View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15352_low_3 (Length: 637)

Name: NF15352_low_3
Description: NF15352
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15352_low_3
NF15352_low_3
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (20-540)||(40017757-40018276)
chr2 (82-540)||(31626329-31626784)
chr2 (78-540)||(31528169-31528629)
chr2 (78-538)||(13709852-13710309)
chr2 (172-540)||(16294679-16295044)
chr2 (80-540)||(23673353-23673810)
chr2 (78-540)||(36326702-36327165)
chr2 (272-540)||(32575887-32576152)
chr2 (545-626)||(7703040-7703121)
chr2 (545-626)||(27150671-27150752)
chr2 (535-580)||(40016936-40016981)
chr2 (537-594)||(24479785-24479842)
chr2 (473-534)||(8426783-8426844)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (80-540)||(33574868-33575326)
chr5 (78-540)||(15532206-15532666)
chr5 (78-540)||(15542388-15542848)
chr5 (170-540)||(26712439-26712811)
chr5 (170-540)||(26982177-26982549)
chr5 (156-540)||(34405628-34406009)
chr5 (80-540)||(14616437-14616894)
chr5 (78-540)||(22159524-22159986)
chr5 (80-540)||(7649950-7650416)
chr5 (78-338)||(11988868-11989134)
chr5 (423-534)||(11989166-11989277)
chr5 (78-176)||(26711470-26711567)
chr5 (78-176)||(26981207-26981304)
chr5 (387-446)||(13371932-13371991)
chr5 (545-597)||(31571507-31571560)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (78-540)||(39563516-39563976)
chr3 (78-540)||(22626318-22626778)
chr3 (78-540)||(11138576-11139035)
chr3 (238-533)||(13979273-13979565)
chr3 (142-540)||(35366156-35366549)
chr3 (250-428)||(46731386-46731561)
chr3 (537-626)||(25338558-25338647)
chr3 (140-181)||(20536404-20536445)
chr3 (387-423)||(47412079-47412115)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (72-540)||(11279272-11279736)
chr7 (78-540)||(33312774-33313233)
chr7 (80-540)||(46846320-46846778)
chr7 (78-540)||(23759615-23760074)
chr7 (71-533)||(36222308-36222761)
chr7 (72-540)||(294644-295106)
chr7 (156-540)||(6966927-6967308)
chr7 (156-540)||(17866438-17866819)
chr7 (184-540)||(17863206-17863560)
chr7 (195-540)||(23107767-23108111)
chr7 (165-540)||(24783185-24783560)
chr7 (269-540)||(36843135-36843403)
chr7 (78-534)||(3861913-3862362)
chr7 (197-487)||(23313384-23313673)
chr7 (256-540)||(9765572-9765862)
chr7 (545-626)||(26620526-26620607)
chr7 (545-626)||(26618562-26618643)
chr7 (425-532)||(2719331-2719438)
chr7 (427-461)||(27796693-27796727)
chr7 (545-626)||(26607996-26608076)
chr7 (537-583)||(8248670-8248716)
chr7 (30-68)||(22796604-22796642)
chr7 (165-221)||(7227726-7227782)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (80-540)||(9642-10101)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (78-540)||(13017195-13017655)
chr6 (156-540)||(14790398-14790779)
chr6 (156-540)||(14795426-14795807)
chr6 (80-540)||(22221503-22221959)
chr6 (80-540)||(22247338-22247794)
chr6 (218-540)||(32704401-32704720)
chr6 (199-540)||(16883456-16883795)
chr6 (157-540)||(19664751-19665129)
chr6 (197-540)||(20527286-20527628)
chr6 (256-540)||(1838254-1838534)
chr6 (354-540)||(12983658-12983844)
chr6 (184-419)||(30978322-30978557)
chr6 (142-453)||(15534923-15535230)
chr6 (354-540)||(12980771-12980957)
chr6 (415-540)||(32427146-32427271)
chr6 (385-505)||(15538036-15538156)
chr6 (271-539)||(7769588-7769860)
chr6 (142-304)||(15540583-15540744)
chr6 (239-323)||(27649096-27649180)
chr6 (217-337)||(32427281-32427401)
chr6 (545-626)||(1943176-1943257)
chr6 (20-69)||(15870354-15870403)
chr6 (545-581)||(24631674-24631710)
chr6 (199-247)||(11183962-11184012)
chr6 (497-540)||(15534869-15534912)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (78-540)||(12171762-12172212)
chr4 (156-540)||(647288-647669)
chr4 (156-540)||(650560-650941)
chr4 (142-532)||(26062762-26063151)
chr4 (78-534)||(2541670-2542122)
chr4 (263-540)||(26060367-26060641)
chr4 (549-626)||(37744509-37744586)
chr4 (540-610)||(24558451-24558521)
chr4 (545-626)||(37750413-37750494)
chr4 (267-323)||(11649429-11649485)
chr4 (197-272)||(11649329-11649405)
chr4 (197-275)||(26060653-26060732)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (156-540)||(13493042-13493423)
chr1 (197-540)||(34066124-34066466)
chr1 (157-540)||(32505946-32506320)
chr1 (156-540)||(13495767-13496148)
chr1 (142-540)||(39546022-39546417)
chr1 (269-540)||(27282305-27282573)
chr1 (78-540)||(1936407-1936868)
chr1 (360-540)||(23990374-23990554)
chr1 (197-540)||(16190302-16190637)
chr1 (271-533)||(21153042-21153301)
chr1 (353-540)||(22453414-22453601)
chr1 (156-410)||(10764829-10765080)
chr1 (386-540)||(22104683-22104835)
chr1 (278-540)||(22456699-22456956)
chr1 (354-533)||(15297119-15297298)
chr1 (545-626)||(39367558-39367639)
chr1 (545-626)||(18308794-18308875)
chr1 (196-258)||(23990257-23990321)
chr1 (548-594)||(17113556-17113602)
chr1 (197-247)||(8435305-8435357)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (80-540)||(24193-24649)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (72-540)||(12575300-12575765)
chr8 (237-540)||(13096801-13097100)
chr8 (251-540)||(44008081-44008361)
chr8 (197-540)||(41778866-41779200)
chr8 (151-337)||(14418445-14418630)
chr8 (537-626)||(17633877-17633966)
chr8 (545-626)||(6223927-6224008)
chr8 (267-323)||(41836418-41836474)
chr8 (197-272)||(41836318-41836394)
chr8 (269-304)||(14418396-14418431)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (252-540)||(7173-7458)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (252-540)||(2471-2758)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (262-540)||(2794-3069)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (260-540)||(5999-6276)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (431-540)||(1-110)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (151-337)||(88-273)
scaffold0363 (269-304)||(287-322)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (539-637)||(445692-445790)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 40018276 - 40017757
Alignment:
Q  20 tatcgtacgtggagttccaacaaacaaggaagaactactcaatggcaaagagtgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40018276 tatcgtacgtggagttccaacaaacaaggaagaactactcaatggtaaagagtgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaa 40018177  T
Q  120 ttcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatt 219  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40018176 tttgttttcacaaggagtgcatttaacttcgacttggcaatttttttattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatt 40018077  T
Q  220 tgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40018076 tgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaa 40017977  T
Q  320 tttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtg 419  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40017976 tttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcctttgacctagaattctccccgcaagtg 40017877  T
Q  420 acaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttga 519  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40017876 acaa-cccttattctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtattaaaagaacgttaattcatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttga 40017778  T
Q  520 ttacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40017777 ttacttaggttaaacttatta 40017757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 82 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 31626784 - 31626329
Alignment:
Q  82 ttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgta 181  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31626784 ttggtaagtgaaccaaattcaatcgaagtaata-aaaattcgtttcaatgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtg 31626687  T
Q  182 taaaatttatattgatgccctaggcagttgagttga-tttgtaacataaacgg-attaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtat 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  31626686 taaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaaaggaattaaaaataataaaggattggttttagaaaatctgagagaagaat 31626587  T
Q  280 ggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtac 379  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||     
T  31626586 ggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaattattattt---agtttcacgacagattaacttagtaa 31626490  T
Q  380 ttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaat 479  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31626489 ttctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaat 31626390  T
Q  480 ccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31626389 ccttatgttataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 31626329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 31528629 - 31528169
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528629 atatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 31528530  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattgg--tttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||||| ||||||||||||    
T  31528529 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaag-aaaattgagaga 31528432  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaact 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||| || ||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  31528431 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacagattaact 31528335  T
Q  374 cagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaac 473  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||    
T  31528334 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtatt-aacgaac 31528236  T
Q  474 gttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31528235 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 31528169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 78 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13710309 - 13709852
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13710309 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaa-ttcgtttttacgagaactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 13710211  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13710210 tgtataaaatttatattgatgcctgaggaagttgagttgagttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggttttagaaaatttgagagaagt 13710111  T
Q  278 atggttaagaccttcgaatcctccgaaa-ctcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcag 376  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||| |||||||  |||||| || |  |||||||||| |   ||||  || ||||||||||  ||    
T  13710110 atggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatct---agttcaacaacagattaacaaag 13710014  T
Q  377 tacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtt 476  Q
    || |||| ||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||    
T  13710013 taattctacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtgacaaccccataatctctttagtgaattcgaaatcgttggaggttttaacaaaacgtt 13709914  T
Q  477 aatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttat 538  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13709913 aatccctatgtcataacctaataatgatctatatctagcttgattacttgggttaaacttat 13709852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 172 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16295044 - 16294679
Alignment:
Q  172 aaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||    ||||||||    
T  16295044 aaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaattga 16294945  T
Q  271 gagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatta 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  16294944 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattattta---gtttcacgacagatta 16294848  T
Q  371 actcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaag 470  Q
    ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16294847 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtatt-aaag 16294749  T
Q  471 aacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16294748 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctatta 16294679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Original strand, 23673353 - 23673810
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |   |||| || |||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  23673353 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggat 23673451  T
Q  179 gtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaag 276  Q
    |||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |    
T  23673452 gtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatg 23673549  T
Q  277 tatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   |||| |||||| ||||||  ||    
T  23673550 tatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatcta---gtttaacgacaaattaacaaag 23673646  T
Q  377 tacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtt 476  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  23673647 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacagttggaggttttaacagaacgtt 23673746  T
Q  477 aatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673747 aatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 23673810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 36327165 - 36326702
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagg 176  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |   ||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |    
T  36327165 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttctttatcaaaaaag 36327067  T
Q  177 atgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagaga 274  Q
    |||||| ||||| | | |  ||||||||| ||||   |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  36327066 atgtattaaattcaaagt--tgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagaga 36326969  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactc 374  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||    ||| |||| ||||||||      
T  36326968 tgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaa---tttaacgatagattaacaa 36326872  T
Q  375 agtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattc----gaaaccgttggaggcattaaaag 470  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||||| |||||||| ||||| ||    
T  36326871 agtaattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattaatttgaaactgttggaggtattaacag 36326772  T
Q  471 aacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36326771 aacgttaatccctgtgtcatagcctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 36326702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 272 - 540
Target Start/End: Original strand, 32575887 - 32576152
Alignment:
Q  272 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  32575887 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattattta---gtttcacgacagattaa 32575983  T
Q  372 ctcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaaga 471  Q
    || ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  32575984 cttagtaactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtgacaaccccttaatctcttgactgaattcgaaattgttggaggtattaaaaga 32576083  T
Q  472 acgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32576084 acgttaatccctatgtcgtaacctaataaagatctatctttagcttgattatttaggttaaacatatta 32576152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 7703121 - 7703040
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||  ||||||||||||    
T  7703121 atttggttcaattatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgttctcacgttccttctaaatacttgcagctagaa 7703040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Original strand, 27150671 - 27150752
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  27150671 atttggttaaattatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgttctcacatttcttttaaatacttgcagctagaa 27150752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 535 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40016981 - 40016936
Alignment:
Q  535 ttattattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttactttt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40016981 ttattattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttactttt 40016936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 24479842 - 24479785
Alignment:
Q  537 attattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgtt 594  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24479842 attattggatttgattcaatcatttatacctcaaatttacttttactttatttttgtt 24479785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8426844 - 8426783
Alignment:
Q  473 cgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaac 534  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8426844 cgttaatccctaaatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaac 8426783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33575326 - 33574868
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33575326 atttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttattattaaaaaggatg 33575227  T
Q  180 tataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagta 278  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    ||||||||||||||||    
T  33575226 tataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagta 33575128  T
Q  279 tggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagtt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||   |||| ||||| |||||||| |||    
T  33575127 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattattta---gtttcacgacggattaacttagt 33575031  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  33575030 aattctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaatgtta 33574931  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33574930 atccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 33574868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 15532206 - 15532666
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532206 atatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 15532305  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattgg--tttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||||| ||||||||||||    
T  15532306 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaag-aaaattgagaga 15532403  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaact 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||| || ||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  15532404 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacagattaact 15532500  T
Q  374 cagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaac 473  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||    
T  15532501 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtatt-aacgaac 15532599  T
Q  474 gttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15532600 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 15532666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 15542388 - 15542848
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15542388 atatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcattattaaaaagga 15542487  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattgg--tttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||||| ||||||||||||    
T  15542488 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaag-aaaattgagaga 15542585  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaact 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||| || ||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  15542586 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacagattaact 15542682  T
Q  374 cagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaac 473  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||    
T  15542683 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttgatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtatt-aacgaac 15542781  T
Q  474 gttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15542782 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 15542848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 170 - 540
Target Start/End: Original strand, 26712439 - 26712811
Alignment:
Q  170 aaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacgga-ttaaaaacaataagagattggtttaagaaaaat 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | ||| |||||||||| ||||||      
T  26712439 aaaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggttttagaaaatc 26712538  T
Q  268 tgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacaga 367  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  26712539 tgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattattta---gtttcacgacaga 26712635  T
Q  368 ttaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaa 467  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26712636 ttaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaa 26712735  T
Q  468 aagaacgttaatccatatgtcatgacctaata---atgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26712736 aagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 26712811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 170 - 540
Target Start/End: Original strand, 26982177 - 26982549
Alignment:
Q  170 aaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacgga-ttaaaaacaataagagattggtttaagaaaaat 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | ||| |||||||||| ||||||      
T  26982177 aaaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggttttagaaaatc 26982276  T
Q  268 tgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacaga 367  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  26982277 tgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattattta---gtttcacgacaga 26982373  T
Q  368 ttaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaa 467  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26982374 ttaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaa 26982473  T
Q  468 aagaacgttaatccatatgtcatgacctaata---atgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26982474 aagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 26982549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 34406009 - 34405628
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  34406009 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttgtgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 34405911  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  34405910 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 34405814  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34405813 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccg 34405714  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34405713 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatctcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttatta 34405628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Original strand, 14616437 - 14616894
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |   |||| || ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14616437 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggat 14616535  T
Q  179 gtataaaatttatattgatg-ccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagt 277  Q
    |||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || |   |||||||| | | |||||||||    
T  14616536 gtatgaa-tttatattgattaccctaggaagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatattagagagaagt 14616634  T
Q  278 atggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||| ||   |||| |||||||||||||  |||    
T  14616635 atggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatcta---gtttaacgacagattaacaaagt 14616731  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  14616732 aattctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtgacaagcccttaatctcttgagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacaaaacgtta 14616831  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616832 atccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 14616894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 22159986 - 22159524
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  22159986 atatttgacaagtgtaccaaattcgatcgaagtaataaaaaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttctttgtcaaaaagga 22159887  T
Q  178 tgtata--aaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttgtaaca--taaacggattaaaaacaataagagattggttt-aagaaaaattgaga 272  Q
    ||||||  ||||| | |  | |||||||||||||||  ||| ||| ||  |  |||||| |   |||||||||| | |||||||| ||||| | | ||||    
T  22159886 tgtatattaaattcaaag-gttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaa-attggttttaagaatattagaga 22159789  T
Q  273 gaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaac 372  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |  |||||||||||| |||||| ||| ||   |||  |||| ||||||||    
T  22159788 gaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatcta---gttcaacgatagattaac 22159692  T
Q  373 tcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaa 472  Q
      ||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  22159691 aaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccacaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaa 22159592  T
Q  473 cgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22159591 cgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagtttgattacttaggttaaacctatta 22159524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Original strand, 7649950 - 7650416
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggat 178  Q
    ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |   |||| || |||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  7649950 atttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggat 7650048  T
Q  179 gtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagt 277  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || |   |||||||| | | |||||||||    
T  7650049 gtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgcttttaagaatattagagagaagt 7650147  T
Q  278 atggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |   ||||| | || ||||||||   ||    
T  7650148 atggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatct---agtttaaagatagattaacaaggt 7650244  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||| |||| ||||    
T  7650245 aattctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttgagtgaattcgaaatcgctggaggttttaatagaaggtta 7650344  T
Q  478 atccatatgtc---------atgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||| ||||||         || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7650345 atccctatgtcataacctaaataacctaataatgatctatctctagcttgattttttaggttaaacttatta 7650416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 338
Target Start/End: Original strand, 11988868 - 11989134
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaactttta--cttagcaatttcattattaaaaag 175  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |   ||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||    
T  11988868 atatttgacaagtgaatcaaattcaatcgaagtaataaataattcgtttccacgagaaccgttcttaacttctatacttagcaatttcattagtaataag 11988967  T
Q  176 gatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagag 273  Q
    || |||||  |  |  | || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||| | |||||    
T  11988968 gacgtatattaaattcaatggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgattttagaaaattagagag 11989067  T
Q  274 aagtatggttaagaccttcgaatcctccgaa--actcttctatggtaatttgacctcctagttcaac 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  11989068 aagtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcctagttcaac 11989134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 534
Target Start/End: Original strand, 11989166 - 11989277
Alignment:
Q  423 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgatta 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11989166 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatctctatgttaaaacctaataatgatctatctctaacttgatta 11989265  T
Q  523 cttaggttaaac 534  Q
    | ||||||||||    
T  11989266 cataggttaaac 11989277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 26711470 - 26711567
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26711470 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatcaaaaagg 26711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 26981207 - 26981304
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26981207 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatcaaaaagg 26981304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13371991 - 13371932
Alignment:
Q  387 caatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatt 446  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13371991 caatctcttgacttagaactctcccctaaagtcacaatcccttaatctcttaagtgaatt 13371932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31571560 - 31571507
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaa-tttacttttattttatttttgttctc 597  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31571560 atttagttcaatcatttatacccccaaatttacttttattttgtttttgttctc 31571507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 39563516 - 39563976
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39563516 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcaaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattataaaaaagga 39563614  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacgga-ttaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaa 275  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | ||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  39563615 tgtgtaaaatttatattagtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggttttagaaaatctgagagaa 39563714  T
Q  276 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactca 375  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||   |||| |||||||||||||| |    
T  39563715 gaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttattta---gtttcacgacagattaactta 39563811  T
Q  376 gtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgt 475  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39563812 gtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgt 39563911  T
Q  476 taatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39563912 taatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 39563976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 22626318 - 22626778
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626318 atatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 22626417  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaag 276  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||| || || ||||||||||||||    
T  22626418 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggatttag-aaaattgagagaag 22626515  T
Q  277 tatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactca 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| |    
T  22626516 tatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacggattaactta 22626612  T
Q  376 gtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgt 475  Q
    ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  22626613 gtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgt 22626712  T
Q  476 taatccatatgtcatgacctaataatgatc-tatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22626713 taatccctatatcataacctaataatgatcttatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 22626778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 11138576 - 11139035
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138576 atatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 11138675  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaata-agagattggtttaagaaaaattgagagaa 275  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||    
T  11138676 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaatataga-attggattcag-aaaattgagagaa 11138772  T
Q  276 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactc 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||     
T  11138773 gtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacggattaactt 11138869  T
Q  375 agtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacg 474  Q
    |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  11138870 agtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattcgaaaccataggaggtattaaacgaacg 11138969  T
Q  475 ttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11138970 ttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattactgaggttaaacctatta 11139035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 238 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13979565 - 13979273
Alignment:
Q  238 aaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaa 337  Q
    |||||||||| || | | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  13979565 aaaacaataaaagttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaa 13979466  T
Q  338 ccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctt 437  Q
     |||||||||||||   |||| | |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13979465 acaatgattattta---gtttcatgacagattaacttagtaactctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacctcttaatctctt 13979369  T
Q  438 aagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaa 533  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  13979368 aagtgaattcgaaatcgttcgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctccaacttgattacttaagttaaa 13979273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 35366549 - 35366156
Alignment:
Q  142 ttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaa 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||||    
T  35366549 ttaacttctacttagcaatttcattat-aaaaaggatgtattaaattt-tag-gttgccctaggcagtcgagttggtatttgtaacataaactgtgtaaa 35366453  T
Q  240 aacaataagagattggtttaagaaaa-attgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaac 338  Q
     ||  ||| || ||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||| |||| |||||||  |   ||||||| |||||||||  | || | |||||     
T  35366452 gacggtaaaag-ttggttttagaaattaatgagaaaaatatggttaagatcttcaaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcaccccaa-ttcaat 35366355  T
Q  339 caatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctta 438  Q
    ||||| | ||  |||| ||| |||||| ||||||    || |||| | ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35366354 caatgttcat--ataa-tttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttgacctagaactctctccgcgagtgacaatcccttaatctctta 35366258  T
Q  439 agtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttat 538  Q
    ||||||||| | ||  |||||||  |||| ||  |||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  35366257 agtgaattcaagactcttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcatagcctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctat 35366158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 46731561 - 46731386
Alignment:
Q  250 gattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatt 349  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||     
T  46731561 gattggttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatc 46731462  T
Q  350 tataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccct 428  Q
    |   ||||  |||||| ||||||  ||||  ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  46731461 t---agttcaacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctggagttctccccgcaagtaacaacccct 46731386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 537 - 626
Target Start/End: Original strand, 25338558 - 25338647
Alignment:
Q  537 attattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25338558 attattggatttggttcaatcatttatacctacaatttacttttactttgtttttgttctcacatttcttttaaatacttgcagctagaa 25338647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 20536404 - 20536445
Alignment:
Q  140 atttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgta 181  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536404 atttaacttctacttagaaatttcattattaaaaaggatgta 20536445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 47412115 - 47412079
Alignment:
Q  387 caatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaa 423  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47412115 caatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaa 47412079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 72 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 11279736 - 11279272
Alignment:
Q  72 tgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11279736 tgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaattt-gtttccacaaggactatatttaatttctacttagcaatttcattattaa 11279638  T
Q  172 aaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaac-aataagagattggtttaagaaaaattg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    || ||||    
T  11279637 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacgaataa-agattggtttttagaagattg 11279539  T
Q  270 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatt 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  11279538 agagaagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattattta---gtttcacgacagatt 11279442  T
Q  370 aactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaa 469  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||     
T  11279441 aacttagtaattctacccaatctcttgacctaggattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatctgaaaccgttggaggtatt-aat 11279343  T
Q  470 gaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11279342 gaacgttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 11279272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33313233 - 33312774
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33313233 atatttgagaagtgaaacaaattcaatcgaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 33313136  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacgga-ttaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaa 275  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  33313135 tgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggttttagaaaatctgagagaa 33313036  T
Q  276 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactca 375  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||   |||| |||||  ||||||| |    
T  33313035 aaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattattta---gtttcacgacgaattaactta 33312939  T
Q  376 gtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgt 475  Q
    ||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  33312938 gtaattctacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaaatgaattcgaaaccggcggaggtattaaaagaacgt 33312839  T
Q  476 taatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33312838 taatccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacatatta 33312774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Original strand, 46846320 - 46846778
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatg 179  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  | |||| ||| |||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846320 atttggcaagtgaatcagattcaatcgaagtaataaaaatat-gtttccacgaggactgtatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggatg 46846418  T
Q  180 tataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg-atttgtaacataaacgga-ttaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagt 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||  |||||| || | ||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||    
T  46846419 tataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgaattcttattataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaattgagagaagt 46846518  T
Q  278 atggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||  | |    
T  46846519 atggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattattt---agtttcacgacagattaacctaat 46846615  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  46846616 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaactgaattcgaaaacgttggaggttttaaaagatcgtta 46846715  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  46846716 atccctatgtcataacctaataataatctatctctaacttgattacttaggttaaacctatta 46846778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 23759615 - 23760074
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23759615 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaagttcgtttctacgaggactgtatttaacttctacttagcaaattcatt-ttaaaaagga 23759713  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattgg--tttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  23759714 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaag-aaaatcgagaga 23759811  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaact 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||    
T  23759812 agtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacggattaact 23759908  T
Q  374 cagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaac 473  Q
     |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||    
T  23759909 tagtaattctacccaatctcttgccctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccattggaggtatt-aacgaac 23760007  T
Q  474 gttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23760008 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 23760074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 71 - 533
Target Start/End: Original strand, 36222308 - 36222761
Alignment:
Q  71 gtgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattatta 170  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  36222308 gtgatggatatttggcaaatgaaccaaattcaattgaagtaataaaa-attcgttaccacgaggattgtatttaatttctacgtagcaatttcattatta 36222406  T
Q  171 aaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttga-tttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    || ||||    
T  36222407 aaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttctaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg 36222506  T
Q  270 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatt 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||| |||    
T  36222507 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaatcaatgattattt---agtttcactacaaatt 36222603  T
Q  370 aactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaa 469  Q
    |||| |||| || | || |||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  36222604 aacttagtaattttacctaatctcttgacctagaattctcc-----agtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taa 36222697  T
Q  470 gaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaa 533  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36222698 gaacgttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaa 36222761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 72 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 295106 - 294644
Alignment:
Q  72 tgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  295106 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaatttgtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaa 295007  T
Q  172 aaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaac-aataagagattggtttaagaaaaattga 270  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  295006 aaaggatgtaataaatttatattgatgcccgaggcagt--agttgttttgtaacataagctggttaaaagcaaataag-gattggttttag-aaaattga 294911  T
Q  271 gagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatta 370  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||| |   | ||  |||||||||||    
T  294910 gagaagtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatct---aattcaacgacagatta 294814  T
Q  371 actcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaag 470  Q
    ||  |||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |     
T  294813 acaaagtaattatacccaatctcttgaactagaattctccccataagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggatgttttaacaa 294714  T
Q  471 aacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  294713 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 294644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 6967308 - 6966927
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  6967308 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 6967210  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  6967209 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 6967113  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||| ||||||||  |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6967112 gtttaacgatagattaacaaagtaattctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 6967013  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6967012 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 6966927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Original strand, 17866438 - 17866819
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  17866438 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagctgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 17866536  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  17866537 ttttcagaatattagagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 17866633  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866634 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 17866733  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866734 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 17866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 184 - 540
Target Start/End: Original strand, 17863206 - 17863560
Alignment:
Q  184 aaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggt 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |   |||||||||| || | | ||| |||| | | ||||||||||||||    
T  17863206 aaatttatattgattgccctaggcagttgagctgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggt 17863305  T
Q  283 taagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttc 382  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   |||| |||||||||||||  |||| |||    
T  17863306 taagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta---gtttaacgacagattaacaaagtaattc 17863402  T
Q  383 tccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatcca 482  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17863403 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccc 17863502  T
Q  483 tatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17863503 tatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 17863560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 195 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 23108111 - 23107767
Alignment:
Q  195 gatgccctaggcagttgagttgat--ttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttc 292  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||||    
T  23108111 gatgtcctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagagagaaatgtggttaagaccttc 23108012  T
Q  293 gaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcc 392  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||   |||| || ||||||||||| ||||  ||| |||||| |    
T  23108011 gaatcatccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattattta---gtttcacaacagattaacttagtaactctacccaattc 23107915  T
Q  393 cttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatga 492  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23107914 cttgagctataattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaattgtttgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataa 23107815  T
Q  493 cctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23107814 cctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctatta 23107767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 24783560 - 24783185
Alignment:
Q  165 ttattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaa 263  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||  |   |||||||||| || | | ||||||||    
T  24783560 ttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgtccaaggcagttgagttgttttgtaacataaacttaaataaaacaataaaagttggttttaagaa 24783462  T
Q  264 aaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacga 363  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||| ||   |||| ||||    
T  24783461 tattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatcta---gtttaacga 24783365  T
Q  364 cagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggca 463  Q
     ||||||||  |||| || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  24783364 gagattaacaaagtaattatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagatt 24783265  T
Q  464 ttaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttg---attacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  24783264 ttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatatatctctagcttgattattacttaggttaaacttatta 24783185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 269 - 540
Target Start/End: Original strand, 36843135 - 36843403
Alignment:
Q  269 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| ||   |||  |||||||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatcta---gttcaacgacagat 36843231  T
Q  369 taactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaa 468  Q
    ||||  | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||     
T  36843232 taacaaattaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaac 36843331  T
Q  469 agaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36843332 agaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 36843403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 534
Target Start/End: Original strand, 3861913 - 3862362
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||| |||| || | ||| |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3861913 atatttggcaagtgtactagagtcaatcgaagtaataaataatttgtatccacgaggattgttattaacttctacttagcaatttcattattaaaa-gga 3862011  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt---gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||| ||||| |   ||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||    
T  3862012 tgtattaaattcaa--tgatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggttttataaaattagagaga 3862109  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactc 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||        ||  |||||| |||||  ||||||||| |   ||||  |||||||||||||      
T  3862110 agtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctccta--------tgcactcctaattcaagaaatgattatct---agttcaacgacagattaacaa 3862198  T
Q  375 agtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccc----ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaag 470  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |    
T  3862199 agtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaattaatgtcttaagtgaattcaaaactgttggaagttttaaccg 3862298  T
Q  471 aacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaac 534  Q
      | ||||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3862299 tcctttaatccctatatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaac 3862362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 197 - 487
Target Start/End: Original strand, 23313384 - 23313673
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcga 294  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23313384 tgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggttttagaaaattagagagaagtatggttaagacctttga 23313483  T
Q  295 atcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatccct 394  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||| |   || || || ||| |||||| | |||  ||| ||||||| ||    
T  23313484 atcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatct---aggttcacaacatattaacactgtaactctacccaatctct 23313580  T
Q  395 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgt 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| || |||||    
T  23313581 tggcctagaattctccccgcaagtggaaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaacagaacgttaacccctatgt 23313673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 256 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9765862 - 9765572
Alignment:
Q  256 tttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttata-- 353  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||        
T  9765862 tttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagttt 9765763  T
Q  354 ----agttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcga 449  Q
        ||||| ||| |||||||||  ||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9765762 cacgagtttcacggcagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagtaaaatacccttaatctcttaagtgaattcga 9765663  T
Q  450 aaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||| || ||||  |||| | ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9765662 aaccattagaggttttaacaaaacattagtccttatgtcataacctaataatcatctatctctagcttgattacttaagttaaacttatta 9765572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Original strand, 26620526 - 26620607
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||||    
T  26620526 atttggttcaatcatttatacctcaaatttactttgattttgtttttgctctcacattccttctaaatacttgcagctagaa 26620607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Original strand, 26618562 - 26618643
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||||    
T  26618562 atttagttcattcatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgctctcacattccttctaaatacttgcagctagaa 26618643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2719438 - 2719331
Alignment:
Q  425 cccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||| |||||||| |||  |||| || ||| |||  |||||||||||||| |||| |    
T  2719438 cccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtttttatagatcgttaatctataaatcataacttaacaattgtctatctctagcttaattaat 2719339  T
Q  525 taggttaa 532  Q
    || |||||    
T  2719338 taagttaa 2719331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 27796727 - 27796693
Alignment:
Q  427 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagg 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27796727 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagg 27796693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Original strand, 26607996 - 26608076
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||| ||  ||||||||||||    
T  26607996 atttggttcaatcatttatacgta-aatttacttttattttgtttttgctctcacattccttctacatacttgcagctagaa 26608076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8248716 - 8248670
Alignment:
Q  537 attattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttacttttatt 583  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8248716 attattggatttgtttcaatcacttatacctcaaatttacttttatt 8248670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 22796604 - 22796642
Alignment:
Q  30 ggagttccaacaaacaaggaagaactactcaatggcaaa 68  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22796604 ggagttccaacaaactaggcagaactactcaatggcaaa 22796642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7227782 - 7227726
Alignment:
Q  165 ttattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttg 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  7227782 ttattaaataggatgtgtaaaagttattttgttgccctaggcagtagatttgatttg 7227726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10101 - 9642
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaa-aattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggat 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| | || ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101 atttggcaagtgaatcaaattcgatcgaagtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 10002  T
Q  179 gtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagt 277  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    |||||||||||||||    
T  10001 gtataaa-tttatattggtcccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaattgagagaagt 9903  T
Q  278 atggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagtt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcag 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||   |||| ||||| |||||||| ||    
T  9902 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattattta---gtttcacgacggattaacttag 9806  T
Q  377 tacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtt 476  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9805 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgtt 9706  T
Q  477 aatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9705 aatccctatatcataacctaataatgatctatctttagcttgattacttaggttaaacctatta 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Original strand, 13017195 - 13017655
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017195 atatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaagttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagga 13017294  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaaga-aaaattgagagaa 275  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||   | |||||||||||||    
T  13017295 tgtat-aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaattgagagaa 13017393  T
Q  276 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactc 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||| | |   | ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||     
T  13017394 gtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattattt---agtttcacgacggattaactt 13017490  T
Q  375 agtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacg 474  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||    
T  13017491 agtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtatt-aacgaacg 13017589  T
Q  475 ttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13017590 ttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctatta 13017655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 14790779 - 14790398
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  14790779 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 14790681  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  14790680 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 14790584  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790583 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 14790484  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790483 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 14790398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 14795807 - 14795426
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  14795807 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 14795709  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  14795708 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 14795612  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795611 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 14795512  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795511 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 14795426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 22221959 - 22221503
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatg 179  Q
    |||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||| ||| |||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22221959 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattattaaaaaggatg 22221860  T
Q  180 tataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagta 278  Q
    |||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||||    |||||||||||||| |    
T  22221859 tataaattat-tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagca 22221763  T
Q  279 tggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagtt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||  | ||| |||||||||||||   || | ||||| |||||||| |||    
T  22221762 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattattta---gtatcacgacggattaacttagt 22221666  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||    
T  22221665 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgtta 22221566  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22221565 atccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 22221503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 22247794 - 22247338
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatg 179  Q
    |||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||||||| ||| |||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22247794 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattattaaaaaggatg 22247695  T
Q  180 tataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagta 278  Q
    |||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||||    |||||||||||||| |    
T  22247694 tataaattat-tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagca 22247598  T
Q  279 tggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagtt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||  | ||| |||||||||||||   || | ||||| |||||||| |||    
T  22247597 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattattta---gtatcacgacggattaacttagt 22247501  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||    
T  22247500 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgtta 22247401  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22247400 atccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 22247338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 218 - 540
Target Start/End: Original strand, 32704401 - 32704720
Alignment:
Q  218 tttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggt 317  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || | | ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  32704401 tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggt 32704500  T
Q  318 aatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaag 417  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |    
T  32704501 aatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta---gtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatg 32704597  T
Q  418 tgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagctt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32704598 tgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctatctt 32704697  T
Q  518 gattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32704698 gattacttaggttaaacttatta 32704720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 199 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16883795 - 16883456
Alignment:
Q  199 ccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaat 296  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16883795 ccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagagagaagtatggttaagacattcgaat 16883696  T
Q  297 cctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttg 396  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||| |||    || |||| |||||||| || ||   || ||||||| ||||    
T  16883695 ccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatg---ttcacgaaagattaacacaataaccctacccaatctcttg 16883599  T
Q  397 acctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgaccta 496  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  16883598 acctagaattctccccacaagtggcaaccccttaatctcttatgtgaattcaaaaccgttggaggttttaacagaacattaatccctatg-catcaccta 16883500  T
Q  497 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883499 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 16883456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 157 - 540
Target Start/End: Original strand, 19664751 - 19665129
Alignment:
Q  157 caatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  19664751 caatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttg 19664848  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  19664849 gtttaagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctag-- 19664946  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
      || |||||||||||||  ||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19664947 --ttcacgacagattaacaaagtaactctacccaatatcttgacctagagttctccccgcaagtaacatccccttaatctcttaagtgaattcgaaatca 19665044  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19665045 ttggagattttaatagaacgttaatccctatgtcataacctaat-atgatctatctctatcttgattacttaggttaaacctatta 19665129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 197 - 540
Target Start/End: Original strand, 20527286 - 20527628
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggat-taaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcg 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||  |  |||||||||||| || | | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  20527286 tgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaaagttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcg 20527385  T
Q  294 aatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatccc 393  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||     || |||||||||||||  | ||  | | ||||||| |    
T  20527386 aatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaac---ttcacgacagattaacaaattaactttacccaatctc 20527482  T
Q  394 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgac 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  20527483 ttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaatttgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataat 20527581  T
Q  494 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527582 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 20527628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 1838534 - 1838254
Alignment:
Q  256 tttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataag 355  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||   |    
T  1838534 tttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatg-taattcgcactcctagttcaatcaacgattattta---g 1838439  T
Q  356 ttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgt 455  Q
    ||  |||||||||||||  ||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1838438 ttcaacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaactccttaatctcttaagtgaatttgaaaccat 1838339  T
Q  456 tggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||   |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1838338 tggagattttaacataacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 1838254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 354 - 540
Target Start/End: Original strand, 12983658 - 12983844
Alignment:
Q  354 agttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 453  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12983658 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 12983757  T
Q  454 gttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12983758 gttggaggttttaacagtccgttaatccatgtgtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacatatta 12983844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 419
Target Start/End: Original strand, 30978322 - 30978557
Alignment:
Q  184 aaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggttt--aagaaaaattgagagaagtatg 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  30978322 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaa-ttgagagaagtatg 30978420  T
Q  281 gttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcct-agttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtac 379  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||| | | | | ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  30978421 gttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattattt---agtttcacgacggattaacttagtaa 30978517  T
Q  380 ttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtg 419  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30978518 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 30978557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15535230 - 15534923
Alignment:
Q  142 ttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaa 240  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||    
T  15535230 ttaacttctactcagccatttctttataaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttgagttgattttgtaaaacaaatagattaaaa 15535133  T
Q  241 acaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaacca 340  Q
    ||||||| || ||||||| | |||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  15535132 acaataaaagtttggttttacaaaattaaagtgatgtatggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatca 15535033  T
Q  341 atgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaag 440  Q
    |||||||| ||   |||  |||||||||||||  ||||  |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15535032 atgattatcta---gttcaacgacagattaacaaagtaactctaaccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacctcttaatctcttaag 15534936  T
Q  441 tgaattcgaaacc 453  Q
    |||||||||||||    
T  15534935 tgaattcgaaacc 15534923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 354 - 540
Target Start/End: Original strand, 12980771 - 12980957
Alignment:
Q  354 agttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 453  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  12980771 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccgcttaatctcttaagtgaattcgaaatt 12980870  T
Q  454 gttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||  |||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12980871 gttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataacctaatacttttctatctctagcttaattacttaggttaaacatatta 12980957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 415 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 32427271 - 32427146
Alignment:
Q  415 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctag 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32427271 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtattaacagaatgttaatccctatgtcataacataataatgatctatctctag 32427172  T
Q  515 cttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  32427171 attgattacttaggttaaacttatta 32427146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 385 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15538156 - 15538036
Alignment:
Q  385 cccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccata 484  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  15538156 cccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacaccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaatcccta 15538057  T
Q  485 tgtcatgacctaataatgatc 505  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  15538056 tgtcataacttaataatgatc 15538036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 271 - 539
Target Start/End: Original strand, 7769588 - 7769860
Alignment:
Q  271 gagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatta 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | |  | ||||| ||||| | |||||   |||| |||||| ||||    
T  7769588 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcattta---gtttaacgacatatta 7769684  T
Q  371 actcagtacttctccccaatcccttgacctag----aattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtga---attcgaaaccgttggaggca 463  Q
    ||  |||| |||| | |||||  |||||||||    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||      
T  7769685 acaaagtaattctactcaatcttttgacctagctataattctctctgcaagtgctaaccccttaatctcttcagtgatgaattcgaaatctttggaggtt 7769784  T
Q  464 ttaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatt 539  Q
    |||| ||  ||||||||| ||  |||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  7769785 ttaacagtccgttaatccctaaatcataacctaataattgtctatctctaacttaattacttaggttaaacatatt 7769860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15540744 - 15540583
Alignment:
Q  142 ttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttg-taacataaacggattaaaa 240  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |   |  | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  15540744 ttaacttctactcagcaatttctatatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--ttccctaggcagttgagttgattttctaaaataaagggattaaaa 15540647  T
Q  241 acaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 304  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15540646 acaataaaagtttagttttagaaaattaaagagatttatggttaagaccttcgaatcctccgaa 15540583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27649180 - 27649096
Alignment:
Q  239 aaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttg 323  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  27649180 aaacaataaaagttggttttaagaaaattagagcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttg 27649096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32427401 - 32427281
Alignment:
Q  217 atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatgg 316  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| | |||||| || || |||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||    
T  32427401 atttgtaaaataaacgaattaaaaacaatgaaagtttggttttagaaaattagagagatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatgg 32427302  T
Q  317 taatttgacctcctagttcaa 337  Q
    |||||||  |||||| |||||    
T  32427301 taatttgcactcctaattcaa 32427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 1943257 - 1943176
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||  |||| |||||||    
T  1943257 atttggttcaatcacttatacctcaaatttacttttattttgtttgtgttctcacattccttctaaatacttgcggctagaa 1943176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15870403 - 15870354
Alignment:
Q  20 tatcgtacgtggagttccaacaaacaaggaagaactactcaatggcaaag 69  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15870403 tatcgtatgcggagttccaacaaactaggcagaactactcaatggcaaag 15870354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 581
Target Start/End: Original strand, 24631674 - 24631710
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttactttta 581  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24631674 atttggttcaatcatttatacctcaaatttactttta 24631710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 11183962 - 11184012
Alignment:
Q  199 ccctaggcagttgagttga--tttgtaacataaacggattaaaaacaataa 247  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11183962 ccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataa 11184012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 15534912 - 15534869
Alignment:
Q  497 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15534912 ataatgatctatcactagcttgattacttatgttaaacctatta 15534869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12172212 - 12171762
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaat-tcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12172212 atatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaagg 12172113  T
Q  177 atgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagatt-ggtttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||             |||    
T  12172112 atgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataa-agatttggtttct-----------aga 12172026  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagtt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaact 373  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||   |||| ||||| ||||||||    
T  12172025 agtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattattta---gtttcacgacggattaact 12171929  T
Q  374 cagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaac 473  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12171928 tagtaattctacccaatctcttgacctacaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaac 12171829  T
Q  474 gttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12171828 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 12171762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Original strand, 647288 - 647669
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  647288 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcatttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 647386  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  647387 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 647483  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647484 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 647583  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647584 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 647669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Original strand, 650560 - 650941
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  650560 gcaatttctatatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcatttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 650658  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  650659 ttttcataatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 650755  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650756 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 650855  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650856 ttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 650941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 142 - 532
Target Start/End: Original strand, 26062762 - 26063151
Alignment:
Q  142 ttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaa 239  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  ||||||||| |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26062762 ttaacttctactcaacaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggtagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaa 26062859  T
Q  240 aacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaa--gtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaa 337  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  26062860 aacaataaaagtttggttttagaaaattagagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 26062959  T
Q  338 ccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctt 437  Q
     |||||||||| ||   |||  |||||||||||||  ||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26062960 tcaatgattatcta---gttcaacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctctt 26063056  T
Q  438 aagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaa 532  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26063057 aagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgtttatccatatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaa 26063151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2542122 - 2541670
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2542122 atatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataattcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattattaaaaagga 2542023  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgat--ttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaa 275  Q
    ||||| |||||   | || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    |||||| | |||     
T  2542022 tgtattaaatt--caatggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaatt-aaagag 2541926  T
Q  276 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |   ||||  |||||||||||||  |    
T  2541925 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatct---agttaaacgacagattaacaaa 2541829  T
Q  376 gtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgt 475  Q
    ||| || |  |||||| ||||||||| |||||| | || || | |||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  |||| ||  |||    
T  2541828 gtaattttatccaatctcttgacctaaaattcttctcggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcaaaaccattgaaggttttaacagtccgt 2541729  T
Q  476 taatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaac 534  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2541728 taatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaac 2541670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 263 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26060641 - 26060367
Alignment:
Q  263 aaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacg 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   | ||  ||    
T  26060641 aaaattgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta---gcttcccg 26060545  T
Q  363 acagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggc 462  Q
    | ||||||||  ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26060544 atagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaaataacaaccccttaatgtcttaagtgaattcgaaaccgttggaggt 26060445  T
Q  463 attaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26060444 tttaatagaacgttaatccctatgtcataacctaataatggtctatctctagcttgattacttaagttaaacatatta 26060367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 549 - 626
Target Start/End: Original strand, 37744509 - 37744586
Alignment:
Q  549 ggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||| ||||||    
T  37744509 ggttcaatcatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgttctcacattccttctaaatacttgcacctagaa 37744586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 610
Target Start/End: Original strand, 24558451 - 24558521
Alignment:
Q  540 attgaatttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaa 610  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||    
T  24558451 attggatttggttcaatcatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgtactcacattccttctaa 24558521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Original strand, 37750413 - 37750494
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||| ||||||    
T  37750413 atttgattcaattatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgttctcacattccttctaaatacttgcaactagaa 37750494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 11649429 - 11649485
Alignment:
Q  267 ttgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttg 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  11649429 ttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttg 11649485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 11649329 - 11649405
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttga--tttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgaga 272  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  11649329 tgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttagaaaatttgaga 11649405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26060732 - 26060653
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttga--tttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  26060732 tgccctaggcaggtgagttgatttttgtaatataaatgaaataaaaacaataaaag-ttggttttagaaaatttgagagaa 26060653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13493423 - 13493042
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  13493423 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 13493325  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  13493324 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta--- 13493228  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493227 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 13493128  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493127 ttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 13493042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 197 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 34066466 - 34066124
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcga 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34066466 tgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcga 34066367  T
Q  295 atcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatccct 394  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   |||| |||| ||||||||  |||| |||| ||||||| ||    
T  34066366 atcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatcta---gtttaacgatagattaacaaagtaattctacccaatctct 34066270  T
Q  395 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacc 494  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  34066269 tgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatctctatgtcataacc 34066170  T
Q  495 taataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34066169 taataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttatta 34066124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 157 - 540
Target Start/End: Original strand, 32505946 - 32506320
Alignment:
Q  157 caatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggt 256  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||      ||| ||||||||||| |||||||||||||| || | | |    
T  32505946 caatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgatgcgtgaggcagttgt-----tttctaacataaacgaattaaaaacaataaaagttggtt 32506039  T
Q  257 ttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagt 356  Q
    ||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   ||    
T  32506040 ttaagaatattatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta---gt 32506136  T
Q  357 tttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgtt 456  Q
    || |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506137 ttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgtt 32506236  T
Q  457 ggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32506237 ggaggtattaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgacctatctctagcttgattacttaagttaaacttatta 32506320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 156 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13496148 - 13495767
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || |      
T  13496148 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgtcctaggcagttgaattgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttga 13496050  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||       
T  13496049 ttttaagaatattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctac-- 13495952  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 454  Q
     ||| ||||||||||||   |||| || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13495951 -tttaacgacagattaagaaagtaattatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 13495853  T
Q  455 ttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13495852 ttggaggttttagcagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 13495767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 39546417 - 39546022
Alignment:
Q  142 ttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaa 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||  ||| |||  ||||| |||||| |   ||    
T  39546417 ttaacttttactcagcaatttcattatcgaaa-ggatgtattaaattca-attgttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataa 39546320  T
Q  240 aacaataagagattggtttaagaaaaatt-gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaac 338  Q
    |||||||| || ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||| |||||     
T  39546319 aacaataaaag-ttggttttaaaaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaag 39546221  T
Q  339 caatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctta 438  Q
    |||||||||| ||   |||| |||||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39546220 caatgattatcta---gtttcacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccccttaatctctta 39546124  T
Q  439 agtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttat 538  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39546123 agtgaattcgaaatcgttggaggttttaatagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttat 39546024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 269 - 540
Target Start/End: Original strand, 27282305 - 27282573
Alignment:
Q  269 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagat 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||   |||  ||||| |||    
T  27282305 gagagaagtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatcta---gttcaacgaccgat 27282401  T
Q  369 taactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaa 468  Q
    ||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  27282402 taacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaaa 27282501  T
Q  469 agaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27282502 agaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 27282573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 1936868 - 1936407
Alignment:
Q  78 atatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaagga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| ||      ||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||    
T  1936868 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaatgaataattcatttccacaatgaccattgttaacttctacttggcaatttcattagtaataacga 1936769  T
Q  178 tgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatt--tgtaacataaacgga-ttaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagaga 274  Q
    ||||| ||||| |    | || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||  ||| |  ||||||| |||||| | ||||||    
T  1936768 tgtattaaattcaatgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggttttagaaaattagagaga 1936669  T
Q  275 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||   | || |||| ||||||||      
T  1936668 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatcta---gcttcacgaaagattaacaa 1936572  T
Q  375 agtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacg 474  Q
    ||||  ||| || |||| |||||  || | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||| |    
T  1936571 agtaactctaccaaatctcttgatttatagttctccccgcaagtaacaatcccttaatctcttaagtgaatttgaaac-gtttgaggttttaaaagaatg 1936473  T
Q  475 ttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1936472 ttattccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcatgattacttaggttaaacttatta 1936407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 360 - 540
Target Start/End: Original strand, 23990374 - 23990554
Alignment:
Q  360 acgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttgga 459  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23990374 acgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaaactcttaagtgaattcgaaaccgttgga 23990473  T
Q  460 ggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990474 ggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 23990554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 540
Target Start/End: Original strand, 16190302 - 16190637
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttgat--ttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcga 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16190302 tgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataa-agattggttttagaaaattaaagagaagtatggttaagaccttcga 16190400  T
Q  295 atcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtact-tctccccaatccc 393  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||| |   ||||| |||||| ||||||  | || | | | ||||||| |    
T  16190401 atcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatct---agtttaacgacaaattaacaaaataatatatacccaatctc 16190497  T
Q  394 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccc----ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtca 489  Q
    |||||| | |||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||         ||||||| |||||||    
T  16190498 ttgacccataattctccccacgagtgacaaccccttaattaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagg--tt---------ttaatccctatgtca 16190586  T
Q  490 tgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16190587 taacctaatattgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttatta 16190637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 271 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21153301 - 21153042
Alignment:
Q  271 gagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatta 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  | || | ||||| ||||| | ||||   ||||| |||||||||||    
T  21153301 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcattt---agtttaacgacagatta 21153205  T
Q  371 actcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaag 470  Q
    || ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||    
T  21153204 acacagtaattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatttgaaacctttggaggttttaatag 21153105  T
Q  471 aacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaa 533  Q
      ||||||||| ||  |||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21153104 tccgttaatccctaaatcataacctaataactgtctatctctagcttaattacttaggttaaa 21153042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 353 - 540
Target Start/End: Original strand, 22453414 - 22453601
Alignment:
Q  353 aagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 452  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22453414 aagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 22453513  T
Q  453 cgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
     ||||||||  |||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22453514 tgttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacctatta 22453601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10765080 - 10764829
Alignment:
Q  156 gcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattg 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| || | |    
T  10765080 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgg 10764982  T
Q  255 gtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataa 354  Q
     ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||| |   |    
T  10764981 ttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatct---a 10764885  T
Q  355 gttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctcc 410  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10764884 gtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcc 10764829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 386 - 540
Target Start/End: Original strand, 22104683 - 22104835
Alignment:
Q  386 ccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatat 485  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  22104683 ccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtgacagacc-ttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggtattaaa-gaacgttaatccctat 22104780  T
Q  486 gtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22104781 gtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 22104835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 540
Target Start/End: Original strand, 22456699 - 22456956
Alignment:
Q  278 atggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||  | |||| ||||| ||||| |  | ||   |||| |||||||| ||||  |||    
T  22456699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtcta---gtttaacgacagactaacaaagt 22456794  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||    
T  22456795 aattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaactc-ttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggaggttttaacagtccgtta 22456893  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22456894 atccatgagtcataacctaataattttctatctcttgcttaattacttaggttaaacctatta 22456956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 354 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15297298 - 15297119
Alignment:
Q  354 agttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 453  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||     
T  15297298 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtgacaacccttaaatctcttaagtgaatttgaaact 15297199  T
Q  454 gttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaa 533  Q
    ||||||||  |||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15297198 gttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaa 15297119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Original strand, 39367558 - 39367639
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||| ||||||||    
T  39367558 atttggtacaattatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgttctcacattccttctaaatacttgtagctagaa 39367639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18308875 - 18308794
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| |||   ||||||||  ||||||||||||    
T  18308875 atttggttcaataatttatacctcaaatttatttttatttagtttttgatctcacattcattctaaatacttgcagctagaa 18308794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 258
Target Start/End: Original strand, 23990257 - 23990321
Alignment:
Q  196 atgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggttt 258  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23990257 atgctctaggcagttgagttaatttttgtaacatatacggattaaaaacaataaaagataggttt 23990321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 548 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17113602 - 17113556
Alignment:
Q  548 tggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgtt 594  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  17113602 tggttcaattatttatacctcaaatttacttttatttggtttttgtt 17113556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8435357 - 8435305
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttga--tttgtaacataaacggattaaaaacaataa 247  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  8435357 tgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataa 8435305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Original strand, 24193 - 24649
Alignment:
Q  80 atttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaaaaaggatg 179  Q
    |||||||||||| ||||||  | || |||||| ||| ||||| |||| ||| |||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24193 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcattattaaaaaggatg 24292  T
Q  180 tataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagta 278  Q
    |||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||||    |||||||||||||| |    
T  24293 tataaattat-tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagca 24389  T
Q  279 tggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagtt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||  | |||  ||||||||||||   || | ||||| |||||||| |||    
T  24390 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattattta---gtatcacgacggattaacttagt 24486  T
Q  378 acttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgtta 477  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  24487 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttatgtgaattcgaaaccattggaggaattaaataaacgtta 24586  T
Q  478 atccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24587 atccctatatcataacctaataatgatatatctctagcttgattacttaggttaaacctatta 24649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 540
Target Start/End: Original strand, 12575300 - 12575765
Alignment:
Q  72 tgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgttttcacaaggaatgcatttaacttttacttagcaatttcattattaa 171  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||   ||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  12575300 tgataaatatttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataattcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattattaa 12575399  T
Q  172 aaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattg 269  Q
    ||||||||||| ||||| |   || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |    
T  12575400 aaaggatgtattaaattcaa--tggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattag 12575497  T
Q  270 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagatt 369  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |  ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| || ||   |||| ||||||||||    
T  12575498 agagaagtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatcta---gtttaacgacagatt 12575594  T
Q  370 aactcagtacttctccccaatcccttga-cctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaa 468  Q
    |||  |||| |||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||     
T  12575595 aacaaagtaattctacctaatctcttaaacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaattagaaaccattggaggttttaac 12575693  T
Q  469 agaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  12575694 aatacgttaatccttatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttatgttaaacctatta 12575765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 237 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13097100 - 13096801
Alignment:
Q  237 aaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttca 336  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||||| || |    
T  13097100 aaaaacaataaaagattagttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatg-taatttgcactcctaattta 13097002  T
Q  337 accaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctct 436  Q
    | |||||||||| ||   |||  | || ||||||||  |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13097001 agcaatgattatcta---gttcaatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatgtct 13096905  T
Q  437 taagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaactt 536  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13096904 taagtgaatttgaaaccgtgggaggttttaacagaacgtaaatccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttagcttaaactt 13096805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 251 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 44008361 - 44008081
Alignment:
Q  251 attggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattattt 350  Q
    |||||||| |||||| | || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  44008361 attggttttagaaaattagaaagaattatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattattt 44008262  T
Q  351 ataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaa 450  Q
    |   |||| |||| ||||||     |||  ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  44008261 a---gtttcacgatagatta-----gtaactctaccaaatccctcgacctagaattctccc-gcaagtgacaactccttaatctcataagtgaatttgaa 44008171  T
Q  451 accgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44008170 atcgttggaggtattaaaagaacgttaatccctgtgtcgtaacctaacaatgatctatttctagcttgattagttaggttaaacttatta 44008081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 540
Target Start/End: Original strand, 41778866 - 41779200
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttgattt--gtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcga 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |    
T  41778866 tgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattta-gaagattaaagagaagtatggttaagaccttcaa 41778964  T
Q  295 atcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatccct 394  Q
    ||| ||||||  ||| ||||| |||||||  ||  || ||||| |||||||||| ||   | || ||||||||||||| || ||  ||| ||||||| ||    
T  41778965 atcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatcta---ggttcacgacagattaacacaataactctacccaatctct 41779061  T
Q  395 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||         | |   |  | || ||||| |||||||| |||    
T  41779062 tgacctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatatcttaagtgaattcaaaacc-------aaaatgttattatgtcaatccctatgtcataacc 41779154  T
Q  495 taataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41779155 taataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 41779200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14418630 - 14418445
Alignment:
Q  151 acttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagag 250  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| | || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  14418630 acttagcaatttctttatcaaaaaggatatgttaaattca-atggttgccctaggcagttgagttggtttttaacataaacaaattaaaaacaataaaag 14418532  T
Q  251 attggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaa 337  Q
     | | |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||| |||||    
T  14418531 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 537 - 626
Target Start/End: Original strand, 17633877 - 17633966
Alignment:
Q  537 attattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||    
T  17633877 attattggatttggttcaatcatttatacctaaaatttacttttactttgtttttgttctcacattccttctaaatacttgcagctagaa 17633966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 6224008 - 6223927
Alignment:
Q  545 atttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaa 626  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||  |||||||||  ||||||||||||    
T  6224008 atttggttcaatcatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgttcccatattccttctaaatacttgcagctagaa 6223927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 41836418 - 41836474
Alignment:
Q  267 ttgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttg 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  41836418 ttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttg 41836474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 41836318 - 41836394
Alignment:
Q  197 tgccctaggcagttgagttga--tttgtaacataaacggattaaaaacaataagagattggtttaagaaaaattgaga 272  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  41836318 tgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttagaaaatttgaga 41836394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14418431 - 14418396
Alignment:
Q  269 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14418431 gagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 14418396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 252 - 540
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7458
Alignment:
Q  252 ttggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattattta 351  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  7173 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattattta 7272  T
Q  352 taagttttacgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaa 451  Q
       |||| |||||||||||||| |||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 ---gtttcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttgacttagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaa 7369  T
Q  452 ccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7370 ccgttggaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagctttattacttaggttaaacctatta 7458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 252 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 2758 - 2471
Alignment:
Q  252 ttggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattattta 351  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2758 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattattta 2659  T
Q  352 taagttttacgacagattaactcagtact--tctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcga 449  Q
       |||| |||||||||||||| |||| |  ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2658 ---gtttcacgacagattaacttagtaatattctactcaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccctaaatctcttaagtgaattcga 2562  T
Q  450 aaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2561 aaccgttggaggtattaaaagaacgttgatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtcaaacctatta 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 262 - 540
Target Start/End: Original strand, 2794 - 3069
Alignment:
Q  262 aaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagttttac 361  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||    
T  2794 aaaatttgagagaagtatcgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatata---gtttcac 2890  T
Q  362 gacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagg 461  Q
    || |||||||   |||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  2891 gaaagattaaggtagtaattctaccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaactattggagg 2990  T
Q  462 cattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2991 tattaaaagaacgttaatccttgtgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacgtatta 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 260 - 540
Target Start/End: Original strand, 5999 - 6276
Alignment:
Q  260 agaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaaccaatgattatttataagtttt 359  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||| ||   | ||     
T  5999 agaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatcta---ggttc 6095  T
Q  360 acgacagattaactcagtacttctccccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttgga 459  Q
    ||||||||||||| || ||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  6096 acgacagattaacacaataactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcattgga 6195  T
Q  460 ggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttatta 540  Q
    ||  |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6196 ggttttaacagaacgttaaaccctatgtcataacctaataatgatctatctctaggttgattacttagattaaacttatta 6276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 431 - 540
Target Start/End: Original strand, 1 - 110
Alignment:
Q  431 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggcattaaaagaacgttaatccatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 100  T
Q  531 aaacttatta 540  Q
    ||||||||||    
T  101 aaacttatta 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 337
Target Start/End: Original strand, 88 - 273
Alignment:
Q  151 acttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagag 250  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| | || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  88 acttagcaatttctttatcaaaaaggatatgttaaattca-atggttgccctaggcagttgagttggtttttaacataaacaaattaaaaacaataaaag 186  T
Q  251 attggtttaagaaaaattgagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactcttctatggtaatttgacctcctagttcaa 337  Q
     | | |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||| |||||    
T  187 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 304
Target Start/End: Original strand, 287 - 322
Alignment:
Q  269 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  287 gagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 539 - 637
Target Start/End: Original strand, 445692 - 445790
Alignment:
Q  539 tattgaatttggttcaatcatttatacctctaatttacttttattttatttttgttctctcatatcttctaaatgtttgcagctagaatattggtgttg 637  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||  |||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  445692 tattggatttggttcaaatatttatacctcaaatttacttttattttgtttttgtgcttacattccttctaaatacttgcagctagaagattgttgttg 445790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University