View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15394_low_20 (Length: 376)

Name: NF15394_low_20
Description: NF15394
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15394_low_20
NF15394_low_20
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (20-197)||(14721267-14721444)
chr8 (263-370)||(14399113-14399221)
chr8 (263-362)||(18864125-18864225)
chr8 (263-370)||(21829481-21829589)
chr8 (263-370)||(21974204-21974312)
chr8 (263-370)||(43250152-43250260)
chr8 (83-200)||(12220525-12220640)
chr8 (263-370)||(21978314-21978422)
chr8 (263-370)||(22110551-22110659)
chr8 (263-362)||(30941585-30941685)
chr8 (263-370)||(21409850-21409959)
chr8 (263-370)||(21804342-21804451)
chr8 (20-200)||(28186394-28186572)
chr8 (263-370)||(23427776-23427884)
chr8 (263-370)||(27942706-27942814)
chr8 (263-353)||(44385854-44385945)
chr8 (263-370)||(11774246-11774354)
chr8 (263-335)||(23913250-23913323)
chr8 (278-370)||(8729645-8729738)
chr8 (263-370)||(363218-363326)
chr8 (263-370)||(8414997-8415105)
chr8 (104-174)||(19216005-19216073)
chr8 (263-301)||(21328586-21328624)
chr8 (263-301)||(21386179-21386217)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (263-370)||(27555490-27555597)
chr6 (263-370)||(22075411-22075519)
chr6 (263-370)||(27416548-27416656)
chr6 (263-370)||(8242362-8242470)
chr6 (263-370)||(11565351-11565459)
chr6 (263-370)||(11716961-11717069)
chr6 (263-370)||(12620354-12620462)
chr6 (263-370)||(14470831-14470939)
chr6 (263-362)||(23393599-23393699)
chr6 (263-362)||(23413507-23413607)
chr6 (263-351)||(19869156-19869245)
chr6 (263-370)||(22947617-22947725)
chr6 (263-370)||(22951573-22951681)
chr6 (263-370)||(23870061-23870169)
chr6 (263-370)||(23874017-23874125)
chr6 (263-370)||(31479483-31479591)
chr6 (267-370)||(16758665-16758769)
chr6 (263-370)||(22861705-22861813)
chr6 (263-370)||(23988253-23988361)
chr6 (263-370)||(23537931-23538039)
chr6 (263-370)||(4475745-4475853)
chr6 (263-370)||(12941171-12941279)
chr6 (263-370)||(23955319-23955427)
chr6 (263-370)||(27222782-27222890)
chr6 (264-345)||(16622812-16622892)
chr6 (263-370)||(23400627-23400736)
chr6 (263-370)||(28290915-28291023)
chr6 (263-335)||(2076271-2076344)
chr6 (263-365)||(1254114-1254217)
chr6 (263-301)||(18918601-18918639)
chr6 (263-370)||(25737842-25737950)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (263-370)||(841-949)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (263-370)||(70705-70813)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (263-370)||(20163919-20164027)
chr4 (263-370)||(20158468-20158576)
chr4 (263-370)||(20161144-20161252)
chr4 (263-370)||(17052466-17052574)
chr4 (263-370)||(4562794-4562902)
chr4 (263-370)||(5758476-5758584)
chr4 (263-370)||(9555019-9555127)
chr4 (263-370)||(14759012-14759120)
chr4 (263-370)||(14955780-14955888)
chr4 (263-370)||(22634947-22635055)
chr4 (263-370)||(33740786-33740894)
chr4 (263-370)||(12486221-12486329)
chr4 (263-370)||(15223496-15223604)
chr4 (263-370)||(25688392-25688500)
chr4 (263-370)||(30145733-30145841)
chr4 (263-370)||(13813853-13813961)
chr4 (263-370)||(13818341-13818449)
chr4 (263-370)||(24048405-24048513)
chr4 (263-353)||(17807021-17807112)
chr4 (263-370)||(15533169-15533277)
chr4 (263-370)||(23996987-23997094)
chr4 (263-353)||(12422910-12423001)
chr4 (263-370)||(18211554-18211662)
chr4 (263-370)||(28384801-28384909)
chr4 (263-370)||(36036902-36037010)
chr4 (263-370)||(49549103-49549212)
chr4 (307-370)||(13818470-13818533)
chr4 (307-370)||(24048534-24048597)
chr4 (277-370)||(38106897-38106990)
chr4 (263-335)||(631768-631841)
chr4 (263-301)||(10711845-10711883)
chr4 (263-301)||(10925615-10925653)
chr4 (263-301)||(27532772-27532810)
chr4 (307-335)||(22635076-22635104)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (263-370)||(11301686-11301794)
chr3 (263-370)||(12337206-12337314)
chr3 (263-370)||(5219797-5219905)
chr3 (263-362)||(11853664-11853764)
chr3 (263-370)||(12853384-12853492)
chr3 (74-200)||(7573742-7573866)
chr3 (263-370)||(7108188-7108296)
chr3 (263-370)||(7112123-7112231)
chr3 (263-370)||(11068563-11068671)
chr3 (263-370)||(16795453-16795561)
chr3 (263-370)||(19774148-19774256)
chr3 (263-370)||(22320079-22320187)
chr3 (263-370)||(22335134-22335242)
chr3 (263-370)||(28948411-28948519)
chr3 (263-370)||(55021326-55021434)
chr3 (263-370)||(11167114-11167222)
chr3 (263-370)||(13435768-13435876)
chr3 (263-370)||(14664375-14664483)
chr3 (263-370)||(14667539-14667647)
chr3 (263-370)||(15616127-15616235)
chr3 (263-370)||(16751922-16752030)
chr3 (263-370)||(30064334-30064443)
chr3 (263-370)||(14497898-14498005)
chr3 (267-362)||(15963455-15963551)
chr3 (267-362)||(15967379-15967475)
chr3 (267-362)||(15971303-15971399)
chr3 (269-370)||(4108816-4108918)
chr3 (269-370)||(4112665-4112767)
chr3 (263-370)||(8928888-8928996)
chr3 (263-370)||(10834962-10835070)
chr3 (263-370)||(14764816-14764924)
chr3 (263-368)||(18933376-18933483)
chr3 (263-370)||(41084-41192)
chr3 (263-370)||(3801920-3802028)
chr3 (263-370)||(9532208-9532316)
chr3 (263-370)||(23372564-23372672)
chr3 (263-370)||(51299483-51299591)
chr3 (263-370)||(54519547-54519655)
chr3 (263-335)||(15463863-15463936)
chr3 (263-370)||(18899400-18899511)
chr3 (263-370)||(20249870-20249978)
chr3 (263-370)||(29545959-29546067)
chr3 (263-329)||(14670017-14670084)
chr3 (263-329)||(14681541-14681608)
chr3 (263-365)||(11912382-11912485)
chr3 (263-345)||(12304149-12304232)
chr3 (263-345)||(16326062-16326145)
chr3 (320-370)||(17348806-17348856)
chr3 (263-301)||(4590181-4590219)
chr3 (263-301)||(8491753-8491791)
chr3 (289-370)||(15564801-15564883)
chr3 (263-301)||(17318530-17318568)
chr3 (263-335)||(23173282-23173355)
chr3 (266-322)||(38312881-38312938)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (263-370)||(5775-5883)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (263-370)||(11727-11835)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (263-368)||(14796-14902)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (263-370)||(22132119-22132227)
chr1 (263-370)||(33795983-33796091)
chr1 (263-370)||(1009212-1009320)
chr1 (263-370)||(1926816-1926924)
chr1 (263-370)||(16376836-16376944)
chr1 (263-370)||(20925830-20925938)
chr1 (263-370)||(52634218-52634326)
chr1 (263-370)||(39245191-39245297)
chr1 (263-370)||(39248746-39248852)
chr1 (263-370)||(41389685-41389793)
chr1 (263-368)||(20230159-20230266)
chr1 (263-370)||(29533837-29533945)
chr1 (263-370)||(16370875-16370983)
chr1 (263-370)||(32649017-32649125)
chr1 (263-335)||(41801299-41801372)
chr1 (278-370)||(20439188-20439281)
chr1 (136-194)||(19282606-19282664)
chr1 (263-301)||(21406273-21406311)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (263-370)||(11001-11109)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (263-370)||(11080-11188)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (263-362)||(15595-15695)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (263-370)||(25588-25696)
scaffold0124 (278-370)||(37568-37661)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (263-370)||(60346-60454)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (263-370)||(31675-31783)
chr7 (263-370)||(12706143-12706251)
chr7 (263-370)||(12713490-12713598)
chr7 (263-370)||(12722148-12722256)
chr7 (263-370)||(13891580-13891688)
chr7 (263-370)||(16109996-16110104)
chr7 (263-370)||(16908530-16908638)
chr7 (263-370)||(18277944-18278052)
chr7 (263-370)||(18281908-18282016)
chr7 (263-362)||(45171521-45171621)
chr7 (264-370)||(72393-72500)
chr7 (264-370)||(76502-76609)
chr7 (263-370)||(2833502-2833610)
chr7 (263-370)||(10607341-10607449)
chr7 (263-370)||(12717237-12717345)
chr7 (263-370)||(18424185-18424293)
chr7 (263-370)||(39268334-39268442)
chr7 (263-370)||(7520236-7520345)
chr7 (263-370)||(15083175-15083284)
chr7 (263-370)||(39721145-39721254)
chr7 (263-370)||(834066-834174)
chr7 (263-370)||(838154-838262)
chr7 (263-370)||(1199246-1199354)
chr7 (263-370)||(1203334-1203442)
chr7 (263-370)||(9752528-9752636)
chr7 (263-370)||(13891963-13892071)
chr7 (263-370)||(16582371-16582479)
chr7 (263-368)||(26291108-26291215)
chr7 (263-370)||(2531353-2531460)
chr7 (263-370)||(14420737-14420845)
chr7 (263-370)||(18871247-18871355)
chr7 (263-339)||(1860042-1860119)
chr7 (263-370)||(11660232-11660340)
chr7 (263-370)||(16004954-16005062)
chr7 (266-370)||(10897920-10898025)
chr7 (263-335)||(13919433-13919506)
chr7 (263-370)||(146450-146558)
chr7 (263-370)||(41283595-41283703)
chr7 (263-353)||(18606305-18606396)
chr7 (278-370)||(15166200-15166293)
chr7 (307-370)||(9752657-9752720)
chr7 (263-329)||(20486733-20486800)
chr7 (263-365)||(15213003-15213106)
chr7 (263-335)||(25928392-25928465)
chr7 (303-335)||(9752737-9752769)
chr7 (278-360)||(11302267-11302350)
chr7 (263-299)||(18301373-18301409)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (263-370)||(11219505-11219613)
chr5 (263-370)||(15238138-15238246)
chr5 (263-370)||(20294464-20294572)
chr5 (263-370)||(22120612-22120720)
chr5 (263-370)||(24768583-24768691)
chr5 (263-367)||(18354750-18354855)
chr5 (263-370)||(11224091-11224199)
chr5 (263-370)||(11227913-11228021)
chr5 (263-362)||(19474193-19474293)
chr5 (263-370)||(20912273-20912381)
chr5 (263-370)||(10751767-10751875)
chr5 (263-370)||(11226107-11226215)
chr5 (263-370)||(11229903-11230011)
chr5 (263-371)||(28372102-28372211)
chr5 (263-370)||(37600029-37600137)
chr5 (263-370)||(38146439-38146547)
chr5 (271-362)||(40727428-40727519)
chr5 (263-370)||(19510412-19510520)
chr5 (263-370)||(22108470-22108577)
chr5 (263-370)||(33473952-33474060)
chr5 (263-370)||(22338962-22339070)
chr5 (263-370)||(23113423-23113531)
chr5 (263-370)||(22335432-22335540)
chr5 (263-370)||(41878672-41878780)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (263-370)||(10103317-10103425)
chr2 (263-370)||(12902627-12902735)
chr2 (263-370)||(24630068-24630176)
chr2 (263-370)||(30346678-30346786)
chr2 (263-362)||(41532463-41532563)
chr2 (263-370)||(24645101-24645209)
chr2 (263-370)||(24647044-24647152)
chr2 (263-370)||(24647877-24647985)
chr2 (263-362)||(27381014-27381114)
chr2 (263-362)||(27384984-27385084)
chr2 (263-370)||(27600321-27600429)
chr2 (263-370)||(31343867-31343975)
chr2 (263-370)||(19663578-19663686)
chr2 (263-370)||(20260207-20260315)
chr2 (263-370)||(6481734-6481842)
chr2 (263-370)||(6485201-6485309)
chr2 (263-370)||(9240624-9240732)
chr2 (263-370)||(21074528-21074636)
chr2 (272-370)||(10686276-10686375)
chr2 (263-370)||(37378986-37379094)
chr2 (263-335)||(9783979-9784052)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (271-370)||(5559-5659)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (263-370)||(34148-34256)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (263-370)||(33887-33995)
scaffold0080 (263-326)||(28466-28530)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (263-370)||(68576-68684)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (287-370)||(115390-115473)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (263-370)||(6341-6448)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (263-370)||(18773-18881)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (263-370)||(8760-8868)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (263-367)||(8530-8635)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (263-370)||(109551-109659)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (263-370)||(224163-224271)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (263-370)||(150-258)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (263-370)||(3537-3645)
scaffold0544 (310-370)||(1-61)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (263-365)||(10842-10945)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (263-335)||(6981-7054)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (263-370)||(5192-5300)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (263-335)||(10752-10825)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (311-370)||(641-700)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (263-335)||(74352-74425)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (263-365)||(4076-4179)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (263-329)||(37223-37290)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (263-335)||(21360-21425)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (263-301)||(3994-4032)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (263-301)||(23958-23996)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (263-301)||(62860-62898)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 14721267 - 14721444
Alignment:
Q  20 gtgctcagcatgagtatttccaatctggtgaatcaaggaattgtggaacacattaaaggttcgagataaacacacgttccatctcactctttatatgctg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14721267 gtgctcatcatgagtatttccaatctagtgaatcaatgaattgtggaacgcattaaaggttcaagataaacacacgttccatctcactctttatatgctg 14721366  T
Q  120 acgacatcatgatattttttgcaaaggtaaaatctcttccattcatgctcttatgcagcttttcaactcttatgctca 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14721367 acgacatcaggatattttttgcaaaggtaaaatctcctccattcatgctcttatgtagcttttcaactcttatgctca 14721444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 14399113 - 14399221
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  14399113 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 14399212  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14399213 taatgatgt 14399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 18864125 - 18864225
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  18864125 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 18864224  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  18864225 t 18864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 21829481 - 21829589
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  21829481 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 21829580  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  21829581 taatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 21974204 - 21974312
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  21974204 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 21974303  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  21974304 taatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43250260 - 43250152
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  43250260 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 43250161  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  43250160 taatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12220640 - 12220525
Alignment:
Q  83 agataaacacacgttccatctcactctttatatgctgacgacatcatgatattttttgcaaaggtaaaatctcttccattcatgctcttatgcagctttt 182  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  12220640 agatcaacacatgttccttctcattccttatatgctgacgacattatgatatttt--gcaaaggtaaaatctcctctattcatgctcttatgcaactttt 12220543  T
Q  183 caactcttatgctcaagc 200  Q
    |||||| |||||||||||    
T  12220542 caactcatatgctcaagc 12220525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 21978314 - 21978422
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  21978314 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 21978413  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  21978414 taatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22110659 - 22110551
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22110659 gttgttaagtgtacttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22110560  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22110559 taatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 30941585 - 30941685
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  30941585 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 30941684  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  30941685 t 30941685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21409959 - 21409850
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21409959 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 21409860  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
    || |||||||    
T  21409859 ttaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21804451 - 21804342
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21804451 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 21804352  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
    || |||||||    
T  21804351 ttaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28186572 - 28186394
Alignment:
Q  20 gtgctcagcatgagtatttccaatctggtgaatcaaggaattgtggaacacattaaaggttcgagataaacacacgttccatctcactctttatatgctg 119  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||| ||| | |||||||  ||||| |  || |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28186572 gtgctcagcaggagcatcaccaatcttgtgcaacaaggaaaggtggagcttatcaaaggttcaagatcaacacatgttccttctcattctttatatgctg 28186473  T
Q  120 acgacatcatgatattttttgcaaaggtaaaatctcttccattcatgctcttatgcagcttttcaactcttatgctcaagc 200  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  28186472 acgacattatgata--ttttgcaaaggtaaaatttcctatattcatgctcttctgcaacttttcaactcatatgatcaagc 28186394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23427884 - 23427776
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  23427884 gttgttaaatgtacttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattataaat 23427785  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  23427784 tgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 27942706 - 27942814
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  27942706 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 27942805  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  27942806 tgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Original strand, 44385854 - 44385945
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  44385854 gttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatta 44385945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11774354 - 11774246
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  11774354 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 11774255  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  11774254 tgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23913323 - 23913250
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913323 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg 23913250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729738
Alignment:
Q  278 tgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 363326 - 363218
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |     
T  363326 gttgttaaatgtacttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaa 363227  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  363226 tgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 8414997 - 8415105
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  8414997 gttgttaaatgtacttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 8415096  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  8415097 tgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19216073 - 19216005
Alignment:
Q  104 cactctttatatgctgacgacatcatgatattttttgcaaaggtaaaatctcttccattcatgctcttatg 174  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  19216073 cactctctatatgcagatgacatcatgata--ttctgcaaaggtagaatctcttctattcaggctcttatg 19216005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21328624 - 21328586
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21328624 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 21328586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21386217 - 21386179
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21386217 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 21386179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27555597 - 27555490
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27555597 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaatt 27555498  T
Q  363 gatgatgt 370  Q
    ||||||||    
T  27555497 gatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 22075411 - 22075519
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22075411 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 22075510  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  22075511 tgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 27416548 - 27416656
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattg-ttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27416548 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 27416647  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  27416648 tgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8242470 - 8242362
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  8242470 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 8242371  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  8242370 taatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11565459 - 11565351
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  11565459 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 11565360  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11565359 taatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 11716961 - 11717069
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  11716961 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 11717060  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11717061 taatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 12620354 - 12620462
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12620354 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12620453  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12620454 taatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14470939 - 14470831
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14470939 gttgttaggtgtacttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 14470840  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14470839 taatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23393699 - 23393599
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  23393699 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 23393600  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  23393599 t 23393599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23413607 - 23413507
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  23413607 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 23413508  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  23413507 t 23413507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19869245 - 19869156
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19869245 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtat 19869156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22947725 - 22947617
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22947725 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22947626  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22947625 taatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22951681 - 22951573
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22951681 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22951582  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22951581 taatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23870169 - 23870061
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23870169 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 23870070  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  23870069 taatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23874125 - 23874017
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23874125 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 23874026  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  23874025 taatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 31479483 - 31479591
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  31479483 gttgttaaatgtatttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 31479582  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  31479583 taatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16758769 - 16758665
Alignment:
Q  267 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    
T  16758769 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaataattattattatgaattaat 16758670  T
Q  366 gatgt 370  Q
    |||||    
T  16758669 gatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22861813 - 22861705
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  22861813 gttgttaagtgtacttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatgattatgaat 22861714  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22861713 taatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23988361 - 23988253
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23988361 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 23988262  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  23988261 taatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23538039 - 23537931
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23538039 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 23537940  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  23537939 tgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4475853 - 4475745
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  4475853 gttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 4475754  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  4475753 tgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12941279 - 12941171
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  12941279 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 12941180  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  12941179 tgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23955427 - 23955319
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  23955427 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 23955328  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  23955327 tgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27222890 - 27222782
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  27222890 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaa 27222791  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  27222790 tgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16622892 - 16622812
Alignment:
Q  264 ttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaat 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16622892 ttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt-tcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaat 16622812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23400736 - 23400627
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  23400736 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaa 23400637  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
     | |||||||    
T  23400636 gtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 28290915 - 28291023
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||   |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  28290915 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatgtttgatgaataattattattatgaaa 28291014  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  28291015 tgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2076344 - 2076271
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2076344 gttgttaaatgtatttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatgagatg 2076271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1254217 - 1254114
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |   ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||    
T  1254217 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaataattattgttatgaat 1254118  T
Q  362 tgat 365  Q
    ||||    
T  1254117 tgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 18918601 - 18918639
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18918601 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 18918639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25737950 - 25737842
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||  ||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| || |  |||||||    
T  25737950 gttggtaaatgtacttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatgcttgctgaataattactgttatgaat 25737851  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||| ||||    
T  25737850 tgataatgt 25737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 841 - 949
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  841 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 940  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  941 tgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 70813 - 70705
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattg-ttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  70813 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 70714  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  70713 tgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 20163919 - 20164027
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20163919 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 20164018  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  20164019 tgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 20158468 - 20158576
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20158468 gttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 20158567  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  20158568 tgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 20161144 - 20161252
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20161144 gttgttaagtgtacttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 20161243  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  20161244 tgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 17052466 - 17052574
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  17052466 gttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 17052565  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  17052566 tgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 4562794 - 4562902
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  4562794 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 4562893  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  4562894 taatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 5758476 - 5758584
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  5758476 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 5758575  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  5758576 taatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9555127 - 9555019
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  9555127 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 9555028  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  9555027 taatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 14759012 - 14759120
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14759012 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 14759111  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14759112 taatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 14955780 - 14955888
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14955780 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 14955879  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14955880 taatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 22634947 - 22635055
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22634947 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22635046  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  22635047 tgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33740894 - 33740786
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  33740894 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 33740795  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  33740794 taatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12486329 - 12486221
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12486329 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12486230  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12486229 taatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15223604 - 15223496
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  15223604 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaat 15223505  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  15223504 taatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25688500 - 25688392
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  25688500 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 25688401  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  25688400 taatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30145841 - 30145733
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  30145841 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 30145742  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  30145741 tgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 13813853 - 13813961
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13813853 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 13813952  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  13813953 tgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 13818341 - 13818449
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13818341 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 13818440  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  13818441 tgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 24048405 - 24048513
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  24048405 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaa 24048504  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  24048505 tgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17807112 - 17807021
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17807112 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatta 17807021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15533277 - 15533169
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  15533277 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 15533178  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  15533177 tgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 23996987 - 23997094
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  23996987 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgt-aagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataatcattattatgaat 23997085  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  23997086 taatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12423001 - 12422910
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12423001 gttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatta 12422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18211662 - 18211554
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  18211662 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 18211563  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  18211562 tgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28384909 - 28384801
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  28384909 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaa 28384810  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  28384809 tgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36037010 - 36036902
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| | |||||| ||||| ||||||     
T  36037010 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttcatgaataattattattatgaaa 36036911  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  36036910 tgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 49549103 - 49549212
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt--gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |    
T  49549103 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgga 49549202  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
     |||||||||    
T  49549203 atgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 13818470 - 13818533
Alignment:
Q  307 tcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13818470 tcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 24048534 - 24048597
Alignment:
Q  307 tcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24048534 tcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38106990 - 38106897
Alignment:
Q  277 ttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  38106990 ttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaatga-atgtttgatgaagaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 631768 - 631841
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  631768 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatgagatg 631841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10711883 - 10711845
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10711883 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 10711845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10925653 - 10925615
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10925653 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 10925615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27532810 - 27532772
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27532810 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 27532772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 335
Target Start/End: Original strand, 22635076 - 22635104
Alignment:
Q  307 tcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22635076 tcttttattcatgaattgataatgagatg 22635104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 11301686 - 11301794
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11301686 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 11301785  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  11301786 tgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12337314 - 12337206
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataa-tgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12337314 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgatagttgtcttttattcatgaattgataattgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 12337215  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  12337214 tgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5219905 - 5219797
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  5219905 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaat 5219806  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  5219805 taatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11853764 - 11853664
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11853764 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 11853665  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  11853664 t 11853664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 12853384 - 12853492
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12853384 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12853483  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  12853484 tgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 200
Target Start/End: Original strand, 7573742 - 7573866
Alignment:
Q  74 aaaggttcgagataaacacacgttccatctcactctttatatgctgacgacatcatgatattttttgcaaaggtaaaatctcttccattcatgctcttat 173  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7573742 aaaggttcaagatcaacacatgttccttctcattccttatatgctgacgacattatgatatttt--gcaaaggtaaaatctcctctattcatgctcttat 7573839  T
Q  174 gcagcttttcaactcttatgctcaagc 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7573840 gcaacttttcaactcatatgctcaagc 7573866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7108296 - 7108188
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7108296 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 7108197  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  7108196 taatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7112231 - 7112123
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7112231 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 7112132  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  7112131 taatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11068671 - 11068563
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  11068671 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 11068572  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11068571 taatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16795561 - 16795453
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16795561 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaat 16795462  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  16795461 tgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19774256 - 19774148
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  19774256 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 19774157  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  19774156 taatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22320187 - 22320079
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22320187 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22320088  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22320087 taatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22335242 - 22335134
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22335242 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22335143  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22335142 taatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28948519 - 28948411
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  28948519 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 28948420  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  28948419 taatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55021434 - 55021326
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  55021434 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 55021335  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  55021334 taatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 11167114 - 11167222
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  11167114 gttgttaagtttacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 11167213  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11167214 taatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13435876 - 13435768
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13435876 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 13435777  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  13435776 tgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14664483 - 14664375
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||    
T  14664483 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaat 14664384  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14664383 taatgatgt 14664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14667647 - 14667539
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||    
T  14667647 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaat 14667548  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14667547 taatgatgt 14667539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15616235 - 15616127
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15616235 gttgttaagtgtacttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 15616136  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  15616135 taatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 16751922 - 16752030
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  16751922 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaat 16752021  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  16752022 taatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30064443 - 30064334
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  30064443 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 30064344  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
    || |||||||    
T  30064343 ttaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14498005 - 14497898
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  14498005 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataattattattatgaat 14497907  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  14497906 taatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15963551 - 15963455
Alignment:
Q  267 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  15963551 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15963455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15967475 - 15967379
Alignment:
Q  267 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  15967475 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15967379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15971399 - 15971303
Alignment:
Q  267 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  15971399 ttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15971303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 4108816 - 4108918
Alignment:
Q  269 aagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4108816 aagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatga 4108915  T
Q  368 tgt 370  Q
    |||    
T  4108916 tgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 4112665 - 4112767
Alignment:
Q  269 aagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4112665 aagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatga 4112764  T
Q  368 tgt 370  Q
    |||    
T  4112765 tgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 8928888 - 8928996
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  8928888 gttgttaaatgtacttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 8928987  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  8928988 tgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 10834962 - 10835070
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  10834962 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaa 10835061  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  10835062 tgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 14764816 - 14764924
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  14764816 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 14764915  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  14764916 tgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 368
Target Start/End: Original strand, 18933376 - 18933483
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  18933376 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 18933475  T
Q  361 ttgatgat 368  Q
    || |||||    
T  18933476 ttaatgat 18933483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41192 - 41084
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  41192 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaa 41093  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  41092 tgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3802028 - 3801920
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |     
T  3802028 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaa 3801929  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  3801928 tgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9532316 - 9532208
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  9532316 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 9532217  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  9532216 tgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 23372564 - 23372672
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  23372564 gttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 23372663  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  23372664 tgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 51299591 - 51299483
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  51299591 gttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 51299492  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  51299491 tgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 54519655 - 54519547
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |     
T  54519655 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaa 54519556  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  54519555 tgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15463936 - 15463863
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15463936 gttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg 15463863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18899511 - 18899400
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattg---ataatgagatgtttgaagaataagtattaatatg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18899511 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatgtttgatgaataattattattatg 18899412  T
Q  359 aattgatgatgt 370  Q
    || |||||||||    
T  18899411 aaatgatgatgt 18899400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 20249870 - 20249978
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  || || || |||||| ||||| ||||||     
T  20249870 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatattcgatgaataactattattatgaaa 20249969  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  20249970 tgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 29545959 - 29546067
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||  | |||||| |||||| ||||| ||||||     
T  29545959 gttgttaaatgtacttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaaggtttgatgaataattattattatgaaa 29546058  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  29546059 tgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14670084 - 14670017
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataat 329  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14670084 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14681608 - 14681541
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataat 329  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14681608 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11912485 - 11912382
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |   ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||    
T  11912485 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaat 11912386  T
Q  362 tgat 365  Q
    ||||    
T  11912385 tgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12304232 - 12304149
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaat 345  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||    
T  12304232 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaat 12304149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 16326062 - 16326145
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaat 345  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  16326062 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat 16326145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 370
Target Start/End: Original strand, 17348806 - 17348856
Alignment:
Q  320 aattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  17348806 aattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 4590181 - 4590219
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4590181 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 4590219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 8491753 - 8491791
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8491753 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 8491791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15564883 - 15564801
Alignment:
Q  289 atgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||| |||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  15564883 atgttaagttgatgtgttgtcttctgttcatgagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattattatgaattgatgatgt 15564801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 17318530 - 17318568
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17318530 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 17318568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23173355 - 23173282
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  23173355 gttgttaaatatacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatg 23173282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Original strand, 38312881 - 38312938
Alignment:
Q  266 gttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaat 322  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  38312881 gttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaat 38312938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5883 - 5775
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataa-tgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  5883 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatagttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattattatgaat 5784  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  5783 tgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11835 - 11727
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11835 gttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaat 11736  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  11735 tgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14902 - 14796
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14902 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 14803  T
Q  362 tgatgat 368  Q
    | |||||    
T  14802 taatgat 14796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 22132119 - 22132227
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22132119 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22132218  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  22132219 tgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33796091 - 33795983
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  33796091 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaataattattattatgaat 33795992  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  33795991 taatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1009320 - 1009212
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  1009320 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 1009221  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  1009220 taatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 1926816 - 1926924
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  1926816 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 1926915  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  1926916 taatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 16376836 - 16376944
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16376836 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 16376935  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  16376936 taatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 20925830 - 20925938
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  20925830 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 20925929  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  20925930 taatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 52634326 - 52634218
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  52634326 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 52634227  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  52634226 taatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 39245191 - 39245297
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  39245191 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt-tcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 39245289  T
Q  363 gatgatgt 370  Q
     |||||||    
T  39245290 aatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 39248746 - 39248852
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  39248746 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt-tcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 39248844  T
Q  363 gatgatgt 370  Q
     |||||||    
T  39248845 aatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 41389685 - 41389793
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  41389685 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaat 41389784  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  41389785 taatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 368
Target Start/End: Original strand, 20230159 - 20230266
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  20230159 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 20230258  T
Q  361 ttgatgat 368  Q
    || |||||    
T  20230259 ttaatgat 20230266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29533945 - 29533837
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  29533945 gttgttaaatgtgtttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 29533846  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  29533845 tgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16370983 - 16370875
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  16370983 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaa 16370884  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  16370883 tgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32649125 - 32649017
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  32649125 gttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 32649026  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  32649025 tgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 41801299 - 41801372
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801299 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg 41801372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439281
Alignment:
Q  278 tgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19282664 - 19282606
Alignment:
Q  136 ttttgcaaaggtaaaatctcttccattcatgctcttatgcagcttttcaactcttatgc 194  Q
    |||||||||||||| ||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19282664 ttttgcaaaggtaagatagcatcaatccatgctcttatgcagcttttcaactcttatgc 19282606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21406311 - 21406273
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21406311 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 21406273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11109 - 11001
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  11109 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 11010  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11009 taatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 11080 - 11188
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  11080 gttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaat 11179  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11180 taatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 15595 - 15695
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  15595 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 15694  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  15695 t 15695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 25588 - 25696
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  25588 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatgaataattattattatgaat 25687  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  25688 tgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37661
Alignment:
Q  278 tgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 60346 - 60454
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  60346 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 60445  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  60446 taatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31783 - 31675
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  31783 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 31684  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  31683 taatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 12706143 - 12706251
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12706143 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12706242  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12706243 taatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12713598 - 12713490
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12713598 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12713499  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12713498 taatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12722256 - 12722148
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12722256 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12722157  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12722156 taatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13891688 - 13891580
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13891688 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 13891589  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  13891588 tgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 16109996 - 16110104
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16109996 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 16110095  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  16110096 tgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 16908530 - 16908638
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16908530 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 16908629  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  16908630 taatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18278052 - 18277944
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  18278052 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 18277953  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  18277952 taatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18282016 - 18281908
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  18282016 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 18281917  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  18281916 taatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 45171521 - 45171621
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  45171521 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 45171620  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  45171621 t 45171621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 264 - 370
Target Start/End: Original strand, 72393 - 72500
Alignment:
Q  264 ttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  72393 ttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 72492  T
Q  363 gatgatgt 370  Q
     |||||||    
T  72493 aatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 264 - 370
Target Start/End: Original strand, 76502 - 76609
Alignment:
Q  264 ttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  76502 ttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 76601  T
Q  363 gatgatgt 370  Q
     |||||||    
T  76602 aatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 2833502 - 2833610
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||    
T  2833502 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaatgaataattattattatgaat 2833601  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  2833602 taatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 10607341 - 10607449
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  10607341 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaa 10607440  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  10607441 tgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12717345 - 12717237
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12717345 gttgttaagtgtacttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12717246  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12717245 taatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18424293 - 18424185
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  18424293 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaat 18424194  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  18424193 taatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 39268334 - 39268442
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  39268334 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 39268433  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  39268434 tgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 7520236 - 7520345
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaat-aagtattaatatgaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||    
T  7520236 gttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataaattattattatgaa 7520335  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
     |||||||||    
T  7520336 atgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15083284 - 15083175
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaag-ttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  15083284 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 15083185  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
    || |||||||    
T  15083184 ttaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39721254 - 39721145
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  39721254 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaa 39721155  T
Q  361 ttgatgatgt 370  Q
    || |||||||    
T  39721154 ttaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 834066 - 834174
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  834066 gttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 834165  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  834166 tgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 838154 - 838262
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  838154 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaat 838253  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  838254 tgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 1199246 - 1199354
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  1199246 gttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 1199345  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  1199346 tgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 1203334 - 1203442
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  1203334 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaat 1203433  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  1203434 tgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 9752528 - 9752636
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  9752528 gttgttaaatgtacttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 9752627  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  9752628 tgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13892071 - 13891963
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13892071 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 13891972  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  13891971 tgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16582479 - 16582371
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  16582479 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaa 16582380  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  16582379 tgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26291215 - 26291108
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaa-gttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  26291215 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaa 26291116  T
Q  361 ttgatgat 368  Q
    || |||||    
T  26291115 ttaatgat 26291108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 2531353 - 2531460
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  2531353 gttgttaggtgtacttgatgatgtt-atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaataattattattatgaat 2531451  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  2531452 taatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14420845 - 14420737
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  14420845 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 14420746  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  14420745 tgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18871355 - 18871247
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  18871355 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 18871256  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  18871255 tgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 339
Target Start/End: Original strand, 1860042 - 1860119
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 339  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860042 gttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttg 1860119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11660340 - 11660232
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  11660340 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaa 11660241  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11660240 ttatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16005062 - 16004954
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  16005062 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaa 16004963  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  16004962 tgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 370
Target Start/End: Original strand, 10897920 - 10898025
Alignment:
Q  266 gttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattga 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  10897920 gttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttatgaataattattattatgaaatga 10898019  T
Q  365 tgatgt 370  Q
    ||||||    
T  10898020 tgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 13919433 - 13919506
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919433 gttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg 13919506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 146558 - 146450
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  146558 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 146459  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  146458 tgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41283703 - 41283595
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||| ||||||     
T  41283703 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaa 41283604  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  41283603 tgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18606396 - 18606305
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||    
T  18606396 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattatta 18606305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166200
Alignment:
Q  278 tgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Original strand, 9752657 - 9752720
Alignment:
Q  307 tcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9752657 tcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20486800 - 20486733
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataat 329  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20486800 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15213106 - 15213003
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |   ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||    
T  15213106 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaat 15213007  T
Q  362 tgat 365  Q
    ||||    
T  15213006 tgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 25928392 - 25928465
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25928392 gttgttaaatgtactttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatgagatg 25928465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Original strand, 9752737 - 9752769
Alignment:
Q  303 gttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752737 gttatcttttattcatgaattgataatgagatg 9752769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  278 tgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | || |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18301409 - 18301373
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttg 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18301409 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 18301373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11219613 - 11219505
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  11219613 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaat 11219514  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11219513 taatgatgt 11219505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 15238138 - 15238246
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15238138 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 15238237  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  15238238 taatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20294572 - 20294464
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  20294572 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 20294473  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  20294472 taatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 22120612 - 22120720
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  22120612 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaa 22120711  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  22120712 tgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 24768583 - 24768691
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  24768583 gttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaat 24768682  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  24768683 taatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18354855 - 18354750
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattg-ttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  18354855 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaat 18354756  T
Q  362 tgatga 367  Q
    | ||||    
T  18354755 taatga 18354750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11224199 - 11224091
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  11224199 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaat 11224100  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11224099 taatgatgt 11224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11228021 - 11227913
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  11228021 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaat 11227922  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11227921 taatgatgt 11227913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 19474193 - 19474293
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  19474193 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 19474292  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  19474293 t 19474293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 20912273 - 20912381
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  20912273 gttgttaagtgtacttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaat 20912372  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  20912373 taatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10751875 - 10751767
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  10751875 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaat 10751776  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  10751775 taatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11226215 - 11226107
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  11226215 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaat 11226116  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11226115 taatgatgt 11226107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11230011 - 11229903
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  11230011 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaat 11229912  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  11229911 taatgatgt 11229903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 263 - 371
Target Start/End: Original strand, 28372102 - 28372211
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  28372102 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 28372201  T
Q  362 tgatgatgtc 371  Q
    ||||||||||    
T  28372202 tgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 37600029 - 37600137
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  37600029 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 37600128  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  37600129 tgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 38146439 - 38146547
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  38146439 gttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 38146538  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  38146539 tgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Original strand, 40727428 - 40727519
Alignment:
Q  271 gtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaatt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  40727428 gtgtacttgatgatgtt-atgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaatt 40727519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19510520 - 19510412
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattg-ttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||| ||||| ||||||     
T  19510520 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaa 19510421  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  19510420 tgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 22108470 - 22108577
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||  | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22108470 gttgttaaatgtacttgatgatgtt-acgtataattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 22108568  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  22108569 tgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 33473952 - 33474060
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  33473952 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 33474051  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  33474052 tgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22339070 - 22338962
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  22339070 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 22338971  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22338970 taatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 23113423 - 23113531
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |     
T  23113423 gttgttaaatgtacttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaa 23113522  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  23113523 tgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22335540 - 22335432
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  22335540 gttgttaaatgtatttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 22335441  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  22335440 taatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 41878672 - 41878780
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |     
T  41878672 gttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaa 41878771  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  41878772 tgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 10103317 - 10103425
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10103317 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 10103416  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  10103417 taatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 12902627 - 12902735
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12902627 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 12902726  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  12902727 taatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 24630068 - 24630176
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  24630068 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 24630167  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  24630168 taatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 30346678 - 30346786
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  30346678 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 30346777  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  30346778 taatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 41532463 - 41532563
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  41532463 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaat 41532562  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  41532563 t 41532563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24645209 - 24645101
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  24645209 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 24645110  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  24645109 taatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24647152 - 24647044
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  24647152 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 24647053  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  24647052 taatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24647985 - 24647877
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  24647985 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 24647886  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  24647885 taatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 27381014 - 27381114
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  27381014 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 27381113  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  27381114 t 27381114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 27384984 - 27385084
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  27384984 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 27385083  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  27385084 t 27385084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27600429 - 27600321
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  27600429 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaat 27600330  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  27600329 taatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31343975 - 31343867
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  31343975 gttgttaggtgtacttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaat 31343876  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  31343875 taatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 19663578 - 19663686
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  19663578 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 19663677  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  19663678 tgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20260315 - 20260207
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  20260315 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 20260216  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  20260215 tgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6481842 - 6481734
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattg-ttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||| ||||| ||||||     
T  6481842 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaa 6481743  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  6481742 tgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6485309 - 6485201
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattg-ttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||| ||||| ||||||     
T  6485309 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaa 6485210  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  6485209 tgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9240732 - 9240624
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  9240732 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 9240633  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  9240632 tgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 21074528 - 21074636
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  21074528 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatgtttgatgaataattattattatgaaa 21074627  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  21074628 tgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 370
Target Start/End: Original strand, 10686276 - 10686375
Alignment:
Q  272 tgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  10686276 tgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37379094 - 37378986
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||| ||||||     
T  37379094 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaa 37378995  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  37378994 tgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9784052 - 9783979
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784052 gttgtttaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg 9783979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 370
Target Start/End: Original strand, 5559 - 5659
Alignment:
Q  271 gtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  5559 gtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattatgaattaatgatg 5658  T
Q  370 t 370  Q
    |    
T  5659 t 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 34148 - 34256
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  34148 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 34247  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  34248 taatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33995 - 33887
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  33995 gttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 33896  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  33895 tgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28530 - 28466
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgat 326  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  28530 gttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgat 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 68576 - 68684
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  68576 gttgttaagtgtacttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaat 68675  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  68676 taatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 287 - 370
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  287 ttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgatagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 6341 - 6448
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  6341 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataactattattatgaat 6439  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    | |||||||    
T  6440 taatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18881 - 18773
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||    
T  18881 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattataaat 18782  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  18781 tgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 8760 - 8868
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||     
T  8760 gttgttaaatgtacatgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaaa 8859  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  8860 tgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 263 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8635 - 8530
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||    
T  8635 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattattattattaat 8536  T
Q  362 tgatga 367  Q
    | ||||    
T  8535 taatga 8530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 109659 - 109551
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  109659 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 109560  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  109559 tgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 224163 - 224271
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  224163 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 224262  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  224263 tgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 258 - 150
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |     
T  258 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgtaa 159  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  158 tgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Original strand, 3537 - 3645
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgatt-gttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  3537 gttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 3636  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  3637 tgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  310 tttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Original strand, 10842 - 10945
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  10842 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaa 10941  T
Q  362 tgat 365  Q
    ||||    
T  10942 tgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 6981 - 7054
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6981 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg 7054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5300 - 5192
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || |||||  |||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  5300 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatgtttgatgaataattattatgatgaat 5201  T
Q  362 tgatgatgt 370  Q
    |||||||||    
T  5200 tgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10825 - 10752
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10825 gttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaatagataatgagatg 10752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  311 ttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaattgatgatgt 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 74352 - 74425
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  74352 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatgagatg 74425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4179 - 4076
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataatgagatgtttgaagaataagtattaatatgaat 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |   ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||    
T  4179 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaat 4080  T
Q  362 tgat 365  Q
    ||||    
T  4079 tgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 329
Target Start/End: Original strand, 37223 - 37290
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-tgttatcttttattcatgaattgataat 329  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37223 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 37290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 21360 - 21425
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgattgttatcttttattcatgaattgataatgagatg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21360 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg-------tcttttattcatgaattgctaatgagatg 21425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4032 - 3994
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4032 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 3994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 23958 - 23996
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23958 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 62860 - 62898
Alignment:
Q  263 gttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  62860 gttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgat 62898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University