View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15449_low_12 (Length: 523)

Name: NF15449_low_12
Description: NF15449
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15449_low_12
NF15449_low_12
[»] chr4 (163 HSPs)
chr4 (20-443)||(1793339-1793762)
chr4 (23-422)||(31959817-31960214)
chr4 (25-422)||(52569518-52569913)
chr4 (23-422)||(436111-436508)
chr4 (23-420)||(33227091-33227486)
chr4 (23-420)||(33190853-33191248)
chr4 (23-422)||(53707676-53708073)
chr4 (23-422)||(56375172-56375569)
chr4 (26-422)||(1777020-1777412)
chr4 (21-413)||(4440735-4441123)
chr4 (26-422)||(48622546-48622938)
chr4 (23-422)||(43433800-43434203)
chr4 (25-422)||(48174096-48174491)
chr4 (23-427)||(23906295-23906701)
chr4 (120-418)||(39708412-39708708)
chr4 (27-427)||(27450178-27450569)
chr4 (27-422)||(39100539-39100929)
chr4 (23-422)||(46582829-46583224)
chr4 (25-422)||(47265198-47265600)
chr4 (23-356)||(41009419-41009750)
chr4 (79-422)||(37797790-37798130)
chr4 (24-422)||(27983083-27983472)
chr4 (43-422)||(28236087-28236461)
chr4 (27-422)||(45204843-45205244)
chr4 (117-382)||(20591349-20591606)
chr4 (132-422)||(26037508-26037796)
chr4 (26-375)||(16002812-16003158)
chr4 (44-422)||(20601655-20602025)
chr4 (79-422)||(51421670-51422009)
chr4 (23-185)||(12494632-12494794)
chr4 (25-422)||(1211395-1211788)
chr4 (133-423)||(20192025-20192312)
chr4 (23-366)||(50286853-50287185)
chr4 (160-422)||(32479057-32479317)
chr4 (50-408)||(37773468-37773823)
chr4 (267-422)||(6957726-6957877)
chr4 (165-422)||(8286455-8286718)
chr4 (259-422)||(21236978-21237137)
chr4 (179-410)||(20821019-20821251)
chr4 (172-383)||(53518365-53518571)
chr4 (27-356)||(7092290-7092615)
chr4 (267-422)||(12494791-12494942)
chr4 (27-209)||(31458914-31459098)
chr4 (267-420)||(7947065-7947214)
chr4 (227-422)||(35690357-35690550)
chr4 (26-163)||(35690189-35690326)
chr4 (305-422)||(21528450-21528567)
chr4 (102-203)||(44047568-44047669)
chr4 (311-422)||(55007914-55008025)
chr4 (63-421)||(54470129-54470485)
chr4 (315-422)||(19154866-19154973)
chr4 (246-422)||(31961269-31961441)
chr4 (52-214)||(42639229-42639391)
chr4 (261-375)||(50679626-50679736)
chr4 (23-407)||(55578913-55579295)
chr4 (320-422)||(19969358-19969460)
chr4 (52-212)||(50662300-50662459)
chr4 (53-210)||(51252674-51252829)
chr4 (305-422)||(51811283-51811398)
chr4 (43-210)||(29398721-29398887)
chr4 (106-430)||(31897423-31897743)
chr4 (80-305)||(10208977-10209202)
chr4 (148-299)||(26356626-26356779)
chr4 (103-250)||(28497450-28497598)
chr4 (58-200)||(49987345-49987487)
chr4 (49-210)||(17900388-17900549)
chr4 (104-209)||(33709887-33709992)
chr4 (52-390)||(34233059-34233404)
chr4 (268-422)||(37488220-37488370)
chr4 (103-304)||(46371986-46372189)
chr4 (311-422)||(26024853-26024964)
chr4 (233-422)||(28351651-28351838)
chr4 (125-297)||(31339521-31339693)
chr4 (316-422)||(4548195-4548301)
chr4 (23-97)||(39708340-39708414)
chr4 (52-356)||(50680650-50680953)
chr4 (311-422)||(25574992-25575103)
chr4 (363-422)||(45184136-45184195)
chr4 (260-343)||(50862764-50862844)
chr4 (311-422)||(55388214-55388325)
chr4 (52-174)||(10775671-10775793)
chr4 (316-422)||(34208272-34208378)
chr4 (132-210)||(35555860-35555938)
chr4 (105-251)||(38570919-38571065)
chr4 (64-207)||(45423542-45423681)
chr4 (263-346)||(55809069-55809148)
chr4 (329-422)||(29398990-29399083)
chr4 (305-422)||(31043234-31043351)
chr4 (305-422)||(31459156-31459273)
chr4 (265-375)||(50287993-50288099)
chr4 (66-210)||(50471453-50471595)
chr4 (311-387)||(28486089-28486165)
chr4 (262-375)||(49987531-49987640)
chr4 (352-423)||(13262421-13262492)
chr4 (284-356)||(41009288-41009356)
chr4 (65-212)||(2588905-2589061)
chr4 (324-378)||(41729497-41729551)
chr4 (132-210)||(44360078-44360155)
chr4 (235-422)||(13805268-13805453)
chr4 (305-422)||(28550458-28550575)
chr4 (325-382)||(46749729-46749786)
chr4 (326-422)||(2589255-2589351)
chr4 (326-422)||(5306479-5306575)
chr4 (350-422)||(19061938-19062010)
chr4 (103-207)||(36557246-36557349)
chr4 (43-138)||(2414626-2414721)
chr4 (363-422)||(21359228-21359287)
chr4 (23-70)||(26037835-26037882)
chr4 (126-209)||(30621418-30621501)
chr4 (347-422)||(45209208-45209283)
chr4 (348-422)||(3979125-3979199)
chr4 (368-422)||(30634109-30634163)
chr4 (52-163)||(31403276-31403391)
chr4 (132-210)||(41192827-41192905)
chr4 (52-179)||(43070012-43070135)
chr4 (112-210)||(46715585-46715678)
chr4 (352-422)||(49939737-49939807)
chr4 (43-208)||(56224967-56225133)
chr4 (369-422)||(4879112-4879165)
chr4 (101-170)||(6478921-6478990)
chr4 (233-299)||(7682032-7682100)
chr4 (23-154)||(11389602-11389737)
chr4 (373-422)||(20654868-20654917)
chr4 (318-423)||(31339699-31339804)
chr4 (361-422)||(50238618-50238679)
chr4 (361-422)||(50238704-50238765)
chr4 (126-207)||(55768717-55768798)
chr4 (126-207)||(55832973-55833054)
chr4 (118-206)||(1427501-1427589)
chr4 (262-422)||(2557674-2557831)
chr4 (346-422)||(7066502-7066577)
chr4 (155-251)||(47611741-47611837)
chr4 (309-422)||(55772155-55772264)
chr4 (363-422)||(15661875-15661934)
chr4 (64-210)||(25257794-25257938)
chr4 (151-210)||(42285913-42285972)
chr4 (37-136)||(45185304-45185403)
chr4 (369-420)||(50862857-50862908)
chr4 (363-422)||(50967031-50967090)
chr4 (311-410)||(56225236-56225335)
chr4 (340-422)||(12443292-12443374)
chr4 (368-422)||(15665326-15665380)
chr4 (56-130)||(20105764-20105838)
chr4 (326-420)||(29209180-29209274)
chr4 (326-384)||(40420255-40420313)
chr4 (256-294)||(45184258-45184296)
chr4 (373-422)||(8598899-8598948)
chr4 (326-387)||(16875790-16875851)
chr4 (315-356)||(41340616-41340657)
chr4 (352-413)||(44360295-44360356)
chr4 (324-399)||(52097525-52097599)
chr4 (309-358)||(55836391-55836440)
chr4 (368-428)||(13296658-13296718)
chr4 (354-422)||(17900691-17900759)
chr4 (321-389)||(20131025-20131093)
chr4 (105-184)||(28467248-28467324)
chr4 (132-212)||(40018394-40018474)
chr4 (233-285)||(40933053-40933105)
chr4 (52-120)||(44860765-44860833)
chr4 (132-212)||(45175998-45176077)
chr4 (362-430)||(46236708-46236776)
chr4 (326-422)||(51438628-51438724)
chr4 (263-299)||(55805793-55805829)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (23-423)||(30031138-30031536)
chr6 (23-422)||(28085258-28085655)
chr6 (23-422)||(608041-608440)
chr6 (55-402)||(32755833-32756180)
chr6 (23-385)||(5631700-5632064)
chr6 (117-422)||(12890560-12890854)
chr6 (25-429)||(35043437-35043839)
chr6 (49-422)||(5258151-5258524)
chr6 (57-422)||(9593713-9594078)
chr6 (26-408)||(20427654-20428033)
chr6 (26-428)||(9706661-9707055)
chr6 (26-290)||(10099990-10100254)
chr6 (132-422)||(21351840-21352128)
chr6 (23-378)||(14030688-14031030)
chr6 (23-430)||(2689538-2689920)
chr6 (143-378)||(33496963-33497194)
chr6 (26-356)||(28026896-28027222)
chr6 (234-427)||(5095927-5096118)
chr6 (152-422)||(30679417-30679675)
chr6 (262-422)||(34143768-34143924)
chr6 (262-422)||(34156384-34156540)
chr6 (26-390)||(6055806-6056167)
chr6 (306-422)||(3206462-3206578)
chr6 (149-378)||(24665818-24666046)
chr6 (262-422)||(34508-34664)
chr6 (49-210)||(33083966-33084127)
chr6 (314-422)||(34934833-34934941)
chr6 (25-157)||(2065018-2065154)
chr6 (316-419)||(31819004-31819107)
chr6 (259-386)||(5080960-5081083)
chr6 (135-422)||(31818526-31818810)
chr6 (305-422)||(5897619-5897736)
chr6 (43-384)||(26291680-26292018)
chr6 (52-174)||(5080766-5080888)
chr6 (43-151)||(33496086-33496194)
chr6 (90-422)||(8364525-8364835)
chr6 (305-422)||(10098899-10099014)
chr6 (352-422)||(30789077-30789147)
chr6 (350-427)||(1615221-1615298)
chr6 (226-304)||(7133831-7133911)
chr6 (226-304)||(7136754-7136834)
chr6 (326-422)||(12133905-12134001)
chr6 (132-210)||(14389381-14389458)
chr6 (350-422)||(9109512-9109584)
chr6 (103-174)||(6641658-6641729)
chr6 (307-402)||(32080633-32080728)
chr6 (37-209)||(2079229-2079408)
chr6 (339-420)||(12119647-12119729)
chr6 (353-423)||(21886314-21886384)
chr6 (84-177)||(5095816-5095909)
chr6 (305-422)||(7492551-7492668)
chr6 (248-305)||(10617350-10617407)
chr6 (328-388)||(9568884-9568944)
chr6 (346-422)||(18130817-18130893)
chr6 (133-193)||(21870303-21870363)
chr6 (103-207)||(25494066-25494169)
chr6 (340-408)||(32068617-32068685)
chr6 (340-408)||(32097934-32098002)
chr6 (363-422)||(579638-579697)
chr6 (327-390)||(2079465-2079528)
chr6 (52-139)||(33998288-33998375)
chr6 (350-408)||(586057-586115)
chr6 (155-209)||(7513191-7513245)
chr6 (37-183)||(12134141-12134287)
chr6 (326-387)||(3210546-3210607)
chr6 (248-293)||(3963908-3963953)
chr6 (311-384)||(14389202-14389275)
chr6 (346-422)||(23888481-23888557)
chr6 (380-420)||(29354741-29354781)
chr6 (370-422)||(33730192-33730244)
[»] chr1 (150 HSPs)
chr1 (23-422)||(1210627-1211024)
chr1 (23-422)||(30202133-30202530)
chr1 (23-422)||(49347396-49347793)
chr1 (23-422)||(22089976-22090375)
chr1 (23-422)||(34792352-34792748)
chr1 (26-422)||(696154-696549)
chr1 (25-422)||(8671804-8672197)
chr1 (23-422)||(9592616-9593013)
chr1 (23-378)||(32231001-32231354)
chr1 (23-422)||(15085816-15086201)
chr1 (26-422)||(43240382-43240778)
chr1 (23-422)||(51440768-51441165)
chr1 (43-422)||(38807674-38808054)
chr1 (26-422)||(51601943-51602335)
chr1 (28-422)||(4001458-4001848)
chr1 (23-422)||(8391654-8392051)
chr1 (23-422)||(32082759-32083145)
chr1 (132-422)||(4029113-4029401)
chr1 (36-402)||(9599417-9599781)
chr1 (72-413)||(27847812-27848155)
chr1 (52-390)||(9509229-9509565)
chr1 (53-422)||(37462879-37463241)
chr1 (23-422)||(18469085-18469480)
chr1 (159-422)||(25979234-25979495)
chr1 (221-422)||(39318209-39318407)
chr1 (259-430)||(52921200-52921367)
chr1 (142-412)||(32404539-32404807)
chr1 (45-422)||(39140417-39140794)
chr1 (226-422)||(37311758-37311952)
chr1 (171-422)||(52561592-52561841)
chr1 (132-427)||(2544590-2544877)
chr1 (104-305)||(43423682-43423885)
chr1 (25-349)||(34827179-34827500)
chr1 (307-422)||(4707224-4707338)
chr1 (263-422)||(41560353-41560508)
chr1 (141-422)||(48431402-48431688)
chr1 (144-422)||(5338727-5338992)
chr1 (305-422)||(10200309-10200426)
chr1 (257-399)||(27520233-27520373)
chr1 (315-422)||(24020270-24020377)
chr1 (171-422)||(8796239-8796488)
chr1 (305-422)||(52532619-52532736)
chr1 (63-408)||(6025527-6025870)
chr1 (275-422)||(29128919-29129063)
chr1 (101-290)||(36624003-36624188)
chr1 (307-427)||(46423214-46423331)
chr1 (156-379)||(478695-478913)
chr1 (132-422)||(3818859-3819147)
chr1 (132-402)||(40416362-40416630)
chr1 (308-422)||(32079180-32079292)
chr1 (50-378)||(52831957-52832280)
chr1 (132-210)||(1661421-1661499)
chr1 (326-420)||(6084158-6084252)
chr1 (326-428)||(25715323-25715425)
chr1 (324-422)||(40568413-40568511)
chr1 (336-422)||(44941779-44941865)
chr1 (305-390)||(4415511-4415596)
chr1 (256-386)||(16142019-16142145)
chr1 (333-422)||(28090697-28090786)
chr1 (105-210)||(35828763-35828868)
chr1 (49-210)||(40419547-40419708)
chr1 (132-422)||(36339807-36340094)
chr1 (311-422)||(43375601-43375712)
chr1 (58-209)||(4379922-4380081)
chr1 (23-198)||(19936404-19936571)
chr1 (336-422)||(44751677-44751763)
chr1 (84-162)||(52561872-52561950)
chr1 (275-385)||(7762477-7762583)
chr1 (269-422)||(11941583-11941732)
chr1 (335-427)||(21769709-21769801)
chr1 (326-422)||(34444539-34444635)
chr1 (340-427)||(50257767-50257854)
chr1 (328-422)||(12930314-12930408)
chr1 (68-205)||(14226047-14226182)
chr1 (133-210)||(52073675-52073753)
chr1 (312-423)||(15438799-15438906)
chr1 (316-413)||(19908047-19908144)
chr1 (305-390)||(19936622-19936707)
chr1 (49-210)||(26016345-26016506)
chr1 (349-422)||(28533673-28533746)
chr1 (350-422)||(5113950-5114022)
chr1 (257-358)||(8628148-8628245)
chr1 (350-422)||(29577459-29577531)
chr1 (305-388)||(52739547-52739631)
chr1 (242-391)||(52878333-52878478)
chr1 (135-299)||(37263325-37263491)
chr1 (105-244)||(51812489-51812628)
chr1 (132-210)||(13827930-13828008)
chr1 (337-422)||(1290034-1290119)
chr1 (262-422)||(8342887-8343040)
chr1 (90-305)||(10272212-10272424)
chr1 (304-421)||(27072491-27072608)
chr1 (262-407)||(28511819-28511960)
chr1 (305-419)||(36623891-36624004)
chr1 (327-422)||(4590535-4590630)
chr1 (63-174)||(16943097-16943208)
chr1 (68-206)||(17815402-17815537)
chr1 (363-422)||(37430423-37430482)
chr1 (152-207)||(44905548-44905603)
chr1 (360-422)||(3777263-3777325)
chr1 (139-209)||(13827784-13827854)
chr1 (343-409)||(26113455-26113521)
chr1 (262-421)||(29577147-29577301)
chr1 (36-98)||(46226607-46226669)
chr1 (23-68)||(3192088-3192133)
chr1 (23-68)||(3200906-3200951)
chr1 (23-68)||(3209743-3209788)
chr1 (262-413)||(19908396-19908543)
chr1 (90-210)||(27703958-27704079)
chr1 (155-224)||(34074353-34074421)
chr1 (369-422)||(43481801-43481854)
chr1 (308-377)||(44905404-44905473)
chr1 (311-388)||(48865744-48865821)
chr1 (275-408)||(11331221-11331350)
chr1 (275-408)||(11489242-11489371)
chr1 (43-135)||(16142172-16142264)
chr1 (370-422)||(31434317-31434369)
chr1 (326-378)||(39776942-39776994)
chr1 (142-290)||(39894784-39894930)
chr1 (233-298)||(42501200-42501267)
chr1 (326-422)||(50806850-50806946)
chr1 (313-385)||(52900682-52900754)
chr1 (112-207)||(19908255-19908350)
chr1 (339-418)||(22175341-22175420)
chr1 (167-202)||(31274578-31274613)
chr1 (117-402)||(38868858-38869141)
chr1 (326-413)||(45510845-45510932)
chr1 (233-305)||(50771672-50771746)
chr1 (262-305)||(51584867-51584910)
chr1 (52-147)||(52442780-52442875)
chr1 (149-207)||(7921843-7921901)
chr1 (265-336)||(8203223-8203290)
chr1 (156-210)||(16822235-16822289)
chr1 (132-210)||(23791857-23791935)
chr1 (233-304)||(30834094-30834167)
chr1 (353-419)||(38877349-38877415)
chr1 (326-409)||(48861391-48861476)
chr1 (352-422)||(51584953-51585023)
chr1 (147-193)||(52739767-52739813)
chr1 (141-210)||(8343071-8343140)
chr1 (340-409)||(29808053-29808122)
chr1 (105-210)||(39422256-39422359)
chr1 (251-304)||(40228123-40228176)
chr1 (233-299)||(43898321-43898389)
chr1 (233-299)||(52442650-52442718)
chr1 (380-420)||(7206124-7206164)
chr1 (91-163)||(19969621-19969693)
chr1 (362-418)||(26299287-26299343)
chr1 (350-422)||(32111992-32112064)
chr1 (306-358)||(41611969-41612021)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (23-422)||(52138682-52139079)
chr3 (23-413)||(28245319-28245707)
chr3 (23-422)||(5168710-5169111)
chr3 (27-409)||(54278906-54279286)
chr3 (23-422)||(51447720-51448109)
chr3 (45-428)||(47233593-47233974)
chr3 (60-422)||(21992-22351)
chr3 (43-422)||(54128280-54128658)
chr3 (24-422)||(53519469-53519859)
chr3 (124-422)||(35033129-35033425)
chr3 (174-422)||(48508268-48508514)
chr3 (27-422)||(25191265-25191656)
chr3 (23-346)||(3186651-3186971)
chr3 (23-422)||(26490199-26490594)
chr3 (27-326)||(33272122-33272424)
chr3 (148-390)||(48953454-48953697)
chr3 (43-358)||(27917474-27917785)
chr3 (92-422)||(45289094-45289425)
chr3 (23-304)||(45728027-45728315)
chr3 (134-421)||(50960641-50960922)
chr3 (66-420)||(19676086-19676447)
chr3 (37-422)||(43694774-43695151)
chr3 (144-422)||(38850123-38850400)
chr3 (25-284)||(49503691-49503957)
chr3 (90-378)||(39600728-39601014)
chr3 (63-290)||(19736918-19737147)
chr3 (101-358)||(38430803-38431063)
chr3 (71-290)||(19757829-19758050)
chr3 (259-422)||(12096708-12096867)
chr3 (136-422)||(42510019-42510301)
chr3 (132-251)||(38060422-38060541)
chr3 (157-390)||(39235154-39235384)
chr3 (24-206)||(344928-345110)
chr3 (79-422)||(48734150-48734477)
chr3 (305-422)||(49042098-49042216)
chr3 (305-422)||(52156087-52156204)
chr3 (305-422)||(53262303-53262420)
chr3 (102-375)||(54425015-54425292)
chr3 (144-366)||(30294180-30294403)
chr3 (25-422)||(52678853-52679246)
chr3 (282-422)||(38060857-38060993)
chr3 (107-428)||(54364973-54365290)
chr3 (312-422)||(311312-311422)
chr3 (305-422)||(15296069-15296186)
chr3 (105-420)||(23534576-23534887)
chr3 (321-422)||(47555335-47555436)
chr3 (318-422)||(2133615-2133719)
chr3 (79-210)||(36820174-36820303)
chr3 (23-138)||(38849976-38850091)
chr3 (101-211)||(3987007-3987117)
chr3 (166-346)||(19162666-19162842)
chr3 (326-428)||(40106617-40106719)
chr3 (52-423)||(49841522-49841896)
chr3 (313-413)||(40116350-40116450)
chr3 (311-422)||(29601060-29601171)
chr3 (263-418)||(27893213-27893364)
chr3 (273-414)||(17022683-17022820)
chr3 (111-422)||(31454228-31454537)
chr3 (326-422)||(39208791-39208887)
chr3 (158-299)||(31261064-31261206)
chr3 (58-279)||(50249298-50249527)
chr3 (305-375)||(54422893-54422963)
chr3 (105-209)||(29600863-29600968)
chr3 (330-427)||(30797820-30797917)
chr3 (330-422)||(32170592-32170684)
chr3 (311-427)||(36304134-36304250)
chr3 (326-422)||(40991614-40991710)
chr3 (35-135)||(45236750-45236850)
chr3 (360-423)||(41529978-41530041)
chr3 (311-422)||(49503571-49503682)
chr3 (336-422)||(7895883-7895969)
chr3 (144-202)||(29817507-29817565)
chr3 (305-427)||(48712073-48712195)
chr3 (23-125)||(48953694-48953795)
chr3 (350-419)||(388268-388337)
chr3 (333-410)||(6780678-6780755)
chr3 (342-427)||(7278663-7278748)
chr3 (326-427)||(14415258-14415358)
chr3 (336-413)||(24541344-24541421)
chr3 (63-192)||(31337757-31337884)
chr3 (343-428)||(31566158-31566243)
chr3 (132-305)||(11581435-11581610)
chr3 (305-413)||(19758049-19758156)
chr3 (52-96)||(30345434-30345478)
chr3 (337-421)||(52927852-52927936)
chr3 (62-209)||(2340928-2341075)
chr3 (331-422)||(4472390-4472481)
chr3 (233-421)||(33755348-33755532)
chr3 (363-422)||(35481148-35481207)
chr3 (27-98)||(47542037-47542107)
chr3 (348-422)||(48532162-48532237)
chr3 (373-423)||(26990442-26990492)
chr3 (336-422)||(33271913-33271999)
chr3 (348-422)||(46148233-46148307)
chr3 (52-138)||(46568027-46568113)
chr3 (90-162)||(33307095-33307165)
chr3 (136-209)||(44134044-44134117)
chr3 (341-422)||(45486852-45486933)
chr3 (369-410)||(53266917-53266958)
chr3 (314-379)||(55384064-55384129)
chr3 (305-413)||(19737146-19737253)
chr3 (262-430)||(29475811-29475973)
chr3 (132-208)||(34719287-34719363)
chr3 (65-174)||(55244226-55244331)
chr3 (132-210)||(21200541-21200617)
chr3 (343-422)||(40273208-40273287)
chr3 (142-209)||(41842725-41842792)
chr3 (315-358)||(44571599-44571642)
chr3 (133-204)||(50632054-50632125)
chr3 (372-422)||(21862744-21862794)
chr3 (352-422)||(24778612-24778682)
chr3 (133-210)||(31453151-31453229)
chr3 (330-408)||(34610434-34610512)
chr3 (271-423)||(46367389-46367538)
chr3 (133-210)||(39535653-39535730)
chr3 (333-422)||(39781921-39782009)
chr3 (332-385)||(53509801-53509854)
chr3 (370-422)||(32052544-32052596)
chr3 (64-136)||(38054624-38054696)
chr3 (363-427)||(52882660-52882724)
[»] chr5 (107 HSPs)
chr5 (23-422)||(12492387-12492787)
chr5 (23-422)||(28976862-28977257)
chr5 (23-422)||(24178392-24178789)
chr5 (23-422)||(10639179-10639581)
chr5 (106-418)||(38684932-38685242)
chr5 (23-422)||(2075476-2075874)
chr5 (23-413)||(1287591-1287989)
chr5 (24-427)||(16347378-16347777)
chr5 (67-422)||(4496308-4496663)
chr5 (23-422)||(1275147-1275543)
chr5 (49-422)||(3301752-3302123)
chr5 (23-422)||(34272904-34273292)
chr5 (105-422)||(14665674-14665991)
chr5 (79-422)||(26884692-26885033)
chr5 (144-422)||(20456776-20457052)
chr5 (123-422)||(36215480-36215767)
chr5 (181-421)||(38501422-38501660)
chr5 (105-378)||(14749271-14749542)
chr5 (226-422)||(2915499-2915692)
chr5 (249-422)||(27992-28161)
chr5 (233-422)||(13561389-13561576)
chr5 (270-422)||(29816513-29816661)
chr5 (90-422)||(7359264-7359592)
chr5 (24-148)||(20318870-20318989)
chr5 (20-408)||(32516437-32516819)
chr5 (259-422)||(14911292-14911451)
chr5 (281-422)||(16913885-16914023)
chr5 (316-419)||(5558314-5558417)
chr5 (79-387)||(6888931-6889237)
chr5 (126-305)||(15489608-15489789)
chr5 (90-299)||(31636042-31636251)
chr5 (132-422)||(43557836-43558118)
chr5 (90-212)||(10082950-10083072)
chr5 (90-305)||(2712897-2713110)
chr5 (323-420)||(30213755-30213852)
chr5 (104-422)||(6859344-6859660)
chr5 (306-413)||(418046-418153)
chr5 (262-417)||(9235172-9235320)
chr5 (105-204)||(15168756-15168855)
chr5 (132-419)||(14667754-14668047)
chr5 (134-210)||(33667209-33667285)
chr5 (132-304)||(79504-79678)
chr5 (268-422)||(11675658-11675809)
chr5 (83-209)||(31906603-31906729)
chr5 (305-422)||(28276400-28276517)
chr5 (142-304)||(28676596-28676760)
chr5 (58-201)||(11002645-11002786)
chr5 (144-422)||(43475243-43475518)
chr5 (105-212)||(418196-418303)
chr5 (326-401)||(6788250-6788325)
chr5 (233-422)||(12576863-12577050)
chr5 (340-422)||(7640510-7640592)
chr5 (275-378)||(42504294-42504393)
chr5 (23-192)||(27776-27944)
chr5 (305-422)||(2090575-2090692)
chr5 (264-422)||(29922409-29922563)
chr5 (270-408)||(30588578-30588712)
chr5 (306-427)||(31220546-31220666)
chr5 (304-425)||(39040917-39041038)
chr5 (329-413)||(15252756-15252840)
chr5 (334-422)||(18855798-18855886)
chr5 (326-422)||(20367076-20367172)
chr5 (23-123)||(36200664-36200764)
chr5 (64-290)||(21952274-21952508)
chr5 (326-409)||(32442141-32442224)
chr5 (110-393)||(17340468-17340750)
chr5 (141-210)||(18351120-18351190)
chr5 (352-422)||(28411885-28411955)
chr5 (101-210)||(42199248-42199355)
chr5 (305-422)||(2393039-2393155)
chr5 (329-422)||(21193655-21193748)
chr5 (226-368)||(23980031-23980169)
chr5 (317-422)||(36551320-36551425)
chr5 (349-422)||(38132542-38132615)
chr5 (261-358)||(15168893-15168986)
chr5 (261-422)||(25938091-25938248)
chr5 (148-422)||(1525651-1525920)
chr5 (352-422)||(3442874-3442944)
chr5 (262-422)||(7678601-7678756)
chr5 (250-292)||(8082083-8082125)
chr5 (373-419)||(9121084-9121130)
chr5 (348-422)||(39012783-39012857)
chr5 (361-422)||(408497-408558)
chr5 (261-355)||(14725640-14725730)
chr5 (306-422)||(41894229-41894352)
chr5 (103-160)||(42504446-42504503)
chr5 (370-422)||(4653479-4653531)
chr5 (110-210)||(38684449-38684549)
chr5 (133-210)||(41833795-41833874)
chr5 (350-422)||(42576217-42576289)
chr5 (353-420)||(2713146-2713213)
chr5 (363-422)||(27386560-27386619)
chr5 (315-390)||(35615455-35615530)
chr5 (326-401)||(41808105-41808180)
chr5 (305-363)||(2552944-2553002)
chr5 (132-210)||(4026548-4026626)
chr5 (348-422)||(5860039-5860113)
chr5 (265-299)||(27998567-27998601)
chr5 (305-355)||(36200891-36200941)
chr5 (363-409)||(39322095-39322141)
chr5 (53-130)||(7678392-7678469)
chr5 (237-337)||(9917538-9917636)
chr5 (152-209)||(27553842-27553899)
chr5 (340-401)||(38657040-38657101)
chr5 (101-149)||(9434039-9434087)
chr5 (145-209)||(37065533-37065597)
chr5 (142-210)||(38578734-38578802)
[»] chr2 (122 HSPs)
chr2 (25-422)||(8180664-8181059)
chr2 (25-422)||(3865956-3866351)
chr2 (53-422)||(12734613-12734979)
chr2 (23-413)||(38429766-38430154)
chr2 (23-422)||(36183333-36183730)
chr2 (112-422)||(25834650-25834957)
chr2 (27-422)||(3243656-3244047)
chr2 (23-422)||(11992111-11992506)
chr2 (23-422)||(41763046-41763441)
chr2 (24-422)||(4807475-4807874)
chr2 (55-427)||(38452684-38453057)
chr2 (132-422)||(2610579-2610867)
chr2 (23-422)||(41197230-41197628)
chr2 (23-408)||(45367642-45368024)
chr2 (26-366)||(6237812-6238151)
chr2 (27-409)||(23997503-23997868)
chr2 (25-210)||(16097199-16097388)
chr2 (23-422)||(451651-452022)
chr2 (132-422)||(18424381-18424668)
chr2 (56-422)||(38434866-38435231)
chr2 (183-422)||(7326163-7326400)
chr2 (78-422)||(43751950-43752292)
chr2 (148-422)||(24583634-24583907)
chr2 (233-422)||(28508770-28508957)
chr2 (54-422)||(9556372-9556737)
chr2 (70-408)||(41545335-41545670)
chr2 (257-422)||(31959639-31959800)
chr2 (259-422)||(35643068-35643227)
chr2 (258-422)||(45543076-45543235)
chr2 (263-422)||(43573133-43573287)
chr2 (305-422)||(30306194-30306311)
chr2 (232-422)||(35755248-35755440)
chr2 (141-422)||(18958907-18959190)
chr2 (305-422)||(30743691-30743808)
chr2 (314-422)||(227360-227468)
chr2 (23-138)||(2610410-2610525)
chr2 (311-422)||(9496034-9496145)
chr2 (27-184)||(19337089-19337245)
chr2 (43-210)||(7825260-7825429)
chr2 (137-210)||(43238306-43238379)
chr2 (136-422)||(12141539-12141823)
chr2 (269-422)||(12882048-12882197)
chr2 (323-422)||(3635326-3635425)
chr2 (259-422)||(39029701-39029866)
chr2 (136-422)||(13149326-13149611)
chr2 (139-422)||(44437724-44438005)
chr2 (283-400)||(9996651-9996764)
chr2 (311-422)||(19336896-19337007)
chr2 (23-193)||(30743505-30743674)
chr2 (233-421)||(33504315-33504502)
chr2 (23-125)||(24583904-24584006)
chr2 (110-305)||(37481733-37481930)
chr2 (328-422)||(39709204-39709298)
chr2 (350-422)||(17429257-17429329)
chr2 (262-390)||(26670891-26671015)
chr2 (57-212)||(4598773-4598930)
chr2 (115-209)||(11412695-11412789)
chr2 (317-422)||(11412881-11412989)
chr2 (104-210)||(13240958-13241064)
chr2 (305-422)||(38328373-38328488)
chr2 (337-422)||(9531603-9531688)
chr2 (341-422)||(12520065-12520146)
chr2 (231-422)||(13443911-13444100)
chr2 (21-299)||(13592420-13592697)
chr2 (111-200)||(19024150-19024239)
chr2 (58-249)||(42092436-42092625)
chr2 (343-422)||(10516752-10516831)
chr2 (233-421)||(19234988-19235174)
chr2 (267-422)||(33287549-33287700)
chr2 (265-412)||(37470146-37470289)
chr2 (350-427)||(12474925-12475002)
chr2 (327-423)||(186134-186230)
chr2 (126-177)||(227307-227358)
chr2 (305-420)||(6219127-6219242)
chr2 (233-422)||(42543327-42543514)
chr2 (311-423)||(45077895-45078009)
chr2 (135-205)||(6218961-6219031)
chr2 (26-128)||(13149198-13149300)
chr2 (234-401)||(26784364-26784529)
chr2 (253-346)||(4682256-4682345)
chr2 (256-422)||(11744640-11744802)
chr2 (354-422)||(25384680-25384748)
chr2 (105-212)||(40759063-40759171)
chr2 (154-210)||(41858744-41858800)
chr2 (141-210)||(3481144-3481210)
chr2 (330-413)||(3720427-3720510)
chr2 (355-422)||(17670680-17670747)
chr2 (43-209)||(18188685-18188848)
chr2 (24-87)||(37281990-37282053)
chr2 (316-422)||(9394633-9394739)
chr2 (352-422)||(20900554-20900624)
chr2 (133-207)||(41330121-41330195)
chr2 (348-422)||(42549840-42549914)
chr2 (56-210)||(9647822-9647972)
chr2 (373-422)||(12489805-12489854)
chr2 (321-422)||(18790109-18790210)
chr2 (133-210)||(38860165-38860242)
chr2 (326-422)||(8197544-8197640)
chr2 (326-422)||(8202304-8202400)
chr2 (141-193)||(12882270-12882322)
chr2 (311-387)||(36650610-36650686)
chr2 (43-86)||(1456135-1456178)
chr2 (352-423)||(4598564-4598635)
chr2 (305-387)||(1400495-1400577)
chr2 (340-422)||(3481351-3481433)
chr2 (101-202)||(7615259-7615358)
chr2 (132-210)||(9578916-9578994)
chr2 (352-422)||(15025703-15025773)
chr2 (352-390)||(19334187-19334225)
chr2 (373-422)||(624689-624738)
chr2 (101-174)||(786790-786863)
chr2 (132-209)||(12905085-12905162)
chr2 (341-422)||(19863432-19863513)
chr2 (341-422)||(19867764-19867845)
chr2 (341-422)||(19872665-19872746)
chr2 (144-286)||(32443668-32443812)
chr2 (149-212)||(14197373-14197437)
chr2 (326-422)||(28960214-28960310)
chr2 (338-386)||(31415557-31415605)
chr2 (342-422)||(34931631-34931711)
chr2 (383-423)||(43970020-43970060)
chr2 (144-212)||(44411715-44411783)
[»] chr8 (131 HSPs)
chr8 (26-422)||(36545032-36545428)
chr8 (23-422)||(36565244-36565641)
chr8 (23-377)||(39946739-39947091)
chr8 (23-422)||(36394951-36395353)
chr8 (23-358)||(18125057-18125387)
chr8 (23-410)||(42854019-42854404)
chr8 (107-422)||(11523726-11524040)
chr8 (43-422)||(40813224-40813603)
chr8 (26-410)||(2796440-2796820)
chr8 (143-423)||(12491140-12491418)
chr8 (90-422)||(21121107-21121424)
chr8 (59-422)||(45419157-45419514)
chr8 (27-422)||(37077651-37078028)
chr8 (23-390)||(8879481-8879840)
chr8 (64-422)||(29520583-29520928)
chr8 (25-206)||(18752093-18752271)
chr8 (144-390)||(43904700-43904947)
chr8 (117-423)||(8932680-8932983)
chr8 (226-422)||(42469730-42469924)
chr8 (161-378)||(26904954-26905168)
chr8 (79-299)||(32043528-32043750)
chr8 (45-209)||(6510642-6510803)
chr8 (23-138)||(15215556-15215671)
chr8 (313-422)||(44529395-44529504)
chr8 (259-422)||(2027650-2027809)
chr8 (305-422)||(14742085-14742199)
chr8 (80-210)||(44681252-44681382)
chr8 (305-422)||(15215415-15215532)
chr8 (305-422)||(25473406-25473523)
chr8 (262-422)||(2216411-2216565)
chr8 (91-207)||(13171865-13171981)
chr8 (23-155)||(25288784-25288916)
chr8 (23-155)||(25300119-25300251)
chr8 (305-421)||(45041320-45041435)
chr8 (311-422)||(490503-490614)
chr8 (166-422)||(30559718-30559977)
chr8 (316-422)||(44047535-44047641)
chr8 (23-151)||(12492116-12492242)
chr8 (150-421)||(32930970-32931238)
chr8 (101-358)||(5908602-5908861)
chr8 (305-431)||(4955353-4955479)
chr8 (90-358)||(10079974-10080238)
chr8 (133-390)||(29700268-29700523)
chr8 (268-427)||(35914599-35914754)
chr8 (58-358)||(45512561-45512861)
chr8 (306-387)||(25300262-25300343)
chr8 (172-356)||(9904951-9905132)
chr8 (306-422)||(25288927-25289043)
chr8 (152-422)||(35643611-35643872)
chr8 (52-210)||(41971991-41972145)
chr8 (305-370)||(12025939-12026004)
chr8 (132-388)||(13589477-13589724)
chr8 (104-208)||(9695594-9695698)
chr8 (101-211)||(12796912-12797020)
chr8 (311-422)||(42584527-42584637)
chr8 (249-423)||(29735917-29736087)
chr8 (52-212)||(2518603-2518761)
chr8 (326-422)||(23492217-23492313)
chr8 (54-174)||(30456461-30456580)
chr8 (311-422)||(3802041-3802152)
chr8 (233-422)||(7531647-7531834)
chr8 (105-207)||(7046298-7046400)
chr8 (330-408)||(16035744-16035822)
chr8 (261-356)||(28169514-28169605)
chr8 (36-177)||(13986389-13986530)
chr8 (104-358)||(16917147-16917398)
chr8 (311-387)||(21425214-21425290)
chr8 (104-174)||(25985484-25985552)
chr8 (233-305)||(38178376-38178450)
chr8 (53-164)||(39760683-39760794)
chr8 (57-422)||(39953267-39953630)
chr8 (268-399)||(38391919-38392046)
chr8 (262-413)||(43733330-43733476)
chr8 (353-422)||(1928590-1928659)
chr8 (353-422)||(10668500-10668569)
chr8 (256-385)||(28269720-28269843)
chr8 (268-422)||(35362653-35362803)
chr8 (141-202)||(41444547-41444608)
chr8 (179-293)||(42584409-42584525)
chr8 (310-422)||(26363655-26363765)
chr8 (315-387)||(31715992-31716064)
chr8 (350-422)||(32569713-32569785)
chr8 (261-382)||(33827800-33827917)
chr8 (281-422)||(39967502-39967639)
chr8 (139-210)||(2776442-2776513)
chr8 (63-162)||(16351312-16351411)
chr8 (270-390)||(17491689-17491805)
chr8 (117-204)||(30113416-30113503)
chr8 (262-422)||(30198269-30198425)
chr8 (363-422)||(35323993-35324052)
chr8 (133-212)||(38689530-38689609)
chr8 (262-388)||(41444376-41444501)
chr8 (104-203)||(44373739-44373838)
chr8 (336-390)||(8255568-8255622)
chr8 (311-390)||(12966347-12966428)
chr8 (144-210)||(18474173-18474239)
chr8 (105-210)||(30748423-30748526)
chr8 (328-386)||(43013231-43013289)
chr8 (90-210)||(78989-79112)
chr8 (369-422)||(1335552-1335605)
chr8 (226-390)||(24558572-24558730)
chr8 (148-245)||(29645044-29645141)
chr8 (348-413)||(30689940-30690005)
chr8 (330-422)||(2518401-2518493)
chr8 (141-298)||(25985723-25985881)
chr8 (373-421)||(26055651-26055699)
chr8 (263-299)||(29709821-29709857)
chr8 (57-210)||(36143285-36143434)
chr8 (326-422)||(44699649-44699745)
chr8 (312-427)||(12611666-12611781)
chr8 (351-422)||(32276893-32276964)
chr8 (305-422)||(14459057-14459175)
chr8 (305-390)||(15174870-15174956)
chr8 (265-299)||(23023351-23023385)
chr8 (36-98)||(29735701-29735763)
chr8 (262-390)||(30783077-30783201)
chr8 (132-174)||(33666748-33666790)
chr8 (340-422)||(36143538-36143620)
chr8 (131-193)||(42493536-42493598)
chr8 (268-305)||(4011212-4011249)
chr8 (354-419)||(18741843-18741908)
chr8 (354-419)||(18746807-18746872)
chr8 (349-422)||(27556305-27556378)
chr8 (326-399)||(28299985-28300058)
chr8 (349-422)||(35646933-35647006)
chr8 (145-197)||(7103274-7103326)
chr8 (90-169)||(16705711-16705788)
chr8 (285-346)||(25439471-25439528)
chr8 (310-386)||(33076291-33076367)
chr8 (49-164)||(38328068-38328181)
chr8 (311-387)||(41971828-41971904)
[»] chr7 (148 HSPs)
chr7 (25-422)||(11593844-11594239)
chr7 (23-422)||(39906375-39906775)
chr7 (26-422)||(12841278-12841672)
chr7 (26-418)||(35906208-35906598)
chr7 (23-422)||(37617826-37618224)
chr7 (43-422)||(43491210-43491587)
chr7 (23-412)||(49029158-49029545)
chr7 (23-422)||(34869302-34869699)
chr7 (23-422)||(33349809-33350206)
chr7 (23-422)||(43281558-43281953)
chr7 (36-422)||(45836485-45836867)
chr7 (52-422)||(44855177-44855543)
chr7 (23-366)||(13859067-13859406)
chr7 (23-422)||(46355859-46356251)
chr7 (23-343)||(31005105-31005423)
chr7 (127-422)||(2885725-2886018)
chr7 (23-412)||(36651876-36652261)
chr7 (44-422)||(35558996-35559373)
chr7 (106-422)||(29650349-29650663)
chr7 (106-422)||(6374833-6375147)
chr7 (50-422)||(36136673-36137043)
chr7 (23-295)||(33072836-33073108)
chr7 (23-251)||(7272921-7273149)
chr7 (23-422)||(38606887-38607271)
chr7 (142-422)||(31682605-31682883)
chr7 (23-375)||(23404300-23404649)
chr7 (101-422)||(28627936-28628255)
chr7 (151-422)||(15682184-15682453)
chr7 (259-428)||(40979925-40980090)
chr7 (26-358)||(47848559-47848888)
chr7 (144-422)||(22349623-22349899)
chr7 (140-383)||(36869286-36869527)
chr7 (257-422)||(7273218-7273379)
chr7 (101-241)||(46014363-46014502)
chr7 (262-427)||(45601599-45601760)
chr7 (79-412)||(8492249-8492577)
chr7 (52-212)||(36514418-36514576)
chr7 (23-183)||(32630477-32630636)
chr7 (26-334)||(7189310-7189630)
chr7 (259-422)||(38900077-38900235)
chr7 (305-422)||(27648942-27649059)
chr7 (256-422)||(9210707-9210869)
chr7 (36-208)||(42187366-42187537)
chr7 (305-422)||(32631726-32631843)
chr7 (305-422)||(31681023-31681140)
chr7 (29-138)||(36869574-36869683)
chr7 (36-420)||(38135218-38135603)
chr7 (197-422)||(1011103-1011325)
chr7 (305-422)||(21078079-21078196)
chr7 (305-422)||(48919274-48919391)
chr7 (23-290)||(25579208-25579471)
chr7 (315-422)||(34035157-34035264)
chr7 (330-422)||(28208331-28208423)
chr7 (311-422)||(36101780-36101891)
chr7 (267-422)||(12966144-12966295)
chr7 (57-305)||(14593677-14593926)
chr7 (305-422)||(14057640-14057757)
chr7 (305-422)||(14367668-14367785)
chr7 (272-378)||(21517427-21517529)
chr7 (142-402)||(26741917-26742177)
chr7 (319-420)||(33073105-33073206)
chr7 (57-209)||(39811873-39812025)
chr7 (311-422)||(27893566-27893677)
chr7 (105-305)||(43282369-43282575)
chr7 (259-422)||(24598191-24598349)
chr7 (132-209)||(27021906-27021983)
chr7 (52-210)||(30200176-30200330)
chr7 (314-385)||(31859046-31859117)
chr7 (360-422)||(1523860-1523922)
chr7 (57-305)||(16013200-16013449)
chr7 (281-388)||(36239833-36239936)
chr7 (305-422)||(42187603-42187720)
chr7 (315-413)||(42969870-42969968)
chr7 (112-248)||(19262609-19262742)
chr7 (257-390)||(44951272-44951402)
chr7 (350-422)||(24777168-24777240)
chr7 (197-346)||(1531440-1531587)
chr7 (306-429)||(8519042-8519165)
chr7 (311-378)||(35922421-35922488)
chr7 (66-296)||(48736025-48736256)
chr7 (52-209)||(5335833-5335988)
chr7 (132-210)||(40169640-40169718)
chr7 (305-399)||(40415169-40415263)
chr7 (100-210)||(41948475-41948585)
chr7 (262-388)||(44401164-44401284)
chr7 (321-423)||(47852265-47852367)
chr7 (272-427)||(37976368-37976519)
chr7 (326-422)||(2882739-2882835)
chr7 (105-209)||(28020928-28021032)
chr7 (330-402)||(30814148-30814220)
chr7 (110-218)||(36101970-36102078)
chr7 (318-422)||(47652722-47652826)
chr7 (136-211)||(38920789-38920864)
chr7 (343-422)||(48515475-48515554)
chr7 (144-210)||(12966025-12966091)
chr7 (105-202)||(27893769-27893864)
chr7 (311-413)||(33103094-33103196)
chr7 (326-427)||(33732017-33732116)
chr7 (305-402)||(24434386-24434483)
chr7 (90-200)||(47796359-47796471)
chr7 (142-210)||(18605359-18605427)
chr7 (142-210)||(18637563-18637631)
chr7 (142-210)||(18650997-18651065)
chr7 (326-422)||(34745930-34746026)
chr7 (329-409)||(34926538-34926618)
chr7 (262-378)||(1569139-1569251)
chr7 (49-249)||(1740705-1740909)
chr7 (363-422)||(9796304-9796363)
chr7 (141-212)||(35713695-35713766)
chr7 (266-402)||(43281958-43282089)
chr7 (132-207)||(45558353-45558428)
chr7 (311-421)||(6072220-6072329)
chr7 (352-422)||(31869105-31869175)
chr7 (180-279)||(32631615-32631716)
chr7 (71-169)||(42177269-42177367)
chr7 (341-422)||(25891086-25891167)
chr7 (311-408)||(30664736-30664833)
chr7 (103-164)||(37439600-37439661)
chr7 (342-423)||(46990092-46990173)
chr7 (370-422)||(6263486-6263538)
chr7 (164-305)||(6420606-6420749)
chr7 (132-212)||(9797915-9797994)
chr7 (330-422)||(24177630-24177721)
chr7 (107-202)||(28858012-28858105)
chr7 (326-422)||(34341398-34341494)
chr7 (326-422)||(40008434-40008530)
chr7 (147-210)||(7220750-7220813)
chr7 (363-418)||(28708601-28708656)
chr7 (63-209)||(40139133-40139276)
chr7 (348-422)||(24376026-24376100)
chr7 (340-390)||(26332908-26332958)
chr7 (372-422)||(31005434-31005484)
chr7 (233-401)||(47796176-47796342)
chr7 (342-412)||(48515370-48515440)
chr7 (377-422)||(14593986-14594031)
chr7 (23-76)||(15681239-15681292)
chr7 (377-422)||(16013509-16013554)
chr7 (373-414)||(17759503-17759544)
chr7 (311-427)||(28541941-28542058)
chr7 (373-422)||(39738448-39738497)
chr7 (361-422)||(40630652-40630713)
chr7 (373-413)||(6682583-6682623)
chr7 (309-349)||(18795853-18795893)
chr7 (360-408)||(19119441-19119489)
chr7 (378-422)||(21244286-21244330)
chr7 (52-120)||(28542187-28542254)
chr7 (326-422)||(38103618-38103712)
chr7 (142-210)||(40830224-40830292)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (26-422)||(31353-31747)
scaffold0018 (37-210)||(44081-44257)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (23-422)||(82603-82997)
scaffold0024 (334-423)||(48118-48207)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (104-422)||(951-1265)
scaffold0570 (23-98)||(2595-2670)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (23-185)||(25683-25845)
scaffold0157 (267-422)||(25535-25686)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (21-386)||(86648-87009)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (25-386)||(4320-4670)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (23-209)||(11810-11998)
scaffold0113 (183-410)||(11564-11787)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (259-429)||(16698-16864)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (216-422)||(4711-4915)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (120-422)||(7422-7719)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (305-422)||(493-610)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (283-422)||(14727-14862)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (262-413)||(58238-58385)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (335-422)||(28892-28979)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (305-422)||(160327-160444)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (337-422)||(16439-16524)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (145-209)||(11802-11866)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (305-385)||(39481-39561)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (354-419)||(3648-3713)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 163)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 443
Target Start/End: Original strand, 1793339 - 1793762
Alignment:
Q  20 tttggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaat 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1793339 tttggcggttaagagccaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaat 1793438  T
Q  120 gacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1793439 gacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatg 1793538  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1793539 tcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggagtcgtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 1793638  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1793639 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 1793738  T
Q  420 tgtagtatttaatcaaatcttcac 443  Q
    |||||||||||  |||||| ||||    
T  1793739 tgtagtatttatacaaatcgtcac 1793762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31960214 - 31959817
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  31960214 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 31960115  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  31960114 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 31960015  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||     |||||||| |||||||    
T  31960014 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac----tattagaaaggatttag 31959919  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31959918 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 31959819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 52569913 - 52569518
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||||    
T  52569913 cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacac 52569814  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||     
T  52569813 cattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtg 52569714  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||    |||||||| |||||||||    
T  52569713 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaacc----attagaaaggatttagag 52569618  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52569617 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 52569518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 436111 - 436508
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  436111 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgac 436210  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| ||    
T  436211 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccg 436310  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    | |||||| |||||||    
T  436311 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----actagaaaggatttag 436406  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  436407 aggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 436506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 420
Target Start/End: Original strand, 33227091 - 33227486
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  33227091 ggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgac 33227190  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  33227191 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 33227290  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||   ||||||  | |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||    |||||||| |||||||    
T  33227291 tgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaacc----attagaaaggatttag 33227386  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  33227387 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtt 33227486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33191248 - 33190853
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |  |  |||||||||||| ||||||    
T  33191248 ggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgac 33191149  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  33191148 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 33191049  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    | |||||||  |||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  33191048 tgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 33190953  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33190952 aggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtt 33190853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 53707676 - 53708073
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||  ||||||| ||| ||||||    
T  53707676 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgac 53707775  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  53707776 accattagaaagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 53707875  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| |||| |||| |||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  53707876 tggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 53707971  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||  |||||    
T  53707972 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 53708071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 56375172 - 56375569
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  |||| |||||| ||||||    
T  56375172 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaaacaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgac 56375271  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  56375272 accattagagagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 56375371  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||| | ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  56375372 tggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 56375467  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  56375468 aggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgtt 56375567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1777412 - 1777020
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||    
T  1777412 ggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacc 1777313  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    |||||  |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||      
T  1777312 attag--agagagtggaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtgg 1777215  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  1777214 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttagagg 1777119  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  1777118 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgt 1777020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 4440735 - 4441123
Alignment:
Q  21 ttggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||    
T  4440735 ttggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatg 4440834  T
Q  121 acaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgt 220  Q
     |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||   | ||||     
T  4440835 gcaccattag--agagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgc 4440932  T
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattt 318  Q
     ||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||    
T  4440933 tgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggattt 4441028  T
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4441029 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 4441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48622938 - 48622546
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||    
T  48622938 ggttaggagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacc 48622839  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||      
T  48622838 attag--agagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtgg 48622741  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| || |||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    | |||||||||||||||||||    
T  48622740 taagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa----tcattagaaaagatttagagg 48622645  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48622644 tcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 48622546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 43433800 - 43434203
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  43433800 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgac 43433899  T
Q  123 accattagggaga------gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattg 216  Q
    |||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |    
T  43433900 accattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtag 43433999  T
Q  217 atgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaag 314  Q
    ||| |||  |||||| |||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |    ||| |    
T  43434000 atgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattga----aaatg 43434095  T
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||     
T  43434096 atttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttg 43434195  T
Q  415 gttgttgt 422  Q
    ||||||||    
T  43434196 gttgttgt 43434203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48174491 - 48174096
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  |||| |||||| ||||||||    
T  48174491 cggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacac 48174392  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | |||| |||     
T  48174391 cattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtg 48174292  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||    
T  48174291 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagag 48174196  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||| | || |||| ||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48174195 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 48174096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23906701 - 23906295
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  23906701 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgac 23906602  T
Q  123 accattagggagagag------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattg 216  Q
    |||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |    
T  23906601 accattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagacgta--g 23906504  T
Q  217 atgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaag 314  Q
    ||| |||  |||||| ||||||| | |||||||||  |||  | |||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||    |||| |    
T  23906503 atgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccatta----gaaagg 23906408  T
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||     
T  23906407 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttg 23906308  T
Q  415 gttgttgtagtat 427  Q
    |||||||| ||||    
T  23906307 gttgttgttgtat 23906295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 418
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708708
Alignment:
Q  120 gacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||  || ||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatt 317  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacc----attagaaaggatt 39708607  T
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||    
T  39708608 tagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggtt 39708707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27450569 - 27450178
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||| ||    ||||||||||    
T  27450569 gttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacacca 27450474  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||| |||  |    
T  27450473 ttag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgt 27450376  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  || |||  | |||||||||| ||||||||||   ||||  ||  ||||||||    ||| ||||||||||||||||    
T  27450375 aagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaacc----attggaaaagatttagaggt 27450280  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtag 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||| |    
T  27450279 caatgagttggatccaaatatgattt-tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttg 27450181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39100929 - 39100539
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |    ||||| |||||||||  |   ||||||||||| ||||||||||    
T  39100929 gttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacacca 39100830  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||| |||  |    
T  39100829 ttag--agagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatg-cgttgt 39100733  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||||| |||||    
T  39100732 aagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttggaggt 39100637  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39100636 caatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 39100539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 46583224 - 46582829
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||  || |||||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  46583224 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgac 46583125  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga-cttattgatgtc 221  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||| |   | ||||||    
T  46583124 accattcgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgt--agagaagaccccgtagatgtc 46583027  T
Q  222 gtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    ||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    ||| |||| ||||||    
T  46583026 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaacc----attggaaaggattta 46582931  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
     ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||    
T  46582930 aaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgt 46582832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47265600 - 47265198
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  |||| |||||  ||||||||    
T  47265600 cggttaagagtcaacacgagaatcaagtaggtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacac 47265501  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaag--actta-----ttga 217  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||     | ||    
T  47265500 cattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtaga 47265401  T
Q  218 tgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaaga 315  Q
    || |||| |||||| ||||||  | |||||||||  ||   | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    ||||||||  |    
T  47265400 tgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaagaa 47265305  T
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  47265304 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttgg 47265205  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    || ||||    
T  47265204 ttattgt 47265198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41009750 - 41009419
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||||||||    
T  41009750 ggcgattaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgac 41009651  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt-agaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtc 221  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||      
T  41009650 atcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgca 41009551  T
Q  222 gtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||     |||||||| ||||||    
T  41009550 gtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaac----tattagaaatgattta 41009456  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  41009455 gaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgata 41009419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 422
Target Start/End: Original strand, 37797790 - 37798130
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    |||||||||| | |||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37797790 gttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 37797889  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||| |||| |||||| ||||||||| |||||   ||||||  | ||||||  ||||||||||    
T  37797890 gcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagaggaaga 37797988  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttg 376  Q
     || | |||||||| |||||||    | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  37797989 tctaggaaaactattagagaaa----tcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttg 37798084  T
Q  377 attcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||  ||||||||||   || |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  37798085 atcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgt 37798130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 422
Target Start/End: Original strand, 27983083 - 27983472
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgaca 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||    
T  27983083 gcggttaagagtcaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgaca 27983182  T
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||    
T  27983183 ccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgt 27983275  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||||| |||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||| |   ||||| ||  || |||||     ||||||||||||||||    
T  27983276 tgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacc----tttagaaaagatttaga 27983371  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||| || |||||||    
T  27983372 gttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttg 27983471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 28236087 - 28236461
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |   ||||||||  ||||||| |  |   ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28236087 agaatcaagtaagtgtagcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattag--agagagtggg 28236184  T
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||     
T  28236185 ggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaa 28236284  T
Q  243 atggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    |||| ||||  |||  | ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    |  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28236285 atggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa----tctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatcca 28236379  T
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| || |||||||||||  | ||||  ||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  28236380 aatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 28236461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45205244 - 45204843
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45205244 gttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacacca 45205145  T
Q  127 ttagggagagag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagc--ttagatggtttggacatgtagagagaagac-------ttattg 216  Q
    |||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||| |||||||  || |||||||||||||        | | |    
T  45205144 ttaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtag 45205045  T
Q  217 atgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag-tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaaga 315  Q
    |||  ||  || ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||| |||||    
T  45205044 atgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagagcagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaaga 45204949  T
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||  |||||||| | |  |||||||| |||||||||| |    
T  45204948 tttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttgg 45204850  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  45204849 ttgttgt 45204843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 117 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20591606 - 20591349
Alignment:
Q  117 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  20591606 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatag 20591507  T
Q  217 atgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaa-aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaaga 315  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||    |||||||| ||    
T  20591506 atgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggag---agtcaagtagaggtagaggaagacctaagaaaactataagagacccc----attagaaagga 20591415  T
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcat 382  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20591414 tttagaggtcaatgagttggattcaaatatg-gttatgatagaacacaatgacgtaatttgattcat 20591349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26037796 - 26037508
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    | |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||    
T  26037796 gagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaagaa 26037697  T
Q  232 tagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     ||||||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||     ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26037696 gagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaac----tattaggaaagatttagaggtgaatg 26037601  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  26037600 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgt 26037508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 16002812 - 16003158
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||| || |||||||| |||||||||  |||  |||||||||| |||||||||    
T  16002812 ggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgaagacgatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacacc 16002911  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||  ||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||   | |||| ||||     
T  16002912 attatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgatagaaaatagtcttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtca 16003010  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    ||||||  ||| |||||||||| |  ||| || ||||||||  |||||||| |||   |||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  16003011 taagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaataccgtaaaaaactataagagaaacc----attagaaaaaatttagagg 16003106  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaattt 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16003107 tcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaattt 16003158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20602025 - 20601655
Alignment:
Q  44 gaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggg 143  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||   ||  ||||| |||   |||||||||| |||||||||||||| |    
T  20602025 gaatccagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggag 20601926  T
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||| |||  |||||| |||| || |||    
T  20601925 ataacacttatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataaga 20601826  T
Q  244 tggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 341  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||        ||||||||||||||||| |||    
T  20601825 tggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagaccttg-aaaactataagagaaacc----attagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaa 20601736  T
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  20601735 atatgatttatgatagaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgt 20601655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 422
Target Start/End: Original strand, 51421670 - 51422009
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||  || || |||||||||     
T  51421670 gttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattag--agagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaatag 51421767  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||||||   | ||||| ||  || ||| ||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  51421768 gcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaaga 51421867  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttg 376  Q
      | |||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51421868 tttagaaaaactataagagaaac----tattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttg 51421963  T
Q  377 attcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  51421964 atccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 51422009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 12494632 - 12494794
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  12494632 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 12494731  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttaga 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12494732 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1211788 - 1211395
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||| |||  ||  |||| |||||| ||||||||    
T  1211788 cggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacac 1211689  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag--aaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||   ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||  || ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  1211688 catt--cgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattg 1211591  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||| |||    | ||||||||| | ||||    
T  1211590 tcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaagacataggagaactataagataaa----ttattagaaaa-aattag 1211496  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgt-aatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||| | ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||| |||||    
T  1211495 aggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgt 1211398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 423
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192312
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaat 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||||  ||  ||||||     
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  233 agtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    |||| |||| |||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||| ||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcagtgg 20192220  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||| |  |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  20192221 gttggatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttga-tcaagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgta 20192312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Original strand, 50286853 - 50287185
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  50286853 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 50286952  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||  ||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  50286953 accatta--gagagagggg-------acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 50287043  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||  ||||||  ||||||  | |||||||||||| ||||||||   |||||||| |||| ||    | |||| ||| |||||||    
T  50287044 tggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaa----tcattataaaggatttag 50287139  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  50287140 aggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacactatg 50287185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 422
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479317
Alignment:
Q  160 aaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcata--t 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || | |||  |||||| ||||||||| |||||||||  | |  |    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  258 caaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag 357  Q
      ||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatag 32479252  T
Q  358 agcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  32479253 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgt 32479317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37773823 - 37773468
Alignment:
Q  50 agtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg-ggggtagc 148  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||  ||||||||    
T  37773823 agtaagtgtaggagagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattag--agagagtaaggggtagc 37773726  T
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga- 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||   |  || ||||  |||| | ||||||||| |||||     
T  37773725 acctatagtagaaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggat 37773626  T
Q  248 -ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
      ||||||  | |||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  37773625 gagagtcaatttaaaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttg 37773530  T
Q  347 atttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| | | |||| ||||||||    
T  37773529 gtttatgatagaacactatgacataatttgatctatatagccgaccccgcttaatgagataa 37773468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957877
Alignment:
Q  267 tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatg 6957821  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6957822 acgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 6957877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 422
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286718
Alignment:
Q  165 ttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||   | |||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||  |||  | | ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  263 gagg--------tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatga 354  Q
    ||||        ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatga 8286650  T
Q  355 tagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8286651 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 8286718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 21236978 - 21237137
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21236978 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtatatgataga 21237073  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  21237074 acactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgt 21237137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20821251 - 20821019
Alignment:
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| | | |||| | || ||| || ||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20821251 gcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatgaaga 20821152  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata----gagcactatgacgtaa 372  Q
    ||| | |||||||||||||||||     |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||  | |||    
T  20821151 cctaggaaaactataagagaaac-----attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataagg 20821019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518365
Alignment:
Q  172 aaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagag 271  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | ||||  ||  || ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag-agtcaaatcagaagaggtagag 53518473  T
Q  272 gaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgta 371  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| ||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  53518472 gaaggcctagaaaaactatgagaaaaac---taat-aggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgta 53518377  T
Q  372 atttgattcatg 383  Q
    ||||||| ||||    
T  53518376 atttgatccatg 53518365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7092615 - 7092290
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||  | |||||| |||||| |||||||  |    
T  7092615 gttaagaaccaacacgagaagcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatga 7092517  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    |||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||  || ||||||||| | |||  |||||||| ||| |||||||||||| | | |||||  |  |    
T  7092516 ttagagacagagttggaatagcacctatagtagaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagt 7092417  T
Q  227 aagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    | ||| |||||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||    | ||||  ||||||||||||||    
T  7092416 atgaagagtagatcagatggatgagagtcagaacataagaggtggaggaagacctagagaaa-tataagtgaaa----ttattatgaaagatttagaggt 7092322  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7092321 taatgcgttagatctaaatatgatttatgata 7092290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494942
Alignment:
Q  267 tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 12494886  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12494887 acgtcatttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12494942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 31458914 - 31459098
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  31458914 gttaagaaccaacacgaaaataaagtaagtgtagcacagatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgatacca 31459013  T
Q  127 ttagggaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  31459014 ttagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 267 - 420
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  267 tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattt----gaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatc 7947160  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7947161 atgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Original strand, 35690357 - 35690550
Alignment:
Q  227 aagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    ||||| ||||||||||    
T  35690357 aagaagagtggattagatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatta---cgaaaa-atttagaggt 35690452  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     |||||||| |||||||  | | ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||| ||||    
T  35690453 taatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgt 35690550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Original strand, 35690189 - 35690326
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  35690189 ggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagtgtagccgagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacc 35690288  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 163  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35690289 tttaaagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 21528450 - 21528567
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21528450 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtggcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 21528549  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  21528550 ataaggcttggttgttgt 21528567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44047669 - 44047568
Alignment:
Q  102 cgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtag 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  44047669 cgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtag 44047570  T
Q  202 ag 203  Q
    ||    
T  44047569 ag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008025
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  55008014 cttggttgttgt 55008025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 54470129 - 54470485
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||  | |||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54470129 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 54470228  T
Q  163 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatg--gaggagtcatatcaa 260  Q
    || |||| |||| ||  ||||  |||||||| |||||||||||||||| | |  ||   ||  |||| | |||| |||| |||  ||| ||||| || |     
T  54470229 agatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaattac 54470328  T
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 360  Q
     ||||| | | |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||    |||| | ||||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||  ||||    
T  54470329 tagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaat----aaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagc 54470424  T
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    | |||  ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  54470425 attattgcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154866
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||     
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  415 gttgttgt 422  Q
    ||||||||    
T  19154873 gttgttgt 19154866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31961441 - 31961269
Alignment:
Q  246 gaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 345  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||    | |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||    
T  31961441 gaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatta----ggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacat 31961346  T
Q  346 gatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31961345 ggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 31961269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42639391 - 42639229
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||   ||||| |||  |||||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||  |||| |||||    
T  42639391 taagtgtagaagagatgagaatgttatgtttgatgtatggtaacactagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacc 42639292  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttat 214  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42639291 tatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttat 42639229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 375
Target Start/End: Original strand, 50679626 - 50679736
Alignment:
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 360  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |      
T  50679626 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaat 50679721  T
Q  361 actatgacgtaattt 375  Q
    |||||||||| ||||    
T  50679722 actatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 407
Target Start/End: Original strand, 55578913 - 55579295
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| || || |||||||   |||| |||| |||||  ||||||    
T  55578913 ggcggttaagaaccaacacgagaatcaattaagtgtagcatatatgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgac 55579012  T
Q  123 acca--ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgt 220  Q
    || |  |||  |||||||| ||  || |||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||  |||  ||||    
T  55579013 actattttatagagagagttggaataacacctatagt-gaaaaaatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgt 55579111  T
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattt 318  Q
     ||  || ||| |||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||  ||   ||||||||    
T  55579112 tgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactatt--tt--gaaagattt 55579207  T
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagata 407  Q
    | ||||  |||||||||||  ||| | | ||||||||| | || |||||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  55579208 aaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 422
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969460
Alignment:
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  420 tgt 422  Q
    |||    
T  19969458 tgt 19969460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 50662300 - 50662459
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||  | | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||  ||| | ||||    
T  50662300 taagcgtagcggagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattag--agagagtttgggcaacacc 50662397  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatgg-tttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50662398 tatagtagaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagactt 50662459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51252829 - 51252674
Alignment:
Q  53 aagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacct 152  Q
    ||||||||| | || |||||| || |||| |||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  51252829 aagtgtagcagggaggaggattttgtgttagatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattag--agagagttggggtagcacct 51252732  T
Q  153 atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
     ||||||||||| |||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  51252731 ctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51811398 - 51811283
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  51811398 attagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtggg 51811300  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  51811299 ataaggctt-gttgttgt 51811283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 29398721 - 29398887
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||   ||||||  | ||||||| |  | || || |||||| ||||||||  |||||||| ||||| |     
T  29398721 agaataaaataagtgtagcggagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatattagggaaagagttgc 29398819  T
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  29398820 gatagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagac 29398887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31897743 - 31897423
Alignment:
Q  106 ataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag 205  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||  |||||||||||    
T  31897743 atagaattagaaatgaggacattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagag 31897646  T
Q  206 aagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatt 303  Q
     |||| | | |||   ||  | || | ||| ||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31897645 cagacctgtggattctgtagttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatt 31897546  T
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    |    | || ||| ||||| | |||||||||||   | | ||| ||  ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||     
T  31897545 a----ggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgg 31897450  T
Q  404 gataaggcttagttgttgtagtattta 430  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||    
T  31897449 gataaggctcggttgttgttgtattta 31897423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 305
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209202
Alignment:
Q  80 ttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataag 179  Q
    ||||||| | |||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||     
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattag----agagttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  180 cttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggta--gaggaag 275  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |  || |  |  |||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  276 acctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaa 10209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 299
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356779
Alignment:
Q  148 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||  |||||||||||| | | | | | ||  |||| | |||||||| ||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  248 --ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
      ||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaac 26356779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 28497450 - 28497598
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  28497450 gggataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgta 28497548  T
Q  201 gagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga 250  Q
    |||||||||||| | |||   ||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  28497549 gagagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 200
Target Start/End: Original strand, 49987345 - 49987487
Alignment:
Q  58 tagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagt 157  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||||    
T  49987345 tagcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagt 49987444  T
Q  158 agaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  49987445 agaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 17900388 - 17900549
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||| | |||||||||  | ||||||  ||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||||    
T  17900388 aagtaagcgtagcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagc 17900487  T
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||  || |  |||||||| || |||||||||||||    
T  17900488 acctatagtagaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagac 17900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 33709887 - 33709992
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| |||||| | ||||| |||    
T  33709887 ggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggag 33709986  T
Q  204 agaaga 209  Q
    ||||||    
T  33709987 agaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34233404 - 34233059
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattaggg--agagagtgggggtagca 149  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||  | | |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||| ||| |||||    
T  34233404 taagtgtagtggagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagca 34233305  T
Q  150 cctatagtag-aaaagttggtagaaaataagctta-------gatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||  |||||       | |||||||||||||||||||||  || | | |||   ||  |||| | ||||||| |    
T  34233304 cctatagtagaaaaagttgg-ggaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatga 34233206  T
Q  242 gatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 339  Q
    |||||||||  |||| ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||    |||||  ||||| | |||||||| ||||     
T  34233205 gatggaggatcgtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcat----aaagacctagagattaatgagttagatca 34233110  T
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||| | ||||||||||| || | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  34233109 aaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccga 34233059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 422
Target Start/End: Original strand, 37488220 - 37488370
Alignment:
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatga 367  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||     
T  37488220 agaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaag----aaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatgg 37488315  T
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||||||||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37488316 cgtaatttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 37488370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 304
Target Start/End: Original strand, 46371986 - 46372189
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||    
T  46371986 gggatagaattagaaatgatgacattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtaga 46372085  T
Q  203 gagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaacc 300  Q
    |||||||| | | |||   ||  |||||| || ||||||||| ||  |||| || ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||     
T  46372086 gagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaact 46372185  T
Q  301 atta 304  Q
    ||||    
T  46372186 atta 46372189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26024964 - 26024853
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| | | ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26024964 aaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtagccgacctcacttagtgggataagg 26024865  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  26024864 cttggttgttgt 26024853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Original strand, 28351651 - 28351838
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||| | | |||    
T  28351651 agtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagagaaac----tattacgaaagatttagagattattga 28351746  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||| |  ||||   | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  28351747 gttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggctgttgt 28351838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339693
Alignment:
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||   ||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatg--gaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaa 297  Q
     |||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtca-atcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaa 31339693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Original strand, 4548195 - 4548301
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |    
T  4548195 tttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaacactaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttgg 4548294  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  4548295 ttgttgt 4548301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 97
Target Start/End: Original strand, 39708340 - 39708414
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagac 97  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  39708340 ggcggttaagaggcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgcagatgaggatgttgcgttggatgagcagtaagac 39708414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 356
Target Start/End: Original strand, 50680650 - 50680953
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |  | ||||||  | |  |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||  ||| | ||||    
T  50680650 taagtatagcggagacgaggatgttgtgttgaatgtgtagcaagactatatgacataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacc 50680749  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttg-gacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga 250  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| ||| | |||  |||  |||| | ||||||||  ||| ||||    
T  50680750 tatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaagga 50680849  T
Q  251 --gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
      || | ||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||   |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||  |||||| |    
T  50680850 tagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaa---attatttag-aaagatctagagattaatgagttggatcggaatatggt 50680945  T
Q  349 ttatgata 356  Q
    ||||||||    
T  50680946 ttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575103
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||  |||||||||| |||||||| || | || |||||| |||||||    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  25575092 cttggttgttgt 25575103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45184195 - 45184136
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45184195 tatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 45184136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 343
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862844
Alignment:
Q  260 aaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat-aagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaat 343  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 50862844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388214
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| |||||||    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  55388225 cttggttgttgt 55388214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10775793 - 10775671
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || | |||   || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||    
T  10775793 taagcgtagcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacc 10775694  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  10775693 tatagtagaaaagatggtagaaa 10775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208272
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||  ||| | | |||| || |||||||||| |    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  34208278 ttgttgt 34208272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35555938 - 35555860
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  35555938 gagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagac 35555860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38571065 - 38570919
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| ||||| | || |||| || |||||| |||||||| |||||||| |    
T  38571065 gataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaa 38570966  T
Q  205 gaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag 251  Q
    |||||| | | |||  | || |||| | | |||||||||||||||||    
T  38570965 gaagacatgtggattccatcgtaaggacaatagatcagatggaggag 38570919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 45423542 - 45423681
Alignment:
Q  64 agatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 163  Q
    ||||||||||||| |||||| || | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||     ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  45423542 agatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattat----agagttgaggtagcacctataatagaaaa 45423637  T
Q  164 gttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    | ||||||||| |   ||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  45423638 gatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809069
Alignment:
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatg 55809069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Original strand, 29398990 - 29399083
Alignment:
Q  329 gagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29398990 gagttggaacgaaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 29399083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 31043234 - 31043351
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||| | || ||| || | |||||||||      
T  31043234 attaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccacttagtgca 31043333  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  31043334 ataaagcttagttattgt 31043351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 31459156 - 31459273
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | | |||| || || |||| || || ||||| |||||| |||| | ||||||||| |    
T  31459156 attaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccacttagtggg 31459255  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31459256 ataaggcttggttgttgt 31459273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50287993
Alignment:
Q  265 ggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcacta 364  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |  ||||    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaa----aaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatacta 50288004  T
Q  365 tgacgtaattt 375  Q
    || ||||||||    
T  50288003 tgtcgtaattt 50287993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 210
Target Start/End: Original strand, 50471453 - 50471595
Alignment:
Q  66 atgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 165  Q
    ||||| ||||| |||||||||   | |||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||||||     
T  50471453 atgagaatgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattag--agagactcggggtagcactaatagtagaaaaga 50471550  T
Q  166 tggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||| |||| || | |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  50471551 tggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 387
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486165
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || || || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 49987531 - 49987640
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  49987531 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa----gaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagca 49987626  T
Q  362 ctatgacgtaattt 375  Q
     |||| ||||||||    
T  49987627 ttatggcgtaattt 49987640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 423
Target Start/End: Original strand, 13262421 - 13262492
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13262421 tgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgta 13262492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41009356 - 41009288
Alignment:
Q  284 aaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41009356 aaactataagagaaac----aattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgata 41009288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 212
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2589061
Alignment:
Q  65 gatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattaggga----------gagagtgggggtagcacctat 154  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||          ||| || ||||||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattagggagggagggagggagggttggggtagtacctat 2589004  T
Q  155 agtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2589005 agt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaactt 2589061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729497
Alignment:
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgat 41729497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 44360078 - 44360155
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  44360078 gagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaact-agattaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13805453 - 13805268
Alignment:
Q  235 tagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagt 332  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||     |||||||| |||   ||| |||    
T  13805453 tagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactataagagaaactatgaag----aaagattttgagagtaataagt 13805358  T
Q  333 tggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||   ||||||| ||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  13805357 tggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgt 13805268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28550575 - 28550458
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||   |||||   |||||||||  ||||||| || | |||||| || |    
T  28550575 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccacttattggg 28550476  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| || ||||||||    
T  28550475 ataaggtttggttgttgt 28550458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 382
Target Start/End: Original strand, 46749729 - 46749786
Alignment:
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcat 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  46749729 caatgagttggattcaaatatgatttatgataaaatattatgacgtaatttgattcat 46749786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589351
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||  | | || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgt 2589351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306575
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |||| ||||||||||| ||| ||||  | | ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgt 5306575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19062010 - 19061938
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  19062010 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgt 19061938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36557349 - 36557246
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||    
T  36557349 gggatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtaga 36557251  T
Q  203 gagaa 207  Q
    |||||    
T  36557250 gagaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 138
Target Start/End: Original strand, 2414626 - 2414721
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagag 138  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||| | | ||||||||  |||||||||||| || || |||| ||||||||||||||    
T  2414626 agaatcaaataagtgcagcggagatggagatgttgtggtggataaacagtaagactagacgggataggatcaggaaagacatcattagggagagag 2414721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21359287 - 21359228
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21359287 tatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgt 21359228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26037882 - 26037835
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgag 70  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26037882 ggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtggagcggagatgag 26037835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621418
Alignment:
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45209283 - 45209208
Alignment:
Q  347 atttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  | |||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45209283 atttatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 45209208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 3979125 - 3979199
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |   ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  3979125 tttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgt 3979199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30634163 - 30634109
Alignment:
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30634163 cgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 30634109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31403391 - 31403276
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattag----ggagagagtgggggtag 147  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||  |||| ||| | ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||     || ||||| |||||||    
T  31403391 taagcgtagcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtag 31403292  T
Q  148 cacctatagtagaaaa 163  Q
    ||||||||||||||||    
T  31403291 cacctatagtagaaaa 31403276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 41192827 - 41192905
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  41192827 gagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagac 41192905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43070135 - 43070012
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||    ||||||| | |||||| ||    
T  43070135 taagtgtagcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacatt----agagagttgaggtagcgcc 43070040  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataag 179  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  43070039 tatagtagaaatgatggtggaaactaag 43070012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46715678 - 46715585
Alignment:
Q  112 ttagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |     ||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  46715678 ttagaaatgacaacattagagagagagag-----agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939737
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgt 49939737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 56224967 - 56225133
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact-taa--cgggataggattagaaatgacaccattagggagagagt 139  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||  |||  |  |||| |||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  56224967 agaatcaagtaagcacagcagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataag--agaaagt 56225064  T
Q  140 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaag 208  Q
     ||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||    
T  56225065 tgggataatacctatagtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaag 56225133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4879165 - 4879112
Alignment:
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  4879165 gtaatttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgt 4879112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6478990 - 6478921
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 170  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6478990 acgggatagaattagaaatgatgacattagagtgagagttggggtggcacctatagtagaaaagatggta 6478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7682100 - 7682032
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7682100 agtagattagatggagggtagtcacatcactagaggcagaggaagacctggaaaaactataagagaaac 7682032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Original strand, 11389602 - 11389737
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacggg--ataggattagaaatg 120  Q
    |||||||||||  |||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||  |||||  |||||||||||||||    
T  11389602 ggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaagcgtagcagagatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaactagacgggatataggattagaaatg 11389701  T
Q  121 acaccatt--agggagagagtgggggtagcacctat 154  Q
    ||| | ||  || ||||||||  |||||||||||||    
T  11389702 acaactttagagcgagagagttagggtagcacctat 11389737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Original strand, 20654868 - 20654917
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20654868 tttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttagttgttgt 20654917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 318 - 423
Target Start/End: Original strand, 31339699 - 31339804
Alignment:
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||| |  |||||||| || ||||||||  |||| | |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||  ||    
T  31339699 tagagattaatgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgctt 31339798  T
Q  418 gttgta 423  Q
    ||||||    
T  31339799 gttgta 31339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238618
Alignment:
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 50238618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238704
Alignment:
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 50238704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427501
Alignment:
Q  118 atgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagaga 206  Q
    |||||| |||||| |||||||   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagaga 1427501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557674
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||  ||    ||| |  || | || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaag----gatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaaca 2557736  T
Q  362 cta-tgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     || ||  |||||||||| ||||||||| |   || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  2557735 ttattggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgt 2557674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7066577 - 7066502
Alignment:
Q  346 gatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || | || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  7066577 gatttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgt 7066502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 251
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611837
Alignment:
Q  155 agtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag 251  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | ||  |||| | |||| ||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctagagattttgtaataaggagagtaaatcagatggaggag 47611837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 422
Target Start/End: Original strand, 55772155 - 55772264
Alignment:
Q  309 gaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||    
T  55772155 gaaaagatttatagattaatgagttggatccaaataaaatttatgatagatcaat----cgtactttgatccatgtagccgacctcacctaatggaataa 55772250  T
Q  409 ggcttagttgttgt 422  Q
     |||| ||||||||    
T  55772251 agcttggttgttgt 55772264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15661934 - 15661875
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15661934 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgt 15661875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25257938 - 25257794
Alignment:
Q  64 agatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 163  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |  ||||||||  ||  ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||| | || ||||    
T  25257938 agatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattag--agagagttgaggtaacacctacaatataaaa 25257841  T
Q  164 gttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    | ||||||||  ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  25257840 gatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 25257794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285913
Alignment:
Q  151 ctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagac 42285913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45185403 - 45185304
Alignment:
Q  37 aacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagag 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || || || ||||||||| |  ||||||||  | | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  45185403 aacacgagaataaagtaagtgtagcggtgataagaatattgtgttggatgtgtagtaagactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagag 45185304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 420
Target Start/End: Original strand, 50862857 - 50862908
Alignment:
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50862857 gtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 50967090 - 50967031
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  50967090 tatgtcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgt 50967031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 410
Target Start/End: Original strand, 56225236 - 56225335
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||| | | | ||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| |||||||    
T  56225236 aaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataagg 56225335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 422
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443374
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||  |||||||||| ||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgt 12443374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 422
Target Start/End: Original strand, 15665326 - 15665380
Alignment:
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15665326 cgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 15665380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20105838 - 20105764
Alignment:
Q  56 tgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattag 130  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||||| | |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20105838 tgtagcggagatgatgatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacgagatatgattagaaatgacaacattag 20105764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209180
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||| |||  ||||||  |||||||||| | |||||| || |||||| ||| ||||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtt 29209180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40420313 - 40420255
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgt 384  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  40420313 aatgagttgaatcctaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatacatgt 40420255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45184296 - 45184258
Alignment:
Q  256 atcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataaga 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45184296 atcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataaga 45184258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8598948 - 8598899
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  8598948 tttgattcatgtagccgatcccacttaatgggataagactttgttgttgt 8598899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16875851 - 16875790
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||||| ||||||||    
T  16875851 aatgtgttggacccaaatatgatttatgatagaacattattatgtaacttgatccatgtagc 16875790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41340657 - 41340616
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41340657 atttagagattaatgagttggatccaaatataatttatgata 41340616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 413
Target Start/End: Original strand, 44360295 - 44360356
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  44360295 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggctt 44360356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Original strand, 52097525 - 52097599
Alignment:
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat-tcatgtagccgatctcactta 399  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  52097525 tcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataga--attatgatgtaattggatatcatgtagccaacctcactta 52097599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 358
Target Start/End: Original strand, 55836391 - 55836440
Alignment:
Q  309 gaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55836391 gaaaagatttatagattaatgagttggatccaaataaaatttatgataga 55836440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 13296658 - 13296718
Alignment:
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtatt 428  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||    
T  13296658 cgtaatttgatgcatgcagccgacctcacttagtgggaaaatgcttggttgttgtattatt 13296718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 422
Target Start/End: Original strand, 17900691 - 17900759
Alignment:
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  17900691 atagagcactatggcgttgtttgattcatttagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgt 17900759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 20131093 - 20131025
Alignment:
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccg 389  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    
T  20131093 aggttaatgagtttaatctaaatatgatttatgatagaacataataagataatttgattcatgtagccg 20131025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 184
Target Start/End: Original strand, 28467248 - 28467324
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttag 184  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||||   | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  28467248 gataggattacaaatgaaaccattaaagagagat--gaggtagcacctatagtagaaaa-atggtggaaaataagcttag 28467324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40018474 - 40018394
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |  |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40018474 gagagaattggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagactt 40018394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40933105 - 40933053
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaa 285  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  40933105 agtagatcagatggagtagtcaaatcaccagaggcagaggaagacctagaaaa 40933053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Original strand, 44860765 - 44860833
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatg 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||  | || ||| |||||||||||    
T  44860765 taagtgtagcagaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagatggaataagattagaaatg 44860833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 45175998 - 45176077
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |  || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45175998 gagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagactt 45176077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 430
Target Start/End: Original strand, 46236708 - 46236776
Alignment:
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtattta 430  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||    
T  46236708 ctatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgtattta 46236776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 51438628 - 51438724
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||| ||| | || |||| ||||||||||| |||||||| || |  |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  51438628 aatgagttggaatgaaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgt 51438724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55805829 - 55805793
Alignment:
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55805829 gaggtagtggaagacctggaaaaactataagagaaac 55805793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 423
Target Start/End: Original strand, 30031138 - 30031536
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  30031138 ggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtc 30031237  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  30031238 accattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccg 30031337  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||    
T  30031338 tcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaac----aattagaaaggatttag 30031433  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30031434 aggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtt 30031533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 28085258 - 28085655
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  28085258 ggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgac 28085357  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |  ||   |    
T  28085358 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaag 28085457  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  28085458 tggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 28085553  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28085554 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 28085653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 608041 - 608440
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||||||| ||||||    
T  608041 ggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcggagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgac 608140  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |     
T  608141 accatta--gagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcct 608238  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacc----tcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagat 316  Q
    |  |||||| ||| ||||| ||||||  |||||| || ||||||||| || |||||||    |   ||||||||  ||||||||    ||||||||||||    
T  608239 ttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaacc----attagaaaagat 608334  T
Q  317 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||| ||    
T  608335 ttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggt 608434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 55 - 402
Target Start/End: Original strand, 32755833 - 32756180
Alignment:
Q  55 gtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga--gagtgggggtagcacct 152  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  ||||  ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32755833 gtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacct 32755932  T
Q  153 atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--ga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||     ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  32755933 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggaga 32756032  T
Q  251 gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgattt 350  Q
    ||||  | ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  32756033 gtcaagttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 32756128  T
Q  351 atgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32756129 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtg 32756180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 385
Target Start/End: Original strand, 5631700 - 5632064
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||| ||||||    
T  5631700 ggcggttaagagccaacgcgagagtaaagtaagtgtagcgaagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgac 5631799  T
Q  123 accattagggaga----gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgat 218  Q
    |||||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  5631800 accattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 5631899  T
Q  219 gtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagat 316  Q
    | | || |||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||  | |||||||| |   ||||| ||  ||||||||    ||||||||||||    
T  5631900 gccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagat 5631995  T
Q  317 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5631996 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 117 - 422
Target Start/End: Original strand, 12890560 - 12890854
Alignment:
Q  117 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||         |  || |    
T  12890560 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------cccatag 12890650  T
Q  217 atgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaag 314  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||| |    
T  12890651 atgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccatta----gaaagg 12890746  T
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35043839 - 35043437
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||  ||||||| |  ||  ||||||||||  ||||||||    
T  35043839 cggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacac 35043740  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||| |||     
T  35043739 cattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgtt 35043640  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||| |||  |||  | |||||| ||||| ||||||||   ||||| || |||||||||||||    |||| |||||||||    
T  35043639 gtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccatta----gaaaggatttagag 35043544  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  35043543 gtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgt 35043444  T
Q  423 agtattt 429  Q
     ||||||    
T  35043443 tgtattt 35043437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5258524 - 5258151
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagag--tgggggta 146  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  5258524 aagtaagtgtagcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggta 5258425  T
Q  147 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  5258424 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatgg 5258325  T
Q  247 ag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaata 344  Q
    ||  ||||||| | ||||||||||||| |||||||   ||||| ||  ||||||    | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5258324 aggagagtcatgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaa----tcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaata 5258229  T
Q  345 tgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || ||| ||||  | ||||||| ||| ||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  5258228 tggtttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgt 5258151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9594078 - 9593713
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg------ggtagcac 150  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||      ||||||||    
T  9594078 gtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcac 9593979  T
Q  151 ctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag-- 248  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||  ||  |||||| ||||||||||||||||      
T  9593978 cattagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggagga 9593879  T
Q  249 gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |    
T  9593878 gagtcaaatc--aagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaac----tattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggt 9593785  T
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||||| ||| |||| || | |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  9593784 ttatgatagaacattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgt 9593713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20428033 - 20427654
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||   || |||||||||||| |||||||||    
T  20428033 ggttaagagccaacacgagagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacacc 20427934  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||   | |||| |||      
T  20427933 attagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttg 20427834  T
Q  226 taagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| |||| |||| || ||  |||||||  | | ||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  20427833 taagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaa-atttagagg 20427739  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||| ||  |||| ||  |||||||||| |  |||||||| |||||    
T  20427738 ttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataa 20427654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 9706661 - 9707055
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||    
T  9706661 ggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacc 9706760  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||  || || | |||      
T  9706761 attagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt------tgtagagagaagacccatagaagccgttg 9706854  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    | |||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||  |||||  ||    |||| || ||| |||||     |||| || ||||||||||    
T  9706855 ttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaacc----gttaggaaggatttagagg 9706950  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  9706951 ttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 9707050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10100254 - 10099990
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||    
T  10100254 ggttaagagccaagacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacacc 10100155  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||      
T  10100154 attag--agagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttg 10100057  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10100056 taagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 10099990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21352128 - 21351840
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||| | |  | ||||    
T  21352128 gagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaa 21352029  T
Q  232 tagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     | |||| || ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  21352028 gaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccaatagagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatg 21351933  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  21351932 agctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccgacctcagttagtgagataagacttcgtcgttgt 21351840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 378
Target Start/End: Original strand, 14030688 - 14031030
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggt-aagacttaacgggataggattagaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||  || |||||||||||| |||||    
T  14030688 ggcggttaaaagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatga 14030787  T
Q  122 caccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtc 221  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||| |    
T  14030788 caccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgcc 14030887  T
Q  222 gtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    ||  |||||| ||||||||| || | |  |||||  || ||||||||||||||||||||           ||||| ||||     |||||||||||||||    
T  14030888 gttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagacc-----------taagaaaaac-----attagaaaagattta 14030971  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||    
T  14030972 gaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgat 14031030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 430
Target Start/End: Original strand, 2689538 - 2689920
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||| || |||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  2689538 ggcggttaacagccaacgcgagaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgac 2689637  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||                || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | | |||| ||    
T  2689638 accat----------------gttgcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccg 2689721  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  2689722 tcataagaagagtagatcagatagagtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaa----aaaagatttag 2689811  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||  || |||||| |||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||  ||||| | || ||||||    
T  2689812 aggtcagcgaattggatgcaaatattgtttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgtt 2689910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 378
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497194
Alignment:
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taagcttagatggtttggacatgtagagagaagac--ttattgatgtcgtcttaagaatagtagat 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  | ||||||   ||||| || ||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagaccgtaaacgctgtcgt---aagaagagaagat 33497059  T
Q  240 cagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 339  Q
    || ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33497060 caaatgaaggagtcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacc----tttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatcc 33497155  T
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  33497156 aaatatgatttatgatataacactatagcgtaatttgat 33497194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28027222 - 28026896
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  | || |||||||||| ||||||  |    
T  28027222 ggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagcatagcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtc 28027123  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
     ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || || | | ||||  ||      
T  28027122 gttagatagagaat-ggggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggctt-ggtggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtag 28027025  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    || ||| |||| |||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||| |||    
T  28027024 tacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaacc----attatgaaagatttacagg 28026929  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    | ||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  28026928 ttaatgatttgtattcaaatatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 5095927 - 5096118
Alignment:
Q  234 gtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgag 331  Q
    |||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    | |||||||||| ||| ||||||    
T  5095927 gtagatcagatggaagagagttagatcagaagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactctta----ggaaagatttagtggttaatgag 5096022  T
Q  332 ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  5096023 ttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgtat 5096118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 422
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679675
Alignment:
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--g 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  250 agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
    |||||  | | |||||||| ||||||          ||||| ||||||||||||||    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |     
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaa----aaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtc 30679602  T
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  30679603 tatgatagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgt 30679675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143768
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattac----aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 34143829  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  34143828 ctatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgt 34143768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156384
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattac----aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 34156445  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  34156444 ctatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgt 34156384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6056167 - 6055806
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||  || ||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |  ||||  |||||  |||||||||    
T  6056167 ggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtagaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacacc 6056068  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt-tggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||   |  ||| ||||| | ||   |||||||  ||||||||||||||| || | ||||| ||     
T  6056067 attag--agagagttggggtaacacctatagtagaaaaaaattataggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgta 6055970  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |   |||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||      ||||||||||||    
T  6055969 gtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatg----aaagatttagag 6055874  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    || |||||||| |||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  6055873 gttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206462
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgaga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  406 taaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  3206478 taagacttggttattgt 3206462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 378
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666046
Alignment:
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattga-tgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || | | ||  |||| | ||||||||||||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  248 g--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 345  Q
    |   ||||  ||||  ||||| |||||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||||     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaa----gaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatat 24666013  T
Q  346 gatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    | ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24666014 ggtttatgatagaacattatgacttaatttgat 24666046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34508
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaag----aaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaaca 34569  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  34568 ttatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 34508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 33083966 - 33084127
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |  |||||||| | |||||||||  | ||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||    
T  33083966 aagtaagcgtagcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagc 33084065  T
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  33084066 acctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934833
Alignment:
Q  314 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  414 agttgttgt 422  Q
     ||||||||    
T  34934841 ggttgttgt 34934833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2065154 - 2065018
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||    
T  2065154 cggttaagagccaacacgagaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacac 2065055  T
Q  125 cattag----ggagagagtgggggtagcacctatagt 157  Q
    ||||||     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2065054 cattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819107
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  416 ttgt 419  Q
    ||||    
T  31819104 ttgt 31819107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 386
Target Start/End: Original strand, 5080960 - 5081083
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||| |    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5080960 aaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattca----aaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgataga 5081055  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
     |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  5081056 acactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 422
Target Start/End: Original strand, 31818526 - 31818810
Alignment:
Q  135 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatag 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||| |||||| | ||||  |||||||||| | |||||   |   |||| | ||    
T  31818526 agagtcggggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaag 31818624  T
Q  235 tagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagt 332  Q
    ||||||| |||||||  ||| | ||||  | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    | |||| ||| ||| | |||||||    
T  31818625 tagatcatatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactatta----ggaaaggtttggagattaatgagt 31818720  T
Q  333 tggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || || |||| ||||||||    
T  31818721 tggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgt 31818810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897736
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||| | |||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||  |||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgt 5897736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 384
Target Start/End: Original strand, 26291680 - 26292018
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattaggga--gagagtg 140  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||| | |||||| ||  ||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||||||     
T  26291680 agaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagtt 26291779  T
Q  141 ggggtag-cacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagat 239  Q
     |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |   |||||  |||||||    
T  26291780 agggtagacacctataatagaaaatatggtagaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagat 26291877  T
Q  240 cagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat 337  Q
    ||||||||||||  |   ||||||||| ||||||||||||    |||||||||  ||||||    | ||||  |||||||||||| |  |||||||| ||    
T  26291878 cagatggaggagagtgtgatcaaaagacgtagaggaagactaaaaaaaactat--gagaaa----ttattatgaaagatttagagattcatgagttgaat 26291971  T
Q  338 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgt 384  Q
      ||||||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||||||    
T  26291972 aaaaatatggtttatgatataacattataacataatttgattcatgt 26292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 174
Target Start/End: Original strand, 5080766 - 5080888
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||| |  ||   ||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  5080766 taagtgtagtggagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacc 5080865  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5080866 tatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Original strand, 33496086 - 33496194
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||    
T  33496086 agaatcaagtaagtgtaacggagatgatgatgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtagg 33496185  T
Q  143 ggtagcacc 151  Q
    |||||||||    
T  33496186 ggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 8364525 - 8364835
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||    | ||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  8364525 ggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattag----acagttggagtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggt 8364620  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    |||| ||||||||             ||||| | ||  || | ||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||    
T  8364621 ttgggcatgtaga-------------gatgtag-ct--aggagagtagatcagatggaggattgtcagatcactagaggaagatgaagacctaaaaaaac 8364704  T
Q  288 tataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||||||||||| |||||     |||||||||||  | ||| |||||||   ||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  8364705 tataagagaaactattaa----gaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 8364800  T
Q  388 cgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| | | ||||||| || |||||||  |||||||    
T  8364801 cgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgt 8364835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10099014 - 10098899
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |    
T  10099014 attaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccacttagtggg 10098917  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| |||  |||||||    
T  10098916 ataagacttgattgttgt 10098899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30789147 - 30789077
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30789147 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgt 30789077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1615298 - 1615221
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  1615298 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgtat 1615221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 304
Target Start/End: Original strand, 7133831 - 7133911
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7133831 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccatta 7133911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 304
Target Start/End: Original strand, 7136754 - 7136834
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7136754 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccatta 7136834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12134001 - 12133905
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| | |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12134001 aatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgt 12133905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14389458 - 14389381
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14389458 gagagagttgaggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaaa-cttaggtggtttggacatgtagagagaagac 14389381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9109584 - 9109512
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||    
T  9109584 tatgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgt 9109512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6641729 - 6641658
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6641729 gggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaa 6641658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 402
Target Start/End: Original strand, 32080633 - 32080728
Alignment:
Q  307 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    ||||||||| || ||| | || |||||||||  || |||||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  32080633 tagaaaagacttggagcttaaggagttggattaaattatgatttatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccacttagtg 32080728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 2079229 - 2079408
Alignment:
Q  37 aacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaa-------gacttaacgggataggat-tagaaatgacaccatt 128  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||       |||| || | |||| ||| |||||||||||  |||    
T  2079229 aacacgagaataaaataagcgtagcggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaactggtaagactaaatgagatatgatatagaaatgacaatatt 2079328  T
Q  129 agggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||| |  ||||||||||||||    
T  2079329 agagagggagttggg-tagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119647
Alignment:
Q  339 caaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga-tctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgtt 12119647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 423
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886384
Alignment:
Q  353 gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgta 21886384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095909
Alignment:
Q  84 atgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 177  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||| || ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaata 5095909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492668
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||  |||||| || |||  ||| |||||   || |||||||| | ||||||||| |    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| || ||||||||    
T  7492651 ataaggattggttgttgt 7492668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10617407 - 10617350
Alignment:
Q  248 ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10617407 ggagtcaaatcactagaggtagaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaa 10617350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 388
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568944
Alignment:
Q  328 tgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagcc 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc 9568944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18130893 - 18130817
Alignment:
Q  346 gatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||    
T  18130893 gatttattatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgt 18130817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870303
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgg 21870303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25494169 - 25494066
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||   | || ||| |||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  25494169 gggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaatattg-tggaaaataagtttaggtggtttggacatgtata 25494071  T
Q  203 gagaa 207  Q
    |||||    
T  25494070 gagaa 25494066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Original strand, 32068617 - 32068685
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32068617 aaatacgatttataatataacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataa 32068685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Original strand, 32097934 - 32098002
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  32097934 aaatatgatttatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgggataa 32098002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 579638 - 579697
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  579638 tatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgt 579697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 390
Target Start/End: Original strand, 2079465 - 2079528
Alignment:
Q  327 atgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||||||    
T  2079465 atgagtttgaccgaaatatgatttatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccga 2079528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33998375 - 33998288
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagt 139  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||  | | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  33998375 taagcgtagcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 408
Target Start/End: Original strand, 586057 - 586115
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  586057 tatgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataa 586115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7513245 - 7513191
Alignment:
Q  155 agtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7513245 agtagaaaaaatggtggaaaacaagcttggatggtttagacatgtagagagaaga 7513191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12134287 - 12134141
Alignment:
Q  37 aacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagag 136  Q
    ||||| ||||| || ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||||   | |  |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  12134287 aacacgagaataaactaagcatagcagagatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagag 12134188  T
Q  137 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagctta 183  Q
    | | | ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  12134187 aattgaggtacgacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctta 12134141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3210607 - 3210546
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||    
T  3210607 aatgagttggatggaaatatgagttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagc 3210546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 3963908 - 3963953
Alignment:
Q  248 ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataag 293  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3963908 ggagtcaaatcaccagaggtagaggaagacctagaaaaactataag 3963953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgt 384  Q
    |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| | || || | ||||||||||| |||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23888557 - 23888481
Alignment:
Q  346 gatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||| || ||||  |||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||||||||||||||||    
T  23888557 gatttattatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgt 23888481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 380 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29354781 - 29354741
Alignment:
Q  380 catgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29354781 catgtagcctatctcacttagtgggataaggcttggttgtt 29354741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Original strand, 33730192 - 33730244
Alignment:
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33730192 taatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 33730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 150)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 1210627 - 1211024
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  1210627 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 1210726  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  1210727 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 1210826  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  1210827 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 1210922  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1210923 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 1211022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30202530 - 30202133
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  30202530 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 30202431  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  30202430 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccg 30202331  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  30202330 tggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 30202235  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30202234 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 30202135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 49347793 - 49347396
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  49347793 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 49347694  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||   | |||| ||    
T  49347693 accattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccg 49347594  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  49347593 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 49347498  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49347497 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 49347398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 22089976 - 22090375
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||  ||||||    
T  22089976 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgac 22090075  T
Q  123 accattagggagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgt 220  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   | ||||     
T  22090076 accattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgc 22090175  T
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattt 318  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||    
T  22090176 cgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggattt 22090271  T
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||    
T  22090272 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttg 22090371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34792748 - 34792352
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||     
T  34792748 ggcggttaagagtcaacacgagaatcaag-aagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaa 34792650  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  34792649 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 34792550  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||     
T  34792549 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttaa 34792454  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||    
T  34792453 aggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgtt 34792354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Original strand, 696154 - 696549
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  696154 ggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacacc 696253  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| |||      
T  696254 attagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttg 696353  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||    
T  696354 taagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttagagg 696449  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcacta-tgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  696450 tcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 696549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Original strand, 8671804 - 8672197
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||    
T  8671804 cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacac 8671903  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||| |||     
T  8671904 cattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtg 8672001  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||    
T  8672002 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagag 8672097  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||| ||||| | | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8672098 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgt 8672197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 9592616 - 9593013
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  9592616 ggcggttaagaatcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 9592715  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  9592716 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 9592815  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  9592816 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaacc----attagaaatgatttag 9592911  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||| |||  |||| || | ||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9592912 aggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgtt 9593011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32231354 - 32231001
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | | |||||| ||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||    
T  32231354 ggcggttaagggtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgac 32231255  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  32231254 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccg 32231155  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  32231154 tcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 32231059  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  32231058 aggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgat 32231001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 15085816 - 15086201
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||  |  |||||||||||| ||||||    
T  15085816 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgac 15085915  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||    
T  15085916 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 15086015  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  | |||| ||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||           ||||| |||||    |||||| | |||||||    
T  15086016 ttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagacc-----------taaga-aaacc----attagataggatttag 15086099  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15086100 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 15086199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43240778 - 43240382
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  |||||| ||    
T  43240778 ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgcc 43240679  T
Q  126 attagggagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||   | ||||| ||    
T  43240678 attagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgt 43240579  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggaggagtcata--tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||||| ||||||||| |||||||||   ||  | |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||| |    
T  43240578 ggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaatgatttata 43240483  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
     ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43240482 tgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttg 43240383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51441165 - 51440768
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  51441165 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtgagtgtagcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 51441066  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||| ||    
T  51441065 accattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccg 51440966  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| |||||| || ||||||  ||||||  | ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||     
T  51440965 tggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttat 51440870  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  51440869 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtt 51440770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38808054 - 38807674
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagag---- 138  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||        
T  38808054 agaattaagtaagcgtggcggatatgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaa 38807956  T
Q  139 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtaga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||||   | |||| |||| |||||| ||||||    
T  38807955 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtaga 38807856  T
Q  239 tcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttgga 336  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38807855 ccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaacgagttgga 38807760  T
Q  337 tccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38807759 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 38807674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Original strand, 51601943 - 51602335
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||| |||||| |||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||    
T  51601943 ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagatatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacc 51602042  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||      
T  51602043 attag--agagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtgg 51602140  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||    |||  ||||||||||    
T  51602141 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccatta----gaagggatttagagg 51602236  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||  ||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  51602237 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 51602335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4001848 - 4001458
Alignment:
Q  28 ttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccat 127  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||| |||||||||||||  | | |||||| |||||||||  ||   |||||||||| |||||||||||    
T  4001848 ttaagagtcaacacgagagtaaagtaagt--agcgaagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccat 4001751  T
Q  128 tagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctta 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||| |||  ||    
T  4001750 tagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgta 4001651  T
Q  228 agaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtc 325  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  4001650 agaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaa----aaaagatttagaggtc 4001555  T
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||| | | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4001554 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 4001458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 8391654 - 8392051
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  8391654 ggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgac 8391753  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||   | |||| ||    
T  8391754 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccg 8391853  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||| ||  ||||||| | ||| |||||| | ||||||||   ||||| ||  ||||||    | ||||||||||||||||    
T  8391854 ttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaa----tcattagaaaagatttag 8391949  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||  || ||| |||||| |||    
T  8391950 aggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtaggaaaagacttagtcgtt 8392049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32083145 - 32082759
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  || || ||||||||| ||||||    
T  32083145 ggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtatgtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgac 32083046  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||   | |||| ||    
T  32083045 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccg 32082946  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||           ||||| |||||    ||||||||||||||||    
T  32082945 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacc-----------taaga-aaacc----attagaaaagatttag 32082862  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac-gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| | | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |    
T  32082861 aggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttt 32082762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Original strand, 4029113 - 4029401
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||| |||  ||||||    
T  4029113 gagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaa 4029212  T
Q  232 tagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     | ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||| |||||||||    
T  4029213 gaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttaaaggtcaatg 4029308  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4029309 agttggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 4029401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9599781 - 9599417
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga 135  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  9599781 caacacaataatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagaga 9599682  T
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagt 235  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| || | ||| ||| |   |||||  |  ||  || |||    
T  9599681 gagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagt 9599582  T
Q  236 agatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 333  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     ||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  9599581 agatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaac----tattaggaaatatttagagtttaatgagtt 9599486  T
Q  334 ggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  9599485 tgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccatgtagctgaccttacttagtg 9599417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847812
Alignment:
Q  72 atgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 171  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  172 aaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtag 269  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | | ||||  ||  || ||| |||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  270 aggaagacc-tcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac 368  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||| | ||   |  | |||||||||||| |||||||| | |  ||||||| |||||||| || || |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggctt 27847812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 390
Target Start/End: Original strand, 9509229 - 9509565
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9509229 taagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacc 9509328  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--g 249  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||   |  |||   |  ||   | ||||||||||||||||  |    
T  9509329 tatagtagaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggag 9509428  T
Q  250 agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     ||||| ||||||||| ||   |||||||| || ||||||||| ||    
T  9509429 agtcatattagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaac----tattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtt 9509524  T
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    |||||| || || |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  9509525 tatgattgaacattatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37463241 - 37462879
Alignment:
Q  53 aagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacct 152  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  37463241 aagtgtagaggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccatta--gagagagttggggtagcacct 37463144  T
Q  153 atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--ga 250  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |   || |||| |||| | | |||| |||  || ||| ||||||||||||||||  ||    
T  37463143 atagtagaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggaga 37463047  T
Q  251 gtcatatc-aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
    |||  ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||     || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||    
T  37463046 gtcggatcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaac----gatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtt 37462952  T
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37462951 tatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 37462879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18469480 - 18469085
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  |||| ||||| |||||||||  ||  |||| |||||| ||||||    
T  18469480 ggcggttaagaaccaacacgagaatcaagtaaacgtagcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgac 18469381  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    || ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||| | |||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |    
T  18469380 acaatta--gagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttg 18469283  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  || ||| |||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  ||  |||| ||| ||| ||    
T  18469282 tagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaac--tt--ttaggaaatattaag 18469187  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || || ||||  |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||    
T  18469186 aggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgtt 18469087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979234
Alignment:
Q  159 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcata 256  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  ||  |||| | ||||||||  |||||||||  |||      
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    | ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 25979300  T
Q  357 gagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25979299 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 25979234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 422
Target Start/End: Original strand, 39318209 - 39318407
Alignment:
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattt 318  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||| |||||    
T  39318209 cgtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccatta----gaaaggattt 39318304  T
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||  |||    
T  39318305 agaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtgggataaggcttgtttg 39318403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 430
Target Start/End: Original strand, 52921200 - 52921367
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  52921200 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgataga 52921295  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtattta 430  Q
     ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  52921296 acactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtattta 52921367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404539
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | |||    |  |||| | ||||||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  242 gatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 339  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaac----tattaggaaagatttagagattaatgagttaaatcc 32404612  T
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    ||| ||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  32404611 aaacatggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 32404539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 422
Target Start/End: Original strand, 39140417 - 39140794
Alignment:
Q  45 aatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaa-------gacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagaga 137  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||       ||||  | | ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  39140417 aatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagaga 39140516  T
Q  138 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtag 237  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  |||| ||  || ||| |||||    
T  39140517 gttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtag 39140616  T
Q  238 atcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttgg 335  Q
    |||||||||| |||  ||| || | ||||||||||||||     | |||||   || ||||||| ||||    | ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  39140617 atcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa-----ctaaaaaagttatgagaaactatta----ggaaaaatttagaggttaattagttgg 39140707  T
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  39140708 atccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 226 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37311952 - 37311758
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  37311952 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccatta----gaaaagatttagagg 37311857  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37311856 tcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 37311758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561592
Alignment:
Q  171 gaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggta 268  Q
    ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||  || ||||| |   || ||| |||||||||||||||||||  | | || | ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  269 gaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac 368  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||| || |||| |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgtta----ggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggc 52561646  T
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52561645 gaaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 52561592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 2544590 - 2544877
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    |  |||| |    
T  2544590 gagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagga 2544689  T
Q  232 tagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     |||||||||||||||||  ||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||         ||||||| ||  ||||||    
T  2544690 gagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat---------aagatttggaaatcaatg 2544779  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | ||||||| |||||||| ||||    
T  2544780 agttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgtat 2544877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Original strand, 43423682 - 43423885
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||    
T  43423682 ggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagag 43423781  T
Q  204 agaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgg--aggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaacca 301  Q
    ||||||||| | |||   ||  |||| | ||||||  ||||||  || ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||    
T  43423782 agaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactagaggtagaggaagacctagaaaaattacaagagagacca 43423881  T
Q  302 ttaa 305  Q
    ||||    
T  43423882 ttaa 43423885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34827500 - 34827179
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||||||  |||||| | || ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  ||| |||||||||||  ||    
T  34827500 cggttaagaaccaacacgaaaaacaaataagtgtaactgagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatg--ac 34827403  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
     |||| | ||||||| |||||||| | ||||| || |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||  || ||||   |     
T  34827402 tattatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaaagatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctcta 34827303  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||| ||||||||  |||| |  | | || |  || |||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  34827302 gtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttagaaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tattagaaaagatttagag 34827207  T
Q  323 g-tcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  34827206 gtttaatcagttgaatccaaatatgatt 34827179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707224
Alignment:
Q  307 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagat 406  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttga-tcatgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  407 aaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgt 4707224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560508
Alignment:
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcac 362  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    | | | |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||     
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactatta----ggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacat 41560448  T
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41560449 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41560508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431402
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatc 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||  |||  | ||| ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  241 agatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt-------caatgag 331  Q
    |||||||||  ||||  || | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||     |||||||||||| |        ||||||    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaa----gaaagatttagagatttatgaataatgag 48431493  T
Q  332 ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||  ||| | ||||||||| | |||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  48431492 ttggatccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgt 48431402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 422
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338992
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | | ||||   |  |||| | |||||||||||    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  244 tggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 341  Q
    |||||||   ||| ||||  ||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||               ||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa---------------gatctagagattaatgagttggatcgaa 5338911  T
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5338912 atgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgt 5338992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200309
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgt 10200309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27520373 - 27520233
Alignment:
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagac--ctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatga 354  Q
    |||||||||||| ||||||||   |  ||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27520373 tcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataagagaaac----tattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatga 27520278  T
Q  355 tagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactta 399  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27520277 tagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacctcactta 27520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020270
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||| | | ||||| ||| ||||||||||     
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  415 gttgttgt 422  Q
    ||||||||    
T  24020277 gttgttgt 24020270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796488
Alignment:
Q  171 gaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggta 268  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| | | | | ||||  |||| | |||| ||| |||||||||  |||| ||||  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  269 gaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac 368  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||     |||||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaag----aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 8796434  T
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8796435 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 8796488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 52532736 - 52532619
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  52532736 attaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtggg 52532637  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  52532636 aaaaggcttggttgttgt 52532619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 408
Target Start/End: Original strand, 6025527 - 6025870
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    |||| ||||||||| || ||||||   || ||||||  || ||||| |||||||||||| | |||||  |||| ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  6025527 gagacgaggatgttttgctggatgtttggcaagactagactggataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaaa 6025626  T
Q  163 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaa 260  Q
     | |||| |||| || |||||||||  |||| |||||| |||||| || ||| |||       |||| | ||||||||||||| |||  ||||| ||||     
T  6025627 cgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatcac 6025726  T
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 360  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    ||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||| | | ||||||| |    
T  6025727 tagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaa----aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaac 6025822  T
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |  ||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6025823 atgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataa 6025870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 422
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129063
Alignment:
Q  275 gacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||     
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaata 29129014  T
Q  375 tgat-tcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29129015 tgatcccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgt 29129063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36624188 - 36624003
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |  |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||     
T  36624188 acgggatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggtttgg-catgtc 36624090  T
Q  201 gagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    |||||||||||  |  |||| |   || ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36624089 gagagaagactggt--atgtag---tatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacctagagaaactat 36624003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 307 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423214
Alignment:
Q  307 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |   ||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  407 aaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||  |||||||| ||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgtat 46423214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 379
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478913
Alignment:
Q  156 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| | ||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||   |    
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaa-aagcttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  256 a--tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatg 353  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||     ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||  |||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaac----tattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatg-gttatg 478887  T
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgatt 379  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||    
T  478888 atagaatactatgacataatttgatt 478913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3819147 - 3818859
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||  ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| | |||    |  |||  |    
T  3819147 gagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaaaga 3819048  T
Q  232 tagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     |||||||||||||||||  | ||| | ||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||| | ||||    
T  3819047 gagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaa----gaaagatttagagattaatg 3818952  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||| || || |||| ||  ||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| || |||||    
T  3818951 agttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgt 3818859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 402
Target Start/End: Original strand, 40416362 - 40416630
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||||| | |||||||||||||||  | | ||| | ||  |||| |    
T  40416362 gagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaagga 40416461  T
Q  232 tagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     ||||||||||||| |||  ||||| ||||  | ||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||     |||||| || || | ||||    
T  40416462 gagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaa----gaaagatctatagattaatg 40416557  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||| | | ||||||| | |||||||||    
T  40416558 agttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtg 40416630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 308 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32079292 - 32079180
Alignment:
Q  308 agaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagata 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  || ||| |||||||  |||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  32079292 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccacttggtgggata 32079195  T
Q  408 aggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||    
T  32079194 aggcttggttgttgt 32079180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 378
Target Start/End: Original strand, 52831957 - 52832280
Alignment:
Q  50 agtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagca 149  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||  ||| |||| |||||   ||||||| ||||||| |    
T  52831957 agtaagcgtatcggagatgaggatg-tgtgttgaatgagtggtaagatttaatgagataggattcaaaaagacatcatta--aagagagttggggtagta 52832053  T
Q  150 cctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag- 248  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| |||||  |||||||||  || ||||| ||  ||   | ||||||| ||||||||     
T  52832054 gctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagagagtagataagatggagg 52832153  T
Q  249 -gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatga 347  Q
     ||||| ||| | || ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||      ||||||||||||||||||||  || ||||| || |||||||      
T  52832154 agagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaa----gtattagaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattg 52832249  T
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    |||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  52832250 tttcagatagaacattatgacgtaatttgat 52832280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 1661421 - 1661499
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1661421 gagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagac 1661499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 420
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084252
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgtt 6084252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715323
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagt 425  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T
Q  426 att 428  Q
    |||    
T  25715325 att 25715323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568413
Alignment:
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40568413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941779
Alignment:
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 44941779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Original strand, 4415511 - 4415596
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||||    
T  4415511 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccga 4415596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16142145 - 16142019
Alignment:
Q  256 atcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    |||| ||||| |||| || || || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  16142145 atcagaagagttagaagatgatctggaaaaactataagagaaaccatta----gaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgat 16142050  T
Q  356 agagcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
     || || |||||||||||||||| |||||||    
T  16142049 cgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090697
Alignment:
Q  333 tggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 28090697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35828868 - 35828763
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  35828868 gataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagaga 35828769  T
Q  205 gaagac 210  Q
    ||||||    
T  35828768 gaagac 35828763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 40419547 - 40419708
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||   ||||| |||  | | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||     
T  40419547 aagtaagtgtagcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtaga 40419646  T
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    || |||||||||| || |||||| || ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40419647 acttatagtagaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 40419708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36340094 - 36339807
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | ||  ||||      
T  36340094 gagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaaggc 36339995  T
Q  232 tagtagatcagatggaggagtc--atatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
      || ||||||||||||||  |  | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     ||||| |||||||| ||  | ||||    
T  36339994 gggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaac----tattaggaaagattt-gaaattaatg 36339900  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||   ||| ||| || |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||| ||   ||||||||| || || |||| ||||||||    
T  36339899 agttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgt 36339807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375601
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
     || ||||||||    
T  43375612 attggttgttgt 43375601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 4379922 - 4380081
Alignment:
Q  58 tagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg--------ggggtagca 149  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |   |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |        |||||||||    
T  4379922 tagctgagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagca 4380021  T
Q  150 cctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
     |||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4380022 actatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 19936404 - 19936571
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||| ||||||    
T  19936404 ggcggttaagaaccaacatgagaatcaaataagcatagcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgac 19936503  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatg 198  Q
    |||        ||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||  |||||||| ||||    
T  19936504 acc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 422
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751763
Alignment:
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 44751763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561872
Alignment:
Q  84 atgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaa 52561872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7762583 - 7762477
Alignment:
Q  275 gacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||    
T  7762583 gacctagaaaaactataagagaaac----tattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatt 7762488  T
Q  375 tgattcatgta 385  Q
    ||||| |||||    
T  7762487 tgatttatgta 7762477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941583
Alignment:
Q  269 gaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac 368  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |     |||||||||||||||||| | | |||||||||||  | |||| ||||||||| | || |||| |    
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagc----tattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggc 11941637  T
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  11941636 gtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgt 11941583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769709
Alignment:
Q  335 gatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgtat 21769709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444635
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||  ||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 34444635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 427
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257854
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgtat 50257854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930314
Alignment:
Q  328 tgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||| | | |||||||  | |||||| || ||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgt 12930314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14226182 - 14226047
Alignment:
Q  68 gaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 167  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||| ||  ||  |||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||    
T  14226182 gaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacatt--ggagagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatg 14226085  T
Q  168 gtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag 205  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14226084 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438799
Alignment:
Q  312 aagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggc 411  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |   |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaaaa---tgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  412 ttagttgttgta 423  Q
    || |||||||||    
T  15438810 ttggttgttgta 15438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908047
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||  |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 19908047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Original strand, 19936622 - 19936707
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||    
T  19936622 attaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccga 19936707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 26016345 - 26016506
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||  || |||||  |||| |||| |   |||||| |||||||| |||||| |    
T  26016345 aagtaagcgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaac 26016444  T
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  26016445 acctatatgagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagac 26016506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Original strand, 28533673 - 28533746
Alignment:
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  28533673 ttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 28533746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Original strand, 5113950 - 5114022
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | || ||||||||    
T  5113950 tatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgt 5114022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 358
Target Start/End: Original strand, 8628148 - 8628245
Alignment:
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||  |||| ||||    
T  8628148 tcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaac----tattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgata 8628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Original strand, 29577459 - 29577531
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29577459 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 29577531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 52739631 - 52739547
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatg-atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagcc 388  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  52739631 attaggaaagatttttaggttaatgagttgaatccaaatataatttatggatagaacattatgacttaatttgattcatgtagcc 52739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 52878478 - 52878333
Alignment:
Q  242 gatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 341  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||| ||    | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52878478 gatggatgagtcaggtcataagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaa----ttattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaa 52878383  T
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgat 391  Q
     || ||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||| |||||    
T  52878382 ctacgatttatgatagaactttatagtgtaatttgattcatgtaaccgat 52878333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 37263325 - 37263491
Alignment:
Q  135 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatag 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||   |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |   |||| | ||    
T  37263325 agagttggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagag 37263424  T
Q  235 tagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    || ||||||||||  || |||| ||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  37263425 taaatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaac 37263491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 51812489 - 51812628
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||| || |||||  || ||||| ||||||||||    
T  51812489 gataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagaga 51812588  T
Q  205 gaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagat 244  Q
    ||| | || | ||| | ||  |||||| ||||||||||||    
T  51812589 gaaaaattgtagattttgtagtaagaaaagtagatcagat 51812628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13828008 - 13827930
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13828008 gagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagac 13827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290034
Alignment:
Q  337 tccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgt 1290034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342887
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||  | | |||| || ||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaat----aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaaca 8342945  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     |||||||   ||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  8342944 ttatgacg---tttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgt 8342887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 305
Target Start/End: Original strand, 10272212 - 10272424
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||    ||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || |  ||||    
T  10272212 ggtaagactagacgggatagaattagagatgacaacattag----agattttgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggt 10272307  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    || | |||||||||||||||| | | ||| ||||   ||| | || ||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||      
T  10272308 tttggcatgtagagagaagacctgtggat-tcgtaggaaggagaggagatcagatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaact 10272406  T
Q  288 tataagagaaaccattaa 305  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10272407 tataagagaaactattaa 10272424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27072608 - 27072491
Alignment:
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    |||||| |||||||||||  | || ||||||||   ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |   |||||||     
T  27072608 aattaggaaagatttagaaattaaagagttggacagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgg 27072509  T
Q  404 gataaggcttagttgttg 421  Q
    || ||||||| |||||||    
T  27072508 gaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511819
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    | | ||| ||||| || ||| | ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaa----ttactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaaca 28511865  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagata 407  Q
     |||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  28511864 ttatggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggata 28511819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36624004 - 36623891
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac-gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||| | ||||  |||| ||||||| ||| |  ||||||||     
T  36624004 attagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaa--tgatccatgtagtcgaccctacttagtgg 36623907  T
Q  404 gataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||||| |||||    
T  36623906 gataaggctttgttgt 36623891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4590630 - 4590535
Alignment:
Q  327 atgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||  | ||||||| | ||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  4590630 atgagttggatagatatatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgt 4590535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 174
Target Start/End: Original strand, 16943097 - 16943208
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    |||||||| || || ||||||||| | | |||||||  ||| ||||  |||||| || |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16943097 gagatgagaatattgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagtacctatagtagaaa 16943196  T
Q  163 agttggtagaaa 174  Q
    || |||| ||||    
T  16943197 agatggtggaaa 16943208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 206
Target Start/End: Original strand, 17815402 - 17815537
Alignment:
Q  68 gaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 167  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||   | ||||| || |||| | |||||| ||    
T  17815402 gaggatgttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagagat--gaggtaggacttataatggaaaagatg 17815498  T
Q  168 gtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagaga 206  Q
    || |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17815499 gtggaaactaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37430482 - 37430423
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37430482 tatggcgtagtttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgt 37430423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3777325 - 3777263
Alignment:
Q  360 cactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  3777325 cactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgt 3777263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827784
Alignment:
Q  139 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| || | | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaaga 13827784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113455
Alignment:
Q  343 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    |||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataag 26113455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577147
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||     |||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaa----gaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatg-gttatgatagaaca 29577207  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
     |||| | ||||||  ||||||||||| | | ||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  29577206 ttatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtgcttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 46226669 - 46226607
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  46226669 caacacgagaatcaagtaagtttagcggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtgagact 46226607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 3192088 - 3192133
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatg 68  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3192088 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3192133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 3200906 - 3200951
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatg 68  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3200906 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 3209743 - 3209788
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatg 68  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3209743 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3209788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908396
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||| |||||       
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagaga---cattg-ttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatc 19908448  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
     |||  |||| |||||| |||||| | || | ||||||||| ||||||||||    
T  19908447 ttattgcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataaggctt 19908396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Original strand, 27703958 - 27704079
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacct-atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatgg 188  Q
    |||||||||| | | |||| |||||||||||||    ||||  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||  |||    
T  27703958 ggtaagacttgatgagataagattagaaatgaccatgttagaaagagagatggggtaacaccttatagtagaaaagatggtggaaaacatgcttatgtgg 27704057  T
Q  189 tttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27704058 tttggacatgtagagaaaagac 27704079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34074421 - 34074353
Alignment:
Q  155 agtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  34074421 agtagaaaaatttgtagaaaataat-ttagatggtttggatatgtagagagaagacctctagatgtcgtc 34074353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43481854 - 43481801
Alignment:
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43481854 gtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 43481801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44905473 - 44905404
Alignment:
Q  308 agaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttga 377  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  44905473 agaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagcc 388  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||  | ||||  |||||||||| |||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331221
Alignment:
Q  275 gacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatt 374  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||     |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactattt----gaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatt 11331255  T
Q  375 tgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |||| |||  || |||||||| ||| | ||||||    
T  11331254 tgatccataaagtcgatctcatttactcagataa 11331221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489242
Alignment:
Q  275 gacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatt 374  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||     |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactattt----gaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatt 11489276  T
Q  375 tgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |||| |||  || |||||||| ||| | ||||||    
T  11489275 tgatccataaagtcgatctcatttactcagataa 11489242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16142264 - 16142172
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga 135  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  16142264 agaatcaaataagcatagtggaaatgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31434369 - 31434317
Alignment:
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31434369 taatttaattcatgtagccgacttcacttagtgagataaagcttggttgttgt 31434317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776942
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgat 39776942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Original strand, 39894784 - 39894930
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    ||| |||||||| ||||||  |||||||||| | ||||| ||  || ||| |||| || |    
T  39894784 gggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatagatctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaatta 39894882  T
Q  242 gatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  39894883 gatgga-gagtccgatcaaaagatgtagaggaaaacctagaaaaactat 39894930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Original strand, 42501200 - 42501267
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaa 298  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42501200 agtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagaggaaaacctagaaaaactataagagaaa 42501267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 50806850 - 50806946
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||| |||| | || ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  50806850 aatgcgttggataaaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgt 50806946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  313 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    |||||||||| | |||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19908350 - 19908255
Alignment:
Q  112 ttagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||  ||||  ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  19908350 ttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatttgggcatgtagagagaa 19908255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 418
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175420
Alignment:
Q  339 caaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 22175420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  167 ggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 402
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869141
Alignment:
Q  117 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattg 216  Q
    ||||||| |||||  ||||| || || |||||||||||  |||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  | |    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  217 atgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaag 314  Q
    ||    |    || | ||||||| |||||||||  ||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    | ||||  ||||    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaa----ttattaagaaag 38869053  T
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    || ||| | | |||| |||||||  | ||||| | ||||||||| || |||| |||  |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  38869054 atctagcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtg 38869141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45510932 - 45510845
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  45510932 aatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagctt 45510845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 50771746 - 50771672
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  50771746 agtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagcgaaactattaa 50771672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 305
Target Start/End: Original strand, 51584867 - 51584910
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51584867 agaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa 51584910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52442875 - 52442780
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtag 147  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||  |||| |||||||||||| | |||| | |||||||| |||||||    
T  52442875 taagcgtagcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagttggggtag 52442780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203223
Alignment:
Q  265 ggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttgga 336  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaa----aaaagatctagagattaatgagttgga 8203223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16822289 - 16822235
Alignment:
Q  156 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||| ||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16822289 gtagacaagatggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 16822235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23791935 - 23791857
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||  ||||||| ||| || ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23791935 gagagagatggggtaggacccatggtagaaaagatggtagatactaaacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 23791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30834167 - 30834094
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  30834167 agtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaaaagctataagagaaactatta 30834094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 353 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877349
Alignment:
Q  353 gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgt 38877349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48861476 - 48861391
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttat--gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  48861476 aatgagttggatagaaatatggtatatttgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataag 48861391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Original strand, 51584953 - 51585023
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  51584953 tgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgt 51585023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52739813 - 52739767
Alignment:
Q  147 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgg 193  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52739813 gcacctatagtagaaaaaatggtagaagataagcttaggtggtttgg 52739767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8343140 - 8343071
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  8343140 ggggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagac 8343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808122
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39422359 - 39422256
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||  ||||| || || |||||||||||||    
T  39422359 gatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggagtaacacatatagtagaaaagatagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagaga 39422262  T
Q  205 gaagac 210  Q
    ||||||    
T  39422261 gaagac 39422256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40228176 - 40228123
Alignment:
Q  251 gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  40228176 gtcagatcaaaagaggcagacgaagacctagaaaaactataagtgaaactatta 40228123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 43898321 - 43898389
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43898321 agtagatcagatggaggggagtcaaatcaccaaaggtagggaaagacctggaaaaactataagagaaac 43898389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52442718 - 52442650
Alignment:
Q  233 agtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  52442718 agtagatcagatggaagggagtcaaatctctagaggtagaggaagacctagaacaaatataagagaaac 52442650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 380 - 420
Target Start/End: Original strand, 7206124 - 7206164
Alignment:
Q  380 catgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7206124 catgtagccgatcctacttaatgagataaggcttagttgtt 7206164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19969693 - 19969621
Alignment:
Q  91 gtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 163  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  19969693 gtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattagagaaagagttggggtagcgccaatattagaaaa 19969621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 418
Target Start/End: Original strand, 26299287 - 26299343
Alignment:
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  26299287 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttg 26299343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32112064 - 32111992
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  32112064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgt 32111992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 358
Target Start/End: Original strand, 41611969 - 41612021
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  41611969 ttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaatatggtttatcataga 41612021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 52138682 - 52139079
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  52138682 ggcggttaagagtcaagatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 52138781  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||    
T  52138782 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccg 52138881  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| | ||||| | ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  52138882 tggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 52138977  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52138978 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 52139077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 413
Target Start/End: Original strand, 28245319 - 28245707
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||   | |||||||||||| ||||||    
T  28245319 ggcggttaaaagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgac 28245418  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| ||    
T  28245419 atcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccg 28245518  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| |||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||     |||||||| |||||||    
T  28245519 tggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaac----gattagaaatgatttag 28245614  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28245615 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggctt 28245707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 5168710 - 5169111
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  5168710 ggcggttaagagccaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgac 5168809  T
Q  123 accattagggaga----gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgat 218  Q
    |||||||| ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||    
T  5168810 accattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagat 5168909  T
Q  219 gtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagat 316  Q
    | |||  | |||| ||||||||| ||||||  |||||   | |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||    |||||||| |||    
T  5168910 gccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaacc----attagaaaggat 5169005  T
Q  317 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagt 416  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  5169006 ttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 5169105  T
Q  417 tgttgt 422  Q
    ||||||    
T  5169106 tgttgt 5169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 409
Target Start/End: Original strand, 54278906 - 54279286
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||  ||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  54278906 gttaagagtcaacataagaatcaggtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacacca 54279005  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||   | |||| |||  |    
T  54279006 ttagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggt 54279105  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    || || ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||    
T  54279106 aaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggt 54279201  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  54279202 caatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataag 54279286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51448109 - 51447720
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  51448109 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 51448010  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    | |||| ||    
T  51448009 accattagagagagagt-agggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccg 51447911  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||       |||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  51447910 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 51447822  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||||    
T  51447821 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgtt 51447722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47233974 - 47233593
Alignment:
Q  45 aatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggggg 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  47233974 aatctagtaagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggagg 47233875  T
Q  145 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||  | |||| ||||||||| ||    
T  47233874 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaat 47233775  T
Q  245 ggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa 342  Q
    ||||  ||||||  | |||||| || || ||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  47233774 ggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaa 47233679  T
Q  343 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtatt 428  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  47233678 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 47233593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 21992 - 22351
Alignment:
Q  60 gcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtag 159  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21992 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag 22091  T
Q  160 aaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatat 257  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||  |||||| ||||||| | ||||||  |||||   |    
T  22092 aaaagttggtag-aaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggt 22190  T
Q  258 caaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag 357  Q
     ||||||||||||||||||| |   ||||| || |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22191 taaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 22286  T
Q  358 agcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||||||| ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22287 aacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgt 22351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 54128280 - 54128658
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||    
T  54128280 agaatcaagtaagcttagcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttgg 54128379  T
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcag 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| | | ||||  |   || | | ||||||||||    
T  54128380 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcag 54128479  T
Q  243 atggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaacta-taagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 339  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54128480 atggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaac----tataaggaaagatttagaggtcaatgagttggaccc 54128575  T
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  54128576 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 54128658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 422
Target Start/End: Original strand, 53519469 - 53519859
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgaca 123  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||  || |||||||||||  |||||||    
T  53519469 gcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgaca 53519568  T
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagcacctata------gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattga 217  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||    | ||    
T  53519569 ccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtaga 53519668  T
Q  218 tgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaaga 315  Q
    || |||  |||||| ||||||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    ||||||    
T  53519669 tgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacct-----------aaga-aaaccattaa----aaaaga 53519752  T
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  53519753 tttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg 53519852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 422
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033425
Alignment:
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| | |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||||| |||| |||| |||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttaga 35033324  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  35033325 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttg 35033424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 174 - 422
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508514
Alignment:
Q  174 aataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagag 271  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  272 gaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgta 371  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgta 48508463  T
Q  372 atttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48508464 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 48508514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 422
Target Start/End: Original strand, 25191265 - 25191656
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  |||| |||||  ||||||| ||    
T  25191265 gttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatca 25191364  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||  |    
T  25191365 ttag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgt 25191462  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| || |||||| ||||||  ||| |   | |||||||||||||||||| ||   ||||  ||  ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  25191463 aagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaacc----attagaaaagatttagaggt 25191558  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  25191559 caatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgt 25191656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 346
Target Start/End: Original strand, 3186651 - 3186971
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  3186651 ggcgattaagagtcaacacgagaatcaagtaaatgtagcgtagatgagaatcttatgttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgac 3186750  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||     
T  3186751 accattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtca 3186849  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||   |||||  ||||||||||| ||| || ||||   |||||||||||| |||    | ||||||||  |||||     
T  3186850 ttgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaa----tcattagaaagaatttaa 3186945  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3186946 aggtcaatgagttagatccaaatatg 3186971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 26490199 - 26490594
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||| |||||| ||||||    
T  26490199 ggcggttaagaaccaacaagagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgac 26490298  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
      |||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||   | ||||| |    
T  26490299 gtcatta--gacagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttg 26490396  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| || ||||||  | ||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||    
T  26490397 tagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagatgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaac----tattagaaaagatttag 26490492  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||   |||||||| ||||||||| ||||||   |||||  | |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||||    
T  26490493 agactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattatggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgtt 26490592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33272424 - 33272122
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||    
T  33272424 gttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacacca 33272325  T
Q  127 tt--agggagagagtgggggtagcacc----tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgt 220  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||     
T  33272324 ttagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac-tgtagatgc 33272226  T
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattt 318  Q
    |||  ||||||  ||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| |||||    
T  33272225 cgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaacc----attagaaatgattt 33272130  T
Q  319 agaggtca 326  Q
    ||||||||    
T  33272129 agaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  148 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa-gacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||     ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  247 aggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaata 344  Q
    |||||  ||   |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||   ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttat--aaaggtcaatgagttggatccaaata 48953500  T
Q  345 tgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48953499 tgatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 27917474 - 27917785
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||| |||  |||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||    
T  27917474 agaatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattag--agaaagttgg 27917571  T
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcag 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||  || | |||||||     
T  27917572 ggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaa 27917671  T
Q  243 atggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    |||||||  | ||| |||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||    || ||||||||||||  |||| |||   ||||||| |    
T  27917672 atggaggacaatcagatcataataggtagacgaagacctataaaaactataagagagac----aactagaaaagattttaaggttaattcattggatcta 27917767  T
Q  341 aatatgatttatgataga 358  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  27917768 aatatggtttacgataga 27917785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45289425 - 45289094
Alignment:
Q  92 taagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg--ggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaataagcttagatg 187  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||    
T  45289425 taagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtg 45289327  T
Q  188 gtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaa 285  Q
    |||||| || |||||||||| |||| | ||| | ||  |||||| |||||||||||||||||  ||| | || | ||||| |||||||||| ||   |||    
T  45289326 gtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaa 45289227  T
Q  286 actataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    ||||||||||||||     ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||| |||||     
T  45289226 actataagagaaac----tattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtc 45289131  T
Q  386 gccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45289130 gccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 45289094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Original strand, 45728027 - 45728315
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtc-aacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatga 121  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||   |||  ||||||||||||||||    
T  45728027 ggcggttaagagcccaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatga 45728126  T
Q  122 caccatt-agggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag-aagacttattgatg 219  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||||||| || ||  || ||||    
T  45728127 catcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatg 45728226  T
Q  220 tcgtcttaagaatag--tagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
    ||||  |||||| ||  || |||| ||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  45728227 tcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta 45728315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 50960922 - 50960641
Alignment:
Q  134 gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaata 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    || ||   ||||| |    
T  50960922 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctat----gttgtagaaagaaga 50960827  T
Q  234 gtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgag 331  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||     ||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  50960826 gtagatcagatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaac----tattaggaaaggtttagagattaatgag 50960731  T
Q  332 ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50960730 ttggatccaaatatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 50960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676086
Alignment:
Q  66 atgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg----------ggggtagcacctata 155  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||  | |||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |          |||||||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  156 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tc 253  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||| |||| | | |||||||||||||||| | | ||||  ||  ||  || || ||||||||| ||||||  ||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  254 atatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatg 353  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaac----tattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatg 19676153  T
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19676152 atagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 19676086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43695151 - 43694774
Alignment:
Q  37 aacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact-----taacgggataggattagaaatgacaccattagg 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||      | ||  ||||||||||| |||||||      |     
T  43695151 aacacgagaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgaca------ga 43695058  T
Q  132 gagagagtggggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaaga 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  43695057 gagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaaga 43694958  T
Q  231 atagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    | | ||||||| ||| |||    |  | |||||||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||     
T  43694957 agattagatcaaatgaagg----aagttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaa----aaaagatttagaggtcaatgg 43694866  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||| |||   | ||||||||||| || || ||||| |||||||  |||||| ||| | || |||||| ||||| |||  ||||||||    
T  43694865 attggatctaaactaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgt 43694774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 422
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850400
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    | || |||||| |||||| ||||||||  |    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  244 tggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaag-atttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    ||||||||  |||  | | ||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||    |||||| || |||| |||||||| ||| || ||    
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccatta----gaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattca 38850318  T
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  38850319 aatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgt 38850400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49503957 - 49503691
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctg-----ttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaat 119  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |     ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| | |||    
T  49503957 cggttaagaatcaacatgaaaatcaagtaagtgtagcggagataaggatgttgcgttggattggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaat 49503858  T
Q  120 gacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||    
T  49503857 gacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatg 49503758  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaa 284  Q
    | ||  ||  || |||||||||||||||  ||||||  || | |||| |||||||||||||| ||||    
T  49503757 ttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagacctagaaa 49503691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39601014 - 39600728
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  39601014 ggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggt 39600915  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    || | |||||| ||||||||| | | |||   ||    || | |||||||||||| ||||  ||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39600914 tttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaac 39600815  T
Q  288 tataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    |||||||||||| |||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||  ||||||||||    
T  39600814 tataagagaaactattaa----gaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgat 39600728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737147
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagt-gggggtagcacctatagtagaa 161  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  162 aagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatca 259  Q
    ||| |||||||||||| | |||| |||||||  |||| ||||||||||| | | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||    
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatca 19737117  T
Q  260 aaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19737118 aaa-aggttgaggaagacctagaaaaactat 19737147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 358
Target Start/End: Original strand, 38430803 - 38431063
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattaggg-----agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggac 195  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |     |||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||| |    
T  38430803 acgggataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggc 38430902  T
Q  196 atgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataag 293  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||| ||  || ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  38430903 atgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaag 38431002  T
Q  294 agaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||| |||   | |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38431003 agaaactatt--gtgg--aaggtttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgataga 38431063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 290
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758050
Alignment:
Q  71 gatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagt-gggggtagcacctatagtagaaaagttggt 169  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  170 agaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggt 267  Q
    |||||||| | |||| |||||||  |||| ||||||||||| | | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggt 19758027  T
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  19758028 agaggaagacctagaaaaactat 19758050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12096867 - 12096708
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  12096867 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 12096772  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12096771 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12096708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42510301 - 42510019
Alignment:
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagt 235  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||| | ||  |||| | |||    
T  42510301 gagttgggatagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagt 42510204  T
Q  236 agatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 333  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    | |||||||| ||  | ||||||||    
T  42510203 agatcagatggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccatta----ggaaagatttggaaataaatgagtt 42510108  T
Q  334 ggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| | ||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || ||||||| | ||||||    
T  42510107 ggaccaaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgt 42510019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 38060422 - 38060541
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||    
T  38060422 gagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaagaa 38060521  T
Q  232 tagtagatcagatggaggag 251  Q
     ||||||| | |||||||||    
T  38060522 gagtagattaaatggaggag 38060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 390
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  157 tagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtca 254  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||  || ||| |||||||||||||||||  |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  255 tatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatga 354  Q
     |||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||     ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaac----tattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacga 39235349  T
Q  355 tagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    |||| || |||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  39235350 tagaacattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 345110 - 344928
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgaca 123  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||||  ||| |||||||||||||||||      
T  345110 gcggttaagaaccaacacaagaataaagtaagcatagcggaaattaggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatg 345011  T
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagaga 206  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||    
T  345010 acattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48734477 - 48734150
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    |||||||||| ||||| |||   ||||||| |||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||     
T  48734477 gttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattag--agagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaatag 48734380  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||  | | || |  ||  || ||| ||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||     
T  48734379 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaagg 48734280  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttg 376  Q
    ||| ||||||||                |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||| |||    
T  48734279 ccttgaaaaact----------------attagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttg 48734196  T
Q  377 attcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  48734195 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgt 48734150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 49042098 - 49042216
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgattt-atgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  49042098 attaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtga 49042197  T
Q  404 gataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  49042198 gataaggcttggttgttgt 49042216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 52156204 - 52156087
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  52156204 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccgaccccacttagtggg 52156105  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  52156104 ataaggctcggttgttgt 52156087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 53262303 - 53262420
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |    
T  53262303 attagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtggg 53262402  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  53262403 ataaggcttggttgttgt 53262420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54425292 - 54425015
Alignment:
Q  102 cgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtag 201  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||    
T  54425292 cgggataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtag 54425194  T
Q  202 agagaagacttattgatgtcgtcttaagaat-------agtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataa 292  Q
     |||||||| |   |||| |||  |||| |        |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  54425193 ggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataa 54425094  T
Q  293 gagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaattt 375  Q
    |||  ||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54425093 gagggaccattaa----aaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataattt 54425015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294180
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacat---gtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatc 240  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||   ||||||||||||||| | |||| |  | |||||| |||| ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  241 agatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatc 338  Q
    ||||  |||||  ||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaa----aaaagatttataggtcaatgagttggatc 30294208  T
Q  339 caaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
     || |||||||||||||| | |||||||    
T  30294207 taagtatgatttatgataaaacactatg 30294180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 52679246 - 52678853
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |  || | |||||| |||||||   |||||| |||||||| |||  | | ||||  |||| |||||||||    
T  52679246 cggttaagagtcaacacaagaatcaaataggcataacagagatggggatgttgcattggatcagcggtaaaactatatgagataatattaaaaatgacac 52679147  T
Q  125 cattagg--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||   ||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||| | |||||      
T  52679146 cattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagatgt-- 52679049  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| | |||||| |||||||  |||||   | |||||| ||||| |||||||| | |||||  ||||||||||     ||||  ||||||||||    
T  52679048 tggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaac----tattatgaaagatttag 52678955  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |  | |||  ||||||||||| |||| || | | |||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  52678954 aggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatgcagtcaacctcatttagtaagataaaacttagttgtt 52678855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 282 - 422
Target Start/End: Original strand, 38060857 - 38060993
Alignment:
Q  282 aaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattca 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||    
T  38060857 aaaaactattagagaaaccatta----gaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatcca 38060952  T
Q  382 tgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  38060953 tgtagccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgt 38060993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 54365290 - 54364973
Alignment:
Q  107 taggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagaga 206  Q
    ||||||||||||||| |  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54365290 taggattagaaatgaaaatattag--agagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaata-gcttaggtggtttgggcatgtagagaga 54365194  T
Q  207 --agacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccat 302  Q
      | || | | |||    |  |||| | ||||||||| ||| ||||  |||| | ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  54365193 gaatacctgtagattctattataaggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 54365094  T
Q  303 taattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    ||    | ||||| || ||| | |||| ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||    
T  54365093 ta----ggaaagacttggagattaatgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacac-tagtg 54364999  T
Q  403 agataaggcttagttgttgtagtatt 428  Q
     |||||||||| | |||||| |||||    
T  54364998 ggataaggcttggctgttgttgtatt 54364973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311312
Alignment:
Q  312 aagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggc 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  412 ttagttgttgt 422  Q
    || ||||||||    
T  311322 ttggttgttgt 311312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 15296069 - 15296186
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |    
T  15296069 attaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtggg 15296168  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15296169 ataaggcttggttgttgt 15296186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23534887 - 23534576
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata--agcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  23534887 gataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaaagatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtaga 23534789  T
Q  203 gagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaacc 300  Q
    ||  ||||   | | |   ||  |||| | ||||||||||||||| ||  || | ||||  |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||     
T  23534788 ga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatcactagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaac- 23534692  T
Q  301 attaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttag 400  Q
        ||||| ||||| |||||| | |||||||||||    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |    
T  23534691 ---tattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttg 23534595  T
Q  401 tgagataaggcttagttgtt 420  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  23534594 tg-gataaggcttggttgtt 23534576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555335
Alignment:
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  421 gt 422  Q
    ||    
T  47555336 gt 47555335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133615
Alignment:
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| |||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  418 gttgt 422  Q
    |||||    
T  2133619 gttgt 2133615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36820303 - 36820174
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||     
T  36820303 gttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattag--agagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaactag 36820206  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  36820205 gcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Original strand, 38849976 - 38850091
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||  ||  |||| |||||| ||||||    
T  38849976 ggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgac 38850075  T
Q  123 accattagggagagag 138  Q
    | ||| || |||||||    
T  38850076 atcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Original strand, 3987007 - 3987117
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||    
T  3987007 acgggatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgta 3987106  T
Q  201 gagagaagact 211  Q
    |||||||||||    
T  3987107 gagagaagact 3987117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162666
Alignment:
Q  166 tggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaag 263  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||| |||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||  |||||||    
T  19162842 tggtagaaaa-aagcttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  264 aggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
    || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||     ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaac----tattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaagtatg 19162666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106617
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagt 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||  || | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T
Q  426 att 428  Q
    |||    
T  40106619 att 40106617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 423
Target Start/End: Original strand, 49841522 - 49841896
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagag---tgggg----- 143  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  ||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||   |||||         
T  49841522 taagtgtagcatagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagcc 49841621  T
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct-taagaatagtagatcag 242  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||  || || |||||||| | ||||||||||||||  |||||  || |   |||| | |||| |||||    
T  49841622 gtagcacctatattagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac--attgacttctttagtaaggagagtaaatcag 49841719  T
Q  243 atggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    ||| |||  ||||| || |  |||||||||||||||||   |||||  ||||||||||| |||||     |||||| || || | ||||||||||||| |    
T  49841720 atgaagggtagtcaaattactagaggtagaggaagaccagaaaaaa--ataagagaaactattaac----aaagatctaaagattaatgagttggatcga 49841813  T
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    |||||| | ||||||||| || |||| | ||||||||| |||||||| || | ||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  49841814 aatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacatagcgaggtaaggcttggttgttgta 49841896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116350
Alignment:
Q  313 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  413 t 413  Q
    |    
T  40116350 t 40116350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601171
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||| ||    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||| ||||    
T  29601160 cttggttcttgt 29601171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 418
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893364
Alignment:
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcac 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    ||| ||  ||||| | |||||||||||   | | ||||||| ||| ||| |||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaa----aaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacac 27893308  T
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    |||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  27893309 tatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttg 27893364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022683
Alignment:
Q  273 aagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaa 372  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  | ||||  || |    
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaa----aaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtca 17022725  T
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  17022724 tttaattcatgtagccgacctcatttagtgggataaggctta 17022683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454228
Alignment:
Q  111 attagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||  |||||||||||||||     
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgttggt-tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgg-tggtttgtgcatgtagagagaagaa 31454440  T
Q  211 ttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagag--gtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaat 306  Q
     |   |||   ||  | || | |||||||||||||||||  ||||| |||   ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31454439 atgcggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaat 31454340  T
Q  307 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagat 406  Q
    |||    ||| ||||  | ||||| |||||   | | ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  31454339 tag----gatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggat 31454244  T
Q  407 aaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31454243 aaggcttggttgttgt 31454228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208887
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  || | || |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgt 39208887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31261206 - 31261064
Alignment:
Q  158 agaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg-agtcata 256  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||  | | ||| | ||  |||    ||||||||||||||||| ||||| |    
T  31261206 agaaaagatgatagaaactcagcttagatggtttgggcatgttgagagaagatatgtagattttgtagtaatgtgagtagatcagatggaggtagtcaaa 31261107  T
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31261106 tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 31261064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 279
Target Start/End: Original strand, 50249298 - 50249527
Alignment:
Q  58 tagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggat---tagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctat 154  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||   ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  50249298 tagcggagatgatgatgtttcgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtat 50249397  T
Q  155 agtagaaaagttggtagaaaataagctta---gatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg-- 249  Q
    |||||||||| |||| |||| ||  ||||   | |||||||| ||||||||| |||||| | | |||    |  |||| | |||||||||||||| ||      
T  50249398 agtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggat 50249497  T
Q  250 agtcatatcaaaagaggtagaggaagacct 279  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50249498 agtcatatcaccagaggtagaggaagacct 50249527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422893
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaattt 375  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataattt 54422893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagctt-agatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  204 agaaga 209  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797820
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgtat 30797820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 422
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170684
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||  ||||||| | ||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 427
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304250
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| | || || ||||    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  411 cttagttgttgtagtat 427  Q
    ||  |||||||| ||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgtat 36304250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991710
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgt 40991710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 45236750 - 45236850
Alignment:
Q  35 tcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggag 134  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45236750 tcaacacgagaataaagtaagcctagccgagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagag 45236849  T
Q  135 a 135  Q
    |    
T  45236850 a 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 423
Target Start/End: Original strand, 41529978 - 41530041
Alignment:
Q  360 cactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41529978 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgta 41530041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 49503682 - 49503571
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||  |||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  49503682 aaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagg 49503583  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  49503582 cttggttgttgt 49503571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895883
Alignment:
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgt 7895883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 202
Target Start/End: Original strand, 29817507 - 29817565
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  29817507 gtagcacctatagtagaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 305 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 48712195 - 48712073
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| | |||| || |||||||  |||| ||||||||| |    
T  48712195 attaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtggg 48712096  T
Q  405 ataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    |||| |||| |||||||| ||||    
T  48712095 ataatgcttggttgttgttgtat 48712073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48953795 - 48953694
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  | | ||||||||||  ||||||    
T  48953795 ggcgtttaagatccaacacaagaaacaagtaagtgt-gcggagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgac 48953697  T
Q  123 acc 125  Q
    |||    
T  48953696 acc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 388337 - 388268
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  388337 tatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgt 388268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6780755 - 6780678
Alignment:
Q  333 tggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  6780755 tggatccaaatatgatttcagatagaacgttatgacgtaatttgatccctgtagccgaccacacttagtgagaaaagg 6780678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 427
Target Start/End: Original strand, 7278663 - 7278748
Alignment:
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  7278663 atatgatatattatagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgtat 7278748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415258
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagt 425  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T
Q  426 at 427  Q
    ||    
T  14415259 at 14415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541344
Alignment:
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggctt 24541344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31337884 - 31337757
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | | |||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31337884 gagataaggatcttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggatta-aaatgacagcattagagagaaagttggg-tagcacctatagtagaaa 31337787  T
Q  163 agttggtagaaaataagcttagatggtttg 192  Q
    || |||| |||| || |||||  |||||||    
T  31337786 agatggttgaaactaggcttaagtggtttg 31337757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566158
Alignment:
Q  343 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtatt 428  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 31566158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 305
Target Start/End: Original strand, 11581435 - 11581610
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |  ||   ||  ||||||    
T  11581435 gagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaagaa 11581534  T
Q  232 tagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
     |||| |||||||| ||  |||||| ||||  |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11581535 gagtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactattaa 11581610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 413
Target Start/End: Original strand, 19758049 - 19758156
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |    
T  19758049 attaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtggg 19758147  T
Q  405 ataaggctt 413  Q
    |||||||||    
T  19758148 ataaggctt 19758156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 96
Target Start/End: Original strand, 30345434 - 30345478
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaaga 96  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30345434 taagtatagcggagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaaga 30345478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927852
Alignment:
Q  337 tccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    |||||||||| |||| || ||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 52927852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2341075 - 2340928
Alignment:
Q  62 ggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaa 161  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||  ||  ||||| ||||||||||| | |||||| ||| | || |||||||||||  | ||||||    
T  2341075 ggagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaa 2340976  T
Q  162 aagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||| |||| |||||| | ||||  |||||||  |||||||||| ||||    
T  2340975 aagatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaaga 2340928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 331 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4472481 - 4472390
Alignment:
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||   ||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  4472481 gttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagttcgataaagcttggttgttgt 4472390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33755532 - 33755348
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||     ||||| ||| | |||||| | |||||    
T  33755532 agtagatcagatggaggatggtcggatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaaaacttagagattaatga 33755437  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    |||||| | | ||||| ||  |||  || || ||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  33755436 gttggaccaagatatggtt--tgagtgaacattatgacgtaatttgatcgatgtagccaaccccacttagtgagatagggctcggttgttg 33755348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 35481148 - 35481207
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  35481148 tatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgt 35481207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47542107 - 47542037
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact 98  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47542107 gttaagagtcaacatgagaat-aagaaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact 47542037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 48532162 - 48532237
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattc-atgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48532162 tttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 48532237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 423
Target Start/End: Original strand, 26990442 - 26990492
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26990442 tttgattcacgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgta 26990492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271913
Alignment:
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| | | |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgt 33271913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 46148233 - 46148307
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  46148233 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgt 46148307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 46568027 - 46568113
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagag 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||  ||  ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46568027 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagagagag 46568113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 162
Target Start/End: Original strand, 33307095 - 33307165
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33307095 ggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattag--agagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44134117 - 44134044
Alignment:
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  44134117 gagttggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486852
Alignment:
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgt 45486852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 410
Target Start/End: Original strand, 53266917 - 53266958
Alignment:
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53266917 gtaatttaatccatgtagccgatctcacttagtgagataagg 53266958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 55384129 - 55384064
Alignment:
Q  314 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgatt 379  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  55384129 gatttataggttaataagttgaatctaaatatgatttatgatagaacgttatgacgtaatttgatt 55384064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 413
Target Start/End: Original strand, 19737146 - 19737253
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||   ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |    
T  19737146 attaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtggg 19737244  T
Q  405 ataaggctt 413  Q
    |||||||||    
T  19737245 ataaggctt 19737253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 430
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475973
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||     |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||  |||||||||||  |    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaag----aaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaa 29475904  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtattta 430  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| |   || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  29475905 ctatggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgtattta 29475973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34719363 - 34719287
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaag 208  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | | ||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  34719363 gagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaagtcaacttaggtgttttgaacatatagagagaag 34719287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 55244226 - 55244331
Alignment:
Q  65 gatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 164  Q
    |||||||||||| || || ||| | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    ||||| || | | |||||||||||||||||    
T  55244226 gatgaggatgttttgatgaatgtgtggtaagacttgacgggataagattagtaatgacaacattag----agagttggtgcaacacctatagtagaaaag 55244321  T
Q  165 ttggtagaaa 174  Q
     |||| ||||    
T  55244322 atggtggaaa 55244331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 21200541 - 21200617
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21200541 gagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 21200617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273208
Alignment:
Q  343 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||| || ||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgt 40273208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842725
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaaga 41842725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 358
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571642
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgataga 44571642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50632125 - 50632054
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||   ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50632125 agagagttggggttgcacatatagtagaaaagaatgtagaaactaaacttaagtggtttggacatgtagaga 50632054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21862794 - 21862744
Alignment:
Q  372 atttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21862794 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgt 21862744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778612
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgt 24778612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31453229 - 31453151
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  31453229 agagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 408
Target Start/End: Original strand, 34610434 - 34610512
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  34610434 agtttgatccaaatattgtttaggatatataattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataa 34610512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 46367538 - 46367389
Alignment:
Q  271 ggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgt 370  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||   | |||| || ||||| | ||||||||||||    ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  46367538 ggaagacctaaaaaaattataagagaaactatta---aaaaaaaatctagagatgaatgagttggataaggatatgatatatgatagaacattatgacgt 46367442  T
Q  371 aatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
      |||||| ||||||||| | | |||||| |  ||||| |||| |||||||||    
T  46367441 cgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgta 46367389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39535730 - 39535653
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  39535730 agagagttggggcaacacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagac 39535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39782009 - 39781921
Alignment:
Q  333 tggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||  |||| ||||| | |||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  39782009 tggatccaaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataaggcttgggtgttgt 39781921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 53509854 - 53509801
Alignment:
Q  332 ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  53509854 ttggatctaaacatgatttatgatagaaaattatgacataatttgattcatgta 53509801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32052596 - 32052544
Alignment:
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  32052596 taatttgattcatgtagccgacgtgacttagtgtgataaggtttggttgttgt 32052544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38054696 - 38054624
Alignment:
Q  64 agatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagag 136  Q
    ||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  38054696 agatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 52882724 - 52882660
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  52882724 tatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgtat 52882660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 107)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12492787 - 12492387
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||| ||||||    
T  12492787 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgac 12492688  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcac---ctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||    
T  12492687 accattagagagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatg 12492588  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatt 317  Q
     ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||    
T  12492587 ccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatt 12492492  T
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||    
T  12492491 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 12492392  T
Q  418 gttgt 422  Q
    |||||    
T  12492391 gttgt 12492387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28977257 - 28976862
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  |   ||||||||||| ||||||    
T  28977257 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgac 28977158  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |  ||| ||    
T  28977157 accattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccg 28977060  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  ||||||  |||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||| ||| |||||||    
T  28977059 tggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attataaaggatttag 28976964  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28976963 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 28976864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 24178392 - 24178789
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  24178392 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgac 24178491  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   | |||| ||    
T  24178492 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccg 24178591  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  24178592 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 24178687  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    || |||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||| | | |||||||  |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  24178688 agttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgtt 24178787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 10639179 - 10639581
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  10639179 ggcggtgaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgac 10639278  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatag-------tagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttatt 215  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| | |     
T  10639279 accattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgta 10639378  T
Q  216 gatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaaga 315  Q
    |||| | |  |||||| |||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||    
T  10639379 gatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaagga 10639474  T
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |    
T  10639475 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttgg 10639574  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  10639575 ttgttgt 10639581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 106 - 418
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  106 ataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  206 aagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatt 303  Q
    |||||   | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||       
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc--- 38685128  T
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  38685129 -attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38685227  T
Q  404 gataaggcttagttg 418  Q
    |||||||||| ||||    
T  38685228 gataaggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2075874 - 2075476
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  2075874 ggcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgac 2075775  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  2075774 aacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 2075675  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaa-gattta 319  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    ||||||||| ||||||    
T  2075674 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaacc----attagaaaaggattta 2075579  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  2075578 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgt 2075479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1287989 - 1287591
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  1287989 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 1287890  T
Q  123 accattagggagagag----------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    | |||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  1287889 atcattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacac 1287790  T
Q  213 attgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattaga 310  Q
     | |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    ||||||    
T  1287789 gtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attaga 1287694  T
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  1287693 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 1287594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16347777 - 16347378
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgaca 123  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||   ||| ||||| |||||| |    
T  16347777 gcggttaagagccaacacgagagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaa 16347678  T
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| | |    
T  16347677 ccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctt 16347578  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
       ||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||    |||||||||||||||||    
T  16347577 tgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaacc----attagaaaagatttaga 16347482  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  || ||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  16347481 ggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttg 16347384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496663
Alignment:
Q  67 tgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacg--ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 164  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||   |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 4496407  T
Q  165 ttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaa 262  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||    
T  4496408 ctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 4496507  T
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcac 362  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 4496603  T
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4496604 tatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 4496663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 1275147 - 1275543
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  | ||||||||| ||||||    
T  1275147 ggcggttacgagtcaacatgagaatcaagtaagcatagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgac 1275246  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    |  ||| ||    
T  1275247 accattagagagagagtgggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccg 1275345  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    |||| ||| |||||||    
T  1275346 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaacc----attataaaggatttag 1275441  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| || | | ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1275442 aggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgtt 1275541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 422
Target Start/End: Original strand, 3301752 - 3302123
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3301752 aagtaagtgtagcggagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagc 3301851  T
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||  | |||| | |  |||| ||||||    
T  3301852 ccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggag 3301951  T
Q  249 --gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
      ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301952 gagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaacc----attataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 3302047  T
Q  347 atttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3302048 gtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3302123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 34272904 - 34273292
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||     |||||||| ||||||    
T  34272904 ggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagac-----aggattaggaatgac 34272998  T
Q  123 accattagggagagag----------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |||||||| |||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34272999 accattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacct 34273098  T
Q  213 attgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaa 312  Q
       ||||||||  |||||| || |||            ||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    ||||    
T  34273099 gcagatgtcgtggtaagaagaggaga------------gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaa 34273182  T
Q  313 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34273183 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggct 34273282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 105 - 422
Target Start/End: Original strand, 14665674 - 14665991
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagag----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14665674 gataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgta 14665773  T
Q  201 gagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaa 298  Q
    ||||||||||   | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  14665774 gagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaa 14665873  T
Q  299 ccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactt 398  Q
    ||||||   ||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||  |||||||||| | |||||    
T  14665874 ccattaggaagaa----tttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 14665967  T
Q  399 agtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  14665968 agtgggataaggcttggttgttgt 14665991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26885033 - 26884692
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 177  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26885033 gttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 26884934  T
Q  178 agcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaag 275  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |    
T  26884933 ggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggatg 26884834  T
Q  276 acctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatt 374  Q
    | || | |||||  ||||| ||||     ||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  26884833 agctaggaaaac--taagaaaaac----tattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaatt 26884740  T
Q  375 tgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  26884739 tgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgt 26884692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 422
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457052
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||| |||  |||||| ||||||||| |    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  244 tggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 341  Q
    |||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaa 20456971  T
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  20456972 atttgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgt 20457052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 422
Target Start/End: Original strand, 36215480 - 36215767
Alignment:
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| |||  |  ||||||    
T  36215480 accattagggagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcg 36215579  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |   ||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  36215580 ttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagagg----------aaaactataagagaaaccattaa----aaaagatttag 36215665  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||   || ||| |||| ||||||||  ||| ||||||    
T  36215666 aggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgattcatgtaatggacctcgcttaatgagataaaacttggttgtt 36215765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  181 ttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacc 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||  |||||||||| | || |||||||    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  279 tcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    | | | |||||||| ||||||     ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||| ||||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaac----tattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgat 38501465  T
Q  379 tcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  38501464 cgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 378
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  205 gaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccat 302  Q
    |||||| | | |||   ||  |||| | ||| |||||||||||  ||||||| ||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  303 taattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
     ||     || ||| ||||| | || |||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  14749471 caa----gaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2915692 - 2915499
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||    
T  2915692 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccatta----gaaaggatttagagg 2915597  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  2915596 tcaatgagttggatccaaatttggtt-atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgt 2915499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 422
Target Start/End: Original strand, 27992 - 28161
Alignment:
Q  249 gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27992 gagtcagatcaaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgat 28087  T
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || | || ||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  28088 ttctgatagaacactatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgt 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13561576 - 13561389
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13561576 agtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatga 13561481  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  13561480 gttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgt 13561389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 422
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816661
Alignment:
Q  270 aggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacg 369  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 29816608  T
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29816609 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 29816661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7359592 - 7359264
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||    
T  7359592 ggtaagactggacgagatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggt 7359493  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    |||| |||||||||||||||  | | |||   ||  |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||  ||| |||||||    
T  7359492 ttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaac 7359394  T
Q  288 tataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
     ||||||||||| |||   ||||||| || ||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  7359393 cataagagaaactatt---tagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgataaa-cattatgacgtaatttgatccatgtagc 7359299  T
Q  388 cgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     || | ||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  7359298 tgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgt 7359264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 148
Target Start/End: Original strand, 20318870 - 20318989
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgaca 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     |||||||||||| |||||||    
T  20318870 gcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact-----ggataggattaggaatgaca 20318964  T
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  20318965 ccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 408
Target Start/End: Original strand, 32516437 - 32516819
Alignment:
Q  20 tttggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaat 119  Q
    ||||||||||||||  || || |||||| |||||   ||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||  || ||||||  ||||||||    
T  32516437 tttggcggttaagaaccatcattagaataaagtacacgtaacggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaat 32516536  T
Q  120 gacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
    |||| |||||  |||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||| || || | | |||     
T  32516537 gacaacatta--gagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagatt 32516634  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatt 317  Q
      ||  || | | |||||||| |||| |||  | ||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     ||||||  |||||    
T  32516635 ctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagaggaagacct-aaaaaactataagagaaac----tattagagcagatt 32516729  T
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||  || || |||||| |||||| ||||||||    
T  32516730 tagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatcgatataaccgatc-cacttaatgagataa 32516819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 14911292 - 14911451
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14911292 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatgatttttgataga 14911387  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
      |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||| || ||||||||    
T  14911388 atactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgt 14911451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16914023 - 16913885
Alignment:
Q  281 gaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattc 380  Q
    |||||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||| ||||||| |    
T  16914023 gaaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatcc 16913928  T
Q  381 atgtagccga-tctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16913927 atgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 16913885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558417
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  416 ttgt 419  Q
    ||||    
T  5558414 ttgt 5558417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 387
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889237
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    |||||||| | |||||||||  | | |||| ||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||     
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||  |||| | | || || |||||||||  ||||| | ||   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttg 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||| | ||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||     
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 6889226  T
Q  377 attcatgtagc 387  Q
    || ||||||||    
T  6889227 atccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489608
Alignment:
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| | || |    
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||| | ||||||| |||||||||  |||   ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactattaa 15489608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31636251 - 31636042
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||    
T  31636251 ggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattag--agaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggt 31636154  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatg--gaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    |||| ||||||||||||||||   | ||||| ||  |||| | ||||||| |||||  | ||||||| ||||  |||| ||| |||||| || |||||||    
T  31636153 ttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaaac 31636054  T
Q  288 tataagagaaac 299  Q
    ||| ||||||||    
T  31636053 tattagagaaac 31636042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43558118 - 43557836
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||  |   ||||||    
T  43558118 gagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaagaa 43558019  T
Q  232 tagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     ||||||| ||||  | ||  |||||||||  ||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| | | ||    
T  43558018 gagtagattagataaatgatggtcatatcactagatg--gatgatgacctagaaaaactataagagaaaccgt--------aaagatttggagattattg 43557929  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  43557928 agttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttgttgt 43557836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10083072 - 10082950
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||  ||||    
T  10083072 ggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggt 10082973  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  10082972 ttcggcatgtagagagaagactt 10082950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 305
Target Start/End: Original strand, 2712897 - 2713110
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||     ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||  ||||| ||||    
T  2712897 ggtaagactagacggggtagaattagaaatgacaacat----cagagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggt 2712992  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||   || | ||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||  || ||||||||| |||||||    
T  2712993 ttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggagagtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaac 2713092  T
Q  288 tataagagaaaccattaa 305  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2713093 tataagagaaactattaa 2713110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 420
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213852
Alignment:
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 30213852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 422
Target Start/End: Original strand, 6859344 - 6859660
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  6859344 ggatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagag 6859443  T
Q  204 agaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaacca 301  Q
    ||||||||| | |||   ||  ||||   | || || |||||||||  ||||| | ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  6859444 agaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaac-- 6859541  T
Q  302 ttaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
       ||||| ||||||||| || | | | | ||||  | ||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| || ||||| || || | ||||||||    
T  6859542 --tattaggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagt 6859639  T
Q  402 gagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | |||||||||| || |||||    
T  6859640 gggataaggcttggtagttgt 6859660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418046
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgaga 405  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  406 taaggctt 413  Q
    || |||||    
T  418053 tatggctt 418046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 417
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235320
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||     |||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaac--taagagaaactattaa----gaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaaca 9235265  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  9235266 ttatggcataatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttagtt 9235320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Original strand, 15168756 - 15168855
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  15168756 gataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 419
Target Start/End: Original strand, 14667754 - 14668047
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgga--------catgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||         |||||||||||||||| | |  ||   ||    
T  14667754 gagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacattatgt 14667853  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||| | |||||||||||||||  |  || ||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||| | | |||     |||||| ||||    
T  14667854 agtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaag----aaagatctaga 14667949  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  14667950 gattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 14668047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 33667209 - 33667285
Alignment:
Q  134 gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33667209 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 304
Target Start/End: Original strand, 79504 - 79678
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||  |||| |    
T  79504 gagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagga 79603  T
Q  232 tagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||  |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  79604 gagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactatta 79678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 422
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675809
Alignment:
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    | | |||||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactatta----ggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatg 11675753  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     |||| ||| || ||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  11675754 gcgtagtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgt 11675809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 31906603 - 31906729
Alignment:
Q  83 gatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagctt 182  Q
    ||||| |||||| |||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| | |||||  |||    
T  31906603 gatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcggaaatattctt 31906702  T
Q  183 agatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  31906703 agatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 28276400 - 28276517
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||| |   ||||||| | |    
T  28276400 attagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccacttagcggg 28276499  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28276500 ataaggcttggttgttgt 28276517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||||| | |  ||   ||| |||| ||| || || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  242 gatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatta 304  Q
    |||||||||  |||| || | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11002786 - 11002645
Alignment:
Q  58 tagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagt 157  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||| | ||||||||   | ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||| |||    
T  11002786 tagcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattag--agagagttcgggtagcacctacagt 11002689  T
Q  158 agaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtag 201  Q
    ||||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  11002688 agaaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 422
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475518
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||  ||  ||||||||||| | | ||||| ||  |||| | |||||||||||    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  244 tggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 341  Q
    ||||||  ||||| ||||  | ||| | | | | || | |||||||| |||||||||| |||||     ||||||  |||| | ||||||||||||| ||    
T  43475343 tggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaact-taagagaaactattaa----gaaagatccagagattaatgagttggatcgaa 43475437  T
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||  |||||||||| || |||||| |   |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  43475438 atatgatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgt 43475518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 418303 - 418196
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttaga--tggtttggacatgtaga 202  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  418303 gatagaattagaaatgacaacattag--agagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctggtttgggcatgtaga 418206  T
Q  203 gagaagactt 212  Q
    ||||| ||||    
T  418205 gagaatactt 418196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 6788250 - 6788325
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6788250 aatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattatagcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagt 6788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12577050 - 12576863
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||     |||||| ||||| | |||||    
T  12577050 agtagatcagatggagggtagtcctatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaa----gaaagatctagagattaatga 12576955  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||  ||||||| | ||||||||| || ||||  || |||| || ||||||||||| | || |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12576954 gttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgt 12576863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42504393 - 42504294
Alignment:
Q  275 gacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||    ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  42504393 gacctagaaaaactataagagaagtcaataa----aaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatt 42504298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 27776 - 27944
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||  ||||| |||||||  || ||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||| |||  |||| |||||  ||||||    
T  27776 ggcggttaagaaccaacatgagaattaagtaagcataacggagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaact-aacaagatatgattatgaatgac 27874  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttg 192  Q
    |||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||    
T  27875 accatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttg 27944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090692
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||  | || |||| ||||||||||| |||||| |||| | || | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgt 2090692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 422
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922563
Alignment:
Q  264 aggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcact 363  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||| | ||  |||||||   |||  || |||| |||||| || |    
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaag----aaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacatt 29922504  T
Q  364 atgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  29922505 atggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgt 29922563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 408
Target Start/End: Original strand, 30588578 - 30588712
Alignment:
Q  270 aggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacg 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  30588578 aggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaag----aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacg 30588673  T
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    | || |||| |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  30588674 tgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 427
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220666
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgaga 405  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| || ||||||| ||| ||| |||||  | ||| |||||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgataga-tattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  406 taaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||| || |||||||| ||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgtat 31220666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 425
Target Start/End: Original strand, 39040917 - 39041038
Alignment:
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||   || ||||||| ||||||||||| | |||||| ||     
T  39040917 aattagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgg 39041016  T
Q  404 gataaggcttagttgttgtagt 425  Q
    |||||| |||  ||||||||||    
T  39041017 gataagacttgattgttgtagt 39041038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15252840 - 15252756
Alignment:
Q  329 gagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15252840 gagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 15252756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855886
Alignment:
Q  334 ggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 18855886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367172
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgt 20367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 36200664 - 36200764
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  36200664 ggcggttaagaaccaacgtgagaatcaagtaagcgtatcagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgac 36200763  T
Q  123 a 123  Q
    |    
T  36200764 a 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952508
Alignment:
Q  64 agatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg--ggggtagcac----ctatagt 157  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |  |||||| |||    |||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  158 agaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcat 255  Q
    ||||||| ||| ||||| ||  || || ||||||||||||||||||||||| | | | |||    |  |||| | | |||||||||||||  |||||||     
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaa 21952473  T
Q  256 atcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21952474 atcactagaggtaggggaagacctagaaaaactat 21952508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442141
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataag 32442141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17340750 - 17340468
Alignment:
Q  110 gattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacct-atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaag 208  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || | | || ||| | ||||||||||  ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||     
T  17340750 gattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtagaaacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaa 17340651  T
Q  209 acttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaat 306  Q
    |||    ||||  ||  || ||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||  |||||| |||||| | |||||| |||||  | ||| |||||     
T  17340650 actcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaag 17340551  T
Q  307 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatct 393  Q
        |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | || |||  | || |||||||||| || |||||||    
T  17340550 ----aaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataacattattgcatactttgattcatttaaccgatct 17340468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351120
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggaca-tgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagac 18351120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411955
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 28411955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Original strand, 42199248 - 42199355
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||  |||||| | |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||||||    
T  42199248 acgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgta 42199345  T
Q  201 gagagaagac 210  Q
    ||||||||||    
T  42199346 gagagaagac 42199355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393155
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||| | |||||  ||||||   | ||||||| ||||||||||||| |||||| || |    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 2393138  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  2393139 ataaagctt-gttgttgt 2393155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21193748 - 21193655
Alignment:
Q  329 gagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  21193748 gagttggatagaaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgt 21193655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 368
Target Start/End: Original strand, 23980031 - 23980169
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtc 325  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |     || |||||| || |     
T  23980031 taagaagagtagatcagatagaaaagtcatattacaagaggtataggcagacctagaagaacaataagagaaactattga----gaatgatttatagatt 23980126  T
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac 368  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23980127 aatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgac 23980169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551425
Alignment:
Q  317 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagt 416  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |  |||| || || |   ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  417 tgttgt 422  Q
    ||||||    
T  36551420 tgttgt 36551425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Original strand, 38132542 - 38132615
Alignment:
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38132542 ttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 38132615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 358
Target Start/End: Original strand, 15168893 - 15168986
Alignment:
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||    | ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15168893 aagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgtta----ggaaaaatttagaggttaataagttggatccagatatggtttatgataga 15168986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 422
Target Start/End: Original strand, 25938091 - 25938248
Alignment:
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 360  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||    ||||   ||||||| ||| ||||||| || |||||||  ||||||| | | |    
T  25938091 aagaggtaaaggaatacctagactaactataagagaaactatta----gaaattttttagagatcactgagttgaattcaaatatagtttatgacataac 25938186  T
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  25938187 actacgttgtaatttgattcatgtagccgactccacatagtgagataagacttggttgttgt 25938248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 422
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525920
Alignment:
Q  148 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga 247  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||   |  ||   |   | || | |||||||||||||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  248 g--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 345  Q
    |  |||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||     ||||| || |||  |||| | |||||||||||   | | ||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaac----tattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacat 1525846  T
Q  346 gatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||| ||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1525847 ggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga---ccattagtgagataaggcttggttgttgt 1525920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442874
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgt 3442874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678756
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||   |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatt---tagaaa-gatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaa-ca 7678695  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  7678696 ttatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgt 7678756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8082125 - 8082083
Alignment:
Q  250 agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataa 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8082125 agtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataa 8082083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9121130 - 9121084
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9121130 tttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgt 9121084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 39012783 - 39012857
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  39012783 tttatgatagaacactatggtgcaatttgattcatattgccgacctcacttagtgaaataagggttggttgttgt 39012857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 408558 - 408497
Alignment:
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  408558 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 408497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 355
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725730
Alignment:
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||| ||||     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattat----aaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgat 14725730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 422
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894352
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa-------tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactt 398  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||       ||||| |||||||| | || ||||  |||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  399 agtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||    
T  41894329 agtgggataagactttgttgttgt 41894352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42504503 - 42504446
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtaga 160  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42504503 gggatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtaga 42504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Original strand, 4653479 - 4653531
Alignment:
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4653479 taatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgt 4653531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 38684449 - 38684549
Alignment:
Q  110 gattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||||  | ||| || ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| ||| |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  38684449 gattagaaatggaaacatcagtgagagagtcagggtagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaaga 38684548  T
Q  210 c 210  Q
    |    
T  38684549 c 38684549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833795
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatag--tagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagac 41833795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Original strand, 42576217 - 42576289
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42576217 tatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 42576289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 420
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  353 gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 27386560 - 27386619
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  27386560 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgt 27386619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 35615455 - 35615530
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  35615455 atttagagattaatgagttggataaaaatatagtttatgatagaacattatgacctaacttgattcatatagccga 35615530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||| |  |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 363
Target Start/End: Original strand, 2552944 - 2553002
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcact 363  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||    
T  2552944 attaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4026626 - 4026548
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| |||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4026626 gagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagac 4026548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 5860039 - 5860113
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  5860039 tttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgt 5860113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 299
Target Start/End: Original strand, 27998567 - 27998601
Alignment:
Q  265 ggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27998567 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 27998601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 355
Target Start/End: Original strand, 36200891 - 36200941
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36200891 attataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggttcatgat 36200941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322095
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 39322095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 130
Target Start/End: Original strand, 7678392 - 7678469
Alignment:
Q  53 aagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattag 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||  | || ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7678392 aagtgtagtggagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattag 7678469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9917636 - 9917538
Alignment:
Q  237 gatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttg 334  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| |||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||   |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  9917636 gatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatgacctagaaaaactattagagaaactatt---tagaaa-gatatagagatcaatgagttg 9917541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27553899
Alignment:
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 401
Target Start/End: Original strand, 38657040 - 38657101
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  38657040 aaatatgatttatgatagaacattatgatgtcgtttgattcatgtagccaacttcacttagt 38657101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9434087 - 9434039
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagca 149  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  9434087 acgggatatgattagaaatgacaacattagagagggagttggggtagca 9434039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  145 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38578802 - 38578734
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||    
T  38578802 gggtagcacctctattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagac 38578734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 122)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Original strand, 8180664 - 8181059
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||    
T  8180664 cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacac 8180763  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||     
T  8180764 cattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtg 8180863  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||    |||||||| |||||||||    
T  8180864 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaacc----attagaaaggatttagag 8180959  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||   || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8180960 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgt 8181059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Original strand, 3865956 - 3866351
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||    
T  3865956 cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacac 3866055  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||   | ||||||||     
T  3866056 cattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtg 3866155  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||| || || |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||    
T  3866156 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagag 3866251  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3866252 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgt 3866351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 422
Target Start/End: Original strand, 12734613 - 12734979
Alignment:
Q  53 aagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacct 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12734613 aagtgtagtggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacct 12734710  T
Q  153 atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag- 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||     
T  12734711 atagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaga 12734810  T
Q  252 -tcatatcaaaagagg-tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
     |||  | |||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12734811 gtcaggttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtt 12734906  T
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12734907 tatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12734979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 413
Target Start/End: Original strand, 38429766 - 38430154
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  38429766 ggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 38429865  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   |  ||| ||    
T  38429866 accattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccg 38429965  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    ||||||||||||||||    
T  38429966 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttag 38430061  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38430062 aggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggctt 38430154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 36183333 - 36183730
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  36183333 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 36183432  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  36183433 acaattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 36183532  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||| | ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  36183533 tggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 36183628  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  |  ||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  36183629 aagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgtt 36183728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 112 - 422
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834957
Alignment:
Q  112 ttagaaatgacaccattagggaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  210 cttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattag 309  Q
    | | | |||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    |||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactttaa-agaaacc----attag 25834844  T
Q  310 aaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  25834845 aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 25834944  T
Q  410 gcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||    
T  25834945 gcttggttgttgt 25834957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3244047 - 3243656
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||    
T  3244047 gttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacacca 3243948  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   | |||| |||  |    
T  3243947 ttag--agagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggt 3243850  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||  |||  | |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  3243849 aagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggt 3243754  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3243753 caatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3243656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11992506 - 11992111
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||| |||||| ||||||    
T  11992506 ggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgac 11992407  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||| ||    
T  11992406 accattag--agagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccg 11992309  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  | |||| ||| ||||| ||||||  |||||   | |||||||||| ||||||||||   ||||| || || ||||    | |||||||| |||||||    
T  11992308 ttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaa----tcattagaaaggatttag 11992213  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  11992212 aggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgtt 11992113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41763441 - 41763046
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  41763441 ggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgac 41763342  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||    
T  41763341 accattagagagagagtgggg-taacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccg 41763243  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||| ||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    ||||||||| |||||     
T  41763242 ttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaaaattta- 41763148  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||   | ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41763147 aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 41763048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 422
Target Start/End: Original strand, 4807475 - 4807874
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgaca 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |  ||  ||||||||||  |||||||    
T  4807475 gcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgaca 4807574  T
Q  124 ccattagggagagag----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
     |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||| |||||||||||||  | ||||    
T  4807575 tcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatg 4807673  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatt 317  Q
    ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||  |||  | |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||    ||||  |||    
T  4807674 tcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaagtatt 4807769  T
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | | || |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||    
T  4807770 tagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 4807869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38453057 - 38452684
Alignment:
Q  55 gtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagag----tgggggtagcac 150  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||    |||||||||||     
T  38453057 gtgtagcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcat 38452958  T
Q  151 ctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg- 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||  |||||| | ||||||| |||||||     
T  38452957 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggagga 38452859  T
Q  250 -agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
     |||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  38452858 aagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 38452763  T
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
     ||||||| | |||||||  || ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  38452762 gtatgataaaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 38452684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Original strand, 2610579 - 2610867
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||  ||||||    
T  2610579 gagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaagaa 2610678  T
Q  232 tagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     ||||||||| |||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||    
T  2610679 gagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaatg 2610774  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2610775 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgt 2610867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41197628 - 41197230
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  41197628 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 41197529  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| ||    
T  41197528 accattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccg 41197429  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtca-tatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||   | |||| |||||||| |||||||   ||||| ||  ||||||||    |||| ||||||||||    
T  41197428 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaacc----attataaaagattta 41197333  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||  || |||||||||| |||||    
T  41197332 gaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgt 41197233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45368024 - 45367642
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| | |||||||| || ||||||||| ||||||  | |||||||  |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  45368024 ggcgattaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgac 45367925  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||    
T  45367924 accattagagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 45367826  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcga-aaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    |  | ||||  |||||||| ||||||  |||||   | |||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||    | |||||||| ||||||    
T  45367825 ttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaaga-ctcaagaaaaccattagagaaa----tcattagaaaggattta 45367731  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  45367730 gaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataa 45367642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6238151 - 6237812
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| |  ||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| |||||||||    
T  6238151 ggttaagagtcaacacgagaatcaaataattgcagcgaatgtgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacacc 6238052  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    | | ||||||||||||   ||||||||| |  |  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  | |||||    
T  6238051 aat-gggagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgt 6237953  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggaggagt--catatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    |||| ||||||||    
T  6237952 cgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccatta----gaaatgatttaga 6237857  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  6237856 ggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatg 6237812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 409
Target Start/End: Original strand, 23997503 - 23997868
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  23997503 gttaagagtcaacacgagagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacacca 23997602  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||   | ||||||||  |    
T  23997603 ttagagatagagtgggtgtagcaccta---tagaaaatttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgt 23997699  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||| || |||||||           ||||| |||||    ||||||||||||||||||||    
T  23997700 aagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaagaagacc-----------taaga-aaacc----attagaaaagatttagaggt 23997783  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||| | |||||||    
T  23997784 caatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccacttattcagataag 23997868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16097388 - 16097199
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  16097388 cggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacac 16097289  T
Q  125 cattagggagag----agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    | |||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16097288 cgttagagagagttagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagac 16097199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 452022 - 451651
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||  ||  ||||||||||||          
T  452022 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattaga------ 451929  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
             |||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||   | |||| ||    
T  451928 ---------gagagagtgggggtagcac-----------aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccg 451849  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||    
T  451848 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttag 451753  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  451752 aggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 451653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18424668 - 18424381
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| || | ||||||    
T  18424668 gagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaa 18424569  T
Q  232 tagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatg 329  Q
     | |||||||  ||||   ||||||  | ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||    |||| ||| ||||||||| |||||     
T  18424568 gattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaacc----attataaaggatttagagatcaata 18424473  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  18424472 agtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgt 18424381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 422
Target Start/End: Original strand, 38434866 - 38435231
Alignment:
Q  56 tgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctata 155  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||  ||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  38434866 tgtagcggagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctata 38434965  T
Q  156 gtagaaaagttggtagaaaata-agcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agt 252  Q
    ||||||||| |||| |||| || |  || | |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||   |  |||| | ||||||||| |||||||  |||    
T  38434966 gtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagt 38435065  T
Q  253 catatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttat 352  Q
    || ||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||     |||||| ||||| | |||| |||||||| |||| || |||||    
T  38435066 cagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaa----gaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttat 38435161  T
Q  353 gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  38435162 gattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgt 38435231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326163
Alignment:
Q  183 agatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctc 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||  |||||| ||||||||| ||| |||||  |||  | ||||||||||||||||||| |     
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  281 gaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattc 380  Q
    | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccatta----gaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 7326205  T
Q  381 atgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7326204 atgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 7326163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43752292 - 43751950
Alignment:
Q  78 tgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 177  Q
    ||||||||| ||||||| ||   | |||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43752292 tgttggatgtgcggtaaaaccagatgggataagattagaactgaccatattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaata 43752193  T
Q  178 agcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaag 275  Q
     |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||   ||  || | | |||||||||||||||||  | ||| ||||   |||| | ||||||    
T  43752192 ggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaag 43752093  T
Q  276 acctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaattt 375  Q
    |||| |||||||||| ||||||||     ||||| |||||||| ||  | ||||||||||| | ||| ||| | ||||||||| |||||||  |||||||    
T  43752092 acctagaaaaactatcagagaaac----tattaggaaagatttggaaattaatgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaattt 43751997  T
Q  376 gattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  43751996 gatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgt 43751950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583634
Alignment:
Q  148 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||  ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  248 g--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 345  Q
    |  ||||||  | ||||||| |||| ||||||    ||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaattt 24583713  T
Q  346 ga--tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||  ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24583712 gagttttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgt 24583634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Original strand, 28508770 - 28508957
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||    
T  28508770 agtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatga 28508865  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28508866 gttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 28508957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9556737 - 9556372
Alignment:
Q  54 agtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcaccta 153  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||    
T  9556737 agtgtagtggagttgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacactta 9556638  T
Q  154 tagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--ag 251  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||   | |||   ||  |||||| |||| ||||||||||||  ||    
T  9556637 tagtagaaaa-atggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatag 9556539  T
Q  252 tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgattta 351  Q
    ||| |  |  ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||     |||||| ||| | | ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  9556538 tcaaactactagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaa----gaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggttta 9556443  T
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| || || |  |||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  9556442 tgatagaacattagggtgtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgt 9556372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 408
Target Start/End: Original strand, 41545335 - 41545670
Alignment:
Q  70 ggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa-gttgg 168  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || |  | | | ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| |||||    
T  41545335 ggatgttatgttggatgaacggtatgattagatgaggtaggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttgg 41545434  T
Q  169 tagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagact-tattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagag 265  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||| || | | ||||||||  |||||   ||| |||||||||||||  ||||   ||||||||    
T  41545435 tagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaagtctctgtagatgtcgttgtaaga---gtatatcagatggaggattgtcaagccaaaagag 41545531  T
Q  266 gtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactat 365  Q
         |||||| |  ||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41545532 acgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccattat----aaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactat 41545627  T
Q  366 gacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  41545628 gacttaatttgatttatttagccgatctcacttaatgagataa 41545670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Original strand, 31959639 - 31959800
Alignment:
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    ||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31959639 tcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  357 gagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || ||||||| | ||||||||| |||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgt 31959800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 35643068 - 35643227
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  35643068 aaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 35643163  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||||| | |||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35643164 acactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 35643227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45543235 - 45543076
Alignment:
Q  258 caaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45543235 caaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaac----tattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatag 45543141  T
Q  358 agcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | || |||| |||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  45543140 aacattatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgt 45543076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573133
Alignment:
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcac 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |      
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaac----aactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgt 43573193  T
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43573192 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 43573133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306311
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  30306294 ataaggcttggttgttgt 30306311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35755440 - 35755248
Alignment:
Q  232 tagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg----tc 325  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    | |||||||||||||    |     
T  35755440 tagtacatcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactatta----ggaaagatttagaggttaatt 35755345  T
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||| |||| |||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35755344 aatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 35755248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 422
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959190
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgga----catgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||     |||| ||||||||||| |   | | | ||  |||| | ||||    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  237 gatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttg 334  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |    | ||||| || ||| | |||||||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataa----ggaaagacttggagattaatgagttg 18959102  T
Q  335 gatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| || |||| | ||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  18959103 gatcaaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgt 18959190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 30743691 - 30743808
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||| | || || ||| |||||||||||||    
T  30743691 attagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcacttagtgag 30743790  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  30743791 ataaggctttgttgttgt 30743808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 422
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227468
Alignment:
Q  314 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  414 agttgttgt 422  Q
     ||||||||    
T  227460 ggttgttgt 227468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Original strand, 2610410 - 2610525
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| ||||||    
T  2610410 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgac 2610509  T
Q  123 accattagggagagag 138  Q
    |||||||| |||||||    
T  2610510 accattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496145
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| || ||||    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  9496134 cttggttgttgt 9496145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19337245 - 19337089
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaa-cgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| |||||| | |    
T  19337245 gttaagaatcaacacgagaataaaataagcgtagtggagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaac 19337146  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttag 184  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  19337145 attag--agagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtggaaaataagcttag 19337089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 7825260 - 7825429
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg-- 140  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||      
T  7825260 agaataaagtaagcgtagcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgtt 7825359  T
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    || |||||||||||||| | |||  ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  7825360 ggagtagcacctatagttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 7825429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  137 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 422
Target Start/End: Original strand, 12141539 - 12141823
Alignment:
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagt 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||    |  |||| | |||    
T  12141539 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagt 12141638  T
Q  236 agatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 333  Q
    ||||||||| |||||  |||| || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||     ||||| ||||| |||||| | ||||| ||    
T  12141639 agatcagattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaac----tattaggaaagacttagagattaatgactt 12141734  T
Q  334 ggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| || |||| | | |||||||  |||||||| | | || |||||| | ||||||||  |||||||    
T  12141735 ggatccaaatatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgt 12141823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12882197 - 12882048
Alignment:
Q  269 gaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgac 368  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | || |    
T  12882197 gaggaagacctataaaagctataagagaaactacta----ggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggc 12882102  T
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12882101 gtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 12882048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635326
Alignment:
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 39029701 - 39029866
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacct-cgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag 357  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39029701 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaaac-attcgagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 39029795  T
Q  358 agcactatgacgtaatttgattca------tgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | || |||| ||| ||||||| ||      ||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39029796 aacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 39029866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 422
Target Start/End: Original strand, 13149326 - 13149611
Alignment:
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagt 235  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||| || |||||||||  ||| | |||| ||| |||||||||||||||| | |  |||  ||     ||| |||    
T  13149326 gagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctcgaagagt 13149425  T
Q  236 agatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggt-agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagt 332  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||| |||||||    
T  13149426 agataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatg----aaagatttagaggttaatgagt 13149521  T
Q  333 tggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     | ||||||||||  || |||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  13149522 agaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgt 13149611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437724
Alignment:
Q  139 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtaga 238  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||||| | |||||||||||||||||| | |||   ||  |||| |   ||||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  239 tcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttgga 336  Q
    | |||||||||  ||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||    ||| ||||| | |||||||||||    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaag----gatctagagataaatgagttgga 44437810  T
Q  337 tccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
       ||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44437809 gaaaaacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 44437724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9996764 - 9996651
Alignment:
Q  283 aaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| | ||||||||| |||    
T  9996764 aaaactataagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccat 9996669  T
Q  383 gtagccgatctcacttag 400  Q
    |||||||| | |||||||    
T  9996668 gtagccgaccccacttag 9996651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Original strand, 30743505 - 30743674
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||| |||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |   |||||| | |||||||  ||||||||||||| | |||| |    
T  30743505 ggcgattaaaagccaacacgagaatcaagtaagtgttgtggagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtc 30743604  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgg 193  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||    
T  30743605 accgttaggaagagagt-ggggtagcacttatggtagaaaaattggtagaaattagaattagatggtttgg 30743674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 421
Target Start/End: Original strand, 33504315 - 33504502
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtc-aatg 329  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||| ||||| |  |||     
T  33504315 agtagatcagatggagggtagtcagatcactagaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaag----aaagatctagagatttaata 33504410  T
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    ||||||||  ||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33504411 agttggattgaaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24584006 - 24583904
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||  ||||||    
T  24584006 ggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgac 24583907  T
Q  123 acc 125  Q
    |||    
T  24583906 acc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481733
Alignment:
Q  110 gattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  || |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  210 cttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    ||| |  || | ||  | || | |||||||||||||||  ||||| | ||||   |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaa 37481733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709204
Alignment:
Q  328 tgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgt 39709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Original strand, 17429257 - 17429329
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17429257 tatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgt 17429329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 390
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671015
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||     |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaa----gaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaata 26670986  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
      |||  |||||||||| |||||||||||    
T  26670987 taatggtgtaatttgatccatgtagccga 26671015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4598930 - 4598773
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg--ggggtagcacctat 154  Q
    ||||| || |||| ||||||  |||||||| | |||||||||  ||||||||| |||  |||||||  |||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  4598930 gtagcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctat 4598831  T
Q  155 agtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  4598830 agtagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagactt 4598773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 11412695 - 11412789
Alignment:
Q  115 gaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| | |||||| ||| |||||| ||||    
T  11412695 gaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataaga 11412789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 11412881 - 11412989
Alignment:
Q  317 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatag---agcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||   | || ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  11412881 ttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataaggctt 11412980  T
Q  414 agttgttgt 422  Q
     ||||||||    
T  11412981 ggttgttgt 11412989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13241064 - 13240958
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||||  |||  |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||    
T  13241064 ggataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagag 13240965  T
Q  204 agaagac 210  Q
    |||||||    
T  13240964 agaagac 13240958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328373
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| || |  |||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 38328391  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  38328390 ataaggcttggttgttgt 38328373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531603
Alignment:
Q  337 tccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 9531603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520065
Alignment:
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12520065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13444100 - 13443911
Alignment:
Q  231 atagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||    | |||  ||||  ||||||  | |||    
T  13444100 atagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaa----ttattgaaaaaattttagatattaat 13444005  T
Q  329 gagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| |||  ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||  |||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  13444004 gagatgggcccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgt 13443911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13592697 - 13592420
Alignment:
Q  21 ttggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatg 120  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | | |  | |||||| |||||||||||    
T  13592697 ttggcggttaagaaccaacaagagaataaagtaagtgt-gtggagatggggatgttgtgttggatgtgtggtgatattagatgggataagattagaaatg 13592599  T
Q  121 acaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgt 220  Q
     || ||||   | || ||| |||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| || | | ||| |    
T  13592598 gcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaatattg-tggaaaata-gtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatat 13592501  T
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
      |  |||||| ||||||||| || |||||  |||||||   |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13592500 tatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttcaagaggtataggaagacctagaagaactataagagaaac 13592420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  111 attagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 249
Target Start/End: Original strand, 42092436 - 42092625
Alignment:
Q  58 tagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagt 157  Q
    |||| ||||||| ||||||   ||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||||| |||||||| |||||| |    
T  42092436 tagcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttag--agagagttggggtagcgcctatact 42092533  T
Q  158 agaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg 249  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| || | ||| |||||||||||||| ||| | ||| | ||  |||| | ||||||| |||||||||    
T  42092534 agaaaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagg 42092625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10516831 - 10516752
Alignment:
Q  343 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10516831 tatgatttatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 10516752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19235174 - 19234988
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |     |||||| ||||| | |||||    
T  19235174 agtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattga----gaaagatctagagattaatga 19235079  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
     ||||||  ||||||| | | ||||||| || | || |||  ||| || ||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19235078 tttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataaggcttagttgttg 19234988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287700
Alignment:
Q  267 tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||| ||||  | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa----gaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatg 33287644  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || || |||||| | ||||||| |   ||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  33287645 acatagtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgt 33287700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470146
Alignment:
Q  265 ggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcacta 364  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    | | |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||   ||||||||| || ||    
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactatta----ggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacatta 37470194  T
Q  365 tgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    ||  ||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  37470193 tggtgtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggct 37470146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12475002 - 12474925
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12475002 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 12474925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186134
Alignment:
Q  327 atgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||| ||  ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgta 186134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227358
Alignment:
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaata 227358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Original strand, 6219127 - 6219242
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| | | ||| ||||  |    
T  6219127 attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttgg 6219226  T
Q  405 ataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||| ||||||    
T  6219227 ataaggcttggttgtt 6219242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Original strand, 42543327 - 42543514
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||     ||||| || ||| ||||| | |||||    
T  42543327 agtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaggatctagagataaatga 42543422  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||   | |  || ||| ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42543423 gttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 42543514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 423
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078009
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgag--ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||| | ||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  409 ggcttagttgttgta 423  Q
     |||| |||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgta 45078009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 6218961 - 6219031
Alignment:
Q  135 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag 205  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6218961 agagttggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 13149198 - 13149300
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||  || ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  13149198 ggttaagaaccaacacgaaaatcaagcaagtgtaacagagatgagggtgttgtgttggacaagtggtaagactaaaagggataagattaggaatgacacc 13149297  T
Q  126 att 128  Q
    |||    
T  13149298 att 13149300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26784529 - 26784364
Alignment:
Q  234 gtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgag 331  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||| ||||| | ||||||    
T  26784529 gtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggcagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaa----gaaagatatagagattaatgag 26784434  T
Q  332 ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
    ||| ||  ||||||| | ||||||| | || | ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26784433 ttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaatttgatccatgtagccaatctcacttagt 26784364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4682345 - 4682256
Alignment:
Q  253 catatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    |  | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4682345 catatcaaaagaggtagatcaagatctagaaaaactataagagaaa----ttttcatgaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatg 4682256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Original strand, 11744640 - 11744802
Alignment:
Q  256 atcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| | |||| ||||    ||||| ||||| |||| ||||| ||| || ||| ||| |||||||||    
T  11744640 atcaaaagcggtataggaagacatagaaaaactataaaaaaaactattat---gaaaa-atttaaaggttaatgaattgaattcaattataatttatgat 11744735  T
Q  356 agagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     || || ||||| ||||||||||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  11744736 cgaacattatgatgtaatttgatttatgtaatcgacttcacttattgagataaggctctgttgttgt 11744802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 422
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384748
Alignment:
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgt 25384748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Original strand, 40759063 - 40759171
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||   |||| |||||||  |||||||||    
T  40759063 gataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggtttgtgcatgtagag 40759162  T
Q  204 agaagactt 212  Q
    |||||||||    
T  40759163 agaagactt 40759171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  154 tagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Original strand, 3481144 - 3481210
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3481144 ggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 3481210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720427
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggagaaggctt 3720427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 422
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670747
Alignment:
Q  355 tagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 17670747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 18188685 - 18188848
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    ||||| || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  18188685 agaataaattaagtgtaacaaagatgaggatgttgtgttggatgtg-tgtaaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacatt--ggagagagttgg 18188781  T
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||| |  |||||||| |||| |||  |   ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  18188782 ggtagcacctcttctagaaaagatggtggaagctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Original strand, 37281990 - 37282053
Alignment:
Q  24 gcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatga 87  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  37281990 gcggttaagaatcaatacgagaatcaagtaagtatagttgagatgaggatgttgtgttggatga 37282053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394633
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| || ||||||||| | | ||||| ||  |||||| ||| |    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttg 9394640  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  9394639 ttgttgt 9394633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Original strand, 20900554 - 20900624
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  20900554 tgatagagtattatgacgtagtttgatccatgtagccgacctcacttaattagataaggcttgattgttgt 20900624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Original strand, 41330121 - 41330195
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41330121 agagagttgaggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42549914 - 42549840
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  42549914 tttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgt 42549840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9647972 - 9647822
Alignment:
Q  56 tgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctata 155  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||  | | |||| ||||||||||| || |||||     ||||| |||| || |||||||    
T  9647972 tgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacattat----agagttggggcagtacctata 9647877  T
Q  156 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| | |||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  9647876 gtagaaatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagac 9647822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12489854 - 12489805
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12489854 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12489805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18790210 - 18790109
Alignment:
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||| ||| || ||||| ||||| | || |||||| || ||||||||||||||    
T  18790210 aggtcaatgaaatagatccaaatatgatttatgatataccatcatgtcgtactttcatccatgtcgccgaccccatttagtgggagaaggcttagttgtt 18790111  T
Q  421 gt 422  Q
    ||    
T  18790110 gt 18790109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860242
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||| | ||| |||| |||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagac 38860242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197544
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||  | |||| |||  |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgt 8197544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202304
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||  | |||| |||  |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgt 8202304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12882322 - 12882270
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgg 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12882322 ggggcagcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgg 12882270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 387
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 86
Target Start/End: Original strand, 1456135 - 1456178
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatg 86  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1456135 agaataaaataagtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatg 1456178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4598635 - 4598564
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  4598635 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttgctgta 4598564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1400577 - 1400495
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |  | |||| |||||||||||  |||||||    
T  1400577 attaggaaagatttagaagttaatgagttgaatctaaatatgatttacgataaaatattatggcgtaatttgatcaatgtagc 1400495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 422
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481433
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgt 3481433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 7615259 - 7615358
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| || | |||| | |||| ||||||||    
T  7615259 acgggataggactagaaatgaccacattag--agagacttggggtaacacctatagtagaaaagatggtgcaaactagggttaggttgtttagacatgta 7615356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9578994 - 9578916
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||| |||| || |  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9578994 gagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Original strand, 15025703 - 15025773
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15025703 tgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgt 15025773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19334225 - 19334187
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19334225 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 624738 - 624689
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  624738 tttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgt 624689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 786790 - 786863
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  786790 acgggataggattagaaatggcaacattacaatgagagttgaagtagcacctatagtagaaaagatggcagaaa 786863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 12905085 - 12905162
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||   |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  12905085 gagagagttggggtagcacctatagcagaaaagattgtagaagctagaattaggtagtttgaacatgtagagagaaga 12905162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863513
Alignment:
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| | | ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgt 19863513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867845
Alignment:
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| | | ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgt 19867845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872746
Alignment:
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| | | ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgt 19872746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 286
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443812
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| |||| | ||||| ||  || ||| ||| ||| |||    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  244 tggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaa 286  Q
    ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaagatctagaaaaa 32443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197373
Alignment:
Q  149 acctatagtagaaaagttggtagaaaataagc-ttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagactt 14197373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28960310 - 28960214
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||   | ||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||   || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  28960310 aatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgt 28960214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Original strand, 31415557 - 31415605
Alignment:
Q  338 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31415557 ccaaatatggtttataatagaacattatgacgtagtttgattcatgtag 31415605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 422
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931711
Alignment:
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgt 34931711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 423
Target Start/End: Original strand, 43970020 - 43970060
Alignment:
Q  383 gtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  43970020 gtagccgatctcacttagttggataaggcttggttgttgta 43970060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 44411715 - 44411783
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||   |||||| |||||||  |||||||||||    
T  44411715 gtagcacctatagtaggaaagatggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagactt 44411783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 131)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Original strand, 36545032 - 36545428
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||    
T  36545032 ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacc 36545131  T
Q  126 attagggagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||    
T  36545132 attagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgt 36545231  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||||| ||||||||| ||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||    
T  36545232 ggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttaga 36545327  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36545328 ggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 36545427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36565641 - 36565244
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  36565641 ggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 36565542  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| ||    
T  36565541 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccg 36565442  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  ||||||  |||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  36565441 tggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 36565346  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  36565345 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgtt 36565246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Original strand, 39946739 - 39947091
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  39946739 ggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgac 39946838  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||    
T  39946839 accattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccg 39946938  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | | ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||    
T  39946939 tcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttag 39947034  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttga 377  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  39947035 aggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36395353 - 36394951
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgt---agcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||    
T  36395353 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgttgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaat 36395254  T
Q  120 gacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagc-ttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgat 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||    
T  36395253 gacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagat 36395154  T
Q  219 gtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagat 316  Q
    | |||  |||||| ||||||||| |||||||  |||||  | |||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||     ||||||| |||    
T  36395153 gccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaacc----gttagaaaggat 36395058  T
Q  317 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcacta-tgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||| ||  | | |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  36395057 ttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcg 36394958  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  36394957 ttgttgt 36394951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 18125057 - 18125387
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |  |||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  18125057 ggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgac 18125156  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||| ||    
T  18125157 accattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccg 18125254  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||||||||||||| ||||||  |||||   |  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    |||||||||||||||     
T  18125255 tcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggt-taaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttaa 18125349  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18125350 aagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 18125387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42854404 - 42854019
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  42854404 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgac 42854305  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||    
T  42854304 accatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 42854205  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    ||||||||||||||||    
T  42854204 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttag 42854109  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  42854108 aggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataagg 42854019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 107 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523726
Alignment:
Q  107 taggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagctt-agatggtttggacatgtagagag 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  206 aagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatt 303  Q
    |||||   | |||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    |    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  11523840 a----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 11523745  T
Q  404 gataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  11523744 gataaggcttggttgttgt 11523726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 40813224 - 40813603
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga--gagtg 140  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||   |||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  40813224 agaataaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtg 40813323  T
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||| |||  |||||| ||||||||    
T  40813324 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatc 40813423  T
Q  241 agatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatc 338  Q
    | ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40813424 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcagtgagttggatc 40813519  T
Q  339 caaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||| || | | ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  40813520 caaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgt 40813603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 410
Target Start/End: Original strand, 2796440 - 2796820
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact-ta-acgggataggattagaaatgaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||    
T  2796440 ggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgaca 2796539  T
Q  124 ccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     | | |||| | |    
T  2796540 ccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccat 2796635  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||||| |||| |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||    
T  2796636 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttaga 2796731  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    ||||||| ||||| |  ||||| || ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  2796732 ggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataagg 2796820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491140
Alignment:
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||  |||||| |||||||||     
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  243 atggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    ||| |||||  |||  | |||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 12491223  T
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12491222 aatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgta 12491140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 21121107 - 21121424
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||            || | |||||||||    
T  21121107 ggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatggt 21121194  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcata--tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||   ||  | |||||||||||||| ||||||   ||| |    
T  21121195 ttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaatc 21121294  T
Q  288 tataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    ||| |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21121295 tattagagaaaccatta----gaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttga-tcatgtagc 21121389  T
Q  388 cgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21121390 cgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 21121424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 422
Target Start/End: Original strand, 45419157 - 45419514
Alignment:
Q  59 agcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagta 158  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  45419157 agcggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattag--agagaattggggtagcacctatagta 45419254  T
Q  159 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcata 256  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||| | | || |   |  || ||| ||||||||||||||||  |||||| |    
T  45419255 gaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagagg--ctagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaga 45419352  T
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||| |||| |||| |    |||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  45419353 tctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgata 45419448  T
Q  357 gagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || || ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45419449 gaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 45419514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 422
Target Start/End: Original strand, 37077651 - 37078028
Alignment:
Q  27 gttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacca 126  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37077651 gttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtggcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacacca 37077750  T
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    || || |||||||| ||||||            ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||  || |||| |||| |    
T  37077751 ttcggaagagagtgagggtag------------aaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgt 37077836  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||   |||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  37077837 aagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccatta----gaaaggatttagaggt 37077932  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||   |  | |||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||| | |||||| || |||||  ||| ||||||||    
T  37077933 caatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac--tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgt 37078028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8879840 - 8879481
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    | ||| || |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  8879840 ggcggtgaagagccagcacaagaatcaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgac 8879741  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||       || ||    
T  8879740 acaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagac----ccgtgccg 8879645  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||  |||   || |||||| | |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  8879644 tcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaa----aaatgatttag 8879549  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  8879548 aagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagccga 8879481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 422
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520928
Alignment:
Q  64 agatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa- 162  Q
    |||||||||||||  |||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaat 29520682  T
Q  163 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaa 260  Q
    |  |||| ||||           |||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||  |||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||     
T  29520683 aaatggtggaaa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcac 29520771  T
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 360  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||    | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29520772 aagaggtagaggaag-cctagaaaaactataagagaaactgtta----ggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 29520866  T
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| | | || |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  29520867 attatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgt 29520928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18752271 - 18752093
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||| | |||||||  ||   ||||||||||  |||||||    
T  18752271 cggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacac 18752172  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagaga 206  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752171 cattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat-agcttagatggtttggacatgtagagaga 18752093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa---gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatc 240  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| | ||||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  241 agatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatc 338  Q
    |||||||||  ||||| || | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  || || ||   |||||||||| | |||||||||||||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggtt-atgag---agatttagagattaatgagttggatc 43904752  T
Q  339 caaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
     ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43904751 taaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 423
Target Start/End: Original strand, 8932680 - 8932983
Alignment:
Q  117 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga-cttatt 215  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |   |     
T  8932680 aatgacaccattag--agagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgtta 8932777  T
Q  216 gatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaa 313  Q
     ||| | |  |||||| |||| |||| |||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||    
T  8932778 aatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaa 8932873  T
Q  314 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||  || ||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||||||| |||| ||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagctt 8932973  T
Q  414 agttgttgta 423  Q
     |||||||||    
T  8932974 ggttgttgta 8932983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42469924 - 42469730
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||    
T  42469924 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttagagg 42469829  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  42469828 tcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggttgttgt 42469730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904954
Alignment:
Q  161 aaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||  ||| |||  |||||| ||||||||| |||||   |||||| ||     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||| |    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaa 26904974  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgat 378  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  26904973 acactatgtcgtaatttgat 26904954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 299
Target Start/End: Original strand, 32043528 - 32043750
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  32043528 gttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaaactag 32043627  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
     ||| | |||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||  |||| | | |||||||||||||  || |||| ||||  |||||||| ||||||    
T  32043628 actttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaaga 32043727  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    |||  ||||||||| ||||||||    
T  32043728 cctaaaaaaactattagagaaac 32043750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6510803 - 6510642
Alignment:
Q  45 aatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggggg 144  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||  | |||||| | | |    
T  6510803 aatcgagtaagtgtagcgg-gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccatt--gaagagagagagcg 6510707  T
Q  145 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6510706 tagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaaga 6510642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15215671 - 15215556
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15215671 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgac 15215572  T
Q  123 accattagggagagag 138  Q
    |||||||| |||||||    
T  15215571 accattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 422
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529504
Alignment:
Q  313 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  413 tagttgttgt 422  Q
    | ||||||||    
T  44529495 tggttgttgt 44529504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 2027650 - 2027809
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  2027650 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaatatggtttatgataga 2027745  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccga-tctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||||||  |||||| || ||||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2027746 acactatgacgccatttga-tcctgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 2027809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14742199 - 14742085
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  14742199 attagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaatat---ttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 14742103  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14742102 ataaggcttggttgttgt 14742085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44681382 - 44681252
Alignment:
Q  80 ttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataag 179  Q
    ||||||| | |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44681382 ttggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataag 44681283  T
Q  180 cttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  44681282 cttagaaggtttggaaatctagagagaagac 44681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215415
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||  |    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15215432 ataaggcttggttgttgt 15215415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25473523 - 25473406
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  25473523 attagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 25473424  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  25473423 ataaggcttggttgttgt 25473406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216565
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaag-----aagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaaca 2216504  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     |||   |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2216505 ttatagtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgt 2216565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13171981 - 13171865
Alignment:
Q  91 gtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtt 190  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  13171981 gtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtt 13171882  T
Q  191 tggacatgtagagagaa 207  Q
    ||| ||| || ||||||    
T  13171881 tgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 25288784 - 25288916
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||  | ||||| || |||||||||  | | ||||||||||| || |||    
T  25288784 ggcggttaagagccaacacgagaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggac 25288883  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctata 155  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25288884 accattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 25300119 - 25300251
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||  | ||||| || |||||||||  | | ||||||||||| || |||    
T  25300119 ggcggttaagagccaacacgagaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggac 25300218  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctata 155  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25300219 accattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45041435 - 45041320
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |    
T  45041435 attaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggg 45041337  T
Q  405 ataaggcttagttgttg 421  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45041336 ataaggcttggttgttg 45041320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490614
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    |||  |||||||    
T  490603 cttgtttgttgt 490614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 422
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559977
Alignment:
Q  166 tggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaag 263  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| | | ||| | ||  |||| | ||| ||||||||||||||  |||  ||||  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  264 aggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcact 363  Q
    || |||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |    | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatca----ggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacatt 30559913  T
Q  364 atgacgtaatttgat-----tcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||     | |||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  30559914 atgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgt 30559977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047535
Alignment:
Q  316 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  416 ttgttgt 422  Q
    |||||||    
T  44047541 ttgttgt 44047535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12492242 - 12492116
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  12492242 ggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgac 12492143  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  12492142 accatta--gagagaatgggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 421
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931238
Alignment:
Q  150 cctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg 249  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| |  ||| |||   ||  |||| | | |||||||||||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  250 a--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatga 347  Q
    |  |||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||     ||||| |||||||| ||  | ||||||||||| | |||||||     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaac----tattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatgg 32931164  T
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    | ||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  32931165 tgtatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttg 32931238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 358
Target Start/End: Original strand, 5908602 - 5908861
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg------tagaaaataagcttagatggtttgga 194  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||      | |||| ||  ||||| ||||||||     
T  5908602 acgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaaagatggttgaaatggaaactagacttagttggtttgg- 5908700  T
Q  195 catgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataa 292  Q
     || |||||||||||| | | ||| | ||  |||| | |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  5908701 -atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtcagatcactagagacataggaagacctagaaaaactataa 5908799  T
Q  293 gagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||| |||||    |||||||  |  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5908800 gagaaactattaa----aaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgataga 5908861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 431
Target Start/End: Original strand, 4955353 - 4955479
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4955353 attaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtagtcgatctcacttagtgag 4955452  T
Q  405 ataaggcttagttgttgtagtatttaa 431  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||    
T  4955453 ataaggtttggttgttgttgtatttaa 4955479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10080238 - 10079974
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggt 189  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||| || || | ||||||    
T  10080238 ggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaagatggtggaaactaggcct-gatggt 10080141  T
Q  190 ttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatg--gaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaac 287  Q
    |||| |||||||||||||||| |   ||| | ||  |||| | ||||||||| |||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||| || ||||    
T  10080140 ttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacctagagaaac 10080041  T
Q  288 tataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||| ||||  ||||     |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  10080040 tataagaaaaactgttaa----gaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatgatatttgataga 10079974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 390
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700523
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaat 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |  |||||| |||||||| ||| |||||| |||||   | |||   ||  |||| |     
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  233 agtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||| ||| ||||| || ||| | |||||    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaac---taa-taggaaagacttggagataaatga 29700463  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    || ||| | |||| |  ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29700464 gtcggaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 29700523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914599
Alignment:
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatga 367  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    | ||||| ||  || | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||     
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactatta----ggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatgg 35914659  T
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  35914658 cgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgtat 35914599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45512861 - 45512561
Alignment:
Q  58 tagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagag--agtgggggtagcacctata 155  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||  |  || |||| |||||||||| |  ||||  |||||  ||| |||||||||||||||    
T  45512861 tagcggagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagcacctata 45512763  T
Q  156 gtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtc 253  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  | | |||   ||  |||| | ||||||| ||||||  |  ||||    
T  45512762 gtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtc 45512663  T
Q  254 atatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatgatttat 352  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  45512662 aaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttat 45512567  T
Q  353 gataga 358  Q
    ||||||    
T  45512566 gataga 45512561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 387
Target Start/End: Original strand, 25300262 - 25300343
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  25300262 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagc 25300343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904951
Alignment:
Q  172 aaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca---gatggaggagtcatatcaaaagaggta 268  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| || | |||||||   || |||| ||||| |||||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggag-agtcaaatcaaaagaggta 9905035  T
Q  269 gaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  9905034 gatgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaat----aaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgata 9904951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 422
Target Start/End: Original strand, 25288927 - 25289043
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgaga 405  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||  || |||| || | ||| |||||  |    
T  25288927 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccacctagtggta 25289026  T
Q  406 taaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| ||||||||    
T  25289027 taaggcttggttgttgt 25289043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643611
Alignment:
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatag-tagatcagatggagga 250  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||      |||| ||    ||||||| |  ||||| |||||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac------atgtagtaaggagaatagatcaatcagctggagga 35643779  T
Q  251 --gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
      |||| || |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||||  |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |    
T  35643778 tagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaa----ttattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggt 35643683  T
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| |||  || | || |||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  35643682 ttatgatagaacac--tgccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 35643611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41972145 - 41971991
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | ||||||| | | ||||| |||| | ||||| ||||||||||| |  |||||  |||||||  ||||| ||||    
T  41972145 taagtgcagtggagatgaggatgttgtattggatgtgtgataaga-ttaatgagatagaattagaaatgagaatattag--agagagttagggtaacacc 41972049  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41972048 ta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 12025939 - 12026004
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  12025939 attagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 12026004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 388
Target Start/End: Original strand, 13589477 - 13589724
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaa 231  Q
    |||||||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||  || ||||| ||  || |||    
T  13589477 gagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtacgaa 13589576  T
Q  232 tagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgag 331  Q
     ||||||| | ||||||||  || || ||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||     ||||||||||||||| || | ||||||    
T  13589577 gagtagattatatggagga--ca-atgaa--gaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaac----tattagaaaagatttaaagattaatgag 13589667  T
Q  332 ttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagcc 388  Q
    ||| ||| |||||||||||   ||||| || |||| || ||||||||  ||||||||    
T  13589668 ttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgtagcc 13589724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 9695594 - 9695698
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| |||||||||    
T  9695594 ggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagag 9695693  T
Q  204 agaag 208  Q
    |||||    
T  9695694 agaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12797020 - 12796912
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |    
T  12797020 acggaataagattaggaataacaccattag--aaagagtggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgca 12796923  T
Q  201 gagagaagact 211  Q
    |||||||||||    
T  12796922 gagagaagact 12796912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584637
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||     
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttga-tcttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    |||  |||||||    
T  42584626 cttgattgttgt 42584637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 423
Target Start/End: Original strand, 29735917 - 29736087
Alignment:
Q  249 gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| || | ||||    ||||||| |||  | | ||  ||||| |||||||||||||    
T  29735917 gagtcagatcagaagagatagaggaagatctagaaaaactataagaaaagctatta----gaaaagacttaatgattaacaagttgaatccaaatatgat 29736012  T
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  29736013 ttatgattgaactttatgacgtaatttgattcatgtagtcggtcatacttagtgagagaagaccttgttgttgta 29736087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2518761 - 2518603
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||||| |||||| |||||   ||||||| | |||||||||  | | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||    
T  2518761 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacc 2518664  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  2518663 tcaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagactt 2518603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492313
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||  || |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgt 23492313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30456580 - 30456461
Alignment:
Q  54 agtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcaccta 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||  || ||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||  | || |||||||    
T  30456580 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacc-aatgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcaccta 30456482  T
Q  154 tagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  30456481 tagtagaaaagatggtagaaa 30456461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 3802041 - 3802152
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| | |||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||| | || |||||| |||||||    
T  3802041 aaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacactatggagtaatttgattaatgtagtcgaacccatttagtgggataagg 3802140  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  3802141 ctttgttgttgt 3802152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7531834 - 7531647
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    | || ||| ||||| | |||||    
T  7531834 agtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactatta----ggaaggatctagagataaatga 7531739  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||   | | ||| ||| ||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  7531738 gttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgt 7531647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 7046298 - 7046400
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| || ||||||||| |||| |||  |  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7046298 gataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggtttgggcatgtagaga 7046397  T
Q  205 gaa 207  Q
    |||    
T  7046398 gaa 7046400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169605
Alignment:
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     ||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaac----tattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgata 28169605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Original strand, 13986389 - 13986530
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga 135  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |||  ||| ||||  ||||| ||||||| |||||  |||     
T  13986389 caacacgagaatcaggtaagcatagcggagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagg 13986488  T
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 177  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13986489 gatttggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaata 13986530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Original strand, 16917147 - 16917398
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||  ||| || |||||| |||||||| |||||| ||    
T  16917147 ggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagtagaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaag 16917246  T
Q  204 agaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaacca 301  Q
    ||||| ||| | ||| | ||  |||| | |||||||||||| ||||  ||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| |    
T  16917247 agaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaatcactacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaacta 16917345  T
Q  302 ttaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    | ||      ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  16917346 tcaa----ggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgataga 16917398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 387
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425290
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagc 21425290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Original strand, 25985484 - 25985552
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25985484 ggatagaattagaaacgacaacattag--agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaa 25985552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38178450 - 38178376
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38178450 agtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa 38178376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39760794 - 39760683
Alignment:
Q  53 aagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacct 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| || |  ||  ||||||| ||||||||| | |||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  39760794 aagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacct 39760695  T
Q  153 atagtagaaaag 164  Q
    || |||||||||    
T  39760694 atcgtagaaaag 39760683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39953630 - 39953267
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatag 156  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | ||||||| | |||  ||||  ||||||||| |   |||||| |||||||| ||| |||||||||||     
T  39953630 gtagcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatat 39953531  T
Q  157 tagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtca 254  Q
     ||||||| ||||||||| ||   |||| |||||| | |||||||||||  ||| ||| |||   ||  |||| | ||||||||||||| ||  || |||    
T  39953530 gagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatca 39953431  T
Q  255 tatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatga 354  Q
     ||||  |||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||     ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   ||| ||| ||| |||    
T  39953430 gatcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaac----tattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttga 39953335  T
Q  355 tagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | |  |||||||  ||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  39953334 tgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgt 39953267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatga 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     |||||| || || | ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  | ||||     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaa----gaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatgg 38391951  T
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcactta 399  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  38391950 cgtaatttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 413
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733476
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |  ||    ||| ||||| | ||||||||||||  |||| || |||  |||||| ||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaag----gatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaaca 43733424  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43733425 ctatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 43733476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928590
Alignment:
Q  353 gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 1928590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668500
Alignment:
Q  353 gatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 10668500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28269843 - 28269720
Alignment:
Q  256 atcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||    
T  28269843 atcaaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagc-----aagatttagaggttaatgagttggatccaaat-ttaattatgat 28269750  T
Q  356 agagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    | | |  |||||| ||||||||| ||||||    
T  28269749 ataacgttatgacataatttgatccatgta 28269720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362653
Alignment:
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatga 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    | |||||||| ||  | |||||||||||   ||||||| | ||||||||| || ||||     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactatta----ggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatgg 35362708  T
Q  368 cgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  35362707 cgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 35362653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 42584409 - 42584525
Alignment:
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||  || ||| ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||  ||||    
T  42584409 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaaga 42584508  T
Q  277 cctcgaaaaactataag 293  Q
    ||| |||||||||||||    
T  42584509 cctagaaaaactataag 42584525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 422
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363765
Alignment:
Q  310 aaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |   |||||||||| ||||||| ||| | |||| |||| ||||||    
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  410 gcttagttgttgt 422  Q
     ||| ||||||||    
T  26363753 acttggttgttgt 26363765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 387
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716064
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 31716064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32569785 - 32569713
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  32569785 tatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgt 32569713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33827917 - 33827800
Alignment:
Q  261 aagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 360  Q
    ||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||    |||| ||||| || | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  33827917 aagaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaa----aaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaac 33827822  T
Q  361 actatgacgtaatttgattcat 382  Q
    | ||||||||| || |||||||    
T  33827821 aatatgacgtatttcgattcat 33827800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39967639 - 39967502
Alignment:
Q  281 gaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattc 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||| ||| | | ||||||||||||  | ||||  |||||| |||| || |||| |||| |||||| |    
T  39967639 gaaaaactataagagaaactattaag----aaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  381 atgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgt 39967502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776442
Alignment:
Q  139 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351411
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    ||||||| ||||||  |||||||  | |||||||||  |||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  270 aggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacg 369  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     ||||| || ||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaag----aaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcg 17491710  T
Q  370 taatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  17491709 tatgttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30113503 - 30113416
Alignment:
Q  117 aatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||| ||| ||||||    
T  30113503 aatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30198425 - 30198269
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||     |||||| | ||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||  |    
T  30198425 agaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaag----aaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaata 30198330  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||  ||| ||||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30198329 ttatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 30198269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324052
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 35324052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 38689530 - 38689609
Alignment:
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38689530 agagagttggggtaatgcctattgtagaaaagatggtagaaactcagcttaggtggttttgacatctagagagaagactt 38689609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444376
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaa--ctataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagag 359  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |     
T  41444501 agaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaa---gaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataa 41444405  T
Q  360 cactatgacgtaatttgattcatgtagcc 388  Q
    || ||  |||||||||||  |||||||||    
T  41444404 cattacaacgtaatttgaaccatgtagcc 41444376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Original strand, 44373739 - 44373838
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||   |||||||  |||||||||    
T  44373739 ggataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagag 44373838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255568
Alignment:
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccga 8255568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat--agagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 30748423 - 30748526
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||||| | ||| |||||  ||||||||||| |||| |||   | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  30748423 gataggattagaaatgacaacattac--agagagttgtggtcgcaccagtagtagaaaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 30748520  T
Q  205 gaagac 210  Q
    ||||||    
T  30748521 gaagac 30748526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43013289 - 43013231
Alignment:
Q  328 tgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||    
T  43013289 tgagttggatcgaaatatgatttatgataggttattatgacgtaatttgatttatgtag 43013231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Original strand, 78989 - 79112
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa---aataagcttagat 186  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||   | || |||||| |    
T  78989 ggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttaggt 79088  T
Q  187 ggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  79089 ggtttgggcatgtatagagaagac 79112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 422
Target Start/End: Original strand, 1335552 - 1335605
Alignment:
Q  369 gtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  1335552 gtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataggacttagttgttgt 1335605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 390
Target Start/End: Original strand, 24558572 - 24558730
Alignment:
Q  226 taagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    | ||||  ||||||||||||     
T  24558572 taagaatagtagatcagatggaggatagtcaaatcaaa----gtagaggaagaccgagaaaaacaataagagaaa----ttattaagaaagatttagaga 24558663  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    | |||||| ||||   |   ||| || | |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24558664 ttaatgagctggactgagtcatggttaacgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccga 24558730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645141
Alignment:
Q  148 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatg 245  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||  |||| | |||||||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagacctatagattttgtagtaaggacagtagatcagatg 29645141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 413
Target Start/End: Original strand, 30689940 - 30690005
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  30689940 tttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgctt 30690005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518401
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||| | |||||| || | |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgt 2518401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985723
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||  |||||||  ||| |||||||||||| | |  || | ||  |||| | ||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagacctgtgaattttgtagtaaggagagtagatc 25985783  T
Q  241 agatgga--ggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaa 298  Q
    |||||||  ||||||| |||   |||||||| || ||| || |||||| |||||||||||    
T  25985782 agatggaagggagtcagatcgctagaggtaggggtagatctagaaaaaatataagagaaa 25985723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 421
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttg 421  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 29709821 - 29709857
Alignment:
Q  263 gaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29709821 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 29709857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 36143285 - 36143434
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatag 156  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  | | |||||||||  | | |||||||||||||| || |  |||||    ||||| | ||||||||||||||    
T  36143285 gtagcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattag----agagtcgaggtagcacctatag 36143380  T
Q  157 tagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
     |||| || |||| |||||||  ||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  36143381 cagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagac 36143434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || | ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 427
Target Start/End: Original strand, 12611666 - 12611781
Alignment:
Q  312 aagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggc 411  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  ||||||||| |||| |||| |  ||||  ||  |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  12611666 aagatctagagataaatgagttgggtagaaatatgatatatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggc 12611765  T
Q  412 ttagttgttgtagtat 427  Q
    || |||||||| ||||    
T  12611766 ttggttgttgttgtat 12611781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 422
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276964
Alignment:
Q  351 atgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgt 32276964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 14459057 - 14459175
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga-tctcacttagtga 403  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||| || | ||||||| |||||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||  | ||||| |||     
T  14459057 attaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgacccccactttgtgg 14459156  T
Q  404 gataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  14459157 gataagccttggttgttgt 14459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15174956 - 15174870
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat-ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||||| | |||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  15174956 attagaaaagatttaaagattaatgagttagattcatatatgttgttatgataaaacattacgacgtaatttgattcaggtagccga 15174870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 299
Target Start/End: Original strand, 23023351 - 23023385
Alignment:
Q  265 ggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaac 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23023351 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 23023385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Original strand, 29735701 - 29735763
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact 98  Q
    |||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  29735701 caacacgagaatgaaataagcgtagtggagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagact 29735763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783077
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||   |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatt---tagaaa-gatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaaca 30783106  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
     ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  30783105 ttatgaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33666790 - 33666748
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33666790 gagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaa 33666748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 422
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143620
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||| | ||| ||||  || ||||||| ||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgt 36143620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42493598 - 42493536
Alignment:
Q  131 ggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgg 193  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||| || |||||| ||||||||    
T  42493598 ggagagagttggggtaacacctatagtagaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 305
Target Start/End: Original strand, 4011212 - 4011249
Alignment:
Q  268 agaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4011212 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa 4011249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 419
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741908
Alignment:
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18741908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 419
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746872
Alignment:
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18746872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27556378 - 27556305
Alignment:
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  27556378 ttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgt 27556305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28300058 - 28299985
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactta 399  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||| || | | ||||||| ||||| ||||||    
T  28300058 aatgagttggatctaaacatgatttatgataaaacaatatgacgtatttcggtccatgtagtcgatcccactta 28299985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35647006 - 35646933
Alignment:
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  35647006 ttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgt 35646933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103326
Alignment:
Q  145 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacat 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||| |||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttaggtgttttagacat 7103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 169
Target Start/End: Original strand, 16705711 - 16705788
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 169  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  16705711 ggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacatta--gagagagttggagtagcatctatagtaaaaaagatggt 16705788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 346
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439528
Alignment:
Q  285 aactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
    |||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattc----gaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatg 25439528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 386
Target Start/End: Original strand, 33076291 - 33076367
Alignment:
Q  310 aaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||||| |||||||    
T  33076291 aaaagatttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtag 33076367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38328181 - 38328068
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagc 148  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||   ||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||  |||||  || ||||| |||||| |    
T  38328181 aagtaagtgtagtggagatgacgatgttacgttggatgtatggtgagactaaagaggatagaattagaaatgacgacatta--gaaagagttggggtaac 38328084  T
Q  149 acctatagtagaaaag 164  Q
    | ||| ||||||||||    
T  38328083 aactacagtagaaaag 38328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41971904 - 41971828
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagc 387  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   ||||||  ||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||    
T  41971904 aaagatttagagattaatgagttggactgaaatattgtttatgatagaacattatgacttaatataattcatgtagc 41971828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 148)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Original strand, 11593844 - 11594239
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||| ||||||||    
T  11593844 cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacac 11593943  T
Q  125 cattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtc 224  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| | |     
T  11593944 catttgagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatg 11594043  T
Q  225 ttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||    
T  11594044 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagag 11594139  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11594140 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 11594239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39906775 - 39906375
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgag-----gatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaa 117  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |    
T  39906775 ggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattagga 39906676  T
Q  118 atgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  39906675 atgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccataga 39906576  T
Q  218 tgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatt 317  Q
    ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||    
T  39906575 tgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatt 39906480  T
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||    
T  39906479 tagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 39906380  T
Q  418 gttgt 422  Q
    |||||    
T  39906379 gttgt 39906375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12841672 - 12841278
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||| |||||| ||    
T  12841672 ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgacccc 12841573  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||      
T  12841572 attagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgg 12841473  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  12841472 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagagg 12841377  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12841376 tcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12841278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 35906598 - 35906208
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  35906598 ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacacc 35906499  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||      
T  35906498 attagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgg 35906399  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| |||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||| ||||    
T  35906398 taagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttcgagg 35906303  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  35906302 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 37617826 - 37618224
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  37617826 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagcaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgac 37617925  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag-aaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtc 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |    
T  37617926 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgcc 37618025  T
Q  222 gtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattta 319  Q
    ||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||    
T  37618026 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggattta 37618121  T
Q  320 gaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  37618122 gaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgt 37618221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 43 - 422
Target Start/End: Original strand, 43491210 - 43491587
Alignment:
Q  43 agaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtggg 142  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |  | |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  43491210 agaatctagtaagtgtagccgagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtagg 43491309  T
Q  143 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcag 242  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  43491310 ggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcag 43491409  T
Q  243 atggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  43491410 atggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaacc----attagaaagaatttagaggtcaataagttggatcca 43491505  T
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43491506 aatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 43491587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 412
Target Start/End: Original strand, 49029158 - 49029545
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  49029158 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 49029257  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  49029258 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 49029357  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||  | ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  49029358 tggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 49029453  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||| ||||    
T  49029454 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggct 49029545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 34869302 - 34869699
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  34869302 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 34869401  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |  ||| ||    
T  34869402 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccg 34869501  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||  |||| |  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  34869502 tggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttag 34869597  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  34869598 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgtt 34869697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33350206 - 33349809
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  33350206 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgac 33350107  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  33350106 accattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 33350007  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||    
T  33350006 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaatgatttag 33349911  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||    
T  33349910 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgtt 33349811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 43281558 - 43281953
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||   |||||||||| ||||||    
T  43281558 ggcggttaagagccaacgcaagagtaaagtaagtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgac 43281657  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||    
T  43281658 accattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 43281755  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    ||||||||||||||||    
T  43281756 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttag 43281851  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  43281852 aggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 43281951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45836867 - 45836485
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga 135  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |  ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45836867 caacacgagagtcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 45836768  T
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||  |||||| |||    
T  45836767 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagt 45836668  T
Q  236 agatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttgg 335  Q
    |||||| |||||||||   ||    | |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45836667 agatcaaatggaggagagttaggttatgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaacc----attagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 45836572  T
Q  336 atccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  45836571 atccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgt 45836485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44855543 - 44855177
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  44855543 taagtgtagcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacc 44855444  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--g 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  |    
T  44855443 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggag 44855344  T
Q  250 agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
    |||||  | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44855343 agtcaagttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtt 44855248  T
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44855247 tatgat--aacactatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 44855177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13859406 - 13859067
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  13859406 ggcggttaagagttaacacgagaatcaagtaagt--agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 13859309  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||  |    
T  13859308 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctg 13859209  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||    
T  13859208 tcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttag 13859113  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13859112 aggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 46356251 - 46355859
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||    ||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  46356251 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagt----gtagcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 46356157  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| |    
T  46356156 accatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttg 46356057  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||    |||||||| ||||||     
T  46356056 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaacc----attagaaaggatttaa 46355961  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46355960 aggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgtt 46355861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 343
Target Start/End: Original strand, 31005105 - 31005423
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||| ||    
T  31005105 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataac 31005204  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  31005205 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccg 31005304  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||     |||| |||| ||    
T  31005305 tggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattt----gaaaggattcag 31005400  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaat 343  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  31005401 agatcaatgagttggatccaaat 31005423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2886018 - 2885725
Alignment:
Q  127 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtctt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||| |||  |    
T  2886018 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgt 2885919  T
Q  227 aagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggt 324  Q
    | ||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||| |||    
T  2885918 acgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccatta----gaaatgatttagtggt 2885823  T
Q  325 caatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2885822 caatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 2885725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 412
Target Start/End: Original strand, 36651876 - 36652261
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  36651876 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgac 36651975  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||  ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||   | |||| ||    
T  36651976 accatta--gagagggtaggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccg 36652073  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  |||||| ||||||||| || ||||  |||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    |||||||| |||| ||    
T  36652074 tggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacc----attagaaaggattcag 36652169  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  36652170 aggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 36652261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35559373 - 35558996
Alignment:
Q  44 gaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggg 143  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| |||||||    |   ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  35559373 gaatcaagtaagtgtagtaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggg 35559274  T
Q  144 gtagcacct-atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcag 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   | ||||||||  |||||| |||||||||     
T  35559273 gtagcaccttatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaa 35559174  T
Q  243 atggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 340  Q
    ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35559173 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 35559078  T
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||| |  |||||| |||| || |||  | | ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35559077 aatttagtttatggtagaacattatagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgt 35558996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 422
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650663
Alignment:
Q  106 ataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag 205  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  206 aagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatt 303  Q
    |||||   | |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| ||||| ||||   ||||| ||  ||||||||       
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaacc--- 29650545  T
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  29650546 -attagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 29650644  T
Q  404 gataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  29650645 gataaggcttggttgttgt 29650663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 422
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375147
Alignment:
Q  106 ataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagag 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  206 aagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatt 303  Q
    |||||   | ||||  ||  ||||||  |||||||| ||| |||||  |||  | |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||       
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaacc--- 6375029  T
Q  304 aattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
     ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  6375030 -attagaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 6375128  T
Q  404 gataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  6375129 gataaggcttggttgttgt 6375147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 36136673 - 36137043
Alignment:
Q  50 agtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagca 149  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36136673 agtaagcgtatcgaagatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagca 36136772  T
Q  150 cctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag- 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||| ||| ||||||||| || ||| ||||| ||  || ||| || |||||||||||||     
T  36136773 cctatagtagaaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggagg 36136872  T
Q  249 -gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatga 347  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||     
T  36136873 agagtcagatcagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac----tatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatgg 36136968  T
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||| || |||   ||||||||||| || || |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36136969 tttatgatagaacattatagggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgt 36137043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 33072836 - 33073108
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  33072836 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaaataagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgac 33072935  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | |||||||    
T  33072936 accattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcg 33073033  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagag 295  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33073034 tggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Original strand, 7272921 - 7273149
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  7272921 ggcggttgagagccaacacgagaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgac 7273020  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||| ||    
T  7273021 acctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccg 7273120  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggag 251  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||    
T  7273121 ccgtatgaagagtagatcagatggaggag 7273149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 38606887 - 38607271
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  38606887 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 38606986  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||    
T  38606987 aacattaag-agagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 38607085  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttag 320  Q
    |  | |||| ||||||||| ||||||  ||||||  | | |||||| |||||||||||           ||||| |||||    |||||||| |||||||    
T  38607086 ttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagacc-----------taaga-aaacc----attagaaaggatttag 38607169  T
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  38607170 aggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgtt 38607269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682605
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   | |||| |||| |||||| |||||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  242 gatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 339  Q
     |||||||||  |||  | | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgaattggatcc 31682688  T
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31682687 atatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 31682605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 23404300 - 23404649
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  23404300 ggcggttaaaagccagcacgagaatcaagtaagtgtattggaaatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgac 23404399  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||||||  | |||||||    
T  23404400 accattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggcttagacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcg 23404498  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccatt--aattagaaaagattt 318  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||  |||||      ||||    
T  23404499 tcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaatta------attt 23404592  T
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaattt 375  Q
    | || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||  |||||||    
T  23404593 atagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatggtgtaattt 23404649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28628255 - 28627936
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||| | |||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  28628255 acgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgta 28628156  T
Q  201 gagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaa 298  Q
     |||||| || | | |||   ||  |||| | |||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28628155 aagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaa 28628056  T
Q  299 ccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactt 398  Q
    |     ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  28628055 c----tattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccactt 28627960  T
Q  399 agtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  28627959 agtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 422
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682453
Alignment:
Q  151 ctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagga 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  251 --gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat 348  Q
      ||||  ||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcatta----gaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgat 15682379  T
Q  349 ttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  15682380 ttatgatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgt 15682453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40980090 - 40979925
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40980090 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaac----tattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga 40979995  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtatt 428  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  40979994 acactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 40979925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Original strand, 47848559 - 47848888
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||| ||| | |    
T  47848559 ggttaagaaccaacacgagaataaaataagtctaggggagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataac 47848658  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |  ||   ||      
T  47848659 attagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtac 47848758  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||| | |||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||     | |||||||| | |     
T  47848759 taaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactatt-----ggaaagatttgggga 47848853  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47848854 ttaatgagctggatccaaatatggtttatgataga 47848888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 422
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349899
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcaga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||   |   |||| |  |||||| ||||||||| |    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  244 tggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaa 341  Q
    ||||||||  |||  | |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaa----aaaggatttaaaggtcaataagttggatccaa 22349818  T
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    || || | |||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22349819 atttggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgt 22349899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869286
Alignment:
Q  140 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||  |||  ||||| |||||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  240 cagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat 337  Q
    || ||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaacc----attagaaaggatttagatgtcaatgagttagat 36869332  T
Q  338 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatg 383  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  36869331 tcaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 36869286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Original strand, 7273218 - 7273379
Alignment:
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgata 356  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7273218 tcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataagagaaaccatta----gaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgata 7273313  T
Q  357 gagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  7273314 tagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgt 7273379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46014502 - 46014363
Alignment:
Q  101 acgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgta 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46014502 acgggataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgta 46014404  T
Q  201 gagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    ||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||||    
T  46014403 gagagaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatca 46014363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601760
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaag----aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaaca 45601694  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  45601695 ctatggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgtggtat 45601760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8492577 - 8492249
Alignment:
Q  79 gttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataa 178  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||     
T  8492577 gttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaatag 8492478  T
Q  179 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaaga 276  Q
    ||| || ||||||| || |||||||| ||||||| | ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||||  | | || | ||||||||||| ||||    
T  8492477 gctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaaaga 8492378  T
Q  277 cctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttg 376  Q
    || ||||||| |||||    |||      |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| | |||||||    
T  8492377 ccacgaaaaattataa---taac----tgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttg 8492285  T
Q  377 attcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    ||  ||||| |  | | |||||||||||||||||||    
T  8492284 atcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggct 8492249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36514576 - 36514418
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  36514576 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattag--agagagttggggtagcacc 36514479  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  36514478 tatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgactt 36514418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Original strand, 32630477 - 32630636
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| | |||     
T  32630477 ggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgat 32630575  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagctta 183  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32630576 accattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7189630 - 7189310
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |  ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  7189630 ggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagacgagataggatatgaa-tgacacc 7189532  T
Q  126 attagggagaga--------gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattga 217  Q
    ||||| ||||||        || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |   || ||    
T  7189531 attagagagagaaagagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgataga 7189432  T
Q  218 t------gtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattag 309  Q
    |      || ||  || ||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||    
T  7189431 tgttgtagttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagc---taattag 7189335  T
Q  310 aaaagatttagaggtcaatgagttg 334  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    
T  7189334 aaaagatttagaggttaaggagttg 7189310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 38900077 - 38900235
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||    
T  38900077 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattga 38900172  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38900173 acactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 38900235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 27648942 - 27649059
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  27648942 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 27649041  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27649042 ataaggcttggttgttgt 27649059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9210869 - 9210707
Alignment:
Q  256 atcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9210869 atcagaagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaac--tt--ttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgat 9210774  T
Q  356 agagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | | || |||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9210773 acaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgt 9210707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Original strand, 42187366 - 42187537
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggaga 135  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  ||||||||  |||||||||| || ||||||  |||    
T  42187366 caacacaagaatagagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaaga 42187464  T
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaag 208  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42187465 gagtcggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 32631726 - 32631843
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |    
T  32631726 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtggg 32631825  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  32631826 ataaggcttggttgttgt 32631843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31681140 - 31681023
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  31681140 attagaaaggatttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 31681041  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  31681040 aaaaggcttggttgttgt 31681023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36869683 - 36869574
Alignment:
Q  29 taagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccatt 128  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  36869683 taagagtcaacacgtgaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccatt 36869584  T
Q  129 agggagagag 138  Q
    || |||||||    
T  36869583 agagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 38135603 - 38135218
Alignment:
Q  36 caacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggatta-------gaaatgacaccatt 128  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |  | ||||||||||||       |||||||||  |||    
T  38135603 caacactagaataaaacaagcgtagcggagatgaggatcttttgttggatgtgtggtaagattagatgggataggattataaattagaaatgacaatatt 38135504  T
Q  129 agggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaa 228  Q
    || |||||  | ||| ||||| |  |||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||   | ||| | ||  |||    
T  38135503 agcgagag--ttgggttagcaacgctagt-gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaa 38135407  T
Q  229 gaatagtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtca 326  Q
    | | | ||||||||||||||||  |||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||    ||||||||||||| | |    
T  38135406 ggaga-tagatcagatggaggatagtcagatcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaa----aaaagatttagagatta 38135312  T
Q  327 atgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||||||||| | |||||||  ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  38135311 atgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgtt 38135218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 422
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011325
Alignment:
Q  197 tgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataaga 294  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||  || ||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  295 gaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctc 394  Q
    ||||    | ||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||| || ||||  ||||||||||  |||||||||| | |    
T  1011203 gaaa----ttattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatcc-aatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgacccc 1011297  T
Q  395 acttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1011298 acttagtgggataaggcttggttgttgt 1011325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 21078079 - 21078196
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||| |    
T  21078079 attagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgacttcatttagtggg 21078178  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  21078179 ataaggcttggttgttgt 21078196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 48919274 - 48919391
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| || |    
T  48919274 attagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttaatggg 48919373  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  48919374 ataaggcttggttgttgt 48919391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25579471 - 25579208
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||      ||||||||||||||||||    
T  25579471 ggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcgtagaggagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatacta-----gataggattagaaatgac 25579377  T
Q  123 accattagggagagagtgggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtc 221  Q
      ||||||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | |||       
T  25579376 cacattag--agagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattct 25579279  T
Q  222 gtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat 290  Q
    ||  |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  25579278 gtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcacaagagttaaatgaagacctagaaaaactat 25579208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035157
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||     
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  415 gttgttgt 422  Q
    ||||||||    
T  34035164 gttgttgt 34035157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208331
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 28208331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101780
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||| |||||||    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  36101791 cttggttgttgt 36101780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 12966144 - 12966295
Alignment:
Q  267 tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     ||| |||||||| | ||||| ||||||  ||||||| | ||||||| | || ||||    
T  12966144 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaag----aaatatttagagattaatgatttggatagaaatatggtatatgataaatcattatg 12966239  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
     | |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12966240 ccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12966295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 14593677 - 14593926
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg----ggggtagcacct 152  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||  |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||||||||    |||||  |||||    
T  14593677 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacct 14593776  T
Q  153 atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagat--ggagga 250  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||| |||||||| | | |||   || |     ||||||||||||||   |||||    
T  14593777 atagtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacctgtggattctgtat-----atagtagatcagatagagagga 14593871  T
Q  251 gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14593872 gtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa 14593926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 14057640 - 14057757
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| | | ||||||||  |    
T  14057640 attaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtagg 14057739  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14057740 ataaggcttagttgttgt 14057757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 14367668 - 14367785
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| | | ||||||||  |    
T  14367668 attaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtagg 14367767  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14367768 ataaggcttagttgttgt 14367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517427
Alignment:
Q  272 gaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgta 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaa----aaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgta 21517434  T
Q  372 atttgat 378  Q
    |||||||    
T  21517433 atttgat 21517427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741917
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||| | ||  |||| | |||||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  242 gatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactat--aagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat 337  Q
    ||| |||   ||||| ||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||  |||| ||||     ||||| ||| |||| ||  | |||||||||||     
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaac----tattaggaaatatttggaaataaatgagttggac 26741982  T
Q  338 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    | ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||| || ||| |||||||||    
T  26741981 cgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtg 26741917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 420
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073206
Alignment:
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  419 tt 420  Q
    ||    
T  33073205 tt 33073206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 39811873 - 39812025
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatag 156  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||      
T  39811873 gtagcggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatca 39811972  T
Q  157 tagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||  ||||  ||| |  |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39811973 tagaaaaaatggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaaga 39812025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893566
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| | ||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  411 cttagttgttgt 422  Q
    ||| ||||||||    
T  27893577 cttggttgttgt 27893566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 305
Target Start/End: Original strand, 43282369 - 43282575
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccatt---agggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtag 201  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| ||  |||| |||||||    
T  43282369 gatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtag 43282468  T
Q  202 agagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagag--gtagaggaagacctcgaaaaactataagagaa 297  Q
    |||||||||||   |||   ||   ||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43282469 agagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcacaagaggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaa 43282567  T
Q  298 accattaa 305  Q
    || |||||    
T  43282568 actattaa 43282575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24598349 - 24598191
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24598349 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccatta----gaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgataga 24598254  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
      | | || | | ||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||||||    
T  24598253 atattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaatgggataagacttggttgttgt 24598191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27021983 - 27021906
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27021983 gagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30200330 - 30200176
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | |||||| |||||||||||||| ||||    |||||||  ||||| ||||    
T  30200330 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacatt----agagagttagggtaacacc 30200235  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || |||||| || ||| | |||||| | |||||||    
T  30200234 tatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagac 30200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 385
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  314 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 1523860 - 1523922
Alignment:
Q  360 cactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1523860 cactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgt 1523922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 16013200 - 16013449
Alignment:
Q  57 gtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtg----ggggtagcacct 152  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||  |||| |    ||||||||||||| |||||| |||||||||    |||||  |||||    
T  16013200 gtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacct 16013299  T
Q  153 atagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--ga 250  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||| |||||||| | | |||   || |     |||||||||||||| |||  ||    
T  16013300 atagtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacctgtggattatgtat-----atagtagatcagatagagagga 16013394  T
Q  251 gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16013395 gtcaaatcaccagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaa 16013449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36239936 - 36239833
Alignment:
Q  281 gaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattc 380  Q
    |||||||||||||||||||     ||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |    
T  36239936 gaaaaactataagagaaac----tattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 36239841  T
Q  381 atgtagcc 388  Q
    ||||||||    
T  36239840 atgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 42187603 - 42187720
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcact-atgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtga 403  Q
    ||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  42187603 attaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 42187701  T
Q  404 gataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  42187702 gataaggctttgttgttgt 42187720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 413
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969968
Alignment:
Q  315 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 42969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19262742 - 19262609
Alignment:
Q  112 ttagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagact 211  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  19262742 ttagaaatgacaatattag--agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacc 19262645  T
Q  212 tattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag 248  Q
    | | ||| | ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19262644 tgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Original strand, 44951272 - 44951402
Alignment:
Q  257 tcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataa-gagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgat 355  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| || || |||||||| |||    ||||| ||||| | |||||| | || ||| ||||||| |||||||||    
T  44951272 tcaaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaaccttta----gaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgat 44951367  T
Q  356 agagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44951368 agaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga 44951402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 422
Target Start/End: Original strand, 24777168 - 24777240
Alignment:
Q  350 tatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  24777168 tatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgt 24777240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531440
Alignment:
Q  197 tgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggagt--catatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataaga 294  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||  || ||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  295 gaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 346  Q
     |||    | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1531487 aaaa----ttattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatg 1531440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519042
Alignment:
Q  306 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgaga 405  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||| |  | | ||||||||||||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  406 taaggcttagttgttgtagtattt 429  Q
    |||||||   ||||||| ||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgtattt 8519042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 378
Target Start/End: Original strand, 35922421 - 35922488
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgat 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  35922421 aaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgat 35922488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48736025
Alignment:
Q  66 atgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 165  Q
    |||||||||||  |||| ||| | |||||||||  | | ||||  ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  166 tggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatgga-ggagtcatatcaaaaga 264  Q
    ||| ||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||| |||||| | | |||   ||  | || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagggagtcagatcactaga 48736057  T
Q  265 ggtagaggaagacctcgaaaaactataagaga 296  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  48736056 ggtagggctagaccttgaaaaactataagaga 48736025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 5335833 - 5335988
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||  || | ||   ||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  5335833 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattag--agagagttggggtagcatc 5335930  T
Q  152 tatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  5335931 tatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169718
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagac 40169718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 399
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415263
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcactta 399  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || | ||||  | ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccactta 40415263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 41948475 - 41948585
Alignment:
Q  100 aacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgt 199  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||| || | |||||||| |||| |||| || |||||  |||||||| |||||    
T  41948475 aacgagatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgt 41948574  T
Q  200 agagagaagac 210  Q
    |||||||||||    
T  41948575 agagagaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401164
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||     |||||||||||| | || |||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaa----gaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaaca 44401191  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagcc 388  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  44401190 ttatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 423
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852367
Alignment:
Q  321 aggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgtt 420  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||| | ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  421 gta 423  Q
    |||    
T  47852365 gta 47852367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 427
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976519
Alignment:
Q  272 gaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgta 371  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||  |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |  |    
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaac---taatatgaaa-gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaa 37976463  T
Q  372 atttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtat 427  Q
    ||| ||| ||||||||| | | | |||||  |||||||| || |||||||| ||||    
T  37976464 attagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgtat 37976519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882739
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||  || |||| || |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtgagaaaaggcttggtggttgt 2882739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Original strand, 28020928 - 28021032
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 204  Q
    |||| |||| ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  28020928 gatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtagaaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagaga 28021027  T
Q  205 gaaga 209  Q
    |||||    
T  28021028 gaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814148
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 30814148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36102078 - 36101970
Alignment:
Q  110 gattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||||||| |||| | |  ||||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  36102078 gattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaaga 36101979  T
Q  210 cttattgat 218  Q
    | ||| |||    
T  36101978 cctatagat 36101970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 422
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652826
Alignment:
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagtt 417  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  418 gttgt 422  Q
    |||||    
T  47652822 gttgt 47652826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Original strand, 38920789 - 38920864
Alignment:
Q  136 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagact 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  38920789 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgact 38920864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 422
Target Start/End: Original strand, 48515475 - 48515554
Alignment:
Q  343 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||| ||||    
T  48515475 tatgatttatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgt 48515554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966091
Alignment:
Q  144 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 12966091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27893864 - 27893769
Alignment:
Q  105 gataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| | |||| |||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  27893864 gataggattagaaacgacaatattag--agagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 413
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103196
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  411 ctt 413  Q
    |||    
T  33103194 ctt 33103196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 427
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732116
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagt 425  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||||  | |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatg--gcaatttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24434483 - 24434386
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||   ||||||||||||||    
T  24434483 attagaaaagatttagggattaatgaattggactcaaatatgatttaagatacagcattatgatgtaatttgatccaagtaattgatctcacttagtg 24434386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47796471 - 47796359
Alignment:
Q  90 ggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagg--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatg 187  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||   |||||||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||    
T  47796471 ggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtaggtg 47796372  T
Q  188 gtttggacatgta 200  Q
    |||||| ||||||    
T  47796371 gtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Original strand, 34745930 - 34746026
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||   ||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34745930 aatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 34746026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926538
Alignment:
Q  329 gagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 409  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |   ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagcgggataag 34926538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Original strand, 1569139 - 1569251
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  1569139 agaggcagaggtagtcctagaaaaactataagagtaactattaa----gaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaaca 1569234  T
Q  362 ctatgacgtaatttgat 378  Q
     || | |||||||||||    
T  1569235 ttacggcgtaatttgat 1569251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 1740705 - 1740909
Alignment:
Q  49 aagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccatt----agggagagagtggggg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||    ||| || |||||||||||| | ||||    || ||||||||  |||    
T  1740705 aagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactaggtggggtaagattagaaatgagaacattagagagagagagagtttggg 1740804  T
Q  145 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagat 244  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||| |||| || |||||| ||||||||  ||||||| || ||| || | ||| | ||  |||| | ||||||||||||    
T  1740805 tagcatctacagtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaaggagagtagatcagat 1740904  T
Q  245 ggagg 249  Q
    |||||    
T  1740905 ggagg 1740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 9796304 - 9796363
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||    
T  9796304 tatgacgtaattcgattcatgtagccgacctcacttaatgggataagatttagttgttgt 9796363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Original strand, 35713695 - 35713766
Alignment:
Q  141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    ||||||| || |||||| |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35713695 ggggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagactt 35713766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 402
Target Start/End: Original strand, 43281958 - 43282089
Alignment:
Q  266 gtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactat 365  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | || |||    
T  43281958 gtagaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagta----agatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tat 43282052  T
Q  366 gacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 402  Q
    | |||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  43282053 ggcgtaatttgatctatctagccgacctcacttagtg 43282089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 45558353 - 45558428
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaa 207  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||  || ||||||||||    
T  45558353 gagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Original strand, 6072220 - 6072329
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||     
T  6072220 aaagatctagagtttaattagttgaatcgaaatatgatttatgacagaatattatgacgtagtttgatacatgtagctgaccacacttagtgag-taaga 6072318  T
Q  411 cttagttgttg 421  Q
    ||| |||||||    
T  6072319 cttggttgttg 6072329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869105
Alignment:
Q  352 tgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 31869105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 279
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631716
Alignment:
Q  180 cttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaaagaggtagaggaagac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||  | |||| ||| ||||| |||||||  |||||  | |||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  278 ct 279  Q
    ||    
T  32631715 ct 32631716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42177367 - 42177269
Alignment:
Q  71 gatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 169  Q
    |||||| ||||||||  | |||||||||  || ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42177367 gatgttttgttggatatgtggtaagactatactggatttgattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggt 42177269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891167
Alignment:
Q  341 aatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgt 25891167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Original strand, 30664736 - 30664833
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||  || ||| ||||||||| |  ||| ||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30664736 aaagatctagagattaatgagttggatcataacatggtttatgatacaatactttgacgtaatattatccatgtagccgacctcatttagtgagataa 30664833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37439661 - 37439600
Alignment:
Q  103 gggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 164  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  37439661 gggatatgataagaaatgacaacattagagagagagttggagtagcacctatggtagaaaag 37439600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 423
Target Start/End: Original strand, 46990092 - 46990173
Alignment:
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| ||| |||||||||    
T  46990092 atatgatatctgatagagcattatgaagtcatttgatacatgtagccgacctcacccagtgggataagactttgttgttgta 46990173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Original strand, 6263486 - 6263538
Alignment:
Q  370 taatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6263486 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 6263538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420606
Alignment:
Q  164 gttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggagg--agtcatatcaaa 261  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||   ||  |||| | ||||||||||||| | |  ||||| ||||      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaa 305  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagagatactattaa 6420606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9797994 - 9797915
Alignment:
Q  132 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactt 212  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |  | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9797994 gagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattct-gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagactt 9797915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177630
Alignment:
Q  330 agttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtca-ttgatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgt 24177630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Original strand, 28858012 - 28858105
Alignment:
Q  107 taggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtaga 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| | |  |||| |||||||| ||||||||    
T  28858012 taggattagaaatgacaacattagtgagaga--tggggtggcacctattgtagaaaacatggtagaaactcaagttaggtggtttgggcatgtaga 28858105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341398
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||   |||||||||| | || ||||||  |||||||||  |||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgt 34341398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40008530 - 40008434
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||  | | ||||| ||||||||| || |||| |||  |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  40008530 aatgagttggatagagacatgatatatgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataagacttggttgttgt 40008434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220813
Alignment:
Q  147 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 418
Target Start/End: Original strand, 28708601 - 28708656
Alignment:
Q  363 tatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttg 418  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  28708601 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 28708656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40139276 - 40139133
Alignment:
Q  63 gagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 162  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  40139276 gagacgaggatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattag--agagagtcgggttt-cacctatagtagaaa 40139180  T
Q  163 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |  |||| |||| |  |||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  40139179 atatggtggaaactgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaaga 40139133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24376100 - 24376026
Alignment:
Q  348 tttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||| || ||||||||    
T  24376100 tttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtgggacaaggttttgttgttgt 24376026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  340 aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga 390  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 422
Target Start/End: Original strand, 31005434 - 31005484
Alignment:
Q  372 atttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31005434 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 31005484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47796342 - 47796176
Alignment:
Q  233 agtagatcagatggagga--gtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatga 330  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||  || || ||| |||||||  |||||| |||||||||| | ||||    | |||||||||||  | ||| |    
T  47796342 agtagatcagatggaggattgtcagatcactaggggcagatgaagaccgagaaaaattataagagaacctatta----ggaaagatttagaaattaataa 47796247  T
Q  331 gttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  47796246 gttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgcagccgatcccgcttagt 47796176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 412
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515440
Alignment:
Q  342 atatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggct 412  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||||| |||||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggct 48515440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 422
Target Start/End: Original strand, 14593986 - 14594031
Alignment:
Q  377 attcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14593986 attcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 14594031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 15681239 - 15681292
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgtt 76  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  15681239 ggcggttaagagccaacacgagactcaagtaagtgtagtggagattagaatgtt 15681292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 422
Target Start/End: Original strand, 16013509 - 16013554
Alignment:
Q  377 attcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16013509 attcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 16013554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 414
Target Start/End: Original strand, 17759503 - 17759544
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctta 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  17759503 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctta 17759544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541941
Alignment:
Q  311 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccga-tctcacttagtgagataag 409  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||  ||| | || |||||| | |||||||||  | ||||||||  ||||||    
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  410 gcttagttgttgtagtat 427  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgtat 28541941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39738497 - 39738448
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39738497 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 39738448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 422
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630713
Alignment:
Q  361 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 40630713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Original strand, 6682583 - 6682623
Alignment:
Q  373 tttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  6682583 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 6682623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 349
Target Start/End: Original strand, 18795853 - 18795893
Alignment:
Q  309 gaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatt 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  18795853 gaaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatatgatt 18795893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19119489 - 19119441
Alignment:
Q  360 cactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataa 408  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19119489 cactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 19119441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21244330 - 21244286
Alignment:
Q  378 ttcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21244330 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21244286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28542254 - 28542187
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  28542254 taagtgtagcggagatgagggtgttgcgttggatgtgtggtaagac-tagtgggatagaattagaaatg 28542187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38103712 - 38103618
Alignment:
Q  326 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||  ||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  38103712 aatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaatttga-tcctgtagccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgt 38103618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Original strand, 40830224 - 40830292
Alignment:
Q  142 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |   ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  40830224 gggtagcacctattgaagaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatgaagagagaagac 40830292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 422
Target Start/End: Original strand, 31353 - 31747
Alignment:
Q  26 ggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacacc 125  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||| |||||||||    
T  31353 ggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacacc 31452  T
Q  126 attagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtct 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| | |      
T  31453 attagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatgg 31552  T
Q  226 taagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagagg 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  31553 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaacc----attagaaaggatttagagg 31648  T
Q  324 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31649 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 31747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44257 - 44081
Alignment:
Q  37 aacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac----cattaggg 132  Q
    ||||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  | || |||| |||| ||||||||     || ||       
T  44257 aacacgagaataaaataagcgcagcggagatgaggatgttgcgttggatgtgcggtaagactagatggtatagtattaaaaatgacaattgacaatatt- 44159  T
Q  133 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagac 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 82603 - 82997
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||||  ||  ||||||||||  ||||||    
T  82603 ggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgac 82702  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||   || ||||  |    
T  82703 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcag 82802  T
Q  223 tcttaagaatagtagatcagatggaggagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagag 322  Q
    || ||||||  ||| |||| |||||||||     | || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||    
T  82803 tcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagtggttaagagaggtagaggaagacctaggaaaactat-agagaaacc----attagaaaggatttagag 82897  T
Q  323 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  82898 gtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgt 82997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48118
Alignment:
Q  334 ggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgta 423  Q
    |||| |||||||| | |||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgta 48118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1265 - 951
Alignment:
Q  104 ggataggattagaaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagag 203  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1265 ggataggattatgaatgacaccattag--agagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagag 1168  T
Q  204 agaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaacca 301  Q
    |||||||   | |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  1167 agaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacca 1068  T
Q  302 ttaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagt 401  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| || | || |||||    
T  1067 ttaa----aaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagt 972  T
Q  402 gagataaggcttagttgttgt 422  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  971 gggataaggcttggttgttgt 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 2670 - 2595
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagact 98  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  2670 ggcggttaagagtcaacatgataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagact 2595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25845 - 25683
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  25845 ggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgac 25746  T
Q  123 accattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttaga 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25745 accattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25535
Alignment:
Q  267 tagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 25591  T
Q  367 acgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25590 acgtcatttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 25535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 87009 - 86648
Alignment:
Q  21 ttggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatg 120  Q
    |||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||   |  ||||| |||||||||||    
T  87009 ttggcggttaagagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatg 86910  T
Q  121 acaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||| | | | || |   | |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||   | ||||     
T  86909 acaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgc 86812  T
Q  221 cgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagattt 318  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||| | |||||| | |||||| | |||||||||    | |||||| |||||    
T  86811 cgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaacc----actagaaaggattt 86716  T
Q  319 agaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  86715 agaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtag 86648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4670 - 4320
Alignment:
Q  25 cggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgacac 124  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| | || | || |||||||||||  |||||||||  |||||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  4670 cggttatgagtcaacacgagaatcaagtaaatttaacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacac 4571  T
Q  125 cattagggagagagtg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgt 223  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||  | || |  ||    
T  4570 cattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgt 4471  T
Q  224 cttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttaga 321  Q
      |||||| ||||||||| |||||||||  |||  | |||||||||| |||          |||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||    
T  4470 ggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggtatagg----------aaaactattagagaaacc----attagaaaggatttaga 4385  T
Q  322 ggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtag 386  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4384 ggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatttgatccatgtag 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11998 - 11810
Alignment:
Q  23 ggcggttaagagtcaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttctgttggatgagcggtaagacttaacgggataggattagaaatgac 122  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||    
T  11998 ggcgggtaagagtcaacatgagaatcaagtatgtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgac 11899  T
Q  123 accattagggagaga--gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11898 accatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11564
Alignment:
Q  183 agatggtttggacatgtagagagaagacttattgatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctc 280  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||   | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||  |||  | | |||||||||| ||| ||||     
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  281 gaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattc 380  Q
    | |||||||| ||||||| | |||    ||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgtta----gaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttggttt--gatagagtactatgacgtcatttgatcc 11594  T
Q  381 atgtagccgatctcacttagtgagataagg 410  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  11593 atgtagccgaccccacttagtaggataagg 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 429
Target Start/End: Original strand, 16698 - 16864
Alignment:
Q  259 aaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgataga 358  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16698 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaacc----attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 16793  T
Q  359 gcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtattt 429  Q
     ||||||| ||| |||||||  ||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16794 acactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtattt 16864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 422
Target Start/End: Original strand, 4711 - 4915
Alignment:
Q  216 gatgtcgtcttaagaatagtagatcagatggaggag--tcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaa 313  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||| | | | ||||| ||||||||||||||||    ||||     
T  4711 gatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccatta----gaaag 4806  T
Q  314 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4807 gatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgctt 4906  T
Q  414 agttgttgt 422  Q
     ||||||||    
T  4907 ggttgttgt 4915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 422
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7719
Alignment:
Q  120 gacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttattgatg 219  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||||    
T  7422 gacaccattag--agagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatg 7519  T
Q  220 tcgtcttaagaatagtagatcagatggag--gagtcatatcaaaagaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatt 317  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||  |||| |  |||||||| ||  |  ||||| |   |||||||||||| ||||     |||||||||||||    
T  7520 tcttcataagaagagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaaga-gtgtatcaagacataagaaaactataagataaac----tattagaaaagatt 7614  T
Q  318 tagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatct-cacttagtgagataaggcttagt 416  Q
     |||||||| | |||||||| |||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  7615 cagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggt 7713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 493 - 610
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  493 attagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 592  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||  |||||||    
T  593 ataaggcttgattgttgt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 283 - 422
Target Start/End: Original strand, 14727 - 14862
Alignment:
Q  283 aaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcat 382  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||    
T  14727 aaaactttaagagaaaccatta----gaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccat 14822  T
Q  383 gtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||| | | ||| ||||| |||||  ||| ||||||||    
T  14823 gtagccaaccccacgtagtgggataaatcttggttgttgt 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58238
Alignment:
Q  262 agaggtagaggaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagca 361  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    | ||| | || ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgtta----ggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaaca 58290  T
Q  362 ctatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggctt 413  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  58289 ttatgtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctt 58238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28892
Alignment:
Q  335 gatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 28892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 160444 - 160327
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgag 404  Q
    ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |    
T  160444 attaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccacttagtggg 160345  T
Q  405 ataaggcttagttgttgt 422  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  160344 aaaaggcttggttgttgt 160327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16439
Alignment:
Q  337 tccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgt 16439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  145 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaaga 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 385
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39561
Alignment:
Q  305 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgta 385  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||| |||||||| || ||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 419
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3713
Alignment:
Q  354 atagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgt 419  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University