View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15456_low_4 (Length: 657)

Name: NF15456_low_4
Description: NF15456
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15456_low_4
NF15456_low_4
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (153-336)||(48182971-48183154)
chr4 (156-341)||(50052345-50052530)
chr4 (158-336)||(6034044-6034222)
chr4 (158-336)||(41236347-41236525)
chr4 (156-343)||(29239884-29240071)
chr4 (156-336)||(42044289-42044469)
chr4 (156-323)||(480382-480549)
chr4 (156-336)||(24995029-24995209)
chr4 (158-336)||(11511385-11511562)
chr4 (158-324)||(54473467-54473633)
chr4 (196-340)||(41823920-41824064)
chr4 (158-342)||(31910192-31910376)
chr4 (158-341)||(50526088-50526271)
chr4 (157-298)||(29234205-29234346)
chr4 (155-336)||(23608232-23608413)
chr4 (158-338)||(40574779-40574959)
chr4 (156-344)||(19670630-19670818)
chr4 (158-342)||(3481654-3481828)
chr4 (154-340)||(55475187-55475373)
chr4 (157-340)||(50813810-50813993)
chr4 (157-342)||(28480184-28480369)
chr4 (157-342)||(28481059-28481244)
chr4 (157-342)||(28481934-28482119)
chr4 (163-336)||(53352496-53352660)
chr4 (179-345)||(17983656-17983822)
chr4 (154-338)||(29977881-29978065)
chr4 (179-339)||(48647645-48647805)
chr4 (155-341)||(29547876-29548062)
chr4 (157-343)||(47986207-47986392)
chr4 (156-341)||(32766956-32767141)
chr4 (153-337)||(47104539-47104723)
chr4 (158-343)||(18924410-18924595)
chr4 (187-344)||(29589654-29589811)
chr4 (157-341)||(44536663-44536846)
chr4 (198-337)||(56300086-56300225)
chr4 (158-286)||(55079685-55079814)
chr4 (158-286)||(8343135-8343263)
chr4 (190-280)||(18769141-18769231)
chr4 (202-334)||(18768972-18769103)
chr4 (185-248)||(33703244-33703306)
chr4 (293-338)||(30036994-30037039)
chr4 (313-342)||(32939588-32939617)
chr4 (293-338)||(41327596-41327641)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (158-336)||(9474798-9474976)
chr1 (157-336)||(41758804-41758983)
chr1 (158-336)||(27564657-27564835)
chr1 (156-336)||(2581913-2582093)
chr1 (157-329)||(50630457-50630629)
chr1 (158-336)||(48716204-48716382)
chr1 (156-340)||(32813245-32813429)
chr1 (156-326)||(38632253-38632423)
chr1 (158-336)||(47452242-47452420)
chr1 (148-345)||(45044473-45044670)
chr1 (157-340)||(51898601-51898784)
chr1 (158-336)||(43132-43310)
chr1 (158-336)||(3000319-3000497)
chr1 (158-336)||(37649198-37649376)
chr1 (156-336)||(8346309-8346490)
chr1 (156-336)||(38595152-38595332)
chr1 (153-338)||(49811447-49811632)
chr1 (159-344)||(11152292-11152476)
chr1 (161-289)||(44548345-44548473)
chr1 (156-342)||(5958916-5959102)
chr1 (158-340)||(50590918-50591100)
chr1 (157-345)||(37926351-37926539)
chr1 (154-336)||(26274428-26274607)
chr1 (188-299)||(13414791-13414902)
chr1 (156-338)||(23597011-23597193)
chr1 (158-340)||(6260870-6261052)
chr1 (158-342)||(47748443-47748626)
chr1 (158-345)||(41608406-41608593)
chr1 (163-340)||(44453984-44454165)
chr1 (158-341)||(3302450-3302633)
chr1 (185-284)||(48489328-48489426)
chr1 (157-340)||(7740732-7740915)
chr1 (179-268)||(26440755-26440844)
chr1 (163-338)||(34339968-34340133)
chr1 (178-252)||(44334176-44334250)
chr1 (199-340)||(44332289-44332430)
chr1 (184-248)||(750239-750302)
chr1 (184-248)||(7447928-7447991)
chr1 (184-226)||(4401453-4401494)
chr1 (184-226)||(50448194-50448235)
chr1 (184-248)||(5489879-5489942)
chr1 (184-248)||(43571020-43571083)
chr1 (184-248)||(48498896-48498959)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (153-336)||(53982006-53982189)
chr3 (158-336)||(33644200-33644378)
chr3 (158-341)||(8076393-8076576)
chr3 (156-336)||(49607412-49607592)
chr3 (155-336)||(54868817-54868998)
chr3 (159-336)||(31456690-31456867)
chr3 (163-336)||(52629305-52629478)
chr3 (157-336)||(17470404-17470583)
chr3 (158-343)||(26141445-26141632)
chr3 (155-341)||(33118767-33118954)
chr3 (158-343)||(20764830-20765015)
chr3 (162-345)||(30801646-30801829)
chr3 (156-340)||(11347840-11348024)
chr3 (148-344)||(41189678-41189874)
chr3 (156-336)||(36707350-36707526)
chr3 (163-344)||(26754700-26754881)
chr3 (157-336)||(9562998-9563177)
chr3 (155-336)||(11095289-11095456)
chr3 (157-345)||(35536625-35536813)
chr3 (158-342)||(51419276-51419460)
chr3 (146-345)||(24699868-24700066)
chr3 (162-336)||(48587023-48587187)
chr3 (158-340)||(14623757-14623939)
chr3 (158-344)||(47531865-47532051)
chr3 (156-336)||(27714825-27714993)
chr3 (179-345)||(13897968-13898134)
chr3 (157-340)||(8956761-8956944)
chr3 (158-342)||(45058469-45058652)
chr3 (157-338)||(48375626-48375807)
chr3 (155-343)||(1758374-1758561)
chr3 (180-340)||(36331247-36331407)
chr3 (154-340)||(35965700-35965878)
chr3 (155-340)||(11907368-11907549)
chr3 (163-342)||(42823116-42823295)
chr3 (243-345)||(43746424-43746526)
chr3 (181-340)||(25407065-25407225)
chr3 (180-340)||(35093607-35093767)
chr3 (158-284)||(41080709-41080833)
chr3 (179-336)||(25395256-25395412)
chr3 (303-340)||(11140961-11140998)
chr3 (166-335)||(39670019-39670188)
chr3 (157-340)||(21746106-21746284)
chr3 (188-248)||(25413784-25413843)
chr3 (184-248)||(47190960-47191023)
chr3 (184-228)||(52629951-52629994)
chr3 (184-248)||(53581792-53581855)
chr3 (157-220)||(36331416-36331479)
chr3 (186-226)||(40480874-40480913)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (158-336)||(12831047-12831225)
chr8 (149-336)||(14547913-14548100)
chr8 (158-336)||(504043-504221)
chr8 (159-339)||(5957831-5958011)
chr8 (148-336)||(34012218-34012406)
chr8 (158-336)||(23122519-23122697)
chr8 (158-337)||(40423864-40424043)
chr8 (158-336)||(15197333-15197511)
chr8 (13-130)||(32373616-32373733)
chr8 (157-340)||(37038478-37038661)
chr8 (179-340)||(8841350-8841511)
chr8 (158-341)||(43414498-43414681)
chr8 (158-328)||(1179870-1180040)
chr8 (157-318)||(44507027-44507188)
chr8 (156-340)||(10284549-10284733)
chr8 (158-341)||(15048098-15048281)
chr8 (155-340)||(4854781-4854966)
chr8 (155-342)||(15258845-15259032)
chr8 (202-336)||(9122229-9122363)
chr8 (444-629)||(32373980-32374200)
chr8 (163-286)||(10621059-10621182)
chr8 (155-336)||(24307715-24307896)
chr8 (156-336)||(34307214-34307394)
chr8 (156-337)||(16056322-16056503)
chr8 (156-301)||(16383375-16383520)
chr8 (158-336)||(30479396-30479574)
chr8 (157-338)||(17443824-17444005)
chr8 (156-341)||(42221513-42221698)
chr8 (157-340)||(32032724-32032906)
chr8 (212-344)||(42354502-42354634)
chr8 (158-328)||(14055522-14055692)
chr8 (254-336)||(42710216-42710298)
chr8 (158-341)||(20074869-20075034)
chr8 (157-339)||(25838196-25838370)
chr8 (234-340)||(32707921-32708029)
chr8 (350-400)||(32373921-32373972)
chr8 (213-340)||(40467755-40467882)
chr8 (156-221)||(24307627-24307692)
chr8 (158-277)||(38229429-38229547)
chr8 (184-248)||(29705465-29705528)
chr8 (158-342)||(30183792-30183975)
chr8 (184-226)||(2547121-2547162)
chr8 (159-197)||(9122196-9122234)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (154-336)||(10249304-10249486)
chr2 (161-336)||(28863458-28863633)
chr2 (158-336)||(13438343-13438521)
chr2 (158-336)||(17473020-17473198)
chr2 (154-322)||(9058476-9058644)
chr2 (161-336)||(19930742-19930917)
chr2 (157-336)||(32505570-32505749)
chr2 (146-340)||(20700803-20700997)
chr2 (156-329)||(33436029-33436202)
chr2 (157-336)||(7465657-7465836)
chr2 (158-336)||(40701478-40701656)
chr2 (158-341)||(40613819-40614002)
chr2 (156-336)||(30915461-30915641)
chr2 (158-336)||(28381577-28381755)
chr2 (156-340)||(38273061-38273244)
chr2 (156-336)||(38882733-38882915)
chr2 (158-336)||(4060685-4060863)
chr2 (157-336)||(5574422-5574589)
chr2 (156-341)||(42257191-42257376)
chr2 (157-341)||(2533123-2533306)
chr2 (157-340)||(36168835-36169018)
chr2 (156-340)||(26891422-26891606)
chr2 (164-342)||(3439985-3440163)
chr2 (181-317)||(17819944-17820081)
chr2 (179-345)||(2997400-2997566)
chr2 (158-336)||(27864704-27864869)
chr2 (158-340)||(43490121-43490303)
chr2 (201-340)||(3737986-3738125)
chr2 (158-344)||(38732354-38732540)
chr2 (179-341)||(13365374-13365536)
chr2 (157-343)||(33436210-33436386)
chr2 (180-344)||(41758607-41758773)
chr2 (156-341)||(45097652-45097837)
chr2 (155-341)||(17823781-17823971)
chr2 (208-340)||(3034901-3035033)
chr2 (159-289)||(41575138-41575269)
chr2 (243-345)||(44152012-44152114)
chr2 (156-336)||(15428663-15428842)
chr2 (208-301)||(3154193-3154286)
chr2 (207-343)||(21301415-21301551)
chr2 (184-248)||(42849793-42849856)
chr2 (184-226)||(16096873-16096914)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (149-336)||(32869669-32869856)
chr6 (157-336)||(11427615-11427796)
chr6 (161-336)||(22880580-22880755)
chr6 (158-336)||(17598554-17598732)
chr6 (157-340)||(31976247-31976430)
chr6 (156-336)||(6209388-6209567)
chr6 (158-336)||(29857827-29858005)
chr6 (156-340)||(31110679-31110861)
chr6 (156-336)||(15832575-15832755)
chr6 (158-343)||(31952945-31953130)
chr6 (158-307)||(31109351-31109500)
chr6 (154-340)||(15989960-15990146)
chr6 (149-310)||(23128075-23128236)
chr6 (156-341)||(30341277-30341462)
chr6 (158-343)||(15507939-15508124)
chr6 (162-338)||(28536408-28536582)
chr6 (180-340)||(4231570-4231730)
chr6 (159-336)||(946377-946554)
chr6 (202-338)||(30870058-30870193)
chr6 (156-342)||(12732480-12732665)
chr6 (163-289)||(9379681-9379807)
chr6 (294-340)||(22421997-22422043)
chr6 (184-226)||(7367674-7367715)
chr6 (184-226)||(26669943-26669984)
chr6 (184-241)||(30014453-30014509)
chr6 (184-248)||(21280032-21280095)
chr6 (312-344)||(26466795-26466827)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (156-336)||(8080305-8080485)
chr7 (158-336)||(4999436-4999614)
chr7 (158-336)||(19329842-19330020)
chr7 (156-336)||(38837215-38837395)
chr7 (156-336)||(40957705-40957885)
chr7 (158-329)||(35137533-35137704)
chr7 (155-336)||(7389386-7389566)
chr7 (159-336)||(32951415-32951592)
chr7 (156-331)||(19436114-19436289)
chr7 (157-340)||(46033719-46033902)
chr7 (158-336)||(38267040-38267218)
chr7 (161-320)||(3783998-3784157)
chr7 (158-341)||(21234401-21234584)
chr7 (163-345)||(35522881-35523063)
chr7 (157-336)||(3434561-3434730)
chr7 (145-344)||(8238199-8238399)
chr7 (156-336)||(11044186-11044356)
chr7 (157-336)||(36361847-36362014)
chr7 (157-336)||(36362025-36362192)
chr7 (161-310)||(3694370-3694519)
chr7 (156-340)||(38044195-38044379)
chr7 (158-340)||(41423682-41423864)
chr7 (188-339)||(16374743-16374894)
chr7 (157-340)||(22343360-22343543)
chr7 (147-338)||(41915730-41915921)
chr7 (158-341)||(31735884-31736060)
chr7 (156-338)||(18207178-18207359)
chr7 (158-343)||(32564341-32564526)
chr7 (157-340)||(26296643-26296826)
chr7 (154-289)||(36208169-36208304)
chr7 (156-340)||(35468773-35468957)
chr7 (158-344)||(40846027-40846213)
chr7 (158-338)||(39255844-39256023)
chr7 (192-342)||(27744225-27744375)
chr7 (181-339)||(2318160-2318320)
chr7 (156-338)||(7727904-7728086)
chr7 (158-252)||(46374808-46374902)
chr7 (156-284)||(10343537-10343665)
chr7 (157-340)||(12310905-12311086)
chr7 (275-341)||(46374741-46374807)
chr7 (156-338)||(45223040-45223222)
chr7 (184-226)||(32029751-32029792)
chr7 (244-337)||(1766702-1766795)
chr7 (308-340)||(36208304-36208336)
chr7 (184-248)||(42972955-42973018)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (156-336)||(18520806-18520986)
chr5 (148-336)||(33149560-33149748)
chr5 (158-336)||(40145407-40145585)
chr5 (156-328)||(36732872-36733044)
chr5 (157-336)||(2740273-2740452)
chr5 (158-336)||(14831814-14831992)
chr5 (158-336)||(35785199-35785377)
chr5 (157-345)||(6679697-6679885)
chr5 (150-346)||(15409522-15409718)
chr5 (156-331)||(13811650-13811825)
chr5 (156-341)||(31008986-31009171)
chr5 (158-338)||(35943812-35943992)
chr5 (158-342)||(26720516-26720700)
chr5 (158-342)||(26990265-26990449)
chr5 (158-297)||(28177775-28177914)
chr5 (158-285)||(42414275-42414402)
chr5 (156-342)||(3921181-3921367)
chr5 (157-346)||(2252080-2252269)
chr5 (158-339)||(33825243-33825424)
chr5 (159-337)||(36875537-36875702)
chr5 (202-340)||(21370048-21370186)
chr5 (155-341)||(39688814-39689000)
chr5 (155-338)||(9603810-9603993)
chr5 (158-341)||(20073433-20073616)
chr5 (158-343)||(6259916-6260101)
chr5 (230-342)||(2177436-2177548)
chr5 (145-345)||(16327888-16328088)
chr5 (181-340)||(39557432-39557594)
chr5 (156-307)||(38296201-38296352)
chr5 (157-247)||(41470427-41470517)
chr5 (206-336)||(31132392-31132512)
chr5 (207-308)||(25831334-25831435)
chr5 (163-221)||(10356639-10356698)
chr5 (294-336)||(16115254-16115296)
chr5 (184-248)||(22512408-22512471)
chr5 (184-248)||(25914930-25914993)
chr5 (184-248)||(41334597-41334660)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (158-336)||(4029-4207)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (158-339)||(848-1029)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (158-339)||(848-1029)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (156-336)||(10031-10211)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (158-342)||(8779-8963)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (183-339)||(152523-152679)
[»] scaffold0316 (2 HSPs)
scaffold0316 (254-345)||(17199-17290)
scaffold0316 (181-284)||(17077-17175)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (184-226)||(810-851)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48183154 - 48182971
Alignment:
Q  153 tataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48183154 tataagagtaatgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcaca 48183055  T
Q  253 atttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48183054 ctttctcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 48182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50052530 - 50052345
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50052530 aagagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 50052431  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50052430 tctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcct 50052345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 6034044 - 6034222
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  6034044 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 6034143  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6034144 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 6034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 41236347 - 41236525
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41236347 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 41236446  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41236447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 41236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 29239884 - 29240071
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  29239884 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactt 29239983  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29239984 tctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 29240071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42044469 - 42044289
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  42044469 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 42044370  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  42044369 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 480549 - 480382
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  480549 aagagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactt 480450  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtg 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  480449 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtatggaaataatgggtg 480382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24995209 - 24995029
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24995209 aagagtaatgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattt 24995110  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24995109 tctcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 24995029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11511562 - 11511385
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11511562 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 11511463  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  11511462 tcttttctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtatggaaataaa-tgtgtctatgtatcatt 11511385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54473633 - 54473467
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  54473633 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttta 54473534  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgt 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  54473533 tcttttctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 54473467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 340
Target Start/End: Original strand, 41823920 - 41824064
Alignment:
Q  196 cctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggt 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  41823920 cctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggt 41824019  T
Q  296 gtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41824020 gtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 41824064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Original strand, 31910192 - 31910376
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  31910192 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacactttc 31910291  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31910292 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcctt 31910376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50526271 - 50526088
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||  ||||    
T  50526271 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgctttc 50526172  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50526171 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcct 50526088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29234346 - 29234205
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29234346 agagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 29234247  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgta 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29234246 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgta 29234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 336
Target Start/End: Original strand, 23608232 - 23608413
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |    
T  23608232 taagagtaatgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacact 23608331  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  23608332 ttctcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 23608413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Original strand, 40574779 - 40574959
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||| |||| |||| |||| ||||    
T  40574779 gagttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactttc 40574878  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40574879 tcttttctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatctaacatttt 40574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19670818 - 19670630
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  19670818 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 19670719  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    |||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19670718 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctttt 19670630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Original strand, 3481654 - 3481828
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  3481654 gagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 3481753  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || || ||| | ||||||||||| ||| ||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3481754 tctttcctcccatcttctctctttctagtgca----------tagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 3481828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 55475187 - 55475373
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||| ||| ||  |||     
T  55475187 ataagagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacac 55475286  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  55475287 tttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 55475373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50813993 - 50813810
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||  ||| |||    
T  50813993 agagttatgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacacttt 50813894  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  50813893 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 50813810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28480369 - 28480184
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| || ||||||||| |  |||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  28480369 agagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacacttt 28480270  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28480269 ctccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28480184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28481244 - 28481059
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| || ||||||||| |  |||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  28481244 agagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacacttt 28481145  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481144 ctccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28481059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28482119 - 28481934
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| || ||||||||| |  |||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  28482119 agagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacacttt 28482020  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28482019 ctccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28481934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53352660 - 53352496
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | |||||| ||    
T  53352660 atgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctcttt 53352562  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  53352561 tctctcctcttctctcttccta--------ggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 53352496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17983822 - 17983656
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  17983822 cttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctc 17983723  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17983722 ttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatttcccttttt 17983656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 29977881 - 29978065
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||     
T  29977881 ataagagtaatgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcacac 29977980  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    |||||| ||  ||| ||||| |||||  |||||| | |||||||||||  ||||||  ||||||| | | |||||||||||||||    
T  29977981 tttctctttcatcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatttt 29978065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48647805 - 48647645
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    |||||||  |||||||||  || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48647805 cttaggtaacaatacacctcttaacacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttctctttcctctcctcttctctc 48647706  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    |||||| ||||  |  ||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  48647705 ttcctagtgcatagaatgtacaaagatgtataaaaataaatgatgtctatgtaacattttc 48647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29548062 - 29547876
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    ||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| |||||| ||  ||| |    
T  29548062 taagagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagtacact 29547963  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || || ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29547962 ttttctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 29547876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 343
Target Start/End: Original strand, 47986207 - 47986392
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| |||    
T  47986207 agagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 47986306  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    ||| ||  | | |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  47986307 ctctttcttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatg-caattaaaggtgtctatgtaacattttccttt 47986392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Original strand, 32766956 - 32767141
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||| ||||||  ||| ||    
T  32766956 aagagttatgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactt 32767055  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||| ||  ||| ||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  32767056 tctctttcttcttctcctctctctttctaatacatagagtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcct 32767141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 337
Target Start/End: Original strand, 47104539 - 47104723
Alignment:
Q  153 tataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||    | |||||| ||||||||||    
T  47104539 tataagagtaatgatatatagacattcttagatgacaatacactctctgacacccacacaaaaatttgacacgtggttttattgaccccacacaaacaca 47104638  T
Q  253 atttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattt 337  Q
     |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |   |||| |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  47104639 ctttctctttcatctcctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtactagaatgtacgagaataaaaagtgtctacgtaacattt 47104723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18924595 - 18924410
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |  |  || || ||||||||  ||| ||||    
T  18924595 gagttatgatccataaatacccttaggtggcaatacaccccttgatatccacacaaaaatctgacatgtggcaatatgaactccgcacaagtacactttc 18924496  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18924495 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 18924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29589811 - 29589654
Alignment:
Q  187 gcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaat 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | ||  |||||||| |||||  ||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  29589811 gcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaat 29589712  T
Q  287 gcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
     || | |||||||||  |||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29589711 acatgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaatattttcctttt 29589654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44536846 - 44536663
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| || ||  ||| |||    
T  44536846 agagttatgatacataaacacttttaggtggcaatacaccctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatagaccccacataagtacacttt 44536748  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  44536747 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagaatgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcct 44536663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 56300225 - 56300086
Alignment:
Q  198 tttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgt 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||  || | || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||| | | | |||    
T  56300225 tttgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaatcctgcacaaacacactttctctttcctctcctcttctctctttctaatgtatgagatgt 56300126  T
Q  298 acaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattt 337  Q
    ||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  56300125 acaagattgtatgagaataaagaatgtctacgtaacattt 56300086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55079814 - 55079685
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgga-ccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||  |||| |||| |||||  ||| |||    
T  55079814 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggacccccacacaagtacacttt 55079715  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaat 286  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  55079714 ctctttcttcttctcttctctcttcctaat 55079685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8343263 - 8343135
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||  ||||||||||| ||  | | ||||    
T  8343263 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcctttgacacctacataaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcataagtatactttc 8343164  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaat 286  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  8343163 tctttcttcttctcttctctcttcctaat 8343135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 280
Target Start/End: Original strand, 18769141 - 18769231
Alignment:
Q  190 atacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctctt 280  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||| ||| |||||| ||  |||||| || ||||||    
T  18769141 atacaccctctaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcatgtaaaccccacacaaatacattttctctttcatctccttttttctctt 18769231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18769103 - 18768972
Alignment:
Q  202 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||| |||||||||| |||||| ||  |||| | || |||||||||||| | | ||||||||||    
T  18769103 acacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtaaatcccacacaaacacattttctctttcatctcattttttctcttcctaatac-atgggtgtacaa 18769005  T
Q  302 aggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaaca 334  Q
     | ||||||||  |||| | ||| |||||||||    
T  18769004 ggatgtatgagggtaaatgatgtttatgtaaca 18768972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33703306 - 33703244
Alignment:
Q  185 tggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||    
T  33703306 tggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaa 33703244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Original strand, 30036994 - 30037039
Alignment:
Q  293 ggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30036994 ggtgtacaaggatgtatgaaaataaagggtgtctatgtaatatttt 30037039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32939617 - 32939588
Alignment:
Q  313 aataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32939617 aataaagggtgtctatgtaacattttcctt 32939588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Original strand, 41327596 - 41327641
Alignment:
Q  293 ggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41327596 ggtgtacaatggggtgtgtgaataaagggtgtctatgtaacatttt 41327641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9474976 - 9474798
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9474976 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 9474877  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9474876 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 9474798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 41758804 - 41758983
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41758804 agagtaatgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacacttt 41758903  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41758904 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 41758983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27564835 - 27564657
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27564835 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttc 27564736  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27564735 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 27564657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 2581913 - 2582093
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  2581913 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 2582012  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  2582013 tcttttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaagggtgtttatgtatcatt 2582093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 329
Target Start/End: Original strand, 50630457 - 50630629
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  50630457 agagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 50630556  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatg 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  50630557 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatg 50630629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48716382 - 48716204
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  48716382 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttta 48716283  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48716282 tcttttctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48716204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 32813245 - 32813429
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  32813245 aagagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactt 32813344  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32813345 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 32813429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 38632423 - 38632253
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  38632423 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 38632324  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtct 326  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38632323 tttcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtct 38632253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47452420 - 47452242
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  47452420 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 47452321  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  47452320 tcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcatt 47452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45044670 - 45044473
Alignment:
Q  148 ttttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa 247  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  45044670 ttttttttaagagttatgatacatacatttccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaa 45044571  T
Q  248 acacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  45044570 acacattttctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacattttccttttt 45044473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51898784 - 51898601
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  51898784 agagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 51898685  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51898684 ctatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 51898601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 43132 - 43310
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  43132 gagtaatgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttc 43231  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  43232 tcttttctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaagggtatctatgtatcatt 43310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 3000319 - 3000497
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  3000319 gagtaatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 3000418  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| ||||    
T  3000419 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 3000497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 37649198 - 37649376
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||| ||||    
T  37649198 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactttc 37649297  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37649298 ccttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 37649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8346490 - 8346309
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  8346490 aagagtaatgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactt 8346391  T
Q  256 tctcctttctctcctc-ttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  8346390 tctcttttctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaatggtatttatgtatcatt 8346309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 38595152 - 38595332
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  38595152 aagagtaatgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactt 38595251  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| ||||    
T  38595252 tctcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 38595332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49811632 - 49811447
Alignment:
Q  153 tataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| ||||    
T  49811632 tataagagttatgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcaca 49811533  T
Q  253 atttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49811532 ctttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 49811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11152476 - 11152292
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttct 258  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||    
T  11152476 agtaatgaaacatagacac-cttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttct 11152378  T
Q  259 cctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
      || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11152377 ttttcctctcctcttctctcttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatataacattttcctttt 11152292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44548473 - 44548345
Alignment:
Q  161 taatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcc 260  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  44548473 taatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 44548374  T
Q  261 tttctctcctcttctctcttcctaatgca 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44548373 tttctctcttcttctctcttcctaatgca 44548345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5959102 - 5958916
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  5959102 aagagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactt 5959003  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    |||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5959002 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcctt 5958916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50591100 - 50590918
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  50591100 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 50591001  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  50591000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 50590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37926539 - 37926351
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||  ||| |||    
T  37926539 agagttatgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacacttt 37926440  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  37926439 ctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctatataatattttccatttt 37926351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Original strand, 26274428 - 26274607
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  |||     
T  26274428 ataagaataatgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtacac 26274527  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||| || |||||   ||||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26274528 tttttcttttct---ctcttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 26274607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 299
Target Start/End: Original strand, 13414791 - 13414902
Alignment:
Q  188 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  13414791 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttctatcatcttctctcttcctaatg 13414890  T
Q  288 caaggggtgtac 299  Q
    || || ||||||    
T  13414891 catggagtgtac 13414902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23597193 - 23597011
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  23597193 aagagtaatgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacactt 23597094  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    | || |||||||||| |||||| |||||| | || | ||||| ||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23597093 tatcttttctctcctattctctattcctagttcatgaggtgtccaaggatgtatgagaataaaaaatgtctatgtaacatttt 23597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Original strand, 6260870 - 6261052
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  6260870 gagttatgatagatagatatccttaggtggtaatacacccctgaacacccacataaaaatctaacatgtggtcacgtggaccccgcataagcacattttc 6260969  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |  ||  |||||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6260970 tatttcttctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaatggtgtgtatgtaacattttcc 6261052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Original strand, 47748443 - 47748626
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || | ||  |||| |||||||||  | | ||||    
T  47748443 gagttatgatacataaatacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactttc 47748541  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47748542 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 47748626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41608593 - 41608406
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||  ||| ||||    
T  41608593 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacactttc 41608494  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41608493 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacattttccatttt 41608406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 44453984 - 44454165
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||| ||| || ||    
T  44453984 atgatacatagacacctttaagtggcaatacatctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacactttttcttt 44454083  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggt----gtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44454084 cctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtcagagtataagggtgtataagaataaatggtgtttatgtaacattttcc 44454165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3302633 - 3302450
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||| |||| ||||    
T  3302633 gagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttc 3302534  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |  ||  |||| ||||||||||||| |||  |  |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3302533 tttttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgttaataaaggatgtttatataacattttcct 3302450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Original strand, 48489328 - 48489426
Alignment:
Q  185 tggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttccta 284  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  48489328 tggcaatacaccctg-gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcccgcacaagcacattttctattttctcacctcttctctcttccta 48489426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 7740732 - 7740915
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||| ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||| |  | ||||||||| |||||| | | |||    
T  7740732 agagttatgatacattgacaaccttatgtgacaatacatccattgacacctacataaaaatatgacacgtggctatgtggaccccacacaaatatatttt 7740831  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  7740832 ctttttcatctcctcttctctcttcctgttgcatgggatgtacaaagatgtacgagaataaagggtatccatgtgacatcttcc 7740915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Original strand, 26440755 - 26440844
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctc 268  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  26440755 cttagatgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactttctcttttctctc 26440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34340133 - 34339968
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||        ||||| || | || |||| |||||  ||    
T  34340133 atgatacatagacactcttaggtggtaatacacctgttgatgcc-acacaaaaatctgacacgt--------ggacctcgtataagcacagtttcttttt 34340043  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34340042 tctcttctcttctctcttccaagtgcatagggtgtacaagagtgt-tgaaaataaaaggtgtctatgtaacatttt 34339968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44334250 - 44334176
Alignment:
Q  178 tcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44334250 tctttggtggtaatacacacattgacatccacacaaaaacctgacacgtagtcacatggacccagcacaaacaca 44334176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44332430 - 44332289
Alignment:
Q  199 ttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgta 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | |   ||||||||||||||  | | |||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  44332430 ttgacacccacataaaaatctgacatgtggccctatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagagtgta 44332331  T
Q  299 caaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  44332330 caagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 44332289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 750239 - 750302
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  750239 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaa 750302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7447991 - 7447928
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  7447991 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 7447928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4401494 - 4401453
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4401494 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 4401453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 50448194 - 50448235
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50448194 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 50448235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5489942 - 5489879
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  5489942 gtggcaatacacccttt-acacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 5489879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 43571020 - 43571083
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  43571020 gtggcaatacacccttt-acacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 43571083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 48498896 - 48498959
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  48498896 gtggcaatacacccttt-acacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 48498959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Original strand, 53982006 - 53982189
Alignment:
Q  153 tataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53982006 tatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcaca 53982105  T
Q  253 atttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  53982106 ctttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 53982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 33644200 - 33644378
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33644200 gagtaatgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33644299  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33644300 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 33644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Original strand, 8076393 - 8076576
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8076393 gagtaatgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8076492  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8076493 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcct 8076576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 49607412 - 49607592
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  49607412 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactt 49607511  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49607512 tctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 49607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 54868998 - 54868817
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  54868998 taagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacact 54868899  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  54868898 ttctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 54868817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 159 - 336
Target Start/End: Original strand, 31456690 - 31456867
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttct 258  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31456690 agtaatgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttct 31456789  T
Q  259 cctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  31456790 cttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgcatgggaataaagggtgtttatgtatcatt 31456867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Original strand, 52629305 - 52629478
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||    
T  52629305 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 52629404  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  52629405 tctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 52629478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 17470404 - 17470583
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  17470404 agagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacacttt 17470503  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17470504 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 17470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26141632 - 26141445
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||    
T  26141632 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcacactttc 26141533  T
Q  258 tcctttctctcctcttc--tctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26141532 tcttttctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 26141445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33118954 - 33118767
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |    
T  33118954 taagagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacact 33118855  T
Q  255 ttctcctttctctcct-cttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33118854 ttctctttcctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacattttcct 33118767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20765015 - 20764830
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  20765015 gagttatgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacactttc 20764916  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20764915 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 20764830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30801829 - 30801646
Alignment:
Q  162 aatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcct 261  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  30801829 aatgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacattttctctt 30801730  T
Q  262 ttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    | ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30801729 tcctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccttttt 30801646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11348024 - 11347840
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  11348024 aagagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactt 11347925  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11347924 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccattttcc 11347840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41189874 - 41189678
Alignment:
Q  148 ttttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa 247  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  41189874 ttttttgtaagagttatgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaa 41189775  T
Q  248 acacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41189774 gcacactttctcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 41189678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36707526 - 36707350
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     |||| ||    
T  36707526 aagagtaatgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactt 36707431  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  36707430 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 36707350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 344
Target Start/End: Original strand, 26754700 - 26754881
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  26754700 atgattcatagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctcttt 26754799  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
     |||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26754800 cctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagagtgtctatgtaacattttcctttt 26754881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 9562998 - 9563177
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  9562998 agagtaatgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacacttt 9563097  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9563098 ctctcttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaagggtatctatgtatcatt 9563177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 155 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11095456 - 11095289
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  11095456 taagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt--accccgcataaacacact 11095359  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||            ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11095358 tt------------ctcttttctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11095289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Original strand, 35536625 - 35536813
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||   ||||| |||| ||     
T  35536625 agagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttc 35536724  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35536725 ctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttttt 35536813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51419460 - 51419276
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  51419460 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacactttc 51419361  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51419360 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacattttcctt 51419276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24700066 - 24699868
Alignment:
Q  146 tattttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcac 245  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    
T  24700066 tatttttttttagagtaatgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtac 24699967  T
Q  246 aaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |  | | ||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24699966 aaacacactttctctttcctctcctcttctctcttcctagtttatgaggtgta-taagatgtatgagaataaaagatgtctatgtaacattttccttttt 24699868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48587187 - 48587023
Alignment:
Q  162 aatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcct 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||       
T  48587187 aatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttct--- 48587091  T
Q  262 ttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
           || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48587090 -------cttttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtatatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48587023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14623939 - 14623757
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| | ||||| |||| ||||    
T  14623939 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttc 14623840  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    || ||  ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14623839 tctttcatcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 14623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 344
Target Start/End: Original strand, 47531865 - 47532051
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||| ||||    
T  47531865 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacactttc 47531964  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47531965 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcctttt 47532051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27714993 - 27714825
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  27714993 aagagtaatgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactt 27714894  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |            |||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  27714893 t------------ctcttctctcttcccaatacatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagagtgtatatgtatcatt 27714825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13898134 - 13897968
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||| |||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  13898134 cttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttctctttcatcttctcttctctc 13898035  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    | |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13898034 tccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatctaacatttttcttttt 13897968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 8956761 - 8956944
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||   ||||| |||| ||     
T  8956761 agagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttc 8956860  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8956861 ctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacattttcc 8956944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45058652 - 45058469
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||  | | ||||    
T  45058652 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatactttc 45058554  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45058553 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 45058469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48375807 - 48375626
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||| |  | | ||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  48375807 agagttatgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacatttt 48375708  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    |  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48375707 ctctttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaagatgtatggaaataaagggtgtctatgtaacatttt 48375626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1758561 - 1758374
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccct--ttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    ||||||| |||||||||||  |  | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||||||||||    
T  1758561 taagagttatgatacatagtcaaccataggttgcaatacaccccccttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacaca 1758462  T
Q  253 atttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
     |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  1758461 ttttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgc-atgggtgtacaaaggtgtat--gaataaacagtgtttatgtaacatttttcttt 1758374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 180 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36331407 - 36331247
Alignment:
Q  180 ttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctct 279  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  36331407 ttaggtggcaatgcaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctct 36331308  T
Q  280 tcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||    
T  36331307 tcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaagatgtatatgtaacattttcc 36331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35965878 - 35965700
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||| || |||||| ||||     
T  35965878 ataagagtaatgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacacgt--------ggatcctgcacaagcacac 35965787  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35965786 tttctctttcctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 35965700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 340
Target Start/End: Original strand, 11907368 - 11907549
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| | |  |||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||| |    
T  11907368 taagagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacatt 11907467  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgca-aggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||| |||||||||||||||   |      ||||   ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907468 ttctcttttctctcctcttcttagt-----gtgcattagggtggacaaagatgtatgaaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 11907549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 342
Target Start/End: Original strand, 42823116 - 42823295
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||| | ||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | | |||||| ||    
T  42823116 atgatacataaacaccattatgtggtaatacaccccttgacacccacaaaaaaatttgacatgtggtcatatggaccccgcataagtatactttctcttt 42823215  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
      | | |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42823216 cttattctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 42823295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 345
Target Start/End: Original strand, 43746424 - 43746526
Alignment:
Q  243 cacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43746424 cacaaacacaatttctctttcatctcctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgacaacaaagggtgtttatgtaacatttttctt 43746523  T
Q  343 ttt 345  Q
    |||    
T  43746524 ttt 43746526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25407225 - 25407065
Alignment:
Q  181 taggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaa-tctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctct 279  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||  |||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  25407225 taggtggcaatataccccttgacacacacacaaaaaatctgacacgtgatcatatggatcccacacaaacacactttctctttcatctcctcttctctct 25407126  T
Q  280 tcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
      |||||| |   |||||| |||  | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25407125 cactaatgtataaggtgtataaatatatataagaataaagggtgactatataacattttcc 25407065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 340
Target Start/End: Original strand, 35093607 - 35093767
Alignment:
Q  180 ttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctct 279  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||  |||| |||| |||||| |   |||  | ||||||||    
T  35093607 ttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttctcttgcatctttttttctctct 35093706  T
Q  280 tcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  35093707 tcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacattttcc 35093767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 284
Target Start/End: Original strand, 41080709 - 41080833
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  41080709 gagtaatgatacatagacatccttag-tagcaaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtgga-cccacacaagcacattttc 41080806  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttccta 284  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||    
T  41080807 tctttcatctcctcttctctcttccta 41080833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25395412 - 25395256
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    |||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| || |  |  | |||||| |||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||    
T  25395412 cttatgtggccatacatcccttaatacccacacaaaaatctgacatgtggctatatagaccccacacaaacacattttctctttcatcttctcttttctc 25395313  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||| | || ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  25395312 tttctagtacatggg-tgtacaaagatgtatgaggataaaagatgtctatgtaacatt 25395256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11140998 - 11140961
Alignment:
Q  303 ggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11140998 ggtgtatgagactaaagggtgtctatgtaacattttcc 11140961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 335
Target Start/End: Original strand, 39670019 - 39670188
Alignment:
Q  166 atacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttct 265  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||| | || |||||| | | | |||||| ||||||||  ||| ||||||| || |||  |||| || ||| |||||    
T  39670019 atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacacttcctcttttct 39670118  T
Q  266 ctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacat 335  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | | ||||||| |||||| |  |||||| | ||||| ||||||||    
T  39670119 ctcctcttctctcttcttaatgtatgagatgtacaagggtgtacggaaataaatgatgtctgtgtaacat 39670188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21746284 - 21746106
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacaccc--acacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||||||||        ||||||  |||| |||| |    
T  21746284 agagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctggacacccccacacaaaaatctgacacgta-------agaccccatacaagcacact 21746192  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||| ||  |||| ||||||||||||| |||  | | ||||||||| ||||||||  |||||| | |||| |||||| |||||||    
T  21746191 ttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatgaggtgtacaagggtgtatgtaaataaatgatgtccatgtaatattttcc 21746106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25413843 - 25413784
Alignment:
Q  188 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  25413843 caatacacccttt-acacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacacaaa 25413784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 47190960 - 47191023
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || || |||||||| ||||||    
T  47190960 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaa 47191023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52629994 - 52629951
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtag 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52629994 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtag 52629951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 53581792 - 53581855
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  53581792 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 53581855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36331479 - 36331416
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctg 220  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36331479 agagttatgatacataaacacccttagatggcaatgcaccccttgacatccacacaaaaatctg 36331416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40480913 - 40480874
Alignment:
Q  186 ggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40480913 ggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 40480874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 12831047 - 12831225
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12831047 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 12831146  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12831147 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 12831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 149 - 336
Target Start/End: Original strand, 14547913 - 14548100
Alignment:
Q  149 tttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14547913 ttttgataagagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaag 14548012  T
Q  249 cacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14548013 cacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14548100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 504221 - 504043
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  504221 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacattc 504122  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  504121 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 504043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 339
Target Start/End: Original strand, 5957831 - 5958011
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttct 258  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  5957831 agtaatgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttct 5957930  T
Q  259 cctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5957931 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttc 5958011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34012406 - 34012218
Alignment:
Q  148 ttttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa 247  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34012406 ttttttttatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaa 34012307  T
Q  248 acacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34012306 gcacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 34012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23122697 - 23122519
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  23122697 gagtaatgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 23122598  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23122597 tcttttctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 23122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40424043 - 40423864
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  40424043 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 40423944  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattt 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40423943 tcttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattt 40423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 15197333 - 15197511
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15197333 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 15197432  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  15197433 tcttttctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcatt 15197511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 32373616 - 32373733
Alignment:
Q  13 atactcaaaaagtatgtataaaatcccaattttaataagattgtgtacgagtaaaagaaaacagagaggttgtatattgaaatatgtatgagaaaatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373616 atactcaaaaagtatgtataaaatcccaattttaataagattgtgtacgagtaaaagaaaacagagaggttgtatattgaaatatgtatgagaaaatata 32373715  T
Q  113 taccataaaataaattta 130  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32373716 taccataaaataaattta 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 37038478 - 37038661
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  37038478 agagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 37038577  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37038578 ctatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37038661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8841511 - 8841350
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||     
T  8841511 cttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctctt 8841412  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8841411 ttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 8841350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43414681 - 43414498
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  43414681 gagttatgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactttc 43414582  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43414581 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacattttcct 43414498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1180040 - 1179870
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  1180040 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacactttc 1179941  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctat 328  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||    
T  1179940 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatatatgggaataaaggatgtctat 1179870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 157 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44507188 - 44507027
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||    
T  44507188 agagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatacttt 44507089  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaa 318  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44507088 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaa 44507027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10284733 - 10284549
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10284733 aagagttatgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 10284634  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| || || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10284633 tctctttcctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 10284549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15048281 - 15048098
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15048281 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactttc 15048183  T
Q  258 tcctttc-tctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15048182 tctttttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctatataacattttcct 15048098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4854966 - 4854781
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | || | ||| ||||||| |||||| |||| |    
T  4854966 taagagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacact 4854867  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4854866 ttctcttttctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacattttcc 4854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15259032 - 15258845
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |    
T  15259032 taagagttatgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacatt 15258933  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    |  || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15258932 ttctctttcctctcctcttctctcttcctagaatataggatgtacaaaagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 15258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 9122229 - 9122363
Alignment:
Q  202 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9122229 acacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaa 9122328  T
Q  302 aggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
      ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  9122329 gagtgtatgggaataaagaatgtctatgtatcatt 9122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 444 - 629
Target Start/End: Original strand, 32373980 - 32374200
Alignment:
Q  444 gtggggggtctaacaaatcaaccaaactcaagttttcattattatccaggtgggtaaactaagtta------------------ttttgatgtgaatatt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                  |||||||||||||| |    
T  32373980 gtggggggtctaacaaatcaaccaaactcaagttttcattattatccaagtgggtaaactaagttattttgatgtgctagaaacttttgatgtgaatagt 32374079  T
Q  526 ctttatcctaattggataaaatatatttcaga-----------------tggtgcatcttctggagtgcttggaaaagcatttgtggaggcatgtttaga 608  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32374080 ctttatcctaattggataaaatgtatttcagatggtgcatcttctcagatggtgcatcttctgaagtgcttggaaaagcatttgtggaggcatgtttaga 32374179  T
Q  609 tcaagtcaagctggtcatatg 629  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  32374180 tcaagtcaagctgatcatatg 32374200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10621182 - 10621059
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| |||||| ||    
T  10621182 atgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctcttt 10621083  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10621082 tctctcctcttctctcttcctaat 10621059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24307896 - 24307715
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || | ||  ||||||||||||||  ||| |    
T  24307896 taagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaagtacact 24307797  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  24307796 ttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 24307715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 34307214 - 34307394
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  || |||||||||||  ||| ||    
T  34307214 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactt 34307313  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  34307314 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16056503 - 16056322
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | |  |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  16056503 aagagttatgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 16056404  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattt 337  Q
    |||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  16056403 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattt 16056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Original strand, 16383375 - 16383520
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  16383375 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 16383474  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaa 301  Q
    |||| ||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16383475 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaa 16383520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30479574 - 30479396
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |  |  |||||| |||||||  ||| ||||    
T  30479574 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttc 30479475  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  30479474 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 17443824 - 17444005
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  17443824 agagttatgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacacttt 17443923  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||||| | |||| | | ||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  17443924 ctctttcatcttctcttctctcttcccagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacatttt 17444005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Original strand, 42221513 - 42221698
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||| |||| ||    
T  42221513 aagagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactt 42221612  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||| |||  |  |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  42221613 tctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtttatataacattttcct 42221698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 32032724 - 32032906
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || | ||  |||| || ||||||  ||| |||    
T  32032724 agagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacacttt 32032822  T
Q  257 ctcctttctc-tcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  32032823 ctc-tttctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32032906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42354634 - 42354502
Alignment:
Q  212 aaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatga 311  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| | | || || |||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  42354634 aaaaatctgacacgtgttcatgtggatctcacataagcacactttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatga 42354535  T
Q  312 gaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42354534 gaataaatggtgtctatgtaacattttcctttt 42354502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14055692 - 14055522
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc-gcacaaacacaattt 256  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| | || |||    
T  14055692 gagttatgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cacttt 14055594  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctat 328  Q
     || || ||||  |||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14055593 ttctttcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaatagtgtctat 14055522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42710298 - 42710216
Alignment:
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  42710298 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctgtgtatcatt 42710216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20075034 - 20074869
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||        ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20075034 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtga--------cacgtggaccctgcacaagcacactttc 20074943  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||| | || |          |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20074942 tctttcctcttctcttctctcttcctagttcatg----------aggtgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacattttcct 20074869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 339
Target Start/End: Original strand, 25838196 - 25838370
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| |||    
T  25838196 agagttatgataaatagatatccttaggtggcaatacactttttgacatccacacaa--------cacgttgtcacatggactccgtacaagcacacttt 25838287  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||||| | ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  25838288 ttcttttctctcctcttctcttttgctaatgtatagggtgtacaaggttgtatggcaataaaggatatctatgtaacattttc 25838370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32708029 - 32707921
Alignment:
Q  234 tggaccccgcacaa--acacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgta 331  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  32708029 tggaccccgcacaagtacacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgta 32707930  T
Q  332 acattttcc 340  Q
    |||||||||    
T  32707929 acattttcc 32707921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 400
Target Start/End: Original strand, 32373921 - 32373972
Alignment:
Q  350 ttttataacaagaggaaatgacaacaaaa-ataagtatcaagatgagggaag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32373921 ttttataacaagaggaaatgacaacaaaagataagtatcaagatgagggaag 32373972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 340
Target Start/End: Original strand, 40467755 - 40467882
Alignment:
Q  213 aaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgag 312  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||||  | |||| |    
T  40467755 aaaatctgacatgtgaccacgtggacttcgcacaagcacactttctctttcctctcatcttctctcttcctagtctatggggtgtacaaaaatttatggg 40467854  T
Q  313 aataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40467855 gataaaaggtgtctatgtaacattttcc 40467882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 24307627 - 24307692
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctga 221  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24307627 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaatctga 24307692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 277
Target Start/End: Original strand, 38229429 - 38229547
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | | |||| |||| ||||    
T  38229429 gagttatgatacatgaacactcttaggtggcaatacgctcct-gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggattctgtacaagcacattttc 38229527  T
Q  258 tcctttctctcctcttctct 277  Q
    || || |||| |||||||||    
T  38229528 tctttcctcttctcttctct 38229547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29705528 - 29705465
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  29705528 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaa 29705465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30183975 - 30183792
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||  | | ||||| || |||||||||||| ||||| |||  |||||  |  | || |||| ||||    
T  30183975 gagtaatgatacatatacatccttacgtggcaatacattcctggacactcatacaaaaatctgatacgtaatcatatggacttcatataagcacactttc 30183876  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || ||||  || |||||| |||||| |||  | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30183875 tc-tttcattcatcttctttcttccaaatatatggggtgtacaagagtgtatgtaaataaaggatgtctatctaacattttcctt 30183792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2547162 - 2547121
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2547162 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 2547121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 9122196 - 9122234
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccc 197  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9122196 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccc 9122234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10249486 - 10249304
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10249486 ataagagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 10249387  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10249386 tttctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 161 - 336
Target Start/End: Original strand, 28863458 - 28863633
Alignment:
Q  161 taatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcc 260  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  28863458 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 28863557  T
Q  261 tttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28863558 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28863633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 13438343 - 13438521
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13438343 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 13438442  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13438443 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 13438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 17473020 - 17473198
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  17473020 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 17473119  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17473120 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 17473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 322
Target Start/End: Original strand, 9058476 - 9058644
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  9058476 ataagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacac 9058575  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggt 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  9058576 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggt 9058644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 161 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19930917 - 19930742
Alignment:
Q  161 taatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcc 260  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  19930917 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactttctct 19930818  T
Q  261 tttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19930817 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 19930742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32505749 - 32505570
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32505749 agagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 32505650  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32505649 ctattttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 32505570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Original strand, 20700803 - 20700997
Alignment:
Q  146 tattttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcac 245  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20700803 tattttctaaaagagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcat 20700902  T
Q  246 aaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20700903 aagcacactttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 20700997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33436202 - 33436029
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33436202 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 33436103  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatg 329  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33436102 tctctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatg 33436029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7465836 - 7465657
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  7465836 agagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacacttt 7465737  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7465736 ctcttttatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 7465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 40701478 - 40701656
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40701478 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 40701577  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  40701578 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 40701656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40614002 - 40613819
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  40614002 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 40613903  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || |||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40613902 tcttttctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcct 40613819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 30915461 - 30915641
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  30915461 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactt 30915560  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| ||||    
T  30915561 tctcttttctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 30915641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28381755 - 28381577
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  28381755 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcacactttc 28381656  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28381655 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28381577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38273244 - 38273061
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||    
T  38273244 aagagttatgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactt 38273145  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  38273144 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtac-aagatgtatgagaataaatggtgtttatgtaatattttcc 38273061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38882915 - 38882733
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc---gcacaaacaca 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||    
T  38882915 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgca 38882817  T
Q  253 atttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
     |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  38882816 ctttctcttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtctctatgtatcatt 38882733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 4060685 - 4060863
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||    
T  4060685 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4060784  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||| ||||    
T  4060785 ttttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaagatgtttatgtatcatt 4060863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5574589 - 5574422
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  5574589 agagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 5574490  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
                ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5574489 ------------ctcttttctcttcctaatgcatggcgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 5574422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Original strand, 42257191 - 42257376
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||    
T  42257191 aagagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactt 42257290  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42257291 tctcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgtaatattttcct 42257376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 341
Target Start/End: Original strand, 2533123 - 2533306
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||    
T  2533123 agagttatgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacacttt 2533221  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
     || ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2533222 ttcttttatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtatatataacattttcct 2533306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 36168835 - 36169018
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || | |||    
T  36168835 agagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatacttt 36168934  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36168935 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 36169018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26891606 - 26891422
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||| ||    
T  26891606 aagagttatgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattt 26891507  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26891506 tctctttcctcttctcttctctcttcctaatatacagggtgtaaaaatgtgtatgaaaattaagggtgtatatgtaacattttcc 26891422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 342
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440163
Alignment:
Q  164 tgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctccttt 263  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  264 ctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||||||||||||||| |||    |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3440085 ctctcctcttctctctttctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 3440163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17820081 - 17819944
Alignment:
Q  181 taggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctctt 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17820081 taggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacacattttctctttcatctcctcttctctctt 17819982  T
Q  281 cctaatgcaaggggtgtac-aaaggtgtatgagaataa 317  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  17819981 cctaatgcatgaggtgtacaaaaggtttatgagaataa 17819944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2997566 - 2997400
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  2997566 cttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctc 2997467  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  2997466 ttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatttcccttttt 2997400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 27864704 - 27864869
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  27864704 gagtaatgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactttc 27864803  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||             | |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27864804 tc-------------tttctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtcaatgtatcatt 27864869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Original strand, 43490121 - 43490303
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| |||     
T  43490121 gagttatgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttta 43490220  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  43490221 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 43490303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Original strand, 3737986 - 3738125
Alignment:
Q  201 gacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| ||||||||    |  |||||||||    
T  3737986 gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctcctcttctttcttcctagaatatagggtgtaca 3738085  T
Q  301 aaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3738086 aaggtgtatgaaaatatagggtgtctatgtaacattttcc 3738125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 344
Target Start/End: Original strand, 38732354 - 38732540
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  38732354 gagttatgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 38732453  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38732454 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctttt 38732540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 341
Target Start/End: Original strand, 13365374 - 13365536
Alignment:
Q  179 cttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctc 278  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  13365374 cttagatggcaatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctc 13365473  T
Q  279 ttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13365474 ttcctaatacatggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 13365536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 343
Target Start/End: Original strand, 33436210 - 33436386
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||   |||||| |||| |||    
T  33436210 agagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacacttt 33436309  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    ||| || || |||||||||||||||||| | || |          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33436310 ctctttcctatcctcttctctcttcctagttcatg----------aggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccttt 33436386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 344
Target Start/End: Original strand, 41758607 - 41758773
Alignment:
Q  180 ttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaac--acaatttctcctttctctcctcttctct 277  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |  | | |||| ||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  41758607 ttaggtggtaatataccttttgacacctatataaaaatctgacacgtagccacataaatctcgcataaacgcacattttctcttttatctcctcttctct 41758706  T
Q  278 cttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    |||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  41758707 cttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatttttctttt 41758773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45097837 - 45097652
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  45097837 aagagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 45097738  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||  |||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  45097737 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatcggatgtacaagagtgtatgcaattaaaagatgtttatgtaacattttcct 45097652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Original strand, 17823781 - 17823971
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt----ggaccccgcacaaaca 250  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||   |  |    |||||||  |||| ||    
T  17823781 taagagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctgaacacccacacaaaaatctgacacgtaactatatatatggaccccatacaagca 17823880  T
Q  251 caatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || |||||| ||  |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17823881 cactttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacattttcct 17823971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3035033 - 3034901
Alignment:
Q  208 acacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgt 307  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | | |||||| ||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||    
T  3035033 acacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaccaaggtgt 3034934  T
Q  308 atgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  3034933 atgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3034901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 289
Target Start/End: Original strand, 41575138 - 41575269
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc-gcacaaacacaatttc 257  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||  ||||| |||| ||||    
T  41575138 agtaatgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacactttc 41575237  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgca 289  Q
    || ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  41575238 tctttcatctcctcttctctcgtcctaatgca 41575269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 345
Target Start/End: Original strand, 44152012 - 44152114
Alignment:
Q  243 cacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    ||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  44152012 cacaagcacactttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacattttcttt 44152111  T
Q  343 ttt 345  Q
    |||    
T  44152112 ttt 44152114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15428842 - 15428663
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | |  |||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || | || ||  ||||| | |||||||| ||    
T  15428842 aagagttatgatacataaacatccttatgtggccatacaccccttaacactcacacaaaaatctgacatgtggccatgtaaaccccacgcaaacacattt 15428743  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||  ||||||||| |||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  15428742 tctctttcatctcctcttttctctttctagtac-atgggtgtacaagggtgtatgagggtaaatgatgtctatgtaacatt 15428663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 301
Target Start/End: Original strand, 3154193 - 3154286
Alignment:
Q  208 acacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||    
T  3154193 acacaaaaatctgacacgtggtcacatggatcccgcccaaacacagtttctctttcatctcctcttttctctcactaatgcacggggtatacaa 3154286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21301551 - 21301415
Alignment:
Q  207 cacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtg 306  Q
    |||||||||||| || ||||  ||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||   |||    
T  21301551 cacacaaaaatcagatacgtgatcatgtggactctacacaaacacactttctcttttatcttctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacatgagtg 21301452  T
Q  307 tatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  21301451 tatggaaataaagggtgtgtatctaacatttttcttt 21301415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 42849793 - 42849856
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  42849793 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 42849856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16096914 - 16096873
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16096914 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 16096873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 149 - 336
Target Start/End: Original strand, 32869669 - 32869856
Alignment:
Q  149 tttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32869669 tttttttatgagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaag 32869768  T
Q  249 cacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32869769 cacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 32869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 11427615 - 11427796
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatac--tcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  11427615 agagtaatgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacact 11427714  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11427715 ttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11427796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22880755 - 22880580
Alignment:
Q  161 taatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcc 260  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  22880755 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 22880656  T
Q  261 tttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22880655 tttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtatatgtatcatt 22880580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 17598554 - 17598732
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17598554 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 17598653  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  17598654 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 17598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 31976247 - 31976430
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  31976247 agagttatgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacacttt 31976346  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31976347 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31976430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6209567 - 6209388
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  6209567 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactt 6209468  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6209467 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaagatgta-gggaataaagggtatctatgtatcatt 6209388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 29857827 - 29858005
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||    
T  29857827 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 29857926  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  29857927 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 29858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31110861 - 31110679
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  31110861 aagagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactcaca--aaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactt 31110764  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31110763 tctcttttctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 31110679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 15832575 - 15832755
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  15832575 aagagtaatgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaatacattt 15832674  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15832675 tctcttttttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgtctacgtatcatt 15832755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31953130 - 31952945
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  31953130 gagtaatgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacactttc 31953031  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31953030 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 31952945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31109500 - 31109351
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||    
T  31109500 gagtaatgattaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacactttc 31109401  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgt 307  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31109400 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtatacaagggtgt 31109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15990146 - 15989960
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  |||     
T  15990146 ataagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacac 15990047  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15990046 tttctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23128236 - 23128075
Alignment:
Q  149 tttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  23128236 tttttaaaagaataatgatatatagacacctttatgtgataatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaag 23128137  T
Q  249 cacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatg 310  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  23128136 cacactttctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatg 23128075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30341462 - 30341277
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  30341462 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 30341363  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30341362 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 30341277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15508124 - 15507939
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  15508124 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 15508025  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15508024 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 15507939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28536582 - 28536408
Alignment:
Q  162 aatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcct 261  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  28536582 aatgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacacg--gtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 28536485  T
Q  262 ttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    || ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  28536484 ttatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaatgatgtcgatgtaacatttt 28536408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 340
Target Start/End: Original strand, 4231570 - 4231730
Alignment:
Q  180 ttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctct 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  4231570 ttaggtggcaatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctct 4231669  T
Q  280 tcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  4231670 tcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 4231730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 336
Target Start/End: Original strand, 946377 - 946554
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttct 258  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||| | | |||| |||||    
T  946377 agtaacgatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttct 946476  T
Q  259 cctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  946477 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaagaatgtatgacaataaaaagtgtcaatgtatcatt 946554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 30870058 - 30870193
Alignment:
Q  202 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaa 301  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||    
T  30870058 acacccatataaaaatctaacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaa 30870157  T
Q  302 aggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30870158 aggtgtatgaaaataaagggtgtctat-taacatttt 30870193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Original strand, 12732480 - 12732665
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||| || || |||| ||    
T  12732480 aagagtaatgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattt 12732579  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| ||| | ||   |||| |||||  ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12732580 tctctttcatctcctcttctctctttctagtacataaggtgcacaaaaatgtatggaaataaa-gatgtctatgtaacattttcctt 12732665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9379807 - 9379681
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| |  ||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||| | | |||||||||| |||||| ||    
T  9379807 atgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctcttt 9379708  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgca 289  Q
      ||| ||||| |||||||||||||||    
T  9379707 catcttctcttttctcttcctaatgca 9379681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22422043 - 22421997
Alignment:
Q  294 gtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22422043 gtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 22421997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7367715 - 7367674
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7367715 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 7367674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 26669943 - 26669984
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26669943 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 26669984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30014509 - 30014453
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  30014509 gtggcaatacacccttt-acatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggacccc 30014453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21280095 - 21280032
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  21280095 gtggcaatatacccttt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 21280032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26466827 - 26466795
Alignment:
Q  312 gaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26466827 gaataaagggtgtttatgtaacattttcctttt 26466795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8080485 - 8080305
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8080485 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 8080386  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8080385 tctcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 8080305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4999614 - 4999436
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4999614 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 4999515  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4999514 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 4999436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 19329842 - 19330020
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19329842 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttc 19329941  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19329942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 19330020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 38837215 - 38837395
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  38837215 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 38837314  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  38837315 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 38837395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 40957705 - 40957885
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||    
T  40957705 aagagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactt 40957804  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  40957805 tctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataatgggtgtctatgtatcatt 40957885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 158 - 329
Target Start/End: Original strand, 35137533 - 35137704
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35137533 gagtaatgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 35137632  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatg 329  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  35137633 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaacaaatggtatctatg 35137704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 336
Target Start/End: Original strand, 7389386 - 7389566
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7389386 taagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 7389485  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  7389486 ttctcttttctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 7389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 159 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32951592 - 32951415
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32951592 agtaatgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 32951493  T
Q  259 cctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32951492 cttttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaggggtgtctatgtatcatt 32951415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19436289 - 19436114
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||    
T  19436289 aagagtaatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactt 19436190  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgta 331  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19436189 tctcttttctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgta 19436114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 46033902 - 46033719
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || | |||    
T  46033902 agagttatgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatatttt 46033803  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46033802 ctcttttctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46033719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 38267040 - 38267218
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38267040 gagtaatgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 38267139  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| | | |||||||| ||||    
T  38267140 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacgaaggtgtatggaaataaatgatatctatgtatcatt 38267218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 320
Target Start/End: Original strand, 3783998 - 3784157
Alignment:
Q  161 taatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcc 260  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  3783998 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctct 3784097  T
Q  261 tttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||    
T  3784098 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagaatgtatgtgaataaagg 3784157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Original strand, 21234401 - 21234584
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  21234401 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattttc 21234500  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || |  ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21234501 tcttacctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcct 21234584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 345
Target Start/End: Original strand, 35522881 - 35523063
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctt 262  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  35522881 atgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttctcttt 35522980  T
Q  263 tctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35522981 tctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacattttccttttt 35523063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 3434561 - 3434730
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  3434561 agagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 3434660  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||          || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3434661 ct----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 3434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 145 - 344
Target Start/End: Original strand, 8238199 - 8238399
Alignment:
Q  145 ctattttttataagagtaatgatacatagatactct-taggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgc 243  Q
    |||||||| | | |||| |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8238199 ctatttttaaaatgagttatgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgc 8238298  T
Q  244 acaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    ||||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  8238299 acaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacattttccttt 8238398  T
Q  344 t 344  Q
    |    
T  8238399 t 8238399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 11044186 - 11044356
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  11044186 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacaccc----------ctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactt 11044275  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11044276 tctctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcatt 11044356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36362014 - 36361847
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  36362014 agagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacacttt 36361915  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
                ||||| |||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36361914 ------------ctcttttctcttcctaatacatggaatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36361847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 36362025 - 36362192
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  36362025 agagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacacttt 36362124  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
                ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36362125 ------------ctcttttctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Original strand, 3694370 - 3694519
Alignment:
Q  161 taatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcc 260  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  3694370 taatgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactttctct 3694469  T
Q  261 tttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  3694470 tttctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtatg 3694519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 38044195 - 38044379
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  38044195 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactt 38044294  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| ||  ||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  38044295 tctctttcttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38044379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 340
Target Start/End: Original strand, 41423682 - 41423864
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |   |||| ||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| || | ||||    
T  41423682 gagttatgatacatagacatcattagatggtaatacacctcttgacacttacacaaaaatctgacatgtggtcacgtagatcccgtacaagcatattttc 41423781  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    || ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41423782 tctttcatctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 41423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 188 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16374894 - 16374743
Alignment:
Q  188 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatg 287  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||  ||||| ||  |||| | ||||||||||||||||    
T  16374894 caatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaatg 16374795  T
Q  288 caaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16374794 tatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 16374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 22343360 - 22343543
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||  ||| |||    
T  22343360 agagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacacttt 22343459  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  22343460 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 22343543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 338
Target Start/End: Original strand, 41915730 - 41915921
Alignment:
Q  147 attttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcaca 246  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||    
T  41915730 attttttaatagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcaca 41915829  T
Q  247 aacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    |  ||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  41915830 agtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 41915921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Original strand, 31735884 - 31736060
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       ||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  31735884 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 31735976  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  31735977 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctatctaacattttcct 31736060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 18207178 - 18207359
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||| |||| ||    
T  18207178 aagagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgtgg-cacgtgaaccccacacaagcacactt 18207276  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18207277 tctctttcatctcctcttctctcttcctagtggatagagtgtacaagggtgtatgataataaagggtatctatctaacatttt 18207359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32564526 - 32564341
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32564526 gagttatgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacactttc 32564427  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||  | ||||   |||||||||||||| |||||||    
T  32564426 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatatgtctatgtaacatcttccttt 32564341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 26296643 - 26296826
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| | ||  |||||||||||||| | || |||    
T  26296643 agagttatgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcatttt 26296742  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  26296743 ctcttttctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacattttcc 26296826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Original strand, 36208169 - 36208304
Alignment:
Q  154 ataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaa 253  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||     
T  36208169 ataagagttatgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacat 36208268  T
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgca 289  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36208269 tttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgca 36208304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35468957 - 35468773
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | | ||   || |||||||| ||||||||||| ||    
T  35468957 aagagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctaatatgtgaccatgtggaccctgcacaaacacactt 35468858  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| || || |||||||||||||||||| | || | | |||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35468857 tctctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgagatgtataaggatgtatgagaataaaaggtgtatatgtaacattttcc 35468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40846213 - 40846027
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  40846213 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttc 40846114  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||   | | | ||||||| ||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40846113 tctttcttcttctcttctctcttcctaaaagatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcctttt 40846027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39256023 - 39255844
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||  ||| ||||    
T  39256023 gagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgt-ggcacgtggactccacacaagaacactttc 39255925  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    || ||  ||||||||||||||||||   || |  |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39255924 tctttcatctcctcttctctcttcccggtggatagaatgtacaagggtgtatgataataaagggtgtctatgtaacatttt 39255844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27744375 - 27744225
Alignment:
Q  192 acaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaag 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| || || |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27744375 acaccctttgatacccacacaaaaatctgacatgtggccacgtggatccctcataagcacattttctctatcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 27744276  T
Q  292 gggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || ||||||| | | |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  27744275 ggatgtacaaggatatatgggaataaatggtgtttatataacattttcctt 27744225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2318320 - 2318160
Alignment:
Q  181 taggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctct- 279  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  || || || | |||||| ||  |||| ||||||||||     
T  2318320 taggtggcaagacacctcttgacacccacacaaaaatctgacgtgtggtcacgtggacccgacataagcatactttctctttcatctcatcttctctctc 2318221  T
Q  280 tc-ctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2318220 tctctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacattttc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 7727904 - 7728086
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  7727904 aagagttatgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactt 7728003  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    |||  ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  7728004 tctgtttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 7728086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 46374902 - 46374808
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacaca 252  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  46374902 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcaca 46374808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10343665 - 10343537
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | ||| |  |||| ||    
T  10343665 aagagtaatgatacatagacacccttaggtggaaatacacatcttgacacccacacaaaaatctgacacatgtttccgtggactctgcagacgcacactt 10343566  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttccta 284  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  10343565 tctctttcctctcctcttctctcttccta 10343537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 12310905 - 12311086
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| | |  | || | ||| |||||||||||||| || |||||||||| || | |||| |||| |||    
T  12310905 agagttatgatacatagacacccttaggtggaaatatatc--tggatatccatacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcctgaacaagcacatttt 12311002  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
     || || || |||||||||||||||||| |  |   | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12311003 atctttcctttcctcttctctcttcctagtatacaagatgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 12311086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46374807 - 46374741
Alignment:
Q  275 tctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46374807 tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcct 46374741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 45223040 - 45223222
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||| |||  |  ||| |  |||| | || ||    
T  45223040 aagagtaatgatatatatacatccttaggtggcaatacattcttgaacatctacacaaaaatctgacacgtaatcatattaacctcatacaagcgcattt 45223139  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||| | |||  | ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  45223140 tctctttcatctcatcttctctctttcaaatatatggggtgtacaaagatgtatgtaaataaaggatgtctatgtgacatttt 45223222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 32029751 - 32029792
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32029751 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 32029792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1766795 - 1766702
Alignment:
Q  244 acaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattt 337  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| || |  | | ||| |||||  || |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1766795 acaagcacactttctctttcctctcctcttctctcttcgtagtatatgaggtatacaagagtatatgagaacaaagtgtgtctatgtaacattt 1766702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 340
Target Start/End: Original strand, 36208304 - 36208336
Alignment:
Q  308 atgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208304 atgaaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 36208336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42973018 - 42972955
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  42973018 gtggcaatacaccattt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 42972955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18520986 - 18520806
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18520986 aagaataatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 18520887  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18520886 tctcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 18520806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33149748 - 33149560
Alignment:
Q  148 ttttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa 247  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33149748 ttttttttatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaa 33149649  T
Q  248 acacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33149648 gcacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 33149560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 40145407 - 40145585
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40145407 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 40145506  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40145507 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 40145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36733044 - 36732872
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36733044 aagagtaatgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 36732945  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctat 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36732944 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctat 36732872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Original strand, 2740273 - 2740452
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  2740273 agagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 2740372  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2740373 ctcttttctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 2740452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 14831814 - 14831992
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  14831814 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 14831913  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14831914 ttttttttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14831992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 35785199 - 35785377
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  35785199 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacactttc 35785298  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  35785299 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 35785377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Original strand, 6679697 - 6679885
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6679697 agagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacatttt 6679796  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  6679797 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacattttctttttt 6679885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15409718 - 15409522
Alignment:
Q  150 ttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaac 249  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  15409718 ttttgtaagagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagc 15409619  T
Q  250 acaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttta 346  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15409618 acactctctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacattttccctttta 15409522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 13811650 - 13811825
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13811650 aagagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 13811749  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgta 331  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13811750 tctcttctctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtctatgta 13811825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Original strand, 31008986 - 31009171
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  31008986 aagagttatgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 31009085  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31009086 tctatttcctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 31009171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35943992 - 35943812
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  35943992 gagttatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttc 35943893  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  35943892 tctttcctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatttt 35943812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Original strand, 26720516 - 26720700
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  26720516 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 26720615  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  26720616 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcctt 26720700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Original strand, 26990265 - 26990449
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  26990265 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 26990364  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  26990365 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcctt 26990449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 297
Target Start/End: Original strand, 28177775 - 28177914
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28177775 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactttc 28177874  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgt 297  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  28177875 tcttttctctcctcttccctcttcctaatgtatggggtgt 28177914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42414402 - 42414275
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||     
T  42414402 gagtaatgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacacttta 42414303  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaa 285  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  42414302 tcttttctttcctcttctctcttcctaa 42414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3921367 - 3921181
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  3921367 aagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 3921268  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3921267 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 3921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2252269 - 2252080
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaattt 256  Q
    ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||| |||    
T  2252269 agagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 2252170  T
Q  257 ctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttta 346  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2252169 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctattta 2252080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33825424 - 33825243
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||   ||||| |||| ||||    
T  33825424 gagtaatgatgcatagacattcttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttc 33825325  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33825324 tcttttatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacattttc 33825243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36875702 - 36875537
Alignment:
Q  159 agtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttct 258  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  36875702 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaat---------agtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 36875612  T
Q  259 cctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattt 337  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36875611 cttttttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgga----aataaatggtgtctatgtaacattt 36875537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 340
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370186
Alignment:
Q  202 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||| |  |   | |||||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctcatcttctttcttcctagtatataagatgtacaa 21370147  T
Q  302 aggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21370148 aggtgtatgaaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21370186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39689000 - 39688814
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||  || |||||||| ||  ||| |    
T  39689000 taagagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtacact 39688901  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    ||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39688900 ttctctttcttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 39688814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Original strand, 9603810 - 9603993
Alignment:
Q  155 taagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaat 254  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||| |    
T  9603810 taagagtaatgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacact 9603909  T
Q  255 ttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 338  Q
    ||||| ||  | || |||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9603910 ttctctttcatttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatttt 9603993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20073616 - 20073433
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||| ||||| |   |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||   ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20073616 gagtaatgatatatagacatcattagatgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacactttc 20073517  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 341  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| | || | | | ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  20073516 tatttcctctcctcttctctcttcctagttcatgagatttacaaaggtgtatgagaataaaaaatgtctatctaacattttcct 20073433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6260101 - 6259916
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||| | |  | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||| | || || |||| ||||    
T  6260101 gagtaatgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaagcacactttc 6260002  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 343  Q
    || ||  |||||||||||||||  |||||| | ||| |||||||  ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6260001 tctttcatctcctcttctctctcactaatgtatgggatgtacaagtgtgtataggaataaaggatatctatgtaacattttccttt 6259916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 342
Target Start/End: Original strand, 2177436 - 2177548
Alignment:
Q  230 cacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatg 329  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  2177436 cacgtggatcccacacaagcacattttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgtgtctctg 2177535  T
Q  330 taacattttcctt 342  Q
    |||||||||||||    
T  2177536 taacattttcctt 2177548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 345
Target Start/End: Original strand, 16327888 - 16328088
Alignment:
Q  145 ctattttttataagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgca 244  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| | ||    
T  16327888 ctatattttttaaaagtaatgatagataaatatccttaggtggcaatacatccattgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgcacctcaca 16327987  T
Q  245 caaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctttt 344  Q
    ||| |||| ||| || ||  | | ||||||||||| ||||||  | |||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||    
T  16327988 caagcacactttttctttcattttctcttctctctccctaatatatggggtgtagaaaagtatatgaaaataaatggtgtttatctaacattttccattt 16328087  T
Q  345 t 345  Q
    |    
T  16328088 t 16328088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39557594 - 39557432
Alignment:
Q  181 taggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctctt 280  Q
    ||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39557594 taggtggtaatacacctcttaacatccacacaaaaatctgacacgtgatcacatggaccccatacaatcacactttctcttttatctcctcttctctctt 39557495  T
Q  281 cctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaat-aaagggtg--tctatgtaacattttcc 340  Q
    |||||| || | ||||||||  | | ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  39557494 cctaatacatgaggtgtacatggatctatgagaataaaagggtgtatctatgaaacattttcc 39557432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Original strand, 38296201 - 38296352
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||| |||| ||    
T  38296201 aagagttatgatacatagactatcttaggtgtcaatacacctcttaatacccacacaaaaatcagacacgtagctacgtggatccaacacaagcacactt 38296300  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgt 307  Q
    |||| ||  ||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||||    
T  38296301 tctcattcatctcctcttctttcttcttactacatggggtgtataaaggtgt 38296352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41470517 - 41470427
Alignment:
Q  157 agagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| | |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41470517 agagtaataatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa 41470427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 336
Target Start/End: Original strand, 31132392 - 31132512
Alignment:
Q  206 ccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||          | || ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  31132392 ccacacaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatacttt----------ttcttttctctctttctaatgcatgaggtgtacaagggt 31132481  T
Q  306 gtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  31132482 gtatgaaaataaagggtgtttatgtatcatt 31132512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Original strand, 25831334 - 25831435
Alignment:
Q  207 cacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtg 306  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||| | |||| |||||| | ||||| ||||||||||    
T  25831334 cacaaaaaaatctaacacgtggtcatgtggaccccacacaaacacattttctctttcatatcctcttttttctttctaatggatggggtctacaaaggtg 25831433  T
Q  307 ta 308  Q
    ||    
T  25831434 ta 25831435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 221
Target Start/End: Original strand, 10356639 - 10356698
Alignment:
Q  163 atgatacatagatactcttaggtggcaataca-ccctttgacacccacacaaaaatctga 221  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10356639 atgatacatagacatccttaggtggcaatacatcccattgacacccacacaaaaatctga 10356698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16115296 - 16115254
Alignment:
Q  294 gtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16115296 gtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 16115254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22512471 - 22512408
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  22512471 gtggcaatacacccttt-acatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaa 22512408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 25914930 - 25914993
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  25914930 gtggcaatacaccattt-acacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 25914993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 41334597 - 41334660
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  41334597 gtggcaatacacccttt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 41334660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4207
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||    
T  4029 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4128  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4129 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 848
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  1029 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttc 930  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  929 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 848
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  1029 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttc 930  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  929 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10031
Alignment:
Q  156 aagagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatt 255  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||    
T  10211 aagagttatgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactt 10112  T
Q  256 tctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  10111 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 10031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8963 - 8779
Alignment:
Q  158 gagtaatgatacatagatactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttc 257  Q
    |||| |||||| ||||| |  |||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  8963 gagttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtacattttc 8864  T
Q  258 tcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 342  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8863 tctttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcctt 8779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 339
Target Start/End: Original strand, 152523 - 152679
Alignment:
Q  183 ggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctcttcc 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| |    
T  152523 ggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctcttctctctttc 152622  T
Q  283 taatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 339  Q
    |||| || ||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  152623 taatacatgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttc 152679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 345
Target Start/End: Original strand, 17199 - 17290
Alignment:
Q  254 tttctcctttctctcctcttctctcttcctaatgcaaggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 345  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||    |   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199 tttctctttcctctcctcttctctcttcctagaatataaggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttccttttt 17290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 284
Target Start/End: Original strand, 17077 - 17175
Alignment:
Q  181 taggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacaatttctcctttctctcctcttctctctt 280  Q
    ||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||     |||||||||||||    
T  17077 taggttgcaatacatccctcgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctcttt-----cctcttctctctt 17171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 851 - 810
Alignment:
Q  184 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  851 gtggcaatacacccttt-acacccacacaaaattctgacacgt 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University