View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15374_low_8 (Length: 435)

Name: NF15374_low_8
Description: NF15374
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15374_low_8
NF15374_low_8
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (153-425)||(5406199-5406471)
chr6 (153-425)||(5410524-5410796)
chr6 (153-425)||(31404674-31404947)
chr6 (161-425)||(5413401-5413665)
chr6 (153-417)||(2171531-2171796)
chr6 (156-425)||(30834538-30834809)
chr6 (153-417)||(16452328-16452594)
chr6 (153-425)||(33160351-33160626)
chr6 (153-425)||(9183031-9183304)
chr6 (154-425)||(28137409-28137681)
chr6 (153-425)||(26954286-26954558)
chr6 (154-376)||(21593608-21593831)
chr6 (153-425)||(33211185-33211458)
chr6 (153-415)||(3072758-3073016)
chr6 (154-336)||(21588916-21589098)
chr6 (177-386)||(3038926-3039137)
chr6 (153-376)||(3808707-3808933)
chr6 (153-398)||(6097450-6097679)
chr6 (154-376)||(2972940-2973163)
chr6 (154-376)||(5043571-5043795)
chr6 (153-415)||(412014-412271)
chr6 (154-376)||(17762933-17763158)
chr6 (154-349)||(17757995-17758191)
chr6 (154-366)||(26830124-26830337)
chr6 (154-376)||(22424826-22425052)
chr6 (153-376)||(603088-603304)
chr6 (180-386)||(4045356-4045566)
chr6 (153-432)||(16653008-16653281)
chr6 (153-418)||(16554778-16555038)
chr6 (153-418)||(16631334-16631594)
chr6 (153-412)||(16568951-16569190)
chr6 (153-321)||(27647861-27648029)
chr6 (153-418)||(16578517-16578777)
chr6 (153-418)||(16616603-16616863)
chr6 (161-252)||(5409076-5409167)
chr6 (153-398)||(25421235-25421475)
chr6 (153-398)||(6027178-6027416)
chr6 (154-267)||(26800642-26800755)
chr6 (326-425)||(16567101-16567201)
chr6 (157-398)||(33342108-33342343)
chr6 (157-321)||(13153913-13154080)
chr6 (193-352)||(25073538-25073698)
chr6 (157-321)||(34164856-34165023)
chr6 (153-321)||(34167078-34167249)
chr6 (17-89)||(5408933-5409005)
chr6 (17-89)||(5413258-5413330)
chr6 (17-91)||(9182894-9182968)
chr6 (17-89)||(31404538-31404610)
chr6 (17-91)||(16452191-16452265)
chr6 (17-91)||(2171390-2171464)
chr6 (17-91)||(28137274-28137347)
chr6 (17-91)||(30834397-30834471)
chr6 (178-245)||(9572667-9572735)
chr6 (17-89)||(5406066-5406135)
chr6 (17-89)||(5410391-5410460)
chr6 (351-384)||(5017329-5017362)
chr6 (351-384)||(5572076-5572109)
chr6 (351-384)||(5757311-5757344)
chr6 (351-384)||(22709241-22709274)
chr6 (351-386)||(24435802-24435837)
chr6 (195-248)||(2908532-2908586)
chr6 (17-91)||(16569251-16569324)
chr6 (17-91)||(26954154-26954227)
chr6 (351-384)||(21356268-21356301)
chr6 (351-384)||(22963930-22963963)
chr6 (351-384)||(23824430-23824463)
chr6 (351-380)||(31936806-31936835)
chr6 (17-81)||(3072620-3072684)
chr6 (154-198)||(19643894-19643938)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (153-425)||(45095060-45095332)
chr3 (153-425)||(37408354-37408627)
chr3 (153-425)||(5260322-5260596)
chr3 (153-425)||(19683888-19684162)
chr3 (153-415)||(5258143-5258407)
chr3 (153-425)||(7762161-7762434)
chr3 (153-417)||(23200137-23200402)
chr3 (153-417)||(23197938-23198203)
chr3 (153-425)||(7764363-7764633)
chr3 (153-425)||(9636125-9636400)
chr3 (153-425)||(9581178-9581451)
chr3 (153-423)||(5236457-5236727)
chr3 (153-425)||(40734393-40734666)
chr3 (161-425)||(22835010-22835275)
chr3 (159-425)||(40735278-40735545)
chr3 (153-395)||(44331470-44331713)
chr3 (153-425)||(760742-761015)
chr3 (174-425)||(29810763-29811016)
chr3 (153-425)||(51398709-51398982)
chr3 (153-386)||(29196386-29196622)
chr3 (153-425)||(29682254-29682527)
chr3 (153-425)||(29812958-29813231)
chr3 (153-425)||(39153361-39153634)
chr3 (153-425)||(16498925-16499197)
chr3 (153-425)||(800993-801261)
chr3 (161-425)||(53921511-53921776)
chr3 (154-376)||(6095600-6095823)
chr3 (153-386)||(44700479-44700713)
chr3 (154-366)||(4569906-4570120)
chr3 (154-376)||(54593648-54593871)
chr3 (153-386)||(31314379-31314613)
chr3 (161-425)||(32890998-32891264)
chr3 (153-376)||(34491157-34491380)
chr3 (153-376)||(43401800-43402026)
chr3 (153-376)||(49199468-49199694)
chr3 (153-386)||(23391909-23392143)
chr3 (153-376)||(30236069-30236293)
chr3 (154-366)||(41819523-41819737)
chr3 (153-376)||(43403743-43403969)
chr3 (154-366)||(46860427-46860642)
chr3 (153-425)||(9666466-9666741)
chr3 (153-425)||(32744436-32744699)
chr3 (153-361)||(7780003-7780204)
chr3 (153-349)||(47304224-47304419)
chr3 (178-376)||(5433906-5434102)
chr3 (163-375)||(46173311-46173515)
chr3 (153-386)||(23410329-23410563)
chr3 (153-398)||(6716430-6716668)
chr3 (153-398)||(54635055-54635293)
chr3 (153-398)||(45282913-45283155)
chr3 (187-376)||(36018795-36018987)
chr3 (153-398)||(3617379-3617619)
chr3 (270-425)||(26386597-26386754)
chr3 (157-398)||(25637358-25637592)
chr3 (221-376)||(31340268-31340425)
chr3 (193-341)||(51352150-51352298)
chr3 (153-263)||(40913352-40913461)
chr3 (154-258)||(55301972-55302076)
chr3 (203-386)||(5373157-5373353)
chr3 (157-398)||(4600747-4600982)
chr3 (157-321)||(4598526-4598693)
chr3 (157-321)||(10056217-10056384)
chr3 (157-321)||(10058439-10058606)
chr3 (157-321)||(10060661-10060828)
chr3 (157-321)||(10062883-10063050)
chr3 (157-321)||(10065105-10065272)
chr3 (157-321)||(10211393-10211560)
chr3 (276-387)||(2075178-2075292)
chr3 (159-316)||(4055769-4055926)
chr3 (157-321)||(10209173-10209340)
chr3 (17-91)||(37408690-37408764)
chr3 (195-361)||(35138746-35138915)
chr3 (17-89)||(45095396-45095468)
chr3 (17-91)||(9581514-9581588)
chr3 (17-91)||(9634684-9634758)
chr3 (17-91)||(9635987-9636061)
chr3 (17-91)||(7764696-7764770)
chr3 (17-91)||(19683751-19683825)
chr3 (17-91)||(29813292-29813366)
chr3 (17-91)||(40735613-40735687)
chr3 (159-287)||(4075476-4075605)
chr3 (23-91)||(51399045-51399113)
chr3 (162-221)||(27305719-27305777)
chr3 (17-91)||(7762497-7762571)
chr3 (17-91)||(29811099-29811173)
chr3 (188-302)||(25491003-25491116)
chr3 (205-361)||(26323124-26323283)
chr3 (154-228)||(2075076-2075149)
chr3 (17-91)||(5258007-5258081)
chr3 (17-91)||(5260186-5260260)
chr3 (17-91)||(40734728-40734802)
chr3 (201-382)||(3148037-3148221)
chr3 (197-300)||(20937678-20937781)
chr3 (178-288)||(33191866-33191974)
chr3 (214-386)||(8166516-8166693)
chr3 (202-383)||(1313852-1314037)
chr3 (25-91)||(5236328-5236394)
chr3 (17-91)||(21350874-21350944)
chr3 (215-351)||(40519258-40519391)
chr3 (205-316)||(54739004-54739116)
chr3 (157-193)||(10067435-10067471)
chr3 (351-386)||(3323511-3323546)
chr3 (17-91)||(761076-761149)
chr3 (17-91)||(22834870-22834943)
chr3 (351-384)||(16264580-16264613)
chr3 (351-384)||(24694988-24695021)
chr3 (351-384)||(26299219-26299252)
chr3 (351-384)||(26928421-26928454)
chr3 (351-384)||(27986278-27986311)
chr3 (351-384)||(36029324-36029357)
chr3 (351-384)||(40592604-40592637)
chr3 (351-384)||(47923726-47923759)
chr3 (352-384)||(21711454-21711486)
chr3 (17-81)||(23200000-23200063)
chr3 (344-380)||(30709615-30709651)
chr3 (351-386)||(6794535-6794570)
chr3 (351-382)||(8126861-8126892)
chr3 (351-385)||(3328178-3328212)
chr3 (352-386)||(4386797-4386831)
chr3 (351-425)||(39032335-39032409)
chr3 (178-349)||(39127519-39127693)
chr3 (17-91)||(44700347-44700420)
chr3 (351-380)||(1736130-1736159)
chr3 (351-384)||(8370311-8370344)
chr3 (351-384)||(27038282-27038315)
chr3 (351-384)||(27453191-27453224)
chr3 (351-384)||(27974774-27974807)
chr3 (233-309)||(28253346-28253423)
chr3 (351-384)||(32143554-32143587)
chr3 (351-384)||(33386497-33386530)
chr3 (351-380)||(35925709-35925738)
chr3 (321-366)||(40612562-40612607)
chr3 (19-91)||(23391778-23391849)
[»] chr5 (90 HSPs)
chr5 (153-425)||(25412657-25412929)
chr5 (153-425)||(30182484-30182757)
chr5 (153-425)||(13342956-13343229)
chr5 (153-425)||(13239647-13239920)
chr5 (153-425)||(36074042-36074317)
chr5 (153-425)||(32636719-32636992)
chr5 (159-425)||(13488098-13488365)
chr5 (153-384)||(37439070-37439310)
chr5 (153-425)||(42428430-42428703)
chr5 (153-425)||(533664-533937)
chr5 (153-415)||(16409387-16409644)
chr5 (153-425)||(39468549-39468822)
chr5 (154-425)||(16451976-16452247)
chr5 (159-425)||(28750661-28750928)
chr5 (153-415)||(26177795-26178051)
chr5 (153-425)||(42426235-42426508)
chr5 (154-376)||(213409-213633)
chr5 (161-422)||(30682930-30683190)
chr5 (161-425)||(537920-538185)
chr5 (153-415)||(9789223-9789480)
chr5 (153-415)||(18441647-18441904)
chr5 (153-425)||(33831575-33831848)
chr5 (154-425)||(31182868-31183138)
chr5 (153-398)||(8565946-8566192)
chr5 (153-376)||(28278260-28278484)
chr5 (154-376)||(40147205-40147428)
chr5 (154-425)||(3075659-3075931)
chr5 (153-415)||(26170686-26170931)
chr5 (154-366)||(5058002-5058212)
chr5 (153-398)||(29751159-29751398)
chr5 (172-425)||(42309953-42310208)
chr5 (225-425)||(5887487-5887689)
chr5 (156-376)||(27637615-27637838)
chr5 (153-398)||(29720294-29720533)
chr5 (153-398)||(29722454-29722693)
chr5 (165-386)||(9049354-9049576)
chr5 (159-376)||(38746949-38747167)
chr5 (177-365)||(13695713-13695904)
chr5 (154-376)||(27015476-27015690)
chr5 (153-321)||(22536289-22536457)
chr5 (153-415)||(19806289-19806531)
chr5 (154-365)||(16640941-16641153)
chr5 (153-321)||(10593258-10593427)
chr5 (153-398)||(25078050-25078290)
chr5 (153-398)||(25136019-25136259)
chr5 (301-425)||(42926788-42926913)
chr5 (153-321)||(40380090-40380260)
chr5 (153-321)||(40382301-40382471)
chr5 (153-315)||(316769-316932)
chr5 (157-398)||(16546561-16546796)
chr5 (157-398)||(16544339-16544574)
chr5 (153-274)||(33906029-33906151)
chr5 (17-91)||(30682786-30682860)
chr5 (17-91)||(39468412-39468486)
chr5 (154-246)||(42926967-42927058)
chr5 (193-386)||(3325847-3326043)
chr5 (159-219)||(4160702-4160762)
chr5 (17-89)||(25412993-25413065)
chr5 (214-361)||(35616129-35616278)
chr5 (17-91)||(13343291-13343365)
chr5 (17-91)||(30182819-30182893)
chr5 (192-267)||(10054854-10054929)
chr5 (19-91)||(36073908-36073980)
chr5 (178-315)||(10700674-10700809)
chr5 (192-267)||(8445770-8445846)
chr5 (342-386)||(11181663-11181707)
chr5 (351-386)||(24553358-24553393)
chr5 (351-386)||(28832488-28832523)
chr5 (17-91)||(16409710-16409784)
chr5 (204-300)||(22097886-22097981)
chr5 (164-256)||(30793202-30793293)
chr5 (17-91)||(33831910-33831983)
chr5 (17-91)||(42426099-42426172)
chr5 (17-91)||(42428294-42428367)
chr5 (221-267)||(42926922-42926968)
chr5 (215-361)||(6016968-6017115)
chr5 (351-384)||(9353165-9353198)
chr5 (351-384)||(11916805-11916838)
chr5 (351-384)||(14520461-14520494)
chr5 (351-384)||(36932181-36932214)
chr5 (217-296)||(30802854-30802934)
chr5 (351-386)||(17003790-17003825)
chr5 (351-386)||(31300426-31300461)
chr5 (24-91)||(42927124-42927190)
chr5 (17-91)||(26178117-26178191)
chr5 (351-384)||(15464765-15464798)
chr5 (351-384)||(19588976-19589009)
chr5 (153-198)||(38882340-38882384)
chr5 (19-91)||(13488432-13488503)
chr5 (154-198)||(18596881-18596924)
[»] chr7 (113 HSPs)
chr7 (153-425)||(29990950-29991222)
chr7 (153-417)||(35853818-35854083)
chr7 (153-425)||(23554935-23555209)
chr7 (153-425)||(4178670-4178942)
chr7 (153-425)||(14069833-14070106)
chr7 (153-425)||(14379861-14380134)
chr7 (153-425)||(19502073-19502347)
chr7 (174-425)||(48491474-48491727)
chr7 (153-415)||(39731281-39731538)
chr7 (153-417)||(48408705-48408973)
chr7 (153-425)||(18126539-18126812)
chr7 (153-425)||(43864139-43864412)
chr7 (159-425)||(4586056-4586323)
chr7 (153-386)||(41317434-41317668)
chr7 (153-425)||(31732969-31733242)
chr7 (161-425)||(47676144-47676409)
chr7 (153-425)||(48489326-48489599)
chr7 (153-392)||(27347745-27347985)
chr7 (153-417)||(25766959-25767219)
chr7 (172-425)||(1113552-1113807)
chr7 (153-386)||(8153276-8153510)
chr7 (161-425)||(30024740-30025005)
chr7 (162-398)||(47673953-47674189)
chr7 (153-425)||(26417211-26417483)
chr7 (153-425)||(38671222-38671495)
chr7 (153-366)||(34310715-34310929)
chr7 (153-425)||(41649011-41649282)
chr7 (154-425)||(31105394-31105666)
chr7 (153-425)||(495983-496256)
chr7 (154-362)||(22269931-22270140)
chr7 (153-425)||(25615758-25616022)
chr7 (154-376)||(4508707-4508930)
chr7 (154-382)||(8359316-8359547)
chr7 (158-376)||(6431915-6432134)
chr7 (153-386)||(36146408-36146643)
chr7 (154-425)||(4253529-4253803)
chr7 (153-415)||(43504153-43504411)
chr7 (154-376)||(48599335-48599558)
chr7 (159-376)||(2360978-2361196)
chr7 (154-376)||(3258938-3259162)
chr7 (156-376)||(29608680-29608902)
chr7 (156-376)||(2390226-2390447)
chr7 (153-386)||(12097867-12098093)
chr7 (212-425)||(31518690-31518905)
chr7 (154-376)||(4510549-4510772)
chr7 (154-376)||(4512391-4512614)
chr7 (304-425)||(24514912-24515033)
chr7 (154-425)||(36574517-36574789)
chr7 (161-425)||(23565069-23565333)
chr7 (153-398)||(24789771-24790010)
chr7 (154-290)||(32358055-32358190)
chr7 (164-398)||(23343896-23344130)
chr7 (250-425)||(24525992-24526170)
chr7 (241-398)||(4538627-4538786)
chr7 (153-398)||(20343827-20344065)
chr7 (291-425)||(2761439-2761575)
chr7 (153-296)||(2759197-2759339)
chr7 (153-398)||(18388759-18388997)
chr7 (153-398)||(18392195-18392433)
chr7 (159-376)||(22328395-22328622)
chr7 (153-398)||(6592339-6592577)
chr7 (153-398)||(6594557-6594795)
chr7 (153-398)||(32060321-32060563)
chr7 (161-313)||(31518911-31519063)
chr7 (153-267)||(6359952-6360065)
chr7 (159-246)||(24525508-24525594)
chr7 (159-236)||(1560671-1560749)
chr7 (161-385)||(3904624-3904851)
chr7 (20-91)||(27348048-27348119)
chr7 (154-247)||(18396392-18396486)
chr7 (17-91)||(25766820-25766894)
chr7 (17-91)||(35854147-35854221)
chr7 (17-90)||(23555273-23555346)
chr7 (153-228)||(30814530-30814604)
chr7 (17-91)||(25616086-25616160)
chr7 (17-91)||(48409038-48409112)
chr7 (192-343)||(5116582-5116735)
chr7 (154-258)||(5513668-5513771)
chr7 (18-91)||(43864475-43864548)
chr7 (260-385)||(5514115-5514243)
chr7 (17-89)||(29991286-29991358)
chr7 (17-91)||(495851-495924)
chr7 (17-91)||(18126877-18126951)
chr7 (17-91)||(48489662-48489736)
chr7 (229-354)||(1360226-1360353)
chr7 (287-386)||(30843366-30843467)
chr7 (353-425)||(6570489-6570561)
chr7 (161-386)||(26639254-26639486)
chr7 (17-88)||(48491810-48491881)
chr7 (17-91)||(26417547-26417621)
chr7 (18-91)||(4586392-4586465)
chr7 (351-426)||(9184964-9185040)
chr7 (17-91)||(4179004-4179078)
chr7 (17-91)||(31732832-31732906)
chr7 (17-91)||(39731602-39731676)
chr7 (17-91)||(41648877-41648950)
chr7 (17-91)||(47673808-47673881)
chr7 (251-398)||(1562103-1562241)
chr7 (351-386)||(9189838-9189873)
chr7 (351-386)||(20284320-20284355)
chr7 (351-386)||(23402844-23402879)
chr7 (351-385)||(9235414-9235448)
chr7 (17-91)||(41317302-41317375)
chr7 (188-309)||(43363507-43363629)
chr7 (17-91)||(47676000-47676073)
chr7 (351-384)||(2479567-2479600)
chr7 (351-384)||(21989139-21989172)
chr7 (351-384)||(44847958-44847991)
chr7 (351-386)||(2580621-2580656)
chr7 (18-88)||(1113887-1113956)
chr7 (351-384)||(4796501-4796534)
chr7 (351-384)||(46516138-46516171)
chr7 (353-381)||(35961050-35961078)
[»] chr8 (97 HSPs)
chr8 (153-425)||(31218152-31218426)
chr8 (153-425)||(34254330-34254601)
chr8 (153-425)||(34256506-34256777)
chr8 (153-425)||(17982548-17982822)
chr8 (153-425)||(42498089-42498363)
chr8 (153-425)||(44303749-44304024)
chr8 (153-425)||(1746218-1746491)
chr8 (153-425)||(19945358-19945633)
chr8 (153-425)||(15212681-15212954)
chr8 (153-425)||(43036318-43036591)
chr8 (153-425)||(33352045-33352318)
chr8 (153-425)||(12702634-12702911)
chr8 (153-425)||(4731553-4731826)
chr8 (153-425)||(27811173-27811446)
chr8 (153-425)||(3303670-3303943)
chr8 (153-425)||(5689166-5689439)
chr8 (174-425)||(30143237-30143488)
chr8 (153-425)||(6598867-6599140)
chr8 (153-425)||(6674320-6674593)
chr8 (153-425)||(1345371-1345644)
chr8 (154-376)||(4283468-4283691)
chr8 (156-415)||(2627647-2627902)
chr8 (160-425)||(1292471-1292736)
chr8 (153-386)||(40321014-40321248)
chr8 (160-423)||(18141717-18141981)
chr8 (154-366)||(42434992-42435204)
chr8 (154-420)||(4162400-4162663)
chr8 (154-366)||(18655355-18655567)
chr8 (160-415)||(41366622-41366877)
chr8 (159-425)||(18106087-18106351)
chr8 (159-376)||(40221689-40221907)
chr8 (153-378)||(9765691-9765912)
chr8 (153-376)||(10930199-10930423)
chr8 (154-374)||(8965692-8965914)
chr8 (153-378)||(19491699-19491924)
chr8 (192-376)||(44353736-44353923)
chr8 (153-411)||(4743214-4743462)
chr8 (180-376)||(40328723-40328922)
chr8 (162-380)||(30291545-30291767)
chr8 (154-366)||(11383941-11384152)
chr8 (153-398)||(25689885-25690123)
chr8 (161-352)||(3772161-3772352)
chr8 (153-398)||(3439434-3439672)
chr8 (233-425)||(41364926-41365120)
chr8 (203-425)||(10929696-10929907)
chr8 (165-398)||(8153683-8153914)
chr8 (157-321)||(42575327-42575494)
chr8 (158-321)||(15290522-15290688)
chr8 (158-321)||(15470891-15471057)
chr8 (178-365)||(11712024-11712214)
chr8 (154-244)||(4733784-4733873)
chr8 (192-331)||(1822282-1822423)
chr8 (192-331)||(1856727-1856868)
chr8 (159-284)||(10015119-10015241)
chr8 (154-258)||(3073875-3073977)
chr8 (154-425)||(29796320-29796596)
chr8 (161-288)||(7597648-7597776)
chr8 (17-89)||(34254194-34254266)
chr8 (17-91)||(4731889-4731963)
chr8 (351-425)||(4733704-4733778)
chr8 (17-91)||(15213017-15213091)
chr8 (17-91)||(30143571-30143645)
chr8 (17-89)||(34256370-34256442)
chr8 (17-91)||(17982884-17982958)
chr8 (17-91)||(27811509-27811583)
chr8 (17-91)||(44304086-44304160)
chr8 (17-90)||(1746082-1746155)
chr8 (20-91)||(42498426-42498497)
chr8 (351-425)||(10015043-10015117)
chr8 (178-267)||(32902197-32902287)
chr8 (213-316)||(10240159-10240264)
chr8 (19-91)||(33352381-33352453)
chr8 (17-91)||(18105939-18106012)
chr8 (218-386)||(3231859-3232031)
chr8 (17-91)||(19945222-19945296)
chr8 (323-388)||(38863803-38863868)
chr8 (17-91)||(41366481-41366554)
chr8 (364-425)||(19948533-19948594)
chr8 (214-386)||(41266902-41267078)
chr8 (17-81)||(4733947-4734011)
chr8 (20-91)||(31218488-31218559)
chr8 (180-231)||(38863949-38864000)
chr8 (205-316)||(11137031-11137146)
chr8 (351-384)||(4456259-4456292)
chr8 (351-384)||(4696441-4696474)
chr8 (17-91)||(6599200-6599270)
chr8 (17-91)||(6674653-6674723)
chr8 (351-384)||(7412571-7412604)
chr8 (282-361)||(7444946-7445026)
chr8 (351-386)||(7493004-7493039)
chr8 (17-91)||(1292332-1292405)
chr8 (17-91)||(1345239-1345312)
chr8 (202-264)||(30909426-30909487)
chr8 (351-384)||(5702313-5702346)
chr8 (351-384)||(19175587-19175620)
chr8 (350-386)||(5990392-5990428)
chr8 (352-384)||(23799409-23799441)
[»] chr2 (92 HSPs)
chr2 (153-425)||(5723255-5723527)
chr2 (153-425)||(4503132-4503405)
chr2 (153-425)||(45099650-45099923)
chr2 (153-425)||(2334417-2334690)
chr2 (153-425)||(36205664-36205936)
chr2 (153-425)||(36988075-36988348)
chr2 (153-415)||(4484329-4484594)
chr2 (159-398)||(29867791-29868031)
chr2 (153-425)||(6595005-6595279)
chr2 (153-425)||(38312135-38312408)
chr2 (153-415)||(30833250-30833515)
chr2 (153-425)||(723744-724017)
chr2 (174-425)||(42362247-42362500)
chr2 (153-425)||(34139770-34140044)
chr2 (153-425)||(11151591-11151864)
chr2 (153-421)||(17057369-17057638)
chr2 (153-421)||(17085352-17085621)
chr2 (153-425)||(36318009-36318282)
chr2 (161-425)||(11690396-11690661)
chr2 (153-415)||(32289477-32289733)
chr2 (153-425)||(14633825-14634099)
chr2 (153-386)||(36773496-36773730)
chr2 (153-425)||(33162450-33162723)
chr2 (154-376)||(35446885-35447108)
chr2 (156-376)||(1631735-1631956)
chr2 (154-378)||(45726871-45727096)
chr2 (153-377)||(11067248-11067473)
chr2 (153-398)||(6266621-6266860)
chr2 (188-385)||(13121703-13121901)
chr2 (220-399)||(24885582-24885763)
chr2 (154-386)||(17490149-17490376)
chr2 (159-376)||(42288117-42288334)
chr2 (153-376)||(24397997-24398227)
chr2 (192-425)||(14202450-14202680)
chr2 (192-386)||(7815311-7815508)
chr2 (278-425)||(39284780-39284929)
chr2 (154-385)||(11049484-11049721)
chr2 (154-349)||(33648142-33648340)
chr2 (157-321)||(13656035-13656200)
chr2 (154-386)||(26353124-26353351)
chr2 (153-398)||(12647385-12647623)
chr2 (153-361)||(17450550-17450745)
chr2 (214-398)||(12123644-12123831)
chr2 (154-267)||(7451173-7451284)
chr2 (17-88)||(5723119-5723190)
chr2 (153-228)||(39284930-39285004)
chr2 (178-352)||(7597036-7597211)
chr2 (17-91)||(45099985-45100059)
chr2 (178-349)||(30218068-30218241)
chr2 (165-276)||(28671976-28672088)
chr2 (17-91)||(17057232-17057306)
chr2 (17-91)||(17085215-17085289)
chr2 (17-91)||(36205528-36205602)
chr2 (17-91)||(38312471-38312545)
chr2 (17-91)||(6594867-6594941)
chr2 (17-91)||(36987938-36988012)
chr2 (302-424)||(5700271-5700396)
chr2 (180-267)||(42019896-42019986)
chr2 (193-316)||(42261524-42261648)
chr2 (17-91)||(4484191-4484265)
chr2 (153-265)||(24197955-24198065)
chr2 (17-91)||(4502996-4503070)
chr2 (177-223)||(42412117-42412162)
chr2 (17-91)||(723610-723683)
chr2 (17-91)||(2838177-2838250)
chr2 (202-307)||(3897005-3897111)
chr2 (17-91)||(11067532-11067605)
chr2 (17-91)||(14633691-14633764)
chr2 (17-91)||(32289799-32289873)
chr2 (214-307)||(34811281-34811375)
chr2 (351-384)||(17865436-17865469)
chr2 (351-384)||(21630176-21630209)
chr2 (351-384)||(23078304-23078337)
chr2 (351-384)||(34389082-34389115)
chr2 (351-384)||(36757595-36757628)
chr2 (351-384)||(40739065-40739098)
chr2 (189-382)||(41454173-41454366)
chr2 (351-386)||(10445298-10445333)
chr2 (44-91)||(30833579-30833626)
chr2 (351-386)||(40015156-40015191)
chr2 (17-91)||(34139636-34139709)
chr2 (351-384)||(8389982-8390015)
chr2 (351-384)||(10707085-10707118)
chr2 (351-384)||(13569560-13569593)
chr2 (351-384)||(14698842-14698875)
chr2 (351-384)||(28259010-28259043)
chr2 (351-384)||(33118366-33118399)
chr2 (351-384)||(33528457-33528490)
chr2 (351-384)||(39483164-39483197)
chr2 (153-198)||(42064725-42064770)
chr2 (230-263)||(43406029-43406062)
chr2 (351-425)||(3278231-3278307)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (153-425)||(56178636-56178909)
chr4 (154-425)||(29999806-30000078)
chr4 (153-425)||(52095362-52095635)
chr4 (153-425)||(48142937-48143212)
chr4 (153-425)||(12739550-12739823)
chr4 (153-425)||(5370082-5370359)
chr4 (153-425)||(9927458-9927730)
chr4 (192-425)||(12747794-12748029)
chr4 (153-425)||(5429574-5429847)
chr4 (153-425)||(37740521-37740793)
chr4 (153-417)||(13992292-13992551)
chr4 (153-425)||(26175636-26175909)
chr4 (153-425)||(34570414-34570687)
chr4 (153-425)||(54199907-54200179)
chr4 (153-425)||(52082663-52082930)
chr4 (153-425)||(47038411-47038682)
chr4 (194-424)||(12745476-12745708)
chr4 (153-425)||(5871715-5871988)
chr4 (153-425)||(36994420-36994692)
chr4 (153-386)||(36463389-36463623)
chr4 (153-425)||(52467354-52467628)
chr4 (153-398)||(31495315-31495556)
chr4 (154-376)||(46703443-46703669)
chr4 (154-386)||(6542180-6542415)
chr4 (153-366)||(2209668-2209883)
chr4 (153-425)||(29254389-29254662)
chr4 (153-378)||(48893638-48893868)
chr4 (153-376)||(54882964-54883188)
chr4 (154-386)||(37229722-37229957)
chr4 (174-376)||(8665351-8665556)
chr4 (154-376)||(41639370-41639593)
chr4 (154-411)||(31474059-31474318)
chr4 (153-386)||(45687182-45687417)
chr4 (154-366)||(40632400-40632612)
chr4 (154-376)||(6655900-6656123)
chr4 (154-364)||(8648095-8648306)
chr4 (196-425)||(24969006-24969238)
chr4 (154-386)||(4587892-4588126)
chr4 (157-376)||(41964358-41964580)
chr4 (154-366)||(50673848-50674059)
chr4 (153-349)||(27416965-27417160)
chr4 (153-425)||(13009444-13009704)
chr4 (153-334)||(26364223-26364404)
chr4 (154-376)||(12073336-12073560)
chr4 (154-376)||(379322-379548)
chr4 (154-425)||(5207843-5208116)
chr4 (153-376)||(50262700-50262922)
chr4 (153-300)||(12743925-12744071)
chr4 (153-300)||(12745314-12745460)
chr4 (153-376)||(12119481-12119708)
chr4 (192-360)||(3913408-3913578)
chr4 (162-376)||(35662384-35662600)
chr4 (154-386)||(51336998-51337231)
chr4 (153-337)||(46147391-46147575)
chr4 (192-424)||(48142413-48142651)
chr4 (194-300)||(12744087-12744193)
chr4 (153-398)||(8393326-8393563)
chr4 (153-398)||(8395535-8395772)
chr4 (159-376)||(26699447-26699670)
chr4 (174-376)||(21688192-21688397)
chr4 (231-366)||(55085442-55085578)
chr4 (200-351)||(53345187-53345340)
chr4 (162-382)||(29056295-29056518)
chr4 (180-361)||(33089837-33090021)
chr4 (153-398)||(7124831-7125071)
chr4 (157-398)||(5135994-5136230)
chr4 (234-366)||(41639218-41639351)
chr4 (157-321)||(5138288-5138455)
chr4 (153-398)||(7122612-7122852)
chr4 (161-348)||(22882759-22882946)
chr4 (161-348)||(22934423-22934610)
chr4 (178-267)||(33989899-33989989)
chr4 (17-91)||(5429910-5429984)
chr4 (195-386)||(6677402-6677597)
chr4 (17-91)||(48143279-48143353)
chr4 (218-343)||(32091456-32091583)
chr4 (17-91)||(5369945-5370019)
chr4 (17-91)||(13992154-13992228)
chr4 (17-91)||(34570277-34570351)
chr4 (178-300)||(5349932-5350052)
chr4 (17-88)||(52082526-52082597)
chr4 (17-91)||(47038279-47038352)
chr4 (17-91)||(54199771-54199845)
chr4 (17-91)||(56178499-56178573)
chr4 (352-425)||(3910002-3910075)
chr4 (21-91)||(9927326-9927396)
chr4 (17-91)||(37740856-37740930)
chr4 (154-258)||(21703836-21703940)
chr4 (165-300)||(34112839-34112973)
chr4 (17-81)||(52095225-52095289)
chr4 (370-425)||(52093882-52093937)
chr4 (17-91)||(5872049-5872122)
chr4 (201-382)||(52065534-52065719)
chr4 (154-386)||(44967829-44968064)
chr4 (18-91)||(52467222-52467295)
chr4 (201-308)||(16422653-16422761)
chr4 (271-361)||(35369558-35369649)
chr4 (180-263)||(37754986-37755070)
chr4 (351-386)||(5112468-5112503)
chr4 (230-309)||(34788851-34788930)
chr4 (17-91)||(31474378-31474451)
chr4 (342-384)||(31985466-31985508)
chr4 (216-349)||(44570427-44570567)
chr4 (17-91)||(48893506-48893579)
chr4 (351-384)||(3777780-3777813)
chr4 (351-384)||(5269033-5269066)
chr4 (351-384)||(5396504-5396537)
chr4 (351-384)||(6743248-6743281)
chr4 (351-384)||(10047612-10047645)
chr4 (351-384)||(16623126-16623159)
chr4 (351-384)||(16628705-16628738)
chr4 (352-384)||(25861866-25861898)
chr4 (351-425)||(36315021-36315096)
chr4 (351-425)||(36329230-36329305)
chr4 (351-386)||(39774136-39774171)
chr4 (322-386)||(5349840-5349905)
chr4 (17-91)||(29254725-29254798)
chr4 (17-91)||(46147259-46147332)
chr4 (351-384)||(8689329-8689362)
chr4 (204-247)||(1122865-1122909)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (153-425)||(434428-434702)
scaffold0002 (193-316)||(490359-490483)
scaffold0002 (44-91)||(434765-434812)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (157-425)||(20762567-20762837)
chr1 (153-425)||(3189226-3189499)
chr1 (153-425)||(3198043-3198316)
chr1 (153-425)||(3206882-3207155)
chr1 (153-425)||(3156761-3157033)
chr1 (153-425)||(834167-834440)
chr1 (153-425)||(8550786-8551060)
chr1 (153-425)||(28220226-28220499)
chr1 (159-425)||(44455055-44455322)
chr1 (153-425)||(28223421-28223694)
chr1 (153-425)||(31659133-31659406)
chr1 (153-425)||(49918244-49918518)
chr1 (153-386)||(50167175-50167409)
chr1 (153-425)||(3847121-3847394)
chr1 (161-425)||(50169218-50169483)
chr1 (153-415)||(51765300-51765566)
chr1 (153-425)||(37503557-37503827)
chr1 (161-425)||(196915-197181)
chr1 (153-386)||(28265554-28265788)
chr1 (177-425)||(1833417-1833667)
chr1 (153-425)||(13659336-13659609)
chr1 (153-425)||(45644354-45644628)
chr1 (154-376)||(37168241-37168465)
chr1 (153-424)||(4552637-4552909)
chr1 (154-375)||(13547090-13547312)
chr1 (154-375)||(13549001-13549223)
chr1 (153-425)||(37559867-37560142)
chr1 (153-425)||(10925118-10925394)
chr1 (154-376)||(11348642-11348865)
chr1 (153-425)||(13137976-13138247)
chr1 (174-425)||(23555286-23555538)
chr1 (153-398)||(46064840-46065086)
chr1 (154-366)||(29136202-29136415)
chr1 (153-321)||(13316351-13316520)
chr1 (174-425)||(15820202-15820455)
chr1 (154-349)||(47255340-47255535)
chr1 (153-366)||(42297974-42298188)
chr1 (153-376)||(37033071-37033297)
chr1 (154-376)||(47115115-47115340)
chr1 (153-396)||(30476446-30476692)
chr1 (154-365)||(31925708-31925919)
chr1 (154-376)||(193555-193778)
chr1 (153-376)||(19754438-19754663)
chr1 (154-425)||(927977-928251)
chr1 (154-366)||(7482231-7482445)
chr1 (153-398)||(9987132-9987370)
chr1 (153-398)||(20622236-20622476)
chr1 (158-376)||(34603519-34603740)
chr1 (153-398)||(40282307-40282546)
chr1 (153-425)||(40122196-40122471)
chr1 (153-378)||(41360857-41361082)
chr1 (153-363)||(19752643-19752854)
chr1 (153-418)||(9036326-9036585)
chr1 (157-398)||(21053888-21054123)
chr1 (193-352)||(16455591-16455750)
chr1 (178-316)||(22079322-22079461)
chr1 (153-398)||(44203563-44203801)
chr1 (163-383)||(37282701-37282923)
chr1 (249-376)||(37879006-37879135)
chr1 (154-245)||(28242382-28242472)
chr1 (163-386)||(44650172-44650398)
chr1 (154-253)||(37876767-37876865)
chr1 (180-349)||(6808418-6808595)
chr1 (347-417)||(13316513-13316583)
chr1 (153-314)||(2926516-2926678)
chr1 (194-343)||(9109459-9109610)
chr1 (18-91)||(44455391-44455464)
chr1 (165-365)||(8871074-8871259)
chr1 (17-91)||(3157096-3157170)
chr1 (17-91)||(8550647-8550721)
chr1 (178-316)||(13938143-13938281)
chr1 (174-236)||(36683766-36683828)
chr1 (177-300)||(3460717-3460841)
chr1 (17-91)||(37559728-37559803)
chr1 (17-88)||(49918584-49918655)
chr1 (153-352)||(12318523-12318721)
chr1 (17-90)||(31659470-31659543)
chr1 (17-89)||(10925455-10925527)
chr1 (196-285)||(2263016-2263106)
chr1 (182-267)||(5459961-5460046)
chr1 (351-425)||(22819662-22819737)
chr1 (24-91)||(37503427-37503494)
chr1 (17-91)||(13316215-13316289)
chr1 (19-81)||(20762909-20762971)
chr1 (204-297)||(32471486-32471579)
chr1 (339-386)||(777177-777225)
chr1 (251-350)||(44646881-44646981)
chr1 (351-386)||(47098656-47098691)
chr1 (351-386)||(47102670-47102705)
chr1 (17-91)||(834033-834106)
chr1 (214-376)||(25652029-25652195)
chr1 (17-91)||(28220090-28220163)
chr1 (17-91)||(28223285-28223358)
chr1 (17-91)||(50169078-50169151)
chr1 (351-384)||(3281938-3281971)
chr1 (351-384)||(13604455-13604488)
chr1 (351-384)||(16124347-16124380)
chr1 (214-258)||(16914234-16914279)
chr1 (351-384)||(37069998-37070031)
chr1 (31-91)||(51765630-51765690)
chr1 (17-91)||(196773-196846)
chr1 (201-258)||(4535527-4535585)
chr1 (163-225)||(44646814-44646875)
chr1 (353-386)||(9022737-9022770)
chr1 (351-384)||(13598631-13598664)
chr1 (153-198)||(15916626-15916671)
chr1 (351-380)||(29652044-29652073)
chr1 (153-198)||(31422862-31422906)
chr1 (351-380)||(32889669-32889698)
chr1 (214-382)||(1050503-1050674)
chr1 (324-376)||(6484023-6484075)
chr1 (352-380)||(26644735-26644763)
chr1 (250-317)||(36683694-36683762)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (153-417)||(820-1084)
scaffold1519 (44-91)||(1147-1194)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (153-376)||(11502-11726)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (153-386)||(114537-114771)
scaffold0016 (19-91)||(114834-114906)
[»] scaffold0491 (4 HSPs)
scaffold0491 (153-415)||(11160-11425)
scaffold0491 (153-415)||(8734-8999)
scaffold0491 (44-91)||(8623-8670)
scaffold0491 (44-91)||(11049-11096)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (153-425)||(20415-20688)
scaffold0066 (17-91)||(20278-20352)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (153-425)||(149097-149370)
scaffold0006 (351-384)||(133112-133145)
scaffold0006 (352-384)||(2726-2758)
scaffold0006 (351-384)||(5916-5949)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (154-366)||(7282-7494)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (154-366)||(18004-18216)
scaffold0176 (351-384)||(17482-17515)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (154-343)||(10468-10656)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (153-398)||(2603-2841)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (209-366)||(80338-80496)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (157-398)||(3729-3963)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (157-418)||(6183-6438)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (165-386)||(27453-27678)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (201-310)||(25065-25175)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (331-386)||(19117-19173)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (351-384)||(8250-8283)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (157-186)||(1-30)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (351-384)||(45429-45462)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (351-384)||(36665-36698)
scaffold0087 (351-380)||(43798-43827)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (351-384)||(85914-85947)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 5406199 - 5406471
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406199 ttgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5406298  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406299 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5406398  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5406399 aaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 5406471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 5410524 - 5410796
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410524 ttgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5410623  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410624 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5410723  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5410724 aaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 5410796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 31404674 - 31404947
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404674 ttgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 31404773  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404774 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31404873  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatc-aaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31404874 aaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 31404947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413665
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaa 5413500  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtt 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5413501 ttagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaatgtgtt 5413600  T
Q  361 tacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5413601 tacaatgtttcccaacccgagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 5413665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 2171531 - 2171796
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2171531 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaagggtt 2171629  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171630 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 2171729  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag-aactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  2171730 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgc 2171796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 156 - 425
Target Start/End: Original strand, 30834538 - 30834809
Alignment:
Q  156 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttaca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30834538 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttaca 30834637  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacca 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30834638 agaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccg 30834737  T
Q  354 aggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  30834738 aggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaactctaatcaaagaccataaaccctaaagttgcttcctttg 30834809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 16452328 - 16452594
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16452328 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggtt 16452427  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452428 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 16452527  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16452528 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaactctaaagttgc 16452594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 33160351 - 33160626
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33160351 ttgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 33160450  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta--tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-ttttcactc 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33160451 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactc 33160550  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||    
T  33160551 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 33160626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 9183031 - 9183304
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9183031 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 9183129  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9183130 acaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 9183229  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  9183230 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaggagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 9183304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137681
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggtta 28137507  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28137508 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 28137607  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  28137608 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttaactcctttg 28137681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 26954286 - 26954558
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  26954286 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagtt 26954384  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26954385 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttataccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactcccc 26954484  T
Q  353 -aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||    
T  26954485 aaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagataactctaatcaaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 26954558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593608
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 21593733  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  21593732 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 21593634  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  21593633 caaggtgtttacaattgtttcccaac 21593608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211458
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagct 33211283  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |     
T  33211284 acaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgac 33211383  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||    
T  33211384 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaactgtaaagttacctcctttg 33211458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 3072758 - 3073016
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3072758 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagag 3072857  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  3072858 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 3072950  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  3072951 tcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 3073016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588916
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 21589000  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 336  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588999 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 21588916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 177 - 386
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039137
Alignment:
Q  177 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| |    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagct 3039025  T
Q  277 cacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac-caaggtgtttacaatgtttccca 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3039026 cacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttccca 3039125  T
Q  375 acccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||    
T  3039126 acccaagagaac 3039137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 3808707 - 3808933
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggt 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3808707 ttgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 3808806  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||     
T  3808807 tacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-tgtgattttcactct 3808905  T
Q  350 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3808906 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 3808933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 6097450 - 6097679
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||    
T  6097450 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttct----------tacaaaagagtt 6097539  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6097540 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccatttttccaatctcac-------caaaacactcaatgattttcactcacc 6097632  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6097633 aaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaaga 6097679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973163
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 2973038  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |    
T  2973039 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacgacact-tatgattttcactctcc 2973137  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  2973138 caaggtgtttacaattgtttcccaac 2973163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043571
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 5043696  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac- 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  5043695 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactc-atgattttcactctca 5043597  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5043596 caaggtgtttacaattgtttcccaac 5043571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 412271 - 412014
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  412271 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagag 412172  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  412171 ttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttctacctttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 412079  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
     |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  412078 tcaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 412014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762933
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagtta 17763059  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac- 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |     
T  17763058 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctct 17762959  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  17762958 caaagtgtttacaattgtttcccaac 17762933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17757995
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 17758092  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  17758091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaagaagacactcatgaattttcactc 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830337
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggatta 26830222  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  26830223 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 26830321  T
Q  351 ccaaggtgtttacaat 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  26830322 ccaaggtgtttacaat 26830337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22425052
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa--gggt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||     
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactct 22425024  T
Q  350 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||    
T  22425025 cccaaagtgtttacaattgtttcccaac 22425052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 603088 - 603304
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  603088 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 603186  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-cac 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  603187 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttcta-------cccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactatcc 603278  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  603279 caaggtgtttacaattgtttcccaac 603304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4045566 - 4045356
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttca 278  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  4045566 acctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctca 4045467  T
Q  279 caaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaa 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  4045466 taaagaacaaaccctaatttctaccattttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcccaa 4045367  T
Q  376 cccaagagaac 386  Q
    | |||||||||    
T  4045366 ctcaagagaac 4045356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16653281 - 16653008
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16653281 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 16653183  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||     
T  16653182 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 16653091  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcctcctttgcttctcc 432  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  16653090 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc-cctttgattctcc 16653008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16555038 - 16554778
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16555038 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 16554940  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||     
T  16554939 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 16554848  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcc 418  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  16554847 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 16554778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16631594 - 16631334
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16631594 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 16631496  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||     
T  16631495 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 16631404  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcc 418  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  16631403 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 16631334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16569190 - 16568951
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||    
T  16569190 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa------------ggtt 16569104  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||||| |    
T  16569103 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct----------caagacactcaatgattttcactta 16569014  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaa 412  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  16569013 cccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaa 16568951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27648029 - 27647861
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  27648029 ttgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 27647931  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27647930 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 418
Target Start/End: Original strand, 16578517 - 16578777
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16578517 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 16578615  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||     
T  16578616 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 16578707  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcc 418  Q
      ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  16578708 tacaacgtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 16578777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16616863 - 16616603
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16616863 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 16616765  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||     
T  16616764 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 16616673  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcc 418  Q
      ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  16616672 tacaacgtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 16616603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 252
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409167
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5409167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25421475 - 25421235
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  25421475 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 25421377  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  25421376 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 25421285  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421284 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 25421235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6027416 - 6027178
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  6027416 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 6027318  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  6027317 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 6027228  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6027227 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 6027178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagtt 26800657  T
Q  253 acaagatattagctt 267  Q
    |||||| ||||||||    
T  26800656 acaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 326 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16567201 - 16567101
Alignment:
Q  326 caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctccttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||    
T  16567201 caagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttaactccttt 16567102  T
Q  425 g 425  Q
    |    
T  16567101 g 16567101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Original strand, 33342108 - 33342343
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagaga-tacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| | |||||    
T  33342108 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaaga-ggtta 33342206  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||      
T  33342207 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctcta 33342296  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33342297 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 33342343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13154080 - 13153913
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  13154080 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 13153982  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13153981 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 13153913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073538
Alignment:
Q  193 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||| ||||| ||  |    
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  292 taatttctatcattttcccaatct-caccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25073598 taatttctaccattttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatga-tttcactcacc 25073538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34165023 - 34164856
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  34165023 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 34164925  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  34164924 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 34164856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34167249 - 34167078
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||| | |    
T  34167249 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaaga-g 34167151  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  34167150 gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 34167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 5408933 - 5409005
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5408933 agtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaag 5409005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 5413258 - 5413330
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5413258 agtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaag 5413330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 9182894 - 9182968
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9182894 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 9182968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 31404538 - 31404610
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31404538 agtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaag 31404610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 16452191 - 16452265
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16452191 agtaaccaataacaaagtgaatacaagcaataatcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 16452265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 2171390 - 2171464
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| || ||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2171390 agtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 2171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 28137274 - 28137347
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28137274 agtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataa-cgacaataacaacacatagatctaatataggaatcaaagtg 28137347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 30834397 - 30834471
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  30834397 agtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtg 30834471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9572735 - 9572667
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 245  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9572735 tgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 5406066 - 5406135
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5406066 agtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataat---caataatagcacctagatctaatctaggaatcaaag 5406135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 5410391 - 5410460
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5410391 agtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataat---caataatagcacctagatctaatctaggaatcaaag 5410460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5017362 - 5017329
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017362 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5017329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5572109 - 5572076
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5572109 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5572076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5757344 - 5757311
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757344 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5757311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 22709241 - 22709274
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709241 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 22709274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24435837 - 24435802
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24435837 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaac 24435802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908532
Alignment:
Q  195 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaag 248  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctttacaataagatacaaaag 2908532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16569324 - 16569251
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16569324 agtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataa-caacaatagcagcacctagatctaatctagaaatcaaagtg 16569251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 26954154 - 26954227
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||| ||||||| | || ||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26954154 agtaaccaatttcaaagtaaacataagaaataa-caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 26954227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 21356268 - 21356301
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21356268 ccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga 21356301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 22963930 - 22963963
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22963930 ccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga 22963963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23824463 - 23824430
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23824463 ccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga 23824430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 380
Target Start/End: Original strand, 31936806 - 31936835
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31936806 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 31936835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 3072620 - 3072684
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctagg 81  Q
    |||||||| || ||||||| |  ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  3072620 agtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctagg 3072684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19643938 - 19643894
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 198  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19643938 tgtttaccaagttcggtccaaatttgacctactctgaaggagaga 19643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45095332 - 45095060
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095332 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 45095233  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095232 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 45095133  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  45095132 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcttttg 45095060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37408627 - 37408354
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37408627 ttgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 37408528  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37408527 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcac 37408428  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  37408427 taaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccataaaccctaaagttgcctcctttg 37408354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 5260322 - 5260596
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5260322 ttgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 5260421  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5260422 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca 5260521  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5260522 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 5260596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 19683888 - 19684162
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19683888 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 19683987  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19683988 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcac 19684087  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  19684088 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttaactcctttg 19684162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 5258143 - 5258407
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5258143 ttgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 5258242  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258243 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 5258342  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5258343 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagtt 5258407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7762434 - 7762161
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7762434 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 7762335  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7762334 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcac 7762235  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  7762234 caaggtgttcacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 7762161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 23200137 - 23200402
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23200137 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtt 23200236  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200237 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactcac 23200335  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag-aactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  23200336 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgc 23200402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 23197938 - 23198203
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23197938 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtt 23198037  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198038 acaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactcac 23198136  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag-aactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  23198137 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgc 23198203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7764633 - 7764363
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7764633 ttgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 7764534  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764533 acaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 7764436  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||    
T  7764435 aaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagaaatctaatcaaagaccctcaactctaaagttacctcctttg 7764363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 9636125 - 9636400
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9636125 ttgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtt 9636224  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9636225 acaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca 9636324  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  9636325 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaagaccctaaaccctaaagtttcttcctttg 9636400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9581451 - 9581178
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9581451 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 9581352  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    | |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9581351 aaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9581252  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  9581251 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttaactcctttg 9581178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 423
Target Start/End: Original strand, 5236457 - 5236727
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5236457 ttgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 5236554  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5236555 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 5236654  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  5236655 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctt 5236727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40734666 - 40734393
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  40734666 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgtt 40734568  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40734567 acaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 40734468  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  40734467 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 40734393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835275
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaa 22835108  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22835109 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 22835208  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  22835209 attacaatgtttcccaacacaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 22835275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40735545 - 40735278
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  40735545 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaata 40735447  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac-tcaccaagg 356  Q
     ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  40735446 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaagg 40735347  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  40735346 tgtttacaatgtttcctaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 40735278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331470
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggctt 44331615  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44331614 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 44331515  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaa 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44331514 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaa 44331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 761015 - 760742
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  761015 ttgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 760917  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  760916 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcat 760817  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  760816 ccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttaactcctttg 760742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810763
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 29810917  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttc 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29810916 gttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttc 29810817  T
Q  372 ccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||    
T  29810816 ccaacccaaaagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaaattacctcctttg 29810763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 51398982 - 51398709
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51398982 ttgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 51398884  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51398883 acaagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcat 51398784  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||    
T  51398783 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaaaactctaatcaaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 51398709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 29196386 - 29196622
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29196386 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 29196484  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29196485 ccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 29196584  T
Q  351 -ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29196585 cccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaac 29196622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29682527 - 29682254
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  29682527 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtg 29682429  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29682428 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcac 29682329  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||  ||||||||    
T  29682328 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaatttaactcctttg 29682254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29813231 - 29812958
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29813231 ttgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggtt 29813133  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||     
T  29813132 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcac 29813033  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  29813032 ccaatgtgtttacaatgcttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 29812958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 39153361 - 39153634
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  39153361 ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagtt 39153459  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39153460 acaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcac 39153559  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  39153560 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 39153634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16499197 - 16498925
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  16499197 ttgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggta 16499099  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-ca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16499098 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactacc 16499000  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||| |||||||||    
T  16498999 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaagaccctcaacccacaagttacctcctttg 16498925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 801261 - 800993
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  801261 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagag 801162  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  801161 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 801069  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||| | |||||||    
T  801068 tcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtttcttcctttg 800993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921776
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaa 53921609  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  53921610 ttagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtt 53921709  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || || ||||||||| |||| ||||    
T  53921710 tttacaatgttttccaacccaagaaaaccctaatcaaagactctcaaccctaaagttacctcatttg 53921776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095823
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 6095698  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| |||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  6095699 caagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcc 6095797  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  6095798 caaggtgtttacaattgtttcccaac 6095823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 44700479 - 44700713
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44700479 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggtt 44700576  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44700577 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 44700676  T
Q  351 ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44700677 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaac 44700713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569906
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4570021  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    ||||| ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4570020 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 4569921  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  4569920 caaggtgtttacaat 4569906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593648
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 54593773  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct-atcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  54593772 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 54593674  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  54593673 caaggtgtttacaattgtttcccaac 54593648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31314613 - 31314379
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31314613 ttgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggtt 31314515  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31314514 acaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcac 31314415  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31314414 ccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 31314379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32890998
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 32891166  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 357  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32891165 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggt 32891066  T
Q  358 gtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  32891065 gtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 32890998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34491380 - 34491157
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  34491380 ttgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 34491282  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||      
T  34491281 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca--gaatttcactctc 34491184  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34491183 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 34491157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 43401800 - 43402026
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  43401800 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgt 43401899  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  43401900 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 43401998  T
Q  350 accaaggtgtttacaat-gtttcccaac 376  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43401999 cccaaggtgtttacaatcgtttcccaac 43402026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 49199468 - 49199694
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49199468 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 49199567  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  49199568 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacactc-atgattttcactct 49199666  T
Q  350 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||    
T  49199667 cccaaagtgtttacaattgtttcccaac 49199694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 23391909 - 23392143
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23391909 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggtt 23392007  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  23392008 acaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcac 23392107  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392108 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 23392143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30236293 - 30236069
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30236293 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtt 30236195  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-ca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||       
T  30236194 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactc-atgattttcactatc 30236096  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30236095 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 30236069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819737
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||      
T  41819622 acaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 41819721  T
Q  351 ccaaggtgtttacaat 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  41819722 ccaaggtgtttacaat 41819737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 43403743 - 43403969
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-aagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  43403743 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagt 43403842  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  43403843 tacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 43403941  T
Q  350 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||    
T  43403942 cccaaagtgtttacaattgtttcccaac 43403969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860427
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 46860543  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg-attttcactc-a 350  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  46860542 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctc 46860443  T
Q  351 ccaaggtgtttacaat 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  46860442 ccaaggtgtttacaat 46860427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 9666466 - 9666741
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| | |||    
T  9666466 ttgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagtt 9666564  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9666565 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 9666664  T
Q  351 -ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  9666665 cccaaggtgtttacaaatgtttcccaactgaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 9666741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 32744436 - 32744699
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  32744436 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagtt 32744534  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||  ||||||||| ||        | ||||||||||||||||||||    
T  32744535 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaac-taatttctacccattttttcaatctcacaaa--------atactcaatgattttcactcac 32744625  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  32744626 caatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 32744699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 7780003 - 7780204
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  7780003 ttgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaa-ggt 7780101  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||      
T  7780102 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------gaagacactcaatgattttctctctt 7780194  T
Q  352 caaggtgttt 361  Q
    ||||||||||    
T  7780195 caaggtgttt 7780204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47304419 - 47304224
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  47304419 ttgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggtt 47304321  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304320 acaagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactc-atgattttcactc 47304224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 376
Target Start/End: Original strand, 5433906 - 5434102
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  5433906 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccaccg-------gttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagct 5433998  T
Q  277 cacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttc--ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa-tgtttcc 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5433999 cacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaattgtttcc 5434098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 163 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173311
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatatt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 46173417  T
Q  263 agctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgttt 361  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  46173416 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta--------ccaattttaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt 46173326  T
Q  362 acaa-tgtttcccaa 375  Q
    |||| ||||||||||    
T  46173325 acaattgtttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 23410329 - 23410563
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23410329 ttgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtt 23410427  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    | | || ||||||||  ||||| |||||||||| || | |||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23410428 atacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 23410527  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23410528 tcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaac 23410563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6716668 - 6716430
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  6716668 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 6716570  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  6716569 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 6716478  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6716477 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 6716430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 54635293 - 54635055
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  54635293 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 54635195  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  54635194 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 54635103  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  54635102 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 54635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45283155 - 45282913
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac----aaagagatacaaaa 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||    
T  45283155 ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaa 45283056  T
Q  248 gggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 346  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  45283055 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 45282965  T
Q  347 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45282964 ctttgcaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 45282913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018795
Alignment:
Q  187 ctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg-gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaa 285  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaa 36018889  T
Q  286 caaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36018888 caaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 36018795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3617619 - 3617379
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  3617619 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 3617521  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  3617520 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 3617429  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3617428 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 3617379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 270 - 425
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386754
Alignment:
Q  270 acaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatg 367  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttaccctg 26386696  T
Q  368 tttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||    
T  26386697 tttcccaacctaagagaactctaatcaaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 26386754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25637592 - 25637358
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  25637592 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggtta 25637494  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |    
T  25637493 caagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctac 25637404  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25637403 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 25637358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 376
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340425
Alignment:
Q  221 aatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcacc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  320 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 31340425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 341
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352298
Alignment:
Q  193 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccc 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||| | ||| |||||| |||||| |||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatgg-ttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  292 taatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51352249 taacttctatcattttcctaatctcaccaataaacaagacactcaatgat 51352298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913352
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 40913363  T
Q  253 acaagatatta 263  Q
    |||||| ||||    
T  40913362 acaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 258
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302076
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggtta 55302071  T
Q  254 caaga 258  Q
    |||||    
T  55302072 caaga 55302076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373157
Alignment:
Q  203 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaac-cctaatttcta 300  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  301 tcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc--------aaggtgttta-caatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcacccacccaataaggtgtttaccaatgtttcccaacccaagagaac 5373157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Original strand, 4600747 - 4600982
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||    
T  4600747 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaa-ggtta 4600845  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||      
T  4600846 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctcta 4600935  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4600936 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 4600982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Original strand, 4598526 - 4598693
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  4598526 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 4598624  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4598625 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 4598693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10056384 - 10056217
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  10056384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 10056286  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10056285 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10056217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10058606 - 10058439
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  10058606 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 10058508  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10058507 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10058439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10060828 - 10060661
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  10060828 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 10060730  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10060729 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10060661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10063050 - 10062883
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  10063050 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 10062952  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10062951 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10065272 - 10065105
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  10065272 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 10065174  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10065173 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10211560 - 10211393
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  10211560 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 10211462  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10211461 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 387
Target Start/End: Original strand, 2075178 - 2075292
Alignment:
Q  276 tcacaaagaac-aaccctaatttctatcatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta-caatgtttcc 372  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  2075178 tcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcagcaaggtgtttataaatgtttcc 2075277  T
Q  373 caacccaagagaact 387  Q
    |||||||||| ||||    
T  2075278 caacccaagataact 2075292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 316
Target Start/End: Original strand, 4055769 - 4055926
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaag-ggttaca 255  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4055769 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttaca 4055866  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc 316  Q
    ||| |||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4055867 agaaattaacttttacaagttctccaagaacaa-cctaatttctacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10209340 - 10209173
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagaga-tacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| | |||||    
T  10209340 tcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaaga-ggtta 10209242  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  10209241 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37408764 - 37408690
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37408764 agtaaccaatattaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 37408690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138915
Alignment:
Q  195 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 293  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||  ||||  |||| |||||||| | ||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacata 35138845  T
Q  294 atttctatcattttcccaatctcac-caatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgttt 361  Q
    ||||||| |  |||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35138846 atttctacccatttctcaatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt 35138915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 45095468 - 45095396
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  45095468 agtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacatagatctaatctatgaatcaaag 45095396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9581588 - 9581514
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  9581588 agtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtg 9581514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 9634684 - 9634758
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9634684 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 9634758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 9635987 - 9636061
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9635987 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 9636061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7764770 - 7764696
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  7764770 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtg 7764696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 19683751 - 19683825
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  19683751 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtg 19683825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29813366 - 29813292
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  29813366 agtaactaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaagaatcaaagtg 29813292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40735687 - 40735613
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  40735687 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtg 40735613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 287
Target Start/End: Original strand, 4075476 - 4075605
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaag-ggttaca 255  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4075476 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttaca 4075573  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaaca 287  Q
    ||| |||| |||| |||||||| | |||||||    
T  4075574 agaaattaacttttacaagttctctaagaaca 4075605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51399113 - 51399045
Alignment:
Q  23 caatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  51399113 caatatcaaagtgagcactagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 51399045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 221
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  162 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7762571 - 7762497
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7762571 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtg 7762497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29811173 - 29811099
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29811173 agtaaccaatttcaaagagaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 29811099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Original strand, 25491003 - 25491116
Alignment:
Q  188 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac 286  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||| || |||||  ||||| || ||||||||    
T  25491003 tggaggagaga--gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaac 25491100  T
Q  287 aaccctaatttctatc 302  Q
    || |||||||||||||    
T  25491101 aaacctaatttctatc 25491116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 361
Target Start/End: Original strand, 26323124 - 26323283
Alignment:
Q  205 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca 303  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||  ||   || ||||| |||||||| || |     
T  26323124 tctccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttaccc 26323223  T
Q  304 ttttcccaatctca-ccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac-caaggtgttt 361  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26323224 ttttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgttt 26323283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075149
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 228  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt 2075149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 5258007 - 5258081
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5258007 agtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 5258081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 5260186 - 5260260
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5260186 agtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtg 5260260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40734802 - 40734728
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40734802 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaataataaaaaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 40734728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 382
Target Start/End: Original strand, 3148037 - 3148221
Alignment:
Q  201 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct 299  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||| ||||||||  ||||| ||   ||||| || ||||||||||    
T  3148037 gatctctgcacttcacaatcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaagaaacctaatttct 3148136  T
Q  300 atcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaaga 382  Q
    |||  |||| |||||||  || |  ||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3148137 atccatttctcaatctcttcccacaaacaaaagactcaattattttcactcaccaaaatgtttacaattgtttcccaacctaaga 3148221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20937781 - 20937678
Alignment:
Q  197 gattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaat 295  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || | || ||||| | ||||    
T  20937781 gattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataat 20937683  T
Q  296 ttcta 300  Q
    |||||    
T  20937682 ttcta 20937678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33191974 - 33191866
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||  |||||||  ||||| |    
T  33191974 tgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacat--aaaatggttacaagaacttagcttcaacaagct 33191878  T
Q  277 cacaaagaacaa 288  Q
    | | ||||||||    
T  33191877 ctctaagaacaa 33191866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Original strand, 8166516 - 8166693
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttccca 311  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||  || | |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||    
T  8166516 cactatcaacaagttctttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctactca-tttatca 8166614  T
Q  312 atctcaccaatgaacaag--acactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||  | |||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  8166615 atctcttccatgaacaagacacactcaatgattttcacccacccaatgtgtttacaaatgtttttcaactcaagagaac 8166693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 383
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1314037
Alignment:
Q  202 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttct 299  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| || | |||||| || | |||||| |    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaaaacataattttt 1313951  T
Q  300 atcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagag 383  Q
    | | ||||| |||||||  |  | ||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1313952 acccttttctcaatctcttctcaagaataagagactcaat-aatttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaatccaagag 1314037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 5236328 - 5236394
Alignment:
Q  25 atatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  5236328 atatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtg 5236394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 21350874 - 21350944
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21350874 agtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaa----caacaataacaacacttagatctaatctaggaatcaaagtg 21350944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 351
Target Start/End: Original strand, 40519258 - 40519391
Alignment:
Q  215 actatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaacc-ctaatttctatcattttcccaa 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||  |||| |    ||||||||| | |||||||||||  |||||| ||    
T  40519258 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaata-ttacaagaaattaacttcaacaaat----aaagaacaaactctaatttctattgttttcctaa 40519352  T
Q  313 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40519353 tatctccaatgaataagacattcaatgattttcactcac 40519391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 316
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739116
Alignment:
Q  205 tctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | | ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttac-ataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T
Q  303 attttcccaatctc 316  Q
    |||||  |||||||    
T  54739103 attttttcaatctc 54739116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10067471 - 10067435
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067471 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3323546 - 3323511
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323546 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 3323511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 761149 - 761076
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  761149 agtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataa-caacaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 761076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 22834870 - 22834943
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22834870 agtaaccaatatcaaagtaaacacaggtaataa-caacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 22834943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 16264580 - 16264613
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264580 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 16264613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24695021 - 24694988
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695021 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 24694988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 26299219 - 26299252
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299219 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 26299252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26928454 - 26928421
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928454 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 26928421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27986311 - 27986278
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986311 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 27986278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 36029324 - 36029357
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029324 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36029357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40592637 - 40592604
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40592637 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 40592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47923759 - 47923726
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47923759 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 47923726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 384
Target Start/End: Original strand, 21711454 - 21711486
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711454 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 21711486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 23200000 - 23200063
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctagg 81  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23200000 agtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataa-aacacctagatctaatctagg 23200063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30709651 - 30709615
Alignment:
Q  344 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709651 tcactccccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 30709615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6794570 - 6794535
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6794570 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaac 6794535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 382
Target Start/End: Original strand, 8126861 - 8126892
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8126861 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 8126892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3328212 - 3328178
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3328212 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaa 3328178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4386831 - 4386797
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4386831 caaggtgattacaatgtttcccaacccaagagaac 4386797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39032409 - 39032335
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    ||||||  || || ||||||||| |||||||||    
T  39032409 ccaaggtgtttacaatgtttaccaacccaagagatctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 39032335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39127693 - 39127519
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatcca-ctatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagt 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||  |||| || ||||||||||    || |||| ||||||||  |||||     
T  39127693 tgacctgctctggaggagagattgatctttcaaatccatttatcaatgagttatttacgaaaagatacaaaaaaactataagaaattagcttcaacaagc 39127594  T
Q  276 tcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||    |||| |||||||  |  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39127593 tcaccaagaacaaacataatttatacttatttctcaatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactc 39127519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 44700347 - 44700420
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44700347 agtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 44700420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1736159 - 1736130
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736159 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 1736130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8370344 - 8370311
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370344 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 8370311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 27038282 - 27038315
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27038282 ccaaggtgtttacaatgtttccctacccaagaga 27038315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 27453191 - 27453224
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27453191 ccaaggtgtttacaatgtttgccaacccaagaga 27453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27974807 - 27974774
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27974807 ccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagaga 27974774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Original strand, 28253346 - 28253423
Alignment:
Q  233 caaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcc 309  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28253346 caaagaaatacaaaatcgttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 32143554 - 32143587
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32143554 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga 32143587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33386530 - 33386497
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33386530 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga 33386497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 380
Target Start/End: Original strand, 35925709 - 35925738
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35925709 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 35925738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40612607 - 40612562
Alignment:
Q  321 atgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  40612607 atgaacaagagactcaatgattttcacttgccaagttgtttacaat 40612562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 23391778 - 23391849
Alignment:
Q  19 taaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  23391778 taaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 23391849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 90)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25412929 - 25412657
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412929 ttgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 25412830  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412829 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 25412730  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  25412729 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaatgttgcctcctttg 25412657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30182757 - 30182484
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30182757 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggtt 30182658  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182657 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 30182558  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  30182557 caaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaatccctaaagttgcttcctttg 30182484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13343229 - 13342956
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13343229 ttgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggatt 13343131  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343130 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 13343031  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  13343030 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcagagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 13342956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13239920 - 13239647
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13239920 ttgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 13239821  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239820 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 13239721  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||    
T  13239720 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccataaagttacctcctttg 13239647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 36074042 - 36074317
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  36074042 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 36074140  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta----tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074141 acaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 36074240  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  36074241 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 36074317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636719
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtt 32636894  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  32636893 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcac 32636794  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  32636793 ccaaggtgtttacaatgtttcactacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttacctcctttg 32636719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488098
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 13488267  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaagg 356  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13488266 aattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaagg 13488167  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  13488166 tgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 13488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37439310 - 37439070
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37439310 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 37439211  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatt---------ttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 343  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||         |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37439210 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattt 37439111  T
Q  344 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439110 tcactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 37439070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 42428430 - 42428703
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42428430 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 42428528  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42428529 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 42428628  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||    
T  42428629 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccttcaaccctaaagttatctcctttg 42428703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 533937 - 533664
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 533839  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  533838 acaaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcac 533739  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||    
T  533738 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccccaaccctaaagttacctcctttg 533664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16409644 - 16409387
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16409644 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagt 16409545  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  16409544 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcac 16409452  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  16409451 caaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 16409387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 39468549 - 39468822
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39468549 ttgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 39468647  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39468648 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 39468747  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  39468748 tcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatgaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 39468822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16451976
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 16452149  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16452148 caagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcacttacc 16452049  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  16452048 aaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaatcaaagatcctcaaccctaaagttacctcctttg 16451976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750928
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacagga 28750759  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaagg 356  Q
     |||| |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28750760 aattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 28750859  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  28750860 tgttttcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 28750928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26178051 - 26177795
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26178051 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagt 26177952  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  26177951 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttt-ccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcac 26177860  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  26177859 caaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 26177795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 42426235 - 42426508
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42426235 ttgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 42426333  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
     ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  42426334 gcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcac 42426433  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  42426434 ccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 42426508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213409
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 213435  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  213434 caaggtgtttacaattgtttcccaac 213409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683190
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt--tcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaaga 30683028  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 357  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683029 aattagcttcaacaagttcacaaagaac---cctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 30683125  T
Q  358 gtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcct 422  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||||    
T  30683126 gtttacaatgtttcgcaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaaattacctcct 30683190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 538185 - 537920
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  538185 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 538087  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  538086 ttagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtg 537987  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  537986 tttacgatgtttcccaagccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 537920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 9789223 - 9789480
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9789223 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagt 9789322  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  9789323 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcac 9789415  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  9789416 caaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 9789480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 18441647 - 18441904
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18441647 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagt 18441746  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  18441747 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcac 18441839  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  18441840 caaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 18441904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33831848 - 33831575
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33831848 ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 33831750  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33831749 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 33831650  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||  ||||||||    
T  33831649 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaaattaactcctttg 33831575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182868
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg-tta 31183041  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc- 352  Q
    ||||| |||| |||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacct 31182941  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  31182940 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 31182868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 8565946 - 8566192
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  8565946 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggtt 8566044  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8566045 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 8566144  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8566145 ccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaatcaaaga 8566192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28278484 - 28278260
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28278484 ttgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 28278386  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  28278385 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 28278287  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||    
T  28278286 ccaatgtgtttacaattgtttcccaac 28278260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147205
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 40147330  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  40147329 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttccactctcc 40147231  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  40147230 caaggtgtttacaattgtttcccaac 40147205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075931
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaatgggtta 3075757  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    ||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3075758 caagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatc 3075857  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  3075858 aaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3075931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26170931 - 26170686
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||    
T  26170931 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta----------caaaagagtt 26170842  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  26170841 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccctttt-ccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc 26170750  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  26170749 aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaagactctaaaccctagagtt 26170686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058002
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggata 5058114  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| | ||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5058113 caagaaaatagcttcaacaagctcac--agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactcttc 5058017  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  5058016 caaggtgtttacaat 5058002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 29751159 - 29751398
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  29751159 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 29751257  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  29751258 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 29751350  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29751351 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 29751398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 425
Target Start/End: Original strand, 42309953 - 42310208
Alignment:
Q  172 caaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgac 271  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  42309953 caaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaac 42310052  T
Q  272 aagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtt 369  Q
    ||| ||||||||| ||| | | |||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||    
T  42310053 aagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaatgtt 42310152  T
Q  370 tcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||    
T  42310153 ttccaaccaaagagaaccctaatcaaagaccataaaccctaaagttacctcctttg 42310208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 425
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887689
Alignment:
Q  225 agttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatg 323  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  324 aacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcct 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaataccctcaaccctaaagttacctcct 5887686  T
Q  423 ttg 425  Q
    |||    
T  5887687 ttg 5887689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 376
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637838
Alignment:
Q  156 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggttac 254  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttac 27637713  T
Q  255 aagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-acc 352  Q
    |||| ||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||    
T  27637714 aagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttcc 27637813  T
Q  353 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||| |||| |||||||||||    
T  27637814 aaggtgttcacaattgtttcccaac 27637838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29720533 - 29720294
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  29720533 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 29720435  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  29720434 tacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 29720342  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29720341 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 29720294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29722693 - 29722454
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  29722693 ttgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 29722595  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  29722594 tacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 29722502  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29722501 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 29722454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049576
Alignment:
Q  165 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattag 264  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattag 9049452  T
Q  265 ctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac 363  Q
    |||  ||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  9049453 cttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttac 9049552  T
Q  364 -aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||  |||||||||    
T  9049553 aaatgtttcccaaatcaagagaac 9049576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38747167 - 38746949
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  38747167 acccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaaga 38747069  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 356  Q
     ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  38747068 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactc-atgattttcactctcccaagg 38746970  T
Q  357 tgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  38746969 tgtttacaattgtttcccaac 38746949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 365
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695904
Alignment:
Q  177 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagt 275  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  276 tcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac-caaggtgtttacaa 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcacacaaggtgtttacaa 13695904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015476
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg--- 27015595  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
         |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |    
T  27015594 -----tattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaa-acactc-atgattttcactctcc 27015502  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27015501 caagatgtttacaattgtttcccaac 27015476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Original strand, 22536289 - 22536457
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  22536289 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 22536387  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22536388 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806289
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                   ||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt-------------------tt 19806452  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    | |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19806451 agaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt-cactcac 19806354  T
Q  352 c-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  19806353 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctcaagtt 19806289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 365
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641153
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttacaaagagatacaaaagagtta 16641036  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatca---ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
      ||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16641037 tcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaatttcactc 16641136  T
Q  350 ac-caaggtgtttacaa 365  Q
    || ||||||||||||||    
T  16641137 actcaaggtgtttacaa 16641153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10593427 - 10593258
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10593427 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 10593329  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  10593328 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaa 10593258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25078290 - 25078050
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  25078290 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 25078192  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  25078191 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 25078100  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25078099 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 25078050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25136259 - 25136019
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  25136259 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 25136161  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  25136160 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 25136069  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25136068 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 25136019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 301 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42926913 - 42926788
Alignment:
Q  301 tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagat 399  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42926913 tcatattcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagac 42926814  T
Q  400 cctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | | |||||||||||| |||| ||||    
T  42926813 catcaatcctaaagttacctcatttg 42926788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40380260 - 40380090
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  40380260 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 40380162  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  40380161 gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 40380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40382471 - 40382301
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  40382471 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 40382373  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  40382372 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaa 40382301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 316932 - 316769
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  316932 ttgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggat 316833  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatct 315  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| || | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  316832 tacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16546796 - 16546561
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  16546796 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggtta 16546698  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||       |||||||||||||||  ||| |||      
T  16546697 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctcta 16546608  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16546607 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 16546561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16544574 - 16544339
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  16544574 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-ggtta 16544476  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
      ||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||      
T  16544475 tgagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctcta 16544386  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16544385 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 16544339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Original strand, 33906029 - 33906151
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  33906029 ttgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggat 33906128  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaag 274  Q
    |||||||  ||||||| ||||||    
T  33906129 tacaagaagttagcttcgacaag 33906151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 30682786 - 30682860
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30682786 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 30682860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 39468412 - 39468486
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  39468412 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtg 39468486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42927058 - 42926967
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 246  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42927058 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaa 42926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3326043 - 3325847
Alignment:
Q  193 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||| ||   ||||||||  |    
T  3326043 gagatattgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaac 3325944  T
Q  292 taatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||| | ||||  |||| ||  || | |||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  3325943 taatttctacctttttttcaatttcttcctaagaacaagatacccaatg-gtttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttctcaactcaagagaac 3325847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 219  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25413065 - 25412993
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||    
T  25413065 agtaatcaatatccaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaag 25412993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616129
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttccca 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  || || || | |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactca-tttctca 35616180  T
Q  312 atctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt 361  Q
    |||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35616179 atctcttcccgtgaacaagagactcaatga-tttcactcacccaaggtgttt 35616129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 13343365 - 13343291
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13343365 agtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 13343291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30182893 - 30182819
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30182893 agtaaccaataacaaagtgaatgcaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 30182819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 267
Target Start/End: Original strand, 10054854 - 10054929
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  10054854 ggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaa-ggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 36073908 - 36073980
Alignment:
Q  19 taaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36073908 taaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 36073980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 315
Target Start/End: Original strand, 10700674 - 10700809
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||| |    
T  10700674 tgacctactatgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataaga-attagcttcaacaagct 10700770  T
Q  277 cacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatct 315  Q
    | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  10700771 ctctaagaacaaacctaatttctaccttttttccaatct 10700809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8445846 - 8445770
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8445846 ggagagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagctt 8445770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11181707 - 11181663
Alignment:
Q  342 tttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11181707 tttcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 11181663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24553393 - 24553358
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553393 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 24553358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Original strand, 28832488 - 28832523
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28832488 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 28832523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16409784 - 16409710
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| || ||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  16409784 agtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 16409710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097886
Alignment:
Q  204 ctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| |||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaa--gggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttcta 22097886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30793293 - 30793202
Alignment:
Q  164 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaa 256  Q
    |||||||||||   |||| |||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30793293 gttcggtccaacaatgacttactctaggggagaga--gatctctccacttcactatcaattagttctttacaaagagatacaaaatggttacaa 30793202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33831983 - 33831910
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33831983 agtaaccaaaatcaaagtgaacacaagcaataa-caacaatagcagcacctaaatctaatctaggaatcaaagtg 33831910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 42426099 - 42426172
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  42426099 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaaca-tcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 42426172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 42428294 - 42428367
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  42428294 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaat-aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 42428367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926922
Alignment:
Q  221 aatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 42926922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6017115 - 6016968
Alignment:
Q  215 actatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatattag-ctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaa 312  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||  ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||    
T  6017115 actatcaatgagtttcttacgaagaaataaaaaaaggttacaagaaattagtcttcaacaggttctcaaagaagaacc-taatttctaccaatttcc-aa 6017018  T
Q  313 tctcacc-aatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 361  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  6017017 tttcatctaatgaacaagagactcaagaattttcactcttcaaggtgttt 6016968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9353198 - 9353165
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353198 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 9353165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11916838 - 11916805
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916838 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 11916805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 14520461 - 14520494
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520461 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 14520494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36932214 - 36932181
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932214 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36932181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30802934 - 30802854
Alignment:
Q  217 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatt 296  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30802934 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatt 30802854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17003825 - 17003790
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17003825 ccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaac 17003790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31300461 - 31300426
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31300461 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaac 31300426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42927190 - 42927124
Alignment:
Q  24 aatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42927190 aatatcaaagtaaacacaagcaacaa-caacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 42927124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26178191 - 26178117
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| || ||||||| |  ||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26178191 agtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 26178117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 15464765 - 15464798
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15464765 ccaaggtgtttacgatgtttcccaacccaagaga 15464798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 19588976 - 19589009
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19588976 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 19589009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882340
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 13488503 - 13488432
Alignment:
Q  19 taaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  13488503 taaccaatttcaaagtgaacacaatcaatag-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 13488432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596881
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 18596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 113)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29991222 - 29990950
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29991222 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggtt 29991123  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991122 acaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 29991023  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  29991022 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgtctcctttg 29990950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35854083 - 35853818
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35854083 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 35853984  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853983 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 35853884  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35853883 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactcaaatcaaagaccctaaaccctaaagttgc 35853818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23555209 - 23554935
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23555209 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgtt 23555110  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca--ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555109 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 23555010  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||| |||||||||    
T  23555009 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaactctaatcaaagaccttcaaccctgaagttacctcctttg 23554935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4178942 - 4178670
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178942 ttgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtt 4178844  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4178843 acaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 4178744  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  4178743 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 4178670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 14069833 - 14070106
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14069833 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 14069931  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14069932 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 14070031  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||    
T  14070032 ccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcagccctaaagttacctcctttg 14070106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 14379861 - 14380134
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14379861 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 14379959  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14379960 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 14380059  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||    
T  14380060 ccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcagccctaaagttacctcctttg 14380134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19502347 - 19502073
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19502347 ttgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 19502248  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19502247 acaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactca 19502148  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  19502147 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 19502073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491474
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 48491628  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48491627 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttc 48491528  T
Q  372 ccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  48491527 ccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 48491474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 39731538 - 39731281
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39731538 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagt 39731439  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  39731438 tacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcac 39731346  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39731345 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagtt 39731281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48408973 - 48408705
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaaaggg- 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||     
T  48408973 ttgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaagggg 48408874  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48408873 ttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 48408774  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag-aactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  48408773 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgc 48408705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18126812 - 18126539
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18126812 ttgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 18126714  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18126713 acaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcac 18126614  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  18126613 ccaagttgtttacaatgtttcccaacccatgagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 18126539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43864412 - 43864139
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43864412 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggtt 43864314  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43864313 acaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 43864214  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  43864213 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 43864139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4586323 - 4586056
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  4586323 acccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaa 4586225  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaagg 356  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4586224 aattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaagg 4586125  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||    
T  4586124 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagagcctcaaccctaaagttacatcctttg 4586056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317668
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggatt 41317532  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  41317533 acaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcat 41317632  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317633 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 41317668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 31732969 - 31733242
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31732969 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 31733067  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31733068 acaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 31733167  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||| ||||    
T  31733168 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaactctaaagttacctcttttg 31733242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 47676144 - 47676409
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47676144 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 47676242  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47676243 ttagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtg 47676342  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  47676343 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 47676409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48489599 - 48489326
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  48489599 ttgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggtt 48489501  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  48489500 acaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcac 48489401  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  48489400 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccatcaaccctaaagttacctcctttg 48489326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347745
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 27347887  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27347886 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 27347787  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347786 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacctaagagaactctaat 27347745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 25766959 - 25767219
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggt 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25766959 ttgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggt 25767058  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767059 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaatgattttcactca 25767155  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag-aactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  25767156 ccaaggtgtttacaatgtttccca----aagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgc 25767219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 172 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1113807 - 1113552
Alignment:
Q  172 caaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgac 271  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||    
T  1113807 caaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaac 1113708  T
Q  272 aagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1113707 aagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaatgtt 1113608  T
Q  370 tcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||    
T  1113607 tcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacttcctttg 1113552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8153510 - 8153276
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  8153510 ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagtt 8153412  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8153411 acaagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 8153312  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153311 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 8153276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30025005
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30024740 ccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 30024838  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30024839 ttagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 30024938  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  30024939 tttacaacgtttttcaacctaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 30025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 162 - 398
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  162 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatat 261  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 47674050  T
Q  262 tagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgt 359  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47674051 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 47674150  T
Q  360 ttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47674151 ttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26417483 - 26417211
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26417483 ttgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 26417386  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26417385 acaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgc 26417286  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  26417285 tcaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 26417211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 38671222 - 38671495
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  38671222 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgtt 38671320  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38671321 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcac 38671420  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  38671421 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 38671495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 366
Target Start/End: Original strand, 34310715 - 34310929
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  34310715 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgtt 34310814  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  34310815 acaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 34310913  T
Q  351 ccaaggtgtttacaat 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  34310914 ccaaggtgtttacaat 34310929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 41649011 - 41649282
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41649011 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 41649109  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  41649110 acaagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttac 41649208  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  41649209 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaataaaaga-ccttaaccctaaagttaactcctttg 41649282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105666
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggtta 31105492  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31105493 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31105592  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  31105593 caaggtgtttacaatgtttctcaccccaagataactataatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 31105666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 495983 - 496256
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  495983 ttgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggtt 496081  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
     ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||     
T  496082 gcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcac 496181  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| ||||    
T  496182 ccaaggtttttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccttaaagttacctcatttg 496256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269931
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggtta 22270042  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  22270041 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcc 22269942  T
Q  352 caaggtgttta 362  Q
    |||||||||||    
T  22269941 caaggtgttta 22269931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25616022 - 25615758
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  25616022 ttgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggtt 25615923  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||  |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||     
T  25615922 acaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatct----------caagacactcaatgattttctctcac 25615833  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||  ||||||||    
T  25615832 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccttaaagttaactcctttg 25615758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508930
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 4508805  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |    
T  4508806 caagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactc-atgattttcactctcc 4508904  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  4508905 caaggtgtttacaattgtttcccaac 4508930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 382
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359547
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 8359415  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  8359416 acaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 8359514  T
Q  352 -caaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaaga 382  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8359515 tcaaggtgtttacaattgttttccaactcaaga 8359547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 158 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431915
Alignment:
Q  158 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaag 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaag 6432036  T
Q  258 atattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaag 355  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||     
T  6432035 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaat 6431937  T
Q  356 gtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  6431936 gtgtttacaattgtttcccaac 6431915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 36146408 - 36146643
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36146408 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 36146506  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    || ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36146507 ac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 36146605  T
Q  351 -ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36146606 cccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaac 36146643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253803
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtt 4253627  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4253628 acatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcac 4253727  T
Q  352 c-aaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | ||| || ||||||||| |||||||||    
T  4253728 ctaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaaccctcaccaaataccctcaaccctaaagttacctcctttg 4253803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 43504153 - 43504411
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  43504153 ttgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagag 43504252  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||     
T  43504253 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcgatgattttctctct 43504345  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
     |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  43504346 tcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 43504411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599558
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagtta 48599433  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-cac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  48599434 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatc-atgattttcactcctc 48599532  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  48599533 caaggtgtttacaattgtttcccaac 48599558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361196
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaga 2361076  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 356  Q
     ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  2361077 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 2361175  T
Q  357 tgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  2361176 tgtttacaattgtttcccaac 2361196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258938
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagtta 3259064  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac-tcac 351  Q
    ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  |    
T  3259063 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcc 3258964  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3258963 caaggtgtttacaattgtttcccaac 3258938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608680
Alignment:
Q  156 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttaca 255  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 29608804  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac-ca 353  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||| ||| | ||    
T  29608803 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctca 29608704  T
Q  354 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  29608703 aggtgtttacaattgtttcccaac 29608680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2390447 - 2390226
Alignment:
Q  156 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttaca 255  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2390447 ttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttaca 2390349  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-acca 353  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||    
T  2390348 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacact-tatgattttcgctctccca 2390250  T
Q  354 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  2390249 aggtgtttacaattgtttcccaac 2390226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12098093
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||| |||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggtt 12097957  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12097958 acaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 12098057  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12098058 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 12098093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518690
Alignment:
Q  212 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttccc 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  311 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcct 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||| || |||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttacgatgttttccaacccaaaagaaccataatcaaagacccttaaccct 31518706  T
Q  410 aaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||  ||||||||    
T  31518705 aaagttatctcctttg 31518690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510772
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggtta 4510647  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |    
T  4510648 caagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctcc 4510746  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  4510747 caaggtgtttacaattgtttcccaac 4510772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512614
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggtta 4512489  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |    
T  4512490 caagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctcc 4512588  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  4512589 caaggtgtttacaattgtttcccaac 4512614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 304 - 425
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24515033
Alignment:
Q  304 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatccta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccta 24515011  T
Q  404 aatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  24515012 aaccctaaagttgcttcctttg 24515033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 36574517 - 36574789
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36574517 tgtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 36574614  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  36574615 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcac 36574713  T
Q  352 c-aaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  36574714 ctaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaaccctcatcaaagaccgtcaaccctaaagttacctcctttg 36574789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565333
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaa 23565167  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatc---attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaag 355  Q
    |||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||||||||   | || |||||||| |||||    
T  23565168 ttagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacact---tcatgttcactcacccaag 23565264  T
Q  356 gtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  23565265 gtgtttacaaatgttttctaaaccaagagaac-ctaatcaaagacccttaa-cctaaagttacctcctttg 23565333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24790010 - 24789771
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||  ||    
T  24790010 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaa-tgt 24789912  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||       |||||||||||||||||||| |||     
T  24789911 tacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatcttac-------caagacactcaatgattttctctct 24789819  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24789818 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 24789771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358190
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 32358153  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaacc 290  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  32358154 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343896
Alignment:
Q  164 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatatta 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  23344130 gttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaatta 23344034  T
Q  264 gctttgacaagttcacaaagaa-caaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg-tt 360  Q
    ||||  ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23344033 gcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttt 23343934  T
Q  361 tacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    |  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  23343933 tgaaatgtttccaaacctaagagaaccctaatcaaaga 23343896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 425
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526170
Alignment:
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaac-cctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 24526091  T
Q  348 tca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  24526092 tcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagagaaccataatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 24526170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 398
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538786
Alignment:
Q  241 tacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 339  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4538726  T
Q  340 attttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4538727 attttcactcacccaaggtgtttacaatttttcccaacccaagagaattctaatcaaaga 4538786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20344065 - 20343827
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20344065 ttgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 20343968  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||     
T  20343967 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 20343876  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20343875 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 20343827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 425
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761575
Alignment:
Q  291 ctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactc 388  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactc 2761538  T
Q  389 taatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||    
T  2761539 taatcaaatatcatcaaccctaaagttacctcctttg 2761575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Original strand, 2759197 - 2759339
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  2759197 ttgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagtt 2759295  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatt 296  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2759296 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 18388759 - 18388997
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  18388759 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 18388857  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  18388858 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 18388947  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18388948 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 18388997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 18392195 - 18392433
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  18392195 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 18392293  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  18392294 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 18392383  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18392384 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 18392433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328622
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaag 257  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  258 atattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcatt--ttcccaatctcaccaatg----aacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||||||||| ||     
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactcaatgattttcattcc 22328594  T
Q  351 c-caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  22328595 ctcaaggtgtttacaattgtttcccaac 22328622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 6592339 - 6592577
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  6592339 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 6592437  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  6592438 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 6592527  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6592528 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 6592577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 6594557 - 6594795
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  6594557 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 6594655  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  6594656 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 6594745  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6594746 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 6594795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 32060321 - 32060563
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaa---gagatacaaaa 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   | ||||||| |    
T  32060321 ttgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaaga 32060420  T
Q  248 gggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 346  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  32060421 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 32060511  T
Q  347 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32060512 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 32060563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518911
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaga- 31518966  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaat 313  Q
    | ||||||  | ||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  31518965 actagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 31518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 267
Target Start/End: Original strand, 6359952 - 6360065
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6359952 ttgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 6360050  T
Q  253 acaagatattagctt 267  Q
    |||||| ||||||||    
T  6360051 acaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 24525508 - 24525594
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 246  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525508 acccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 24525594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 236
Target Start/End: Original strand, 1560671 - 1560749
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 385
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904851
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 356  Q
    ||||  ||  | | | || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  3904723 attacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttctaccattttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcgcccaagg 3904821  T
Q  357 tgtttac-aatgtttcccaacccaagagaa 385  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  3904822 tgtttacaaatgtttcttaactcaagagaa 3904851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27348119 - 27348048
Alignment:
Q  20 aaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27348119 aaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 27348048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396392
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaa 247  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaa 18396392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 25766820 - 25766894
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25766820 agtaaccaataacaaagtgagcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 25766894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35854221 - 35854147
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  35854221 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtg 35854147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23555346 - 23555273
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagt 90  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23555346 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagt 23555273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30814604 - 30814530
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814604 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25616160 - 25616086
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25616160 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtg 25616086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 48409112 - 48409038
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48409112 agtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 48409038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5116735 - 5116582
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaacc 290  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||  ||||  |  | |||||||| |    
T  5116735 ggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaacaaac 5116636  T
Q  291 ctaatttctatcattttcccaatct-caccaatgaacaagacactcaatgattt 343  Q
    ||||||||||   |||||| ||||| | || || ||||||| ||||||||||||    
T  5116635 ctaatttctactcttttcctaatctcctcccataaacaagagactcaatgattt 5116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 258
Target Start/End: Original strand, 5513668 - 5513771
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5513668 tgtttacccagttcagtccaaa-ttgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 5513765  T
Q  253 acaaga 258  Q
    | ||||    
T  5513766 ataaga 5513771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43864548 - 43864475
Alignment:
Q  18 gtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43864548 gtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 43864475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 385
Target Start/End: Original strand, 5514115 - 5514243
Alignment:
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccc-taatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 357  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||  | |||||||||   ||||  ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  5514115 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctactcttttttcaatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaaggt 5514214  T
Q  358 gtttacaa-tgtttcccaacccaagagaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5514215 gtttacaagtgtttcccaacccaagagaa 5514243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 29991358 - 29991286
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  29991358 agtaaccaatatcaaagtgagcacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatataggaatcaaag 29991286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 495851 - 495924
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  495851 agtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataa-caacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 495924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18126951 - 18126877
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18126951 agtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 18126877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 48489736 - 48489662
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48489736 agtaaccaatatcaaagtgaacatgagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 48489662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 354
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360353
Alignment:
Q  229 cttacaaagagatacaaaa--gggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctca-ccaatgaa 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||  |||||||| | ||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttctacctttttcccaatctcattccatgaa 1360325  T
Q  326 caagacactcaatgattttcactcaccaa 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1360326 caagagactcaatga-tttcactcaccaa 1360353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 30843366 - 30843467
Alignment:
Q  287 aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||| || | ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30843366 aaccctaatttataccttttactcaatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaaatgtttctcaacccaagaga 30843465  T
Q  385 ac 386  Q
    ||    
T  30843466 ac 30843467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6570561 - 6570489
Alignment:
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  6570561 aaggtgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctagtcaaagacactcaatcctaaagttacctcctttg 6570489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26639486 - 26639254
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaa----agagatacaaaagggttaca 255  Q
    |||||||||| |||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||    | | ||||||||||||||||    
T  26639486 ccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagattgatctctctaatccattatcaaagagttatttacaatgatatatatacaaaagggttaca 26639387  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-a 353  Q
    ||| |||| | |  ||||  || | |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||  || |  || |||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  26639386 agaaattaacatcaacaaactctccaagaacatacctaatttctaccattttcacaatctcttcccaaaaagaagagactcaatgatttt-actcaccta 26639288  T
Q  354 aggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26639287 aagtgtttacaaatgtttcccaacgcaagagaac 26639254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 48491881 - 48491810
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||||    
T  48491881 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacgcctagatctaatataggaatcaaa 48491810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26417621 - 26417547
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  26417621 agtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaataatcaacaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtg 26417547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4586465 - 4586392
Alignment:
Q  18 gtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  4586465 gtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 4586392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9185040 - 9184964
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttgc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  9185040 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaccttactacaaagatactcaaccctaaagttacctcctttgc 9184964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4179078 - 4179004
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4179078 agtaaccaataacaaagtgaatgtaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 4179004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 31732832 - 31732906
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||  |||||||||    
T  31732832 agtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacctttagatctaatctagtaatcaaagtg 31732906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 39731676 - 39731602
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39731676 agtaaccaataacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 39731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 41648877 - 41648950
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41648877 agtaactaatatcaaagtgaacacaagcaataa-caacaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 41648950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 47673808 - 47673881
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47673808 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 47673881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 398
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562241
Alignment:
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||    
T  1562103 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctc 1562192  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1562193 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 1562241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9189873 - 9189838
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9189873 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 9189838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Original strand, 20284320 - 20284355
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284320 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 20284355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23402879 - 23402844
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402879 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 23402844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9235448 - 9235414
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9235448 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa 9235414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 41317302 - 41317375
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  41317302 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 41317375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 43363507 - 43363629
Alignment:
Q  188 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaa--gagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaaga 284  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||||| || | ||||    
T  43363507 tggaggagaga--gatctatccacttcactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaaga 43363604  T
Q  285 acaaccctaatttctatcattttcc 309  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  43363605 acaaacctaatttctaccattttcc 43363629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 47676000 - 47676073
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47676000 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 47676073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 2479567 - 2479600
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479567 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 2479600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 21989139 - 21989172
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21989139 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 21989172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44847991 - 44847958
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44847991 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 44847958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Original strand, 2580621 - 2580656
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2580621 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaac 2580656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1113956 - 1113887
Alignment:
Q  18 gtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaa 88  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1113956 gtaactaatatcaaagtaaacacaagcaataa-caacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaa 1113887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4796534 - 4796501
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4796534 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga 4796501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46516171 - 46516138
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46516171 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagaga 46516138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 381
Target Start/End: Original strand, 35961050 - 35961078
Alignment:
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961050 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 35961078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 97)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31218426 - 31218152
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31218426 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 31218327  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca--ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218326 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 31218227  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  31218226 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 31218152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 34254330 - 34254601
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254330 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggtt 34254429  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254430 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 34254529  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34254530 aaggtgtttacaatgtct-ccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 34254601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 34256506 - 34256777
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256506 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 34256605  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34256606 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacacc 34256705  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34256706 aaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagataactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttg 34256777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17982822 - 17982548
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17982822 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 17982723  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982722 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 17982623  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  17982622 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 17982548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42498363 - 42498089
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42498363 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggtt 42498264  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta--tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498263 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 42498164  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  42498163 ccaaggtgtttacaacgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 42498089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44304024 - 44303749
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44304024 ttgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggatt 44303925  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta---tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303924 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 44303825  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  44303824 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgtttcctttg 44303749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 1746218 - 1746491
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1746218 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtt 1746316  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta--tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746317 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 1746416  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||    
T  1746417 ccaaggtgtttacaatgtttcccaaccaaagagaactctaatcaaggaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 1746491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 19945358 - 19945633
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaag-ggt 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19945358 ttgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggt 19945457  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945458 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 19945557  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19945558 accaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagagaactctaatcaaagactctaaaccctaaagttgcttcctttg 19945633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212681
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 15212856  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15212855 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcac 15212756  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  15212755 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 15212681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43036591 - 43036318
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  43036591 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 43036493  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43036492 acaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 43036393  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  43036392 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 43036318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352045
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 33352220  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33352219 acaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcac 33352120  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||    
T  33352119 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttaccttctttg 33352045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 12702634 - 12702911
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12702634 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggtt 12702732  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta------tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 346  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12702733 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttca 12702832  T
Q  347 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||    
T  12702833 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaatttacctcctttg 12702911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4731826 - 4731553
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4731826 ttgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 4731728  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4731727 acaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 4731628  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  4731627 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 4731553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811173
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggtt 27811348  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27811347 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 27811248  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||    
T  27811247 ccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaatttacctcctttg 27811173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 3303670 - 3303943
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3303670 ttgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 3303768  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3303769 acaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcac 3303868  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||    
T  3303869 tcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccgtaaagttacctcctttg 3303943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5689439 - 5689166
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5689439 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 5689341  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5689340 acaagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 5689241  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  5689240 ccaaggtgtttacaatgtttccaaactcaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 5689166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143237
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 30143389  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttc 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30143388 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca--caatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttc 30143291  T
Q  372 ccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  30143290 ccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 30143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6599140 - 6598867
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtt 6599042  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6599041 acaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcac 6598942  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  6598941 tcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 6598867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6674593 - 6674320
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtt 6674495  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6674494 acaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcac 6674395  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  6674394 tcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 6674320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 1345371 - 1345644
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  1345371 ttgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggtt 1345469  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1345470 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcac 1345569  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||    
T  1345570 ccaaggtgtttacaatatttcccaactcaagagaactctaatcaaaaaccctcaaccctaaagttacatcctttg 1345644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283468
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 4283593  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4283592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 4283494  T
Q  353 -aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  4283493 taaggtgtttacaattgtttcccaac 4283468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 156 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2627902 - 2627647
Alignment:
Q  156 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatac-aaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||     
T  2627902 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttg 2627803  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacca 353  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  2627802 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcttca 2627710  T
Q  354 aggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  2627709 aggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 2627647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 425
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292736
Alignment:
Q  160 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 1292568  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 357  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1292569 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaaggt 1292668  T
Q  358 gtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  1292669 gttcacagtgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 1292736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321014
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggtt 40321150  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40321149 acaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcac 40321050  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40321049 tcaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaac 40321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141717
Alignment:
Q  160 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaa 18141883  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggt 357  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18141882 attagcttcaacaagctcacaaagaacaa-cctaatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggt 18141784  T
Q  358 gtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctt 423  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| || |||||||    
T  18141783 gtttacaaatgtttcccaacctaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaaattacctcctt 18141717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435204
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 42435090  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  42435091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 42435189  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    ||| |||||||||||    
T  42435190 caaagtgtttacaat 42435204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 154 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162400
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4162566  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac- 351  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4162565 caagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgct 4162469  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctc 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  4162468 caaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctc 4162400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655355
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 18655469  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |    
T  18655468 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcc 18655370  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  18655369 caaggtgtttacaat 18655355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366877
Alignment:
Q  160 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||     
T  41366622 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaa 41366719  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 357  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41366720 attagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 41366819  T
Q  358 gtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41366820 gtttacaatgtttcccaatctaagagaactctaatcaaagatcctcaaccctaaagtt 41366877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106351
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaaga 18106182  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aagg 356  Q
     ||||||||  ||||| || |||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18106183 aattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaagg 18106282  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||  ||||||||    
T  18106283 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaatctaattaaagaccctctatcctaaagttctctcctttg 18106351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221689
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 40221809  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 356  Q
     ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  40221808 aattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 40221710  T
Q  357 tgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  40221709 tgtttacaattgtttcccaac 40221689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765691
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 9765815  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||     
T  9765814 acaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa----tttcactcac 9765719  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765718 ccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 9765691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 10930199 - 10930423
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10930199 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggtt 10930297  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||      
T  10930298 acaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttcactctc 10930396  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  10930397 ccaaaatgtttacaattgtttcccaac 10930423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 154 - 374
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965914
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggtta 8965790  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
     |||| |||| |||  ||||  ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8965791 taagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8965890  T
Q  352 caaggtgtttac-aatgtttccca 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  8965891 caaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 378
Target Start/End: Original strand, 19491699 - 19491924
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19491699 ttgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 19491797  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19491798 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcac 19491896  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 378  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19491897 ccaagatgtttacgatgtttcccaaccc 19491924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353736
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccc 44353824  T
Q  292 taatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  44353823 taatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaac 44353736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Original strand, 4743214 - 4743462
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  4743214 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaat----------gggtt 4743302  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    ||||||| |||||||  ||||   |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4743303 acaagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaatt-ctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcac 4743401  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| || |||||    
T  4743402 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagattcctaatcaaagaccctcaaccctaa 4743462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328723
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggttacaagatattagctttgacaagttca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||| |||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctca 40328823  T
Q  279 caaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 375  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40328822 caaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaa 40328724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291545
Alignment:
Q  162 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 30291669  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 357  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30291668 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggt 30291569  T
Q  358 gtttac-aatgtttcccaacccaa 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  30291568 gtttacaaatgtttcccaacccaa 30291545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383941
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagtta 11384054  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  11384053 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctca-taatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 11383956  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  11383955 caaggtgtttacaat 11383941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25690123 - 25689885
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  25690123 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 25690025  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  25690024 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 25689933  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25689932 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 25689885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 161 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772161
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  3772352 ccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaa 3772254  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3772253 ttagcttaaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactcacc 3772161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3439672 - 3439434
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  3439672 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 3439574  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||      
T  3439573 tacaagaaattagc-ttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctcttt 3439482  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3439481 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 3439434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 425
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365120
Alignment:
Q  233 caaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagac 331  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  332 actcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 41365120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929696
Alignment:
Q  203 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag-----------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T
Q  303 -attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatc 400  Q
     |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10929818 cattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaatg-ttcccaacccaagagaactctaatcaaaga-c 10929721  T
Q  401 ctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |  || ||||||||| |||||||||    
T  10929720 cccaaccctaaagttacctcctttg 10929696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153683
Alignment:
Q  165 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattag 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttag 8153816  T
Q  265 ctttgacaa-gttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaaca--agacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtt 360  Q
    |||  |||| | ||| |||      |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8153815 cttcaacaaagctcagaaa------ccctaatttctaccattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgta 8153722  T
Q  361 tac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  8153721 tacaaatgtttcccaacccaaaagaacattaatcaaaga 8153683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Original strand, 42575327 - 42575494
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  42575327 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 42575425  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  42575426 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 42575494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15290688 - 15290522
Alignment:
Q  158 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||    
T  15290688 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttac 15290590  T
Q  255 aagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15290589 aagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 15290522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15471057 - 15470891
Alignment:
Q  158 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||    
T  15471057 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttac 15470959  T
Q  255 aagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15470958 aagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 15470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 365
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712214
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |    
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagct 11712123  T
Q  277 cacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaa 365  Q
    | ||| |||| || |||||||| ||| |||||| |||||||  |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  11712124 ctcaaggaacaaaacctaatttatattattttctcaatctcttccaaagaacaaaagactcaatga-tttcactcatccaagatgtttacaa 11712214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733784
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 244  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1822423 - 1822282
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  1822423 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 1822324  T
Q  290 cctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagac 331  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1822323 cataatttctatcctttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1822282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1856868 - 1856727
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  1856868 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 1856769  T
Q  290 cctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagac 331  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1856768 cataatttctatcctttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1856727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015119
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaaga 10015145  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaaga 284  Q
     ||||||||  |||||  ||||||||    
T  10015144 aattagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 258
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073977
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaatgtta 3073972  T
Q  254 caaga 258  Q
    |||||    
T  3073973 caaga 3073977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 29796320 - 29796596
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||||||  ||    
T  29796320 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaatgt 29796419  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| || |||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||||   |||||||||||||  |  | |||||||| |||||||||  |||||||    
T  29796420 tacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactcttttcccaatctcttctcaagaacaagagactcaatga-attcactc 29796518  T
Q  350 -accaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
      ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  29796519 gcccaagatatttacaaatgtttcccaacccaagagaaccctcgccaaagatcctcaaccctaaagttacctcctttg 29796596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597648
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaa 7597677  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaa 288  Q
    ||||||||  ||||| || | ||||||||    
T  7597676 attagcttcaacaagctctccaagaacaa 7597648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 34254194 - 34254266
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34254194 agtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaag 34254266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4731963 - 4731889
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4731963 agtaaccgatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 4731889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4733778 - 4733704
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  4733778 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcttttg 4733704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15213091 - 15213017
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  15213091 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtg 15213017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30143645 - 30143571
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30143645 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 30143571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 34256370 - 34256442
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34256370 agtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaag 34256442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17982958 - 17982884
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17982958 agtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 17982884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27811583 - 27811509
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27811583 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtg 27811509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 44304160 - 44304086
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44304160 agtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtg 44304086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Original strand, 1746082 - 1746155
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagt 90  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1746082 agtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagt 1746155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42498497 - 42498426
Alignment:
Q  20 aaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42498497 aaccaatatcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 42498426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10015117 - 10015043
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| | |||||||    
T  10015117 ccaacgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccataaagttacgtcctttg 10015043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902287
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagctt 32902287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240159
Alignment:
Q  213 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttccc 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttctatctttgtccc 10240165  T
Q  311 aatctc 316  Q
    ||||||    
T  10240164 aatctc 10240159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33352453 - 33352381
Alignment:
Q  19 taaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  33352453 taaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtg 33352381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 18105939 - 18106012
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18105939 agtaaccaatattaaagtaaacacaagcaataa-caacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 18106012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 386
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3232031
Alignment:
Q  218 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatct 315  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||| |||| |||||| || |||||||||||   ||||| ||||||    
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttctacatttttctcaatct 3231958  T
Q  316 c-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |  || | |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3231959 cttcctaagaacaagagactcaatga-attcacccacccaaggtgtttactaatgtttcccaactcaagagaac 3232031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 19945222 - 19945296
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  19945222 agtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtg 19945296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38863868 - 38863803
Alignment:
Q  323 gaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaagagaactc 388  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38863868 gaacaagagactcaatgatttt-actctccaagatgtttacaaatgtttcccaacccaagagaactc 38863803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 41366481 - 41366554
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  41366481 agtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataa-caacaataacaacacctagatctaatataggaatcaaagtg 41366554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 425
Target Start/End: Original strand, 19948533 - 19948594
Alignment:
Q  364 aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19948533 aatgtttcccaactcaaaagaactctaatcaaagactctaaaccctaaagttgcttcctttg 19948594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41267078 - 41266902
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaac-cctaatttctatcattttccca 311  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |  |||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  41267078 cactatcaagaagttctttagaaagaaatacaaaagagttacaagaaattagtctcaacaagttctctaagaacaaaacctaatttctaccattttctca 41266979  T
Q  312 atctca-ccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    | |||  || | |||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41266978 aactcttcctaagaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaagtatttacaactgtctcccaacccaagagaac 41266902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4734011 - 4733947
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctagg 81  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  4734011 agtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatcaaatgtagg 4733947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 31218559 - 31218488
Alignment:
Q  20 aaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  31218559 aaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtg 31218488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38864000 - 38863949
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 231  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38864000 acctactatgcaggggagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11137146 - 11137031
Alignment:
Q  205 tctccaatccactatcaatgagttctt----acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||   ||| |||  | |||||||||    
T  11137146 tctccaattcactatcaatgagtttttttttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaagttcttcaaggacatacttaatttcta 11137047  T
Q  301 tcattttcccaatctc 316  Q
     ||||||| |||||||    
T  11137046 ccattttctcaatctc 11137031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 4456259 - 4456292
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456259 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4456292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4696474 - 4696441
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696474 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 4696441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6599270 - 6599200
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6599270 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaa----caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 6599200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6674723 - 6674653
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6674723 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaa----caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 6674653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 7412571 - 7412604
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412571 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 7412604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 361
Target Start/End: Original strand, 7444946 - 7445026
Alignment:
Q  282 agaacaaccctaatttctatcattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 361  Q
    |||||||  |||||||||| || |||| |||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7444946 agaacaaatctaatttctaccaatttctcaatctcttcccatgaacaagagactcaaagattttcactcaccaacgtgttt 7445026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7493039 - 7493004
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7493039 ccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaac 7493004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 1292332 - 1292405
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||  | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1292332 agtaaacaatatcaaagtaaacacaagtagtaa-caacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 1292405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 1345239 - 1345312
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| ||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1345239 agtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaa-caataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 1345312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909426
Alignment:
Q  202 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattag 264  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatac-aaagagttacaagaaattag 30909426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5702346 - 5702313
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5702346 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga 5702313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19175620 - 19175587
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19175620 ccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga 19175587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5990428 - 5990392
Alignment:
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5990428 accaagatgattacaatgtttcccaacccaagagaac 5990392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23799441 - 23799409
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23799441 caaggtgtttacaatgttccccaacccaagaga 23799409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 92)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 5723255 - 5723527
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5723255 ttgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggtt 5723354  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723355 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5723454  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5723455 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccccaaaccctaaagttgcctcctttg 5723527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 4503132 - 4503405
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4503132 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 4503230  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503231 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 4503330  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  4503331 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaacctaaaccctaaagttgcttcctttg 4503405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45099923 - 45099650
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  45099923 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 45099825  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099824 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 45099725  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  45099724 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 45099650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 2334417 - 2334690
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2334417 ttgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 2334516  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334517 actagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 2334616  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||    
T  2334617 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaataccctcaaccctaaagttacctcctttg 2334690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 36205664 - 36205936
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  36205664 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 36205762  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205763 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36205862  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  36205863 caaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 36205936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 36988075 - 36988348
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36988075 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 36988174  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988175 acaagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36988274  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  36988275 caaggtgtttactatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 36988348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 4484329 - 4484594
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4484329 ttgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggt 4484428  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4484429 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc 4484527  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4484528 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagtt 4484594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 159 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29868031 - 29867791
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29868031 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 29867933  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaagg 356  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29867932 aattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 29867833  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867832 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 29867791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 6595005 - 6595279
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6595005 ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggtt 6595104  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca--ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  6595105 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactct 6595204  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  6595205 ccaaagtgtttacaatttttcccagcccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 6595279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38312408 - 38312135
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38312408 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggtt 38312310  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312309 acaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 38312210  T
Q  352 -caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  38312209 acaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaacctcaaccctaaagttacctcctttg 38312135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30833515 - 30833250
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30833515 ttgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggt 30833416  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30833415 tacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc 30833317  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  30833316 accaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaaaaccctaaaccctagagtt 30833250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 723744 - 724017
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 723842  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  723843 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 723942  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  723943 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 724017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362247
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 42362401  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttc 371  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42362400 gctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttc 42362301  T
Q  372 ccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  42362300 ccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 42362247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34140044
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggt 34139868  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139869 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 34139968  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| |||||||||    
T  34139969 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagactttcaaccctaaagttacctcctttg 34140044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 11151591 - 11151864
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11151591 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtt 11151689  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11151690 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcac 11151789  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  11151790 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 11151864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 421
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057638
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 17057467  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17057468 acaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 17057567  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcc 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||    
T  17057568 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccttcaaccctaaagttacctcc 17057638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 421
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085621
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 17085450  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17085451 acaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 17085550  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcc 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||    
T  17085551 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccttcaaccctaaagttacctcc 17085621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 36318009 - 36318282
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36318009 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 36318107  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36318108 acaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36318207  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   | || ||||||||| |||||||||    
T  36318208 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagataactctaatcaaagacattcaaccctaaagttacctcctttg 36318282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11690661 - 11690396
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  11690661 ccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaa 11690563  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11690562 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 11690463  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  11690462 tttacaatgtttcccaacccaagagaactataatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 11690396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32289733 - 32289477
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32289733 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagt 32289634  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  32289633 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttt-ccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcac 32289542  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  32289541 caaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagtt 32289477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 14633825 - 14634099
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  14633825 ttgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggt 14633923  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633924 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 14634023  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||  |||||||| |||||||||    
T  14634024 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaaaaccctcaactctaaagttacctcctttg 14634099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36773730 - 36773496
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36773730 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtt 36773632  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaattt-ctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36773631 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36773532  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773531 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 36773496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 33162450 - 33162723
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33162450 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggtt 33162548  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  33162549 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcac 33162648  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||    
T  33162649 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaaattacctcctttg 33162723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447108
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 35446983  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  35446984 caagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 35447082  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  35447083 caaggtgtttacaattgtttcccaac 35447108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 376
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631956
Alignment:
Q  156 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttaca 255  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 1631833  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac-ca 353  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  1631834 agatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctca 1631932  T
Q  354 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  1631933 aggtgtttacaattgtttcccaac 1631956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726871
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 45726998  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  45726997 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcc 45726899  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 378  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45726898 caaggtgtttacaattgtttcctaaccc 45726871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11067473 - 11067248
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11067473 ttgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 11067375  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11067374 acaagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcac 11067275  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11067274 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacc 11067248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6266860 - 6266621
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  6266860 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 6266762  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  6266761 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 6266669  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6266668 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 6266621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121703
Alignment:
Q  188 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaaca 287  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  288 a-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13121803 aaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaacccaagaga 13121704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 220 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885582
Alignment:
Q  220 caatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcac 318  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  319 caatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagat 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccatgagaactctaatcaaagat 24885582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490376
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagtta 17490247  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-cc 352  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  17490248 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataa----aatttctaccatttt-ccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcacccaccc 17490342  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |  |||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17490343 actgtgtttgcaatgttttccaactcaagagaac 17490376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288334
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaata 42288214  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 356  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  42288215 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactc-gtgattttcactctcccaagg 42288313  T
Q  357 tgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  42288314 tgtttacaattgtttcccaac 42288334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24398227 - 24397997
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24398227 ttgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggt 24398128  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcatt--ttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24398127 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcact 24398028  T
Q  349 c--accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |   | ||||||||||||| |||||||||||    
T  24398027 cttccaaaggtgtttacaattgtttcccaac 24397997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 425
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202680
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      | ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |     
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag-gat------gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaca 14202542  T
Q  292 taatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacac--tcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaact 387  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202543 taatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaact 14202642  T
Q  388 ctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||| |||| ||||    
T  14202643 ctaatcaaagaccctcaaccataaagttacctcatttg 14202680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 386
Target Start/End: Original strand, 7815311 - 7815508
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aacc 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |   ||||||| ||||    
T  7815311 ggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaacc 7815410  T
Q  291 ctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  7815411 ctaatttcaacctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaacccaatagaac 7815508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 278 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284780
Alignment:
Q  278 acaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaa 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 39284830  T
Q  376 cccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  39284829 cccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 39284780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11049721 - 11049484
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaaagggtt 252  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11049721 tgtttacccagttcagtccaat-ttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggtt 11049623  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaa---agaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    | |||| ||||||||  ||||| ||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11049622 ataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttataccattttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcact 11049523  T
Q  349 ca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaa 385  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11049522 tacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacacaagagaa 11049484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648142
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatct-caccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||| || ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | |  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactc 33648142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Original strand, 13656035 - 13656200
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  13656035 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttac 13656133  T
Q  255 aagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13656134 aagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 13656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353124
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgtta 26353253  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| ||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||||   ||||  |||||||||||| ||     ||||||||| |||||||||||||    
T  26353252 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaaaga-----acactcaataattttcactcacc 26353158  T
Q  353 aag-gtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     || |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26353157 gagagtgtttacaatg-ttcccaactcaagagaac 26353124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 12647385 - 12647623
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  12647385 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 12647483  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  12647484 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 12647573  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12647574 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 12647623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17450745 - 17450550
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||||    
T  17450745 ttgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc------------acaaatgggtt 17450660  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17450659 acaaaa-attagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 17450561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Original strand, 12123644 - 12123831
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttccca 311  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| || |||||  ||||  ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |    
T  12123644 cactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcattttcc-a 12123742  T
Q  312 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttta-caatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12123743 atctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaacctaagagaactctaaccaaaga 12123831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451173
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaatta 7451187  T
Q  254 caagatattagctt 267  Q
    ||||| ||||||||    
T  7451186 caagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 5723119 - 5723190
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5723119 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaa 5723190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284930
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Original strand, 7597036 - 7597211
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||  || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||    
T  7597036 tgacctactctgaaggagaga--gatctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagtt 7597133  T
Q  277 cacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    || || |||| || ||||||||||||   |||| |||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7597134 cataaggaacaaaacctaatttctattcatttctcaatctcttcccatgaacaagacactgagtgattttcactcacc 7597211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 45100059 - 45099985
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45100059 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 45099985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 349
Target Start/End: Original strand, 30218068 - 30218241
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||| |    
T  30218068 tgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagct 30218167  T
Q  277 cacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatct-caccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    | | |||||||| ||||| ||||| |  |||| |||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30218168 ctccaagaacaaacctaacttctacccatttctcaatctccttccatgaacaagacactcaatgatttccactc 30218241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671976
Alignment:
Q  165 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatatta 263  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T
Q  264 gctttgacaagtt 276  Q
     | || |||||||    
T  28671988 accttaacaagtt 28671976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 17057232 - 17057306
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  17057232 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtg 17057306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 17085215 - 17085289
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  17085215 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtg 17085289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 36205528 - 36205602
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36205528 agtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 36205602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 38312545 - 38312471
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38312545 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 38312471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 6594867 - 6594941
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6594867 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtg 6594941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 36987938 - 36988012
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36987938 agtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 36988012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 424
Target Start/End: Original strand, 5700271 - 5700396
Alignment:
Q  302 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaa-gagaactctaatcaaaga 398  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||  | || || ||    
T  5700271 cattttctcaatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaaatgtttctcaacccaacgagaaccatcattaatga 5700370  T
Q  399 tcctaaatcctaaagttgcctccttt 424  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||    
T  5700371 tcctcaaccctaaagttacctccttt 5700396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Original strand, 42019896 - 42019986
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42019896 acctactatggggaagagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 42019986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 316
Target Start/End: Original strand, 42261524 - 42261648
Alignment:
Q  193 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| || | |||||||| |     
T  42261524 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 42261623  T
Q  292 taatttctatcattttcccaatctc 316  Q
    |||||||||  |||||| |||||||    
T  42261624 taatttctacgattttctcaatctc 42261648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 4484191 - 4484265
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4484191 agtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 4484265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24198065 - 24197955
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaaggg 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||    
T  24198065 ttgtttacccagttcggcccaaacgtgacctacgtctggagaagata--gatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatac--aaggg 24197970  T
Q  251 ttacaagatattagc 265  Q
    |||||||| ||||||    
T  24197969 ttacaagaaattagc 24197955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 4502996 - 4503070
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4502996 agtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtg 4503070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412117
Alignment:
Q  177 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaat 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 723610 - 723683
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  723610 agtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 723683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2838250 - 2838177
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2838250 agtaaccactatcaaagtaaacacaaacaacaa-caacaataacaacacctagatataatctaggaatcaaagtg 2838177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3897111 - 3897005
Alignment:
Q  202 atctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||  || |||||   |||||||| | |||||||||    
T  3897111 atctctctaatccactttcaatgagttctttacaaaattatacaaaagagttacaaaaaattagcttcaacgagttcttcaagaacaatcttaatttcta 3897012  T
Q  301 tcatttt 307  Q
    |||||||    
T  3897011 tcatttt 3897005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11067605 - 11067532
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  11067605 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 11067532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 14633691 - 14633764
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14633691 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 14633764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 32289873 - 32289799
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| || ||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  32289873 agtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 32289799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811375
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||  ||||| || | |||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctaccatttt 34811375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 17865436 - 17865469
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865436 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 17865469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 21630176 - 21630209
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21630176 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 21630209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23078337 - 23078304
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078337 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 23078304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 34389082 - 34389115
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34389082 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 34389115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36757628 - 36757595
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757628 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 36757595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 40739065 - 40739098
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40739065 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 40739098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41454366 - 41454173
Alignment:
Q  189 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaaca 287  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| | ||| ||||||||  ||||| || |||| ||||    
T  41454366 ggaggagaga--gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaaca 41454269  T
Q  288 accctaatttctatcattttcccaatc-tcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaaga 382  Q
    |  |||||||||| |||||| | |||| |   | |||| ||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  41454268 aatctaatttctaccatttttcgaatctttttccatgatcaagatactcaatgaattt-attcactaaggtgtagacaattgtttcccaacccaaga 41454173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10445333 - 10445298
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10445333 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaac 10445298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30833626 - 30833579
Alignment:
Q  44 caataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30833626 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 30833579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Original strand, 40015156 - 40015191
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40015156 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 40015191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 34139636 - 34139709
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||||||    
T  34139636 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaagacctagatctaatctagtaatcaaagtg 34139709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8390015 - 8389982
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8390015 ccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga 8389982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10707118 - 10707085
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10707118 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga 10707085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 13569560 - 13569593
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13569560 ccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga 13569593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14698875 - 14698842
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14698875 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga 14698842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28259043 - 28259010
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28259043 ccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagaga 28259010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 33118366 - 33118399
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33118366 ccaaggtgtttacaatgttccccaacccaagaga 33118399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33528490 - 33528457
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33528490 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 33528457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 39483164 - 39483197
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39483164 ccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga 39483197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064725
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagaga 42064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43406062 - 43406029
Alignment:
Q  230 ttacaaagagatacaaaagggttacaagatatta 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43406062 ttacaaagagatacacaagggttacaagatatta 43406029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Original strand, 3278231 - 3278307
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  3278231 ccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaatctctcatcaacgatactcaaccctaaagttacctcatttg 3278307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 56178636 - 56178909
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178636 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 56178735  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178736 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 56178835  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  56178836 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccttcaaccctaaagttacctcctttg 56178909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000078
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga-gatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagtt 29999905  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29999906 acaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcacc 30000005  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  30000006 aaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgtctcctttg 30000078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 52095362 - 52095635
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  52095362 ttgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggtt 52095460  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52095461 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 52095560  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||    
T  52095561 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagtccctcaaccctaaagttacctcctttg 52095635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48143212 - 48142937
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48143212 ttgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggtt 48143113  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta--tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143112 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 48143013  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  48143012 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 48142937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739823
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggtt 12739648  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12739649 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcac 12739748  T
Q  352 c-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  12739749 ctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 12739823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 5370082 - 5370359
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370082 ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5370181  T
Q  253 acaagatattagc-tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta----tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 347  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370182 acaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 5370281  T
Q  348 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  5370282 tcaccaaagtgtttacaatgtttcccagcccaagagaactataatcaaagaccctaaaccctaaagttgtctcctttg 5370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 9927458 - 9927730
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9927458 ttgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 9927556  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9927557 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactcac 9927656  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  9927657 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 9927730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 192 - 425
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12748029
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 12747893  T
Q  292 taatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactct 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747894 taatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactct 12747993  T
Q  390 aatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  12747994 aatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 12748029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5429847 - 5429574
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5429847 ttgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggtt 5429749  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5429748 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 5429649  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||    
T  5429648 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacttcctttg 5429574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37740793 - 37740521
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37740793 ttgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 37740695  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37740694 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcac 37740595  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||    
T  37740594 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaacttacctcctttg 37740521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 13992292 - 13992551
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13992292 ttgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagtt 13992390  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  13992391 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca 13992483  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgc 13992551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175909
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 26175734  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct-atcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26175735 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 26175834  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||    
T  26175835 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaacagaactttaatcaaagaccctcaactctaaagttacctcctttg 26175909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 34570414 - 34570687
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34570414 ttgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggtt 34570512  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34570513 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 34570612  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||    
T  34570613 ccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagctacctcctttg 34570687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 54199907 - 54200179
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54199907 ttgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 54200004  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54200005 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 54200104  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  54200105 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 54200179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 52082663 - 52082930
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  52082663 ttgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggtt 52082755  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  52082756 acaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcac 52082855  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  52082856 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 52082930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 47038411 - 47038682
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||    
T  47038411 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatga-tt 47038508  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47038509 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 47038608  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  47038609 caaggtgtttataatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttaactcctttg 47038682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 194 - 424
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745708
Alignment:
Q  194 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaacccta 12745575  T
Q  294 atttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaa 391  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12745576 atttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacattgtttcccaaaccaagagaactctaa 12745675  T
Q  392 tcaaagatcctaaatcctaaagttgcctccttt 424  Q
    ||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||    
T  12745676 tcaaagaccctcaactctaaagttacctccttt 12745708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5871988 - 5871715
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  5871988 ttgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggtt 5871890  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5871889 acaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 5871790  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||    
T  5871789 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccataaccctaaagttacctcctttg 5871715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36994692 - 36994420
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36994692 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 36994594  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36994593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36994494  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||    
T  36994493 ccaaggtgtttacaatgtttgccaaatcaagagaactctaatcaaagaccctcaa-ccaaaagttacctcctttg 36994420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463623
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtt 36463487  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  36463488 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcac 36463587  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36463588 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaac 36463623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 52467354 - 52467628
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  52467354 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggtt 52467452  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52467453 acaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 52467552  T
Q  351 ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||    
T  52467553 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaaattacctcctttg 52467628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 31495315 - 31495556
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  31495315 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagag 31495414  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  31495415 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 31495507  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31495508 tcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703443
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||      
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 46703470  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  46703469 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 46703443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542415
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaa 6542278  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatca--ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6542279 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactca 6542378  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542379 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 6542415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2209883 - 2209668
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2209883 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggt 2209784  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2209783 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacactc-atgattttcactct 2209685  T
Q  350 accaaggtgtttacaat 366  Q
     ||||||||||||||||    
T  2209684 cccaaggtgtttacaat 2209668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29254662 - 29254389
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29254662 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggtt 29254564  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
     ||||| |||| |||  ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29254563 gcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcac 29254464  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||||  ||||||||    
T  29254463 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctactcaaagaccttcaaccctaaagttatctcctttg 29254389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 378
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893868
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtt 48893736  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaa----gaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 347  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893737 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 48893836  T
Q  348 tca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48893837 tcacccaaggtgtttacaatgtttccaaaccc 48893868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54883188 - 54882964
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54883188 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 54883090  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  54883089 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 54882991  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  54882990 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 54882964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229957
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtt 37229820  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaaca-accctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37229821 acaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcac 37229920  T
Q  351 ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37229921 ccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaac 37229957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665351
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 8665457  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgttt 370  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  8665456 gctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaattgttt 8665357  T
Q  371 cccaac 376  Q
    ||||||    
T  8665356 cccaac 8665351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639370
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggtta 41639495  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  41639494 caagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactc-gtgattttcactctcc 41639396  T
Q  353 -aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  41639395 taaggtgtttacaattgtttcccaac 41639370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474059
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 31474220  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    ||||| ||||||||  ||||  ||| |||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31474219 caagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 31474120  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaa 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||    
T  31474119 ccaaagtgtttacaatgtttcccactccaagagaaccttaatcaaagaccctcaaccctaa 31474059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 45687182 - 45687417
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  45687182 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagtt 45687280  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttc-tatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  45687281 ataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactca 45687380  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687381 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 45687417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632400
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 40632514  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  40632513 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 40632415  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  40632414 caaggtgtttacaat 40632400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655900
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 6656025  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  6656024 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactc-atgattttcactctcc 6655926  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  6655925 caaggtgtttacaattgtttcccaac 6655900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648095
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 8648208  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
     |||| ||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  8648207 taagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttc 8648108  T
Q  352 caaggtgtttaca 364  Q
    |||||||||||||    
T  8648107 caaggtgtttaca 8648095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 196 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969006
Alignment:
Q  196 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaat 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  296 ttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaat 392  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaactctaat 24969039  T
Q  393 caaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||| | | || | ||||||| |||||||||    
T  24969038 caaagaccgtcaaccttaaagttacctcctttg 24969006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587892
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 4588028  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    ||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || | ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4588027 caagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcac 4587928  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4587927 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccatgagaac 4587892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964358
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggttaca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttaca 41964482  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac-tcacca 353  Q
    | | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||| |  |||    
T  41964481 ataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttccca 41964382  T
Q  354 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  41964381 aggtgtttacaattgtttcccaac 41964358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50674059
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 50673946  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  50673947 caagaaattagcttcaacaagctcacaaag-acaatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactc-atgattttcactctcc 50674044  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  50674045 caaggtgtttacaat 50674059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 349
Target Start/End: Original strand, 27416965 - 27417160
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27416965 ttgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 27417063  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27417064 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 27417160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 13009444 - 13009704
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| || |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  13009444 ttgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtttt 13009542  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||             ||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13009543 acaaga-------------aagctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 13009629  T
Q  352 c-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  13009630 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttacctcatttg 13009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26364404 - 26364223
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26364404 ttgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 26364306  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 334  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364305 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073336
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |    
T  12073460 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactc-atgattttcacactcc 12073362  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  12073361 caaggtgtttacaattgtttcccaac 12073336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379322
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggtta 379449  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg-attttcactc-a 350  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||      
T  379448 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctc 379349  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  379348 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 379322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208116
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||     
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttg 5207941  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  5207942 caataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacc 5208041  T
Q  352 caaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||  || |||| |||| |||||||||    
T  5208042 caaggtgtttacaaatgtttcccaatccaagagaaccctcaccaaagacccgcaaccctatagttacctcctttg 5208116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 50262700 - 50262922
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50262700 ttgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 50262799  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||      
T  50262800 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatct---caataaacaagacactc-atgattttcactctc 50262895  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50262896 ccaaggtatttacaattgtttcccaac 50262922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Original strand, 12743925 - 12744071
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 12744023  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744024 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 12744071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Original strand, 12745314 - 12745460
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12745314 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 12745412  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745413 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 12745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12119708 - 12119481
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119708 ttgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggt 12119610  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12119609 tacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactc 12119510  T
Q  350 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12119509 tcccaaggtatttacaattgtttcccaac 12119481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913408
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||||| | |    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctc 3913479  T
Q  292 taatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtt 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3913478 taatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662384
Alignment:
Q  162 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatat 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 35662502  T
Q  262 tagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-ttttcactcac-caaggtg 358  Q
    ||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||    
T  35662501 tagcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttcacactctcaaggtg 35662403  T
Q  359 tttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  35662402 tttacaattgtttcccaac 35662384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51336998
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggtta 51337133  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa--ccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
     || | |||| |||  | ||| |||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51337132 taataaattatctt--aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactca 51337035  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51337034 cccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaac 51336998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 337
Target Start/End: Original strand, 46147391 - 46147575
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  46147391 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtt 46147489  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 337  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46147490 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagacaatcaa 46147575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 424
Target Start/End: Original strand, 48142413 - 48142651
Alignment:
Q  192 ggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaa 288  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  48142413 ggagagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaa 48142512  T
Q  289 -ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt-acaatgtttcccaacccaagagaa 385  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  48142513 accctaatttctatcatgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactcaagagaa 48142612  T
Q  386 ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctccttt 424  Q
    | ||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||    
T  48142613 ccctaatcaaagaccatcaaccctaaagttacctccttt 48142651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 300
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744193
Alignment:
Q  194 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 12744186  T
Q  294 atttcta 300  Q
    |||||||    
T  12744187 atttcta 12744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8393563 - 8393326
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  8393563 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 8393465  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||    
T  8393464 ttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctc 8393375  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8393374 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 8393326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8395772 - 8395535
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  8395772 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 8395674  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||    
T  8395673 ttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctc 8395584  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8395583 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 8395535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699670
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaag 257  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  258 atattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcatt--ttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-cca 353  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | || | ||  |||  |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattttcactcaccca 26699646  T
Q  354 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    | |||||||||| |||||||||||    
T  26699647 aagtgtttacaattgtttcccaac 26699670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21688397 - 21688192
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||  ||||    
T  21688397 aacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaa 21688298  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-caccaaggtgtttacaa-tgtt 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  21688297 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtt 21688199  T
Q  370 tcccaac 376  Q
    |||||||    
T  21688198 tcccaac 21688192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 366
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085578
Alignment:
Q  231 tacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaaga 330  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttccaatctcaccaatgaacaaga 55085541  T
Q  331 cactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 366  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55085542 cagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 55085578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345187
Alignment:
Q  200 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaa-caaccctaattt 297  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaattt 53345241  T
Q  298 ctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53345240 ctatcattttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactcac 53345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29056518 - 29056295
Alignment:
Q  162 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||  ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  29056518 cagttcggtcaaaa-tggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaa 29056420  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaacc-ctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||| | | |||||  |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29056419 ttagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattcctaccattttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgatttttactcacccaaggtg 29056320  T
Q  359 tttac-aatgtttcccaacccaaga 382  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||    
T  29056319 tttccaaatgtttcccaacacaaga 29056295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089837
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttca 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||| ||     
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctct 33089922  T
Q  279 caaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgttt 361  Q
    | |||||||| | ||||||||||   | || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33089921 ccaagaacaaacataatttctattcatctctcaatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaaggtgttt 33089837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7125071 - 7124831
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |    
T  7125071 ttgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-g 7124973  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  7124972 gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 7124881  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7124880 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 7124831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5136230 - 5135994
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  5136230 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 5136132  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||      
T  5136131 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctcta 5136042  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |||||| ||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5136041 caaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaaga 5135994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639218
Alignment:
Q  234 aaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  333 ctcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaat 366  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41639251 ctc-gtgattttcactctcctaaggtgtttacaat 41639218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5138455 - 5138288
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  5138455 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 5138357  T
Q  254 caagatattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  5138356 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5138288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7122852 - 7122612
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |    
T  7122852 ttgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-g 7122754  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  7122753 gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 7122662  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7122661 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 7122612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Original strand, 22882759 - 22882946
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  22882759 ccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaa 22882856  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||  ||||  || | |||||||| |||||||| ||||  |||  |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22882857 attagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcact 22882946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Original strand, 22934423 - 22934610
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  22934423 ccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaa 22934520  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||  ||||  || | |||||||| |||||||| ||||  |||  |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22934521 attagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcact 22934610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5429984 - 5429910
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5429984 agtaatcaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 5429910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677402
Alignment:
Q  195 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaag--aacaaccc 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || | |||  || || ||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacc 6677498  T
Q  292 taatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||  || | |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6677497 taatttctaccatttt-ccaatttcttcccaagaacaagagactcaatta-tttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaac 6677402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 48143353 - 48143279
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48143353 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 48143279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091456
Alignment:
Q  218 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatc-t 315  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||  || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctagcattttcccaatctt 32091484  T
Q  316 caccaatgaacaagacactcaatgattt 343  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||    
T  32091483 ctcccatgaacaagagactcaatgattt 32091456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 5369945 - 5370019
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5369945 agtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 5370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 13992154 - 13992228
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13992154 agtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtg 13992228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 34570277 - 34570351
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  34570277 agtaaccaatatcaaaatgaacacaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtg 34570351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5350052 - 5349932
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||  | || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||    
T  5350052 tgacctactctgg-ggagaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagtt 5349956  T
Q  277 cacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  5349955 cacaaagaacaaacctaatttcta 5349932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 52082526 - 52082597
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  52082526 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaa 52082597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 47038279 - 47038352
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47038279 agtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataa-caacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 47038352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 54199771 - 54199845
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  54199771 agtaaccagtatcaaagtgaacacaagcaataatcagcaataacatcacctagatctaatctaagaatcaaagtg 54199845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 56178499 - 56178573
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  56178499 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtg 56178573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3910075 - 3910002
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3910075 caaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaaggccctaaacccttaagttacctcctttg 3910002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 9927326 - 9927396
Alignment:
Q  21 accaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9927326 accaatatcaaagtaaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtg 9927396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37740930 - 37740856
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  37740930 agtaatcaatatcaaagtgaacagaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtg 37740856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 258
Target Start/End: Original strand, 21703836 - 21703940
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || |    
T  21703836 tgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgg-ggatagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaaaagggt 21703934  T
Q  253 acaaga 258  Q
    ||||||    
T  21703935 acaaga 21703940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34112973 - 34112839
Alignment:
Q  165 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatatta 263  Q
    ||||||||||   ||||||||| | | |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  34112973 ttcggtccaacaatgacctactataggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaatta 34112876  T
Q  264 gctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 300  Q
    ||||  ||||| || |  ||||||| | |||||||||    
T  34112875 gcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttcta 34112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 52095225 - 52095289
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctagg 81  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  52095225 agtaatcaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagg 52095289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 425
Target Start/End: Original strand, 52093882 - 52093937
Alignment:
Q  370 tcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  52093882 tcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 52093937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5872122 - 5872049
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5872122 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 5872049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 52065719 - 52065534
Alignment:
Q  201 gatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaa-gggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttc 298  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||  | ||| || | |||||||| |||||||||    
T  52065719 gatctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaacaa-cctaatttc 52065621  T
Q  299 tatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaaga 382  Q
    || |  ||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  52065620 tacctgtttcccaatatcttccgttgatcaagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaacccaaga 52065534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Original strand, 44967829 - 44968064
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||| |||||| |||||||||   |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  44967829 tgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatac-aaatggtt 44967927  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    |||||| ||| ||||   |||| || | |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||| |  |||||||| ||||||||     
T  44967928 acaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctcttcccaagaacaacaggctcaatga-tttcactca 44968026  T
Q  350 accaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  44968027 accaatttgtttacaaatgtttccaaatccaagagaac 44968064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Original strand, 52467222 - 52467295
Alignment:
Q  18 gtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52467222 gtaaccaatatcaaagtaaagacaagcaatcatcaataataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtg 52467295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422761
Alignment:
Q  201 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct 299  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||  | ||| || |||| ||||| | ||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttct 16422752  T
Q  300 atcattttc 308  Q
    | |||||||    
T  16422753 accattttc 16422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 361
Target Start/End: Original strand, 35369558 - 35369649
Alignment:
Q  271 caagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcac-caatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 361  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35369558 caagctcaccaagaacaaacctaatttctactcattt-cccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactctacaaggtgttt 35369649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 37754986 - 37755070
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatatta 263  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  37754986 acctactatgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagataaaaaaaggttacaagaaatta 37755070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Original strand, 5112468 - 5112503
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112468 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 5112503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 309
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788930
Alignment:
Q  230 ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcc 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||| || | |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctaccattttcc 34788930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 31474451 - 31474378
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  31474451 agtaatcaatatcaaagtaaacacaaacaacaa-caacaataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtg 31474378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31985508 - 31985466
Alignment:
Q  342 tttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31985508 tttcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 31985466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570567
Alignment:
Q  216 ctatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatc 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||  ||||| || | || ||||| | ||||||||| ||||||  |||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttctaccatttt-tcaatc 44570525  T
Q  315 tc--acca-----atgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||   |||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44570526 tcttcccatgaacatgaacaagacactcaatgattttcactc 44570567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 48893506 - 48893579
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  48893506 agtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataa-caacaataacagcacctagatctaatccaagaatcaaagtg 48893579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 3777780 - 3777813
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3777780 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3777813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5269066 - 5269033
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5269066 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5269033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5396537 - 5396504
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396537 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5396504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6743281 - 6743248
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6743281 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 6743248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 10047612 - 10047645
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047612 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 10047645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16623159 - 16623126
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623159 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 16623126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16628738 - 16628705
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628738 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 16628705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25861898 - 25861866
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25861898 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 25861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36315096 - 36315021
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36315096 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccctaaagttacctcctttg 36315021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36329305 - 36329230
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36329305 ccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccctaaagttacctcctttg 36329230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39774171 - 39774136
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39774171 ccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaac 39774136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5349905 - 5349840
Alignment:
Q  322 tgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  5349905 tgaacaagacactcaaagattttcaatcatccaaggtgtttacaaatgttt-ccaacccaaaagaac 5349840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29254798 - 29254725
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  29254798 agtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacga-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 29254725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 46147259 - 46147332
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||||||    
T  46147259 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaatacctagatctaatctagtaatcaaagtg 46147332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8689362 - 8689329
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8689362 ccaaggtgtttaaaatgtttcccaacccaagaga 8689329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 247
Target Start/End: Original strand, 1122865 - 1122909
Alignment:
Q  204 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaa 247  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1122865 ctctcaaatctactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaa 1122909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 434702 - 434428
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434702 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 434603  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434602 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 434503  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  434502 ccaaggtatttaccatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 434428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 316
Target Start/End: Original strand, 490359 - 490483
Alignment:
Q  193 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 291  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| || | |||||||| |     
T  490359 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 490458  T
Q  292 taatttctatcattttcccaatctc 316  Q
    |||||||||  |||||| |||||||    
T  490459 taatttctacgattttctcaatctc 490483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 434812 - 434765
Alignment:
Q  44 caataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  434812 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 434765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 157 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20762837 - 20762567
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaa 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20762837 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaa 20762738  T
Q  257 gatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 354  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20762737 gaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcaccaa 20762638  T
Q  355 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  20762637 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttg 20762567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3189499 - 3189226
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3189499 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtt 3189400  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3189399 acaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcac 3189300  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  3189299 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3189226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3198316 - 3198043
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3198316 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtt 3198217  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3198216 acaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcac 3198117  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  3198116 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3198043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3207155 - 3206882
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3207155 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtt 3207056  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3207055 acaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcac 3206956  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  3206955 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3206882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3157033 - 3156761
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 3156935  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156934 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 3156835  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  3156834 cagggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3156761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834440
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 834265  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  834266 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcac 834365  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  834366 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 834440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 8550786 - 8551060
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  8550786 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtt 8550885  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8550886 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 8550985  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  8550986 ccaatgtgtttacaatgtttcttaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttaactcctttg 8551060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220499
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 28220324  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28220325 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcac 28220424  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  28220425 ccaaggtgttttcaatgcttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 28220499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 159 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455055
Alignment:
Q  159 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  44455322 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaaga 44455224  T
Q  259 tattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaagg 356  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44455223 aattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaagg 44455124  T
Q  357 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  44455123 tgtttacaatgtttcccaacccaagaaaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 44455055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 28223421 - 28223694
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 28223519  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28223520 acaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 28223619  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  28223620 ccaaggtgtcttcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 28223694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659133
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggtt 31659308  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31659307 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 31659208  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  31659207 ccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 31659133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 49918518 - 49918244
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49918518 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 49918420  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49918419 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 49918320  T
Q  351 ccaaggtg-tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  49918319 ccaaggtgttttataatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagaccttcaaccctaaagttacctcctttg 49918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 50167175 - 50167409
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50167175 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 50167273  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50167274 acaagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 50167373  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167374 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 50167409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 3847121 - 3847394
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3847121 ttgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 3847219  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||| |  |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3847220 acaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 3847319  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||    
T  3847320 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcgaccctaaagttacctcctttg 3847394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 50169218 - 50169483
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagata 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  50169218 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 50169316  T
Q  261 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  50169317 ttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggta 50169416  T
Q  359 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||| || ||||||||| |||||||||    
T  50169417 tttacaatgtttcccaacccaagataaccctaataaaaaaccctcaaccctaaagttacctcctttg 50169483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51765566 - 51765300
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaa-ggg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  51765566 ttgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggg 51765467  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaa-gaacaaccctaatttctatcattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  51765466 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttacac 51765368  T
Q  348 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  51765367 tcaccaaggtgtttacaatgttt-ccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagtt 51765300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 37503557 - 37503827
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  37503557 ttgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---ggtt 37503652  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37503653 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 37503752  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||    
T  37503753 ccaaggtgtttacaatattttccaacccaatagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagtcacctcctttg 37503827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Original strand, 196915 - 197181
Alignment:
Q  161 ccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagat 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||     
T  196915 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaa 197013  T
Q  260 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 357  Q
    |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  197014 attaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 197113  T
Q  358 gtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  197114 gtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 197181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265788
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtt 28265652  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28265653 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 28265752  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28265753 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagagaac 28265788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 177 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833417
Alignment:
Q  177 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||  | |  ||    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagatt 1833568  T
Q  277 cacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttccca 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1833567 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccca 1833468  T
Q  375 acccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||  ||||||||    
T  1833467 atccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccttaaagttatctcctttg 1833417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 13659336 - 13659609
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  13659336 ttgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggta 13659434  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-ca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13659435 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactacc 13659534  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||| |||||||||    
T  13659535 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaagaccctcaacccacaagttacctcctttg 13659609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 45644354 - 45644628
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  45644354 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 45644452  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45644453 gcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactca 45644552  T
Q  351 -ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  45644553 cccaagatgtttacaatgttttccaacctaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 45644628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168241
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 37168367  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37168366 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 37168268  T
Q  352 -caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  37168267 tcaaggtgtttacaattgtttcccaac 37168241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 424
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552909
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggtt 4552735  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4552736 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcac 4552835  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctccttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  4552836 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctcaattaaagaccctcaaccctaaagttacctccttt 4552909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 375
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547312
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 13547188  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  13547189 caagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 13547287  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaa 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  13547288 caaggtgtttacaattgtttcccaa 13547312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 375
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549223
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 13549099  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    || || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  13549100 catgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 13549198  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaa 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  13549199 caaggtgtttacaattgtttcccaa 13549223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 37559867 - 37560142
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37559867 ttgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggt 37559965  T
Q  252 tacaagatattagcttt-gacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37559966 tacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 37560065  T
Q  350 acc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| ||||    
T  37560066 acctaatgtgtttacaatgttttcaaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccttaaagttacctcatttg 37560142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10925394 - 10925118
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaaagg 249  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |     
T  10925394 ttgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatga 10925296  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925295 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 10925196  T
Q  349 cacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  10925195 cacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactataatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 10925118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348642
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggtta 11348767  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  11348766 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 11348668  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  11348667 caaggtgtttacaattgtttcccaac 11348642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 13137976 - 13138247
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  13137976 ttgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggtt 13138074  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 351  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13138075 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 13138173  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  13138174 caaggtgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 13138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555538
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||  ||||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaa 23555384  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23555385 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtttacaatgtttc 23555484  T
Q  372 ccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  23555485 ccaacccaagagaactttaatcaaagatcctcaaccctgaagttacctcctttg 23555538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 46065086 - 46064840
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  46065086 ttgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagtt 46064988  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  || || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46064987 acaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 46064888  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  46064887 ccaaggtgtttacaatgttttccaccccaagagaaccataatcaaaga 46064840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136202
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  29136315 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 29136217  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  29136216 caaggtgtttacaat 29136202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Original strand, 13316351 - 13316520
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13316351 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 13316450  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaa 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  13316451 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820202
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaa 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaa 15820356  T
Q  274 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttc 371  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15820355 gctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttc 15820256  T
Q  372 ccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||    
T  15820255 ccaactcaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcttttg 15820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255535
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 47255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 366
Target Start/End: Original strand, 42297974 - 42298188
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  42297974 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 42298073  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  42298074 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttactctc 42298172  T
Q  351 ccaaggtgtttacaat 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  42298173 ccaaggtgtttacaat 42298188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Original strand, 37033071 - 37033297
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  37033071 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggat 37033170  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 349  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37033171 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 37033269  T
Q  350 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37033270 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 37033297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115115
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 47115142  T
Q  351 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47115141 ccaagatgtttacaattgtttcccaac 47115115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 396
Target Start/End: Original strand, 30476446 - 30476692
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30476446 ttgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 30476544  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaa---tgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    |||| | |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||     
T  30476545 acaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcacc 30476643  T
Q  349 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaa 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30476644 cacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaa 30476692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 365
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925919
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 31925806  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31925807 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 31925905  T
Q  352 caaggtgtttacaa 365  Q
    ||||||||||||||    
T  31925906 caaggtgtttacaa 31925919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193555
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagtta 193680  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  193679 caagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcaccctcc 193581  T
Q  352 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  193580 caaggtgtttacaattgtttcccaac 193555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19754663 - 19754438
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19754663 ttgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggtt 19754565  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19754564 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 19754466  T
Q  351 c-caaggtgtttac-aatgtttcccaac 376  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19754465 ctcaaggtgtttacgaatgtttcccaac 19754438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 425
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928251
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggtta 928075  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  928076 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcac 928175  T
Q  351 ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | || | ||||||| |||||||||    
T  928176 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaatcctaatcaaagaccttcaaccataaagttacctcctttg 928251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482445
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggtt 252  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 7482329  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac-tca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |      
T  7482330 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttc 7482429  T
Q  351 ccaaggtgtttacaat 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  7482430 ccaaggtgtttacaat 7482445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9987370 - 9987132
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  9987370 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaa-ggt 9987272  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  9987271 tgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 9987179  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9987178 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 9987132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 20622236 - 20622476
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| |    
T  20622236 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaa-g 20622334  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||| |||||||||||| |||    
T  20622335 gttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacagtcaatgattttccctc 20622427  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20622428 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 20622476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603519
Alignment:
Q  158 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-gggttacaa 256  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaa 34603642  T
Q  257 gatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac-tcaccaa 354  Q
    || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  ||||    
T  34603641 gaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaa 34603542  T
Q  355 ggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  34603541 ggtgtttacaattgtttcccaac 34603519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40282546 - 40282307
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  40282546 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 40282448  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  40282447 tacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 40282355  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40282354 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 40282307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 40122196 - 40122471
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaaaggg 250  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  40122196 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgag 40122294  T
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40122295 ttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactc 40122394  T
Q  350 acc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || | ||||||| |||||||||    
T  40122395 acccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagataactctaattaatgatcctcaaccataaagttacctcctttg 40122471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41361082 - 41360857
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41361082 ttgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 41360984  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  41360983 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcac 41360885  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 378  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41360884 ccaagatgtttacgatgtttcccaaccc 41360857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19752854 - 19752643
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19752854 ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggtt 19752756  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19752755 acaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 19752657  T
Q  351 c-caaggtgtttac 363  Q
    | ||||||||||||    
T  19752656 ctcaaggtgtttac 19752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9036585 - 9036326
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  9036585 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 9036487  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  9036486 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 9036395  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcc 418  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  9036394 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 9036326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21054123 - 21053888
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttaca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  21054123 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttgca 21054025  T
Q  256 agatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 354  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||  |||  |||    
T  21054024 agaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttttctctacaa 21053932  T
Q  355 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21053931 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 21053888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455591
Alignment:
Q  193 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccct 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||| ||  ||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-tagaaaaaatct 16455652  T
Q  293 aatttct-atcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455651 aatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  178 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagtt 276  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  277 cacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc 316  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaacataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44203801 - 44203563
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  44203801 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 44203703  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  44203702 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 44203613  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44203612 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 44203563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 383
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282923
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatat 261  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaat 37282799  T
Q  262 tagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgt 359  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  37282800 tagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttttc-aatctctccaatgaacaagacactcaatggttttcactcatacaaggtgt 37282898  T
Q  360 tt-acaatgtttcccaacccaagag 383  Q
    || | || |||| ||||||||||||    
T  37282899 ttaaaaaagttttccaacccaagag 37282923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 376
Target Start/End: Original strand, 37879006 - 37879135
Alignment:
Q  249 ggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 347  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37879006 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 37879104  T
Q  348 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37879105 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 37879135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242382
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 386
Target Start/End: Original strand, 44650172 - 44650398
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatat 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||||| | ||    
T  44650172 agttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaat 44650270  T
Q  262 tagctttgacaagttcacaaagaacaaccc-taatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgt 359  Q
    |||| || ||||  ||||||||||||| || |||||| ||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  44650271 tagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacatttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgt 44650370  T
Q  360 ttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  44650371 ttacaaatgttttccaacttaagagaac 44650398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876865
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808418
Alignment:
Q  180 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttca 278  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| ||     
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctct 6808496  T
Q  279 caaagaac------aaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    | ||||||      || ||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6808495 ccaagaacaaacctaatcctaatttctaccatttccctaatctctactcatgaacaagacactcaataattttcactc 6808418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 417
Target Start/End: Original strand, 13316513 - 13316583
Alignment:
Q  347 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13316513 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgc 13316583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2926678 - 2926516
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| ||| |||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||| |||    
T  2926678 ttgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggt 2926579  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatc 314  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2926578 tacaataaattaactttaacaagttcttcaagcacaaacctaatttctaccatttttccaatc 2926516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 343
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109610
Alignment:
Q  194 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccct 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| | ||| | || | |    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagttctccaagtaaaaactt 9109558  T
Q  293 aatttctatcattttcccaatctc--accaatgaacaagacactcaatgattt 343  Q
    |||||||  ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9109559 aatttcttccattttctcaatctcctacc-atgaacaagacactcaaggattt 9109610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 44455464 - 44455391
Alignment:
Q  18 gtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44455464 gtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 44455391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 365
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871259
Alignment:
Q  165 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattag 264  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||              ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa--------------gagttacaaaatggttacaagaaattag 8871158  T
Q  265 ctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttta 362  Q
    |||  || |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8871159 cttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcacaaaagaacaagacact--atgattttcgctcatccaaggtgttta 8871256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3157170 - 3157096
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3157170 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 3157096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 8550647 - 8550721
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8550647 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtg 8550721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13938281 - 13938143
Alignment:
Q  178 tgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaaagggttacaagatattagctttgacaag 274  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||| |||||    
T  13938281 tgacctacatctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaag 13938184  T
Q  275 ttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc 316  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13938183 ttctccaagaacaa-cctaatttctacccatttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36683828 - 36683766
Alignment:
Q  174 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36683828 aacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3460841 - 3460717
Alignment:
Q  177 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagt 275  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||     
T  3460841 ttgacctactctag-gaagatattgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagc 3460743  T
Q  276 tcacaaagaac-aaccctaatttcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3460742 tcacaaagaacaaactctaatttcta 3460717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 37559728 - 37559803
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatct-aatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  37559728 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtg 37559803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 49918655 - 49918584
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||    
T  49918655 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaa 49918584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Original strand, 12318523 - 12318721
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaaagggt 251  Q
    ||||| ||| ||||||||||||   ||| ||||| ||| |||||||  ||||||||   | || |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||    
T  12318523 ttgtttacctagttcggtccaataatgaactactatgggggagaga--gatctctctgcttcagtatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggt 12318620  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| || | | |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12318621 tacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctacccatttccaaatctctacccatgaacaagaaactcaatga-tttcactca 12318719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 31659543 - 31659470
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagt 90  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  31659543 agtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatcaacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagt 31659470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10925527 - 10925455
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaag 89  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  10925527 agtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaag 10925455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Original strand, 2263016 - 2263106
Alignment:
Q  196 agattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaa 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||    
T  2263016 agattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  182 ctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctt 267  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaa-tgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Original strand, 22819662 - 22819737
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  22819662 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactaaatcctaaagttacctcctttg 22819737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Original strand, 37503427 - 37503494
Alignment:
Q  24 aatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  37503427 aatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtg 37503494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 13316215 - 13316289
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    ||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13316215 agtaatcaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 13316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20762971 - 20762909
Alignment:
Q  19 taaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctagg 81  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20762971 taaccaatatcaaagtgaattcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagg 20762909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471486
Alignment:
Q  204 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaattt 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||  || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaattt 32471486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 777225 - 777177
Alignment:
Q  339 gattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  777225 gattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 777177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Original strand, 44646881 - 44646981
Alignment:
Q  251 ttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc-taatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    |||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||| || |||||| ||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44646881 ttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacatttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactc 44646980  T
Q  350 a 350  Q
    |    
T  44646981 a 44646981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47098691 - 47098656
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47098691 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 47098656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47102705 - 47102670
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102705 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 47102670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 834033 - 834106
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||    
T  834033 agtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataa-caacaataacaacaccaagatctaatctgggaatcaaagtg 834106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652029
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaa 312  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||  || |||| ||||  | ||||||||| || |||| |||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttctaccaatttctcaa 25652096  T
Q  313 t-ctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac-caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 376  Q
    |  |  |  |||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  25652095 tattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaac 25652029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 28220090 - 28220163
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28220090 agtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 28220163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 28223285 - 28223358
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28223285 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg 28223358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 50169078 - 50169151
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  50169078 agtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa-caataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtg 50169151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 3281938 - 3281971
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281938 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 3281971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13604488 - 13604455
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13604488 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 13604455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16124380 - 16124347
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124380 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 16124347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914279
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaaga 16914279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 37069998 - 37070031
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069998 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 37070031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51765690 - 51765630
Alignment:
Q  31 aagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  51765690 aagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 51765630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 196773 - 196846
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  196773 agtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaa-caataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtg 196846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Original strand, 4535527 - 4535585
Alignment:
Q  201 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaaga 258  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  4535527 gatctctccacttaactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaaga 4535585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 44646814 - 44646875
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatga 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646814 agttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9022770 - 9022737
Alignment:
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9022770 aaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaac 9022737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 13598631 - 13598664
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13598631 ccaaggtgtttacaatgtttgccaacccaagaga 13598664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916626
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagaga 15916626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 380
Target Start/End: Original strand, 29652044 - 29652073
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29652044 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 29652073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 31422862 - 31422906
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422862 ttgttcacccagctcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 380
Target Start/End: Original strand, 32889669 - 32889698
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32889669 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 32889698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 1050503 - 1050674
Alignment:
Q  214 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattttcccaa 312  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  | ||| || | |||||||  ||||||||  | |  ||||||||    
T  1050503 cactatcaacgagttatttacaaagagacacaaaaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcacccatttcccaa 1050602  T
Q  313 tctcacca-atgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaaga 382  Q
    ||||  || |||||||||| ||||||| | |||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1050603 tctcttcacatgaacaagagactcaat-aatttcactcattcaatgtgtgtacaaatgtttcccaacccaaga 1050674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6484075 - 6484023
Alignment:
Q  324 aacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaac 376  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  6484075 aacaagatactcaatgatttttactcatcaaaatgtttagaatgtttcccaac 6484023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26644763 - 26644735
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644763 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 26644735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36683762 - 36683694
Alignment:
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctca 317  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36683762 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcccaatctca 36683694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1084 - 820
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1084 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtt 986  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcatttt--cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  985 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactca 887  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  886 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgc 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1194 - 1147
Alignment:
Q  44 caataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1194 caataatcaacaataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtg 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11726 - 11502
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11726 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 11627  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11626 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 11527  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11526 caaggtgtttacaatgtttcccaac 11502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 153 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 114771 - 114537
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  114771 ttgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgtt 114672  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114671 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 114572  T
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114571 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 114537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 114906 - 114834
Alignment:
Q  19 taaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||    
T  114906 taaccaatatcaaagtgaacacaatcaataatcaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtg 114834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 11160 - 11425
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11160 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggt 11259  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11260 tacaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc 11358  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  11359 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccataaaccctagagtt 11425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Original strand, 8734 - 8999
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8734 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggt 8833  T
Q  252 tacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatcattt--tcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 349  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8834 tacaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacactc 8932  T
Q  350 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaa-ctctaatcaaagatcctaaatcctaaagtt 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8933 accaaggtctttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaagcctagagtt 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Original strand, 8623 - 8670
Alignment:
Q  44 caataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  8623 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Original strand, 11049 - 11096
Alignment:
Q  44 caataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11049 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtg 11096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20688
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtt 20513  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct-atcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  20514 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactcac 20613  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  20614 ccaaggtgtttacaatgtctcccaacccaagataactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 20688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 20278 - 20352
Alignment:
Q  17 agtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacatcacatagatctaatctaggtatcaaagtg 91  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20278 agtaaccaatgtcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtg 20352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 425
Target Start/End: Original strand, 149097 - 149370
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  149097 ttgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggta 149195  T
Q  253 acaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctat-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact-ca 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  149196 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactacc 149295  T
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagatcctaaatcctaaagttgcctcctttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||| |||||||||    
T  149296 ccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaagaccctcaacccacaagttacctcctttg 149370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 133145 - 133112
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133145 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 133112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 384
Target Start/End: Original strand, 2726 - 2758
Alignment:
Q  352 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2726 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 2758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 5916 - 5949
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5916 ccaaggtgtttacaatgtttgccaacccaagaga 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7282
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 7396  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  7395 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 7297  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  7296 caaggtgtttacaat 7282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18216
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagtta 18102  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |    
T  18103 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcc 18201  T
Q  352 caaggtgtttacaat 366  Q
    ||| |||||||||||    
T  18202 caaagtgtttacaat 18216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 17482 - 17515
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17482 ccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga 17515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10468
Alignment:
Q  154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggtta 10558  T
Q  254 caagatattagctttgaca--agttcacaaagaac-aaccctaatttctatc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 343  Q
    ||| | ||||||    |||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10557 caataaattagc----acaagagctcacaaagaacaaaccctaatttatatctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaaagattt 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 2603 - 2841
Alignment:
Q  153 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |    
T  2603 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga-g 2701  T
Q  250 gttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| ||    
T  2702 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctct 2791  T
Q  349 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2792 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 366
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80496
Alignment:
Q  209 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-tcatttt 307  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  308 cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttcacaat 80496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Original strand, 3729 - 3963
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  3729 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 3827  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |    
T  3828 caagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctac 3917  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 398  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3918 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 3963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6438 - 6183
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggtta 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || || |||    
T  6438 tcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagggctta 6340  T
Q  254 caagatattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 352  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |    
T  6339 caagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctac 6250  T
Q  353 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctaaatcctaaagttgcc 418  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  6249 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcc 6183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27678
Alignment:
Q  165 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaaagggttacaagatatta 263  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 27552  T
Q  264 gctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctatcattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtt 360  Q
    ||||  ||||| ||   ||||||||  | |||||||||   ||||| |||||||  ||   |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27553 gcttcaacaagctcttcaagaacaatacataatttctactcttttcacaatctcttccctagaacaagagactcaaaga-tttcactcatccaaggtgtt 27651  T
Q  361 tac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27652 tacaaatgtttcccaactcaagagaac 27678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25065
Alignment:
Q  201 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaaagggttacaagatattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct 299  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||  || ||||||||||  ||| |||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttct 25076  T
Q  300 atcattttccc 310  Q
    | |||||||||    
T  25075 accattttccc 25065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 386
Target Start/End: Original strand, 19117 - 19173
Alignment:
Q  331 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac-aatgtttcccaacccaagagaac 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19117 cactcaatgattttcactcacccaagtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaac 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8283 - 8250
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 8250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30 - 1
Alignment:
Q  157 tcacccagttcggtccaaacttgacctact 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30 tcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 45429 - 45462
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45429 ccaaggtgtttacaatgtttcacaacccaagaga 45462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36698 - 36665
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36698 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga 36665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43827 - 43798
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43827 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 43798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 85914 - 85947
Alignment:
Q  351 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85914 ccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 85947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University