View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15347_low_7 (Length: 369)

Name: NF15347_low_7
Description: NF15347
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15347_low_7
NF15347_low_7
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (1-360)||(16744016-16744377)
chr3 (26-349)||(13838905-13839232)
chr3 (99-360)||(17912483-17912744)
chr3 (26-360)||(14842487-14842824)
chr3 (26-360)||(2049810-2050147)
chr3 (26-360)||(12030073-12030410)
chr3 (73-360)||(15858996-15859287)
chr3 (99-264)||(2449238-2449404)
chr3 (89-361)||(51158008-51158282)
chr3 (106-360)||(15936634-15936890)
chr3 (3-161)||(19231982-19232144)
chr3 (106-357)||(15938476-15938729)
chr3 (99-231)||(13975722-13975853)
chr3 (26-145)||(19260749-19260869)
chr3 (99-231)||(45860937-45861068)
chr3 (99-231)||(13954890-13955021)
chr3 (143-356)||(15614838-15615053)
chr3 (111-231)||(55316351-55316471)
chr3 (133-360)||(16821139-16821369)
chr3 (111-231)||(41270207-41270327)
chr3 (251-360)||(47984650-47984759)
chr3 (251-360)||(48003224-48003333)
chr3 (251-360)||(47993937-47994046)
chr3 (251-360)||(48012510-48012619)
chr3 (3-57)||(17955861-17955916)
chr3 (1-57)||(3992873-3992930)
chr3 (115-156)||(14080715-14080756)
chr3 (1-57)||(55513193-55513250)
chr3 (1-60)||(15857138-15857198)
chr3 (1-57)||(45581954-45582012)
chr3 (1-57)||(2844514-2844571)
chr3 (106-196)||(11986173-11986263)
chr3 (243-360)||(12264932-12265049)
chr3 (5-57)||(54038003-54038056)
chr3 (106-195)||(54651625-54651714)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (99-360)||(22907214-22907476)
chr8 (26-361)||(16193643-16193980)
chr8 (26-349)||(24928716-24929043)
chr8 (1-360)||(16404875-16405235)
chr8 (26-360)||(43373392-43373731)
chr8 (99-264)||(5238184-5238350)
chr8 (99-264)||(24661248-24661414)
chr8 (99-264)||(43685643-43685809)
chr8 (99-349)||(17345581-17345832)
chr8 (111-356)||(6774258-6774505)
chr8 (111-356)||(24548986-24549233)
chr8 (115-231)||(21844576-21844692)
chr8 (115-231)||(21851969-21852085)
chr8 (111-231)||(30120854-30120974)
chr8 (111-231)||(16674392-16674512)
chr8 (1-57)||(274766-274823)
chr8 (1-57)||(641026-641083)
chr8 (1-57)||(826832-826889)
chr8 (1-57)||(24716737-24716794)
chr8 (174-360)||(222754-222943)
chr8 (174-360)||(736377-736566)
chr8 (174-360)||(860272-860461)
chr8 (249-343)||(23837214-23837308)
chr8 (115-156)||(23149985-23150026)
chr8 (115-156)||(23226076-23226117)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (99-360)||(26680201-26680463)
chr4 (1-360)||(54118143-54118507)
chr4 (26-360)||(13246430-13246769)
chr4 (26-360)||(15675009-15675352)
chr4 (26-231)||(122020-122226)
chr4 (99-264)||(10488659-10488825)
chr4 (99-264)||(16327926-16328092)
chr4 (126-360)||(31115629-31115865)
chr4 (26-296)||(10104170-10104449)
chr4 (99-231)||(13048221-13048353)
chr4 (26-161)||(33240901-33241043)
chr4 (115-360)||(10644219-10644467)
chr4 (111-360)||(47357654-47357906)
chr4 (262-360)||(111395-111493)
chr4 (115-296)||(40885570-40885753)
chr4 (1-57)||(25119082-25119139)
chr4 (249-343)||(41166083-41166177)
chr4 (315-360)||(10104449-10104494)
chr4 (26-131)||(31132545-31132657)
chr4 (249-336)||(15044851-15044938)
chr4 (5-57)||(5682407-5682460)
chr4 (114-231)||(7850131-7850248)
chr4 (249-361)||(52265645-52265758)
chr4 (116-156)||(13809511-13809551)
chr4 (249-313)||(13809647-13809711)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (99-360)||(37066-37328)
scaffold0078 (1-57)||(41632-41689)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (99-360)||(7293017-7293279)
chr7 (1-360)||(3059966-3060328)
chr7 (26-358)||(16211768-16212103)
chr7 (26-360)||(13036938-13037277)
chr7 (26-355)||(11580661-11580997)
chr7 (99-264)||(11516324-11516490)
chr7 (99-264)||(15441564-15441730)
chr7 (99-264)||(30262129-30262295)
chr7 (26-360)||(36052667-36053003)
chr7 (99-360)||(47481031-47481294)
chr7 (106-360)||(18253842-18254098)
chr7 (100-360)||(13321014-13321278)
chr7 (117-360)||(16478968-16479213)
chr7 (99-231)||(25292338-25292470)
chr7 (115-231)||(13572808-13572924)
chr7 (111-231)||(10989541-10989661)
chr7 (34-227)||(295900-296094)
chr7 (110-230)||(2437590-2437710)
chr7 (111-223)||(13911024-13911136)
chr7 (99-141)||(14113989-14114031)
chr7 (99-141)||(14423639-14423681)
chr7 (1-57)||(32493921-32493978)
chr7 (3-57)||(126738-126793)
chr7 (1-57)||(1936892-1936949)
chr7 (115-195)||(16914928-16915009)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-360)||(41394222-41394584)
chr1 (26-360)||(20445679-20446019)
chr1 (38-360)||(20531444-20531770)
chr1 (26-360)||(20931345-20931682)
chr1 (26-360)||(37844374-37844714)
chr1 (26-360)||(20893551-20893889)
chr1 (26-360)||(20913037-20913367)
chr1 (99-264)||(51452589-51452755)
chr1 (111-356)||(2116258-2116506)
chr1 (110-360)||(22227809-22228061)
chr1 (110-360)||(22232506-22232758)
chr1 (111-231)||(45051554-45051674)
chr1 (111-231)||(5072388-5072508)
chr1 (111-231)||(18601118-18601238)
chr1 (1-57)||(21860334-21860391)
chr1 (1-57)||(44034846-44034903)
chr1 (115-156)||(22143361-22143402)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-360)||(19794604-19794967)
chr2 (26-360)||(36982364-36982704)
chr2 (1-360)||(43642856-43643220)
chr2 (26-355)||(462743-463075)
chr2 (1-360)||(20627213-20627576)
chr2 (32-360)||(8891242-8891574)
chr2 (99-264)||(19689401-19689567)
chr2 (99-264)||(23820168-23820334)
chr2 (99-264)||(14906440-14906606)
chr2 (26-360)||(24341309-24341652)
chr2 (99-264)||(20015108-20015274)
chr2 (99-360)||(25265390-25265653)
chr2 (99-231)||(17396653-17396784)
chr2 (149-360)||(7507894-7508107)
chr2 (26-121)||(22863169-22863267)
chr2 (111-360)||(19886661-19886913)
chr2 (3-57)||(22284278-22284333)
chr2 (1-57)||(22275045-22275102)
chr2 (1-56)||(15633538-15633594)
chr2 (283-343)||(9636761-9636821)
chr2 (283-327)||(24884718-24884762)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (26-360)||(1124-1462)
scaffold0266 (26-358)||(3508-3843)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (26-360)||(48598-48935)
scaffold0023 (133-231)||(36225-36323)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (25-360)||(36836-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (34-360)||(19206-19537)
scaffold0195 (99-360)||(21290-21553)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (26-349)||(171916-172242)
scaffold0001 (26-349)||(177619-177945)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (26-360)||(23506965-23507302)
chr5 (26-360)||(27182471-27182810)
chr5 (26-360)||(18530988-18531330)
chr5 (99-264)||(20623066-20623232)
chr5 (99-264)||(21233528-21233694)
chr5 (26-360)||(22053753-22054096)
chr5 (99-261)||(37052844-37053007)
chr5 (99-264)||(16536294-16536460)
chr5 (101-264)||(25900408-25900571)
chr5 (99-349)||(34939289-34939540)
chr5 (111-231)||(29188284-29188404)
chr5 (115-229)||(27009975-27010089)
chr5 (111-360)||(4199985-4200237)
chr5 (111-360)||(22366481-22366733)
chr5 (111-360)||(25426628-25426880)
chr5 (114-360)||(18777995-18778244)
chr5 (111-360)||(12374-12626)
chr5 (114-231)||(43443398-43443515)
chr5 (111-231)||(19500031-19500151)
chr5 (111-360)||(21073595-21073847)
chr5 (249-360)||(23493917-23494029)
chr5 (115-336)||(23981516-23981740)
chr5 (106-196)||(32950861-32950951)
chr5 (115-156)||(21310709-21310750)
chr5 (115-195)||(29918131-29918212)
chr5 (249-313)||(7728466-7728530)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (26-356)||(41733-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (26-360)||(882-1218)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (26-349)||(23153458-23153786)
chr6 (70-356)||(14626089-14626377)
chr6 (99-360)||(35009439-35009702)
chr6 (99-349)||(1657748-1657999)
chr6 (99-349)||(15862484-15862734)
chr6 (111-356)||(1650105-1650352)
chr6 (111-360)||(25175563-25175815)
chr6 (26-94)||(23148266-23148335)
chr6 (111-360)||(27653983-27654235)
chr6 (257-360)||(27740838-27740941)
chr6 (99-182)||(27751605-27751688)
chr6 (111-231)||(16825752-16825874)
chr6 (99-296)||(29665937-29666137)
chr6 (1-57)||(19983167-19983224)
chr6 (1-57)||(35015032-35015089)
chr6 (250-343)||(18381821-18381914)
chr6 (115-156)||(16887792-16887833)
chr6 (115-195)||(18629608-18629689)
chr6 (115-156)||(33324898-33324939)
chr6 (115-156)||(35136013-35136054)
chr6 (273-360)||(22361926-22362014)
chr6 (249-313)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (26-360)||(12115-12450)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-354)||(272031-272362)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (26-349)||(247366-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (26-360)||(128095-128431)
scaffold0008 (133-223)||(31697-31787)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-360)||(5990-6326)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (38-231)||(51121-51314)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (35-360)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (26-360)||(26340-26678)
scaffold0162 (99-360)||(8180-8440)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (99-264)||(26892-27058)
scaffold0141 (106-264)||(22637-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (99-264)||(1582-1748)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (26-360)||(123087-123427)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (26-360)||(8878-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (37-360)||(8849-9180)
scaffold0025 (67-360)||(148721-149018)
scaffold0025 (26-125)||(146838-146938)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (26-231)||(89378-89586)
scaffold0028 (26-150)||(107708-107835)
scaffold0028 (115-156)||(79745-79786)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (106-360)||(48187-48443)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (99-360)||(13506-13769)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (106-360)||(107747-108003)
scaffold0026 (115-231)||(64527-64648)
scaffold0026 (114-156)||(89863-89905)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (99-360)||(41648-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (99-360)||(534-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (106-231)||(5660-5785)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (99-360)||(34460-34724)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (110-356)||(2966-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (133-356)||(9371-9596)
scaffold0215 (133-356)||(16269-16494)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-231)||(13325-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (115-231)||(167-283)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (149-360)||(5254-5466)
scaffold0022 (116-156)||(102923-102963)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (149-360)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (134-360)||(42997-43226)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (111-231)||(1304-1424)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (262-360)||(9382-9480)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (133-231)||(14083-14181)
scaffold0139 (110-228)||(21115-21233)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (149-360)||(54416-54630)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (99-188)||(3364-3453)
scaffold0361 (306-358)||(3210-3262)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (106-224)||(56106-56226)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (5-57)||(80187-80240)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-58)||(162053-162111)
scaffold0016 (1-58)||(166139-166197)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-57)||(5752-5809)
scaffold0686 (1-57)||(5958-6015)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (115-156)||(1546-1587)
scaffold0456 (115-156)||(8691-8732)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-57)||(31155-31212)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (115-156)||(8216-8257)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (271-360)||(48514-48603)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (115-156)||(70307-70348)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (115-336)||(22422-22646)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (249-336)||(197390-197477)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (115-153)||(1348-1386)
scaffold0409 (115-153)||(9603-9641)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (5-58)||(331-385)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (283-360)||(104793-104871)
scaffold0032 (115-156)||(93773-93814)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (282-343)||(2471-2532)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (106-224)||(10338-10458)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (272-336)||(2548-2612)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (116-156)||(10868-10908)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 16744016 - 16744377
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744016 gctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 16744115  T
Q  100 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16744116 tggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaa 16744215  T
Q  200 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgat 298  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744216 tatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgat 16744315  T
Q  299 gctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16744316 gctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 123  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  124 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  224 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 321  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  322 aatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 297  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  298 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 360
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859287
Alignment:
Q  73 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 170  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  171 atgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 268  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  269 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 361
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  89 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaatt 188  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  189 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 286  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  287 gatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgt 361  Q
    |||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 303  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  304 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19232144 - 19231982
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--att 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||     
T  19232144 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcata 19232045  T
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232044 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 357
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 303  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  304 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatg 357  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  125 tccaactttgatgatatgttt 145  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955021
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgc 13955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614838
Alignment:
Q  143 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||  ||| | |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  242 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 340  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  341 atattcatggattgat 356  Q
    ||||||||| ||||||    
T  15614853 atattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316351
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821139
Alignment:
Q  133 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  232 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 329  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  330 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270207
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  251 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 350  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  351 attgatgatg 360  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  251 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 350  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  351 attgatgatg 360  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  251 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 350  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  351 attgatgatg 360  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  251 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 350  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  351 attgatgatg 360  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3992930 - 3992873
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992930 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 55513250 - 55513193
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513250 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 15857138 - 15857198
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 60  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857138 gctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 45582012 - 45581954
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582012 gctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2844571 - 2844514
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844571 gctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986263
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 11986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 360
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265049
Alignment:
Q  243 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 342  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  343 attcatggattgatgatg 360  Q
    | | ||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 54038003 - 54038056
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54038003 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54651714 - 54651625
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| ||||||    
T  54651714 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 297  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  298 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  26 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  126 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  226 ttgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 323  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||    
T  16193843 ttgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaa 16193942  T
Q  324 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgt 361  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16193943 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  26 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  124 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 223  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  224 aattgtgc-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 321  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  322 aatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 16404875 - 16405235
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16404875 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcat 16404973  T
Q  98 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttta 197  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  16404974 gatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 16405073  T
Q  198 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 295  Q
    |||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16405074 aataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttatt 16405170  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16405171 gttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 308  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  309 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 308  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  309 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844692
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 214  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  215 agttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852085
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 214  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  215 agttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120854
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 274823 - 274766
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274823 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 641026 - 641083
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641026 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 826832 - 826889
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826832 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 24716737 - 24716794
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716737 gctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  174 attgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 270  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  271 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  174 attgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 270  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  271 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  174 attgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 270  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  271 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 343  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 297  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  298 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 54118143 - 54118507
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  54118143 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcat 54118242  T
Q  98 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttta 197  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  54118243 aatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 54118342  T
Q  198 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 295  Q
    |||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  54118343 aataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttata 54118442  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  54118443 gttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  119 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  219 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 316  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  317 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  225 attgtgc 231  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  126 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  226 ttgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 323  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  324 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104449
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  119 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 218  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  219 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048353
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  119 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 214  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||  |    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  215 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 311  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  312 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  262 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 296
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 213  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  214 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 25119082 - 25119139
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119082 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 343
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 343  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 360
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  315 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  119 tcgtgctccaact 131  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 336  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 5682407 - 5682460
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682407 gagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7850248 - 7850131
Alignment:
Q  114 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgag 213  Q
    ||||||||||||||||    |||| |||||||| ||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||  ||||  ||||  || |||||  ||||| |    
T  7850248 taaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtg 7850149  T
Q  214 aagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7850148 aagttatgaaaattgtgc 7850131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 347  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  348 tggattgatgatgt 361  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809551
Alignment:
Q  116 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 13809551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 313  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 297  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  298 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 41689 - 41632
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41689 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 297  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  298 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3060328 - 3059966
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3060328 gctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgctta 3060229  T
Q  100 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| ||||| |||||| |||    
T  3060228 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaa 3060129  T
Q  200 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
    |||||| |||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |      
T  3060128 tatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatga 3060030  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  3060029 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 358  Q
     |||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  121 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 220  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  221 gaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttg 318  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  319 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattga 355  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 295  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | |  |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 303  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  304 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  100 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--a 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  198 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 294  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  295 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 360
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479213
Alignment:
Q  117 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaag 216  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  217 ttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgta 314  Q
    || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | ||||||||     
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgtt 16479167  T
Q  315 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16479168 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572808
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 214  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  215 agttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||||| |||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989541
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296094
Alignment:
Q  34 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 131  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  132 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaatt 227  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437590
Alignment:
Q  110 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 209  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  210 tgagaagttatgaaaattgtg 230  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911136
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  211 gagaagttatgaa 223  Q
    || ||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 141
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 141
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 32493921 - 32493978
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493921 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 126793 - 126738
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126793 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 1936892 - 1936949
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 57  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936892 gctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915009
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 195  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 16915009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41394584 - 41394222
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394584 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 41394485  T
Q  100 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  41394484 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaa 41394385  T
Q  200 tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 297  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  ||||||||||| |||     
T  41394384 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgt 41394285  T
Q  298 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394284 tgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  26 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  122 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  222 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 319  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  320 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531444
Alignment:
Q  38 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttga 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  136 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaa 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  235 tggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttg 333  Q
    | | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531570 ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttg 20531471  T
Q  334 ggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20531470 ggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tg 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  222 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 319  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  320 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 2116307  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2116306 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227809
Alignment:
Q  110 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 209  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  210 tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22227862  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22227861 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232506
Alignment:
Q  110 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 209  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  210 tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22232559  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22232558 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051554
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072508
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601238
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21860391 - 21860334
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860391 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 44034846 - 44034903
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034846 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143402
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaa 22143402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 19794604 - 19794967
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||    
T  19794604 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcat 19794702  T
Q  98 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttta 197  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19794703 aatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 19794802  T
Q  198 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 295  Q
    |||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19794803 aataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatt 19794902  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
       | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794903 tccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  122 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  222 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 319  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  320 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 43642856 - 43643220
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  43642856 gctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcat 43642955  T
Q  98 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttta 197  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  43642956 agtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 43643055  T
Q  198 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 295  Q
    |||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||    
T  43643056 aataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctatt 43643155  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43643156 gctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  225 attgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 321  Q
    ||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  ||||||    
T  462875 attgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  322 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattga 355  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 20627213 - 20627576
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgatt 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20627213 gctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgatt 20627312  T
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||    
T  20627313 atggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaa 20627412  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| || | |    
T  20627413 atatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatgg 20627512  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  20627513 ttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891242
Alignment:
Q  32 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaa 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  130 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 229  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  230 gc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 327  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8891374 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcat 8891275  T
Q  328 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  8891274 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  119 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 218  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  219 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 316  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  317 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 246  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  247 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 344  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  345 tcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22284333 - 22284278
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284333 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22275102 - 22275045
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275102 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 15633594 - 15633538
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 56  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633594 gctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  283 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 343  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  283 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  124 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  224 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 321  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  322 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  225 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 358  Q
    || || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36225
Alignment:
Q  133 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 360
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  122 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  222 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 319  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  320 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19206
Alignment:
Q  34 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaac 130  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  131 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  231 c-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 328  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||     
T  19337 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcatt 19238  T
Q  329 gtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19237 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  120 cgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  220 tgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 316  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  317 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  119 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  219 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 316  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  317 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 261  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  101 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  201 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009975
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 214  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  215 agttatgaaaattgt 229  Q
    ||||||||| |||||    
T  27009989 agttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 360
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  114 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgag 213  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  214 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 310  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| |    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  311 tgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443515
Alignment:
Q  114 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgag 213  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  214 aagttatgaaaattgtgc 231  Q
    |||||||||| |||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500031
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 347  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  348 tggattgatgatg 360  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 336
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981740
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa-tatgtagaaatga 212  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||  |||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||     
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 23981615  T
Q  213 gaagttatgaaaattgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 311  Q
     || |||||||   ||  ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  23981616 taacttatgaattatgctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 23981715  T
Q  312 gtagttgatgaatcatcgtttgggt 336  Q
    || |||||||| |||| | ||||||    
T  23981716 gttgttgatgattcatggcttgggt 23981740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950861
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 32950861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310750
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaa 21310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918131
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 195  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 29918131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 313  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  223 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 356
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626377
Alignment:
Q  70 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 169  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  170 tatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattga 266  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttga 14626287  T
Q  267 gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  14626288 gatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 349
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650352
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 308  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  309 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 94  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 307  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  308 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  257 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  357 gatg 360  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 182  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825874
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgta--tgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaa 208  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  | ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  209 atgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    |||| |||||||||| |||||||    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgc 16825874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt-- 196  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  197 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 294  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  295 tg 296  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 19983167 - 19983224
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983167 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 35015032 - 35015089
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015032 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  250 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 343  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887833
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaa 16887833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629689
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 195  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 18629689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324898
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 33324898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136054
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 35136054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 360
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  273 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 360  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 313  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  124 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 223  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  224 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 321  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  322 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattg 354  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  223 aaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 320  Q
    ||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  321 gaatcatcgtttgggtatacatattcatg 349  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  225 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31787
Alignment:
Q  133 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 31787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  38 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatg 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  138 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  35 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaacttt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  134 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 232  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  233 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 331  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  332 tgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  124 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  224 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 321  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  322 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8440
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 264  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  122 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  222 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 319  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  320 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  125 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  225 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 322  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  323 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8849
Alignment:
Q  37 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaattcgtgctccaac 130  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  131 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  231 c-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 328  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||     
T  8980 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcatt 8881  T
Q  329 gtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8880 gcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148721
Alignment:
Q  67 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  165 aagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaa 262  Q
    || |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| |     
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  263 ttgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  125 t 125  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 222  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  223 aaattgtgc 231  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  26 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  123 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 150  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79745
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 79745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 303  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  304 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 303  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  304 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64648
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 209  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     ||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  210 tgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||| |||||||||| |||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 156
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  114 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 295  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 296  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  297 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  206 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  199 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgtt 295  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  296 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    | || || | |||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  110 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 209  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  210 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 306  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  307 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 356
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9596
Alignment:
Q  133 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  232 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 330  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  331 ttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 356
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16494
Alignment:
Q  133 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  232 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 330  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  331 ttgggtatacatattcatggattgat 356  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13445
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 167
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 214  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  215 agttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||||| | |||||||    
T  183 agttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-ttt 245  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  246 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 345  Q
    |    ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  346 catggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 102923 - 102963
Alignment:
Q  116 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 102963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgt-agaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-ttt 245  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||| | |||| |||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  246 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 345  Q
    |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  346 catggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42997
Alignment:
Q  134 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 232  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  233 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 330  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  331 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  211 gagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  262 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  133 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 231  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21233
Alignment:
Q  110 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 209  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  210 tgagaagttatgaaaattg 228  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  21215 tgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54416
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 245  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  246 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 344  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  345 tcatggattgatgatg 360  Q
    | ||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3364
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaatt 188  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaatt 3364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3210
Alignment:
Q  306 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 358  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--aaatatg 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  204 tagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 80240 - 80187
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80240 gagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 162053 - 162111
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162053 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 166139 - 166197
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166139 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 5752 - 5809
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5752 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 5958 - 6015
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5958 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 31155 - 31212
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31155 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  271 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 336
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22646
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt-taaatatgtagaaatga 212  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||  |||||||| || || ||||||  ||||||||| |||||     
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgc 22521  T
Q  213 gaagttatgaaaattgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 311  Q
     || |||||||   ||  |||||   |||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||| || |||  |||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  22522 taacttatgaattatgctcaaattattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgatatt 22621  T
Q  312 gtagttgatgaatcatcgtttgggt 336  Q
    || ||||| || |||| ||||||||    
T  22622 gttgttgaagattcatagtttgggt 22646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 336
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197477
Alignment:
Q  249 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 336  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 197477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 153
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1386
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 153  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 153
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9641
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 153  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 9641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 331 - 385
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 58  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  331 gagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 360
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  283 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 360  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93814
Alignment:
Q  115 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaa 93814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  282 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 10338 - 10458
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--aaatatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| |||||||  || ||||    
T  10338 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 10437  T
Q  204 tagaaatgagaagttatgaaa 224  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  10438 tataaatgctaagttatgaaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  272 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10868
Alignment:
Q  116 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaa 10868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University