View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15408_low_38 (Length: 244)

Name: NF15408_low_38
Description: NF15408
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15408_low_38
NF15408_low_38
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (42-226)||(10853224-10853408)
chr3 (38-224)||(50664721-50664906)
chr3 (42-215)||(26519635-26519808)
chr3 (41-224)||(20813108-20813290)
chr3 (40-226)||(3348203-3348389)
chr3 (39-217)||(10334107-10334285)
chr3 (41-222)||(44224726-44224907)
chr3 (36-215)||(53074874-53075052)
chr3 (40-224)||(52966764-52966948)
chr3 (41-224)||(38172263-38172446)
chr3 (44-224)||(8424689-8424868)
chr3 (42-217)||(42318299-42318473)
chr3 (43-221)||(21224955-21225133)
chr3 (37-217)||(23496293-23496466)
chr3 (48-224)||(35930700-35930876)
chr3 (39-217)||(44939370-44939546)
chr3 (41-217)||(48189398-48189573)
chr3 (42-224)||(38340768-38340949)
chr3 (41-217)||(15511332-15511507)
chr3 (41-217)||(38125398-38125573)
chr3 (41-224)||(35425296-35425477)
chr3 (43-224)||(16246054-16246233)
chr3 (76-217)||(53179818-53179958)
chr3 (40-224)||(30811487-30811670)
chr3 (39-175)||(4984592-4984728)
chr3 (82-224)||(25847995-25848136)
chr3 (56-217)||(23207039-23207198)
chr3 (40-215)||(42475680-42475855)
chr3 (43-217)||(34561077-34561251)
chr3 (82-217)||(31084177-31084311)
chr3 (131-217)||(31618933-31619019)
chr3 (41-138)||(55154549-55154646)
chr3 (82-209)||(30809942-30810069)
chr3 (99-217)||(32357480-32357597)
chr3 (66-190)||(40415277-40415401)
chr3 (68-217)||(14651085-14651233)
chr3 (69-154)||(19877449-19877534)
chr3 (67-224)||(49526651-49526808)
chr3 (60-216)||(45423744-45423899)
chr3 (73-182)||(29716674-29716783)
chr3 (156-224)||(22736943-22737011)
chr3 (68-224)||(14959681-14959829)
chr3 (58-151)||(42644297-42644390)
chr3 (41-150)||(44225601-44225709)
chr3 (38-123)||(52813278-52813363)
chr3 (45-97)||(35930877-35930929)
chr3 (79-145)||(22737055-22737121)
chr3 (44-150)||(25181246-25181351)
chr3 (99-150)||(7012676-7012727)
chr3 (84-147)||(10852712-10852775)
chr3 (99-150)||(52931586-52931637)
chr3 (41-95)||(31618368-31618422)
chr3 (69-216)||(53078328-53078474)
chr3 (176-213)||(55087593-55087630)
chr3 (181-215)||(37698485-37698519)
chr3 (69-150)||(21023201-21023280)
chr3 (159-224)||(41459035-41459099)
chr3 (99-147)||(23918881-23918929)
chr3 (68-167)||(30958111-30958210)
chr3 (68-167)||(30973923-30974022)
chr3 (67-107)||(45488498-45488538)
chr3 (99-146)||(41459255-41459302)
chr3 (99-146)||(46864334-46864381)
chr3 (68-150)||(31766159-31766240)
chr3 (45-151)||(41115251-41115356)
chr3 (69-107)||(48181728-48181766)
chr3 (66-167)||(33791915-33792015)
chr3 (180-217)||(44610311-44610347)
chr3 (69-150)||(53567968-53568048)
chr3 (168-216)||(1218560-1218608)
chr3 (159-199)||(19874675-19874715)
chr3 (181-217)||(30811293-30811329)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (41-226)||(3097162-3097347)
chr8 (41-215)||(3467512-3467686)
chr8 (42-217)||(25697917-25698091)
chr8 (36-217)||(22936744-22936925)
chr8 (38-217)||(28425425-28425604)
chr8 (43-217)||(27649723-27649896)
chr8 (43-217)||(36113999-36114172)
chr8 (41-215)||(8124950-8125123)
chr8 (69-222)||(6399092-6399245)
chr8 (44-207)||(42143323-42143486)
chr8 (43-217)||(4941739-4941913)
chr8 (63-217)||(38152153-38152306)
chr8 (38-217)||(33626987-33627166)
chr8 (43-217)||(41289016-41289190)
chr8 (67-217)||(44926818-44926967)
chr8 (44-189)||(26243129-26243274)
chr8 (38-217)||(440142-440321)
chr8 (50-224)||(40742260-40742432)
chr8 (39-217)||(38114422-38114599)
chr8 (40-217)||(15206673-15206850)
chr8 (44-208)||(24897547-24897710)
chr8 (82-217)||(42148982-42149117)
chr8 (94-224)||(43550861-43550991)
chr8 (82-224)||(40742094-40742236)
chr8 (42-217)||(35615686-35615861)
chr8 (43-215)||(31246273-31246445)
chr8 (69-215)||(30081635-30081780)
chr8 (42-120)||(30085596-30085674)
chr8 (59-216)||(11126494-11126651)
chr8 (39-217)||(29023216-29023378)
chr8 (42-150)||(36121502-36121609)
chr8 (104-217)||(34342873-34342984)
chr8 (39-143)||(30759259-30759363)
chr8 (82-217)||(45147247-45147382)
chr8 (69-215)||(3619053-3619198)
chr8 (41-169)||(25497717-25497845)
chr8 (159-215)||(41981136-41981192)
chr8 (99-217)||(37458313-37458435)
chr8 (132-224)||(26125542-26125634)
chr8 (41-109)||(26125842-26125910)
chr8 (41-123)||(3465396-3465478)
chr8 (76-224)||(16915031-16915175)
chr8 (69-150)||(29970846-29970926)
chr8 (69-209)||(8702392-8702531)
chr8 (97-147)||(20190186-20190236)
chr8 (81-191)||(23018099-23018209)
chr8 (45-151)||(36779434-36779539)
chr8 (99-157)||(39219758-39219816)
chr8 (42-150)||(26490977-26491085)
chr8 (99-150)||(19649230-19649281)
chr8 (99-145)||(10552923-10552969)
chr8 (101-209)||(14382178-14382285)
chr8 (69-169)||(40792188-40792287)
chr8 (69-216)||(22552724-22552871)
chr8 (40-215)||(24297547-24297721)
chr8 (182-217)||(26243068-26243103)
chr8 (99-150)||(33588764-33588815)
chr8 (42-149)||(35550266-35550372)
chr8 (84-146)||(35239546-35239608)
chr8 (84-157)||(37667057-37667129)
chr8 (38-86)||(45147218-45147266)
chr8 (181-216)||(41891915-41891950)
chr8 (69-171)||(31201649-31201750)
chr8 (69-150)||(12124716-12124796)
chr8 (66-95)||(26125826-26125855)
chr8 (39-95)||(2071537-2071593)
chr8 (67-107)||(26575890-26575930)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (40-224)||(33898960-33899144)
chr6 (41-217)||(13739175-13739350)
chr6 (41-217)||(13744675-13744850)
chr6 (42-215)||(10826062-10826235)
chr6 (41-217)||(6208019-6208194)
chr6 (44-224)||(17829957-17830137)
chr6 (39-217)||(29409205-29409383)
chr6 (41-217)||(1312395-1312571)
chr6 (69-217)||(31132433-31132580)
chr6 (82-224)||(16442347-16442489)
chr6 (39-217)||(21254833-21255010)
chr6 (99-224)||(16548101-16548226)
chr6 (58-217)||(699527-699684)
chr6 (37-217)||(5584001-5584180)
chr6 (35-224)||(21455844-21456031)
chr6 (44-217)||(16121960-16122133)
chr6 (41-123)||(15151461-15151543)
chr6 (42-111)||(29399750-29399819)
chr6 (62-123)||(32599439-32599500)
chr6 (37-215)||(7215546-7215722)
chr6 (36-123)||(26274578-26274665)
chr6 (69-148)||(3605736-3605814)
chr6 (69-148)||(8551077-8551155)
chr6 (40-79)||(16548216-16548255)
chr6 (69-146)||(1499996-1500072)
chr6 (184-225)||(32140686-32140727)
chr6 (86-150)||(882778-882842)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (37-224)||(3622399-3622586)
chr7 (41-224)||(48459693-48459876)
chr7 (38-216)||(37562561-37562739)
chr7 (40-224)||(37639413-37639597)
chr7 (42-217)||(3342780-3342955)
chr7 (40-217)||(10371900-10372077)
chr7 (41-217)||(34010330-34010504)
chr7 (40-222)||(3375475-3375657)
chr7 (43-217)||(9456095-9456268)
chr7 (46-224)||(12632031-12632209)
chr7 (44-213)||(43631642-43631810)
chr7 (44-217)||(47217487-47217660)
chr7 (48-224)||(44967349-44967525)
chr7 (42-221)||(41715643-41715822)
chr7 (40-222)||(43737881-43738063)
chr7 (43-224)||(38230051-38230232)
chr7 (44-217)||(39391083-39391256)
chr7 (45-215)||(386428-386597)
chr7 (78-224)||(42740375-42740521)
chr7 (38-217)||(34010901-34011081)
chr7 (40-217)||(34365924-34366100)
chr7 (41-221)||(32186926-32187106)
chr7 (44-224)||(48134563-48134742)
chr7 (45-215)||(46541593-46541762)
chr7 (40-215)||(39977544-39977719)
chr7 (44-222)||(47021904-47022082)
chr7 (63-213)||(36920143-36920293)
chr7 (41-213)||(24770854-24771026)
chr7 (37-217)||(39634104-39634284)
chr7 (66-215)||(3750678-3750827)
chr7 (41-209)||(42904551-42904719)
chr7 (88-215)||(32205919-32206044)
chr7 (41-195)||(37008296-37008447)
chr7 (82-224)||(1766408-1766550)
chr7 (38-217)||(42752131-42752310)
chr7 (42-216)||(40903112-40903285)
chr7 (69-146)||(12964659-12964736)
chr7 (42-121)||(19097483-19097562)
chr7 (138-217)||(19095927-19096005)
chr7 (163-217)||(47301622-47301676)
chr7 (99-198)||(33746398-33746497)
chr7 (58-147)||(20088929-20089018)
chr7 (97-147)||(44274698-44274748)
chr7 (69-150)||(4228604-4228684)
chr7 (67-119)||(12212438-12212490)
chr7 (69-216)||(46285312-46285458)
chr7 (182-215)||(37886854-37886887)
chr7 (69-209)||(2839289-2839428)
chr7 (45-151)||(16353483-16353589)
chr7 (160-215)||(43581627-43581682)
chr7 (97-147)||(12306818-12306868)
chr7 (99-149)||(16079460-16079510)
chr7 (67-109)||(25472150-25472192)
chr7 (160-205)||(12964438-12964483)
chr7 (81-134)||(20388679-20388732)
chr7 (181-217)||(4035924-4035960)
chr7 (67-107)||(15000536-15000576)
chr7 (67-107)||(25472165-25472205)
chr7 (99-147)||(38494276-38494324)
chr7 (69-149)||(45697670-45697748)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (36-215)||(29149258-29149437)
chr4 (40-217)||(9889290-9889466)
chr4 (43-224)||(39636732-39636913)
chr4 (42-224)||(14072450-14072631)
chr4 (43-217)||(43781477-43781650)
chr4 (39-217)||(51922894-51923072)
chr4 (39-224)||(16566252-16566437)
chr4 (39-215)||(28986977-28987150)
chr4 (42-214)||(6138577-6138749)
chr4 (45-217)||(9893665-9893837)
chr4 (33-217)||(14564094-14564278)
chr4 (36-217)||(15603314-15603495)
chr4 (41-226)||(46830025-46830210)
chr4 (41-217)||(32238015-32238190)
chr4 (42-213)||(26426072-26426242)
chr4 (42-217)||(26651805-26651980)
chr4 (48-215)||(42944861-42945028)
chr4 (36-224)||(43772074-43772262)
chr4 (41-217)||(19592187-19592363)
chr4 (41-221)||(48550167-48550347)
chr4 (69-217)||(49136476-49136624)
chr4 (41-224)||(49519677-49519863)
chr4 (44-217)||(30842086-30842258)
chr4 (41-215)||(13167481-13167655)
chr4 (39-224)||(14075962-14076146)
chr4 (39-224)||(54735605-54735789)
chr4 (84-224)||(4954050-4954190)
chr4 (39-215)||(54150482-54150658)
chr4 (45-217)||(54152999-54153170)
chr4 (66-217)||(48407679-48407829)
chr4 (39-217)||(6505155-6505333)
chr4 (45-217)||(13183010-13183182)
chr4 (42-217)||(48908229-48908402)
chr4 (39-201)||(39187704-39187866)
chr4 (42-215)||(25312671-25312844)
chr4 (42-224)||(31520328-31520509)
chr4 (82-224)||(48550424-48550566)
chr4 (99-217)||(2175161-2175279)
chr4 (59-209)||(46926010-46926160)
chr4 (69-190)||(38263881-38264001)
chr4 (66-164)||(55638736-55638834)
chr4 (39-224)||(53531924-53532109)
chr4 (94-217)||(56241844-56241967)
chr4 (45-171)||(45779970-45780095)
chr4 (43-216)||(14054806-14054979)
chr4 (76-216)||(19599487-19599625)
chr4 (41-217)||(38305965-38306141)
chr4 (82-208)||(15619579-15619703)
chr4 (41-215)||(54488561-54488735)
chr4 (99-224)||(30887168-30887292)
chr4 (40-149)||(41866176-41866285)
chr4 (65-217)||(38694002-38694154)
chr4 (66-152)||(33574197-33574283)
chr4 (41-196)||(523129-523280)
chr4 (82-151)||(36150624-36150693)
chr4 (159-217)||(55638861-55638919)
chr4 (44-144)||(22694556-22694656)
chr4 (99-224)||(28752462-28752586)
chr4 (69-216)||(5025484-5025630)
chr4 (84-150)||(54487219-54487285)
chr4 (39-215)||(14597579-14597754)
chr4 (91-152)||(24512222-24512283)
chr4 (69-150)||(39000532-39000612)
chr4 (67-123)||(4649911-4649967)
chr4 (69-170)||(8683012-8683115)
chr4 (84-216)||(16492884-16493014)
chr4 (45-152)||(20232001-20232108)
chr4 (99-150)||(22699763-22699814)
chr4 (99-150)||(22980716-22980767)
chr4 (99-150)||(22994303-22994354)
chr4 (38-89)||(48550395-48550446)
chr4 (41-108)||(48556616-48556683)
chr4 (42-137)||(54655266-54655361)
chr4 (159-217)||(48257057-48257115)
chr4 (41-86)||(26459852-26459897)
chr4 (81-146)||(40335641-40335706)
chr4 (99-147)||(28947763-28947811)
chr4 (82-150)||(53914920-53914987)
chr4 (99-150)||(2341449-2341500)
chr4 (111-174)||(8754155-8754217)
chr4 (84-147)||(46958047-46958110)
chr4 (99-149)||(29778996-29779046)
chr4 (68-150)||(38740286-38740367)
chr4 (67-116)||(1616515-1616563)
chr4 (68-109)||(16202518-16202559)
chr4 (99-152)||(33843801-33843854)
chr4 (41-150)||(40286303-40286411)
chr4 (99-148)||(52062992-52063041)
chr4 (159-216)||(54655205-54655262)
chr4 (67-107)||(16202532-16202572)
chr4 (82-150)||(39993574-39993642)
chr4 (181-217)||(45106362-45106398)
chr4 (181-217)||(50523350-50523386)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (42-217)||(7472629-7472803)
chr2 (42-215)||(2213486-2213659)
chr2 (40-224)||(9988454-9988638)
chr2 (42-215)||(28127242-28127415)
chr2 (41-214)||(1944993-1945166)
chr2 (36-217)||(39141419-39141599)
chr2 (40-224)||(36312248-36312431)
chr2 (41-224)||(5916196-5916378)
chr2 (41-217)||(36548178-36548353)
chr2 (41-217)||(44619015-44619191)
chr2 (45-217)||(14821141-14821312)
chr2 (43-215)||(32501966-32502137)
chr2 (47-217)||(42515936-42516105)
chr2 (41-217)||(8170291-8170466)
chr2 (39-217)||(2215232-2215408)
chr2 (40-224)||(31562640-31562821)
chr2 (42-217)||(25747837-25748011)
chr2 (41-215)||(28261274-28261448)
chr2 (39-224)||(3853871-3854056)
chr2 (41-217)||(23358236-23358411)
chr2 (42-184)||(2213658-2213800)
chr2 (69-217)||(7296133-7296281)
chr2 (67-215)||(16467066-16467214)
chr2 (48-217)||(18511080-18511249)
chr2 (39-207)||(42089480-42089652)
chr2 (69-217)||(7295330-7295476)
chr2 (42-215)||(26207884-26208057)
chr2 (42-185)||(31224690-31224833)
chr2 (38-224)||(28641613-28641799)
chr2 (44-193)||(34433263-34433413)
chr2 (43-147)||(30007509-30007613)
chr2 (84-215)||(27911386-27911517)
chr2 (68-150)||(41580691-41580773)
chr2 (42-215)||(3602415-3602587)
chr2 (99-215)||(39106681-39106796)
chr2 (99-221)||(43436293-43436415)
chr2 (67-185)||(45714648-45714766)
chr2 (76-217)||(8041258-8041397)
chr2 (41-150)||(12110919-12111027)
chr2 (110-217)||(25940264-25940371)
chr2 (68-146)||(38600424-38600502)
chr2 (45-217)||(11240649-11240820)
chr2 (69-216)||(18970272-18970416)
chr2 (159-215)||(2234907-2234962)
chr2 (68-123)||(23267345-23267400)
chr2 (44-150)||(1763265-1763370)
chr2 (41-150)||(30599858-30599967)
chr2 (69-221)||(43858194-43858346)
chr2 (99-150)||(23359942-23359993)
chr2 (45-152)||(34997194-34997301)
chr2 (99-150)||(23377549-23377600)
chr2 (99-149)||(10918649-10918699)
chr2 (97-194)||(42770406-42770503)
chr2 (40-81)||(43436264-43436305)
chr2 (99-146)||(5055218-5055265)
chr2 (39-107)||(7474196-7474264)
[»] chr1 (69 HSPs)
chr1 (41-217)||(43728835-43729010)
chr1 (41-224)||(48510894-48511077)
chr1 (41-215)||(6166105-6166278)
chr1 (41-226)||(42850176-42850361)
chr1 (38-217)||(35569156-35569335)
chr1 (41-217)||(1199820-1199996)
chr1 (41-224)||(7826311-7826494)
chr1 (41-224)||(31223360-31223543)
chr1 (41-217)||(20800234-20800410)
chr1 (40-217)||(12468206-12468381)
chr1 (37-217)||(10470583-10470762)
chr1 (43-224)||(25229993-25230173)
chr1 (43-215)||(11023289-11023460)
chr1 (37-217)||(12247413-12247592)
chr1 (37-221)||(26058230-26058414)
chr1 (43-217)||(5410633-5410806)
chr1 (39-217)||(13055991-13056168)
chr1 (39-217)||(13931616-13931792)
chr1 (41-224)||(50977297-50977479)
chr1 (47-217)||(45710042-45710211)
chr1 (30-217)||(35536065-35536251)
chr1 (39-215)||(47123381-47123557)
chr1 (42-217)||(6464601-6464775)
chr1 (40-195)||(27801608-27801763)
chr1 (47-217)||(40229433-40229603)
chr1 (44-217)||(36205184-36205357)
chr1 (84-224)||(4369803-4369942)
chr1 (41-215)||(50406125-50406299)
chr1 (41-209)||(34718452-34718620)
chr1 (45-210)||(9447533-9447696)
chr1 (66-217)||(15884219-15884371)
chr1 (69-215)||(25061221-25061367)
chr1 (39-157)||(40352444-40352561)
chr1 (84-209)||(23628706-23628830)
chr1 (112-224)||(11051339-11051450)
chr1 (84-206)||(11561826-11561948)
chr1 (58-146)||(49242956-49243044)
chr1 (44-150)||(4347034-4347139)
chr1 (37-123)||(29441271-29441357)
chr1 (165-226)||(31933711-31933772)
chr1 (39-220)||(41919-42096)
chr1 (99-185)||(291732-291818)
chr1 (44-106)||(6061246-6061308)
chr1 (38-147)||(13344836-13344944)
chr1 (66-123)||(43134537-43134594)
chr1 (41-150)||(7765241-7765349)
chr1 (69-210)||(15576454-15576595)
chr1 (84-217)||(32365072-32365205)
chr1 (74-115)||(43134454-43134495)
chr1 (162-222)||(40821813-40821873)
chr1 (42-150)||(43730002-43730110)
chr1 (66-150)||(47981778-47981861)
chr1 (42-145)||(29438648-29438750)
chr1 (99-150)||(29759711-29759762)
chr1 (84-150)||(6219966-6220032)
chr1 (58-120)||(21063283-21063345)
chr1 (82-150)||(16556295-16556362)
chr1 (99-183)||(49178202-49178286)
chr1 (159-198)||(41856950-41856989)
chr1 (82-145)||(47085898-47085961)
chr1 (82-149)||(47978359-47978426)
chr1 (41-98)||(291704-291762)
chr1 (99-141)||(11018998-11019040)
chr1 (159-221)||(13855712-13855774)
chr1 (58-116)||(21051098-21051156)
chr1 (66-120)||(30557624-30557677)
chr1 (84-144)||(3134656-3134716)
chr1 (99-147)||(5930823-5930871)
chr1 (181-217)||(46033210-46033246)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (43-217)||(13253038-13253211)
chr5 (41-215)||(35760174-35760348)
chr5 (42-215)||(3667839-3668012)
chr5 (38-215)||(8049001-8049178)
chr5 (41-217)||(22482172-22482348)
chr5 (41-209)||(39987920-39988088)
chr5 (41-224)||(2430250-2430432)
chr5 (67-226)||(3060203-3060360)
chr5 (40-217)||(32454520-32454697)
chr5 (38-217)||(32030699-32030876)
chr5 (39-217)||(24045814-24045991)
chr5 (40-214)||(40495310-40495483)
chr5 (45-217)||(7714923-7715095)
chr5 (40-217)||(27021111-27021288)
chr5 (39-215)||(7385883-7386059)
chr5 (42-222)||(41834870-41835050)
chr5 (39-217)||(40885193-40885372)
chr5 (39-217)||(10058057-10058235)
chr5 (39-213)||(40791021-40791194)
chr5 (41-213)||(42146295-42146466)
chr5 (42-224)||(33953856-33954037)
chr5 (59-217)||(41740564-41740722)
chr5 (41-214)||(5710339-5710511)
chr5 (43-224)||(9275439-9275620)
chr5 (67-224)||(4292125-4292282)
chr5 (41-217)||(7178761-7178936)
chr5 (45-224)||(2694717-2694896)
chr5 (69-224)||(16158446-16158601)
chr5 (69-209)||(34106928-34107068)
chr5 (132-224)||(28869547-28869638)
chr5 (69-175)||(23914235-23914341)
chr5 (39-123)||(35847841-35847925)
chr5 (99-216)||(41959445-41959561)
chr5 (80-217)||(2861620-2861760)
chr5 (37-215)||(3747540-3747717)
chr5 (81-191)||(20068923-20069033)
chr5 (99-150)||(22811076-22811127)
chr5 (59-150)||(33467963-33468054)
chr5 (58-150)||(2483684-2483776)
chr5 (69-149)||(19784864-19784944)
chr5 (165-224)||(16843514-16843573)
chr5 (40-150)||(19203957-19204066)
chr5 (68-120)||(16843609-16843661)
chr5 (58-118)||(18850984-18851043)
chr5 (40-147)||(3748951-3749057)
chr5 (84-151)||(24036622-24036689)
chr5 (99-149)||(2868364-2868414)
chr5 (67-109)||(4295607-4295649)
chr5 (68-109)||(33386859-33386900)
chr5 (67-107)||(33082342-33082382)
chr5 (181-217)||(40980001-40980037)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (40-217)||(9080-9256)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (41-217)||(8418-8594)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (33-217)||(253097-253281)
scaffold0005 (39-215)||(219624-219799)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (42-224)||(29080-29261)
[»] scaffold0983 (1 HSPs)
scaffold0983 (42-216)||(2225-2399)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (39-217)||(1981-2159)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (39-224)||(5784-5970)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (41-176)||(118366-118501)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (40-150)||(15213-15322)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (42-216)||(46733-46906)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (58-224)||(65462-65627)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (81-149)||(301562-301630)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (99-224)||(138522-138647)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (84-217)||(99637-99764)
scaffold0031 (84-146)||(99918-99980)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (99-147)||(199383-199431)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (61-106)||(32058-32103)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (67-107)||(32459-32499)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (67-107)||(38372-38412)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 226
Target Start/End: Original strand, 10853224 - 10853408
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10853224 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 10853323  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10853324 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtatt 10853408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50664906 - 50664721
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  50664906 cttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgat 50664807  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  50664806 ttatgtttggatacacacacttagaagtgattcttaagagtt-atgttgtttagatagtttaaattaaaattgattttgaatgtgta 50664721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26519808 - 26519635
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26519808 gtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 26519709  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26519708 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaaacaaaattgatttt 26519635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20813290 - 20813108
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  || | |||||||||     
T  20813290 agtgtgtgtttggtatatcggtggagagaattgattttgatagaat-gagtttgagagaattgtgtttggttaaaagtgagttggatttgaattgatttt 20813192  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20813191 tgtttggatatacttattcaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 20813108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3348389 - 3348203
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  3348389 tagtgtgtgtttggcatagcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttagaagtgagttggatgtaaattgattt 3348290  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3348289 atgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttatatcaaaattgattttgaatgtgtatt 3348203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10334285 - 10334107
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  10334285 ttagtgtgtgtttgatatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtcagttgaatatgaattgatt 10334186  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| |||    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10334185 tatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 10334107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44224907 - 44224726
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||| |||||||| | |||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44224907 agtgtttgtttggtttggcggcggggagaattgattccggtagaattgagtttgagataattgattatggttaaaagtgagtttgatatgaattgattta 44224808  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  44224807 tgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataattttagtcaaaattgattttgaatgtg 44224726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53075052 - 53074874
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattg 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||    
T  53075052 ctcttcgtgtgtgtttgatacggcggcggtgaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattg 53074953  T
Q  136 atttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53074952 att-atgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 53074874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Original strand, 52966764 - 52966948
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  52966764 tagtgtgtgtttggtttggaggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgactttgatgtgaattgattt 52966863  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52966864 atgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 52966948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 38172263 - 38172446
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||    
T  38172263 agtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtgggatgtgaattgattta 38172362  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38172363 tgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgta 38172446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 8424689 - 8424868
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||    
T  8424689 gtgtgtttagtatagcggtggtcataattgaatttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtgaattga-ttatgt 8424787  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8424788 ttggatacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 8424868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42318473 - 42318299
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||    
T  42318473 gtgtgtgtttggtatagcggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttat 42318375  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42318374 gtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 42318299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21225133 - 21224955
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21225133 tgtgtgtttggtttagcggcggcgagaattgatctctatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatatatg 21225034  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21225033 tttggatacactttcttaaaagcgattcttacgagttgatgtcgttttgatagtttgaatcaaaattgattatgagtgt 21224955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23496466 - 23496293
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  23496466 tcttagtgtgtgtttggtatggcggcgaggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga 23496367  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||        ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496366 tttatgtttggata-------ctaaaagtgattcttgcgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 23496293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35930876 - 35930700
Alignment:
Q  48 gtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  35930876 gtttggtatatcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgcttgg 35930777  T
Q  148 atatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||| ||| |  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  35930776 atacactaatgtataagtcattcttatgagttgataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgta 35930700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 44939370 - 44939546
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  44939370 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgaatttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatatgaattga-t 44939468  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  44939469 tatgtttggatacatttac-tataagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagttttaatcaaaattaattttga 44939546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 48189398 - 48189573
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  48189398 agtgtgtgtttggtagggcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-tta 48189496  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| ||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48189497 tgtttggatacacgttaacagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 48189573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38340949 - 38340768
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  38340949 gtgtgtgtttggtatggcgttggtgagaattgattttgatagaatgaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttat 38340850  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| || | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  38340849 gtttggatatgctta-ttaaaagtaatttttataagttgacgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttaaatgtgta 38340768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 15511332 - 15511507
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||    
T  15511332 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaacggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgggtgtgaattgattta 15511431  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15511432 tgtttggatacgctta-ttaaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttga 15511507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 38125398 - 38125573
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||| |||    
T  38125398 agtgtgtgtttggtatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattga-tta 38125496  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38125497 tgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 38125573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35425477 - 35425296
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  35425477 agtgtgtgtttg-tagggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattga-tta 35425380  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| |||     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35425379 tgtttggatacactttaacagaagtgattcttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 35425296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Original strand, 16246054 - 16246233
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16246054 tgtgtgtttggtttggcggtagcgagaattgatattaatagaattgagtttgaga--attgattttagttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatg 16246151  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||| | |||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16246152 tttggaaacactttaatagaagtgattcttaggagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 16246233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53179958 - 53179818
Alignment:
Q  76 tttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatg 175  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||    
T  53179958 tttgatagaattgagttttatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatg 53179859  T
Q  176 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53179858 agttgat-ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 53179818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Original strand, 30811487 - 30811670
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||    
T  30811487 tagtgtgtgtttggtagggcggtgacgagaattgattttgatataattgaatttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattga-tt 30811585  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||| |||     | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30811586 atgtttggatacactttaacagaagtgattcttatgacttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 30811670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4984728 - 4984592
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||    
T  4984728 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttgatataattgaatttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatt 4984629  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatg 175  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  4984628 tatgtttggatacactcgtttaaaagtgattcttatg 4984592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25848136 - 25847995
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||      
T  25848136 agaattgagtttgagaaaattaattttggtaaaaagtgagtttaatatgaattgatttatgtttggataccttcacttaaaaatgattcttatgagtttg 25848037  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  25848036 tgttgtttggatag-ttgaataaaaattgattttaaatgtgta 25847995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 23207039 - 23207198
Alignment:
Q  56 tagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactc 155  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||     
T  23207039 tagcggtggcgaaaattgattttgatataattgattttgttataattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactt 23207138  T
Q  156 acttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23207139 ttttacaagtgatt-ttatgagttgatgttgttt-gatagtttgaatcaaaattaattttga 23207198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42475855 - 42475680
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||    
T  42475855 tagtgtgcgtttggtttggcggtgacgagaattgatttttatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgattt 42475756  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
     |||||| ||| |||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  42475755 ttgtttgaatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgctttt 42475680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34561251 - 34561077
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  34561251 tgtgtgtttggttcagcagtggagaaaattgattttgatagaattaagtttgataaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgcgaattgatttatg 34561152  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| | | ||||| || |||||||||  | || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34561151 tttggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttggttggatagtttgacccaaaattgattttga 34561077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31084311 - 31084177
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  31084311 agaattgattttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactt-cttaaaagtgattcttatgacttga 31084213  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31084212 tattatttggatagtttgaatcataattgattttga 31084177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 217
Target Start/End: Original strand, 31618933 - 31619019
Alignment:
Q  131 aattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31618933 aattgatttatgtttggatactctcacttagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 31619019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 55154646 - 55154549
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  55154646 agtgtgtgtttggtatggcagtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 55154549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 30809942 - 30810069
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||  ||  || ||||||||||||||||||| | ||||    
T  30809942 agaattgattttgataaaattgagtttggttaaaagtgagttaaatgtgaattgatttatgattgattacgcttacttaaaagtgattcttataaattga 30810041  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  30810042 tgatgtttggatagtttgaatcaaaatt 30810069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32357597 - 32357480
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  32357597 aattgattttggttgaa-gtgaatttgatgtaaattgatttatgtttgaaaacactcatttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttgggtacttt 32357499  T
Q  199 gaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  32357498 gaattaaaattgattttga 32357480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 190
Target Start/End: Original strand, 40415277 - 40415401
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  40415277 gagaattgattttgatagaattgagtttaaaggaatcgattttagttaaaagtgagttggatgtaaattaatttatgtttggatatacccacttaaagat 40415376  T
Q  166 gattcttatgagttgatgttgtttg 190  Q
     |||||||| ||||||| |||||||    
T  40415377 aattcttataagttgattttgtttg 40415401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 14651085 - 14651233
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtga 167  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  14651085 gaattgattttaataaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatat-aattgatttgtgttttgatatacttacatagaagtga 14651183  T
Q  168 ttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    || |||  | || | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14651184 tttttaccaattcaagttgtttggataatttgaatcaaaatagcttttga 14651233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19877534 - 19877449
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatact 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19877534 aatttattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttagatatact 19877449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Original strand, 49526651 - 49526808
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||    
T  49526651 agaattgagtttgatgaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgaattgattgtaaattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattg 49526750  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||| | || |||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  49526751 attcttatcaatttatgttgtttaaatagtctaaatcaaaattgcttttgaatgtgta 49526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 45423744 - 45423899
Alignment:
Q  60 ggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcactt 159  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||| | ||| | |||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| | |  |    
T  45423744 ggtggcgaaaattgattttggcataattgattctgatagaattgattttgcctaaaagtgagttgaacttaa-ttggtttatgtttggatatattaaagt 45423842  T
Q  160 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45423843 aaaagtgattcttatcaattcatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgattttg 45423899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 29716674 - 29716783
Alignment:
Q  73 gattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattctt 172  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | || |   | | |||||||||||||||    
T  29716674 gattttgataaaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagttaaatatgaattgatttatttatagacacgtttaattaaaagtgattctt 29716773  T
Q  173 atgagttgat 182  Q
    |||| |||||    
T  29716774 atgaattgat 29716783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22737011 - 22736943
Alignment:
Q  156 acttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22737011 acttaaaagtgattattatgagttaatgttgttgggatggtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 22736943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14959829 - 14959681
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtga 167  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||| | |   ||||    ||    
T  14959829 gaattgattttgata-aactgaatttgaaataattgattttaattaaaagtgagtttgatattaactcatttatttttggatacatt---ttaa----ga 14959738  T
Q  168 ttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14959737 tttttatgagttgatgttgtttagatgatttgaatcaaacttgattttgaatgtgta 14959681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42644390 - 42644297
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatat 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||   | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42644390 gcggtgatgagaattgattttgagtgaattgattttataaaaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatat 42644297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44225709 - 44225601
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||   | ||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44225709 agtgtgtgtttggttgtgtggtggagaaaattgattttaatataattgattttgt-agaattgattttcgttaaaagtgagtttaatgtaaagtgattta 44225611  T
Q  141 tgtttggata 150  Q
    ||||||||||    
T  44225610 tgtttggata 44225601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 52813363 - 52813278
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    |||||||||||||||||   ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  52813363 cttagtgtgtgtttggttctgcggtgagtaaaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 52813278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 35930929 - 35930877
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgaga 97  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930929 tgtgtttggtatactggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgaga 35930877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22737121 - 22737055
Alignment:
Q  79 gatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgttt 145  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  22737121 gatagaattgagtttgaaaaaattgattttggttaaaagtaagtagaatgtaaattgatttatgttt 22737055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25181351 - 25181246
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||   |||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  25181351 gtgtgtttggttatgcggtggctagaattgatattgattgaattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtgagtttaatgtaaaattatttatgt 25181253  T
Q  144 ttggata 150  Q
    |||||||    
T  25181252 ttggata 25181246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7012727 - 7012676
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7012727 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 7012676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 147
Target Start/End: Original strand, 10852712 - 10852775
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  10852712 aattgattttggtataattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttgg 10852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Original strand, 52931586 - 52931637
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52931586 aattgattttagttaaaagtgagtttagtgtaaattgatttatgtttggata 52931637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 95
Target Start/End: Original strand, 31618368 - 31618422
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttga 95  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31618368 agtgtgtgtttggtatgacggtgggaagaattgattttgatagaattgagtttga 31618422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53078474 - 53078328
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcactta--aaagtg 166  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  | |||||||||| |||| || |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||    
T  53078474 aattgattttgattgaattaattttgt-agaattgattttagttagaaatgagttgaacaaaaattgatttatgtttggata-actccctaacaaaagtg 53078377  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||  ||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53078376 atttatataaaat-atgttgtttggacagtttgaatcaaaattgattttg 53078328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 213
Target Start/End: Original strand, 55087593 - 55087630
Alignment:
Q  176 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55087593 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 55087630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 215
Target Start/End: Original strand, 37698485 - 37698519
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698485 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 37698519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 21023201 - 21023280
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  21023201 aattgattttgatagaattga-tttgtaa-aattgattttggttaaatgtgagttgaatttgaagtgatttatgtttagata 21023280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41459099 - 41459035
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41459099 taaaagtgattcttatcaattcatggtgtttggataatttgaat-aaaattgattttgaatgtgta 41459035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23918929 - 23918881
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23918929 aattaattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttgg 23918881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30958210 - 30958111
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaa-ttgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30958210 gaattgattttgaatgaattgattttgtaa-aattgattttggctaaatgtgagttgaatgtaaagtttatttatgtttggatatattcatgtaaaagtg 30958112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30974022 - 30973923
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaa-ttgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30974022 gaattgattttgaatgaattgattttgtaa-aattgattttggctaaatgtgagttgaatgtaaagtttatttatgtttggatatattcatgtaaaagtg 30973924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 45488498 - 45488538
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  45488498 agaattgattttgaaagaattgattttgagataattgattt 45488538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41459302 - 41459255
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41459302 aattgactttggttaaaagtgatttgaagataaattgatttatgtttg 41459255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46864381 - 46864334
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  46864381 aattgattttggttaaaagtgattttaacataaagtggtttatgtttg 46864334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Original strand, 31766159 - 31766240
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  31766159 gaattgattttgaatgaattgattttgtaa-aattaattttggataaaagtgagttgaagttaaagtgatttatgtttggata 31766240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Original strand, 41115251 - 41115356
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||| | | || || ||||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  41115251 tgtgtttggttttgtggcggcgagaattgattatgaatgaattgattttgt-ataattgattttggctaacaatgagttgaatgtaaaatggtttatgtt 41115349  T
Q  145 tggatat 151  Q
    |||||||    
T  41115350 tggatat 41115356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 48181766 - 48181728
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48181766 aattgattctgatagaattgattttgagataattgattt 48181728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 33791915 - 33792015
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||  | ||||| ||| |||||| |||||||||| | |||  |||||||    
T  33791915 gagaattcattttgatagaattgattttg-tatgattgattttggctagaagtggttctaataaaaaatgatttgtgtttggatagattcatgtaaaagt 33792013  T
Q  166 ga 167  Q
    ||    
T  33792014 ga 33792015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 44610311 - 44610347
Alignment:
Q  180 gatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44610311 gatgttgtttggatagtttg-atcaaaattgattttga 44610347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 53568048 - 53567968
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||    
T  53568048 aattgattttgagtgaattgatttt-acaaaattgattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtaatttatgtttggata 53567968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1218608 - 1218560
Alignment:
Q  168 ttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  1218608 ttcttatgagttaatgttgtttccatagtttgaaataaaattgattttg 1218560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19874715 - 19874675
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19874715 taaaagttattcttatgagttgacgttgtttgcatagtttg 19874675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30811329 - 30811293
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30811329 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttga 30811293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Original strand, 3097162 - 3097347
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3097162 agtgtgtgtttggtatagcagtggtgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatatgaattgattta 3097261  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3097262 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtatt 3097347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3467686 - 3467512
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||     
T  3467686 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttc 3467587  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3467586 tgtttggatatatttatttaaaagtgattcttatgaattgatgttggttggatagtttgaatcaaaattgatttt 3467512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 25697917 - 25698091
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||| ||    
T  25697917 gtgtgtgcttggtatagcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatt-at 25698015  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25698016 gtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 25698091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 22936744 - 22936925
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattg 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  22936744 ctcttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg 22936843  T
Q  136 atttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22936844 atttatgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaatttggttttga 22936925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 28425425 - 28425604
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||    
T  28425425 cttagtgtgtgtttggtatgacggtggcgaaaattgattttgatagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgat 28425524  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425525 ttatgtttggatacactttcttacaagtgattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 28425604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27649896 - 27649723
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | |||    
T  27649896 tgtgtgtttggttgggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgatttggatatgaattgaat-atg 27649798  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27649797 tttagatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 27649723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 36113999 - 36114172
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| || |||    
T  36113999 tgtgtgtttggtatgacggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtaagtttgatgtagattggtt-atg 36114097  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36114098 tttggatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 36114172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8125123 - 8124950
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |    
T  8125123 agtgtgtgtttggtatagcagtcctgataattgattttggttgaatcgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatgtgaattgatt-a 8125025  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8125024 tgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgaagttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 8124950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 6399092 - 6399245
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6399092 aattgattctggtagaattgagtttgatagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttcgatacactcacttaaaagtgat 6399191  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6399192 tcttatgagttgatgttgtttggataattttaatcaaaattgattttgaatgtg 6399245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 42143323 - 42143486
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  42143323 gtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattatgatataattgagtttgagaaaattgattttagttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgt 42143422  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaa 207  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  42143423 ttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgacgttgtttggataatttgaaacaaaa 42143486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 4941739 - 4941913
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  4941739 tgtgtgtttggtatggcggtggctagaattgattctgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatg 4941838  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4941839 tttggataaaattatttaaaagcgattcttatgagttgatgttgtttgaataatttgaattaaaattgattttga 4941913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 38152153 - 38152306
Alignment:
Q  63 ggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  38152153 ggtgagaattgattttgatagaattaagtttgagaaaattgattttagttaaa-gtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggaaatatttacttaaa 38152251  T
Q  163 agtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38152252 aatgattcttatgagttgatgtggtttggatactttaaatcaaaattgattttga 38152306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 33626987 - 33627166
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||||    
T  33626987 cttagtgtgtgtttggttcggcggtggagggaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttatttaaaactgagttggataagaattgat 33627086  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33627087 ttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaatcgattttga 33627166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 41289016 - 41289190
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | | ||||||||||||    
T  41289016 tgtgggtttggtttggcggcggcgagaattgattttgacagaattgagtttgagagaattgattttaattaaaagtgagttgattgtgaattgatttatg 41289115  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| |||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41289116 tttggatacactttactaaaagtgattcttataggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 41289190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44926967 - 44926818
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||    
T  44926967 agaattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtg 44926869  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44926868 attcttatgagttgatgttatttggatagtttgaatcaaaattaattttga 44926818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26243274 - 26243129
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26243274 gtgtgtttggtatagcggcagtgagaattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgt 26243175  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgttt 189  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26243174 ttggatataattgtttaaaagtgattcttatgagttggtgatgttt 26243129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 440142 - 440321
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    |||||||||||||||||    ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||    
T  440142 cttagtgtgtgtttggttggacggcggagataattgattttgatagaattgagtctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgat 440241  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  440242 ttatgtttggatacattcagttaaaaatgattcttatgagttaacgttgtttggatagattgaatcaaaactgattttga 440321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 40742260 - 40742432
Alignment:
Q  50 ttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  40742260 ttggtatagcgacggtgagaattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgattttcgttaaaagtgagtttgatctgaattgatttatgtttggat 40742359  T
Q  150 atactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    | ||| |  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40742360 acactaa--tgtaagtgattcttatgagttgatgatgtttggatattttaaatcaaaattgattttaaatgtgta 40742432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38114599 - 38114422
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | |||||| |    
T  38114599 ttagtgtgtgtttggtttggcggtggtgagaatttattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttggatgtgaattga-t 38114501  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||||||    
T  38114500 tatgtttggatacactcggtttcaagtgattcttatgagttgaggttgtttgaatatttcgaacaaaaattgattttga 38114422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15206850 - 15206673
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  15206850 tagtgtgtgtttggttcagtggtggagagaattaattttgatagaattgagtttgacaaaattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtgaattgattt 15206751  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15206750 atgtttggatacattgacttagaagtgattcttaaaaattcatgttgtttggatagtttggcccaaaattgattttga 15206673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 24897547 - 24897710
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||    
T  24897547 gtgtgtttggtatggcggcggtaagaattgattttgataaaattgagtttatgagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaa-tgaattatgt 24897645  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaat 208  Q
    ||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24897646 ttggatacatttatttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaat 24897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42149117 - 42148982
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  42149117 agaattgattctgatataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatagacttatttaaaagtgattcgtatgagttga 42149018  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42149017 tgttgtttagataatttgaatcaaaattgattttga 42148982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43550991 - 43550861
Alignment:
Q  94 gagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggat 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43550991 gagaaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggat 43550892  T
Q  194 agtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43550891 aatttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 43550861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40742236 - 40742094
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||    
T  40742236 agaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttga 40742137  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    | ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  40742136 tattgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgta 40742094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35615861 - 35615686
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||||| |||   |||||||||||    
T  35615861 gtgtctgtttggttcagcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgacaagattgattttggaaagaagtgagttgaatgggaattgatttat 35615762  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| |||| | |||||||||| |||||| ||    ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35615761 gtttagatacattcacttaaaattgattcctaaatattcttgttgtttggatagtttggctcaaaattgattttga 35615686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 31246273 - 31246445
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  31246273 tgtgtgtttggttctgcggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatg 31246372  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||   | |   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  31246373 tttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgatttt 31246445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Original strand, 30081635 - 30081780
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||  || ||  |||||  ||    
T  30081635 aattgattttgataaaattgattttgtgaaaattgattttagttaaaagtgag-ttaaagtgaattgatttatgtttggataagctgacacaaaagcaat 30081733  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30081734 tcttatgggctgatgttgtttggatagtttgtttcaaaattgatttt 30081780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 30085596 - 30085674
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30085596 gtgtgtgtttggtatagcggcggtgagaattgattttgatataattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtga 30085674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11126651 - 11126494
Alignment:
Q  59 cggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcact 158  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  11126651 cggtgatgagaattgattttgttagaatttatttcgagagaattgattttagttaaaagaaagttgatcatagattgatttatgtttggatacacttata 11126552  T
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
     | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11126551 aataagtgattttcatgagtttgtgttgtttggatagtttgaatcaaaattgagtttg 11126494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29023378 - 29023216
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                | || ||||| ||    
T  29023378 ttagtgtgtgttcggtatggtggtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttg----------------agatgaattggtt 29023295  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||| |||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023294 tatatttggatacacttgtttaaaattgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 29023216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 36121502 - 36121609
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||    
T  36121502 gtgtgtgtttggtacagcggtgtcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaataga-ttat 36121600  T
Q  142 gtttggata 150  Q
    |||||||||    
T  36121601 gtttggata 36121609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 34342873 - 34342984
Alignment:
Q  104 attttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatc 203  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34342873 attttggttaaaagtgagtaga-tatgaattgatttttgtttggataaatttatttaaaagtgattcttat-agtggatgttgtttggataatttgaatc 34342970  T
Q  204 aaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||    
T  34342971 aaaattgattttga 34342984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Original strand, 30759259 - 30759363
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||    
T  30759259 ttagtgtgtgtttggtttggcgatgggaagaattgattttaatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatt 30759358  T
Q  139 tatgt 143  Q
    |||||    
T  30759359 tatgt 30759363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 45147247 - 45147382
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||| |||  |||||   ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45147247 agaattgattttgatagaatcgaatttggttaaaagtgagttgaatgcaaatttggttatgtttggacactctcatttaaaagtgattcttataagttga 45147346  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  45147347 tattgtttgaataacttgaatcaaaattgattttga 45147382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Original strand, 3619053 - 3619198
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| || | ||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||| | | |  | ||||||||    
T  3619053 aattgattttgatagaattgattttgaatgaattgattctgatcaaaagtgagttgagtg-aaattgatttgtgtttggatacattaatatgaaagtgat 3619151  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3619152 tcttatcaatgtatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 3619198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25497845 - 25497717
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtgg-tgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||    
T  25497845 agtgtgtgtttggtatggccgagggtaagaattgattttgataaaattgagtttaggagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattga-tt 25497747  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgatt 169  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  25497746 atgtttggatacacttatttaaaagtgatt 25497717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41981192 - 41981136
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41981192 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatactttgaatcaaaattgatttt 41981136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Original strand, 37458313 - 37458435
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagt---tgatgt--tgtttggat 193  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | |   ||||||  |||||||||    
T  37458313 aattgattttggtaaaaa-tgtgttgaagctaaattgatttatgtttggatatattgacataaaagtgattcttatcaattcatgatgtgatgtttggat 37458411  T
Q  194 agtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37458412 agtttgaatcaaaattgattttga 37458435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26125634 - 26125542
Alignment:
Q  132 attgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26125634 attgatttatgtttggatacactaatgtaaaaatgattcttatgagttgataatgtttggacggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgta 26125542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26125910 - 26125842
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttg 109  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26125910 agtgtgtctttggtacagcggtggtgagaattaattttgatagaattgagtttaagagaattgattttg 26125842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 3465396 - 3465478
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    ||||||||||||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  3465396 agtgtgtgtttggttctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 3465478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16915175 - 16915031
Alignment:
Q  76 tttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatg 175  Q
    |||||||||||||| | || || |||||||||| || ||| |||||||| |   ||||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  16915175 tttgatagaattgattctgggagaattgattttagt-aaacgtgagtttgacg-aaattgattt--gtttggatacaccaacataaaagtgattcttatg 16915080  T
Q  176 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16915079 agttaatgatgtttggttggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgta 16915031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29970926 - 29970846
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  29970926 aattgattttgatagaattgaatttgt-ataattgattttagttaaaagtgagttgagtttaaagtgatttatgtttggata 29970846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Original strand, 8702392 - 8702531
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| ||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||| | |  | | ||||||||    
T  8702392 aattgattttgatagaattgactttagcaaaattgattttagttaaaaatgatttgaagataa-ttgatttatgtttggatacattatccttaaagtgat 8702490  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    |||||| | || ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8702491 tcttatcaattcatgttgtttggatagcttgggtcaaaatt 8702531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20190236 - 20190186
Alignment:
Q  97 ataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20190236 ataattgattttggttaaaagtgagtttaagataaaatgatttatgtttgg 20190186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23018209 - 23018099
Alignment:
Q  81 tagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttg 180  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||| | |||    
T  23018209 tagaattgagtttgatcgaattgattttgatcaaaagtgagttgagtataaatttatttatgtttggatacacgaatgcaaaagtgattcttattaattg 23018110  T
Q  181 atgttgtttgg 191  Q
    || ||||||||    
T  23018109 attttgtttgg 23018099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36779539 - 36779434
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||    
T  36779539 tgtgtttggttgtgcggtgacgagaattgattttgatataattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaagtaatttatgtt 36779441  T
Q  145 tggatat 151  Q
    |||||||    
T  36779440 tggatat 36779434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39219816 - 39219758
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcac 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  39219816 aattgattttcgttaaaagtgagtttaatatgaagtgatttatgtttggatatcctcac 39219758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26491085 - 26490977
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||   |||||||||| ||  | |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  26491085 gtgtgtgtttggtgtggcggtgactagaattgattctgtcaaaattgattttggtagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtaaattgatttgt 26490986  T
Q  142 gtttggata 150  Q
    |||||||||    
T  26490985 gtttggata 26490977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19649281 - 19649230
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  19649281 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 19649230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 145
Target Start/End: Original strand, 10552923 - 10552969
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10552923 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgttt 10552969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14382285 - 14382178
Alignment:
Q  101 ttgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttga 200  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| | |  | | |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||     
T  14382285 ttgattttagttaaaagtgatttgaacataa-ttgatttatgtttggatacattatccttaaagtgattcttatcaattcatgttatttggatagtttgg 14382187  T
Q  201 atcaaaatt 209  Q
     ||||||||    
T  14382186 gtcaaaatt 14382178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 169
Target Start/End: Original strand, 40792188 - 40792287
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||| |||| ||||| | || || |||||||    
T  40792188 aattgattttaataaaattgattttgatataattgattttgattaaaagtgagttgaat-gcaattgatttatatttgaatatatttacatagaagtgat 40792286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 22552724 - 22552871
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |   |||||||||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||  | |    ||||||||||    
T  22552724 aattgattttgacataattgattttaattgaattgattttggataaaagtgagttgatggaaaattgatttatgtttggatgcattattgtaaaagtgat 22552823  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    | |||| | || |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  22552824 tattatcaattcatgttgtttggatactttcaactaaaattgattttg 22552871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 24297547 - 24297721
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||   |||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||    | ||||||||||| | |  ||||| ||||    
T  24297547 tagtgtgtgtttggttctgcggtgataaaaattaattttgatagaattgattttgaatgaattgattcgaatcaaaagtgagttgagtg-aaattaattt 24297645  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    || |||||||  | | |  | |||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24297646 atatttggatgcattaatatgaaagtgattcttagtaatgcatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 24297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26243103 - 26243068
Alignment:
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243103 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 26243068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33588815 - 33588764
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  33588815 aattgattttgattaaaagtgagtttaatgtaaaattatttatgtttggata 33588764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 35550372 - 35550266
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||| | | ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||  | ||||||||||||| | |||| |||||| |    
T  35550372 gtgtgtgtttgattttgcggtggcgaaaattgattttgattgaattgattttg-taaaattgatttttatcaaaagtgagtttagtgtaaagtgattttt 35550274  T
Q  142 gtttggat 149  Q
    ||||||||    
T  35550273 gtttggat 35550266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35239608 - 35239546
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  35239608 aattgattttgataaaattgattttggttaaaagtgaattgaatataaaataatttatgtttg 35239546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Original strand, 37667057 - 37667129
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcac 157  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37667057 aattgattttgatagaattgattttcgttaaaa-taagtttaatgtgaattgatttatatttggatatactcac 37667129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 86
Target Start/End: Original strand, 45147218 - 45147266
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaat 86  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45147218 cttagtgtgtgtttggttcggcggcggtgagaattgattttgatagaat 45147266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 216
Target Start/End: Original strand, 41891915 - 41891950
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41891915 atgttgtttggacagtttgaatcaaaattgattttg 41891950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31201750 - 31201649
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||    
T  31201750 aattgagttttataaaattgagtttgacagaattgattttaattaaaagcga-attaagatgaattgatttatgtttggattcatttgcttaaaagtgat 31201652  T
Q  169 tct 171  Q
    |||    
T  31201651 tct 31201649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 12124716 - 12124796
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||  ||| | |||||||||||||||    
T  12124716 aattgattttgtttgaattgatttt-agataattgatttcgattaatagtgagttgaatgaaaagttatttatgtttggata 12124796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26125855 - 26125826
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttga 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125855 gagaattgattttgatagaattgagtttga 26125826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Original strand, 2071537 - 2071593
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttga 95  Q
    ||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2071537 ttagtgtgtgtttggttctgcggcgatgagaattgattttgacagaattgattttga 2071593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26575930 - 26575890
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26575930 agaattgattctgatagaattgattttgagagaattgattt 26575890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Original strand, 33898960 - 33899144
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33898960 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgattt 33899059  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33899060 atgtttggatacactaatgtaaaagtgattcttatgagttaataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgta 33899144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13739350 - 13739175
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||    
T  13739350 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-tta 13739252  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13739251 tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 13739175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13744850 - 13744675
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||    
T  13744850 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-tta 13744752  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13744751 tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 13744675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10826235 - 10826062
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |    
T  10826235 gtgtgtgtttggtttggcggcggtgagaattaattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatttgaattgattttt 10826136  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10826135 gtttggatatacttatttaaaagtgattcttatgagttgattttgtttggatagtttgaatcaaaattaatttt 10826062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 6208019 - 6208194
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  6208019 agtgtgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgattttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattga-tta 6208117  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6208118 tgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagatagtttgaatcaaaattaattttga 6208194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 17829957 - 17830137
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  17829957 gtgtgtttggtatagctgtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgt 17830056  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    || | || | |   ||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17830057 ttagttacagtttattagaagtcgttcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 17830137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 29409205 - 29409383
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  29409205 ttagtgtgtttttggtatgacggtggcgaaaattgattttaatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatt 29409304  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| | |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29409305 tatgtttggatacagttttttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 29409383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 1312395 - 1312571
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  1312395 agtgtgtgtttggttcagcggtggagaaaattgattttgatagaatcgagtttgataaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgcgaattgattta 1312494  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| ||||| | | ||||| || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1312495 tgttcggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttgtttggatagtttgacccaaaattgattttga 1312571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31132580 - 31132433
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  || | ||||  || || |||||||| ||| | |||||||||||    
T  31132580 aattgattttgatagaattgagtttgagataatttattttggctaaaaatgagttggatgttaattcgtt-atttttggatacacttatttaaaagtgat 31132482  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132481 tcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 31132433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Original strand, 16442347 - 16442489
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16442347 agaattgattttgagagaattgattttagttacaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttga 16442446  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16442447 tattgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgta 16442489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 21254833 - 21255010
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  21254833 ttagtgtgtgtttggttccacggtggtgataattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgaatttgattaaaagtgagttgaatgt-aattgatt 21254931  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| | | || ||||| |||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21254932 tatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttcggtagtttgaatcaaaattgcttttga 21255010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16548226 - 16548101
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  16548226 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagttt 16548127  T
Q  199 gaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16548126 gaatcaaaattgattttgaatgtgta 16548101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 699684 - 699527
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcac 157  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  |||       
T  699684 gcggtggagggaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagtt-aaagtgagttggataagaattgatttatgtttggatgcacttta 699586  T
Q  158 ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  699585 ctaaaagtaattcttataagttaatgttg-ttggatagtttgaatcaaaatcgattttga 699527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Original strand, 5584001 - 5584180
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  5584001 tcttagtgtgtgttaggttctgcggtgacgagaattgattttgatagaattgattttgacagaattgattttgactaaaagtgagtttaatgt-aattga 5584099  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||||||| | |  || |||||||| |||  | || | |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  5584100 tttatgtttggatatatttatatagaagtgatttttaccaattcaagttgtttggataatttaaatcaaaatagcttttga 5584180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21456031 - 21455844
Alignment:
Q  35 tctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaatt 134  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||  || | |||     
T  21456031 tctcttagtgtatgtttagtttaacggtgacgggaattgattttgatataattgagtttgtaagaattgattttagttaaaagtaagttggatgtgaatc 21455932  T
Q  135 gatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
     |||  |||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  21455931 aattg-tgtttgtatacactta-ttaaaagtgattctcatgagttaatgttgtttgcatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgta 21455844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 16121960 - 16122133
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || | | ||| ||||||| |||    
T  16121960 gtgtctttggtatggcggtggttataattgattttgataaaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgatttgagtgtaagttgatttgtgt 16122059  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||| |||   | |  || ||||||||||||| | || || ||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  16122060 ttgaatacctttatgtataagtgattcttattaatttattttgtttggatagttgagatcaaaattgcttttga 16122133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 15151461 - 15151543
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    ||||||||||||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  15151461 agtgtgtgtttggttctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 15151543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Original strand, 29399750 - 29399819
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggt 111  Q
    |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29399750 gtgtatgtttggtttggcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgatagaattgattttggt 29399819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 123
Target Start/End: Original strand, 32599439 - 32599500
Alignment:
Q  62 tggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32599439 tggtgagaattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttgattaaaagtgagtt 32599500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7215722 - 7215546
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||   | | |||||||| ||||||||||| ||  |  | |||  |    
T  7215722 tcttagtgtatgtttagtttaacggtgatcagaattgattttgatataattgagtttttaagacttgattttagttaaaagtgaattggacgtgaatcaa 7215623  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    || ||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  7215622 tt-atgtttgtatacactta-ttaaaagtgattctcatgagttaatgttgtttgcataaattgaatcaaaattaatttt 7215546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 26274578 - 26274665
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    |||||||||||||||||||   ||||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  26274578 ctcttagtgtgtgtttggttctgcggcaacgagaattgattttgatagaattgattttgacataattgattctgactaaaagtgagtt 26274665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 148
Target Start/End: Original strand, 3605736 - 3605814
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgga 148  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||    
T  3605736 aattgattttgatataattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtgagttgagtgaaaagtgatttatgtttgga 3605814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 148
Target Start/End: Original strand, 8551077 - 8551155
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgga 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||    
T  8551077 aattgattttgatagaattga-ttccatataattgattctgattaaaagtgagttgagtgaaaagtgatttatgtttgga 8551155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16548255 - 16548216
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttg 79  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16548255 tagtgtgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttg 16548216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1500072 - 1499996
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  1500072 aattgattttgactgaattgattttgtaa-aattgattttggctaaaagcgagttgagtgtaaattgatttatgtttg 1499996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32140727 - 32140686
Alignment:
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32140727 ttgtttggataatttgaatcaaaattgcttttgtgtgtgtat 32140686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 882842 - 882778
Alignment:
Q  86 ttgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  882842 ttgagtttgagtgaattgattctagttaaaattgagttgaaggtaaaatgatttatgtttggata 882778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 3622399 - 3622586
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||    
T  3622399 tcttagtgtgtgtttgttatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattga 3622498  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  3622499 tttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtataaatcaaaattgattttaaatgtgta 3622586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48459876 - 48459693
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  48459876 agtgtgtgtttggtatgacgttggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 48459777  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  48459776 tgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgaatggatgttgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgta 48459693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37562739 - 37562561
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||    
T  37562739 cttagtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgat 37562640  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37562639 ttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttg 37562561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37639597 - 37639413
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  37639597 tagtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaattgaatgtgaattgattt 37639498  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||| | |||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  37639497 atgtttggagaaactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgta 37639413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3342955 - 3342780
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3342955 gtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttggatatgaattgatttat 3342856  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3342855 gtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 3342780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 10371900 - 10372077
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  10371900 tagtgtgtgtttggtaaaacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattt 10371999  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| || | |   ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10372000 atgtttggttacagtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattgattttga 10372077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34010504 - 34010330
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |    
T  34010504 agtgtgtgtttggt-tggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaactgatt-a 34010407  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34010406 tgtttgaatacactcatttaaaagtggttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 34010330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3375657 - 3375475
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||| |||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  3375657 tagtatgtgtttggtacggtgatggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgattt 3375558  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3375557 gtgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtcgatgttgtttggatgatttggatcaaaattgattttgaatgtg 3375475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9456268 - 9456095
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  9456268 tgtgtctttggtacggcggtagtgagaattgattttgatagaattaagttcgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtaaattgatt-atg 9456170  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456169 tttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatcttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 9456095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Original strand, 12632031 - 12632209
Alignment:
Q  46 gtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgttt 145  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  12632031 gtgtttggtttcgcggtggagagaattgattttgatagaattttgtttgagagaatagattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgttt 12632130  T
Q  146 ggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12632131 gagtgtactcgcttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaattgtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 12632209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Original strand, 43631642 - 43631810
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  43631642 gtgtgtttggtatggcggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-ttatgt 43631740  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43631741 ttggatatgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatatattgaatcaaaattgatt 43631810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 47217487 - 47217660
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47217487 gtgtgtttggttcggcggcggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgt 47217586  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47217587 ttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 47217660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Original strand, 44967349 - 44967525
Alignment:
Q  48 gtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||     
T  44967349 gtttggtatgacggtagcgagaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttga 44967448  T
Q  148 atatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44967449 atacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgagtttgta 44967525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41715822 - 41715643
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  41715822 gtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttat 41715723  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  41715722 gtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttgggtgt 41715643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Original strand, 43737881 - 43738063
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  43737881 tagtgtgtgtttagtatggcgacggtgagaattgattttaacataattgagtttaagagaattgattttgattaaaagttagttagatatgaattgattt 43737980  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
     |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43737981 ttgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 43738063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38230232 - 38230051
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  38230232 tgtgtgtttggtatggcggccgagagaattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatg 38230133  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||| | |   ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38230132 tttggatacattttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 38230051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 39391083 - 39391256
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  39391083 gtgtgtttggtatggcggtggcgaaaattgattttgatagaattgatttttttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgt 39391182  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39391183 ttggatacactttcttacaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 39391256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 386428 - 386597
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||    
T  386428 tgtgtttggtttggcggtggttaaaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagttagctgaatgtgaattgatttatgtt 386527  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  386528 tggatatactaaccgaaaagtgattcttatga-ttgatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42740521 - 42740375
Alignment:
Q  78 tgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgag 177  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  42740521 tgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgttaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtg 42740422  T
Q  178 ttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  42740421 ttgatattgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgta 42740375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 34010901 - 34011081
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttt-aatataaattga 136  Q
    |||||| |||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |    
T  34010901 cttagtatgtgtttggtttggcagcggtgataattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaagtgagtttgagtgtaaattaa 34010999  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgttt-ggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||    
T  34011000 tttatgtttggaaacattcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggggtactttaaatcaaaattgattttga 34011081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 34365924 - 34366100
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||    
T  34365924 tagtgtgtgtttggtatggcggtggctagaattgattttgatataatggagtttgaaagaattgattttagttaaaagttagttgggtgtgaattgattt 34366023  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34366024 atgtttggatacgctta-ttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttga 34366100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32187106 - 32186926
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  32187106 agtgtatgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattaattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgattta 32187007  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  32187006 tgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttgggtgt 32186926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48134742 - 48134563
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |    |||||||| ||||    
T  48134742 gtgtgtttggtatggcggttgcgaaaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgggtttgaggagaattgatt-atgt 48134644  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||| |||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48134643 ttggataaacttgtttaaaagtgatttttataagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 48134563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46541762 - 46541593
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  46541762 tgtgtttggtttggcggtggttaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagttgaatgtgaattggtttatgtt 46541663  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||  |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46541662 tgagtatattcaccgaaaagtgattcttatga-ttgatattgttttgatagattgaatcaaaattgatttt 46541593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39977719 - 39977544
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39977719 tagtgtgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaatttagtttgaaagaattgattttagtcaaaagtgagtttgatatgaattgattt 39977620  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    || |||||||| |||||  ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  39977619 atttttggataaactcatataaaagttattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgatttt 39977544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47022082 - 47021904
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  47022082 gtgtgtttggtatgatggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaaagtgaattgatttatgt 47021983  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
    ||||||| |||    || | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47021982 ttggatacactttactagatgtgattcttacgaattgatgttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtg 47021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Original strand, 36920143 - 36920293
Alignment:
Q  63 ggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaa 162  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||   | | |||||    
T  36920143 ggtgagaattaattttgataaaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattgatttatgtttgaatacgtttaattaaa 36920242  T
Q  163 agtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36920243 ggtgattcttttgagttgatgttgtttgggtacattgaatcaaaattgatt 36920293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 24770854 - 24771026
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||| |||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  24770854 agtgtgcgtttggtatgacggtgacgagaattaattttgatagaattaagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttggatgtaaattgattta 24770953  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
    | ||| |||||||  |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  24770954 tatttagatatacaaaactaaaagtgatttttatcaatttatgttgtttggataatttttgtcaaaattgatt 24771026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Original strand, 39634104 - 39634284
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39634104 tcttagtgtgtgtttggttctgcggtggagagaattgatttggacagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 39634203  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||   | |   ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  39634204 tttatgtttggataacttaaaacaaaagtgattcttataaattcttgttgtttggataacttggatcaaaattgattttga 39634284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3750827 - 3750678
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagt 165  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||    || || |    
T  3750827 gagaatagattttaataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatataatt 3750728  T
Q  166 gattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3750727 gaatcttatgaattgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattaatttt 3750678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42904719 - 42904551
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  42904719 agtgtgtgtttggtatggcagtgggaaaaatgaattttgatagaattgagtttgagagaattgtttttggataaaaatgagttagatgtgaattgattta 42904620  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  42904619 tgttttgatacactcgtttaaaagtgattcttatgaattaattttgtttgtatattttaaatcaaaatt 42904551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32206044 - 32205919
Alignment:
Q  88 gagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgt 187  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32206044 gagtttgaaagaattgattttaattaaaagtgggtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgagtt-atgttgt 32205946  T
Q  188 ttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  32205945 tt-gatagtatgaatcaaaattgatttt 32205919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Original strand, 37008296 - 37008447
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||||||    
T  37008296 agtgtgtgtttggtat--cggtggcgaaaactgatttttatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtga-ttgattta 37008392  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 195  Q
    |||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37008393 tgtttggagacactttcttataagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 37008447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1766550 - 1766408
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||   | || |||||||||||||||| | ||||    
T  1766550 agaattgattttgattaaattgattttgattaaaagtgagttgaacctaaattgatttatatttggataccttaacataaaagtgattcttatcaattga 1766451  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    || |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1766450 tgatgtttgaataatttgaattaaaattgattttgagtgtgta 1766408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 42752131 - 42752310
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  42752131 cttagtgtgtgtttggttctgcggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgat 42752230  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||||   | |   |||| | |||||||| | || ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  42752231 ttatgtttggataccttaaagcaaaaataattcttataaattcatgttgtttggataacttagatcaaaattgattttga 42752310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 216
Target Start/End: Original strand, 40903112 - 40903285
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| |  | |||| || |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||| |||||    
T  40903112 gtgtgtgtttggttttccagtggcgaaaattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagttgaacttaa-ttggtttat 40903210  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40903211 gtttggatatattaaagtaaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttg 40903285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12964736 - 12964659
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  12964736 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttcgttataagtgagttgaatgtagattgatttatgtttg 12964659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19097562 - 19097483
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgag 121  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  19097562 gtgtgtgtttggtatggcggcggtgagaattaattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgag 19097483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19096005 - 19095927
Alignment:
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19096005 ttatgtttggatacactcgtttaaaaatgattcttatgagtt-atgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 19095927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 217
Target Start/End: Original strand, 47301622 - 47301676
Alignment:
Q  163 agtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47301622 agtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 47301676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33746497 - 33746398
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||  ||||||||||| | || || |||||||||||||||    
T  33746497 aattgattttgattaaaagtgagttgaatataaattgatttttgtttggttacattaacttaaccgtgattcttataaattcattttgtttggatagttt 33746398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20089018 - 20088929
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgag-ataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  20089018 gcggtggaaagaattgattttgatagaattga-tttaagtataattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 20088929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44274748 - 44274698
Alignment:
Q  97 ataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44274748 ataattgattttggttaaaagtgagtttaagataaaatgatttatgtttgg 44274698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4228684 - 4228604
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  4228684 aattgattttggttgaattgatttt-acataattgattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtgatttatgtttggata 4228604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 119
Target Start/End: Original strand, 12212438 - 12212490
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  12212438 agaattgattttgatagaattgagcttgagtgaattgattttggttagaagtg 12212490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 46285312 - 46285458
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || |||||| ||| || | |  ||||| ||||||||||||||| | | |  | ||||||||    
T  46285312 aattgattttgatataattgattttgaattaattgattctgattaaaaatgaattgagt-gaaattaatttatgtttggatacattaatatgaaagtgat 46285410  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||||  | |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46285411 tcttagcaatatatgatgtttggatagtttgaattaagattgattttg 46285458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 215
Target Start/End: Original strand, 37886854 - 37886887
Alignment:
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37886854 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 37886887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2839428 - 2839289
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | | | | |||||||||    
T  2839428 aattgattatgattgaattgattttgatagaatagatttttatgaaaagtgagttgaac-taaattgatttatgtttggattcattaagtcaaaagtgat 2839330  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    |||| | | || |  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2839329 tcttgttaatttaaattgtttggatactttgagtcaaaatt 2839289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16353589 - 16353483
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggtt-aaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||   ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||| | | ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16353589 tgtgtttggttctgcggtggagataattgattctgatagaattgattttgc-agaattgatttttgatgaaaagtgagtttaatctaaagtggtttatgt 16353491  T
Q  144 ttggatat 151  Q
    ||| ||||    
T  16353490 ttgaatat 16353483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43581682 - 43581627
Alignment:
Q  160 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43581682 aaaagtgattataattaattgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgctttt 43581627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12306868 - 12306818
Alignment:
Q  97 ataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12306868 ataattgattctggctaaaagtgagttgaagataaagtgatttatgtttgg 12306818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16079510 - 16079460
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  16079510 aattgattttggtttaaagtgagttgaatgaaaagtgatttatgtttggat 16079460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 109
Target Start/End: Original strand, 25472150 - 25472192
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  25472150 agaattgattttgatagaattgattttgacagaattgattttg 25472192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12964483 - 12964438
Alignment:
Q  160 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaa 205  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12964483 aaaagtaattattatgagttaatgttgtttggatagtttgagtcaa 12964438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20388732 - 20388679
Alignment:
Q  81 tagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaatt 134  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  20388732 tagaattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtataaatt 20388679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4035960 - 4035924
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4035960 atgttgtttggatagttttaatcaaaattgcttttga 4035924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15000576 - 15000536
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15000576 agaattgattctgacagaattgattttgagataattgattt 15000536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 25472165 - 25472205
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  25472165 agaattgattttgacagaattgattttgagagaattgattt 25472205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38494324 - 38494276
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||    
T  38494324 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaagtggtttatgtttgg 38494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45697748 - 45697670
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  45697748 aattgagtttgatagaattaaatttgagaaagttga-tttgataaaaagtgagttgaatttaaattga-ttatgtttggat 45697670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 29149258 - 29149437
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattg 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||    
T  29149258 ctcttagtgtgtatttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattg 29149357  T
Q  136 atttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149358 atttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 29149437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 9889290 - 9889466
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | |    
T  9889290 tagtatgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaattg-tat 9889388  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9889389 atgtttggatacactcacttgaaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 9889466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39636913 - 39636732
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  39636913 tgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgatttatg 39636814  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  39636813 tttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtatgaatcaaaattgattttaaatgtgta 39636732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14072631 - 14072450
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  14072631 gtgtgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgtttaaaagtgagttgaaggtaaattga-ttat 14072533  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||| |||    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14072532 gtttggatacactttaatagaagtgattctaatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 14072450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 43781477 - 43781650
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||    
T  43781477 tgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatg 43781575  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43781576 tttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 43781650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51923072 - 51922894
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  51923072 ttagtgtgtgtttggtatggcggcgacgagaattgattttgttagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatctgaattgatt 51922973  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| |||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51922972 tatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 51922894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16566437 - 16566252
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16566437 ttagtgtgtgtttggtatggcagcagggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 16566338  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16566337 tatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 16566252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28987150 - 28986977
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |    
T  28987150 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-t 28987052  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28987051 tatgtttgaatacactcactt--aagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 28986977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 6138577 - 6138749
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  6138577 gtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgaaataattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttat 6138676  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 214  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6138677 gtttggatacacttatttaaaaatgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattt 6138749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9893837 - 9893665
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  9893837 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgatttttgtcaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtt 9893738  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9893737 tggatacacccacttgaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttaaattaaaattgattttga 9893665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 217
Target Start/End: Original strand, 14564094 - 14564278
Alignment:
Q  33 aatctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaa 132  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  14564094 aatcacttagtgtgtgtttggttgggcggcggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaa 14564193  T
Q  133 ttgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14564194 ttgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgattttga 14564278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15603495 - 15603314
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattg 135  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||||    
T  15603495 ctctaagtgtgtgtttggtttgacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattatggtaaaaagtgagtttgatgtgaattg 15603396  T
Q  136 atttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  15603395 atttgtgtttagatatacttgcttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaagtcaaaattgattttga 15603314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Original strand, 46830025 - 46830210
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  46830025 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 46830124  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  46830125 tgtttggatacactttcttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatattctacatcaaaattgattttaaatgtgtatt 46830210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 32238015 - 32238190
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||    
T  32238015 agtgtgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg-gtta 32238113  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32238114 tgtttggatacactatattagaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaactgattttga 32238190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 26426072 - 26426242
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26426072 gtgtgtgtttggtatgacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattga-ttat 26426170  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
    |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26426171 gtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 26426242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 26651805 - 26651980
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26651805 gtgtgtgtttggtatggcggcggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 26651904  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| |||| |||    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26651905 gtttagatacactttactaaaagtaattcttatgagtcgatgttatttggatagtttgaatcaaaattgattttga 26651980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 42944861 - 42945028
Alignment:
Q  48 gtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    ||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |    
T  42944861 gtttggtacggcggtggcaagaatttattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttag 42944960  T
Q  148 atatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42944961 atatacttacttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttggatagtatgtatcaaaattgatttt 42945028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 43772074 - 43772262
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattg 135  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||| |    
T  43772074 ctcttagtgtgtgtttggtttggtggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatcg 43772173  T
Q  136 atttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43772174 atttatgtttggatacacttttttagaagtgattcttacgagttgatgttgtttggataatatgaatcaaaattgattttaagtgtgta 43772262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 19592187 - 19592363
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||    
T  19592187 agtgtgtgtttgatatggcggtggggagaattgattttgatagaattgagttttagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgattta 19592286  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19592287 tgtttggatacactttactaaaagtgattcttacgaattgacgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttga 19592363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48550347 - 48550167
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  48550347 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgattta 48550248  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  48550247 tgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatattgtttggatagattggattaaaattgattttgggtgt 48550167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49136624 - 49136476
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49136624 aattgattctggtataattgagtttgagagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgat 49136525  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49136524 tcttatgagttgatgttgtttgaataattttaatcaaaattgattttga 49136476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49519863 - 49519677
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtg---agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||    
T  49519863 agtgtgtgtttggtatggcggtggtggtgagaattggttttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatttat 49519764  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  49519763 ttatgtttggatacacttgcttaaaaatgattcttatgaattgatattgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgta 49519677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30842258 - 30842086
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||| ||||||    
T  30842258 gtgtgtttggtatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatgt 30842160  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||| |||   || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30842159 ttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttga 30842086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13167655 - 13167481
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13167655 agtgtgtgtttggtatggcggtaggaaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 13167556  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13167555 tatttggatacacccatttaaaagtgattcttatgtattaatgatgtttggatagattgaatcaaaattgctttt 13167481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14076146 - 14075962
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  14076146 ttagtatgtgtttagtttggcggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaagtgagtttgatgtaaattgatt 14076048  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||| || |||| ||||||    
T  14076047 tatgtttggaaacatatacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgagtactttaaatcaaaattaatcttgaatgtgta 14075962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Original strand, 54735605 - 54735789
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||    
T  54735605 ttagtatgtgcttggtttggcggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaattgagtttgatgtaaattggtt 54735703  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  54735704 tatgtttggaaacatatacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgagtattttaaatcaaaattgatcttgaatgtgta 54735789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 4954050 - 4954190
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954050 aattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 4954149  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  4954150 ttgtttggataggttgaatcaaaattaattttaaatgtgta 4954190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54150658 - 54150482
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||    
T  54150658 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggcaagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatt 54150559  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    | |||||||||| |||   |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  54150558 tttgtttggatacacttcgttaaaaatgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgctttt 54150482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54153170 - 54152999
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  54153170 tgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttaatataattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatgtt 54153072  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    || ||| |||    || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54153071 tgaatacactttactagaagtgattctcatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 54152999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Original strand, 48407679 - 48407829
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||| |||   || |||||    
T  48407679 gagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatgtttggatacacttgtttgaaagt 48407777  T
Q  166 gattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48407778 gattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttga 48407829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6505333 - 6505155
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||  | |||| |  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  6505333 ttagtgtgtgtttggattggcggcgtcgataattgactttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatt 6505234  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6505233 tatgtttagatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttga 6505155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 13183010 - 13183182
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    ||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||    
T  13183010 tgtgtttggtatgacggtgacgataattgattttgataaaattgagtctgagataattgattttggttaaaagcaagtttaaggtgaattgatttatgtt 13183109  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13183110 tggatacacttatttaaaaatgatttttataagttgatgttttttggataatttaaatcaaaattgattttga 13183182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48908402 - 48908229
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||    
T  48908402 gtgtgtgtttggtttggcggcggtgaaaattgattttaatattattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattg-gttat 48908304  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48908303 gtttggata-cctcgcttaaaagtaattcatataagttgatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgattttga 48908229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39187866 - 39187704
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||    
T  39187866 ttagtgtgtgtttggtttggcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaatttgaatgtgaattgatt 39187767  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaa 201  Q
    |||||||||||| |||    || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39187766 tatgtttggatacactttactagaagtgattcttgttagttgatgttgtttgaataatttgaa 39187704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25312844 - 25312671
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||| |    
T  25312844 gtgtgtgtttggtttggcggtaacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgattttt 25312745  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25312744 gtttggatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgctttt 25312671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 31520328 - 31520509
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||   | | ||| |||||||    
T  31520328 gtgtgtgtttggtatagcgatggcgagaattgattttggtagaatgaagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgggtgtgaatggatttat 31520427  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  31520428 gtttagatatgctta-ttaaaagtgatttttatgagttgatgttttttgggtagtttgaataaaaattgattttaaatgtgta 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Original strand, 48550424 - 48550566
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||    
T  48550424 agaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataaactttaatagaagtgattcttatgagttga 48550523  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48550524 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 48550566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Original strand, 2175161 - 2175279
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2175161 aattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagttt 2175260  T
Q  199 gaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  2175261 gaattaaaattgattttga 2175279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46926160 - 46926010
Alignment:
Q  59 cggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcact 158  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  46926160 cggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtttggatacactcgtt 46926061  T
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||  ||| ||||||||||||||    
T  46926060 taaaagtgatttttatgaattaattttatttatatattttgaatcaaaatt 46926010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38264001 - 38263881
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38264001 aattgattttgatataattgagtttgagaaaattaattttgcttaaaattgagtttgatgtgaattaatttatgtttgaatatactcacttaaaagtgat 38263902  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttg 190  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  38263901 acttatgagtt-atgttgtttg 38263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Original strand, 55638736 - 55638834
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  55638736 gagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttaaatgtaaattgatttatgtttagatacacttatttaaaag 55638834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 53532109 - 53531924
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||  || ||    
T  53532109 ttagtatgtgtttggttcggcggtggtgagaattgattttgataaaattgagtttgacataattgattttagttaaaagtgagttggatgtaacgtggtt 53532010  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||| || |  ||  ||||||||||| ||||   |  ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  53532009 tatgtttggctacatgcaagtaaaagtgatttttatttatatatgttgtttgggtagttttgattaaaattgattttgaatgtgta 53531924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Original strand, 56241844 - 56241967
Alignment:
Q  94 gagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggat 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  56241844 gagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacattaatgtaaaagtgattcttatgagttgataatgtttagat 56241943  T
Q  194 agtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
      ||| ||||||||||||||||||    
T  56241944 gatttaaatcaaaattgattttga 56241967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Original strand, 45779970 - 45780095
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| ||||    
T  45779970 tgtgtttggtttggcggcgatgagaattgatttcgatagaattgagtttgaga-aattgattttggtaaaaagtgagtttggtatgaattaatttttgtt 45780068  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattct 171  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||    
T  45780069 tagatacattcacttaaaagtgattct 45780095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14054979 - 14054806
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||||  || |||  | ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||| || | ||||||||||||    
T  14054979 tgtgtgtttggtacggcagtgacgggaattgattttgacataattgagtttgaaagaattgagtttagtcaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatg 14054880  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||||||| ||| |  ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14054879 tttggataaacttatataaaagtgattatttcaagttgatgttgtttgaatactttaaattaaaattgattttg 14054806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Original strand, 19599487 - 19599625
Alignment:
Q  76 tttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatg 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||     
T  19599487 tttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatgcaattacttaaaattgattcttatc 19599585  T
Q  176 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  19599586 aatttatgttgtttgg-tatttagaatcaaaattgcttttg 19599625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38306141 - 38305965
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  38306141 agtgtgtgtttggttctacggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgcgaattgattta 38306042  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||   | |   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  38306041 tgtttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttga 38305965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15619703 - 15619579
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttga 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||| |||||||||||| | | || || ||||||||| | || |||||    
T  15619703 agaattgagtttgagagaattgattttggtaaaaagtgagttggatgtgaattgatgtatgtttggataca-ttac-tataagtgattcatgtgggttga 15619606  T
Q  182 tgttgtttggatagtttgaatcaaaat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15619605 tgttgtttggatagtttgaatcaaaat 15619579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54488735 - 54488561
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  54488735 agtgtgtgtttggttctgcggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 54488636  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||| |||   | |   ||||||||||||||| | || || |||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  54488635 tgtttgaataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcattttgtttggataacttggatcaaaattgatttt 54488561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Original strand, 30887168 - 30887292
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30887168 aatttattttagttaaacgtgagtttgatg-aaattgatttatgtttggatacaccaatataaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggatggttt 30887266  T
Q  199 gaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  30887267 gtatcaaaattgattttgaatgtgta 30887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 41866285 - 41866176
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  || | |||||||||    
T  41866285 tagtgtgtgtttggtttggcggtggcgataattgattttgataaaattgagtttgagggaattgagtttagttaaaagtgagttggatgtgaattgattt 41866186  T
Q  140 atgtttggat 149  Q
    ||||||||||    
T  41866185 atgtttggat 41866176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38694154 - 38694002
Alignment:
Q  65 tgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaag 164  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| | | |||||||||||  ||||||| |||| | |  |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38694154 tgagaattaattttgatatgattgagtttaaaagaattgattttgtctaaaagtaagttgagtgcaaattagtttatgtttggatacactcgcttaaaag 38694055  T
Q  165 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  38694054 tgattcttatgggttgatcttgcttgaataatttaaatcaaaattaattttga 38694002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33574283 - 33574197
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatata 152  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  33574283 gagaattatttttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaatata 33574197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 523280 - 523129
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||  ||| || | || |||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  523280 agtgtgtgtttggttcagctgttgagaaaattgattttgatttaattgagcttgacaaaattgattttgggaaaaagtgagttcaatatgaattgattta 523181  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagt 196  Q
    |||||||||    ||||||| || |||||||||  | ||  |||||||||||||||    
T  523180 tgtttggat----tcacttagaattgattcttaaaaattcttgttgtttggatagt 523129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36150693 - 36150624
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatat 151  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36150693 agaattgattttgatataattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatat 36150624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Original strand, 55638861 - 55638919
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  55638861 taaaagggattcttatgagttgatattgtttggataatatgaatcaaaattgattttga 55638919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 22694556 - 22694656
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgag-ataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||   |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22694556 gtgtgtttggttgtgcggtggaaagaattgattttggtagaattga-tttaagtagaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaagtgatttatg 22694654  T
Q  143 tt 144  Q
    ||    
T  22694655 tt 22694656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28752586 - 28752462
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    | || |||||||||||||||| | || ||| ||||  ||||||||    
T  28752586 aattgattttggttaaaagtgagttgac-ataatttgatttatgtttggatgccttaacataaaagtgattcttatcaattcatgatgttctgatagttt 28752488  T
Q  199 gaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  28752487 gaataaaaattatttttgaatgtgta 28752462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5025630 - 5025484
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcactta--aaagtg 166  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||| |||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||  ||| || |  |||||     
T  5025630 aattgattttgattgaattgattttgt-agaattgattttagttagaagtgagttgagcaaaaattgatttatgtttggatac-ctccctaacaaaagta 5025533  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||  ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5025532 atttatataaaat-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 5025484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 54487219 - 54487285
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  54487219 aattgagtttgatagaattgatttcgatcaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttggata 54487285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 14597579 - 14597754
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||   ||||||   | ||||||||||| | ||||||| ||| | |||| | |||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  14597579 ttagtgtgtgtttggttacgcggtgaaaataattgattttggttgaattgatttt-acataactaattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtgatt 14597677  T
Q  139 tatgtttggatat-actcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||||   | |  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  14597678 tatgtttggatatctttaagatagaagtgattcttatgag-agatgttgtttggatattttgtgtcaaaattgctttt 14597754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24512283 - 24512222
Alignment:
Q  91 tttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatata 152  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  24512283 tttgagagaattgattttgattaaaagtaagtttaaaataacttaatttatgtttggatata 24512222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 39000532 - 39000612
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39000532 aattgattttgattgaattgattttgt-agaattgagtttagttaaaagtgagcttaataaaaaatgatttatgtttggata 39000612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 4649911 - 4649967
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  4649911 agaattgattttgataaaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagcgagtt 4649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Original strand, 8683012 - 8683115
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatata--aattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    |||||||| ||| | |||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| | | || ||||||||    
T  8683012 aattgattgtgaaataattaattttgagaaaattgaatttggttaaaattgagtttaatgtaagaattaatttatgtttggatacattaacataaaagtg 8683111  T
Q  167 attc 170  Q
    ||||    
T  8683112 attc 8683115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16493014 - 16492884
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| | | ||  |||||||||| |||| | || |||    
T  16493014 aattgattttgaaataattgagtttgattaaaagtgagttgaatgtgaatttatttatgtttggataca-taacacaaaagtgatt-ttatcaatttatg 16492917  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    | ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  16492916 tcgtttggatagtttgtgtcaaagctgattttg 16492884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20232108 - 20232001
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttt-aatataaattgatttatgt 143  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| || |||||||    
T  20232108 tgtgtttggttatgcggtggtgagaattgattttggtggaattga-ttttataaaattgattttggttaaaagttagtttgaatgaaaagtgttttatgt 20232010  T
Q  144 ttggatata 152  Q
    || ||||||    
T  20232009 ttagatata 20232001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22699814 - 22699763
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22699814 aattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22699763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Original strand, 22980716 - 22980767
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22980716 aattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22980767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Original strand, 22994303 - 22994354
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22994303 aattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22994354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Original strand, 48550395 - 48550446
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattga 89  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48550395 cttagtgtgtgtttggtttggcggtgggaagaattgattttgatagaattga 48550446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48556683 - 48556616
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgatttt 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48556683 agtgtgcgtttggttcagcggtggaaataattgattttgatagaattgagtttgataaaattgatttt 48556616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 54655361 - 54655266
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||    
T  54655361 gtgtgtgtttggtacggcggtgacgataattgattttgacataattgagtttaaaataattgattttagtcaaaagtgtgtttgatgtgaattgat 54655266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48257115 - 48257057
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  48257115 taaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataaattggatcaaaattgattttga 48257057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 86
Target Start/End: Original strand, 26459852 - 26459897
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaat 86  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26459852 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattaattttgatagaat 26459897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40335706 - 40335641
Alignment:
Q  81 tagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  40335706 tagaattgattttgataaaattaattttggttaaaagtgaattaaatttaaagtgatttatgtttg 40335641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 28947763 - 28947811
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  28947763 aattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 28947811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 53914987 - 53914920
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  53914987 agaattgagtttcagagaatcgattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggata 53914920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2341500 - 2341449
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2341500 aattgatttcagtttaaagtgagtttaatataaaaagatttatgtttggata 2341449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8754217 - 8754155
Alignment:
Q  111 ttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttat 174  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  8754217 ttaaaagtgagttgaatgtaa-ttgatttatgtttggatacaatcacctaaaattgattcttat 8754155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46958110 - 46958047
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||    
T  46958110 aattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtaatttatgtttgg 46958047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 29778996 - 29779046
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  29778996 aattgattatggataaaagtgagttgaatataaagtgatttatctttggat 29779046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Original strand, 38740286 - 38740367
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  38740286 gaattgattttgaatgaattgattttgtaa-aattgattttggataaaagtgagttgaagttgaagtgatttatgtttggata 38740367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1616563 - 1616515
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  1616563 agaattgattttgatagaattgattttg-tagaattgattttggttaaaa 1616515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Original strand, 16202518 - 16202559
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  16202518 gaattgattttgatagaattgattttgataaaattgattttg 16202559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33843854 - 33843801
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatata 152  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  33843854 aattgattctggctaaaagtgagttggatgtaaagtgatttatgtttggatata 33843801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40286411 - 40286303
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||   |||||||  | ||||||||||||||||| ||| | | | | ||||||||||| |||||| |||||| | |  ||| |||||||    
T  40286411 agtgtgtgtttggttgtgcggtggacaaaattgattttgatagaactgattct-atagaattgattttgattaaaattgagttgagtgaaaaatgattta 40286313  T
Q  141 tgtttggata 150  Q
    ||||||||||    
T  40286312 tgtttggata 40286303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 52062992 - 52063041
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgga 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  52062992 aattgattttagttaaaagtgagtttaaggtaaaatgatttctgtttgga 52063041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54655262 - 54655205
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  54655262 taaaagtgattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgattttg 54655205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 16202532 - 16202572
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  16202532 agaattgattttgataaaattgattttgagagaattgattt 16202572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39993642 - 39993574
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  39993642 agaattgattttcatagaattgattttgattaaaaatgagttaaatgtgaattgatttatgtttagata 39993574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45106398 - 45106362
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45106398 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgattttga 45106362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 50523350 - 50523386
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  50523350 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttga 50523386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 7472629 - 7472803
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  7472629 gtgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattga-ttat 7472727  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472728 gtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 7472803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2213659 - 2213486
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  2213659 gtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 2213560  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2213559 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 2213486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Original strand, 9988454 - 9988638
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||    
T  9988454 tagtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgattt 9988553  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9988554 atgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgta 9988638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Original strand, 28127242 - 28127415
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28127242 gtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaatttagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 28127341  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28127342 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 28127415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 1944993 - 1945166
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  1944993 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 1945092  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 214  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1945093 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 1945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 39141419 - 39141599
Alignment:
Q  36 ctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattg 135  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  39141419 ctcttcgtgtgtgtttggttgggcggtggcgagaattgattttgatataattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaattg 39141518  T
Q  136 atttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39141519 att-atgtttggatacactcatttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 39141599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36312431 - 36312248
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||    
T  36312431 tagtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-tt 36312333  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36312332 atgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 36312248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 5916196 - 5916378
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  5916196 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-tta 5916294  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5916295 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 5916378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36548353 - 36548178
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||    
T  36548353 agtgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtctgatgtgaattgattta 36548254  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  36548253 tgtttggatactctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttaaattaaaattgattttga 36548178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 44619015 - 44619191
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||    
T  44619015 agtgtgtgtttgatataccgatggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggggaattgattta 44619114  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44619115 tgtttggatacacttgtttaaaaatgattattatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaatcgattttga 44619191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14821312 - 14821141
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14821312 tgtgtttggtatagcggtgacgataattaattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttagttaaaagtgagtttaatgtgaattga-ttatgtt 14821214  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14821213 tggatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttgaatcaaaattgattttga 14821141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32502137 - 32501966
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||    
T  32502137 tgtgtgtttggtatggcggtcgtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaattga-ttatg 32502039  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32502038 tttggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgatttt 32501966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 42515936 - 42516105
Alignment:
Q  47 tgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  42515936 tgtttggtatggcggtggagaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagtttgatgtgaattga-ttatgtttg 42516034  T
Q  147 gatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42516035 aatatactcattaaaaaatgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 42516105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8170466 - 8170291
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  8170466 agtgtgtgtttggtagggcggtggcgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-tta 8170368  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| ||      | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8170367 tgtttggatacacgttaacagatgtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 8170291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2215408 - 2215232
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||    
T  2215408 ttagtgtgtgtttggtatagcggttgtgagaattgattttgatagaattgagcttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt 2215309  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| |||   |||||| | ||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  2215308 tatgtttggatacacttgtttaaaaataat--ttttgagttgatgttgtttggataatttaaattagaattgattttga 2215232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Original strand, 31562640 - 31562821
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||    
T  31562640 tagtgcgtgtttggtatggtggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaatttgaggtgaattga-tt 31562738  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31562739 atgtttgg--acactcgtttaaaagtgattcttatgagtttatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 31562821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 25747837 - 25748011
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  25747837 gtgtgtgtttggttccgcggtggtgataattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgt-aattgatttat 25747935  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||| | | || ||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25747936 gtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttga 25748011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28261448 - 28261274
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||    
T  28261448 agtgtgtgtttgggtgggcggtggagagaattaattttaatacaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 28261349  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    | ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28261348 tatttggatactctcacatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattaatttt 28261274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3854056 - 3853871
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3854056 ttagtgtgtgtttggttgtgcggtagcgagaattgagtttgatggaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattgatt 3853957  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||| | |||  ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3853956 tatgtttggatacattcatgtaaaattgattcttatcaatctatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgcttttgaatgtgta 3853871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23358411 - 23358236
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || || |  ||||    
T  23358411 agtgtgtgtttggtatggtgttggcgagaattgattta-atagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaaatagttta 23358313  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23358312 tgtttggatacacttgtttaaaagtgattgtgatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 23358236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2213800 - 2213658
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |    
T  2213800 gtgtgtgtttggtatggcagatgagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttgt 2213701  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgt 184  Q
     |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2213700 ctttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgt 2213658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7296281 - 7296133
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  7296281 aattgactttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcatataaaagtgat 7296182  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | | |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7296181 tatcatgacttgatgttatttggatagtttaagtcaaaattgattttga 7296133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16467214 - 16467066
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||    
T  16467214 agaattgattttgatagaattgattttggcataattgattttggttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatatgataatgtaaaagtg 16467115  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16467114 attcttatgggttgatgtagtttggatagtttagatcaaaattaatttt 16467066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18511249 - 18511080
Alignment:
Q  48 gtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  18511249 gtttggttcagcggtggagagaattgattttgataaaattgattttgatataattgattttggttaaaagtgatttaaatgttaattgatttatgtttgg 18511150  T
Q  148 atatactcact-taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||| | ||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18511149 ataca-tcaatgtaaaaatgattcttataaagtgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgattttga 18511080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 42089480 - 42089652
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  42089480 ttagtgtgtgtttgatttggcggtgatgaaaattgattttgatagaattaagttcaagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 42089579  T
Q  139 tatgtttg----gatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaa 207  Q
    ||||||||    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  42089580 tatgtttggatagatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataaatcgaatcaaaa 42089652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 7295330 - 7295476
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||    
T  7295330 aattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattctggttaaaaatgagtttgacgtaaattgatttatgtttgg--atacacatataaaagtgat 7295427  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  7295428 tatcatgagttgatgttgtttggatagtttaagtcaaacttgattttga 7295476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Original strand, 26207884 - 26208057
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || | |||||||||||    
T  26207884 gtgtgtgtttggtatgacggtgacgaaaattgattttgatagaattaattttgagagaattggttttggttaaaagtcagttggatgtgaattgatttat 26207983  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||| |||| ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  26207984 gttttgatacacttaattaaaattgattcttacaagttgatgttgtttggattatatgaatcaaaattgatttt 26208057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31224833 - 31224690
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||| |||||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  31224833 gtgtgtatttggtttggcggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagttaaaagtgagttggatgtgaattgatttat 31224734  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgtt 185  Q
    ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31224733 gtttggatatattttactaaaagtgattcttatgagttgatgtt 31224690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28641799 - 28641613
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||  | |||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||    
T  28641799 cttagtgtgtgtttggtttggcgatggataaaattgattttaattgaattgattctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgat 28641700  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||| ||||| ||   ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  28641699 ttatatttgggtaacttcatttaaaagtgattattataagttgatgttgtttggatatgttgaattaaaattgattttaaatgtgta 28641613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 34433263 - 34433413
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  34433263 gtgtgtttggttcagcggtgaagagaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgt 34433362  T
Q  144 ttggatatact-cacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggat 193  Q
    ||||||| | |  | | ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  34433363 ttggatacaataaagtaaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggat 34433413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 147
Target Start/End: Original strand, 30007509 - 30007613
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  30007509 tgtgtgtatggtatggctgtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatg 30007608  T
Q  143 tttgg 147  Q
    |||||    
T  30007609 tttgg 30007613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27911517 - 27911386
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||    
T  27911517 aattgattttgatagaattgagtttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatatactcatttaaaagtgattatttcaagttgatg 27911418  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    || |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  27911417 ttatttggatactttaaattaaaattgatttt 27911386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Original strand, 41580691 - 41580773
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  41580691 gaattgattttgatcgaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattaatttatgtttggata 41580773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Original strand, 3602415 - 3602587
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||  ||| |||| ||||    
T  3602415 gtgtgtgtttggttctgcggtgatgaaaattgatttttactgaattgattttgatagaattgattttgtctaaaagtgagttgaacttaa-ttgaattat 3602513  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3602514 gtttggatatattaaaataaaagtgatttttattaattcatgttgtttggatagtttgaattaaaattgatttt 3602587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Original strand, 39106681 - 39106796
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || | ||||||| |||| |||    
T  39106681 aattgattttggtaaaaagtgagtttgatataaattgtttaatgtttggatacattcacttaaaagtgattc-tacgaatttaagttgtttagataattt 39106779  T
Q  199 gaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  39106780 gaatcaaaattgatttt 39106796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 221
Target Start/End: Original strand, 43436293 - 43436415
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43436293 aattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatttatgttttgatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagatt 43436392  T
Q  199 gaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    | || ||||||||||||| ||||    
T  43436393 ggattaaaattgattttgggtgt 43436415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Original strand, 45714648 - 45714766
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  45714648 agaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaaatgagttcgatgtgaattgatttatgtttggatacactccgttaaaaatg 45714747  T
Q  167 attcttatgagttgatgtt 185  Q
    ||| | |||| ||||||||    
T  45714748 attatcatgatttgatgtt 45714766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8041397 - 8041258
Alignment:
Q  76 tttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatg 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||  | | |||||||| | ||| ||||     
T  8041397 tttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgaattgaatgt-aattgatttatgtttggatgcaattacttaaaatttatttttatc 8041299  T
Q  176 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8041298 aatttatgttgtttgg-tagtttgaatcaaaattgtttttga 8041258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12111027 - 12110919
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12111027 agtgtgtgtttggttgtgcggtgacgaaaattgattttgatagaattgattttgtca-aattgattttggttaaaagtgagttgaatataaagtgattta 12110929  T
Q  141 tgtttggata 150  Q
    ||||||||||    
T  12110928 tgtttggata 12110919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 25940264 - 25940371
Alignment:
Q  110 gttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||   || |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25940264 gttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatatttgaatacactcgtatagaagtgattattatgagatgatgttgtttggacagtttgaatcaaaatt 25940363  T
Q  210 gattttga 217  Q
    ||||||||    
T  25940364 gattttga 25940371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 38600424 - 38600502
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38600424 gaattaattttgatcgaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttg 38600502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11240820 - 11240649
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  11240820 tgtgtttggttcagccgtggagagaattgattttgatttaattgggtttaacaaaattgattt-ggaaaaaagcgagttgaatgtgaattgatttatgtt 11240722  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    || ||| | ||||||| || |||||||||  | ||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11240721 tgaatacattcacttagaattgattcttaaaaattcttgttgtttggatagtttggctcataattgattttga 11240649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 18970272 - 18970416
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| |||  ||||   ||||||||||    
T  18970272 aattgattttgatagaattgagga--agataattgattttggttaaaagtgagttt-gcgtaaattgacttatgttttgatgcactcgtataaaagtgat 18970368  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
     ||||||| |||| || ||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  18970369 ccttatgacttgaagtagtttggatactttggattaaaattgtttttg 18970416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2234962 - 2234907
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2234962 taaaagtgattcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattaatttt 2234907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 123
Target Start/End: Original strand, 23267345 - 23267400
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  23267345 gaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 23267400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1763370 - 1763265
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  1763370 gtgtgtttggttgtgcggtgacgagaattgattttgataaaattgattttgtaa-aattgattttggttaaaattgagttgaatttaaagtgatttatgt 1763272  T
Q  144 ttggata 150  Q
    || ||||    
T  1763271 ttagata 1763265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 30599858 - 30599967
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||| | | | |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||     
T  30599858 agtgtatgtttggtttggcggtggttagaattgattctaacaaaattaattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtcaattgatttg 30599957  T
Q  141 tgtttggata 150  Q
    ||||||||||    
T  30599958 tgtttggata 30599967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 43858194 - 43858346
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||  ||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||  | |    | ||||||||    
T  43858194 aattgattttgatagaattgattttaattgaattgattttgggcaaaagtgagttgatgaataattgatttatgtttggatgcattattgtgaaagtgat 43858293  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  43858294 tcttatcaattcatattgtttggatagttttaactaaaattgattttgggtgt 43858346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Original strand, 23359942 - 23359993
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  23359942 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 23359993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 152
Target Start/End: Original strand, 34997194 - 34997301
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||| | || | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||  || | ||||||||||||||    
T  34997194 tgtgtttggtttggctgcggtgaaaattgattttgataaaatttagtttgacaaaattgatttttgttaaaaatgaattggatgtgaattgatttatgtt 34997293  T
Q  145 tggatata 152  Q
    || |||||    
T  34997294 tgaatata 34997301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23377600 - 23377549
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23377600 aattaattttggttaaaagtgagttgaatgtaagttgatttatgtttggata 23377549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10918699 - 10918649
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  10918699 aattgattttggataaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggat 10918649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 194
Target Start/End: Original strand, 42770406 - 42770503
Alignment:
Q  97 ataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatat-actcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggata 194  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||   | |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42770406 ataattcattttgattaaaagtgagttgaatgaaaattgatctatgtttggatatctttaagataaaagtgattcttatgag-agatgttgtttggata 42770503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 81
Target Start/End: Original strand, 43436264 - 43436305
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgat 81  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43436264 tagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgat 43436305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5055265 - 5055218
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  5055265 aattgattttggttaaaagtgagtttaacataaagtggtttgtgtttg 5055218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7474264 - 7474196
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  7474264 ttagtgtgtgtttggttcagctttggatagaattgattctgacagaattgattttgagagaattgattt 7474196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 69)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 43728835 - 43729010
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||| |    
T  43728835 agtgtgtgtttggtatagcgatggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatt-a 43728933  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43728934 tgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 43729010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48511077 - 48510894
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  48511077 agtgtgtgtttggtatggcggcggcgagaattgattttgattgaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 48510978  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  48510977 tgtttggatacacttgcttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgta 48510894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6166278 - 6166105
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||    
T  6166278 agtgtgtgtttggtatcgcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatctgaattga-tta 6166180  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6166179 tgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgatttt 6166105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 226
Target Start/End: Original strand, 42850176 - 42850361
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  42850176 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 42850275  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42850276 tgtttggatacacttccttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtatt 42850361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 35569156 - 35569335
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  35569156 cttagtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgat 35569255  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569256 ttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 35569335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1199996 - 1199820
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  1199996 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 1199897  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1199896 tgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 1199820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 7826311 - 7826494
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||    
T  7826311 agtgtgtgtttggtttggcggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagcttgatgtgaattgattta 7826410  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7826411 tgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 7826494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31223543 - 31223360
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  31223543 agtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 31223444  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31223443 tgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgta 31223360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 20800234 - 20800410
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  20800234 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 20800333  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20800334 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaatattgattttga 20800410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12468381 - 12468206
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12468381 tagtgtgtgtttggtatggcggcgggaagaattgattt-gatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgattt 12468283  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    || |||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12468282 atatttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 12468206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10470762 - 10470583
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10470762 tcttagtgtgtgtttggtagggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga 10470663  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||||||||||| ||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10470662 -ttatgtttggatacacgttaacagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 10470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25230173 - 25229993
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  25230173 tgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaactgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatg 25230075  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||| |||    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25230074 tttggatacactttaatagaagtgattcttattagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgagtgtgta 25229993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 11023289 - 11023460
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||    
T  11023289 tgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaattga-ttatg 11023387  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11023388 tttggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgatttt 11023460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12247592 - 12247413
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||| |    
T  12247592 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtgatgaaaattgattttaatagaattgagtttaagagaattgattctggttaaaagtgagttggatgtaaatt-a 12247494  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12247493 attatgtttggatacacttgtttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggagaatttgaatcaaaattgattttga 12247413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26058414 - 26058230
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||    
T  26058414 tcttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattga 26058315  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  26058314 tttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttgggtgt 26058230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5410806 - 5410633
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  5410806 tgtgtgtttggtttggcggcggcgagaattgattttgatataattgaatttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtaaattgatttatg 5410707  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5410706 tttgaatacact-acttaaaagtgattcttatgacttgatgttgtttggatagtttgaatcataattgattttga 5410633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13056168 - 13055991
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||    
T  13056168 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtgaattgatt 13056069  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| |||  || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13056068 tatgtttgaatacgctta-ttaaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttga 13055991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13931792 - 13931616
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||    
T  13931792 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggtggga-ttgattttgatagaattgagtttccaaaaattgattttgtttaaaaatgagtttgatgtgaattgatt 13931694  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13931693 -atgtttggatatactcacttaaacatgattcttacaagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 13931616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 50977297 - 50977479
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  50977297 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgtttta 50977396  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||  || | ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50977397 tgtttggatacgctta-ttacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgtgta 50977479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45710211 - 45710042
Alignment:
Q  47 tgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||||||    
T  45710211 tgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgtatgtgaattga-ttatgtttg 45710113  T
Q  147 gatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45710112 aatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 45710042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35536251 - 35536065
Alignment:
Q  30 gtgaatctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatat 129  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||| |  |    
T  35536251 gtgaatcatttagtgtgtgtttggtatggcggtgatgaaaattaattttaatagaattgagtttgagagaattaattttgattaaaagtgactttgacgt 35536152  T
Q  130 aaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35536151 gaattggtt-atgtttagatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 35536065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47123557 - 47123381
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||    
T  47123557 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggcaaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatt 47123458  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    | |||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  47123457 tttgtttggatacacttcgttaaaagtgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgctttt 47123381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6464775 - 6464601
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  6464775 gtgtttgtttggtatagtggtgacgagaattgattttgatataattgagtttgagtgagttcattttggttaaaagtgagtttaatgtgaattgatt-at 6464677  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||  ||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6464676 gtttttatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 6464601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 195
Target Start/End: Original strand, 27801608 - 27801763
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  27801608 tagtgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgattt 27801707  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 195  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27801708 atgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatag 27801763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 40229433 - 40229603
Alignment:
Q  47 tgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  40229433 tgtttggtatgacggtgatgaaaattgattttgatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttg 40229532  T
Q  147 gatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||| |||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40229533 gatacactttcttacaggtgattcttctgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 40229603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36205357 - 36205184
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||| ||     
T  36205357 gtgtgtttggtatgacggtggtgagaattgattttaacggaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgggttagatatgaattggtttttga 36205258  T
Q  144 ttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205257 ttggataaacttatttaaaagtgattcttacgagtgaatgttgcttggatagtttgaatcaaaattgattttga 36205184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 4369803 - 4369942
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369803 aattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttga-tgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 4369901  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4369902 ttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 4369942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50406299 - 50406125
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||     
T  50406299 agtgtgtgtttggtatagcggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgaaagatttgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttt 50406200  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||  |||   |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  50406199 tgtttggatgcacttcgttaaaaatgattcttataagttgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgttttt 50406125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34718620 - 34718452
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34718620 agtgtgtgtttggtttgacggtggaaaaaattgattttgatagaattgagtttgagataattaattttggttaaaagtgagtttgatataaattgattta 34718521  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    |||||| ||| |||     ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34718520 tgtttgaatacacttgtacaaaagtgattcttatgaattatagttgtttggatactttgaattaaaatt 34718452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9447696 - 9447533
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||| || | ||| |||| |||||    
T  9447696 tgtgtttggtatggcggtgaagagaattgattttaataaaattgaatttgagagaaatggttt-ggttaaaagtgagtttgatgtgaatggatt-atgtt 9447599  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattg 210  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9447598 tagatatactcatttaaaagtgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattg 9447533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15884371 - 15884219
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatact-cacttaaaag 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| | |  | | |||||    
T  15884371 gagaattgattttgatagagttgagtttgacagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacaataaagtaaaaag 15884272  T
Q  165 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15884271 tgatttttataaattcatgttgtttggatagtttggatcaaaattgattttga 15884219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25061367 - 25061221
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||    
T  25061367 aattgattttgttaaaattgattttggttgaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaattgatttatgtttggataccttaacataaaagtgat 25061268  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25061267 tcttatcaattgatgatgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 25061221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40352561 - 40352444
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40352561 ttagtgtgtgtttggttgtgcggtgaggagaattgattttgatagaattgattttgtgg-aattgattttggttaaaagtgagtttaatgtaaagtgatt 40352463  T
Q  139 tatgtttggatatactcac 157  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  40352462 tatgtttggatatcctcac 40352444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 23628706 - 23628830
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||| | || |||    
T  23628706 aattgagtttgagataattgattttgactaaaagtgagttgaatgtaa-ttgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatg 23628804  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  23628805 ttgtttgggtggtttgaatcaaaatt 23628830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 11051339 - 11051450
Alignment:
Q  112 taaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattga 211  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11051339 taaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgaatacacacacttaaaaatggttcttaagagtt-atgttgtttggatagtttgaataaaaattga 11051437  T
Q  212 ttttgagtgtgta 224  Q
    |||||| ||||||    
T  11051438 ttttgaatgtgta 11051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11561948 - 11561826
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||     
T  11561948 aattgagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatatttgaatatactattttaaaagtgattcttatgagttcatt 11561849  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaa 206  Q
    |  |||||||||||||| |||||    
T  11561848 taatttggatagtttgactcaaa 11561826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Original strand, 49242956 - 49243044
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||    
T  49242956 gcggtggtgagaattaattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagttggatgtgaattgatttatgtttg 49243044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4347139 - 4347034
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgt 143  Q
    |||||||||||   |||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  4347139 gtgtgtttggttgtgcggtggaaaaaattgattttggtagaattgattttgt-agaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgt 4347041  T
Q  144 ttggata 150  Q
    |||||||    
T  4347040 ttggata 4347034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29441357 - 29441271
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  29441357 tcttagtgtgtgtttgattctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 29441271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31933772 - 31933711
Alignment:
Q  165 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31933772 tgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtatt 31933711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42096 - 41919
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||| |   ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||| || ||| ||||||| ||  | ||||||||    
T  42096 ttagtgtgtgtttgattctgcggtggagaaaattgattttgataaaattgattttgttagaattgattttagtaaaaggtgagttgaacgtgaattgatt 41997  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtg 220  Q
    |||||||| ||    | |   ||||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41996 tatgtttgaat----taagacaaaagtgattcttataaattcacgttgtttggatagcttggatcaaaatttattttgagtg 41919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 291732 - 291818
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgtt 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  291732 aattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaattggtttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgttatgagttgttgtt 291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6061308 - 6061246
Alignment:
Q  44 gtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgatt 106  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6061308 gtgtgtttggtttgacggtggtgaaaattgattttgatagaattgaatttgagataattgatt 6061246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13344944 - 13344836
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  13344944 cttagcgtgtgtttggttgggcggtgaagataattgattttgattgaattgattttgt-agaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgat 13344846  T
Q  138 ttatgtttgg 147  Q
    ||||||||||    
T  13344845 ttatgtttgg 13344836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43134594 - 43134537
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43134594 gagaatttatttggatagaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagtt 43134537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 7765241 - 7765349
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||  ||  ||| ||||||     
T  7765241 agtgtgtgtttggttatgcggtgacgagaattgattttgatagaattga-ttttacataattgattatgaataaaagtgagttggatgaaaagtgatttt 7765339  T
Q  141 tgtttggata 150  Q
    ||||||||||    
T  7765340 tgtttggata 7765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15576595 - 15576454
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||| |||  | |||||||||||    
T  15576595 aattgattttaattaaattgagtttaagagaattgattttaattaaaagtgagttagatattaattgttttatgttttgatttacaaaattaaaagtgat 15576496  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattg 210  Q
    | |||  | || || ||| |||| |||||||  |||||||||    
T  15576495 ttttaccaatttatattgattggttagtttgtgtcaaaattg 15576454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32365205 - 32365072
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| | |  ||||| |||||   || | || |||    
T  32365205 aattgattttaaaataattgattttagtcaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttgaacatatttaaataaaattgattaccatcaatttatg 32365106  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32365105 atgtttagatagtttgaattaaaattgtttttga 32365072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43134495 - 43134454
Alignment:
Q  74 attttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaa 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43134495 attttaatagaattgagtttgagataattgattttggttaaa 43134454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40821873 - 40821813
Alignment:
Q  162 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40821873 aagtgattcttatttgttgatgttatttggataatttgaatcaaaattgagtttgaatgtg 40821813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 43730002 - 43730110
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||| |||||||| | || ||||  |||||||||| | | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| |    
T  43730002 gtgtatgtttggtttggcagtggctagaattgattctaacaaaattaattttgatataattgattttggttaaaagtgagttgagtgtcaattgatttgt 43730101  T
Q  142 gtttggata 150  Q
    |||||||||    
T  43730102 gtttggata 43730110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 150
Target Start/End: Original strand, 47981778 - 47981861
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  47981778 gagaattgattttaataaaattgattttgtaa-aattaattttggttaaaattgagttgaatttaaagtgatttatgtttggata 47981861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29438750 - 29438648
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29438750 gtgtgtgtttgaatttgcggtggagagaattgattctgataaaattgattttg-cagaattgattttgatgaaaagtgagttcaatataaagtggtttat 29438652  T
Q  142 gttt 145  Q
    ||||    
T  29438651 gttt 29438648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29759762 - 29759711
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  29759762 aattgattatggttaaaagtgagttgaatgtaaaatgatttatgtttggata 29759711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 6219966 - 6220032
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||  |||||||||||    
T  6219966 aattgagtttgatataattgattttgattaaaagtgtgttggatttaaattgatacatgtttggata 6220032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21063345 - 21063283
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 120  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21063345 gcggtggtgagaacttagtttgatagaatttaatttgacataattgattttggtcaaaagtga 21063283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16556362 - 16556295
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || | || || |||||||||||||||||    
T  16556362 agaattgaatttgacataattgattttggttaaaagtga-attgagatgaagtgatttatgtttggata 16556295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49178286 - 49178202
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| |||| | ||||||    
T  49178286 aattgatttttgttaaaaatgactcgaatataaattgatttatgtttgaatatcttgacataaaagtgatttttattaattgatg 49178202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41856989 - 41856950
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41856989 taaaagtgattcttattagttgattttgtttggatagttt 41856950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47085961 - 47085898
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgttt 145  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  47085961 agaattgattttgatagaattgattttaattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgttt 47085898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 47978359 - 47978426
Alignment:
Q  82 agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||    
T  47978359 agaattcattttgagtgaattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatggttggat 47978426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Original strand, 291704 - 291762
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttga-tagaattgagtttgagat 98  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  291704 agtgtgtgtttggtatggtggtggcgagaattgattttgattaaaagtgagtttgagat 291762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11019040 - 11018998
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  11019040 aattgattttggttaaaattgagttgaatataaattgagttat 11018998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Original strand, 13855712 - 13855774
Alignment:
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgt 221  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  13855712 taaaagtgatttttatgatttcatgtcgtttggatattttagatcaaaattgcttttgagtgt 13855774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21051156 - 21051098
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaa 116  Q
    |||||||||| || | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21051156 gcggtggtgaaaacttaatttgatagaattgaatttgacataattgattttggtcaaaa 21051098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30557677 - 30557624
Alignment:
Q  66 gagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  30557677 gagaattgattttgatagaattgattctg-tagaattgattttggttaaaagtga 30557624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Original strand, 3134656 - 3134716
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    |||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  3134656 aattgattttgagtgaattaattatggttaaaagtgagtttaaaacaaagtgatttatgtt 3134716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5930871 - 5930823
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||    
T  5930871 aattgattttggttaaaagtaaattgaatgtaaagtgatttatgtttgg 5930823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 46033210 - 46033246
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46033210 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgattttga 46033246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 13253038 - 13253211
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  13253038 tgtgtgtttggttgggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt-atg 13253136  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13253137 tttggatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 13253211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35760348 - 35760174
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  35760348 agtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 35760249  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35760248 tgtttggatacactcaattaaaactgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 35760174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3668012 - 3667839
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  3668012 gtgtgtgtttggtatagtggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgttaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 3667913  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3667912 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 3667839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 8049001 - 8049178
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||    
T  8049001 cttagtgtgtctttggtatagcggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggttaattgat 8049100  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  8049101 ttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgttgttgtttggatgatttaaatcaaaattgctttt 8049178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22482348 - 22482172
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22482348 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 22482249  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22482248 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 22482172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 39987920 - 39988088
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||    
T  39987920 agtgtgtgtttggtataccggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgattta 39988019  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  39988020 tgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttaaatcaaaatt 39988088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 2430250 - 2430432
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  2430250 agtgtgtatttggtatggcggtggcgagaattcattttgatggaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacatgaattgatt-a 2430348  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||||| |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430349 tgtttggatacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 2430432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 3060203 - 3060360
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3060203 agaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttttatatgaattaatttatgtttggatatactcactt-aaagtg 3060301  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtatt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3060302 attcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtatt 3060360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32454697 - 32454520
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgat-agaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||    
T  32454697 tagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgattagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt 32454598  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
     ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32454597 -atgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 32454520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32030876 - 32030699
Alignment:
Q  38 cttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgat 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||    
T  32030876 cttagtgtgtgtttggtatagtggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttagatgtgaattgat 32030777  T
Q  138 ttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    || ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32030776 ttttgttttgatatacttattcaaaagtgattcttat--gttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 32030699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24045991 - 24045814
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||    
T  24045991 ttagtatgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagtctgatgtgaattgatt 24045892  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24045891 tatgtttggatgctctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttgaattaaaattgattttga 24045814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 40495310 - 40495483
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40495310 tagtgtgtgtttggtatggcggcgggaagaattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgattt 40495409  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 214  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40495410 atgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttgaatagtttaaatcaaaattgattt 40495483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7715095 - 7714923
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  7715095 tgtgttttgtatggcggtggtaaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtt 7714996  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | || | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7714995 ttgacacactcacttgaaattgattcttataagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 7714923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27021288 - 27021111
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  27021288 tagtatgtgtttggtttggcggtggttagaactgattttgatataattgagtttgagaaaattgattttggttaaaaatgagttaaatgtgaattgattt 27021189  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggat-agtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27021188 atgtttgg-tatactcacttaaaagtgattcttagaagttgatgttgtttggataagattgaatcaaaattgattttga 27021111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 7385883 - 7386059
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||    
T  7385883 ttagtgtgtgtttagtatagcggcggtgagaattgattttgatagaattaagttttagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattgatt 7385982  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7385983 tatgtttaaatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgctttt 7386059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41835050 - 41834870
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||    
T  41835050 gtgtgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttgatagaattcagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgatttat 41834951  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 222  Q
    ||||||||| |||    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41834950 gtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtg 41834870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40885372 - 40885193
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||    
T  40885372 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgttagaattgagtttaagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgatt 40885273  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtga-ttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| | |||   |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885272 tatgtttggacacacttgtttaaaagtgagtttttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 40885193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10058235 - 10058057
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  10058235 ttagtgtgtgtttagtatggcggtggggagaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagtgagttggaaatgaattgatt 10058136  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||| |||    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10058135 tatgtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttga 10058057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 213
Target Start/End: Original strand, 40791021 - 40791194
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |    
T  40791021 ttagtgtgtgtttggtatcacggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-t 40791119  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40791120 tatgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 40791194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42146466 - 42146295
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||    
T  42146466 agtgtgtgtttggtatgacggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-tta 42146368  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 213  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42146367 tgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 42146295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 33953856 - 33954037
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  33953856 gtgtgtgtttggtatggcagtggtgaaaattgattttggtagaattgagtttgagagaattgattttatttaaaagtgagttgaacgtaaattga-ttat 33953954  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||| |||    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33953955 gtttggatacactttaatagaagtgattctgatgagttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtgta 33954037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 217
Target Start/End: Original strand, 41740564 - 41740722
Alignment:
Q  59 cggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcact 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||   |    
T  41740564 cggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattataggtgagtttgagatgaattggtttatgtttgaatacacttgtt 41740663  T
Q  159 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41740664 taaaagtgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 41740722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 5710339 - 5710511
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  5710339 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgcttta 5710438  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 214  Q
    ||||||||||  || | ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5710439 tgtttggatacgctta-ttacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattt 5710511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Original strand, 9275439 - 9275620
Alignment:
Q  43 tgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatg 142  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  9275439 tgtgtgtttggtttggcggtggggaaaattgattttgataaaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagttagatgttaattgatttatg 9275538  T
Q  143 tttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  9275539 tttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgta 9275620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4292282 - 4292125
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtg 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  4292282 agaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaaataagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttaattagaagtg 4292183  T
Q  167 attcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    |||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4292182 attcttgttggttgatattgtttggataatttgaatcaaaattaattttgaatgtgta 4292125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7178936 - 7178761
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    ||||||||||||||   ||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  7178936 agtgtgtgtttggttcggcgatgatgataattgagtttgatagaattgagtttgagagaattaattttgactaaaagtgagttgaatgtaa-ttgattta 7178838  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| | | || ||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7178837 tgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttga 7178761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 2694717 - 2694896
Alignment:
Q  45 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 144  Q
    ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||    
T  2694717 tgtgtttggttatgcggtgacgagaattgattttgtcagaattgattttgattgaattgattttggttaaaagtgagttgatcataaattaatttatttt 2694816  T
Q  145 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    | ||||   | || |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694817 tagataacttaacataaaagtgattcttatcaattgatgatgtttgtataatttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 2694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Original strand, 16158446 - 16158601
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||| |||||||  |||   |||||||||||    
T  16158446 aattgatttttatagatttgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattaatttatatttggatgcacttttttaaaagtgat 16158545  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16158546 tcttaggaattgatgttctttggatgatttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 16158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Original strand, 34106928 - 34107068
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||  ||| | ||| |||||||| ||    
T  34106928 aattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgattaatgtttaaatacattcatttaaaagtaat 34107027  T
Q  169 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 209  Q
    |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34107028 tcttatgaattaatgttgtttgaataggttgaatcaaaatt 34107068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Original strand, 28869547 - 28869638
Alignment:
Q  132 attgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  28869547 attgatttatgtttgaatacacttacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgagt-aaaatagatttcgagtgtgta 28869638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 175
Target Start/End: Original strand, 23914235 - 23914341
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  23914235 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattatacttaaaattgagttggatatgaattgatttacgtttggatacacccatttaaaagtgat 23914334  T
Q  169 tcttatg 175  Q
    |||||||    
T  23914335 tcttatg 23914341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Original strand, 35847841 - 35847925
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 123  Q
    ||||||||||||||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  35847841 ttagtgtgtgtttggttctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 35847925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41959561 - 41959445
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  41959561 aattaattttagttaaaagtgagttaaaagtgaattaatttatgtttggaaacac-cacataaaagtgattcttatgagttaatgttgttttcatagttt 41959463  T
Q  199 gaatcaaaattgattttg 216  Q
    |||  | |||||||||||    
T  41959462 gaaatagaattgattttg 41959445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2861760 - 2861620
Alignment:
Q  80 atagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattctt----atg 175  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    ||     
T  2861760 atagaattgattttgatataattgatttgagttaaaaatgacttgcatgtaaattgatttatgtttggatataat-atgtaaaagtgattcttataaata 2861662  T
Q  176 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    | || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  2861661 aatttatgttgtttgaataatttggatcaaaattgattttga 2861620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 3747540 - 3747717
Alignment:
Q  37 tcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattga 136  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||  | | ||||||||||| | |  ||||| |    
T  3747540 tcttagtgtgtgtttggttatgcggtgataaaaattgattttgatagaattgattgtgaatgaattgattcggatcaaaagtgagttgagtg-aaattaa 3747638  T
Q  137 tttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||||  | | |  | |||||||||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3747639 tttatgtttggatgcattaatatgaaagtgattcttagtaatgtatgttgtttggatagttttaatcaaaattgatttt 3747717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20069033 - 20068923
Alignment:
Q  81 tagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttg 180  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||| | | |||    
T  20069033 tagaattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtttaaatttatttatgtttggatacactaatgcaaaagtgattcttgttaattg 20068934  T
Q  181 atgttgtttgg 191  Q
    || ||||||||    
T  20068933 attttgtttgg 20068923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22811127 - 22811076
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22811127 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22811076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Original strand, 33467963 - 33468054
Alignment:
Q  59 cggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||    
T  33467963 cggtggttagaattgattttaacaaaattgattttgatagaactgattttggttaaaagtgagttgagtgtatattgatttgtgtttggata 33468054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 150
Target Start/End: Original strand, 2483684 - 2483776
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggata 150  Q
    ||||||| || ||||||||| || | |||||| ||||    |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2483684 gcggtggagaaaattgatttggacataattgattttgttggaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggata 2483776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19784944 - 19784864
Alignment:
Q  69 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  19784944 aattgattttgattgaattgattttatttgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtggtttatgtttggat 19784864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16843573 - 16843514
Alignment:
Q  165 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  16843573 tgatttttacgagttgatgttgtttggatagtttaaatgataattgattttgaatgtgta 16843514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 150
Target Start/End: Original strand, 19203957 - 19204066
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||  ||  ||| ||||||    
T  19203957 tagtgtgtgtttggttatgcggtgacgagaattgattttggtagaattga-ttttacataattgattatgaataaaagtgagttggatgaaaagtgattt 19204055  T
Q  140 atgtttggata 150  Q
     ||||||||||    
T  19204056 ttgtttggata 19204066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16843661 - 16843609
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  16843661 gaattgattttgatataattgagtttgaacgaatagattttggttaaaagtga 16843609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Original strand, 18850984 - 18851043
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagt 118  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  18850984 gcggtggggagagttgattttgatagaattgattctca-ataattgattttggttaaaagt 18851043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3749057 - 3748951
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    ||||||||||||| | | || |||| || ||||||||||| | ||| ||| ||| | | |||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  3749057 tagtgtgtgtttgattttgctgtggagaaaattgattttgtttgaactgatttt-acaaaattgattatagttaaaagtgagtttaatgtaaagtggttt 3748959  T
Q  140 atgtttgg 147  Q
    ||||||||    
T  3748958 atgtttgg 3748951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24036689 - 24036622
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatat 151  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24036689 aattgattttgatagaattgattttgatgaaaagtgagttgaatgtaaaatgatttatgtttgaatat 24036622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Original strand, 2868364 - 2868414
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  2868364 aattgattttagttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttaagtttggat 2868414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4295649 - 4295607
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  4295649 agaattgattttgatagaattgattctgacataattgattttg 4295607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Original strand, 33386859 - 33386900
Alignment:
Q  68 gaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  33386859 gaattgattttgatagaattgattctgatataattgattttg 33386900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 33082342 - 33082382
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33082342 agaattgattctgatagaattgattttgagagaattgattt 33082382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40980037 - 40980001
Alignment:
Q  181 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40980037 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttga 40980001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9256 - 9080
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | |    
T  9256 tagtatgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaattg-tat 9158  T
Q  140 atgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9157 atgtttggatacactcacttgaaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8418
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8594 agtgtgtgtttggtatggcggtgggaataattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgattta 8495  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8494 tgtttggatacacttttttaaaaatgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 8418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 253281 - 253097
Alignment:
Q  33 aatctcttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaa 132  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  253281 aatcacttagtgtgtgtttggttgggcggcggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaa 253182  T
Q  133 ttgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  253181 ttgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgattttga 253097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 219799 - 219624
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    ||||||||||||||||   ||||||   | ||||||||||| | ||||||| ||| | |||| | |||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  219799 ttagtgtgtgtttggttacgcggtgaaaataattgattttggttgaattgatttt-acataactaattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtgatt 219701  T
Q  139 tatgtttggatat-actcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 215  Q
    |||||||||||||   | |  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  219700 tatgtttggatatctttaagatagaagtgattcttatgag-agatgttgtttggatattttgtgtcaaaattgctttt 219624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 29080 - 29261
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  29080 gtgtgtgtttggtttggtggtggtaataattgattttgatagaattaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttat 29178  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
    ||||||||| |||    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29179 gtttggatacactttaatagaagttattcttatgaattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 29261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0983 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 216
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2399
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  2225 gtgtctgtttggtatggcggtggcgaaaattgattttgacagaattgagtttgacataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttat 2324  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    ||||||| | |||   ||||||||| || |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2325 gtttggacacacttgtttaaaagtggtttttacaagttgacgttgtttagatagtttgaatcaaaattgattttg 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 1981 - 2159
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||  | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  1981 ttagtgtgtgtttggattggcggtgtcgataattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttcaaaatgagtttgatatgaattgatt 2080  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2081 tatgtttggatgcactcatataaaagtgattatcatggcttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttga 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Original strand, 5784 - 5970
Alignment:
Q  39 ttagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||       
T  5784 ttagtgtgtgtttggtatggtggtagggagaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg--- 5880  T
Q  139 tatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag-----tttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
     |||||||  ||   |   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5881 -atgtttgattaccgtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttaatttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 5970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 118366 - 118501
Alignment:
Q  41 agtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattta 140  Q
    |||||||||||||  | |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  118366 agtgtgtgtttggattggcggtgggaggaattgattttgatcgaattgagtttgatagaatagatttttgttaaaagtgagtttgatgtaaattgattta 118465  T
Q  141 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatga 176  Q
    |||||||||| |||     |||||||||||||||||    
T  118466 tgtttggatacacttgtacaaaagtgattcttatga 118501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 150
Target Start/End: Original strand, 15213 - 15322
Alignment:
Q  40 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgattt 139  Q
    |||||||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15213 tagtgtgtgtttggttgtgcggtgacgaaaattgattttgatagaattgattttgtca-aattgattttggttaaaagtgagttgaatataaagtgattt 15311  T
Q  140 atgtttggata 150  Q
    |||||||||||    
T  15312 atgtttggata 15322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46906 - 46733
Alignment:
Q  42 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 141  Q
    ||||||||||||| |  | |||| || |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||| |||||    
T  46906 gtgtgtgtttggttttccagtggcgaaaattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagttgaacttaa-ttggtttat 46808  T
Q  142 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 216  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46807 gtttggatatattaaagtaaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttg 46733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 65627 - 65462
Alignment:
Q  58 gcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcac 157  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  65627 gcggtgatgggaattaattttgatagaattgattctgtga-aattgattttggttaaaaatgagtttaatgtaaagtgatttatgtttggatatcctcac 65529  T
Q  158 -ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
       ||||||||||  |||||    || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  65528 aacaaaagtgatttgtatga-aaaatattgtttggatactttgtgtcaaaattgattttgggtgtgta 65462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 301630 - 301562
Alignment:
Q  81 tagaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggat 149  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  301630 tagaattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtataaatttatttatgtttggat 301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Original strand, 138522 - 138647
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||||| | |  ||   |||| |||| |||    
T  138522 aattaattttagttaaaagtgagctgaacataaattgatttatgtttggataccttaacataaaagtgattcttatcaatccataaagtttagataattt 138621  T
Q  199 gaatcaaaattgattttgagtgtgta 224  Q
     |||||||||||||||| | ||||||    
T  138622 aaatcaaaattgattttaaatgtgta 138647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 99764 - 99637
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 183  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |  ||| ||      ||||||||||| | || |||    
T  99764 aattgattttaacataattgattttaattaaaagtgagttgaatgtaaattaatttatgtttggttgcactgac------gtgattcttatcaattcatg 99671  T
Q  184 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 217  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  99670 ttgtttggatgatatggatcaaaattgattttga 99637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 99980 - 99918
Alignment:
Q  84 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttg 146  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  99980 aattgattttaacataattgattttaattaaaagtgagttgaatgtaaattaatttatgtttg 99918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 199383 - 199431
Alignment:
Q  99 aattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  199383 aattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 199431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 32103 - 32058
Alignment:
Q  61 gtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  32103 gtggggagaattgattttgatagaattgattttgatagaattgatt 32058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 32459 - 32499
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32459 agaattgattgtgacagaattgattttgagataattgattt 32499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 38412 - 38372
Alignment:
Q  67 agaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38412 agaattgattttgacagaattgattttgagagaattgattt 38372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University