View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15415_low_32 (Length: 248)

Name: NF15415_low_32
Description: NF15415
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15415_low_32
NF15415_low_32
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (21-248)||(5112257-5112484)
chr5 (21-248)||(12910354-12910587)
chr5 (21-248)||(699154-699382)
chr5 (61-245)||(1429129-1429313)
chr5 (21-248)||(36866766-36866994)
chr5 (49-248)||(7693234-7693434)
chr5 (21-248)||(19119863-19120091)
chr5 (21-248)||(23116165-23116393)
chr5 (21-248)||(31786589-31786817)
chr5 (27-248)||(8741835-8742058)
chr5 (21-248)||(22980797-22981025)
chr5 (21-240)||(27318430-27318650)
chr5 (21-248)||(38528180-38528407)
chr5 (21-248)||(40133389-40133617)
chr5 (21-248)||(36860427-36860656)
chr5 (21-248)||(5837559-5837787)
chr5 (21-248)||(39572823-39573051)
chr5 (21-195)||(23954732-23954908)
chr5 (21-248)||(25500869-25501097)
chr5 (21-248)||(26268078-26268306)
chr5 (21-248)||(31705555-31705782)
chr5 (61-248)||(24886106-24886295)
chr5 (21-238)||(30969267-30969485)
chr5 (49-248)||(32563153-32563353)
chr5 (21-240)||(33908245-33908465)
chr5 (21-248)||(21088709-21088937)
chr5 (22-248)||(7208808-7209035)
chr5 (61-248)||(9200237-9200424)
chr5 (22-248)||(22974026-22974253)
chr5 (21-245)||(22255188-22255414)
chr5 (61-248)||(8466749-8466935)
chr5 (61-248)||(14409311-14409497)
chr5 (30-248)||(35826436-35826654)
chr5 (41-246)||(22019638-22019844)
chr5 (51-244)||(35511450-35511644)
chr5 (21-248)||(14919471-14919700)
chr5 (21-248)||(27330310-27330536)
chr5 (21-248)||(15724494-15724720)
chr5 (22-248)||(17157975-17158204)
chr5 (32-243)||(43308606-43308818)
chr5 (49-248)||(28416498-28416693)
chr5 (28-182)||(6824429-6824586)
chr5 (21-248)||(5829901-5830124)
chr5 (21-248)||(35933906-35934128)
chr5 (22-248)||(8436970-8437196)
chr5 (22-190)||(35504427-35504596)
chr5 (49-210)||(42342775-42342934)
chr5 (21-173)||(15992483-15992636)
chr5 (103-215)||(25668687-25668798)
chr5 (167-248)||(26317774-26317855)
chr5 (21-248)||(13956305-13956516)
chr5 (116-240)||(11898014-11898138)
chr5 (204-248)||(22616498-22616542)
chr5 (175-248)||(16004474-16004548)
chr5 (167-243)||(5748437-5748520)
chr5 (21-104)||(2888388-2888472)
chr5 (204-248)||(10237418-10237462)
chr5 (204-248)||(21320755-21320799)
chr5 (204-248)||(33163517-33163561)
chr5 (168-219)||(22255608-22255659)
chr5 (205-248)||(35504171-35504214)
chr5 (61-98)||(25669740-25669777)
chr5 (207-248)||(26411297-26411338)
chr5 (204-248)||(13380499-13380543)
chr5 (204-248)||(27579043-27579087)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (21-248)||(36493668-36493895)
chr4 (21-248)||(35021014-35021242)
chr4 (36-248)||(9139251-9139462)
chr4 (25-248)||(25701039-25701264)
chr4 (27-248)||(55241090-55241311)
chr4 (21-248)||(37663720-37663946)
chr4 (21-248)||(17173294-17173522)
chr4 (22-248)||(25184117-25184344)
chr4 (21-248)||(17167717-17167945)
chr4 (21-248)||(38011858-38012086)
chr4 (21-248)||(50697246-50697473)
chr4 (21-248)||(55477870-55478102)
chr4 (21-248)||(19089432-19089660)
chr4 (21-248)||(28002965-28003193)
chr4 (21-248)||(34948074-34948304)
chr4 (49-248)||(37775673-37775871)
chr4 (21-248)||(33341399-33341630)
chr4 (21-245)||(42199736-42199961)
chr4 (21-248)||(6864039-6864267)
chr4 (21-238)||(46888137-46888354)
chr4 (21-248)||(19440627-19440856)
chr4 (21-240)||(879527-879747)
chr4 (21-248)||(32912559-32912787)
chr4 (21-248)||(34361471-34361698)
chr4 (21-248)||(47253753-47253972)
chr4 (21-248)||(7703521-7703741)
chr4 (21-248)||(49375970-49376199)
chr4 (49-248)||(4597997-4598195)
chr4 (21-194)||(4934181-4934356)
chr4 (21-235)||(23761089-23761303)
chr4 (22-226)||(54499217-54499424)
chr4 (21-248)||(29584179-29584405)
chr4 (21-248)||(27396620-27396848)
chr4 (21-248)||(5047945-5048172)
chr4 (49-248)||(32592097-32592297)
chr4 (21-248)||(3042615-3042851)
chr4 (81-238)||(50764746-50764901)
chr4 (21-248)||(37287737-37287960)
chr4 (49-248)||(39397922-39398113)
chr4 (49-245)||(30002639-30002828)
chr4 (49-236)||(33816540-33816728)
chr4 (21-248)||(35025575-35025795)
chr4 (21-144)||(1815409-1815533)
chr4 (21-248)||(32579448-32579678)
chr4 (160-248)||(4396330-4396418)
chr4 (147-248)||(4205120-4205221)
chr4 (167-248)||(53124291-53124372)
chr4 (170-248)||(7152235-7152313)
chr4 (21-132)||(17272084-17272196)
chr4 (140-211)||(23518402-23518473)
chr4 (198-248)||(38812254-38812304)
chr4 (186-248)||(46884179-46884241)
chr4 (194-248)||(52516601-52516655)
chr4 (204-248)||(2704516-2704560)
chr4 (188-248)||(17272015-17272075)
chr4 (204-248)||(20097491-20097535)
chr4 (204-248)||(47073657-47073701)
chr4 (204-248)||(51204583-51204627)
chr4 (197-248)||(38811817-38811868)
chr4 (204-248)||(9743592-9743636)
chr4 (204-248)||(49878640-49878683)
chr4 (204-248)||(54995799-54995843)
chr4 (205-248)||(42063007-42063050)
chr4 (205-248)||(47028104-47028147)
chr4 (21-110)||(46884089-46884177)
chr4 (187-248)||(53337559-53337620)
chr4 (204-248)||(2266856-2266900)
chr4 (204-248)||(17612339-17612383)
chr4 (204-248)||(28293237-28293281)
chr4 (204-248)||(33255503-33255547)
chr4 (204-248)||(47236868-47236912)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (21-248)||(6098477-6098705)
chr8 (21-246)||(37970478-37970704)
chr8 (21-248)||(16446834-16447062)
chr8 (21-248)||(27082797-27083025)
chr8 (21-248)||(36694925-36695153)
chr8 (21-240)||(1204938-1205158)
chr8 (66-248)||(10555207-10555389)
chr8 (21-248)||(9864151-9864379)
chr8 (21-248)||(38643981-38644209)
chr8 (22-248)||(43643555-43643782)
chr8 (21-245)||(23854390-23854615)
chr8 (49-248)||(465845-466045)
chr8 (21-248)||(13307626-13307854)
chr8 (21-248)||(12876112-12876341)
chr8 (21-248)||(16222866-16223094)
chr8 (21-238)||(11727037-11727255)
chr8 (51-248)||(34894970-34895168)
chr8 (21-248)||(5299905-5300133)
chr8 (49-248)||(1150092-1150292)
chr8 (21-248)||(30654542-30654770)
chr8 (61-248)||(41362521-41362705)
chr8 (21-248)||(31933845-31934073)
chr8 (22-248)||(40862422-40862649)
chr8 (61-248)||(34952031-34952218)
chr8 (22-191)||(1149592-1149762)
chr8 (21-248)||(41910947-41911175)
chr8 (21-248)||(7890916-7891135)
chr8 (21-248)||(8803776-8803993)
chr8 (21-179)||(39099078-39099237)
chr8 (21-248)||(44869499-44869728)
chr8 (25-175)||(1953951-1954104)
chr8 (21-248)||(35459670-35459885)
chr8 (21-248)||(33906227-33906443)
chr8 (21-126)||(4132645-4132750)
chr8 (128-248)||(4133077-4133195)
chr8 (21-182)||(43025771-43025933)
chr8 (187-248)||(15009245-15009306)
chr8 (61-138)||(7998407-7998485)
chr8 (204-246)||(23176763-23176805)
chr8 (204-245)||(8151412-8151453)
chr8 (203-248)||(35735983-35736028)
chr8 (204-248)||(4108912-4108956)
chr8 (204-248)||(5018014-5018058)
chr8 (204-243)||(41191019-41191058)
chr8 (207-248)||(6446709-6446750)
chr8 (196-244)||(24823407-24823455)
chr8 (204-248)||(28220955-28220999)
chr8 (103-153)||(33197947-33197997)
chr8 (203-248)||(38110357-38110402)
chr8 (212-248)||(7998366-7998402)
chr8 (49-96)||(18259238-18259286)
chr8 (188-248)||(33197895-33197955)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (21-248)||(10181956-10182184)
chr1 (21-248)||(42721039-42721267)
chr1 (21-248)||(15752029-15752257)
chr1 (21-233)||(9903002-9903215)
chr1 (21-248)||(18422651-18422879)
chr1 (21-248)||(2959748-2959976)
chr1 (21-248)||(10922727-10922955)
chr1 (21-239)||(27267148-27267364)
chr1 (39-248)||(41926163-41926373)
chr1 (21-248)||(38823214-38823442)
chr1 (21-248)||(16415645-16415874)
chr1 (21-248)||(15382933-15383161)
chr1 (21-248)||(19899717-19899945)
chr1 (21-215)||(32216088-32216283)
chr1 (21-248)||(27227433-27227653)
chr1 (21-247)||(27532929-27533155)
chr1 (21-241)||(47279196-47279417)
chr1 (21-248)||(238461-238688)
chr1 (24-248)||(27563856-27564082)
chr1 (21-248)||(28769653-28769881)
chr1 (21-248)||(23999347-23999575)
chr1 (21-248)||(30326900-30327128)
chr1 (21-248)||(32267034-32267262)
chr1 (49-248)||(48620637-48620837)
chr1 (61-240)||(14758049-14758228)
chr1 (21-223)||(51128884-51129087)
chr1 (21-248)||(8222131-8222356)
chr1 (21-242)||(37451292-37451513)
chr1 (21-248)||(47682442-47682669)
chr1 (21-248)||(7079011-7079250)
chr1 (21-248)||(1547287-1547507)
chr1 (21-242)||(28564731-28564951)
chr1 (51-248)||(34012355-34012553)
chr1 (21-239)||(4330288-4330509)
chr1 (21-248)||(31621502-31621729)
chr1 (23-248)||(30254424-30254649)
chr1 (21-170)||(25160710-25160860)
chr1 (21-248)||(15168089-15168324)
chr1 (84-248)||(3309148-3309311)
chr1 (30-248)||(39393383-39393603)
chr1 (61-248)||(11742340-11742526)
chr1 (21-248)||(33725548-33725776)
chr1 (66-248)||(37618886-37619072)
chr1 (21-248)||(46931408-46931637)
chr1 (21-220)||(40884841-40885041)
chr1 (39-248)||(3534932-3535142)
chr1 (104-245)||(21289668-21289816)
chr1 (22-220)||(27763260-27763458)
chr1 (21-152)||(22170807-22170939)
chr1 (21-192)||(38759583-38759761)
chr1 (157-248)||(30254858-30254948)
chr1 (204-248)||(13876919-13876963)
chr1 (188-248)||(22170754-22170814)
chr1 (204-248)||(42663785-42663829)
chr1 (122-212)||(1359933-1360022)
chr1 (207-245)||(47279166-47279204)
chr1 (207-248)||(4150490-4150531)
chr1 (204-248)||(26970265-26970309)
chr1 (204-248)||(43579246-43579290)
chr1 (205-248)||(45319611-45319654)
chr1 (204-236)||(16127536-16127568)
chr1 (204-248)||(16132479-16132523)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (21-248)||(37347001-37347228)
chr7 (21-248)||(18797308-18797534)
chr7 (61-248)||(31520719-31520905)
chr7 (21-248)||(38258524-38258752)
chr7 (21-248)||(21991615-21991843)
chr7 (21-248)||(32821007-32821235)
chr7 (21-248)||(23111169-23111399)
chr7 (21-248)||(11071184-11071413)
chr7 (22-248)||(27283723-27283950)
chr7 (21-248)||(4582898-4583126)
chr7 (21-248)||(43686020-43686247)
chr7 (21-248)||(37109851-37110081)
chr7 (21-248)||(24211720-24211948)
chr7 (39-248)||(44413351-44413562)
chr7 (21-238)||(22687228-22687446)
chr7 (21-248)||(5657435-5657663)
chr7 (21-248)||(7334773-7335001)
chr7 (21-248)||(41765032-41765260)
chr7 (21-248)||(17842538-17842768)
chr7 (21-248)||(30055505-30055734)
chr7 (21-248)||(9355780-9356008)
chr7 (21-248)||(10481582-10481812)
chr7 (21-248)||(15612713-15612940)
chr7 (21-248)||(31579018-31579251)
chr7 (25-248)||(10359172-10359396)
chr7 (21-248)||(6546498-6546726)
chr7 (21-248)||(8861264-8861492)
chr7 (49-248)||(12165731-12165931)
chr7 (21-248)||(32432436-32432659)
chr7 (31-248)||(27421344-27421561)
chr7 (21-248)||(25691498-25691727)
chr7 (61-225)||(26980325-26980489)
chr7 (61-248)||(12390625-12390812)
chr7 (21-248)||(33688216-33688443)
chr7 (21-248)||(48928518-48928745)
chr7 (21-236)||(48928251-48928466)
chr7 (63-226)||(29173541-29173704)
chr7 (21-248)||(37704147-37704364)
chr7 (61-248)||(38053464-38053644)
chr7 (21-158)||(44598735-44598873)
chr7 (103-248)||(26524364-26524509)
chr7 (21-136)||(15672716-15672832)
chr7 (61-202)||(32593184-32593324)
chr7 (21-166)||(37703452-37703590)
chr7 (21-248)||(43925084-43925308)
chr7 (122-248)||(34362205-34362330)
chr7 (21-108)||(26588038-26588126)
chr7 (21-163)||(46481083-46481218)
chr7 (21-215)||(35353120-35353315)
chr7 (207-248)||(241024-241065)
chr7 (197-248)||(8299194-8299245)
chr7 (198-248)||(3953735-3953785)
chr7 (206-240)||(46481217-46481251)
chr7 (204-248)||(23402371-23402415)
chr7 (153-213)||(44598378-44598438)
chr7 (205-248)||(34095888-34095931)
chr7 (204-248)||(4618755-4618799)
chr7 (204-248)||(4902344-4902388)
chr7 (204-248)||(10675332-10675376)
chr7 (204-244)||(22955312-22955352)
chr7 (204-248)||(40381944-40381988)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (21-248)||(46297715-46297943)
chr3 (21-248)||(37203062-37203290)
chr3 (21-248)||(37157703-37157930)
chr3 (21-248)||(11466819-11467047)
chr3 (21-240)||(52040875-52041096)
chr3 (21-248)||(22446018-22446246)
chr3 (21-248)||(34132930-34133158)
chr3 (49-248)||(51212962-51213162)
chr3 (21-248)||(35844321-35844549)
chr3 (21-229)||(2007948-2008155)
chr3 (21-248)||(39282648-39282875)
chr3 (21-248)||(48354936-48355164)
chr3 (21-248)||(4761601-4761832)
chr3 (21-248)||(3655155-3655383)
chr3 (31-248)||(4015455-4015673)
chr3 (49-242)||(29099356-29099550)
chr3 (21-248)||(26941213-26941441)
chr3 (25-246)||(3362249-3362474)
chr3 (21-248)||(22450963-22451191)
chr3 (21-248)||(7327435-7327664)
chr3 (61-237)||(11357358-11357535)
chr3 (71-248)||(20373300-20373477)
chr3 (52-248)||(44186485-44186682)
chr3 (21-248)||(40552212-40552440)
chr3 (21-202)||(42506028-42506210)
chr3 (21-245)||(24488915-24489140)
chr3 (21-240)||(53229105-53229326)
chr3 (21-248)||(47481517-47481745)
chr3 (21-248)||(21193601-21193830)
chr3 (21-248)||(32373467-32373693)
chr3 (21-240)||(44891510-44891720)
chr3 (61-248)||(27480373-27480560)
chr3 (32-248)||(45174498-45174718)
chr3 (21-248)||(25579734-25579962)
chr3 (21-248)||(54828654-54828881)
chr3 (24-248)||(33378741-33378963)
chr3 (21-248)||(24708068-24708293)
chr3 (21-248)||(46994614-46994831)
chr3 (21-220)||(21009755-21009955)
chr3 (21-182)||(43348319-43348480)
chr3 (49-248)||(43975869-43976066)
chr3 (21-226)||(54505825-54506030)
chr3 (81-239)||(40935995-40936153)
chr3 (21-129)||(22622671-22622780)
chr3 (21-137)||(33698259-33698376)
chr3 (21-210)||(38591727-38591921)
chr3 (49-182)||(14586651-14586785)
chr3 (21-170)||(53176127-53176277)
chr3 (49-149)||(29163912-29164013)
chr3 (21-248)||(11835580-11835787)
chr3 (25-94)||(1089842-1089913)
chr3 (204-248)||(49359628-49359672)
chr3 (184-248)||(55343401-55343465)
chr3 (21-134)||(36012246-36012361)
chr3 (99-166)||(53811694-53811767)
chr3 (166-238)||(2613895-2613967)
chr3 (204-248)||(38392628-38392672)
chr3 (204-248)||(40640634-40640678)
chr3 (204-248)||(47930666-47930710)
chr3 (205-248)||(4556544-4556587)
chr3 (202-248)||(42665539-42665585)
chr3 (207-248)||(5124672-5124713)
chr3 (195-248)||(29163842-29163895)
chr3 (204-248)||(19606914-19606958)
chr3 (204-248)||(23165838-23165882)
chr3 (168-248)||(33698187-33698263)
chr3 (204-238)||(7568719-7568753)
chr3 (167-209)||(41585407-41585449)
chr3 (210-248)||(43348284-43348322)
chr3 (198-248)||(53811970-53812020)
chr3 (207-248)||(48155220-48155261)
chr3 (203-248)||(53818508-53818553)
chr3 (204-248)||(45879498-45879542)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (21-248)||(29242109-29242337)
chr2 (21-248)||(4166926-4167154)
chr2 (33-248)||(33550969-33551185)
chr2 (27-248)||(36641990-36642214)
chr2 (21-248)||(3176943-3177171)
chr2 (21-248)||(19424599-19424827)
chr2 (49-248)||(33660367-33660567)
chr2 (21-248)||(41463821-41464049)
chr2 (21-219)||(43648216-43648415)
chr2 (21-248)||(4763632-4763863)
chr2 (21-248)||(17071708-17071936)
chr2 (21-248)||(37905713-37905942)
chr2 (30-248)||(4264057-4264276)
chr2 (21-248)||(17054067-17054295)
chr2 (49-248)||(43770838-43771037)
chr2 (21-248)||(4478372-4478597)
chr2 (21-248)||(2325349-2325569)
chr2 (22-248)||(26357581-26357808)
chr2 (21-248)||(33902072-33902298)
chr2 (21-248)||(19289294-19289517)
chr2 (21-248)||(31570705-31570933)
chr2 (21-248)||(44913666-44913896)
chr2 (49-248)||(27349938-27350138)
chr2 (21-248)||(11366352-11366580)
chr2 (21-248)||(13711468-13711691)
chr2 (49-248)||(39167362-39167562)
chr2 (49-248)||(5881538-5881742)
chr2 (49-248)||(19313856-19314055)
chr2 (21-220)||(33709203-33709403)
chr2 (21-240)||(44285961-44286181)
chr2 (21-152)||(41960940-41961072)
chr2 (21-248)||(41465513-41465733)
chr2 (21-248)||(18494252-18494467)
chr2 (61-182)||(7006933-7007054)
chr2 (21-248)||(35958913-35959128)
chr2 (21-171)||(45327801-45327952)
chr2 (21-133)||(31861971-31862084)
chr2 (21-111)||(18258258-18258349)
chr2 (107-225)||(41051263-41051382)
chr2 (204-248)||(34441921-34441965)
chr2 (204-248)||(41643876-41643920)
chr2 (188-248)||(41960887-41960947)
chr2 (204-248)||(42005393-42005437)
chr2 (202-248)||(31861899-31861945)
chr2 (204-248)||(18947598-18947642)
chr2 (205-248)||(43446463-43446506)
chr2 (69-149)||(19501760-19501839)
chr2 (204-240)||(27139020-27139056)
chr2 (210-248)||(7007051-7007089)
chr2 (204-248)||(6177779-6177823)
chr2 (204-248)||(18514771-18514815)
chr2 (204-248)||(19093417-19093461)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (21-248)||(4318774-4319003)
chr6 (21-248)||(3879891-3880119)
chr6 (21-240)||(21017064-21017284)
chr6 (21-248)||(1945837-1946066)
chr6 (21-248)||(5627395-5627623)
chr6 (21-248)||(6091134-6091362)
chr6 (21-248)||(7055167-7055395)
chr6 (21-248)||(30353310-30353538)
chr6 (21-248)||(7234987-7235214)
chr6 (21-248)||(8513237-8513460)
chr6 (21-248)||(29182167-29182396)
chr6 (21-248)||(6088912-6089135)
chr6 (21-236)||(15491631-15491847)
chr6 (21-248)||(20768090-20768314)
chr6 (49-248)||(33892983-33893182)
chr6 (76-248)||(33618838-33619010)
chr6 (121-245)||(18498440-18498565)
chr6 (203-248)||(3005392-3005437)
chr6 (204-248)||(11084152-11084196)
chr6 (204-248)||(19631753-19631797)
chr6 (207-248)||(4488589-4488630)
chr6 (207-248)||(25440962-25441003)
chr6 (204-248)||(24662190-24662234)
chr6 (204-248)||(26301923-26301967)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (21-248)||(7891-8119)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (21-248)||(138-366)
scaffold0002 (21-231)||(94336-94547)
scaffold0002 (21-198)||(408382-408559)
scaffold0002 (204-248)||(408706-408750)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-248)||(145969-146197)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (21-248)||(11910-12141)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (21-248)||(267286-267517)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (21-248)||(43961-44188)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (21-248)||(154599-154826)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (161-248)||(42352-42439)
scaffold0009 (187-248)||(100825-100886)
scaffold0009 (67-108)||(100894-100935)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (205-248)||(6983-7026)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (204-248)||(12138-12182)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 5112257 - 5112484
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112257 gatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 5112356  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112357 ttgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 5112456  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5112457 gtcattttcatgacttcaccataaaatt 5112484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12910587 - 12910354
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  12910587 gatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatga 12910488  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgcc-----actgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc 214  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12910487 attgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcacc 12910388  T
Q  215 aaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910387 aaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 12910354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 699382 - 699154
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  699382 gatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 699283  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||    
T  699282 attgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaa 699183  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  699182 agtcattctcataacttcaccataaaatt 699154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Original strand, 1429129 - 1429313
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  1429129 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgta 1429228  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1429229 caaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttcaccataga 1429313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36866994 - 36866766
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  36866994 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 36866895  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||    
T  36866894 attgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaa 36866795  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36866794 aatcattttcgtgacttcaccatagaatt 36866766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7693434 - 7693234
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7693434 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttt 7693335  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7693334 tgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaat 7693235  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  7693234 t 7693234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19120091 - 19119863
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||    
T  19120091 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatga 19119992  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | | |||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  19119991 attgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaa 19119892  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19119891 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 19119863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 23116165 - 23116393
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||    
T  23116165 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatga 23116264  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||  |||||    
T  23116265 attgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaa 23116364  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23116365 agtcattttcatgacgtcaccatagaatt 23116393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 31786589 - 31786817
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  31786589 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31786688  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31786689 attgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaa 31786788  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  31786789 agtcattctcactacttcactatagaatt 31786817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Original strand, 8741835 - 8742058
Alignment:
Q  27 atgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||    
T  8741835 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgat 8741934  T
Q  126 gatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtca 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | | |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8741935 gatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtca 8742034  T
Q  225 ttttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  8742035 ttctcatgacttcaccatagaatt 8742058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22981025 - 22980797
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  22981025 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22980926  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||    
T  22980925 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaa 22980826  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  22980825 agtcattctcataacttcatcataaaatt 22980797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 27318430 - 27318650
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27318430 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 27318529  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||| || | | | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  27318530 attgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaa 27318629  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  27318630 aatcattctcatgacttcacc 27318650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 38528180 - 38528407
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  38528180 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38528279  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  38528280 attgatgatactatgag-actgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaa 38528378  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38528379 aaccattttcatgacttcaccatagaatt 38528407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40133617 - 40133389
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  40133617 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 40133518  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||  |||| | |||||||||||| |||    
T  40133517 attgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaa 40133418  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40133417 agtcattttcgtgacttcaccatagaatt 40133389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36860656 - 36860427
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaa-ggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | || |||||||| | | |||    
T  36860656 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatg 36860557  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  36860556 aattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaa 36860457  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36860456 aaatcattttcgtgacttcaccatagaatt 36860427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5837787 - 5837559
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  5837787 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 5837688  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| ||| |||||||| |||    
T  5837687 attgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaa 5837588  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  5837587 agtcattctcatgaattcaccgtagaatt 5837559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39573051 - 39572823
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  39573051 gatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 39572952  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  39572951 atttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaa 39572852  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39572851 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 39572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 23954732 - 23954908
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  23954732 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 23954831  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccact-gtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatg 195  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954832 attgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatattttttatg 23954908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 25500869 - 25501097
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||    
T  25500869 gatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatga 25500968  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||    
T  25500969 attgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaa 25501068  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25501069 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 25501097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26268306 - 26268078
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||| | ||||    
T  26268306 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatga 26268207  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  26268206 attgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaa 26268107  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26268106 aatcattctcatgacttcactgtagaatt 26268078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 31705555 - 31705782
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  31705555 gatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31705654  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31705655 attgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 31705753  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31705754 aatcatttttatgacttcaccatagaatt 31705782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24886295 - 24886106
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  24886295 ttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta 24886196  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaa--aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24886195 caaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaatt 24886106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 30969267 - 30969485
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  30969267 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30969366  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| | |    
T  30969367 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagata 30969466  T
Q  220 agtcattttcatgacttca 238  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  30969467 aatcattctcatgacttca 30969485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32563353 - 32563153
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  32563353 actttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttt 32563254  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32563253 tgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaat 32563154  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  32563153 t 32563153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33908465 - 33908245
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |  |    
T  33908465 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaata 33908366  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||||| |||    
T  33908365 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaa 33908266  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
      ||||| |||||||||||||    
T  33908265 gttcattctcatgacttcacc 33908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 21088709 - 21088937
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  21088709 gatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatga 21088808  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc-aaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  21088809 attgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatactacagt-ttaacttcaccaaaaa 21088907  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21088908 aagtcattttcgtgacttcatcgtagaatt 21088937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Original strand, 7208808 - 7209035
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  7208808 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaa 7208907  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc-aaaaa 219  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  |  ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  7208908 ttgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaa 7209006  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7209007 agtcatttttatgacttcaccgtagaatt 7209035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9200424 - 9200237
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||    
T  9200424 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgta 9200325  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  9200324 caaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaatt 9200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Original strand, 22974026 - 22974253
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||     
T  22974026 atattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgag 22974125  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22974126 ttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 22974225  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22974226 atcattctcataacttcaccatagaatt 22974253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22255414 - 22255188
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  22255414 gatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22255315  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttt-atgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  22255314 attgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaa 22255215  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22255214 aagttatttttatgacttcaccgtaga 22255188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8466935 - 8466749
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8466935 ttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgta 8466836  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| || ||||||||| |||| | | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  8466835 caaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaatt 8466749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 14409311 - 14409497
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  14409311 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgccaccgta 14409409  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
      || ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409410 ttaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 14409497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Original strand, 35826436 - 35826654
Alignment:
Q  30 tgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgat 128  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||| || |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | | || |||||||| || |||| |||||||    
T  35826436 tgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatcta-tgaactgatgat 35826534  T
Q  129 actatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcatttt 228  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  35826535 actatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattat 35826634  T
Q  229 catgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35826635 catgacttcaccatagaatt 35826654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22019844 - 22019638
Alignment:
Q  41 agtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggat 139  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||     
T  22019844 agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggac 22019745  T
Q  140 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcac 239  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  22019744 ttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttcac 22019645  T
Q  240 catagaa 246  Q
    |||||||    
T  22019644 catagaa 22019638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 244
Target Start/End: Original strand, 35511450 - 35511644
Alignment:
Q  51 tttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttg 149  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  35511450 tttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttg 35511549  T
Q  150 atgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatag 244  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35511550 atgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttcaccatag 35511644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 14919471 - 14919700
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  14919471 gatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatga 14919570  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca-ccaaaa 218  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||| | ||||    
T  14919571 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaa 14919670  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  14919671 aaataattctcatgacttcaccatataatt 14919700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27330536 - 27330310
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||  ||||| | ||||    
T  27330536 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 27330437  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27330436 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 27330339  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||    
T  27330338 agtcattcccacgacttcaccatagaatt 27330310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15724720 - 15724494
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| || |||||||||||| || |  |||||| || || ||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  15724720 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 15724621  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15724620 attgatgatattatggg-actgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 15724523  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15724522 agtcattctcataacttcaccatagaatt 15724494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Original strand, 17157975 - 17158204
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  17157975 atattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaa 17158074  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcac---caaa 217  Q
    || ||||||||||   ||  |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    |||    
T  17158075 ttaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacaaaaaaa 17158173  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17158174 aaaatcatttttatgacttcaccatagaatt 17158204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 243
Target Start/End: Original strand, 43308606 - 43308818
Alignment:
Q  32 atagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatac 130  Q
    |||||||||||||||  |||||   |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||    
T  43308606 atagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatac 43308705  T
Q  131 tatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcac-caaaaaagtcattttc 229  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||| | ||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  43308706 tatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaactttactaaaaaaagtcattctc 43308804  T
Q  230 atgacttcaccata 243  Q
    ||||||||||||||    
T  43308805 atgacttcaccata 43308818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 28416498 - 28416693
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  28416498 actttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttt 28416597  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||| ||     ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28416598 tgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcactaa-----tcattctaatgacttcaccatagaat 28416692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Original strand, 6824429 - 6824586
Alignment:
Q  28 tgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatg 126  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | || ||||||||    
T  6824429 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatg 6824528  T
Q  127 atactatggggattga--acttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcac 182  Q
    ||||||||  || |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6824529 atactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcac 6824586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5830124 - 5829901
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||          
T  5830124 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatt------ 5830031  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgtta----tagtattaacttcacca 215  Q
       |||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||    || | ||||||||||||    
T  5830030 ---gatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgttaattataatgttaacttcacca 5829934  T
Q  216 aaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  5829933 aaaaaatcatttttacgacttcaccctagaatt 5829901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35934128 - 35933906
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaat-tagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||| | |||    
T  35934128 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatg 35934029  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||        |||| |||||||||||| | | |||| ||  |||||| ||||||||| |||||    
T  35934028 aattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaa 35933936  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35933935 aaatcattctcatgacttcaccatacaatt 35933906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8437196 - 8436970
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttaca-cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||      
T  8437196 atattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatgg- 8437098  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  | | |||||| |||| ||||||||||||    
T  8437097 ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaa 8436998  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  8436997 atcattctcatgacttcacattagaatt 8436970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35504596 - 35504427
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| || | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  35504596 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaa 35504497  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttt 190  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  35504496 ttgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42342934 - 42342775
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||   |  |||    
T  42342934 actttgtggtgtattacacttaaaacaag-taagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttt 42342838  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaactt 210  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  42342837 tgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 15992483 - 15992636
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| || |||| ||| |||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||    
T  15992483 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatga 15992582  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 173  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15992583 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25668798 - 25668687
Alignment:
Q  103 tcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| |||    
T  25668798 tcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtta-agt 25668700  T
Q  203 attaacttcacca 215  Q
     ||||||||||||    
T  25668699 gttaacttcacca 25668687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 26317774 - 26317855
Alignment:
Q  167 gtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26317774 gtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaatt 26317855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 13956305 - 13956516
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||    
T  13956305 gatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatga 13956404  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||       ||          |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  | |||    
T  13956405 attgatgatac-------at----------atgcaagtgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaa 13956487  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13956488 agtcattttcatgacttcaccgtagaatt 13956516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11898138 - 11898014
Alignment:
Q  116 atgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |  | |||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  11898138 atgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacca 11898039  T
Q  216 aaaaagtcattttcatgacttcacc 240  Q
     |||||| ||| |||||||||||||    
T  11898038 gaaaagttattatcatgacttcacc 11898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22616542 - 22616498
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22616542 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 22616498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 248
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004548
Alignment:
Q  175 ttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtc-attttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaatt 16004548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5748520 - 5748437
Alignment:
Q  167 gtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaact-------tcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccata 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5748520 gtggggtgttactcattatatttttgacgttatagtgttaactgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcata 5748437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Original strand, 2888388 - 2888472
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||  | ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2888388 gatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10237462 - 10237418
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10237462 ttaacttcactagaaaagtcattttcatgacttcacaatagaatt 10237418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21320799 - 21320755
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21320799 ttaacttcatcaaaaaagtcatttttattacttcaccatagaatt 21320755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33163561 - 33163517
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33163561 ttaactccaccgaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaatt 33163517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22255659 - 22255608
Alignment:
Q  168 tggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22255659 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 22255608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35504214 - 35504171
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35504214 taacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaacatagaatt 35504171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25669777 - 25669740
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagt 98  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25669777 ttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt 25669740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26411338 - 26411297
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26411338 acttcaccaaaaaaatcattctaatgacttcaccatagaatt 26411297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13380543 - 13380499
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13380543 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatt 13380499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27579087 - 27579043
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  27579087 ttaacttcaccaaaaaagtcgttttcacgatttcaccataaaatt 27579043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 36493668 - 36493895
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36493668 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaa 36493767  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36493768 ttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaa 36493867  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  36493868 gttattttcatgacttcaccatagaatt 36493895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 35021014 - 35021242
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  35021014 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatga 35021113  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| | |||   ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||    
T  35021114 attgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaa 35021213  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021214 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 35021242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9139462 - 9139251
Alignment:
Q  36 tcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg 134  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  9139462 tcttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatg 9139363  T
Q  135 gggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgac 234  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9139362 gggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcac--tattttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgac 9139265  T
Q  235 ttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||    
T  9139264 ttcaccatagaatt 9139251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 25701039 - 25701264
Alignment:
Q  25 ttatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaatt 122  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  25701039 ttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaatt 25701138  T
Q  123 gatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagt 222  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25701139 gatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagt 25701238  T
Q  223 cattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25701239 cattatcatgacttcaccataaaatt 25701264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Original strand, 55241090 - 55241311
Alignment:
Q  27 atgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | | || |||||||    
T  55241090 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgat 55241188  T
Q  126 gatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  55241189 gatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcat 55241288  T
Q  226 tttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  55241289 tctcatgacttcaccatagaatt 55241311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 37663720 - 37663946
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  37663720 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 37663819  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  37663820 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttcatcaaaaa 37663917  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37663918 agtcattcttatgacttcaccatagaatt 37663946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17173522 - 17173294
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| ||| | | ||||    
T  17173522 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17173423  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | ||||||||| || |||    
T  17173422 attaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaa 17173323  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17173322 agtcattttcgtaacttcaccatagaatt 17173294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25184344 - 25184117
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||     
T  25184344 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgag 25184245  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25184244 ttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaata 25184145  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25184144 gtcattctcatgacttcaccatagaatt 25184117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17167945 - 17167717
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| ||| | | ||||    
T  17167945 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17167846  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | ||||||||| || |||    
T  17167845 attaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaa 17167746  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17167745 agtcattttcgtaacttcaccatagaatt 17167717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38012086 - 38011858
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  38012086 gatattatgtgatagtcttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38011987  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||||| || ||||||||| |||    
T  38011986 attgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaa 38011887  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38011886 agtcattctcatgatttcaccatagaatt 38011858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50697473 - 50697246
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  50697473 gatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 50697374  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  50697373 attgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttcactaaaaa 50697275  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50697274 aatcatttttatgacttcaccgtagaatt 50697246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 55477870 - 55478102
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  55477870 gatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 55477969  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgt----acaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacca 215  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||    ||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  55477970 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 55478069  T
Q  216 aaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  55478070 aaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 55478102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 19089432 - 19089660
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| | || | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  19089432 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19089531  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19089532 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaa 19089631  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  19089632 agttattcttatgacttcaccatagaatt 19089660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 28002965 - 28003193
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||    
T  28002965 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatga 28003064  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||| | |||| ||| |||||| || ||||||||| |||    
T  28003065 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaa 28003164  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28003165 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 28003193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 34948074 - 34948304
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagt--gttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||    
T  34948074 gatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgat 34948173  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  34948174 gaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccaga 34948273  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34948274 aaagtcattctcatgacttcaccataaaatt 34948304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37775871 - 37775673
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  37775871 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggg--gaacttt 37775774  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37775773 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcaccgtagaat 37775674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33341630 - 33341399
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||    
T  33341630 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatga 33341531  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc---actat-attttttatgttatagtattaacttcacca 215  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || || | |||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  33341530 attgatgatactat-gggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcacca 33341432  T
Q  216 aaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33341431 gaaaaatcattctcatgacttcactatagaatt 33341399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42199961 - 42199736
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  42199961 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42199862  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || | |||||| | |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42199861 attgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaa 42199762  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||    
T  42199761 aatcattcttatgatttcaccataga 42199736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6864267 - 6864039
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || |    
T  6864267 gatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataa 6864168  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6864167 attgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaa 6864068  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  6864067 agtcattctcatgacatcaccatacaatt 6864039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 46888137 - 46888354
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  46888137 gatattatgtgatagtct-aagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 46888235  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  46888236 attaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaa 46888335  T
Q  220 agtcattttcatgacttca 238  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  46888336 agttattttcttgacttca 46888354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 19440627 - 19440856
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||  || ||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  19440627 gatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19440726  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19440727 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaa 19440826  T
Q  220 agtcattttcatgac-ttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19440827 agtcattctcatgactttcaccatagaatt 19440856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 879527 - 879747
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||    
T  879527 gatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatga 879626  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  879627 gttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaa 879726  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
    | | ||| |||||||||||||    
T  879727 aattattctcatgacttcacc 879747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 32912559 - 32912787
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | || |    
T  32912559 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataa 32912658  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| |   ||||||||||||  || | |||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32912659 attgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 32912758  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32912759 agtcattcttatgacttcaccatagaatt 32912787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 34361471 - 34361698
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||    ||||    
T  34361471 gatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatga 34361570  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| || | |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34361571 attgatgatattatgaggct-gaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 34361669  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34361670 agtcattcttatgacttcaccatagaatt 34361698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47253972 - 47253753
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |         
T  47253972 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatct----- 47253878  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
       |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47253877 ---gatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggg-tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaa 47253782  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47253781 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 47253753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7703741 - 7703521
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |         
T  7703741 gatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatct----- 7703647  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  7703646 ---gatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 7703550  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  7703549 agtcattctcatgactttaacatagaatt 7703521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49376199 - 49375970
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttaca-cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || | |||||| ||||| |  |||||||||||| |||  || |||||||||| | ||||    
T  49376199 gatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatga 49376100  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacca-aaa 218  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||| |||| | |||||||||||| |||    
T  49376099 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaa 49376000  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49375999 aagtcattctcatgacttcaccgtagaatt 49375970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4598195 - 4597997
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  4598195 actttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttt 4598097  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  4598096 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-ctttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccataaaat 4597998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 4934181 - 4934356
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  4934181 gatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 4934280  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttat 194  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  4934281 aatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttttat 4934356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23761303 - 23761089
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||   ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  23761303 gatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 23761205  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| || | ||     
T  23761204 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaat 23761105  T
Q  220 agtcattttcatgact 235  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23761104 agtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 54499217 - 54499424
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  54499217 atatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatga 54499316  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccact-gtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  54499317 attgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaa 54499416  T
Q  219 aagtcatt 226  Q
    ||||||||    
T  54499417 aagtcatt 54499424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 29584179 - 29584405
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggttta-cacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   ||||  |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||  ||||| | ||||    
T  29584179 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 29584278  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  29584279 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 29584376  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||    
T  29584377 agtcattcccacgacttcaccatagaatt 29584405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27396848 - 27396620
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||    
T  27396848 gatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 27396749  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  | | |||| ||| |||| | |||||||||||| |||    
T  27396748 attgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaa 27396649  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27396648 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 27396620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 5047945 - 5048172
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||    
T  5047945 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaa 5048044  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  |||||||||||| |||  ||||||||| | |||| |||||||||  || ||||||||| ||||    
T  5048045 ttgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaa 5048144  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     ||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  5048145 atcattctcataacttcattatagaatt 5048172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32592297 - 32592097
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32592297 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttt 32592198  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | | | |||| ||  | |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  32592197 tgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaataaaat 32592098  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  32592097 t 32592097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3042851 - 3042615
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||    
T  3042851 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatga 3042752  T
Q  120 attgatg--------atactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttc 211  Q
    |||||||        ||||| |   || |||| |||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3042751 attgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttc 3042652  T
Q  212 accaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3042651 accaaaaaaatcatttttatgatttcaccatagaatt 3042615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50764901 - 50764746
Alignment:
Q  81 gataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 180  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50764901 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactc 50764802  T
Q  181 actatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttca 238  Q
    || | | |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  50764801 acaacacttttgatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgacttca 50764746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37287960 - 37287737
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt--ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||    
T  37287960 gatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttat 37287861  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc-aa 216  Q
    ||        || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  37287860 ga--------tattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaa 37287769  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37287768 aaaagtcattctcattacttcaccatagaatt 37287737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39398113 - 39397922
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||         |||||||||  |  || ||||||||    
T  39398113 actttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatt---------gatgatactgagaagactgaacttt 39398023  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39398022 tgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaat 39397923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 245
Target Start/End: Original strand, 30002639 - 30002828
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |        |||||||||| |  || ||||||||    
T  30002639 actttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct--------gatgatactaagaagactgaacttt 30002730  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||| || ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30002731 tgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccataga 30002828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Original strand, 33816540 - 33816728
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33816540 actttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttt 33816639  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 236  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| | |||| ||| || | | || ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  33816640 tgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 35025575 - 35025795
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggttt-acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |  |||||||||||| |         
T  35025575 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatct----- 35025669  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
       |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||||| |||    
T  35025670 ---gatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaa 35025766  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35025767 aatcattttcatgacttcagcatagaatt 35025795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1815533 - 1815409
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
T  1815533 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatga 1815434  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaac 144  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1815433 attgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32579678 - 32579448
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||    
T  32579678 gatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatga 32579579  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgt---acaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaa 216  Q
    | |||| ||||||| | || | ||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||  | |||| |||||||| | || |||||||||     
T  32579578 actgataatactat-gagactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccag 32579480  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  32579479 aaaagtcattctcagaacttcaccataaaatt 32579448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4396418 - 4396330
Alignment:
Q  160 acaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4396418 acaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaatt 4396330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205120
Alignment:
Q  147 ttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaa 246  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||  | |||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  247 tt 248  Q
    ||    
T  4205121 tt 4205120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53124372 - 53124291
Alignment:
Q  167 gtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  53124372 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataatt 53124291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 248
Target Start/End: Original strand, 7152235 - 7152313
Alignment:
Q  170 gggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7152235 gggtgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaatt 7152313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17272196 - 17272084
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||  ||||| | ||||    
T  17272196 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 17272097  T
Q  120 attgatgatacta 132  Q
    |||||||||||||    
T  17272096 attgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 211
Target Start/End: Original strand, 23518402 - 23518473
Alignment:
Q  140 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttc 211  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  23518402 tgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaacttc 23518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Original strand, 38812254 - 38812304
Alignment:
Q  198 atagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38812254 ataggattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 38812304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 46884179 - 46884241
Alignment:
Q  186 attttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  46884179 attttttatgttacggtgttaacttcgccaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaatt 46884241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52516655 - 52516601
Alignment:
Q  194 tgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52516655 tgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttcaccataaaatt 52516601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2704560 - 2704516
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2704560 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaatt 2704516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17272075 - 17272015
Alignment:
Q  188 tttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  17272075 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaatt 17272015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 20097491 - 20097535
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20097491 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 20097535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 47073657 - 47073701
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47073657 ttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccatagaatt 47073701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 51204627 - 51204583
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51204627 ttaacttcaccagaaaagtcatttttatgacttcaccatagaatt 51204583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38811868 - 38811817
Alignment:
Q  197 tatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38811868 tataggattaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 38811817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9743636 - 9743592
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9743636 ttaatttcaccaaaaaagtcatttacatgactttaccatagaatt 9743592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49878683 - 49878640
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49878683 ttaacttcaccaaaaaagtcattatcat-acttcaccatagaatt 49878640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 54995799 - 54995843
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  54995799 ttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgacttcatcgtagaatt 54995843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42063050 - 42063007
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42063050 taacttcaccaaaaaagtcaattgaatgacttcaccatagaatt 42063007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47028147 - 47028104
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  47028147 taacttcaccaaaaaagtcaattgaatgacttcaccatagaatt 47028104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 46884089 - 46884177
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgtta 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||||| | | |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46884089 gatattatgtgatagt-ttaagtgttacattttgtgagatgttagcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Original strand, 53337559 - 53337620
Alignment:
Q  187 ttttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53337559 ttttttatgttttagtgttaactttatcagaaaaatcattatcatgactttaccatagaatt 53337620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 2266856 - 2266900
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2266856 ttaacttcactagaaaagtcattatcatgacttcaccatataatt 2266900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17612383 - 17612339
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17612383 ttaacttcattaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 17612339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 28293237 - 28293281
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  28293237 ttaacttcaccgaaaaagtcattctcatgacttcagcgtagaatt 28293281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33255547 - 33255503
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  33255547 ttaacttcaccaaaaaagtgattctcgtgacttcaccatataatt 33255503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47236912 - 47236868
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47236912 ttaacttaaccaaaaaaatcattttcatgatttcaccataaaatt 47236868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 6098477 - 6098705
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  6098477 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatga 6098576  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6098577 attgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaa 6098676  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6098677 agttattttcatgacttcaccatagaatt 6098705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 37970478 - 37970704
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  37970478 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatga 37970577  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37970578 attgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 37970677  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaa 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37970678 agtcattctcatgacttcaccatagaa 37970704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 16446834 - 16447062
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  16446834 gatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 16446933  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| | || |||    
T  16446934 attgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaa 16447033  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16447034 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 16447062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 27082797 - 27083025
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27082797 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 27082896  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  27082897 attgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaa 27082996  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  27082997 agtcagtctgatgacttcaccatagaatt 27083025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 36694925 - 36695153
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| ||| | | ||||    
T  36694925 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 36695024  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||| || |||    
T  36695025 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaa 36695124  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36695125 agtcattttcctgacttcaccatagaatt 36695153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1205158 - 1204938
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  1205158 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatga 1205059  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1205058 actgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaa 1204959  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  1204958 agtcattctcatgacttcacc 1204938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 248
Target Start/End: Original strand, 10555207 - 10555389
Alignment:
Q  66 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaac 165  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10555207 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaac 10555306  T
Q  166 agtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10555307 agtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaatt 10555389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9864379 - 9864151
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| | | ||||    
T  9864379 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatga 9864280  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||| |||| |||||||||||    
T  9864279 attgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaa 9864180  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  9864179 agtcattttcgtgacttcattatagaatt 9864151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38644209 - 38643981
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  38644209 gatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38644110  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38644109 attgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaa 38644010  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38644009 agtcattctcatgatttcaccatagaatt 38643981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Original strand, 43643555 - 43643782
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||     
T  43643555 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgag 43643654  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43643655 ttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaata 43643754  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43643755 gtcattctcatgacttcaccatagaatt 43643782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 23854390 - 23854615
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||    
T  23854390 gatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatga 23854489  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23854490 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 23854589  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23854590 agtcattctcatgacttcaccgtaga 23854615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 466045 - 465845
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  466045 actttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttt 465946  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  465945 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttcaccataaaat 465846  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  465845 t 465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13307854 - 13307626
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||    
T  13307854 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatga 13307755  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  13307754 attgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 13307655  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13307654 aatcattctcatgacttcaccatagaatt 13307626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12876341 - 12876112
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtctt-aagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||| | |||    
T  12876341 gatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatg 12876242  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  12876241 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaa 12876142  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12876141 aagtcattttcgtgacttaaccatagaatt 12876112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16223094 - 16222866
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  16223094 gatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 16222995  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  16222994 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaa 16222895  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  16222894 agtcattctcatgatttcaccgtagaatt 16222866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11727255 - 11727037
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  11727255 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatga 11727156  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11727155 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 11727056  T
Q  220 agtcattttcatgacttca 238  Q
    | ||||| |||| ||||||    
T  11727055 aatcattctcataacttca 11727037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34895168 - 34894970
Alignment:
Q  51 tttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttg 149  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  34895168 tttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttg 34895069  T
Q  150 atgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34895068 atgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 34894970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 5299905 - 5300133
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  5299905 gatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 5300004  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || | | |||| ||| |||||| |||||||||  |||||    
T  5300005 attgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaa 5300104  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5300105 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 5300133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 1150092 - 1150292
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  1150092 actttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttt 1150191  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1150192 tgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaat 1150291  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  1150292 t 1150292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 30654542 - 30654770
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  30654542 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatga 30654641  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    | |||||||||||||  |  ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30654642 agtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 30654741  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||| | | |||||||||||||| ||||    
T  30654742 aatcactcttatgacttcaccataaaatt 30654770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41362705 - 41362521
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||    
T  41362705 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactata 41362606  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41362605 caaatagtggggtgttactcactaca-tttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaatt 41362521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 31933845 - 31934073
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  31933845 gatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 31933944  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  31933945 attgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaa 31934044  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||| |||||||  |||||||    
T  31934045 aatcattctcataacttcacgttagaatt 31934073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40862649 - 40862422
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||| | | |  ||    
T  40862649 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaa 40862550  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttt-atgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||    
T  40862549 ttgatgataccatgag-actgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaa 40862451  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  40862450 agttattttcgtgacttcactatagaatt 40862422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 34952031 - 34952218
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  34952031 ttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgta 34952130  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  34952131 caaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaatt 34952218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 1149592 - 1149762
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  1149592 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgag 1149691  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttt 191  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  1149692 ttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 41910947 - 41911175
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||    
T  41910947 gatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 41911046  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41911047 attgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaa 41911146  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  41911147 aaatca-tatcatgacttcatcgtagaatt 41911175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 7890916 - 7891135
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  7890916 gatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatga 7891015  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||         ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  7891016 attgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgt---------tatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 7891106  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7891107 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 7891135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 8803776 - 8803993
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | || |    
T  8803776 gatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataa 8803875  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||       |  ||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8803876 attgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 8803968  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||    
T  8803969 agtcat----atgacttcaccatagaatt 8803993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 39099078 - 39099237
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||    
T  39099078 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 39099177  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttact 179  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  39099178 attgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44869728 - 44869499
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||||| | || |    
T  44869728 gatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtggggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataa 44869629  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcac--tatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  | ||||||   ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44869628 attgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg-atcactcacaaaatacttttaatgttatagtgttaacttcaccaaa 44869530  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| ||| | || | |||||| |||||||    
T  44869529 aaagttattcttataatttcaccgtagaatt 44869499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 1953951 - 1954104
Alignment:
Q  25 ttatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| | |||||||    
T  1953951 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaatt 1954050  T
Q  123 gat-gatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 175  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  1954051 gatagatactatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 35459670 - 35459885
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| | ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  35459670 gatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35459769  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||              | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  35459770 gttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagtg-------------aagattttttatattatagtattaactttacgaaaaa 35459856  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35459857 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 35459885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33906443 - 33906227
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  33906443 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33906344  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || |||||||            || ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||  |||||| || ||||||||| |||    
T  33906343 attgatgatactatgaagactgaactt------------tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaa 33906256  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  33906255 agtcattctcataatttcaccatagaatt 33906227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Original strand, 4132645 - 4132750
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4132645 gatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacacttaaa-caaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 4132743  T
Q  120 attgatg 126  Q
    |||||||    
T  4132744 attgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133195
Alignment:
Q  128 tactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattt 227  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||     
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  228 tcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||||| |||||| ||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaatt 4133195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43025933 - 43025771
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||| ||| | | ||||    
T  43025933 gatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatga 43025834  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcac 182  Q
    |||||||||| |||  | | ||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  43025833 attgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcac 43025771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15009306 - 15009245
Alignment:
Q  187 ttttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15009306 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaatt 15009245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7998485 - 7998407
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggga 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  7998485 ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatgggga 7998407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 23176763 - 23176805
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23176763 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaa 23176805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 245
Target Start/End: Original strand, 8151412 - 8151453
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8151412 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactgcaccataga 8151453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Original strand, 35735983 - 35736028
Alignment:
Q  203 attaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35735983 attaacttcaccaaaaaagtcattctaatgacttcaccatagaatt 35736028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 4108912 - 4108956
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4108912 ttaactttaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaatt 4108956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5018058 - 5018014
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5018058 ttaacttcactaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatt 5018014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 243
Target Start/End: Original strand, 41191019 - 41191058
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccata 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41191019 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccata 41191058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 6446709 - 6446750
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6446709 acttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatt 6446750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Original strand, 24823407 - 24823455
Alignment:
Q  196 ttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatag 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  24823407 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatag 24823455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 28220955 - 28220999
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28220955 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactttatcatagaatt 28220999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33197997 - 33197947
Alignment:
Q  103 tcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgc 153  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  33197997 tcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38110402 - 38110357
Alignment:
Q  203 attaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38110402 attaacttcatcagaaaaatcattttcatgacttcaccataaaatt 38110357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7998402 - 7998366
Alignment:
Q  212 accaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7998402 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 7998366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18259286 - 18259238
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaa 96  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18259286 actttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaa 18259238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33197955 - 33197895
Alignment:
Q  188 tttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | || |||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33197955 ttttgatgctatagtattaacttaatcagaaaaattattctcatgacttcaccatagaatt 33197895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 10181956 - 10182184
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  10181956 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 10182055  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10182056 attgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaa 10182155  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10182156 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 10182184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42721267 - 42721039
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  42721267 gatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42721168  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  42721167 attgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaa 42721068  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42721067 aatcattttcatgacttcaccatagaatt 42721039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15752257 - 15752029
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  15752257 gatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15752158  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15752157 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 15752058  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15752057 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 15752029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 9903002 - 9903215
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9903002 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 9903101  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9903102 attgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 9903201  T
Q  220 agtcattttcatga 233  Q
    ||||||||||||||    
T  9903202 agtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18422879 - 18422651
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  18422879 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 18422780  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18422779 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 18422680  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18422679 agtcatttttatgacttcaccatagaatt 18422651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2959976 - 2959748
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||    
T  2959976 gatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatga 2959877  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  2959876 attgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaa 2959777  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2959776 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 2959748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10922955 - 10922727
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  10922955 gatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10922856  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10922855 gttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 10922756  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  10922755 aatcattctcatgatttcaccataaaatt 10922727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 27267148 - 27267364
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27267148 gatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 27267246  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  27267247 attgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaa 27267344  T
Q  220 agtcattttcatgacttcac 239  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  27267345 aatcattctcatgacttcac 27267364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41926373 - 41926163
Alignment:
Q  39 taagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggg 137  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  41926373 taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactataggg 41926274  T
Q  138 attgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 237  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  41926273 actgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttc 41926174  T
Q  238 accatagaatt 248  Q
    |||||||||||    
T  41926173 accatagaatt 41926163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38823442 - 38823214
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  38823442 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38823343  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | | |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||    
T  38823342 attgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaa 38823243  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38823242 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 38823214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16415874 - 16415645
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16415874 gatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatga 16415775  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaaca-gtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  16415774 attgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaa 16415675  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16415674 aagtcattctcatgacttcaccttagaatt 16415645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15383161 - 15382933
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  15383161 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15383062  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  15383061 attgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaa 15382962  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15382961 agtcatttttataacttcaccatagaatt 15382933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 19899717 - 19899945
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  19899717 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 19899816  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19899817 attgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 19899916  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19899917 aatcattattatgacttcaccatagaatt 19899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32216283 - 32216088
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  32216283 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatga 32216184  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacca 215  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32216183 attgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 27227433 - 27227653
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  27227433 gatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 27227532  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||      | || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  27227533 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg------agtacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaa 27227624  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27227625 aatcattctcatgacttcaccatagaatt 27227653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 27532929 - 27533155
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||    
T  27532929 gatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatga 27533027  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  27533028 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaa 27533127  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  27533128 agtcattctcataactttatcatagaat 27533155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47279417 - 47279196
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  47279417 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 47279318  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||  |||| | ||||||||||||||||    
T  47279317 attgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaa 47279218  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacca 241  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  47279217 aatcattctcatgacttcacca 47279196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 238461 - 238688
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | | || |    
T  238461 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatta 238560  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||| | |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  238561 attgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaa 238659  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  238660 agttattttcgtgacttcactatagaatt 238688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 27563856 - 27564082
Alignment:
Q  24 attatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27563856 attatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 27563955  T
Q  123 gatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcac-caaaaaag 221  Q
    ||| ||| ||| || | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||     
T  27563956 gataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaa 27564055  T
Q  222 tcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  27564056 tcattttcataacttcaccgtagaatt 27564082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28769881 - 28769653
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  28769881 gatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatg 28769782  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  28769781 aattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaa 28769683  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28769682 aagttatttttatgacttcaccatagaatt 28769653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23999575 - 23999347
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  23999575 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 23999476  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23999475 attgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaa 23999376  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23999375 aatcattcttatgacttcaccataaaatt 23999347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 30326900 - 30327128
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  30326900 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatga 30326999  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  30327000 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaa 30327099  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30327100 agtcatttttatgacttcactatagaatt 30327128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32267262 - 32267034
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||     
T  32267262 gatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgg 32267163  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||| |||||    
T  32267162 gttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaa 32267063  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  32267062 agtcattcttatgacttcaccataaaatt 32267034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48620837 - 48620637
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48620837 actttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttt 48620738  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  48620737 tgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaat 48620638  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  48620637 t 48620637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14758228 - 14758049
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14758228 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgta 14758129  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcacc 240  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14758128 caaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacc 14758049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51129087 - 51128884
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  51129087 gatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatga 51128988  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51128987 attgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaa 51128888  T
Q  220 agtc 223  Q
    ||||    
T  51128887 agtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8222356 - 8222131
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  8222356 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 8222257  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||   ||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8222256 attgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaa 8222160  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8222159 ggtcatttttatgacttcaccgtagaatt 8222131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37451513 - 37451292
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  37451513 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataa 37451414  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37451413 attgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaa 37451315  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  37451314 agtcatttttatgacttcaccat 37451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 47682442 - 47682669
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||    
T  47682442 gatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatga 47682541  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg-gtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  47682542 attgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaa 47682639  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  47682640 aagtcactctcatgacttcaccataaaatt 47682669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 7079011 - 7079250
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7079011 gatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 7079110  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaac-----------agtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaac 208  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||           ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||| |||||    
T  7079111 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaac 7079210  T
Q  209 ttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  7079211 ttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccataaaatt 7079250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1547507 - 1547287
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||||| |         
T  1547507 gatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatct----- 1547413  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
       |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1547412 ---gatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaa 1547316  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1547315 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 1547287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 28564731 - 28564951
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||  ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  28564731 gatattatgtgatagt--taagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 28564828  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28564829 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 28564928  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccat 242  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  28564929 aatcattttcataacttcaccat 28564951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 34012355 - 34012553
Alignment:
Q  51 tttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttg 149  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  34012355 tttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttg 34012454  T
Q  150 atgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34012455 atgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaatt 34012553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4330509 - 4330288
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | || |    
T  4330509 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataa 4330410  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagt-attaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||  ||| ||||| || |    
T  4330409 attgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcaga 4330310  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcac 239  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  4330309 aaagtcattctcataacttcac 4330288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 31621502 - 31621729
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  31621502 gatattatgcgatagtcttaagtgtcacacttc-tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31621600  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| || |  ||| |||||||||| || ||||||| | |||    
T  31621601 attgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaa 31621700  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31621701 agtcattctcatgacttcaccgtagaatt 31621729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30254649 - 30254424
Alignment:
Q  23 tattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30254649 tattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaat 30254550  T
Q  122 tgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaag 221  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  30254549 tgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaag 30254451  T
Q  222 tcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||    
T  30254450 tcattcttataacttcaccatagaatt 30254424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25160860 - 25160710
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  25160860 gatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatga 25160761  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 170  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25160760 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15168324 - 15168089
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||    
T  15168324 gatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatga 15168225  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccac-------tgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||    
T  15168224 attgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttca 15168125  T
Q  213 ccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  15168124 ccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaatt 15168089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3309311 - 3309148
Alignment:
Q  84 aaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcact 183  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  3309311 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcaca 3309213  T
Q  184 atattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | | |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3309212 acacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaatt 3309148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39393603 - 39393383
Alignment:
Q  30 tgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatga 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||| | ||||||| ||||    
T  39393603 tgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatga 39393504  T
Q  128 tactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| | | |||| ||| |||||| |||||||||  | ||||||||||     
T  39393503 tactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattc 39393404  T
Q  228 tcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  39393403 tcataacttcaccgtagaatt 39393383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 11742340 - 11742526
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  11742340 ttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatggg-actgaacttttgatgtcactgta 11742438  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  11742439 caaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaaatt 11742526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 33725548 - 33725776
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  33725548 gatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 33725647  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||| |||||| || |||||| || | |||| ||| |||||  || ||||||| | |||    
T  33725648 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaa 33725747  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  33725748 agtcattctcttgactttaccatagaatt 33725776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 248
Target Start/End: Original strand, 37618886 - 37619072
Alignment:
Q  66 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgata--ctatggggattgaacttttgatgccactgtacaa 163  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||| || | |||||    
T  37618886 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaa 37618985  T
Q  164 acagtggggtgtt--actcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  37618986 acagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatt 37619072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46931637 - 46931408
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  46931637 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 46931540  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcac---caa 216  Q
    |||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||    ||    
T  46931539 attgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 46931440  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  46931439 aaaattcattcttataacttcaccatagaatt 46931408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40885041 - 40884841
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||  | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  | |||||||||| | ||||    
T  40885041 gatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 40884942  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| || || ||||||||| |||    
T  40884941 attgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaa 40884842  T
Q  220 a 220  Q
    |    
T  40884841 a 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3535142 - 3534932
Alignment:
Q  39 taagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggg 137  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||| ||| || ||||    
T  3535142 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaagggg 3535043  T
Q  138 attgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 237  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||| | |||| | ||| | ||||||||    
T  3535042 actgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttc 3534943  T
Q  238 accatagaatt 248  Q
    |  ||||||||    
T  3534942 ataatagaatt 3534932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289668
Alignment:
Q  104 cttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacta-------tattttttatgt 196  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  197 tatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaataga 21289668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 27763260 - 27763458
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || ||    
T  27763260 atattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaa 27763359  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||| || | |||||||  | |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27763360 ttgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaa 27763458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22170939 - 22170807
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||    
T  22170939 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatga 22170840  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatg 152  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  22170839 attgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38759761 - 38759583
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||| || ||||| | ||||    
T  38759761 gatattatctgatagtctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatga 38759662  T
Q  120 attgatgatactatgggga----ttgaacttttgatgccactgtacaaac--agtggggtgttactcactatatttttt 192  Q
    |||||||||| || |  ||     ||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  38759661 attgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgtcactgtacaaacagagcgaggtgttactcactatatttttt 38759583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30254948 - 30254858
Alignment:
Q  157 tgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||| |||||  || || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30254948 tgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaatt 30254858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 13876919 - 13876963
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13876919 ttaacttcaccataaaagtcattttcataacttcaccatagaatt 13876963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22170814 - 22170754
Alignment:
Q  188 tttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22170814 ttttgatgttatagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatgatttcaccatagaatt 22170754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 42663785 - 42663829
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42663785 ttaacttcactaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatt 42663829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1360022
Alignment:
Q  122 tgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca 212  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || | |||||||| ||   | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacactgaaatatta-tcactatatttttaatgttatagtattaacttca 1360022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47279204 - 47279166
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47279204 acttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccataga 47279166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 4150490 - 4150531
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4150490 acttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatt 4150531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26970309 - 26970265
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26970309 ttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccataaaatt 26970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43579290 - 43579246
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43579290 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 43579246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45319654 - 45319611
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  45319654 taacttcaccaaaaaagtcaattgaatgacttcaccatagaatt 45319611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16127568 - 16127536
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16127568 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactt 16127536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16132523 - 16132479
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  16132523 ttaacttcaccaaaaaagtcaatctattgacttcaccatagaatt 16132479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37347228 - 37347001
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  37347228 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaa 37347129  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37347128 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaa 37347029  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37347028 atcattttcatgacttcaccataaaatt 37347001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18797534 - 18797308
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  18797534 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 18797435  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18797434 gttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgt--tagtgttaacttcaccaaaaa 18797337  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18797336 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 18797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 31520719 - 31520905
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  31520719 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggg-actgaacttttgatgtcactgta 31520817  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31520818 caaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaatt 31520905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38258752 - 38258524
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  38258752 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38258653  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38258652 attgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 38258553  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38258552 aatcatttttatgacttcaccgtagaatt 38258524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21991843 - 21991615
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  21991843 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 21991744  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  21991743 attgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaa 21991644  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21991643 aatcattctcatgacttcaccctagaatt 21991615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 32821007 - 32821235
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  32821007 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatga 32821106  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  32821107 attgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaa 32821206  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32821207 aatcattttcatgacttcaccatagaatt 32821235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23111399 - 23111169
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgata--aaattagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23111399 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaat 23111300  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  23111299 gaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaga 23111200  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23111199 aaaatcattttcatgacttcaccacagaatt 23111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11071413 - 11071184
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||    
T  11071413 gatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatga 11071314  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  11071313 attgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagtactaactttaccaaaaa 11071214  T
Q  220 agt-cattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11071213 aatacattttcatgacttcaccatagaatt 11071184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27283950 - 27283723
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  27283950 atattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaa 27283851  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27283850 ttgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 27283751  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27283750 atcatttttataacttcaccatagaatt 27283723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4583126 - 4582898
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  4583126 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4583027  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  4583026 attgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaa 4582927  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4582926 agtcattttcgtgacttcaccatagaatt 4582898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43686247 - 43686020
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  43686247 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 43686148  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  43686147 attgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaa 43686049  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43686048 agtcattttcgtgacttcaccatagaatt 43686020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37110081 - 37109851
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtat--gataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||    
T  37110081 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgat 37109982  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||||| |||   || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37109981 gaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaa 37109882  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37109881 aaagtcatttttatgacttcaccatagaatt 37109851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24211948 - 24211720
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  24211948 gatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 24211849  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24211848 attgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 24211749  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24211748 agtcattcttatgacttcaccatagaatt 24211720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413562
Alignment:
Q  39 taagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggg 137  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  138 attgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca-ccaaaaaagtcattttcatgactt 236  Q
    |  |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactt 44413550  T
Q  237 caccatagaatt 248  Q
     |||||||||||    
T  44413551 taccatagaatt 44413562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22687446 - 22687228
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||    
T  22687446 gatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatga 22687347  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  22687346 attgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaa 22687247  T
Q  220 agtcattttcatgacttca 238  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22687246 agtcattctcatgacttca 22687228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 5657435 - 5657663
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || | |||||||| | ||||    
T  5657435 gatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatga 5657534  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  5657535 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaa 5657634  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5657635 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 5657663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7335001 - 7334773
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  7335001 gatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatga 7334902  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7334901 gttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 7334802  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  7334801 agtcattctcacgacttcaccgtagaatt 7334773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 41765032 - 41765260
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  41765032 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 41765131  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| | || |||    
T  41765132 attgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaa 41765231  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41765232 agtcattctcatgacttcaccatggaatt 41765260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 17842538 - 17842768
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtat--gataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||    
T  17842538 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgat 17842637  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||||| |||   || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17842638 gaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaa 17842737  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17842738 aaagtcatttttatgacttcaccatagaatt 17842768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30055734 - 30055505
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  30055734 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 30055635  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca-ccaaaa 218  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||||| ||||||||| | ||||    
T  30055634 attaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaa 30055535  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30055534 aagtcattcttatgacttcaccatagaatt 30055505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 9355780 - 9356008
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  9355780 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9355879  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| | |||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||     
T  9355880 attaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaat 9355979  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9355980 ggtcattctcatgacttcaccataaaatt 9356008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10481812 - 10481582
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||    
T  10481812 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatga 10481713  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca-ccaaa 217  Q
    ||||||||||||||   || |||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  10481712 attgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcattaaaa 10481613  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  10481612 aaagtcattctcctaactttaccatagaatt 10481582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 15612713 - 15612940
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||    
T  15612713 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 15612812  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    ||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  15612813 attgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactca-taacactttgatgttatagtgttaacttcacaagaaa 15612911  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||    
T  15612912 cgttattctcatgacttcaccatagaatt 15612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 31579018 - 31579251
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  31579018 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31579117  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta-----caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc 214  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||      |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31579118 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacc 31579217  T
Q  215 aaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  31579218 aaaaaaattattcttatgacttcaccatagaatt 31579251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 10359172 - 10359396
Alignment:
Q  25 ttatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatt-aagtatagtcttgttaatttaatgaatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||||||    
T  10359172 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaatt 10359271  T
Q  123 gatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagt 222  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||  ||||| || |||| ||||||    
T  10359272 gatgatactatcag-actgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagt 10359370  T
Q  223 cattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  10359371 cattatcatgacttcaccatagaatt 10359396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6546726 - 6546498
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||    
T  6546726 gatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 6546627  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | | | |||| ||| |||||| |||||||||| | |||    
T  6546626 attgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaa 6546527  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  6546526 aatcattcttatgacttcaccatagaatt 6546498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8861492 - 8861264
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || | |||||||| | || |    
T  8861492 gatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgatta 8861393  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||| ||| |||||| |||||||| | | |||    
T  8861392 attgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaa 8861293  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8861292 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 8861264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12165931 - 12165731
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||   |||| | ||||||    
T  12165931 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttt 12165832  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  12165831 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaacgacttcaccgtagaat 12165732  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  12165731 t 12165731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32432659 - 32432436
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | || |||||||| | | ||||    
T  32432659 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatga 32432560  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | |||||     | ||||| |||||||||||| |||    
T  32432559 attgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttt-----tgatagtgttaacttcaccagaaa 32432465  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32432464 aatcattttcgtgacttcaccatagaatt 32432436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Original strand, 27421344 - 27421561
Alignment:
Q  31 gatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgata 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | || |||| ||||||    
T  27421344 gatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgata 27421443  T
Q  130 ctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttc 229  Q
     ||| || | ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27421444 ttatagg-actgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatc 27421542  T
Q  230 atgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||||||||||||    
T  27421543 acgacttcaccatagaatt 27421561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 25691498 - 25691727
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || | |||||||| | ||||    
T  25691498 gatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatga 25691597  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt-gttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||    
T  25691598 attgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaa 25691697  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25691698 aagtcattctcatgacttcaccataaaatt 25691727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26980489 - 26980325
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26980489 ttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgta 26980390  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcat 225  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  26980389 caaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 12390625 - 12390812
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||| |    
T  12390625 ttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgca 12390724  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  12390725 caaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaatt 12390812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 33688216 - 33688443
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  33688216 gatatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33688315  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  | | |||| |||||||||| ||||||| |||| |||    
T  33688316 attgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaa 33688414  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  33688415 agtcattctcataacttcaccatataatt 33688443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 48928518 - 48928745
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| || ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||    
T  48928518 gatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 48928617  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||| |||    
T  48928618 attgataatactatggg-actgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaa 48928716  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48928717 agtcattctcatgacttcaccataaaatt 48928745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 48928251 - 48928466
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||    
T  48928251 gatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 48928350  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||| |||    
T  48928351 attgataatactatggg-actgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaa 48928449  T
Q  220 agtcattttcatgactt 236  Q
    ||||||| |||||||||    
T  48928450 agtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29173704 - 29173541
Alignment:
Q  63 acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtaca 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  29173704 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 29173605  T
Q  163 aacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcatt 226  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||| ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29173604 aacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 29173541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37704364 - 37704147
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |    
T  37704364 gatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataa 37704265  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactata-ttttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||            ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  37704264 attgatgatactatggggactgaa-----------tctgtacaaacaatggggtgttactcactacatttttttatgctatagtgttaacttca-taaaa 37704177  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||||||| || | |||| |||||||||    
T  37704176 aaatcatttttataatttcatcatagaatt 37704147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38053644 - 38053464
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||| |||||| | | ||||||||||||| || ||||    
T  38053644 ttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaattt--------gatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgta 38053553  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaa-aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  38053552 caaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaaacattatcatgacctcaccattgaatt 38053464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44598873 - 44598735
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||    
T  44598873 gatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 44598774  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactg 158  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44598773 atttatgatactatggggattgaatttttgatgccactg 44598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 248
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524509
Alignment:
Q  103 tcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagt 202  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  203 attaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 26524509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 15672716 - 15672832
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||    
T  15672716 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 15672815  T
Q  120 attgatgatactatggg 136  Q
    |||||||||||||||||    
T  15672816 attgatgatactatggg 15672832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Original strand, 32593184 - 32593324
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||| | |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||  ||    
T  32593184 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgt-gagactgaacttttgataccaccata 32593282  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagt 202  Q
     ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  32593283 taaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagt 32593324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 37703452 - 37703590
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||           
T  37703452 gatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat------- 37703544  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaaca 166  Q
      |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37703545 -ctgatgatactatggagactgaacttttgatgtcactatacaaaca 37703590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43925308 - 43925084
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||  || ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | | || |    
T  43925308 gatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-a 43925210  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcac-caaaa 218  Q
     ||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||    |||||| |||||||||||| | |||||||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  43925209 gttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgt----acagtgaggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcactaaaaa 43925114  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  43925113 aaatcattttcgtgactttaccgtagaatt 43925084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362330
Alignment:
Q  122 tgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaag 221  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| |||||||  | | |||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  222 tcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaatt 34362330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 26588038 - 26588126
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgt 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  26588038 gatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Original strand, 46481083 - 46481218
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||           
T  46481083 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaat------- 46481175  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaa 163  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  46481176 -ctgatgatactatggggattgaatttttgatgtcattgtacaa 46481218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35353315 - 35353120
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggta--tgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||  || || |  |||  ||| |  |||||||||||| | ||    
T  35353315 gatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctag--taa-tgcagtcttgttaatctgat 35353219  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattg-aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacca 215  Q
    |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || |||||||||    
T  35353218 gaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 35353120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 241024 - 241065
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241024 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 241065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8299245 - 8299194
Alignment:
Q  197 tatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8299245 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatt 8299194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3953785 - 3953735
Alignment:
Q  198 atagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3953785 ataggattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcatcatagaatt 3953735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 240
Target Start/End: Original strand, 46481217 - 46481251
Alignment:
Q  206 aacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcacc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481217 aacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcacc 46481251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 23402371 - 23402415
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23402371 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcgccatagaatt 23402415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44598438 - 44598378
Alignment:
Q  153 ccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcac 213  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  44598438 ccactgtccaaacagtagagtgttactcacaacatttttgatattatagtattaacttcac 44598378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Original strand, 34095888 - 34095931
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  34095888 taacttcaccaaaaaagtcaattgaatgacttcaccatagaatt 34095931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 4618755 - 4618799
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4618755 ttaactttaccaaaaaaatcattttcatgactttaccgtagaatt 4618799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4902388 - 4902344
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  4902388 ttaaattcaccaaaaaaattattttcatgacttcaccataaaatt 4902344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 10675332 - 10675376
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10675332 ttaatttcatcagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatt 10675376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 22955312 - 22955352
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatag 244  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22955312 ttaacttcaccagaaaagtcattctcattacttcaccatag 22955352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40381988 - 40381944
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  40381988 ttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaatt 40381944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 46297715 - 46297943
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  46297715 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatga 46297814  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  46297815 attgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 46297914  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297915 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 46297943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37203290 - 37203062
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt-tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  37203290 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatga 37203191  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37203190 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 37203091  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37203090 aatcatttttatgacttcaccatagaatt 37203062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37157930 - 37157703
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  37157930 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataa 37157831  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37157830 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 37157732  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37157731 agccattttcatgacttcaccatagaatt 37157703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11467047 - 11466819
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  11467047 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 11466948  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||   |||||||||| ||||||||| || |||    
T  11466947 attgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaa 11466848  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11466847 agtcattctcaagacttcaccatagaatt 11466819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 52040875 - 52041096
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  52040875 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 52040974  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaaca-gtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  52040975 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaa 52041074  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcacc 240  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  52041075 aagtcattctcatgacttcacc 52041096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 22446018 - 22446246
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || || | |||||    
T  22446018 gatattatatgatagtcttgagtgttatacattgtgagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaa 22446117  T
Q  121 ttgatgatactatg-gggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc-aaaa 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  22446118 ttgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaa 22446216  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22446217 aagtcattttcatgacttcaccgtagaatt 22446246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34133158 - 34132930
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| | | ||||    
T  34133158 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatga 34133059  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||| |||| |||||||||||    
T  34133058 attgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaa 34132959  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  34132958 agtcattttcgtgacttcattatagaatt 34132930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 51212962 - 51213162
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  51212962 actttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttt 51213061  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51213062 tgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaat 51213161  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  51213162 t 51213162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35844549 - 35844321
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||    
T  35844549 gatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 35844451  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  35844450 aattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaa 35844351  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35844350 aagtcattatcatgacttcaccatagaatt 35844321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2008155 - 2007948
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  2008155 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgtacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaa 2008056  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | | |||||| |||||||||  ||||||    
T  2008055 ttgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca-aaaaaaa 2007957  T
Q  221 gtcattttc 229  Q
     ||||||||    
T  2007956 atcattttc 2007948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39282875 - 39282648
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  39282875 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 39282776  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    || ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||| |||| || | || |||    
T  39282775 atggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaa 39282677  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39282676 aatcattttcatgacttcaccatagaatt 39282648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48355164 - 48354936
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||    
T  48355164 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatga 48355065  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||| |||    
T  48355064 gttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaa 48354965  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48354964 aatcattctcatgacttcaccatagaatt 48354936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 4761601 - 4761832
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  4761601 gatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatg 4761700  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc--aa 216  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||  ||    
T  4761701 agttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaa 4761800  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  4761801 aaaagtcaatctcatgaattcaccatagaatt 4761832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 3655155 - 3655383
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| || |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  3655155 gatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 3655254  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3655255 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaa 3655354  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3655355 agtcatttttatgacttcaccataaaatt 3655383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4015673 - 4015455
Alignment:
Q  31 gatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgata 129  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  4015673 gatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgata 4015574  T
Q  130 ctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttc 229  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||    
T  4015573 ctatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctc 4015474  T
Q  230 atgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4015473 atgacttcaccatagaatt 4015455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29099550 - 29099356
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29099550 actttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaacttt 29099451  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccat 242  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  29099450 agatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccat 29099356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 26941213 - 26941441
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||||| || ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  26941213 gatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 26941312  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  26941313 attaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaa 26941412  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26941413 aatcattcttatgacttcaccatagaatt 26941441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3362474 - 3362249
Alignment:
Q  25 ttatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaa--gtatagtcttgttaatttaatgaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||  | ||||||    
T  3362474 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaat 3362375  T
Q  122 tgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaa-aaaa 220  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3362374 tgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaa 3362275  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaa 246  Q
    || |||||||| | |||||| |||||    
T  3362274 gttattttcataatttcaccgtagaa 3362249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22451191 - 22450963
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  22451191 gatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 22451092  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||||| |||    
T  22451091 attgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaa 22450992  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22450991 aatcattctcatgacttcaccatagaatt 22450963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 7327435 - 7327664
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||   ||||    
T  7327435 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatga 7327534  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagt-attaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  7327535 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaa 7327634  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7327635 aagtcattctcataacttcaccatagaatt 7327664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 11357358 - 11357535
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11357358 ttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgta 11357457  T
Q  161 caaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11357458 caaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 248
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373477
Alignment:
Q  71 aacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  171 ggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaatt 20373477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 44186485 - 44186682
Alignment:
Q  52 ttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttga 150  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44186485 ttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttga 44186584  T
Q  151 tgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  44186585 tgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaatt 44186682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552440
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||| | || ||||||||  || ||||||| | |||| |||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  40552212 gatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatga 40552311  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  40552312 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaa 40552411  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40552412 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 40552440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 42506028 - 42506210
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  42506028 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42506127  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagt 202  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||    
T  42506128 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagt 42506210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 24488915 - 24489140
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||    
T  24488915 gatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 24489014  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||| | |||||| ||  |||||| |||||||||| |||||    
T  24489015 attgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaa 24489114  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||    
T  24489115 aatcattttcgtgacttcaccgtaga 24489140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 53229105 - 53229326
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  53229105 gatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatga 53229204  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtg-gggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||| ||| |||||| |||| ||||||| ||    
T  53229205 attgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaa 53229304  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcacc 240  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  53229305 aaataattttcatgacttcacc 53229326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47481745 - 47481517
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  47481745 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatga 47481646  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47481645 attgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 47481546  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
      |||||   |||||||||||||| ||||    
T  47481545 catcattcctatgacttcaccataaaatt 47481517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21193830 - 21193601
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtctt-aagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| | |||    
T  21193830 gatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatg 21193731  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||   | ||| |||||||||||| ||    
T  21193730 aattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaa 21193631  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21193630 aagtcattctcatgactttaccatagaatt 21193601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32373693 - 32373467
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  32373693 gatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 32373594  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||| |    |||    
T  32373593 attgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaa 32373496  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32373495 agtcattctcatgacttcatcatagaatt 32373467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44891720 - 44891510
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | || |    
T  44891720 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatta 44891621  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||         |||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44891620 attgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacc-aaaa 44891531  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44891530 agtcattttcatgacttcacc 44891510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 27480373 - 27480560
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  27480373 ttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgta 27480472  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||| | || || |||||| |||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27480473 caaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaatt 27480560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45174718 - 45174498
Alignment:
Q  32 atagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgata 129  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  45174718 atagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 45174619  T
Q  130 ctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcact--atattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattt 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45174618 ctatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattc 45174519  T
Q  228 tcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||  ||||||||||| ||||    
T  45174518 tcacaacttcaccataaaatt 45174498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25579962 - 25579734
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |    
T  25579962 gatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataa 25579863  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |  ||||| |||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25579862 actgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaa 25579763  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  25579762 aatcattctcataacttaaccataaaatt 25579734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 54828654 - 54828881
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||    
T  54828654 gatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatga 54828753  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||| |||||  || |||| |||||||| |  |||  |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54828754 attgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattaca-tttttatgttatagtgttaactttaccaaaaa 54828852  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  54828853 aattatttttatgacttcaccataaaatt 54828881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 33378741 - 33378963
Alignment:
Q  24 attatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  33378741 attatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 33378840  T
Q  123 gatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagt 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||||||||| | |||| ||  |||||| || |||||||   ||||||    
T  33378841 gataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagt 33378937  T
Q  223 cattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||| ||||  ||||||||||    
T  33378938 cattctcataactttgccatagaatt 33378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 24708068 - 24708293
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaa--gtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| | ||    
T  24708068 gatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgat 24708167  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  | |||| ||||||  || ||||| |||  |||    
T  24708168 gaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgatgtta-cgtgttaacatca--aaa 24708262  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  24708263 aaagtcattttgataacttcaccataaaatt 24708293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 46994614 - 46994831
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  46994614 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatga 46994713  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||           |||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46994714 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta----------tgtgttactcattaca-ttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaa 46994802  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  46994803 aatcattcttacgacttcaccgtagaatt 46994831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 21009755 - 21009955
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || |||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  21009755 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 21009854  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | || ||||| |||||    
T  21009855 attgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtcaaattcacaaaaaa 21009954  T
Q  220 a 220  Q
    |    
T  21009955 a 21009955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43348480 - 43348319
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  43348480 gatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 43348381  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcac 182  Q
    |||||||||||||    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43348380 attgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctcac 43348319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 43975869 - 43976066
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | | |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  43975869 actttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttt 43975968  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  43975969 tgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt---caaaaaagtcattctcatgacttcaccataaaat 43976065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54506030 - 54505825
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||     
T  54506030 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgt 54505931  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| ||||||||||| || | ||| |||||||| || | || ||| | |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54505930 atttatgatactatgaggct-gaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaa 54505832  T
Q  220 agtcatt 226  Q
    |||||||    
T  54505831 agtcatt 54505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40936153 - 40935995
Alignment:
Q  81 gataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 180  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  40936153 gataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactc 40936054  T
Q  181 actatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcac 239  Q
     | | | |||| ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  40936053 gcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 40935995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 22622671 - 22622780
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  22622671 gatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 22622770  T
Q  120 attgatgata 129  Q
    ||||||||||    
T  22622771 attgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33698376 - 33698259
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  33698376 gatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33698277  T
Q  120 attgatgatactatgggg 137  Q
    |||||||||||| |||||    
T  33698276 attgatgatactctgggg 33698259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38591921 - 38591727
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  38591921 gatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38591822  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaa----acagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaactt 210  Q
     ||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| |||||||    ||| || | |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  38591821 gttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagatgttactccctataattttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 182
Target Start/End: Original strand, 14586651 - 14586785
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  14586651 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttt 14586750  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcac 182  Q
    ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  14586751 tgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcac 14586785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53176277 - 53176127
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | ||||||  ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  53176277 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 53176178  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgg 170  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  53176177 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29164013 - 29163912
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29164013 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttt 29163914  T
Q  148 tg 149  Q
    ||    
T  29163913 tg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 11835580 - 11835787
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaa-attagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | |||||||| | ||     
T  11835580 gatatcatgtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgata 11835679  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||     | ||||| |||||||||||||||    
T  11835680 aattgatgatactatgggg-----------------actgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttt-----tgatagtgttaacttcaccaaaa 11835757  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11835758 aaatcattctcatgacttcaccatagaatt 11835787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1089913 - 1089842
Alignment:
Q  25 ttatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagatt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1089913 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 1089842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 49359628 - 49359672
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49359628 ttaacttcacaaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 49359672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 55343401 - 55343465
Alignment:
Q  184 atattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55343401 atatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatt 55343465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36012361 - 36012246
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||| || | |||    
T  36012361 gatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatg 36012262  T
Q  119 aattgatgatactatg 134  Q
    ||||||||||| ||||    
T  36012261 aattgatgatattatg 36012246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 53811694 - 53811767
Alignment:
Q  99 atagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggg------attgaacttttgatgccactgtacaaaca 166  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53811694 atagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2613967 - 2613895
Alignment:
Q  166 agtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttca 238  Q
    |||| |||||||||||| | | ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2613967 agtgtggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattttaatgacttca 2613895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 38392628 - 38392672
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38392628 ttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatataatt 38392672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 40640634 - 40640678
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40640634 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 40640678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 47930666 - 47930710
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47930666 ttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaatt 47930710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4556587 - 4556544
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4556587 taacttcacgagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 4556544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 42665539 - 42665585
Alignment:
Q  202 tattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42665539 tattaacttcaccaaaaaaatcattatcataacttcaccatagaatt 42665585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5124713 - 5124672
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5124713 acttcaccaaaaaagtcattttaatgatttcaccatagaatt 5124672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29163895 - 29163842
Alignment:
Q  195 gttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29163895 gttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccataaaatt 29163842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 19606914 - 19606958
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19606914 ttaacttcaccagaaaagtcatttttataacttcaccatagaatt 19606958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 23165838 - 23165882
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23165838 ttaacttcactaaaaaaatcattatcatgacttcaccatagaatt 23165882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698187
Alignment:
Q  168 tggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| | | |    ||| |||||||||||||||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcactagaga----attctcatgacttcaccatagaatt 33698187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 7568719 - 7568753
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttca 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7568719 ttaacttcaccaaaaaagtaattttcatgacttca 7568753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 41585407 - 41585449
Alignment:
Q  167 gtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaact 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41585407 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43348322 - 43348284
Alignment:
Q  210 tcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43348322 tcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 43348284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Original strand, 53811970 - 53812020
Alignment:
Q  198 atagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  53811970 atagcattaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaatt 53812020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 48155220 - 48155261
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  48155220 acttcaccaaaaaagtcattttaacgacttcaccgtagaatt 48155261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Original strand, 53818508 - 53818553
Alignment:
Q  203 attaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53818508 attaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccataaaatt 53818553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 45879498 - 45879542
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45879498 ttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcagcatagaatt 45879542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 29242109 - 29242337
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  29242109 gatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 29242208  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29242209 attgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaa 29242308  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29242309 aaccattttcatgacttcaccatagaatt 29242337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4167154 - 4166926
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  4167154 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4167055  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||| |||    
T  4167054 attgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaa 4166955  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4166954 agtcattttcgtgacttcaccatagaatt 4166926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 248
Target Start/End: Original strand, 33550969 - 33551185
Alignment:
Q  33 tagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatact 131  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33550969 tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 33551068  T
Q  132 atggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcat 231  Q
    |||  ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33551069 atgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcat 33551168  T
Q  232 gacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33551169 gacttcaccgtagaatt 33551185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36642214 - 36641990
Alignment:
Q  27 atgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa--ttagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattg 123  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  36642214 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattg 36642115  T
Q  124 atgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtc 223  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | | |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36642114 atgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtc 36642015  T
Q  224 attttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642014 attctcatgacttcaccatagaatt 36641990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3177171 - 3176943
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| | | ||||    
T  3177171 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 3177072  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  3177071 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaa 3176972  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3176971 agtcattttcgtaacttcaccatagaatt 3176943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 19424599 - 19424827
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||    
T  19424599 gatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatga 19424698  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  19424699 attgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 19424798  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19424799 agccattctcatgacttcaccataaaatt 19424827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 33660367 - 33660567
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  33660367 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttt 33660466  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33660467 tgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaat 33660566  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  33660567 t 33660567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 41463821 - 41464049
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||   || |||||||||| | ||||    
T  41463821 gatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatga 41463920  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41463921 attgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaa 41464020  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41464021 tgtcattctcacgacttcaccatagaatt 41464049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 43648216 - 43648415
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  43648216 gatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 43648315  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     ||||||||||||||  || ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43648316 gttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 43648415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4763863 - 4763632
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt-tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||    
T  4763863 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 4763764  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatag---tattaacttcaccaa 216  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||   | ||||||||| ||     
T  4763763 attgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcag 4763664  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4763663 aaaagtcattttcatgacttcatcatagaatt 4763632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 17071708 - 17071936
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  17071708 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 17071807  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||||| || |||||||| | || | ||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17071808 attgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaa 17071907  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17071908 agtcattcgcatgacttcaccatagaatt 17071936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37905942 - 37905713
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt---ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaat 117  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||    
T  37905942 gatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 37905843  T
Q  118 gaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37905842 gaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaa 37905743  T
Q  218 aaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  37905742 aaa-tcatttttataacttcaccatagaatt 37905713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Original strand, 4264057 - 4264276
Alignment:
Q  30 tgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgat 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||| ||    
T  4264057 tgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataat 4264156  T
Q  129 actatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcatttt 228  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  4264157 actatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattat 4264256  T
Q  229 catgacttcaccatagaatt 248  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4264257 gatgacttcaccatagaatt 4264276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 17054067 - 17054295
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||    
T  17054067 gatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatga 17054166  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| ||||   |  | |||||||||| || |||||||||| || | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17054167 attgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaa 17054266  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17054267 agtcattcgcatgacttcaccatagaatt 17054295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 43770838 - 43771037
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  43770838 actttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttt 43770937  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  43770938 tgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa-tcattctaatgacttcaccatagaat 43771036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4478597 - 4478372
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  4478597 gatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 4478502  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4478501 attgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 4478402  T
Q  220 agtcattttc-atgacttcaccatagaatt 248  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4478401 tatcattttctatgacttcactatagaatt 4478372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 2325349 - 2325569
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||         
T  2325349 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaattt----- 2325443  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
       |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||| | |||||||||| | |||    
T  2325444 ---gatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaa 2325540  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  2325541 agtcattcacataacttcaccatagaatt 2325569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26357808 - 26357581
Alignment:
Q  22 atattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||    
T  26357808 atattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaa 26357709  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  26357708 ttgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaa 26357609  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26357608 gtcattttcatgacttcaccataaaatt 26357581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33902298 - 33902072
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt-tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  33902298 gatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatga 33902199  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    | |||||||||| || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  33902198 actgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgt--tagtgttaacttcaccagaaa 33902101  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  33902100 agtcattctaacgacttcatcatagaatt 33902072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 19289294 - 19289517
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  19289294 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 19289393  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     ||||||||||| || | | | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19289394 gttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 19289493  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||     ||||||||||||||||||    
T  19289494 agtcat-----tgacttcaccatagaatt 19289517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 31570705 - 31570933
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  31570705 gatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 31570804  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| || | | |||| |||||||||| |||| ||||||| |||    
T  31570805 attcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaa 31570904  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31570905 agttattctcataacttcaccatagaatt 31570933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44913896 - 44913666
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||    
T  44913896 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatg 44913797  T
Q  119 aattgatgatactat-ggggattgaacttttgatgccactgtacaaac-agtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||  || ||| ||||||||| ||     
T  44913796 aattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cat 44913698  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44913697 aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatt 44913666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 27349938 - 27350138
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27349938 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggg-actgaacttt 27350036  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa-gtcattttcatgacttcaccatagaa 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||    
T  27350037 tgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaatattattttaatgacttcaccataaaa 27350136  T
Q  247 tt 248  Q
    ||    
T  27350137 tt 27350138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 11366352 - 11366580
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  11366352 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatga 11366451  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | |||||| |||| | ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  11366452 attgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaa 11366551  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  11366552 agtcattcttatgatttcaccatagaatt 11366580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13711691 - 13711468
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||| |||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||    
T  13711691 gatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaaca-----tgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 13711597  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| |||| | |||||||||||| |||    
T  13711596 attgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaa 13711497  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13711496 agtcattctgatgacttcaccatagaatt 13711468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 39167362 - 39167562
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39167362 actttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 39167461  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||  |||  | ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  39167462 tgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaat 39167561  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  39167562 t 39167562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5881742 - 5881538
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  5881742 actttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttt 5881644  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttact-----cactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccat 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||| |  |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  5881643 tgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaat 5881544  T
Q  243 agaatt 248  Q
    | ||||    
T  5881543 aaaatt 5881538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19314055 - 19313856
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19314055 actttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagg-actgaacttt 19313957  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    ||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| | | |||| ||| |||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19313956 tgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaat 19313857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 33709203 - 33709403
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||| | |  |    
T  33709203 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaata 33709302  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  33709303 tttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaa 33709402  T
Q  220 a 220  Q
    |    
T  33709403 a 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44286181 - 44285961
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||    
T  44286181 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatga 44286082  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||| | | | |||| ||| |||||| ||||||||| || |||    
T  44286081 atttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaa 44285982  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
    | |||||  ||||||||||||    
T  44285981 aatcattcgcatgacttcacc 44285961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41961072 - 41960940
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  41961072 gatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 41960973  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatg 152  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41960972 attgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41465733 - 41465513
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  41465733 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatga 41465634  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||  ||        | ||||| ||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  41465633 attgatgatattatagggactgaacttttgataccagcgt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaa 41465542  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41465541 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 41465513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 18494252 - 18494467
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaa 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||| || ||| | |||||    
T  18494252 gatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggtttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaa 18494351  T
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 220  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |            |||||||||||||||| | | |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  18494352 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaa 18494439  T
Q  221 gtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18494440 gtcattttcatgacttcaccacagaatt 18494467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 182
Target Start/End: Original strand, 7006933 - 7007054
Alignment:
Q  61 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  7006933 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgta 7007032  T
Q  161 caaacagtggggtgttactcac 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  7007033 caaacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35959128 - 35958913
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||| | ||||    
T  35959128 gatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatga 35959030  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||| |            |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  35959029 attgatgct------------gaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaa 35958942  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35958941 agtcatttttatgacttcatcatagaatt 35958913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45327952 - 45327801
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  45327952 gatattatgcgatagtcttatgtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 45327853  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggg 171  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  45327852 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcaccgtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31862084 - 31861971
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  31862084 gatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31861985  T
Q  120 attgatgatactat 133  Q
    ||||||||||||||    
T  31861984 attgatgatactat 31861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 18258258 - 18258349
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18258258 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  107 gttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccact-gtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtatt 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||  ||| | | |||| ||| |||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  206 aacttcaccaaaaaagtcat 225  Q
    | ||||| || |||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 34441921 - 34441965
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34441921 ttaactttaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 34441965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41643920 - 41643876
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41643920 ttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatt 41643876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41960947 - 41960887
Alignment:
Q  188 tttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41960947 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttcaccatagaatt 41960887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42005437 - 42005393
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42005437 ttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaatt 42005393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31861945 - 31861899
Alignment:
Q  202 tattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31861945 tattaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaatt 31861899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 18947598 - 18947642
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18947598 ttaacttcaccagaaaagttattttcatgacttcaccatagaatt 18947642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Original strand, 43446463 - 43446506
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43446463 taacttcaccgaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatt 43446506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  69 aaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttg 149  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 240
Target Start/End: Original strand, 27139020 - 27139056
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcacc 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27139020 ttaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttcacc 27139056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 7007051 - 7007089
Alignment:
Q  210 tcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7007051 tcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 7007089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6177823 - 6177779
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  6177823 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcgccgtagaatt 6177779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 18514771 - 18514815
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  18514771 ttaacttcatcaaaaaagtcattctcatgacttcactataaaatt 18514815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19093461 - 19093417
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19093461 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccataaaatt 19093417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 4318774 - 4319003
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  4318774 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatg 4318873  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4318874 aattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaa 4318973  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4318974 aagtcattctcatgacttcaccatagaatt 4319003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 3879891 - 3880119
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||    
T  3879891 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatga 3879990  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||  |||| | |||||||||||| |||    
T  3879991 attgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaa 3880090  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3880091 agtcattctcgtgacttcaccatagaatt 3880119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 21017064 - 21017284
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||    
T  21017064 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatga 21017163  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||  || | | ||||||||||||||||    
T  21017164 attgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaa 21017263  T
Q  220 agtcattttcatgacttcacc 240  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  21017264 agtcattttcgtgacttcacc 21017284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1946066 - 1945837
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  1946066 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatga 1945967  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaa-aa 218  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1945966 attcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 1945867  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  1945866 aagtcattcttatgacttcaccgtagaatt 1945837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5627623 - 5627395
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  5627623 gatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 5627524  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5627523 attgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 5627424  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  5627423 agtcattcttatgacttcaccttagaatt 5627395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 6091134 - 6091362
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtctt-aagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  6091134 gatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatg 6091233  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  6091234 aattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgttaca-tgttaactttaccaaaa 6091332  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6091333 aaattattttcatgacttcacaatagaatt 6091362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 7055167 - 7055395
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  7055167 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 7055266  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7055267 attgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 7055366  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  7055367 aatcattcttatgacttcaccataaaatt 7055395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 30353310 - 30353538
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||    
T  30353310 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatga 30353409  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||| | | | |||| |||||||| | |||||||||||| |||    
T  30353410 attgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaa 30353509  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30353510 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 30353538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 7234987 - 7235214
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  7234987 gatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 7235086  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||  |||    
T  7235087 attgataatactatgag-actgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaa 7235185  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7235186 agtcattctcataacttcaccatagaatt 7235214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8513460 - 8513237
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |     |||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||| | ||||    
T  8513460 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgt-----taaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatga 8513366  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||| |||||||||||| |||    
T  8513365 attgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaa 8513266  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8513265 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 8513237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29182396 - 29182167
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||    
T  29182396 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatg 29182297  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaa 218  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  29182296 aattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaata 29182197  T
Q  219 aagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29182196 aaatcattctcatgacttcaccataaaatt 29182167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6089135 - 6088912
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggtttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | || |     |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| | ||||    
T  6089135 gatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgt-----taaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatga 6089041  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||  |||||| |||||||||||| |||    
T  6089040 attgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaa 6088941  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6088940 aatcattctcatgacttcaccatagaatt 6088912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15491847 - 15491631
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||    
T  15491847 gatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatga 15491748  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||| | | |||||||||| | |||    
T  15491747 attgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaa 15491648  T
Q  220 agtcattttcatgactt 236  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  15491647 agtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20768314 - 20768090
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||    
T  20768314 gatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtaa--tcttgttaatctgatga 20768217  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||||| |||    
T  20768216 attaatgatactatgaggactgaacttttgatgccacta-acaaacaatgga-tgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaa 20768119  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20768118 agtcattctcatgacttcaccatagaatt 20768090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 33892983 - 33893182
Alignment:
Q  49 actttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttt 147  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33892983 actttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggg-actgaacttt 33893081  T
Q  148 tgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaat 247  Q
    | ||  || |||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||    
T  33893082 taatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaat 33893181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618838
Alignment:
Q  76 ggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||     
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgc 33618911  T
Q  176 tactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| | |||| |||  ||||| || ||||||||| ||||||  ||  |||||||||||| |||||||    
T  33618910 tactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgacttcaccgtagaatt 33618838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498440
Alignment:
Q  121 ttgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||||||  ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccataga 245  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactataga 18498440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Original strand, 3005392 - 3005437
Alignment:
Q  203 attaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3005392 attaacttcatcaaaaaagtcattctcatgacttcaacatagaatt 3005437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 11084152 - 11084196
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11084152 ttaactttaccagaaaagttattttcatgacttcaccatagaatt 11084196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19631797 - 19631753
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19631797 ttaacttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaatt 19631753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 4488589 - 4488630
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  4488589 acttcaccaaaaaagtcattttaacgacttcaccgtagaatt 4488630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25441003 - 25440962
Alignment:
Q  207 acttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25441003 acttcaccagaaaagtcattttaacgacttcaccatagaatt 25440962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 24662190 - 24662234
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24662190 ttaacttcactagaaaagtcattatcatgactttaccatagaatt 24662234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 26301923 - 26301967
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26301923 ttaacttcacgaaaaaaatcatttttatgacttcaccatataatt 26301967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8119 - 7891
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  8119 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 8020  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8019 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 7920  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  7919 agtcattcttataacttcaccatagaatt 7891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 366 - 138
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||    
T  366 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 267  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  || ||| |||||||||||| |||    
T  266 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaa 167  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166 agtcattttcgtgacttcaccatagaatt 138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 94336 - 94547
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  94336 gatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatga 94435  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| || |||    
T  94436 attgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaa 94535  T
Q  220 agtcattttcat 231  Q
    ||||||||||||    
T  94536 agtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 408382 - 408559
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  408382 gatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 408481  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgtta 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||  || | ||||||| ||  ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  408482 attgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 408706 - 408750
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  408706 ttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaatt 408750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 145969 - 146197
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  145969 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 146068  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  146069 attgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaa 146168  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    | ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  146169 aatcattcttatgacttcaccgtagaatt 146197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12141 - 11910
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  12141 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 12042  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactg-tacaaacagt-ggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaa 217  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | | |||| ||||||| || |||| ||||||| |    
T  12041 attgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccaga 11942  T
Q  218 aaagtcattt-tcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11941 aaagtcatttctcatgacttcaccatagaatt 11910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 267517 - 267286
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtctt-aagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  267517 gatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatg 267418  T
Q  119 aattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtac-aaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacc-aa 216  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||  | ||| ||    
T  267417 aattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgtaaatattaccaaa 267318  T
Q  217 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  267317 aaaaataattttcatgacttcaccatagaatt 267286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44188 - 43961
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||    
T  44188 gatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 44090  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  44089 attgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaa 43990  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| || | | |||||||||||||||||    
T  43989 agtctttcttacgacttcaccatagaatt 43961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 154599 - 154826
Alignment:
Q  21 gatattatgtgatagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatga 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||    
T  154599 gatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 154697  T
Q  120 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  154698 attgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaa 154797  T
Q  220 agtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| || | | |||||||||||||||||    
T  154798 agtctttcttacgacttcaccatagaatt 154826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42352
Alignment:
Q  161 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaatt 42352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 100886 - 100825
Alignment:
Q  187 ttttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  100886 tttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatt 100825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  67 ttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtatagtcttgt 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0662 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6983
Alignment:
Q  205 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  7026 taacttcaccaaaaaagtcaattgaatgacttcaccatagaatt 6983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 12138 - 12182
Alignment:
Q  204 ttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  12138 ttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcatagaatt 12182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University