View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15420_high_8 (Length: 411)

Name: NF15420_high_8
Description: NF15420
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15420_high_8
NF15420_high_8
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (46-386)||(29940945-29941299)
chr2 (47-393)||(6289232-6289590)
chr2 (46-380)||(45546937-45547285)
chr2 (62-388)||(11534833-11535173)
chr2 (61-391)||(20157502-20157846)
chr2 (61-388)||(34028677-34029019)
chr2 (62-375)||(24193232-24193559)
chr2 (67-390)||(11998169-11998505)
chr2 (81-351)||(24193585-24193875)
chr2 (135-384)||(45485364-45485603)
chr2 (193-386)||(27090635-27090829)
chr2 (193-385)||(2372970-2373163)
chr2 (157-321)||(38822787-38822952)
chr2 (157-388)||(24935992-24936224)
chr2 (271-388)||(2288459-2288575)
chr2 (271-386)||(37981622-37981738)
chr2 (343-393)||(21736645-21736696)
chr2 (196-388)||(25684715-25684908)
chr2 (157-231)||(18176323-18176397)
chr2 (305-335)||(22552000-22552030)
chr2 (359-393)||(24192657-24192691)
chr2 (305-335)||(43078618-43078648)
chr2 (318-386)||(25343220-25343289)
chr2 (305-341)||(6224701-6224737)
chr2 (272-328)||(10859853-10859909)
chr2 (303-335)||(22551914-22551946)
chr2 (359-391)||(45547973-45548005)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (46-388)||(151856-152212)
chr7 (46-370)||(35089836-35090174)
chr7 (46-379)||(43057411-43057758)
chr7 (46-388)||(27418372-27418728)
chr7 (46-382)||(30110807-30111157)
chr7 (135-388)||(47914889-47915143)
chr7 (62-385)||(39301002-39301329)
chr7 (61-388)||(40097092-40097434)
chr7 (46-137)||(47914059-47914150)
chr7 (157-386)||(31494239-31494469)
chr7 (161-391)||(24939509-24939738)
chr7 (224-386)||(47031245-47031408)
chr7 (157-382)||(48545674-48545899)
chr7 (273-335)||(41060037-41060099)
chr7 (157-231)||(46037204-46037278)
chr7 (273-389)||(12253361-12253478)
chr7 (193-354)||(32630731-32630892)
chr7 (157-354)||(36355338-36355534)
chr7 (273-391)||(33474513-33474632)
chr7 (353-389)||(43057839-43057875)
chr7 (304-386)||(3634213-3634296)
chr7 (305-335)||(28342283-28342313)
chr7 (271-388)||(34115441-34115559)
chr7 (178-335)||(37042438-37042595)
chr7 (305-341)||(3022940-3022976)
chr7 (271-381)||(9599033-9599145)
chr7 (271-381)||(9826604-9826716)
chr7 (357-389)||(12252384-12252416)
chr7 (300-375)||(32630649-32630725)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (46-387)||(8583735-8584090)
chr4 (46-391)||(44929872-44930229)
chr4 (80-388)||(8880442-8880764)
chr4 (62-383)||(52109409-52109744)
chr4 (46-388)||(3435693-3436038)
chr4 (62-388)||(40143774-40144098)
chr4 (46-288)||(42218176-42218431)
chr4 (135-393)||(25935779-25936039)
chr4 (65-391)||(45332661-45333001)
chr4 (67-385)||(47685145-47685477)
chr4 (62-387)||(54509713-54510050)
chr4 (61-384)||(26336079-26336407)
chr4 (65-375)||(42720730-42721055)
chr4 (65-308)||(45340435-45340691)
chr4 (135-281)||(33450011-33450157)
chr4 (243-391)||(7820091-7820240)
chr4 (46-210)||(7820239-7820401)
chr4 (306-388)||(42218407-42218490)
chr4 (157-393)||(28846956-28847193)
chr4 (192-324)||(5117024-5117156)
chr4 (157-335)||(53271961-53272139)
chr4 (306-388)||(33450140-33450223)
chr4 (274-387)||(41761978-41762093)
chr4 (273-388)||(28100552-28100669)
chr4 (337-387)||(35261614-35261665)
chr4 (271-375)||(53594097-53594202)
chr4 (273-389)||(56397440-56397557)
chr4 (90-137)||(25936050-25936096)
chr4 (305-335)||(9163101-9163131)
chr4 (305-335)||(27767997-27768027)
chr4 (157-231)||(38230928-38231002)
chr4 (359-392)||(388612-388645)
chr4 (271-336)||(37370855-37370920)
chr4 (308-341)||(39307407-39307440)
chr4 (273-330)||(42314956-42315013)
chr4 (304-388)||(44646719-44646804)
chr4 (310-389)||(25331017-25331097)
chr4 (355-387)||(27529084-27529116)
chr4 (359-395)||(28846162-28846198)
chr4 (305-341)||(32322110-32322146)
chr4 (310-389)||(39479597-39479677)
chr4 (255-283)||(40915353-40915381)
chr4 (303-335)||(53275864-53275896)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (46-387)||(41386600-41386956)
chr8 (46-392)||(43605094-43605453)
chr8 (46-386)||(2112791-2113145)
chr8 (46-393)||(29260006-29260367)
chr8 (46-388)||(40265011-40265367)
chr8 (46-390)||(42274968-42275327)
chr8 (46-389)||(4655044-4655401)
chr8 (46-382)||(7148050-7148394)
chr8 (61-386)||(28619843-28620183)
chr8 (78-389)||(10802533-10802858)
chr8 (95-388)||(9457541-9457848)
chr8 (62-389)||(30382420-30382761)
chr8 (61-371)||(4302551-4302877)
chr8 (192-391)||(1605902-1606102)
chr8 (62-389)||(37567118-37567450)
chr8 (90-351)||(8502667-8502942)
chr8 (138-387)||(35142041-35142291)
chr8 (46-266)||(41965530-41965761)
chr8 (135-393)||(9209029-9209288)
chr8 (194-387)||(40013363-40013555)
chr8 (46-122)||(41965328-41965404)
chr8 (157-386)||(24296506-24296736)
chr8 (157-335)||(14061598-14061776)
chr8 (271-391)||(17790431-17790552)
chr8 (178-283)||(23185801-23185906)
chr8 (81-134)||(40013264-40013317)
chr8 (251-330)||(3148564-3148642)
chr8 (359-392)||(4656134-4656167)
chr8 (357-393)||(10128319-10128355)
chr8 (271-335)||(24317963-24318027)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (46-388)||(45318458-45318814)
chr1 (46-387)||(26882556-26882911)
chr1 (46-386)||(52705393-52705747)
chr1 (62-388)||(36402245-36402585)
chr1 (61-387)||(1928149-1928489)
chr1 (62-393)||(33243060-33243401)
chr1 (62-393)||(33263233-33263574)
chr1 (65-384)||(29208757-29209090)
chr1 (62-387)||(10896799-10897138)
chr1 (178-391)||(9831294-9831499)
chr1 (200-347)||(45534847-45534993)
chr1 (157-386)||(9191131-9191361)
chr1 (271-388)||(42657712-42657829)
chr1 (157-386)||(27198271-27198501)
chr1 (95-180)||(45534991-45535089)
chr1 (273-391)||(48203343-48203462)
chr1 (273-386)||(19007549-19007663)
chr1 (135-171)||(9831782-9831818)
chr1 (271-385)||(14555279-14555394)
chr1 (157-391)||(48194585-48194820)
chr1 (157-231)||(19007434-19007508)
chr1 (274-335)||(28824492-28824553)
chr1 (359-392)||(52706446-52706479)
chr1 (359-391)||(10897700-10897732)
chr1 (359-391)||(14389480-14389512)
chr1 (303-335)||(22183389-22183421)
chr1 (305-341)||(25612170-25612206)
chr1 (271-386)||(43553536-43553652)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (46-387)||(24150562-24150917)
chr3 (46-388)||(36054737-36055093)
chr3 (46-385)||(35730933-35731286)
chr3 (46-387)||(38629530-38629885)
chr3 (46-389)||(30588836-30589194)
chr3 (46-386)||(50900177-50900531)
chr3 (76-389)||(26555811-26556121)
chr3 (46-384)||(26293297-26293649)
chr3 (46-389)||(19551888-19552235)
chr3 (61-388)||(13662546-13662887)
chr3 (103-391)||(26005770-26006072)
chr3 (76-392)||(46251963-46252293)
chr3 (62-391)||(27593147-27593490)
chr3 (138-388)||(52024034-52024286)
chr3 (62-387)||(39338046-39338383)
chr3 (61-375)||(36785982-36786309)
chr3 (137-386)||(38682426-38682675)
chr3 (46-216)||(26005585-26005768)
chr3 (202-387)||(53183972-53184158)
chr3 (178-381)||(6783976-6784180)
chr3 (192-386)||(25713327-25713523)
chr3 (200-351)||(24574816-24574967)
chr3 (271-374)||(10104982-10105086)
chr3 (271-374)||(10225758-10225862)
chr3 (236-324)||(33119571-33119659)
chr3 (271-348)||(10216129-10216206)
chr3 (245-322)||(43151223-43151300)
chr3 (271-335)||(10216008-10216072)
chr3 (271-335)||(10225637-10225701)
chr3 (271-387)||(45926913-45927034)
chr3 (271-325)||(44042013-44042067)
chr3 (178-335)||(10104768-10104925)
chr3 (76-134)||(52023963-52024017)
chr3 (303-335)||(996235-996267)
chr3 (305-341)||(6035204-6035240)
chr3 (305-341)||(12103648-12103684)
chr3 (303-335)||(25418391-25418423)
chr3 (359-391)||(26292560-26292592)
chr3 (100-128)||(38682700-38682728)
chr3 (305-341)||(44276408-44276444)
chr3 (303-335)||(52114553-52114585)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (46-389)||(40410587-40410944)
chr5 (62-388)||(6828537-6828878)
chr5 (81-388)||(17518426-17518748)
chr5 (81-384)||(10571113-10571430)
chr5 (220-386)||(7857025-7857192)
chr5 (157-279)||(6902525-6902647)
chr5 (271-395)||(28594410-28594536)
chr5 (271-374)||(26795601-26795705)
chr5 (273-392)||(39753429-39753549)
chr5 (271-374)||(26806665-26806769)
chr5 (317-386)||(27786210-27786280)
chr5 (178-335)||(26806451-26806608)
chr5 (304-387)||(9689337-9689421)
chr5 (357-392)||(6827947-6827982)
chr5 (192-284)||(26876251-26876347)
chr5 (359-393)||(40411476-40411510)
chr5 (178-335)||(26795387-26795544)
chr5 (135-231)||(2276037-2276133)
chr5 (305-341)||(13925951-13925987)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (46-388)||(81512-81868)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (50-389)||(6476447-6476800)
chr6 (95-388)||(29834064-29834371)
chr6 (95-388)||(29865498-29865805)
chr6 (62-387)||(10643758-10644099)
chr6 (61-388)||(30877850-30878191)
chr6 (69-388)||(3110038-3110371)
chr6 (135-386)||(7858206-7858457)
chr6 (271-391)||(5957121-5957242)
chr6 (310-382)||(11007689-11007762)
chr6 (196-388)||(35164802-35164995)
chr6 (135-231)||(709070-709166)
chr6 (157-231)||(7100320-7100394)
chr6 (305-335)||(7497101-7497131)
chr6 (157-231)||(8794236-8794310)
chr6 (162-231)||(5957285-5957354)
chr6 (293-388)||(31609682-31609778)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (95-388)||(21192-21499)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (46-395)||(34544-34895)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (61-368)||(16303-16610)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (304-386)||(11789-11872)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29941299 - 29940945
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  29941299 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 29941200  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941199 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 29941100  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941099 tggatttcattagactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 29941000  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29940999 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccc 29940945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 47 - 393
Target Start/End: Original strand, 6289232 - 6289590
Alignment:
Q  47 tggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac--------- 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  6289232 tggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatc 6289331  T
Q  138 ----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccact 233  Q
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289332 tcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccact 6289431  T
Q  234 cgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactt 333  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  6289432 ggatttcattggattcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatct--attgaatatcacaaaactt 6289529  T
Q  334 ttataaaacaaaaaag-tcattaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289530 ttataaaacaaaaaagttttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 6289590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45547285 - 45546937
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  45547285 ttggaagtgtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatataaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 45547186  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45547185 ctcacaaaatccattacttacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgctaaatctcaattgaataccac 45547086  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45547085 tgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 45546986  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaat 380  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  45546985 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaattctttgaaatctcaatccaat 45546937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11535173 - 11534833
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||    
T  11535173 aaatctcaaagctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttatgtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 11535074  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11535073 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaattccactggattttattggact 11534974  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  11534973 cattaaaaaatcctgaaaatcctaattaaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaa 11534874  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  11534873 gtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccc 11534833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 20157502 - 20157846
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||             ||||| ||||    
T  20157502 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaagctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 20157601  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20157602 actcataacaatctattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatatttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactgaattttattggac 20157701  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  20157702 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttctttaaaacaaaaa 20157801  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20157802 agtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccctaa 20157846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 388
Target Start/End: Original strand, 34028677 - 34029019
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||             ||||| ||||    
T  34028677 aaaatctcaagactatgtgtggcagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 34028776  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcatt-gga 246  Q
    ||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  34028777 actcgtaacaatccattaaaatccttataattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactggattttatttgga 34028876  T
Q  247 ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  34028877 ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaa 34028976  T
Q  347 aagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||  |||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  34028977 aagtcttttaaaatcctttgaaatatcagttgaatacaccccc 34029019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 62 - 375
Target Start/End: Original strand, 24193232 - 24193559
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||    
T  24193232 aaatttcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 24193331  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  24193332 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggact 24193431  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||     
T  24193432 cattaaaaaatcctgaaaattctaattgaatatcacaagaatgttttagatttcttaaaagtcttgtttgaatacctaaaaacttttttaaaacaaaaat 24193531  T
Q  349 gtcatt-aaaatcttttgaaatctcaat 375  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  24193532 gtctttaaaaatcttttgaaatctcaat 24193559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 390
Target Start/End: Original strand, 11998169 - 11998505
Alignment:
Q  67 tcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcac 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||             ||||| ||||||||||    
T  11998169 tcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaatctcaaggct-ggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcac 11998267  T
Q  154 aacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcatta 253  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11998268 aacaaaccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcatta 11998367  T
Q  254 aaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-a 352  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||      
T  11998368 aaaaattctgaaaatcctaattgaatacgacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaaaacatttttaaaacaaaaaagtctt 11998467  T
Q  353 ttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccccta 390  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11998468 ttaaaatcctttgaaatctcaattgaatatacccccta 11998505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 81 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24193875 - 24193585
Alignment:
Q  81 gggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaa 167  Q
    |||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24193875 gggagacagaaaagtcttgaggctaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacagcaatccattaaa 24193776  T
Q  168 a-------tccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatc 260  Q
    |       | |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  24193775 aattaaaattcgtagaattttgaataccaataaacagtttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccaccgaattttattggactcattaaaaaatc 24193676  T
Q  261 ttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24193675 ttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccccaagacttttttaaaacaaaaaagtc 24193585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45485603 - 45485364
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactc 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||     
T  45485603 cacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagaattttgaatattagtagac----------ttatgcaaaatctcaattgaataccactg 45485514  T
Q  235 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttt 334  Q
     |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45485513 aattttattggattcattgaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaata-cacaagatttt 45485415  T
Q  335 tataaaacaaaaaagt-cattaaaatcttttgaaatctcaatccaatacac 384  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  45485414 tataaaataaaaaagtattttaaaatatcttgaaatctgaatccaatacac 45485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27090829 - 27090635
Alignment:
Q  193 gacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgt 292  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||      
T  27090829 gacaatttttaagttgttaaaaatcatagttgaataccactgaattttgttggactctttaaaaaatcagtaaaatcctaattgaataccaccagaatta 27090730  T
Q  293 tttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27090729 tttctaatcttttaaaatcttgattgaatacttcaagatttttctataaccaaaaaatcttttaaaatctttggaaatcccaatccaatacaccc 27090635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2373163 - 2372970
Alignment:
Q  193 gacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgt 292  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||    ||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||      
T  2373163 gacaatttttaagttgtgaaaaatcttgattaaataccaacgaattttgttggactctttaaaaattcatgaaaatcctaattgaataccaccgaaatta 2373064  T
Q  293 tttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacc 385  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  2373063 tttctaatcttttaaaatcttgattgaatacctcaagatttttctataacaaaaaagtcttttaaaatccttcgaaatcccaattcaatacacc 2372970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Original strand, 38822787 - 38822952
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    |||||||| |||||  || | |||| |||||||  |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||  |||||  ||||| || ||||||    
T  38822787 aatccattgaaatctatacattttttaataccaagagacaatttttaagttgtgaaaaatcttgatcgaataccaccggattttgttggattctttaaaa 38822886  T
Q  257 -aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaat 321  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| || || || ||||||||||||||||    
T  38822887 aaatcttgaaaatcctaattgaataccaccggaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaat 38822952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 388
Target Start/End: Original strand, 24935992 - 24936224
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||| ||   || ||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||||   ||||  |||||||| ||||||    
T  24935992 aatccattaaaatctatatatttttgaataacaaaggataatttttaagttgagaaaaatcttgatttaataccaccaaattttgttggactctttaaaa 24936091  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtca-tta 355  Q
    |  | |||||||| |||||||||||||| | |||  ||| || || || |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||| |||    
T  24936092 atgcctgaaaatcttaattgaataccactaaaattatttctaatcttttaaaatcatgattgaataactcaagatttttttataaccaaaaagtcattta 24936191  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||| ||  ||||||||||  |||||| ||||    
T  24936192 aaatccttcaaaatctcaattgaatacaacccc 24936224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2288575 - 2288459
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||  ||||||||  ||||| |    
T  2288575 taattgaataccacaagatttgtttacattttataaaagtcttgattgaataccactagacttttat--aataaaaaagtcttttaaaatcccttgaatt 2288478  T
Q  370 ctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  2288477 ctcaattcaatacaccccc 2288459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37981738 - 37981622
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcat-taaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||   ||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||  ||||| || | |||||||| |||||||    
T  37981738 taattgaataccacaaaatttatttatattttataaaagttttgattgaataccacatgacttttctataatcaaaaaatcttctaaaatctcttgaaat 37981639  T
Q  370 ctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37981638 ctcaatctaatacaccc 37981622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 393
Target Start/End: Original strand, 21736645 - 21736696
Alignment:
Q  343 aaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21736645 aaaaaagtctattaaaatcctttgaaatctcaattcaatacaccccctaaat 21736696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 388
Target Start/End: Original strand, 25684715 - 25684908
Alignment:
Q  196 aatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgtttt 295  Q
    ||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||   |||  |||    
T  25684715 aatttttaagttgagaaaaatcttgatttaataccaccaaattttgttggactctttaaaaatgcctgaaaatcttaattgaataccactgaaattattt 25684814  T
Q  296 atattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtca-ttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
     || || || |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||||| ||||    
T  25684815 ctaatcttttaaaatcatgattgaataactcaagatttttttataaccaaaaagtcatttaaaatccttcaaaatctcaattgaatacaacccc 25684908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 18176323 - 18176397
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  18176323 aatccattaaaatctcaagaattttgaataccaatagacattttataagatttataaaatctcaattgaatacca 18176397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Original strand, 22552000 - 22552030
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22552000 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 22552030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24192691 - 24192657
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24192691 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaaat 24192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43078648 - 43078618
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078648 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 43078618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25343289 - 25343220
Alignment:
Q  318 gaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  25343289 gaataccgaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttaaaatctcaattgaatacaccc 25343220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Original strand, 6224701 - 6224737
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6224701 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 6224737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10859909 - 10859853
Alignment:
Q  272 aattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaa 328  Q
    ||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10859909 aattgaataccacaaaacttatttagattacttaaaaatcttgattgagtaccacaa 10859853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Original strand, 22551914 - 22551946
Alignment:
Q  303 ttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22551914 ttaaaagtcttgattgaataccacaagactttt 22551946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 391
Target Start/End: Original strand, 45547973 - 45548005
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45547973 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaa 45548005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 152212 - 151856
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  152212 ttggtagagtattacaaaatctaaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 152113  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152112 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccattagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 152013  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  152012 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatatcacaagact 151913  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  151912 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccc 151856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 35089836 - 35090174
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacatttta----------- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||               
T  35089836 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttataccaaacaat 35089935  T
Q  135 --cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089936 ctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 35090035  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35090036 ttgatttcattggactcattaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaattttgattgaataccacaagact 35090135  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatc 370  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  35090136 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatctattgaaatc 35090174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 43057411 - 43057758
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  43057411 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 43057510  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057511 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 43057610  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  43057611 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatattaatagaataacacaagact 43057710  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaa 379  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43057711 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaa 43057758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 27418372 - 27418728
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||            
T  27418372 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctttgtgtgggagaccaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacactaaacaat 27418471  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418472 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgattactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 27418571  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418572 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 27418671  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27418672 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccagtacaccccc 27418728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30111157 - 30110807
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||            
T  30111157 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacactaaacaat 30111058  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30111057 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataatagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 30110958  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30110957 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttaattgaatactacaagact 30110858  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatac 382  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30110857 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaattctttgaaatctcaatccaatac 30110807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 135 - 388
Target Start/End: Original strand, 47914889 - 47915143
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactc 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47914889 cacaaaatccattactcacaacaatccataaaaatctgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactg 47914988  T
Q  235 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47914989 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttcaaaatcttaattgaataccacaagacttt 47915088  T
Q  335 tataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47915089 tataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctatgaaatctcaatccaatacaccccc 47915143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 62 - 385
Target Start/End: Original strand, 39301002 - 39301329
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-aaaattcattactcacaacaat 159  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  39301002 aaatctcaaggctatatgtgggagacaaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacattaaaatccattactcacaacaat 39301101  T
Q  160 ccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaat 259  Q
    | |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  39301102 ctattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggaatttattggactcattaaaaaat 39301201  T
Q  260 cttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaac-aaaaaagtc-attaaa 357  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||  |||||    
T  39301202 tctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattaaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaaagtcttttaaa 39301301  T
Q  358 atcttttgaaatctcaatccaatacacc 385  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39301302 atcttttgaaatctcaattgaatacacc 39301329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40097434 - 40097092
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca-------------caaaattcat 146  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||             |||||| |||    
T  40097434 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaagctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacattaaaaagtctcacaaaatccat 40097335  T
Q  147 tactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattgga 246  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  40097334 tagtcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactgaattttattgga 40097235  T
Q  247 ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaa 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40097234 ctcattaaaaaattttgaaaatcataattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaa 40097135  T
Q  347 aagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40097134 aagtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccc 40097092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Original strand, 47914059 - 47914150
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47914059 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac 47914150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31494469 - 31494239
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||||||||||  || | |||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||    
T  31494469 aatccattaaaatcaatacattttttaataccaagagacaatttttaagttgtaaaaaatcttgattgaataccaccagattttgtttgactctttaaaa 31494370  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-atta 355  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||  ||||  ||| || || || ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||  |||    
T  31494369 aatcattaaaatcctaattgaatacaactggaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtctttta 31494270  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  31494269 aaatccttccaaatcccaatccaatacaccc 31494239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 24939509 - 24939738
Alignment:
Q  161 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatc 260  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||||  |||||||| ||||||| ||    
T  24939509 cattaaaatctataaatttttgaataccaa-agactatttttaagttatgaaaaattttaattgaataccatcagattttgttggactctttaaaaattc 24939607  T
Q  261 ttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaat 359  Q
     |||||||| ||||||||||||||  |||| | || || || || |||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||  |||||||    
T  24939608 atgaaaatcataattgaataccac-cgaatttattctaatcttttaaaatcatgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtcttttaaaat 24939706  T
Q  360 cttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||| ||||    
T  24939707 ctttcgaactcccaatgcaatacaccctctaa 24939738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47031408 - 47031245
Alignment:
Q  224 gaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaatac 323  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||| |  || |||||||||||||||||     
T  47031408 gaataccactggatttggttgaactctttaaaaattcttgaaaatcttaattgaataccaccggaattatttataattttttaaaatcttgattgaatat 47031309  T
Q  324 cacaagacttttataaaacaaaaaag-tcattaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    | ||||| |||| || ||| |||||| |  |||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  47031308 ctcaagatttttctataaccaaaaagttttttaaaatccttcaaaatcccaattcaatacaccc 47031245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 382
Target Start/End: Original strand, 48545674 - 48545899
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    |||||||| |||||  || | ||||||||||||  ||| ||||||||||||  | |||||||  || |||||||||   ||||  || ||||| ||||||    
T  48545674 aatccattgaaatctatacatttttgaatacca--agagaatttttaagttgcgaaaaatcttgatggaataccaccgaatttagttagactctttaaaa 48545771  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaaga-cttttataaaacaaaaaagtc-att 354  Q
    ||||   |||||| ||||||||||| || | |||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||| ||||| ||  ||    
T  48545772 aatccgaaaaatcttaattgaatactaccaaaattatttctaatcctttaaaatcttgattgaatacctcaagattttttttagaactaaaaaatctttt 48545871  T
Q  355 aaaatcttttgaaatctcaatccaatac 382  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  48545872 aaaatctttcaaaatctcaattcaatac 48545899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41060099 - 41060037
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41060099 attgaataccacaagatttatttatatttaataaaaatcttgattgaataccacaaaactttt 41060037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 46037204 - 46037278
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  46037204 aatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 46037278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 273 - 389
Target Start/End: Original strand, 12253361 - 12253478
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatct 371  Q
    ||||||||||| |||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  |||| |||  |   | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12253361 attgaataccataagatttatttagattccataaaagtcttgattcaatacctaaagattttcttttcataaaaaagtctattaaaatcctttgaaatct 12253460  T
Q  372 caatccaatacaccccct 389  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12253461 caattcaatacaccccct 12253478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32630892 - 32630731
Alignment:
Q  193 gacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgt 292  Q
    |||||||||||||||  | |||||||  ||  ||||||||  |||||  |||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||   |||      
T  32630892 gacaatttttaagttgagaaaaatcttgatataataccaccagattttgttggactctttaaaagtgcctgaaaatcctaattgaataccactgaaatta 32630793  T
Q  293 tttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt 354  Q
    ||| || || || |||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||||    
T  32630792 tttctaatcttttaaaagcttgattgaatacctcaagatttttttataagcaaaaagtcatt 32630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 36355338 - 36355534
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||| ||   |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||   |||||  |||||||| ||||||    
T  36355338 aatccattaaaatctatacatttttgaataacaaaggacaatttttaagttgagaaaaatcttgatttaataccatcagattttgttggactccttaaaa 36355437  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt 354  Q
    |  | ||||| || ||||||||||||||  ||||  ||| || || || ||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||| |||||    
T  36355438 atgcctgaaa-tcttaattgaataccactggaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatacctcacgatttttttataaccaaaaaatcatt 36355534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33474632 - 33474513
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaa-acaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatc 370  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||    | |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  33474632 attgaataccacaagatttatttagattccataaaagtcttgattcaataactcaaga-ttttatgttcataaaaaaatctattaaaatcctttgaaatc 33474534  T
Q  371 tcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  33474533 tcaattcaatacaccccctaa 33474513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 389
Target Start/End: Original strand, 43057839 - 43057875
Alignment:
Q  353 ttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057839 ttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccct 43057875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3634296 - 3634213
Alignment:
Q  304 taaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||  ||||||||  | ||||||  ||||||||||||||    
T  3634296 taaaagtcttgattgaatatcacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaatccctagaaatccgaatccaatacaccc 3634213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28342313 - 28342283
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342313 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 28342283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 388
Target Start/End: Original strand, 34115441 - 34115559
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  34115441 taattgaataccatgagatttatttatattccataaaagtcttgattgaatactacaagatttttttatcattaaaaagtcttttaaaatcatttgaaat 34115540  T
Q  370 ctcaatccaatacaccccc 388  Q
     | ||| ||||||| ||||    
T  34115541 tttaattcaatacatcccc 34115559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Original strand, 37042438 - 37042595
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||  |||||| |||||||||| ||  |||||| ||| | | |  ||||||  ||||   || |||||||    
T  37042438 ttttgaataccatgagataatttataagttgtgagaaatcttaattgaatactaccggatttcgttgcatttaaaaaaaaaatttgattgtcataattga 37042537  T
Q  278 ataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    ||||||||| | |  |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37042538 ataccacaaaattaatttagattttataaaaatcttgattgaataccacaagattttt 37042595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3022976 - 3022940
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3022976 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 3022940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 381
Target Start/End: Original strand, 9599033 - 9599145
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttata-aaacaaaaaag-tcattaaaatcttttgaaa 368  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| |||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| |  ||||||||| || |||    
T  9599033 taattgaatacaacaagatttatttaaattttataaaattcttgattgaatactacaagacttttttataattaaaaaagttttttaaaatctcttaaaa 9599132  T
Q  369 tctcaatccaata 381  Q
    |||||||||||||    
T  9599133 tctcaatccaata 9599145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 381
Target Start/End: Original strand, 9826604 - 9826716
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttata-aaacaaaaaag-tcattaaaatcttttgaaa 368  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| |||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| |  ||||||||| || |||    
T  9826604 taattgaatacaacaagatttatttaaattttataaaattcttgattgaatactacaagacttttttataattaaaaaagttttttaaaatctcttaaaa 9826703  T
Q  369 tctcaatccaata 381  Q
    |||||||||||||    
T  9826704 tctcaatccaata 9826716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12252416 - 12252384
Alignment:
Q  357 aatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12252416 aatcttttaaaatctcaatccaatacaccccct 12252384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32630725 - 32630649
Alignment:
Q  300 tccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtca-ttaaaatcttttgaaatctcaat 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||| |||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  32630725 tccttcaaaatcttgattgaatacctcaagatttttttataaccaaaacgtcatttaaaatccttcaaaatctcaat 32630649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 8583735 - 8584090
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  8583735 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 8583834  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8583835 ctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatcttaattgaataccac 8583934  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583935 tgaatttcattggactcgttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 8584034  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8584035 tttataaaataaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacacccc 8584090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44930229 - 44929872
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  44930229 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaaatctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 44930130  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930129 ctcacaaaatcctttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacccgtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 44930030  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930029 tgaatttcattg--ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatattttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 44929932  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagt-cattaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44929931 tttataaaacaaaaaagtattttaaaatcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaa 44929872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 80 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8880764 - 8880442
Alignment:
Q  80 tgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaa 166  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880764 tgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaa 8880665  T
Q  167 aatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880664 aatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 8880565  T
Q  267 atcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgatt-gaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatctttt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  8880564 atcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttaattggaataccacaagatttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatccttt 8880465  T
Q  365 gaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  8880464 gaaatct-aatccaatacaccccc 8880442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 62 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 52109744 - 52109409
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca-------------caaaattcatta 148  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||             |||||| |||||    
T  52109744 aaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgggattgttagtaggtacattttacattaaacaatctcacaaaatccatta 52109645  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52109644 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcggtatacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccattggatttcattggact 52109545  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52109544 cattaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagatttttataaaacaaaaaa 52109445  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaataca 383  Q
    |||  |||||||  ||| |||||| |||| ||||||    
T  52109444 gtcttttaaaatactttaaaatctaaatctaataca 52109409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 3435693 - 3436038
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  3435693 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatg------agatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 3435786  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435787 ctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagcacacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 3435886  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     |||    
T  3435887 tgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagattgttttacattccttaaaattcttgattgaatacc-----act 3435981  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3435982 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttaaaatctcaatccaataaaccccc 3436038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40144098 - 40143774
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacaaaattcattactcacaacaatcc 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |   |||||||||||||    
T  40144098 aaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa---aagtctcacaacaatcc 40144002  T
Q  162 attaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatct 261  Q
    |||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||     
T  40144001 attaaaattcttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatacctctgaattttattggacttattaaaaaatca 40143902  T
Q  262 tgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  40143901 tgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaatc 40143802  T
Q  361 ttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    
T  40143801 ttttgaaatctcaattgaatacaccccc 40143774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 46 - 288
Target Start/End: Original strand, 42218176 - 42218431
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  42218176 ttggaagaatattacaaaatctcaaggctatgtgtaggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 42218275  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42218276 ctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 42218375  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaga 288  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42218376 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaga 42218431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25936039 - 25935779
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactc 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25936039 cacaaaatccattactcacaacaatccattaaaattcgatgagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatactacta 25935940  T
Q  235 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25935939 gatttcattggactcattaaaaaattttgaaaatcctaattgaatatcacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccataaaacttt 25935840  T
Q  335 tataaaa-caaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25935839 tataaaataaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 25935779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 65 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45333001 - 45332661
Alignment:
Q  65 tctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||             ||||| ||||||||    
T  45333001 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtttcataaaatccattactc 45332902  T
Q  152 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcat 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45332901 acaacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcat 45332802  T
Q  252 taaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45332801 taaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagttttgattgaatacctaaagacatttttaaaacaaaaaagtc 45332702  T
Q  352 -attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
      |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45332701 ttttaaaattctttgaaatctcaattgaatacaccccctaa 45332661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 67 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47685477 - 47685145
Alignment:
Q  67 tcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcac 153  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||  |||||||||    
T  47685477 tcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaagtttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcgcaaaatctattactcac 47685378  T
Q  154 aacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcatta 253  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  47685377 aacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgagcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggactcatta 47685278  T
Q  254 aaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-a 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||      
T  47685277 aaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagatttttttaaaacaaaaaagtctt 47685178  T
Q  353 ttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47685177 ttaaaatcttttgaaatctcaattgaatacacc 47685145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 62 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 54510050 - 54509713
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac--aaaattc-------att-act 150  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       ||  | |    
T  54510050 aaatctcaaagctatgtgtgggagacaaaaaaagcctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 54509951  T
Q  151 cacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactca 250  Q
    || |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54509950 cataacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactca 54509851  T
Q  251 ttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagt 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  54509850 ttaaaaaattatgaaaatcctaattgaatatcacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagt 54509751  T
Q  351 c-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  54509750 cttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacacccc 54509713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26336407 - 26336079
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||             ||||| ||||    
T  26336407 aaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 26336308  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  26336307 actcacaataatccattaaaatccttagaattttgaataccaataaacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggac 26336208  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  26336207 tcattaaaa---------aatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacatttttaaaacaaaaa 26336117  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacac 384  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  26336116 agtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacac 26336079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42721055 - 42720730
Alignment:
Q  65 tctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattact 150  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||             ||||| |||||||    
T  42721055 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattact 42720956  T
Q  151 cacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactca 250  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  42720955 cacaacaacccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactca 42720856  T
Q  251 ttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagt 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  42720855 ttaaaaaattctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattacttaaaagttttgattaaatacctaaagacatttttaaaacaaaaaagt 42720756  T
Q  351 c-attaaaatcttttgaaatctcaat 375  Q
    |  |||||||| ||| ||||||||||    
T  42720755 cttttaaaatcctttaaaatctcaat 42720730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45340691 - 45340435
Alignment:
Q  65 tctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||             ||||| ||||||||    
T  45340691 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtttcataaaatccattactc 45340592  T
Q  152 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcat 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45340591 acaacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcat 45340492  T
Q  252 taaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaa 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45340491 taaaaaattctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaa 45340435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 281
Target Start/End: Original strand, 33450011 - 33450157
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactc 234  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  33450011 cacaaaatccattactcacaataatccattaaaatccgtagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccaccg 33450110  T
Q  235 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatac 281  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33450111 aattttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatac 33450157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7820240 - 7820091
Alignment:
Q  243 tggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7820240 tggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttagattccttgaaaattttgatggaataccacaaaacttttataaaac 7820141  T
Q  343 aaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7820140 aaataagtcttttaaaatcatttgaaatctcaatccaatataccccctaa 7820091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7820401 - 7820239
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaagg-ctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacaaaattc 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |    
T  7820401 ttggaagagtaatacaaaatcccaagggctatgtgtgggagacagaaaagtctccaggctaggtgtgagattgttagtaggtgcattttacactaaa--c 7820304  T
Q  145 attactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatg 210  Q
    | | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7820303 aat-ctcataaaaattcattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatg 7820239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 388
Target Start/End: Original strand, 42218407 - 42218490
Alignment:
Q  306 aaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaag-tcattaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42218407 aaaatcctaattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagttttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccc 42218490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 28846956 - 28847193
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||    |||||||| |  || |  ||||    
T  28846956 aatccatcaaaatctatagatttttgaataccaatggacaattaataagtcaagagaaatctcaattgaataccgacggatttcatggccctgaacaaaa 28847055  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt-a 355  Q
    | || |||   || |||||||||||||||||| |  |||  ||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||| || |    
T  28847056 agtcatgattgtcttaattgaataccacaagatttattttcatttcataaaagttttgattgaataccactagacttttttattataaaaaagtctttta 28847155  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28847156 aaatcctttaaaatctcaatccaatacatcccctaaat 28847193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5117156 - 5117024
Alignment:
Q  192 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatg 291  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||  || |||||||||  |||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||     
T  5117156 agacaatttttaagttgcgaaaaatcttgatggaataccaccggatttcattgaactctttaaaaagtcctgaaaatcttaattgaataccacttgaatt 5117057  T
Q  292 ttttatattccttaaaaatcttgattgaatacc 324  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||||    
T  5117056 atttctaatctcttaaaatcttgattgaatacc 5117024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53272139 - 53271961
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||  || | |||||    
T  53272139 aatccattaaaatatgtatacttttgaataccaatagacattttataagtcagccaaagtctcatttgaataccaccggatttcgttgccctgaataaaa 53272040  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    | ||||||   || | |||||||||||||| | |  ||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53272039 agtcttgattgtcttgattgaataccacaatatttatttatattatataaaagtcttgattgaatatcacaagactttt 53271961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 388
Target Start/End: Original strand, 33450140 - 33450223
Alignment:
Q  306 aaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt-aaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33450140 aaaatcctaattgaatactacacgacttttttaaaacgaaaaagtcttttaaaatccattgaaatctcaatccaatacaccccc 33450223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41762093 - 41761978
Alignment:
Q  274 ttgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaa-tcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt-aaaatcttttgaaatct 371  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||||| || |||||| ||| ||||||    
T  41762093 ttgaataccacaagacttatttatattttataaaaagtcttgattcaataccacaagacttttttataatcacaaagtcttttaaaatcctttaaaatct 41761994  T
Q  372 caatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||||||||||    
T  41761993 caatccaatacacccc 41761978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 388
Target Start/End: Original strand, 28100552 - 28100669
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa-gtcatt-aaaatcttttgaaatc 370  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| || |||| |  ||||||||    
T  28100552 attgaataccataagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagacttttttataataaaaaaagtcttttaaaaccccttgaaatc 28100651  T
Q  371 tcaatccaatacaccccc 388  Q
     |||||||||||||||||    
T  28100652 ccaatccaatacaccccc 28100669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35261665 - 35261614
Alignment:
Q  337 taaaacaaaaaagtcatt-aaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35261665 taaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacacccc 35261614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53594202 - 53594097
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||  |||||||   |||||||    
T  53594202 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaatttttgattgaatgccacaagacttttctataataaaaaagtcttttaaaattcattgaaat 53594103  T
Q  370 ctcaat 375  Q
    ||||||    
T  53594102 ctcaat 53594097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 273 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 56397557 - 56397440
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatct 371  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||| |||  |   | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  56397557 attgaataccacaaaatttatttagattccataaaagtcttgaatcaatacctcaagattttcttttcataaaaaagtctattaaaatcctttgaaatct 56397458  T
Q  372 caatccaatacaccccct 389  Q
    |||| |||||||||||||    
T  56397457 caattcaatacaccccct 56397440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25936096 - 25936050
Alignment:
Q  90 aaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25936096 aaaagtctcaaggctag-tgtgagattgttaataggttcattttacac 25936050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9163131 - 9163101
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9163131 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 9163101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27768027 - 27767997
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768027 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 27767997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38231002 - 38230928
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38231002 aatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 38230928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 388645 - 388612
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaa 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  388645 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaaa 388612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 336
Target Start/End: Original strand, 37370855 - 37370920
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttta 336  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  37370855 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagttttgattgaataccacgagactttta 37370920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 341
Target Start/End: Original strand, 39307407 - 39307440
Alignment:
Q  308 aatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39307407 aatcttgattgaataccacaagacttttttaaaa 39307440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42315013 - 42314956
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaaga 330  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  42315013 attgaataccacaagatttatttagattccataaaaatcttgattcaatacctcaaga 42314956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44646804 - 44646719
Alignment:
Q  304 taaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |  ||||||||  ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  44646804 taaaagtcttgattgaataccacaagatttttttatcattaaaaagtcttttaaaatctcttgaaatcttgattcaatacaccccc 44646719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25331097 - 25331017
Alignment:
Q  310 tcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||  ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  25331097 tcttgattgaataccacaagactttttcatgataaaaaagtcttttaaaatcttttagaatcatgatccaatacaccccct 25331017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27529116 - 27529084
Alignment:
Q  355 aaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27529116 aaaatctcttgaaatctcaatccaatacacccc 27529084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28846198 - 28846162
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaatat 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28846198 tcttttaaaatctcaatccaatacacccccttaatat 28846162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32322146 - 32322110
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32322146 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 32322110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 39479597 - 39479677
Alignment:
Q  310 tcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||  ||||||| | || |||||   ||||||||||||||||    
T  39479597 tcttgattgaataccacaagacttttttatgataaaaaagtcttttaaaatttcttaaaatcatgatccaatacaccccct 39479677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40915381 - 40915353
Alignment:
Q  255 aaaatcttgaaaatcctaattgaatacca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40915381 aaaatcttgaaaatcctaattgaatacca 40915353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53275896 - 53275864
Alignment:
Q  303 ttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53275896 ttaaaaatcttgattgaatactacaagactttt 53275864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 41386600 - 41386956
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  41386600 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 41386699  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386700 ctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 41386799  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386800 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaacaatgttatacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 41386899  T
Q  333 tttataaaacaaaaaag-tcatt-aaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386900 tttataaaacaaaaaaaatcttttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 41386956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 43605094 - 43605453
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca--------- 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             
T  43605094 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaagtacattttacattaaacaat 43605193  T
Q  137 ----caaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43605194 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcgaaatctcaattgaataccac 43605293  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43605294 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 43605393  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaa 392  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43605394 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatac-ccccctaaa 43605453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2113145 - 2112791
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            
T  2113145 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagacagaaaagtctcaatgctaggtgtgagattgtcagtaggtacattttacactaaacaat 2113046  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2113045 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcgaaatctcaattgaataccac 2112946  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112945 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 2112846  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2112845 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccc 2112791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Original strand, 29260006 - 29260367
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||            
T  29260006 ttggaatagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtacgtacattttacactaaacaat 29260105  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29260106 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 29260205  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29260206 tggatttcattggactcgttaaaaaatctcgaaaatcctaattgaatatcacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 29260305  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29260306 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttaaaatctcaatccaatacaccccctaaat 29260367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 40265011 - 40265367
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  40265011 ttggtagagtattacaaaatctaaaggctacgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 40265110  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40265111 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagagttttgaataccattagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 40265210  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40265211 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatatcacaagact 40265310  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40265311 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatttcaatccaatacaccccc 40265367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 46 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 42275327 - 42274968
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattg-ttagtaggtacattttacac------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  42275327 ttggaagagtattacaaaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattggttagtaggtacattttacactaaacaa 42275228  T
Q  138 ------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
          ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42275227 tctcacaaaatccattactcacaacaatccataaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccg 42275128  T
Q  232 ctcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagac 331  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42275127 ctggatttcatttgactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagac 42275028  T
Q  332 ttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccccta 390  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42275027 ttttataaaacaaaaaaatcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacacccccta 42274968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 46 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4655401 - 4655044
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            
T  4655401 ttggaagagtatcacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatgtacattttacactaaacaat 4655302  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655301 ctcacaaaatccattactcataacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccggtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 4655202  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4655201 tgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattaaataccacaagact 4655102  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655101 tttattaaacaaaaaaatcttttaaaattctttgaaatctcaatccaatacaccccct 4655044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7148394 - 7148050
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  7148394 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 7148295  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148294 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatgccagtagacaatttctaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 7148195  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  7148194 tggatttcattggactccttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatgccacaagaatgttttacattcctta------ttgattgaataccacaagact 7148101  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatac 382  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7148100 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatac 7148050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28620183 - 28619843
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca-------------caaaattcatt 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||| ||||||    
T  28620183 aaaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaagattaggtgtgagattgttagtaggtacattgtacattaaacaatctcacaaagttcatt 28620084  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  28620083 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactgaatttcattggat 28619984  T
Q  248 tcattaaaaa-atcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaa 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28619983 tcattaaaaatatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttaattgaataccacaaaacttttataaaacaaaa 28619884  T
Q  347 aagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28619883 aagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccc 28619843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 389
Target Start/End: Original strand, 10802533 - 10802858
Alignment:
Q  78 tgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccatt 164  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10802533 tgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccatt 10802632  T
Q  165 aaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802633 aaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttga 10802732  T
Q  265 aaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttt 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||    
T  10802733 aaatcctaattgaatactacaagaatgttttacattttttaaaaatcttgattgaataccagaagacttttataaaataaaaaagtcttttaaaattatt 10802832  T
Q  364 tgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  10802833 tgaaatctcaattcaatacaccccct 10802858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 95 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9457848 - 9457541
Alignment:
Q  95 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 181  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457848 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 9457749  T
Q  182 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatac 281  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9457748 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaaatgaatac 9457649  T
Q  282 cacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaat 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9457648 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaatctcaatcgaat 9457549  T
Q  381 acaccccc 388  Q
    ||||||||    
T  9457548 acaccccc 9457541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 389
Target Start/End: Original strand, 30382420 - 30382761
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||             |||||| ||||    
T  30382420 aaatctcaaagttatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaattgatta 30382519  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  30382520 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattgaact 30382619  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  30382620 aattaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttagaagtcttgattgaatacctaaagactttttaaaaacaaaaaa 30382719  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30382720 gtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccct 30382761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 61 - 371
Target Start/End: Original strand, 4302551 - 4302877
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa--gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacaaaa-------------ttca 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             | ||    
T  4302551 aaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaatgtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcgctaaatcca 4302650  T
Q  146 ttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattgg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  4302651 ttactcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaatactaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccattgaattttattgg 4302750  T
Q  246 actcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4302751 actcattaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaacagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaa 4302850  T
Q  346 aaagtc-attaaaatcttttgaaatct 371  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4302851 aaagtcttttaaaatcctttgaaatct 4302877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 192 - 391
Target Start/End: Original strand, 1605902 - 1606102
Alignment:
Q  192 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1605902 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatactactggatttcattagactcattaaaaaatcttgaaaatcttaattgaataccacaagaatg 1606001  T
Q  292 ttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccccta 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606002 ttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacacccccta 1606101  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  1606102 a 1606102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 62 - 389
Target Start/End: Original strand, 37567118 - 37567450
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||             ||||| |||||    
T  37567118 aaatcttaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaaagcctcacaaaatccatta 37567217  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  37567218 ctcacaacaattcattaaaatccgtacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatactactggattttattggact 37567317  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  37567318 cattaa---------aaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttaattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaa 37567408  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37567409 atcttttaaaatcttttgaaatctcaattgaatacaccccct 37567450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 90 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8502942 - 8502667
Alignment:
Q  90 aaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtaga 176  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502942 aaaagtcttaaggctatgtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtaga 8502843  T
Q  177 gttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattg 276  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8502842 attttaaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatcttaattgaataccaccggattttattggactcattcaaaaatcttgaaaatcctaattg 8502743  T
Q  277 aataccacaagaatgttttatatt-ccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8502742 aataccacaagaatgttttacattcccttaaaaatcttaattaaataccacaagacttttttaaaacgaaaaagtc 8502667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 138 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35142291 - 35142041
Alignment:
Q  138 aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgat 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||  |||    
T  35142291 aaaatccattactcacaacaatctaataaaatccgtaatattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatcttaattgaatacgaccggat 35142192  T
Q  238 ttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttat 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35142191 tttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaattttgattgaataccacaagactttttt 35142092  T
Q  338 aaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  35142091 aaaacgaaaaagtcttttaaaatccattaaaatctcaatccaatacacccc 35142041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 266
Target Start/End: Original strand, 41965530 - 41965761
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            
T  41965530 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgcgagattgttagtaggtacattttacactaaataat 41965629  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965630 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatatgtagagttttgaataccagtagacaattt--aagttatgcaaaatctcaattgaataccac 41965727  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 266  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965728 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 41965761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 135 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9209288 - 9209029
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactc 234  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||     
T  9209288 cacaaaataaattacccacaacaaactattaaaatccttagagttttgaataccaatagacaatttttaagttgtccaaaatttcaattgaataccactg 9209189  T
Q  235 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttt 334  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||    
T  9209188 gattttattgaactcattaaaaaatcctgaaaatcttaattgaataccacaaaaatgttttagattccttaaaagtcttgattcaatacctaaatacttt 9209089  T
Q  335 tataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    | |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9209088 tttaaaacaaaaaagtcttttaaaattctttgaaatctcaattcaatacaccccttaaat 9209029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 194 - 387
Target Start/End: Original strand, 40013363 - 40013555
Alignment:
Q  194 acaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgtt 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40013363 acaatttttaagttgtgcaaaatctaaattgaataccactgaattttattgaactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattaaataccacatgaatgtt 40013462  T
Q  294 ttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40013463 ttacattccttaaaaattttgattgaata-cacaa-acttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaattctttgaaatctccatccaatacacccc 40013555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 41965328 - 41965404
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41965328 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgcgagattgttagt 41965404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Original strand, 24296506 - 24296736
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||  | |  |||||||||||   ||||| |||| |||| ||||||    
T  24296506 aatccattaaaatctatacatttttgaatatcaagagactatttttaagttatgaaatttttttattgaataccatcagattttattgaactctttaaaa 24296605  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-atta 355  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |  |||||| || || |||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||  |||    
T  24296606 aatcatgaaaatcctagtggaataccaccagatttatttataatcttttaaaatcatgattgaatacctcaagatttttctataaccaaaaagtctttta 24296705  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  24296706 aaatctttcgaaatcccaattcaatacaccc 24296736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14061776 - 14061598
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||| ||| |||||    |||| ||||| |||||||||||   ||||| ||| ||| | |||||    
T  14061776 aatccattaaaatttgtatacttttgaataccaacagacattttataagtcggccaaagtctcatttgaataccaccgaatttcgttgcactgaataaaa 14061677  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    | ||||||   || | |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14061676 agtcttgattgtcttgattgaataccacaagatttatttatattctataaaaatcttgattgaataccacaagactttt 14061598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17790552 - 17790431
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt-aaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||   ||||| || |||||||||||||||| | |||  ||  |  |||||||| || ||||||| |||||||    
T  17790552 taattgaataccacaagattttgttatattttataaaagtcatgattgaataccacaaaattttattatcatcaaaaagtcttttaaaatctcttgaaat 17790453  T
Q  370 ctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17790452 ctcaatccaatacaccccctaa 17790431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23185906 - 23185801
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||  ||||| ||||||  |  |||||  | |||||||||||||||||    
T  23185906 tttttaataccaggagacaatttttaagttgtgaaaaattttgattgaataccaccagattttattggatcctataaaattttttgaaaatcctaattga 23185807  T
Q  278 atacca 283  Q
    ||||||    
T  23185806 atacca 23185801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Original strand, 40013264 - 40013317
Alignment:
Q  81 gggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacatttta 134  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40013264 gggagacagaaaagtctcaaggccaagtgtgagattgttagtaggtatatttta 40013317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3148642 - 3148564
Alignment:
Q  251 ttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaaga 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||||    
T  3148642 ttaaaaaatcttgaaaatccaaattgaataccataag-attttttatattatataaaagtcctgattaaataccgcaaga 3148564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 392
Target Start/End: Original strand, 4656134 - 4656167
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaa 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4656134 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaaa 4656167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 393
Target Start/End: Original strand, 10128319 - 10128355
Alignment:
Q  357 aatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10128319 aatcttttaaattctcaatccaatacaccccctaaat 10128355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24318027 - 24317963
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24318027 taattgagtaccacaagattaatttatattatataaaagtcttgattgaataccacgagactttt 24317963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45318814 - 45318458
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  45318814 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggtgataaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 45318715  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45318714 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 45318615  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45318614 tggatttcattggattcattagaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaataatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccagaagact 45318515  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45318514 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccc 45318458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 26882556 - 26882911
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||            
T  26882556 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggtgatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatatacattttacactaaacaat 26882655  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26882656 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatctgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 26882755  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26882756 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataacacaagact 26882855  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26882856 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacacccc 26882911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 52705747 - 52705393
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||            
T  52705747 ttggaagagtattacaatatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtcttaaggctaggcgtgagattgttagtaagtacattttacaccaaacaat 52705648  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52705647 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 52705548  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52705547 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 52705448  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52705447 tttataaaacaaaaaaatcttttaaaatcttttgaaatctcaattgaatacaccc 52705393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36402585 - 36402245
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||    
T  36402585 aaatctcaaagttatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 36402486  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36402485 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggact 36402386  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  36402385 cattaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaa 36402286  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  36402285 gtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccc 36402245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 61 - 387
Target Start/End: Original strand, 1928149 - 1928489
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||             ||||| ||||    
T  1928149 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtcacaaggctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 1928248  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1928249 actcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactggattttattggac 1928348  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  1928349 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaa 1928448  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||  |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1928449 agtcttttaaaatcctttaaaatctcaattgaatacacccc 1928489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 393
Target Start/End: Original strand, 33243060 - 33243401
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca-------------caaaattcatta 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||             |||||| |||||    
T  33243060 aaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctct----taggtgtgagattgttagtaggtacaatttacattaaaaagtttcacaaaatccatta 33243155  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  33243156 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatctcaattgaataccactggattttattgtact 33243255  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  33243256 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaaaacttttttaaaacaaaaaa 33243355  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  33243356 gtcttttaaaatcttttgaaatttcaattgaatacatcccctaaat 33243401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 393
Target Start/End: Original strand, 33263233 - 33263574
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca-------------caaaattcatta 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||             |||||| |||||    
T  33263233 aaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctct----taggtgtgagattgttagtaggtacaatttacattaaaaagtttcacaaaatccatta 33263328  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  33263329 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatctcaattgaataccactggattttattgtact 33263428  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  33263429 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaaaacttttttaaaacaaaaaa 33263528  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  33263529 gtcttttaaaatcttttgaaatttcaattgaatacatcccctaaat 33263574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29209090 - 29208757
Alignment:
Q  65 tctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||             ||||| ||||||||    
T  29209090 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatatatgttacactaaaaagtctcacaaaatccattactc 29208991  T
Q  152 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcat 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  29208990 acaacaatccattaaaatccttagaactttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactcat 29208891  T
Q  252 taaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  29208890 taaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccaccagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacatttttaaaacaaaaaagtc 29208791  T
Q  352 -attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacac 384  Q
      |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  29208790 ttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacac 29208757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 62 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10897138 - 10896799
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca-------------caaaattcatta 148  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||| |||||    
T  10897138 aaatctcaaagctatgtgtgagagacaaaaaagtgtcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacattaaaatgtttcacaaaatccatta 10897039  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  10897038 ctcataacaatccattaaaatcctaccaattttgaataccaatagacaatttttaagttgggcaaaatctcaattgaataccactggattttattagact 10896939  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  10896938 cattaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaataaaaaa 10896839  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
     ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10896838 atcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacacccc 10896799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9831499 - 9831294
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  9831499 ttttgaataccaatagacaatttgtaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaaatc---------ctaattga 9831409  T
Q  278 ataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatc 376  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||     
T  9831408 atactacaagaatgttttagattccttacaagttttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatt 9831309  T
Q  377 caatacaccccctaa 391  Q
     ||||||||| ||||    
T  9831308 gaatacaccctctaa 9831294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45534993 - 45534847
Alignment:
Q  200 tttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  45534993 tttaagttatgcaaaatctcaattgaataccgctgaatttcattggactcattaaaaaatcttaaaaatcctaattaaataccacaagaatg--ttacat 45534896  T
Q  300 tccttaaaaatcttgattgaat-accacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||    
T  45534895 tccttaaaaatcttgattgactaagtaccagacttttataaaacaaaaa 45534847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9191361 - 9191131
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    |||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||    
T  9191361 aatccattgaaatcaatacatttttgaataccaagagacaatttttaagttgtaataaatcttgattgaataccaccagattttgttggactctttaaaa 9191262  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-atta 355  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||  ||||  ||| || || || ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||  |||    
T  9191261 aatcattaaaatcctaattgaataccaccggaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaataactcaagatttttctataaccaaaaagtctttta 9191162  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  9191161 aaatttttccaaatctcaatccaatacaccc 9191131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42657829 - 42657712
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt-aaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| || ||||||| |||||||    
T  42657829 taattgaataccacaagattattt-atattttatgaaagtcttgattgaataccacaagacttttttataattaaaaagtcttttaaaatctcttgaaat 42657731  T
Q  370 ctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42657730 ctcaatccaatacaccccc 42657712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27198501 - 27198271
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||||||| | |||| |||  |||| |||  ||||||||||| |||||||   |||||| |||  || |  |||     
T  27198501 aatccattaaaatctatatatttttgaataccaatggacattttagaagtaatgagaaatctcaattcaataccaacggatttcgttgcgctgaaaaaag 27198402  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-atta 355  Q
    |||| |||   || |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  |||    
T  27198401 aatcatgattgtcttaattgaataccacaagatttatttatattttataaaagttttgattgaataccacaagacttttttataaacaaaaagtctttta 27198302  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||    
T  27198301 aaatcccttaaagtctcaatccaatacaccc 27198271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45535089 - 45534991
Alignment:
Q  95 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttt 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45535089 tctcaaggctacgtgtgagattgttagtaggtacattttacactcaacaatctcaaaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcagtagagttt 45534991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48203462 - 48203343
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatct 371  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||  ||||||||  ||||||||     
T  48203462 attgaataccacaagatttgtttatattttataaaagtcttgattgaataccactagactttttcattctaaaaaagtcttttaaaatcccttgaaatcc 48203363  T
Q  372 caatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  48203362 caattcaatacaccccctaa 48203343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 386
Target Start/End: Original strand, 19007549 - 19007663
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatct 371  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |  | |||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  19007549 attgaataccacaagatttgtttacattttataaaagtcttgattgaataccactagactttttcattataaaaaagtcttttaaaatcccttgaaatct 19007648  T
Q  372 caatccaatacaccc 386  Q
    |||| ||||||||||    
T  19007649 caattcaatacaccc 19007663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9831818 - 9831782
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatcc 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9831818 cacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcc 9831782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 385
Target Start/End: Original strand, 14555279 - 14555394
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  14555279 taattgaataccacaaattttttttatattttataaaagtcttgattgaataccaccaaacttttttattataaaaaagtcttttaaaatccttttaaat 14555378  T
Q  370 ctcaatccaatacacc 385  Q
      ||||||||||||||    
T  14555379 tacaatccaatacacc 14555394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48194820 - 48194585
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||   |||||  |||   | |  ||||    
T  48194820 aatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaattgaataccaacggattttgttgccttaaaaaaaa 48194721  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-atta 355  Q
    | || |||   || | |||||||||||||||| |  |||| |||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||  |||    
T  48194720 agtcatgattgtcttgattgaataccacaagatttgtttagattttataaaagtcttgattgaataccactagactttttcattctaaaaaagtctttta 48194621  T
Q  356 aaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48194620 aaatcccttgaaatcccaattcaatacaccccctaa 48194585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 19007434 - 19007508
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19007434 aatccatcaaaatctatagactttttaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 19007508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 28824492 - 28824553
Alignment:
Q  274 ttgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28824492 ttgaataccacaagactgtttttaagtgattaagagtcttgattgaataccacaagactttt 28824553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 392
Target Start/End: Original strand, 52706446 - 52706479
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaa 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52706446 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaaa 52706479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 391
Target Start/End: Original strand, 10897700 - 10897732
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10897700 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaa 10897732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 391
Target Start/End: Original strand, 14389480 - 14389512
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14389480 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaa 14389512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22183421 - 22183389
Alignment:
Q  303 ttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183421 ttaagaatcttgattgaataccacaagactttt 22183389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25612206 - 25612170
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25612206 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 25612170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43553652 - 43553536
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| |||   ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||  |  |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  43553652 taattgaatacaacaagatttatttaaattttataaaagtcttaattgtataccacaagacttttttattatgaaaatgtctattaaaatctcttgaaat 43553553  T
Q  370 ctcaatccaatacaccc 386  Q
    || ||| ||||||||||    
T  43553552 cttaattcaatacaccc 43553536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 24150562 - 24150917
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  24150562 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 24150661  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150662 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtggacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 24150761  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24150762 tggatttcattggactcattaaaaaatcttcaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagatt 24150861  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24150862 tttataaaacaaaaaaatcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatatacccc 24150917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 36054737 - 36055093
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||            
T  36054737 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacactaaacaat 36054836  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36054837 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaaaactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 36054936  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36054937 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 36055036  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36055037 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccc 36055093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35731286 - 35730933
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||            
T  35731286 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaatgctaggtgtgagattgttagcaggtgcattttacactaaacaat 35731187  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35731186 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 35731087  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35731086 tggatttgattggactcattaaaaaatcttgaaaatcttaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaatatcacaagact 35730987  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacc 385  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35730986 tttataaaacaaaaaaatcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacacc 35730933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 38629530 - 38629885
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  38629530 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaaatctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 38629629  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38629630 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtatagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccgc 38629729  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629730 tgaatttcattgaactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 38629829  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  38629830 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaattatttgaaatcttaatccaatacacccc 38629885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30589194 - 30588836
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac------- 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  30589194 ttggaagagtattacaaaatctgaaggctatgtgtgggtgataaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaa 30589095  T
Q  138 ------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30589094 tctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgctaaatctcaattgaatacca 30588995  T
Q  232 ctcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagac 331  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30588994 ctgaatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattctttaaaaatcttgattgaataccacaagac 30588895  T
Q  332 ttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  30588894 ttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttaaaatttcaatctaatacaccccct 30588836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Original strand, 50900177 - 50900531
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttaca--------- 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             
T  50900177 ttggaagagtattacaaaatctcaaggaaatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatgtacattttacattaaacaat 50900276  T
Q  137 ----caaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50900277 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatctctagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaatcgaataccac 50900376  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50900377 tggatttcattggactcattaaaaaagcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattctttaaaaatcttgattgaataccacaagact 50900476  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50900477 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatcttaatccaatacaccc 50900531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 76 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26556121 - 26555811
Alignment:
Q  76 tgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtag 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26556121 tgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa--caat-ctcacaa-aatccattaaaatccgtag 26556026  T
Q  176 agttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaatt 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26556025 agttttgaatacccgtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatctagaaaatcctaatt 26555926  T
Q  276 gaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaa 374  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  26555925 gaataccacaataatattttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaa 26555826  T
Q  375 tccaatacaccccct 389  Q
    |||||||||||||||    
T  26555825 tccaatacaccccct 26555811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Original strand, 26293297 - 26293649
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||            
T  26293297 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacagaaaagtctcaagattaggtgtgaggttgttagtaggtacattttacactaaacaat 26293396  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26293397 cacacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtaaacaatttttaagttatgcaaaatctcaattaaatatcac 26293496  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26293497 tagatttcattggactcattaaaaaatattgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaaaact 26293596  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacac 384  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  26293597 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatttcaattcaatacac 26293649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 389
Target Start/End: Original strand, 19551888 - 19552235
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacaaaattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |    
T  19551888 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagaaagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttattaggtacattttacactaaaca-a 19551986  T
Q  146 ttactca----caacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttca 241  Q
    || | ||    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  19551987 tttcacaaaatcaacaatcaattaaaatctgtagagttttgaataccactagacaatttttaagttatgcaaaatcttaattaaataccactggatttca 19552086  T
Q  242 ttggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19552087 ttgaactcgttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacatttcttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 19552186  T
Q  342 caaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
     |||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19552187 taaaaaaatcttttaaaatcctttaaaatctcaatccaatacaccccct 19552235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 61 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13662887 - 13662546
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||    
T  13662887 aaaatctcaaggttatgtgtgggaggcagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 13662788  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662787 actcacaacaatccattaaaacccgtagtgttttgaatacgagtagacaatttttaagttgtgcgaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 13662688  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13662687 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacgagaatgttttacattccttacaaatcttgattgaataccacgagacttttgtaaaacaaaaa 13662588  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13662587 agtcttttaaaattctttgaaatctcaatccaatacaccccc 13662546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 103 - 391
Target Start/End: Original strand, 26005770 - 26006072
Alignment:
Q  103 ctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26005770 ctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagagttttgaatacca 26005869  T
Q  190 gtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005870 gtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaa 26005969  T
Q  290 tgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26005970 tgttttacattcctttaaaatttttattgaatattacaagacttttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatacaccccc 26006069  T
Q  389 taa 391  Q
    |||    
T  26006070 taa 26006072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 76 - 392
Target Start/End: Original strand, 46251963 - 46252293
Alignment:
Q  76 tgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatcca 162  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||||||    
T  46251963 tgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatcca 46252062  T
Q  163 ttaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatctt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46252063 ttaaaatccgtaaagttttgaataccagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatctt 46252162  T
Q  263 gaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatct 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||  ||||||||     
T  46252163 gaaaatcctaattgaataccacaaaaatattttgcattccttaaaaatcttaattgaataccacgagacttgtttaaaacaaaaaaatcttttaaaatca 46252262  T
Q  362 tttgaaatctcaatccaatacaccccctaaa 392  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  46252263 tttaaaatctcaatccaatacatcccctaaa 46252293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 62 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27593490 - 27593147
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||    
T  27593490 aaatctcaaagctatgtgttggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 27593391  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggact 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27593390 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagatgtgcaaaacctcaattgaataccactgaattttattggact 27593291  T
Q  249 cattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  27593290 cattaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaa 27593191  T
Q  349 gtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
     ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  27593190 atcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacactccctaa 27593147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 138 - 388
Target Start/End: Original strand, 52024034 - 52024286
Alignment:
Q  138 aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgat 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52024034 aaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagaattttgattactaatagacaatttttaaattgtgcaaaatctcaattgaataccactggat 52024133  T
Q  238 ttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagac-tttta 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  52024134 tttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcataattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttttt 52024233  T
Q  337 taaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  52024234 taaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatccaatgcaccccc 52024286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 62 - 387
Target Start/End: Original strand, 39338046 - 39338383
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-----------aaaattcattact 150  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||    
T  39338046 aaatctgaaggctatttgtgggagacaaaaa-gtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcaaaatccattact 39338144  T
Q  151 cacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactca 250  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39338145 cacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactca 39338244  T
Q  251 ttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaag- 349  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||      
T  39338245 ttaaaaaatcctaaaaatcctaattgaataacacaagaatattttagattccttaaaagtctttattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaaaaa 39338344  T
Q  350 tcatt-aaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  39338345 tcttttaaaatcttttaaaatctcaattgaatacacccc 39338383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 61 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36786309 - 36785982
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||    
T  36786309 aaaatctcaaggctatgtgtgagagacaaaaaagtctcaaggc-aggtgtgtgattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcataaaatccatt 36786211  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36786210 actcacaacaattcattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaagtttaaagttttgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggac 36786111  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  36786110 tcattaaaaaatccttaaaattctaattgaatgccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaa 36786011  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaat 375  Q
    ||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  36786010 agtcttttaaaatcctttaaaatctcaat 36785982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 137 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 38682675 - 38682426
Alignment:
Q  137 caaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcga 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  38682675 caaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagaattttgaataccaata-acaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatatcactgaa 38682577  T
Q  237 tttcattggactcatt-aaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38682576 gtttattggactcattaaaaaaatcttgaaaatcataattgaataccacaataat-ttttacatttcttaaaaatcttgattgaataccacaagattttt 38682478  T
Q  336 ataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
     |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38682477 ttaaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttgaaatctcaatacaatacaccc 38682426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Original strand, 26005585 - 26005768
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacatttta----------- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  26005585 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 26005684  T
Q  135 --cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaat 216  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26005685 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccaatagacaatttttaagttatgcaaaat 26005768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 387
Target Start/End: Original strand, 53183972 - 53184158
Alignment:
Q  202 taagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  53183972 taagttatgcaaaatctcaattgaataccaccagattttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatagcacaagaatgttttaccttc 53184071  T
Q  302 cttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  53184072 cttaaaaatcttgattgaataccacgagacttttttaaaacaaaaaaatcttttaaaatccattgaaatctcaattcaatagacccc 53184158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 381
Target Start/End: Original strand, 6783976 - 6784180
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||   ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  6783976 ttttgaatatcaagagacaatttttaagttgtggaaaatcttgatggaataccaccgaatttggttggactctttaaaaaatcctgaaaatcttaattta 6784075  T
Q  278 ataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcat-taaaatcttttgaaatctcaatc 376  Q
    ||||||| |||||  ||| || || || ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||     
T  6784076 ataccaccagaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatatctcaagatttttgtataactaaaaagtcttataaaatcctttgaaatctcgatt 6784175  T
Q  377 caata 381  Q
    |||||    
T  6784176 caata 6784180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 386
Target Start/End: Original strand, 25713327 - 25713523
Alignment:
Q  192 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaa-tcttgaaaatcctaattgaataccacaagaat 290  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||   |||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  || |    
T  25713327 agacaatttttaagttgtgaaaaatcttgattgaataccaacggattttgttggattctttaaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccaccggatt 25713426  T
Q  291 gttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
      ||| || || || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||| ||||| ||  |||||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  25713427 tatttctaatcttttaaaatcttgatggaatacctcaagatttttctataactaaaaactcttttaaaatccttcgaaatcccaattcaatacaccc 25713523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Original strand, 24574816 - 24574967
Alignment:
Q  200 tttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatat 299  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||| ||   ||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||     
T  24574816 tttaagttgtgtaaaatcttgattgaatactaccgaattttgttggattctttaaaaaattttgaaaatcctaattgaataccaccggaattatttctaa 24574915  T
Q  300 tccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc 351  Q
    || || ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  24574916 tcttttaaaatcttgattgaatatctcaagatttttttataactaaaaagtc 24574967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 10104982 - 10105086
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  10104982 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagatttttttataataaaaaagtcttttaaaatcccttgaaat 10105081  T
Q  370 ctcaa 374  Q
    |||||    
T  10105082 ctcaa 10105086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 10225758 - 10225862
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  10225758 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaatagcacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaatcccttgaaat 10225857  T
Q  370 ctcaa 374  Q
    |||||    
T  10225858 ctcaa 10225862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 33119571 - 33119659
Alignment:
Q  236 atttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaatacc 324  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||| || || || |||||||||||||||||||    
T  33119571 attttattggattctttaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccaccgaaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaatacc 33119659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 348
Target Start/End: Original strand, 10216129 - 10216206
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaa 348  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  10216129 taattgaatacgacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagacttttttataataaaaaa 10216206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43151300 - 43151223
Alignment:
Q  245 gactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaata 322  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| || || || |||||||||||||||||    
T  43151300 gactctttaaaaatttttgaaaatcctaattgaataccaccggaattatttctaatcttttaaaatcttgattgaata 43151223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 10216008 - 10216072
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10216008 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagttttgattgaataccacaagactttt 10216072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 10225637 - 10225701
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10225637 taattgaatactacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagactttt 10225701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 387
Target Start/End: Original strand, 45926913 - 45927034
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaatac----cacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttg 365  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   || || ||||||||||||||     ||||||||||| || ||  ||||||||  |||||||| |||     
T  45926913 taattgaataccacaagatttatttatattttatagaagtcttgattgaatactacgtacaagacttttttataatcaaaaagtcttttaaaatccttta 45927012  T
Q  366 aaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45927013 aaatctcaatccaatacacccc 45927034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 325
Target Start/End: Original strand, 44042013 - 44042067
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaatacca 325  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  44042013 taattgaataccacaagatttatttatattctataaaagtcttgattgaatacca 44042067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Original strand, 10104768 - 10104925
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    |||||||||||   ||||| ||| |||||| ||  |||||  |||||||||||| | |||||| ||| | | |  ||||| ||||||   || |||||||    
T  10104768 ttttgaatacccaaagacattttataagttgtgagaaatcctaattgaataccaatggatttcgttgcattgaaaaaaaagtcttgattgtcttaattga 10104867  T
Q  278 ataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||| |||||| |  ||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10104868 atactacaagatttatttatattttataaaagttttgattgaataccacaagactttt 10104925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 52023963 - 52024017
Alignment:
Q  76 tgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacatttta 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52023963 tgtgtgggagacaaaaaagtct----gttaggtgtgagattgttactaggtacatttta 52024017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Original strand, 996235 - 996267
Alignment:
Q  303 ttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  996235 ttaagaatcttgattgaataccacaagactttt 996267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Original strand, 6035204 - 6035240
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6035204 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 6035240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12103684 - 12103648
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12103684 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 12103648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25418423 - 25418391
Alignment:
Q  303 ttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25418423 ttaaaagtcttgattgaataccacaagactttt 25418391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26292592 - 26292560
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26292592 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaa 26292560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38682728 - 38682700
Alignment:
Q  100 aggctaggtgtgagattgttagtaggtac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38682728 aggctaggtgtgagattgttagtaggtac 38682700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44276444 - 44276408
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44276444 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 44276408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52114585 - 52114553
Alignment:
Q  303 ttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52114585 ttaaaagtcttgattgaataccacaagactttt 52114553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 46 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 40410944 - 40410587
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  40410944 ttggaaaagtattacaaaatttcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaagtctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaat 40410845  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410844 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacgagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 40410745  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410744 tagatttcattggactcattaaaaaatcatgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 40410645  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40410644 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatccattgaaatctcaatccaatacaccccct 40410587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Original strand, 6828537 - 6828878
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||    
T  6828537 aaatctcaaagctatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 6828636  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6828637 actcataacaatccattaaaatccttacaattttgaatatcaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggac 6828736  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6828737 tcattaaaaaatcctgaaaatcctaattaaataccacaagaatgttttagattccttaaaggtcttgattgaatacccaaagacttttttaaaacaaaaa 6828836  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6828837 agtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccc 6828878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17518748 - 17518426
Alignment:
Q  81 gggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaa 167  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17518748 gggagacagaaaagtcttgaggctgggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcgcaacattccattaaa 17518649  T
Q  168 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcg-atttcattggactcattaaaaaatcttgaaa 266  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17518648 atccgtagaattttgaatcccaataaacaatttttaagttgtgcaaaatcttaattgaataccaccgggattttattggactctttaaaaaatcttgaaa 17518549  T
Q  267 atcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttg 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||  |||    
T  17518548 atcctaattgaatagcacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttttaaaacgaaaaagtcttttaaaatccattg 17518449  T
Q  366 aaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||||||||| |||||| ||||    
T  17518448 aaatctcaatctaatacatcccc 17518426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10571430 - 10571113
Alignment:
Q  81 gggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacatttta-------------cacaaaattcattactcacaacaatccattaaa 167  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  10571430 gggagacagaaaagtcttaaggttaggtgtgagattgttagtatgtacattttatactaaaaagtttcacaaaatccattcctgacaacaatctattaaa 10571331  T
Q  168 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaa 267  Q
     | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10571330 tttcatagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatcttaattgaataccaccggattttattggactctttaaaaaattttgaaaa 10571231  T
Q  268 tcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaag-tcattaaaatcttttga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||  ||||    
T  10571230 tcctaattgaataccacaagaatgttttacattccttaaaaattttgattgaatatcacaagacttttataaaacgaaaaagttttttaaaatccattga 10571131  T
Q  367 aatctcaatccaatacac 384  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10571130 aatctcaatccaatacac 10571113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7857192 - 7857025
Alignment:
Q  220 aattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattga 319  Q
    ||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||| | |||  ||| || || || ||||||||||||||    
T  7857192 aattgaataccgccagattttgttggactctttaaaaattcattaaaatcctaattcaataccaccaaaattatttctaatcttttaaaatcttgattga 7857093  T
Q  320 ataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  7857092 atacctcaagatttttctataaccaaaaagtcttttaaaatccttctaaatctcaatctaatacaccc 7857025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 279
Target Start/End: Original strand, 6902525 - 6902647
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaa 256  Q
    |||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||    
T  6902525 aatccattgaaatcaatacatttttgaataccaagagacaatttttaagttgtaaaaaatcttgattgaataccaccagattttgttggactctttaaaa 6902624  T
Q  257 aatcttgaaaatcctaattgaat 279  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  6902625 aatcattaaaatcctaattgaat 6902647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 395
Target Start/End: Original strand, 28594410 - 28594536
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttata-aaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaa 368  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||  ||||||||| || |||    
T  28594410 taattaaataccacaagatttatttatgttttataaaaatcttgattgaataccacaagacttttttataataaaaaaagtcttttaaaatctcttaaaa 28594509  T
Q  369 tctcaatccaatacaccccctaaatat 395  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||    
T  28594510 tcccaatcaaatacacccccttaatat 28594536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 26795601 - 26795705
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  26795601 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagatttttttataataaaaaagtcttttaaaatcccttgaaat 26795700  T
Q  370 ctcaa 374  Q
    |||||    
T  26795701 ctcaa 26795705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39753549 - 39753429
Alignment:
Q  273 attgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcat-taaaatcttttgaaatct 371  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||    ||||||||| | |||||||  ||||||||     
T  39753549 attgaatatcacaagatttttttatattttataaaagtcttgattgaataccaccaaacttttttatttaaaaaaagtcttctaaaatccgttgaaatca 39753450  T
Q  372 caatccaatacaccccctaaa 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39753449 caatccaatacaccccctaaa 39753429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 26806665 - 26806769
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  26806665 taattgaataccacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaatatcacaagatttttttataataaaaaagtcttttaaaatcccttgaaat 26806764  T
Q  370 ctcaa 374  Q
    |||||    
T  26806765 ctcaa 26806769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27786280 - 27786210
Alignment:
Q  317 tgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  27786280 tgaataccacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaatcccttgaaatcttaatccaatacaccc 27786210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Original strand, 26806451 - 26806608
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    |||||||||||   ||||| ||| |||||| ||  |||||  |||||||||||| | |||||| ||| | | |  ||||| ||||||   || |||||||    
T  26806451 ttttgaatacccaaagacattttataagttgtgagaaatcctaattgaataccaatggatttcgttgcattgaaaaaaaagtcttgattgtcttaattga 26806550  T
Q  278 ataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||| |||||| |  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26806551 atactacaagatttatttatattttataaaagtcttgattgaataccacaagactttt 26806608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 9689337 - 9689421
Alignment:
Q  304 taaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9689337 taaaaatcttgattgaatacctcaagatttttttataattaaaaaatcttttaaaatctcttgaaatctaaatcaaatacacccc 9689421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6827982 - 6827947
Alignment:
Q  357 aatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaa 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6827982 aatcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaaa 6827947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26876347 - 26876251
Alignment:
Q  192 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata----ccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccac 284  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    |||  ||||||  ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26876347 agacaatttttaagttgtgaaaaatcttgattgaatatataccatccgattttgttaaactctttaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccac 26876251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 393
Target Start/End: Original strand, 40411476 - 40411510
Alignment:
Q  359 tcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaat 393  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40411476 tcttttaaaatctcaatccaatacaccccctaaat 40411510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Original strand, 26795387 - 26795544
Alignment:
Q  178 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattga 277  Q
    |||||||||||   ||||| ||| |||||| ||  |||||  |||||||||||| | |||||| ||| | | |  ||||| ||||||   || |||||||    
T  26795387 ttttgaatacccaaagacattttataagttgtgagaaatcctaattgaataccaatggatttcgttgcattgaaaaaaaagtcttgattgtcttaattga 26795486  T
Q  278 ataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||| |||||| |  ||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26795487 atactacaagatttatttatattttataaaagttttgattgaataccacaagactttt 26795544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 2276037 - 2276133
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    |||||||| |||||  || || ||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||  ||||| |||  |||| | ||||||||||||    
T  2276037 cacaaaatccattatacaaaagaatccattaaaatctatagacttttgaatatcaatagacaattcataagtcatgagaaattttaattgaatacca 2276133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13925987 - 13925951
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13925987 aaaaatcttgattgaatacctcaagacttttttaaaa 13925951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 81512 - 81868
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||            
T  81512 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaat 81611  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81612 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccaggagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 81711  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81712 tggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatagcacaagaatgttttagattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 81811  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  81812 tttataaaacaaaaaagtcttttaaaatcctttaaaatctcaatccaatacaccccc 81868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 50 - 389
Target Start/End: Original strand, 6476447 - 6476800
Alignment:
Q  50 aagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac------------ 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                
T  6476447 aagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagttacattttacactaaacaatctca 6476546  T
Q  138 -aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcga 236  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6476547 caaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactgga 6476646  T
Q  237 tttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagactttta 336  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6476647 ttttattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaaaaatgttttacatttcttaaaaatcttaattgaatactgcaagactttta 6476746  T
Q  337 taaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccct 389  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6476747 taaaacaaaacagtcttttaaaatccattgaaatttcaatccaatacaccccct 6476800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 95 - 388
Target Start/End: Original strand, 29834064 - 29834371
Alignment:
Q  95 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 181  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834064 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 29834163  T
Q  182 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatac 281  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29834164 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaattgcatac 29834263  T
Q  282 cacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaat 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  29834264 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaatctcaatcgaat 29834363  T
Q  381 acaccccc 388  Q
    ||||||||    
T  29834364 acaccccc 29834371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 95 - 388
Target Start/End: Original strand, 29865498 - 29865805
Alignment:
Q  95 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 181  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865498 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 29865597  T
Q  182 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatac 281  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29865598 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaattgcatac 29865697  T
Q  282 cacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaat 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  29865698 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaatctcaatcgaat 29865797  T
Q  381 acaccccc 388  Q
    ||||||||    
T  29865798 acaccccc 29865805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 387
Target Start/End: Original strand, 10643758 - 10644099
Alignment:
Q  62 aaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatta 148  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| |||||    
T  10643758 aaatcttaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtcttaagattaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 10643857  T
Q  149 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatg--caaaatctcaattgaataccactcgatttcattgga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10643858 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgattaccaatagacaatttttaagttgtgatcaaaatctcaattgaataccactggattttattgga 10643957  T
Q  247 ctcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaa 346  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10643958 ctcattaaaaaatcctgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaa 10644057  T
Q  347 aagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacacccc 387  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  10644058 aagtcttttaaaatattttgaaatctcaattgaatacacccc 10644099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30878191 - 30877850
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcatt 147  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||             ||||| ||||    
T  30878191 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctagatgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 30878092  T
Q  148 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggac 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30878091 actcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagctgtacaaaatctgaattgaataccactagattttattggac 30877992  T
Q  248 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  30877991 tcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatatcacaagaatattttagattccttaaaagtcttgattgaatacctaaagacttttttaaaacaaaaa 30877892  T
Q  348 agtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  30877891 agtcttttaaaatcctttgaaatctcaattgaatacaccccc 30877850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 69 - 388
Target Start/End: Original strand, 3110038 - 3110371
Alignment:
Q  69 aaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaa 155  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||             ||||| ||||||||||||    
T  3110038 aaggctatgtgtgggagatagaaaagtcttaatactaggtgcgagattgtcagtatgtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaa 3110137  T
Q  156 caatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3110138 caatccattaaaatccgtagagttttgaataactgcacacaattttcaagttaggcaaaatctcaattgaatatcactggatttcattggactcattaaa 3110237  T
Q  256 aaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-att 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  3110238 aaatcttgaaaattctaattgaataccacaaaaatgttttacattccttaaaaattatgattgaataccataagatttttataaaacaaaaaagtctttt 3110337  T
Q  355 aaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3110338 aaaatattttgaaatctgaatccaatacaccccc 3110371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 135 - 386
Target Start/End: Original strand, 7858206 - 7858457
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactc 234  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  7858206 cacaaaatctattactcacaacaatgcattaaaatccgtagaattttgaatatcaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccagtg 7858305  T
Q  235 gatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttt 334  Q
     | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7858306 cactttattgaactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttacattcctttaaaatcttgattgaacaccacaa-acttt 7858404  T
Q  335 tataaaacaaaaaagt-cattaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    | |||||||||||| |   |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  7858405 tttaaaacaaaaaaatattttaaaatcatatgaaatctcaattcaatacaccc 7858457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5957242 - 5957121
Alignment:
Q  271 taattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaat 369  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||  ||||||||  ||||| |    
T  5957242 taattgaataccacaagatttgtttacattttataaaagtcttgattgaataccactagacttttttattataaaaaagtcttttaaaatcccttgaatt 5957143  T
Q  370 ctcaatccaatacaccccctaa 391  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  5957142 ctcaattcaatacaccccctaa 5957121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 382
Target Start/End: Original strand, 11007689 - 11007762
Alignment:
Q  310 tcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt-aaaatcttttgaaatctcaatccaatac 382  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007689 tcttaattaaataccacaagacttttttatatttaaaaagtcttttaaaatcttttgaaatctcaatccaatac 11007762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35164995 - 35164802
Alignment:
Q  196 aatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgtttt 295  Q
    ||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||   |||  |||    
T  35164995 aatttttaagttgagaaaaatcttgatttaataccaccaaattttgttggactctttaaaaatgcctgaaaatcttaattgaataccactgaaattattt 35164896  T
Q  296 atattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtca-ttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
     || || || |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||||| ||||    
T  35164895 ctaatcttttaaaatcatgattgaataactcaagatttttttataaccaaaaagtcatttaaaatccttcaaaatctcaattgaatacaacccc 35164802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 709166 - 709070
Alignment:
Q  135 cacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    |||||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  709166 cacaaaatccattacatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatttcaattgaatacca 709070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7100394 - 7100320
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7100394 aatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 7100320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7497131 - 7497101
Alignment:
Q  305 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7497131 aaaaatcttgattgaataccacaagactttt 7497101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 8794236 - 8794310
Alignment:
Q  157 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  8794236 aatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaattgaatacca 8794310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5957354 - 5957285
Alignment:
Q  162 attaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 231  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  5957354 attaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatcttaattgaatacca 5957285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 388
Target Start/End: Original strand, 31609682 - 31609778
Alignment:
Q  293 tttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccc 388  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||  ||||||||  |||||| ||  || ||||||||||||    
T  31609682 tttatattctataaaagtcttgattgaataccacaagatttttttataattaaaaagtcttttaaaatccattgaaaacttcattcaatacaccccc 31609778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 95 - 388
Target Start/End: Original strand, 21192 - 21499
Alignment:
Q  95 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------------aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 181  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21192 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 21291  T
Q  182 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaatac 281  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21292 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaattctaattgcatac 21391  T
Q  282 cacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaat 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21392 cacaagaatgttttacattccttcaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaatgtcttttaaaatcctttgaaatctcaatcgaat 21491  T
Q  381 acaccccc 388  Q
    ||||||||    
T  21492 acaccccc 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 395
Target Start/End: Original strand, 34544 - 34895
Alignment:
Q  46 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacac-------- 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||            
T  34544 ttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaacaat 34643  T
Q  138 -----aaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 232  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644 ctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccac 34743  T
Q  233 tcgatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattccttaaaaatcttgattgaataccacaagact 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34744 tgtatttcattggactcattaaaaaatcttgaaaat------------ccacaagaatgttttacattccttaaaaatcttgattgaata-cacaagact 34830  T
Q  333 tttataaaacaaaaaagtca--ttaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccccctaaatat 395  Q
    ||||||||||||||||   |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34831 tttataaaacaaaaaaagtattttaaaatcctttaaaatctcaatccaatacacccccttaatat 34895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 368
Target Start/End: Original strand, 16303 - 16610
Alignment:
Q  61 aaaatctcaaggctgtgtgtgggagataaaaaagtctcaaggcta--ggtgtgagattgttagtaggtacattttacacaaaattcattactcacaacaa 158  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||||||| ||    
T  16303 aaaatttcaaggctatgtgtgagagacataaaagtctcaaggttataggtgtgagattgttagtaggtacactttacactaaa--caat-ctcacaa-aa 16398  T
Q  159 tccattaaaatc-cgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactcgatttcattggactcattaaaaa 257  Q
    |||||||   || | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16399 tccattac--tcacatagaattttgaatactaatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactcattaaaaa 16496  T
Q  258 atcttgaaaatcctaattgaataccacaagaatgttttatattcctt--aaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtcatt- 354  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  16497 ttcttgaaaatactaattgaataccacaaaaatgttttacatttcttaaaaaaatcttgattaaataccacaagacttttttaaaacaaaaaagtctttc 16596  T
Q  355 aaaatcttttgaaa 368  Q
    |||||| |||||||    
T  16597 aaaatcatttgaaa 16610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Original strand, 11789 - 11872
Alignment:
Q  304 taaaaatcttgattgaataccacaagacttttataaaacaaaaaagtc-attaaaatcttttgaaatctcaatccaatacaccc 386  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||  ||||||||  | ||||||  ||||||||||||||    
T  11789 taaaagtcttgattgaatatcacaagacttttttataataaaaaagtcttttaaaatccctagaaatccgaatccaatacaccc 11872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University