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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15351_low_1 (Length: 918)

Name: NF15351_low_1
Description: NF15351
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15351_low_1
NF15351_low_1
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (16-900)||(43365261-43366145)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 852; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 852; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 900
Target Start/End: Original strand, 43365261 - 43366145
Alignment:
Q  16 aacctgtgtaatgcaattaaatgttattcaatcatatggcatcaacacaacaataactagcatgttggacacctaacttacaatgttggaaccacaaatt 115  Q
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T  43365261 aacctgtgtaatgcaattaaatgttattcaatcatatggcatcaacacaacaataactagcatgttggacacctaacttacaatgttggaaccacaaatt 43365360  T
Q  116 ttattaataaaattgaggcacacaattttgatgaaagcttccaattagggacctttaatgaaacacttacacgtttcttgatcagcactggtaaaacacg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43365361 ttattaataaaattgaggcacacaattttgatgaaagcttccaattagggacctttaattaaacacttacacgtttcttgatcagcactggtaaaacacg 43365460  T
Q  216 accctcgtagcatttgggggtgcatttccttggaacacgcactgtatatggagtcgcaaatttctctcccatatttggtagttgctttacaactcttatg 315  Q
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T  43365461 accctcgtagcatttgggggtgcatttccttggaacacgcactgtatatggagtcgcaaatttctctcccatatttggtagttgctttacaactcttatg 43365560  T
Q  316 tcattccggagggatgttataaaccaatcggcatcaaataattgagaaaaattgctgcaagaaaataataatcaaatattacttacaaattaaggggtac 415  Q
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T  43365561 tcattccggagggatgttataaaccaatcggcatcaaataattgagaaaaattgctgcaagaaaataataatcaaatattacttacaaattaaggggtac 43365660  T
Q  416 aatgaaaatgtgttctgctaccaaagaaaatattatatgtgatttaagagacattcttcctgatatgatagaagtaaattgtaaacacagacctgttgtc 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43365661 aatgaaaatgtgttctgctaccaaagaaaatattatatgtgatttaagagacattcttcctgatatgatagaagtaaattgtaaacacagacctgttgtc 43365760  T
Q  516 tttccagaaagatgtatgatccaatgctggaataacaagagtagcattcaaaagataggcagccacaacagcatcaattatctgcacccacaaacaatct 615  Q
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T  43365761 tttccagaaagatgtatgatccaatgctggaataacaagagtagcattcaaaagataggcagccacaacagcatcaattatctgcacccacaaacaatct 43365860  T
Q  616 gtattttttcaataccagaaatattgcatccacataacattatttatcattcatatttgtatcaccaatcattcatcaaattcgattgagaaaatcctaa 715  Q
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T  43365861 gtattttttcaataccagaaatattgcatccacataacattatttatcattcatatttgtatcaccaatcattcatcaaattcgattgagaaaatcctaa 43365960  T
Q  716 ttgagnnnnnnnagccgaacggcacatacaaaatctgtatatcaatcaccaatttgtgcagacctataattattgggtagaaatttcatcctatactttt 815  Q
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T  43365961 ttgagtttttttagccgaacggcacatacaaaatctgtatatcgatcaccaatttgtgcagacctataattattgggtagaaatttcatcctatactttt 43366060  T
Q  816 ttgcaaatgaccacggtcccactctatgaaataaagttatagcatattacatattacatgttttagattgcagcatagttatatt 900  Q
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T  43366061 ttgcaaatgaccagggtcccactctatgaaataaagttatagcatattacatattacatgttttagattgcagcatagttatatt 43366145  T

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