View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15454_high_23 (Length: 390)

Name: NF15454_high_23
Description: NF15454
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15454_high_23
NF15454_high_23
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (12-373)||(27486936-27487297)
chr4 (12-373)||(27523231-27523590)
chr4 (12-370)||(27505531-27505886)
chr4 (12-373)||(27479854-27480213)
chr4 (90-367)||(27469419-27469693)
chr4 (12-373)||(27525942-27526299)
chr4 (89-373)||(27476640-27476921)
chr4 (90-373)||(27513683-27513963)
chr4 (60-258)||(27502011-27502207)
chr4 (157-373)||(27501270-27501486)
chr4 (156-373)||(27498368-27498585)
chr4 (12-330)||(27460474-27460783)
chr4 (144-373)||(27516567-27516796)
chr4 (143-373)||(27500295-27500525)
chr4 (24-373)||(27473845-27474178)
chr4 (24-373)||(27466774-27467118)
chr4 (156-365)||(27444764-27444973)
chr4 (158-365)||(27557450-27557657)
chr4 (156-365)||(27554270-27554479)
chr4 (156-342)||(27431118-27431304)
chr4 (150-373)||(27502771-27502994)
chr4 (179-361)||(27585653-27585835)
chr4 (186-367)||(27425771-27425952)
chr4 (186-367)||(27570049-27570230)
chr4 (179-361)||(27415589-27415768)
chr4 (188-361)||(27565953-27566126)
chr4 (186-361)||(27412635-27412804)
chr4 (186-345)||(27506679-27506838)
chr4 (186-359)||(27563346-27563519)
chr4 (186-345)||(27485943-27486102)
chr4 (186-365)||(27497322-27497501)
chr4 (150-373)||(27507777-27508000)
chr4 (187-345)||(27478884-27479042)
chr4 (145-342)||(27567239-27567436)
chr4 (186-342)||(27414304-27414460)
chr4 (179-342)||(17970283-17970446)
chr4 (186-324)||(27468327-27468465)
chr4 (186-367)||(27420367-27420548)
chr4 (186-342)||(27411456-27411612)
chr4 (186-342)||(27424514-27424670)
chr4 (186-324)||(27503924-27504062)
chr4 (186-327)||(27524523-27524664)
chr4 (206-342)||(27527145-27527281)
chr4 (190-325)||(27489961-27490096)
chr4 (179-324)||(27514893-27515038)
chr4 (187-342)||(27419072-27419227)
chr4 (187-342)||(27571607-27571762)
chr4 (187-324)||(27475580-27475717)
chr4 (203-340)||(27508838-27508975)
chr4 (173-242)||(27495620-27495689)
chr4 (186-342)||(27556379-27556535)
chr4 (186-237)||(27559240-27559291)
chr4 (179-218)||(27600661-27600700)
chr4 (12-49)||(27476928-27476964)
chr4 (148-284)||(27423264-27423400)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (143-322)||(1759252-1759435)
chr5 (186-342)||(1756757-1756913)
chr5 (150-373)||(1754206-1754428)
chr5 (179-345)||(1754669-1754835)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (156-365)||(55084747-55084956)
chr3 (156-365)||(38024845-38025054)
chr3 (156-365)||(38031297-38031506)
chr3 (152-342)||(38028732-38028922)
chr3 (186-342)||(38043887-38044043)
chr3 (179-342)||(50904785-50904948)
chr3 (152-342)||(38040047-38040237)
chr3 (179-342)||(50909944-50910107)
chr3 (152-342)||(38036759-38036949)
chr3 (180-365)||(50911863-50912048)
chr3 (170-342)||(48840696-48840867)
chr3 (209-342)||(38033802-38033935)
chr3 (179-218)||(55088044-55088083)
chr3 (169-351)||(38032257-38032439)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (152-342)||(21604720-21604910)
chr8 (156-365)||(21607266-21607475)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (179-342)||(3073553-3073716)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27487297 - 27486936
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaataaaactgctacaaaaaatgggtcagatatctacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27487297 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaataaaactgctacaaaaaatgggtcagatatctacg 27487198  T
Q  112 tcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27487197 tcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagtaagaccacccatt 27487098  T
Q  212 ggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27487097 ggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaattcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttct 27486998  T
Q  312 ctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27486997 ctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 27486936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 27523231 - 27523590
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaata-aaactgctacaaaaaatgggtcagatatctac 110  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||| |||||||     
T  27523231 tgaggtgaacatatttacaagcaaatatgataacaacaaaagataaaatcttttgaaggtgagaaactaaactgctacaaaac-tgggtcaaatatctat 27523329  T
Q  111 gtca-gtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccaccca 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523330 gtcatgtcctatgatatcttcaaagagctaat---tcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccaccca 27523426  T
Q  210 ttggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcatttt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||| || || | |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27523427 ttggatggtcatattcaaattgttcctcggcttcgctcaacaattcttggaatgaagtttggttcaaatatgatacaggaatcacaaaccgcttcatttt 27523526  T
Q  310 ctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523527 ctctcctacgtacactgctagatagccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 27523590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 370
Target Start/End: Original strand, 27505531 - 27505886
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaata-aaactgctacaaaaaatgggtcagatatctac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27505531 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaatgtgagaaactaaactgctacaaaaa-tgggtcaaatatctac 27505629  T
Q  111 gtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccat 210  Q
     | ||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27505630 attagtccaatgatatcttcaaagagctaat---tcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccat 27505726  T
Q  211 tggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttc 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27505727 tggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttc 27505826  T
Q  311 tctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgcc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  27505827 tctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcc 27505886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27480213 - 27479854
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgag-aataaaactgctacaaaaaatgggtcagatatctac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  27480213 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatattttgaacgtgagaaactaaactactacaaaaaatggatcaaataactac 27480114  T
Q  111 gtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  27480113 gtcagtcctatgatatcttcaaaaa---ggtaattcaattcaagtgagaattaatatctaagaaaatgtcttctctgcaaggaatggtgagaccacccat 27480017  T
Q  211 tggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  27480016 tggatgatcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaacttttggaatgatgtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaacgcttcattttc 27479917  T
Q  311 tctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27479916 tctcctacgtatactgctagatagccttttggcacgtccaaaccttttgaagatgatgccctt 27479854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 90 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27469693 - 27469419
Alignment:
Q  90 aaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27469693 aaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagagctaat---tcaattgaagtgagaggtgatatctaagaaaatttcttctctgca 27469597  T
Q  190 aggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaaggg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| ||| || || ||||||| ||||    
T  27469596 aggaatagttagaccacccattggatgttcatattcaaattgttcttcagcttggctcaacagttcttgtaatgatgtttgcttcaaatatgatataggg 27469497  T
Q  290 atcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469496 atcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgat 27469419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 27525942 - 27526299
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaata-aaactgctacaaaaaatgggtcagatatctac 110  Q
    |||| ||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27525942 tgaggtgaactttttcataaacaagtatcataacaacaaaagat-aaatcttctaaaggtgagaaactaaactgctacaaaaa-tgggtcaaatatctac 27526039  T
Q  111 gtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccat 210  Q
    |||| || |||| |||||||  ||| | |||   |||||||||  ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  27526040 gtcaatcttatggtatcttccgagagccaat---tcaattcaaacgagaagtgatctctaagaaaacgtcttctctgcaaggaatagtgagaccacccgt 27526136  T
Q  211 tggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27526137 tggatgatcatattcaaattgttcctcagcttggctcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttc 27526236  T
Q  311 tctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  27526237 tctccaacatacactgctagatatccctttggaacatcgacaccttttgaagatgatgccctt 27526299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27476921 - 27476640
Alignment:
Q  89 aaaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgc 188  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27476921 aaaaaatgagtaaaatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagagctaat---tcaatttaagtgagaggtaatatccaagaaaatgtcttctctgc 27476825  T
Q  189 aaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||  ||||| || || | |||||| |||||||||| |||    
T  27476824 aaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcactttggctcagcagttcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacagg 27476725  T
Q  289 gatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
     ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  27476724 aatcacaaaccgcttcattttctcaccaacatacactgctagatatccctttggaacgtccacggtttttgaagatgatgtcctt 27476640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 373
Target Start/End: Original strand, 27513683 - 27513963
Alignment:
Q  90 aaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgca 189  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||  | ||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||    
T  27513683 aaaattgggtcaaatatctacgtcaatactatgctaacttcaaagatttgat---tcaattcaagcgagaagtgatatctaagaatacttcttctctgca 27513779  T
Q  190 aggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaaggg 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||  |||    
T  27513780 aggaatagtgagaccacccattggatgatcatattcatattgttcttcagcttggttcaacaattcttggaacgaggtttggttcaagtatgatattggg 27513879  T
Q  290 atcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27513880 atcacaaaccgcttcattttctctcctacatacactgctagatatccttttggcacgtcaacagcttttgaagatgataccctt 27513963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Original strand, 27502011 - 27502207
Alignment:
Q  60 tcttttgaaggtgagaata-aaactgctacaaaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgag 158  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||    
T  27502011 tcttttgaaggtgagaaactaaactgctacaaaaaatgtgtcaaatatctacgtcagtcctatgatatcttcaaagagctaat---tcaatttaagtgag 27502107  T
Q  159 aagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttg 258  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27502108 aggtgatatctaagaaaatgtcttctctgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttg 27502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27501486 - 27501270
Alignment:
Q  157 agaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtct 256  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27501486 agaagtgatatctaagaacatgtcttctctacaaggaatagtgagaccacccgttggatgatcgtattcaaattgttcctcggcttggttcaacaagtct 27501387  T
Q  257 tgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagctt 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  27501386 tgaaacaatggttggtttaagtatgatattgggatcacaaaccgtttcatttcctctccaacatatactgctagacatccctttggaacctcgacacctt 27501287  T
Q  357 ttgaagatgatgccctt 373  Q
    |||||||||||| ||||    
T  27501286 ttgaagatgatgtcctt 27501270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27498585 - 27498368
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  27498585 gagaagtgatatctaagaacatgtcttctccgcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcatattcgaattgttcctcggcttggttcaacaagtc 27498486  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||  ||    
T  27498485 ttggaacgatggttggttcaagtatgatatagggatcacaaaacgtttcatttcctctccaacatatactgctagatatccctttggcatgtccacgcct 27498386  T
Q  356 tttgaagatgatgccctt 373  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  27498385 tttgaagacgatgtcctt 27498368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27460783 - 27460474
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaata-aaactgctacaaaaaatgggtcagatatctac 110  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||   ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  27460783 tgagatgaacatttttacaac----tatgataacaacaaaagattaa-tcttctgaaggatagaaactaaactgctacaaaa--tgggtcaaataactac 27460691  T
Q  111 gtcagtcctatgatatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  27460690 gtcagtcctatgatatcttcaaagagctaat---tcaaattaagtgagaggtgatatccaagaaaatgtcttctctgcaaggaatggtgagaccacccat 27460594  T
Q  211 tggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||| ||||| || |||  ||| || || ||||||| |||||||||||| | |||||| | |    
T  27460593 tggatgatcatattcaaattgttcctcactttggctcagcaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatgtcc 27460494  T
Q  311 tctcctacgtacactgctag 330  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  27460493 tctcctatgtacactgctag 27460474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 373
Target Start/End: Original strand, 27516567 - 27516796
Alignment:
Q  144 ttcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttg 243  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27516567 ttcaattcaagttagaagtgatatctaagaaaacttcttctttgcaaggaatagtgagaccccccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttg 27516666  T
Q  244 gttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgga 343  Q
    ||||||||| ||||| || |||  ||| || || ||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27516667 gttcaacaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatgtcctttcctacatacacagctagatatccctttgga 27516766  T
Q  344 acgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27516767 acgcccacagattttgaagatgatgacctt 27516796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 373
Target Start/End: Original strand, 27500295 - 27500525
Alignment:
Q  143 attcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagctt 242  Q
    ||||||||||||  |||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||    
T  27500295 attcaattcaagcaagaagtgaattctaagaaaaggtcttctctgcaaggaatagtgatgccacccattggatggtcatatccgaactgttcttcagatt 27500394  T
Q  243 ggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    || ||| ||| ||||| || ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27500395 ggctcagcaattcttggaatgaactttggtttaagtatgatatagggatcacaaatcgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccttttgg 27500494  T
Q  343 aacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27500495 tacgtccacagattttgaagatgatgacctt 27500525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27474178 - 27473845
Alignment:
Q  24 ttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgag-aataaaactgctacaaaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||  ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  27474178 ttttacatccaagtatgataacaacaaaagtgaaaatcttttgaaggttagaaactaaagtgctac-aaaaattggtcaaatatctatgtcagtcttttg 27474080  T
Q  123 atatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcata 222  Q
    |||||                ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27474079 atatc----------------ttcaattcaagcgagaagtgatgtctaagaaaacgtcttctccgcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcata 27473996  T
Q  223 ttcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtac 322  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||| ||| ||||| || |||  ||| || || ||||||| |||||||||||| | |||||| | |||||||||||||    
T  27473995 ttcaaattgttcctcactttggctcagcaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatctcctctcctacgtac 27473896  T
Q  323 actgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  27473895 acagctagatatccctttggaacacccacagattttgaagatgatgccctt 27473845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27467118 - 27466774
Alignment:
Q  24 ttttacaaccaagtatgataacaacaaaagattaaatcttttgaaggtgagaataaaactgc-tacaaaaaatgggtcagatatctacgtcagtcctatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||   || | | |||||||| ||  ||||||||||| |||| || | |     
T  27467118 ttttacatccaagtatgataacaacaaaagtggaaatcgtttgaaggttagaaactaatttcatacaaaaattga-tcagatatctatgtcaatcttcta 27467020  T
Q  123 atatcttcaaagaactaataattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcata 222  Q
    ||||||||| ||      || |||||||||||  |||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27467019 atatcttcagagc-----tacttcaattcaagctagaagtgatgtctaagaaaacttcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcata 27466925  T
Q  223 ttcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtac 322  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||| ||  ||||| ||  ||  ||| || || ||||||| |||||||||||| | |||||| | || ||||||||||    
T  27466924 ttcaaattgttcctcactttggctcagcagttcttggaataatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatctcctttcctacgtac 27466825  T
Q  323 actgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27466824 actgctagatatccctttggaacgcccacagattttgaagatgatgacctt 27466774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 365
Target Start/End: Original strand, 27444764 - 27444973
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  27444764 gagaagtaatatctaagaaaacgtcttctctgcaaggaattgtgagaccacccattggatggtcatatccgaattgttcctcggcttgattcaataattc 27444863  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||    
T  27444864 ttgaaatgatgattggctcaagtatgatattgggatcacaaacctcttcatttcctctccaacgtatactgcaagatatccctttggcacatccacgcct 27444963  T
Q  356 tttgaagatg 365  Q
    ||||||||||    
T  27444964 tttgaagatg 27444973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 158 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27557657 - 27557450
Alignment:
Q  158 gaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtctt 257  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  27557657 gaagtgatatctaagaaaacatcttctctgcatggaatagtgagaccacccattggatgaacatattcaaattgttcctcagcttgattcagcaattctt 27557558  T
Q  258 gaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || || || || ||||||||| |||| || |||||| | ||    
T  27557557 gaaatgatggttggtttaagtatgacattgggatcacaaacctcttcatttcctctccaacatatacggcaagatatccccttggcacatccacaccctt 27557458  T
Q  358 tgaagatg 365  Q
    ||||||||    
T  27557457 tgaagatg 27557450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27554479 - 27554270
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  27554479 gagaagtaatatctaagaaaacgtcttctctacaaggaattgtgagactacccgttggatgatcatatccaaattgttcctcagcttgattcagcaattc 27554380  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || |  |  ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||  ||    
T  27554379 ttgaaacgatggttggcttaacaaagaaattgatatcacaaaccgcttcatttcctctccaacatatactgcaaggtatccctttggcacatccactcct 27554280  T
Q  356 tttgaagatg 365  Q
    ||||||||||    
T  27554279 tttgaagatg 27554270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Original strand, 27431118 - 27431304
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27431118 gagaagtaatatttaagaaaacgtcttctctgcaaggaattgtgagaccaccggttggatggtcatatccaaattgttcctcggcttgattcaacaattc 27431217  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || || || || ||||| | ||||||||||||    
T  27431218 ttgaaatgacggttggttcaagtatgatattgggatcacaaacctcttcatttcatccccaacatatactgcaatatatccctttgg 27431304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Original strand, 27502771 - 27502994
Alignment:
Q  150 tcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||| |||     
T  27502771 tcaagcgagaagtgatatctacgaaaaaatcttcttcacaaggaatagtaagaccacccattggatggtcatatccaaattcttccacagcttggctcag 27502870  T
Q  250 caagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtcc 349  Q
    |||||||||||| || | ||| || || ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| || |||    
T  27502871 caagtcttgaaatgaagtttgattcaaatatgacattggaatcacaaaccgcttcatcttctctcctacataaacggcaagatatccttttggcacatcc 27502970  T
Q  350 acagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    |   ||||||||||||||| ||||    
T  27502971 aagccttttgaagatgatgacctt 27502994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27585835 - 27585653
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  27585835 tcttctgtgcaaggaatggtgagacctcccattggatgatcatatccaaactcttcttcggcttgactcatcaaatcttgaaacaatggttggttcaagt 27585736  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaa 361  Q
    ||||||  ||||||||||| | |||   ||| || || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27585735 atgatacggggatcacaaatctcttttgtttatcaccaacgcacactgcgagatatccctttggcacgtccacaacttttgaa 27585653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27425952 - 27425771
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||  |||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  27425952 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcaaattgactcaataagtcttgaaatgatggttggttcaagtatgatat 27425853  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgat 367  Q
     ||||||||| |||||||   ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  27425852 tgggatcacataccgcttttgtttctctccaacatatactgcaagatatccctttggcacgtccacagctttcgaagctgat 27425771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 367
Target Start/End: Original strand, 27570049 - 27570230
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| | || | ||| ||||||||  ||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||     
T  27570049 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccgaactcttcctcagcttgactcagcaagtcttgaaatgaaggttggcttaagtatgatac 27570148  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgat 367  Q
     ||||||||| ||||| ||  ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  27570149 ggggatcacataccgcgtctgtttctctccaacatatactgcaagatatccctttggcacatccacagcttttgaagctgat 27570230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27415768 - 27415589
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27415768 tcttctgtgcaaggaatggtgaggccacccatggaatgatcatatccaaactcttcctcagcttgactcaacaagtcttgaaacgatggttggttcaagt 27415669  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaa 361  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||   |||  | ||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  27415668 atgatatggggatcacaaatcgct---tttgttttccaacatacactgcaagatatccctttggcacatccacaacttttgaa 27415589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 361
Target Start/End: Original strand, 27565953 - 27566126
Alignment:
Q  188 caaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaag 287  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||   | ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  27565953 caaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccatgctcttcctcaacttgtatcagcaagtcttgaaacaatggttggttcaggtatgatatgg 27566052  T
Q  288 ggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaa 361  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27566053 ggatcacaaatcgcttttgtttctctccaacatacactgcaagatatccctttggcacgtccacaacttttgaa 27566126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27412804 - 27412635
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||     
T  27412804 tgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcttcagcttgactcaataagtcttgaaataatggttggttcaagtatgatat 27412705  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaa 361  Q
     ||||||||||||||      ||||||||| || ||||| || | |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  27412704 tgggatcacaaaccg------tttctctccaacatacacggcaatatatccctttggcatgtcaacagcttttgaa 27412635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27506838 - 27506679
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27506838 tgcaaggaatggtgagtccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggtttaagtatgatat 27506739  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaac 345  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||    
T  27506738 tgggatcacaaaccgcgtctgtttctctccgacatatactgcaacatagccctttggaac 27506679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 359
Target Start/End: Original strand, 27563346 - 27563519
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  ||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||     
T  27563346 tgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcttcggcttgactcagcaaatcttgaaacaatgtttggttcaagtatgatac 27563445  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttg 359  Q
     ||||||||||  | |||   ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  27563446 ggggatcacaattctcttttgtttatctccaacgtacactgcaagatagccctttggcacgtccacaacttttg 27563519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 345
Target Start/End: Original strand, 27485943 - 27486102
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  27485943 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggttcaagtatgatat 27486042  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaac 345  Q
     ||||  ||||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||    
T  27486043 tgggacaacaaaccgcttctgtttctctccaacatacactgcaacatagccctttggaac 27486102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 27497322 - 27497501
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||  | |||||||||||| |||| | ||| ||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  27497322 tgcaaggaatggtgaggccacctgtgggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgactcaacaaatattgaaacaatggttggtttaagtatgagat 27497421  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatg 365  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  27497422 agggatcacaaaccgcttttgtttatctccaacatacactgcaacatagccctttggaacttctacagattttgatgatg 27497501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Original strand, 27507777 - 27508000
Alignment:
Q  150 tcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaa 249  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||| ||| | |     
T  27507777 tcaagcgagaagtgatatctaagaaaagatcttcttcacaaggaattgtaagaccacccattggatggtcatatccaaattcttcgacagcctggctgag 27507876  T
Q  250 caagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtcc 349  Q
    ||| |||||||  || | ||| || || ||||| |  || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |  |||    
T  27507877 caactcttgaagtgaagtttgattcaaatatgacattggaattacaaaccgcttcatttttactcctacgtacaccgcaaggtatccctttggcatatcc 27507976  T
Q  350 acagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    |   ||||||||||||||||||||    
T  27507977 aagccttttgaagatgatgccctt 27508000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 345
Target Start/End: Original strand, 27478884 - 27479042
Alignment:
Q  187 gcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaa 286  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  27478884 gcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggttcaagtatgatatt 27478983  T
Q  287 gggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaac 345  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||    
T  27478984 gggacaacaaaccgcttctgtttctctccaacatacactgcaacatagccctttggaac 27479042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27567436 - 27567239
Alignment:
Q  145 tcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttgg 244  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||   |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||     
T  27567436 tcaattcaagtgagaagtgagttctaagaaagcatcttcgctgcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcataaccaaattcttcttctgtttga 27567337  T
Q  245 ttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    || |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27567336 tttagtaattcttgaaacgatggttggttcaagtatgatactggaatcacgaaccgtctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27567239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 27414304 - 27414460
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| || |  || |||||||| || |||||||| ||||||||||     
T  27414304 tgcacggaattgtaagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaatgagggttggttcaagtatgatac 27414403  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27414404 aggaatcacaaaccgtctcattttatctccaacgtagactgcaagatagccttttgg 27414460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17970446 - 17970283
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| || ||  |  ||| ||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  17970446 tcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccgaattcttcctctgcccgactcagcaagtattgaaatgaagtttggttcaagt 17970347  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  17970346 atgacgtagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaacgtacaccgcaagatatccctttgg 17970283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Original strand, 27468327 - 27468465
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| ||| || | |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  27468327 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcctcggattgactcaacaagtcttgaaatgaaggttggtttaagtatgatac 27468426  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 324  Q
    |||||  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27468427 agggactacaaaccgcaccagtttctctccaacatacac 27468465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27420548 - 27420367
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| || |||||| | ||||||||||     
T  27420548 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcaacttgactcagcaagccttgaaatgaaggttggctcaagtatgatac 27420449  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgat 367  Q
     ||||| | | ||||| ||  ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27420448 ggggattaaataccgcgtctgtttctctccaacatatactgcaagatatccctttggcacgtccacagattttgaagctgat 27420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 27411456 - 27411612
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27411456 tgcaaggaattgtgagaccacccataggatgatcatatccaaattcttcttctgcttgatttagtaattcttgaaacgatggttggttcaagtatgatac 27411555  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     || ||||| |||||  ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27411556 tggaatcacgaaccgtctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27411612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 27424514 - 27424670
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| || | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||     
T  27424514 tgcacggaatggtaagaccacccattggatgatcatatccatattcttcttcagattgatttagcaattcttgaaatgaaggttggttcaagtatgatac 27424613  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     || |||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27424614 tggaatcacaaaccgcctcatttgatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27424670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27504062 - 27503924
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| || |||||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||     
T  27504062 tgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgactcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaagtatgatac 27503963  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 324  Q
    ||| |  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27503962 aggaactacaaaccgcgccaatttctctccaacatacac 27503924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27524664 - 27524523
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||     
T  27524664 tgcacggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgattcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaaatatgatac 27524565  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgc 327  Q
    ||| |  |  |||||| ||| ||||||||| || ||||||||    
T  27524564 aggaactatgaaccgcgtcagtttctctccaacatacactgc 27524523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27527281 - 27527145
Alignment:
Q  206 cccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttca 305  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||     
T  27527281 cccatgggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgactcagcaactctagaaacgatggttggtttaagtgtgatattgggatcacaaaccgtttct 27527182  T
Q  306 ttttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27527181 gtttatctccaacatacaccgcaagatagccctttgg 27527145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27490096 - 27489961
Alignment:
Q  190 aggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaaggg 289  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  27490096 aggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgattcaacaaatcttgaaatgatggtttgtttaagtatgacacaggg 27489997  T
Q  290 atcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 325  Q
    |  |||||||| ||   ||||||||| || ||||||    
T  27489996 actacaaaccgtttttgtttctctccaacatacact 27489961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27515038 - 27514893
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| ||| || | |||  |||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  27515038 tcttctgtacaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcctcggattgactcaacaagtcttgaaatgaaggttgattcaagt 27514939  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 324  Q
    |||||| |||||  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27514938 atgatacagggactacaaaccgcaccagtttctctccaacatacac 27514893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 27419072 - 27419227
Alignment:
Q  187 gcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaa 286  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| || |  || |||||||||||||| ||| | || |||||||      
T  27419072 gcaaggaattgtaagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaacgatggctggctcaaatatgatact 27419171  T
Q  287 gggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    || ||||| |||||| ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27419172 ggaatcacgaaccgcctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27419227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27571762 - 27571607
Alignment:
Q  187 gcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaa 286  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| || |  || |||||||||||||| ||| | || |||||||      
T  27571762 gcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaacgatggctggctcaaatatgatact 27571663  T
Q  287 gggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    || ||||| |||||| ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27571662 ggaatcacgaaccgcctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27571607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 324
Target Start/End: Original strand, 27475580 - 27475717
Alignment:
Q  187 gcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaa 286  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| | ||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |    
T  27475580 gcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgactcaacaagtcttgaaatgaaggttgattcaagtatgataca 27475679  T
Q  287 gggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 324  Q
    || |  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27475680 ggaactacaaaccgcgccaatttctctccaacatacac 27475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27508975 - 27508838
Alignment:
Q  203 ccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgct 302  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||| |  ||||| |||     
T  27508975 ccacccgttggatgatcatatccaaactcttcctcagcctgattcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaaatatgacacaggaacgacaaaacgcg 27508876  T
Q  303 tcattttctctcctacgtacactgctagatatcccttt 340  Q
    ||| ||||||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  27508875 tcagtttctctccaacatacactgcaacatagcccttt 27508838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27495689 - 27495620
Alignment:
Q  173 aaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagctt 242  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||||||    
T  27495689 aaaatatcttctctgcaaggaatggtgagaccacccattggatgattaaatccaaactcttcttcagctt 27495620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 27556379 - 27556535
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||| |  |  || |||||||| || |||||||| ||  |||| |     
T  27556379 tgcatggaattgtgagaccacccatagaatgatcatatccaaattcttcttctgcttgatgtagtaattcttgaaatgaaggttggttcaataatgaaat 27556478  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27556479 gggaatcacaaatcgcttcattttttctccaacataaactgcgagatagccttttgg 27556535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Original strand, 27559240 - 27559291
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttc 237  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  27559240 tgcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcatatccaaactcttcttc 27559291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27600700 - 27600661
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgat 218  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27600700 tcttctttgcaaggaattgtgagaccacccattggatgat 27600661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 27476964 - 27476928
Alignment:
Q  12 tgagatgaacatttttacaaccaagtatgataacaaca 49  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27476964 tgagatgaacatttttacaa-caagtatgataacaaca 27476928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27423400 - 27423264
Alignment:
Q  148 attcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttc 247  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||  |||||  |||||||||  || || |||||||| |||||||  ||  |||| | ||| || |||||  ||    
T  27423400 attcaagtgagaagttatatgttggaaaacatcttccgtgcaaggaacggtgaggccacccatgggatgattgtaaccaaactcttcctcggcttgactc 27423301  T
Q  248 aacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgata 284  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27423300 aacaattcttgaaatgaaggttggttcaagtatgata 27423264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1759435 - 1759252
Alignment:
Q  143 attcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttca---- 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||        
T  1759435 attcaattcaagtgagaagtgatatctaagaaaacttcttctctgcaaagaatggtgagaccacccattggatggttgtattcaaattgttcctcagctt 1759336  T
Q  239 gcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtac 322  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1759335 gcttggctcaacaattcttggaatgatgtttggtttaaatatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtac 1759252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 1756757 - 1756913
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1756757 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtattgaaacgatggttggttcaagtatgatat 1756856  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||    
T  1756857 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 1756913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Original strand, 1754206 - 1754428
Alignment:
Q  150 tcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |     
T  1754206 tcaagcgagaagtgatatctaagaaaaggt-ttctctacaaggaatagtgagaccacccatcggatgatcatattcaaactgttcctcagatttgtttag 1754304  T
Q  250 caagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtcc 349  Q
    ||| | |||||| || | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||| |||||  |||||    
T  1754305 caatttttgaaatgacgattggttcaagtatgatacggggatcacaaaccgcttcatttcttctccaacatatacagctagatatccttttggctcgtcc 1754404  T
Q  350 acagcttttgaagatgatgccctt 373  Q
    ||  ||||||  ||||||| ||||    
T  1754405 acgccttttggggatgatgtcctt 1754428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1754835 - 1754669
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||  ||||||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  1754835 tcttctgtgcaaagaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttccgcagcttgactcaacaaggattgaaacgatggttgattcaagt 1754736  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaac 345  Q
    ||||||  |||||||||  ||| |||  ||||||||| |  |||||||| | ||| |||||||||||    
T  1754735 atgatattgggatcacatgccgtttctgtttctctccaatatacactgcaacatagccctttggaac 1754669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 55084956 - 55084747
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||  |  ||||||||||    
T  55084956 gagaagtaatatgaaagaaaacatcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccaaattcttcctccgcccgactcaacaagtc 55084857  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||| || | ||||| |    
T  55084856 ttgaaatgatggttggttcaagtaagacatagggatcacaaaccgcttcattttctctccaacatacactgcaagacacccttttggcacattcacagat 55084757  T
Q  356 tttgaagatg 365  Q
    ||||| ||||    
T  55084756 tttgatgatg 55084747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 365
Target Start/End: Original strand, 38024845 - 38025054
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  |||| ||||     
T  38024845 gagaagtaatttccatgaaaatgtcttctgtgcaaggaatcgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagtt 38024944  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    |||||| || | |||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||| || | |||||||    
T  38024945 ttgaaaggaagcttggttcaagtatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatatactgcaagatagccctttggtacattcacagct 38025044  T
Q  356 tttgaagatg 365  Q
    ||||| ||||    
T  38025045 tttgatgatg 38025054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 365
Target Start/End: Original strand, 38031297 - 38031506
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  |||| ||||     
T  38031297 gagaagtaatttccatgaaaatgtcttctgtgcaaggaatcgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagtt 38031396  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    |||||| || | |||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||| || | |||||||    
T  38031397 ttgaaaggaagcttggttcaagtatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatatactgcaagatagccctttggtacattcacagct 38031496  T
Q  356 tttgaagatg 365  Q
    ||||| ||||    
T  38031497 tttgatgatg 38031506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 38028732 - 38028922
Alignment:
Q  152 aagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaaca 251  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||  ||||||    
T  38028732 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccaaattcttcctcggcttgactcaaca 38028831  T
Q  252 agtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     || |||||| || | |||||| ||||||||    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38028832 ggttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctccaacgtacactgcaagatagccctttgg 38028922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38044043 - 38043887
Alignment:
Q  186 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 285  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||  ||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||| |     
T  38044043 tgcaaggaattgtgaggccgcccattggatgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcagcaagtcttgaaacgaagtttgattcaagtatgacat 38043944  T
Q  286 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | ||||||    
T  38043943 agggatcacaaaccgcttcatttcctctccaaagtacactgcaagatagctctttgg 38043887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 50904785 - 50904948
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||  || || ||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  50904785 tcttctctgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccgaattcatcctctgctcgactcaacaagtcttgaaatgaagtttggttcaagt 50904884  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    | || | | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  50904885 aggacatatggatcacaaaccgcttcatttcttctccaacgtacactgcaagatatccctttgg 50904948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 38040047 - 38040237
Alignment:
Q  152 aagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaaca 251  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||| | |||| ||| || |||||  ||||||    
T  38040047 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccgaattcttcctcggcttgactcaaca 38040146  T
Q  252 agtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     || |||||| || | |||||| ||||||||    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38040147 ggttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctccaacgtacactgcaagatagccctttgg 38040237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50910107 - 50909944
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  50910107 tcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaattcttcctccacttgattcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagt 50910008  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    |||| |  ||||| |||||||||  ||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  50910007 atgacatggggataacaaaccgcagcatttgctctccaacatacactgcaagataaccctttgg 50909944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 38036759 - 38036949
Alignment:
Q  152 aagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaaca 251  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||| | |||| ||| || |||||  ||||||    
T  38036759 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtattctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccgaattcttcctcggcttgactcaaca 38036858  T
Q  252 agtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    | | |||||| || | |||||| |||||||  |  ||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38036859 aattttgaaatgaagcttggttcaagtatggcatggggacaacaaaccgtttcatttgctctccaacgtacactgcaagatagccctttgg 38036949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 50911863 - 50912048
Alignment:
Q  180 cttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagta 279  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  50911863 cttctgtgcaaggaattgttaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagta 50911962  T
Q  280 tgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatg 365  Q
    |||    |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || | |||| ||||||| ||||    
T  50911963 tgacttggggatcacaaaccgtttcatcttgtctccaacatataccgcaagatagccctttggcacattcacaacttttgatgatg 50912048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 342
Target Start/End: Original strand, 48840696 - 48840867
Alignment:
Q  170 aagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggtt 269  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||  |||  | ||||||||||||||| || | ||    
T  48840696 aagaaaacatcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaattctttctccacttact-caacaagtcttgaaatgaggctt 48840794  T
Q  270 ggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    |||| |||||||  |  ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48840795 ggttcaagtatggcatggggattacaaatcgcttcatctcctctccgacgtacaatgcaagatatccctttgg 48840867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 342
Target Start/End: Original strand, 38033802 - 38033935
Alignment:
Q  209 attggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattt 308  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||| || | |||||| ||||||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  38033802 attggatggtcatatccaaattcttcctcggcttgactcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaaccgcttcattt 38033901  T
Q  309 tctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38033902 gctctccaatgtacactgcaagatagccctttgg 38033935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 218
Target Start/End: Original strand, 55088044 - 55088083
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgat 218  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  55088044 tcttctttgcatggaatagtgagaccacccattggatgat 55088083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38032439 - 38032257
Alignment:
Q  169 taagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggt 268  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||  |||  | ||||  ||||||| |||| | | ||| ||||||||  | ||     
T  38032439 taagaacatgtcttctttgcagggaattgtaagaccgcccattggatgacaataaccgaattcctcttcagattggctaagcaattcttgaaataaaggc 38032340  T
Q  269 tggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccac 351  Q
    |  || ||| ||||||  || |||| |||||   ||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  38032339 tcattcaagaatgatactggaatcataaaccttctcattttctctccaacatacactgcaagatagccttttggaacttccac 38032257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 21604720 - 21604910
Alignment:
Q  152 aagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaaca 251  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||  ||||  ||||||    
T  21604720 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatcctaattcttcctcgtcttgactcaaca 21604819  T
Q  252 agtcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
     || |||||| || | |||||| ||||||||    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  21604820 tgttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctcctacttacactgcaagatagccctttgg 21604910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 365
Target Start/End: Original strand, 21607266 - 21607475
Alignment:
Q  156 gagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtc 255  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||  || || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  |||| ||||     
T  21607266 gagaagtaatttccatgaaaatatcttctgtgcaaggaaccgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagtt 21607365  T
Q  256 ttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttggaacgtccacagct 355  Q
    |||||| || | | |||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || || |||||||||||||| || | |||| ||    
T  21607366 ttgaaaggaagctcggttcaagtatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatataccgcaagatatccctttggtacattcacaact 21607465  T
Q  356 tttgaagatg 365  Q
    ||||| ||||    
T  21607466 tttgatgatg 21607475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3073716 - 3073553
Alignment:
Q  179 tcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaagtcttgaaacgatggttggtttaagt 278  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| || ||  |  ||| ||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  3073716 tcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccgaattcttcctctgcccgactcagcaagtattgaaatgaagtttggttcaagt 3073617  T
Q  279 atgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 342  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  3073616 atgacgtagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaacgtacaccgcaagatatccctttgg 3073553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University