721 - 41531579
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41531721 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 41531622  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41531621 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 41531579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30345732 - 30345590
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30345732 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 30345633  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30345632 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 30345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 309
Target Start/End: Original strand, 38967084 - 38967230
Alignment:
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967084 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactctaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 38967183  T
Q  264 caatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatact 309  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  38967184 caatacggagcatcaagcccctatcactatttgagtattattatact 38967230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 225 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22741329 - 22741119
Alignment:
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  22741329 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagc 22741231  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  22741230 ccccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctc 22741133  T
Q  424 ttaaacaacttaat 437  Q
    ||||||| ||||||    
T  22741132 ttaaacatcttaat 22741119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24629196 - 24629053
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24629196 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 24629097  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  24629096 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 24629053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27380149 - 27380006
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27380149 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27380050  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27380049 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 27380006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27384195 - 27384052
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27384195 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27384096  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27384095 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 27384052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 27601181 - 27601324
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27601181 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27601280  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27601281 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 27601324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10102370 - 10102227
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10102370 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacgacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 10102271  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  10102270 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 10102227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 24648744 - 24648887
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24648744 acatcgtacaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 24648843  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  24648844 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 24648887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32215482 - 32215253
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa------------- 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||                 
T  32215482 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaatgcaactccaact 32215383  T
Q  212 -----atgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaata 305  Q
         |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||    
T  32215382 cgactatgcaacttcaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtccaaatcgctatttgagtattatta 32215283  T
Q  306 tacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||| |||  ||||||| ||| |||||||    
T  32215282 tacttacagagcatcaagccccaatcgcta 32215253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 283
Target Start/End: Original strand, 24367446 - 24367565
Alignment:
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24367446 taacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccgacttgactatgcaacttagaccttctatatgcatgtggtac 24367545  T
Q  264 caatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  24367546 caatccagggcatcaagccc 24367565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 353 - 486
Target Start/End: Original strand, 19671710 - 19671844
Alignment:
Q  353 caacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19671710 caacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagctcccaaccatgaaatgctaatgcatagactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctctta 19671809  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    || || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19671810 taatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 19671844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 299189 - 299076
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttg 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  299189 actttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagccccaatcgctatttg 299090  T
Q  296 agtattaatatact 309  Q
    ||||||| ||||||    
T  299089 agtattattatact 299076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12902196 - 12902090
Alignment:
Q  112 acatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa 211  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  12902196 acataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 12902097  T
Q  212 atgcgac 218  Q
    |||||||    
T  12902096 atgcgac 12902090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24529795 - 24529672
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24529795 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24529697  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24529696 gaacttcatcatcttaatcaactta 24529672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 24679936 - 24680137
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  24679936 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 24680034  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  24680035 cccatcgttatttttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcattgactcaatctct 24680133  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  24680134 taaa 24680137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45678493 - 45678310
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||  || |    
T  45678493 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcatggcatgagcccccatctttattttagtattaatatactttcagtgcat-tagcc 45678395  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  45678394 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 45678310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Original strand, 43137012 - 43137136
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||     
T  43137012 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac- 43137110  T
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  43137111 tccagagcatcaagcccctatcgcta 43137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22759083 - 22758874
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |    
T  22759083 cgactatgcaacttagacctcttatgtgcatgtggtaccaattcaaggcatgagcccccatcgttatttgagtatttatatacttccagggcat-aggcc 22758985  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  22758984 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 22758887  T
Q  425 taaacaacttaat 437  Q
    || ||| ||||||    
T  22758886 tatacatcttaat 22758874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 25615970 - 25616105
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  25615970 ttgactcgacaaatgcgactctaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgatatttgagt 25616069  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgct 334  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  25616070 attattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 25616105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 6725701 - 6725787
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6725701 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 6725787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 494
Target Start/End: Original strand, 23659940 - 23660045
Alignment:
Q  389 cccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcat 487  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23659940 cccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcat 23660038  T
Q  488 caactta 494  Q
    |||||||    
T  23660039 caactta 23660045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23712469 - 23712383
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23712469 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 23712383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 375 - 494
Target Start/End: Original strand, 23076344 - 23076464
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  23076344 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcggcctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaa 23076442  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23076443 catcatcatcttcatccactta 23076464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 18808840 - 18808962
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18808840 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 18808937  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  18808938 gaacttcatcatcttaatcaactta 18808962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 23135487 - 23135609
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23135487 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 23135584  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  23135585 gaacttcatcatcttaatcaactta 23135609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23712278 - 23712156
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23712278 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 23712181  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  23712180 gaacttcatcatcttaatcaactta 23712156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 24367670 - 24367793
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24367670 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24367768  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||| || |||||||||    
T  24367769 gaacttcatcattttaatcaactta 24367793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24905898 - 24905776
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24905898 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24905801  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24905800 gaacttcatcatcttaatcaactta 24905776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24908373 - 24908251
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24908373 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24908276  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24908275 gaacttcatcatcttaatcaactta 24908251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 26505276 - 26505398
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26505276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 26505373  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  26505374 gaacttcatcatcttaatcaactta 26505398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 26507754 - 26507876
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26507754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 26507851  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  26507852 gaacttcatcatcttaatcaactta 26507876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 39682210 - 39682332
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39682210 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 39682307  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  39682308 gaacttcatcatcttaatcaactta 39682332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 45030119 - 45029997
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45030119 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 45030022  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  45030021 gaacttcatcatcttaatcaactta 45029997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22799490 - 22799291
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  22799490 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatgagcccctatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 22799393  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||    
T  22799392 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcggtctct 22799295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 24673319 - 24673520
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||      
T  24673319 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagct 24673417  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| || ||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  24673418 cccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctct 24673516  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  24673517 taaa 24673520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21177803 - 21177717
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21177803 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccc 21177717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23713290 - 23713204
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23713290 actttgactcgacaattgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 23713204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24898461 - 24898339
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24898461 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 24898364  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24898363 gaacttcatcatcttaatcaactta 24898339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24900944 - 24900822
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24900944 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 24900847  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24900846 gaacttcatcatcttaatcaactta 24900822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24903421 - 24903299
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24903421 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 24903324  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24903323 gaacttcatcatcttaatcaactta 24903299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 284
Target Start/End: Original strand, 7679337 - 7679424
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7679337 actttgacccgacaaatgcgactccaactcgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcataaagcccc 7679424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23020070 - 23019871
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  || |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |    
T  23020070 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgtta-ttgagtattaatatacatccagggcat-aagcc 23019973  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  |||| | ||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  23019972 cccatcgctaa-tttgagctaattcaccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 23019875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40622575 - 40622375
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  40622575 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 40622477  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    | ||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  40622476 cacatcg-ttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctcaagggcat-gagcccacaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 40622379  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  40622378 taaa 40622375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 43137204 - 43137318
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||    
T  43137204 gcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaatactttggaacttaat 43137302  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  43137303 catcttaatcaactta 43137318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24643406 - 24643328
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24643406 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 24643328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 571294 - 571416
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  571294 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 571391  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  571392 gaacttcatcatcttaatcaactta 571416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 6725892 - 6726014
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  6725892 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttacatcgacaacctcttata-taattcaataatttg 6725989  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  6725990 gaacttcatcatcttaatcaactta 6726014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 19671602 - 19671686
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19671602 ttgactcgacaaatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctcttttatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccc 19671686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23709797 - 23709675
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23709797 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 23709700  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  23709699 gaacttcatcatcttaatcaactta 23709675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24643216 - 24643093
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24643216 gctctagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatcatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24643118  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| || ||||||| |||||||||    
T  24643117 gaacttcgtcatcttaatcaactta 24643093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 28576996 - 28577118
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  28576996 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacttcttata-taatccaataatttg 28577093  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  28577094 gaacttcatcatcttaatcaactta 28577118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 32039763 - 32039641
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32039763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 32039666  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  32039665 gaacttcatcatcttaatcaactta 32039641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 38967272 - 38967393
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||    
T  38967272 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaaactcctata-taatccaatattttgga 38967370  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  38967371 acttcatcatcttaatcaactta 38967393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Original strand, 23130634 - 23130743
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| || |  ||||||| |    
T  23130634 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatactaccggagcatcaagcc 23130733  T
Q  326 cccatcgcta 335  Q
    || |||||||    
T  23130734 ccaatcgcta 23130743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Original strand, 23133101 - 23133210
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| || |  ||||||| |    
T  23133101 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatactaccggagcatcaagcc 23133200  T
Q  326 cccatcgcta 335  Q
    || |||||||    
T  23133201 ccaatcgcta 23133210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21155325 - 21155203
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21155325 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 21155228  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| || ||||||| |||||||||    
T  21155227 gaacttcttcatcttaatcaactta 21155203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 17306187 - 17306327
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17306187 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactgaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 17306286  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  17306287 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 17306327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22413538 - 22413414
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttg 295  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || ||     
T  22413538 actttgactcgacaa-tgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gta-tta 22413442  T
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22413441 agtattaatatacttccagggcatcaag 22413414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 23130768 - 23130881
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  23130768 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 23130865  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  23130866 catcttaatcaactta 23130881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 23133235 - 23133348
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  23133235 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 23133332  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  23133333 catcttaatcaactta 23133348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 34402778 - 34402665
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34402778 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 34402681  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  34402680 catcttaatcaactta 34402665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8134 - 8049
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8134 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcattaagccc 8049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Original strand, 36838904 - 36839042
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        |||  |||| || |||||||||||||||    
T  36838904 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatgaatgacaactcatcaacaacttaa 36839003  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgact 205  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  36839004 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgact 36839042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 309
Target Start/End: Original strand, 22105099 - 22105183
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatact 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22105099 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagtccctatcgctatttaagtattaatatact 22105183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18787304 - 18787219
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18787304 actttgactcgacaa-tgcgacttcgacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 18787219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Original strand, 23076247 - 23076317
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23076247 actatgcaacttacacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgag 23076317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 494
Target Start/End: Original strand, 23285818 - 23285887
Alignment:
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285818 taaacatcttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 23285887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21318992 - 21318819
Alignment:
Q  234 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| | | ||| ||||| ||     
T  21318992 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcataagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggc-ttaagcccccaacgt 21318897  T
Q  334 taattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    || ||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21318896 tatttttgagcaaatgctccatcgcggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 21318819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21327931 - 21327750
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||    || |||||||| |||||| |||| | | ||| |    
T  21327931 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaact---gtttagtattaacatactttcagggc-ttaagcc 21327836  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| || || ||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21327835 cccaacgttatttttgagcaaatgctccatcgcggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 21327750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25964076 - 25963896
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  25964076 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccagc---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 25963981  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25963980 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 25963896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Original strand, 23657592 - 23657663
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23657592 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggtatcaagcccccatcgctatttgag 23657663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32452310 - 32452243
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32452310 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactattcaacttagacctcttgtatgcatgtggtacca 32452243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Original strand, 37524444 - 37524620
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  37524444 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 37524539  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37524540 caattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 37524620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 299034 - 298914
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |    
T  299034 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatgttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaaaaatttgaa 298937  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  298936 acttcatcatcttaatcaactta 298914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 253
Target Start/End: Original strand, 19795848 - 19795902
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatg 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795848 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatg 19795902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 494
Target Start/End: Original strand, 22105319 - 22105431
Alignment:
Q  380 catcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatc 479  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  22105319 catcaagtccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgaaacttcatc 22105416  T
Q  480 atcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||    
T  22105417 atcttaatcaactta 22105431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 32215184 - 32215082
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  32215184 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 32215086  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  32215085 catc 32215082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22812273 - 22812093
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |   |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||| |    
T  22812273 cgaccatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagc---attatagtattaatatactttaagggcat-aagcc 22812178  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22812177 cccaacaat-attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 22812093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 23004516 - 23004630
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |  | ||| ||||||||||||    
T  23004516 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaaccatgcatatggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtgtttaagtattaatata 23004614  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  23004615 cttccagggcatcaag 23004630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 23031128 - 23031176
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23031128 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggc 23031176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 23791004 - 23791078
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23791004 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 23791078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24697917 - 24697843
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24697917 aatgcaacttcaacttgattatgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 24697843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 281
Target Start/End: Original strand, 25175598 - 25175653
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  25175598 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccattgcatcaagc 25175653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 379 - 478
Target Start/End: Original strand, 25616087 - 25616185
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  25616087 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 25616185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10823020 - 10822939
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa 279  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10823020 actttgactcgaaaaatgcgactc-atcttgactatgcaacttaaacctcttctatgcatgtggtaccaatccagagcatcaa 10822939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Original strand, 20322402 - 20322444
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20322402 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 20322444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24688679 - 24688606
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcc 282  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24688679 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcattaagcc 24688606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20520534 - 20520470
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20520534 caacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 20520470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22134446 - 22134388
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134446 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 22134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7950 - 7910
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7950 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 7910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23713104 - 23713064
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23713104 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 23713064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 24514974 - 24515026
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24514974 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 24515026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 25175754 - 25175794
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 25175794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 28405881 - 28405921
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405881 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 28405921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28653766 - 28653714
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  28653766 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 28653714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43947702 - 43947604
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  43947702 gactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggcatcaag 43947604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 24514919 - 24514982
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24514919 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 24514982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34402913 - 34402803
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||||     
T  34402913 gactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatactaccggagcatcaagc 34402814  T
Q  325 ccccatcgcta 335  Q
    ||| |||||||    
T  34402813 cccaatcgcta 34402803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 7679462 - 7679520
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7679462 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 7679520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18787116 - 18787012
Alignment:
Q  375 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaac 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  ||| |||| |||| |  | || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18787116 cagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac 18787018  T
Q  474 atcatc 479  Q
    ||||||    
T  18787017 atcatc 18787012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19691963 - 19691922
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691963 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 19691922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 24735181 - 24735222
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735181 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 24735222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Original strand, 28405738 - 28405775
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405738 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 28405775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 25108648 - 25108761
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  | | ||||||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  25108648 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtattattccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 25108745  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  25108746 cttccagggcatcaag 25108761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18547336 - 18547262
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18547336 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 18547262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22413372 - 22413247
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||| |||| |||||  |    ||||||||    
T  22413372 ccaacgtggtgagcg-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactt-aacatcttaaaacattgacctctta 22413275  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatc 479  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22413274 tataaatccaataatttggaacatcatc 22413247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23708769 - 23708726
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23708769 acaacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcatctt 23708726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28653821 - 28653758
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  28653821 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacatgtggatagaagacaactcaacaact 28653758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32215484 - 32215445
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32215484 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 32215445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24716878 - 24716828
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24716878 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 24716828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10822854 - 10822796
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10822854 ccaacgtggtgag--caaaggctctagggcatcaagcccccgacaatgaatgctaatgcat 10822796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22134567 - 22134526
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22134567 cgactatgcaacttaaatctcttatatgcatgtggtaccaat 22134526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 24367393 - 24367442
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24367393 ttcataagtacttcattaacaacacatggatagaagacagctcaacaact 24367442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 393
Target Start/End: Original strand, 23657640 - 23657713
Alignment:
Q  318 atcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaa 393  Q
    |||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23657640 atcaagcccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaa 23657713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24697823 - 24697792
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697823 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 24697792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Original strand, 21237502 - 21237602
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  21237502 aatgcgacttcgacttaactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccattccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatata 21237600  T
Q  308 ct 309  Q
    ||    
T  21237601 ct 21237602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 17306353 - 17306386
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17306353 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 17306386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 21115513 - 21115585
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  21115513 atgcatgtggtaccagtccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagtgcatcaag 21115585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 400
Target Start/End: Original strand, 23004653 - 23004682
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23004653 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 23004682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 402
Target Start/End: Original strand, 23207183 - 23207212
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207183 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 23207212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32215278 - 32215209
Alignment:
Q  267 tacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  32215278 tacagagcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgcta 32215209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 38967031 - 38967080
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38967031 ttcataagtactttattaacaacacatggatagaaaacaactcaacaact 38967080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39828305 - 39828272
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39828305 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 39828272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 34492425 - 34492389
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34492425 cttcaacaacttatacaacatcaacaacttaagactc 34492389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 37379421 - 37379457
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37379421 cttcaacaacttaaacaacattaacaacttaagactc 37379457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 233)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 70 - 391
Target Start/End: Original strand, 14670449 - 14670778
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaa--------ctcaacaactcatagatgataattcatcaacaa 161  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  14670449 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggttgaagacaactcaacaactcaacaactcatggatgacaactcgtcaacaa 14670548  T
Q  162 cttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggt 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670549 cttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggt 14670648  T
Q  262 accaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtgg 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  14670649 accaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatgcttccagggcatcaagcccccatcgctaa-tttgagctaaagctccaacgtgg 14670747  T
Q  361 tgagtgcaaagctccagggcatcaagccccc 391  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  14670748 tgactacaaagctccaaggcatcaagccccc 14670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 70 - 391
Target Start/End: Original strand, 14681971 - 14682300
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaa 161  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |  |||||||    
T  14681971 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaacttgtcaacaa 14682070  T
Q  162 cttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggt 261  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682071 cttaacaactcatgcatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggt 14682170  T
Q  262 accaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtgg 360  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  14682171 accaatatagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa-tttgagctaaagctccaacgtgg 14682269  T
Q  361 tgagtgcaaagctccagggcatcaagccccc 391  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14682270 tgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 14682300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 518
Target Start/End: Original strand, 16795875 - 16796360
Alignment:
Q  50 tcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgata 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16795875 tcataagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgagtagaatacaactcagcaactcatagatgata 16795974  T
Q  150 attcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 249  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795975 attcattaataacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacttcgactagacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 16796074  T
Q  250 tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatg 349  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||  ||| |    
T  16796075 tatgcatgtggtaccaatttagggcatgagcccccaacgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaa-tttgagctaaag 16796171  T
Q  350 ctccaacgtggtgagtgca----------------------aagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||| |||||||||| ||                      ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  16796172 ctccatcgtggtgagtacaaaattccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctctta 16796270  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    |||| | ||||   |  | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16796271 aacatcataat--catcatctcttatattagtgcaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 16796360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13210693 - 13210426
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  13210693 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccc 13210594  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  13210593 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 13210495  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13210494 aaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgaaacatcatcatcttcaacaactta 13210426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 12398965 - 12399231
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12398965 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 12399064  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12399065 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacagtgctccagggcatcaagccaccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 12399163  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12399164 aacatcttaatttgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 12399231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20698801 - 20698534
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||    
T  20698801 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttgcatagcatcaagccc 20698702  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  20698701 ccatcgctaattt-gagttaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttctt 20698603  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698602 aaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 20698534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 17487613 - 17487878
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17487613 actatgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 17487712  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  17487713 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 17487810  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487811 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 17487878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 17499095 - 17499360
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17499095 actatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 17499194  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  17499195 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 17499292  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499293 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 17499360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23083725 - 23083460
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23083725 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 23083626  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23083625 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaaactccaaggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 23083528  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083527 aaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 23083460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 228 - 497
Target Start/End: Original strand, 43840689 - 43840957
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatc-aagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43840689 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 43840788  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||  |||||  ||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  43840789 ccatcgcta--tttgagctaaagctctttcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 43840886  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaac 497  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43840887 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcattatcttcatcaacttaaac 43840957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40214085 - 40213819
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  40214085 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccacatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcc 40213986  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  40213985 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggacatcaagccatccacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctct 40213888  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40213887 taaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 40213819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25476745 - 25476484
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  25476745 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcatcgcta-ttgagtattaatatacttacagggcatcaa-ccccc 25476648  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    ||| |||  |||||  ||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25476647 atcacta--tttgagctaaagctccatcttgttgagtacaaagctccagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 25476550  T
Q  428 acaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476549 acatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 25476484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 200 - 485
Target Start/End: Original strand, 23274415 - 23274700
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23274415 ttgactcgacaaatgtgactccaatttgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaaacccctatcgctatttgagt 23274514  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg 398  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23274515 attattatac-tccagggcatcaagcccctatcgct-attttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactg 23274612  T
Q  399 -aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttc 485  Q
     ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  23274613 aaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaatttgacaaccttttataatagtccaatactttgaaacatcaacatcttc 23274700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 18438291 - 18438556
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18438291 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 18438389  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    || || |||  |||||  |||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  18438390 ccttcacta--tttgagctaaaactccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 18438487  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg-gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18438488 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttgaaaacatcatcatcttcatcaactta 18438556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Original strand, 14665037 - 14665223
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665037 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 14665136  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665137 ctcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg-----------cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Original strand, 14668193 - 14668379
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668193 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagataactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 14668292  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668293 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg-----------cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14668379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 14972615 - 14972876
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14972615 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatcgagggcatcaagcccccatccctata--agtattaatatacttccagggcatcaagccc 14972712  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  14972713 ccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgag--caaaggctccaggacatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctct 14972807  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972808 taaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 14972876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Original strand, 15464486 - 15464630
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464486 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcgtagatgataattcatcaacaacttaacaa 15464585  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15464586 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg 15464630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12853054 - 12852887
Alignment:
Q  48 catcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatga 147  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  12853054 catcataagaaacttgaccacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactaagaaactcaaagatga 12852955  T
Q  148 taattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgc 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  12852954 taattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaataactttgactcgacaaatgc 12852887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 15964337 - 15964479
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15964337 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 15964436  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15964437 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 15964479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 15968261 - 15968403
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15968261 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 15968360  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15968361 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 15968403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 15972185 - 15972327
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15972185 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 15972284  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15972285 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 15972327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37440353 - 37440211
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37440353 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 37440254  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37440253 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 37440211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 219
Target Start/End: Original strand, 12339088 - 12339236
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339088 tcataaacatcgtaaaatcttcataggtacttctttaacaacacatgg-tagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 12339186  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgact 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12339187 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgagaaatgcgact 12339236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 482
Target Start/End: Original strand, 30029591 - 30029844
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  30029591 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatggggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagg-cat-aagccc 30029688  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca--acaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    ||||||||||  ||||  ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  30029689 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacatgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccatcactatgaaatgctaatgcatggactcgacctc 30029786  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  30029787 ttaaacatcttaattcaacgacctcttgta-tagtccaataatttggaacatcatcatc 30029844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 19774954 - 19775102
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19774954 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 19775053  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19775054 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 19775102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8489906 - 8489761
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8489906 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcat---caacttaacaa 8489810  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8489809 ctcatggatgaaaattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 8489761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Original strand, 13543677 - 13543833
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543677 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgccaa-tgcaacctcaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 13543775  T
Q  256 tgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13543776 tgtggtaccaatacggggcatcaagccccaatctctatttgagtattattatacttcc 13543833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16751063 - 16750919
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16751063 tcatgaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaacttaacaactcatagatgataattcattgacaacttaacaa 16750964  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatg 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  16750963 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatg 16750919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4589635 - 4589487
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4589635 tcataaacatcgtataaccttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 4589536  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4589535 ctcatagatgataattcatcaacaacaactttgactcgacaaatgcgac 4589487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12120220 - 12120050
Alignment:
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12120220 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcaacaaatgcgactccgacttgactatgcaacttagaccttctatatgcatgtggtac 12120121  T
Q  264 caatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  12120120 caatacagagcatcaagccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 12120050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Original strand, 13442115 - 13442296
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  13442115 cagggcatcaagcccccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatattaatgca 13442213  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442214 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 13442296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 335
Target Start/End: Original strand, 46821903 - 46822098
Alignment:
Q  140 atagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaactt 239  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  46821903 atagaagataactcaataacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa-tacaacttcaactcgactatgcaactt 46822001  T
Q  240 agacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  46822002 agacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtctcaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgcta 46822098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 317 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11425033 - 11424858
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtc 415  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  11425033 catcaagcccccatcacta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggac 11424936  T
Q  416 tcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424935 tcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 11424858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10543158 - 10542852
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactca--------tagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |        | ||||| || |||||||||||||||    
T  10543158 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaatttaacgaatcgtggatgacaactcatcaacaacttaa 10543059  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtacc 264  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||                    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||    
T  10543058 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa--------------------tgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtacc 10542979  T
Q  265 aatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtga 363  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| |||    
T  10542978 aatccaaggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttga 10542881  T
Q  364 gtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10542880 gtacaaagctccagggcatcaagccccca 10542852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4108116 - 4107985
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4108116 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 4108017  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4108016 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactc 4107985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4111968 - 4111837
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4111968 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 4111869  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4111868 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactc 4111837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 11069460 - 11069603
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11069460 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11069559  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  11069560 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 11069603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 14498717 - 14498860
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14498717 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14498816  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  14498817 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 14498860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 22321056 - 22321199
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22321056 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22321155  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  22321156 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 22321199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 22336111 - 22336254
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22336111 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22336210  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  22336211 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 22336254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27410361 - 27410218
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27410361 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27410262  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27410261 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 27410218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 28949114 - 28949257
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28949114 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 28949213  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28949214 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 28949257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 351 - 478
Target Start/End: Original strand, 12510929 - 12511057
Alignment:
Q  351 tccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctct 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12510929 tccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctct 12511028  T
Q  450 tatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12511029 tatattaatccaataatttggaacatcat 12511057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17317850 - 17317702
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17317850 tcataaacatcgtataatattcgttggtacttctttaacaacatataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacgacttaacaa 17317751  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17317750 ttcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 17317702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 7109088 - 7109231
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7109088 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 7109187  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  7109188 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 7109231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 7113023 - 7113166
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7113023 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 7113122  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  7113123 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 7113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 15616766 - 15616909
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15616766 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 15616865  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15616866 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 15616909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 55022257 - 55022400
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55022257 acatcgtacaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 55022356  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  55022357 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 55022400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 8499262 - 8499398
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  8499262 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 8499361  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  8499362 tattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 8499398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15878415 - 15878213
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  15878415 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 15878317  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||||    
T  15878316 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctct 15878219  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  15878218 taaaca 15878213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Original strand, 26686729 - 26686909
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  ||  |||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26686729 cagggcatcaagcccccatcgctaatt--gagctaaaactccaacatgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 26686826  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26686827 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-tagtccaataatttggaacatcatcatcttcttcaactta 26686909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11166246 - 11166103
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11166246 acatcgtataatctttgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11166147  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  11166146 ggatgataattcatcaacaacgaccttgaatcgacatatgcgac 11166103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24340968 - 24340830
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacct 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24340968 gctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacct 24340869  T
Q  448 cttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24340868 cttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 24340830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 15412173 - 15412309
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  15412173 tttgattcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 15412272  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  15412273 tattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 15412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 27164994 - 27165130
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  27164994 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccgtcgctatttgag 27165093  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  27165094 tattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 27165130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 53301925 - 53301812
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  53301925 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 53301826  T
Q  298 tattaatatacttc 311  Q
    ||||||||||||||    
T  53301825 tattaatatacttc 53301812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38962338 - 38962219
Alignment:
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38962338 taacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccgacttgactatgcaacttagaccttctatatgcatgtggtac 38962239  T
Q  264 caatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  38962238 caatccagggcatcaagccc 38962219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 23408182 - 23408383
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  23408182 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcc 23408280  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||||    
T  23408281 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctct 23408377  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  23408378 taaaca 23408383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 43550744 - 43550630
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa-caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43550744 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 43550645  T
Q  472 acatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||| ||||    
T  43550644 acatcatcatattca 43550630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24153430 - 24153307
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24153430 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24153332  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24153331 gaacttcatcatcttaatcaactta 24153307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 309
Target Start/End: Original strand, 44494511 - 44494623
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44494511 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttga 44494610  T
Q  297 gtattaatatact 309  Q
    |||||| ||||||    
T  44494611 gtattattatact 44494623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 50242569 - 50242704
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||||    
T  50242569 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgttatttgagt 50242668  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  50242669 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 50242704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 335
Target Start/End: Original strand, 10556739 - 10556865
Alignment:
Q  209 caaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  10556739 caaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgagtattaccata 10556838  T
Q  308 cttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    | |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  10556839 c-tccagagcatcaagcccctatcgcta 10556865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10901570 - 10901484
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10901570 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 10901484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 480
Target Start/End: Original strand, 14572417 - 14572600
Alignment:
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572417 agtattaatatacttccagagcatcaagccctcatcgctaatt--gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaca 14572514  T
Q  396 atg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca 480  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||  | | |||||| |||||||||| |||||    
T  14572515 atgaaatgcaaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaaaacaacatcctcttaagtaagtccaataatttggaacaacatca 14572600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24153578 - 24153492
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24153578 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatgcagggcatcaagcccc 24153492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10542764 - 10542634
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgc 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  10542764 cagggcatcaagcccccatcgctatttgaatattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatt--gagctaaagctccaacgtgttgagtac 10542667  T
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542666 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa 10542634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Original strand, 5222761 - 5222857
Alignment:
Q  122 aagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5222761 aagactactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataatttatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 5222857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 428
Target Start/End: Original strand, 15067438 - 15067635
Alignment:
Q  229 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || ||||    
T  15067438 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagccccc 15067536  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    |||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | |||||||    
T  15067537 atcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaa 15067634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 315
Target Start/End: Original strand, 26683111 - 26683199
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccagg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26683111 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagg 26683199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 28194440 - 28194575
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcc-ccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  28194440 ttgactcgacaaatgcgactctaactcaactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcctcaatcgctatttgagt 28194539  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  28194540 attaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 28194575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 29172849 - 29172726
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29172849 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 29172751  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
     ||| |||||||||| |||||||||    
T  29172750 aaacttcatcatcttaatcaactta 29172726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38962157 - 38962034
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38962157 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatagactcgatctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 38962059  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||| || |||||||||    
T  38962058 gaacttcatcattttaatcaactta 38962034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16283267 - 16283181
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16283267 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 16283181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17447110 - 17447024
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17447110 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 17447024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52524131 - 52524045
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52524131 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 52524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13152056 - 13151934
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13152056 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 13151959  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  13151958 gaacttcatcatcttaatcaactta 13151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13154521 - 13154399
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13154521 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 13154424  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  13154423 gaacttcatcatcttaatcaactta 13154399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16454546 - 16454424
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16454546 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 16454449  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  16454448 gaacttcatcatcttaatcaactta 16454424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17446919 - 17446797
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17446919 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgggctcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 17446822  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  17446821 gaacttcatcatcttaatcaactta 17446797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 17463075 - 17463197
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17463075 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 17463172  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  17463173 gaacttcatcatcttaatcaactta 17463197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 34159223 - 34159345
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34159223 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 34159320  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  34159321 gaacttcatcatcttaatcaactta 34159345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 14234200 - 14234283
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14234200 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 14234283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14577124 - 14576942
Alignment:
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14577124 agtattaatatacgtccagggcatcaagccctcatcgcta---ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaaa 14577028  T
Q  396 atg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca 480  Q
    ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||    |||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||    
T  14577027 atgaaatgcaaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaataacaacctcttaagtaagtccaataatttggaacatcatca 14576942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 16369153 - 16369352
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  16369153 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatgcagggcat-gagccttaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 16369250  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||    
T  16369251 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagctcccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctct 16369348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 8898800 - 8898886
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8898800 ctttgactcgacaaatgcaactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 8898886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Original strand, 17736951 - 17737075
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||     
T  17736951 aatgcgactccaactcgaccatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagtattattatac- 17737049  T
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  17737050 tccagagcatcaagcccctatcgcta 17737075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 382
Target Start/End: Original strand, 855892 - 856046
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| || | |||  || |    
T  855892 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcaaggcat-gagcc 855990  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcat 382  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  855991 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat 856046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28848876 - 28848754
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28848876 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 28848779  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  28848778 gaacttcatcatcttaatcaactta 28848754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43550943 - 43550807
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||||    
T  43550943 ttgactcgacaaatgcgactttaactcgattatccaacttagacctattatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtctcaatcgttatttgagt 43550844  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  43550843 attattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 43550807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 45578102 - 45577981
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45578102 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttgg 45578005  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    
T  45578004 aacttcatcatcttaatcaactta 45577981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10542869 - 10542747
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgc 367  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  10542869 cagggcatcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtac 10542772  T
Q  368 aaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10542771 aaagctccagggcatcaagccccca 10542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6469395 - 6469277
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatga-atgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||     |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6469395 gctccagggcatcaagcccccaacaatgacatgctaatgcatggactcgacctctt-----acttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 6469302  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  6469301 gaacttcatcatcttaatcaactta 6469277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 490
Target Start/End: Original strand, 8898991 - 8899109
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8898991 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 8899088  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8899089 gaacttcatcatcttaatcaa 8899109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15076364 - 15076272
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15076364 caacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttcc 15076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16283076 - 16282954
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaat-gaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16283076 gctccagggcatcaagcccccaacaataaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 16282979  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| | |||||||| |||||||||    
T  16282978 gaactttatcatcttaatcaactta 16282954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 45607172 - 45607050
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45607172 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 45607075  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  45607074 gaacttcatcatcttaatcaactta 45607050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 55500839 - 55500961
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55500839 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 55500936  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  55500937 gaacttcatcatcttaatcaactta 55500961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2842805 - 2842665
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  2842805 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaactttacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 2842706  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  2842705 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 2842665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 14440973 - 14441104
Alignment:
Q  65 caacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagat-gataattcatcaacaact 163  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |   ||||||||||    
T  14440973 caacatcataaacatcgtataatcttcataagcactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactcatggatagaagacaaatcaacaact 14441072  T
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14441073 taacaactcatggatgacaattcatcaacaac 14441104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 55476397 - 55476510
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  55476397 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 55476494  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  55476495 catcttaatcaactta 55476510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18701016 - 18700873
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac-----------tcatagatgataattcatcaacaact 163  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||| || ||||||||||||    
T  18701016 aacatcatataatcttcatgagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaact 18700917  T
Q  164 taacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  18700916 taacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 18700873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 9707872 - 9707750
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  9707872 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaaactcttgta-taatccaataatttg 9707775  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  9707774 gaacttcatcatcttaatcaactta 9707750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 10247988 - 10247866
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10247988 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttgta-taatccaataatttg 10247891  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  10247890 gaacttcatcatcttaatcaactta 10247866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 11862548 - 11862729
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  11862548 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagccctcatc---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 11862643  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11862644 cccaacagttattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 11862729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 21618345 - 21618468
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  21618345 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacttcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 21618443  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||| |||  |||||||||    
T  21618444 gaacttcatcttctcaatcaactta 21618468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24341074 - 24340990
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcc 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24341074 ctttgactcgacaaatgcgactctgattcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcc 24340990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 36166494 - 36166617
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  36166494 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcggcctctttaacttcttaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 36166592  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  36166593 gaacttcatcatcttaatcaactta 36166617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 41123601 - 41123683
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41123601 ctttgactcgacaaatgcgactcc---ttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 41123683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53071078 - 53071011
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071078 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 53071011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17661276 - 17661195
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa 279  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17661276 actttgactcgacaa-tgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaacaatccagggcatcaa 17661195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 28194592 - 28194712
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  28194592 ctccagagcatcaaacccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 28194689  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  28194690 acctcatcatcttaatcaactta 28194712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7781609 - 7781490
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7781609 ccagggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaa 7781512  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  7781511 cttcatcatcttaatcaactta 7781490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 396
Target Start/End: Original strand, 11849070 - 11849235
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  11849070 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 11849165  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11849166 cccaacagttattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 11849235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Original strand, 12172556 - 12172748
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||| | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  12172556 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attttaatattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 12172651  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |  | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  12172652 c-attattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctacagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 12172748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 8499443 - 8499537
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8499443 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 8499537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 10556882 - 10557004
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  10556882 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taattcaataatttgg 10556980  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    
T  10556981 aacttcatcatcttaatcaactta 10557004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14878880 - 14878681
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  14878880 cgacaatgcaacttagacttcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcctccaacgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 14878783  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||  ||| |||||  ||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  14878782 cccatctttaa-tttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaatctccagggcat-gagccccctacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 14878685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 15412354 - 15412448
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15412354 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 15412448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 27165175 - 27165269
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27165175 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 27165269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 30065372 - 30065459
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaac-aactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30065372 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacaccactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaac 30065459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 13442077 - 13442130
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442077 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 13442130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 15977409 - 15977534
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactt---aattcgacaacctcttatattaatccaatgat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | |||   || ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  15977409 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaaaaatcgacaacctcttgta-taatccaataat 15977506  T
Q  467 ttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15977507 ttggaacttcatcatcttaatcaactta 15977534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 42386139 - 42386224
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42386139 ctttgactcgacaaatgcgacttcaacttgactatgcaacctaaaccttttatatgcatatggtaccaatccagggcatcaagccc 42386224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Original strand, 15470809 - 15470941
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||||||||   | ||||||||||    
T  15470809 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcattgacacaacaactt-aacaacttagaacaacaacctctt 15470905  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    | || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15470906 aaataagtccaataatttggaacatcatcatcttca 15470941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18384277 - 18384096
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||  |    
T  18384277 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggaaccaatacagggcatgagcccccagcattat---agtattaatatactttcagggcataaac-c 18384182  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18384181 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 18384096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 53301744 - 53301650
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  53301744 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 53301650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11425079 - 11425009
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  11425079 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagcccccatcactatttgag 11425009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 17737135 - 17737255
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| || || || | ||||||| | |||||    
T  17737135 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgataatgcatagactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctattgta-tgatccaataacttgga 17737232  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  17737233 acttcatcatcttaatcaactta 17737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37642458 - 37642372
Alignment:
Q  400 atgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37642458 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 37642372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 44494708 - 44494828
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||| |||| |||| ||    
T  44494708 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgttaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taattcaataatttaga 44494805  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  44494806 acttcatcatcttaatcaactta 44494828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22110740 - 22110671
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag 280  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22110740 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcatcaag 22110671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 401 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22147717 - 22147632
Alignment:
Q  401 tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22147717 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 22147632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 32307426 - 32307483
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32307426 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccc 32307483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 315851 - 315965
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  315851 aatgcgacttcaacttgactatgcaacctacacctcttaatcatgcatgtggtactaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagtattaatata 315949  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||| | |||||||    
T  315950 cttccaaggcatcaag 315965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 322347 - 322528
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| || | ||| ||| |    
T  322347 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcccccagc---attatagtattaatatactttcacggcat-aagcc 322442  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  322443 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 322528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 324
Target Start/End: Original strand, 15467625 - 15467722
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |   |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467625 cgactatgcaacttagacctcttatatgtatgtggtaccaatccagggcatcaaaccctcaacgtaa--taagtattaatatacttccaggacatcaagt 15467722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19726263 - 19726082
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  19726263 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 19726168  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  19726167 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaa-cccgcaacaaatgtatgctaatgcat 19726082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 41123787 - 41123909
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  41123787 gctccagggcattaaggccccatcaatgaaatgctaatgcatggattcgacctctt-aacatcttaaatcgacaaccttttata-taatccaataatttg 41123884  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| | |||||||| |||||||||    
T  41123885 gaactttatcatcttaatcaactta 41123909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43890356 - 43890243
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaaca--------actcatagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  43890356 aacatcatataatcttcataagcacttcataaacaacacatgggtagaagacaactcaacaaattaacgactcatgaatgacaactcatcaacaacttaa 43890257  T
Q  167 caactcatggatga 180  Q
    ||||||||||||||    
T  43890256 caactcatggatga 43890243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 12119962 - 12119868
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12119962 aatgctaatgcatggcctttacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 12119868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14067352 - 14067289
Alignment:
Q  111 cacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14067352 cacatgggtagaacacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14067289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 16097116 - 16097171
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16097116 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatgaagccc 16097171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 606697 - 606643
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  606697 gactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagc 606643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 488
Target Start/End: Original strand, 9512825 - 9512939
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| ||||||||||  | ||| | |||||||  | |||||| ||||||    
T  9512825 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatctt-aacaacttaaaacaacatcatcttata--agtccaataatttgg 9512921  T
Q  471 aacatcatcatcttcatc 488  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9512922 aacatcatcatcatcatc 9512939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 14441067 - 14441149
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||    
T  14441067 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacagctcatggataacaactcatcgacaacgactttgactcg 14441149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Original strand, 15206676 - 15206780
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggac 317  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15206676 caacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggc 15206774  T
Q  318 atcaag 323  Q
    ||||||    
T  15206775 atcaag 15206780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 50242721 - 50242841
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  50242721 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaacgttgatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 50242818  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || ||||||| || |||||||||    
T  50242819 acttcatcattttaatcaactta 50242841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 12377688 - 12377764
Alignment:
Q  209 caaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12377688 caaatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 12377764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23077776 - 23077642
Alignment:
Q  292 tttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  23077776 tttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgct-agtttgagataatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagccccc 23077680  T
Q  392 aaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |||| ||| ||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  23077679 aacatatgtatgctaatgaatggactcgatctcttaaa 23077642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 478
Target Start/End: Original strand, 46822161 - 46822265
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||    
T  46822161 tccagagcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaa 46822259  T
Q  473 catcat 478  Q
    ||||||    
T  46822260 catcat 46822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Original strand, 15245764 - 15245862
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15245764 gactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggcatcaag 15245862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37251498 - 37251442
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37251498 gactatacaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 37251442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 13919097 - 13919211
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatac 308  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    | |||||||| ||||||||||    
T  13919097 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccaaggcattaagccctcaatgtatttgagcattaatatac 13919196  T
Q  309 ttccaggacatcaag 323  Q
    | ||||| |||||||    
T  13919197 tcccagggcatcaag 13919211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 49668310 - 49668178
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| |||||||||   | ||| | ||||    
T  49668310 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatctt-aacaacttagaacaacatcatctt 49668214  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatc 488  Q
    |||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  49668213 ata--agtccaataatttggaacatcatcatcatcatc 49668178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 16909626 - 16909676
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16909626 cgactatgcaacttagacctcttatatgcaagtggtaccaattcagggcat 16909676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43890265 - 43890183
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  43890265 acaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaatccatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 43890183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1645046 - 1644993
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa 279  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1645046 cgactgtgcaacttcgacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaa 1644993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 9520782 - 9520840
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520782 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 9520840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12174623 - 12174566
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12174623 cgactgtgcatcttatacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 12174566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 478
Target Start/End: Original strand, 12567477 - 12567557
Alignment:
Q  397 tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  12567477 tgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 12567557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 478
Target Start/End: Original strand, 13543942 - 13544022
Alignment:
Q  397 tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  13543942 tgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 13544022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 14572365 - 14572406
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572365 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14572406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23053432 - 23053391
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23053432 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 23053391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26196777 - 26196732
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26196777 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataaagggcat 26196732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13521038 - 13520978
Alignment:
Q  135 aactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13521038 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgaaaattcatcaacaac 13520978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 35353358 - 35353410
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35353358 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 35353410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2898151 - 2898108
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898151 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 2898108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 482
Target Start/End: Original strand, 16097214 - 16097341
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | | || |||| |||||||||   | |||| ||||||    
T  16097214 ccaacgtggtgag--caaggctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaattcatggacacaacatctt-aacaacttagaacaacaatctctta 16097310  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
     || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  16097311 aataagtccaataatttggaacatcatcatc 16097341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 35353303 - 35353366
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35353303 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 35353366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Original strand, 15264869 - 15264969
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||    
T  15264869 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaatccctcaact-tatttgagcattaatata 15264967  T
Q  308 ct 309  Q
    ||    
T  15264968 ct 15264969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Original strand, 15565301 - 15565371
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  15565301 acaacttaacaactcgtggatgacaattcatcaacaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaac 15565371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19884921 - 19884859
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19884921 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaac 19884859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 329
Target Start/End: Original strand, 43925691 - 43925809
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  43925691 aatgcgacttcaacttgactatgtaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatcca-ggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 43925787  T
Q  308 cttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  43925788 cttccagggcatcaagccccca 43925809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Original strand, 55476262 - 55476372
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||||     
T  55476262 gactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatactaccggagcatcaagc 55476361  T
Q  325 ccccatcgcta 335  Q
    ||| |||||||    
T  55476362 cccaatcgcta 55476372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 327493 - 327452
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327493 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 327452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7793678 - 7793637
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793678 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 7793637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 9512686 - 9512727
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9512686 cgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 9512727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 9520661 - 9520702
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9520661 cgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 9520702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12174485 - 12174427
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12174485 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 12174427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Original strand, 12496019 - 12496064
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496019 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 12496064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22147892 - 22147808
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  22147892 atgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgcta 22147808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49668431 - 49668390
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49668431 cgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 49668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 10562476 - 10562528
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  10562476 tcaacaacttaataactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 10562528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Original strand, 10562524 - 10562626
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  10562524 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccaaggcat 10562622  T
Q  320 caag 323  Q
    ||||    
T  10562623 caag 10562626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11298876 - 11298711
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| |  |||   ||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| |  | ||||||    
T  11298876 acctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagcccccaacattat---agtattattatactttcagggcat-aagcccccaacaattattttg 11298781  T
Q  342 aattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    |   ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11298780 agcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgaa-cccccaacagatgtatgctaatgcat 11298711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 14234382 - 14234422
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234382 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 14234422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 428
Target Start/End: Original strand, 15051369 - 15051461
Alignment:
Q  336 attttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  15051369 attttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaggccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 15051461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 16103685 - 16103725
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16103685 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 16103725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42353731 - 42353683
Alignment:
Q  159 caacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  42353731 caacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 42353683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 42386323 - 42386363
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386323 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtatgctaatgcat 42386363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52523946 - 52523906
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52523946 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 52523906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3403292 - 3403258
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3403292 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 3403258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19884862 - 19884816
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  19884862 caacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttg 19884816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 30065432 - 30065482
Alignment:
Q  168 aactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30065432 aactcatggatgataattcatcgacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 30065482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37642603 - 37642541
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  37642603 atgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttgattattattatacttcc 37642541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 5214723 - 5214772
Alignment:
Q  158 acaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  5214723 acaacttaataactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 5214772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 113
Target Start/End: Original strand, 5220536 - 5220573
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacac 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5220536 acatcatataatcttcataggtacttctttaacaacac 5220573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20461828 - 20461787
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20461828 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 20461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22110569 - 22110461
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||| |||| |||| |  | || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22110569 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttg 22110471  T
Q  470 gaacatcatc 479  Q
    ||||||||||    
T  22110470 gaacatcatc 22110461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23077821 - 23077780
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23077821 cgacaatgcaacttagacctctcatatgcatgtggtaccaat 23077780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 32307564 - 32307622
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32307564 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaatagtgaatgctaatgcat 32307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1644889 - 1644849
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1644889 gctctagggcatcaagcccctaacaatgaatgctaatgcat 1644849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 13543632 - 13543680
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13543632 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaacaac 13543680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 21618218 - 21618282
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21618218 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 21618282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32404499 - 32404427
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  32404499 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctaaacttatttgagcattaatatactcccagagcatcaag 32404427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 36166324 - 36166388
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36166324 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 36166388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43890187 - 43890124
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43890187 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagcccc 43890124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 5214643 - 5214706
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  5214643 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtagatagaaaacaactcaacaact 5214706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 9577452 - 9577510
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9577452 gactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 9577510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 10562421 - 10562484
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10562421 aacatcatataatcttcataagcacttcatttacaacatgtggatagaagacaactcaacaact 10562484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14872333 - 14872290
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 274  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14872333 atgcaacttggacttcttatatgaatgtggtaccaatacagggc 14872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15076268 - 15076205
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  15076268 gcatcaagccccaatctctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgcta 15076205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22147783 - 22147720
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  22147783 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 22147720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12852871 - 12852837
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12852871 acctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 12852837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 15482452 - 15482494
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15482452 cgacaatgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 15482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 43925845 - 43925894
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925845 ccaacgtggtgagta-aaggcttcagggcatcaagcccccaacaatgaatg 43925894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 334
Target Start/End: Original strand, 46822123 - 46822185
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgct 334  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  46822123 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 46822185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12120273 - 12120224
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12120273 ttcataagtacttcattaacgacacatggatagaaaacaactcaacaact 12120224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 13543679 - 13543716
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13543679 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 13543716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 494
Target Start/End: Original strand, 14234472 - 14234509
Alignment:
Q  457 atccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14234472 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 14234509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14577172 - 14577135
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14577172 tatgcatcttagacgtcttatatgcatgtggtaccaat 14577135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18700847 - 18700814
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18700847 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 18700814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42353657 - 42353624
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42353657 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 42353624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 207
Target Start/End: Original strand, 44269408 - 44269449
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  44269408 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 44269449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 44269445 - 44269509
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca 285  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44269445 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatcaagggcatcaagcccca 44269509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 46821921 - 46821958
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46821921 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 46821958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 312
Target Start/End: Original strand, 13543837 - 13543877
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13543837 gcatcaagccccaatctctatttgagtattattatacttcc 13543877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 14441145 - 14441208
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14441145 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatacatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 14441208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Original strand, 15565298 - 15565338
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  15565298 tcaacaacttaacaactcgtggatgacaattcatcaacaac 15565338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 35353406 - 35353469
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35353406 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagcccc 35353469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35961821 - 35961785
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35961821 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 35961785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2766 - 2499
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2766 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaagacatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 2667  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2666 ccatcgttaattttgagctaatgctccaacgttgtgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 2567  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2566 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 2499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 31823 - 32089
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31823 actatgcaacttagacttcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 31922  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31923 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 32021  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32022 aacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 32089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 46750 - 47009
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  46750 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccc 46849  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  46850 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggggagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttg 46949  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46950 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttca 47009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 65072 - 65022
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  65072 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 65022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 13251 - 13519
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13251 actatgcaacttagacctcttatatgcatatggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 13350  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  13351 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 13450  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13451 aaacgacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcaacttcaacaactta 13519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 179)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 35245340 - 35245600
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  35245340 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccc 35245439  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35245440 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagactcgacctctta 35245539  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35245540 aaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 35245600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20638649 - 20638382
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20638649 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 20638550  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  20638549 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcgtcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 20638451  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638450 aaacatcttaattcaacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 20638382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 1561058 - 1561325
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1561058 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 1561157  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||     
T  1561158 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggattcgacctctta 1561256  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1561257 aaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttggaacatcatcatcttcaacaactta 1561325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22074708 - 22074502
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074708 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagataactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 22074609  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074608 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgacttcaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 22074509  T
Q  270 agggcat 276  Q
    |||||||    
T  22074508 agggcat 22074502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 276
Target Start/End: Original strand, 2076871 - 2077062
Alignment:
Q  85 aatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataat 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2076871 aatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataat 2076970  T
Q  185 tcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076971 tcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 2077062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 226 - 486
Target Start/End: Original strand, 22831262 - 22831517
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22831262 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccc-----atttgagtattaatatacttccagggcatcaagcc 22831356  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  22831357 cccatcgctaatttttagctaatgctccaacgtcgtgagtacaaagctccagggaatcaagcccccaactatgaatgctaatgtatggactcgacctctt 22831456  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22831457 aaacaacttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 22831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16920996 - 16920737
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16920996 actatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagaccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 16920897  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  16920896 ccattgctatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggtgtcaagccccctactatgaatgctaatgcatggacttgacctctta 16920797  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16920796 aacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaacaatttggaacatcatcatcttca 16920737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 227 - 484
Target Start/End: Original strand, 11185267 - 11185526
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  11185267 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcc 11185366  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11185367 cccatcgctaattttgagctaatgctccaacgcggtgagtacaaaaatccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctctt 11185466  T
Q  426 -aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11185467 aaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatctt 11185526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 22780591 - 22780326
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  22780591 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagccc 22780492  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  22780491 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccaaggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 22780394  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780393 aaacatcttaattcgactacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 22780326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 231 - 494
Target Start/End: Original strand, 29060300 - 29060562
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29060300 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 29060398  T
Q  330 tcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29060399 tcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaa 29060496  T
Q  429 caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29060497 catcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcagctta 29060562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28496836 - 28496578
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  28496836 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctc 28496737  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
     |||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  28496736 acatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 28496639  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttca 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28496638 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttca 28496578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29809247 - 29808989
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  29809247 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctc 29809148  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
     |||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  29809147 acatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 29809050  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttca 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29809049 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttca 29808989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17288160 - 17287895
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17288160 actaagcaacttagacctcttatatacatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 17288061  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||  ||  |||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17288060 ccatcgctaatt--gagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagcttcagggcatcaagcccacaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 17287963  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17287962 aagcatcttaattcggcaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 17287895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 518
Target Start/End: Original strand, 22805370 - 22805789
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22805370 tataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactca 22805469  T
Q  174 tggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacag 271  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||                    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| |||    
T  22805470 tggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa--------------------tgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccag 22805549  T
Q  272 ggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaag 371  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22805550 ggcatcaagccccatcgctatttaagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaa--atgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaag 22805647  T
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  22805648 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacttcttata-taatccaataatttgg 22805746  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    |||| || | |      ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22805747 aacaacaactt-----acaacttagacaacatcaacaacttaagactc 22805789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 312 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19774003 - 19773797
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19774003 cagggcatcaagcccccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 19773905  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaact 510  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19773904 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagacaacatcaacaact 19773805  T
Q  511 taagactc 518  Q
    ||||||||    
T  19773804 taagactc 19773797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 226 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25629719 - 25629454
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||     
T  25629719 cgactatgcaatttagacctcctatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta--taagtattaatatacttccagggcatcaagc 25629622  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  25629621 ccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctc 25629524  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629523 ttaaacatcttaaatcgaaaacttcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 25629454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 23414289 - 23414437
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23414289 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 23414388  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23414389 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 23414437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25612093 - 25611840
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25612093 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatatacggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 25611994  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||    
T  25611993 ccatcgctaaatt-gagctaatgctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatcctaatgcatggacacgacctctt 25611895  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  25611894 aaacatctt-attcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcaacatc 25611840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 228 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25603755 - 25603502
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||    
T  25603755 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatcaagcccccatttctatttgaatattaatatactaccagagcatcaagccc 25603656  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||    
T  25603655 ccatcgctaa-attgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggacacgacctctt 25603557  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  25603556 aaacatctt-attcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcaacatc 25603502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19774204 - 19773988
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||| || || ||||||||||||    
T  19774204 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaa 19774105  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 266  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774104 caactcatggatgacaagtcatcaacaacgactttgactcgacaa-tgcaacttcgacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 19774006  T
Q  267 tacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19774005 tacagggcatcaagcccc 19773988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 1643894 - 1644042
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1643894 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 1643993  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1643994 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 1644042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31478706 - 31478558
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31478706 tcataaacatcgtataatcttcgtatgtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 31478607  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31478606 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 31478558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Original strand, 34963068 - 34963235
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963068 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa-tgcaacttcaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 34963166  T
Q  256 tgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34963167 tgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaag 34963235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 317 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20361236 - 20361059
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtc 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  20361236 catcaagcccccatcgctaattt-gagctaaaactccaacgtgttgagtataaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggac 20361138  T
Q  416 tcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20361137 tcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcattttcatcaactta 20361059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Original strand, 23992125 - 23992281
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992125 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaa-tgcaacttcaactcgactatgcaacttagacctcttatatgca 23992223  T
Q  256 tgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttcc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23992224 tgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcactatttgagtattattatacttcc 23992281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 16623738 - 16623886
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16623738 tcataaacatcgtataattttcgtaggtacttttttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 16623837  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16623838 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 16623886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 14471603 - 14471745
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14471603 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcata 14471702  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14471703 gatgatagttcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 14471745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 238 - 494
Target Start/End: Original strand, 20076470 - 20076722
Alignment:
Q  238 ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||     
T  20076470 ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatcgagggcatcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgcta- 20076566  T
Q  337 ttttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta 435  Q
      ||||   || |||||| |||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||| ||||    
T  20076567 --ttgagcgaaagctccatcgtgttgagcataaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaaaatcttaaacatctta 20076664  T
Q  436 attcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
       | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076665 gaacaacaacctcttatat-aatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 20076722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 11566251 - 11566394
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11566251 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11566350  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  11566351 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 11566394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12619559 - 12619416
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12619559 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12619460  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  12619459 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 12619416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 22862335 - 22862478
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22862335 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22862434  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  22862435 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 22862478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 23394457 - 23394600
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23394457 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 23394556  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  23394557 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 23394600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 8243222 - 8243365
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8243222 acatcgtaaaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 8243321  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  8243322 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 8243365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 23989309 - 23989452
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23989309 acatcgtataatcttcgcaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 23989408  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  23989409 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 23989452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 19872873 - 19873075
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  19872873 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 19872971  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||  ||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  19872972 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccccaaattatgtatgctaatgcatggactcgatctctt 19873070  T
Q  426 aaaca 430  Q
    |||||    
T  19873071 aaaca 19873075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 296 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18410126 - 18409926
Alignment:
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||  ||| ||||||  |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18410126 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcta--tttgagctaaagctccattgtgtggagtacaaggctccagggcatcaagcccccaaca 18410029  T
Q  396 atgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa----catcatcatcttcatcaa 490  Q
    ||||| || ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||    
T  18410028 atgaaatgataatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaa 18409930  T
Q  491 ctta 494  Q
    ||||    
T  18409929 ctta 18409926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 317 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19303814 - 19303639
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtc 415  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  19303814 catcaagcccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatactaatgcatggac 19303717  T
Q  416 tcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303716 tcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatctta 19303639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 19862731 - 19862933
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  19862731 cgactaagcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 19862829  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  19862830 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacttatgtatgctaatgcatggactcgatctct 19862927  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  19862928 taaaca 19862933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 22432002 - 22432204
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  22432002 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 22432100  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||| ||||    
T  22432101 cccatcgct-attttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccagagcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctct 22432198  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  22432199 taaaca 22432204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 22438552 - 22438754
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  22438552 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 22438650  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||| ||||    
T  22438651 cccatcgct-attttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccagagcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctct 22438748  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  22438749 taaaca 22438754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22335261 - 22335052
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  22335261 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttatttgagtattaatatacttccagggca-aaagcc 22335163  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  22335162 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgcgtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 22335065  T
Q  425 taaacaacttaat 437  Q
    |||||| ||||||    
T  22335064 taaacatcttaat 22335052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25642551 - 25642342
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  25642551 cgactatgcaacttataccacttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 25642453  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | || || ||||    
T  25642452 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctct 25642355  T
Q  425 taaacaacttaat 437  Q
    |||||| ||||||    
T  25642354 taaacatcttaat 25642342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 311 - 494
Target Start/End: Original strand, 20593615 - 20593795
Alignment:
Q  311 ccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgc 409  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20593615 ccagggcatcaagcccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccagcaatgaaatgctaatgc 20593711  T
Q  410 atagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593712 atggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 20593795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15894801 - 15894602
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  15894801 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 15894703  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||  |||||  |||||||||| |||| || || | |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  15894702 cccatcgtta--tttgagctaatgctccatcgtgttgtgtactaagctctagggcat-aagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 15894606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 169
Target Start/End: Original strand, 27556065 - 27556159
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27556065 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcatagatgataattcatcatcaacttaacaa 27556159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 16759626 - 16759739
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaac-aactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16759626 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactaat 16759725  T
Q  175 ggatgataattcat 188  Q
    ||||||||||||||    
T  16759726 ggatgataattcat 16759739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8227830 - 8227706
Alignment:
Q  212 atgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatactt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  8227830 atgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttgagtattattatactt 8227731  T
Q  311 ccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    || |  ||||||| ||| |||||||    
T  8227730 ccggagcatcaagccccaatcgcta 8227706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19848419 - 19848283
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19848419 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgattatgcaacttagacctctcatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtcccaatcgctatttgagt 19848320  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  19848319 attattatacttccggagcatcaagccccaatcgcta 19848283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 19869978 - 19870122
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggt-agaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19869978 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggttataacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcg 19870077  T
Q  174 tggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  19870078 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 19870122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 22948506 - 22948592
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948506 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 22948592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 22952462 - 22952548
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22952462 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 22952548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 23870950 - 23871036
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23870950 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 23871036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 23874906 - 23874992
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23874906 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 23874992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 1595255 - 1595341
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1595255 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 1595341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4643072 - 4642962
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4643072 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaatttagacctcttatatgcatgtcgtaccaatacgaagcatcaagcccctatcgctatttgagt 4642973  T
Q  299 attaatatact 309  Q
    |||||||||||    
T  4642972 attaatatact 4642962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3852465 - 3852341
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatact 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||     
T  3852465 aatgcgactctaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac- 3852367  T
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  3852366 tccagagcatcaagcccctatcgcta 3852341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30677092 - 30676979
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||    
T  30677092 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatacaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtctcaatcgctatttga 30676993  T
Q  297 gtattaatatactt 310  Q
    |||||| |||||||    
T  30676992 gtattattatactt 30676979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 1595446 - 1595568
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1595446 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 1595543  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  1595544 gaacttcatcatcttaatcaactta 1595568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2291445 - 2291323
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2291445 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 2291348  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  2291347 gaacttcatcatcttaatcaactta 2291323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18334857 - 18334735
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18334857 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 18334760  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  18334759 gaacttcatcatcttaatcaactta 18334735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 19004943 - 19005065
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19004943 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 19005040  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  19005041 gaacttcatcatcttaatcaactta 19005065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 24422444 - 24422566
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24422444 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 24422541  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  24422542 gaacttcatcatcttaatcaactta 24422566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 33861691 - 33861813
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33861691 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 33861788  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  33861789 gaacttcatcatcttaatcaactta 33861813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20557349 - 20557263
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20557349 ctttgactcgacaaatgcgattccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatatggtaccaatccagggcatcaagcccc 20557263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 23019122 - 23019208
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  23019122 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatccagggcaccaagccc 23019208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19859184 - 19859062
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  19859184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-tagtccaataatttg 19859087  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  19859086 gaacttcatcatcttaatcaactta 19859062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 33864175 - 33864297
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33864175 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 33864272  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  33864273 gaacttcatcatcttaatcaactta 33864297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 17742849 - 17743001
Alignment:
Q  133 acaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactat 232  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||    
T  17742849 acaactcatggatgtcaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgg-taatgcaacttcgacttgactat 17742947  T
Q  233 gcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||   | |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17742948 gcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 17743001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 25644057 - 25644143
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25644057 actttgactcgacaaatgcgactccaattcaactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcatgccc 25644143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 8054926 - 8055048
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8054926 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 8055023  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  8055024 gaacttcatcatcttaatcaactta 8055048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 18906866 - 18907046
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  18906866 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcagggcat-aagcc 18906961  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18906962 cccaac-attattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 18907046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26924905 - 26924783
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26924905 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 26924808  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  26924807 gaacttcatcatcttaatcaactta 26924783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 25754554 - 25754660
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||    
T  25754554 ctttgactcgacaaatgcgactccaaatcgactatgcaacttagacatcctatacgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcgttatttga 25754653  T
Q  297 gtattaa 303  Q
    |||||||    
T  25754654 gtattaa 25754660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1541176 - 1541054
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1541176 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 1541079  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  1541078 gaacttcatcatcttaatcaactta 1541054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18692273 - 18692092
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  18692273 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattat---agtattaatatactttcagggcat-aagcc 18692178  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18692177 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 18692092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31165201 - 31165006
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  31165201 cgactatgcaacctagacatctcatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgcta--taagtattaatatactt-cagggcat-gagcc 31165106  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  || ||  ||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  31165105 cccatcgcta--ttcgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacaatgtatgctaatgcatggactcgatctctt 31165009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3852273 - 3852160
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  3852273 gcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttggaacttcat 3852176  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  3852175 catcttaatcaactta 3852160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 25754715 - 25754828
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25754715 gcatcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttggaacttcat 25754812  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  25754813 catcttaatcaactta 25754828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 19668091 - 19668176
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19668091 actttgactcgacaa-tgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatggatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 19668176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 20108855 - 20108940
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20108855 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttaaatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 20108940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Original strand, 18456445 - 18456510
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456445 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 18456510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 12742214 - 12742336
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |  || | ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12742214 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct-tgtaatatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 12742311  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  12742312 gaacttcatcatcttaatcaactta 12742336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16523745 - 16523564
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  16523745 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattat---agtattaatatactttcagggcat-aagcc 16523650  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    | || |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16523649 ctcaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 16523564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19656888 - 19656762
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattca--tcaacaacttaac 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||  ||||||||||| |    
T  19656888 tcataaacatcgtataatcttcataagcacttcattaacaacacatagatagaagacaactcaacaactcatggat-agaagacaactcaacaacttagc 19656790  T
Q  168 aactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19656789 aactcatggatgacaattcatcaacaac 19656762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 494
Target Start/End: Original strand, 22782139 - 22782246
Alignment:
Q  387 cccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttc 485  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  22782139 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcata-taatccaataatttggaaattcatcatctta 22782237  T
Q  486 atcaactta 494  Q
    |||||||||    
T  22782238 atcaactta 22782246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21740398 - 21740212
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc---catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||   |||   ||||| ||||||||||||| | |||| |||  |    
T  21740398 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattaatattttagtattaatataccttcagggcat-ga 21740300  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    | |||||| | | |||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21740299 gcccccattg-ttattttgagctgatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 21740212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16965672 - 16965428
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |   |  | ||||||||||||||| |||| ||   || ||    
T  16965672 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccaacgtaa--taagtattaatatactt-cagggca-agagccc 16965577  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    | |||| | |||||||  ||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  16965576 caatcg-ttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagagcat-aagcccccatcatatgaatactaatgcatggactcgatctctt 16965479  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca 480  Q
    ||||| || ||||    | | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16965478 aaacatctcaatt----atcatcttatatttgtccaataatttggaacatcatca 16965428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18918092 - 18918006
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18918092 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgatcacccatggatgataattcatcaccaac 18918006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 482
Target Start/End: Original strand, 19652080 - 19652208
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| |||||||||   | |||||||||||    
T  19652080 ccaacgtggtgag-gaaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatctt-aacaacttagaacaacaacctctta 19652177  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
     || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19652178 aataactccaataatttggaacatcatcatc 19652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Original strand, 18461605 - 18461670
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461605 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 18461670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22081101 - 22081044
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22081101 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccc 22081044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 23538215 - 23538296
Alignment:
Q  124 gacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgact 205  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23538215 gacaacttaacaactcttgaatgataattcatcaacaacttaacaactcttggatgataattcatcaacaacgaatttgact 23538296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Original strand, 25688401 - 25688521
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25688401 ccagggcatcaagccctcaactttgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcgtaaatcgataacctcttata-taatccaataatttggaa 25688499  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||| ||||| |||||||||    
T  25688500 cctcattatcttaatcaactta 25688521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8227703 - 8227611
Alignment:
Q  401 tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactt 493  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8227703 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacaactt 8227611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15706106 - 15705985
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaaca--------actcatagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  15706106 tatagtcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatagatgacaactcatcaacaacttaaccactca 15706007  T
Q  174 tggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||| || |||| ||||||    
T  15706006 tggatgacaactcatcaacaac 15705985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20557158 - 20557035
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20557158 gctccacgacatcaagcccacaacaatgaaatgttaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaaattgaaaacctcttata-taatccaataatttg 20557060  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20557059 gaacttcatcatcttaatcaactta 20557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16448945 - 16448858
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaac-tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448945 ctttgactcgacaaatgctacttcaacattgactatgcaacttagacctcctatatgcatatggtaccaatccagggcatcaagcccc 16448858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19303861 - 19303790
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19303861 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccccatcgctatttgag 19303790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9100973 - 9100888
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  9100973 actttgactcgacaa-tgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggtatcaagccc 9100888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 494
Target Start/End: Original strand, 16496204 - 16496266
Alignment:
Q  432 cttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16496204 cttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 16496266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 17105321 - 17105403
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17105321 acaacttaacaactcatggatgccaactcatcgacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttgactcg 17105403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19656702 - 19656625
Alignment:
Q  130 tcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  19656702 tcaacaactcatggatgagaattcatcatcaacttaacaactcatggatgacaactcatcgacaacgactttgactcg 19656625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 284
Target Start/End: Original strand, 20593574 - 20593631
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20593574 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaaaccagggcatcaagcccc 20593631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Original strand, 25714319 - 25714439
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaat-gctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||  | |||||||| | ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25714319 ccagggcatcaagccctcaactttgaaaagttaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaaccggcaacctcttatat-aatccaataatttggaa 25714417  T
Q  473 catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  25714418 catcatcatcttaatcaactta 25714439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27333498 - 27333441
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27333498 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatccagggcatcaagccc 27333441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27394238 - 27394181
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27394238 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatccagggcatcaagccc 27394181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 482
Target Start/End: Original strand, 34963266 - 34963374
Alignment:
Q  373 tccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||    
T  34963266 tccagagcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaa 34963364  T
Q  473 catcatcatc 482  Q
    ||||||||||    
T  34963365 catcatcatc 34963374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 200
Target Start/End: Original strand, 16759708 - 16759784
Alignment:
Q  124 gacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactt 200  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16759708 gacaacttaacaactaatggatgataattcatcgacaacttaacagctaatggatgataattcatcaacaacgactt 16759784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20361282 - 20361226
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20361282 actatgcaatttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcaagcccc 20361226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21830801 - 21830621
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21830801 cgacaatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgaacctccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 21830706  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21830705 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 21830621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 195
Target Start/End: Original strand, 17742750 - 17742878
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactc--------aacaactcatagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||        |||||||||| || || |||||||||||||||| |    
T  17742750 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggaggacaattcatcaacaacttta 17742849  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17742850 caactcatggatgtcaattcatcaacaac 17742878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 19848214 - 19848116
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  19848214 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 19848116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16960383 - 16960334
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16960383 gactatgcagcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 16960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 22080963 - 22080824
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |  |  |||||   ||||||  | ||||||||||    
T  22080963 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgtatggacacatcaacttaa--cacttaaaacaacaacctctt 22080868  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22080867 atataagtccaataatttggaacatcatcatcttaatcatctta 22080824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 267
Target Start/End: Original strand, 13019222 - 13019278
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13019222 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 13019278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15706022 - 15705942
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgact 205  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  15706022 acaacttaaccactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgaatttgact 15705942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 19651944 - 19651999
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19651944 actatgcaacttaaatctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 19651999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27126665 - 27126610
Alignment:
Q  152 tcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  27126665 tcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 27126610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30676973 - 30676871
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  30676973 gcatcaagccccaatcgctggatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacatcat 30676875  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  30676874 catc 30676871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4738895 - 4738854
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738895 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 4738854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 20109021 - 20109079
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaa-gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109021 ccaacgtggtgag--caaatgctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 20109079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22408654 - 22408472
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||   |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  22408654 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccctatc---attttagtattaatatactttcagggcat-aagcc 22408559  T
Q  326 cccatc-gctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| | | | |||||||   ||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22408558 cccaacagtttattttgagcaaatgctccatcgtggtgacgacaaagctccaggacat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 22408472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 411
Target Start/End: Original strand, 13019394 - 13019433
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13019394 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 13019433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15041861 - 15041803
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15041861 cgactatgcaacctagacatctcatatgcatgtggtaccaatacagggcat-aagcccca 15041803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Original strand, 18180254 - 18180430
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||     
T  18180254 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatacttttagggcat-aagcccccaa 18180349  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||  ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18180350 caattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcat 18180430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Original strand, 20182317 - 20182440
Alignment:
Q  81 gtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactc---------aacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaact 171  Q
    ||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20182317 gtatactcttcataagcacttcatttacaacacatgggtagaagacaactcaacaactttaacaactcatgtatgacaattcatcgacaactcaacaact 20182416  T
Q  172 catggatgataattcattaacaac 195  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||    
T  20182417 cgtggatgacaattcatcaacaac 20182440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 20182402 - 20182453
Alignment:
Q  124 gacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20182402 gacaactcaacaactcgtggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatg 20182453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22153589 - 22153538
Alignment:
Q  124 gacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22153589 gacaactcaacaactcgtggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatg 22153538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22153674 - 22153551
Alignment:
Q  81 gtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaac---------aactcatagatgataattcatcaacaacttaacaact 171  Q
    ||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  22153674 gtatactcttcataagcacttcatttacaacacatgggtagaagacaactcaacaactttaacaactcatgtatgacaattcatcgacaactcaacaact 22153575  T
Q  172 catggatgataattcattaacaac 195  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||    
T  22153574 cgtggatgacaattcatcaacaac 22153551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31155734 - 31155695
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155734 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 31155695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16448787 - 16448682
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  16448787 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 16448689  T
Q  473 catcatc 479  Q
    | |||||    
T  16448688 cttcatc 16448682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 16492921 - 16492993
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16492921 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatactcccagggcatcaag 16492993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 17803975 - 17804016
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17803975 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 17804016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19656799 - 19656746
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggat 178  Q
    |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656799 acaacttagcaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggat 19656746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27325943 - 27325902
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325943 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 27325902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27416557 - 27416500
Alignment:
Q  161 acttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  27416557 acttaacaactcatagatgataattcatcaacaacgacttcgactcgacagatgcgac 27416500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 31155634 - 31155505
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacct 447  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||    ||||| |    
T  31155634 gctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaa----acaactt 31155539  T
Q  448 cttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    | || | || |||||| ||||||||||||||||||    
T  31155538 cgta-aatagtccaataatttggaacatcatcatc 31155505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 33442778 - 33442892
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatat---gcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||    | ||||| ||||||||||||    
T  33442778 aatgcgacttcgactcgactatgcaacttat-cttcttaaatcatgcatgtggtaccaatccaggacatcaagccctcaatgtatttaagtattaatata 33442876  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  33442877 cttccagggcatcaag 33442892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Original strand, 4186251 - 4186339
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaa 436  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  4186251 gctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgacctcgacctcttaaacatcttaa 4186339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4738794 - 4738706
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaa 436  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||    
T  4738794 gctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaa 4738706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 479
Target Start/End: Original strand, 19668257 - 19668383
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctctt 450  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||| |||| |||| | || || |||||||    
T  19668257 ccaacgtggtgagcg-aaggctccaaggcatcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaatcaacgacctctt 19668354  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatc 479  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19668355 atataaatccaataatttggaacatcatc 19668383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 22948563 - 22948615
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22948563 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 22948615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 22952519 - 22952571
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22952519 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 22952571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 23076462 - 23076576
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc-cccatctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||| | || |  ||||| ||||||||||||    
T  23076462 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgtatgtgatatcaatccagggcatcaagctctcaac-gtatttaagtattaatata 23076560  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  23076561 cttccagggcatcaag 23076576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 23871007 - 23871059
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23871007 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 23871059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 23874963 - 23875015
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23874963 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 23875015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 7825378 - 7825441
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  7825378 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaactcgtggatagaagacaactcaacaact 7825441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 478
Target Start/End: Original strand, 23992329 - 23992427
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | || ||| |||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  23992329 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatacaacgaccgctta-aatagtccaataatttggaacatcat 23992427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 264
Target Start/End: Original strand, 18926656 - 18926690
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926656 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 18926690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27126720 - 27126658
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27126720 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcatcaac 27126658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4186058 - 4185929
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa-tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacct 447  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || | |||  ||||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||    ||||| |    
T  4186058 gctccatcgtggtgagtacaaagccccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa----acaactt 4185963  T
Q  448 cttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    |||| | || |||||| |||||||||||| |||||    
T  4185962 ctta-aatagtccaataatttggaacatcgtcatc 4185929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4186159 - 4186118
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4186159 cgactatgaaacttagacctcttatatacatgtggtaccaat 4186118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Original strand, 7825433 - 7825481
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttga 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  7825433 tcaacaacttaacaactcgtggatgacaactcatcaacaacgactttga 7825481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 18452962 - 18453025
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18452962 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 18453025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 21766448 - 21766628
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| || | ||| ||| |    
T  21766448 cgacaatgcaacttatacctattatatgcatgtggtgccaattcagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcaaggcat-aagcc 21766543  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21766544 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaaactccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 21766628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 23992080 - 23992128
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23992080 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaactcaacaac 23992128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 25644224 - 25644281
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25644224 ccaacgtggtgag--caaggatccagcgcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 25644281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 25714185 - 25714249
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25714185 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 25714249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 35007881 - 35007994
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |  ||||| || |||||||||    
T  35007881 aatgcgacttcaacttgactatgcaactta-acttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccctcaac-gtatttaagcattaatata 35007978  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||| ||| |||||||    
T  35007979 cttctagggcatcaag 35007994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 484
Target Start/End: Original strand, 23019377 - 23019420
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23019377 acaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcatctt 23019420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 179
Target Start/End: Original strand, 17105288 - 17105342
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatg 179  Q
    |||||| |||||||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17105288 acaacttaacaactcgtggatgacgactcatcaacaacttaacaactcatggatg 17105342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18918029 - 18917983
Alignment:
Q  172 catggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18918029 catggatgataattcatcaccaacgactttgactcaacaaatgcgac 18917983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 18929236 - 18929286
Alignment:
Q  260 gtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatact 309  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18929236 gtaccaatacagagcatcaaggccccatcgctatttgagtatcaatatact 18929286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27416553 - 27416523
Alignment:
Q  132 aacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416553 aacaactcatagatgataattcatcaacaac 27416523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 334
Target Start/End: Original strand, 34963228 - 34963290
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgct 334  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  34963228 gcatcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 34963290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 23019289 - 23019347
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23019289 ccaacgtggtgag--caaaggctccagagcattaagcccccaacaatgaatgttaatgcat 23019347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 23992127 - 23992164
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23992127 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 23992164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 34963070 - 34963107
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34963070 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 34963107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15174388 - 15174352
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15174388 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 15174352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 18913775 - 18913811
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18913775 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 18913811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 18937033 - 18937069
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18937033 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 18937069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 19362199 - 19362231
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19362199 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 19362231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19656629 - 19656566
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19656629 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtatcaatccagggcatcaagcccc 19656566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19656735 - 19656695
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  19656735 tcaacaacttaacaactcatggatgacaatttatcaacaac 19656695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 484
Target Start/End: Original strand, 20109112 - 20109152
Alignment:
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20109112 acctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatctt 20109152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23528449 - 23528417
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23528449 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 23528417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 23538324 - 23538356
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23538324 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 23538356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 25656521 - 25656585
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25656521 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatccagggaatcaagcccc 25656585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 218
Target Start/End: Original strand, 27556159 - 27556195
Alignment:
Q  182 aattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27556159 aattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 27556195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 5494 - 5235
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  5494 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggtatcaagccc 5395  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  5394 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgttaatgcatggactcgacctctta 5295  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5294 aacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacgtcatcatcttca 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 228 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11539
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11809 actattcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 11710  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  11709 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 11611  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaac 497  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11610 aaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcttcatcttcaacaacttaaac 11539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 33878 - 34145
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33878 actatgcaacttagacctcttatatgcatatggtacgaatacagggcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 33977  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33978 ccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagttgcagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagactcgacctctta 34077  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34078 agcaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 34145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 30 - 295
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 129  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||| ||||  ||||  ||| |||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  130 ccatctctaa--ttgagctaaagctccaacgcattaagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 227  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  228 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcattatcttcatcaactta 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 168343 - 168077
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  168343 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaaaatacttccagggcatcaagccc 168244  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  168243 ccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 168145  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  168144 aacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 168077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 51670 - 51935
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  51670 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtagcaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagccc 51769  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  51770 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 51867  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||  | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51868 aaacatcttaaaacaaaaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 51935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38505 - 38391
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||    
T  38505 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-taattgagcataaatata 38407  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || ||||| |||||||    
T  38406 ctcccagggcatcaag 38391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 1705 - 1966
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  1705 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccc 1804  T
Q  327 ccatcgctaatttt--gaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1805 ccatcgctaattttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctct 1904  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1905 taaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 1966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15830 - 15562
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15830 actatgcaacttagacctcttatatgaatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 15731  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt- 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||     
T  15730 ccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggactagacctctta 15631  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15630 aaacaacttgattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 15562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 382
Target Start/End: Original strand, 7049 - 7201
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || ||    
T  7049 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggcaccaattcagggtatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagccc 7147  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcat 382  Q
    |||||| ||  |||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7148 ccatcgtta--tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat 7201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6613 - 6407
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6613 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 6514  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6513 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 6414  T
Q  270 agggcat 276  Q
    |||||||    
T  6413 agggcat 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 31915 - 32183
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31915 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 32014  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||    
T  32015 ccatcgctaattttgagctaatgccccaatgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctctt 32114  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaac-atcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32115 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacaatcatcatcttcatcaactta 32183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 4468 - 4734
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4468 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 4567  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4568 ccatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccctaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 4666  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4667 aacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcaacaactta 4734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 15)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 243 - 494
Target Start/End: Original strand, 119646 - 119897
Alignment:
Q  243 cctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  119646 cctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattt-g 119744  T
Q  342 aattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcga 441  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  119745 agctaatgctccaacgtggtgagtacagagctccagggcatcaagccctcaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcga 119844  T
Q  442 caacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  119845 caacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 119897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18145 - 17935
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||    
T  18145 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcaaggatgataattcatcaacaacgactttgactcgac-aatacaacttcaac 18047  T
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  18046 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcctcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttctagagcatcaag 17947  T
Q  324 tccccatcgcta 335  Q
     ||| |||||||    
T  17946 ccccaatcgcta 17935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 94308 - 94430
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  94308 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 94405  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  94406 gaacttcatcatcttaatcaactta 94430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 44160 - 44246
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44160 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccc 44246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38838 - 38644
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  38838 atgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatta-ttgagtattaatatacttctagggcat-aagcccccat 38741  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
     ||||| |||||  |||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  38740 tgctaa-tttgagctaatgctcaatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 38644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 44351 - 44473
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaa-tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  44351 gctccagggcatcaagtccccaacaattaaaagctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttt 44448  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  44449 gaacttcatcatcttaatcaactta 44473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40467 - 40409
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40467 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 40409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 101286 - 101343
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  101286 cgactatgcagcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 101343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 100099 - 100155
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  100099 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaggccc 100155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 101404 - 101444
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101404 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 101444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 100278 - 100318
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100278 gctccagggcatcaagctcccaacaatgaatgctaatgcat 100318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 18108
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18147 caacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 18108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40391 - 40351
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40391 gctccacggcatcaagtccccaacaatgaatgctaatgcat 40351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17954 - 17891
Alignment:
Q  273 gcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  17954 gcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 17891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18192 - 18144
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18192 ttcataagtacttcattaaatacacatggatagaagacaactcaacaac 18144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 224 - 547
Alignment:
Q  50 tcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgata 149  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  224 tcataagcaacttgacaacatcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaataaaactcagcaactcatagatgata 323  T
Q  150 attcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta 249  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  324 attcattaacaacttgacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgacttgac-aatgcgactcgaactcgactatgcaacttagacctctta 422  T
Q  250 tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatg 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||    |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||  ||| |    
T  423 tatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaaaggttattgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaa-tttgagctaaag 520  T
Q  350 ctccaacgtggtgagtgcaaagctcca 376  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  521 ctccatcgtggtgagtacaaagctcca 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 357 - 518
Target Start/End: Original strand, 550 - 709
Alignment:
Q  357 gtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa-tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatatt 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||   |  | ||||||||||    
T  550 gtggtgagtacaaagctccagggcctga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcataatc--atcatctcttatatt 646  T
Q  456 aatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  647 agtccaataatttggaacatcattatcttcaacaactaagacaacatcaacaacttaagactc 709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 4606 - 4871
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  4606 actatgcaacttagacctcttataagaatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagccc 4705  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4706 ccatcgctaatt--gacctaaagctccaacgtggtgagtacaaaactccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 4803  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4804 aacaaattaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 8236 - 8501
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8236 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagtcc 8335  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8336 ccatcgctaatgttgagctaatgctccaatgtggtgagtacaaagatccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctctta 8435  T
Q  427 aacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8436 aaaatcttaa-tcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 8501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 1040 - 1303
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctctta----tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1040 actacgcaacttagacctcttaattatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagccccgaccgctatttgagttttaatatacttccaggacatcaa 1139  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacct 422  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  1140 gcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatgaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacct 1239  T
Q  423 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1240 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15460 - 15340
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttata-taatccaataatttg 15362  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaac 491  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  15361 gaacttcatcatcttaatcaac 15340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 486
Target Start/End: Original strand, 7192 - 7280
Alignment:
Q  398 gaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7192 gaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 7280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15608 - 15522
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15608 ctttgactcaacaaatgtgactccaacttgactatgcaacttagacttgttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 15522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19995 - 19923
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19995 atgcatgtggtaccaatccagggcatctagccctcaact-tatttgagtattaatatactcccagggcatcaag 19923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 6)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 226 - 494
Target Start/End: Original strand, 1750 - 2019
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||     
T  1750 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatggggcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttctagggcatcaagc 1849  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1850 cccaatcgctaattt-gagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagactcgacctct 1948  T
Q  425 t-aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1949 taaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 2019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 226 - 494
Target Start/End: Original strand, 4305 - 4574
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccca-tctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | | |||||||     
T  4305 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataaggggcatcaagccccaatcgatatttgagtattattatacttcaaaggcatcaagc 4404  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4405 cccaatcgctaattt-gagctaatgctccaacgaggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctct 4503  T
Q  425 -taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4504 aaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 4574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 28169 - 28436
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||    
T  28169 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatacatggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggctttaagccc 28268  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||| | |||||| ||  |||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  28269 ccattgttaattt-gagctaaacctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 28367  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368 aaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaatagtttggaacatcatcatcttcatcaactta 28436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 494
Target Start/End: Original strand, 11252 - 11314
Alignment:
Q  432 cttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11252 cttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 11314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26414 - 26342
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26414 atgcatgtggttccaatccagggcatcaagcccccaacgtatttgagaattaatatactcccagggcatcaag 26342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17265 - 17193
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17265 atgcatgtggttccaatccagggcatcaatcccccaacgtatttgagcattaatatactcccagggcatcaag 17193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 12969 - 13233
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12969 actatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 13068  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  13069 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaag-ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 13165  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13166 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8893 - 8628
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  8893 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccc 8794  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||| ||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  8793 ccatcactaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 8696  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8695 aaacatcttaattcaacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 8628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 51336 - 51596
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc-cccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51336 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagttcccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 51435  T
Q  327 ccatcgctaatttt-gaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  51436 ccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcattaagcccccaactaagaatgctcatgcatggactcgacctctt 51535  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51536 aaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattttca 51596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 63536 - 63454
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  63536 acaacttaacaactcatggttgacaattcatcaagaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgaatttgactcg 63454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 63585 - 63535
Alignment:
Q  87 tcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  63585 tcttcataagcacctcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaac 63535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 230 - 486
Target Start/End: Original strand, 174523 - 174780
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcc-ccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  174523 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcaagccaccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccc 174622  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  174623 atcgctaattttgagcaaattctccaatgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaa 174722  T
Q  429 caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  174723 caacttaattcgataacctcttaatttagtccaataatttggagcatcatcaacttca 174780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Original strand, 121607 - 121788
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| || ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  121607 cagggcatcaaacccccatcgctaaatt-gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 121705  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121706 tggactcgacctcttaaacatattaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 121788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 121566 - 121622
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  121566 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaaacccc 121622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 136784 - 136661
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |  || || |    
T  136784 ctttgactcgacaa-tgcgacctcaacttgactatgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaggccctcaac-gta-ttaa 136688  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  136687 gtattaatatacttccagggcatcaag 136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 136619 - 136491
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctctt 450  Q
    ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  | | |||| |||| |  |  | |||||||    
T  136619 ccaacgtggtgagcg-aaggctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcgacaac-tcaacatcttagaaacctcgacctctt 136522  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcat 481  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  136521 atataaatccaataatttggaacatcatcat 136491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 145304 - 145199
Alignment:
Q  376 agggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaaca 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  | | |||| |||| |  |  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  145304 agggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcgacaac-tcaacatcttagaaacctcgacctcttatataaatccaataatttggaaca 145206  T
Q  475 tcatcat 481  Q
    |||||||    
T  145205 tcatcat 145199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Original strand, 16036 - 16296
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16036 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 16135  T
Q  327 ccatcgctaatttt-gaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  16136 ccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggtatcaagcgcccaactatgaatgctattgcatggactcgatctctt 16235  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16236 agacaacttaattcgacaacctcttacattagtctaataatttggaacatcatcatcttca 16296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 1608 - 1873
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  1608 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccattacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagccc 1707  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||| || | |  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  1708 ccatcactgaat--gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 1805  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1806 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 208327 - 208187
Alignment:
Q  78 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208327 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaagtcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 208228  T
Q  178 tgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  208227 tgataattcatcaacaacgactttgacttgacaaatgcgac 208187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5196 - 4932
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  5196 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagcattaatatacttccagggcatcaaaccc 5098  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  5097 ccatcgcta--gttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctctt 5000  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4999 aaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 4932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 6)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 494
Target Start/End: Original strand, 3227 - 3492
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  3227 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacgtccagggcatcaagccc 3326  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  3327 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaatctctagggcatctagcccccaaaaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt 3424  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3425 agacatcttaattcaacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 494
Target Start/End: Original strand, 143 - 365
Alignment:
Q  270 agggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgca 368  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||||||    
T  143 agggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatataattccagcgcatcaagcccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtgca 240  T
Q  369 aagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || ||| |||    
T  241 aagctccagggcatcaagcccccaacaaagaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgac-acctcttata-tagtctaataatt 338  T
Q  468 tggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  339 tggaacatcatcatctttatcgactta 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 195
Target Start/End: Original strand, 4329 - 4449
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4329 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcat 4428  T
Q  175 ggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||| || |||| ||||||    
T  4429 ggatgacaactcatcaacaac 4449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 308
Target Start/End: Original strand, 10264 - 10345
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10264 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac 10345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 4412 - 4494
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||    
T  4412 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgattttgactcg 4494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 4490 - 4553
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4490 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 237 - 494
Target Start/End: Original strand, 39679 - 39935
Alignment:
Q  237 cttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39679 cttagacctcttatatgcatgtagtaccaatagagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagctcccatcgcta 39778  T
Q  336 attttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactt 434  Q
      |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||    
T  39779 --tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagtccccaacaatgaaatgctaatgcatggacccgacctcttaaacatctt 39876  T
Q  435 aattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39877 aattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19081 - 18879
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  19081 actcgactatgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac-atattttagtattaatatactttcagggcat-aa 18984  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacc 421  Q
    | |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | |    
T  18983 gaccccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc 18886  T
Q  422 tcttaaa 428  Q
    |||||||    
T  18885 tcttaaa 18879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20206 - 20121
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20206 actttgactcgacaa-tgcaacttcgacttgattatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 20121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16838 - 16788
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16838 cgacaatgcaacctaaaccttttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20102 - 20072
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaat 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20102 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaat 20072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17586 - 17316
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17586 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcc 17487  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||     
T  17486 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaacctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcg 17389  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa----catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  17388 taaacatcttaattcgacaacctctcata-taatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactta 17316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14425 - 14252
Alignment:
Q  252 tgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgct 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||  |||||  |||||||    
T  14425 tgcatatggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgtta--tttgagctaatgct 14329  T
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  14328 ccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 14252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 490
Target Start/End: Original strand, 128506 - 128769
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatat--gcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  128506 actatgcaacttagacctcttatatatgcatgcggtaccaatacagggcatcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttcaagggcatcaagc 128605  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  128606 ccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctc 128703  T
Q  424 ttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  128704 ttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaa 128769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36833 - 36685
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36833 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 36734  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36733 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 36685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 66161 - 65960
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  66161 cgactatgcaacttagacctcttttatgcatgtggtaccatttcagggcatgagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 66063  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  66062 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagttcaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 65966  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  65965 taaaca 65960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 53343 - 53384
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53343 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 53384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18419 - 18134
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18419 ttgactcgacaaatgcgactccaattcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatactgagcatcaagcccctatcgctatttgagt 18320  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg 398  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18319 attattatact-ccagggcatcaagcccctatcgttaatt--gagctaaacctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaaccccccaacactg 18223  T
Q  399 aa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    || || |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18222 aaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 18134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2547 - 2411
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgag 297  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2547 ctttgactcgacacatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagagcatcgagccccatcactatttgag 2448  T
Q  298 tattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2447 tattaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgcta 2411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2366 - 2272
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  2366 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaaccgacaacctcttata-taatccaataatttagaacttcatcattttaatcaactta 2272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8254 - 8093
Alignment:
Q  27 cataaacaaccttataaacaacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagac 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8254 cataaacaacattataaacaacatcataagcaacttaacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagac 8155  T
Q  127 aactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcat 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 aactcaacaactcatagatgacaattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcat 8093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8124 - 8041
Alignment:
Q  124 gacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8124 gacaacttaacaactcatggatgataattcatcaaaaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 8041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8037 - 7982
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8037 atgcaacttcgacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 7982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8337 - 8167
Alignment:
Q  45 caacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcataga 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  8337 caacatcataagcaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaacttagcaactcaaaga 8238  T
Q  145 tgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgc 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  8237 tgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatgc 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 16483 - 16569
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16483 ctttgacccgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacctatccagggcatcaagcccc 16569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 494
Target Start/End: Original strand, 16710 - 16803
Alignment:
Q  400 atgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16710 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaccaactcttgta-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaactta 16803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 8117
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8151 acctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 309 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1156
Alignment:
Q  309 ttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatg 408  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatg 1234  T
Q  409 catagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1233 catggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttca 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1372 - 1315
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa-tacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1372 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattccagggcatcaagcccc 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25330 - 25173
Alignment:
Q  58 aacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  25330 aacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaactcgtagatgataattcatta 25231  T
Q  158 acaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  25230 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatgc 25173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38676 - 38562
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38676 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacgtagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 38577  T
Q  298 tattaatatacttcc 312  Q
    ||||| |||||||||    
T  38576 tattattatacttcc 38562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 38450 - 38363
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38450 aatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 38363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 42384 - 42566
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  42384 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 42479  T
Q  326 cccatc-gctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| | | | |||||||   ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  42480 cccaacagtttattttgagcaaatactccatcgtggtgagtacaaacctccagggcat-gatcccccaacaaatgtatgctaatgcat 42566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 226 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16962 - 16703
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16962 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagtccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagc 16865  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacct 422  Q
    |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16864 ccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgag--caaaggcttcagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 16770  T
Q  423 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16769 cttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttgaaacatcatcatcttcatcaa 16703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 238 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 340299 - 340046
Alignment:
Q  238 ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  340299 ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatcgagggcatcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgc-aa 340203  T
Q  337 ttttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta 435  Q
    |||| |  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  340202 tttt-agctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 340104  T
Q  436 attcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  340103 aatcgacaacctcttata-taatccaataattttgaacttcatcatcttcgtcaactta 340046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 158716 - 158593
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  158716 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 158618  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  158617 gaacttcatcatcttaatcaactta 158593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 70804 - 70861
Alignment:
Q  161 acttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  70804 acttaacaactcatagatgataattcatcaacaacgacttagactcgacaaatgcgac 70861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 162
Target Start/End: Original strand, 70808 - 70838
Alignment:
Q  132 aacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70808 aacaactcatagatgataattcatcaacaac 70838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 270 - 486
Target Start/End: Original strand, 20707 - 20924
Alignment:
Q  270 agggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgca 368  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||    
T  20707 agggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattt-gagctaaagctccaacgtggtgagtaca 20805  T
Q  369 aagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatt 467  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20806 aagctccaaggcatcaatcccccaacaatgaaatcctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatt 20905  T
Q  468 tggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20906 tggaacatcaacatcttca 20924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 323
Target Start/End: Original strand, 10072 - 10168
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10072 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaag 10168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3509 - 3249
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3509 tatgcaacttagacctcttatatgaatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcatcgctaca--agt-ttaatatacttccagggcatcaagccccc 3413  T
Q  329 atcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaa 427  Q
    |||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3412 atcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 3315  T
Q  428 acaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314 acatcttagaacaacaacctcttatat-aatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 3249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14828 - 14686
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14828 acatcgtaaaatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 14729  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14728 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 14686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 356 - 494
Target Start/End: Original strand, 39361 - 39499
Alignment:
Q  356 cgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatat 454  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  39361 cgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattggacaacctcttata- 39458  T
Q  455 taatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  39459 taatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaactta 39499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 323
Target Start/End: Original strand, 37105 - 37200
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37105 actatgaaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagtattaatatacttccagggcatcaag 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 190116 - 189976
Alignment:
Q  78 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  190116 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggaagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 190017  T
Q  178 tgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  190016 ttataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 189976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 275
Target Start/End: Original strand, 225209 - 225284
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  225209 ttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatatggtaccaatccagggca 225284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 225335 - 225393
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  225335 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 225393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5054 - 5021
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5054 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtg 5021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25286 - 25245
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25286 cgacaatgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaat 25245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12791 - 12581
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  12791 acaacttaacaactcatggatgataatacatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgac-aatgcaacttcaac 12693  T
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||| | |  |||||||    
T  12692 tcgattattcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtcccaatcgctatttgaatattattatactttcggagcatcaag 12593  T
Q  324 tccccatcgcta 335  Q
     ||| |||||||    
T  12592 ccccaatcgcta 12581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12512 - 12410
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| |||||| |||||||    
T  12512 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatgtactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggtacatcat 12414  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  12413 catc 12410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12793 - 12754
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12793 caacaacttaacaactcatggatgataatacatcaacaac 12754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12829 - 12790
Alignment:
Q  98 acttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12829 acttcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaac 12790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Original strand, 27634 - 27899
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27634 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta--taagtattaatatacttccagggcatcaag-c 27730  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  27731 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttct 27828  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa--catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||   | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  27829 taaacatcttagaacaacaacctcttata-taatccaataatttggaaaccatcatcatcttcataaactta 27899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 349 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1292 - 1147
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctc 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1292 gctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctc 1193  T
Q  449 ttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1192 ttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaactta 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 11354 - 11502
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11354 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaagacatgggtagaagacaactcgacaactcgtagatgataattcatcaacaacttaacaa 11453  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  11454 ctcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcaacaaatgcgac 11502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36711 - 36563
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36711 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 36612  T
Q  170 ctcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36611 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 36563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1145 - 1059
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa 211  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1145 acaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgactcggcaa 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 1108
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1147 caacaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaac 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 74036 - 73893
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74036 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacttaggtagaagacaactcgacaactcttagatgataattcatcaacaactgaacaactcat 73937  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  73936 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 73893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 30043 - 30128
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30043 ctttgactcaacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 30128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 479
Target Start/End: Original strand, 30235 - 30343
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgattt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||  |||||||| |  |  | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  30235 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggacttgacgtctt--acaacttagaaacatcgacctcttatataaatccaataattt 30332  T
Q  469 ggaacatcatc 479  Q
    |||||| ||||    
T  30333 ggaacaacatc 30343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2988 - 2947
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2988 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 2947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 90
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  234 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactca 135  T
Q  174 tggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  134 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgcgac 90  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 33318 - 33055
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||      
T  33318 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccccatcggtata--agtattaatatacttccagggcatcaagct 33221  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |  |||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  33220 cttatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctct 33124  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||   | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33123 taaacatcttagaacaacaacctcttatat-aatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 33055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Original strand, 45687 - 45950
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||      
T  45687 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccccatcggtata--agtattaatatacttccagggcatcaagct 45784  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |  |||||||   ||||  ||| |||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  45785 cttatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctct 45881  T
Q  425 taaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||   | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882 taaacatcttagaacaacaacctcttatat-aatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 45950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17690 - 17428
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17690 gactatgcaacttagacctcttctatgcatgtggtaccaatccagggaatcaagccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagccc 17593  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
      |||||||   ||||  ||  |||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  17592 gtatcgcta---ttgagctatagctccatcgtgttgagcacaaggctctagggcattaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcaacctctt 17496  T
Q  426 aaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||  |||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17495 aaacattttagaacgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 17428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Original strand, 15955 - 16135
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15955 cagggcatcaagcccccatcgcta--tttgaactaaagctccatcgttttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 16052  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16053 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgaaaacctcttata-taatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaactta 16135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 296
Target Start/End: Original strand, 15914 - 15983
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15914 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttga 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20933 - 20778
Alignment:
Q  67 acgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttcttt--aacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatc--aacaac 162  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  20933 acgtcataaacatcatataatcttcataggtacttctttttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaaaaaaac 20834  T
Q  163 ttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20833 ttaacaactcatggatgataattcatcaacaacaactttgactcgacaaatgcgac 20778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 284
Target Start/End: Original strand, 17234 - 17309
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  | |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17234 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 17309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 7)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 66240 - 66098
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  66240 acatcgtataatcttcgtagctacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 66141  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  66140 gatgataattcataaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 66098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 62324 - 62182
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62324 acatcgtataatcttcgtagctacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatgtatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 62225  T
Q  176 gatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  62224 gatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaaatgcgac 62182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 79925 - 80074
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaaca 168  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  79925 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaataacacataggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaaca 80024  T
Q  169 actcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||    
T  80025 acttatggatgataattcatcaacaacgaccttgacttgacatatgcgac 80074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 11070 - 11205
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11070 ttgactcgacaaatgcgactcaaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaagccccaatcgctatttgagt 11169  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgct 334  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  11170 attattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 428
Target Start/End: Original strand, 12578 - 12714
Alignment:
Q  290 tatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccc 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | | ||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  12578 tatttgagtattagtatacttccagagcgt-aagcccccatcactaattt-gagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 12674  T
Q  390 ccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  12675 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 12714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 10482 - 10523
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10482 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Original strand, 11187 - 11289
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||    
T  11187 gcatcaagccccaatcgctgaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacattat 11285  T
Q  479 catc 482  Q
    ||||    
T  11286 catc 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 312 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6404 - 6223
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6404 cagggcatcaagcccccatcgcta-ttttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagcttcagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgca 6306  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305 tagactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttata-taatccaaaaatttggaacatcatcatcttcatcaactta 6223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6445 - 6389
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6445 actattcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 69547 - 69749
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  69547 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 69645  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  69646 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctct 69743  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  69744 taaaca 69749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 332048 - 332163
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatat---gcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatat 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||    
T  332048 aatgcgacttcaacttgactatgcaacctaaacctcttaaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-aatttgagcattaatat 332146  T
Q  307 acttccaggacatcaag 323  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  332147 actcccagggcatcaag 332163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5816 - 5673
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5816 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 5717  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  5716 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 5673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 11811 - 11954
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11811 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11910  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  11911 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33403 - 33260
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33403 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 33304  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  33303 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 33260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 68018 - 67875
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  68018 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 67919  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  67918 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 67875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19757 - 19617
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||| |||     
T  19757 aacatcatataatcttcacaagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaaattag 19658  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  19657 caactcatggatgacaactcattaacaacgactttaactcg 19617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 9235 - 9384
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataat-cttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaaca 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9235 tcataaacatcgtataattcttcataggtacttctttaacaacacttaggtataagacagctcgacaattcttggatgataattcatcaacaacttaaca 9334  T
Q  169 actcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9335 actcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 9384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 8117 - 8256
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaac 167  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||  |||| || ||||||||||||||||    
T  8117 acatcatataatcttcataagcactccataaacaacacatgggtagaagacaactcaacgacttaacgactcatgaatgacaactcatcaacaacttaac 8216  T
Q  168 aactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  8217 aactcatggatgacaactcatcaacaacgacttagactcg 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 8282 - 8315
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8282 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 8315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 59436 - 59293
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaa-ctcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcat 174  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  59436 acatcgtataatcatcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 59337  T
Q  175 ggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  59336 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgcgac 59293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 136577 - 136699
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  136577 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 136674  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  136675 gaacttcatcatcttaatcaactta 136699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 139046 - 139168
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  139046 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 139143  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  139144 gaacttcatcatcttaatcaactta 139168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 141515 - 141637
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  141515 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 141612  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  141613 gaacttcatcatcttaatcaactta 141637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 143984 - 144106
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  143984 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 144081  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  144082 gaacttcatcatcttaatcaactta 144106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 491
Target Start/End: Original strand, 134108 - 134227
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  134108 gctccacggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttg 134205  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaac 491  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  134206 gaacttcatcatcttaatcaac 134227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 488
Target Start/End: Original strand, 132545 - 132677
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | |||| ||||||||||  | ||| | ||||    
T  132545 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatctt-aacaacttaaaacaacatcatctt 132641  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatc 488  Q
    |||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  132642 ata--agtccaataatttggaacatcatcatcatcatc 132677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 132462 - 132503
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132462 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 132503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 9)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 223 - 392
Target Start/End: Original strand, 116665 - 116835
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  116665 actcgacaatgcaacttcgacttcttaatcatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat 116764  T
Q  320 caagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  116765 caagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagccccca 116835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 32252 - 32338
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32252 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacatagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 32338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 116923 - 117044
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgca 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||  ||  |||  |||||||||| ||||| ||    
T  116923 cagggcatcaagccccatcgctatttaagtattaatatacttccagggcaacaagcccctatcgctaatt--gagctaaaactccaacgtgttgagtaca 117020  T
Q  369 aagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  117021 aagctccagggcatcaagccccca 117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 390
Target Start/End: Original strand, 116818 - 116938
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgc 367  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  116818 cagggcatcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaa--ttgagctaaagctccaacgtgttgagtac 116915  T
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccc 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  116916 aaagcttcagggcatcaagcccc 116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 395
Target Start/End: Original strand, 117025 - 117108
Alignment:
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  117025 tccagggcatcaagcccccatcgctaatt--gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaaca 117108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 32437 - 32477
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32437 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 32477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 116562 - 116625
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116562 aacatcatataatcttcaaaaacacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 116617 - 116669
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  116617 tcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 116669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 484
Target Start/End: Original strand, 32510 - 32550
Alignment:
Q  444 acctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32510 acctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatctt 32550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 6)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7274
Alignment:
Q  41 taaacaacatcataagtaacttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactc--------a 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        |    
T  7112 taaacaacaacataagcaacttaataacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacaggggtagcagacaactcaacaactta 7211  T
Q  133 acaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7212 acaactcatagatgacaattcatcaacaacttgacaactcatggatgacaattcatcaacaac 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 394
Target Start/End: Original strand, 7342 - 7482
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgc 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||    
T  7342 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaacgtattt-agtattaatttacttccagggcatcaagcccccatcgctaatt--gagctaaagc 7438  T
Q  351 tccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac 394  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7439 tccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 5393 - 5449
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5393 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 5449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 395
Target Start/End: Original strand, 7486 - 7585
Alignment:
Q  293 ttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||  |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7486 ttgagtattaatatacttccagggcatcaag-ccccatcgataatt--gagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagccccca 7582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Original strand, 7245 - 7316
Alignment:
Q  133 acaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7245 acaactcatggatgacaattcatcaacaacttaac---tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 5547 - 5587
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5547 gctccagggcatcaagcccccaacaatggatgctaatgcat 5587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9327 - 9125
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  9327 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttaattgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 9229  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  |||    
T  9228 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttct 9131  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  9130 taaaca 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1654 - 1568
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1654 ctttgactcgacaaatgcaactctaacttgactatgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagcccc 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1541 - 1436
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa 472  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  1541 ccagggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgta-taatccaataatttggaa 1443  T
Q  473 catcatc 479  Q
    | |||||    
T  1442 cttcatc 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3478 - 3285
Alignment:
Q  303 atatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-t 401  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3478 atatacttctagggcatcaagcccccatcgcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaat 3381  T
Q  402 gctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa----catcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  3380 gctaatgcatggactcgacctcttaaatatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactta 3285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 10380 - 10491
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10380 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 10479  T
Q  298 tattaatatact 309  Q
    ||||||||||||    
T  10480 tattaatatact 10491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 475
Target Start/End: Original strand, 10672 - 10767
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacat 475  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||||||    
T  10672 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctttta-aatagtccaataatttggaacat 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 8849 - 8960
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  8849 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 8948  T
Q  298 tattaatatact 309  Q
    ||||||||||||    
T  8949 tattaatatact 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 476
Target Start/End: Original strand, 9141 - 9237
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatc 476  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||    
T  9141 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctttta-aatagtccaataatttggaacatc 9237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 7)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 312 - 490
Target Start/End: Original strand, 32783 - 32960
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32783 cagggcatcaagcccccatctcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 32880  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaa 490  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32881 tggactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaa 32960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 349 - 494
Target Start/End: Original strand, 38637 - 38783
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacct 447  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38637 gctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagaactcttaaacatcttaattcgacaacct 38736  T
Q  448 cttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38737 cttata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 38783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 454
Target Start/End: Original strand, 32317 - 32458
Alignment:
Q  312 caggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgca 410  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||  |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32317 cagggcatcaagcccccatctcta--tttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 32414  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatat 454  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32415 tggactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatat 32458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 9645 - 9768
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgc-taatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  9645 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaaaaataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcctata-taatccaataatttg 9743  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    | || |||||||||| |||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaactta 9768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Original strand, 32276 - 32346
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32276 actatgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagggcatcaagcccccatctctatttgag 32346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Original strand, 32742 - 32812
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32742 actatgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagggcatcaagcccccatctctatttgag 32812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 38561 - 38617
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38561 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 38617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 430
Target Start/End: Original strand, 19735 - 19935
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||    
T  19735 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-gagccc 19833  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||||||||  ||||  ||| |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  19834 ccatcgctaa--ttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaaactccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctctt 19930  T
Q  426 aaaca 430  Q
    |||||    
T  19931 aaaca 19935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 329
Target Start/End: Original strand, 38162 - 38281
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |  || || ||||||||||||    
T  38162 aatgcgtcttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccagtccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatata 38259  T
Q  308 cttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  38260 cttccagggcatcaagccccca 38281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Original strand, 38297 - 38328
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38297 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 38328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 494
Target Start/End: Original strand, 39736 - 39880
Alignment:
Q  351 tccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctct 449  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39736 tccatcgtgttgagtacaaagctccagggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaaacttaattcgacaacctct 39835  T
Q  450 tatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39836 tata-taatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaactta 39880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 317 - 494
Target Start/End: Original strand, 25742 - 25918
Alignment:
Q  317 catcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtc 415  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||  ||| |||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  25742 catcaagcccccatcgtta--tttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggac 25839  T
Q  416 tcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25840 tcgacctcttatacatcttaattcgacaacctcttata-taatccaataatttggaaacatcattatcttcatcaactta 25918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 25696 - 25752
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25696 actatgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccc 25752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 161509 - 161396
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  161509 ctttgactcgacaaatgcgattccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttga 161410  T
Q  297 gtattaatatactt 310  Q
    ||||||||||||||    
T  161409 gtattaatatactt 161396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 161355 - 161233
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| || |||||||| | |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  161355 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgttaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttga 161257  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||| | |||||||    
T  161256 aacttcatcatcttaaccaactta 161233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 312
Target Start/End: Original strand, 11165 - 11279
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  11165 tttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacgtagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagcccccatcgctatttgag 11264  T
Q  298 tattaatatacttcc 312  Q
    ||||| |||||||||    
T  11265 tattattatacttcc 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 486
Target Start/End: Original strand, 11391 - 11478
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11391 aatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttca 11478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16042 - 15841
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  16042 cgactatgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaattcagggcataagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 15945  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||| | || || ||||    
T  15944 cccatcgctaa-tttgagttaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccgcaacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctct 15847  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  15846 taaaca 15841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10882 - 10683
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  10882 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 10784  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||||   ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||||    
T  10783 cccat---taa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcat-gagcccccaacaaatgtatcctaatgcatggactcgatctct 10689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 193341 - 193086
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  193341 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcccccaacattatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcc 193243  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| | || |    
T  193242 cccatcgttaa-tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactctaactgt 193145  T
Q  425 taaa-caacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
    |||| || ||||||   |  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  193144 taaagcatcttaat--catcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatctt 193086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 422
Target Start/End: Original strand, 10055 - 10247
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10055 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 10154  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaa-gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacct 422  Q
    ||||| |||   |||   ||| |||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  10155 ccatcacta---ttgtgctaaagctccatcgtgttga--gcaaaggctccagggcatcaaggcccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 35282 - 35083
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  35282 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatgagcccccattgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 35184  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||  |||||  |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  35183 cccatcgtta--tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 35087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24464 - 24403
Alignment:
Q  250 tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatactt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24464 tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt 24403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16713 - 16513
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  16713 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 16615  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  16614 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gatcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 16517  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  16516 taaa 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 420
Target Start/End: Original strand, 20885 - 20957
Alignment:
Q  349 gctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgac 420  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  20885 gctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaaggccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac 20957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39077 - 38966
Alignment:
Q  199 tttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgag 297  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39077 tttgacttgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaagcatcaagcccccatcgctatttgag 38978  T
Q  298 tattaatatact 309  Q
    ||||||||||||    
T  38977 tattaatatact 38966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 51375 - 51300
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagat 145  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51375 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagat 51300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38895 - 38801
Alignment:
Q  399 aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38895 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttata-taatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaactta 38801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4549 - 4443
Alignment:
Q  112 acatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa 211  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  4549 acataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaa 4450  T
Q  212 atgcgac 218  Q
    |||||||    
T  4449 atgcgac 4443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 36208 - 36409
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  36208 cgactatgcaagttagacctcttatatgcatgtggtactaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcc 36306  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||  |||||  ||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||    
T  36307 cccatcgcta--tttgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaacctct 36403  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  36404 taaaca 36409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Original strand, 500820 - 500958
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||    
T  500820 ctttgactcgacaagtgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagtctcaatcactatttga 500919  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  500920 gtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 500958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 482
Target Start/End: Original strand, 160570 - 160697
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  160570 ccaacgtggtgag--caaggctcaagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacgcaacctctt-aacaacttaaagcaacaacctctta 160666  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
     || | |||||| |||||| |||||||||||    
T  160667 aataattccaataatttgggacatcatcatc 160697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 85845 - 85723
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  85845 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttata-taatccaataatttgg 85747  T
Q  471 aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||    
T  85746 aacttcatcatcttaatcatctta 85723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 160434 - 160485
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  160434 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaa 160485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 204642 - 204724
Alignment:
Q  232 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccagg 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  204642 tgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccgtc-gttgttgagtattaatatacttccagg 204724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 480
Target Start/End: Original strand, 501001 - 501083
Alignment:
Q  397 tgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatca 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  501001 tgaatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacataatca 501083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 85885 - 85820
Alignment:
Q  269 cagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgct 334  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  85885 cagggcatcaagcccctatcgctatttgagcattaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 85820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 85915 - 85862
Alignment:
Q  281 ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  85915 ccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgcta 85862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7979
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  8180 cgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtacc-atttagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 8083  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    |||||| |||| |||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| ||||    
T  8082 cccatcactaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatggactcgatctct 7985  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  7984 taaaca 7979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  126 actatgcaacttagacctcttatatacatgtggtactaatacagggcatgaagaccccatcgctatttgagttttaatatacttccagggcatcaagccc 27  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctc 352  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  26 ccatcgctaattttgagctaatgctc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 17989 - 18191
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  17989 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcaataattgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 18087  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||    
T  18088 cccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttcagtactaagctccagggtat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacttct 18185  T
Q  425 taaaca 430  Q
    ||||||    
T  18186 taaaca 18191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 77483 - 77448
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  77483 atgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 77448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 4110 - 4233
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4110 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 4208  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  4209 gaacttcatcatcttaatcaactta 4233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 1876 - 1926
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1876 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1310
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || || |    
T  1440 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaa 1343  T
Q  297 gtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1342 gtattaatatacttccagggcatcaagccccca 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1274 - 1133
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctct 449  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | |||||||||    
T  1274 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctct 1178  T
Q  450 tatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1177 taaatatatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 1133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Original strand, 29251 - 29382
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||              
T  29251 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggataataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg---------- 29340  T
Q  225 tcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29341 -cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 29382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Original strand, 29248 - 29288
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29248 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 29288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 29222 - 29256
Alignment:
Q  104 ttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29222 ttaacaacacatggatagaagacaactcaacaact 29256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1352
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  1488 ttgactcgacaaatgtgactccaactcgattatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaaacccctatcgctatttgagt 1389  T
Q  299 attaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  1388 attattatacttccagagcatcaagccccaatcgcta 1352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 379 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 1283 - 1176
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1283 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 1184  T
Q  479 catcttca 486  Q
    ||||||||    
T  1183 catcttca 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10487 - 10395
Alignment:
Q  70 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10487 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcacagatgataattcatcaacaac 10395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10424 - 10334
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10424 acaactcacagatgataattcatcaacaacgactttgactcatcaaatgcgaca-----------atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatca 10336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 310 - 494
Target Start/End: Original strand, 4350 - 4530
Alignment:
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatg 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4350 tccagggcatcaagcccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatg 4445  T
Q  409 catagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4446 catggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgta-taatccaataatttggaacataatcattttcatcaactta 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 310 - 494
Target Start/End: Original strand, 11932 - 12112
Alignment:
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatg 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11932 tccagggcatcaagcccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatg 12027  T
Q  409 catagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12028 catggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgta-taatccaataatttggaacataatcattttcatcaactta 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 310 - 494
Target Start/End: Original strand, 21884 - 22064
Alignment:
Q  310 tccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatg 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21884 tccagggcatcaagcccccatcgcta---ttgagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatg 21979  T
Q  409 catagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21980 catggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgta-taatccaataatttggaacataatcattttcatcaactta 22064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 21843 - 21901
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21843 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 21901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18949 - 18907
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18949 cgacaatgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 18907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18819 - 18619
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  18819 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtgttaccatttcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 18721  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  18720 cccatcgttaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 18623  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  18622 taaa 18619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 3494 - 3694
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  3494 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcc 3592  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||    
T  3593 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccctaacatatgtatactaatgcatggactcgatctct 3690  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  3691 taaa 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 7925 - 8125
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  7925 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcc 8023  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||    
T  8024 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccctaacatatgtatactaatgcatggactcgatctct 8121  T
Q  425 taaa 428  Q
    ||||    
T  8122 taaa 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 484
Target Start/End: Original strand, 29836 - 29940
Alignment:
Q  379 gcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcat 478  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||| ||||    
T  29836 gcatcaagccccaatcgctgaatgctaatgcatggaatcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta-aatagtccaataatttggaacttcat 29934  T
Q  479 catctt 484  Q
    ||||||    
T  29935 catctt 29940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 335
Target Start/End: Original strand, 29726 - 29811
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgcta 335  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  29726 atgcatgtggtaccaatacggagcatcaagcccctatcggtatttgagtattattacacttccagagcatcaagccccaatcgcta 29811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 11769 - 11855
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11769 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 11960 - 12083
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11960 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 12058  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  12059 gaacttcatcatcttaatcaactta 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 428
Target Start/End: Original strand, 10244 - 10447
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10244 actcgactatgcgacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aa 10342  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacc 421  Q
    | |||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |    
T  10343 gcccccatcgttaa-tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctcaagggcat-gagcacccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc 10440  T
Q  422 tcttaaa 428  Q
    |||||||    
T  10441 tcttaaa 10447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 281260 - 281077
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  281260 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 281162  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  281161 cccatcg-ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 281077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14505 - 14395
Alignment:
Q  215 cgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  14505 cgacttcaacttgactatgcaacctacacctattaatcatgcatgtggtaccaatgcagggcatcaagccctcaact-tatttgagtattaatatacttt 14407  T
Q  312 caggacatcaag 323  Q
    |||| |||||||    
T  14406 cagggcatcaag 14395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 1 - 82
Alignment:
Q  195 cgactttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 cgactttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 82  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3690 - 3596
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  3690 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta--taagtattaatatacttccaaggcatcaag 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Original strand, 20425 - 20529
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20425 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaatacagggcatcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccc 20524  T
Q  327 ccatc 331  Q
    |||||    
T  20525 ccatc 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 392
Target Start/End: Original strand, 20553 - 20590
Alignment:
Q  355 acgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagccccca 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20553 acgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagccccca 20590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 14416 - 14615
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||||||  || ||| |    
T  14416 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcc 14513  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  14514 cccttcgctaa-tttgagctaatgctacatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 14611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 38856 - 39055
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||||||  || ||| |    
T  38856 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggtat-aagcc 38953  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  38954 cccttcgctaa-tttgagctaatgctgcatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 39051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 23432 - 23631
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||||||  || ||| |    
T  23432 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgtta-ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcc 23529  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||   || ||| || |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  23530 cccatcgataa-tttgagaaaaagctacatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctct 23627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5072 - 4971
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacat 319  Q
    |||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5072 actcgactatgcaactta-acttcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatatacttccagggcat 4975  T
Q  320 caag 323  Q
    ||||    
T  4974 caag 4971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Original strand, 5852 - 6047
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  5852 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacataagcccccaacgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagctcccat 5950  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    |||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5951 cgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52380 - 52294
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52380 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 52294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53950 - 53865
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53950 actttgactcgacaa-tgcgacttcaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccc 53865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 53784 - 53726
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  53784 ccaacgtggtgag--caaaggctctagggcatcaagcccccaacaatgaatgtgaatgcat 53726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 7)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 32199 - 32396
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  32199 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 32297  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| |||   | ||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||| ||||    
T  32298 cccatcgttaa-tttgagctaatgctccatcgtgttga---ctaagcttcagggcat-gagcccccaacatatgtatgataatgcatggactcgatctct 32392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20154 - 20014
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20154 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacgacacgtggatagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 20055  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||    
T  20054 caactcatggatgacaactcatcaacaatgactttcactcg 20014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 7050 - 7100
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactca 132  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7050 tataatcttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactca 7100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 14169 - 14219
Alignment:
Q  82 tataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactca 132  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14169 tataatcttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactca 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 211
Target Start/End: Original strand, 7093 - 7138
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa 211  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7093 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggcaa 7138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 211
Target Start/End: Original strand, 14212 - 14257
Alignment:
Q  166 acaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa 211  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14212 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcggcaa 14257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19988 - 19955
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19988 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 19955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 752 - 836
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  752 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagaactcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagc 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 476
Target Start/End: Original strand, 919 - 1041
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  | | |||||| ||  || ||||||||||    
T  919 ccaacgtggtgag--caaaggctccagagcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaac-tcaacaacatagatcaacaacctctt 1015  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatc 476  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||    
T  1016 atataagtccaataatttggaacatc 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8462 - 8378
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8462 actttgactcgacaaatgcgactccaactcaactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagc 8378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8295 - 8173
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | | |   | |||||||||  || ||||||||||    
T  8295 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaatcccccaacaatgaatgctaatgcatggacac-aacaagtcaacaacttagatcaacaacctctt 8199  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatc 476  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  8198 atataaatccaataatttggaacatc 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 20644 - 20766
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20644 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 20741  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20742 gaacttcatcatcttaatcaactta 20766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22169 - 21968
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  22169 cgactatgcaacttagacctcgtatatgcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 22071  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| | |||    
T  22070 cccatcg-ttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctc 21973  T
Q  424 ttaaa 428  Q
    |||||    
T  21972 ttaaa 21968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30061 - 29860
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  30061 cgactatgcaacttagacctcgtatatgcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagcc 29963  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatg-aatgctaatgcatagtctcgacctc 423  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| | |||    
T  29962 cccatcg-ttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctc 29865  T
Q  424 ttaaa 428  Q
    |||||    
T  29864 ttaaa 29860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44929 - 44806
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  44929 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaatcgacaacctcttata-taatccaatactttg 44831  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  44830 gaacttcatcatcttaatcaactta 44806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47121 - 47042
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatc 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47121 ctttgactcgacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatc 47042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 40297 - 40419
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40297 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 40394  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  40395 gaacttcatcatcttaatcaactta 40419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 12693 - 12735
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12693 cgacaatgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 12735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 18977 - 19019
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18977 cgacaatgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 19019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 6308 - 6394
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6308 ctttgactagacaaatgcgactccaacttgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 6394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 6499 - 6540
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6499 gctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 6540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1292
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||    
T  1093 gactatgcaacttagacctcttttatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcat-atgccc 1191  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||  |||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  ||||    
T  1192 ccatcgctaa-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagaacat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatatctt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Original strand, 15412 - 15521
Alignment:
Q  200 ttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagt 298  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  15412 ttgactcgacaaatgcgactctaactagaatatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggtatcaagccccaatcgctatttgagt 15511  T
Q  299 attaatatac 308  Q
    |||| |||||    
T  15512 attattatac 15521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 15563 - 15683
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  15563 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgctaatccatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttgga 15660  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  15661 acttcatcatcttaatcaactta 15683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 430
Target Start/End: Original strand, 23599 - 23798
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |   |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||    
T  23599 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcggggcatgagctcccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagccc 23697  T
Q  327 ccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctctt 425  Q
    ||||| |||   ||||  ||| |||| | |||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  23698 ccatcacta---ttgagctaaagctctatcgtgttgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctctt 23793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 324
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1244
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatc-aagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1147 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagt 1244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 1634 - 1833
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||  ||    
T  1634 actatgcaacttagaccccttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-gagctcc 1732  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctctta 426  Q
    ||||| || ||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||    
T  1733 catcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctctta 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 356 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 75451 - 75313
Alignment:
Q  356 cgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatat 454  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  75451 cgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattggacaacctcttata- 75354  T
Q  455 taatccaatgatttgg-aacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  75353 taatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaactta 75313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 77707 - 77612
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  77707 actatgaaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgcta-ttgagtattaatatacttccagggcatcaag 77612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14057 - 13917
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact--------catagatgataattcatcaacaacttaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14057 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagataactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 13958  T
Q  167 caactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  13957 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 13917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13891 - 13858
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13891 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 13858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5170 - 4971
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  5170 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggtatgagcccccatcatta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 5073  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcatagtctcgacctct 424  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| | || ||||| | |||||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| | ||||| ||||    
T  5072 cccatcgctaa-tttgagctaatgctccatcatgttgagtactaagctttagggcat-aagcccccaacatatctatgctattgcatggactcgatctct 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 211
Target Start/End: Original strand, 10656 - 10742
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaa 211  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10656 acaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgactcggcaa 10742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 10609 - 10657
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaac 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10609 ttcataagtacttcattaacaacacatggatagaacacaactcaacaac 10657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Original strand, 10654 - 10693
Alignment:
Q  156 caacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10654 caacaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaac 10693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Original strand, 116328 - 116449
Alignment:
Q  374 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatcc-aatgatttgga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||    
T  116328 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaaatactttgga 116426  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  116427 acttcatcatcttaatcaactta 116449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 44322 - 44405
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44322 actttgactcgacaa-tgcgacttcgacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagc 44405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 78043 - 78126
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  78043 actttgactcgacaa-tgcgacttcgacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagc 78126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 74123 - 73947
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  ||||   ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||     
T  74123 atgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattatt---gtattaatatacttttagggcat-aagcccccaa 74028  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||   ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  74027 caattattttgagcaaatgctccatcgtggttagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 73947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 129323 - 129209
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  129323 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttatacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatata 129225  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  129224 cttccagggcatcaag 129209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 78208 - 78257
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78208 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 78257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 116188 - 116252
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat-atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  116188 caacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 116252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 13289 - 13411
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13289 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 13386  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  13387 gaacttcatcatcttaatcaactta 13411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 37718 - 37840
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37718 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 37815  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  37816 gaacttcatcatcttaatcaactta 37840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 393
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2193
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  2030 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacaaatacagggcatgagcccccaacttta-ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcc 2127  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaa 393  Q
    ||||||  ||| |||||  |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||    
T  2128 cccatctttaa-tttgagctaatgctccatcgtggtgagtagtaagctccagggtat-aagcccccaa 2193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 430
Target Start/End: Original strand, 178657 - 178853
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||| ||| ||| |||||    
T  178657 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctaattgagtgttaatataccgccagggcat-aagccccca 178755  T
Q  330 tcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaa 428  Q
    ||||||   ||||  ||| |||||| | || | ||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  178756 tcgcta---ttgagctaaagctccatcatgttaagtacaaagctccagggtat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 178851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16017 - 15876
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctct 449  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||| |||  |||| |  | |||||||||    
T  16017 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaaacccccaacaatgaatgctaatgcatagacacaacaactt-aacttcttataagcaacaacctct 15921  T
Q  450 tatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15920 taaatatatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 15876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5020 - 4913
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc-atctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5020 gactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcataaagcccccattgctata--agtattaatatacttccaggccatcaagcc 4923  T
Q  326 cccatcgcta 335  Q
    ||||||||||    
T  4922 cccatcgcta 4913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48810 - 48662
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  48810 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcc 48712  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctcca 376  Q
    ||||||  | |||||||  ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  48711 cccatc-tttattttgagctaaagctccattgtggtgagtacaaagctcca 48662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 281
Target Start/End: Original strand, 19011 - 19064
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19011 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagc 19064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 19166 - 19206
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19166 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 482
Target Start/End: Original strand, 19236 - 19277
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19236 acaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatcatc 19277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 396
Target Start/End: Original strand, 2582 - 2752
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  |    
T  2582 actcgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcat-ga 2680  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    | |||||||  | |||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  2681 gcccccatc-attattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcaagggcat-gagcccccaacaa 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 396
Target Start/End: Original strand, 6248 - 6418
Alignment:
Q  223 actcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||||  |||||||||||||| |||| |||  |    
T  6248 actcgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttttgtattaatatactttcagggcat-ga 6346  T
Q  323 gtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 396  Q
    | |||||||  | |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6347 gcccccatc-attattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 6418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 13844 - 13966
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13844 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcgt-aatatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttg 13941  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  13942 gaacttcatcatcttaatcaactta 13966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Original strand, 10281 - 10364
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10281 actttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttaagcctcttacatgcatgtggtaccaatctagggcatcaag 10364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 407
Target Start/End: Original strand, 10426 - 10465
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaat 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10426 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 491
Target Start/End: Original strand, 4276 - 4536
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaag-ccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  |||   |||||||||||||||||||| ||| |||     
T  4276 cgactatgcaacttagacctcttat--gcatgtggtaccaatctggggcatcaattccccatcgttata--agtattaatatacttccagggcat-aagc 4370  T
Q  325 ccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtg--caaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagtctcgac 420  Q
    || |||||| |   ||||  ||| |||||| |||| ||||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  4371 cctcatcgcaa---ttgagctaaagctccatcgtgttgagcaaacaaaggctccggggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaac 4467  T
Q  421 ctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaac 491  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4468 ctcttaaacatcttaaa-caacaacctcgtatat-aatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaac 4536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 9)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15627 - 15545
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15627 acaactaaacaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttaactcg 15545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15752 - 15689
Alignment:
Q  132 aacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15752 aacaactcacggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3013 - 2959
Alignment:
Q  229 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3013 ctatgcaacttatacctcttatatgcatgtggtagcaatccagggcatcaagccc 2959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15693 - 15623
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  15693 acaactaaacaactcatggatcacaattcatcaacaacttaacaactcatggacgacaattcatgaacaac 15623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15726 - 15656
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  15726 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaactaaacaactcatggatcacaattcatcaacaac 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2879 - 2821
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2879 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 2821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15660 - 15590
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15660 acaacttaacaactcatggacgacaattcatgaacaactaaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 15590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15792 - 15722
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  15792 acaacttaacgactcgtggatgacaattcatcaacaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaac 15722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15519 - 15487
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15519 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 801
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgactccaac 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  914 acaacttaacaactcatggatgacaattcctcaataacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaaagactttgactcggc-aatgcaacttcgac 816  T
Q  225 tcgactatgcaactt 239  Q
    | |||||||||||||    
T  815 ttgactatgcaactt 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 947 - 886
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattc 186  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  947 acaacttaacaactcatggatgacaactcgtctacaacttaacaactcatggatgacaattc 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 484
Target Start/End: Original strand, 6704 - 6833
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||   | |||||||||||    
T  6704 ccaacgtggtgag--caaggctccatggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacctctt-aacaacttagaacaacaacctctta 6800  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatctt 484  Q
     || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6801 aataagtccaataatttggaacatcatcatctt 6833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 6568 - 6623
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6568 actatgcaactgagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 6623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31868
Alignment:
Q  198 ctttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31928 ctttgactcgacaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgt 31868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24255 - 23987
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | || ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  24255 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaatgta-ttatgtattaatatacttccagggcatcaagccct 24157  T
Q  328 catcgctaattttgaattaatgctcc----------------aacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgca 410  Q
    || || |||  ||||  ||| |||||                ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24156 caacg-taa--ttgagctaaagctccaaggcatcaagcccccaacgtggtga--gcaaaggctccagggcatcaatcccccaacaatgaatgctaatgca 24062  T
Q  411 tagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    | | | | || |||| |||||||||   | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24061 tggacacaacatctt-aacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatcatcttca 23987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 46027 - 45900
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| |||||||||   | |||||||||||    
T  46027 ccaacgtggtgag--caaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatctt-aacaacttagaacaacaacctctta 45931  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatc 482  Q
     || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  45930 aataagtccaataatttggaacatcatcatc 45900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46163 - 46108
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46163 actatgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 46108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47085 - 46910
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||     
T  47085 atgcgacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccaac---attttagtattaatatactttcagggcat-aagccctcaa 46990  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  46989 c-attattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccctaacaaatgtatgctaatgcat 46910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 218
Target Start/End: Original strand, 28796 - 28859
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28796 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgac 28859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 28755 - 28804
Alignment:
Q  89 ttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28755 ttcataagtactttattaacaacacatagatagaagacaactcaacaact 28804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 28799 - 28836
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaac 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28799 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 28836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 633
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  715 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgagaactcatcaacaacgactttgactcg 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 678
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  718 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 6)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8271
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8186 actttgactcgacaa-tgcgactccaactcgactatgcaacttaaacctcttatatgcttgtggtaccaatgcatggcatgaagccc 8271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 1863 - 1920
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1863 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 6280 - 6337
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6280 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 8352 - 8410
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8352 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagccaccaacaatgaatgctaatgcat 8410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6476
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6436 gctccagggcatcaagcccgcaacaatgaatgctaatgcat 6476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 494
Target Start/End: Original strand, 6506 - 6557
Alignment:
Q  441 acaacctcttatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6506 acaacctcttata--agtccaataatttggaacatcatcatcatcatcaactta 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19356 - 19274
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  19356 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgattttgactcg 19274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19248 - 19216
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19248 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 19216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 329
Target Start/End: Original strand, 12512 - 12611
Alignment:
Q  229 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtcccc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12512 ctatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaatgta-ataagtattaatatacttccagggcatcaagccccc 12610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 494
Target Start/End: Original strand, 12647 - 12788
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaat-tcgacaacctct 449  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | |||||||||    
T  12647 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgataatgcatggacacaacaactt-aacttcttattaacaacaacctct 12743  T
Q  450 tatattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12744 tatataagtccaatcatttggaacatcatcataatcatcaactta 12788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 5349 - 5399
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5349 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcat 5399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 6544 - 6594
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6544 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcat 6594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 7311
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |   |||| |||||||||| |||| |||| ||| ||| |    
T  7491 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggaaccaatacagggcatgagcccccaac---attttagtattaataaactttcagggcat-aagcc 7396  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7395 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcgtggtgattacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 7311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21886 - 21705
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||| ||||||||||||||| || | ||| ||| |    
T  21886 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attttagtattaatatactttcaaggcat-aagcc 21791  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21790 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 21705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 494
Target Start/End: Original strand, 81978 - 82091
Alignment:
Q  380 catcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttggaa-catcat 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| | ||||    
T  81978 catcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataatttggaaccttcat 82075  T
Q  479 catcttcatcaactta 494  Q
    |||||| |||||||||    
T  82076 catcttaatcaactta 82091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22986
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23043 cgactatgcaacttagatctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 22986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22905 - 22774
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctta 451  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||| |||||||   | |||||||||||    
T  22905 ccaacgtggtgagc-caaggctcaagggcatcaagcccccaa-aatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctctta 22809  T
Q  452 tattaatccaatgatttggaacatcatcatcttca 486  Q
    ||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22808 tacaagtccaataatttggaacatcatcaccttca 22774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 118014 - 117942
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  118014 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 117942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 129655 - 129710
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  129655 actatgcaacttagacctcttatatgaatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 129710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 129791 - 129848
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  129791 ccaacgtggtgag--caaggctccagggcatcaagcctgcaacaatgaatgctaatgcat 129848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 419 - 452
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  419 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 6787 - 6820
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6787 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 6820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 106051 - 106165
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  106051 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttgagtattaatata 106149  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    |||||| | |||||||    
T  106150 cttccaaggcatcaag 106165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 494
Target Start/End: Original strand, 5 - 125
Alignment:
Q  372 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||    
T  5 ctccagagcatcaagcccccaacaaagaatgccaatacatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaa-ctcttgta-taatccaataattggga 102  T
Q  472 acatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  103 acttcatcatcttaatcaactta 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8474 - 8389
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8474 actttgactcgacaa-tgcaacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 8389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Original strand, 2417 - 2521
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggac 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2417 caacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gtatttaagtattaatatacttccagggc 2515  T
Q  318 atcaag 323  Q
    ||||||    
T  2516 atcaag 2521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 104019 - 103908
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatact 309  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || || ||||||||||||||    
T  104019 aatgcgacctcaacttgactatgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaac-gta-ttaagtattaatatact 103922  T
Q  310 tccaggacatcaag 323  Q
    |||||| |||||||    
T  103921 tccagggcatcaag 103908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 102361 - 102311
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  102361 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgact 102311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 102416 - 102353
Alignment:
Q  75 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  102416 aacatcatataatattcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagacaactcaacaact 102353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 284
Target Start/End: Original strand, 10911 - 10944
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10911 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccc 10944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15071 - 14971
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15071 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagccctcaatgta-ataagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 14973  T
Q  328 ca 329  Q
    ||    
T  14972 ca 14971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14916 - 14805
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  14916 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttatattcaacaacctcttaaatatatccaataatttg 14818  T
Q  470 gaacatcatcatc 482  Q
    |||||||||||||    
T  14817 gaacatcatcatc 14805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 1665 - 1705
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1665 cgacaatgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 1705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Original strand, 4190 - 4365
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| |||  |  |||||     
T  4190 atgcaacttagacctcttatatacatgtggtaccaattcagggcatgaacccccaac---attttagtattaatatactttcagggcatgca-cccccaa 4285  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||   |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4286 c-attattttgagcaaatgttccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 4365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14072 - 13998
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctctta--tatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14072 aatgcgacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 13998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6618 - 6544
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6618 aatgcaacttcaacttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 6544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6445 - 6414
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6445 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 6414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13899 - 13868
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13899 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 13868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1068
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1018 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 26 - 108
Alignment:
Q  125 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  26 acaacttaaccactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatgaacaacgacattgactcg 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 271 - 356
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  271 actttgactcgacaa-tgcgacttcgacatgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcttcaagccc 356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2433 - 2265
Alignment:
Q  234 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |      
T  2433 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccct---tat---agtattaatatactttcagggcat-aagcccccaac-a 2343  T
Q  334 taattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2342 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 2265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 10762 - 10645
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatt 467  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | | || |||| |||||||||   | |||||||||||||| | |||||| |||    
T  10762 aaagctccaaggcatcaagcccccaacgatgaatgcaaatgcatggacacaacatctt-aacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatt 10664  T
Q  468 tggaacatcatcatcttca 486  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  10663 tggaacatcaccatcttca 10645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12373
Alignment:
Q  221 caactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12311 caacttgactatgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 12373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 12472 - 12512
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  12472 gctccagggcatcaagcccccaacgataaatgcgaatgcat 12512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 379
Target Start/End: Original strand, 14849 - 14992
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  14849 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---aatttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 14944  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccaggg 379  Q
    |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14945 c-attattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccaggg 14992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1774
Alignment:
Q  197 actttgactcggcaaatgcgactccaactcgactatgcaa---------cttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1681 actttgactcgacaaatgcgactccaattcgactatgcaacttagacctcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagc 1774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 407
Target Start/End: Original strand, 971 - 1024
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaat 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  971 ccaacgtggtgag--caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaat 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1545
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  1431 aatgtgacttcaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatata 1529  T
Q  308 cttccaggacatcaag 323  Q
    || ||||| |||||||    
T  1530 ctcccagggcatcaag 1545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16451 - 16379
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16451 aatgcgactttaacttgactacgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 16379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16320 - 16209
Alignment:
Q  368 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  | | |||| |||| |  | || ||||||||||| |||||||| ||    
T  16320 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaac-tcaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataat 16222  T
Q  467 ttggaacatcatc 479  Q
    |||||||||||||    
T  16221 ttggaacatcatc 16209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6633
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  6510 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttg 6608  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  6609 gaacatcatcatcttaatcaactta 6633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 13890 - 14013
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaatgatttg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  13890 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttg 13988  T
Q  470 gaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  13989 gaacatcatcatcttaatcaactta 14013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 6354 - 6411
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  6354 cgactgtgcaacttagacctcttatatgcatgtgctaccaatccacggcatcaagccc 6411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Original strand, 22014 - 22124
Alignment:
Q  215 cgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttc 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  22014 cgacttcaacttgactatgcaacctacacctattaatcatgcatgtggtaccaatgcagggcatcaagccctcaact-tatttgagtattaatatacttt 22112  T
Q  312 caggacatcaag 323  Q
    |||| |||||||    
T  22113 cagggcatcaag 22124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2908
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | |||| ||||||||||  | ||| | ||||    
T  3040 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatctt-aacaacttaaaacaacatcatctt 2944  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatc 488  Q
    |||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2943 ata--agtccaataatttggaacatcatcatcatcatc 2908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3342 - 3284
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3342 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 3284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3463 - 3422
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3463 cgactatgcaactcagacctcttatatgcatgtggtaccaat 3422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8023 - 7982
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8023 cgactatgcaactcagacctcttatatgcatgtggtaccaat 7982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29006 - 28946
Alignment:
Q  350 ctccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29006 ctccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 28946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29140 - 29085
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29140 actatgcaacttagacctcttatatccatgtggtaccaatctagggcatcaagccc 29085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 488
Target Start/End: Original strand, 31985 - 32117
Alignment:
Q  352 ccaacgtggtgagtgcaaag-ctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctctt 450  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | |||| ||||||||||  | ||| | ||||    
T  31985 ccaacgtggtgag--caaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatctt-aacaacttaaaacaacatcatctt 32081  T
Q  451 atattaatccaatgatttggaacatcatcatcttcatc 488  Q
    |||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32082 ata--agtccaataatttggaacatcatcatcatcatc 32117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 31864 - 31905
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31864 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaat 31905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 12842 - 12956
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagtctcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaatgatttgg 470  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   | ||  ||| |||||||||   | |||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  12842 gctccagggcatgaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggaaacaacaactt-aacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataattttg 12940  T
Q  471 aacatcatcatcttca 486  Q
    ||||||||||||||||    
T  12941 aacatcatcatcttca 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 283
Target Start/End: Original strand, 12709 - 12743
Alignment:
Q  249 atatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12709 atatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 1002
Alignment:
Q  230 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1048 tatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17467 - 17422
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17467 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatacagggcat 17422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 281
Target Start/End: Original strand, 24839 - 24911
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagc 281  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  24839 aatgcaacttcaactcgactatgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccaaagcatcaagc 24911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Original strand, 25012 - 25043
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25012 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 25043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 31 - 71
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcat 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2186 - 2114
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2186 aatgcgacttcaacttgactgtgttacttaaacctcttatatgcatgtggtacaaatccagggcatcaagccc 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2015 - 1984
Alignment:
Q  371 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2015 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaatg 1984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 10704 - 10756
Alignment:
Q  155 tcaacaacttaacaactcatggatgataattcattaacaacgactttgactcg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  10704 tcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 10650 - 10712
Alignment:
Q  76 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaact 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  10650 acatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacgtggatagaagataactcaacaact 10712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 56099 - 56001
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  56099 gactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcataaatatactcacagggcatcaag 56001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 20943 - 20987
Alignment:
Q  136 actcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatga 180  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20943 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 20987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 411
Target Start/End: Original strand, 156 - 332
Alignment:
Q  231 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccat 330  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| | |  |||   ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||     
T  156 atgcaacctaaacctcttatatgcatgcggtaccaattcagggcatgagcccctagcattat---agtattaatatactttcagggcat-aagcccccaa 251  T
Q  331 cgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  252 caattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 413
Target Start/End: Original strand, 1585 - 1768
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||   ||||||| |||||||  ||| ||| ||| |    
T  1585 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatatggtaccaattcagggcatgagcccccagcattat---agtattactatacttttagggcat-aagcc 1680  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatag 413  Q
    |||| |  | | |||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1681 cccaacaattagtttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatag 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 413
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9451
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||   ||||||| |||||||  ||| ||| ||| |    
T  9268 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatatggtaccaattcagggcatgagcccccagcattat---agtattactatacttttagggcat-aagcc 9363  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatag 413  Q
    |||| |  | | |||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9364 cccaacaattagtttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatag 9451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1842 - 1665
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  1842 cgacaatgcaacctaaacctcatatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat-aagcc 1747  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatg 408  Q
    |||| |  | |||||||  |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  1746 cccaac-attattttgagctaatgctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatg 1665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Original strand, 650 - 830
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |   |||  ||||||||||||||| |||| |||  |  |    
T  650 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatttagggcatgagcccccaac---attatagtattaatatactttcagggcat--aacc 744  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  745 cccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 3440 - 3481
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3440 cgactatgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 3481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 66743 - 66702
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66743 cgacaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 66702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Original strand, 68648 - 68811
Alignment:
Q  242 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |  | |||| |    
T  68648 acctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacatttattt-g 68741  T
Q  342 aattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    |   ||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  68742 agcaaatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgaatgctaatgcat 68811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4945 - 4874
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaa 322  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4945 atgcatgtggtaccaacccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcattaatatacttccagggcatcaa 4874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6766 - 6586
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||  |   |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||| |    
T  6766 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccggc---attatagtattaatatacttttagggcat-aagcc 6671  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| |  | |||||||   ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6670 cccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctctagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 6586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14077 - 14036
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14077 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 14036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 411
Target Start/End: Original strand, 1316 - 1430
Alignment:
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac- 394  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |  | |||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  1316 agtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacaattattttgagaaaatgctctatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaaca 1413  T
Q  395 aatgaatgctaatgcat 411  Q
    |||| ||||||||||||    
T  1414 aatgtatgctaatgcat 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 6426 - 6474
Alignment:
Q  171 tcatggatgataattcattaacaacgactttgactcggcaaatgcgact 219  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6426 tcatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgact 6474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 6470 - 6510
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6470 cgactatgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 6510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 276
Target Start/End: Original strand, 66291 - 66338
Alignment:
Q  228 actatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66291 actatgcaacttagtc-tcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 66338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19650 - 19486
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagtc 325  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |   | || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  19650 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac---agtttagtattaatatactttcagggcat-aagcc 19555  T
Q  326 cccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca 395  Q
    |||| |  | |||||||  ||| |||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  19554 cccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctctagggcat-gagcccccaaca 19486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Original strand, 14365 - 14434
Alignment:
Q  254 catgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14365 catgtggtaccaatccagggcatcaagccgtcaacg-tatttgagtattaatatacttccagggcatcaag 14434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Original strand, 29 - 94
Alignment:
Q  346 aatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29 aatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Original strand, 12360 - 12429
Alignment:
Q  254 catgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12360 catgtggtaccaatccagggcatcaagccgtcaacg-tatttgagtattaatatacttccagggcatcaag 12429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 324
Target Start/End: Original strand, 2136 - 2251
Alignment:
Q  211 aatgcgactccaactcgactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatata 307  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||    
T  2136 aatgcgacttcgacttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtagcaatccagggcatcaagccctgaact-tatttgagtataaatata 2234  T
Q  308 cttccaggacatcaagt 324  Q
    || ||| | ||||||||    
T  2235 ctcccatggcatcaagt 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Original strand, 8636 - 8734
Alignment:
Q  227 gactatgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||    
T  8636 gactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcataaatatactcccatggcatcaag 8734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 382
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8445
Alignment:
Q  296 agtattaatatacttccaggacatcaagtccccatcgctaattttgaattaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcat 382  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |  | |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8360 agtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat 8445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 33306 - 33356
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 276  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33306 cgacaatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtacgaattcagggcat 33356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27371 - 27306
Alignment:
Q  346 aatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaaca-atgaatgctaatgcat 411  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27371 aatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcat-gagcccccaacatatgaatgctaatgcat 27306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9165
Alignment:
Q  226 cgactatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9125 cgacaatgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 9165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6259 - 6222
Alignment:
Q  457 atccaatgatttggaacatcatcatcttcatcaactta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6259 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaactta 6222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10483 - 10411
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc-catctctatttgagtattaatatacttccaggacatcaag 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  10483 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaact-tatttgagcataaatatactcacagggcatcaag 10411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 35952 - 35984
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35952 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 35984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 10340 - 10376
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10340 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 10376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 518
Target Start/End: Original strand, 7987 - 8023
Alignment:
Q  482 cttcatcaacttaaacaacatcaacaacttaagactc 518  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7987 cttcaacaacttagacaacatcaacaacttaagactc 8023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 1666 - 1698
Alignment:
Q  251 atgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccc 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1666 atgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccc 1698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University