View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15408_high_24 (Length: 327)

Name: NF15408_high_24
Description: NF15408
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15408_high_24
NF15408_high_24
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (34-288)||(25828677-25828932)
chr1 (37-289)||(48542425-48542678)
chr1 (34-288)||(40359667-40359922)
chr1 (34-290)||(30159012-30159269)
chr1 (34-290)||(6978901-6979158)
chr1 (34-290)||(15475850-15476107)
chr1 (34-290)||(45502223-45502479)
chr1 (34-290)||(52469303-52469560)
chr1 (34-289)||(28226213-28226469)
chr1 (34-289)||(37094022-37094278)
chr1 (34-288)||(13556077-13556332)
chr1 (34-288)||(46674745-46675000)
chr1 (34-288)||(47534001-47534256)
chr1 (34-278)||(15907250-15907495)
chr1 (34-290)||(28068699-28068956)
chr1 (34-290)||(42885266-42885523)
chr1 (34-289)||(3770504-3770760)
chr1 (34-290)||(44233896-44234155)
chr1 (34-290)||(3046761-3047018)
chr1 (34-290)||(24180430-24180688)
chr1 (34-290)||(35719709-35719967)
chr1 (34-290)||(30361154-30361411)
chr1 (34-290)||(44054687-44054944)
chr1 (34-287)||(18604860-18605114)
chr1 (34-290)||(3994737-3994996)
chr1 (34-289)||(4490013-4490267)
chr1 (34-278)||(49456849-49457094)
chr1 (34-280)||(3416314-3416552)
chr1 (34-288)||(25729800-25730045)
chr1 (34-289)||(8895622-8895868)
chr1 (34-239)||(29033535-29033741)
chr1 (34-289)||(17580762-17581009)
chr1 (34-290)||(31760581-31760829)
chr1 (118-290)||(50490801-50490974)
chr1 (136-290)||(26770097-26770252)
chr1 (34-288)||(17926071-17926315)
chr1 (34-285)||(43106409-43106659)
chr1 (128-278)||(46234296-46234447)
chr1 (34-184)||(11493516-11493657)
chr1 (34-184)||(11335496-11335637)
chr1 (163-290)||(20599594-20599722)
chr1 (117-278)||(49740096-49740258)
chr1 (217-290)||(11335642-11335715)
chr1 (217-290)||(11493662-11493735)
chr1 (217-288)||(7042911-7042982)
chr1 (34-103)||(46234226-46234295)
chr1 (88-278)||(17136907-17137104)
chr1 (148-288)||(8969466-8969607)
chr1 (151-288)||(12320186-12320321)
chr1 (244-287)||(45926257-45926300)
chr1 (258-288)||(641458-641488)
chr1 (244-286)||(23545621-23545663)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (34-290)||(33489792-33490049)
chr6 (34-288)||(32938276-32938531)
chr6 (34-287)||(742726-742980)
chr6 (34-290)||(4210393-4210650)
chr6 (34-290)||(10790491-10790748)
chr6 (34-290)||(4169664-4169921)
chr6 (34-290)||(17595739-17595996)
chr6 (34-289)||(34475144-34475400)
chr6 (34-288)||(8933680-8933935)
chr6 (34-289)||(8062790-8063046)
chr6 (34-290)||(8658987-8659247)
chr6 (34-286)||(33131008-33131261)
chr6 (34-290)||(28914004-28914257)
chr6 (34-290)||(18676578-18676835)
chr6 (34-290)||(29516665-29516922)
chr6 (37-227)||(29863806-29863997)
chr6 (122-288)||(5545373-5545541)
chr6 (34-288)||(12712971-12713216)
chr6 (34-278)||(9224609-9224860)
chr6 (34-288)||(8313626-8313887)
chr6 (44-288)||(11590248-11590499)
chr6 (75-288)||(9576031-9576251)
chr6 (80-288)||(25143999-25144205)
chr6 (148-288)||(2559732-2559872)
chr6 (194-288)||(20554819-20554914)
chr6 (243-285)||(13889149-13889191)
chr6 (244-288)||(24418700-24418743)
chr6 (244-280)||(26947090-26947126)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (34-290)||(21866853-21867110)
chr2 (34-290)||(11124203-11124460)
chr2 (34-290)||(30787013-30787270)
chr2 (34-288)||(19390441-19390696)
chr2 (34-290)||(20115061-20115318)
chr2 (34-286)||(2357341-2357594)
chr2 (34-290)||(25336524-25336781)
chr2 (34-289)||(26479722-26479978)
chr2 (37-290)||(17977619-17977874)
chr2 (34-288)||(12242744-12243001)
chr2 (34-290)||(8113687-8113948)
chr2 (34-286)||(39430129-39430382)
chr2 (37-290)||(6034411-6034666)
chr2 (34-290)||(41568576-41568833)
chr2 (34-290)||(14287330-14287578)
chr2 (34-290)||(33965315-33965572)
chr2 (34-290)||(31547151-31547401)
chr2 (34-289)||(2371971-2372218)
chr2 (34-288)||(2380170-2380416)
chr2 (34-289)||(4049460-4049693)
chr2 (122-290)||(11978762-11978931)
chr2 (179-286)||(1222638-1222746)
chr2 (34-139)||(1222308-1222413)
chr2 (244-287)||(43652933-43652976)
chr2 (34-80)||(11978930-11978976)
chr2 (244-288)||(17435356-17435400)
chr2 (243-288)||(932076-932121)
chr2 (243-288)||(9141719-9141764)
chr2 (242-287)||(35006463-35006508)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (34-288)||(11005483-11005738)
chr4 (34-290)||(28867545-28867803)
chr4 (34-290)||(22169109-22169366)
chr4 (34-289)||(7327527-7327783)
chr4 (34-288)||(2491833-2492088)
chr4 (34-288)||(27767467-27767721)
chr4 (34-288)||(56162475-56162730)
chr4 (34-290)||(3875496-3875753)
chr4 (34-286)||(50621666-50621919)
chr4 (34-288)||(54202332-54202587)
chr4 (34-286)||(29923605-29923858)
chr4 (34-290)||(39677536-39677793)
chr4 (34-286)||(36308834-36309087)
chr4 (34-288)||(26488353-26488609)
chr4 (34-290)||(33961632-33961889)
chr4 (34-289)||(20492504-20492760)
chr4 (34-289)||(36224964-36225220)
chr4 (34-289)||(55282304-55282559)
chr4 (34-290)||(3931819-3932077)
chr4 (34-290)||(7554271-7554528)
chr4 (39-290)||(24744826-24745078)
chr4 (34-288)||(49331963-49332218)
chr4 (34-290)||(3874401-3874658)
chr4 (34-278)||(45884570-45884815)
chr4 (34-289)||(36432318-36432573)
chr4 (34-278)||(41764521-41764765)
chr4 (39-288)||(43957704-43957945)
chr4 (34-288)||(29933373-29933619)
chr4 (34-287)||(35949342-35949587)
chr4 (34-290)||(17445500-17445748)
chr4 (34-290)||(28573612-28573856)
chr4 (34-288)||(44878044-44878299)
chr4 (104-288)||(11308768-11308953)
chr4 (104-280)||(11381821-11381997)
chr4 (167-286)||(55541828-55541948)
chr4 (88-288)||(7326317-7326525)
chr4 (242-287)||(15506588-15506633)
chr4 (34-86)||(11308952-11309004)
chr4 (148-283)||(41476627-41476763)
chr4 (246-288)||(7795327-7795368)
chr4 (246-288)||(7818464-7818506)
chr4 (251-288)||(1536980-1537017)
chr4 (158-186)||(16319341-16319369)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (34-290)||(35393389-35393646)
chr8 (34-290)||(8352379-8352636)
chr8 (34-290)||(11020402-11020659)
chr8 (34-286)||(30655004-30655257)
chr8 (34-290)||(36781651-36781908)
chr8 (34-288)||(38098652-38098907)
chr8 (34-289)||(29997494-29997750)
chr8 (34-289)||(24757636-24757891)
chr8 (34-290)||(33411044-33411302)
chr8 (34-290)||(39780311-39780569)
chr8 (34-290)||(483025-483282)
chr8 (34-290)||(25487092-25487349)
chr8 (34-290)||(20187471-20187728)
chr8 (34-290)||(20206540-20206797)
chr8 (34-287)||(1104813-1105066)
chr8 (34-289)||(31097515-31097762)
chr8 (34-289)||(30699882-30700140)
chr8 (37-290)||(26416170-26416424)
chr8 (64-288)||(45084246-45084462)
chr8 (34-290)||(12986670-12986916)
chr8 (135-290)||(27719241-27719397)
chr8 (107-288)||(5458261-5458442)
chr8 (34-139)||(20819064-20819169)
chr8 (182-290)||(20818954-20819063)
chr8 (170-286)||(32834592-32834709)
chr8 (88-264)||(18574818-18575002)
chr8 (194-288)||(13174239-13174334)
chr8 (145-264)||(20524967-20525086)
chr8 (34-92)||(5458438-5458496)
chr8 (244-287)||(16584425-16584468)
chr8 (243-277)||(29225979-29226013)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (34-290)||(3390702-3390959)
chr5 (34-289)||(35065912-35066170)
chr5 (34-289)||(41743231-41743487)
chr5 (34-289)||(42675529-42675785)
chr5 (34-289)||(25031424-25031680)
chr5 (34-289)||(8836402-8836657)
chr5 (34-289)||(8335319-8335575)
chr5 (34-288)||(36484471-36484726)
chr5 (34-288)||(29296188-29296444)
chr5 (56-289)||(18185762-18185995)
chr5 (34-290)||(6230223-6230471)
chr5 (39-280)||(1420978-1421211)
chr5 (34-290)||(23191752-23192011)
chr5 (88-288)||(42221727-42221928)
chr5 (34-290)||(27771132-27771387)
chr5 (34-290)||(28349033-28349288)
chr5 (37-289)||(10691793-10692037)
chr5 (88-290)||(33591619-33591822)
chr5 (34-289)||(15472541-15472793)
chr5 (34-288)||(8782564-8782809)
chr5 (34-133)||(18617562-18617661)
chr5 (34-288)||(33569959-33570195)
chr5 (79-288)||(25472199-25472415)
chr5 (164-288)||(8935886-8936012)
chr5 (82-126)||(38244527-38244571)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (34-290)||(1546057-1546314)
chr3 (34-289)||(44377782-44378038)
chr3 (34-290)||(10471227-10471484)
chr3 (34-290)||(24348802-24349059)
chr3 (34-290)||(51754422-51754679)
chr3 (34-290)||(55274020-55274277)
chr3 (37-290)||(5273456-5273710)
chr3 (34-290)||(10048988-10049245)
chr3 (34-290)||(43973104-43973361)
chr3 (34-290)||(51167050-51167307)
chr3 (34-290)||(38252518-38252775)
chr3 (34-290)||(8068395-8068652)
chr3 (34-286)||(23150742-23150995)
chr3 (34-288)||(22497241-22497496)
chr3 (34-288)||(53018982-53019237)
chr3 (34-290)||(13286929-13287186)
chr3 (34-290)||(37821061-37821317)
chr3 (34-289)||(8828489-8828745)
chr3 (34-289)||(9745944-9746199)
chr3 (34-289)||(27449491-27449747)
chr3 (34-285)||(49804734-49804986)
chr3 (34-290)||(10659525-10659782)
chr3 (34-289)||(2445961-2446217)
chr3 (34-288)||(43218757-43219012)
chr3 (34-290)||(12227623-12227881)
chr3 (34-286)||(24405774-24406035)
chr3 (34-290)||(46528089-46528354)
chr3 (34-288)||(17338352-17338607)
chr3 (34-290)||(31655044-31655299)
chr3 (34-290)||(3019201-3019457)
chr3 (83-290)||(35846746-35846954)
chr3 (37-289)||(28555046-28555296)
chr3 (34-290)||(47697767-47698020)
chr3 (34-290)||(37126513-37126761)
chr3 (34-290)||(20607573-20607821)
chr3 (34-277)||(41113977-41114221)
chr3 (34-288)||(41454247-41454502)
chr3 (34-290)||(26229371-26229629)
chr3 (88-289)||(30357251-30357453)
chr3 (34-290)||(26975357-26975596)
chr3 (117-288)||(48458387-48458559)
chr3 (135-289)||(998292-998447)
chr3 (34-288)||(35512936-35513188)
chr3 (167-288)||(26717973-26718095)
chr3 (34-169)||(501837-501972)
chr3 (34-120)||(48477878-48477964)
chr3 (193-288)||(501740-501836)
chr3 (220-288)||(5218974-5219042)
chr3 (193-255)||(33591124-33591187)
chr3 (217-288)||(9126349-9126419)
chr3 (217-288)||(9134456-9134526)
chr3 (250-286)||(9116495-9116531)
chr3 (241-279)||(31608389-31608427)
chr3 (245-287)||(50507665-50507707)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (34-290)||(31587793-31588050)
chr7 (34-289)||(5544179-5544435)
chr7 (34-290)||(3887670-3887927)
chr7 (34-290)||(18676631-18676888)
chr7 (34-290)||(12726093-12726350)
chr7 (34-290)||(12848440-12848697)
chr7 (34-289)||(47020344-47020600)
chr7 (34-280)||(44061818-44062065)
chr7 (34-290)||(40186581-40186838)
chr7 (34-290)||(47455050-47455307)
chr7 (34-288)||(40431150-40431405)
chr7 (34-286)||(31621940-31622193)
chr7 (34-290)||(41118652-41118909)
chr7 (34-288)||(42076336-42076591)
chr7 (34-290)||(9741110-9741358)
chr7 (34-290)||(44291052-44291309)
chr7 (34-289)||(9870277-9870533)
chr7 (76-290)||(44508503-44508719)
chr7 (34-290)||(38743104-38743355)
chr7 (34-288)||(42697408-42697654)
chr7 (34-212)||(25105054-25105232)
chr7 (34-288)||(3111957-3112205)
chr7 (168-289)||(30888401-30888523)
chr7 (193-286)||(27419067-27419161)
chr7 (248-288)||(39494886-39494926)
chr7 (34-80)||(44509059-44509105)
chr7 (217-278)||(40190128-40190188)
chr7 (243-288)||(38168132-38168177)
chr7 (243-287)||(37544997-37545041)
[»] scaffold0562 (2 HSPs)
scaffold0562 (34-290)||(6315-6572)
scaffold0562 (34-290)||(5220-5477)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (34-290)||(814-1072)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (34-288)||(27691-27937)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (34-290)||(105576-105833)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (34-289)||(42552-42805)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (34-288)||(11112-11367)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (37-227)||(19503-19694)
[»] scaffold0548 (2 HSPs)
scaffold0548 (104-288)||(5258-5443)
scaffold0548 (34-86)||(5442-5494)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (218-290)||(20396-20468)
[»] scaffold0896 (1 HSPs)
scaffold0896 (132-168)||(50-86)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25828932 - 25828677
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25828932 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 25828833  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25828832 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 25828733  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25828732 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 25828677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 48542425 - 48542678
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48542425 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatacagtacagatcaataacaaatat 48542524  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48542525 gttgattcagatatttgttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgtgtttttaaaaatttacatg 48542624  T
Q  236 aagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48542625 aagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 48542678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40359922 - 40359667
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40359922 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 40359823  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40359822 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 40359723  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40359722 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 40359667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30159269 - 30159012
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30159269 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcaaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 30159170  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30159169 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagagttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 30159070  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30159069 atgaagatga-caattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 30159012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6979158 - 6978901
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6979158 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 6979059  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6979058 aatgttgattcagatattggttgcacatctatgttgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 6978959  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6978958 atgaagaaggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 6978901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 15475850 - 15476107
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15475850 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacttttatgaatatagtacagatcaataacaaa 15475949  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15475950 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgataataaaagatgggtttttaaaaatttac 15476049  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15476050 atgaagagggcaatttttgtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 15476107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 45502223 - 45502479
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45502223 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 45502322  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45502323 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 45502422  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45502423 atgaagagggcaattttggtattattataaaa-tttaattaaatttgggtgtaacttg 45502479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 52469303 - 52469560
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52469303 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 52469402  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52469403 gatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggaagaaagggggtaatggttcataatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 52469502  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52469503 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 52469560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 28226213 - 28226469
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28226213 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 28226312  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28226313 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 28226412  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28226413 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 28226469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 37094022 - 37094278
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37094022 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 37094121  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  37094122 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaaagaggggtttttaaaaatttac 37094221  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37094222 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 37094278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13556332 - 13556077
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13556332 atctcataccaaagcaaacaataaacaaatagaaactcattggaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 13556233  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  13556232 tatgttgattcagatattggttgcacaactatggtgatttgtggacgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaattgac 13556133  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556132 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 13556077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46675000 - 46674745
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46675000 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 46674901  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  46674900 gatgttgattcagatattggttacacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggattttaaaaatttac 46674801  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46674800 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 46674745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47534256 - 47534001
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47534256 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 47534157  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47534156 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 47534057  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47534056 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaact 47534001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15907495 - 15907250
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15907495 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 15907396  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15907395 gatgttgattcagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 15907296  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15907295 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 15907250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 28068699 - 28068956
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28068699 atctcatatcaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 28068798  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28068799 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttatggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 28068898  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28068899 atgaagagggcaagtttggtattattgtaaaattttaaataaatttatgtgtaacttg 28068956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42885523 - 42885266
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  42885523 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttaagaatatagtacatatcaataacaaa 42885424  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42885423 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtgtatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 42885324  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885323 atgaagaggacaatttttgtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 42885266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3770760 - 3770504
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3770760 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3770661  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     || |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3770660 gatattgatttatatattggttgcgcatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 3770561  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3770560 atgaagaaggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 3770504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 44233896 - 44234155
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44233896 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 44233995  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44233996 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgttgatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 44234095  T
Q  233 atgaagtgagcaattttgg--tattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44234096 atgaagagggcaattttggtatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 44234155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3047018 - 3046761
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3047018 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcattaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3046919  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3046918 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtaatttgtggatgaaaggatataagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 3046819  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3046818 atgaagagggcaattttaatattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 3046761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 24180430 - 24180688
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24180430 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 24180529  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-at-gagtttttaaaaattta 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  24180530 aatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggtgtaagggttcagaatgatcataaaagatggggtttttaaaaattta 24180629  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180630 catgaaaagggcaattttggtattattataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 24180688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35719967 - 35719709
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  35719967 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacaaattaataacaaa 35719868  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-at-gagtttttaaaaattta 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  35719867 aatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggtgtaagggttcagaatgatcataaaagatggggtttttaaaaattta 35719768  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35719767 catgaagagggcaattttggtattattataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 35719709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30361411 - 30361154
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30361411 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaactcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 30361312  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  30361311 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaggggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttagaaatttac 30361212  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30361211 atgaagagagcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgaatgtaacttg 30361154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 44054687 - 44054944
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44054687 atctcataccaaaacaaacaaaaaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 44054786  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44054787 gatgttgatttaaatcttggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 44054886  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44054887 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 44054944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18605114 - 18604860
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18605114 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaatgacaaa 18605015  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  18605014 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggggtgagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagtaatttac 18604915  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18604914 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaac 18604860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 3994737 - 3994996
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatc---aaaaac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  3994737 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcattaacctttatgaatatagtacagatcaataacaac 3994836  T
Q  131 aaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3994837 aaagatgttgattcagatattggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagtgttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatt 3994936  T
Q  230 tacatgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3994937 ttcatgaagatga-caa-tttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 3994996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 4490013 - 4490267
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4490013 atctcataccaaaacaaacaataaacata--gaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 4490110  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4490111 gatgttgattcaaatcttggttgcacatctatggtgatttatggatgaaagagagtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttagaaatttac 4490210  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4490211 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 4490267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49457094 - 49456849
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  49457094 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaacttatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacagatcaataataaa 49456995  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49456994 gatgttgattcagatattggttgcacatctatagtgatttgtggatgaaagatggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 49456895  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49456894 atgaagaggataattttagtattattgtaaaattttaaataaattt 49456849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3416552 - 3416314
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3416552 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactgacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3416453  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3416452 gatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcataatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 3416362  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 280  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416361 atgaagagggcgattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 3416314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 25729800 - 25730045
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25729800 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtatagatcaataacaaa 25729899  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||        |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25729900 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg--taaggtt--------tcataaaagatgggtttttaaaaatttac 25729989  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25729990 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 25730045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8895868 - 8895622
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8895868 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattca---------ctaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 8895778  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8895777 gatgttgattcagatattggttgcacatctat-gtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 8895679  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8895678 atgaagaggacaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 8895622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Original strand, 29033535 - 29033741
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29033535 atctcataccaaaataaacaataaacaaatataaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataagaaa 29033634  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29033635 gatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttatggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaaaataagtttttaaaaatttac 29033734  T
Q  233 atgaagt 239  Q
    |||||||    
T  29033735 atgaagt 29033741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 17580762 - 17581009
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17580762 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 17580852  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||    
T  17580853 gatgttgattcagatcttggttgcatatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagataggtttttagaaaattac 17580952  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17580953 atgaagagaacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 17581009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 31760581 - 31760829
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  31760581 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatataatacatatcaataacaaa 31760671  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31760672 gatgttgattcagatcttggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 31760771  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31760772 atgaagaggacaatttttatattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaacttg 31760829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 118 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50490974 - 50490801
Alignment:
Q  118 acagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atga 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||     
T  50490974 acagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgg 50490875  T
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50490874 gtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 50490801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 290
Target Start/End: Original strand, 26770097 - 26770252
Alignment:
Q  136 tgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  26770097 tgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttacat 26770196  T
Q  235 gaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26770197 gaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 26770252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 17926071 - 17926315
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||          |||||||| | ||||||||||  |||||    
T  17926071 atctcataccaaaacaaaccataaacaaatagaaactattagaaaataaaattcatgaaatt----------tatgaatagattacagatcaatgacaaa 17926160  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17926161 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaaaggga-aaaaattcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 17926259  T
Q  233 atgaa-gtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17926260 acgaacatga-caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 17926315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Original strand, 43106409 - 43106659
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  43106409 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatattacatatcaataacaaa 43106499  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtt-------tttaaa 225  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||       ||||||    
T  43106500 gatgttgattcagatattggttgtatatctatggtgattttttgatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagataggtttttaaaatttaaa 43106599  T
Q  226 aatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgta 285  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43106600 aatttacatgaagaggacacttttgatattattgtaaaattttaaataaatttgagtgta 43106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 278
Target Start/End: Original strand, 46234296 - 46234447
Alignment:
Q  128 aacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46234296 aacaaagatgttgattcagatattggttgtacatctatggtgatttgtgaatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaa 46234395  T
Q  227 atttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46234396 atttacatgaagaggacaattttagtattattgtaaaattttaaataaattt 46234447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Original strand, 11493516 - 11493657
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11493516 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 11493606  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaag 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11493607 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaag 11493657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Original strand, 11335496 - 11335637
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11335496 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 11335586  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaag 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11335587 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaag 11335637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Original strand, 20599594 - 20599722
Alignment:
Q  163 tatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgta 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  20599594 tatggtgatttgtgtatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaatataagtttttaaaaatttacatgaagagaacaattttagtattattgta 20599693  T
Q  262 aaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20599694 aaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20599722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49740258 - 49740096
Alignment:
Q  117 tacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcata-aaaatg 215  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||| ||| || |||    
T  49740258 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatagtgatttgtggatgaaaggaggtgaaaattcagaatgattatataagatg 49740159  T
Q  216 agtttttaaaaatttacatgaa-gtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
     ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49740158 ggtttttagaaatttacatgaacatga-caattttgatattattgtaaaattttaaataaattt 49740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Original strand, 11335642 - 11335715
Alignment:
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11335642 gtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 11335715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Original strand, 11493662 - 11493735
Alignment:
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11493662 gtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 11493735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Original strand, 7042911 - 7042982
Alignment:
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7042911 gtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaagattttaaataaatttaggtgtaact 7042982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Original strand, 46234226 - 46234295
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46234226 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaacctcatcgaaattgaaattcatgaaattcactaacc 46234295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17137104 - 17136907
Alignment:
Q  88 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  | ||| |||||||||||      ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17137104 atgaaattcactaacctttatgaataaagcaccgatcaatgaaaaagatgttgattcaatctttgatcttgattttacatctatggtgatttgtggatga 17137005  T
Q  182 aaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||   ||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||| || |||| ||| |     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17137004 aagggatcaaaggttcaaaattatcatgaaaagggggtttttagaattttatatggatacgacaatttcggtattattataaaattttaaataaattt 17136907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8969607 - 8969466
Alignment:
Q  148 tattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaat 246  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||   |||| ||| | | ||||||||||||| || ||| | |  |||||| |||||||||||||| | | |||    
T  8969607 tattgattgcatatctatggtggtttgtgcgagaaaaggggtgagggttcagaatgataatgaaagaaggatttttagaaatttacatgaagagggaaat 8969508  T
Q  247 tttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8969507 tttagtattattgtaaaattttaaataaatttgagtataact 8969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 12320186 - 12320321
Alignment:
Q  151 tggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttg 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||||| | |||| || ||||  || ||||||||||||||||  ||    ||||||||    
T  12320186 tggttgcacatctatggtt-tttatgg-tgaaaagggatgaaggttcaaagtgataatgaaaaaaagattttaaaaatttacattgagaagacaattttg 12320283  T
Q  251 gtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  12320284 atattattgtaaaattttaagtaaatttaagtgtaact 12320321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 45926257 - 45926300
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  45926257 aattttggtattattgtaaacttttaagtaaatttaggtgtaac 45926300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 641488 - 641458
Alignment:
Q  258 tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641488 tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 641458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23545663 - 23545621
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23545663 aattttagtattattgtaaaattttaatgaaatttgggtgtaa 23545621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33490049 - 33489792
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33490049 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtatagatcaataacaaa 33489950  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33489949 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 33489850  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33489849 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 33489792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 32938276 - 32938531
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32938276 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 32938375  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  32938376 gatgttgattcatatattggttgcacatctatggtgatttgtcgatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 32938475  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938476 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 32938531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 742726 - 742980
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  742726 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 742825  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  742826 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 742925  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  742926 acgaagagagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaac 742980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4210650 - 4210393
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4210650 atctcataccaaaacaaacaacaaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacatttatgaatataatacagatcaataacaaa 4210551  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4210550 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 4210451  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210450 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 4210393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10790748 - 10790491
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10790748 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 10790649  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10790648 gattttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggtgtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 10790549  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10790548 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattttggtgtaacttg 10790491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4169921 - 4169664
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4169921 atctcatactaaaacaaacaacaaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacatttatgaatataatacagatcaataacaaa 4169822  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4169821 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 4169722  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4169721 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 4169664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 17595739 - 17595996
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  17595739 atctcgtaccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaatgacaaa 17595838  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17595839 aatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 17595938  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595939 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 17595996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34475400 - 34475144
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34475400 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 34475301  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34475300 tatgttgatttagatattggttgcacatctatggtcatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 34475201  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34475200 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattgtaaataaatttagatgtaactt 34475144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 8933680 - 8933935
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8933680 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 8933779  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8933780 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 8933879  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933880 atgaagaggacaattttggtattatagtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 8933935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8063046 - 8062790
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8063046 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacatttatgaatatagtacagatcaataacaaa 8062947  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  8062946 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaaattac 8062847  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8062846 atgaagaggacaattttggtattattataaaattttaaataaatttgggtgtaactt 8062790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8659247 - 8658987
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8659247 atctcatgccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 8659148  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatca----taaaaatgagtttttaaaaatt 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    |||| ||| |||||||||||||    
T  8659147 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataattaaagatgggtttttaaaaatt 8659048  T
Q  230 tacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659047 tacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8658987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 33131008 - 33131261
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33131008 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 33131107  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  33131108 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 33131207  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33131208 atgaagaggacaattttagtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaa 33131261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 28914004 - 28914257
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28914004 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaattaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 28914103  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28914104 gatgttgattcagatattggttgcacatc----gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagattggtttttaaaaatttac 28914199  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28914200 atgaagagagtaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 28914257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 18676578 - 18676835
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18676578 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaaaaacatttataaatatagtacagatcaataacaaa 18676677  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18676678 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg-taagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 18676776  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgt-aaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18676777 atgaagaggacaattttggtattattataaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 18676835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29516922 - 29516665
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29516922 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 29516823  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  29516822 gatgttgattcagatcttagttgcgcatctatggtgatttgtagatgaaaggaggtaagagtccaaaatgatcataaaagatgaatttttagaaatttac 29516723  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29516722 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 29516665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 29863806 - 29863997
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  29863806 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaagat 29863905  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  29863906 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaaaaatgggtttttaaaaa 29863997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5545541 - 5545373
Alignment:
Q  122 atcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtga-tttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtt 219  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5545541 atcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgaatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtt 5545442  T
Q  220 tttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5545441 tttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 5545373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 12712971 - 12713216
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||  |||||||||||||          | |||||| |||| |||||||  |||||    
T  12712971 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcttagaaaatacaattcatgaaatt----------tgtgaatagagtatagatcaatgacaaa 12713060  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  12713061 gaagtttattcagattttggttgcacatctatggtgagttgtggatgaaaaggggcgagggttcagaatgatcataaaagatggggttttagaaatttac 12713160  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12713161 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaact 12713216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9224860 - 9224609
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||  | |||    
T  9224860 atctcataccaaaacaaacaatatacaaatagaaacttttagaaaatgaaattcaataagttcactaacctttatgaatagagtacatatcaatgaaaaa 9224761  T
Q  134 tatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaa 226  Q
     ||||||| |||      ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||| |||||| || ||| | | ||||| ||||    
T  9224760 gatgttgactcaatctttgatcttggtagcacatctatggtgatttctagatgaaagggggtgagggttcaaaatgataatgaaagaagggttttaaaaa 9224661  T
Q  227 atttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9224660 atttacatgaagaggacaattttgatattgttgtaaaattttaaataaattt 9224609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 8313626 - 8313887
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||    
T  8313626 atctcataccaaaataaataataaacaaatagaaactcttagaaaatgaaatttatgaaattcactgacttttatgaatatagtacagatcaatgaaaaa 8313725  T
Q  134 tatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaa 226  Q
     |||||||||||      ||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||| || ||| |   ||||||| ||    
T  8313726 gatgttgattcaatctttgattttggttacacatatatggtgatttattgatgaaagggggtgagggttcggaatgataatgaaataaaggtttttacaa 8313825  T
Q  227 atttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8313826 atttacatgaagaggacaattatgatattattgtaaaattttatataaattcgagtgtaact 8313887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11590499 - 11590248
Alignment:
Q  44 aaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgatt 143  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||  | ||| |||||||||    
T  11590499 aaaaaaaacaataaacaaatagaaactcttaaaaaattaaatttatgaaattcactgacttttatgaatggagtacatatcaatgaaaaagatgttgatt 11590400  T
Q  144 ca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatga 236  Q
    ||      ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   | ||||||||||||| || ||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  11590399 caatctttgatcttggttgcacatctatggtgatttatggacgaaatggggcgatggttcagaatgataatgaaagaaggatttttagaaatttacatga 11590300  T
Q  237 agtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11590299 agagtgtaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 11590248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9576251 - 9576031
Alignment:
Q  75 gaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattca------gatattggttgcacatctatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  | ||| || |||||| |      ||| ||| | |||| |||||| |    
T  9576251 gaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttattaatagagtaaagatcaatgaaaaagatattgatttaatctttgatcttgatagcacgtctatgat 9576152  T
Q  169 gatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattt 267  Q
    ||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||| || ||| | | ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9576151 gatttgtggatgaagtggggtgagggttcagaatgataatgaaagaagggtttttagaaatttacatgatgagagcaattttagtattattgtaaaattt 9576052  T
Q  268 taaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  9576051 taaataaatttgtgtgtaact 9576031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 288
Target Start/End: Original strand, 25143999 - 25144205
Alignment:
Q  80 tgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgattt 173  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||      ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25143999 tgaaattcataaaattcactgacctttatgaatagagtacatatcaataaaaaaaatgttgattcaatctttgatcttggttgcacatctatggtggtct 25144098  T
Q  174 gtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaata 273  Q
    |||||||||||||| | |    ||| |||||| ||||||| | | |||| | || ||| |||       |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25144099 gtggatgaaagggggtgagaactcataatgataataaaaaaggggtttttagaaatta-atg-------caattttggtattattgtaaaattttaagta 25144190  T
Q  274 aatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| ||||||||    
T  25144191 aatttgagtgtaact 25144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2559872 - 2559732
Alignment:
Q  148 tattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaat 246  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||| | | |||||| |||||| || ||| | || |||||| ||||| |||||||| | |||||    
T  2559872 tattgattgcatatccatggtggtttgtgggtgaaaaggggtgagggttcaaaatgataatgaaagaaga-tttttagaaattgacatgaagagggcaat 2559774  T
Q  247 tttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2559773 tttggtattattataaaattttaaataaattttggtgtaact 2559732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 288
Target Start/End: Original strand, 20554819 - 20554914
Alignment:
Q  194 gttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  20554819 gttcagaatgataatgaaagaagagtttttagaaatttacatgaagagggtaattttagtattattgtacagttttaaataaatttagatgtaact 20554914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 285
Target Start/End: Original strand, 13889149 - 13889191
Alignment:
Q  243 caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13889149 caattttggtattattgtaaaattttaagtaaatttaggtgta 13889191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24418743 - 24418700
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24418743 aattttggtat-attctaaaattttaaataaattggggtgtaact 24418700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26947126 - 26947090
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26947126 aattttggtattattgtaaacttttaagtaaatttgg 26947090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 21866853 - 21867110
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21866853 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 21866952  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21866953 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 21867052  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21867053 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 21867110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 11124203 - 11124460
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11124203 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 11124302  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11124303 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 11124402  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11124403 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 11124460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 30787013 - 30787270
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30787013 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 30787112  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30787113 gatgttaattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 30787212  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787213 atgaatagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 30787270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 19390441 - 19390696
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19390441 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 19390540  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19390541 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 19390640  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390641 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 19390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20115318 - 20115061
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20115318 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 20115219  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  20115218 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaaaggttcagaatgatcataaaagatgggttttaaaaaatttac 20115119  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20115118 atgaagaggaaaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20115061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2357594 - 2357341
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2357594 atctcataccaaaacaaccaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 2357495  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2357494 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 2357395  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2357394 atgaagaggacaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaa 2357341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25336781 - 25336524
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25336781 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 25336682  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  25336681 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaaggttcagaataatcataaaagatagatttttaaaaatttac 25336582  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336581 atgaaaaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 25336524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 26479722 - 26479978
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26479722 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaatttactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 26479821  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26479822 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagattggtttttaaaaatttac 26479921  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26479922 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaattggggtgtaactt 26479978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Original strand, 17977619 - 17977874
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17977619 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcgtcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagtt 17977718  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-at-gagtttttaaaaatttacat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  17977719 gttgattcagatattggttgcacatctattgtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggggtttttaaaaatttacat 17977818  T
Q  235 gaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17977819 gaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 17977874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12243001 - 12242744
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12243001 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacttttatgaatatagtacagatcaataacaaa 12242902  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa--ggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaattt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12242901 gatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaatggggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaattt 12242802  T
Q  231 acatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12242801 acatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 12242744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8113948 - 8113687
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8113948 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttataaatatagtacagatcaataacaaa 8113849  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg----ataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8113848 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgacttgtggatgaaagggggtaagtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaat 8113749  T
Q  229 ttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8113748 ttacatgaagaggacaattttggtattatagtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8113687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 39430129 - 39430382
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39430129 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcattaaattcactaacctttataaatatagtacagatcaataacaaa 39430228  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    ||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39430229 tatattgatttaaatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaatgatcataaaatatgagtttttagaaatttac 39430328  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39430329 atgaagagaacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 39430382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6034666 - 6034411
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6034666 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaaaat 6034567  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-at-gagtttttaaaaatttacat 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  6034566 gttgattcagatattagttgcacatctatagtgatttgtggatgaaagggtgtaagggttcagaatgatcataaaagatggggtttttaaaaatttacat 6034467  T
Q  235 gaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6034466 gaagagggcaattttagtattattataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 6034411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 41568576 - 41568833
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41568576 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 41568675  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41568676 gatgatgattcagatcttggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgagtttttagaaatttac 41568775  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41568776 atgaagaggataattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 41568833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 14287330 - 14287578
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14287330 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 14287420  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14287421 tatgttaattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaaggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 14287520  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14287521 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 14287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 33965315 - 33965572
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  33965315 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcaaaaatgaaattcatgaaattcactgacctttatgaatataatacaaatcaataacaga 33965414  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33965415 gatgttgattcagatattggttgcacatttatggtgatttgtggatgaaagagggcaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 33965514  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33965515 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 33965572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 31547151 - 31547401
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31547151 atctcataccaaaacaaataataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttaagaatatagtacagatcaataacaaa 31547250  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31547251 gatgttgattcagata-------cacatatatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 31547343  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31547344 atgaagatga-caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtctaacttg 31547401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 2371971 - 2372218
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2371971 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 2372061  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  2372062 gatgttgattcagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 2372161  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  2372162 atgaagagggcaattttagtattattgtaaaagtttaaataaatttagatgtaactt 2372218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 2380170 - 2380416
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2380170 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcat---------taatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 2380260  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  2380261 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagattgatttttaaaaatttac 2380360  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2380361 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 2380416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4049693 - 4049460
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |    
T  4049693 atctcataccaaaacaaacaataaacaaataaaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatga----------------------a 4049616  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4049615 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaaagatg-gtttttaaaaatttac 4049517  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4049516 atgaagaagacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 4049460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11978931 - 11978762
Alignment:
Q  122 atcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcata-aaaatgagttt 220  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11978931 atcaataataaagatgttgattcaaatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagagttcagaatgatcataaaaaatgggttt 11978832  T
Q  221 ttaaaaatttacatgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11978831 ttaaaaatttacagaaagatga-caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 11978762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 286
Target Start/End: Original strand, 1222638 - 1222746
Alignment:
Q  179 tgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1222638 tgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttagtattattgtaaaattctaaataaatt 1222737  T
Q  278 tgggtgtaa 286  Q
    |||||||||    
T  1222738 tgggtgtaa 1222746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Original strand, 1222308 - 1222413
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1222308 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcattaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 1222407  T
Q  134 tatgtt 139  Q
     |||||    
T  1222408 gatgtt 1222413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43652976 - 43652933
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43652976 aattttagtattattgtaaaattttaaataaatttgggtataac 43652933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11978976 - 11978930
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaat 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  11978976 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaat 11978930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17435400 - 17435356
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17435400 aattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaagtgtaact 17435356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 932121 - 932076
Alignment:
Q  243 caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  932121 caattttggtattattataaaatttaaagtaaatatgggtgtaact 932076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9141764 - 9141719
Alignment:
Q  243 caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9141764 caattttggtattaatgcaaaattttaagttaatttgggtgtaact 9141719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 287
Target Start/End: Original strand, 35006463 - 35006508
Alignment:
Q  242 gcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  35006463 gcaattttgatattattgtaaacttttaagtaaatttaggtgtaac 35006508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 11005483 - 11005738
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11005483 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 11005582  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11005583 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 11005682  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11005683 atgaagagggcaattttggtattattgttaaattttaaataaatttgggtgtaact 11005738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 28867545 - 28867803
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaa-caaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28867545 atctcataccaaaacaaacaataaaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaa 28867644  T
Q  133 atatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaattta 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28867645 agatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaattta 28867744  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28867745 catgaagagagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaagtgtaacttg 28867803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22169366 - 22169109
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22169366 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaataaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 22169267  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  22169266 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 22169167  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22169166 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattcgggtgtaacttg 22169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 7327527 - 7327783
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7327527 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 7327626  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7327627 gatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaagattcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 7327726  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7327727 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 7327783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2492088 - 2491833
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2492088 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaataaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 2491989  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2491988 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 2491889  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2491888 atgaagagggcaattttgatattattgttaaattttaaataaatttgggtgtaact 2491833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 27767467 - 27767721
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27767467 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 27767566  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27767567 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg-taagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 27767665  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767666 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 27767721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 56162730 - 56162475
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  56162730 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 56162631  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  56162630 gatgttgattcatatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 56162531  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56162530 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 56162475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 3875496 - 3875753
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3875496 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 3875595  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3875596 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgggataagggttcagaatgatcataaaatatgggtttttaaaaatttac 3875695  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875696 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 3875753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50621919 - 50621666
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50621919 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 50621820  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50621819 gattttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 50621720  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621719 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 50621666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54202587 - 54202332
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  54202587 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcattaatctttatgaatatagtacagatcaataataaa 54202488  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54202487 tatgttgattcagatattggttgcaaatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 54202388  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202387 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 54202332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29923858 - 29923605
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29923858 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 29923759  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29923758 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaaagataggtttttaaaaatttac 29923659  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29923658 atgaagagggcaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaa 29923605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 39677536 - 39677793
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  39677536 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataataaa 39677635  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39677636 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 39677735  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39677736 atgaagagggtaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 39677793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 36308834 - 36309087
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36308834 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaattcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 36308933  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36308934 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggagtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 36309033  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36309034 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 36309087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26488609 - 26488353
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26488609 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 26488510  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa--ggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaattt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26488509 gatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaattt 26488410  T
Q  231 acatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26488409 acatgaagagggcaattttggtattattgt-aaatttgaaataaatttgggtgtaact 26488353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 33961632 - 33961889
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33961632 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 33961731  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33961732 gatgttgattcagatattggttgcacacctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcagaaaagatgagtttttaaaaatttac 33961831  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33961832 atgaagatggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 33961889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20492760 - 20492504
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20492760 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaagtcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 20492661  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20492660 gatgttgattcagatattagttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaatgttttagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 20492561  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20492560 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttcgatgtaactt 20492504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 36224964 - 36225220
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  36224964 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactatcctttatgaatatagtacagatcaataataaa 36225063  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36225064 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagagttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 36225163  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36225164 atgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 36225220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 55282304 - 55282559
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55282304 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 55282403  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  55282404 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagg-taagggttcagaatgatcataaaatatgggtttttaaaaaattac 55282502  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55282503 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaactt 55282559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 3931819 - 3932077
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3931819 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3931918  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atga-gtttttaaaaattta 231  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  3931919 gatgttgattcagatattggttacacatctatggtgatttgtggataaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaggtttttagaaattta 3932018  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3932019 catgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattttggtgtaacttg 3932077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 7554271 - 7554528
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7554271 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaatctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 7554370  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7554371 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtggtttatgaatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 7554470  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7554471 atgaagatggcaattttggtattattgtaaaatttgaaataaatttgggtgtaacttg 7554528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 290
Target Start/End: Original strand, 24744826 - 24745078
Alignment:
Q  39 ataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  24744826 ataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagattaataacaaagatgt 24744925  T
Q  139 tgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaa 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  24744926 tgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgattataaaagatggatttttaaaaatttatatgaa 24745025  T
Q  238 gtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24745026 gagggcaattttggtattattgtaaaattgtaaataaatttgggtgtaacttg 24745078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 49331963 - 49332218
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  49331963 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactgatctttatgaatacagtacaaatcaataacaaa 49332062  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  49332063 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 49332162  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49332163 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 49332218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 3874401 - 3874658
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3874401 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3874500  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3874501 gatgttgattcagatcttggttgcacatctttggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 3874600  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3874601 atgaagaggacaattttggtattatagtacaattttaaataaatttggatgtaacttg 3874658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45884815 - 45884570
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45884815 atctcataccaaaaccaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtagagatcaataacaaa 45884716  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45884715 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 45884616  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45884615 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaattt 45884570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 36432318 - 36432573
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36432318 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactgacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 36432417  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36432418 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcataaaagatg-gtttttaaaaatttac 36432516  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36432517 atgaagagggcaattttgacgttattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 36432573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 41764521 - 41764765
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41764521 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaattcatcgaaaatgaaattcatgaaattcgctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 41764620  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41764621 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggataaaaggaggtaagagttcagaatgatcataaaagataagtttttaaaaatttac 41764720  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41764721 atgaagaga-caattttgatattattgtaaaattttaaataaattt 41764765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 43957704 - 43957945
Alignment:
Q  39 ataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43957704 ataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgt 43957803  T
Q  139 tgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaa 237  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43957804 tgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaattttacatgaa 43957894  T
Q  238 gtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43957895 aagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggggtaact 43957945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 29933373 - 29933619
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29933373 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaga 29933472  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29933473 gatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcagaataatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 29933563  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29933564 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaact 29933619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 35949342 - 35949587
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35949342 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatataaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 35949441  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  35949442 gatgttgattcagatatttgttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 35949532  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35949533 ataaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 35949587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 17445500 - 17445748
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  17445500 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacatgtcaataacaaa 17445590  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17445591 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 17445690  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445691 atgaagaggataattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 17445748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 28573612 - 28573856
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  28573612 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatcgtacaaattaataacaaa 28573711  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatttaca 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||            || |||||||||||||||||||||    
T  28573712 gatgttgattcagatattggttgcacatctatagtgatttgtggatgaaagggggtaagggttc------------aagatgagtttttaaaaatttaca 28573799  T
Q  234 tgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573800 tgaagagggcaattttgatattactgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 28573856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44878299 - 44878044
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  44878299 atctcatacaaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacatttatgaatatagtacaaatcaatgacaaa 44878200  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  44878199 gatgttgattcagatcttagttgcacatctatggtgatttatggatgaaagggggtgaaggttcagaacgatcataaaagatgagtttctagaaatttac 44878100  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  44878099 atgaagaggacaattttagtattattgtaaatttttaaataaatttgaatgtaact 44878044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11308953 - 11308768
Alignment:
Q  104 tttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatg 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||    
T  11308953 tttatgaatagattacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatatatggtgatttgtggatgaaagggggtgagaattcagaatg 11308854  T
Q  204 atcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11308853 atcataaaagatgggtttttagaaatttacatgaacagggcaattttggtataattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaact 11308768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 280
Target Start/End: Original strand, 11381821 - 11381997
Alignment:
Q  104 tttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatg 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   || ||||||    
T  11381821 tttatgaatagattacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggg-tgagaatttagaatg 11381919  T
Q  204 atcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11381920 atcataaaagatgagtttttagaaatttacttgaacagagcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgg 11381997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55541948 - 55541828
Alignment:
Q  167 gtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55541948 gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaattttacatgaagagagcaattttggtattattgtaaaat 55541849  T
Q  266 tttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  55541848 tttaaataaatttgagtgtaa 55541828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Original strand, 7326317 - 7326525
Alignment:
Q  88 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatga 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||   | ||| |||||||||||      ||| || |||  |||||||||||| ||||||| |||    
T  7326317 atgaaattcactaacctttatgaatagtgtatcgatcagtgaaaaagatgttgattcaatctttgatctttgtttaacatctatggtggtttgtgggtga 7326416  T
Q  182 aaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgag-tttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttg 279  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||| || | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7326417 aagaggttaaaggttcaaaatgatcatgaaaaatggggtttttagaattttacatggagagggcaatttcagtattattctaaaattttaaataaatttg 7326516  T
Q  280 ggtgtaact 288  Q
    |||||||||    
T  7326517 ggtgtaact 7326525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 287
Target Start/End: Original strand, 15506588 - 15506633
Alignment:
Q  242 gcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15506588 gcaatttttgtattattataaaattttaagtaaatttgggtgtaac 15506633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11309004 - 11308952
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaatt 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  11309004 atctcataccaaaacaaaccataaacaaatagaaactcttagaaaatgaaatt 11308952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 41476627 - 41476763
Alignment:
Q  148 tattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaa-aaatttacatgaagtgagcaat 246  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| | |||| || ||||  || |||||| ||||||||||  || |  ||||    
T  41476627 tattggttgcacattcatggtggtttgtgggtgaaaaggagtgaaggttcaaagtgataatgaaaaaaaggttttaagaaatttacatagagaggacaat 41476726  T
Q  247 tttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtg 283  Q
    ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41476727 tttggcatcgttgtaaaattttaagtaaatttgggtg 41476763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 288
Target Start/End: Original strand, 7795327 - 7795368
Alignment:
Q  246 ttttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7795327 ttttggtattattataaaatttt-aataaatttgggtgtaact 7795368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 288
Target Start/End: Original strand, 7818464 - 7818506
Alignment:
Q  246 ttttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7818464 ttttggtattattataaatttttaagtaaatttgggtgtaact 7818506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 288
Target Start/End: Original strand, 1536980 - 1537017
Alignment:
Q  251 gtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1536980 gtattattgtaaaatttttagtaaatttgggtgtaact 1537017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16319369 - 16319341
Alignment:
Q  158 acatctatggtgatttgtggatgaaaggg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16319369 acatctatggtgatttgtggatgaaaggg 16319341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 35393389 - 35393646
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35393389 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 35393488  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35393489 gattttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 35393588  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393589 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 35393646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8352636 - 8352379
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8352636 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcaaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 8352537  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8352536 aatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggggaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 8352437  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8352436 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8352379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11020659 - 11020402
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11020659 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaataaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 11020560  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  11020559 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttat 11020460  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11020459 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattcgggtgtaacttg 11020402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30655257 - 30655004
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30655257 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactagcctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 30655158  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcata-aaaatgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30655157 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaaaataggtttttaaaaatttac 30655058  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655057 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 30655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36781908 - 36781651
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36781908 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaattcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 36781809  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36781808 gatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 36781709  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781708 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 36781651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 38098652 - 38098907
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38098652 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 38098751  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38098752 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 38098851  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098852 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 38098907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29997750 - 29997494
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29997750 atctcataccaaaacaaataataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 29997651  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29997650 aatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 29997551  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29997550 atgaagaaggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 29997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 24757636 - 24757891
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24757636 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 24757735  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatttaca 233  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24757736 gatgttgattcagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagagttcagaatgatcataaaaatgggtttttaaaaatttaca 24757835  T
Q  234 tgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24757836 tgaagaggacaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 24757891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33411302 - 33411044
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33411302 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattccctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 33411203  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagttttt-aaaaattta 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  33411202 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgggtttttaaaaaattta 33411103  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411102 catgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 33411044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39780569 - 39780311
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39780569 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 39780470  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-at-gagtttttaaaaattta 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  39780469 aatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggtgtaagggttcagaatgatcataaaagatggggtttttaaaaattta 39780370  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39780369 catgaagagggcaattttgatattattataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 39780311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 483025 - 483282
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  483025 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 483124  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  483125 gatgttgattcagatattagttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 483224  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  483225 atgaagaggacaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaacttg 483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 25487092 - 25487349
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  25487092 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaagttcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataaaaaa 25487191  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  25487192 gatgttgattcagatcttggctgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatggatttttagaaatttac 25487291  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25487292 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 25487349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20187728 - 20187471
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20187728 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcacaaacctttatgaatatagtacagaacaataacaaa 20187629  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20187628 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 20187529  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20187528 atgaagatga-caattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 20187471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20206797 - 20206540
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20206797 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcacaaacctttatgaatatagtacagaacaataacaaa 20206698  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20206697 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 20206598  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20206597 atgaagatga-caattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 20206540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 1104813 - 1105066
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1104813 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaatgacaaa 1104912  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  1104913 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg-tgagagttcagaattatcataaaagatgggtttttagtaatttac 1105011  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1105012 atgaagaaagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaac 1105066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31097762 - 31097515
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31097762 atctcataccaaaacaaacaaaaaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 31097663  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatttaca 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |        ||| ||| |||||||||||||||||    
T  31097662 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcata--------aaagatgggtttttaaaaatttaca 31097571  T
Q  234 tgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097570 tgaagaagacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 31097515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 30699882 - 30700140
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30699882 atctcataccaatacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcattaacctttatgaatatagtacaaattaataacaaa 30699981  T
Q  134 ta--tgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaattt 230  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30699982 aaaatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaattt 30700081  T
Q  231 acatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30700082 acacaaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaactt 30700140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Original strand, 26416170 - 26416424
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  26416170 tcatgccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcttgaaattcactgacctttatgaatatagtacatatcaataacaaagat 26416269  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  26416270 gttgattcagatcttggttgcacatctattgtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaaagatgggtttttagaaatttacatg 26416369  T
Q  236 aagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26416370 aagaggaccattttgatattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaacttg 26416424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45084462 - 45084246
Alignment:
Q  64 agaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatct 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||          
T  45084462 agaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgc------ 45084369  T
Q  164 atggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaa 262  Q
       ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45084368 ---gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaa 45084272  T
Q  263 aattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45084271 aattttaaataaatttgggtgtaact 45084246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12986916 - 12986670
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12986916 atctcatactaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattca---------ctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 12986826  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12986825 gatgttgattcagatattggtttcacatctatgataatttgtggatgaaatgg--taagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 12986728  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12986727 acgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 12986670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27719397 - 27719241
Alignment:
Q  135 atgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttaca 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  27719397 atgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttaca 27719298  T
Q  234 tgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27719297 tgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 27719241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5458442 - 5458261
Alignment:
Q  107 atgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatc 206  Q
    ||||||| | ||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  5458442 atgaatagattaccgatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtgaaa-ttcagaatgatc 5458344  T
Q  207 ataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458343 ataaaagatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 5458261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20819169 - 20819064
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20819169 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 20819070  T
Q  134 tatgtt 139  Q
     |||||    
T  20819069 gatgtt 20819064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20819063 - 20818954
Alignment:
Q  182 aaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 280  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20819063 aagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 20818964  T
Q  281 gtgtaacttg 290  Q
    ||||||||||    
T  20818963 gtgtaacttg 20818954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32834709 - 32834592
Alignment:
Q  170 atttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaa-tgagtttttaaaaatttacatgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32834709 atttgtggatgaaaggggataagggttcagaataatcataaaaaatggatttttaaaaatttacatgaagatga-caattttggtattattgtaaaattt 32834611  T
Q  268 taaataaatttgggtgtaa 286  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  32834610 taaataaatttaggtgtaa 32834592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18575002 - 18574818
Alignment:
Q  88 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatga 181  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||  | |||   |||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575002 atgaaattcagtaacttttatgaatagagtacatatcaatgaaaaagtagttgattcaatatttgatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatga 18574903  T
Q  182 aaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgag-tttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaa 264  Q
    |||||| | | |||||| |||||| ||  || | ||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  18574902 aagggggtgagggttcaaaatgataatggaagaagagttttttacaaatttacatgaagagggtaattttggtattattgtaaaa 18574818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13174334 - 13174239
Alignment:
Q  194 gttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13174334 gttcataatgatcatgaaaaaagggtttttaaaaatttacttgaagaggctaatttcggtattattgtaaaattttaagtaaatttgagtgtaact 13174239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20525086 - 20524967
Alignment:
Q  145 agatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatttacatgaagtgagca 244  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||| || |||    ||||| ||||||||||||||||    ||    
T  20525086 agatattgattgcacatccatgatgatttttgggtgaaaagggataaaggttcaaagtgataatgaaagaaggttttaaaaaatttacatgaagaagaca 20524987  T
Q  245 attttggtattattgtaaaa 264  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20524986 atttcggtattattgtaaaa 20524967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5458496 - 5458438
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaa 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5458496 atctcataccaaaacaaaccataaacaaatagaaactcttagaaaatgaaattcatgaa 5458438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16584468 - 16584425
Alignment:
Q  244 aattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16584468 aattttggtattattataaaattttaagtaaatttgggtgtaac 16584425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 29225979 - 29226013
Alignment:
Q  243 caattttggtattattgtaaaattttaaataaatt 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29225979 caattttgatattattgtaaaattttaaataaatt 29226013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 3390702 - 3390959
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3390702 atctcataccaaatcaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtaaagatcaataacaaa 3390801  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3390802 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 3390901  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390902 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 3390959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 35065912 - 35066170
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataa---acaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaac 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35065912 atcttataccaaaacaaacaataataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataac 35066011  T
Q  131 aaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaattt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35066012 aaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaaatgggtttttaaaaattt 35066111  T
Q  231 acatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35066112 acatgaagagagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 35066170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 41743231 - 41743487
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41743231 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 41743330  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41743331 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcaaaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 41743430  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41743431 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 41743487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 42675529 - 42675785
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42675529 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 42675628  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42675629 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 42675728  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42675729 atgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 42675785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25031680 - 25031424
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25031680 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 25031581  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25031580 gatgttgattcagatattggttgcatatctacggtgatttgtggatgaaagggggtaaggattcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 25031481  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25031480 atgaagagtgcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 25031424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 8836402 - 8836657
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8836402 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 8836501  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8836502 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatg-aagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 8836600  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8836601 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 8836657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8335575 - 8335319
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  8335575 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacttttatgaatatattacagatcaataacata 8335476  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8335475 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggaaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 8335376  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8335375 atgaagagagcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaagtgtaactt 8335319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 36484471 - 36484726
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36484471 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 36484570  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  36484571 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 36484670  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36484671 atgaaaaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttaggtgtaact 36484726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29296444 - 29296188
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29296444 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 29296345  T
Q  134 tatgttgattcagat-attggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaattta 231  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29296344 gatgttgattcagataattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagagttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaattta 29296245  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29296244 catgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaact 29296188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18185995 - 18185762
Alignment:
Q  56 aaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggtt 155  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18185995 aaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggtt 18185896  T
Q  156 gcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18185895 gcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg-taagagttcaaaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtat 18185797  T
Q  255 tattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18185796 tattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 18185762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6230471 - 6230223
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6230471 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatgaaattca---------ctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 6230381  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6230380 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaatatgagtttttaaaaatttac 6230281  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6230280 atgaagagggcaattttaatattattgtaaaattttaaataaatttaagtgtaacttg 6230223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1421211 - 1420978
Alignment:
Q  39 ataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1421211 ataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgt 1421112  T
Q  139 tgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaa 237  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  1421111 tgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaattttacatgaa 1421021  T
Q  238 gtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 280  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421020 aagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 1420978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 23191752 - 23192011
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaa---gaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaac 130  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23191752 atctcataccataacaaacattaaacaaataatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcataa-c 23191850  T
Q  131 aaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatt 229  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  23191851 aaagatgttgattcagatcttgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatt 23191950  T
Q  230 tacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23191951 tacatgaagagggcaattttagtattattataaaattttaaacaaatttgggtgtaacttg 23192011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42221928 - 42221727
Alignment:
Q  88 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42221928 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacacctatggtgatttgtggatgaaagggg 42221829  T
Q  188 ataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42221828 gtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagtgcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaa 42221729  T
Q  287 ct 288  Q
    ||    
T  42221728 ct 42221727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 27771132 - 27771387
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27771132 atctcataccaaaacaaacaataaacatata--aactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 27771229  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  27771230 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgaggtaagagttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 27771329  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27771330 atgaagatga-caattttggtattattgttaaattttaaataaatttggatgtaacttg 27771387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28349288 - 28349033
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  28349288 atctcataccaaaacaaacaataaacata--gaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacataccaataacaaa 28349191  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  28349190 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgaggtaagggttcagaatcatcataaaagatgggtttttagaaatttac 28349091  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28349090 atgaagatga-caattttggtattattgttaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 28349033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 10691793 - 10692037
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10691793 tcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcat---------taacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagat 10691883  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10691884 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatcgggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatg 10691983  T
Q  236 aagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10691984 aagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 10692037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 290
Target Start/End: Original strand, 33591619 - 33591822
Alignment:
Q  88 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591619 atgaaattcaataacctttatgaatatagtactgatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg 33591718  T
Q  188 ataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
     ||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33591719 gtaaggattcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaa 33591818  T
Q  287 cttg 290  Q
    ||||    
T  33591819 cttg 33591822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 15472541 - 15472793
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15472541 atctcataccaaaacaaacaataaacagatagaaactcatcgaaaatgaaattca---------ctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 15472631  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggga-----taaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15472632 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggaagggggtaagggttcagattgatcataaaagatgggtttttaaaaa 15472731  T
Q  228 tttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15472732 tttacatgaagaagacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 15472793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 8782564 - 8782809
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||          |||||||| | ||||||||||   ||||    
T  8782564 atctcataccaaaaaaaaccataaacaaatagaaactcttagaaaataaaattcatgaaatt----------tatgaatagattacagatcaatggcaaa 8782653  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  8782654 gatgttgattcaaatcttggttgcacatctatggtaatttgtggatgaaagggggtgagaattcagaatgatcatgaaagatgggtttttagaaatttac 8782753  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8782754 atgaacaagacaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 8782809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18617661 - 18617562
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18617661 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatacagtacagatcaataacaaa 18617562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 33569959 - 33570195
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||          |||||||| | ||||||||||  |||||    
T  33569959 atctcataccaaaacaaaccataaacaaatagaaactcttagaaaataaaattcatgaaatt----------tatgaatagattacagatcaatgacaaa 33570048  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaaa-tgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||         |||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  33570049 gatgttgattcagatcttggttgcaca---------atttgtggataaaagggggtgagaattcagaatgatcataaaaggtgggtttttagaaatttac 33570139  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33570140 atgaacatga-caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 33570195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 288
Target Start/End: Original strand, 25472199 - 25472415
Alignment:
Q  79 atgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatt 172  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||| || ||||||||      ||| |||||| ||||| |||| || ||    
T  25472199 atgaaatttatgaaatttagtaacctttatgaatagagtaccgatcaatgaaaaaaatattgattcaatctttgattttggtttcacatttatgatggtt 25472298  T
Q  173 tgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaa 271  Q
    ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| | |   |||  |||||||| ||||||||||||    
T  25472299 tgtaggtgaaaggggatgaaagttcagaatgatcatgaaaaatgggtttttagaattttaaatgaagagggtggtttcagtattattataaaattttaaa 25472398  T
Q  272 taaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||||||    
T  25472399 taaatttgggtgtaact 25472415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 288
Target Start/End: Original strand, 8935886 - 8936012
Alignment:
Q  164 atggtgatttgtggatgaaag-gggataaaggttcagaatgatcataaaa--atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgt 260  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  ||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8935886 atggtggtttgtgggtgaaaaagggatgagggttcagaatgataatgaaagaatg-gtttttagaaatttacatgaagaggacaattttggtattattgt 8935984  T
Q  261 aaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8935985 aaaattttaaataaatttgggtgtaact 8936012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 38244527 - 38244571
Alignment:
Q  82 aaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  38244527 aaattcatgaaattcactaacctttataaatagagcacggatcaa 38244571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 1546057 - 1546314
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1546057 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 1546156  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1546157 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 1546256  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1546257 atgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 1546314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44378038 - 44377782
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44378038 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 44377939  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  44377938 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 44377839  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44377838 atgaagagagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 44377782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 10471227 - 10471484
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10471227 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 10471326  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10471327 gatgttgattcagatattagttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaaggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 10471426  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10471427 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 10471484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24349059 - 24348802
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24349059 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaaatcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 24348960  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24348959 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 24348860  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348859 atgaagatggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 24348802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51754679 - 51754422
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51754679 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcaataacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 51754580  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51754579 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 51754480  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51754479 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 51754422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 55274020 - 55274277
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55274020 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 55274119  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55274120 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 55274219  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55274220 atgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaacttg 55274277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Original strand, 5273456 - 5273710
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5273456 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaatccactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagat 5273555  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5273556 gttgattcagatattggttgcacatctacggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttacatg 5273655  T
Q  236 aagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273656 aagagggcaatttcggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 5273710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 10048988 - 10049245
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10048988 atctcatatcaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 10049087  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10049088 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcataatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 10049187  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049188 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 10049245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 43973104 - 43973361
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43973104 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 43973203  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43973204 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 43973303  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43973304 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtataacttg 43973361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 51167050 - 51167307
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51167050 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactgacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 51167149  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51167150 gatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcataatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 51167249  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51167250 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 51167307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38252775 - 38252518
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38252775 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 38252676  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38252675 gatgttgattcagatattggttgcacatctacggtgatttgtgaatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 38252576  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38252575 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 38252518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 8068395 - 8068652
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8068395 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 8068494  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  8068495 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaataatcataaaatatgagttttaagaaatttac 8068594  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8068595 atgaagagggcaatcttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8068652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23150995 - 23150742
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23150995 atctcatatcaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 23150896  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  23150895 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggtttagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 23150796  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23150795 atgaagagggcaattttggtattattataaaattttaaataaatatgggtgtaa 23150742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22497496 - 22497241
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22497496 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 22497397  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  22497396 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 22497297  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22497296 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 22497241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53019237 - 53018982
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53019237 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatattacagatcaataacaaa 53019138  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  53019137 gatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaacatttac 53019038  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53019037 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 53018982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13287186 - 13286929
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13287186 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaataaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 13287087  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13287086 gatgttgattctaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaattatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 13286987  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286986 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 13286929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37821317 - 37821061
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37821317 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 37821218  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  37821217 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagg-tacgggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 37821119  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37821118 atgaagaggacaattttggtattattataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 37821061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 8828489 - 8828745
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8828489 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccgacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 8828588  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8828589 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 8828688  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8828689 atgacgaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 8828745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9746199 - 9745944
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9746199 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaataaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 9746100  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9746099 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggataaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 9746000  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9745999 atgaagagggcaattttagtattattgtaaaa-tttaaataaattcgggtgtaactt 9745944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27449747 - 27449491
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27449747 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 27449648  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27449647 gatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtaatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 27449548  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27449547 atgaagagggaaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaactt 27449491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Original strand, 49804734 - 49804986
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49804734 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaa 49804833  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49804834 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 49804933  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgta 285  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49804934 atgaagaggacaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttggatgta 49804986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10659782 - 10659525
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  10659782 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatattacaaatcaataacaaa 10659683  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaa-aatgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||    
T  10659682 gatgttgattaagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaacgatggatttttaaaaatttac 10659583  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10659582 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtttaacttg 10659525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2446217 - 2445961
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2446217 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaagctttttgaatatagtacagatcaataacaaa 2446118  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  2446117 gatgttgattcagatattggttgcacatctattgtgatttgtggatgaaatggggtaagggttcagaatgatcataaaatatgggtttttaaaaattcac 2446018  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2446017 atgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 2445961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43219012 - 43218757
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43219012 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcaccaatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 43218913  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  43218912 gatgttgattcaaatattggttgcacatctacggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 43218813  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43218812 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 43218757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 12227623 - 12227881
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12227623 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 12227722  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-ggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaattta 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12227723 gatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaaggggggtaagggttcagaataatcataaaagatgggtttttaaaaattta 12227822  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12227823 cgtgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaagtgtaacttg 12227881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24406035 - 24405774
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24406035 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 24405936  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatga--------aaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24405935 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaa 24405836  T
Q  225 aaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24405835 aaatttacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaa 24405774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 46528354 - 46528089
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46528354 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 46528255  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatga--------aaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaa 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  46528254 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaa 46528155  T
Q  225 aaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46528154 aaatttacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 46528089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 17338352 - 17338607
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  17338352 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcataaaattcactaatctttatgaatataatacaaatcaataacaaa 17338451  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  17338452 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 17338551  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17338552 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 17338607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31655299 - 31655044
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31655299 atctcataccaaaacaaacaataaacata--gaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 31655202  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31655201 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgaggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 31655102  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655101 atgaagagggcaattttggtattattgttaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 31655044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3019457 - 3019201
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3019457 atctcataccaaaacaaacaataaacagatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaatctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3019358  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3019357 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-gggataagggttcagaatgattataaaagatgagtttttaaaaatttac 3019259  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3019258 atgaagatga-caattttaatattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 3019201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 83 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35846954 - 35846746
Alignment:
Q  83 aattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaa 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35846954 aattnatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaa 35846855  T
Q  183 aggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggg 281  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35846854 agggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggg 35846755  T
Q  282 tgtaacttg 290  Q
    |||||||||    
T  35846754 tgtaacttg 35846746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 28555046 - 28555296
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  28555046 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattc--gaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaagat 28555143  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  28555144 gttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagg-taagggttcagaatgatcataaaagataagtttttagaaatttacatg 28555242  T
Q  236 aagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555243 aagaagacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 28555296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47698020 - 47697767
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47698020 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattca---------ctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 47697930  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggga-----taaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47697929 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggaagggggtaagggttcagattgatcataaaagatgggtttttaaaaa 47697830  T
Q  228 tttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47697829 tttacatgaagagagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 47697767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 37126513 - 37126761
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37126513 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 37126603  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37126604 gatgttgattcagatattggttgtatatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 37126703  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126704 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 37126761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 20607573 - 20607821
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20607573 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 20607663  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20607664 gatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 20607763  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20607764 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20607821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Original strand, 41113977 - 41114221
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  41113977 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaataaaattcatgaaattcaccaacctttataaatatagtacagaacaataacaaa 41114076  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  41114077 gatgttgatttagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagataaatttttaaaaatttac 41114176  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatt 277  Q
    |||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41114177 atgaagaggataattttgatattattgtaaaattttaaataaatt 41114221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41454502 - 41454247
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  41454502 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaatctttatgaatatagtacaaattaatgacaaa 41454403  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  41454402 gatgttgattcagatcttggttgcacatttatggtgatttttggatgaaagggggtgaaggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagtaatttac 41454303  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41454302 atgaaaaagacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 41454247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26229629 - 26229371
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattca---------ctaacctttatgaatatagtacagatc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  26229629 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatc 26229530  T
Q  125 aaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagttttta 223  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||        |||||||| ||| |||||||    
T  26229529 aataactaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggtt--------tcataaaagatgggttttta 26229438  T
Q  224 aaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26229437 aacatttacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 26229371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30357453 - 30357251
Alignment:
Q  88 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30357453 atgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttacatatctatggtgatttgtggatgaaagggg 30357354  T
Q  188 ataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
     ||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30357353 gtaagggttcaaaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaa 30357254  T
Q  287 ctt 289  Q
    |||    
T  30357253 ctt 30357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 26975357 - 26975596
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26975357 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 26975447  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  26975448 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 26975547  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |         |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26975548 a---------caattttgatattatagtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 26975596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 48458559 - 48458387
Alignment:
Q  117 tacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atg 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  48458559 tacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatg 48458460  T
Q  216 agtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48458459 ggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 48458387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Original strand, 998292 - 998447
Alignment:
Q  135 atgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttaca 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  998292 atgttgattcagatcttggttgtacatctatggtgatttgtgaatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaacatgggtttttagaaatttaca 998391  T
Q  234 tgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  998392 tgaagatggcaattttagtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaactt 998447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 35512936 - 35513188
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||         |||||||||||||||| | |||| |||||  | |||    
T  35512936 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcttggaaaatgaaattca---------ctaacctttatgaatagaatacatatcaatgaaaaa 35513026  T
Q  134 tatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaa 226  Q
    ||||||||||||      ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| | | ||||||||||    
T  35513027 tatgttgattcaatctttgatcttggtagcacatctatgatgatttttggatgaaagggggtgaaggttcagaatgataatgaaagaagggtttttaaaa 35513126  T
Q  227 atttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35513127 atctacatgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaact 35513188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Original strand, 26717973 - 26718095
Alignment:
Q  167 gtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  26717973 gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattattgtaaaat 26718072  T
Q  266 tttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26718073 tttaaataaatttgggtgtaact 26718095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 501972 - 501837
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||   ||||    
T  501972 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcttaaaaaatgaaattcatgaaattcactaaccttaatgaatagagtacaaatcaatggcaaa 501873  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtg 169  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  501872 aatgttgattctgatattggttgcgcatctatggtg 501837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48477964 - 48477878
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48477964 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataataca 48477878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 501836 - 501740
Alignment:
Q  193 ggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  501836 ggttcagaatgatcataaaagatgagtttttagaaatttacatgaagagaacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaact 501740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5219042 - 5218974
Alignment:
Q  220 tttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5219042 tttagaaatttagatggagggggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 5218974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33591187 - 33591124
Alignment:
Q  193 ggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtatt 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33591187 ggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtatt 33591124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Original strand, 9126349 - 9126419
Alignment:
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9126349 gttttaaaaaatttacatgaagag-gtaatttcggtattattgtaaaattttaagtaaatttaggtgtaact 9126419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Original strand, 9134456 - 9134526
Alignment:
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9134456 gttttaaaaaatttacatgaagag-gtaatttcggtattattgtaaaattttaagtaaatttaggtgtaact 9134526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 286
Target Start/End: Original strand, 9116495 - 9116531
Alignment:
Q  250 ggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9116495 ggtattattgtaaaattttaagtaaatttgggtgtaa 9116531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 279
Target Start/End: Original strand, 31608389 - 31608427
Alignment:
Q  241 agcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31608389 agcaattttggtattattataaaattttaagtaaatttg 31608427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50507707 - 50507665
Alignment:
Q  245 attttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50507707 attttggtactattgtaaaatattaagtaaatttgggtgtaac 50507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 31587793 - 31588050
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31587793 atctcataccaaaacaaacaataaacaaataaaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 31587892  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31587893 gatgttgattcagatattggttgcacatatatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 31587992  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31587993 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 31588050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 5544179 - 5544435
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5544179 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 5544278  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5544279 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 5544378  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544379 atgaagagggcaattttaatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 5544435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3887927 - 3887670
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3887927 atctcataccaaaacaaacaataaataaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 3887828  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3887827 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 3887728  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3887727 atgaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaacttg 3887670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 18676631 - 18676888
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18676631 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcattaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 18676730  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18676731 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 18676830  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676831 atgaagatggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 18676888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 12726093 - 12726350
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12726093 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaataaaattcatgaaattcgctaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 12726192  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12726193 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 12726292  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12726293 atgaagagggtaattttggtattattgtaaaattttaaataaattcgggtgtaacttg 12726350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12848697 - 12848440
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12848697 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttataaatatagtacagatcaataacaaa 12848598  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  12848597 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttat 12848498  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12848497 atgaagagggtaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 12848440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 47020344 - 47020600
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47020344 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 47020443  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47020444 ggtgttgattcagatattggttgcacatctatgatggtttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 47020543  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47020544 atgaagaggacaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 47020600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44062065 - 44061818
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44062065 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 44061966  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44061965 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 44061866  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgg 280  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44061865 atgaagagagcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgg 44061818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 40186581 - 40186838
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40186581 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 40186680  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40186681 aatgttgattcagatgttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttac 40186780  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40186781 atgaagagggcacttttggtattattataaaattttaaataaatttggatgtaacttg 40186838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47455307 - 47455050
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47455307 atctgataccaaaacaaacaataaacagatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacatatcaataacaaa 47455208  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47455207 gatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 47455108  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47455107 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 47455050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 40431150 - 40431405
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40431150 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 40431249  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40431250 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 40431349  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40431350 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 40431405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31622193 - 31621940
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31622193 atctcatatcaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaatttatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 31622094  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31622093 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 31621994  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31621993 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttggatgtaa 31621940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 41118652 - 41118909
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41118652 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacacatcaataacaaa 41118751  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  41118752 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaattatcataaaagatggatttttaaaaatttac 41118851  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41118852 atgaagaaggcaattttggtattattgttaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 41118909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42076591 - 42076336
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42076591 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcaccaatctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 42076492  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  42076491 gatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggggtaacggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 42076392  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42076391 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 42076336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 9741110 - 9741358
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9741110 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatga---------aattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 9741200  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9741201 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 9741300  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9741301 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 9741358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44291309 - 44291052
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44291309 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcacaaacctttatgaatatagtacagaacaataacaaa 44291210  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44291209 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 44291110  T
Q  233 atgaag-tgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44291109 atgaagatga-caattttgatattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 44291052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 9870277 - 9870533
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9870277 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 9870376  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9870377 gatgttgattcagatattggatgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagtgttcagaatgataataaaagatgggtttttagaaatttac 9870476  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9870477 atgaagaggacaattttgttattattgtaaactttttaattaatttggatgtaactt 9870533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 76 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44508719 - 44508503
Alignment:
Q  76 aaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgt 175  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44508719 aaaataaaattcatgaaactcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgt 44508620  T
Q  176 ggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagttttt-aaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaata 273  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44508619 ggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaata 44508520  T
Q  274 aatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||||||||||||||    
T  44508519 aatttgggtgtaacttg 44508503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 38743104 - 38743355
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38743104 atctcatgccaaaacaaataataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 38743203  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||      
T  38743204 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaatttt-- 38743301  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
        || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38743302 ----agagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaacttg 38743355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42697654 - 42697408
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42697654 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatataaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacttttatgaatatattacagatcaataacaaa 42697555  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42697554 gatgttgattcagatatttgttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttac 42697464  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42697463 ataaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 42697408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25105232 - 25105054
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25105232 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 25105133  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa 212  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25105132 gatgttgattcagatattgatttcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaataatcataaaa 25105054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 3111957 - 3112205
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||  |||||    
T  3111957 atctcataccaaaagaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcacta-------tgaatatagtacagatcaatgacaaa 3112049  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||  |||||||    
T  3112050 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtaatttgtggatgaaagggggtgaaggttcataatgatcataaaagataggtttttagtaatttac 3112149  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3112150 atgaagatggtaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 3112205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 289
Target Start/End: Original strand, 30888401 - 30888523
Alignment:
Q  168 tgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaatt 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30888401 tgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaatatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgtaaaatt 30888500  T
Q  267 ttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  30888501 ttaaataaatttggatgtaactt 30888523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Original strand, 27419067 - 27419161
Alignment:
Q  193 ggttcagaatgatcataaaaatgagtttttaaaaatt-tacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaa 286  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||| | |||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27419067 ggttcagaatgattatgaaaaagaggtttttagaattctacgtggagagagcaattttggtattattataaaattttaagtaaatttaggtgtaa 27419161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39494926 - 39494886
Alignment:
Q  248 ttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39494926 ttggtattattgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 39494886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 44509105 - 44509059
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaat 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  44509105 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaat 44509059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 278
Target Start/End: Original strand, 40190128 - 40190188
Alignment:
Q  217 gtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattt 278  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40190128 gtttttagaaatttatatgaagagggcaattttgatattattgt-aaattttaaataaattt 40190188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Original strand, 38168132 - 38168177
Alignment:
Q  243 caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  38168132 caattttggtatttttgtaaaattttaagtaattttggatgtaact 38168177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 287
Target Start/End: Original strand, 37544997 - 37545041
Alignment:
Q  243 caattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 287  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37544997 caattttgatattattgttaaattttaagtaaaattgggtgtaac 37545041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 6315 - 6572
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6315 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacaaatcaataacaaa 6414  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6415 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgggataagggttcagaatgatcataaaatatgggtttttaaaaatttac 6514  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6515 atgaagaggacaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 6572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 5220 - 5477
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5220 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 5319  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5320 gatgttgattcagatcttggttgcacatctttggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttac 5419  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5420 atgaagaggacaattttggtattatagtacaattttaaataaatttggatgtaacttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 814 - 1072
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  814 atctcataccaaaataaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcacaaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 913  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atga-gtttttaaaaattta 231  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  914 gatgttgattcagatattggttacacatctatggtgatttgtggataaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaggtttttagaaattta 1013  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1014 catgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaattttggtgtaacttg 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 27691 - 27937
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27691 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 27790  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27791 gatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttac 27881  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27882 atgaagagggcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 27937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 105576 - 105833
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  105576 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaatttcatgaaattcaccaacctttatgaatatagtacacatcaataacaaa 105675  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  105676 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaattatcataaaagatggatttttaaaaatttac 105775  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  105776 atgaagaaggcaattttggtattattgttaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 42552 - 42805
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42552 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaataacaaa 42651  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-at-gagtttttaaaaattta 231  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  42652 gatgttaattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggggtaagggttcaaaatgatcataaaagatggagttttt-aaaattta 42750  T
Q  232 catgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 289  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42751 catgaagagggcaattttgg---tattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaactt 42805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11367 - 11112
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  11367 atctcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcataaaattcactaacctttatgaatatagtacatatcaatgacaaa 11268  T
Q  134 tatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcataaaa-atgagtttttaaaaatttac 232  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||    
T  11267 gatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttttggatgaaaggggatgagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagtaatatac 11168  T
Q  233 atgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11167 atgaagagggcaattttgttattattgtaaaattttaaataaatttagatgtaact 11112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 19503 - 19694
Alignment:
Q  37 tcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  19503 tcataccaaaacaaacaataaacaaatagaaactcatcgaaaatgaaattcatgaaattcactaacctttatgaatataatacagatcaataacaaagat 19602  T
Q  137 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatgatcat-aaaaatgagtttttaaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  19603 gttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaaaaatgggtttttaaaaa 19694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0548 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5258
Alignment:
Q  104 tttatgaatatagtacagatcaaaaacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaatg 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||    
T  5443 tttatgaatagattacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatatatggtgatttgtggatgaaagggggtgagaattcagaatg 5344  T
Q  204 atcataaaa-atgagtttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 288  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5343 atcataaaagatgggtttttagaaatttacatgaacagggcaattttggtataattgtaaaattttaaataaatttgagtgtaact 5258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0548; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5494 - 5442
Alignment:
Q  34 atctcataccaaaacaaacaataaacaaaaagaaacttattgaaaatgaaatt 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  5494 atctcataccaaaacaaaccataaacaaatagaaactcttagaaaatgaaatt 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 290
Target Start/End: Original strand, 20396 - 20468
Alignment:
Q  218 tttttaaaaatttacatgaagtgagcaattttggtattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 290  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396 tttttaaaaatttacattaagagggcaattttgatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0896 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:

Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Original strand, 50 - 86
Alignment:
Q  132 aatatgttgattcagatattggttgcacatctatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50 aatatgttgattcagatattggttgcacatctatggt 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University