View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15389_low_1 (Length: 726)

Name: NF15389_low_1
Description: NF15389
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15389_low_1
NF15389_low_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-708)||(17323523-17324229)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (1-708)||(1381215-1381922)
chr8 (1-244)||(1379365-1379608)
chr8 (1-135)||(17129729-17129863)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (1-708)||(34585112-34585819)
chr3 (485-556)||(44479077-44479148)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (1-708)||(30964998-30965705)
chr1 (8-81)||(26268811-26268884)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (11-378)||(37875895-37876262)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (50-244)||(20653958-20654152)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (485-556)||(21975030-21975101)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 620; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 708
Target Start/End: Original strand, 17323523 - 17324229
Alignment:
Q  1 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17323523 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggagcaaaagatg 17323622  T
Q  101 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  17323623 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgcttttaattattactctaagtgtg 17323722  T
Q  201 atgttttgatgaacaacttgtcagaagcttttaattccacaatactgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatct 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17323723 atgttttgatgaacaatttgtcagaagcttttaattccacaatattgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatct 17323822  T
Q  301 gatgaatagaatttcaacaattaggtataaacttagttcatggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagactaaatgttgaaattgaatttagt 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17323823 gttgaatagaatttcaacaattaggtataaacttagttcatggcaacataggataatgccaatgtctagaaaaagactaaatgttgaaattgaattaagt 17323922  T
Q  401 ggaaactggagggtcatttggagaataggtgatgaatatgaagtgcataaattatatgggggatatcagtacatagttgatattgggaaaatgacttgta 500  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17323923 gaaaactggagggtcatttggagaatagatgatgaatatgaagt-tataaattatatgggggatatcagtacatagttgatattgggaaaatgacttgta 17324021  T
Q  501 cttgtaacttctggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgttgcaatgggtaaaaggtctcagagacctgaggattatgttgatgactgtta 600  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324022 cttgtaacttcaggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgctgcaatgggtaaaaggtctcagagacctgaggattatgttgatgactgtta 17324121  T
Q  601 ttctagagcaacctatgaaaaatgttatagttatggtgtaagtgcacttaatggtgaagatatgtggccaaatgtggatgtgaaagagatgttgccacct 700  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17324122 ttctagagcaacctatgaaagatgctatagttatggtgtaagtgcacttaatggtgaagatatgtggccaagtgtggatgtggaagagatgttgccacct 17324221  T
Q  701 gcttataa 708  Q
     |||||||    
T  17324222 tcttataa 17324229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 616; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 616; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1381922 - 1381215
Alignment:
Q  1 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1381922 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggagcaaaagatg 1381823  T
Q  101 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  1381822 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgcttttaattattactctaagtgtg 1381723  T
Q  201 atgttttgatgaacaacttgtcagaagcttttaattccacaatactgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatct 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1381722 atgttttgatgaacaatttgtcagaatcttttaattccacaatattgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatct 1381623  T
Q  301 gatgaatagaatttcaacaattaggtataaacttagttcatggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagactaaatgttgaaattgaatttagt 400  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1381622 tattaatagaatttcaacaattaggtataaactttcttcatggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagactaaatgttgaaattgaatttagt 1381523  T
Q  401 ggaaactggagggtcatttggagaataggtgatgaatatgaagtgcataaattatatgggggatatcagtacatagttgatattgggaaaatgacttgta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1381522 ggaaactggagggtcatttggagaatagataatgaatatgaagtgcataaattatatggtggatatcagtacatagttgatattgggaaaagaacttgta 1381423  T
Q  501 cttgtaacttctggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgttgcaatgggtaaaaggtctcagagacctgaggattatgttgatgactgtta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1381422 cttgtaacttctggcagctagtaggtattccatgtagacatgctattgctgcaatgggtaaaaggtctcagagacctgaggattatgttgatgactgtta 1381323  T
Q  601 ttctagagcaacctatgaaaaatgttatagttatggtgtaagtgcacttaatggtgaagatatgtggccaaatgtggatgtgaaagagatgttgccacct 700  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1381322 tgctagagcaacctatgaaagatgctatagttatggtgtaagtgcacttaatggtgaagatatgtggccaaatgtggatgtggaagagatgttgccacct 1381223  T
Q  701 gcttataa 708  Q
    ||||||||    
T  1381222 gcttataa 1381215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1379608 - 1379365
Alignment:
Q  1 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1379608 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggagcaaaagatg 1379509  T
Q  101 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  1379508 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgcttttaattattactctaagtgtg 1379409  T
Q  201 atgttttgatgaacaacttgtcagaagcttttaattccacaata 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1379408 atgttttgatgaacaatttgtcagaagcttttaattccacaata 1379365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17129863 - 17129729
Alignment:
Q  1 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatg 100  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||| || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  17129863 tgcaaacttcaagaaaaaatatggtggaggtgctgcaatcagggactcgatgatgggggcagctaaagcaacatactatcaggcatgggaacagaagatg 17129764  T
Q  101 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatggga 135  Q
    |   |||| |||||| |||||   |||||||||||    
T  17129763 ctgcaacttaaggcaattgatgaaggagcatggga 17129729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 708
Target Start/End: Original strand, 34585112 - 34585819
Alignment:
Q  1 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  34585112 tgcaaattttaagaaaaaatttggaggagggtcagcaattagagacttgatgatgggggcatccaaggcaacttattaccaagcttgggaaaaaaagatg 34585211  T
Q  101 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctg 200  Q
    ||| |  | |||||| | ||| |   ||||||||||||| | ||||     ||||| |||||||||||||||||||  ||   ||  |||||||||| ||    
T  34585212 caacagttgaaggcaatcgatgtaccagcatgggagtggcttatgcttgtgcctaccaagctttggtgtaagcatgccttctctttctattctaagtgtg 34585311  T
Q  201 atgttttgatgaacaacttgtcagaagcttttaattccacaatactgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatct 300  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||| |    
T  34585312 atgttttaatgaacaacttctctgaagcttttaactcaacaatattgtgtgcaagagataagcctccaattaccatgtgtgagtttattaggacatattt 34585411  T
Q  301 gatgaatagaatttcaacaattaggtataaacttagttcatggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagactaaatgttgaaattgaatttagt 400  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||  ||||    
T  34585412 gatgaataggattgcaactattaggtataaactaacttcatggcaacaaaaggtaatgccaatgcctaagaaaagattagatgttgagattgaaaatagt 34585511  T
Q  401 ggaaactggagggtcatttggagaataggtgatgaatatgaagtgcataaattatatgggggatatcagtacatagttgatattgggaaaatgacttgta 500  Q
     |||  ||||     |||||||| || | |||||| | ||||||   |||  | ||||  || | | ||||||||||||||||||| || |  |  ||||    
T  34585512 agaagttggattcctatttggaggatggatgatgagtttgaagttagtaagctttatgaaggttttaagtacatagttgatattggaaagagaatatgta 34585611  T
Q  501 cttgtaacttctggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgttgcaatgggtaaaaggtctcagagacctgaggattatgttgatgactgtta 600  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34585612 cttgtaacttttggcaattagtgggtattccctgtaggcatgcaattgctgcaatgggtaaaaggtctcaaaaacccgaggattatgtggatgactgtta 34585711  T
Q  601 ttctagagcaacctatgaaaaatgttatagttatggtgtaagtgcacttaatggtgaagatatgtggccaaatgtggatgtgaaagagatgttgccacct 700  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||     
T  34585712 ttcaagagcaacttatgaaaaatgttatagctatagtgtaagtgccattaatggagaagacatgtggccagttgttgatgtggaagaaatgttgccacca 34585811  T
Q  701 gcttataa 708  Q
     |||||||    
T  34585812 acttataa 34585819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Original strand, 44479077 - 44479148
Alignment:
Q  485 gggaaaatgacttgtacttgtaacttctggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgttgcaatg 556  Q
    |||||||  ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  44479077 gggaaaagaacttgtagttgtaatttttgggagctagtaggtataccttgcagacatgctattgttgcaatg 44479148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 708
Target Start/End: Original strand, 30964998 - 30965705
Alignment:
Q  1 tgcaaactttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  30964998 tgcaaattttaagaaaaaatttggaggagggtcagcaattagagacttgatgatgggggcatccaaggcaacttattaccaagcttgggaaaaaaagatg 30965097  T
Q  101 caagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctg 200  Q
    ||| |  | |||||| | ||| |   ||||||||||||| | ||||     ||||| |||||||||||||||||||  ||   ||  |||||||||| ||    
T  30965098 caacagttgaaggcaatagatgtaccagcatgggagtggcttatgcttgtgcctaccaagctttggtgtaagcatgccttctctttctattctaagtgtg 30965197  T
Q  201 atgttttgatgaacaacttgtcagaagcttttaattccacaatactgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatct 300  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||| |    
T  30965198 atgttttaatgaacaacatctctgaagcttttaactcaacaatattgtgtgcaagagataagcctccaattaccatgtgtgagtttattaggacatattt 30965297  T
Q  301 gatgaatagaatttcaacaattaggtataaacttagttcatggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagactaaatgttgaaattgaatttagt 400  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||  ||||    
T  30965298 gatgaataggattgcaactattaggtataaactaacttcatggcaacaaaaggtaatgccaatgcctaagaaaagattagatgttgagattgaaaatagt 30965397  T
Q  401 ggaaactggagggtcatttggagaataggtgatgaatatgaagtgcataaattatatgggggatatcagtacatagttgatattgggaaaatgacttgta 500  Q
     |||  ||||     |||||||| || | |||||| | ||||||   |||  | ||||  || | | ||||||||||||||||||| || |  |  ||||    
T  30965398 agaagttggattcctatttggaggatggatgatgagtttgaagttagtaagctttatgaaggttttaagtacatagttgatattggaaagagaaaatgta 30965497  T
Q  501 cttgtaacttctggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgttgcaatgggtaaaaggtctcagagacctgaggattatgttgatgactgtta 600  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30965498 cttgtaacttttggcaattagtgggtattccctgtaggcatgcaattgctgcaatgggtaaaaggtctcaaaaacccgaggattatgtggatgactgtta 30965597  T
Q  601 ttctagagcaacctatgaaaaatgttatagttatggtgtaagtgcacttaatggtgaagatatgtggccaaatgtggatgtgaaagagatgttgccacct 700  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||     
T  30965598 ttcaagagcaacttatgaaaaatgttatagctatagtgtaagtgccattaatggagaagacatgtggccagttgttgatgtggaagaaatgttgccacca 30965697  T
Q  701 gcttataa 708  Q
     |||||||    
T  30965698 acttataa 30965705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 26268811 - 26268884
Alignment:
Q  8 tttaagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattacca 81  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  26268811 tttaagaagaagtttggaggaggaacattgattagagacttgatgatgggtgctgccaaggctacatattacca 26268884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 37875895 - 37876262
Alignment:
Q  11 aagaaaaagtttggaggaggtactgctattagagacttaatgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatgcaagaactaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||    | || |    
T  37875895 aagaaaaagtttggtggagggactgcaattagggatttgatgatgggggcagctaaagcaacctattatcaggcatgggaagagaagatgatgcagctta 37875994  T
Q  111 aggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagcatcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctgatgttttgat 210  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||| | |||||||||||||  ||||  || || ||||| | ||||||||| ||    
T  37875995 aggcattagatccaggagcatgggagtggcttatgaagcatgatactaagttgtggtgtaagcatgcatttacctactactctaaatgtgatgttttaat 37876094  T
Q  211 gaacaacttgtcagaagcttttaattccacaatactgtgtgcaagagataagccacccattaccatgtgtgagtggattagaacatatctgatgaataga 310  Q
    ||| ||  | |||||  |||||||||||||||| ||   ||| ||||| || |||  |||  | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  37876095 gaataatatctcagagtcttttaattccacaatcctacttgctagagacaaaccaatcatatctatgtgtgaatggattagaacttatttgatgaatata 37876194  T
Q  311 atttcaacaattaggtataaacttagttcatggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagact 378  Q
    |||||||| ||||| | |||  || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876195 atttcaactattagatctaaggttggtgcttggcaacataggataatgccaatgcctaggaaaagact 37876262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 244
Target Start/End: Original strand, 20653958 - 20654152
Alignment:
Q  50 atgatgggggcagccaaagcaacatattaccaggcctgggaacaaaagatgcaagaactaaaggcacttgatttgggagcatgggagtggttgatgcagc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| | |  | |||||  |||||   ||||||||||| ||| | ||| | |    
T  20653958 atgatgggggcagccaaagcaacatactttcaggcatgggaacagaagatgctacagttgaaggctattgatgaaggagcatgggattggcttatgaaac 20654057  T
Q  150 atcctactaagctttggtgtaagcatgtttttaattattattctaagtctgatgttttgatgaacaacttgtcagaagcttttaattccacaata 244  Q
    ||  ||  |||||||| ||||||||||  |||| || |||| |||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||    
T  20654058 atgatagaaagctttgatgtaagcatgcctttagtttttatcctaaatgtgatgtattgatgaacaatttttctgaagcatttaattcaacaata 20654152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21975101 - 21975030
Alignment:
Q  485 gggaaaatgacttgtacttgtaacttctggcagctagtaggtattccctgtaggcatgctattgttgcaatg 556  Q
    |||||||  ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  21975101 gggaaaagaacttgtagttgtaatttttgggagctagtaggtataccttgcagacatgctattgttgcaatg 21975030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University