View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15408_high_16 (Length: 364)

Name: NF15408_high_16
Description: NF15408
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15408_high_16
NF15408_high_16
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (18-364)||(4586-4933)
scaffold0077 (156-360)||(23767-23975)
scaffold0077 (156-360)||(18136-18344)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (18-364)||(29610-29956)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (18-364)||(23102426-23102773)
chr2 (57-364)||(23089998-23090306)
chr2 (18-361)||(23169269-23169613)
chr2 (18-361)||(23580526-23580870)
chr2 (131-364)||(9241308-9241542)
chr2 (46-361)||(23877727-23878045)
chr2 (20-360)||(26582538-26582880)
chr2 (137-364)||(27367551-27367779)
chr2 (134-364)||(200619-200850)
chr2 (131-361)||(6482296-6482528)
chr2 (131-361)||(6485763-6485995)
chr2 (18-359)||(21907109-21907455)
chr2 (134-364)||(43693379-43693610)
chr2 (131-364)||(20260799-20261032)
chr2 (138-364)||(6744292-6744519)
chr2 (23-359)||(23263848-23264188)
chr2 (136-361)||(5706985-5707211)
chr2 (156-364)||(22809882-22810092)
chr2 (131-321)||(10685637-10685826)
chr2 (114-359)||(21073951-21074200)
chr2 (156-364)||(2105577-2105787)
chr2 (134-364)||(19649509-19649743)
chr2 (156-360)||(23290925-23291133)
chr2 (156-360)||(24658773-24658981)
chr2 (200-363)||(19703449-19703615)
chr2 (156-361)||(20724032-20724241)
chr2 (156-356)||(27295980-27296181)
chr2 (156-356)||(12572311-12572512)
chr2 (156-356)||(12578793-12578994)
chr2 (156-321)||(27785695-27785859)
chr2 (156-321)||(27790916-27791080)
chr2 (156-361)||(24943376-24943585)
chr2 (131-364)||(26884128-26884364)
chr2 (131-364)||(6261513-6261748)
chr2 (23-233)||(23269064-23269276)
chr2 (23-233)||(23275933-23276145)
chr2 (156-360)||(23752791-23752998)
chr2 (131-364)||(27210944-27211181)
chr2 (156-360)||(24652329-24652537)
chr2 (134-242)||(28971371-28971478)
chr2 (131-364)||(19662789-19663026)
chr2 (183-364)||(27208609-27208795)
chr2 (130-238)||(23062475-23062583)
chr2 (134-238)||(21133349-21133453)
chr2 (131-364)||(29280916-29281153)
chr2 (270-359)||(22796597-22796688)
chr2 (272-361)||(28971246-28971336)
chr2 (131-364)||(9497-9734)
chr2 (272-361)||(21133220-21133310)
chr2 (272-361)||(23062668-23062759)
chr2 (200-364)||(25181797-25181966)
chr2 (115-170)||(15643412-15643468)
chr2 (156-212)||(22703489-22703545)
chr2 (131-238)||(45028484-45028588)
chr2 (335-364)||(6261432-6261461)
chr2 (335-364)||(19662708-19662737)
chr2 (335-364)||(24660648-24660677)
chr2 (335-364)||(38931522-38931551)
chr2 (115-170)||(13101297-13101353)
chr2 (336-364)||(20914297-20914325)
chr2 (336-364)||(23148712-23148740)
chr2 (336-364)||(23560502-23560530)
chr2 (95-170)||(24660395-24660470)
chr2 (134-170)||(28292698-28292734)
chr2 (115-170)||(32911606-32911662)
[»] chr7 (97 HSPs)
chr7 (18-363)||(16676053-16676400)
chr7 (18-363)||(17650290-17650636)
chr7 (18-364)||(11390294-11390641)
chr7 (18-364)||(11383806-11384153)
chr7 (18-364)||(20328216-20328563)
chr7 (20-361)||(13006170-13006513)
chr7 (18-364)||(21232001-21232348)
chr7 (23-364)||(13123939-13124280)
chr7 (134-364)||(4279941-4280172)
chr7 (134-364)||(19616273-19616504)
chr7 (20-364)||(12710868-12711212)
chr7 (126-364)||(14421324-14421564)
chr7 (20-361)||(12591606-12591948)
chr7 (20-361)||(13742369-13742711)
chr7 (114-364)||(18606823-18607075)
chr7 (131-364)||(11302827-11303060)
chr7 (131-358)||(23665802-23666029)
chr7 (131-358)||(29795705-29795932)
chr7 (131-358)||(29799524-29799751)
chr7 (156-364)||(14281612-14281822)
chr7 (156-364)||(6411821-6412031)
chr7 (156-364)||(35962704-35962914)
chr7 (156-364)||(1612623-1612833)
chr7 (158-359)||(19599844-19600046)
chr7 (156-361)||(11220081-11220290)
chr7 (156-364)||(15338826-15339035)
chr7 (156-364)||(15723183-15723392)
chr7 (156-321)||(20579954-20580118)
chr7 (156-321)||(23201515-23201679)
chr7 (156-321)||(23507642-23507806)
chr7 (156-364)||(15710959-15711168)
chr7 (156-356)||(806973-807174)
chr7 (156-355)||(16109044-16109243)
chr7 (156-358)||(14431989-14432192)
chr7 (156-321)||(11631953-11632117)
chr7 (156-321)||(18049243-18049407)
chr7 (156-321)||(18055722-18055886)
chr7 (131-364)||(147042-147280)
chr7 (156-364)||(3289746-3289956)
chr7 (131-364)||(14320530-14320767)
chr7 (115-297)||(31154325-31154509)
chr7 (131-364)||(14565683-14565920)
chr7 (244-358)||(14128259-14128374)
chr7 (270-358)||(36306032-36306121)
chr7 (131-363)||(20907326-20907562)
chr7 (131-364)||(18871841-18872078)
chr7 (117-364)||(2965891-2966143)
chr7 (131-364)||(15166749-15166987)
chr7 (134-238)||(37244402-37244506)
chr7 (130-364)||(2464287-2464524)
chr7 (130-364)||(3858321-3858558)
chr7 (134-238)||(15086017-15086120)
chr7 (272-361)||(18958394-18958484)
chr7 (131-364)||(16008059-16008296)
chr7 (114-235)||(13678239-13678361)
chr7 (134-238)||(3327778-3327881)
chr7 (134-238)||(32771473-32771576)
chr7 (272-361)||(37244273-37244363)
chr7 (147-258)||(36306109-36306222)
chr7 (274-364)||(836990-837082)
chr7 (274-364)||(1202170-1202262)
chr7 (134-242)||(18958519-18958627)
chr7 (272-364)||(3327920-3328014)
chr7 (272-361)||(15085888-15085978)
chr7 (134-238)||(16952331-16952434)
chr7 (272-361)||(26289733-26289823)
chr7 (246-360)||(16187693-16187810)
chr7 (270-364)||(832947-833043)
chr7 (270-364)||(1198127-1198223)
chr7 (272-361)||(14178973-14179065)
chr7 (270-360)||(14945836-14945928)
chr7 (270-360)||(15373429-15373521)
chr7 (131-364)||(10897149-10897385)
chr7 (155-238)||(833041-833124)
chr7 (155-238)||(1198221-1198304)
chr7 (156-258)||(14945916-14946020)
chr7 (156-258)||(15373509-15373613)
chr7 (274-361)||(16952202-16952290)
chr7 (97-171)||(19145506-19145581)
chr7 (97-171)||(20744905-20744980)
chr7 (134-216)||(46174303-46174383)
chr7 (114-171)||(14266165-14266223)
chr7 (335-364)||(10896982-10897011)
chr7 (335-364)||(10897068-10897097)
chr7 (335-364)||(12547358-12547387)
chr7 (335-364)||(12694772-12694801)
chr7 (335-364)||(14038761-14038790)
chr7 (335-364)||(14348791-14348820)
chr7 (335-364)||(15167022-15167051)
chr7 (335-364)||(16008348-16008377)
chr7 (335-364)||(16073930-16073959)
chr7 (131-172)||(16089996-16090037)
chr7 (335-364)||(18872130-18872159)
chr7 (131-172)||(29182212-29182253)
chr7 (128-169)||(46624814-46624855)
chr7 (335-364)||(46625033-46625062)
chr7 (131-171)||(14255889-14255929)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (18-364)||(22439693-22440040)
chr5 (134-364)||(1857471-1857702)
chr5 (134-364)||(21675439-21675670)
chr5 (131-361)||(19510974-19511206)
chr5 (131-364)||(37805284-37805517)
chr5 (20-361)||(23527311-23527656)
chr5 (131-358)||(9775442-9775669)
chr5 (131-364)||(23112704-23112939)
chr5 (156-364)||(758219-758427)
chr5 (156-364)||(20937594-20937804)
chr5 (156-364)||(22312796-22313005)
chr5 (156-364)||(10816774-10816985)
chr5 (156-364)||(23538801-23539012)
chr5 (156-364)||(22509137-22509346)
chr5 (156-356)||(21678242-21678443)
chr5 (156-360)||(6404465-6404673)
chr5 (156-364)||(22007888-22008102)
chr5 (156-356)||(17264770-17264971)
chr5 (156-321)||(22175014-22175179)
chr5 (156-356)||(17271252-17271453)
chr5 (131-360)||(34829003-34829236)
chr5 (156-361)||(6728228-6728438)
chr5 (131-364)||(42960057-42960292)
chr5 (131-364)||(28371390-28371627)
chr5 (131-364)||(38145719-38145954)
chr5 (156-360)||(22232605-22232813)
chr5 (134-216)||(24669109-24669191)
chr5 (134-216)||(24738878-24738960)
chr5 (134-216)||(24751647-24751729)
chr5 (18-179)||(18409187-18409349)
chr5 (131-363)||(22336082-22336318)
chr5 (190-361)||(18408968-18409130)
chr5 (134-238)||(27635973-27636076)
chr5 (131-364)||(19235822-19236059)
chr5 (131-364)||(22466701-22466938)
chr5 (131-363)||(22339620-22339856)
chr5 (131-364)||(22749728-22749966)
chr5 (133-361)||(20819107-20819339)
chr5 (133-361)||(20826207-20826439)
chr5 (272-360)||(21829622-21829712)
chr5 (115-238)||(19801965-19802086)
chr5 (131-364)||(22460077-22460314)
chr5 (272-361)||(24668959-24669050)
chr5 (272-361)||(24738728-24738819)
chr5 (272-361)||(24751497-24751588)
chr5 (115-238)||(19362556-19362677)
chr5 (272-361)||(27635844-27635934)
chr5 (335-364)||(427403-427432)
chr5 (335-364)||(10035300-10035329)
chr5 (335-364)||(17022824-17022853)
chr5 (335-364)||(18819091-18819120)
chr5 (335-364)||(20772100-20772129)
chr5 (335-364)||(20780875-20780904)
chr5 (335-364)||(20843329-20843358)
chr5 (335-364)||(21624714-21624743)
chr5 (335-364)||(21869514-21869543)
chr5 (335-364)||(21873794-21873823)
chr5 (335-364)||(22336371-22336400)
chr5 (335-364)||(22339909-22339938)
chr5 (335-364)||(22750001-22750030)
chr5 (131-172)||(28890519-28890560)
chr5 (131-172)||(28897223-28897264)
chr5 (131-172)||(28910423-28910464)
chr5 (131-172)||(28925691-28925732)
chr5 (131-172)||(28932114-28932155)
chr5 (131-172)||(28933618-28933659)
chr5 (131-172)||(28946818-28946859)
chr5 (335-364)||(37599170-37599199)
chr5 (335-364)||(37599251-37599280)
chr5 (131-172)||(37599454-37599495)
chr5 (335-364)||(42960344-42960373)
chr5 (335-363)||(15193995-15194023)
chr5 (336-364)||(21901825-21901853)
chr5 (115-170)||(23076436-23076492)
chr5 (115-170)||(23081884-23081940)
chr5 (115-170)||(24057558-24057614)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (18-364)||(17156923-17157270)
chr3 (18-364)||(24191624-24191971)
chr3 (18-364)||(16802417-16802764)
chr3 (18-312)||(17190698-17190992)
chr3 (74-361)||(23174076-23174363)
chr3 (20-364)||(41456115-41456463)
chr3 (137-364)||(13968801-13969029)
chr3 (137-364)||(13974276-13974504)
chr3 (134-364)||(14084509-14084740)
chr3 (134-364)||(14089910-14090141)
chr3 (136-364)||(9532829-9533059)
chr3 (134-364)||(24123171-24123402)
chr3 (134-364)||(49399451-49399682)
chr3 (134-364)||(8583262-8583493)
chr3 (18-359)||(17243651-17243996)
chr3 (131-364)||(12304724-12304957)
chr3 (134-364)||(31690562-31690796)
chr3 (156-364)||(14544158-14544368)
chr3 (156-356)||(12200203-12200403)
chr3 (159-364)||(14292706-14292914)
chr3 (114-363)||(18888923-18889177)
chr3 (114-364)||(18899962-18900217)
chr3 (156-364)||(14652683-14652892)
chr3 (156-364)||(12961369-12961580)
chr3 (18-360)||(18913867-18914213)
chr3 (156-356)||(13909529-13909728)
chr3 (156-356)||(13939988-13940187)
chr3 (134-364)||(31943419-31943653)
chr3 (156-364)||(34852175-34852386)
chr3 (156-356)||(13946474-13946673)
chr3 (156-364)||(16382847-16383056)
chr3 (156-358)||(16838475-16838677)
chr3 (156-364)||(17199007-17199218)
chr3 (156-321)||(4677164-4677328)
chr3 (156-321)||(8742922-8743086)
chr3 (156-321)||(8761092-8761256)
chr3 (156-321)||(41175477-41175641)
chr3 (156-321)||(41180615-41180779)
chr3 (156-359)||(13203511-13203715)
chr3 (156-321)||(44775201-44775365)
chr3 (156-321)||(44780385-44780549)
chr3 (156-364)||(18719101-18719312)
chr3 (156-361)||(11964871-11965080)
chr3 (156-361)||(19443469-19443679)
chr3 (131-360)||(38312118-38312352)
chr3 (190-361)||(13313906-13314082)
chr3 (246-358)||(16829952-16830065)
chr3 (270-360)||(23173876-23173967)
chr3 (190-361)||(13303230-13303406)
chr3 (190-361)||(13324818-13324994)
chr3 (246-364)||(12255215-12255334)
chr3 (220-360)||(18129772-18129915)
chr3 (156-258)||(23173786-23173888)
chr3 (156-292)||(12363445-12363583)
chr3 (246-360)||(12479675-12479791)
chr3 (136-216)||(11850780-11850860)
chr3 (156-360)||(18136286-18136493)
chr3 (131-364)||(23371841-23372078)
chr3 (131-364)||(14764095-14764332)
chr3 (272-361)||(10597701-10597791)
chr3 (246-356)||(12355944-12356056)
chr3 (246-356)||(12362493-12362605)
chr3 (251-360)||(15518591-15518703)
chr3 (131-364)||(51300077-51300314)
chr3 (132-364)||(20249101-20249337)
chr3 (134-238)||(12419369-12419472)
chr3 (156-280)||(16830055-16830178)
chr3 (115-297)||(10553831-10554015)
chr3 (272-361)||(17496239-17496330)
chr3 (134-242)||(10597826-10597933)
chr3 (272-361)||(18756930-18757020)
chr3 (131-361)||(10390365-10390599)
chr3 (131-361)||(10415474-10415708)
chr3 (131-361)||(10422144-10422378)
chr3 (131-364)||(12034312-12034549)
chr3 (272-364)||(13692040-13692135)
chr3 (272-359)||(11305740-11305829)
chr3 (131-172)||(14864763-14864804)
chr3 (131-172)||(17130672-17130713)
chr3 (115-170)||(8374077-8374133)
chr3 (332-364)||(12255747-12255779)
chr3 (115-170)||(30597011-30597067)
chr3 (131-170)||(3802512-3802551)
chr3 (144-238)||(18757059-18757153)
chr3 (335-364)||(1989226-1989255)
chr3 (335-364)||(11850567-11850596)
chr3 (335-364)||(13036949-13036978)
chr3 (335-364)||(14764014-14764043)
chr3 (335-364)||(15011967-15011996)
chr3 (335-364)||(17512726-17512755)
chr3 (335-364)||(20249037-20249066)
chr3 (335-364)||(23371760-23371789)
chr3 (335-364)||(51300365-51300394)
chr3 (115-170)||(15374638-15374694)
chr3 (156-238)||(17496119-17496200)
chr3 (115-170)||(18957721-18957777)
chr3 (134-170)||(20187671-20187707)
chr3 (335-363)||(38312055-38312083)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (18-364)||(4267-4614)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (18-364)||(15424-15771)
scaffold0025 (220-364)||(71154-71299)
scaffold0025 (273-364)||(76837-76931)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (18-364)||(2428-2775)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (46-364)||(21566155-21566474)
chr6 (20-361)||(29615170-29615511)
chr6 (20-361)||(12167101-12167444)
chr6 (20-361)||(19286010-19286353)
chr6 (20-361)||(19877193-19877537)
chr6 (20-361)||(19882969-19883313)
chr6 (20-361)||(19786842-19787186)
chr6 (134-364)||(24562260-24562491)
chr6 (131-364)||(12941775-12942008)
chr6 (131-358)||(28290182-28290409)
chr6 (104-361)||(25470662-25470922)
chr6 (138-364)||(23837562-23837790)
chr6 (136-361)||(34647623-34647849)
chr6 (136-361)||(34640949-34641175)
chr6 (21-196)||(18799251-18799425)
chr6 (24-361)||(24513796-24514137)
chr6 (21-196)||(18788271-18788445)
chr6 (156-359)||(19726606-19726810)
chr6 (160-364)||(22906969-22907175)
chr6 (240-364)||(18788443-18788568)
chr6 (240-364)||(18799423-18799548)
chr6 (235-364)||(19439782-19439912)
chr6 (154-364)||(1592757-1592968)
chr6 (156-364)||(29416432-29416643)
chr6 (156-356)||(33682180-33682380)
chr6 (156-361)||(19588551-19588760)
chr6 (156-321)||(14033142-14033306)
chr6 (156-321)||(23835057-23835221)
chr6 (156-321)||(27562551-27562715)
chr6 (229-361)||(11289573-11289705)
chr6 (156-360)||(19818899-19819106)
chr6 (198-364)||(8760394-8760562)
chr6 (156-361)||(14375279-14375489)
chr6 (156-321)||(28359868-28360032)
chr6 (156-360)||(2708368-2708577)
chr6 (156-359)||(937655-937859)
chr6 (156-361)||(14724364-14724573)
chr6 (246-364)||(8768141-8768260)
chr6 (115-364)||(15457423-15457675)
chr6 (115-364)||(15464018-15464270)
chr6 (156-361)||(14616240-14616449)
chr6 (156-361)||(14581826-14582034)
chr6 (156-360)||(19300639-19300846)
chr6 (159-364)||(21724728-21724934)
chr6 (131-364)||(31251344-31251581)
chr6 (200-364)||(14995915-14996084)
chr6 (134-216)||(5290259-5290341)
chr6 (272-361)||(23234896-23234986)
chr6 (117-364)||(21365432-21365684)
chr6 (117-364)||(23969414-23969666)
chr6 (131-364)||(4476340-4476577)
chr6 (20-193)||(11283984-11284160)
chr6 (272-361)||(17414114-17414205)
chr6 (131-216)||(25347057-25347143)
chr6 (134-238)||(26418762-26418866)
chr6 (132-238)||(18786038-18786144)
chr6 (272-360)||(23233377-23233467)
chr6 (131-364)||(20008844-20009082)
chr6 (272-361)||(5290109-5290200)
chr6 (134-242)||(23235021-23235128)
chr6 (272-361)||(26418633-26418723)
chr6 (131-172)||(20011100-20011141)
chr6 (115-238)||(23021424-23021545)
chr6 (280-364)||(19472289-19472376)
chr6 (115-216)||(17207833-17207933)
chr6 (128-170)||(25395972-25396014)
chr6 (131-217)||(31250267-31250352)
chr6 (335-364)||(221852-221881)
chr6 (335-364)||(21469905-21469934)
chr6 (335-364)||(21476406-21476435)
chr6 (335-364)||(25347269-25347298)
chr6 (134-170)||(94630-94666)
chr6 (115-170)||(12447336-12447392)
chr6 (115-170)||(27767317-27767373)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (18-361)||(11846915-11847259)
chr4 (130-364)||(18212113-18212347)
chr4 (18-361)||(15406774-15407118)
chr4 (20-361)||(8046868-8047220)
chr4 (131-364)||(15533761-15533994)
chr4 (18-360)||(14485372-14485717)
chr4 (156-364)||(23121599-23121809)
chr4 (156-364)||(4831054-4831265)
chr4 (156-364)||(4834349-4834560)
chr4 (159-364)||(14484432-14484639)
chr4 (156-364)||(26077678-26077890)
chr4 (156-356)||(635739-635940)
chr4 (151-364)||(11171225-11171440)
chr4 (156-364)||(16156630-16156844)
chr4 (156-321)||(53748763-53748927)
chr4 (156-321)||(41799964-41800128)
chr4 (156-321)||(42701226-42701390)
chr4 (156-321)||(51602085-51602249)
chr4 (156-321)||(51607966-51608130)
chr4 (156-364)||(17000134-17000344)
chr4 (185-364)||(14048228-14048412)
chr4 (131-360)||(14910560-14910792)
chr4 (156-360)||(14556050-14556260)
chr4 (156-359)||(14062908-14063116)
chr4 (156-359)||(43284868-43285072)
chr4 (156-358)||(20940260-20940463)
chr4 (156-360)||(41529054-41529263)
chr4 (156-316)||(16152484-16152648)
chr4 (200-361)||(15324919-15325082)
chr4 (156-364)||(2585135-2585346)
chr4 (190-360)||(27905244-27905418)
chr4 (156-361)||(1651026-1651236)
chr4 (156-282)||(16221226-16221355)
chr4 (156-361)||(40908583-40908792)
chr4 (134-242)||(13452204-13452311)
chr4 (200-304)||(14048121-14048227)
chr4 (156-364)||(30146777-30146978)
chr4 (114-235)||(10977120-10977241)
chr4 (272-361)||(13453847-13453937)
chr4 (272-360)||(12931958-12932049)
chr4 (276-361)||(37881521-37881607)
chr4 (114-170)||(15306958-15307015)
chr4 (115-170)||(42220340-42220396)
chr4 (335-364)||(13886852-13886881)
chr4 (335-364)||(13887718-13887747)
chr4 (125-170)||(15244068-15244113)
chr4 (335-364)||(15244285-15244314)
chr4 (131-172)||(16147934-16147975)
chr4 (335-364)||(17176547-17176576)
chr4 (335-364)||(18261483-18261512)
chr4 (335-364)||(18271448-18271477)
chr4 (335-364)||(27849437-27849466)
chr4 (335-364)||(30237933-30237962)
chr4 (115-170)||(19128461-19128517)
chr4 (115-170)||(33097002-33097058)
chr4 (134-170)||(42956141-42956177)
chr4 (134-170)||(45959861-45959897)
chr4 (134-170)||(47872541-47872577)
chr4 (134-170)||(54845067-54845103)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (18-364)||(14057575-14057921)
chr8 (20-364)||(19902896-19903243)
chr8 (26-337)||(25409424-25409735)
chr8 (20-361)||(17053461-17053804)
chr8 (134-364)||(23825102-23825333)
chr8 (131-361)||(44476211-44476443)
chr8 (131-361)||(44479473-44479705)
chr8 (23-364)||(23865302-23865643)
chr8 (137-364)||(30766917-30767145)
chr8 (80-325)||(18609716-18609962)
chr8 (156-364)||(22025551-22025762)
chr8 (156-364)||(22063554-22063765)
chr8 (147-364)||(21282049-21282269)
chr8 (225-364)||(25110911-25111051)
chr8 (200-364)||(21668901-21669067)
chr8 (156-361)||(41009428-41009637)
chr8 (156-359)||(22177586-22177790)
chr8 (156-360)||(21326818-21327027)
chr8 (156-356)||(9273159-9273360)
chr8 (156-356)||(1804467-1804668)
chr8 (156-356)||(36799376-36799577)
chr8 (156-321)||(18681539-18681703)
chr8 (156-360)||(21322230-21322439)
chr8 (156-321)||(31567848-31568012)
chr8 (156-321)||(31573069-31573233)
chr8 (156-359)||(22050201-22050405)
chr8 (156-359)||(22055719-22055923)
chr8 (156-361)||(10606931-10607141)
chr8 (18-179)||(25110731-25110893)
chr8 (156-361)||(20973992-20974201)
chr8 (156-360)||(19988159-19988367)
chr8 (246-359)||(21300114-21300229)
chr8 (97-238)||(23653083-23653224)
chr8 (131-284)||(27942221-27942375)
chr8 (134-242)||(31412602-31412710)
chr8 (134-242)||(31418784-31418892)
chr8 (156-360)||(20839893-20840101)
chr8 (282-364)||(22176026-22176107)
chr8 (131-364)||(24321567-24321804)
chr8 (131-361)||(8728979-8729214)
chr8 (134-238)||(23653817-23653920)
chr8 (130-310)||(8596113-8596293)
chr8 (276-361)||(31412477-31412563)
chr8 (276-361)||(31418659-31418745)
chr8 (335-364)||(8728916-8728945)
chr8 (335-364)||(20012146-20012175)
chr8 (156-216)||(21300293-21300354)
chr8 (335-364)||(21683654-21683683)
chr8 (335-364)||(21688003-21688032)
chr8 (335-364)||(22743888-22743917)
chr8 (335-364)||(39363667-39363696)
chr8 (115-170)||(14416689-14416745)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (71-364)||(135-429)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (20-364)||(19664097-19664442)
chr1 (20-361)||(41110678-41111021)
chr1 (117-364)||(20438499-20438748)
chr1 (134-364)||(21542034-21542265)
chr1 (134-364)||(42095871-42096102)
chr1 (20-360)||(20045851-20046193)
chr1 (156-361)||(32650102-32650309)
chr1 (156-364)||(23066668-23066878)
chr1 (156-360)||(19778430-19778639)
chr1 (221-364)||(20242599-20242743)
chr1 (156-361)||(29554414-29554623)
chr1 (156-358)||(3706736-3706939)
chr1 (156-356)||(27280192-27280393)
chr1 (156-360)||(20941826-20942034)
chr1 (156-360)||(19961135-19961342)
chr1 (156-360)||(16883510-16883719)
chr1 (156-359)||(22448241-22448440)
chr1 (220-358)||(20838140-20838280)
chr1 (246-360)||(20824329-20824445)
chr1 (270-364)||(955033-955128)
chr1 (131-364)||(16371512-16371749)
chr1 (134-238)||(23195572-23195675)
chr1 (131-364)||(20852030-20852267)
chr1 (131-364)||(20858656-20858893)
chr1 (247-360)||(21732569-21732683)
chr1 (131-364)||(21705197-21705434)
chr1 (156-297)||(29534939-29535071)
chr1 (131-238)||(36614910-36615014)
chr1 (272-360)||(21664280-21664370)
chr1 (272-361)||(24108992-24109082)
chr1 (147-238)||(24079542-24079633)
chr1 (147-238)||(24109121-24109212)
chr1 (272-360)||(19666701-19666791)
chr1 (272-360)||(19853151-19853241)
chr1 (272-360)||(19859286-19859376)
chr1 (133-238)||(11156938-11157043)
chr1 (90-171)||(21987128-21987210)
chr1 (272-360)||(23195443-23195533)
chr1 (115-238)||(43088349-43088470)
chr1 (156-258)||(955116-955219)
chr1 (272-364)||(15316470-15316565)
chr1 (335-364)||(13226893-13226922)
chr1 (335-364)||(16371801-16371830)
chr1 (131-172)||(16669433-16669474)
chr1 (335-364)||(20108496-20108525)
chr1 (335-364)||(32650343-32650372)
chr1 (134-170)||(4231165-4231201)
chr1 (134-170)||(9269910-9269946)
chr1 (115-170)||(49327991-49328047)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (18-364)||(12844-13193)
scaffold0026 (156-357)||(63168-63370)
scaffold0026 (156-361)||(124441-124649)
scaffold0026 (131-364)||(110168-110405)
scaffold0026 (335-364)||(110457-110486)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (91-364)||(10135-10408)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (18-364)||(41584-41931)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (130-364)||(10226-10460)
[»] scaffold0124 (6 HSPs)
scaffold0124 (131-364)||(36785-37019)
scaffold0124 (18-287)||(44063-44334)
scaffold0124 (246-361)||(43962-44080)
scaffold0124 (204-321)||(40549-40664)
scaffold0124 (272-360)||(45014-45105)
scaffold0124 (272-360)||(9344-9435)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (21-358)||(174535-174875)
scaffold0001 (20-316)||(488991-489288)
scaffold0001 (156-360)||(95848-96055)
scaffold0001 (131-364)||(493924-494159)
scaffold0001 (115-238)||(178961-179082)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-364)||(9600-9946)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (20-364)||(110622-110967)
scaffold0029 (20-217)||(116657-116855)
scaffold0029 (130-364)||(92099-92336)
scaffold0029 (130-364)||(97825-98062)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (134-364)||(38379-38610)
scaffold0106 (156-360)||(46728-46936)
scaffold0106 (156-360)||(51001-51209)
scaffold0106 (335-364)||(28782-28811)
scaffold0106 (335-364)||(36368-36397)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (134-364)||(30113-30344)
scaffold0076 (134-364)||(35514-35745)
scaffold0076 (162-364)||(51668-51872)
scaffold0076 (115-170)||(19-75)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (134-364)||(46947-47178)
scaffold0028 (134-364)||(52352-52583)
scaffold0028 (335-364)||(1141-1170)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (134-364)||(174529-174760)
scaffold0011 (151-364)||(152356-152570)
scaffold0011 (156-360)||(258491-258700)
scaffold0011 (156-360)||(197409-197618)
scaffold0011 (272-360)||(252004-252094)
scaffold0011 (272-360)||(154248-154338)
scaffold0011 (272-356)||(147127-147213)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (18-356)||(16914-17253)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (18-359)||(102900-103244)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (18-356)||(392-731)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (23-359)||(115601-115941)
scaffold0004 (156-361)||(321062-321271)
scaffold0004 (156-361)||(326771-326980)
scaffold0004 (272-364)||(129656-129751)
scaffold0004 (114-170)||(129858-129915)
scaffold0004 (335-364)||(129592-129621)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (156-364)||(5148-5358)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (156-364)||(17477-17687)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (134-364)||(17368-17602)
scaffold0034 (134-364)||(10072-10306)
scaffold0034 (156-360)||(72229-72436)
scaffold0034 (130-238)||(35820-35928)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (156-364)||(5998-6208)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (156-364)||(14464-14673)
scaffold0239 (190-364)||(7181-7356)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (156-364)||(56413-56623)
scaffold0067 (156-364)||(47379-47589)
scaffold0067 (156-364)||(62799-63009)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (20-285)||(1-266)
[»] scaffold0461 (4 HSPs)
scaffold0461 (18-287)||(1125-1397)
scaffold0461 (18-287)||(8061-8333)
scaffold0461 (246-361)||(1024-1142)
scaffold0461 (246-361)||(7960-8078)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (18-287)||(1899-2172)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (156-364)||(4973-5184)
scaffold0222 (114-170)||(27951-28008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (156-359)||(41931-42135)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (156-360)||(8410-8619)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (134-364)||(298-532)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (156-364)||(141326-141534)
scaffold0021 (156-364)||(146566-146778)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (188-364)||(20485-20664)
scaffold0023 (156-303)||(156797-156944)
scaffold0023 (333-361)||(153311-153339)
[»] scaffold0348 (4 HSPs)
scaffold0348 (155-364)||(2918-3131)
scaffold0348 (156-360)||(1696-1904)
scaffold0348 (156-359)||(15451-15641)
scaffold0348 (335-364)||(8487-8516)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (156-360)||(16017-16225)
scaffold0243 (156-360)||(7997-8205)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (200-364)||(7293-7459)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (156-364)||(10341-10551)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (156-361)||(27861-28070)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (156-355)||(50948-51148)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (156-356)||(265100-265300)
scaffold0005 (156-356)||(258674-258874)
[»] scaffold0249 (3 HSPs)
scaffold0249 (18-360)||(7778-8125)
scaffold0249 (115-297)||(14832-15016)
scaffold0249 (335-364)||(14763-14792)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (181-364)||(8-181)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (156-364)||(14539-14747)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (156-361)||(16861-17071)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (18-128)||(49759-49869)
scaffold0019 (115-170)||(143920-143976)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (156-361)||(34776-34986)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (200-361)||(171780-171945)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (219-360)||(11912-12055)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (156-364)||(44200-44403)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (200-364)||(881-1049)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (156-361)||(3297-3496)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (159-361)||(5872-6077)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (156-312)||(27788-27945)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (156-361)||(13384-13593)
scaffold0301 (272-361)||(3326-3418)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (200-359)||(14052-14212)
scaffold0063 (156-359)||(24209-24413)
[»] scaffold1684 (1 HSPs)
scaffold1684 (18-141)||(1350-1473)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (200-360)||(24472-24637)
scaffold0261 (335-364)||(10622-10651)
scaffold0261 (335-364)||(18801-18830)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (156-360)||(44086-44294)
scaffold0010 (156-360)||(49152-49360)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (244-357)||(16982-17096)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (156-360)||(6939-7147)
scaffold0167 (335-364)||(20019-20048)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (156-290)||(2380-2516)
scaffold0203 (246-361)||(17073-17190)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (246-359)||(5638-5753)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (233-360)||(55939-56069)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (134-297)||(52670-52836)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (97-238)||(4221-4362)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (251-325)||(4-78)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (156-360)||(370396-370594)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (114-238)||(1852-1977)
scaffold0089 (272-364)||(2062-2156)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (131-364)||(2814-3051)
scaffold0544 (335-364)||(2733-2762)
[»] scaffold0720 (2 HSPs)
scaffold0720 (131-235)||(4264-4370)
scaffold0720 (270-364)||(4158-4255)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (130-238)||(16141-16249)
[»] scaffold0377 (3 HSPs)
scaffold0377 (270-364)||(7344-7440)
scaffold0377 (156-258)||(7253-7356)
scaffold0377 (333-364)||(3370-3401)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (114-235)||(132-254)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (270-359)||(57154-57245)
scaffold0061 (160-238)||(57328-57406)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (270-359)||(141388-141479)
scaffold0017 (160-238)||(141227-141305)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (134-216)||(509-591)
scaffold0326 (335-364)||(296-325)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (272-360)||(6758-6848)
[»] scaffold1726 (2 HSPs)
scaffold1726 (134-238)||(202-306)
scaffold1726 (271-361)||(344-435)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (272-364)||(25703-25798)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (134-216)||(26069-26152)
scaffold0104 (134-216)||(27451-27534)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (128-173)||(9-54)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (246-360)||(38636-38752)
scaffold0022 (246-360)||(136696-136812)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (132-238)||(43-148)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (134-238)||(31670-31774)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (272-360)||(8356-8447)
scaffold0298 (272-360)||(18440-18531)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (272-364)||(5091-5186)
scaffold0120 (335-364)||(5027-5056)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (272-360)||(3267-3357)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (147-238)||(9993-10086)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (114-170)||(4478-4535)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (156-257)||(20803-20907)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (114-170)||(19565-19622)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (272-361)||(17396-17488)
[»] scaffold1469 (2 HSPs)
scaffold1469 (146-310)||(283-448)
scaffold1469 (335-364)||(485-514)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (200-310)||(13-125)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (128-170)||(51103-51145)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (114-171)||(43059-43117)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (114-171)||(97503-97561)
[»] scaffold1336 (1 HSPs)
scaffold1336 (335-364)||(789-818)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (335-364)||(586-615)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (335-364)||(2313-2342)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (335-364)||(4972-5001)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (131-172)||(297-338)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (335-364)||(8770-8799)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (335-364)||(45686-45715)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (335-364)||(72869-72898)
scaffold0053 (131-172)||(80594-80635)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (335-363)||(770-798)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (156-216)||(3658-3718)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (272-320)||(13717-13765)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (272-360)||(9357-9448)


Alignment Details
Target: scaffold0077 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4933 - 4586
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  4933 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagatatagcaattcattcaacaacaacaactcatgtaatg 4834  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4833 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattct 4734  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4733 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 4634  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4633 tatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctacatacaactcaac 4586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23975 - 23767
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  23975 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttcaggacataggtcctcaccgctaatcaccgcttt 23876  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||     
T  23875 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctg 23776  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  23775 catacaact 23767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18344 - 18136
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  18344 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggctaaagcattcatttcaggacataggtcctcaccgctaatcaccgcttt 18245  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18244 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 18145  T
Q  352 catacaact 360  Q
     ||||||||    
T  18144 tatacaact 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 29610 - 29956
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  29610 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccaaatatagcaattcaatcaacaaaaacaactcatgtaatg 29709  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29710 acatgacacccctctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattct 29809  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29810 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccactttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttt 29909  T
Q  318 tatgcttagacaactacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29910 tatgcttagacaactacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 29956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23102773 - 23102426
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  23102773 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtattccataatcaacaacaatcatccagatatagcaattcagtcaacaacaacaactcatgtaatg 23102674  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23102673 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 23102574  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23102573 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttt 23102474  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23102473 taggcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 23102426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23090306 - 23089998
Alignment:
Q  57 cataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaacta 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23090306 cataatcaacaacaatcatccagatatagcaattcagtcaacaacaacaactcatgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaacta 23090207  T
Q  157 tgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttga 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23090206 tgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttga 23090107  T
Q  257 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacata 355  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23090106 ataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacata 23090007  T
Q  356 caactcaac 364  Q
    |||||||||    
T  23090006 caactcaac 23089998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23169613 - 23169269
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataa-ccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||    
T  23169613 cctacaaaatcaataattattcaataggcatagatatttcataaaccaacaacaaccatccagatatagcaat-caatcaacaatagcaactcatgaaat 23169515  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23169514 gacatgacacccctataagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23169415  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23169414 tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactt 23169315  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | |||||||  ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  23169314 tgatgcttatgcaactacccaacccgtgtatatccacatacaactc 23169269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23580870 - 23580526
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataa-ccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||    
T  23580870 cctacaaaatcaataattattcaataggcatagatatttcataaaccaacaacaaccatccagatatagcaat-caatcaacaatagcaactcatgaaat 23580772  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580771 gacatgacacccctataagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23580672  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23580671 tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactt 23580572  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | |||||||  ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  23580571 tgatgcttatgcaactacccaacccgtgtatatccacatacaactc 23580526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 9241308 - 9241542
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241308 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 9241407  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    
T  9241408 gtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagttcttccacttttatgcttatgcaa 9241507  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241508 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 9241542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 361
Target Start/End: Original strand, 23877727 - 23878045
Alignment:
Q  46 cataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcg 143  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | | |||| | |||||| | |||| ||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  23877727 cataagtatttcataaacaacaaca-tcatcaacaatataacgattcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactccccg 23877825  T
Q  144 ataaatgcaactatgcatgtggtaccatatt-cagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgct 242  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  23877826 acaattgcaactatgcatgtggtaccatatttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcatcaggacataagtcttcaccgct 23877925  T
Q  243 caacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  23877926 caacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaactacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttg 23878025  T
Q  342 tgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23878026 tgtatatctacatacaactc 23878045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 26582538 - 26582880
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagc-atttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatga 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | || |||||  ||||||| |  ||||    
T  26582538 tacaacatcaataattattcaataagcatatggtatttcataatcaacaacaatcatccaaatatag-aatttagtcaacaatg-caactcatgatatga 26582635  T
Q  119 catgaca--cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    || |||   |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26582636 cacgacttccccccctaatactcttcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 26582735  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26582736 tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 26582835  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    | ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26582836 tgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaact 26582880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27367779 - 27367551
Alignment:
Q  137 ctcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctc 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27367779 ctcctcgataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctc 27367680  T
Q  237 actgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactacc 335  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  27367679 accgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgc-tatgcaactacc 27367581  T
Q  336 c-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  27367580 caacctgtgtatatctacatacaactcaac 27367551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 200619 - 200850
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  200619 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 200718  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  200719 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 200817  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  200818 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 200850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Original strand, 6482296 - 6482528
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6482296 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 6482395  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  6482396 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 6482495  T
Q  330 actaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  6482496 actacccaacctgtgtatctctacatacaactc 6482528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Original strand, 6485763 - 6485995
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6485763 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 6485862  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  6485863 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 6485962  T
Q  330 actaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  6485963 actacccaacctgtgtatctctacatacaactc 6485995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 21907109 - 21907455
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| | || | ||| ||||| | |||    
T  21907109 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcataagtatttcataatcaacaaca-tcatcaataatatagcaattcaaccaactacaacgactcatgcaat 21907207  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  21907208 gacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaaacat 21907307  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccca 313  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  21907308 tcttttcaggacataagtcctcaccgcaaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctccca 21907407  T
Q  314 cttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21907408 cttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 21907455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 43693379 - 43693610
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43693379 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 43693478  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  43693479 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 43693577  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43693578 acccaacctgtggatatctacatacaactcaac 43693610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 20260799 - 20261032
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260799 ctaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 20260898  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20260899 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaa 20260997  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20260998 ctgacccacctgtgtatatctacatacaactcaac 20261032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 138 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6744519 - 6744292
Alignment:
Q  138 tcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctca 237  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6744519 tcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctca 6744420  T
Q  238 ctgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactaccc 336  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  6744419 ccgctcaacaccgcttttgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaactaccc 6744321  T
Q  337 -acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  6744320 aacctgtgtatatctacatacaactcaac 6744292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 359
Target Start/End: Original strand, 23263848 - 23264188
Alignment:
Q  23 aatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||||||    
T  23263848 aatatcaatgattattccatatgcataagtatttcataaatcaacaaca-tcatcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaatgaca 23263946  T
Q  121 tgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 219  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| || ||||||| ||||||||||||      
T  23263947 tgacaacacctctaagactcctcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattcttt 23264046  T
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttta 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23264047 tcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgctttta 23264146  T
Q  320 tgcttagacaac-tac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23264147 tgcttatgcaacagactccactggtgtatatctacatacaac 23264188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5707211 - 5706985
Alignment:
Q  136 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcc 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5707211 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcc 5707112  T
Q  235 tcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactac 334  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||    
T  5707111 tcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactac 5707013  T
Q  335 cc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||    
T  5707012 ccaaccagtgtatatctacatacaactc 5706985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22810092
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccatatccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 22809981  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22809982 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 22810081  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||||||||    
T  22810082 tacaactcaac 22810092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10685826 - 10685637
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685826 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 10685727  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10685726 gtcctcaccact-aacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 10685637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21074200 - 21073951
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaag 211  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21074200 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaag 21074101  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcc 311  Q
    ||||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  21074100 cattcttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccagggccgaagccctcc 21074001  T
Q  312 cacttttatgcttagacaact--acccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    | |||||||| |||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  21074000 cgcttttatggttatgcaattgaatccacttgtgtatatctacatacaac 21073951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105787
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| |||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccactt 2105675  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2105676 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 2105775  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||| ||||    
T  2105776 atacaacccaac 2105787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19649743 - 19649509
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataag 231  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||| ||    
T  19649743 agactcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacatgag 19649644  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  19649643 tcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatacttatgcaa 19649544  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19649543 ctgactcacttgtgtatatctacatacaactcaac 19649509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 23290925 - 23291133
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23290925 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcgtttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 23291024  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  23291025 gaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatcta 23291124  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  23291125 catacaact 23291133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 24658773 - 24658981
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  24658773 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagttctcactgctaaacaccacttt 24658872  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac-tac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24658873 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatacttatacaacttactccacttgtgtatatcta 24658972  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  24658973 catacaact 24658981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19703615 - 19703449
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccaga 298  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  19703615 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagg 19703516  T
Q  299 gccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19703515 gccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatctacatacaactcaa 19703449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724241
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 20724131  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||   ||||| |||||||||||    
T  20724132 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 20724231  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  20724232 catacaactc 20724241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27296181 - 27295980
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  27296181 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 27296083  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  27296082 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 27295983  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  27295982 tac 27295980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 12572311 - 12572512
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  12572311 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 12572408  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12572409 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctac 12572508  T
Q  353 atac 356  Q
    ||||    
T  12572509 atac 12572512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 12578793 - 12578994
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  12578793 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 12578890  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12578891 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctac 12578990  T
Q  353 atac 356  Q
    ||||    
T  12578991 atac 12578994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 27785695 - 27785859
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  27785695 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 27785792  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27785793 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 27785859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 27790916 - 27791080
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  27790916 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 27791013  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27791014 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 27791080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 24943376 - 24943585
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  24943376 atgcatgtggtaccatattcagggccgcagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgcgaaacaccgcttt 24943475  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||  ||| ||||||||||| ||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  24943476 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttctagggccagagccctcccacttttgtgcgtatgcaactgactccacttgtgtatatcta 24943575  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  24943576 catacaactc 24943585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 26884128 - 26884364
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc---tcatcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| | | |||||||||||||||||   | |||||||||    
T  26884128 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 26884226  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctta 325  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| ||| |||||||||||    
T  26884227 tgagtcctccc--attaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccatttttatgctta 26884324  T
Q  326 gacaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884325 tgcactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 26884364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6261748 - 6261513
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct---catcaggaca 227  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6261748 ctaaaactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaaaccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcatcaggaca 6261650  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaact-agtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttag 326  Q
    | ||||||| |   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |  |||||||||||     
T  6261649 tgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacttagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccattttatgcttat 6261552  T
Q  327 acaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261551 gcaccgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 6261513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 23269064 - 23269276
Alignment:
Q  23 aatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||||||    
T  23269064 aatatcaatgattattccatatgcataagtatttcataaatcaacaaca-tcatcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaatgaca 23269162  T
Q  121 tgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 219  Q
    ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  23269163 tgacaacacctctaagactcttcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttt 23269262  T
Q  220 tcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||||||||    
T  23269263 tcaggacataagtc 23269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 23275933 - 23276145
Alignment:
Q  23 aatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||||||    
T  23275933 aatatcaatgattattccatatgcataagtatttcataaatcaacaaca-tcatcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaatgaca 23276031  T
Q  121 tgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 219  Q
    ||||| | |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  23276032 tgacaacacctctaagactcttcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttt 23276131  T
Q  220 tcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||||||||    
T  23276132 tcaggacataagtc 23276145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 23752791 - 23752998
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   | | |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  23752791 atgcatgtggtaccatattcagggccggagctctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 23752889  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  23752890 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatcta 23752989  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  23752990 catacaact 23752998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27211181 - 27210944
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct---catcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  27211181 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattcttttcatcaggaca 27211083  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctta 325  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |  ||| ||  |||||||||||    
T  27211082 tgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctaggaccgaggtcctcaccgtttttatgctta 27210985  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27210984 tgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 27210944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 24652329 - 24652537
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||   | |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  24652329 atgcatgtggtaccatattatgggtcggagccctcaccgcgaattgaatggttaaagcattcatttcaagacataagtcctcaccgctaaacactgcttt 24652428  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac-tac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  24652429 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccagggccagagccctcccgcttttatacttatacaacagactccacttgtgtatatcta 24652528  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  24652529 catacaact 24652537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28971478 - 28971371
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28971478 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 28971381  T
Q  233 cctcactgct 242  Q
    ||||||||||    
T  28971380 cctcactgct 28971371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19663026 - 19662789
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  19663026 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 19662928  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  19662927 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 19662829  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662828 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 19662789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27208795 - 27208609
Alignment:
Q  183 tgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct---catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgcttt 278  Q
    |||||| ||||| | | ||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||| |   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27208795 tgaccctcaccgttatagaatggttaaaacattcttttcatcaggacatgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgcttt 27208698  T
Q  279 gaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||| |  ||| ||  |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208697 gaacgacaaggcgttctaggaccgaggtcctcaccgtttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 27208609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 23062475 - 23062583
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||    
T  23062475 tctaagactcctcaacaagtgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc-attcaggacat 23062573  T
Q  229 aagtcctcac 238  Q
    ||||||||||    
T  23062574 aagtcctcac 23062583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21133453 - 21133349
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21133453 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtagtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 21133356  T
Q  232 tcctcac 238  Q
    |||||||    
T  21133355 tcctcac 21133349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 29280916 - 29281153
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || |  | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  29280916 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 29281014  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  29281015 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 29281113  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29281114 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 29281153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22796688 - 22796597
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22796688 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 22796597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28971336 - 28971246
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28971336 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 28971246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9734
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  9497 ctaagactcctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 9595  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| |  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  9596 gagtcctca-tcgttaacatcattttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 9694  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9695 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 9734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21133310 - 21133220
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21133310 ccgctttgaacgacaaggcgttctagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 21133220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Original strand, 23062668 - 23062759
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23062668 ccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactc 23062759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25181966 - 25181797
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattcca 296  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||    
T  25181966 gaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttcca 25181868  T
Q  297 gagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  ||||||  |||  |  |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25181867 ggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 25181797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15643468 - 15643412
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15643468 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 15643412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 22703489 - 22703545
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22703489 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctttagaatggttaaagc 22703545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 238
Target Start/End: Original strand, 45028484 - 45028588
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  45028484 ctaagacccctcgataaatgcaattatgcatgtggtacca-aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaa 45028580  T
Q  231 gtcctcac 238  Q
    ||||||||    
T  45028581 gtcctcac 45028588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6261461 - 6261432
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261461 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 6261432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19662737 - 19662708
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662737 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 19662708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 24660648 - 24660677
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24660648 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 24660677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38931551 - 38931522
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38931551 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 38931522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13101353 - 13101297
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  13101353 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtacca 13101297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20914325 - 20914297
Alignment:
Q  336 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20914325 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 20914297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 364
Target Start/End: Original strand, 23148712 - 23148740
Alignment:
Q  336 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148712 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 23148740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 364
Target Start/End: Original strand, 23560502 - 23560530
Alignment:
Q  336 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23560502 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 23560530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Original strand, 24660395 - 24660470
Alignment:
Q  95 cgacaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  24660395 cgacaatgacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaa-tgcgactatgcatgtggtacca 24660470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Original strand, 28292698 - 28292734
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28292698 agactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtacca 28292734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32911662 - 32911606
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32911662 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 32911606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 97)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 363
Target Start/End: Original strand, 16676053 - 16676400
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16676053 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataaatcaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaat 16676152  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676153 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattaaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 16676252  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16676253 tcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 16676352  T
Q  317 ttatgcttagacaa-ctacccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    |||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16676353 ttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctacatacaactcaa 16676400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 363
Target Start/End: Original strand, 17650290 - 17650636
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17650290 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataaatcaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaat 17650389  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17650390 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatatttaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 17650489  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17650490 tcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgctttgaacaactagtgttccaccgc-ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 17650588  T
Q  317 ttatgcttagacaa-ctacccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    |||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17650589 ttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctacatacaactcaa 17650636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11390641 - 11390294
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataa-ccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11390641 cctataatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatccaatcaca-tcatccagatacagcaattcaatccacaataacaactcatgtaat 11390543  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11390542 gacatgacaccccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattc 11390443  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11390442 ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactt 11390343  T
Q  317 ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11390342 ttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 11390294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11384153 - 11383806
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataa-ccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  11384153 cctataatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatccaatcaca-tcatccagatacagcaattcaattcacaataacaactcatgtaat 11384055  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11384054 gacatgacaccccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattc 11383955  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11383954 ttttcaggacttaagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 11383855  T
Q  317 ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383854 ttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 11383806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20328563 - 20328216
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||| ||||||    
T  20328563 cctacaatatcaatgattattcgataagcataagtatttcataatcaacaaca-tcatccagatatagcaatttaatcaacaacagcaattcatgtaatg 20328465  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20328464 acatgacaacacctctaagacccctcgacaaatgctactatgcatgtggtaccatatacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 20328365  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20328364 ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccactt 20328265  T
Q  317 ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20328264 ttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20328216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 13006170 - 13006513
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  13006170 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcgacaacaatcattcaaatatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 13006267  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13006268 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattc 13006367  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13006368 tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 13006467  T
Q  317 ttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13006468 tgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 13006513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21232348 - 21232001
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||| | | |||| ||| ||||| ||||||    
T  21232348 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcataagtatttcataatcaacaaca-tcatcaaaatataacaattcgaccaacaacaacgactcatgtaatg 21232250  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  21232249 ccatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattc 21232151  T
Q  217 -tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
     |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21232150 attttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 21232051  T
Q  316 tttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21232050 tttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatacaactcaac 21232001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13124280 - 13123939
Alignment:
Q  23 aatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacat 121  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||  ||  |||  | ||||||     
T  13124280 aatatcaatgattattcaataagcataagtatttcataaatcaacaacaatcatccata-atag-aattcaatcaacaatg-cagttcatcttatgacac 13124184  T
Q  122 gaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattc-agggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 219  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13124183 gacatcccccctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 13124084  T
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttta 319  Q
     |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  13124083 acaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttga 13123985  T
Q  320 tgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13123984 tgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 13123939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 4279941 - 4280172
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4279941 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 4280040  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  4280041 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 4280139  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4280140 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 4280172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 19616273 - 19616504
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19616273 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 19616372  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  19616373 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 19616471  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19616472 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 19616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12711212 - 12710868
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||  ||  |||  | ||||    
T  12711212 tacaatatcaatgattattcaataagcataagtatttcataaatcaacaacaatcatccata-atat-aattcaatcaacaatg-cagttcatcttatga 12711116  T
Q  119 catgaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattc-agggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    || |||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711115 cacgacatcccccctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12711016  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12711015 tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactt 12710916  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccca-cttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||  |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12710915 g-atatttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 12710868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 126 - 364
Target Start/End: Original strand, 14421324 - 14421564
Alignment:
Q  126 cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagg 224  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14421324 cccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagg 14421423  T
Q  225 acataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 324  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14421424 acctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgttt 14421523  T
Q  325 agacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14421524 atgcaactacccaacctgtgtatctctatatacaactcaac 14421564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12591948 - 12591606
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | | ||||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  12591948 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtaattcataatcaacaaaaatcattcaagtatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 12591851  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591850 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12591751  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |    
T  12591750 tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccac-t 12591652  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  12591651 tgatgattatgcaactacccaaccagtgtatatctacatacaactc 12591606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 13742369 - 13742711
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||   ||||||| |  |||||    
T  13742369 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcaacaacaatcatccaagtatag-aattcaatcaacaaatgcaactcatgatatgac 13742467  T
Q  120 atgacaccc-ctct-aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    | ||||||| | || || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13742468 acgacaccctccctcaatactcctcaat-aatgcaattatgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 13742566  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  13742567 tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccac-t 13742665  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  ||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13742666 tgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatcaacatacaactc 13742711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 114 - 364
Target Start/End: Original strand, 18606823 - 18607075
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 212  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18606823 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagc 18606922  T
Q  213 attctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccc 312  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  18606923 attcttttcagaacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaaccacaaggcgttccagagtcgaagctctctc 18607022  T
Q  313 acttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607023 acttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18607075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 11302827 - 11303060
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11302827 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 11302926  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11302927 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaa 11303025  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11303026 ctgacccacctgtgtatatctacatacaactcaac 11303060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23666029 - 23665802
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666029 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 23665930  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  23665929 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaa 23665831  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23665830 ctgacccacttgagtatatctacatacaa 23665802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Original strand, 29795705 - 29795932
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29795705 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaaccagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 29795804  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  29795805 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaa 29795903  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29795904 ctgacccacttgagtatatctacatacaa 29795932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Original strand, 29799524 - 29799751
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29799524 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaaccagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 29799623  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  29799624 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaa 29799722  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29799723 ctgacccacttgagtatatctacatacaa 29799751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281612
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || |||||| ||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccacttt 14281723  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14281722 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 14281623  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  14281622 tacaacccaac 14281612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 6411821 - 6412031
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  6411821 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacactgcttt 6411920  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6411921 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctaca 6412020  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||||||||    
T  6412021 tacaactcaac 6412031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962704
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 35962815  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35962814 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 35962715  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  35962714 tacaacccaac 35962704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 1612623 - 1612833
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  1612623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 1612721  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  1612722 gagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatccaactgactccacttgtgtatatctac 1612821  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  1612822 atacaactcaac 1612833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 359
Target Start/End: Original strand, 19599844 - 19600046
Alignment:
Q  158 gcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttga 256  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  19599844 gcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatttattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccactttga 19599942  T
Q  257 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacata 355  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19599943 gcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgcttatacaactgacccacttgtgtatatctacata 19600042  T
Q  356 caac 359  Q
    ||||    
T  19600043 caac 19600046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220081
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgcttaacaccgctt 11220191  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||   ||||| |||||||||||    
T  11220190 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttctgcaactaactccactggtgtatatcta 11220091  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  11220090 catacaactc 11220081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15339035
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 15338924  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15338925 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 15339024  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  15339025 tacaacccaac 15339035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723183
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 15723294  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15723293 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 15723194  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  15723193 tacaacccaac 15723183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20580118 - 20579954
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  20580118 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 20580021  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20580020 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 20579954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23201679 - 23201515
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  23201679 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 23201582  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23201581 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatg 23201515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23507806 - 23507642
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  23507806 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 23507709  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507708 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatg 23507642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15711168 - 15710959
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  15711168 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 15711070  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15711069 gagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 15710970  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  15710969 tacaacccaac 15710959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 807174 - 806973
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  807174 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 807077  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  807076 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctac 806977  T
Q  353 atac 356  Q
    ||||    
T  806976 atac 806973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109044
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 16109145  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  16109144 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgta-atctaca 16109046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432192
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccact-aacaccacttt 14432087  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14432088 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctaca 14432187  T
Q  354 tacaa 358  Q
    |||||    
T  14432188 tacaa 14432192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11632117 - 11631953
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  11632117 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 11632020  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11632019 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 11631953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18049407 - 18049243
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  18049407 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 18049310  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18049309 gagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 18049243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18055886 - 18055722
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  18055886 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 18055789  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18055788 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 18055722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 147042 - 147280
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---atcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  147042 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 147140  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctta 325  Q
    | ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| ||  |||||||||||    
T  147141 tgagtcctcaccgtt-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccgtttttatgctta 147239  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147240 tgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 147280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3289956 - 3289746
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   ||| | |||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  3289956 atgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcgccgctaattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 3289858  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  3289857 gaacaacaagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctac 3289758  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  3289757 atacaactcaac 3289746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14320767 - 14320530
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc---tcatcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| | | |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  14320767 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcatcaggaca 14320669  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctta 325  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| ||  |||||||||||    
T  14320668 tgagtcctccc--attaacaccgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccgtttttatgctta 14320571  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14320570 tgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14320530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 297
Target Start/End: Original strand, 31154325 - 31154509
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  31154325 atgacatgacgactcctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccgaggccctcaccgttatagaatggttaaagca 31154423  T
Q  214 ttct---catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||    |||||||||| ||||||| |   | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31154424 ttctttatatcaggacatgagtcctccc--attatcaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 31154509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 14565683 - 14565920
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc----atcaggac 226  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  14565683 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttttatcaggac 14565781  T
Q  227 ataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctt 324  Q
    || ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| ||  ||||||||||    
T  14565782 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccgtttttatgctt 14565879  T
Q  325 agacaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14565880 atgcaacgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14565920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 14128259 - 14128374
Alignment:
Q  244 aacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgt 342  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||     
T  14128259 aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttga 14128358  T
Q  343 gtatatctacatacaa 358  Q
    ||||||||||||||||    
T  14128359 gtatatctacatacaa 14128374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306032
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatacaa 36306032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20907562 - 20907326
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20907562 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagtcgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 20907464  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  20907463 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaggcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 20907365  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20907364 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaa 20907326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 18871841 - 18872078
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18871841 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 18871939  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  18871940 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 18872038  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872039 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18872078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 364
Target Start/End: Original strand, 2965891 - 2966143
Alignment:
Q  117 gacatgaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | ||||||||||||||||    
T  2965891 gacatgacaaccccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcatt 2965989  T
Q  216 c--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-c 311  Q
    |  | |||||||||| |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||      
T  2965990 cttttatcaggacatgagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcat 2966088  T
Q  312 cacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2966089 cgtttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 2966143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 15166749 - 15166987
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15166749 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 15166847  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaag--ctctcccacttttatgctta 325  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |   |||||||||||    
T  15166848 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgttttttatgctta 15166946  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166947 tgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15166987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37244506 - 37244402
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37244506 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 37244409  T
Q  232 tcctcac 238  Q
    |||||||    
T  37244408 tcctcac 37244402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Original strand, 2464287 - 2464524
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   | | || || | | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2464287 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata-tcagagtcgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattctttatcaggacat 2464385  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  2464386 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 2464484  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2464485 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 2464524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3858558 - 3858321
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc-atcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3858558 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattctttatcaggacat 3858460  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||     
T  3858459 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttat 3858361  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3858360 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 3858321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15086120 - 15086017
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15086120 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggctgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 15086023  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  15086022 cctcac 15086017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18958484 - 18958394
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18958484 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagctctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 18958394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 16008059 - 16008296
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  16008059 ctaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 16008157  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  16008158 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgctccatcgttttgaacgacaaggcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 16008256  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16008257 gcaactgactccacttgtatatatctacatacaactcaac 16008296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Original strand, 13678239 - 13678361
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaag 211  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  13678239 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaag 13678338  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcct 235  Q
    |||||   ||||||||||||||||    
T  13678339 cattc-attcaggacataagtcct 13678361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 3327778 - 3327881
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgc-tgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3327778 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 3327875  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  3327876 cctcac 3327881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 32771473 - 32771576
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||     
T  32771473 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcagggcataagc 32771570  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  32771571 cctcac 32771576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37244363 - 37244273
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37244363 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 37244273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36306222 - 36306109
Alignment:
Q  147 aatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctca 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||   ||| |||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| |    
T  36306222 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaagaccgaagccctcaccactagtcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaa 36306123  T
Q  245 acaccgctttgaac 258  Q
    ||||||||||||||    
T  36306122 acaccgctttgaac 36306109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 837082 - 836990
Alignment:
Q  274 gctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837082 gctttgaacgacaaggcgttccagagccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 836990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1202262 - 1202170
Alignment:
Q  274 gctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1202262 gctttgaacgacaaggcgttccagagccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 1202170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18958627 - 18958519
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18958627 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcatgacataag 18958530  T
Q  232 tcctcactgct 242  Q
    ||||||| |||    
T  18958529 tcctcaccgct 18958519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Original strand, 3327920 - 3328014
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||  ||||| ||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3327920 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaaaagtcctcccgcttttatgcttatgcaactgactctacttgtgtatatctacatacaactcaac 3328014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15085978 - 15085888
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15085978 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgggactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 15085888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16952434 - 16952331
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||    || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16952434 agacttctcaataaaagcaaatatgcatgcggtaccatattcagggccgaagacctcaccgctgtttgaatggttaaagcattct--tcaggacataagt 16952337  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  16952336 cctcac 16952331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26289823 - 26289733
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26289823 ccgctttgaatgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 26289733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16187810 - 16187693
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaact-agtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgt 342  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||   || ||||| ||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16187810 caccactttgaacaacagagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagggccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgt 16187711  T
Q  343 gtatatctacatacaact 360  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16187710 gtatatctacgtacaact 16187693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 833043 - 832947
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  833043 caccgctttgaacgacaaggcgttccaaggccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 832947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1198223 - 1198127
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1198223 caccgctttgaacgacaaggcgttccaaggccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 1198127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14179065 - 14178973
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14179065 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 14178973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14945928 - 14945836
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||| |||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14945928 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggaaaaagccctcccgctttatatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14945836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15373521 - 15373429
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||| |||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373521 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggaaaaagccctcccgctttatatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 15373429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10897385 - 10897149
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || |  | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  10897385 ctaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 10897287  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||   |  |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  10897286 gagtcctca--tcataacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 10897189  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10897188 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 10897149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 833124 - 833041
Alignment:
Q  155 tatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  833124 tatgcatgtggtaccatattcagagtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc-attcaggacataagtcctcac 833041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1198304 - 1198221
Alignment:
Q  155 tatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1198304 tatgcatgtggtaccatattcagagtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc-attcaggacataagtcctcac 1198221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14946020 - 14945916
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  14946020 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 14945921  T
Q  254 tgaac 258  Q
    |||||    
T  14945920 tgaac 14945916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15373613 - 15373509
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15373613 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 15373514  T
Q  254 tgaac 258  Q
    |||||    
T  15373513 tgaac 15373509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16952290 - 16952202
Alignment:
Q  274 gctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||| | ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16952290 gctttgaacgacaaggcgttccagggtagaagccctctcgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 16952202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 19145506 - 19145581
Alignment:
Q  97 acaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  19145506 acaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 19145581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 20744905 - 20744980
Alignment:
Q  97 acaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20744905 acaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 20744980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 46174303 - 46174383
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  46174303 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 46174383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14266223 - 14266165
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  14266223 aatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 14266165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10897011 - 10896982
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897011 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 10896982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10897097 - 10897068
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897097 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 10897068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 12547358 - 12547387
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12547358 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 12547387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 12694772 - 12694801
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12694772 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 12694801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 14038761 - 14038790
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038761 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14038790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 14348791 - 14348820
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348791 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14348820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 15167022 - 15167051
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167022 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15167051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 16008348 - 16008377
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008348 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 16008377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16073959 - 16073930
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16073959 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 16073930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Original strand, 16089996 - 16090037
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16089996 ctaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccata 16090037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 18872130 - 18872159
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872130 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18872159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29182253 - 29182212
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  29182253 ctaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccata 29182212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 46624814 - 46624855
Alignment:
Q  128 cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacc 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  46624814 cctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacc 46624855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 46625033 - 46625062
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46625033 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 46625062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14255929 - 14255889
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  14255929 ctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 14255889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22440040 - 22439693
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22440040 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcattcagatatagcaattcaatcaataataacaactcatgtaatg 22439941  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22439940 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattct 22439841  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22439840 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttt 22439741  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22439740 tatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctacatacaactcaac 22439693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1857702 - 1857471
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1857702 agactccttgataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 1857603  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  1857602 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgc-tatgcaact 1857504  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1857503 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 1857471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21675670 - 21675439
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21675670 agactccttgataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 21675571  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  21675570 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 21675472  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21675471 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 21675439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Original strand, 19510974 - 19511206
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19510974 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 19511073  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  19511074 agtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 19511173  T
Q  330 actaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19511174 actacccaacctgtgtatctctacatacaactc 19511206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37805517 - 37805284
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37805517 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 37805418  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  37805417 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaa 37805319  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37805318 ctgacccacctgtgtatatctacatacaactcaac 37805284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 23527311 - 23527656
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| || ||||||||||||| | ||||| | || |||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  23527311 tacaacattaatgattattcaataagcataggtatctcataatcaacgacaatcattcaagtatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 23527408  T
Q  120 atgacacccctc---taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    ||||| |||| |   ||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23527409 atgacgccccccctttaacactcctcaatgaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 23527508  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23527509 ctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 23527608  T
Q  316 tttatgctt-agacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23527609 ttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 23527656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Original strand, 9775442 - 9775669
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775442 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 9775541  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  9775542 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaa 9775640  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9775641 ctgacccacttgagtatatctacatacaa 9775669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23112939 - 23112704
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23112939 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 23112840  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagac 328  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||  || || ||||||||||||  |    
T  23112839 gtcctcaccact-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccaggaccgaggccatcaccgcttttatgcttatgc 23112741  T
Q  329 aact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23112740 aaatgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 23112704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758219
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  || |||||| |||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcaggacgtaagtcctcaccact-aacaccactttg 758329  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacat 354  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  758328 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacat 758229  T
Q  355 acaactcaac 364  Q
    ||||| ||||    
T  758228 acaacccaac 758219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 20937594 - 20937804
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  20937594 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcattttcaagacataagtcctcaccactaaacaccacttt 20937693  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20937694 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 20937793  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  20937794 tacaacccaac 20937804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312796
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || | |||| ||||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactga-caccacttt 22312907  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22312906 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 22312807  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  22312806 tacaacccaac 22312796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 10816774 - 10816985
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  10816774 atgcatgtggtaccatattcagtgtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 10816873  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| | |    
T  10816874 gagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatattc 10816973  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  10816974 atacaactcaac 10816985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 23538801 - 23539012
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  23538801 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagtatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 23538900  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| |||    
T  23538901 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagccgaagctctctcacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatatac 23539000  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  23539001 atacaactcaac 23539012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22509346 - 22509137
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  22509346 atgcatgtggtaccaaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 22509248  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22509247 gagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 22509148  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  22509147 tacaacccaac 22509137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21678443 - 21678242
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  21678443 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 21678346  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  21678345 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctac 21678246  T
Q  353 atac 356  Q
    ||||    
T  21678245 atac 21678242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6404673 - 6404465
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  6404673 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttaaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 6404574  T
Q  255 gaacaact-agtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  6404573 gaacaacagagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagctctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 6404474  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  6404473 catacaact 6404465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22008102 - 22007888
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22008102 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacctaagtcctcaccgctaaacatcgct 22008003  T
Q  253 ttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt-ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatc 349  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  22008002 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccacttgtgtatatc 22007903  T
Q  350 tacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||    
T  22007902 tacatacaactcaac 22007888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17264971 - 17264770
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  17264971 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 17264873  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  17264872 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 17264773  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  17264772 tac 17264770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 22175014 - 22175179
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||    
T  22175014 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctaaccact-aacaccacttt 22175112  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22175113 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 22175179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17271453 - 17271252
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  17271453 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 17271355  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  17271354 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 17271255  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  17271254 tac 17271252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 360
Target Start/End: Original strand, 34829003 - 34829236
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---atcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  34829003 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 34829101  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctta 325  Q
    | |||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| || ||||||||||||    
T  34829102 tgagtcctcaccatt-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccgcttttatgctta 34829200  T
Q  326 gacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34829201 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6728438 - 6728228
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6728438 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattctttttcaagacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 6728339  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  6728338 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttcagggccggagccctcctgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 6728239  T
Q  351 acatacaactc 361  Q
    |||||||||||    
T  6728238 acatacaactc 6728228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 42960057 - 42960292
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---atcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  42960057 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 42960155  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttag 326  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| |  |||||||||||     
T  42960156 tgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccaggaccgaggtcctcaccattttatgcttat 42960253  T
Q  327 acaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960254 gcaccgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 42960292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28371627 - 28371390
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc----atcaggac 226  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||     ||||||||    
T  28371627 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttttatcaggac 28371529  T
Q  227 ataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctt 324  Q
    || ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| ||| ||||||||||    
T  28371528 atgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccatttttatgctt 28371431  T
Q  325 agacaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28371430 atgcaacgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 28371390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38145954 - 38145719
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---atcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  38145954 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 38145856  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttag 326  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |  |||||||||||     
T  38145855 tgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccattttatgcttat 38145758  T
Q  327 acaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38145757 gcaccgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 38145719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22232813 - 22232605
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||| |||||||   |||||||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  22232813 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttatagcattcatttcaggacataagtctttaccgctaaacaccgcttt 22232714  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22232713 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 22232614  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  22232613 catacaact 22232605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24669191 - 24669109
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24669191 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24669109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24738960 - 24738878
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24738960 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24738878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24751729 - 24751647
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751729 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18409349 - 18409187
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | | || |  ||||||| | |||| ||| ||||| | |||    
T  18409349 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcatatgtatttcataatcaacaaca-tcatcaataatacaaaaattcaaccaacaacaacgactcatgcaat 18409251  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaggg 179  Q
      ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18409250 ttcatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcacgtggtaccatattcaggg 18409187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 363
Target Start/End: Original strand, 22336082 - 22336318
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22336082 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 22336180  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  |||| |  |||  |  |||||||||||     
T  22336181 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcatcgtttttatgcttat 22336279  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336280 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaa 22336318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18409130 - 18408968
Alignment:
Q  190 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagg 289  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||          ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18409130 caccgctattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcactgct----------ttgaacaacaagagtttcaccgctttgaacgacaagg 18409042  T
Q  290 cattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| || ||| |||| || || ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18409041 cgttctagggccaaagcccttccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 18408968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27636076 - 27635973
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27636076 agactcctcaataagtgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 27635979  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  27635978 cctcac 27635973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 19235822 - 19236059
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  19235822 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 19235920  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||| ||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  19235921 gagtcatca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 19236019  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19236020 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 19236059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 22466701 - 22466938
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22466701 ctaagactcatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 22466799  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  22466800 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcattttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 22466898  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22466899 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 22466938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 363
Target Start/End: Original strand, 22339620 - 22339856
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22339620 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtcgtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 22339718  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||  |||| |  |||  |  |||||||||||     
T  22339719 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaggtgttccaggaccgaggtcctcatcgtttttatgcttat 22339817  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339818 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaa 22339856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 22749728 - 22749966
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22749728 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 22749826  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaag--ctctcccacttttatgctta 325  Q
     |||| ||| |  | |||| || |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||  |   |||||||||||    
T  22749827 gagtcttca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgctccatcgttttgaacgacaaggcgttccaggaccgaagtcctcatcgttttttatgctta 22749925  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22749926 tgcaactgactccacttgtggatatctacatacaactcaac 22749966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 361
Target Start/End: Original strand, 20819107 - 20819339
Alignment:
Q  133 aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataa 230  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  20819107 aagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccat-ttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatga 20819205  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagac 328  Q
    |||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||  |    
T  20819206 gtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttatgc 20819304  T
Q  329 aact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20819305 aactgactccacttgtgtatatctgcatacaactc 20819339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 361
Target Start/End: Original strand, 20826207 - 20826439
Alignment:
Q  133 aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataa 230  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  20826207 aagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccat-ttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatga 20826305  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagac 328  Q
    |||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||  |    
T  20826306 gtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttatgc 20826404  T
Q  329 aact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20826405 aactgactccacttgtgtatatctgcatacaactc 20826439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 21829622 - 21829712
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21829622 ccgctttgaacgacaaggcgttccaaggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 21829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19802086 - 19801965
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  19802086 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 19801988  T
Q  214 ttctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  19801987 ttc--atcaggacataagtcctcac 19801965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 22460077 - 22460314
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| ||  | | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22460077 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcattgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 22460175  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  22460176 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaaaaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 22460274  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22460275 gcaactgactccacttgtgtatatatgcatacaactcaac 22460314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24669050 - 24668959
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24669050 ccgctttgaacgacaaggtgttccaggaccgaggccctcccgcttttatgctcatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 24668959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24738819 - 24738728
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24738819 ccgctttgaacgacaaggtgttccaggaccgaggccctcccgcttttatgctcatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 24738728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24751588 - 24751497
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24751588 ccgctttgaacgacaaggtgttccaggaccgaggccctcccgcttttatgctcatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 24751497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 19362556 - 19362677
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||  ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  19362556 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 19362654  T
Q  214 ttctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  19362655 ttc--atcaggacataagtcctcac 19362677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27635934 - 27635844
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||| ||| | ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27635934 ccgctttgaacgataaggcgttccagggcaaaagccctctcgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 27635844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 427403 - 427432
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  427403 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 427432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 10035300 - 10035329
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10035300 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 10035329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17022853 - 17022824
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17022853 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 17022824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 18819091 - 18819120
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18819091 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18819120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 20772100 - 20772129
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20772100 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20772129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 20780875 - 20780904
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780875 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20780904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 20843329 - 20843358
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843329 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20843358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 21624714 - 21624743
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21624714 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21624743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21869543 - 21869514
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21869543 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21869514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21873823 - 21873794
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21873823 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21873794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 22336371 - 22336400
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336371 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 22336400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 22339909 - 22339938
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339909 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 22339938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 22750001 - 22750030
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22750001 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 22750030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28890560 - 28890519
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28890560 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28890519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28897264 - 28897223
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28897264 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28897223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28910464 - 28910423
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28910464 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28910423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28925732 - 28925691
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28925732 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28925691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28932155 - 28932114
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28932155 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28932114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28933659 - 28933618
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28933659 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28933618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28946859 - 28946818
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28946859 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 28946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37599199 - 37599170
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37599199 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 37599170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37599280 - 37599251
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37599280 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 37599251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 37599495 - 37599454
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37599495 ctaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 37599454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 42960344 - 42960373
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960344 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 42960373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15194023 - 15193995
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15194023 ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 15193995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21901853 - 21901825
Alignment:
Q  336 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21901853 cacttgtgtatatctacatacaactcaac 21901825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23076492 - 23076436
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23076492 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 23076436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23081940 - 23081884
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23081940 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 23081884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 24057558 - 24057614
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24057558 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 24057614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 17156923 - 17157270
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17156923 cctacaataacaatgattattcaataggcaaaagtatttcataatcaacaacaataatccagttatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaatg 17157022  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157023 acatgacacccctctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccgtattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 17157122  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17157123 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 17157222  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17157223 tatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaactcaac 17157270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 24191624 - 24191971
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24191624 cctacaataacaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagttatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaatg 24191723  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24191724 acatgacacccctctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccgtattcggggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 24191823  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24191824 catcaggacataagttctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 24191923  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24191924 tatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaactcaac 24191971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16802764 - 16802417
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  16802764 cctacaatatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatcagcaacaatcatccagatatagcaattcaatcaacgacaacaactcatgtaatg 16802665  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16802664 acatgacacctctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattct 16802565  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16802564 catcaggacataagtcatcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 16802465  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16802464 tatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 16802417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Original strand, 17190698 - 17190992
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17190698 cctacaataacaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagttatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaatg 17190797  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17190798 acatgacacccctctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccaaattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattct 17190897  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17190898 catcaggacataagtcctcaccgatcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 74 - 361
Target Start/End: Original strand, 23174076 - 23174363
Alignment:
Q  74 atccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23174076 atccagatatagcagttcaatcaacaacagcaactcatgtaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatg 23174175  T
Q  173 ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccac 272  Q
    |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174176 ttcaagaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattttt-tcaggacataagtcctcaccgct-aacaccgctttgaacaactagtgttccac 23174273  T
Q  273 cgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174274 cgctttgaacgacaaggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactc 23174363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41456463 - 41456115
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaa-tcgacaataa-caactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |||   ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||| |  |||| || || |||    
T  41456463 tacaatatcaaagattattcaataagtatagttatttcataatcaacaacaatcatccata-atag-aattcaaatcaacaaaatgcaacccatgttatg 41456366  T
Q  118 acatgacacccc--tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41456365 acacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcat 41456266  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccac 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41456265 tctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac 41456166  T
Q  315 ttttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||| ||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41456165 tttgatgtttatgcaactatcccacctgtgtatatctacatacaactcaac 41456115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13969029 - 13968801
Alignment:
Q  137 ctcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctc 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13969029 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctc 13968930  T
Q  237 actgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactacc 335  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  13968929 accgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgc-tatgcaactacc 13968831  T
Q  336 c-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  13968830 caacctgtgtatatctacatacaactcaac 13968801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13974504 - 13974276
Alignment:
Q  137 ctcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctc 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13974504 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctc 13974405  T
Q  237 actgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactacc 335  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  13974404 accgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgc-tatgcaactacc 13974306  T
Q  336 c-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  13974305 caacctgtgtatatctacatacaactcaac 13974276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 14084509 - 14084740
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14084509 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 14084608  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  14084609 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 14084707  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14084708 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 14084740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 14089910 - 14090141
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14089910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 14090009  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  14090010 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 14090108  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14090109 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 14090141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 364
Target Start/End: Original strand, 9532829 - 9533059
Alignment:
Q  136 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcc 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9532829 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcc 9532928  T
Q  235 tcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactac 334  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  9532929 tcaccgctccacaccactttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactac 9533028  T
Q  335 cc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  9533029 ccaacctgtgtatctctacatacaactcaac 9533059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24123402 - 24123171
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24123402 agactcctcaataaatgcaaatatgcacgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 24123303  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  24123302 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 24123204  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24123203 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 24123171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 49399451 - 49399682
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  49399451 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtc 49399550  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  49399551 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 49399649  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49399650 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 49399682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8583493 - 8583262
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8583493 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 8583394  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  8583393 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 8583295  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  8583294 acccaacctatggatatctacatacaactcaac 8583262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17243996 - 17243651
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| |||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||| | | |||    
T  17243996 cctaaaatatcaatgatgattctatatgcataagtatttcataatcaacaacac-catcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactgatgcaat 17243898  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17243897 gacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctagtcgaatggttaaagcat 17243798  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccac 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  17243797 tcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttctagggccgaagccctcccgc 17243698  T
Q  315 ttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  17243697 ttttatgcttatgcaactgactccactgatgtatatctacatacaac 17243651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 12304724 - 12304957
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304724 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgtatgtggtatcaaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 12304823  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12304824 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaa 12304922  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12304923 ctgactcacctgtgtatatctacatacaactcaac 12304957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31690796 - 31690562
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataag 231  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||    
T  31690796 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgag 31690697  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||    
T  31690696 tcctcaccgctaaacaccgctttaaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaa 31690597  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31690596 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 31690562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544158
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 14544269  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14544268 gagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctaca 14544169  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  14544168 tacaacccaac 14544158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 12200203 - 12200403
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||    
T  12200203 atgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccact-aacaccactttg 12200301  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac-tacccacttgtgtatatctacat 354  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12200302 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagctgaagctctcccactgttatgcttatgcaacttacccacttgagtatatctacat 12200401  T
Q  355 ac 356  Q
    ||    
T  12200402 ac 12200403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 159 - 364
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292914
Alignment:
Q  159 catgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttga 256  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 14292805  T
Q  257 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacata 355  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  14292806 gcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatttctacata 14292905  T
Q  356 caactcaac 364  Q
    |||||||||    
T  14292906 caactcaac 14292914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 363
Target Start/End: Original strand, 18888923 - 18889177
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaag 211  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18888923 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaag 18889022  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc 310  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18889023 cattcttttcaggacataagtcctcatcactgaacaccgctttgaacaataaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctc 18889122  T
Q  311 ccacttttatgcttagacaactacc--cacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    || |||||||||||   ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18889123 ccgcttttatgcttgtgcaaccgactgcacttgtgtatatctacatacaactcaa 18889177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 364
Target Start/End: Original strand, 18899962 - 18900217
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaag 211  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18899962 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaag 18900061  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc 310  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18900062 catttttttcaggacataagtcctcacctctaaacatcgctttgaacaacaaagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctc 18900161  T
Q  311 ccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900162 ccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18900217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652683
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 14652794  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14652793 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 14652694  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  14652693 tacaacccaac 14652683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961369
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctt 12961481  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12961480 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagcccttccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 12961381  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||| ||||||||    
T  12961380 ataaaactcaac 12961369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Original strand, 18913867 - 18914213
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagat-atagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||| | |||| ||| ||||| | | |    
T  18913867 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcatacgtatttcataatcaacaacaa-catcaataacatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcatt 18913965  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  18913966 gacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcat 18914065  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccca 313  Q
    ||   |||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |   ||| |||||     
T  18914066 tcatttcaggacataagtcatctc-cctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacaaggtgttccaggacaatagccctcccg 18914164  T
Q  314 cttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914165 ctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18914213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 13909529 - 13909728
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  13909529 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 13909626  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactacccacttgtgtatatctacat 354  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  13909627 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaaccccttgagtatatctacat 13909726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 13939988 - 13940187
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  13939988 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 13940085  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactacccacttgtgtatatctacat 354  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  13940086 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaaccccttgagtatatctacat 13940185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 31943419 - 31943653
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataag 231  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||   ||||||||||||| ||||||  | ||||| || ||    
T  31943419 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgcaaatcgaatggttaaaacattctttttcaggaaatgag 31943518  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||||  |||    
T  31943519 tcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagccctctcgctttcatgcttatgcaa 31943618  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31943619 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 31943653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34852386 - 34852175
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  34852386 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 34852287  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| |||    
T  34852286 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatatac 34852187  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  34852186 atacaactcaac 34852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 13946474 - 13946673
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  13946474 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 13946571  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactacccacttgtgtatatctacat 354  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  13946572 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaaactctcccactgttatgttaatgcaactaaccccttgagtatatctacat 13946671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382847
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 16382958  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16382957 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 16382858  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
     ||||| ||||    
T  16382857 cacaacccaac 16382847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16838677 - 16838475
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  16838677 atgcatgtggtaccataatcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 16838580  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16838579 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctaca 16838480  T
Q  354 tacaa 358  Q
    |||||    
T  16838479 tacaa 16838475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17199218 - 17199007
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17199218 atgcatgtggtaccataatcagggctggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgct-aacaccgctt 17199120  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact-tttatgcttagacaa-ctacccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||  ||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  17199119 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatcta 17199020  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||    
T  17199019 catacaactcaac 17199007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 4677164 - 4677328
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  4677164 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 4677261  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4677262 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 4677328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8743086 - 8742922
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  8743086 atgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 8742989  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8742988 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 8742922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8761256 - 8761092
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  8761256 atgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 8761159  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8761158 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 8761092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 41175477 - 41175641
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  41175477 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 41175574  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41175575 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 41175641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 41180615 - 41180779
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  41180615 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 41180712  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41180713 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 41180779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13203715 - 13203511
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||    
T  13203715 atgcatgtggtaccataaacaggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccact-aacaccacttt 13203617  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13203616 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactaacccacttgagtatatctaca 13203517  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  13203516 tacaac 13203511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 44775201 - 44775365
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  44775201 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 44775298  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44775299 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 44775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 44780385 - 44780549
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  44780385 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 44780482  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44780483 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 44780549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18719312 - 18719101
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18719312 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 18719213  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| | |||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18719212 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgagaaggcgttccagggccgaaaccctcacgcttt-atacttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 18719114  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||    
T  18719113 catacaactcaac 18719101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11965080 - 11964871
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11965080 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttcaggacctaagtcctcaccgctaaacaccgcttt 11964981  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  11964980 gaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacatggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatcta 11964881  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    | ||||||||    
T  11964880 cttacaactc 11964871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 19443469 - 19443679
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  19443469 atgcatgtggtaccataa-cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 19443567  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatc 349  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| || ||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||    
T  19443568 tgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgactccgcttgtgtatatc 19443667  T
Q  350 tacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||    
T  19443668 tacatacaactc 19443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38312352 - 38312118
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc---tcatcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||| |||||   | |||||||||    
T  38312352 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattctttttatcaggaca 38312254  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttg-aacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctt 324  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| || |||||||||||    
T  38312253 tgagtcctcaccgct-aacaccgctttgaaacaacatggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccgcttttatgctt 38312155  T
Q  325 agacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38312154 atgcaactgacccacttgtgtatatttacatacaact 38312118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13314082 - 13313906
Alignment:
Q  190 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgaca 286  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||  || | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13314082 caccgctatagaatggttaaagtattcttttatcaggacatgagtcctcaccactaatcaccgttttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgaca 13313983  T
Q  287 aggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||| |||||| || ||||| ||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13313982 aggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactc 13313906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829952
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgt 344  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagt 16829966  T
Q  345 atatctacatacaa 358  Q
    ||||||||||||||    
T  16829965 atatctacatacaa 16829952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 360
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173967
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13303406 - 13303230
Alignment:
Q  190 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgaca 286  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13303406 caccgctatagaatggttaaagtattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgttttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgaca 13303307  T
Q  287 aggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||| |||||| || ||||| ||| || |||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13303306 aggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgtttatgcaactgacccacttgtatatatctacatacaactc 13303230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13324994 - 13324818
Alignment:
Q  190 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgaca 286  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| | ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13324994 caccgctatagaatgattaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccattttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgaca 13324895  T
Q  287 aggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||| |||||| || ||||| ||| || ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324894 aggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactc 13324818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Original strand, 12255215 - 12255334
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtg 343  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  12255215 caccgctttgatcaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgc-tttatacttatgcaactgacccacttgtg 12255313  T
Q  344 tatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12255314 tatatctacatacaactcaac 12255334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18129915 - 18129772
Alignment:
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttt 318  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   || ||||| ||||     
T  18129915 tcaggacataagtcctcaccactaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagggccctcccgctttc 18129816  T
Q  319 atgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18129815 atgcttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatacaact 18129772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Original strand, 23173786 - 23173888
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23173786 atgcatgtggtaccatattcagggt-gtaaccctcacctctgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 23173884  T
Q  255 gaac 258  Q
    ||||    
T  23173885 gaac 23173888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 292
Target Start/End: Original strand, 12363445 - 12363583
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  12363445 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttc 12363544  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcat 292  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12363545 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaaagacaatgcat 12363583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12479791 - 12479675
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  12479791 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtg 12479692  T
Q  344 tatatctacatacaact 360  Q
    |||||||||||||||||    
T  12479691 tatatctacatacaact 12479675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11850860 - 11850780
Alignment:
Q  136 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11850860 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 11850780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18136493 - 18136286
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||| |||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  18136493 atgcatgtggtaccatattaagggccggagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccactaatcaccgcttt 18136395  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||     ||||| |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  18136394 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagggtcgggaacctcccgctttcatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 18136295  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  18136294 catacaact 18136286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23372078 - 23371841
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23372078 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 23371980  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  23371979 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 23371881  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371880 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 23371841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14764332 - 14764095
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14764332 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 14764234  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  14764233 gagtcctca-tcattaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 14764135  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14764134 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 14764095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10597791 - 10597701
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10597791 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgcgactaactcacttgtgtatatctacatacaactc 10597701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12356056 - 12355944
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||  ||| || || ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  12356056 caccgctttgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacgaggcgttgcagggccagagcccttccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 12355957  T
Q  344 tatatctacatac 356  Q
    |||||||||||||    
T  12355956 tatatctacatac 12355944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12362605 - 12362493
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||  ||| || || ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  12362605 caccgctttgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacgaggcgttgcagggccagagcccttccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 12362506  T
Q  344 tatatctacatac 356  Q
    |||||||||||||    
T  12362505 tatatctacatac 12362493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 15518591 - 15518703
Alignment:
Q  251 ctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtata 347  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  15518591 ctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtata 15518690  T
Q  348 tctacatacaact 360  Q
    |||||||||||||    
T  15518691 tctacatacaact 15518703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 51300077 - 51300314
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  51300077 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 51300175  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  51300176 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 51300274  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51300275 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 51300314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20249337 - 20249101
Alignment:
Q  132 taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacata 229  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||  |||| || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  20249337 taagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatat-cagagccgaaaccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatg 20249239  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcc-cacttttatgcttaga 327  Q
    ||||||||  | | |||| || |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||      
T  20249238 agtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgctccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttatg 20249140  T
Q  328 caact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249139 caattgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20249101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 12419369 - 12419472
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||   ||| ||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12419369 agacttctcgataaatgcaaatatgcatatggtaccataatcagggccgaagccctcactgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 12419466  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  12419467 cctcac 12419472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16830178 - 16830055
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  16830178 atgcatgtggtaccataatcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 16830081  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttga 280  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||    
T  16830080 gagcaactagtgctccaccactttga 16830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 297
Target Start/End: Original strand, 10553831 - 10554015
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    | | || || ||| ||||||||||||||    
T  10553831 atgacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccaaagctctcatcgttgtagaatggttaaagca 10553929  T
Q  214 ttc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    |||  | |||||||||| |||||||| |  | |||| || |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  10553930 ttcttttatcaggacatgagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaggcgttccag 10554015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Original strand, 17496239 - 17496330
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17496239 ccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 17496330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10597933 - 10597826
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||  |||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10597933 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgtcaccactgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 10597836  T
Q  233 cctcactgct 242  Q
    |||||| |||    
T  10597835 cctcaccgct 10597826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18757020 - 18756930
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18757020 ccgctttgaacgacgaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 18756930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10390599 - 10390365
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  10390599 ctaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccat-ttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 10390501  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||     
T  10390500 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttat 10390402  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10390401 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactc 10390365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10415708 - 10415474
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  10415708 ctaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccat-ttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 10415610  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||     
T  10415609 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttat 10415511  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10415510 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactc 10415474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10422378 - 10422144
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  10422378 ctaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccat-ttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 10422280  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||     
T  10422279 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttat 10422181  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10422180 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactc 10422144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12034549 - 12034312
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | || | ||   ||| || |  | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12034549 ctaagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataat-agagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 12034451  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  12034450 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 12034352  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12034351 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 12034312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Original strand, 13692040 - 13692135
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13692040 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 13692135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11305829 - 11305740
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  11305829 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaagtaactccacttgtgtatatctatatacaac 11305740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Original strand, 14864763 - 14864804
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14864763 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 14864804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Original strand, 17130672 - 17130713
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17130672 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 17130713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8374133 - 8374077
Alignment:
Q  115 atgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8374133 atgacatgacaacacctctaagacccctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 8374077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 364
Target Start/End: Original strand, 12255747 - 12255779
Alignment:
Q  332 tacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12255747 tacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 12255779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30597067 - 30597011
Alignment:
Q  115 atgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30597067 atgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 30597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Original strand, 3802512 - 3802551
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3802512 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 3802551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18757153 - 18757059
Alignment:
Q  144 ataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||    
T  18757153 ataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagca--atcattaggacaaaagtcctcac 18757059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1989255 - 1989226
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989255 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 1989226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11850596 - 11850567
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11850596 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 11850567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13036978 - 13036949
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036978 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 13036949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14764043 - 14764014
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764043 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14764014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15011996 - 15011967
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15011996 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15011967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 17512726 - 17512755
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17512726 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 17512755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20249066 - 20249037
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249066 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20249037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23371789 - 23371760
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371789 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 23371760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 51300365 - 51300394
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300365 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 51300394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 15374638 - 15374694
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15374638 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 15374694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 17496119 - 17496200
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  17496119 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcat--tcatcagaatataagtcctcac 17496200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 18957721 - 18957777
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18957721 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 18957777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Original strand, 20187671 - 20187707
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20187671 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 20187707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38312083 - 38312055
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312083 ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 38312055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4614 - 4267
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  4614 cctacaatatcaatgattatgaaataggcataagtatttcctaatcaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcaacaacaacaactcaagtaatg 4515  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4514 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgcggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 4415  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4414 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctgtgaacaattagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 4315  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314 tatgcttatgcaactaatccacttgtgtatatctacatacaactcaac 4267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15771 - 15424
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15771 cctacaataacaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagttatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaatg 15672  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15671 acatgacacccctctaagactcctctataaatgcaactatgcatgtggtaccttattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattct 15572  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15571 catcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttt 15472  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471 tatgcttgtgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaactcaac 15424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 220 - 364
Target Start/End: Original strand, 71154 - 71299
Alignment:
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttta 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  71154 tcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgctttta 71253  T
Q  320 tgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  71254 tgcttatgcaactgacacacttgtgtatatctacatacaactcaac 71299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 364
Target Start/End: Original strand, 76837 - 76931
Alignment:
Q  273 cgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76837 cgctttgaacgacaaggcgttcccgggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 76931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 2428 - 2775
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| | ||||    
T  2428 cctacaatatccatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagatatagcaatttgatcaacaatagcaactcatgaaatg 2527  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 acatgacaccccactaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 2627  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2628 catcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttt 2727  T
Q  318 tatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2728 gatgcttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 46 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21566474 - 21566155
Alignment:
Q  46 cataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgat 145  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21566474 cataagtatttcataatcaacaacaatcatccagatatagcaattcagtcaacaacaacaactcatgtaaagacatgacacccctctaagactcctcgat 21566375  T
Q  146 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaa 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21566374 aaatgcaactatgcacgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcatgacataagtcctcaccgctcaa 21566275  T
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  21566274 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgt 21566175  T
Q  345 atatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21566174 atatctacatacaactcaac 21566155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29615511 - 29615170
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||| | ||||||    
T  29615511 tacaacatcaatgattattcaataggcataagtatttcataatcaacaacagtcatccaaatatag-aattcaatcaacaaatgcaactcatgaaatgac 29615413  T
Q  120 atgacacccctct-aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc 218  Q
    |||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29615412 atgacatcccccttaatactccccaataa-tgcaactatgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc 29615314  T
Q  219 atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttt 318  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  29615313 atcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttg 29615214  T
Q  319 atgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29615213 atgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactc 29615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 12167101 - 12167444
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  12167101 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcgacaacaatcattcaaatatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 12167198  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12167199 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattc 12167298  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12167299 tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 12167398  T
Q  317 ttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12167399 tgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 12167444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 19286010 - 19286353
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  19286010 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcgacaacaatcattcaaatatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 19286107  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19286108 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattc 19286207  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19286208 tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 19286307  T
Q  317 ttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19286308 tgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 19286353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 19877193 - 19877537
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  19877193 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcgacatcaatcattcaaatatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 19877290  T
Q  120 atgacacccctc---taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    |||||||||| |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19877291 atgacaccccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcatt 19877390  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19877391 ctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 19877490  T
Q  316 tttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19877491 ttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 19877537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 19882969 - 19883313
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  19882969 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcgacatcaatcattcaaatatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 19883066  T
Q  120 atgacacccctc---taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    |||||||||| |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19883067 atgacaccccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcatt 19883166  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19883167 ctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 19883266  T
Q  316 tttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19883267 ttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 19883313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19787186 - 19786842
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  19787186 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcgacaacaatcattcaaatatag-aatccaatcaacaatg-caactcatgatatgac 19787089  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19787088 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccattacccacaccactgtcgaatggttaaagcattc 19786989  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19786988 tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 19786889  T
Q  317 ttatgctt-agacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19786888 tgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 19786842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 24562260 - 24562491
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24562260 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 24562359  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  24562360 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 24562458  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24562459 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 24562491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 12941775 - 12942008
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941775 ctaagactcctcaacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 12941874  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12941875 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaa 12941973  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12941974 ctgacccacctgtgtatatctacatacaactcaac 12942008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28290409 - 28290182
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28290409 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 28290310  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||    
T  28290309 gtcctcaccact-aacatcactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactgttatgctcatgcaa 28290211  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28290210 ctgacccacttgagtatatctacatacaa 28290182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 104 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25470922 - 25470662
Alignment:
Q  104 caactcacgtaatgacatgacacccc--tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcg 200  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25470922 caactcatgttatgacacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcg 25470823  T
Q  201 aatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagc 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25470822 aatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagc 25470723  T
Q  301 cgaagctctcccacttttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  25470722 cgaagctctcccac-ttgatgattatgcaactacccaaccagtgtatacctacatacaactc 25470662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 138 - 364
Target Start/End: Original strand, 23837562 - 23837790
Alignment:
Q  138 tcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctc 236  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  23837562 tcctcaataaatgtaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagttctc 23837661  T
Q  237 actgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactaccc 336  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||    
T  23837662 accgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatggaactaccc 23837761  T
Q  337 -acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||    
T  23837762 aacctgtgtatctctacatacaactcaac 23837790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34647849 - 34647623
Alignment:
Q  136 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcc 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34647849 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcc 34647750  T
Q  235 tcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactac 334  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||    
T  34647749 tcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgtttatgcaactac 34647651  T
Q  335 cc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||    
T  34647650 ccaaccagtgtatatctacatacaactc 34647623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34641175 - 34640949
Alignment:
Q  136 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcc 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34641175 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcc 34641076  T
Q  235 tcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactac 334  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||    
T  34641075 tcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgtttatgcaactac 34640977  T
Q  335 cc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||    
T  34640976 ccaaccagtgtatatctacatacaactc 34640949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 18799251 - 18799425
Alignment:
Q  21 acaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  18799251 acaatatcaatgattattcaatacgcataagtatttcataatcaacaataatcatccagatatagcaattcaatcaacaataataactcatg-aatgaca 18799349  T
Q  121 tgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18799350 tgacgcccctctaagactcctcgaaaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgct 18799425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24514137 - 24513796
Alignment:
Q  24 atatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | | || | |||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||    
T  24514137 atatcaatgattattcaatatgcataaatatttcataatcaacaaca-tcatcaataatacaacaatacaatcaacaacaacgactcatgtaatggcatg 24514039  T
Q  123 acacccct-ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat 220  Q
    ||| |  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  24514038 acaacattactaagactcctcgacaaatgcaa-tatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattctttt 24513940  T
Q  221 caggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttta 319  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  24513939 caggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttaaacgacaaggcgttccagggccgaaaccctcccgctttta 24513840  T
Q  320 tgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24513839 tgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacaactc 24513796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 18788271 - 18788445
Alignment:
Q  21 acaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  18788271 acaatatcaatgattattcaataagaataagtatttcataatcaacaaaaatcatccagatatagcaattcaatcaacaataataactcatg-aatgaca 18788369  T
Q  121 tgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct 196  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18788370 tgacgccactctaagactcctcgaaaaatgcaactatacatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgct 18788445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726810
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 19726704  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19726705 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 19726804  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  19726805 tacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Original strand, 22906969 - 22907175
Alignment:
Q  160 atgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaac 258  Q
    ||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| |||||| |    
T  22906969 atgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagc 22907068  T
Q  259 aactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacataca 357  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  22907069 aactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcagctgacccacttgtgtatatctacataca 22907168  T
Q  358 actcaac 364  Q
    || ||||    
T  22907169 acccaac 22907175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 240 - 364
Target Start/End: Original strand, 18788443 - 18788568
Alignment:
Q  240 gctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18788443 gctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccac 18788542  T
Q  339 ttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18788543 ttgtgtatatctacatacaactcaac 18788568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 240 - 364
Target Start/End: Original strand, 18799423 - 18799548
Alignment:
Q  240 gctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18799423 gctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccac 18799522  T
Q  339 ttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18799523 ttgtgtatatctacatacaactcaac 18799548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 364
Target Start/End: Original strand, 19439782 - 19439912
Alignment:
Q  235 tcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-a 333  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |    
T  19439782 tcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactga 19439881  T
Q  334 cccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19439882 cccacttgtgtatatctacatacaactcaac 19439912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 364
Target Start/End: Original strand, 1592757 - 1592968
Alignment:
Q  154 ctatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||    
T  1592757 ctatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccact 1592855  T
Q  253 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||    
T  1592856 ttgagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtataccta 1592955  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
    |||||||| ||||    
T  1592956 catacaacccaac 1592968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29416643 - 29416432
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  29416643 atgcatgtggtaccatattcaaggtcgtagccctcacagctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 29416544  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| |||    
T  29416543 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgctccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatatac 29416444  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  29416443 atacaactcaac 29416432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33682380 - 33682180
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  33682380 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 33682283  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  33682282 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 33682183  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  33682182 tac 33682180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19588760 - 19588551
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19588760 atgcatgtggtaccataatcagggccgaatccctcaccgctaattgaatggttaaagtattcattttcatgacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 19588661  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||   ||||| |||||||||||    
T  19588660 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 19588561  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  19588560 catacaactc 19588551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 14033142 - 14033306
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  14033142 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 14033239  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14033240 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 14033306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 23835057 - 23835221
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  23835057 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 23835154  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23835155 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 23835221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27562715 - 27562551
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccat-attcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  27562715 atgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 27562618  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27562617 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccgctgttatg 27562551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289573
Alignment:
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagac 328  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttgatgtttatgc 11289607  T
Q  329 aactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11289606 aactacccaacctgtgtatatctacatacaactc 11289573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 19818899 - 19819106
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||  |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  19818899 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccttcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgcttt 19818998  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  19818999 gaacaacaaagtgttccacctctttgaacgacaaggcattccagggccggagc-ctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatcta 19819097  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  19819098 catacaact 19819106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8760562 - 8760394
Alignment:
Q  198 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattcca 296  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  8760562 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacgactagtgttccaccactttgaacaacaaggcgttcca 8760463  T
Q  297 gagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8760462 gggcagaagccctccagcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatattcacatacaactcaac 8760394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14375489 - 14375279
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14375489 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaggattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 14375390  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||   ||||| ||||||||||    
T  14375389 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttaagcttatgcaaataactccactagtgtatatct 14375290  T
Q  351 acatacaactc 361  Q
    |||||||||||    
T  14375289 acatacaactc 14375279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28360032 - 28359868
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  28360032 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 28359935  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28359934 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 28359868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 2708368 - 2708577
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  2708368 atgcatgtggtaccatatttagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagttctcaccgctaaacaccgctt 2708467  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  2708468 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcctatgcaactaactccacttgtgtatatct 2708567  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  2708568 acatacaact 2708577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 937859 - 937655
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  | |  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  937859 atgcatgtggtaccataatcatgaccttagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcacctct-aacaccacttt 937761  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  937760 gagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttctatgcttatgcaattgacccactcgtgtatatctaca 937661  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  937660 tacaac 937655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 14724364 - 14724573
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  14724364 atgcatgtggtaccataatcagggttggggccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggatataagttctcaccgctaatcaccgctt 14724463  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  14724464 tgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 14724563  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  14724564 catacaactc 14724573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8768260 - 8768141
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  8768260 caccgctttgaacaactagtgttccaccattttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctccagcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgt 8768161  T
Q  345 atatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8768160 atatctacatacaactcaac 8768141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 364
Target Start/End: Original strand, 15457423 - 15457675
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  15457423 atgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagca 15457521  T
Q  214 ttct---catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctct 309  Q
    ||||    |||||||||| ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||    
T  15457522 ttctttatatcaggacatgagtcctccc--attaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcct 15457619  T
Q  310 cccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | |  ||||||| |||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457620 caccgttttatg-ttatgcgactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15457675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 364
Target Start/End: Original strand, 15464018 - 15464270
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  15464018 atgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagca 15464116  T
Q  214 ttct---catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctct 309  Q
    ||||    |||||||||| ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||    
T  15464117 ttctttatatcaggacatgagtcctccc--attaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcct 15464214  T
Q  310 cccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | |  ||||||| |||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464215 caccgttttatg-ttatgcgactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15464270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14616449 - 14616240
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||   ||  |||||||  | ||||| |||||||||||   | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  14616449 atgcatgtggtaccgtattcagggccggagccgtcaccgctaatagaatgtttaaagcattcattttaggacataagtcatcaccgctaaacaccgcttt 14616350  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  14616349 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 14616250  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  14616249 catacaactc 14616240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581826
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct--catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataa-cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcaggacatgagtcctcaccgttaaacaccgctt 14581936  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaactacccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||| || || |||||||||  |||||| || ||| ||||||| ||    
T  14581935 tgaacaacattgtgttcctccactttgaatgacaaggcattccaggaccgaagtcctcaccgctattatgcttatgcaactaaccccttatgtatatata 14581836  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  14581835 catacaactc 14581826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300639
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  19300846 atgcatgtggtaccatat-caggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgct-aacaccgctt 19300749  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||   ||||||| ||| || ||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||    
T  19300748 tgaacaacatagtgttccaccactttgaacgacaaagcgttccaagaccgaagccctcaccgcttttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatct 19300649  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  19300648 acatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21724934 - 21724728
Alignment:
Q  159 catgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaa 257  Q
    |||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || || ||| ||||||     
T  21724934 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aataccactttgag 21724836  T
Q  258 caactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatac 356  Q
    ||||||||  |||||| |||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21724835 caactagtactccaccactttgatctattaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatac 21724736  T
Q  357 aactcaac 364  Q
    ||| ||||    
T  21724735 aacccaac 21724728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 31251344 - 31251581
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---atcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  31251344 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatat-cagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 31251442  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctct-cccacttttatgctta 325  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |  ||  ||  |||||||||||    
T  31251443 tgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccaggaccgaggtcctaaccgtttttatgctta 31251540  T
Q  326 gacaacta--cccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31251541 tgcaactaactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 31251581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14996084 - 14995915
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14996084 gaatggttaaagcattccttttcaggacatgagtcctcaccattaaacaccgctttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14995985  T
Q  298 agccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||  |||| ||| || |||||||| |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14995984 ggcataagccctcaccgcttttatgattatgcaactgactccgcttgtgtatatctacatacaactcaac 14995915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5290341 - 5290259
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5290341 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggacgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 5290259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23234986 - 23234896
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23234986 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 23234896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21365684 - 21365432
Alignment:
Q  117 gacatgacacccct-ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||    
T  21365684 gacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcatt 21365586  T
Q  216 c--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-c 311  Q
    |  | |||||||||| |||||||| |  | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||      
T  21365585 cttttatcaggacatgagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcat 21365487  T
Q  312 cacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21365486 cgtttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 21365432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23969666 - 23969414
Alignment:
Q  117 gacatgacacccct-ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||    
T  23969666 gacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcatt 23969568  T
Q  216 c--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-c 311  Q
    |  | |||||||||| |||||||| |  | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||      
T  23969567 cttttatcaggacatgagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcat 23969469  T
Q  312 cacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23969468 cgtttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 23969414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 4476340 - 4476577
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  4476340 ctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 4476438  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  4476439 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 4476537  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4476538 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 4476577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11284160 - 11283984
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaa-tcgacaataa-caactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||   ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||| || |||| |  |||| || || |||    
T  11284160 tacaatatcaaagattattcaataagcatagttatttcataatcaacaacaatcatccata-atag-aatccaaatcaacaaaatgcaacccatgttatg 11284063  T
Q  118 acatgacacccc--tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggtcgtgacccacacc 193  Q
    ||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11284062 acacgacatccccatctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacacc 11283984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Original strand, 17414114 - 17414205
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17414114 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 17414205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Original strand, 25347057 - 25347143
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  25347057 ctaagacacctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 25347143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26418866 - 26418762
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26418866 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtatcataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 26418769  T
Q  232 tcctcac 238  Q
    |||||||    
T  26418768 tcctcac 26418762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Original strand, 18786038 - 18786144
Alignment:
Q  132 taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||| |||||||  | |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18786038 taagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggcagaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatt-tattcaggacataa 18786136  T
Q  231 gtcctcac 238  Q
    ||||||||    
T  18786137 gtcctcac 18786144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23233467 - 23233377
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac-tac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23233467 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgctcatgcaacttactccacttgtgtatatctacatacaact 23233377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20009082 - 20008844
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20009082 ctaagactcctcaacaaatgtaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 20008984  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccg-ctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgctta 325  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||    
T  20008983 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgtttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgctta 20008885  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
      ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20008884 tgcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 20008844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5290200 - 5290109
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  |||| || ||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5290200 ccgctttgaacgacaaggcgttcccggaccgaggccctcccgcttttatgctcatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 5290109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23235128 - 23235021
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||| || ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23235128 agactcctcaaaaaataaaaatatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 23235031  T
Q  233 cctcactgct 242  Q
     ||||| |||    
T  23235030 actcaccgct 23235021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26418723 - 26418633
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  26418723 ccgctttgaacgacaaggcgttccaggacagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatacctacatacaactc 26418633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20011141 - 20011100
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20011141 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata 20011100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23021545 - 23021424
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||   ||| ||||||| | |||||||||||| |    
T  23021545 atgacatgacgacaccactaagacacctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca-aaacaggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaa 23021447  T
Q  214 ttctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  23021446 t--tcatcaggacataagtcctcac 23021424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19472376 - 19472289
Alignment:
Q  280 aacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472376 aacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccactttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 19472289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17207933 - 17207833
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||  |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  17207933 atgacatgacgaccccactaagactcctcaataa-tgcaattatgcatgtggtacca-aaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagca 17207836  T
Q  214 ttc 216  Q
    |||    
T  17207835 ttc 17207833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 25395972 - 25396014
Alignment:
Q  128 cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  25395972 cctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 25396014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 217
Target Start/End: Original strand, 31250267 - 31250352
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  31250267 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattct 31250352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 221852 - 221881
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221852 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 221881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 21469905 - 21469934
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21469905 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21469934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 21476406 - 21476435
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21476406 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21476435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 25347269 - 25347298
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25347269 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 25347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 94666 - 94630
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  94666 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 94630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12447392 - 12447336
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12447392 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 12447336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 27767317 - 27767373
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  27767317 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtacca 27767373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 11846915 - 11847259
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||    
T  11846915 cctacaatatccatggttattcaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagatatagcaattcgatcaacaatagcaactcatgaaatg 11847014  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11847015 acatgacaccccactaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataaacagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 11847114  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11847115 caacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 11847214  T
Q  318 tatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
     ||| |||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11847215 gatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatcttcatacaactc 11847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Original strand, 18212113 - 18212347
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212113 tctaagactcctc-acaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 18212211  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18212212 agtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgca 18212311  T
Q  330 act-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212312 actgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18212347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 15406774 - 15407118
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  15406774 cctacaatatcaatgattattctatatgcataagtatttcataatcaacaaca-tcatccagatatagcaattcaaccaacaacaacaactcatgtaatg 15406872  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||| | |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  15406873 acatgacaacacctctaagactccttgacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattc 15406971  T
Q  217 -tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
     |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  15406972 attttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctctcgct 15407071  T
Q  316 tttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15407072 ttcatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactc 15407118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8047220 - 8046868
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||| | ||||||    
T  8047220 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcaacaacaatcatccaaatatag-aattcaatcaacaaatgcaactcatgaaatgac 8047122  T
Q  120 atgacacccctc------------taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggt 206  Q
    | |||||||| |            ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8047121 acgacacccccccccccccccccctaatactcctcaataa-tgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggt 8047023  T
Q  207 taaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagc 306  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8047022 taaagcattctcaacaggacctaagtcctcactgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagc 8046923  T
Q  307 tctcccacttttatgcttagacaactaccca-cttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||  ||| |||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8046922 tctcccacttg-atgtttatgccactacccaacctgtgtatatctacatacaactc 8046868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 15533761 - 15533994
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533761 ctaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 15533860  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15533861 gtcctcaccact-aacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaa 15533959  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533960 ctgacccacctgtgtatatctacatacaactcaac 15533994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Original strand, 14485372 - 14485717
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||| | |||| ||| ||||| | | ||    
T  14485372 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcataaatatttcataatcaacaacac-catcaaaatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcattg 14485470  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcatt 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  14485471 acatgacaacacctctaagactcctcgataattacgactatgcttgtggtaccatatt-agggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcatt 14485569  T
Q  216 ctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccca 313  Q
    ||  | |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||     
T  14485570 ctttttcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggccgaagccctcccg 14485669  T
Q  314 cttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14485670 cttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121809
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 23121698  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23121699 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 23121798  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  23121799 tacaacccaac 23121809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4831265 - 4831054
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  4831265 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 4831166  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| |||    
T  4831165 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatatac 4831066  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  4831065 atacaactcaac 4831054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4834560 - 4834349
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  4834560 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 4834461  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatctac 352  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| |||    
T  4834460 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatatac 4834361  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  4834360 atacaactcaac 4834349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 159 - 364
Target Start/End: Original strand, 14484432 - 14484639
Alignment:
Q  159 catgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaa 257  Q
    |||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||     
T  14484432 catgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgag 14484531  T
Q  258 caactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatac 356  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14484532 caactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtgtatctacatac 14484631  T
Q  357 aactcaac 364  Q
    ||| ||||    
T  14484632 aacccaac 14484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26077890 - 26077678
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26077890 atgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 26077791  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||||||    
T  26077790 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttcagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatcta 26077691  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||    
T  26077690 catacaactcaac 26077678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 635940 - 635739
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  635940 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 635842  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  635841 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 635742  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  635741 tac 635739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11171440 - 11171225
Alignment:
Q  151 caactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacacc 249  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  11171440 caaccatgcatgtagtaccataatcagggtcgtagccctcaccgccgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacacc 11171341  T
Q  250 gctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatat 348  Q
     |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11171340 actttgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatat 11171241  T
Q  349 ctacatacaactcaac 364  Q
     ||||||| |||||||    
T  11171240 atacataccactcaac 11171225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 16156630 - 16156844
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16156630 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 16156729  T
Q  253 ttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt-ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatc 349  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  16156730 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaggccgaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccactcgtgtatatc 16156829  T
Q  350 tacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||    
T  16156830 tacatacaactcaac 16156844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53748927 - 53748763
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  53748927 atgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 53748830  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53748829 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 53748763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41800128 - 41799964
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  41800128 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 41800031  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41800030 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 41799964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 42701226 - 42701390
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  42701226 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 42701323  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42701324 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 42701390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51602249 - 51602085
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  51602249 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 51602152  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51602151 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 51602085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51608130 - 51607966
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  51608130 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 51608033  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51608032 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 51607966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17000344 - 17000134
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||   || |||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||  || |||||| ||||    
T  17000344 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagtcctcaccgctgtaaaatggttaaaacattcattttcaggacataagttctcaccactaaacaccacttt 17000245  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17000244 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 17000145  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  17000144 tacaacccaac 17000134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 364
Target Start/End: Original strand, 14048228 - 14048412
Alignment:
Q  185 acccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaa 281  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14048228 accctcaccgctgatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaa 14048327  T
Q  282 cgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048328 cgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14048412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 360
Target Start/End: Original strand, 14910560 - 14910792
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | || |||||||    
T  14910560 ctaagactactcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttataaggacat 14910659  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||||  |  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| || ||||||||||||     
T  14910660 gagtcctcac--cctaacatcgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttat 14910757  T
Q  327 acaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14910758 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14556260 - 14556050
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14556260 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 14556161  T
Q  253 ttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatc 349  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  14556160 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgctactgacccacttgtgtatatc 14556061  T
Q  350 tacatacaact 360  Q
    |||||||||||    
T  14556060 tacatacaact 14556050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 14062908 - 14063116
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14062908 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 14063007  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||| ||    
T  14063008 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatacct 14063107  T
Q  351 acatacaac 359  Q
    |||||||||    
T  14063108 acatacaac 14063116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43285072 - 43284868
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| | || |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  43285072 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctctcctctgtagaatggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 43284974  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  43284973 gagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccactcttgtatatctaca 43284874  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  43284873 tacaac 43284868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Original strand, 20940260 - 20940463
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  20940260 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 20940358  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20940359 gagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctaca 20940458  T
Q  354 tacaa 358  Q
    |||||    
T  20940459 tacaa 20940463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41529263 - 41529054
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41529263 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 41529164  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  41529163 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgtttcagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 41529064  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||| ||||    
T  41529063 acatataact 41529054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 316
Target Start/End: Original strand, 16152484 - 16152648
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16152484 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 16152583  T
Q  253 ttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  16152584 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccactt 16152648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 361
Target Start/End: Original strand, 15324919 - 15325082
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccaga 298  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15324919 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaa-accgctttgaacatcaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagg 15325017  T
Q  299 gccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||   |||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15325018 gcagaagccctcccgcttttatgcttatgtaactaactccactggtgtatatctacatacaactc 15325082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2585346 - 2585135
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  2585346 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 2585248  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||| |||||||    
T  2585247 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgcatatcta 2585148  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||    
T  2585147 catacaactcaac 2585135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 360
Target Start/End: Original strand, 27905244 - 27905418
Alignment:
Q  190 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgaca 286  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27905244 caccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctctccgct-aacaccgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgaca 27905342  T
Q  287 aggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |||| ||| ||  |||| || ||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27905343 aggcgttctaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttattcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 27905418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1651236 - 1651026
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |   ||| ||||||    
T  1651236 atgcatgtggtaccataa-cagggtcggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgtcaaactccgctt 1651138  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatc 349  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| || ||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||    
T  1651137 tgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgactccgcttgtgtatatc 1651038  T
Q  350 tacatacaactc 361  Q
    ||| ||||||||    
T  1651037 tacttacaactc 1651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 282
Target Start/End: Original strand, 16221226 - 16221355
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16221226 atgcatgtggtaccatattcagggacgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaacgctaaacaccgctt 16221325  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaac 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16221326 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaac 16221355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908792
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataa-cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgttaaacaccgctt 40908681  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |   | ||||||||  ||||| || || |||||||||||||    
T  40908682 tgaacaacattgtgttccaccactttgaatgacaaggcattccaggaccgaaaccctcaccgctgtatgcttatgcaactgactccgcttgtgtatatct 40908781  T
Q  351 acatacaactc 361  Q
    |||||||||||    
T  40908782 acatacaactc 40908792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Original strand, 13452204 - 13452311
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13452204 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 13452301  T
Q  233 cctcactgct 242  Q
    ||||||||||    
T  13452302 cctcactgct 13452311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Original strand, 14048121 - 14048227
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14048121 gaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgttttgaacgacaaggcgttccag 14048220  T
Q  298 agccgaa 304  Q
     ||||||    
T  14048221 ggccgaa 14048227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 30146777 - 30146978
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||          ||||||    
T  30146777 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcac----------cgcttt 30146865  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||   || ||||| |||||||| |||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  30146866 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatgta 30146965  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
     ||||||||||||    
T  30146966 gatacaactcaac 30146978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10977241 - 10977120
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaag 211  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||   ||| |||||||  | ||||||||||||    
T  10977241 aatgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcgactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaag 10977142  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcct 235  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  10977141 cat--tcatcaggacataagtcct 10977120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Original strand, 13453847 - 13453937
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13453847 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatttaactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 13453937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 12931958 - 12932049
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12931958 ccgctttgaacgacaaggcattccagggcaagagctctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 12932049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 361
Target Start/End: Original strand, 37881521 - 37881607
Alignment:
Q  276 tttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac-tacccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37881521 tttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgacttactcacttgtgtatatctacatacaactc 37881607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 15306958 - 15307015
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  15306958 aatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 15307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 42220340 - 42220396
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42220340 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 42220396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 13886852 - 13886881
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13886852 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 13886881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 13887718 - 13887747
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13887718 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 13887747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 170
Target Start/End: Original strand, 15244068 - 15244113
Alignment:
Q  125 acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  15244068 acccctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtgttacca 15244113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 15244285 - 15244314
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15244285 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15244314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16147975 - 16147934
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16147975 ctaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccata 16147934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 17176547 - 17176576
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17176547 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 17176576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 18261483 - 18261512
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18261483 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18261512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 18271448 - 18271477
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18271448 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18271477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27849466 - 27849437
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27849466 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 27849437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 30237933 - 30237962
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237933 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 30237962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19128517 - 19128461
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  19128517 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 19128461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 33097002 - 33097058
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  33097002 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 33097058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42956177 - 42956141
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42956177 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 42956141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45959897 - 45959861
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45959897 agactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtacca 45959861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47872577 - 47872541
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47872577 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 47872541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54845103 - 54845067
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  54845103 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 54845067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14057921 - 14057575
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  14057921 cctacaatatcaatgattattcattaagcataagtatttcataatcaacaaca-tcatccagatataacaattcaaccaacaacaacaactcatgtaatg 14057823  T
Q  118 acatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14057822 acatgacaaccctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattct 14057723  T
Q  218 catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt 317  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14057722 tatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 14057623  T
Q  318 tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14057622 tatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatttacatacaactcaac 14057575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19903243 - 19902896
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |   |||||||  | ||||    
T  19903243 tacaatatcaatgattattcaataagcataggtatttcataaatcaacaacaatcatccata-atagcaattcaatcaacgaatgcaactcatcttatga 19903145  T
Q  119 catgaca--cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    || ||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19903144 cacgacatccccccctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 19903045  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19903044 ctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccact 19902945  T
Q  316 tttatgcttagacaactaccca-cttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  ||  |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19902944 tg-atatttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 19902896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Original strand, 25409424 - 25409735
Alignment:
Q  26 atcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||| |  ||  ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||    
T  25409424 atcaatgattattcaacaggcataaacttttcataatcaa-agcaatcatccacaattattaattcaatcgacaaatgcaactcatgaaatgacatgaca 25409522  T
Q  126 -cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagg 224  Q
     |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25409523 tcccccctaattctcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagg 25409622  T
Q  225 acataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 324  Q
    || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25409623 acctaagtcatcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcccactttgatgttt 25409722  T
Q  325 agacaactaccca 337  Q
    |  ||||||||||    
T  25409723 atgcaactaccca 25409735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 17053461 - 17053804
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||||| | ||||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  17053461 tacaacatcaatgattattaaataagcataggtatttcataatcgacaacaatcatttaaatatag-aattcaatcaacaatg-caactcatgatatgac 17053558  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17053559 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgccgaatggttaaagcattc 17053658  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17053659 tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccactt 17053758  T
Q  317 ttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17053759 tgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 17053804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 23825102 - 23825333
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23825102 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 23825201  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  23825202 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 23825300  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23825301 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 23825333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Original strand, 44476211 - 44476443
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44476211 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 44476310  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  44476311 agtcctcaccgctccacaccgttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 44476410  T
Q  330 actaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  44476411 actacccaacctgtgtatctctacatacaactc 44476443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Original strand, 44479473 - 44479705
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44479473 ctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaccta 44479572  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  44479573 agtcctcaccgctccacaccgttttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgca 44479672  T
Q  330 actaccc-acttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  44479673 actacccaacctgtgtatctctacatacaactc 44479705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 23865302 - 23865643
Alignment:
Q  23 aatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacat 121  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||  ||  |||  | |||| |     
T  23865302 aatatcaatgattattcaataagcataagtatttcataaatcaacaacaatcatccatag-tag-aattcaatcaacaatg-cagttcatcttatgatac 23865398  T
Q  122 gaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattc-agggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 219  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23865399 gacatcccccctaatactcctcaataaatgcaagtatgcatgtggtaccataatccagggccatgacccacaccgctgtcaaatggttaaagcattctca 23865498  T
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttta 319  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  23865499 acaggacataagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttga 23865597  T
Q  320 tgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23865598 tgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 23865643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30767145 - 30766917
Alignment:
Q  137 ctcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctc 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30767145 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcataaggacctaagtcctc 30767046  T
Q  237 actgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactac- 334  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||     
T  30767045 accgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgc-tatgcaactact 30766947  T
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  30766946 caacctgtgtatatctacatacaactcaac 30766917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 325
Target Start/End: Original strand, 18609716 - 18609962
Alignment:
Q  80 atatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagg 178  Q
    |||||||||||||  | |||| ||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609716 atatagcaattcatccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagg 18609815  T
Q  179 gtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttt 278  Q
    | ||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609816 gccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttt 18609915  T
Q  279 gaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgctta 325  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18609916 caacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgctta 18609962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025551
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 22025663  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22025662 tgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtctatatctac 22025563  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  22025562 atacaactcaac 22025551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22063765 - 22063554
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22063765 atgcatttagtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 22063666  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22063665 tgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccggagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 22063566  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||    
T  22063565 atacaactcaac 22063554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 364
Target Start/End: Original strand, 21282049 - 21282269
Alignment:
Q  147 aatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctca 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||      
T  21282049 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcgtcaccgctat 21282148  T
Q  245 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtg 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  21282149 acaccgctttgaacaacaagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 21282248  T
Q  344 tatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21282249 tatatctacatacaactcaac 21282269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 225 - 364
Target Start/End: Original strand, 25110911 - 25111051
Alignment:
Q  225 acataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 324  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25110911 acataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 25111010  T
Q  325 agacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25111011 atgcaactaacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 25111051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Original strand, 21668901 - 21669067
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccaga 298  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21668901 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21669000  T
Q  299 gccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21669001 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgactcacttgtgtatatatacatacaactcaac 21669067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009428
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 41009538  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||   ||||| |||||||||||    
T  41009537 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 41009438  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  41009437 catacaactc 41009428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177790
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || |||||| ||||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcttcaccact-aacaccacttt 22177684  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22177685 gagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttttgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 22177784  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  22177785 tacaac 22177790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21327027 - 21326818
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21327027 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 21326928  T
Q  253 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact--acccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||  |||||  | ||||||||||||||||    
T  21326927 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaaatccacttgtgtatatct 21326828  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  21326827 acatacaact 21326818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9273360 - 9273159
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  9273360 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagaacataagtcctcaccact-aacaccacttt 9273262  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  9273261 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 9273162  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  9273161 tac 9273159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1804668 - 1804467
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  1804668 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 1804571  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  1804570 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctac 1804471  T
Q  353 atac 356  Q
    ||||    
T  1804470 atac 1804467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 36799376 - 36799577
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  36799376 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 36799473  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  36799474 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctac 36799573  T
Q  353 atac 356  Q
    ||||    
T  36799574 atac 36799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18681703 - 18681539
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  18681703 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 18681606  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18681605 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 18681539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322230
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21322439 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 21322340  T
Q  253 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  | ||||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  21322339 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatct 21322240  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  21322239 acatacaact 21322230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31568012 - 31567848
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  31568012 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 31567915  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31567914 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 31567848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31573233 - 31573069
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  31573233 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 31573136  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatg 321  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31573135 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 31573069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050405
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccact-aacaccacttt 22050299  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
     | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  22050300 aagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctaca 22050399  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  22050400 tacaac 22050405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055923
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  || |||||| ||||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaaatcctcaccact-aacaccacttt 22055817  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
     | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  22055818 aagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctaca 22055917  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  22055918 tacaac 22055923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 10606931 - 10607141
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  10606931 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcgt 10607030  T
Q  254 tgaacaactag-tgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  10607031 tgaacaacaaggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatct 10607130  T
Q  351 acatacaactc 361  Q
    |||||||||||    
T  10607131 acatacaactc 10607141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 25110731 - 25110893
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcattt-cataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||| |||||    
T  25110731 cctataatatcaatgattattcaatatgcataagtattttcataatcaacaaca-tcatccagatatagcaattcaatcaacatcatcaattcatgtaat 25110829  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaggg 179  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25110830 gacatgacaacacccctaagactcctcgacaaatgcagccatgcatgtggtaccatattcaggg 25110893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20974201 - 20973992
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  20974201 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcatcgctaaacaccgctt 20974102  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20974101 tgaacaacttgtgttccaccgctttgaactataaggctttctagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccgcttgtttatatcta 20974002  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  20974001 catacaactc 20973992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19988367 - 19988159
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19988367 atgcatgtggtaccatatttagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 19988268  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt-ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||| ||||| |||  |||||||   ||||| ||||||| |||||||||||    
T  19988267 caacaacaaaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggaaagagccctcccgcttcatatgcttttgcaactgacccactagtgtatatcta 19988168  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  19988167 catacaact 19988159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21300229 - 21300114
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  21300229 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaaggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 21300130  T
Q  344 tatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||||||    
T  21300129 tatatctacatacaac 21300114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23653224 - 23653083
Alignment:
Q  97 acaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgc 195  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||    
T  23653224 acaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgc 23653125  T
Q  196 t-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23653124 taattgaatggttaaagcat--ttatcaggacataagtcctcac 23653083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27942375 - 27942221
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc---tcatcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| ||||| | | ||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  27942375 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaaacattcttttcatcaggaca 27942277  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacga 284  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27942276 tgagtcctccc--attaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacga 27942221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31412710 - 31412602
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31412710 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 31412613  T
Q  232 tcctcactgct 242  Q
    |||||||||||    
T  31412612 tcctcactgct 31412602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31418892 - 31418784
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31418892 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 31418795  T
Q  232 tcctcactgct 242  Q
    |||||||||||    
T  31418794 tcctcactgct 31418784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20840101 - 20839893
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||   ||| ||| |||  | |||| ||||||||||||   ||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  20840101 atgcatttggtaccatattcagggccggagccctcactgctaattgaattgttaaagcattcatttcatgacataagtcttcattgctaaacacctcttt 20840002  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  | |   || ||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  20840001 gaacaacaaagtgttccacttctttgaacgacaaggcgttccatggtcagggccctcccgcttttatacttatacaactgactccacttgtgtatatcta 20839902  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  20839901 catacaact 20839893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22176107 - 22176026
Alignment:
Q  282 cgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22176107 cgacaaggcgttccagagccgaatctctccc--ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 22176026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24321804 - 24321567
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  24321804 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa-cagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 24321706  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  24321705 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 24321607  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24321606 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 24321567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8729214 - 8728979
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  8729214 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 8729116  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaag--ctctcccacttttatgctta 325  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |   |||||||||||    
T  8729115 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgttttttatgctta 8729017  T
Q  326 gacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
      ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8729016 tgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactc 8728979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 23653817 - 23653920
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  23653817 agactcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcat--tcattaggacataagt 23653914  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  23653915 cctcac 23653920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8596293 - 8596113
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc-atcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8596293 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattctttatcaggacat 8596195  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc 310  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  8596194 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctc 8596113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31412563 - 31412477
Alignment:
Q  276 tttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| | ||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31412563 tttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctctcgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatccacatacaactc 31412477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31418745 - 31418659
Alignment:
Q  276 tttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| | ||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31418745 tttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctctcgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatccacatacaactc 31418659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8728945 - 8728916
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8728945 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 8728916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20012175 - 20012146
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20012175 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20012146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21300354 - 21300293
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  21300354 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 21300293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21683683 - 21683654
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21683683 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21683654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21688032 - 21688003
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21688032 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 21688003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 22743888 - 22743917
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22743888 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 22743917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 39363667 - 39363696
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363667 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 39363696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14416745 - 14416689
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14416745 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 14416689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 71 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 135
Alignment:
Q  71 atcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  429 atcatccagatacagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgacaaatgcaattatgcatgtggtacca 330  T
Q  171 tattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttcc 270  Q
    | ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  329 tgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttcc 230  T
Q  271 accgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229 accgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19664442 - 19664097
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  19664442 tacaatatcaatgattattcaatatgcataagtatttcataatcaacaaca-tcatccagatatagcaattcaaccaacaacaacaactcatgtaatgac 19664344  T
Q  120 atgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc 218  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  19664343 atgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattctt 19664244  T
Q  219 atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19664243 atcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttta 19664144  T
Q  319 atgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664143 atgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 19664097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 41110678 - 41111021
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  41110678 tacaacatcaatgattattcaataagtataggtatttcataatcgacaacaatcattcaaatatag-aattcaatcaacaatt-caactcatgatatgac 41110775  T
Q  120 atgacacccctct--aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41110776 atgacacccccctttaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtgataccataattcagggtcatgacccacaccattgtcgaatggttaaagcattc 41110875  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41110876 tcagcatgacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 41110975  T
Q  317 ttatgcttagacaacta-cccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    | ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41110976 tgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatacaactc 41111021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 117 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20438748 - 20438499
Alignment:
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20438748 gacatgacctccccctaatactcctaaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 20438649  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20438648 ctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 20438549  T
Q  316 tttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||| |||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  20438548 ttgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatctctacatacaactcaac 20438499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 21542034 - 21542265
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21542034 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 21542133  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  21542134 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 21542232  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21542233 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 21542265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42096102 - 42095871
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42096102 agactcctcagtaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 42096003  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  42096002 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 42095904  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42095903 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 42095871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20046193 - 20045851
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaata-acaactcacgtaatga 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||   |||| |||| ||||||||||||| ||  ||  | ||| ||||| |||| | |||||||| || ||||    
T  20046193 tacaatatcaaagattattcaataagcatagttattttataatcaacaacaatcattca--taatggaatccaatcaacaaaatacaactcatgttatga 20046096  T
Q  119 catgacacccc--tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    || |||| |||  ||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20046095 cacgacatccccatctaatactcctcaaaaaatgaaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaagcatt 20045996  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  20045995 ctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccgc- 20045897  T
Q  316 tttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    || ||| |||   |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20045896 ttgatgtttatgaaactacccaacctgtgtatatctacatacaact 20045851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 32650102 - 32650309
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32650102 atgcatgtggtaccatattcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttg 32650201  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctaca 353  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  32650202 aacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctaca 32650301  T
Q  354 tacaactc 361  Q
    ||||||||    
T  32650302 tacaactc 32650309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23066878 - 23066668
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || |||||| ||||    
T  23066878 atgcatgtggtaccaaaatcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccacttt 23066779  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23066778 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 23066679  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  23066678 tacaacccaac 23066668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778430
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  19778639 atgcatgtggtaccataatcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagct 19778540  T
Q  253 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  19778539 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatct 19778440  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  19778439 acatacaact 19778430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 364
Target Start/End: Original strand, 20242599 - 20242743
Alignment:
Q  221 caggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttat 320  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242599 caggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttat 20242698  T
Q  321 gcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242699 gcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20242743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29554623 - 29554414
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29554623 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 29554524  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  29554523 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 29554424  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  29554423 catacaactc 29554414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706736
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 3706841  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3706840 gagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctaca 3706741  T
Q  354 tacaa 358  Q
    |||||    
T  3706740 tacaa 3706736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 27280192 - 27280393
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  27280192 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 27280290  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  27280291 gagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 27280390  T
Q  354 tac 356  Q
    |||    
T  27280391 tac 27280393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941826
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 20941935  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||  |||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  20941934 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccttcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 20941835  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  20941834 catacaact 20941826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 19961135 - 19961342
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  19961135 atgcatgtggtaccatat-cagagccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatccggacatgagtcctcaccgct-aacaccgctt 19961232  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatct 350  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19961233 cgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatct 19961332  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  19961333 acatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16883719 - 16883510
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16883719 atgcatatggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 16883620  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgc-tttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  16883619 gaacaacaaagtgttccaccgcttttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatct 16883520  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  16883519 acatacaact 16883510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448241
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||          | ||||    
T  22448440 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcac----------cacttt 22448351  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-----acccacttgtgtatatc 349  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |     |||||||||||||||||    
T  22448350 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttctacttttatgcttatgcaattaattgacccacttgtgtatatc 22448251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20838280 - 20838140
Alignment:
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt-tt 318  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||| ||    
T  20838280 tcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaatgttccaccactttgaacgacaaggcattccagggcagaatccctcccgcttatt 20838181  T
Q  319 atgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20838180 atgcttatgcaactaacccacttgtgtatatccacatacaa 20838140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20824445 - 20824329
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt-ttatgcttagacaact-acccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  20824445 caccgctttgaacaacaagtgttccacctctttgaacgacaaggcgttctagagcagaagccctcccgcttattatgcttatgcaactaacctacttgtg 20824346  T
Q  344 tatatctacatacaact 360  Q
    |||||||||||||||||    
T  20824345 tatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955033
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccacttttatgctcatgctactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaac 955033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 16371512 - 16371749
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||   ||| || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16371512 ctaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 16371610  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
    |||||||||  | | |||| || |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||  |||  |  |||||||||||     
T  16371611 aagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgctccatcgttttgaacgacaaggctttccagaacccaagtcctcatcgtttttatgcttat 16371709  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371710 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 16371749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23195675 - 23195572
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagt 232  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23195675 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagt 23195578  T
Q  233 cctcac 238  Q
    ||||||    
T  23195577 cctcac 23195572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20852267 - 20852030
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20852267 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa-cagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 20852169  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  20852168 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 20852070  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20852069 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 20852030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20858893 - 20858656
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20858893 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataa-cagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 20858795  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  20858794 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 20858696  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20858695 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 20858656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Original strand, 21732569 - 21732683
Alignment:
Q  247 accgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgt 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||  ||| ||||| | ||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  21732569 accgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttctagggccagagccctcccgc-tttatgcttatgcaactgactccacttgtgt 21732667  T
Q  345 atatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||    
T  21732668 atatctacatacaact 21732683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 21705197 - 21705434
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  21705197 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-acagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 21705295  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  21705296 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 21705394  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21705395 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 21705434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 297
Target Start/End: Original strand, 29534939 - 29535071
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||          ||||||    
T  29534939 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcac----------cgcttt 29535027  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29535028 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 29535071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 238
Target Start/End: Original strand, 36614910 - 36615014
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||  |||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36614910 ctaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca-aaacagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataa 36615006  T
Q  231 gtcctcac 238  Q
    ||||||||    
T  36615007 gtcctcac 36615014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 21664280 - 21664370
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21664280 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 21664370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24109082 - 24108992
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24109082 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactc 24108992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Original strand, 24079542 - 24079633
Alignment:
Q  147 aatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24079542 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcac 24079633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24109212 - 24109121
Alignment:
Q  147 aatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24109212 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcac 24109121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19666791 - 19666701
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19666791 ccgctttgaacaacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 19666701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 19853151 - 19853241
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19853151 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccaattgtgtatatctacatacaact 19853241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 19859286 - 19859376
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19859286 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccaattgtgtatatctacatacaact 19859376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Original strand, 11156938 - 11157043
Alignment:
Q  133 aagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||| |||| ||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11156938 aagactcctcaacaagtgcaactatgcgtgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattc-gttcaggacataag 11157036  T
Q  232 tcctcac 238  Q
    |||||||    
T  11157037 tcctcac 11157043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21987210 - 21987128
Alignment:
Q  90 tcaatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  21987210 tcaatcaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 21987128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23195533 - 23195443
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  23195533 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacatgtgtatatctacatacaact 23195443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 43088349 - 43088470
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||   ||| ||||||| | |||||||||||| |    
T  43088349 atgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca-aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagta 43088447  T
Q  214 ttctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |  |||| |||||||||||||||||    
T  43088448 t--tcattaggacataagtcctcac 43088470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 955219 - 955116
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||    
T  955219 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccactaaacaccacttt 955120  T
Q  255 gaac 258  Q
    ||||    
T  955119 gaac 955116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15316565 - 15316470
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15316565 ccgctttgaacgacaatgcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 15316470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 13226893 - 13226922
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13226893 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 13226922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 16371801 - 16371830
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371801 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 16371830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16669474 - 16669433
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16669474 ctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccata 16669433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20108525 - 20108496
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20108525 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20108496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 32650343 - 32650372
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650343 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 32650372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Original strand, 4231165 - 4231201
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4231165 agactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtacca 4231201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Original strand, 9269910 - 9269946
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9269910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 9269946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 49327991 - 49328047
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  49327991 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 49328047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13193 - 12844
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattatt-caacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||||||| | |||    
T  13193 cctacaatatcaatgattatttcaaaagtcataagtgtttcataatcaacaacaatcatccagatatcacactccaatcaacaatagcaactcatgaaat 13094  T
Q  117 gacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13093 gacatgacatccccctaatactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12994  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  12993 ttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgctttgaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccactt 12894  T
Q  317 ttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | |||||||  ||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  12893 tgatgcttatgcaactaacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 12844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63168
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  63370 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 63272  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  63271 gagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 63172  T
Q  354 taca 357  Q
    ||||    
T  63171 taca 63168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 124649 - 124441
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  124649 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 124550  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctac 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  124549 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcagaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtttatatctac 124450  T
Q  353 atacaactc 361  Q
    |||||||||    
T  124449 atacaactc 124441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Original strand, 110168 - 110405
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  110168 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 110266  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  110267 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 110365  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110366 gcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 110405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 110457 - 110486
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110457 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 110486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 91 - 364
Target Start/End: Original strand, 10135 - 10408
Alignment:
Q  91 caatcgacaataacaactcacgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccac 190  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10135 caatcaacagtaacaactcatgtaatgacatgacacccctctaagactcctcgataa-tgcaactatgcttgtggtaccatattcagggccgtgacccac 10233  T
Q  191 accgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggc 290  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10234 tccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggc 10333  T
Q  291 attccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10334 gttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcgactaacccatttgtgtatatccacatacaactcaac 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41931 - 41584
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  41931 cctacaatatcaatgattattctatatgcgtaagtatttcataatcaacaaca-tcatccagatattgcaattcaaccaacaacaactactcatgtaatg 41833  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  41832 acatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattc 41734  T
Q  217 -tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
     |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41733 attttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 41634  T
Q  316 tttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41633 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 41584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10460 - 10226
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10460 tctaagactcctc-acaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacata 10362  T
Q  230 agtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagaca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10361 agtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttatgca 10262  T
Q  330 act-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10261 actgacccacttatgtatatctacatacaactcaac 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 6)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37019 - 36785
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37019 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacataa 36920  T
Q  231 gtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  36919 gtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaa 36820  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 36785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44334 - 44063
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||    
T  44334 cctaaaatatcaatgattattctatatgcataagtatttcataatcaacaacac-catcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaat 44236  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  44235 gacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatccatgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcat 44136  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaa 287  Q
    |||  | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  44135 tctttttaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttg-acaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaa 44063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44080 - 43962
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgt 342  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||| | || ||||||||    
T  44080 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgctttaatgcttatgcaaccgactccacttgt 43981  T
Q  343 gtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  43980 gtatatctacataccactc 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 321
Target Start/End: Original strand, 40549 - 40664
Alignment:
Q  204 ggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccga 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40549 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccga 40646  T
Q  304 agctctcccacttttatg 321  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  40647 agctcttccactgttatg 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 45014 - 45105
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45014 ccgctttgaacgacaaggcgttccagagcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 45105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 9344 - 9435
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact--acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9344 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgaatccacttgtgtatatctacatacaact 9435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 174875 - 174535
Alignment:
Q  21 acaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  174875 acaacatcaatgattattcaacaggcataaccattttataatcaaaagcaatcatccacaaatagtaattcaatcgacaaatgcaactcatgaaatgaca 174776  T
Q  121 tgaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc 218  Q
    ||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174775 tgacatcccccctaattctcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcttggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc 174676  T
Q  219 atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttt 318  Q
    | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  174675 aacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttttaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttg 174576  T
Q  319 atgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaa 358  Q
    ||| |||  ||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  174575 atgtttatgcaactacccaacctttgtatctctacatacaa 174535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 488991 - 489288
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||   ||||||| || |||||    
T  488991 tacaacatcaatgattattcaataaacataggtatttcataatcaacaacaatcatccaagtatag-aattcaatcaacaaatgcaactcatgttatgac 489089  T
Q  120 atgacacccctc--taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    |  ||||||  |  ||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  489090 acaacaccctcccttaatactcctcaataa-tgtaattatgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaacactgtcgaatggttaaagcattc 489188  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  489189 tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 489288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 95848 - 96055
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||  |  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  95848 atgcatgtggtaccatattcagggcagaaaccctcaccgctaattaaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 95946  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  95947 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcaagggccaaagccctcccacttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 96046  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  96047 catacaact 96055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 494159 - 493924
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc---atcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||    
T  494159 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggaca 494061  T
Q  228 taagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttag 326  Q
    | ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |  |||||||||||     
T  494060 tgagtcctccca--ttaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggtcctcaccattttatgcttat 493963  T
Q  327 acaactac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  493962 gcaccgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 493924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 178961 - 179082
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||  ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  178961 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 179059  T
Q  214 ttctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  179060 ttc--atcaggacataagtcctcac 179082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9946 - 9600
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || |   |||||||  | ||||    
T  9946 tacaatatcaatgattattcaataagcataggtatttcataaatcaacagcaatcatccata-atagcaattcaatcaacgaatgcaactcatcttatga 9848  T
Q  119 catgaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||  ||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9847 cacaacatcccccctaatactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 9748  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    |||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9747 tcaataggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 9648  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     | |  |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9647 gt-tttttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 9600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Original strand, 110622 - 110967
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||   ||||||| |  |||||    
T  110622 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcaacatccatcatccaagtatag-aattcaatcaacaaatgcaactcatgatatgac 110720  T
Q  120 atgacacccctc--taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata-ttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    | |||||||| |  ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110721 acgacacccccccttaatactcctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 110819  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactt 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  110820 tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcattgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-t 110918  T
Q  317 ttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    | ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  110919 tgatgtttatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 110967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 116657 - 116855
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||| | |||||||   ||||| ||| ||||| ||||   ||||||| |  |||||    
T  116657 tacaacatcaatgattattcaataagcataggtatttcataatcaacatccatcatcccagtatag-aatccaatcaacaaatgcaactcatgatatgac 116755  T
Q  120 atgacacccctc--taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat-attcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    | |||||||| |  ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116756 acgacacccccccttaatactcctcaat-aatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc 116854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 92336 - 92099
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc-atcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  92336 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattctttatcaggacat 92238  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||     
T  92237 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttat 92139  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  92138 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 92099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 98062 - 97825
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc-atcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  98062 tctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattctttatcaggacat 97964  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||     
T  97963 gagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccagaaccgaagttctcatcgtttttatgcttat 97865  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  97864 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 97825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 38379 - 38610
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38379 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 38478  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  38479 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 38577  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38578 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 38610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46936 - 46728
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| || ||||  | ||||||||||| |||||   |||| | |||||||||||| ||| | ||||| |||    
T  46936 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaacgctaattgaatggttaaaacattcatttcagaaaataagtcctcaccgctaatcaccgattt 46837  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  46836 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccatagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 46737  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  46736 catacaact 46728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 51209 - 51001
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| || ||||  | ||||||||||| |||||   |||| | |||||||||||| ||| | ||||| |||    
T  51209 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaacgctaattgaatggttaaaacattcatttcagaaaataagtcctcaccgctaatcaccgattt 51110  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51109 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccatagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 51010  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  51009 catacaact 51001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 28782 - 28811
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28782 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 28811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 36368 - 36397
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36368 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 36397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30344 - 30113
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30344 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 30245  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  30244 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgc-tatgcaact 30146  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30145 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 30113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35745 - 35514
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35745 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 35646  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  35645 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 35547  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35546 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 35514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51872 - 51668
Alignment:
Q  162 gtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaa 260  Q
    ||||||||||| | |||| || | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51872 gtggtaccataattagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaacaa 51773  T
Q  261 ctagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51772 ctactgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 51673  T
Q  360 tcaac 364  Q
    |||||    
T  51672 tcaac 51668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 19 - 75
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47178 - 46947
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47178 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 47079  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  47078 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 46980  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46979 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 46947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52583 - 52352
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52583 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 52484  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  52483 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 52385  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  52384 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 52352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1170
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1141 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 174760 - 174529
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  174760 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 174661  T
Q  234 ctcactgctcaacaccgc-tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  174660 ctcaccgctcaacaccgcttttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaact 174562  T
Q  333 accc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  174561 acccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 174529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 364
Target Start/End: Original strand, 152356 - 152570
Alignment:
Q  151 caactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacacc 249  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| || | |||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  || ||||||    
T  152356 caaccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaacactgtagaatggttaaagcaatcattttcaggacataagtcctcaccact-aacacc 152454  T
Q  250 gctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatat 348  Q
     |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  152455 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatat 152554  T
Q  349 ctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  152555 ctacatacaactcaac 152570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 258491 - 258700
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  258491 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 258590  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  258591 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 258690  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  258691 acatacaact 258700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 197618 - 197409
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  197618 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 197519  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  197518 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggccagagccctcccacttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatct 197419  T
Q  351 acatacaact 360  Q
     |||||||||    
T  197418 tcatacaact 197409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 252004 - 252094
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  252004 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 252094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 154248 - 154338
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  154248 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccatagtcctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 154338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 356
Target Start/End: Original strand, 147127 - 147213
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatac 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  147127 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaaatgactccacttgtgtatatctacatac 147213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17253 - 16914
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||  || ||||| ||||||    
T  17253 cctaaaatatcaatgattattcaatatacataagtatttcataatcaacaaca-tcatcaaaatatagcaattcgaccaacaaccacgactcatgtaatg 17155  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  17154 acttgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattc 17056  T
Q  217 -tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
     |  |||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17055 attttcaggacataaggcctcaccgctaaactccgttttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 16956  T
Q  316 tttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatac 356  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16955 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 103244 - 102900
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | | |||| |||||||| | |||| ||| ||||| | |||    
T  103244 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcataagtatttcataatcaacaacac-catcaataatataacaattcaaccaacaacaacgactcatgcaat 103146  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 215  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  103145 gacatgacaacacctctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcacttctttcgaatggttaaagcatt 103046  T
Q  216 ctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||    
T  103045 cttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccagggccgaagctctcccgct 102946  T
Q  316 tttatgcttagacaac--tacccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||  ||||    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  102945 tttatgcttatgcaacagaccccactggtgtatacctacatacaac 102900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 731 - 392
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  |||||||| |||| |    
T  731 cctaaaatatcaatgattattcaatatacataagtacttcataatcaacaaca-tcatcaaaatatagcaattcgaccaagaaccacaactcatgtaacg 633  T
Q  118 acatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    || ||||| | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  632 acttgacaacacctctaagacccctcggcaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattc 534  T
Q  217 -tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact 315  Q
     |  ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  533 attttcaggacataagtcctcatcgctaaactccgctttgaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 434  T
Q  316 tttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatac 356  Q
    || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  433 ttaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 359
Target Start/End: Original strand, 115601 - 115941
Alignment:
Q  23 aatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccag-atatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatgaca 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  |||||||| || || |  |||||||||||||| | |||| ||  ||||| | |||||||    
T  115601 aatatcaatgattattccatatgcataagtatttcataaatcaacaaca-tcctcaaatatatagcaattcaaccaacaacaaagactcatgcaatgaca 115699  T
Q  121 tgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctca 219  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||| || ||||||||||||||||||||      
T  115700 tgacaacacctctaagactcctcgacaattgcaactatgcatgtggtaccatatttagggccggagccctcaccactatcgaatggttaaagcattcttt 115799  T
Q  220 tcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttta 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  115800 tcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggtcgaagccctcccgctttta 115899  T
Q  320 tgcttagacaac-tac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  115900 tgcttatgcaacagactccactggtgtatatctacatacaac 115941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321271
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  321062 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 321161  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||  |||| |   || ||||||||||||||    
T  321162 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccatttttgtgcttatgcaacaaactccccttgtgtatatcta 321261  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  321262 catacaactc 321271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 326771 - 326980
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   | | |||| ||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  326771 atgcatgtggtaccataatcagggtcggagcgctcaccactaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 326870  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||   || ||||||||||||||    
T  326871 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccccttgtgtatatcta 326970  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  326971 catacaactc 326980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 129751 - 129656
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129751 ccgctttgaacgacaaggcgttccagagcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 129656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 129915 - 129858
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  129915 aatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 129858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 129621 - 129592
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129621 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 129592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 5148 - 5358
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5148 atgcatgtggtaccataattagggccaaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacaccgcttt 5247  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5248 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctaca 5347  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||||||||    
T  5348 tacaactcaac 5358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 17477 - 17687
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||   ||| || |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17477 atgcatgtggtaccataatcggggccgaagccctcatcgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 17576  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17577 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctttcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 17676  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  17677 tacaacccaac 17687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17602 - 17368
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataag 231  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||    
T  17602 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaaacattctttttcaggacatgag 17503  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaactag-tgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||   ||    
T  17502 tcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaaatgttccacagctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaa 17403  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17402 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 17368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10306 - 10072
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataag 231  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  10306 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgag 10207  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    || |||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  10206 tcttcaccgctaaacaccgcttttaacaacaaagtgttccacatctttgaacgacaaggcgttccagggctgaagccctcccgcttttatgcttatgcaa 10107  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10106 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 10072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 72229 - 72436
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||| || || ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  72229 atgcatgtggtaccatat-caaggccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgct-aataccgctt 72326  T
Q  254 tgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||| || ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  72327 tgaacaacatagtgttccaccgctttaaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttatgaaactaacccacttgtgtatatct 72426  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  72427 acatacaact 72436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35928 - 35820
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||| |||||||  | ||| |||||||||||||   |||||||||    
T  35928 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaaaggttaaagcattc-attcaggacat 35830  T
Q  229 aagtcctcac 238  Q
    ||||||||||    
T  35829 aagtcctcac 35820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 5998
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  6208 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccacttt 6109  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6108 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgtaactaacccacttatgtatatctaca 6009  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||||||||    
T  6008 tacaactcaac 5998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14464
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  14673 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 14575  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14574 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 14475  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  14474 tacaacccaac 14464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7181
Alignment:
Q  190 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaag 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || || ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aataccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaag 7258  T
Q  289 gcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7257 gcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatccaactgtcccacttgtgtatatctacatacaacccaac 7181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56413
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  56623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 56524  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  56523 gagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaatctctcccacttttatgcttatgcaactgaccctcttgtgtatatctaca 56424  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  56423 tacaacccaac 56413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47379
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  47589 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 47490  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47489 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctaca 47390  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  47389 tacaacccaac 47379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62799
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  63009 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 62910  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  62909 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctaca 62810  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||| ||||    
T  62809 tacaacccaac 62799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 266 - 1
Alignment:
Q  20 tacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataac-caacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  | |   ||||||||| |||||   |  |||  | ||||    
T  266 tacaatatcaatgattattcaataagcataagtatttcataaatcaacaacaatcatccatttttt--aattcaatcaacaatgt-agttcatcttatga 170  T
Q  119 catgaca-cccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattc-agggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    || |||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  169 cacgacatcccccctaatactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaagcatta 70  T
Q  217 tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 285  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69 tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1397 - 1125
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||    
T  1397 cctaaaatatcaatgattattctatatgcataagtatttcataatcaacaacac-catcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaat 1299  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  1298 gacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcat 1199  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaa 287  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  1198 tctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaa 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8333 - 8061
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||    
T  8333 cctaaaatatcaatgattattctatatgcataagtatttcataatcaacaacac-catcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaat 8235  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  8234 gacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcat 8135  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaa 287  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  8134 tctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaa 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 1024
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgt 342  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | || ||||||||    
T  1142 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgt 1043  T
Q  343 gtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  1042 gtatatctacataccactc 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8078 - 7960
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgt 342  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | || ||||||||    
T  8078 caccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgt 7979  T
Q  343 gtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  7978 gtatatctacataccactc 7960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 1899 - 2172
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| | |||    
T  1899 cctaaaatatcaatgattattctatatgcataagtatttcataatcaacaacac-catcaataatatagcaattcaaccaacaacaacgactcatgcaat 1997  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  1998 gacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcat 2097  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac--tagtgttccaccgctttgaacgacaa 287  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2098 tctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttgaacaacaatagtgttccaccgctgtgaacaacaa 2172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 4973
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgcttt 5085  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctac 352  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5084 gaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctac 4985  T
Q  353 atacaactcaac 364  Q
    ||||||| ||||    
T  4984 atacaacacaac 4973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 27951 - 28008
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  27951 aatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgacaatgcatgtggtacca 28008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 41931 - 42135
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  41931 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 42029  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42030 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 42129  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  42130 tacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8619
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  8410 atgcatgtggtaccataatcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagct 8509  T
Q  253 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  8510 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatct 8609  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  8610 acatacaact 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 364
Target Start/End: Original strand, 298 - 532
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataag 231  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||| ||    
T  298 agactcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacatgag 397  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa 330  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  398 tcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatacttatgcaa 497  T
Q  331 ct-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  498 ctgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141534
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  || |||||| |||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcaggacgtaagtcctcaccact-aacaccactttg 141424  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacat 354  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  141425 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacat 141524  T
Q  355 acaactcaac 364  Q
    ||||| ||||    
T  141525 acaacccaac 141534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 146566 - 146778
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    || |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || || ||| |||    
T  146566 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccactt 146665  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaa-ctac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||   || |||||||||||||| ||    
T  146666 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagacgaagctctcccacttttatgattatgcaatggactccacttgtgtatatata 146765  T
Q  352 catacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||    
T  146766 catacaactcaac 146778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20664 - 20485
Alignment:
Q  188 cacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 285  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20664 cacaccactgtagaatgattaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgac 20565  T
Q  286 aaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20564 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 156944 - 156797
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||    
T  156944 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacacctctt 156845  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccga 303  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  156844 tgaacaac--gtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccga 156797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 153339 - 153311
Alignment:
Q  333 acccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  153339 acccacttgtgtatatctacatacaactc 153311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 364
Target Start/End: Original strand, 2918 - 3131
Alignment:
Q  155 tatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| ||| |||||| ||    
T  2918 tatgcatgtggtaccatgttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcatcaccgctaaacacctct 3017  T
Q  253 ttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatct 350  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  3018 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatct 3117  T
Q  351 acatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||    
T  3118 acatacaactcaac 3131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1696
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||    
T  1904 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaagacataagtcctcaccgctaaaaagcgcttt 1805  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1804 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccaggtcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 1705  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  1704 catacaact 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15451
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  15641 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 15543  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15542 gagcaactagtgctccaccactttgaacgac--------------tcgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccactcgtgtatatctaca 15457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 8487 - 8516
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8487 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16225 - 16017
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16225 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 16126  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  16125 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcctgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 16026  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  16025 catacaact 16017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8205 - 7997
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  8205 atgcatgtggtaccatattcagggcaggagctctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgcttt 8106  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  8105 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagggccggagccctcccgcttttgtccttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 8006  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  8005 catacaact 7997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Original strand, 7293 - 7459
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccaga 298  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7293 gaatggttaaagcattcattttcaggatataagtccttaccactaaacaccgctttgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccaga 7392  T
Q  299 gccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 7459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 10341 - 10551
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||   || |||| | ||||    
T  10341 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcactaaacatcacttt 10440  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  10441 gagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgaccgactcgtgtatatctaca 10540  T
Q  354 tacaactcaac 364  Q
    |||||||||||    
T  10541 tacaactcaac 10551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 27861 - 28070
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 27960  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||   ||||| |||||||||||    
T  27961 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 28060  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  28061 catacaactc 28070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 50948
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  51148 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcgttttcaggacataagtcctcaccact-aacaccacttt 51050  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51049 gagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctaca 50950  T
Q  354 ta 355  Q
    ||    
T  50949 ta 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 265100 - 265300
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  265100 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatgacataagtcctcaccact-aacaccactttg 265198  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacat 354  Q
    | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  265199 agcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacat 265298  T
Q  355 ac 356  Q
    ||    
T  265299 ac 265300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 258674 - 258874
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||  || |||||| |||||    
T  258674 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatgacatatgtcctcaccact-aacaccactttg 258772  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacat 354  Q
    | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  258773 agcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacat 258872  T
Q  355 ac 356  Q
    ||    
T  258873 ac 258874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 7778
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccaga-tatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| ||||||||| || | | | |||||||||||||   | || ||| ||||| | |||    
T  8125 cctaaaatatcaatgattattcaatatgcataactgtttcataatcaacaacaa-caacaataatatagcaattcaacaaaaaacaacgactcatgcaat 8027  T
Q  117 gacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcat 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||   ||| ||| |||  | |||||||||||||||    
T  8026 gacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatatggtaccatattctgggccggagccctcactgctaattgaatggttaaagcat 7927  T
Q  215 tctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccca 313  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||  |||||     
T  7926 tcatttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggacaagagacctcccg 7827  T
Q  314 cttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |||| |||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7826 ctttatatgtttatgcaactgacccaattgtgtatatctacatacaact 7778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15016 - 14832
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  15016 atgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagca 14918  T
Q  214 ttct---catcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||    |||||||||| ||||||| |   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14917 ttctttatatcaggacatgagtcctccc--attaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14792 - 14763
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14792 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 14763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Original strand, 8 - 181
Alignment:
Q  181 cgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttga 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8 cgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcac----------cgctttgaacaactagtgttccaccactttga 97  T
Q  281 acgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaactaccc-acttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |   |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  98 acgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-ttaaaaattatgcaactacccaacctgtgtatatctacatacaactcaac 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14747 - 14539
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttg 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  14747 atgcatgtggtatcatattcaggaccgtagccatcatcgctgtagaatggttaaaacattcatttcaggacataagtcctcaccact-aacaccactttg 14649  T
Q  256 aacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacat 354  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14648 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactgttatgcttattcaactgactcacttatgtatatctacat 14549  T
Q  355 acaactcaac 364  Q
    ||||| ||||    
T  14548 acaacccaac 14539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17071 - 16861
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  17071 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaaacattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 16972  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  16971 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatct 16872  T
Q  351 acatacaactc 361  Q
    |||||||||||    
T  16871 acatacaactc 16861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49869 - 49759
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49869 cctacaataacaatgattatccaataggcataagtatttcataatcaacaacaatcatccagttatagcaattcaatcaacaataacaactcatgtaatg 49770  T
Q  118 acatgacaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  49769 acatgacaccc 49759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 143920 - 143976
Alignment:
Q  115 atgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  143920 atgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 143976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 34776 - 34986
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||| ||  | |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34776 atgcatgtggtaccatattcagggcggag-ccctcaccactaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 34874  T
Q  253 ttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatc 349  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  34875 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatc 34974  T
Q  350 tacatacaactc 361  Q
    ||||| ||||||    
T  34975 tacatgcaactc 34986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 171945 - 171780
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt-gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  171945 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccag 171846  T
Q  298 agccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
     |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  171845 ggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtttatatctacatacaactc 171780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12055 - 11912
Alignment:
Q  219 atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccactt 316  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| || |||    
T  12055 atcaggacatgagtcctcaccgct-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgctt 11957  T
Q  317 ttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11956 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Original strand, 44200 - 44403
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||          |||||    
T  44200 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcac----------cgctt 44289  T
Q  254 tgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaacta--cccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  |||| ||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  44290 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaagccatcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 44389  T
Q  351 acatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||    
T  44390 acatacaactcaac 44403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Original strand, 881 - 1049
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattcca 296  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  881 gaatggttaaagcattcttttatcaagacatgcgtcctcaccact-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 979  T
Q  297 gagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |  |||| || ||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  980 ggaccgaggcactcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 1049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3496 - 3297
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||          ||||||    
T  3496 atgcatgtgataccatattcagggtcggagcccacaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcac----------cgcttt 3407  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  3406 gaacaacaacgtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 3307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6077 - 5872
Alignment:
Q  159 catgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttga 256  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  6077 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagaattcattttcaggacataagtcctcatcgct-aacaccgctttga 5979  T
Q  257 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacat 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  5978 acaacaagtgttccaccgctttgaacggcaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcttcat 5879  T
Q  355 acaactc 361  Q
    |||||||    
T  5878 acaactc 5872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27788
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  27945 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgct-aacaccgctt 27847  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctccc 312  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27846 tgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctccc 27788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13593 - 13384
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  13593 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 13494  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-acccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  13493 tgaacaacatgtgttccaccgctttgaacaataaggcattctagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatcta 13394  T
Q  352 catacaactc 361  Q
    ||||||||||    
T  13393 catacaactc 13384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Original strand, 3326 - 3418
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaactacc--cacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3326 ccgctttaaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatacaactc 3418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 359
Target Start/End: Original strand, 14052 - 14212
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccaga 298  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  14052 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccact-aacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctaga 14150  T
Q  299 gccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14151 gccgaagctctcccacttctatgtttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaac 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 24209 - 24413
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||| |||||||||| |||||  |||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||| ||||    
T  24209 atgcatctggtaccataatcaggaccgtagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccact-aacaccacttt 24307  T
Q  255 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 353  Q
    ||  ||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||    
T  24308 gaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctcttccacttctatgcttatgcaactaaccgccttgtgtatatccaca 24407  T
Q  354 tacaac 359  Q
    ||||||    
T  24408 tacaac 24413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1684 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1684
Description:

Target: scaffold1684; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 1350 - 1473
Alignment:
Q  18 cctacaatatcaatgattattcaacaggcataagcatttcataaccaacaacaatcatccagatatagcaattcaatcgacaataacaactcacgtaatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  1350 cctacaatatcaatgattattctatatgcataagtatttcataatcaacaaca-tcatccagatatagcaattcaaccaacaacaacaactcatgtaatg 1448  T
Q  118 acatgac-acccctctaagactcct 141  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  1449 acatgacaacacctctaagactcct 1473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24637 - 24472
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattctc---atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattcc 295  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24637 gaatggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctcaccgtt-aacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaagtcgttcc 24539  T
Q  296 agagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||  |||| || ||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24538 aggaccgaggccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10622
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10651 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 10622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18830 - 18801
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18830 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 18801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44294 - 44086
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  44294 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaagacataagtcgtcattgctaaacaccacttt 44195  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||   || ||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  44194 gaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaaggccagggccctcccgcttttatacttatacaactgactccacttgtgtatatcta 44095  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  44094 catacaact 44086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49360 - 49152
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  49360 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaagacataagtcgtcattgctaaacaccacttt 49261  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||   || ||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  49260 gaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaaggccagggccctcccgcttttatacttatacaactgactccacttgtgtatatcta 49161  T
Q  352 catacaact 360  Q
    |||||||||    
T  49160 catacaact 49152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 357
Target Start/End: Original strand, 16982 - 17096
Alignment:
Q  244 aacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgt 342  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16982 aacactgctttgaacaacatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagcgccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgt 17081  T
Q  343 gtatatctacataca 357  Q
     ||||||||||||||    
T  17082 atatatctacataca 17096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 6939 - 7147
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  6939 atgcatgtggtaccatgttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgcttt 7037  T
Q  255 gaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccac-ttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatct 350  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||   || ||||| | ||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  7038 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccagggccagggccctcccgctttttatggttatacaactgactccacttgtgtatatct 7137  T
Q  351 acatacaact 360  Q
    ||||||||||    
T  7138 acatacaact 7147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 20019 - 20048
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 20048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2380
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  2516 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatagttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 2417  T
Q  254 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggc 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2416 tgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggc 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17190 - 17073
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||  |||| ||| ||  ||| | || |||||||||    
T  17190 caccgctttgaacaacaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgattttgtgcctatgcaattgactccacttgtg 17091  T
Q  344 tatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17090 tatatctacatacaactc 17073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Original strand, 5638 - 5753
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtg 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  5638 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 5737  T
Q  344 tatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||||||    
T  5738 tatatctacatacaac 5753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 360
Target Start/End: Original strand, 55939 - 56069
Alignment:
Q  233 cctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac 331  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||  ||||    
T  55939 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgtttatgcaac 56038  T
Q  332 ta--cccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  56039 taactccacttgtgtatatctacatacaact 56069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52836 - 52670
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataag 231  Q
    ||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |    
T  52836 agactcctcaacaaatgctgatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatggg 52737  T
Q  232 tcctcactgctcaacaccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 297  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52736 tcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 52670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4362 - 4221
Alignment:
Q  97 acaataacaactcacgtaatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgc 195  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| |    
T  4362 acaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctc 4263  T
Q  196 t-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4262 taattgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcac 4221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 325
Target Start/End: Original strand, 4 - 78
Alignment:
Q  251 ctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgctta 325  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctta 78  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 370396 - 370594
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgcttt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||          | ||||    
T  370396 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcac----------cacttt 370485  T
Q  255 gaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatcta 351  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||| | ||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  370486 gaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcacgcttttgtgcttatgcaactgacaccacttgtgtatatcta 370585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 1852 - 1977
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaag 211  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||||    
T  1852 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaag 1951  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||||   |||||||||||||||||||    
T  1952 cattc-attcaggacataagtcctcac 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Original strand, 2062 - 2156
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || | |  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2062 ccgctttgaacgacgaggcgttctagggtcagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 2156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3051 - 2814
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacat 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||| || || | | |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  3051 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacat 2953  T
Q  229 aagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttag 326  Q
     |||||||| |  | |||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||  |||  |  |||||||||||     
T  2952 gagtcctca-tcgttaacatcgttttgaacaacatagtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttccaggaccgaagtcctcatcgtttttatgcttat 2854  T
Q  327 acaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2853 gcaactgactccacttgtgtatatctgcatacaactcaac 2814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2733
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 2733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4370 - 4264
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc---tcatcaggaca 227  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| | | |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  4370 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccgttgccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcatcaggaca 4272  T
Q  228 taagtcct 235  Q
    | ||||||    
T  4271 tgagtcct 4264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4255 - 4158
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc-ccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||  |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4255 caccgctttgaacgacaaggcattccaggaccgaggtcctcaccgtttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 4158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16249 - 16141
Alignment:
Q  130 tctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacat 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||||||||||| |||||   |||||||||    
T  16249 tctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattc-attcaggacat 16151  T
Q  229 aagtcctcac 238  Q
    ||||||||||    
T  16150 aagtcctcac 16141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Original strand, 7344 - 7440
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccact-tttatgcttagacaa-ctacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||  ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344 caccgctttgaacgacagggcgttccagagccgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatacaactcaac 7440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Original strand, 7253 - 7356
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcactgctcaacaccgctt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7253 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatacgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgct-aacaccgctt 7351  T
Q  254 tgaac 258  Q
    |||||    
T  7352 tgaac 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 364
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3401
Alignment:
Q  333 acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3370 acccacttgtgtatatctacatacaactcaac 3401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Original strand, 132 - 254
Alignment:
Q  114 aatgacatgac-acccctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaag 211  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  132 aatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaag 231  T
Q  212 cattctcatcaggacataagtcct 235  Q
    |||||   ||||||||||||||||    
T  232 cattc-attcaggacataagtcct 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 57245 - 57154
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  57245 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 57154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 57406 - 57328
Alignment:
Q  160 atgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  57406 atgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc-attcaggacataagtcctcac 57328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 359
Target Start/End: Original strand, 141388 - 141479
Alignment:
Q  270 caccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaac 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  141388 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaac 141479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Original strand, 141227 - 141305
Alignment:
Q  160 atgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  141227 atgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc-attcaggacataagtcctcac 141305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 509
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||||| |||||||||||    
T  591 agactcctcaataaatacaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccactgtagaatgattaaagcattc 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 296
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  325 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 6758 - 6848
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6758 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 6848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 202 - 306
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  202 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcaaggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 299  T
Q  232 tcctcac 238  Q
    |||||||    
T  300 tcctcac 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 361
Target Start/End: Original strand, 344 - 435
Alignment:
Q  271 accgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaac-tacccacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||||| ||  | || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  344 accgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagtcctcccgcttttatgcatatgcgacttactcacttgtgtatacctacatacaactc 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Original strand, 25703 - 25798
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25703 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaggagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 25798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 26069 - 26152
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26069 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 26152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 27451 - 27534
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  27451 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc 27534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 9
Alignment:
Q  128 cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatat 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54 cctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatat 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38752 - 38636
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgt 342  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||    
T  38752 caccgcttttaacaacaaagtgttc-accgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccactcgt 38654  T
Q  343 gtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38653 gtatatctacatacaact 38636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 136812 - 136696
Alignment:
Q  246 caccgctttgaacaacta-gtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgt 342  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||    
T  136812 caccgcttttaacaacaaagtgttc-accgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccactcgt 136714  T
Q  343 gtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||    
T  136713 gtatatctacatacaact 136696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 43
Alignment:
Q  132 taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataa 230  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||  | ||| |||||||||||  |||||  |||||||    
T  148 taagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcat--tcatcgagacataa 51  T
Q  231 gtcctcac 238  Q
    ||||||||    
T  50 gtcctcac 43  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31774 - 31670
Alignment:
Q  134 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg--tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataag 231  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    | | ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31774 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccaaagcactcaccgctgttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataag 31677  T
Q  232 tcctcac 238  Q
    |||||||    
T  31676 tcctcac 31670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 8356 - 8447
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8356 ccgctttgaacgacaaggcgttccagagcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 8447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 18440 - 18531
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18440 ccgctttgaacgacaaggcgttccagagcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 18531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 5091
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5186 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcaac 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5056 - 5027
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5056 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 5027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3357 - 3267
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttagacaact-ac-ccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||  ||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  3357 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcctgcttttatgcttatgcaactgactccgcttgtgtatatctacatacaact 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Original strand, 9993 - 10086
Alignment:
Q  147 aatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcac 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    || |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  9993 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcac 10086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4535 - 4478
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  4535 aatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 4478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 20803 - 20907
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcactgctcaacaccgct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||   | |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  20803 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgcaaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcatcgctaaacaccgct 20902  T
Q  253 ttgaa 257  Q
    |||||    
T  20903 ttgaa 20907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19565
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19622 aatgacatgacatcacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 19565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17488 - 17396
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaactacc--cacttgtgtatatctacatacaactc 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17488 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatacaactc 17396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1469
Description:

Target: scaffold1469; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Original strand, 283 - 448
Alignment:
Q  146 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   | | || || | | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||  | |     
T  283 aaatgcaactatgcatgtggtaccatat-cagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcatcgtt- 380  T
Q  244 aacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctc 310  Q
    |||| || |||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  381 aacatcgttttgaacaacatcgtattccatcgttttgaacgacaaggcgttccagaaccgaagttctc 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 485 - 514
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 13 - 125
Alignment:
Q  200 gaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcactgctcaacaccgctttgaacaac-tagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattcca 296  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||  | | |||| || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||| || |||||    
T  13 gaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcatcgtt-aacatcgttttgaacaacatcgtgttccatcgttttgaacgacaaagcgttcca 111  T
Q  297 gagccgaagctctc 310  Q
    || |||||| ||||    
T  112 gaaccgaagttctc 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 51103 - 51145
Alignment:
Q  128 cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 170  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  51103 cctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 51145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 43117 - 43059
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  43117 aatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 43059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 97561 - 97503
Alignment:
Q  114 aatgacatgacacc-cctctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccat 171  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  97561 aatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccat 97503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 818 - 789
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  818 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 586 - 615
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  586 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 2313 - 2342
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2313 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 2342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5001 - 4972
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5001 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 297
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  338 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtgggaccata 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 8770 - 8799
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8770 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 8799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Original strand, 45686 - 45715
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45686 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 45715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 72898 - 72869
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72898 ccacttgtgtatatctacatacaactcaac 72869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 80635 - 80594
Alignment:
Q  131 ctaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccata 172  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  80635 ctaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccata 80594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 798 - 770
Alignment:
Q  335 ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  798 ccacttgtgtatatctacatacaactcaa 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 3658 - 3718
Alignment:
Q  156 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 216  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3658 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Original strand, 13717 - 13765
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||    
T  13717 ccgctttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcccacttttat 13765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Original strand, 9357 - 9448
Alignment:
Q  272 ccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttt-tatgcttagacaact--acccacttgtgtatatctacatacaact 360  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9357 ccgctatgaacgacaaggcgttccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgaatccacttgtgtatatctacatacaact 9448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University