View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF15458_low_1 (Length: 1127)
Name: NF15458_low_1
Description: NF15458
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15458_low_1 |
 | |
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| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0440 (2 HSPs) |
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 961; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 961; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 43554238 - 43553138
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
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| T |
43554238 |
tgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatctacaatgcttccttgttcactagctc |
43554139 |
T |
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| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
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| T |
43554138 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccatatttgttgtctatgaacaatgcc |
43554039 |
T |
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| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
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| T |
43554038 |
ataggtctgctaacctatatctccatctatttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
43553939 |
T |
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| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
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| T |
43553938 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccgtgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
43553839 |
T |
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| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
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| T |
43553838 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
43553739 |
T |
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| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatacttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcat |
617 |
Q |
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| T |
43553738 |
ctcaccactcttttggctactagcaggtgagatacttggttcactcatgaatccactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgcat |
43553639 |
T |
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| Q |
618 |
agatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatg |
717 |
Q |
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| T |
43553638 |
aaatacctcagtgaaccaactatttgcttgaacaatgtaggactcacatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtgatg |
43553539 |
T |
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| Q |
718 |
atgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacat |
817 |
Q |
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| T |
43553538 |
atgatggattgcagttcatcatattgaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgctgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacat |
43553439 |
T |
|
| Q |
818 |
gcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcact |
917 |
Q |
| |
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| T |
43553438 |
gcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctatgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcact |
43553339 |
T |
|
| Q |
918 |
atcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgct |
1017 |
Q |
| |
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| T |
43553338 |
atcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttaattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgct |
43553239 |
T |
|
| Q |
1018 |
gcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatcccttt |
1116 |
Q |
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| T |
43553238 |
gcacaaaaaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagattttagtaatctatacaccatatcctctatcccttt |
43553139 |
T |
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| Q |
1117 |
g |
1117 |
Q |
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| |
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| T |
43553138 |
g |
43553138 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 808; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 54167555 - 54168657
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
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|
| T |
54167555 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctc |
54167654 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
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| T |
54167655 |
cctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
54167754 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
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|
|
| T |
54167755 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttaagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
54167854 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |
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|
| T |
54167855 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
54167954 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
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| T |
54167955 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctgtcagctcaatagtgttttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
54168054 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
54168055 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
54168154 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
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|
|
| T |
54168155 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
54168254 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
54168255 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatatcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
54168354 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
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|
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| T |
54168355 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
54168454 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54168455 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
54168554 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
54168555 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
54168654 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
54168655 |
ttg |
54168657 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 807; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 1074
Target Start/End: Complemental strand, 21850135 - 21849086
Alignment:
| Q |
28 |
gtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctccctcagaaaa |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
21850135 |
gtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctcccttagaaaa |
21850036 |
T |
|
| Q |
128 |
tgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgccataggtctgc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21850035 |
tgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgc |
21849936 |
T |
|
| Q |
228 |
taacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgc |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21849935 |
taacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctaacatgctgccatacaccctgcaatatattcagattcacaggttgacaatgc |
21849836 |
T |
|
| Q |
328 |
tacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgacaccaa |
427 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||| |
|
|
| T |
21849835 |
tacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtactctttctatcttgtctgtctccacaccaa |
21849736 |
T |
|
| Q |
428 |
tcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtatcccatcactc |
527 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21849735 |
tcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaatagaataccatactgcagtgttcctttgatgtatctcatcactc |
21849636 |
T |
|
| Q |
528 |
tcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatacct |
625 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21849635 |
ttttggctgctagcaggtgagagactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgcatagatacct |
21849536 |
T |
|
| Q |
626 |
cagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatgatgga |
725 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21849535 |
cagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcattaccagttttacatttgtctcagctggtgatgatgatgga |
21849436 |
T |
|
| Q |
726 |
ttgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacatgcctaaaa |
825 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
21849435 |
ttgcagctcatcatattgaacctcttcaatatatcagatgcatacttcttttggtgcattatcaatccctctgcaacttcagtaaattccatgcctagaa |
21849336 |
T |
|
| Q |
826 |
agtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcactatcaagtc |
925 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21849335 |
agtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatttgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcactatcagatc |
21849236 |
T |
|
| Q |
926 |
atcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaaaa |
1025 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
21849235 |
atcaacataaaggcagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttgacaaattcttgctgtacaaga |
21849136 |
T |
|
| Q |
1026 |
aat-tgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccata |
1074 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
21849135 |
aatctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccata |
21849086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 892
Target Start/End: Original strand, 53353192 - 53354068
Alignment:
| Q |
17 |
atgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagct |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| ||| |
|
|
| T |
53353192 |
atgatgaacctgtcaaccttcaatgcttttgtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtggagcaatggacaatctgcaatgcacctttgttcacttgct |
53353291 |
T |
|
| Q |
117 |
ccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgc |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53353292 |
cccttagaaaatggaatttagcctttatatgcttgcttctcccatgcagaactggatttattgctaagcttatagcatatttgttgtcgatgaacaatgc |
53353391 |
T |
|
| Q |
217 |
cataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacag |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53353392 |
tataggtctgctaacctctatctccatttccttaagtatattttcaagtcatactgcctgacatgctgtcatacatcctgcaatatactcagattcacag |
53353491 |
T |
|
| Q |
317 |
gttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgt |
416 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53353492 |
gttgacaatgctacaactggttgtttcttagcacaccatgaaattggagcatttaagaacttaaataggtaccctgaagtgctctttctatcctgcttgt |
53353591 |
T |
|
| Q |
417 |
ctcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgta |
516 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53353592 |
ctccacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaatagaataccatactgtagtgttcctttgatgta |
53353691 |
T |
|
| Q |
517 |
tcccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattt |
614 |
Q |
| |
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|
|
| T |
53353692 |
tctcatcacccttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattataccaactgcatatgcaatatcaagcctactattg |
53353791 |
T |
|
| Q |
615 |
catagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtt |
714 |
Q |
| |
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| T |
53353792 |
catagatacctcagtgaacctacaatttgcttgaacaatgtaggatccactgattcttcatcttcatttaacaccagtttcatatttgtttcagcaggtg |
53353891 |
T |
|
| Q |
715 |
atgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaatta |
814 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53353892 |
atgaatatgaattgcaattcatcatattgaacctcttcaatatgtca-atgcatacttcttttgatgtatcaccaatccctttgcaacttcagtaaattc |
53353990 |
T |
|
| Q |
815 |
catgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctat |
892 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53353991 |
cattcctagaaaatatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaattcattcatcatctgagttttgaatgcttctat |
53354068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 902 - 1117
Target Start/End: Original strand, 53355300 - 53355516
Alignment:
| Q |
902 |
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1001 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53355300 |
atcacgaccagttactatcaaatcatcaacatatagacagatgagtagttgattaccttcaattcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcat |
53355399 |
T |
|
| Q |
1002 |
ttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacacca |
1100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53355400 |
ttgacaaattcttgctgcataagaaaactgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagtgctttgtgtaatctatacacca |
53355499 |
T |
|
| Q |
1101 |
tatcctctatccctttg |
1117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53355500 |
tattctccttccctttg |
53355516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 856; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 856; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 43807694 - 43808796
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43807694 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttgttcacttgctc |
43807793 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43807794 |
cctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
43807893 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43807894 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
43807993 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
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| T |
43807994 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
43808093 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43808094 |
tccacaccaatcagcatcagaatataccatcagttccatagaactatcattcaagcatttaggaaatagaataccatactgcagtgttcctttgatgtat |
43808193 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
43808194 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagagactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
43808293 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43808294 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcattaccagttttacatttgtctcagctggtga |
43808393 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43808394 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaaccttttcaatatgtcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
43808493 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43808494 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
43808593 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43808594 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
43808693 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43808694 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
43808793 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
43808794 |
ttg |
43808796 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 844; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 197895 - 198997
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
197895 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctc |
197994 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
197995 |
cctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
198094 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
198095 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
198194 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
198195 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
198294 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
198295 |
tccacaccaatcagcatcagaatataccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaatagaataccatactgcattgttcctttgatgtat |
198394 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
198395 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagagactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcttactattac |
198494 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
198495 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcattaccagttttacatttgtctcagctggtga |
198594 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
198595 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaaccttttcaatatgtcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
198694 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
198695 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatatgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
198794 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
198795 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
198894 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
198895 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
198994 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
198995 |
ttg |
198997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 844; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 312732 - 313834
Alignment:
| Q |
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117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
312732 |
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T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
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| T |
312832 |
cctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
312931 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
312932 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
313031 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
313032 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
313131 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
313132 |
tccacaccaatcagcatcagaatataccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaatagaataccatactgcattgttcctttgatgtat |
313231 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
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| T |
313232 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagagactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcttactattac |
313331 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
313332 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcattaccagttttacatttgtctcagctggtga |
313431 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
313432 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaaccttttcaatatgtcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
313531 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
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|
| T |
313532 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatatgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
313631 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
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| T |
313632 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
313731 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
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| T |
313732 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
313831 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
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| T |
313832 |
ttg |
313834 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 30406014 - 30407116
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |
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|
| T |
30406014 |
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30406113 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
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| T |
30406114 |
ccttagaaaatggaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
30406213 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
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|
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Target: chr8; HSP #7
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 18 - 1116
Target Start/End: Original strand, 27435392 - 27436494
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
27435392 |
tgatgaacctgtcatccttcaatggcttagtgaatatttctgcaagctgcagcttagtgaaacaatgaacaatctgcaatgctcccttgttcacttgctc |
27435491 |
T |
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| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
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| T |
27435492 |
cctcagaaaatggaacttagcctctatgtgtttgcttcttccaagcaaaactggatttcttgctaagcttatagcagatctgttatctttgaacaatgtt |
27435591 |
T |
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| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
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| T |
27435592 |
attggtctgctcacttctatctccatctccttgagtatgttttaaagccatactgcctgacatgctgtcatacaccctgcaatatactcagattcaaagg |
27435691 |
T |
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| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
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| T |
27435692 |
ttgacaatgccacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggggcattcagaaacttgaataggtaacctgaggtactttttctatcctgcttatc |
27435791 |
T |
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418 |
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517 |
Q |
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| T |
27435792 |
tccacaccaatctgcattagagtaagctattaattccatagagttttcatccagacacctaggaaatagaatgccaaactctagtgttcctttgatgtat |
27435891 |
T |
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518 |
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615 |
Q |
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T |
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616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
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T |
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716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
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| T |
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27436191 |
T |
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| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgc-ttctatctcattcatatcactaccagtc |
914 |
Q |
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| T |
27436192 |
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27436291 |
T |
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| Q |
915 |
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1014 |
Q |
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| T |
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actatcaagtcatcaacatagagacagatgagtaattgactaccttcaattcctttcttcatctatacaccatattcagacttgcatttaacaaattctt |
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T |
|
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1015 |
gctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccc |
1113 |
Q |
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| T |
27436392 |
gttgcacaagaaaattgtcaattcttttgttccaagctcttggtgtctgctttaatccatatagtgttttgtgtaatctatacaccatatcctccttccc |
27436491 |
T |
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1114 |
ttt |
1116 |
Q |
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| T |
27436492 |
ttt |
27436494 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 302 - 1090
Target Start/End: Original strand, 17782650 - 17783434
Alignment:
| Q |
302 |
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401 |
Q |
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17782650 |
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T |
|
| Q |
402 |
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501 |
Q |
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| T |
17782750 |
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17782849 |
T |
|
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599 |
Q |
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| T |
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T |
|
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699 |
Q |
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| T |
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T |
|
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799 |
Q |
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| T |
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T |
|
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Q |
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T |
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999 |
Q |
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| T |
17783243 |
acgttgctactaggcacaattagatcatcaacatataagcagatgagtatctgattacctgcttttcctttcgtcacatagacaccatactcagacttgc |
17783342 |
T |
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1090 |
Q |
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| T |
17783343 |
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17783434 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 856; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 856; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 8055338 - 8054236
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
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|
| T |
8055338 |
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8055239 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
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| T |
8055238 |
cctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgtagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
8055139 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
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|
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| T |
8055138 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
8055039 |
T |
|
| Q |
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ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
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|
| T |
8055038 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
8054939 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
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|
| T |
8054938 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaatagaataccatactgcagtgttcctttgatgtat |
8054839 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
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| T |
8054838 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagagactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
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T |
|
| Q |
616 |
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715 |
Q |
| |
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|
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| T |
8054738 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
8054639 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
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| T |
8054638 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatatcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
8054539 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
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|
| T |
8054538 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
8054439 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
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|
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| T |
8054438 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
8054339 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
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| T |
8054338 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
8054239 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
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| T |
8054238 |
ttg |
8054236 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 36674997 - 36673895
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
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| T |
36674897 |
cctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
36674798 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
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|
|
| T |
36674797 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagactcacagg |
36674698 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
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| T |
36674697 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
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T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
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| T |
36674597 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctgtcagctcaatagtgttttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
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T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
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| T |
36674497 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
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T |
|
| Q |
616 |
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715 |
Q |
| |
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|
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| T |
36674397 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
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T |
|
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716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
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|
| T |
36674297 |
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|
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atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
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| T |
36674197 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
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T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
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| T |
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ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
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|
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1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 35950649 - 35951751
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0044
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Target: scaffold0044; HSP #1
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| |
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| |
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|
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|
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Q |
| |
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|
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| |
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||| |
|
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ttg |
46178 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 844; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 844; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 44151504 - 44150402
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cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
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| |
|
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|
|
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T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
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44151304 |
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|
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ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
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| |
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| |
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T |
|
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| |
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|
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| |
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|
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| |
|
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|
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|
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816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
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|
| T |
44150704 |
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T |
|
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916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
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ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
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|
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1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
44150504 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
44150405 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
44150404 |
ttg |
44150402 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 761; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 50628141 - 50629244
Alignment:
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| |
|
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|
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|
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cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
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|
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218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
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| |
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|
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418 |
tcgacaccaatcagcatc-agaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgta |
516 |
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| |
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| T |
50628541 |
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tcccatcactctcttggctgctagccggtgagatac--ttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattt |
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Q |
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catagatacttcagtgaaccaactatttgcttgaaaagtgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtataagctggtg |
50628840 |
T |
|
| Q |
715 |
atgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaatta |
814 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50628841 |
atgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttggtgcatcacgaatccctctgcaacttcagtaaattc |
50628940 |
T |
|
| Q |
815 |
catgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtc |
914 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50628941 |
catgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctaacatttcaaactcactcatcatttgtgatttgaatgcttttatctcattcatatcactaccagtc |
50629040 |
T |
|
| Q |
915 |
actatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattctt |
1014 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50629041 |
actatcaaattatcaacataaagacagatgagtagttgattacctttacttcctctcttcacatatacaccatactcagacttgcatttgacaaattctt |
50629140 |
T |
|
| Q |
1015 |
gctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccc |
1113 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
50629141 |
gctgcacaagaaaactgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagaggactttgtgtaatctatacaccatatcctctttccc |
50629240 |
T |
|
| Q |
1114 |
tttg |
1117 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
50629241 |
tttg |
50629244 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 759; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 31359098 - 31358005
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31359098 |
tgatgaacctgtcaaccttcaatgccttaatgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctacagtgctcccttgttcacttgctc |
31358999 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31358998 |
cctcagaaaatgaaacttgacttctatatgcttgcttctcccatgcataactagatttctttctaagcttataacagatttgttgtctatgaacaatgct |
31358899 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31358898 |
ataggtctgctaacctctatctccatctcattgagtatattttcaagccatactgcctgacatactgccatacatcctgcaatatacttagattcacagg |
31358799 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31358798 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtc |
31358699 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31358698 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctatcagctcaatagaattttcatttaagcacttaggaaataaaatgtcatactgcagtgttcctttgatgtat |
31358599 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31358598 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggt--------gaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcatactattgt |
31358507 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31358506 |
atagataccttagtgaaccaactatttgcttgaacaatgttggattcacaggttcttcatcttcattcatcatcagttttacatttgtctcagctggtga |
31358407 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31358406 |
tgatgatggattgcagttc-tcatattgaccctcttcaatatgtcagatgcatatttcatttggtgcatcaccaatccctctgcaacttcattaaattcc |
31358308 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31358307 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttatatctcattcatatcactaccagtta |
31358208 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31358207 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatagttagacttgcatttgacaaattcttg |
31358108 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
31358107 |
ctgcacaagaaaactgttaattctcttgttccatgctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctttccct |
31358008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 644
Target Start/End: Original strand, 8892832 - 8893460
Alignment:
| Q |
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117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8892832 |
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8892931 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8892932 |
cctcagaaaatggaactcagcttctatatgtttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgattaattct |
8893031 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8893032 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagctatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
8893131 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8893132 |
ttgacaatgctacaactgggtgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtatcctgaagtgctctttctatcttgtttgtc |
8893231 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| | | ||| || || |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
8893232 |
tccacaccaatcaacatcagaatatgctatcagctcaatagaatttttatttaagcacttagaaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
8893331 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
8893332 |
ctcatcactcttttggctgctggcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggtctactattgc |
8893431 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgc |
644 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8893432 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgc |
8893460 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 464 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 29258194 - 29257872
Alignment:
| Q |
464 |
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561 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| | || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
| T |
29258194 |
tcattcagacatttaggaaacaaaatgccatactatagtgttcccttgatgtatctcatcactcttttagctgctagcaagtgagaagctcttggttcac |
29258095 |
T |
|
| Q |
562 |
tcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagact |
661 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
29258094 |
tcatgaacctactgattataccaactgcataagcaatataaggtttactattgcactgataccttagtgatcccacaatttgcttgaacaatgtatga-t |
29257996 |
T |
|
| Q |
662 |
ct-catgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtc |
760 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||||||||||| | | |||| ||| |||| | | ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
29257995 |
ctactagttcttcttcttcattcatcacctattttaaattaacctcaacaaatgatgatgatggattgcagctcaccgtattgaacctcttcaatatatc |
29257896 |
T |
|
| Q |
761 |
agatgcatacttcatttgttgcat |
784 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
29257895 |
aaatacatacttcatctgatgcat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
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Target Start/End: Original strand, 18217902 - 18218011
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| Q |
972 |
ttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatc |
1070 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
18217902 |
ttcacatagacaccatattcaggtttgcactttacaaattcttgctgcacaagaaagctatcaattctcttgttctagactcttggagcatgattcaatc |
18218001 |
T |
|
| Q |
1071 |
catagagagc |
1080 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
18218002 |
catatagagc |
18218011 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 376
Target Start/End: Original strand, 17507513 - 17507622
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| Q |
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366 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| | ||||| ||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17507513 |
atattgcttgacatgctgctaaacaacctgctatatattctgattctcatgttgagaaggctaccataagttgtttctttgtacaccatgatattggata |
17507612 |
T |
|
| Q |
367 |
attcataaac |
376 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
17507613 |
attcataaac |
17507622 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 824; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 824; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 27761343 - 27760241
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27761343 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctc |
27761244 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
27761243 |
ccttagaaaatgaaactttgtttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
27761144 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27761143 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
27761044 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
27761043 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtc |
27760944 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| || || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27760943 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctatcagctcaatagagttttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
27760844 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
27760843 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggtctactattgc |
27760744 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27760743 |
atagatacctcaatgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
27760644 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27760643 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
27760544 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27760543 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
27760444 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27760443 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
27760344 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27760343 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
27760244 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
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||| |
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27760243 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 7940294 - 7941396
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217 |
Q |
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317 |
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Q |
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517 |
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| |
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Q |
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T |
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915 |
Q |
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|
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1015 |
Q |
| |
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|
|
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7941194 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
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T |
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1114 |
Q |
| |
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7941294 |
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7941393 |
T |
|
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1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
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7941394 |
ttg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 603; E-Value: 0
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Target Start/End: Original strand, 13828316 - 13829404
Alignment:
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| |
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416 |
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| |
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| |
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|
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| |
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tctcatcactcttttggctactagcagatgagatactcttggttcactcattaatctactgattataccaactgcatatgcaatatcaggcctactattt |
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T |
|
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714 |
Q |
| |
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|
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|
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
|
| Q |
815 |
catgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtc |
914 |
Q |
| |
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|
| T |
13829115 |
catgcctagaaaatatgtcaagtttcctaaatctgacatttcaaactcattcatcatctgagttttgaatgcttctatctcattcacatcactacgagtc |
13829214 |
T |
|
| Q |
915 |
actatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattctt |
1014 |
Q |
| |
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|
| T |
13829215 |
actatcaagtcatcaacatataaacagatgagtagttgattaccttcaattcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattctt |
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T |
|
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1103 |
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| |
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| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |
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|
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13829315 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22580833 - 22580233
Alignment:
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| |
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|
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|
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Q |
| |
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| T |
22580733 |
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T |
|
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258 |
tttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatga |
357 |
Q |
| |
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|
| T |
22580633 |
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T |
|
| Q |
358 |
aattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccata |
457 |
Q |
| |
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|
| T |
22580533 |
gattggagcatttagaaatttgaatatgtagcctaaggtactctttctatcttgcttatccccgtagcaatctgcatcagaataagctatcaattccata |
22580434 |
T |
|
| Q |
458 |
gaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtatcccatcactctcttggctgctagccggtgaga--tacttg |
555 |
Q |
| |
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|
| T |
22580433 |
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T |
|
| Q |
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gttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgt |
655 |
Q |
| |
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|
| Q |
656 |
a |
656 |
Q |
| |
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| |
|
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22580233 |
a |
22580233 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1089
Target Start/End: Complemental strand, 5242674 - 5242616
Alignment:
| Q |
1031 |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
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5242674 |
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5242616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 816; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 7099585 - 7100687
Alignment:
| Q |
18 |
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Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7099685 |
cctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
7099784 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7099785 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagactcacagg |
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T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7099885 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
7099984 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
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| T |
7099985 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctgtcagctcaatagtgttttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
7100084 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
7100085 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
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T |
|
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616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
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| T |
7100185 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
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T |
|
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716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
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| |
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7100285 |
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T |
|
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Q |
| |
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|
| T |
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atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
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T |
|
| Q |
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ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
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|
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ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
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| |
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cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaattggatttcttactaagcttatagcagatttgttgtatatgaacaattat |
10276951 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10276950 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgtttgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaag |
10276851 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
10276850 |
ttgacaatgccacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccatgaagtgatctttctatcttgtttgtc |
10276751 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaata |
485 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
10276750 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctatcagctcaatagaattttcatttaagcacttaggaaata |
10276683 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 1104
Target Start/End: Original strand, 26454478 - 26455554
Alignment:
| Q |
28 |
gtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctccctcagaaaa |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
26454478 |
gtcaaccttcaaaggtttagtgaatatatctgcaagttgcagctcaatggaacaatgaacaatttgcaatgcctccttgttaacttgttccctcagaaag |
26454577 |
T |
|
| Q |
128 |
tgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgccataggtctgc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || || || || ||||||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
26454578 |
tgaaacttaacttcaatgtgtttactcattccatgcaaaattggattatttgctaagttaatagatgatttgttatctatgaacaatgatataagtatgt |
26454677 |
T |
|
| Q |
228 |
taacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgc |
327 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
26454678 |
taacttctatttccatattcttgagtatattttcaagctaaactgcttgacaagctgtcatacatcctgcaatgtactcagattcacaagttgacagtgc |
26454777 |
T |
|
| Q |
328 |
tacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattgga--gcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgacacc |
425 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | || || | |||| |
|
|
| T |
26454778 |
tacaactggttgcttcttagcacaccatgaa--tggatcgcatttagaaacttgaataggtaatctgaggtgctcttcctatcttgcttatccccacact |
26454875 |
T |
|
| Q |
426 |
aatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtatcccatcac |
525 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | |||| ||||||||| | |||| || |||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26454876 |
aatctgcatcagaataagatatcaattccatagagttttcatccagacatttaggaaacaaaatgacatactctagtgttcctttgatgtatctcatcac |
26454975 |
T |
|
| Q |
526 |
tctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatac |
623 |
Q |
| |
|
||| || || |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26454976 |
tcttttagcagctagcaaatgagaaactcttggttcactcatgaacctactaattataccaactgaatatgcaatatcaggtctactattgcatagatac |
26455075 |
T |
|
| Q |
624 |
ctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatgatg |
723 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| || ||| |||| |||||| || || | ||| ||||||||||||| | || | | | |||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
26455076 |
cttagtgatccaacaatctgcttgaataatgtagga---tccactaattcttcttcattcatcactagtttcaaactagtctcaacatgtgatgatgatt |
26455172 |
T |
|
| Q |
724 |
gattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacatgcctaa |
823 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || || || ||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
26455173 |
ggttgcagttcaccatattgaacctcttcaatatatcagatgcatacttcatttgatgcatagcaaaaccttcatgaacttcagtgaattccatgccttg |
26455272 |
T |
|
| Q |
824 |
aaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcactatcaag |
923 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||| ||| | |||||||| || || | |
|
|
| T |
26455273 |
aaaatatgtaagtttacctaaatcagtcatttcaaacttcttcatcatttgagttttgaatgattctatctcaatcaagttgctaccagttacaattaga |
26455372 |
T |
|
| Q |
924 |
tcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa |
1023 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26455373 |
tcatcaacatgtagacacatgagtatttgattacctctttctcctttcttcacatacacgccatactcagacttacattttacaaattcttgctgcacaa |
26455472 |
T |
|
| Q |
1024 |
-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatc |
1104 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||||| || ||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
26455473 |
ggaagctgtcaattatcttattccatgcccttagtgcttgctttaaaccataaagagccttgtgtaacttgtacaccatatc |
26455554 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 319
Target Start/End: Original strand, 40367811 - 40368112
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40367811 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagcttagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctc |
40367910 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
40367911 |
ccttagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
40368010 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40368011 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcatattcacagg |
40368110 |
T |
|
| Q |
318 |
tt |
319 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
40368111 |
tt |
40368112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 10276674 - 10276578
Alignment:
| Q |
538 |
tagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatacctcagtgaa |
632 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10276674 |
tagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggtctactattgcatagatacctcagtgaa |
10276578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 26337018 - 26337111
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcac |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26337018 |
tgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagagcaatgaaaaatctgcagtgctcccttgttcac |
26337111 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 25632567 - 25631915
Alignment:
| Q |
124 |
aaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgccataggt |
223 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||||||||| || |||| | |||||| |
|
|
| T |
25632567 |
aaaatgaaagttggcttcagtgtgcgtgctccttccaagcagaactggatttttagccaagtttatagctgatttgttgtccataaacagagttataggt |
25632468 |
T |
|
| Q |
224 |
ctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgaca |
323 |
Q |
| |
|
|| | || || || | |||||| || |||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25632467 |
ctatttacttcaattttcatctcctttagtatagattcaagccaaactgcttgacaggctgccaatcaacctgcaatgtactcagattcacatgttgaca |
25632368 |
T |
|
| Q |
324 |
atgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgaca |
423 |
Q |
| |
|
| ||| | | | ||| ||||||||| ||||| || || ||||||| | ||| ||||| ||||| | | | ||| |||||||||| | || | || ||| |
|
|
| T |
25632367 |
aggctgccattggtttcttcttagctcaccaagagatcagagcatttagaaatttgaacaggtagcataaggtgttctttctatcttgcttat-tccaca |
25632269 |
T |
|
| Q |
424 |
ccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtatcccatc |
523 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| || |||| ||||| || ||| ||| |||||||||||| | || |||| | ||| |||| || ||||||| | | |
|
|
| T |
25632268 |
ccaatctgcatcgaaataagctatcaaatccatgaaatcttcaatcagacatttaggaaacaatatgtcatactctagtattcccttaatgtatctcgtg |
25632169 |
T |
|
| Q |
524 |
actctcttggctgctagccggtgaga--tacttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagat |
621 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||| || | || |
|
|
| T |
25632168 |
acccttttagctgctagcaagtgagaagttcttggttcactcatgaacctactaattataccatgtgcataagcaatatcacgcctaatattgcacaaat |
25632069 |
T |
|
| Q |
622 |
acctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatga |
721 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || || | | ||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||| || | ||| ||||||| | |||||| |
|
|
| T |
25632068 |
acctcagtgatcccaccatcttcttgaacaatgtaggatcaactagttcttcatcttcattaatcaccaatttcaaattcacctcagctagcgatgatgc |
25631969 |
T |
|
| Q |
722 |
tggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcat |
775 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25631968 |
aggattgcagcttaacatattgaacctcttaagtatatcatatgcatacttcat |
25631915 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30066935 - 30066790
Alignment:
| Q |
263 |
agccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattg |
362 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | | ||| || |||||||| || | ||||||||| || | |
|
|
| T |
30066935 |
agccatactgcttgacatgctgctaaacaccctacaatgtactcagattcacaagttgaaagtactaatacaagttgcttttttgtacaccatgatatag |
30066836 |
T |
|
| Q |
363 |
gagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatc |
408 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
30066835 |
gagcattcagaaatttgaacaagtagcatgaagtgcttttcctatc |
30066790 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30067094 - 30067034
Alignment:
| Q |
104 |
ttgttcactagctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgca |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30067094 |
ttgttcacttgttctctgagaaaatgaaactttgcttcaatatgcttgcttcttccatgca |
30067034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1092
Target Start/End: Original strand, 15063514 - 15063640
Alignment:
| Q |
966 |
cctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgtt |
1064 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||| ||||||||| | || | |
|
|
| T |
15063514 |
cctttcttcacatacaaaccatatt-agatttacatttcacaaattcttgctgcacaagaaaactgccaagcctcttattccatgctcttggtacttgct |
15063612 |
T |
|
| Q |
1065 |
ttaatccatagagagctttgtgtaatct |
1092 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
15063613 |
tcaagccataaagagccttatgtaatct |
15063640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 986 - 1054
Target Start/End: Complemental strand, 30065065 - 30064996
Alignment:
| Q |
986 |
atattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcac-aaaaaattgtcaattctcttgttccaagctctt |
1054 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
30065065 |
atattcagctttgcatttgacaaattcttgctgcactagaaagttgacaatcctcttattccatgctctt |
30064996 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 816; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 26315959 - 26314857
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26315959 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttgttcacttgctc |
26315860 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
26315859 |
cctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
26315760 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26315759 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagactcacagg |
26315660 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
26315659 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
26315560 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||| || || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26315559 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctgtcagctcaatagtgttttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
26315460 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26315459 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
26315360 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
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| T |
26315359 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
26315260 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
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| T |
26315259 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatatcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
26315160 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
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| T |
26315159 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
26315060 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
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| T |
26315059 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
26314960 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
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|
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| T |
26314959 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
26314860 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
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| T |
26314859 |
ttg |
26314857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 848
Target Start/End: Original strand, 43592032 - 43592863
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
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|
| T |
43592032 |
tgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctacagagctcccttgttcacttggtc |
43592131 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |
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| T |
43592132 |
cctcataaaatggaacttagcttttatatgcttgcttctcccatgcagaactgaatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattat |
43592231 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43592232 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgttgccatacaccctgtaatatactcaaattcacagg |
43592331 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
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| T |
43592332 |
ttaacaatgccacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaatttgaataggtaccatgaagtgctctttctatcttgtttgtc |
43592431 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
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| T |
43592432 |
tccacaccaatcagcattataatatgctatcaactcaatataattttcatttaagcactta-gaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
43592530 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| | |
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| T |
43592531 |
ctcatcactcttttgtctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgctaactgcatatgcaatagcaggtcgactattgc |
43592630 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
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||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || | |
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|
| T |
43592631 |
ataaatacctcggtgaaccaactatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcatcagttttacatttgtctcggatagtga |
43592730 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43592731 |
tgatgatggattgcagttcatcatattgaacatcttcaatatgtcagatgtatactccatttggtgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaatttc |
43592830 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatct |
848 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43592831 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatct |
43592863 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 958 - 1117
Target Start/End: Original strand, 43592862 - 43593024
Alignment:
| Q |
958 |
cttcacttcctttcttcacatatacac--catattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctctt |
1054 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43592862 |
cttcacttcctttcttcacatatacacaccatactcagatttgcatttgacaaactcttgctgcacaagaaaactgccaattatcttgttccaagctctt |
43592961 |
T |
|
| Q |
1055 |
ggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccctttg |
1117 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
43592962 |
ggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccttatcctttttccctttg |
43593024 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 30647039 - 30646871
Alignment:
| Q |
290 |
caccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtacc |
389 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30647039 |
caccatgcaatacactcaaactcacaagttgataaggctaccaccggttgcttcttagcacaccatgatatttgagcatttagaaatttaaacaagtagc |
30646940 |
T |
|
| Q |
390 |
ctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatag |
458 |
Q |
| |
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|| |||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30646939 |
ctcaagtactctttctatcttgcctatctccacaccaatcagcatatgagtatgccatcaattccatag |
30646871 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 964 - 1054
Target Start/End: Complemental strand, 30646364 - 30646273
Alignment:
| Q |
964 |
ttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctctt |
1054 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30646364 |
ttcctttcttcacatatacacaatattcagctttgcattttataaattcttgttgcacaagaaagctgtcaattctcttttttcaggctctt |
30646273 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 804; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 804; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Original strand, 8315715 - 8316817
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8315715 |
tgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagcttcagctcagtagatcaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctc |
8315814 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
8315815 |
cctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaaacttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
8315914 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8315915 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagactcacagg |
8316014 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8316015 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
8316114 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8316115 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctgtcagctcaatagtgttttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
8316214 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8316215 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactattgc |
8316314 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8316315 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaacaatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagctggtga |
8316414 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8316415 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatatcagatgcatacttcttttgatgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
8316514 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8316515 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
8316614 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8316615 |
ctatcaaatcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttg |
8316714 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8316715 |
cttcacaagaaagctgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctgtacaccatatcctctttccct |
8316814 |
T |
|
| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
8316815 |
ttg |
8316817 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 698; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 1117
Target Start/End: Original strand, 27568524 - 27569496
Alignment:
| Q |
148 |
cttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgccataggtctgctaacctctatctccatctct |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27568524 |
cttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctcc |
27568623 |
T |
|
| Q |
248 |
ttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactagttgcttcttag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
27568624 |
ttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaattggttgcttcttag |
27568723 |
T |
|
| Q |
348 |
cacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgacaccaatcagcatcagaatatgccat |
447 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
27568724 |
cacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatcagcatcataatatgctat |
27568823 |
T |
|
| Q |
448 |
cagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtatcccatcactctcttggctgctagccggtga |
547 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | ||||| || || |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |
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| T |
27568824 |
cagctcaatagaattttcatttaagcacttaggaaataaaatgtcatactgtagtgttcctttgatgtatctcatcactcttttggctgctagcaggtga |
27568923 |
T |
|
| Q |
548 |
gatact--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatacctcagtgaaccaactatttgcc |
645 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27568924 |
gatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggtctactattgcatagatacctcagtgaaccaactatttgct |
27569023 |
T |
|
| Q |
646 |
tgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatgatggattgcagttcatcatattaaa |
745 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
27569024 |
tgaacaatgtaggattcacacgttcttcatcttcattcatcaccagttttacatttgtctcagttggtgatgatgatggattgcagctcatcatattgaa |
27569123 |
T |
|
| Q |
746 |
cctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacatgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaa |
845 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27569124 |
cctcttcaatatgtcagatgcatacttcttttggtgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaactccatgcctagaaagtatgtcaattttcctaaa |
27569223 |
T |
|
| Q |
846 |
tctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcactatcaagtcatcaacataaagacagatga |
945 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27569224 |
tctgacatttcaagctcactcatcatctgtgatttaaatgcttctatctcattcatatcactaccagacactatcaaatcatcaacataaagacagctga |
27569323 |
T |
|
| Q |
946 |
gtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgtt |
1044 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
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| T |
27569324 |
gtagttgattatcttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttaacaaattcttgctgcacaagaaagctgtcaattctcttgtt |
27569423 |
T |
|
| Q |
1045 |
ccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccctttg |
1117 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
27569424 |
ccaagctcttcgtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcttctttccctttg |
27569496 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Original strand, 17887056 - 17887523
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
17887056 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgtttacttgctc |
17887155 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
17887156 |
cctcagaaaatggaagttagcttctacatgtttacttcttccatgcagaactagatttcttgctaagcttatagctgatttgttgtctatgaacaattct |
17887255 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17887256 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgcttccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
17887355 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
17887356 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacacggtgaaattggatcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtc |
17887455 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaata |
485 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
17887456 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgatatcagctcaatagaattttcatttaagcacttaggaaata |
17887523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 715 - 1117
Target Start/End: Original strand, 17887539 - 17887942
Alignment:
| Q |
715 |
atgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaatta |
814 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17887539 |
atgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcttttggtgcatcaccaatccctctccaacttcagtaaattc |
17887638 |
T |
|
| Q |
815 |
catgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtc |
914 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17887639 |
catgccttgaaagtatgccaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtc |
17887738 |
T |
|
| Q |
915 |
actatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattctt |
1014 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17887739 |
actatcaaatcatcaacataaagaaaaatgagtagttgattaccatcatttcctttcttcacatatacaccatactcaaacttgcatttaacaaattctt |
17887838 |
T |
|
| Q |
1015 |
gctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccc |
1113 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17887839 |
gctgcacaagaaaactgtcaattctcttgtttcaagctcttggtgcctgtttcaatccatagagggctttgtgtaatctatacaccatatcctctttccc |
17887938 |
T |
|
| Q |
1114 |
tttg |
1117 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
17887939 |
tttg |
17887942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 668 - 1102
Target Start/End: Complemental strand, 17163382 - 17162955
Alignment:
| Q |
668 |
ttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgca |
767 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
17163382 |
ttcttcttcttcattcatcaccaatttcatattagtctcagcagatgatgatgatgaattgtagttcatcatattgaacctcttcaatatatcagataca |
17163283 |
T |
|
| Q |
768 |
tacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacatgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactca |
867 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17163282 |
tacttcaattgatgcatcaccagtcccactgcaacttcagtaaattccatgcctagaaaatatgtcaagtttcctaaatctgacatttcaaactcattca |
17163183 |
T |
|
| Q |
868 |
tcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcactatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcc |
967 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
17163182 |
tcatctgagttttgaatgcttctatctcattcacaacactaacaatca--------ttatcaacatatagacaaatgagtagttgattatcttcaattcc |
17163091 |
T |
|
| Q |
968 |
tttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgtttt |
1066 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
17163090 |
tttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgccgcacaagaaaattgtcaattctcttgttccaggctcttggtgcttgcttc |
17162991 |
T |
|
| Q |
1067 |
aatccatagagagctttgtgtaatctatacaccata |
1102 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17162990 |
aaaccatatagtgccttgtgtgatctatacaccata |
17162955 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 354 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 3596327 - 3595757
Alignment:
| Q |
354 |
atgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttc |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | | | ||||||| ||||||||||| | || | ||| |
|
|
| T |
3596327 |
atgaaattggagcattcagaaacttgaataggtaacctgatgtgctcttcctatctcgcttattccca-accaatctgcatcagaataagttataaattc |
3596229 |
T |
|
| Q |
454 |
catagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtatcccatcactctcttggctgctagccggtgagatact |
553 |
Q |
| |
|
| |||| | ||||| | |||||||||||| | || | ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
3596228 |
cgtagagttttcatttatacatttaggaaacaaaatgc-atactctagtgttcctttgatgtatctcatcactcttttagctgctagcaggtgagatgct |
3596130 |
T |
|
| Q |
554 |
--tggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttcatagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaaca |
651 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| || || || ||| |||||| |
|
|
| T |
3596129 |
cttggttcactcatgaatcgtctgattataccaactgcatatgcaatatcaggtctactattgcacatataccttagtgatcccacaatatgcttgaaca |
3596030 |
T |
|
| Q |
652 |
atgtaagactct-catgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggttatgatgatggattgcagttcatcatattaaacctct |
750 |
Q |
| |
|
||||| || ||| | ||||||| |||||||||| || || || | ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
3596029 |
atgtagga-tctactagttcttcttcttcattcaccaccattttaaaattagtttcagtaggtgatgataatggattgcagctcaccattttgaacctct |
3595931 |
T |
|
| Q |
751 |
tcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattacatgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctga |
850 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || || ||||| |||| |||||| | || ||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
3595930 |
tcaatatatcagatgcatacttcatttgatgcataacacatccttcaaaaatctcagtgaattccatgccaagaacatatgttagctttaataaatctgt |
3595831 |
T |
|
| Q |
851 |
catttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtcactatcaagt |
924 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||| | |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
3595830 |
catttcacactctttcatcattttgcctttgaacgtttctatctcattcacatcactaccggtcacaatcaagt |
3595757 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Original strand, 27552331 - 27552453
Alignment:
| Q |
28 |
gtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctccctcagaaaa |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
27552331 |
gtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgtttacttgctcccttagaaaa |
27552430 |
T |
|
| Q |
128 |
tgaaacttggcttctatatgctt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27552431 |
tgaaacttggcttctatatgctt |
27552453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 300 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 23256140 - 23255807
Alignment:
| Q |
300 |
tatactcagattcacaggttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgct |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
23256140 |
tatactcagatttacatgttcacaatgctaccactagttgcttcttagcacaccaagagattggagcattcagaaatttaaataggtaacctaaggtgct |
23256041 |
T |
|
| Q |
400 |
ctttctatcctatttgtctcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgc |
499 |
Q |
| |
|
|||| |||| | || || | |||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||| | | ||| |||||||||||| || ||||| || | |
|
|
| T |
23256040 |
ctttatatcttgcttatccccacactaatatgcatcagaataagctatcaactccatagaatcttaagtcagacatttaggaaacagtataccttactct |
23255941 |
T |
|
| Q |
500 |
agtgttcctttgatgtatcccatcactctcttggctgctagccggtgaga--tacttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaa |
597 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| |||||| || || |||||| || |||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
23255940 |
agtattcaattgatgtatctcatcacccttttagctgcttgcaagtgagaagctcttggttcactcacgaacatgctaattatgccaagtgcataagcaa |
23255841 |
T |
|
| Q |
598 |
tatcaggcctactatttcatagatacctcagtga |
631 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
23255840 |
tatcaggccttctattgcacaaatacctcagtga |
23255807 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17163571 - 17163431
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| ||| |
|
|
| T |
17163571 |
tgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagaagcagctcagtggagcaatggacaatctgcaatgcacctttgttcactttctc |
17163472 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
17163471 |
cctcagaaaatggaactttgcctctacgtgtttgcttcttc |
17163431 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 972 - 1093
Target Start/End: Original strand, 15566068 - 15566190
Alignment:
| Q |
972 |
ttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttgctgcacaa-aaaattgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatc |
1070 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || | |
|
|
| T |
15566068 |
ttcacatagacaccatattcagctttgcatttgacaaagtattgctgcacaagaaagttgtcaatcctcttattccaggctcttggagcttgcttcaaac |
15566167 |
T |
|
| Q |
1071 |
catagagagctttgtgtaatcta |
1093 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
15566168 |
catatagagccttatgtaatcta |
15566190 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0440 (Bit Score: 796; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:
Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 796; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 7452 - 6350
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7452 |
tgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagctacagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctc |
7353 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatgaacaatgcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
7352 |
cctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattct |
7253 |
T |
|
| Q |
218 |
ataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7252 |
ataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacagg |
7153 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgacaatgctacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
7152 |
ttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtc |
7053 |
T |
|
| Q |
418 |
tcgacaccaatcagcatcagaatatgccatcagttccatagaactatcattcaaacatttaggaaataggataccatattgcagtgttcctttgatgtat |
517 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7052 |
tccacaccaatcagcatcagaatatgctatcagttcaatagaattttcatttaagcacttaggaaataaaatgccatactgcagtgttcctttgatgtat |
6953 |
T |
|
| Q |
518 |
cccatcactctcttggctgctagccggtgagata--cttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggcctactatttc |
615 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
6952 |
ctcatcactcttttggctgctagcaggtgagatactcttggttcactcatgaatctactgattatgccaactgcatatgcaatatcaggtctactattgc |
6853 |
T |
|
| Q |
616 |
atagatacctcagtgaaccaactatttgcctgaacaatgtaagactctcatgttcttcatcttcattcatcatcaactttacatttgtctcagctggtta |
715 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || || || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6852 |
atagatacctcagtgaaccaacaatttgcttgaataatgtaggattcacaggttcttcatcttcattcattaccagttttacatttgtctcagctggtga |
6753 |
T |
|
| Q |
716 |
tgatgatggattgcagttcatcatattaaacctcttcaatatgtcagatgcatacttcatttgttgcatcaccaatccctctgcaacttcagtaaattac |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6752 |
tgatgatggattgcagctcatcatattgaacctcttcaatatttcagatgcatacttcttttgttgcattatcaatccctctgcaacttcagtaaattcc |
6653 |
T |
|
| Q |
816 |
atgcctaaaaagtatgtcaattttcctaaatctgacatttcaaactcactcatcatctgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
915 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6652 |
atgcctagaaagtatgtcaattttcccaaatctgacatttcaaattcactcatcatttgtgatttgaatgcttctatctcattcatatcactaccagtca |
6553 |
T |
|
| Q |
916 |
ctatcaagtcatcaacataaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatattcagacttgcatttgacaaattcttg |
1015 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6552 |
ctatcagatcatcaacctaaagacagatgagtagttgattaccttcacttcctttcttcacatatacaccatactcagacttgcatttgacaaattcttg |
6453 |
T |
|
| Q |
1016 |
ctgcacaaaaaat-tgtcaattctcttgttccaagctcttggtgcatgttttaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctatccct |
1114 |
Q |
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| T |
6452 |
ctgtacaagaaatctgtcaattctcttgttccaagttcttggtgcctgtttcaatccatagagagctttgtgtaatctatacaccatatcctctttccct |
6353 |
T |
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| Q |
1115 |
ttg |
1117 |
Q |
| |
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||| |
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| T |
6352 |
ttg |
6350 |
T |
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Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2926 - 2735
Alignment:
| Q |
18 |
tgatgaacccgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatgaacaatttgcagtgctcccttgttcactagctc |
117 |
Q |
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| T |
2926 |
tgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagcttcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctc |
2827 |
T |
|
| Q |
118 |
cctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagattataccagatttgttgtcaatga |
209 |
Q |
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| T |
2826 |
cctcagaaaatgtaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatga |
2735 |
T |
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