View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15394_high_1 (Length: 824)

Name: NF15394_high_1
Description: NF15394
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15394_high_1
NF15394_high_1
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (554-815)||(41806110-41806370)
chr8 (222-554)||(30410154-30410486)
chr8 (317-554)||(28644562-28644799)
chr8 (1-197)||(41805920-41806116)
chr8 (228-555)||(30405651-30405961)
chr8 (359-554)||(33071918-33072113)
chr8 (359-554)||(42234656-42234851)
chr8 (359-554)||(38757003-38757186)
chr8 (401-555)||(43807485-43807641)
chr8 (401-554)||(43812044-43812199)
chr8 (401-556)||(202202-202361)
chr8 (401-556)||(317039-317198)
chr8 (401-555)||(197684-197842)
chr8 (401-555)||(312521-312679)
chr8 (603-812)||(41800036-41800242)
chr8 (458-554)||(41945339-41945434)
chr8 (454-555)||(41949801-41949902)
chr8 (242-290)||(38757253-38757301)
chr8 (376-526)||(27435169-27435314)
chr8 (234-290)||(28644826-28644882)
chr8 (197-260)||(38757331-38757395)
chr8 (47-144)||(41799727-41799824)
chr8 (214-254)||(28644850-28644890)
chr8 (197-265)||(30410105-30410174)
chr8 (229-261)||(30405629-30405661)
chr8 (197-265)||(30405585-30405654)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (317-554)||(30695293-30695530)
chr5 (359-554)||(32485947-32486143)
chr5 (359-555)||(26336767-26336965)
chr5 (317-555)||(40367531-40367758)
chr5 (359-554)||(19502307-19502504)
chr5 (197-554)||(40371549-40371892)
chr5 (359-554)||(36632314-36632497)
chr5 (369-534)||(43384972-43385138)
chr5 (401-555)||(7099374-7099532)
chr5 (401-555)||(12023288-12023446)
chr5 (401-554)||(7103943-7104100)
chr5 (401-554)||(12018731-12018888)
chr5 (401-555)||(16798668-16798826)
chr5 (401-554)||(16794108-16794265)
chr5 (373-506)||(20830304-20830437)
chr5 (401-554)||(10274546-10274698)
chr5 (445-560)||(10277198-10277313)
chr5 (401-555)||(37682035-37682182)
chr5 (197-290)||(30695558-30695651)
chr5 (401-554)||(37658732-37658878)
chr5 (554-701)||(278541-278689)
chr5 (432-506)||(20808675-20808749)
chr5 (241-290)||(12018997-12019047)
chr5 (241-289)||(7099217-7099266)
chr5 (241-289)||(7103786-7103835)
chr5 (241-289)||(16798935-16798984)
chr5 (243-289)||(16794374-16794421)
chr5 (98-168)||(278834-278904)
chr5 (241-290)||(12023566-12023616)
chr5 (197-289)||(37658985-37659082)
chr5 (241-289)||(37682289-37682340)
chr5 (197-239)||(40367386-40367427)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (196-555)||(21850198-21850574)
chr3 (197-555)||(21847108-21847483)
chr3 (359-554)||(9105275-9105470)
chr3 (359-554)||(11004365-11004560)
chr3 (359-555)||(43547722-43547920)
chr3 (359-554)||(9697586-9697783)
chr3 (401-555)||(54171924-54172082)
chr3 (401-555)||(54167344-54167502)
chr3 (401-554)||(39399127-39399279)
chr3 (358-478)||(43554645-43554765)
chr3 (554-691)||(24685192-24685329)
chr3 (605-800)||(24631841-24632035)
chr3 (373-493)||(755891-756012)
chr3 (401-506)||(38175790-38175894)
chr3 (477-555)||(43554291-43554371)
chr3 (622-697)||(24682519-24682594)
chr3 (588-750)||(24653501-24653664)
chr3 (711-800)||(24685331-24685420)
chr3 (241-290)||(54167186-54167236)
chr3 (241-290)||(54171766-54171816)
chr3 (451-484)||(755824-755857)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (314-555)||(27761396-27761638)
chr7 (314-554)||(27756846-27757087)
chr7 (317-548)||(47419498-47419729)
chr7 (314-554)||(22901154-22901396)
chr7 (373-555)||(35705633-35705815)
chr7 (359-554)||(7466485-7466669)
chr7 (365-541)||(733634-733811)
chr7 (401-555)||(7940083-7940241)
chr7 (401-554)||(7944636-7944793)
chr7 (382-542)||(13828087-13828248)
chr7 (197-262)||(27757188-27757252)
chr7 (197-290)||(47419376-47419470)
chr7 (241-290)||(7939926-7939976)
chr7 (241-290)||(7944479-7944529)
chr7 (241-290)||(22901420-22901470)
chr7 (241-290)||(27757111-27757161)
chr7 (241-290)||(27761662-27761712)
chr7 (197-265)||(22901505-22901573)
chr7 (197-265)||(27761699-27761767)
chr7 (445-542)||(37355573-37355670)
chr7 (222-262)||(22901497-22901537)
chr7 (196-262)||(7939807-7939875)
chr7 (197-262)||(7944385-7944452)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (314-555)||(27552026-27552268)
chr6 (314-554)||(8319960-8320199)
chr6 (314-555)||(8315421-8315662)
chr6 (314-554)||(17779914-17780155)
chr6 (359-554)||(17096236-17096431)
chr6 (317-556)||(27574657-27574886)
chr6 (365-554)||(17895691-17895881)
chr6 (359-554)||(14531749-14531945)
chr6 (365-555)||(17886816-17887001)
chr6 (222-290)||(8319866-8319935)
chr6 (242-290)||(8315348-8315396)
chr6 (401-516)||(6440865-6440979)
chr6 (229-290)||(27574569-27574630)
chr6 (230-290)||(17886692-17886753)
chr6 (197-290)||(17096075-17096167)
chr6 (452-493)||(17163689-17163730)
chr6 (196-251)||(8315266-8315319)
chr6 (251-290)||(17895589-17895628)
chr6 (197-266)||(27535334-27535404)
chr6 (451-489)||(7888212-7888250)
chr6 (197-251)||(8319806-8319858)
chr6 (452-541)||(17159610-17159700)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (314-554)||(39793831-39794070)
chr1 (314-554)||(16588395-16588635)
chr1 (197-554)||(26311522-26311868)
chr1 (314-555)||(26316012-26316240)
chr1 (359-555)||(43591783-43591979)
chr1 (401-555)||(10504435-10504588)
chr1 (197-290)||(26316253-26316348)
chr1 (195-290)||(16588275-16588370)
chr1 (242-290)||(39794097-39794145)
chr1 (197-251)||(39794198-39794250)
chr1 (197-251)||(39796802-39796854)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (234-555)||(31670089-31670411)
chr4 (359-555)||(53722006-53722202)
chr4 (359-554)||(10317025-10317220)
chr4 (359-555)||(8892582-8892779)
chr4 (359-554)||(27186142-27186341)
chr4 (359-561)||(43683636-43683826)
chr4 (401-555)||(44151557-44151715)
chr4 (401-554)||(3770842-3770999)
chr4 (401-554)||(44147023-44147180)
chr4 (359-555)||(50627904-50628088)
chr4 (401-554)||(41884925-41885076)
chr4 (359-458)||(35842843-35842942)
chr4 (401-555)||(31359150-31359303)
chr4 (401-556)||(49274517-49274670)
chr4 (401-554)||(31354678-31354829)
chr4 (360-520)||(53785880-53786039)
chr4 (222-290)||(44151819-44151889)
chr4 (197-265)||(44147345-44147414)
chr4 (197-265)||(44151856-44151925)
chr4 (241-290)||(3771106-3771156)
chr4 (241-290)||(44147284-44147334)
chr4 (451-503)||(45976222-45976274)
chr4 (195-261)||(53722313-53722380)
chr4 (477-527)||(35842797-35842847)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (314-555)||(8055391-8055632)
chr2 (314-554)||(8050839-8051079)
chr2 (314-554)||(6463355-6463583)
chr2 (359-554)||(12999426-12999622)
chr2 (401-555)||(36670502-36670660)
chr2 (401-555)||(36675050-36675208)
chr2 (392-554)||(13270980-13271131)
chr2 (401-555)||(35950443-35950596)
chr2 (401-554)||(41093824-41093976)
chr2 (214-290)||(12999289-12999366)
chr2 (196-262)||(8055698-8055763)
chr2 (222-290)||(8055656-8055726)
chr2 (241-290)||(8051103-8051153)
chr2 (229-290)||(6463272-6463332)
chr2 (454-541)||(29767953-29768041)
chr2 (401-489)||(34590280-34590366)
chr2 (241-290)||(36670768-36670820)
chr2 (241-290)||(36675316-36675368)
chr2 (197-262)||(8051180-8051247)
chr2 (463-500)||(27403696-27403733)
[»] scaffold0440 (4 HSPs)
scaffold0440 (401-555)||(2979-3137)
scaffold0440 (401-555)||(7505-7662)
scaffold0440 (229-290)||(7772-7833)
scaffold0440 (197-262)||(7836-7902)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (401-555)||(44865-45023)
scaffold0044 (401-554)||(49445-49602)
scaffold0044 (241-290)||(44708-44758)
scaffold0044 (241-290)||(49288-49338)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 554 - 815
Target Start/End: Original strand, 41806110 - 41806370
Alignment:
Q  554 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806110 attctcttcagtgcttatagaagcccgtcttacattctttctacagttaacattc-tcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 41806208  T
Q  654 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806209 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagaaaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 41806308  T
Q  754 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgct 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806309 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgct 41806370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 222 - 554
Target Start/End: Original strand, 30410154 - 30410486
Alignment:
Q  222 gaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttat 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       |||||||    
T  30410154 gaagctagttcagaagc-agttcagaagctagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttat 30410252  T
Q  321 gatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaa 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30410253 gatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaa 30410352  T
Q  421 tgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattat 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30410353 tgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattat 30410452  T
Q  521 cactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30410453 cactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28644799 - 28644562
Alignment:
Q  317 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28644799 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatgcaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaa 28644700  T
Q  417 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28644699 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 28644600  T
Q  517 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28644599 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 41805920 - 41806116
Alignment:
Q  1 aaattttccagttcttacccgtctttgatgctttttattttacattttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41805920 aaattttccagttcttacccgtctttgatgctttttattttacattttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaa 41806019  T
Q  101 gtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctactgatgctgagaaccaggatgtgtattctct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41806020 gtcttcttattccataaaggacttgctcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctactgatgctgagaaccaggacgtgtattctct 41806116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 555
Target Start/End: Original strand, 30405651 - 30405961
Alignment:
Q  228 agttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       ||||||||||||||    
T  30405651 agttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaa 30405750  T
Q  328 ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 427  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30405751 ttgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaaca 30405850  T
Q  428 aactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa 527  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||||||||||||||||    
T  30405851 aattctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca-----------------gaatgtgattatcactaaa 30405933  T
Q  528 ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405934 ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 30405961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 33072113 - 33071918
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33072113 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaaca 33072014  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072013 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 42234656 - 42234851
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42234656 aaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 42234755  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234756 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 38757186 - 38757003
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38757186 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 38757087  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757086 aacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807641
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  499 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43807641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  499 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 556
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202361
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 556  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 202361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 556
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317198
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 556  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 317198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 197684 - 197842
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 197842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312679
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 312679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 603 - 812
Target Start/End: Original strand, 41800036 - 41800242
Alignment:
Q  603 acattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatc 702  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  41800036 acattccccttgttcttcgggacctataaaatcaaataaccaggagaatctaacaaaatcaaacacaaaccataaactgtgcaggaaaaggaaatgcaca 41800135  T
Q  703 taactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatc-tttttcctgac 801  Q
    | ||||||||||   |||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  || ||||||||| ||||||||||     
T  41800136 tcactttggagaataaaaaacagaagtaag----atatttagaagattcacggcttgtgtttttctacctcgtttgagctcctacatcttttttcctgaa 41800231  T
Q  802 ttttctgtgct 812  Q
    |||||||||||    
T  41800232 ttttctgtgct 41800242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 458 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41945434 - 41945339
Alignment:
Q  458 aaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41945434 aaacttgtaaccaacttg-taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 454 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949801
Alignment:
Q  454 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaac 553  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaagcttgaattaaaagaaactaac 41949803  T
Q  554 at 555  Q
    ||    
T  41949802 at 41949801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38757301 - 38757253
Alignment:
Q  242 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38757301 ttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 38757253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 526
Target Start/End: Original strand, 27435169 - 27435314
Alignment:
Q  376 tagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaa-actt 474  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||| |||||      | |||||||||||||| |  |    
T  27435169 tagcttatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactc-tatgtgcta------atcaaacttgtaacaataact 27435261  T
Q  475 cataacaaactaaaacaa-aatgtaattaaccattgattgtgattatcactaa 526  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | || ||||||||||||    
T  27435262 cataacaaactaaaacaataatgtgattaaccactaagtgagattatcactaa 27435314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28644882 - 28644826
Alignment:
Q  234 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28644882 gaagctagttcagaagcgagttcagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 28644826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38757395 - 38757331
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagcagttcagaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  38757395 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagcactcttcagaagcagttcagaag 38757331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 41799727 - 41799824
Alignment:
Q  47 ttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctg 144  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||  ||||| |||||| |||||    
T  41799727 ttatcatagattattagaaactagcttgcaacgatagttaacttgattagttaagtgttcttattccgcataggacttactcttgcatagagactctg 41799824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28644890 - 28644850
Alignment:
Q  214 cagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagtt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28644890 cagaagcggaagctagttcagaagcgagttcagaagcagtt 28644850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Original strand, 30410105 - 30410174
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagc-agttcagaagcagtt 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  30410105 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctagttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagtt 30410174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 261
Target Start/End: Original strand, 30405629 - 30405661
Alignment:
Q  229 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405629 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagc 30405661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Original strand, 30405585 - 30405654
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagc-agttcagaagcagtt 265  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  30405585 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagctagttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagtt 30405654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 317 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30695530 - 30695293
Alignment:
Q  317 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695530 ttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 30695431  T
Q  417 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30695430 gcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 30695331  T
Q  517 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695330 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 32485947 - 32486143
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32485947 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 32486046  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32486047 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Original strand, 26336767 - 26336965
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26336767 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 26336866  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26336867 aacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaacat 26336965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 555
Target Start/End: Original strand, 40367531 - 40367758
Alignment:
Q  317 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtt-gcttgaagcaca 415  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  40367531 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcaca 40367630  T
Q  416 agcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  40367631 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtg 40367718  T
Q  516 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367719 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 40367758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19502504 - 19502307
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19502504 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaaca 19502405  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgt-aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502404 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 554
Target Start/End: Original strand, 40371549 - 40371892
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagcagttc-agaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnn 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  40371549 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagctctgtttagaagcagttttagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaattagag 40371646  T
Q  295 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 394  Q
                       || |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371647 agagaattgagagagaagaaaattatgatgaaattgtagttgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 40371746  T
Q  395 agctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaa 494  Q
    | |              ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40371747 aac--------------cacaaacaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaa 40371832  T
Q  495 tgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371833 tgtgattaatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 36632497 - 36632314
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36632497 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 36632398  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||            |||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632397 aacttgtaaca------------aactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 369 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43385138 - 43384972
Alignment:
Q  369 aaggaggtagctt-atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaa 467  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43385138 aaggaggtagctttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaa 43385039  T
Q  468 caaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaact 534  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  43385038 caaacttcataacaaactaaaagcaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaact 43384972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099532
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7099532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023288
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 12023288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798668
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 16798668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 506
Target Start/End: Original strand, 20830304 - 20830437
Alignment:
Q  373 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 472  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20830304 aggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaac 20830403  T
Q  473 ttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 506  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20830404 ttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20830437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10274698 - 10274546
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10274698 gttgcttgaagtacaagctaaataacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10274600  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10274599 taaccattaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 445 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 10277313 - 10277198
Alignment:
Q  445 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaa 544  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277313 gctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaa 10277214  T
Q  545 caaactaacattctct 560  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10277213 caaactaacatcctct 10277198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37682035
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| | ||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 37682035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30695651 - 30695558
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcag-ttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30695651 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagtttcagaagtagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 30695558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||| | ||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 278689 - 278541
Alignment:
Q  554 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || |   |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  278689 attctcttcagtgcttatagaagcacacctaatcatcttcctacatttaacattcctcttgttctttgggacctataatatcaaatgacaaggagaattt 278590  T
Q  654 cacaaaatc-aaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcat 701  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  278589 cagaaaatcaaaatccaaaccataaaccgtggtggaaaaggaaatgcat 278541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 506
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808749
Alignment:
Q  432 ctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 506  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20808749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12019047 - 12018997
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12019047 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 12018997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Original strand, 7099217 - 7099266
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7099217 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 7099266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Original strand, 7103786 - 7103835
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7103786 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 7103835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16798984 - 16798935
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16798984 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 16798935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16794421 - 16794374
Alignment:
Q  243 tcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16794421 tcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 16794374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 278904 - 278834
Alignment:
Q  98 taagtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctact 168  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  278904 taagtgttgttattccacaaaagacttactcttgcatagaggctctgtggatcagtagcaggacctctact 278834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12023616 - 12023566
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12023616 gttcaaaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 12023566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37659082 - 37658985
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 289  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37659082 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 37658985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37682340 - 37682289
Alignment:
Q  241 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 289  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37682340 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 37682289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 239
Target Start/End: Original strand, 40367386 - 40367427
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40367386 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagct 40367427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 196 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21850574 - 21850198
Alignment:
Q  196 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta--------------gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850574 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttt 21850475  T
Q  282 -atgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagct 380  Q
     |||||||||                       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21850474 tatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagct 21850375  T
Q  381 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850374 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 21850275  T
Q  481 aaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21850274 aaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 197 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21847483 - 21847108
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct--------------agttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-ttt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21847483 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttt 21847384  T
Q  282 atgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagctt 381  Q
    |||||||||                       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847383 atgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagctt 21847284  T
Q  382 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847283 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 21847184  T
Q  482 aactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 555  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21847183 aactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21847108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9105470 - 9105275
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9105470 aaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 9105371  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105370 aacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 11004365 - 11004560
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11004365 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 11004464  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004465 aacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 43547920 - 43547722
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43547920 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43547821  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43547820 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9697783 - 9697586
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9697783 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 9697684  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697683 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167502
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc--ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54167502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 39399225  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399226 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43554765 - 43554645
Alignment:
Q  358 aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaac 457  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43554765 aaaaatatacaaaagaggtagctcatatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaac 43554666  T
Q  458 aaacttgtaacaaacttcata 478  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43554665 aaacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 691
Target Start/End: Original strand, 24685192 - 24685329
Alignment:
Q  554 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 653  Q
    ||||||||| |||| |||| || | ||||| | ||||||  | || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24685192 attctcttctgtgcttataaaaccacatctcatattcttcatgcatttaacattcctcttgttcttggggacctataaaatcaaataaccagaagaatct 24685291  T
Q  654 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaa 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24685292 cacaaaatcaaacacaaaccataaactgtgcaggaaaa 24685329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 605 - 800
Target Start/End: Original strand, 24631841 - 24632035
Alignment:
Q  605 attcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatcta 704  Q
    |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||  |||||| ||||| ||| |     
T  24631841 attcctcttgttctttgggactaataaaatcaaataaccgggataatctcacaaaatcgaaaacagaccataaattgtgttggaaaaagaaatccatatc 24631940  T
Q  705 actttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctga 800  Q
    |||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24631941 acttggaagaga-agaaacattagtaagtgaaatatttagaagatttgtggcttgtatctgtctacctcattcaagctcctggatctttttcctga 24632035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 756012 - 755891
Alignment:
Q  373 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaga-tcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaa 471  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||  | ||  |||||||||||||||||||||    
T  756012 aggtagcttatatacaccatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttattagttacactctaacaaacttgtaacaaa 755913  T
Q  472 cttcataacaaactaaaacaaa 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  755912 cttcaaaacaaactaaaacaaa 755891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 401 - 506
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175894
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgat 38175888  T
Q  501 taacca 506  Q
    ||||||    
T  38175889 taacca 38175894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43554291
Alignment:
Q  477 taacaaactaaaa-caaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43554291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 622 - 697
Target Start/End: Original strand, 24682519 - 24682594
Alignment:
Q  622 ggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaat 697  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24682519 ggacctataaaatcaaagaaccaggagaatctcataaaatcaaacgcaaacaataaactgtgcaggaaaagtaaat 24682594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 750
Target Start/End: Original strand, 24653501 - 24653664
Alignment:
Q  588 ttctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct--cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgca 685  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  24653501 ttcttcctacatttaacattcctctctttctttcggacctataaaatcaaagaaccaggagaatctcgcataaaatcaaacacacacaataaactgtgca 24653600  T
Q  686 gg--aaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatt 750  Q
    ||  ||||| |||||||| | | | |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24653601 ggaaaaaagtaaatgcatatca-tatggaaaaag--aaacagtagtaagtgaaatatttagaagatt 24653664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 711 - 800
Target Start/End: Original strand, 24685331 - 24685420
Alignment:
Q  711 gagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctga 800  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| || || |||||  ||||||||||||    
T  24685331 gagagagaaaaacagtggtaagtgcaacatttagaagattcgcggcttttgtttgtctacctcagtcgagctcctaggtctttttcctga 24685420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Original strand, 54167186 - 54167236
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54167186 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggatttatgcgaatt 54167236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Original strand, 54171766 - 54171816
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54171766 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggatttatgcgaatt 54171816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 755857 - 755824
Alignment:
Q  451 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaac 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  755857 ctctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaac 755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 314 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27761638 - 27761396
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 412  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761638 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27761539  T
Q  413 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27761538 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtgattaaccactgatt 27761439  T
Q  513 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761438 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27761396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27757087 - 27756846
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 412  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757087 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27756988  T
Q  413 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  27756987 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgcgattaaccactgatt 27756888  T
Q  513 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27756887 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 317 - 548
Target Start/End: Original strand, 47419498 - 47419729
Alignment:
Q  317 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47419498 ttatgatgaaattgtaattgatttttattgattctacatacgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaa 47419597  T
Q  417 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 516  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47419598 acaatgtaacaaactctagatattatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 47419697  T
Q  517 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419698 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22901396 - 22901154
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaat-tgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 412  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901396 aagttatgatgaatttgtaaaatgatctttattgattctacatacaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagc 22901298  T
Q  413 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  22901297 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgat 22901198  T
Q  512 tgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901197 tgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 373 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 35705815 - 35705633
Alignment:
Q  373 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 472  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705815 aggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 35705717  T
Q  473 ttcat-aacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705716 tccataaacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 7466485 - 7466669
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7466485 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 7466584  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7466585 aacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 541
Target Start/End: Original strand, 733634 - 733811
Alignment:
Q  365 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttg 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  733634 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaattg 733733  T
Q  465 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||| |||||||| || |   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  733734 taacaaatttcataacaaactaactgaatatgtgattaaccatttaaacatgattatcactaatctaaacttgaatta 733811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940241
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7940241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 542
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828248
Alignment:
Q  382 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 481  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  482 aactaaaacaaaatgtaattaacc-attgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 542  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||| | | |   |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13828187 aacaaaatgaaaatgtgattaaccaactaaacatgattatcactaaggtaaacttgaattaa 13828248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27757252 - 27757188
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 262  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757252 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 27757188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 47419376 - 47419470
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagca-gttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419376 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctctgttcgaaagctcgttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 47419470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Original strand, 7939926 - 7939976
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7939926 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7939976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Original strand, 7944479 - 7944529
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7944479 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7944529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22901470 - 22901420
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22901470 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 22901420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27757161 - 27757111
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27757161 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 27757111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27761712 - 27761662
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27761712 gttcagaagcagttcagaagcagtttctaattctaaggttttatgtgaatt 27761662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22901573 - 22901505
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtt 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22901573 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagtttagaagctagttaagaagcagtt 22901505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27761767 - 27761699
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27761767 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagcactgttcagaagcagtt 27761699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 37355670 - 37355573
Alignment:
Q  445 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-aatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 542  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  37355670 gctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaaccactaagtgtgattatcact-aggtaaacttgaattaa 37355573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22901537 - 22901497
Alignment:
Q  222 gaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901537 gaagctagtttagaagctagttaagaagcagttcagaagca 22901497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 262
Target Start/End: Original strand, 7939807 - 7939875
Alignment:
Q  196 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 262  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7939807 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 7939875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Original strand, 7944385 - 7944452
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 262  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7944385 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 7944452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 314 - 555
Target Start/End: Original strand, 27552026 - 27552268
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552026 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacgaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27552125  T
Q  413 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27552126 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgatt 27552225  T
Q  513 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552226 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27552268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Original strand, 8319960 - 8320199
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8319960 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacata-agaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtttcttgaagca 8320058  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  8320059 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacatattgtgattaaccactgattg 8320158  T
Q  514 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8320159 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 314 - 555
Target Start/End: Original strand, 8315421 - 8315662
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315421 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 8315519  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgatt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  8315520 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgatt 8315619  T
Q  513 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315620 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8315662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17780155 - 17779914
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780155 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggagatagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 17780056  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 513  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  17780055 caagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattg 17779956  T
Q  514 tgattatcactaaactaaacttgaatt-aaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17779955 tgattatcactaaactaaacttgaattcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 17096236 - 17096431
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17096236 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaaca 17096335  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096336 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 556
Target Start/End: Original strand, 27574657 - 27574886
Alignment:
Q  317 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 415  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574657 ttatggtgaaattgtaattgattcttattgattttccatacgaaaaatgttcaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 27574756  T
Q  416 agcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 515  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27574757 agcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctc-----------taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtg 27574845  T
Q  516 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574846 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 27574886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 365 - 554
Target Start/End: Original strand, 17895691 - 17895881
Alignment:
Q  365 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttg 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17895691 tacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg 17895790  T
Q  465 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17895791 taacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 14531749 - 14531945
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14531749 aaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 14531848  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14531849 aacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 365 - 555
Target Start/End: Original strand, 17886816 - 17887001
Alignment:
Q  365 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttg 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17886816 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaactt- 17886914  T
Q  465 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886915 -----tactttataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 17887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Original strand, 8319866 - 8319935
Alignment:
Q  222 gaagctagttcagaagctag-ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8319866 gaagctagttcagaagcactcttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 8319935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 290
Target Start/End: Original strand, 8315348 - 8315396
Alignment:
Q  242 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8315348 ttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 8315396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 516
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 6440963  T
Q  501 taaccattgattgtga 516  Q
    |||||| | |||||||    
T  6440964 taaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 290
Target Start/End: Original strand, 27574569 - 27574630
Alignment:
Q  229 gttcagaagctagttcagaagcag-ttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27574569 gttcagaagctagttcagaagcagtttgagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 27574630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Original strand, 17886692 - 17886753
Alignment:
Q  230 ttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17886692 ttcagaagcaagttcagaagctagttcagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 17096075 - 17096167
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctag-ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17096075 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagcttgttcataagcactcttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 17096167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163689
Alignment:
Q  452 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa 493  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaa 17163689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 251
Target Start/End: Original strand, 8315266 - 8315319
Alignment:
Q  196 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 251  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8315266 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 8315319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 290
Target Start/End: Original strand, 17895589 - 17895628
Alignment:
Q  251 agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17895589 agttcagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17895628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Original strand, 27535334 - 27535404
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct-agttcagaagc-agttcagaagcagttt 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  27535334 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagctagttcataagtagttt 27535404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 489
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888250
Alignment:
Q  451 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 489  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaa 7888250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Original strand, 8319806 - 8319858
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8319806 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 8319858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159610
Alignment:
Q  452 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa-ccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 541  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || || | | | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaagtatgatcaatcaactaatcatgattatcactaatctaaacttgaatta 17159610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39794070 - 39793831
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39794070 aagttatgatgaaaatgtaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 39793972  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  39793971 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgagattaaccactgattg 39793872  T
Q  514 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793871 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Original strand, 16588395 - 16588635
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  16588395 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttaaaaca 16588494  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16588495 caagcaatgtaacaaactctagatcttatatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattg 16588594  T
Q  514 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588595 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 197 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26311868 - 26311522
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnn 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||        
T  26311868 tgattgcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagattttgattctaaggtttatgtgaattagag 26311769  T
Q  295 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 394  Q
                       |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26311768 agagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatct 26311670  T
Q  395 agctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaa 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||    
T  26311669 agctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaa 26311582  T
Q  495 tgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311581 tgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 314 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26316240 - 26316012
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26316240 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26316142  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26316141 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattg 26316054  T
Q  514 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316053 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 26316012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Original strand, 43591783 - 43591979
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43591783 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaaca 43591882  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591883 atattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43591979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504435
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10504490  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504489 taatcactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26316348 - 26316253
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26316348 tgatagcgcagaaaaaccagaaacggaagcttgtttagaagcactgttcagaagttagttcagaagcagtttttaattctaaggtttatgtgaatt 26316253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Original strand, 16588275 - 16588370
Alignment:
Q  195 tctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaag--cagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16588275 tctgatagcacagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcataagcttgttcagaagctctgtacagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 16588370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39794145 - 39794097
Alignment:
Q  242 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39794145 ttcagaagcagttcagaagtagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 39794097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39794250 - 39794198
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39794250 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 39794198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39796854 - 39796802
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39796854 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 39796802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 234 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 31670411 - 31670089
Alignment:
Q  234 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgta 332  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       |||||||||||||||||||    
T  31670411 gaagctagttcagaagttagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgta 31670312  T
Q  333 attgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactc 432  Q
    | ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31670311 aatgatctttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcagaagcaatgtaacaaactc 31670213  T
Q  433 tagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaa 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31670212 tagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaa 31670113  T
Q  532 acttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31670112 acttgaattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 53722202 - 53722006
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53722202 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaaca 53722103  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722102 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 10317025 - 10317220
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10317025 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 10317124  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317125 aacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Original strand, 8892582 - 8892779
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8892582 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaaca 8892681  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892682 aatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8892779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27186341 - 27186142
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27186341 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 27186242  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataac-aaact--aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186241 aacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 359 - 561
Target Start/End: Original strand, 43683636 - 43683826
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||         
T  43683636 aaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatttgctaacctc----- 43683730  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacattct 558  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43683731 ------taacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaataaacttgaattaaaac-aactaacattgt 43683823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151557
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 44151557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Original strand, 50627904 - 50628088
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50627904 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 50628003  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||||            ||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50628004 aacttg------------taacaaactaaaaaaaaaagtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaaaacaaactaacat 50628088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 41884979  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41884978 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 35842942 - 35842843
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35842942 aaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31359150
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||| ||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgat 31359205  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359204 taaccactaattgtgattatcattaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31359150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 556
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274670
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 49274614  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 556  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274615 taaccactaattatgatcatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 49274670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31354829 - 31354678
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||| || || | |||||| ||    
T  31354829 gttgcttgacgtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatccctaagtaacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaatgtgat 31354732  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31354731 taaccactaattgtaattatcactaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 53786039 - 53785880
Alignment:
Q  360 aaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaa 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||  ||||   ||||||||    
T  53786039 aaatgtacaaag-aggtagcttatatactagaactagttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaacccta-actatataagctagtttctaacaa 53785942  T
Q  460 acttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca--aaatgtaattaaccattgattgtgattat 520  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  53785941 acttgtaacaaa-ttcttaacaaacaaaaacactaaatgtgattaaccactgagtgtgattat 53785880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44151889 - 44151819
Alignment:
Q  222 gaagctagttcagaagcta-gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44151889 gaagctagttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44151819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44147414 - 44147345
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44147414 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcactgttcagaagcagtt 44147345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44151925 - 44151856
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 265  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44151925 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcactgttcagaagcagtt 44151856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3771156 - 3771106
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3771156 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 3771106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44147334 - 44147284
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44147334 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44147284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976274
Alignment:
Q  451 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaagatgtgattaa 45976274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 53722380 - 53722313
Alignment:
Q  195 tctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagc 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||    
T  53722380 tctgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagcaggttctgaagcactgttcagaagc 53722313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 477 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  477 taacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa 527  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 314 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 8055632 - 8055391
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 412  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055632 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 8055534  T
Q  413 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8055533 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8055434  T
Q  513 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055433 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8055391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8051079 - 8050839
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 412  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051079 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggcagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagc 8050981  T
Q  413 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8050980 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8050881  T
Q  513 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050880 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 314 - 554
Target Start/End: Original strand, 6463355 - 6463583
Alignment:
Q  314 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6463355 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatactaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 6463454  T
Q  414 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 513  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6463455 caaataatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattg 6463542  T
Q  514 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6463543 tgattatcactaaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 359 - 554
Target Start/End: Original strand, 12999426 - 12999622
Alignment:
Q  359 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 458  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12999426 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 12999525  T
Q  459 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999526 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36675050
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36675050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 554
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  392 tctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca 491  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  492 aaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271068 aagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 35950443 - 35950596
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||   ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  35950443 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttacgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgat 35950541  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950542 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35950596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgat 41093878  T
Q  501 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41093877 taatcactaattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 12999289 - 12999366
Alignment:
Q  214 cagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999289 cagaagcggaagctagtccagaagctaattcagaagctagttcagaagcagtttctgatcctaaggtttatgtgaatt 12999366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8055763 - 8055698
Alignment:
Q  196 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 262  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055763 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 8055698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8055726 - 8055656
Alignment:
Q  222 gaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055726 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 8055656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8051153 - 8051103
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051153 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 8051103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 290
Target Start/End: Original strand, 6463272 - 6463332
Alignment:
Q  229 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 290  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6463272 gttcagaaattagttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 6463332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 29768041 - 29767953
Alignment:
Q  454 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 541  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || || || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29768041 taaccaacttgtaacaaactttaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaattaatcatgattatcactaaactaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 489  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36670820 - 36670768
Alignment:
Q  241 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36670820 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 36670768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36675368 - 36675316
Alignment:
Q  241 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36675368 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 36675316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8051247 - 8051180
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 262  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8051247 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 8051180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 500
Target Start/End: Original strand, 27403696 - 27403733
Alignment:
Q  463 tgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27403696 tgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagtgtaat 27403733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2979
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 2979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7505
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 498  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  499 attaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7833 - 7772
Alignment:
Q  229 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7833 gttcagaagc-agttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7902 - 7836
Alignment:
Q  197 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagca 262  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  7902 tgatagcgcagaaaatt-agaagcggaagcttgttcagaagcaagttcagaagcactgttcagaagca 7836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45023
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 555  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 45023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  401 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  498 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 554  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Original strand, 44708 - 44758
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44708 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Original strand, 49288 - 49338
Alignment:
Q  241 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49288 gttcagaagcagttcataagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 49338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University