View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15340_low_9 (Length: 229)

Name: NF15340_low_9
Description: NF15340
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15340_low_9
NF15340_low_9
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (11-225)||(22072913-22073127)
chr7 (11-225)||(16219626-16219835)
chr7 (11-225)||(47831807-47832019)
chr7 (15-225)||(811040-811248)
chr7 (26-225)||(16056343-16056539)
chr7 (11-225)||(67745-67956)
chr7 (15-225)||(18005650-18005858)
chr7 (15-225)||(44014182-44014387)
chr7 (11-181)||(34200786-34200951)
chr7 (26-225)||(12901338-12901536)
chr7 (14-134)||(3564363-3564482)
chr7 (11-181)||(11995983-11996148)
chr7 (11-181)||(16495402-16495567)
chr7 (11-181)||(28505254-28505419)
chr7 (11-181)||(15754843-15755008)
chr7 (14-134)||(48273392-48273511)
chr7 (11-135)||(2280117-2280238)
chr7 (11-134)||(13647325-13647447)
chr7 (11-131)||(38227481-38227599)
chr7 (11-131)||(12698831-12698951)
chr7 (14-131)||(18456415-18456530)
chr7 (14-134)||(456321-456439)
chr7 (14-134)||(11972496-11972614)
chr7 (14-134)||(14949166-14949284)
chr7 (14-134)||(15376757-15376875)
chr7 (14-134)||(16232520-16232638)
chr7 (14-134)||(16410059-16410177)
chr7 (14-134)||(18640272-18640390)
chr7 (14-134)||(20385167-20385285)
chr7 (14-134)||(21189639-21189757)
chr7 (18-134)||(24275175-24275289)
chr7 (14-134)||(32125491-32125609)
chr7 (14-134)||(41522917-41523035)
chr7 (14-134)||(41525379-41525497)
chr7 (15-134)||(11393331-11393448)
chr7 (11-134)||(18430709-18430830)
chr7 (11-131)||(9509189-9509308)
chr7 (11-131)||(16386249-16386369)
chr7 (14-134)||(24702238-24702356)
chr7 (14-134)||(27216860-27216978)
chr7 (14-134)||(44116509-44116627)
chr7 (14-127)||(16213684-16213795)
chr7 (14-174)||(17061919-17062077)
chr7 (26-191)||(1867937-1868101)
chr7 (14-134)||(3386333-3386451)
chr7 (33-191)||(12255733-12255892)
chr7 (30-225)||(20220098-20220290)
chr7 (26-193)||(14044761-14044928)
chr7 (26-193)||(14354791-14354958)
chr7 (14-123)||(13869346-13869453)
chr7 (11-131)||(26211995-26212115)
chr7 (11-131)||(10589039-10589158)
chr7 (14-134)||(13831373-13831491)
chr7 (26-134)||(15144037-15144143)
chr7 (14-134)||(24704688-24704803)
chr7 (11-191)||(19486686-19486865)
chr7 (18-134)||(38898420-38898535)
chr7 (34-191)||(15008441-15008597)
chr7 (13-112)||(40443393-40443490)
chr7 (14-64)||(20110556-20110606)
chr7 (11-81)||(27847881-27847951)
chr7 (29-135)||(10063816-10063921)
chr7 (183-225)||(16324175-16324217)
chr7 (156-216)||(9389615-9389675)
chr7 (17-80)||(18154894-18154956)
chr7 (39-140)||(14036282-14036384)
chr7 (39-140)||(14346312-14346414)
chr7 (15-64)||(14932802-14932851)
chr7 (15-64)||(15356237-15356286)
chr7 (15-64)||(15360351-15360400)
chr7 (97-181)||(15113028-15113111)
chr7 (14-64)||(26356106-26356156)
chr7 (14-64)||(26358558-26358608)
chr7 (37-83)||(48991206-48991252)
chr7 (12-64)||(2832509-2832561)
chr7 (30-134)||(12756715-12756817)
chr7 (97-181)||(15116565-15116648)
chr7 (15-80)||(12187019-12187083)
chr7 (15-80)||(17138113-17138177)
chr7 (15-64)||(19649557-19649606)
chr7 (32-80)||(9177718-9177766)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (11-225)||(6520368-6520579)
chr8 (11-225)||(38855161-38855372)
chr8 (15-225)||(21285601-21285809)
chr8 (11-225)||(23760753-23760962)
chr8 (26-225)||(983314-983512)
chr8 (25-225)||(21673718-21673916)
chr8 (11-181)||(5866230-5866395)
chr8 (11-181)||(21490995-21491160)
chr8 (11-135)||(16092340-16092463)
chr8 (11-181)||(17140916-17141081)
chr8 (30-225)||(37116366-37116561)
chr8 (11-131)||(18818411-18818530)
chr8 (12-131)||(28649046-28649164)
chr8 (30-191)||(20498581-20498741)
chr8 (11-131)||(7372778-7372897)
chr8 (30-225)||(17266901-17267096)
chr8 (15-191)||(26355643-26355815)
chr8 (8-125)||(6759255-6759371)
chr8 (14-134)||(14409488-14409606)
chr8 (11-131)||(21919002-21919121)
chr8 (11-125)||(23406379-23406492)
chr8 (30-225)||(24353039-24353233)
chr8 (11-181)||(21249384-21249550)
chr8 (11-181)||(21255222-21255388)
chr8 (14-134)||(1484402-1484520)
chr8 (14-134)||(5853336-5853454)
chr8 (14-134)||(15203275-15203393)
chr8 (18-134)||(16413360-16413474)
chr8 (14-134)||(20403227-20403345)
chr8 (11-131)||(20536208-20536327)
chr8 (11-131)||(21923930-21924049)
chr8 (14-134)||(22001753-22001871)
chr8 (11-131)||(22626736-22626854)
chr8 (14-134)||(20046239-20046357)
chr8 (11-135)||(22875065-22875187)
chr8 (14-134)||(41598188-41598306)
chr8 (30-181)||(17439458-17439609)
chr8 (14-134)||(4483281-4483398)
chr8 (14-134)||(4542417-4542535)
chr8 (11-181)||(17612062-17612231)
chr8 (11-89)||(18879275-18879352)
chr8 (14-135)||(26219717-26219835)
chr8 (11-112)||(31971257-31971356)
chr8 (29-191)||(13508027-13508188)
chr8 (11-112)||(16199666-16199765)
chr8 (11-131)||(21395984-21396101)
chr8 (11-131)||(21790477-21790594)
chr8 (14-134)||(19896265-19896386)
chr8 (14-135)||(26225291-26225409)
chr8 (18-119)||(45290754-45290853)
chr8 (29-191)||(13597559-13597720)
chr8 (8-123)||(19937061-19937174)
chr8 (94-225)||(22364745-22364874)
chr8 (11-131)||(21389454-21389571)
chr8 (11-131)||(21778780-21778897)
chr8 (12-134)||(26223917-26224037)
chr8 (11-112)||(45131019-45131117)
chr8 (14-134)||(14823774-14823891)
chr8 (27-123)||(15070571-15070665)
chr8 (14-134)||(25484319-25484430)
chr8 (13-131)||(18678104-18678221)
chr8 (30-83)||(19154936-19154989)
chr8 (30-134)||(19801426-19801527)
chr8 (12-80)||(23648554-23648621)
chr8 (13-131)||(32121734-32121851)
chr8 (94-140)||(40492844-40492890)
chr8 (98-181)||(18862430-18862512)
chr8 (98-181)||(21383896-21383978)
chr8 (98-181)||(21387316-21387398)
chr8 (98-181)||(21411189-21411271)
chr8 (98-181)||(21805681-21805763)
chr8 (98-181)||(21827799-21827881)
chr8 (97-193)||(14103165-14103260)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (11-225)||(21329406-21329618)
chr5 (11-227)||(26011942-26012154)
chr5 (11-225)||(21502064-21502277)
chr5 (30-223)||(20026851-20027043)
chr5 (15-191)||(21565546-21565720)
chr5 (15-180)||(22959489-22959649)
chr5 (11-181)||(19660791-19660956)
chr5 (11-191)||(19668898-19669073)
chr5 (11-131)||(21729066-21729185)
chr5 (11-131)||(21808391-21808510)
chr5 (11-134)||(9077952-9078074)
chr5 (30-180)||(22144068-22144217)
chr5 (30-225)||(22178128-22178323)
chr5 (11-120)||(21997547-21997655)
chr5 (14-135)||(22412187-22412306)
chr5 (14-131)||(24529223-24529339)
chr5 (14-134)||(264812-264930)
chr5 (14-134)||(10732984-10733102)
chr5 (14-134)||(20909012-20909130)
chr5 (11-131)||(24493569-24493687)
chr5 (11-131)||(25421532-25421651)
chr5 (14-134)||(39363384-39363502)
chr5 (11-133)||(1096467-1096588)
chr5 (11-131)||(8286844-8286964)
chr5 (11-131)||(13025311-13025429)
chr5 (11-131)||(13095495-13095613)
chr5 (11-131)||(23390498-23390617)
chr5 (14-134)||(29329934-29330052)
chr5 (14-134)||(42245409-42245527)
chr5 (14-134)||(36154827-36154942)
chr5 (11-110)||(36314577-36314675)
chr5 (14-134)||(20902053-20902172)
chr5 (14-123)||(39245136-39245243)
chr5 (14-134)||(2154658-2154776)
chr5 (14-134)||(11581243-11581361)
chr5 (11-131)||(25431395-25431513)
chr5 (14-134)||(29345980-29346098)
chr5 (14-123)||(10775731-10775838)
chr5 (14-134)||(29348453-29348571)
chr5 (14-134)||(29350926-29351044)
chr5 (17-123)||(18319089-18319193)
chr5 (11-131)||(22075018-22075138)
chr5 (14-123)||(31061068-31061175)
chr5 (14-123)||(38619434-38619541)
chr5 (14-134)||(32027393-32027511)
chr5 (14-98)||(20918028-20918110)
chr5 (15-123)||(23064512-23064618)
chr5 (11-191)||(40725853-40726032)
chr5 (11-82)||(21293020-21293090)
chr5 (64-168)||(29448055-29448159)
chr5 (30-134)||(37723922-37724023)
chr5 (14-64)||(20806854-20806904)
chr5 (17-123)||(24067110-24067214)
chr5 (15-64)||(26704075-26704124)
chr5 (15-64)||(26973808-26973857)
chr5 (21-111)||(18418590-18418678)
chr5 (13-64)||(17517269-17517320)
chr5 (27-81)||(26732884-26732937)
chr5 (78-135)||(20766118-20766174)
chr5 (120-181)||(21741486-21741545)
chr5 (98-181)||(10753603-10753685)
chr5 (98-181)||(21871525-21871607)
chr5 (15-98)||(21873254-21873336)
chr5 (98-181)||(21875805-21875887)
chr5 (98-181)||(22120149-22120231)
chr5 (30-81)||(26740697-26740747)
chr5 (150-181)||(36314685-36314716)
chr5 (30-80)||(15796438-15796487)
chr5 (15-80)||(22032323-22032387)
chr5 (64-131)||(18356367-18356432)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (11-222)||(6035-6244)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (11-222)||(32538-32744)
scaffold0034 (30-112)||(51904-51985)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (11-225)||(23019408-23019618)
chr6 (26-191)||(25644335-25644500)
chr6 (11-181)||(28496427-28496592)
chr6 (11-181)||(29808838-29809003)
chr6 (26-225)||(19668386-19668584)
chr6 (26-182)||(9098465-9098620)
chr6 (15-191)||(19652199-19652371)
chr6 (11-181)||(1561303-1561468)
chr6 (11-110)||(27333241-27333339)
chr6 (11-110)||(27393981-27394079)
chr6 (11-134)||(29060540-29060662)
chr6 (11-135)||(20109140-20109261)
chr6 (12-134)||(30676754-30676874)
chr6 (14-174)||(22782227-22782385)
chr6 (11-131)||(16496244-16496363)
chr6 (11-131)||(17287798-17287917)
chr6 (12-139)||(18409821-18409947)
chr6 (11-134)||(25629354-25629476)
chr6 (14-134)||(12742317-12742435)
chr6 (14-134)||(18334636-18334754)
chr6 (14-134)||(19005046-19005164)
chr6 (14-134)||(19858963-19859081)
chr6 (14-134)||(24422547-24422665)
chr6 (14-134)||(25656629-25656747)
chr6 (14-134)||(33861794-33861912)
chr6 (14-134)||(33864278-33864396)
chr6 (11-134)||(20593773-20593895)
chr6 (11-125)||(20076700-20076812)
chr6 (14-134)||(2291224-2291342)
chr6 (14-134)||(8055029-8055147)
chr6 (14-134)||(25754809-25754927)
chr6 (14-134)||(26924684-26924802)
chr6 (11-134)||(19303540-19303661)
chr6 (12-134)||(34963371-34963491)
chr6 (11-225)||(22080648-22080846)
chr6 (14-134)||(1540955-1541073)
chr6 (14-134)||(1595549-1595667)
chr6 (11-131)||(20360962-20361081)
chr6 (14-134)||(20556936-20557054)
chr6 (14-134)||(25688502-25688620)
chr6 (11-112)||(20638304-20638404)
chr6 (11-131)||(22780229-22780348)
chr6 (17-123)||(16448582-16448686)
chr6 (11-191)||(8227453-8227632)
chr6 (14-134)||(3852061-3852179)
chr6 (11-73)||(25714417-25714478)
chr6 (11-83)||(16920679-16920751)
chr6 (30-134)||(18456735-18456837)
chr6 (30-134)||(18461895-18461997)
chr6 (30-225)||(23076749-23076944)
chr6 (11-83)||(35245586-35245658)
chr6 (25-115)||(4185839-4185928)
chr6 (11-79)||(22831503-22831571)
chr6 (30-222)||(35008167-35008359)
chr6 (25-115)||(4186381-4186470)
chr6 (30-112)||(18821866-18821946)
chr6 (30-74)||(11185524-11185568)
chr6 (13-64)||(19848063-19848114)
chr6 (181-221)||(27333198-27333238)
chr6 (181-221)||(27393938-27393978)
chr6 (94-193)||(18696570-18696667)
chr6 (63-191)||(18706356-18706483)
chr6 (13-64)||(23992429-23992480)
chr6 (32-83)||(33443068-33443118)
chr6 (155-225)||(28103807-28103877)
chr6 (8-52)||(19008799-19008843)
chr6 (98-181)||(22949384-22949466)
chr6 (98-181)||(22953340-22953422)
chr6 (98-181)||(23871828-23871910)
chr6 (98-181)||(23875784-23875866)
chr6 (98-181)||(27325388-27325470)
chr6 (15-64)||(18907111-18907160)
chr6 (15-64)||(19862978-19863027)
chr6 (15-64)||(19873120-19873169)
chr6 (15-80)||(21766695-21766759)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (11-225)||(15470927-15471135)
chr3 (11-218)||(14234487-14234692)
chr3 (15-191)||(16097332-16097506)
chr3 (15-192)||(12174204-12174376)
chr3 (11-181)||(13210283-13210448)
chr3 (15-191)||(16103784-16103957)
chr3 (11-131)||(18438534-18438653)
chr3 (14-135)||(27165250-27165370)
chr3 (11-133)||(14972854-14972975)
chr3 (30-191)||(52523669-52523831)
chr3 (11-131)||(12399209-12399328)
chr3 (14-122)||(53301562-53301669)
chr3 (25-168)||(32307691-32307830)
chr3 (30-225)||(37251076-37251270)
chr3 (29-135)||(42386428-42386533)
chr3 (11-131)||(23083363-23083482)
chr3 (14-134)||(29172627-29172745)
chr3 (11-134)||(25476384-25476506)
chr3 (30-225)||(22110260-22110454)
chr3 (14-131)||(24153211-24153326)
chr3 (14-135)||(36166598-36166716)
chr3 (14-134)||(6469178-6469296)
chr3 (14-134)||(9707651-9707769)
chr3 (14-134)||(17463178-17463296)
chr3 (14-134)||(17672626-17672744)
chr3 (11-131)||(20698437-20698556)
chr3 (11-131)||(26686887-26687006)
chr3 (14-134)||(28848655-28848773)
chr3 (14-134)||(34159326-34159444)
chr3 (14-134)||(45606951-45607069)
chr3 (14-134)||(55476491-55476609)
chr3 (14-129)||(55500942-55501055)
chr3 (11-112)||(11424781-11424880)
chr3 (14-134)||(7781391-7781509)
chr3 (14-134)||(8899094-8899212)
chr3 (11-131)||(13442274-13442393)
chr3 (14-134)||(16454325-16454443)
chr3 (11-131)||(17487856-17487975)
chr3 (11-131)||(17499338-17499457)
chr3 (14-134)||(38961935-38962053)
chr3 (15-115)||(49668094-49668193)
chr3 (30-174)||(43925977-43926121)
chr3 (14-134)||(13151834-13151953)
chr3 (14-134)||(13154299-13154418)
chr3 (13-134)||(13544024-13544143)
chr3 (15-115)||(9512924-9513023)
chr3 (15-115)||(9520899-9520998)
chr3 (14-134)||(10247767-10247885)
chr3 (18-134)||(12567564-12567678)
chr3 (14-134)||(15977515-15977633)
chr3 (14-134)||(17446699-17446816)
chr3 (14-134)||(40213720-40213838)
chr3 (11-174)||(43550482-43550644)
chr3 (11-131)||(43840932-43841051)
chr3 (25-131)||(14572603-14572707)
chr3 (16-134)||(16282855-16282971)
chr3 (14-76)||(28194693-28194755)
chr3 (14-123)||(12119780-12119887)
chr3 (14-123)||(15412429-15412536)
chr3 (14-135)||(21618449-21618567)
chr3 (11-191)||(24340665-24340844)
chr3 (16-134)||(41123892-41124005)
chr3 (14-134)||(50242822-50242940)
chr3 (29-135)||(23274705-23274810)
chr3 (14-123)||(8499518-8499625)
chr3 (11-191)||(37642207-37642386)
chr3 (14-135)||(10556985-10557105)
chr3 (14-115)||(44494809-44494908)
chr3 (30-134)||(53070697-53070799)
chr3 (14-73)||(17737236-17737294)
chr3 (25-131)||(14576835-14576939)
chr3 (14-64)||(45577950-45578000)
chr3 (120-216)||(1465329-1465423)
chr3 (30-139)||(12377940-12378050)
chr3 (73-191)||(2051141-2051260)
chr3 (11-191)||(22147467-22147646)
chr3 (30-134)||(606324-606428)
chr3 (25-168)||(1644642-1644780)
chr3 (13-64)||(46822267-46822318)
chr3 (121-191)||(49389573-49389642)
chr3 (13-64)||(12511059-12511110)
chr3 (15-80)||(856140-856204)
chr3 (15-80)||(23077530-23077594)
chr3 (12-64)||(14665398-14665450)
chr3 (12-64)||(14668554-14668606)
chr3 (98-181)||(14501207-14501290)
chr3 (98-181)||(19776007-19776089)
chr3 (98-181)||(37439421-37439503)
chr3 (32-82)||(13919350-13919399)
chr3 (15-64)||(15878119-15878168)
chr3 (15-63)||(26196500-26196548)
chr3 (12-64)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (11-225)||(944-1155)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (26-225)||(10542-10739)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (11-225)||(39706198-39706409)
chr4 (26-225)||(12288118-12288316)
chr4 (11-181)||(15551817-15551982)
chr4 (26-191)||(52243136-52243302)
chr4 (30-191)||(13793-13953)
chr4 (14-135)||(54798752-54798872)
chr4 (11-131)||(7798774-7798893)
chr4 (11-131)||(52873369-52873488)
chr4 (26-191)||(43198495-43198661)
chr4 (30-225)||(53082060-53082254)
chr4 (15-168)||(12774011-12774160)
chr4 (14-135)||(14280316-14280435)
chr4 (14-134)||(16377522-16377639)
chr4 (11-131)||(7088877-7088996)
chr4 (11-131)||(12902757-12902876)
chr4 (14-134)||(18215318-18215436)
chr4 (14-134)||(44928923-44929042)
chr4 (14-134)||(12351-12469)
chr4 (11-131)||(7893703-7893822)
chr4 (14-134)||(15118396-15118514)
chr4 (14-134)||(44773131-44773249)
chr4 (14-134)||(52312510-52312628)
chr4 (30-222)||(46640367-46640558)
chr4 (8-134)||(19242693-19242817)
chr4 (12-134)||(19618216-19618336)
chr4 (14-134)||(1837553-1837671)
chr4 (14-134)||(3515007-3515125)
chr4 (11-131)||(16270238-16270356)
chr4 (14-134)||(18239463-18239581)
chr4 (14-134)||(44615288-44615406)
chr4 (14-134)||(50222383-50222501)
chr4 (14-134)||(51463912-51464030)
chr4 (15-191)||(8846360-8846550)
chr4 (16-134)||(14038653-14038770)
chr4 (11-104)||(3096293-3096385)
chr4 (14-127)||(23803316-23803427)
chr4 (11-131)||(6899891-6900009)
chr4 (11-131)||(16239972-16240090)
chr4 (11-131)||(44052829-44052948)
chr4 (49-181)||(16596686-16596813)
chr4 (13-131)||(22636437-22636554)
chr4 (14-135)||(8574867-8574985)
chr4 (18-123)||(15355380-15355483)
chr4 (18-131)||(23374361-23374473)
chr4 (14-134)||(44102214-44102332)
chr4 (12-134)||(14970751-14970871)
chr4 (11-83)||(17046487-17046559)
chr4 (30-112)||(6190481-6190563)
chr4 (120-216)||(15099457-15099551)
chr4 (120-216)||(15190424-15190518)
chr4 (14-73)||(7641286-7641344)
chr4 (14-73)||(12610950-12611008)
chr4 (11-112)||(14053323-14053422)
chr4 (11-123)||(15367690-15367800)
chr4 (11-123)||(15370018-15370128)
chr4 (11-123)||(15371202-15371312)
chr4 (11-123)||(15373483-15373593)
chr4 (11-123)||(15402703-15402813)
chr4 (11-123)||(16223532-16223642)
chr4 (30-134)||(21815629-21815731)
chr4 (92-138)||(15464926-15464972)
chr4 (17-123)||(20149832-20149936)
chr4 (13-134)||(22353835-22353955)
chr4 (98-181)||(630728-630810)
chr4 (98-181)||(3331970-3332052)
chr4 (98-181)||(13812763-13812845)
chr4 (98-181)||(14953915-14953997)
chr4 (98-181)||(25690146-25690228)
chr4 (12-64)||(20157527-20157579)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (11-225)||(12942-13151)
scaffold0138 (94-225)||(18146-18276)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (11-225)||(6535-6747)
scaffold0621 (26-135)||(8481-8589)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (11-225)||(6611-6823)
scaffold0333 (11-225)||(13991-14203)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (11-225)||(12766-12978)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (15-225)||(22921778-22921986)
chr1 (30-229)||(21861474-21861672)
chr1 (11-191)||(33681010-33681185)
chr1 (30-225)||(21896164-21896358)
chr1 (11-191)||(22237630-22237805)
chr1 (27-181)||(20918620-20918769)
chr1 (12-134)||(50210212-50210333)
chr1 (11-181)||(14295507-14295672)
chr1 (15-191)||(20248283-20248454)
chr1 (14-131)||(34509783-34509899)
chr1 (25-168)||(21754059-21754198)
chr1 (30-218)||(50614031-50614219)
chr1 (30-218)||(50621859-50622047)
chr1 (30-191)||(35261023-35261180)
chr1 (11-174)||(45574846-45575008)
chr1 (30-225)||(50686630-50686825)
chr1 (14-134)||(13988866-13988984)
chr1 (30-225)||(16368195-16368388)
chr1 (14-134)||(21923335-21923453)
chr1 (14-134)||(23593779-23593897)
chr1 (26-191)||(52927925-52928076)
chr1 (26-190)||(16758664-16758828)
chr1 (14-133)||(31612313-31612430)
chr1 (30-225)||(41049944-41050138)
chr1 (13-134)||(21840766-21840885)
chr1 (14-134)||(21475131-21475249)
chr1 (11-131)||(27250731-27250850)
chr1 (14-134)||(29298137-29298254)
chr1 (14-134)||(433012-433128)
chr1 (14-126)||(22123119-22123230)
chr1 (11-131)||(22532269-22532388)
chr1 (14-134)||(29776688-29776806)
chr1 (11-114)||(20847173-20847275)
chr1 (11-131)||(21026680-21026799)
chr1 (12-134)||(16361915-16362035)
chr1 (14-174)||(21707167-21707325)
chr1 (14-174)||(21711709-21711867)
chr1 (11-123)||(13212917-13213027)
chr1 (12-80)||(20454606-20454673)
chr1 (8-123)||(15860064-15860177)
chr1 (8-123)||(21342090-21342203)
chr1 (30-192)||(16093825-16093987)
chr1 (14-123)||(16275419-16275526)
chr1 (14-123)||(21346961-21347068)
chr1 (11-87)||(38801433-38801508)
chr1 (12-131)||(22468698-22468816)
chr1 (120-216)||(35981606-35981700)
chr1 (120-216)||(49261448-49261542)
chr1 (64-181)||(22130863-22130975)
chr1 (119-216)||(20636956-20637051)
chr1 (17-123)||(40389157-40389261)
chr1 (15-64)||(21714546-21714595)
chr1 (12-131)||(20135188-20135306)
chr1 (15-221)||(21161720-21161921)
chr1 (32-181)||(26064959-26065107)
chr1 (87-181)||(51130639-51130729)
chr1 (12-64)||(24783160-24783212)
chr1 (98-181)||(1924914-1924996)
chr1 (98-181)||(20923928-20924010)
chr1 (97-134)||(12271639-12271676)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (25-225)||(5657-5855)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (15-225)||(19268-19476)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (15-225)||(100378-100586)
scaffold0023 (15-225)||(40083-40291)
scaffold0023 (14-134)||(94411-94529)
scaffold0023 (14-134)||(44454-44573)
scaffold0023 (18-134)||(17484-17598)
scaffold0023 (11-84)||(119875-119948)
scaffold0023 (15-88)||(101503-101576)
scaffold0023 (15-64)||(38547-38596)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (15-225)||(25175854-25176062)
chr2 (30-225)||(7641-7835)
chr2 (15-179)||(7679589-7679750)
chr2 (16-225)||(28405981-28406189)
chr2 (26-225)||(18786811-18787009)
chr2 (14-134)||(22105412-22105531)
chr2 (14-131)||(298816-298933)
chr2 (11-191)||(23708561-23708738)
chr2 (11-131)||(23060513-23060632)
chr2 (11-181)||(23071905-23072070)
chr2 (14-134)||(6725995-6726113)
chr2 (11-135)||(22337115-22337238)
chr2 (11-131)||(23076442-23076561)
chr2 (30-225)||(23207296-23207490)
chr2 (30-225)||(23791292-23791487)
chr2 (14-134)||(571397-571515)
chr2 (14-134)||(18808943-18809061)
chr2 (14-134)||(23130862-23130980)
chr2 (14-134)||(23133329-23133447)
chr2 (14-134)||(23135590-23135708)
chr2 (14-134)||(23709576-23709694)
chr2 (14-134)||(23712057-23712175)
chr2 (14-134)||(26505379-26505497)
chr2 (14-134)||(26507857-26507975)
chr2 (14-134)||(34402566-34402684)
chr2 (14-134)||(39682313-39682431)
chr2 (12-134)||(32214965-32215085)
chr2 (14-134)||(24367774-24367892)
chr2 (14-134)||(28577099-28577217)
chr2 (11-181)||(19671830-19671998)
chr2 (11-129)||(22731238-22731355)
chr2 (30-225)||(25108906-25109101)
chr2 (11-112)||(38136-38235)
chr2 (17-134)||(21155104-21155219)
chr2 (14-134)||(24898239-24898358)
chr2 (14-134)||(24900722-24900841)
chr2 (14-134)||(24903199-24903318)
chr2 (14-134)||(24905676-24905795)
chr2 (14-134)||(24908151-24908270)
chr2 (14-134)||(32039542-32039660)
chr2 (11-89)||(23285865-23285942)
chr2 (16-134)||(43137301-43137417)
chr2 (11-131)||(23660023-23660141)
chr2 (14-134)||(45029898-45030016)
chr2 (11-131)||(20309108-20309225)
chr2 (30-181)||(20520145-20520295)
chr2 (11-131)||(22738182-22738300)
chr2 (11-134)||(23103396-23103516)
chr2 (14-134)||(24529573-24529691)
chr2 (11-90)||(8946657-8946735)
chr2 (30-191)||(22413078-22413240)
chr2 (12-133)||(22134208-22134326)
chr2 (14-134)||(38967374-38967493)
chr2 (11-75)||(23040247-23040310)
chr2 (11-131)||(23654388-23654507)
chr2 (30-112)||(32451949-32452031)
chr2 (17-73)||(24643054-24643109)
chr2 (30-191)||(24697548-24697709)
chr2 (30-140)||(23004767-23004878)
chr2 (97-181)||(22459514-22459598)
chr2 (18-131)||(25616192-25616304)
chr2 (32-82)||(23287384-23287433)
chr2 (32-81)||(26392403-26392451)
chr2 (98-181)||(1283666-1283748)
chr2 (98-181)||(30344776-30344858)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (91-225)||(8094-8227)
scaffold0556 (25-193)||(6826-6989)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (15-225)||(1086-1294)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (15-224)||(2555-2762)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (26-191)||(10484-10647)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (26-224)||(7983-8180)
scaffold0218 (58-179)||(29238-29354)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (26-191)||(22613-22776)
scaffold0037 (14-134)||(82072-82190)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (15-191)||(45735-45909)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (15-191)||(160688-160861)
scaffold0001 (18-134)||(501088-501202)
scaffold0001 (14-123)||(85635-85742)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (25-180)||(129919-130072)
scaffold0010 (30-138)||(60710-60818)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (15-191)||(133-307)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (15-225)||(14606-14814)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (14-181)||(15664-15826)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (11-181)||(11292-11457)
scaffold0046 (11-181)||(1997-2162)
scaffold0046 (11-131)||(28414-28533)
scaffold0046 (11-67)||(4552-4608)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (29-225)||(62216-62407)
scaffold0028 (14-134)||(136680-136798)
scaffold0028 (14-134)||(139149-139267)
scaffold0028 (14-134)||(144087-144205)
scaffold0028 (14-134)||(134211-134329)
scaffold0028 (14-134)||(141618-141736)
scaffold0028 (15-118)||(132662-132765)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (12-134)||(3185-3306)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (30-225)||(6191-6386)
scaffold0420 (30-77)||(13793-13840)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-181)||(1025-1190)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (30-225)||(128878-129072)
scaffold0022 (34-225)||(78345-78534)
scaffold0022 (14-135)||(116430-116548)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (30-225)||(136276-136471)
scaffold0021 (30-225)||(144984-145179)
scaffold0021 (12-134)||(174767-174886)
scaffold0021 (11-81)||(121766-121835)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (14-135)||(44705-44825)
scaffold0122 (18-134)||(26064-26179)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (14-135)||(38700-38820)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (11-135)||(3149-3271)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (30-225)||(12587-12780)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (26-138)||(27744-27855)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (11-147)||(15763-15898)
scaffold0020 (15-64)||(178898-178947)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (34-225)||(38339-38530)
scaffold0139 (15-64)||(19980-20029)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (15-140)||(2799-2923)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (12-134)||(17214-17337)
scaffold0056 (30-134)||(79328-79430)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (26-138)||(16095-16206)
scaffold0357 (30-136)||(13147-13252)
scaffold0357 (30-82)||(2680-2732)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (26-225)||(103547-103737)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (13-135)||(39479-39599)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (30-191)||(53491-53651)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-135)||(75213-75333)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (30-135)||(1051-1155)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-131)||(4849-4968)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (11-181)||(34123-34288)
scaffold0175 (61-131)||(13141-13211)
scaffold0175 (11-64)||(273-326)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (11-131)||(51913-52032)
scaffold0011 (11-131)||(167980-168099)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (11-134)||(16113-16235)
scaffold0120 (11-131)||(32959-33077)
scaffold0120 (11-131)||(45928-46046)
scaffold0120 (11-73)||(17389-17450)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (26-181)||(25121-25275)
scaffold0123 (94-191)||(620-715)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (30-225)||(19793-19987)
scaffold0080 (11-131)||(39913-40031)
scaffold0080 (98-181)||(48939-49021)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (30-225)||(97024-97219)
scaffold0006 (30-225)||(106302-106497)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (69-225)||(2127-2281)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (14-131)||(22886-23001)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (14-134)||(13392-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (14-134)||(20747-20865)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (11-131)||(13211-13330)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (14-134)||(37821-37939)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (14-134)||(158494-158612)
scaffold0003 (14-134)||(339949-340065)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (11-138)||(8479-8605)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (11-134)||(16599-16721)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (13-134)||(10772-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (14-134)||(4694-4812)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (11-131)||(3470-3589)
scaffold0292 (11-131)||(343-461)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (14-134)||(13947-14065)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (11-131)||(32942-33060)
scaffold0145 (9-134)||(9744-9867)
scaffold0145 (11-131)||(38761-38879)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (14-134)||(16784-16902)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-131)||(1851-1970)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-131)||(8535-8650)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (11-115)||(23901-24001)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (12-134)||(11286-11406)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (11-191)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (11-191)||(38198-38377)
scaffold0124 (98-181)||(24605-24690)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (11-131)||(1050-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (11-135)||(4508-4630)
scaffold0228 (11-135)||(12090-12212)
scaffold0228 (11-135)||(22042-22164)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (14-134)||(40400-40518)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-135)||(25896-26018)
scaffold0026 (11-135)||(39858-39980)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (11-131)||(6123-6245)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (15-118)||(32102-32205)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (12-134)||(12293-12413)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (11-131)||(10427-10544)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (14-123)||(4214-4321)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (13-134)||(9241-9360)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (14-134)||(29931-30050)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (30-224)||(267679-267872)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (11-103)||(4712-4803)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (61-225)||(54-218)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (32-191)||(8001-8161)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (29-131)||(24304-24406)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (11-81)||(1289-1359)
scaffold0106 (11-83)||(7266-7338)
scaffold0106 (14-80)||(15291-15356)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (17-134)||(4300-4415)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (30-228)||(1703-1900)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (11-114)||(16282-16382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (11-191)||(17969-18148)
scaffold0247 (14-123)||(2184-2291)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (14-134)||(106-224)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (11-131)||(1952-2071)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (11-131)||(20910-21030)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (11-83)||(51582-51654)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (11-90)||(13497-13575)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (11-82)||(32067-32137)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (30-225)||(569-762)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (14-134)||(12064-12176)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (11-112)||(15485-15584)
scaffold0114 (15-80)||(7295-7359)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (14-134)||(161133-161252)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (32-131)||(4545-4643)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (15-88)||(28813-28887)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-123)||(1336-1440)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-81)||(46995-47065)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (11-112)||(11464-11564)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (11-83)||(1098-1170)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (30-134)||(20423-20524)
scaffold0031 (11-131)||(128751-128869)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (14-77)||(5183-5246)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (11-78)||(4888-4954)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (30-115)||(2694-2780)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (69-191)||(225465-225585)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (15-64)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (15-64)||(36454-36503)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (75-134)||(3529-3588)
scaffold0327 (15-65)||(289-339)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (30-73)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (15-64)||(29558-29607)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (87-181)||(2398-2488)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (98-181)||(6-88)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (93-135)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (32-82)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (15-80)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (15-64)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (15-80)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (15-64)||(21871-21920)
scaffold0210 (15-64)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (15-64)||(69794-69843)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (97-193)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073127
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaa 22073127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219626
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 16219740  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219739 gaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 16219641  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  16219640 ttactgaaacaacaa 16219626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832019
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggc 47832004  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  47832005 ttactgaaacaacaa 47832019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811040
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 214  Q
    | ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttac 811051  T
Q  215 tgaaacaacaa 225  Q
    |||||| ||||    
T  811050 tgaaactacaa 811040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056539
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  126 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16056441 acatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaa 16056539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67956
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 67843  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 209  Q
     |||| || |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatctcaat-atcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 67940  T
Q  210 cttactgaaacaacaa 225  Q
    || |||||||||||||    
T  67941 ctcactgaaacaacaa 67956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005858
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatg-gaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 18005846  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  18005847 ctgaaacaacaa 18005858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014387
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | ||   | |||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  44014281 gcaa---atcaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggctta 44014375  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  44014376 ctgaaacaacaa 44014387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200951
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901536
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 224  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcacaa-catcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995983
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 11996050  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996049 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505254
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
      || ||| ||| |||   |||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505320 ggatataaatcagcaa---ctcaattatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754843
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15754843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280117
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647447
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227599
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38227578  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38227579 aaatgcaagtcaacaacatct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698951
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatat 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456415
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 18456433  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |||||||||||||||    
T  18456432 tgcaagtcaacaacatct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456439
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972614
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949166
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376757
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232638
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640390
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385167
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189639
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  118 agtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125609
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523035
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525497
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393331
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430830
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509308
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386249
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || ||||  ||| ||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702356
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27216978
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116627
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  114 tgtaagtcaacaac 127  Q
    |  |||||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    || |||||| |||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867937
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1868003 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386451
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255733
Alignment:
Q  33 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  132 caaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||| ||| | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255792 caaacattcatatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220098
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
     |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||    
T  20220193 -tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaa 20220098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044928
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14044858  T
Q  124 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044859 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354958
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14354888  T
Q  124 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354889 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13869443  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  13869444 tgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212115
Alignment:
Q  11 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 109  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831491
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaa 13831470  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13831471 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  126 acatctcaa 134  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704803
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||   | || || |||| |||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaa 24704782  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24704783 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24704803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486686
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898420
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  118 agtcaa-caacatctcaa 134  Q
    |||||| |||||||||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  132 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008499 caaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443490
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063816
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  129 tctcaaa 135  Q
    |||||||    
T  10063822 tctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 225
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324217
Alignment:
Q  183 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 16324217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389615
Alignment:
Q  156 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactg 9389615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  39 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 135  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14036379  T
Q  136 catca 140  Q
    |||||    
T  14036380 catca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  39 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 135  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14346409  T
Q  136 catca 140  Q
    |||||    
T  14346410 catca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113111
Alignment:
Q  97 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacatta 15113111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 83
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  37 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756715
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataac-aacagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  12756719 ctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116648
Alignment:
Q  97 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacatta 15116648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520579
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatc-aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6520564  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  6520565 ttactgaaacaacaa 6520579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855161
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 38855176  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  38855175 ttactgaaacaacaa 38855161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285809
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 214  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacat-agttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttac 21285798  T
Q  215 tgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||    
T  21285799 tgaaacaacaa 21285809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760753
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||     
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcatcatgatataacaatatt 23760867  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 209  Q
     |||  || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  23760866 gaattcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcagg 23760769  T
Q  210 cttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  23760768 cttactgaaacaacaa 23760753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983314
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 983414  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  983413 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaac 983316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673916
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||||||||||| ||| || || || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  21673817 aacatctcaaatatc-aatat-aatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaac 21673914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866230
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 5866230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491160
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatt 21491093  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491094 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21491160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092340
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141081
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141015 gaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 17141081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116561
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaa 37116561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818411
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498741
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  130 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 20498741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372897
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266901
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  129 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||| | || || || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatat-aattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaa 17266901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355643
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | || ||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  108 atcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409488
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21919002
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  111 aaatgtaagtcaaca 125  Q
    || || |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353233
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||  | |  || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24353137 atctcaaacatcgtata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 24353233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249550
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21249482  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249483 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255388
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21255320  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255321 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484520
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853336
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203275
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413360
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  118 agtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403345
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536327
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923930
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001871
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626854
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22626833  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||  || ||||||||||||    
T  22626834 aaatacaaatcaacaacatct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046239
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875187
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22875162  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875163 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598306
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439458
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439510 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483398
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542417
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612062
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879275
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219835
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-tagtatgacataataatatcaaa 26219813  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26219814 tgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971356
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 31971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  129 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199666
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896386
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatc 19896362  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19896363 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225291
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaa-cagtatgacataataatatcaaa 26225313  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  26225312 tacaagtcaacaacatctcaaa 26225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290754
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 45290756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  129 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    || |||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataag 19937077  T
Q  108 atcaaatgtaagtcaa 123  Q
    |||||||| |||||||    
T  19937076 atcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364874
Alignment:
Q  94 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  194 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 22364874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131019
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatc 45131021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823891
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 123
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484319
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac-aacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25484340  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25484339 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25484319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678104
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatct 131  Q
     || || ||||||||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatct 18678104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801426
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  19801430 ctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121851
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatct 131  Q
     || || ||||||||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatct 32121851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  94 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 140  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  97 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329406
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatc 21329520  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||  |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 21329421  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  21329420 ttactgaaacaacaa 21329406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011942
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatc 26012058  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggc 26011959  T
Q  211 ttactgaaacaacaata 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  26011958 ttactgaaacaacaata 26011942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502064
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 209  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 21502080  T
Q  210 cttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  21502079 cttactgaaacaacaa 21502064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026851
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaa-cagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20026944 atcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaac 20026851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565720
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 21565720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959489
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 180  Q
    | || |||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660791
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatc 19660858  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||| ||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660857 gaatataaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 19660791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669073
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatc 19668996  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19668997 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729066
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808391
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 180
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144217
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  130 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 180  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178128
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  22178224 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaa 22178128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  111 aaatgtaagt 120  Q
    ||||| ||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412306
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 22412284  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22412285 tgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |||||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264812
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732984
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909130
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493687
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 24493666  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24493667 aaatgcaagtcaacaacatct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421651
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363502
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096588
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctca 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286844
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatat 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025429
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13025408  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13025409 aaatgcaagtcaacaacatct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095613
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13095592  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13095593 aaatgcaagtcaacaacatct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390498
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330052
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245409
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154827
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902053
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245243
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  39245234 tgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154658
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581243
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||| ||| ||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431513
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatct 25431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346098
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775731
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaa 10775741  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  10775740 tgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348571
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351044
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319089
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  117 aagtcaa 123  Q
    |||||||    
T  18319095 aagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075138
Alignment:
Q  11 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 109  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31061165  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  31061166 tgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38619531  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  38619532 tgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027511
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918028
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaat 23064609  T
Q  115 gtaagtcaa 123  Q
    | |||||||    
T  23064610 gcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726032
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatc 40725951  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  64 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 161  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  162 tatacaa 168  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724023
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  37724019 ctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 24067207  T
Q  117 aagtcaa 123  Q
    |||||||    
T  24067208 aagtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  21 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  78 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  120 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873336
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 98  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatga 21873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 181
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  150 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 131
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  64 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6035
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6047  T
Q  211 ttactgaaacaa 222  Q
    ||||||||||||    
T  6046 ttactgaaacaa 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32744
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 32634  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggc 32732  T
Q  211 ttactgaaacaa 222  Q
    ||||||||||||    
T  32733 ttactgaaacaa 32744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51904
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa 51904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019618
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 23019504  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggc 23019603  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  23019604 ttactgaaacaacaa 23019618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644500
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  126 acatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496427
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28496427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808838
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 29808838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668584
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19668485 caacatcac-aacatcatacgt-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaac 19668582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098465
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaa 182  Q
    ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652371
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacat 19652371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561468
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109261
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaa 20109261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676754
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496363
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287798
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409821
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 139  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742435
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334636
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005164
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858963
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422665
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656747
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || |||| || ||| ||||||    
T  25656727 tgcaagttaataacgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861912
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864396
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatc 20076797  T
Q  111 aaatgtaagtcaaca 125  Q
    ||||| || ||||||    
T  20076798 aaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291224
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055147
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754927
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924684
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 19303564  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  19303563 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963491
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080648
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatc 22080761  T
Q  111 aaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcag 208  Q
     |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||    
T  22080760 gaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttag 22080665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540955
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595667
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360962
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556936
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638304
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  111 aa 112  Q
    ||    
T  20638305 aa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780229
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448582
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  117 aagtcaa 123  Q
    |||||||    
T  16448588 aagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227453
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852061
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920679
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456837
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  18456833 ctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076944
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  129 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaa 23076944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245658
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185839
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4185839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008359
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  129 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 222  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||||    
T  35008267 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaa 35008359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186470
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333198
Alignment:
Q  181 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaaca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaaca 27333198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393938
Alignment:
Q  181 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaaca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaaca 27393938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  94 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  63 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 160  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  161 atatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 83
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443118
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtat 33443118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103807
Alignment:
Q  155 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 28103807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471135
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 15471022  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  15471023 gaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggc 15471120  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  15471121 ttactgaaacaacaa 15471135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234692
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggc 14234684  T
Q  211 ttactgaa 218  Q
    ||||||||    
T  14234685 ttactgaa 14234692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097506
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 16097506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174204
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 192  Q
    | ||   ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt 12174204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210283
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     |||| || |||||||   || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103957
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacat 16103957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165370
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972975
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctca 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  128 atctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399328
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  114 tgtaagtca 122  Q
    || ||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307830
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 32307788  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 168  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32307789 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251076
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  37251171 atctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaa 37251076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386533
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  129 tctcaaa 135  Q
    |||||||    
T  42386527 tctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083363
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172627
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110260
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||| ||||| | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110355 atctcaa-catcatatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaa 22110260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153211
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 24153229  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |||||||||||||||    
T  24153228 tgcaagtcaacaacatct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166716
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 36166694  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  36166695 tgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707651
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463296
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687006
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848655
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159444
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606951
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476609
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  114 tgtaagtcaacaacat 129  Q
    || |||||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424781
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781391
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899212
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442393
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454325
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487975
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499457
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961935
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668094
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926076 atctcaaacatcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151834
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154299
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544143
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513023
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520998
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247767
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567678
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  118 agtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446699
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || || ||||| |||| |||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841051
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572707
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  125 aacatct 131  Q
    |||||||    
T  14572701 aacatct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282855
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  116 taagtcaacaacatctcaa 134  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  12119789 tgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15412526  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  15412527 tgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618567
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 21618545  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21618546 tgcaagtcaacaacatctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340665
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124005
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  116 taagtcaacaacatctcaa 134  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242940
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274810
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  129 tctcaaa 135  Q
    |||||||    
T  23274804 tctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 8499615  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  8499616 tgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642207
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557105
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaa 10557082  T
Q  114 tgtaagtcaa-caacatctcaaa 135  Q
    || ||| ||| ||||||||||||    
T  10557083 tgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaa 44494906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070697
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  53070701 ctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576835
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtat-aaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 14576842  T
Q  125 aacatct 131  Q
    |||||||    
T  14576841 aacatct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465329
Alignment:
Q  120 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactg 1465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378050
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-tagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  128 atctcaaacatc 139  Q
    | || |||||||    
T  12378039 aacttaaacatc 12378050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  73 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  170 tatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaa 606332  T
Q  127 catctcaa 134  Q
    ||||||||    
T  606331 catctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644642
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||  || |||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaac 1644684  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 168  Q
    || |||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1644683 aatatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389573
Alignment:
Q  121 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 49389573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 944
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggc 959  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  958 ttactgaaacaacaa 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10739
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  126 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10641 acatctcaaacatcgaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaa 10739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706198
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaacatc-aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggc 39706213  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| |||||||||    
T  39706212 ttactaaaacaacaa 39706198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288118
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288217 caacatcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 12288120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551982
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatc 15551915  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     || |||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551916 gaaggtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243136
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  124 caacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13793
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  130 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798752
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798893
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873369
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198495
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  125 aacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    || |||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 43198495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082060
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 53082060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774160
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 168  Q
      || |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280435
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaa 16377543  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16377542 tgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902876
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || ||||| ||| ||||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215318
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928923
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12351
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893822
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118396
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773131
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312628
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640367
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 222  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  46640459 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaa 46640367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242817
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  108 atcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837553
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515125
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270238
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16270259  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  16270258 aaatgcaagttaacaacatct 16270238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239463
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615406
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222383
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463912
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846550
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgata-------------- 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |                  
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  101 --taacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 8846550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  116 taagtcaacaacatctcaa 134  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096385
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  114 tgtaagtcaacaac 127  Q
    || || ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900009
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatc 6899988  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6899989 aaatgcaagtcaacaacatct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239972
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16239993  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16239992 aaatgcaagtcaacaacatct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052948
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596813
Alignment:
Q  49 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  149 ctcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636554
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatct 131  Q
     || || ||| ||||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574867
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 8574889  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8574888 tgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355380
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  118 agtcaa 123  Q
    ||||||    
T  15355385 agtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374361
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || |    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  118 agtcaacaacatct 131  Q
    | ||||||||||||    
T  23374374 attcaacaacatct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102332
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44102311  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  44102312 tgcaagtaaacaacgtctcaa 44102332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099551
Alignment:
Q  120 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 15099551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190518
Alignment:
Q  120 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 15190518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053323
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367800
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15367787  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||| |||||||    
T  15367788 aaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15370115  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||| |||||||    
T  15370116 aaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15371299  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||| |||||||    
T  15371300 aaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15373580  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||| |||||||    
T  15373581 aaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402813
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15402800  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||| |||||||    
T  15402801 aaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223642
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16223629  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
     |||| |||||||    
T  16223630 taatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815629
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  21815633 ctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  92 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 20149929  T
Q  117 aagtcaa 123  Q
    |||||||    
T  20149930 aagtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353955
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| |||||||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
     |  || |||||||| ||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaa 22353955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13151
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatc 13037  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13038 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggc 13136  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  13137 ttactgaaacaacaa 13151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18146
Alignment:
Q  94 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  194 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
     |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaa 18146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6747
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 209  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcagg 6731  T
Q  210 cttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  6732 cttactgaaacaacaa 6747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8589
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  126 acatctcaaa 135  Q
    ||||||||||    
T  8580 acatctcaaa 8589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6823
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 6709  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||| | || |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  6710 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 6808  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| |||||||||    
T  6809 ttactaaaacaacaa 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14203
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 14089  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||| | || |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14090 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 14188  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| |||||||||    
T  14189 ttactaaaacaacaa 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12978
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 12864  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 210  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggc 12963  T
Q  211 ttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||| ||||||||    
T  12964 ttactggaacaacaa 12978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921778
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aaca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 22921790  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  22921789 ctgaaacaacaa 22921778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861474
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  130 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaatag 228  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatag 21861475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681185
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 33681105  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
     |||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33681106 gaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 33681185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896164
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  130 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaa 21896164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237805
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 22237725  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22237726 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacat 22237805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  127 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248454
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | || |||||||   || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |||||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754198
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 168  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21754157 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614031
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaa 218  Q
    ||||||||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  50614120 atctcaaacatcttttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaa 50614031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621859
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaa 218  Q
    ||||||||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  50621948 atctcaaacatcttttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaa 50621859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261023
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  130 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686825
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaat-agttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaac 50686728  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50686729 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 50686825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13988984
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368195
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  129 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||| ||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctc-aacatcgtttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 16368195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923335
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593779
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927925
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||               
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat----------- 52927989  T
Q  126 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
     ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52927988 -catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 52927925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758828
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 190  Q
    ||||||| |||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758763 caacatcacaacattcatatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612430
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctca 133  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049944
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| ||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41050039 atctc-aacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 41049944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475131
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250731
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298254
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433128
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123119
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  114 tgtaagtcaacaa 126  Q
    || ||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532388
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
     | || || ||||||||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776806
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatc 20847177  T
Q  111 aaat 114  Q
    ||||    
T  20847176 aaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026799
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362035
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| |||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707325
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21707264  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21707265 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21707325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711867
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21711806  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 174  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21711807 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212917
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13212930  T
Q  111 aaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||| |||||||    
T  13212929 aaatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 15860080  T
Q  108 atcaaatgtaagtcaa 123  Q
    || ||||| |||||||    
T  15860079 attaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 21342187  T
Q  108 atcaaatgtaagtcaa 123  Q
    |||||||| |||||||    
T  21342188 atcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtc-aacaa 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaa 16093890  T
Q  127 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 192  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093889 catctcaaacatcataggt-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275419
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 16275429  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  16275428 tgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347068
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21347058  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  21347059 tgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 87  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    | || || ||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981606
Alignment:
Q  120 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 35981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261542
Alignment:
Q  120 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactg 49261542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  64 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  164 tacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637051
Alignment:
Q  119 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 216  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactg 20637051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 40389254  T
Q  117 aagtcaa 123  Q
    |||||||    
T  40389255 aagtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||  | ||| | || ||||| |||| |||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatct 131  Q
      || || ||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161921
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca-aaacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 214  Q
    | || ||| |||| ||   | |||| |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| ||    
T  21161818 gcaattcatcaacttc-atatcatc-aacataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcac 21161914  T
Q  215 tgaaaca 221  Q
    || ||||    
T  21161915 tggaaca 21161921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065107
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  131 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||| |||| | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  87 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 134
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  97 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5855
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  5756 aacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaac 5853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19476
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggtta 19464  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  19465 ctgaaacaacaa 19476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100586
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatat-taacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggctta 100574  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  100575 ctgaaacaacaa 100586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40083
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggctta 40095  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  40094 ctgaaacaacaa 40083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94529
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17484
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  118 agtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 84  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 88  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176062
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 25176050  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  25176051 ctgaaacaacaa 25176062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7641
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  130 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 7641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 179  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406189
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  116 taagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttac 214  Q
     || |||||||||||||||| |||||   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaa--cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttac 28406178  T
Q  215 tgaaacaacaa 225  Q
    | |||||||||    
T  28406179 taaaacaacaa 28406189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786811
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    |||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  18786910 caacgtcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaac 18786813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105531
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298816
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    || || || ||| | |||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060632
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 23071972  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||| ||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071971 gaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726113
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337238
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076561
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||| ||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207490
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||| ||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  23207395 atctcaa-cattataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaa 23207490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791487
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23791391 atctcaaacattatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 23791487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571515
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809061
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23130980
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133447
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135708
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709576
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712057
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505497
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26507975
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402566
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682431
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214965
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367892
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577217
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||| ||||||| ||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671998
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19671928  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     || | |||| |||||||||||||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731238
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    || || || ||| ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109101
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaat 25109004  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25109005 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 25109101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38136
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155104
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||     
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  117 aagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898239
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900722
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903199
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905676
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908151
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039542
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285942
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137417
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  116 taagtcaacaacatctcaa 134  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660141
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatc 23660120  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  23660121 aaatgcaaatcaacaacatct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029898
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520145
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520197 atctcaaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738182
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatct 22738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatc 23103420  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||  || ||| |||||||||||    
T  23103419 aaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529573
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 24529594  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  24529593 tgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946735
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  126 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413141 acatctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134208
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||     
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcg 22134229  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctca 133  Q
    |||| || |||| |||||||||    
T  22134228 aatgcaa-tcaataacatctca 22134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967493
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  || ||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaa 38967471  T
Q  114 tgtaagtcaa-caacatctcaa 134  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  38967472 tgcaagtcaatcaacatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 75  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654388
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451949
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697548
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697610 atctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004878
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaa-tagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23004865  T
Q  128 atctcaaacatca 140  Q
    |||||||||||||    
T  23004866 atctcaaacatca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459514
Alignment:
Q  97 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatat-aactcaagtaatgtatatacaattatatcacatta 22459514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616304
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || |    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  118 agtcaacaacatct 131  Q
    | ||||||||||||    
T  25616291 attcaacaacatct 25616304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8227
Alignment:
Q  91 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  191 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaa 8227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6989
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 6924  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
    ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6925 aa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatta 6989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1294
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 214  Q
      | |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| |||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaaacatcaaacat-aattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttac 1283  T
Q  215 tgaaacaacaa 225  Q
    || ||||||||    
T  1284 tggaacaacaa 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2555
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatg-taaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 2566  T
Q  214 ctgaaacaaca 224  Q
    |||||||||||    
T  2565 ctgaaacaaca 2555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10484
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  126 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10548 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 10484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7983
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 223  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8081 caacatcacaa-catcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 7984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29238
Alignment:
Q  58 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  158 tgtatatacaattatataacat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29259 tgtatatacaattatataacat 29238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22613
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  126 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22677 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 22613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82190
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45735
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160861
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacat 160861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501202
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  118 agtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||||||| ||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85635
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 85645  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  85644 tgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130072
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130018 aacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacatt 130072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60710
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaac 60721  T
Q  128 atctcaaacat 138  Q
    |||||||||||    
T  60720 atctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 133 - 307
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14606
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggctta 14618  T
Q  214 ctgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  14617 ctgaaacaacaa 14606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15826
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11457
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2162
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 67  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62407
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |||| |   ||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatg-aaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  129 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattat-acaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  62312 tctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaa 62407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136798
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139267
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144205
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134329
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141736
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132765
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  115 gtaa 118  Q
    ||||    
T  132762 gtaa 132765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6191
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128878
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  129 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatat-aattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaa 128878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78534
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  132 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  78443 caa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 78534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116548
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaa 116526  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  116527 tgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136276
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt-agattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  136372 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 136276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144984
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt-agattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145080 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 144984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||  || |||||||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44705
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  118 agtcaacaacatctcaa 134  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38700
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3149
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 3174  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  3173 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12780
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  130 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    |||||| | | | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || ||||||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatat-aattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaa 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27744
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  126 acatctcaaacat 138  Q
    |||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15763
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 15800  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataa 147  Q
     |||| |||||| || ||||  | |||||||||||||    
T  15799 gaatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38530
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  132 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||| | || || |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38438 caaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 38530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2799
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  115 gtaagtcaacaacatctcaaacatca 140  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatca 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaaaccagcatgatataacaatat 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  110 caaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  79332 ctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16095
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  126 acatctcaaacat 138  Q
    |||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13252
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  130 ctcaaac 136  Q
    || ||||    
T  13246 ctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103547
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aac 103641  T
Q  125 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 224  Q
    ||||      |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  103640 aaca------acatcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 103548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39599
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 39576  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  39577 atgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53491
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  130 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 53491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75213
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 75236  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  75235 atgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1155
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  130 ctcaaa 135  Q
    ||||||    
T  1150 ctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34288
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatc 34221  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34222 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  61 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52032
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167980
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32959
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 32980  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  32979 aattgcaattcaacaacatct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46046
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 46025  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  46026 aattgcaattcaacaacatct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25275
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  124 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25219 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  94 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19793
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||| | ||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  19888 atctc-agcatcataaat-aactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaa 19793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40031
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 40010  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  40011 aaatgcatgtcaataacatct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97219
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||    
T  97123 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaa 97219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106497
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||    
T  106401 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaa 106497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2127
Alignment:
Q  69 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 168  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  169 ttatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 2127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23001
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |||||||||||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13510
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20865
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13330
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37939
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158494
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 339969  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  339968 t-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8605
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 138  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4812
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3589
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 343 - 461
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatc 440  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
T  441 aattggaagtcaacaacatct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14065
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33060
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 33039  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  33040 aaatgcaagttaacaacatct 33060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9867
Alignment:
Q  9 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  109 tcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38879
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38858  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| || | ||||||||||    
T  38859 aaatgcaaataaacaacatct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16902
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1970
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8535
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatc 8556  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  8555 aattgcaagtcaacatcatct 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23901
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 23906  T
Q  111 aaatg 115  Q
     ||||    
T  23905 gaatg 23901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1050
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4630
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12212
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22164
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40518
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26018
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 25993  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25994 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39980
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 39955  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  39956 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6123
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  109 tcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| || || ||| ||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32205
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 114  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  115 gtaa 118  Q
    ||||    
T  32202 gtaa 32205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| |||||||| | || |||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  112 aatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || |  || ||||||||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4321
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  4312 tgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30050
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 30028  T
Q  113 atgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  30029 gtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 224
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267872
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 224  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || |||||||||||||||||||    
T  267778 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaaca 267872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4803
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 54 - 218
Alignment:
Q  61 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  159 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaa 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8001
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  130 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
    || |||||| || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacat 8001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24304
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  24307 atct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1359
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7338
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||     
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  117 aagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1703
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaata 227  Q
    ||||||| ||||| | ||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1801 atctcaa-catcatatataattt-atgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaata 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16382
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  111 aaat 114  Q
    ||||    
T  16379 aaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17969
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 191  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2194  T
Q  114 tgtaagtcaa 123  Q
    || |||||||    
T  2193 tgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 106 - 224
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2071
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51654
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13575
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 90  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32137
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Original strand, 569 - 762
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 666  T
Q  128 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 225  Q
    ||| | ||||||| | || || |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  667 atc-ccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12176
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  114 tgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15485
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161133
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  114 tgtaagtcaa-caacatctcaa 134  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4643
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaa 88  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
Q  117 aagtcaa 123  Q
    |||||||    
T  1342 aagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11464
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  111 aa 112  Q
    ||    
T  11465 aa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1098
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20423
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  130 ctcaa 134  Q
    |||||    
T  20427 ctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128869
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  |   |||| |||||||| |||| ||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatc 128848  T
Q  111 aaatgtaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  128849 aaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5183
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 77  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2780
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 191
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  69 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 167  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  168 attatataacattaacaacaacat 191  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  75 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 134  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 65  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2398
Alignment:
Q  87 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  98 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 181  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 135
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  93 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 135  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  97 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 193  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University