View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15402_high_33 (Length: 310)

Name: NF15402_high_33
Description: NF15402
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15402_high_33
NF15402_high_33
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (1-202)||(2327-2528)
scaffold0234 (1-202)||(11218-11419)
scaffold0234 (238-294)||(2564-2620)
scaffold0234 (238-294)||(11455-11511)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-202)||(21940665-21940866)
chr8 (1-200)||(28554885-28555084)
chr8 (12-196)||(6094129-6094313)
chr8 (1-200)||(22171491-22171688)
chr8 (1-196)||(24642655-24642850)
chr8 (69-196)||(24636860-24636987)
chr8 (238-297)||(22070105-22070164)
chr8 (238-294)||(21940573-21940629)
chr8 (238-294)||(6094031-6094087)
chr8 (238-294)||(22171396-22171452)
chr8 (242-294)||(24642556-24642608)
chr8 (238-294)||(28554791-28554847)
chr8 (11-172)||(32872857-32873019)
chr8 (1-190)||(38232383-38232570)
chr8 (101-164)||(10920234-10920297)
chr8 (123-181)||(2375027-2375085)
chr8 (241-294)||(2374947-2375000)
chr8 (257-294)||(24636605-24636642)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (1-202)||(19926766-19926967)
chr4 (1-202)||(26970463-26970664)
chr4 (1-202)||(55612683-55612884)
chr4 (1-202)||(5707320-5707521)
chr4 (1-202)||(26963640-26963841)
chr4 (1-202)||(5713948-5714149)
chr4 (1-202)||(10621339-10621540)
chr4 (1-202)||(868597-868798)
chr4 (1-202)||(10628418-10628619)
chr4 (1-200)||(18262214-18262413)
chr4 (1-200)||(28393140-28393339)
chr4 (1-200)||(4426610-4426808)
chr4 (1-200)||(18269070-18269274)
chr4 (11-190)||(8845215-8845394)
chr4 (11-190)||(8858179-8858358)
chr4 (87-202)||(12357136-12357251)
chr4 (14-194)||(20311299-20311480)
chr4 (11-200)||(5616215-5616406)
chr4 (11-196)||(5668141-5668327)
chr4 (1-196)||(10677561-10677753)
chr4 (1-196)||(10891201-10891393)
chr4 (238-298)||(19927003-19927063)
chr4 (2-196)||(35223576-35223760)
chr4 (238-294)||(5713856-5713912)
chr4 (238-294)||(26963548-26963604)
chr4 (238-294)||(26970371-26970427)
chr4 (238-294)||(5707228-5707284)
chr4 (238-294)||(10621576-10621632)
chr4 (238-294)||(12357044-12357100)
chr4 (238-292)||(868507-868561)
chr4 (238-296)||(17142372-17142430)
chr4 (238-294)||(10628655-10628711)
chr4 (238-294)||(55612594-55612650)
chr4 (240-294)||(28393380-28393434)
chr4 (238-295)||(4426847-4426904)
chr4 (238-294)||(18268976-18269032)
chr4 (86-168)||(39074278-39074361)
chr4 (11-176)||(21454153-21454319)
chr4 (238-287)||(55992680-55992729)
chr4 (238-279)||(5668371-5668412)
chr4 (238-286)||(8845118-8845166)
chr4 (238-286)||(8858082-8858130)
chr4 (238-278)||(18262136-18262176)
chr4 (13-65)||(39074218-39074270)
chr4 (93-152)||(11161913-11161972)
chr4 (238-292)||(20311207-20311261)
chr4 (238-286)||(24699958-24700006)
chr4 (3-134)||(56516124-56516255)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (1-202)||(18252030-18252231)
chr1 (1-202)||(18532520-18532721)
chr1 (1-202)||(27131415-27131616)
chr1 (1-200)||(21171239-21171438)
chr1 (1-200)||(27310583-27310782)
chr1 (1-200)||(16359041-16359240)
chr1 (11-196)||(36816649-36816834)
chr1 (13-202)||(3855937-3856126)
chr1 (15-202)||(22657241-22657429)
chr1 (2-196)||(27277564-27277756)
chr1 (238-297)||(18532757-18532816)
chr1 (19-168)||(12006563-12006712)
chr1 (238-295)||(18251935-18251992)
chr1 (11-168)||(12014300-12014457)
chr1 (238-294)||(27310821-27310877)
chr1 (19-190)||(9917942-9918106)
chr1 (238-294)||(16359280-16359336)
chr1 (127-196)||(30720625-30720694)
chr1 (238-294)||(21171479-21171535)
chr1 (241-286)||(36816881-36816926)
chr1 (238-294)||(3856164-3856220)
chr1 (242-294)||(22657469-22657521)
chr1 (238-294)||(27131652-27131704)
chr1 (238-294)||(27277800-27277856)
chr1 (95-172)||(3403248-3403325)
chr1 (95-172)||(3443494-3443571)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (1-202)||(29327784-29327985)
chr7 (1-202)||(11536068-11536269)
chr7 (1-202)||(11542986-11543187)
chr7 (1-200)||(15152445-15152644)
chr7 (1-200)||(15148144-15148343)
chr7 (1-200)||(18561009-18561208)
chr7 (11-200)||(12750828-12751017)
chr7 (1-196)||(12738542-12738737)
chr7 (11-200)||(18257858-18258047)
chr7 (14-196)||(13392157-13392338)
chr7 (238-296)||(12738441-12738499)
chr7 (15-180)||(2364917-2365081)
chr7 (238-295)||(2653275-2653332)
chr7 (238-294)||(11543223-11543279)
chr7 (238-294)||(11536305-11536361)
chr7 (238-294)||(12750733-12750789)
chr7 (238-294)||(15152350-15152406)
chr7 (12-196)||(39111819-39112002)
chr7 (11-153)||(7396237-7396380)
chr7 (239-294)||(29327690-29327745)
chr7 (238-294)||(15148049-15148105)
chr7 (85-128)||(3132748-3132791)
chr7 (239-294)||(13392030-13392085)
chr7 (87-161)||(10234170-10234244)
chr7 (238-294)||(18258087-18258143)
chr7 (170-202)||(2653207-2653239)
chr7 (238-294)||(18560913-18560969)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-202)||(6110064-6110265)
chr3 (1-202)||(10572598-10572799)
chr3 (1-200)||(16482489-16482688)
chr3 (1-196)||(17781124-17781319)
chr3 (1-202)||(15600890-15601091)
chr3 (1-202)||(15607435-15607636)
chr3 (1-200)||(18522665-18522864)
chr3 (1-199)||(13211305-13211503)
chr3 (1-202)||(13248607-13248808)
chr3 (1-202)||(15357592-15357793)
chr3 (1-196)||(10579361-10579556)
chr3 (16-202)||(8490488-8490674)
chr3 (1-200)||(18519980-18520176)
chr3 (1-196)||(19089751-19089946)
chr3 (1-200)||(17200190-17200389)
chr3 (1-183)||(15342225-15342407)
chr3 (1-200)||(13516813-13517012)
chr3 (41-202)||(18640792-18640953)
chr3 (1-196)||(32056906-32057101)
chr3 (11-196)||(1647537-1647726)
chr3 (14-200)||(16200128-16200313)
chr3 (11-202)||(29924971-29925162)
chr3 (11-202)||(29974124-29974315)
chr3 (14-200)||(16200434-16200619)
chr3 (1-195)||(24253394-24253589)
chr3 (1-96)||(17136465-17136560)
chr3 (238-294)||(6109972-6110028)
chr3 (238-294)||(8490396-8490452)
chr3 (238-294)||(13248515-13248571)
chr3 (138-200)||(18534758-18534820)
chr3 (238-294)||(13211211-13211267)
chr3 (238-294)||(18640989-18641045)
chr3 (238-294)||(17136137-17136193)
chr3 (244-294)||(10579603-10579653)
chr3 (238-294)||(15607672-15607729)
chr3 (238-294)||(15351237-15351293)
chr3 (238-294)||(15357829-15357885)
chr3 (238-294)||(16482727-16482782)
chr3 (238-294)||(17200427-17200483)
chr3 (156-200)||(18510924-18510968)
chr3 (238-294)||(18519885-18519941)
chr3 (244-294)||(10572840-10572890)
chr3 (238-295)||(1647768-1647825)
chr3 (238-294)||(15601127-15601184)
chr3 (238-294)||(13516719-13516775)
chr3 (238-294)||(17781358-17781414)
chr3 (238-294)||(19089985-19090041)
chr3 (238-294)||(32057144-32057200)
chr3 (238-294)||(18510829-18510885)
chr3 (238-294)||(18522570-18522626)
chr3 (238-286)||(18534671-18534719)
chr3 (238-294)||(29924879-29924935)
chr3 (238-294)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (1-202)||(6940-7141)
scaffold0390 (1-202)||(13956-14157)
scaffold0390 (238-294)||(7177-7233)
scaffold0390 (238-294)||(14193-14249)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-202)||(29308890-29309091)
chr6 (1-202)||(29315850-29316051)
chr6 (1-200)||(16566326-16566525)
chr6 (1-202)||(27381258-27381459)
chr6 (1-202)||(27471641-27471842)
chr6 (1-200)||(17684475-17684674)
chr6 (1-202)||(17691446-17691647)
chr6 (1-200)||(188983-189182)
chr6 (1-200)||(25537165-25537364)
chr6 (1-200)||(11651725-11651924)
chr6 (12-200)||(13359286-13359474)
chr6 (238-292)||(17691683-17691737)
chr6 (238-294)||(27381495-27381551)
chr6 (238-294)||(27471878-27471934)
chr6 (238-294)||(29308798-29308854)
chr6 (238-294)||(29315758-29315814)
chr6 (1-163)||(20553593-20553755)
chr6 (238-294)||(17684712-17684768)
chr6 (240-294)||(11651630-11651684)
chr6 (11-183)||(8509941-8510114)
chr6 (238-294)||(25537405-25537461)
chr6 (11-179)||(27925772-27925945)
chr6 (238-286)||(13359512-13359560)
chr6 (238-286)||(16566563-16566611)
chr6 (52-164)||(17850551-17850663)
chr6 (156-195)||(31258081-31258120)
chr6 (238-295)||(189221-189281)
chr6 (238-280)||(16394484-16394526)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1-202)||(21330254-21330455)
chr2 (1-202)||(18796506-18796707)
chr2 (11-200)||(18619807-18619995)
chr2 (57-196)||(19692598-19692737)
chr2 (11-137)||(20977957-20978083)
chr2 (238-296)||(21330493-21330551)
chr2 (11-168)||(18822115-18822274)
chr2 (238-294)||(19692773-19692829)
chr2 (11-166)||(36802664-36802820)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-202)||(18288-18489)
scaffold0220 (238-294)||(18196-18252)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (1-202)||(7107-7308)
scaffold0433 (238-294)||(7015-7071)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-202)||(24695472-24695673)
chr5 (1-202)||(18569869-18570070)
chr5 (1-200)||(19714504-19714703)
chr5 (1-196)||(19707224-19707419)
chr5 (14-197)||(27347497-27347679)
chr5 (11-196)||(22547032-22547217)
chr5 (93-202)||(39537962-39538071)
chr5 (17-198)||(17285754-17285935)
chr5 (238-294)||(24695709-24695765)
chr5 (17-198)||(17298907-17299088)
chr5 (1-136)||(18807040-18807175)
chr5 (238-294)||(19714742-19714798)
chr5 (93-196)||(31886537-31886640)
chr5 (238-294)||(19707462-19707518)
chr5 (238-294)||(27347722-27347778)
chr5 (1-89)||(39538701-39538789)
chr5 (238-286)||(18570108-18570156)
chr5 (239-294)||(39537870-39537925)
chr5 (86-176)||(33477389-33477479)
chr5 (84-152)||(11479420-11479489)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (1-202)||(993-1194)
scaffold0657 (238-295)||(900-957)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-202)||(25996-26197)
scaffold0186 (239-294)||(26231-26286)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-200)||(5531-5730)
scaffold0063 (238-286)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (19-200)||(230365-230545)
scaffold0008 (238-294)||(230584-230640)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (238-294)||(23769-23825)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (138-202)||(8446-8510)
scaffold0176 (238-294)||(8546-8602)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (238-294)||(16523-16579)
scaffold0326 (169-202)||(16615-16648)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (238-294)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (238-294)||(8944-9000)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (238-292)||(10202-10256)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (258-294)||(1-37)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (242-294)||(5878-5930)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (101-133)||(92235-92267)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 2327 - 2528
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2327 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 2426  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2427 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 2526  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  2527 gt 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11218 - 11419
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11218 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 11317  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11318 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 11417  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  11418 gt 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21940866 - 21940665
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940866 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 21940767  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21940766 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcatt 21940667  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  21940666 gt 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28554885
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 28554985  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554984 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6094313 - 6094129
Alignment:
Q  12 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6094313 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaatt 6094214  T
Q  112 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094213 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22171688 - 22171491
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22171688 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatggg 22171591  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22171590 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24642850 - 24642655
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24642850 agtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacggg 24642751  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642750 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  69 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattatttt 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  169 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070105
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 22070105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642556
Alignment:
Q  242 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  111 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctaggaactttattattttgaaa 172  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 38232383 - 38232570
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  || |||||| | ||||||||||   |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  ||| |||||||||     
T  38232383 agtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaatgga 38232481  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    || |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232482 gtgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttatta 164  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  123 aatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaa 181  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2375000 - 2374947
Alignment:
Q  241 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||    
T  2375000 gatacaaagccaaatccaatcaatacatatttattattagggcttattccaaca 2374947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  257 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19926766 - 19926967
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926766 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 19926865  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926866 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 19926965  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  19926966 gt 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26970664 - 26970463
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970664 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 26970565  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970564 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 26970465  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  26970464 gt 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 55612884 - 55612683
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55612884 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatggg 55612785  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612784 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 55612685  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  55612684 gt 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5707521 - 5707320
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707521 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 5707422  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707421 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 5707322  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  5707321 gt 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26963841 - 26963640
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963841 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 26963742  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963741 gtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 26963642  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  26963641 gt 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5714149 - 5713948
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714149 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 5714050  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714049 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 5713950  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  5713949 gt 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10621339 - 10621540
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621339 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 10621438  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621439 ctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 10621538  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  10621539 gt 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 868798 - 868597
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  868798 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggg 868699  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  868698 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 868599  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  868598 gt 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10628418 - 10628619
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628418 agtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 10628517  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628518 ctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 10628617  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  10628618 gt 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18262413 - 18262214
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18262413 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggg 18262314  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262313 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 28393140 - 28393339
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28393140 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatggg 28393239  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28393240 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 4426610 - 4426808
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  4426610 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgtttaacggg 4426708  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426709 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18269274 - 18269070
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18269274 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggg 18269175  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataaagaaat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  18269174 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 18269075  T
Q  196 gcctt 200  Q
    |||||    
T  18269074 gcctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8845394 - 8845215
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8845394 cataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatctcacaat 8845295  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845294 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8858358 - 8858179
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8858358 cataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatctcacaat 8858259  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858258 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  87 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  187 taaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20311480 - 20311299
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20311480 aatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 20311381  T
Q  114 gttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 194  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311380 gttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5616406 - 5616215
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcaca 108  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||| ||| |||||      
T  5616406 cataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacgggatctcatg 5616307  T
Q  109 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5616306 atttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 5668141 - 5668327
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcaca 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   ||||||||| ||||||     
T  5668141 cataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacg 5668239  T
Q  109 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5668240 attaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 10677561 - 10677753
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||    
T  10677561 agtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcac--taaagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg 10677658  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
     |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||  ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10677659 -tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 10891201 - 10891393
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||    
T  10891201 agtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcac--taaagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg 10891298  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
     |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||  ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10891299 -tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927063
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 19927063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35223760 - 35223576
Alignment:
Q  2 gtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  |||| | |       
T  35223760 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgttttacg--- 35223664  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
           ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35223663 -------attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142430
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacata 17142430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  240 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426904
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacat 4426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074361
Alignment:
Q  86 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctaggaactttattatttt 168  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctagaaatgttattatttt 39074361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 21454153 - 21454319
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || |||| || ||| |||||||| |||||||  |||| ||| | |||| | || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  21454153 cataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataattaatggggtctcaatat 21454252  T
Q  111 taagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaa 176  Q
    ||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21454253 taagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 279
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 279  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 39074218 - 39074270
Alignment:
Q  13 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacg 65  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  39074218 taatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  93 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20311261 - 20311207
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20311261 catgatacaaagccaaatccaatgaatacagattggctattacagcttactccaa 20311207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24700006 - 24699958
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24700006 catgatacaaaaccaaattcaatcaatatagattggttattcgggctta 24699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 56516255 - 56516124
Alignment:
Q  3 tctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagt-ttccttatgtttaatgggg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||  |||| ||||||  |    
T  56516255 tctacctacataatagtctctatgttttaatactatcgttattcacaataaagcttgactatagatacttcaagaataatgttctatatg-ttaatgaag 56516157  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccatta 134  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  56516156 tctcacaattaagtcacaattaatgtttcatta 56516124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18252231 - 18252030
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252231 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 18252132  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252131 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18252032  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  18252031 gt 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18532520 - 18532721
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532520 agtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 18532619  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532620 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18532719  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  18532720 gt 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 27131415 - 27131616
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131415 agtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 27131514  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131515 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27131614  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  27131615 gt 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21171239 - 21171438
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  21171239 agtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacggg 21171338  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171339 gtctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 27310583 - 27310782
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  27310583 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacgtg 27310682  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310683 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 16359041 - 16359240
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16359041 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacggg 16359140  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359141 gtctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 36816649 - 36816834
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  36816649 cataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacggagtctcacaat 36816748  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816749 taatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 3855937 - 3856126
Alignment:
Q  13 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatta 112  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3855937 taatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaatta 3856036  T
Q  113 agttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3856037 agttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgccttgt 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Original strand, 22657241 - 22657429
Alignment:
Q  15 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22657241 atagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaaggggtctcacaattaag 22657340  T
Q  115 ttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22657341 ttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 27277564 - 27277756
Alignment:
Q  2 gtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||||   ||    
T  27277564 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaa-aagg 27277662  T
Q  102 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||| | ||||||| | || ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27277663 tctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 297
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532816
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 18532816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 12006563 - 12006712
Alignment:
Q  19 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 118  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||  ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |     
T  12006563 tctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacgattaaggcac 12006662  T
Q  119 acttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattatttt 168  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12006663 acttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 12014300 - 12014457
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||   || |||||||||||||| ||| || ||    
T  12014300 cataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggatctaacgat 12014399  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattatttt 168  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  12014400 taatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 9917942 - 9918106
Alignment:
Q  19 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||||   || |||||||    
T  9917942 tctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tctcgtgatcaagttat 9918040  T
Q  119 acttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918041 acttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  127 ttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816926
Alignment:
Q  241 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657521
Alignment:
Q  242 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  95 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaa 172  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 172
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  95 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaa 172  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29327985 - 29327784
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327985 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 29327886  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327885 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 29327786  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  29327785 gt 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11536068 - 11536269
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11536068 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggg 11536167  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536168 gtctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 11536267  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  11536268 gt 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11542986 - 11543187
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11542986 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggg 11543085  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11543086 gtctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcatt 11543185  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  11543186 gt 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15152644 - 15152445
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  15152644 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacggg 15152545  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152544 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15148343 - 15148144
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15148343 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacggg 15148244  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15148243 gtctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18561208 - 18561009
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  18561208 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacggg 18561109  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561108 gtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12751017 - 12750828
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  12751017 cataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacgaggtctcacaat 12750918  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750917 taagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12738737 - 12738542
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  12738737 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacaag 12738638  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738637 gtctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 18257858 - 18258047
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18257858 cataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggtctcacaat 18257957  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257958 taagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738441
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacata 12738441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2365081 - 2364917
Alignment:
Q  15 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaag 114  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||| | ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  2365081 atagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatgggttctcacgattaag 2364983  T
Q  115 ttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaa 180  Q
      | |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  2364982 ccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39112002 - 39111819
Alignment:
Q  12 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||  |  ||| |||||||||| ||||  | ||| |||   |||||| ||||||||||||| |  ||||    |||    
T  39112002 ataatagtctctatattttaatgttatttcgtttcacaataaagctggactgtgaatatttttgaaatagtgtccttatgtttaaagatgtcttgtgatt 39111903  T
Q  112 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111902 aagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7396380 - 7396237
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  | ||| || ||| ||||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  7396380 cataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaagat 7396281  T
Q  111 taagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 153  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7396280 taagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctag 7396237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  85 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234170
Alignment:
Q  87 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaacttta 161  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattctataaacttta 10234170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 202
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  170 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6110265 - 6110064
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110265 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 6110166  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110165 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 6110066  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  6110065 gt 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10572598 - 10572799
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572598 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 10572697  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572698 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 10572797  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  10572798 gt 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 16482489 - 16482688
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16482489 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatggg 16482588  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482589 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 17781124 - 17781319
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781124 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 17781223  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781224 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15600890 - 15601091
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600890 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 15600989  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15600990 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 15601089  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  15601090 gt 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15607435 - 15607636
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607435 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 15607534  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15607535 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 15607634  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  15607635 gt 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18522864 - 18522665
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18522864 agtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatggg 18522765  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522764 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13211503 - 13211305
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211503 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 13211404  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211403 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13248808 - 13248607
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248808 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 13248709  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248708 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 13248609  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  13248608 gt 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15357592 - 15357793
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15357592 agtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggg 15357691  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15357692 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 15357791  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  15357792 gt 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 10579361 - 10579556
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579361 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 10579460  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579461 gtctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490488
Alignment:
Q  16 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  116 tatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18520176 - 18519980
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||    
T  18520176 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacggg 18520080  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520079 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19089751 - 19089946
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  19089751 agtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaaggg 19089850  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089851 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 17200190 - 17200389
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17200190 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaaggg 17200289  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200290 gtatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 15342225 - 15342407
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15342225 agtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggg 15342324  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342325 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13517012 - 13516813
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  13517012 agtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacggg 13516913  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516912 gtctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 202
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  41 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  141 ctaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 32056906 - 32057101
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  32056906 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacggg 32057005  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057006 gtcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 1647537 - 1647726
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1647537 cataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaat 1647636  T
Q  111 taag----ttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647637 taagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200128
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29925162 - 29924971
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29925162 cataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaat 29925063  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925062 taaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29974315 - 29974124
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29974315 cataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaat 29974216  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974215 taaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200434
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 24253394 - 24253589
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  24253394 agtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatggg 24253493  T
Q  101 g-tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 195  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253494 gatctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17136560 - 17136465
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaa 96  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17136560 agtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  138 ggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 10579603 - 10579653
Alignment:
Q  244 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579603 acaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200483
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18510968 - 18510924
Alignment:
Q  156 actttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510968 actttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 10572840 - 10572890
Alignment:
Q  244 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572840 acaaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781414
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090041
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7141
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6940 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatagg 7039  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7040 gtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 7139  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  7140 gt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13956 - 14157
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13956 agtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 14055  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14056 gtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 14155  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  14156 gt 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29309091 - 29308890
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309091 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 29308992  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308991 ctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 29308892  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  29308891 gt 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29316051 - 29315850
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316051 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 29315952  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315951 ctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 29315852  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  29315851 gt 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 16566326 - 16566525
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16566326 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacggg 16566425  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566426 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 27381258 - 27381459
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27381258 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatggg 27381357  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381358 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27381457  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  27381458 gt 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 27471641 - 27471842
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27471641 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatggg 27471740  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471741 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27471840  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  27471841 gt 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 17684475 - 17684674
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17684475 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggg 17684574  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684575 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17691446 - 17691647
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17691446 agtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatggg 17691545  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691546 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17691645  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  17691646 gt 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 188983 - 189182
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  188983 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatggg 189082  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189083 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 25537165 - 25537364
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  25537165 agtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacggg 25537264  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537265 gtctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11651924 - 11651725
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11651924 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatggg 11651825  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651824 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 13359286 - 13359474
Alignment:
Q  12 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| || |||| |||    
T  13359286 ataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggagtttcacgatt 13359385  T
Q  112 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13359386 aagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381551
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471934
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20553593 - 20553755
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||  || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||||||||    
T  20553593 agtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatggg 20553692  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttatt 163  Q
     |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  20553693 atctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  240 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8510114 - 8509941
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcacaa 109  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  |||||||||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| ||    
T  8510114 cataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcataa 8510015  T
Q  110 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaat 183  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510014 ttaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27925945 - 27925772
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||| ||    
T  27925945 cataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcacgat 27925846  T
Q  111 taagt--tatactta---atgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaaca 179  Q
    |||||   | |||||   ||||||| ||||||  ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27925845 taagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 164
Target Start/End: Original strand, 17850551 - 17850663
Alignment:
Q  52 aaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattct 151  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| || | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| |    
T  17850551 aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaattggatatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattat 17850650  T
Q  152 aggaactttatta 164  Q
    ||| |||||||||    
T  17850651 agggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 195
Target Start/End: Original strand, 31258081 - 31258120
Alignment:
Q  156 actttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258081 actttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189281
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacat 189281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 280
Target Start/End: Original strand, 16394484 - 16394526
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattag 280  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16394484 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattgtctattag 16394526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 21330254 - 21330455
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330254 agtccacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 21330353  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21330354 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 21330453  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  21330454 gt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18796707 - 18796506
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| || | |    
T  18796707 agtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaagag 18796608  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  18796607 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaattcctt 18796508  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  18796507 gt 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18619995 - 18619807
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18619995 cataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tctcataat 18619897  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18619896 taagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  57 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaa 156  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  157 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20978083 - 20977957
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  20978083 cataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatgat 20977984  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaac 137  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977983 taaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330551
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 21330551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18822274 - 18822115
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  18822274 cataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacgat 18822175  T
Q  111 taagttatacttaa-tgttcca-ttaaacggactaactattctaggaactttattatttt 168  Q
    ||||  | |||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||    
T  18822174 taagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  || | || ||||| |||||||  ||| |||||| | || || |||||||||   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  111 taagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctaggaactttattatt 166  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | | |||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18489 - 18288
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18489 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 18390  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389 gtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18290  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  18289 gt 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7308 - 7107
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7308 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 7209  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7208 gtctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatacctt 7109  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  7108 gt 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24695472 - 24695673
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24695472 agtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 24695571  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695572 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 24695671  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  24695672 gt 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18569869 - 18570070
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  18569869 agtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacggg 18569968  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569969 gtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 18570068  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  18570069 gt 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 19714504 - 19714703
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  19714504 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacggg 19714603  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714604 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19707224 - 19707419
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  19707224 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacggg 19707323  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707324 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  14 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  114 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 197  Q
    || | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 22547032 - 22547217
Alignment:
Q  11 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| ||||||| | |||||| ||    
T  22547032 cataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgagatctcacgat 22547131  T
Q  111 taagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22547132 taagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  93 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  193 aatgccttgt 202  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  17 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 116  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  117 atacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 198  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  17 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 116  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  117 atacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 198  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 18807040 - 18807175
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtttaatgg 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaatgg 18807138  T
Q  100 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 136  Q
     ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807139 tgtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  93 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 192  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  193 aatg 196  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 39538789 - 39538701
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcctta 89  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538789 agtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 176
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  86 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaa 176  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  84 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1194 - 993
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1194 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatggg 1095  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1094 gtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 995  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  994 gt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 25996 - 26197
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25996 agtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 26095  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26096 gtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtctt 26195  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  26196 gt 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  239 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5730 - 5531
Alignment:
Q  1 agtctacctccataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  5730 agtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacggg 5631  T
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5630 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  19 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  119 acttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  138 ggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16523
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  169 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 292
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  238 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 292  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  258 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5878
Alignment:
Q  242 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 294  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92235
Alignment:
Q  101 gtctcacaattaagttatacttaatgttccatt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatt 92235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University