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Alignment Overview

Query: NF15475_low_8 (Length: 284)

Name: NF15475_low_8
Description: NF15475
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15475_low_8
NF15475_low_8
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (8-269)||(29199106-29199367)
chr5 (14-157)||(34264508-34264651)
chr5 (14-157)||(36440360-36440503)
chr5 (14-157)||(24040245-24040390)
chr5 (14-139)||(37424422-37424547)
chr5 (19-157)||(9989470-9989608)
chr5 (19-139)||(16860468-16860588)
chr5 (14-157)||(27186020-27186163)
chr5 (19-157)||(2183090-2183228)
chr5 (31-157)||(32288254-32288380)
chr5 (28-139)||(16860594-16860705)
chr5 (38-157)||(35569964-35570083)
chr5 (19-157)||(38958889-38959027)
chr5 (62-139)||(25567196-25567273)
chr5 (28-157)||(11316105-11316230)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (14-157)||(5937973-5938116)
chr6 (14-157)||(7270100-7270243)
chr6 (15-157)||(7270776-7270918)
chr6 (14-157)||(5310973-5311116)
chr6 (8-157)||(32993169-32993318)
chr6 (14-157)||(9046233-9046376)
chr6 (25-157)||(18053103-18053232)
chr6 (14-157)||(35167650-35167795)
chr6 (14-150)||(3423330-3423466)
chr6 (14-157)||(6236081-6236224)
chr6 (14-157)||(34994540-34994683)
chr6 (16-132)||(26957134-26957250)
chr6 (14-157)||(5639333-5639476)
chr6 (14-157)||(34890791-34890934)
chr6 (14-139)||(21856715-21856840)
chr6 (14-157)||(31247263-31247406)
chr6 (19-157)||(2517149-2517287)
chr6 (14-108)||(32753369-32753463)
chr6 (14-157)||(31237893-31238036)
chr6 (31-157)||(25176834-25176960)
chr6 (14-157)||(24744475-24744611)
chr6 (56-151)||(21540179-21540274)
chr6 (54-157)||(26600504-26600607)
chr6 (19-157)||(6137543-6137681)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (14-157)||(33091613-33091756)
chr4 (19-157)||(50768968-50769106)
chr4 (14-157)||(19088501-19088644)
chr4 (14-157)||(44991439-44991581)
chr4 (14-132)||(6505696-6505814)
chr4 (16-158)||(37206589-37206731)
chr4 (14-151)||(14985484-14985621)
chr4 (16-157)||(38339639-38339780)
chr4 (13-157)||(30683687-30683831)
chr4 (14-157)||(8592116-8592259)
chr4 (14-157)||(21763341-21763484)
chr4 (16-139)||(23755580-23755703)
chr4 (8-151)||(50508611-50508754)
chr4 (8-158)||(53751056-53751206)
chr4 (39-151)||(23755985-23756097)
chr4 (14-157)||(19508573-19508716)
chr4 (8-151)||(41878013-41878156)
chr4 (14-157)||(46849829-46849972)
chr4 (24-158)||(43566548-43566682)
chr4 (14-151)||(6712116-6712253)
chr4 (32-157)||(44957536-44957661)
chr4 (14-157)||(623839-623982)
chr4 (30-157)||(1433447-1433574)
chr4 (14-157)||(15477805-15477948)
chr4 (14-157)||(42855499-42855642)
chr4 (30-157)||(53995110-53995237)
chr4 (14-158)||(43734446-43734590)
chr4 (14-157)||(16037954-16038097)
chr4 (14-157)||(25181972-25182115)
chr4 (14-157)||(53259298-53259441)
chr4 (19-157)||(24898336-24898474)
chr4 (27-157)||(52557260-52557390)
chr4 (14-131)||(36122593-36122710)
chr4 (14-157)||(41751976-41752119)
chr4 (28-157)||(39448662-39448791)
chr4 (30-157)||(12817953-12818080)
chr4 (203-269)||(12652538-12652603)
chr4 (19-88)||(8398195-8398264)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (14-157)||(38588734-38588877)
chr8 (14-156)||(15871781-15871923)
chr8 (14-157)||(44594761-44594904)
chr8 (27-153)||(11707923-11708049)
chr8 (14-139)||(40048220-40048344)
chr8 (14-157)||(27473231-27473374)
chr8 (14-139)||(37569474-37569600)
chr8 (19-156)||(45276761-45276898)
chr8 (37-157)||(7949559-7949678)
chr8 (19-151)||(15048552-15048684)
chr8 (29-157)||(33295859-33295987)
chr8 (14-157)||(5435060-5435203)
chr8 (14-157)||(45077362-45077506)
chr8 (14-157)||(1432278-1432421)
chr8 (14-132)||(34470716-34470834)
chr8 (14-157)||(5152694-5152837)
chr8 (14-151)||(27669569-27669711)
chr8 (24-157)||(7535003-7535136)
chr8 (24-137)||(24659366-24659479)
chr8 (24-138)||(1870099-1870215)
chr8 (18-157)||(1651736-1651875)
chr8 (18-157)||(1740112-1740251)
chr8 (78-152)||(11173858-11173932)
chr8 (38-151)||(1646691-1646804)
chr8 (24-95)||(18298410-18298481)
chr8 (16-52)||(40660145-40660181)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (14-157)||(54752310-54752453)
chr3 (14-157)||(39241505-39241648)
chr3 (14-157)||(54108062-54108205)
chr3 (19-157)||(8474011-8474149)
chr3 (14-151)||(27801642-27801779)
chr3 (14-139)||(53716458-53716583)
chr3 (14-157)||(10506108-10506251)
chr3 (24-157)||(29818324-29818457)
chr3 (14-158)||(24428713-24428857)
chr3 (24-139)||(11256268-11256383)
chr3 (14-157)||(12203711-12203854)
chr3 (14-157)||(22151992-22152135)
chr3 (14-157)||(39951504-39951647)
chr3 (14-157)||(51509279-51509422)
chr3 (19-157)||(42591931-42592069)
chr3 (28-157)||(26318356-26318485)
chr3 (14-151)||(39664344-39664481)
chr3 (14-157)||(32633225-32633368)
chr3 (8-157)||(15986382-15986530)
chr3 (14-137)||(19883406-19883530)
chr3 (17-157)||(47669406-47669546)
chr3 (14-157)||(5900583-5900726)
chr3 (19-157)||(16931753-16931891)
chr3 (14-139)||(41835086-41835211)
chr3 (25-157)||(22201763-22201895)
chr3 (14-157)||(1994329-1994471)
chr3 (14-157)||(21568893-21569035)
chr3 (14-157)||(21969776-21969919)
chr3 (14-157)||(21992212-21992355)
chr3 (14-132)||(18464628-18464746)
chr3 (19-139)||(46152778-46152898)
chr3 (19-157)||(44893887-44894025)
chr3 (14-151)||(47303179-47303315)
chr3 (14-157)||(4757654-4757796)
chr3 (19-151)||(4773395-4773527)
chr3 (14-89)||(28986320-28986395)
chr3 (14-63)||(1999488-1999537)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (14-157)||(9006351-9006494)
chr1 (14-157)||(37284888-37285031)
chr1 (14-157)||(49140303-49140446)
chr1 (14-150)||(27547829-27547965)
chr1 (14-157)||(23476501-23476644)
chr1 (27-157)||(27400597-27400727)
chr1 (14-148)||(44322816-44322950)
chr1 (28-157)||(45052863-45052992)
chr1 (14-158)||(20306148-20306292)
chr1 (14-158)||(25995930-25996074)
chr1 (14-149)||(26707356-26707491)
chr1 (19-157)||(37304175-37304313)
chr1 (14-157)||(12481219-12481362)
chr1 (18-157)||(16024044-16024183)
chr1 (14-157)||(31703761-31703903)
chr1 (24-157)||(1762844-1762977)
chr1 (14-139)||(4697042-4697167)
chr1 (18-157)||(6797971-6798110)
chr1 (14-157)||(37576328-37576471)
chr1 (28-157)||(2064385-2064514)
chr1 (28-157)||(3089489-3089618)
chr1 (16-153)||(37585855-37585992)
chr1 (24-157)||(49643841-49643974)
chr1 (17-156)||(8762562-8762701)
chr1 (27-139)||(35612255-35612367)
chr1 (40-157)||(12127239-12127356)
chr1 (43-157)||(38127856-38127970)
chr1 (14-157)||(39486362-39486496)
chr1 (60-157)||(4330043-4330140)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (14-151)||(44332679-44332816)
chr7 (16-157)||(6356912-6357053)
chr7 (16-157)||(21391352-21391493)
chr7 (16-149)||(31638105-31638238)
chr7 (24-157)||(41751797-41751930)
chr7 (14-151)||(43247568-43247705)
chr7 (14-157)||(41453165-41453308)
chr7 (19-158)||(48626228-48626367)
chr7 (14-151)||(7579032-7579169)
chr7 (14-158)||(36423515-36423659)
chr7 (14-157)||(33716735-33716874)
chr7 (14-157)||(28297966-28298109)
chr7 (15-151)||(34037072-34037208)
chr7 (19-157)||(28286282-28286420)
chr7 (19-157)||(17359328-17359470)
chr7 (24-157)||(19681665-19681798)
chr7 (14-157)||(8937009-8937152)
chr7 (14-157)||(10526458-10526600)
chr7 (19-157)||(8542646-8542784)
chr7 (27-139)||(35146871-35146983)
chr7 (19-157)||(40673172-40673308)
chr7 (14-157)||(41191842-41191988)
chr7 (19-157)||(6356432-6356570)
chr7 (14-106)||(17750095-17750187)
chr7 (19-101)||(17363437-17363523)
chr7 (14-92)||(1114257-1114335)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (14-157)||(8575-8718)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (14-157)||(50636-50779)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (14-157)||(15595-15738)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (14-157)||(8174045-8174188)
chr2 (19-157)||(26181865-26182003)
chr2 (14-151)||(2148046-2148183)
chr2 (24-157)||(34735513-34735646)
chr2 (14-157)||(16305172-16305315)
chr2 (15-157)||(29472389-29472531)
chr2 (19-157)||(41474229-41474367)
chr2 (14-157)||(36713735-36713875)
chr2 (14-157)||(13193135-13193278)
chr2 (14-157)||(15744604-15744747)
chr2 (14-157)||(15405916-15406059)
chr2 (19-151)||(19815869-19816001)
chr2 (14-158)||(24372127-24372271)
chr2 (19-157)||(7469313-7469451)
chr2 (14-157)||(10991998-10992141)
chr2 (14-157)||(17052205-17052344)
chr2 (58-157)||(24138710-24138809)
chr2 (25-157)||(19847490-19847621)
chr2 (14-157)||(7496140-7496282)
chr2 (62-157)||(38332851-38332946)
chr2 (64-157)||(12860577-12860670)
chr2 (15-68)||(24138229-24138282)
chr2 (14-52)||(12860540-12860578)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (14-157)||(18420-18563)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (14-157)||(19855-19998)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (14-151)||(349226-349363)
scaffold0003 (14-151)||(113519-113656)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (14-157)||(82018-82161)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (14-157)||(20898-21040)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (14-157)||(14295-14438)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (25-157)||(24309-24441)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (14-157)||(72909-73051)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (19-157)||(21658-21796)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (40-157)||(45903-46020)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (28-157)||(6145-6271)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 269
Target Start/End: Original strand, 29199106 - 29199367
Alignment:
Q  8 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29199106 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttatcaataacatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 29199205  T
Q  108 gaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaataattctaacgtgaaacgactgttatttagagacggtgggactattttga 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29199206 gaattaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatataaataattctaacgtgaaacgactgttatttagagacggtgggactattttga 29199305  T
Q  208 tataattttgtgacgaaagaaagttgatgtatttcattccataattaaataggggaataaac 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29199306 tataattttgtgacgaaagaaagttgatgtatttcattccataattaaatagaggaataaac 29199367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 34264508 - 34264651
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  34264508 ggtacctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatagaacca 34264607  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  34264608 aaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 34264651  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 36440360 - 36440503
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  36440360 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgacca 36440459  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  36440460 aaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaa 36440503  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 24040245 - 24040390
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  24040245 ggtacctgacctcctgttttacacatacatatgaacaataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 24040344  T
Q  114 aa--atgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  24040345 aaatatgatactaataaataaagttagaagacccacataacacaaa 24040390  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 37424422 - 37424547
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || |    
T  37424422 ggtacctgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaaaaataggacca 37424521  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  37424522 aaatgatattaataaataaagttaga 37424547  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9989608 - 9989470
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||    
T  9989608 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatattagtcactgtttaatcataataccttaataagacataggaccaaaatg 9989509  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  9989508 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 9989470  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 16860468 - 16860588
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||    
T  16860468 ctgacctcctgtttcaaacatgcatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatggaaccaaaatg 16860567  T
Q  119 atactaataaataatgttaga 139  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  16860568 atactaataaataaagttaga 16860588  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27186163 - 27186020
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  27186163 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataataccattcactatttaatcataataccttaacaaggcataagacca 27186064  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  27186063 aaatgatactaattaataaaattagaggacccacataaaacaaa 27186020  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2183228 - 2183090
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||  || ||||||    
T  2183228 ctgacctcctgtttcacacatacatataaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataatactttaacaagatatatgaccaaaatg 2183129  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  2183128 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 2183090  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Original strand, 32288254 - 32288380
Alignment:
Q  31 ttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||    
T  32288254 ttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaataatactaataaat 32288353  T
Q  131 aatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    || |||||| || |||||||| |||||    
T  32288354 aaagttagaggacccacataacacaaa 32288380  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Original strand, 16860594 - 16860705
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||    
T  16860594 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactaattaatcataatacattaacaagacataagaccaaaatgatactaata 16860693  T
Q  128 aataatgttaga 139  Q
    ||||| ||||||    
T  16860694 aataaagttaga 16860705  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 35569964 - 35570083
Alignment:
Q  38 atacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgtta 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  35569964 atacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataacttaacaaggaataagaccgaaatgatactaataaataaagtta 35570063  T
Q  138 gaagatccacataatacaaa 157  Q
    || ||  ||||||| |||||    
T  35570064 gaggactcacataacacaaa 35570083  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 38958889 - 38959027
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||  || ||||||    
T  38958889 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacgtaacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataagaccaaaatg 38958988  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  38958989 atacttataaataaagttagaggactcacataacacaaa 38959027  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 25567196 - 25567273
Alignment:
Q  62 caataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25567196 caataatattagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgactaaaataatactaataaataaagttaga 25567273  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11316230 - 11316105
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||| |   ||||| || |||||||||||||||    
T  11316230 tgttttacacatacatatgaaccataacagttaccaataatataagtcaatatttaatcataat-tgttaaga---cataggaccaaaatgatactaata 11316135  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  11316134 aataaagttagaggacctacataacacaaa 11316105  T

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Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 5937973 - 5938116
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5937973 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatagaacca 5938072  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  5938073 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 5938116  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7270243 - 7270100
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |    
T  7270243 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaacaatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgacca 7270144  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  7270143 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 7270100  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7270918 - 7270776
Alignment:
Q  15 gtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaa 114  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  7270918 gtacatgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaa 7270819  T
Q  115 aatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  7270818 aatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 7270776  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5311116 - 5310973
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  5311116 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgacca 5311017  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  5311016 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 5310973  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 32993169 - 32993318
Alignment:
Q  8 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 107  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32993169 tatgtaggtacctgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcata 32993268  T
Q  108 gaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  32993269 agaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaa 32993318  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9046376 - 9046233
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |    
T  9046376 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatagcttaacaaggcataagacca 9046277  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  9046276 aaatgatactaataaataaatttagaggacccacataacacaaa 9046233  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18053232 - 18053103
Alignment:
Q  25 tcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatacta 124  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18053232 tcctgtttcacacatacata---accataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaaccaaaatgatacta 18053136  T
Q  125 ataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  18053135 ataaataaagttagaggacccacataacacaaa 18053103  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 35167650 - 35167795
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatc--ataataccttaacaaagcatagaac 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||    
T  35167650 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccattaatatcagtcactatttaatcatataataccttaacaaggattaggac 35167749  T
Q  112 taaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  35167750 taaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 35167795  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 3423330 - 3423466
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || |    
T  3423330 ggtacctgacctcctgtttaacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcgtaataccttaacaaggcataagacca 3423429  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacata 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  3423430 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacata 3423466  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 6236081 - 6236224
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |    
T  6236081 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggacca 6236180  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||    
T  6236181 agatgatactaataaatgaagttagaggattcacataacacaaa 6236224  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 34994540 - 34994683
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  34994540 ggtacttgacctcgtgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagacca 34994639  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    
T  34994640 aaatgatactaataaatcaagttagaggacccgcataacacaaa 34994683  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26957250 - 26957134
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  26957250 tacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacacttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaa 26957151  T
Q  116 atgatactaataaataa 132  Q
    |||||||||||||||||    
T  26957150 atgatactaataaataa 26957134  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 5639333 - 5639476
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  5639333 ggtacccgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgacca 5639432  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||    
T  5639433 aaatgatactaataaataaagttagagaacccacataacacaaa 5639476  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34890934 - 34890791
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  || |    
T  34890934 ggtacctgaccttctgtttcacacacacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataatactttaacaaggcatatgacca 34890835  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  34890834 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 34890791  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 21856715 - 21856840
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  21856715 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatccgtcactgtttaatcataataccttaacaaggaataagacca 21856814  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21856815 aaatgatgctaataaataaagttaga 21856840  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31247406 - 31247263
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||  |  |    
T  31247406 ggtacctgacttcctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatctgtcattatttaatcataataccttaacaaggaatatgatca 31247307  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  31247306 aaatgatactaataaataaagttagaggactcacataaaacaaa 31247263  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2517287 - 2517149
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  2517287 ctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccactaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatg 2517188  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    || || |||||||| ||| || || |||||||| |||||    
T  2517187 attcttataaataaagttggaggacccacataacacaaa 2517149  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32753463 - 32753369
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32753463 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacacttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 32753369  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31238036 - 31237893
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | |  |  |    
T  31238036 ggtacctgacttcctgtttctcacatacatatgaaccataacagttaacaataatatctgtcattatttaatcataataccttaacaaggaacatgatca 31237937  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  31237936 aaataatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaa 31237893  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Original strand, 25176834 - 25176960
Alignment:
Q  31 ttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||    
T  25176834 ttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatttgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaat 25176933  T
Q  131 aatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    || |||||| |  |||||||| |||||    
T  25176934 aaagttagaggccccacataacacaaa 25176960  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24744611 - 24744475
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |    
T  24744611 ggtacctgaccttctgtttcacacataca-atgaac------agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggacca 24744519  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  24744518 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 24744475  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 151
Target Start/End: Original strand, 21540179 - 21540274
Alignment:
Q  56 agttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21540179 agttgtcaataatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 21540274  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26600607 - 26600504
Alignment:
Q  54 acagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |    
T  26600607 acagttaccaataatatcggtcactatttaatcataataccttaataaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataaca 26600508  T
Q  154 caaa 157  Q
    ||||    
T  26600507 caaa 26600504  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 6137543 - 6137681
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |   |||  || ||||||    
T  6137543 ctgacctcctatttcacacagacaaatgaaacataacaattacaaataatatcactcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatg 6137642  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  6137643 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 6137681  T

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Target: chr4 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 33091613 - 33091756
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33091613 ggtacatgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcataggacca 33091712  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  33091713 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 33091756  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 50769106 - 50768968
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  50769106 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatg 50769007  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  50769006 atactaataaataaagttagaggatccacataacacaaa 50768968  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 19088501 - 19088644
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  |    
T  19088501 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataagatca 19088600  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  19088601 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 19088644  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 44991439 - 44991581
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  44991439 ggtacctgacctc-tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagacca 44991537  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  44991538 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 44991581  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 6505696 - 6505814
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  6505696 ggtacctgacttcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacca 6505795  T
Q  114 aaatgatactaataaataa 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6505796 aaatgatactaataaataa 6505814  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Original strand, 37206589 - 37206731
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||    
T  37206589 tacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaaagttaccaataatatcagccactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaa 37206688  T
Q  116 atgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  37206689 atgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaat 37206731  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14985621 - 14985484
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  14985621 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgagccataagagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcataggacca 14985522  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  14985521 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 14985484  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38339780 - 38339639
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  38339780 tacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatgtgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaa 38339681  T
Q  116 atgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  38339680 atgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 38339639  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Original strand, 30683687 - 30683831
Alignment:
Q  13 aggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaact 112  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  30683687 aggtacctgatcttctgtttcacacatacatatgaaccataacagttgccaataatataagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacc 30683786  T
Q  113 aaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  30683787 aaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 30683831  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8592259 - 8592116
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  8592259 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggacca 8592160  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  8592159 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 8592116  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 21763341 - 21763484
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  |    
T  21763341 ggtacctgacctcctgtttcacacatagatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataaaaaca 21763440  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  21763441 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 21763484  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 23755580 - 23755703
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  23755580 tacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaagcatatgaccaaa 23755679  T
Q  116 atgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  23755680 atgatactaataaataaagttaga 23755703  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 50508611 - 50508754
Alignment:
Q  8 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 107  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50508611 tatgtaggtacctgacctcctgtttcgcacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcata 50508710  T
Q  108 gaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
      || ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  50508711 tgaccaaaataatactaataaataaagttagaggacccacataa 50508754  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Original strand, 53751056 - 53751206
Alignment:
Q  8 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 107  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53751056 tatgtaggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatataagtcactatttaatcataataccttaacaaggcata 53751155  T
Q  108 gaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
      || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  53751156 agaccaaaattatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaat 53751206  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Original strand, 23755985 - 23756097
Alignment:
Q  39 tacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||    
T  23755985 tacatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttag 23756084  T
Q  139 aagatccacataa 151  Q
    | |||||||||||    
T  23756085 aggatccacataa 23756097  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 19508573 - 19508716
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  19508573 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatgtgaaccataacagttactaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 19508672  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  19508673 aaatcatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 19508716  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 41878013 - 41878156
Alignment:
Q  8 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 107  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41878013 tatgtaggtacctgacatcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaataata 41878112  T
Q  108 gaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
      || |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  41878113 tgaccaaaatgatactaataaataaagttggaggacccacataa 41878156  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 46849829 - 46849972
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  || |    
T  46849829 ggtacctgaacccctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagacca 46849928  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  46849929 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 46849972  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Original strand, 43566548 - 43566682
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  43566548 ctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatact 43566647  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||| ||| || || |||||||| ||||||    
T  43566648 aataaataaagtttgaggacccacataacacaaat 43566682  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6712253 - 6712116
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || || |    
T  6712253 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacatttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaataaggcacaggacca 6712154  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  6712153 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 6712116  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44957661 - 44957536
Alignment:
Q  32 tcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaata 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  44957661 tcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattatcaaggcatatgaccaaaatgatactaataaata 44957562  T
Q  132 atgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||    
T  44957561 aagttagaggatccacataacacaaa 44957536  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 623839 - 623982
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  || |    
T  623839 ggtacctgacctcctatttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatctgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagacca 623938  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  623939 aaatgatgctaataaataaagttagaggatccacataacacaaa 623982  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Original strand, 1433447 - 1433574
Alignment:
Q  30 tttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  1433447 tttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccataacaaggcataagaccaaaatgatactaataaa 1433546  T
Q  130 taatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||| |||||| || |||||||| |||||    
T  1433547 taaagttagaggacccacataacacaaa 1433574  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 15477805 - 15477948
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  15477805 ggtacctgaccttctgtttcatacatacatatgaaccataacagttaccaataatatgagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 15477904  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || |||| ||| |||||    
T  15477905 aaatgatactaataaacaaagttagaggacccacgtaacacaaa 15477948  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 42855499 - 42855642
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||| || |    
T  42855499 ggtatctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccacaacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacgaggaataggacca 42855598  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  42855599 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 42855642  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Original strand, 53995110 - 53995237
Alignment:
Q  30 tttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||    
T  53995110 tttcacacatacatatgaaccatatcagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatattaataaa 53995209  T
Q  130 taatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||| |||||| || |||||||| |||||    
T  53995210 taaagttagaggacccacataacacaaa 53995237  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 43734446 - 43734590
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  || |    
T  43734446 ggtatctgatctcctatttcacacatacatataaaccataacagttacaaataatatcagtcactatttaatcataatattttaacaaggcataagacca 43734545  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  43734546 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaat 43734590  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 16037954 - 16038097
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  16037954 ggtacctaacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatccgtcactacttaatcataataccttaacaaggaataggacca 16038053  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  16038054 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 16038097  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 25181972 - 25182115
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |    
T  25181972 ggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggacca 25182071  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  25182072 aaatgatgttaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 25182115  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 53259298 - 53259441
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  53259298 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataataattaccaataatatcactcattgtttaatcataataccttaacaaggcataagacca 53259397  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  53259398 aaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaa 53259441  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24898474 - 24898336
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   || ||||||    
T  24898474 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataatacattaacaagacatgtgaccaaaatg 24898375  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  24898374 atactaataaataaagttagaggacgcacataacacaaa 24898336  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 52557260 - 52557390
Alignment:
Q  27 ctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaat 126  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||    
T  52557260 ctgtttcagacatacatatgaattataacaattaccaataatatcagttactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaat 52557359  T
Q  127 aaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52557360 aaataaagttagaggatccacataatacaaa 52557390  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 36122593 - 36122710
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |    
T  36122593 ggtacctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccatatcagctaccaataatatcaatcactatttagtcataataccttaacaaggcatatgacca 36122692  T
Q  114 aaatgatactaataaata 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36122693 aaatgatactaataaata 36122710  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 41751976 - 41752119
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |  |    
T  41751976 ggtacctgacatcctgtttcacaaatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttagcaaggcatatgatca 41752075  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  41752076 aaatgatattaataaataaaattagaggacccacataacacaaa 41752119  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 39448662 - 39448791
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||    
T  39448662 tgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatgctaata 39448761  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  39448762 aataaagttagaggacccagataacacaaa 39448791  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12818080 - 12817953
Alignment:
Q  30 tttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  12818080 tttcacacatatatatgaaccataacatttaacaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactgataaa 12817981  T
Q  130 taatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||| |||| | || |||||||| |||||    
T  12817980 taaagttacaggacccacataacacaaa 12817953  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12652603 - 12652538
Alignment:
Q  203 tttgatataattttgtgacgaaagaaagttgatgtatttcattccataattaaataggggaataaac 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12652603 tttgatataattt-gtgacaaaagaaagttgatgtatttcattccataattaaatagaggaataaac 12652538  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 8398195 - 8398264
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcat 88  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8398195 ctgacctcctgttccacacatacatataaaccataatagttatcaataatatcagtcactatttagtcat 8398264  T

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Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38588877 - 38588734
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  38588877 ggtacctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacca 38588778  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  38588777 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 38588734  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 15871781 - 15871923
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  15871781 ggtacctgacctcctgtttcacacatacacatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggacca 15871880  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  15871881 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaa 15871923  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 44594761 - 44594904
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  44594761 ggtacttgacctcctatttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatagaacca 44594860  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  44594861 aaataatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaa 44594904  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Original strand, 11707923 - 11708049
Alignment:
Q  27 ctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||    
T  11707923 ctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaaacataagatcaaaatgatactaat 11708022  T
Q  127 aaataatgttagaagatccacataata 153  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||    
T  11708023 aaataaagttagatgacccacataata 11708049  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40048344 - 40048220
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  40048344 ggtacctgacctcctgtttcacacataca-atgaaccataacggttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgacca 40048246  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40048245 aaatgatactaataaataaagttaga 40048220  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 27473231 - 27473374
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  27473231 ggtatctgacctcttgcttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataagacca 27473330  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  27473331 aaatgatactaataaataaagttagaggacctacataacacaaa 27473374  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 37569474 - 37569600
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcacta-tttaatcataataccttaacaaagcatagaact 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  ||     
T  37569474 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaatcatatcagtcactattttaatcataataccttaacaagacatatgacc 37569573  T
Q  113 aaaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37569574 aaaatgatactaataaataaagttaga 37569600  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 45276761 - 45276898
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  || ||||||    
T  45276761 ctgacctcctgttccacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggaatatgaccaaaatg 45276860  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaa 156  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  45276861 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaa 45276898  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7949678 - 7949559
Alignment:
Q  37 catacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgtt 136  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  7949678 catacatatgaacaat-acagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagtt 7949580  T
Q  137 agaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||| || |||||||| |||||    
T  7949579 agaggacccacataacacaaa 7949559  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15048684 - 15048552
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||    
T  15048684 ctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcattatttaatcataataccttaacaaataatatgaccaaaatg 15048585  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15048584 atactaataaataaagttagaggacccacataa 15048552  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Original strand, 33295859 - 33295987
Alignment:
Q  29 gtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataa 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||||||||||||    
T  33295859 gtttcacacatacatatgaatcataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataa 33295958  T
Q  129 ataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  33295959 ataaagttagaggactcacataacacaaa 33295987  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 5435060 - 5435203
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||  || |    
T  5435060 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatttgtcattatttaattataataccttaactaggcatatgacca 5435159  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  5435160 aaatgatactaataaataaagttagatgacccacataacacaaa 5435203  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 45077362 - 45077506
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcaca-gttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaact 112  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  45077362 ggtatctgacctcctctttcacacatacatgtggaccataaaaagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagacc 45077461  T
Q  113 aaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  45077462 aaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 45077506  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1432421 - 1432278
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |  |    
T  1432421 ggtatctgacctcctgtttcacacgtacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaaacataatacattaacaaggcatatgatca 1432322  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  1432321 aaatgatattaataaataaagttagaggacccaaataacacaaa 1432278  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34470834 - 34470716
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  |    
T  34470834 ggtacctgagttcctgtttcacacatacataagaatcataacagttaccaataatatctgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatca 34470735  T
Q  114 aaatgatactaataaataa 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34470734 aaatgatactaataaataa 34470716  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 5152694 - 5152837
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  5152694 ggtatctgacctcctgtttcatatatacatatgaaccataacagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaagaaggcatatgacca 5152793  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  5152794 aaatgatactagtaaataaagttagaggacccatataacacaaa 5152837  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27669711 - 27669569
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatca-----cagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||     
T  27669711 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaattaacagttaccaataacatcagtcactatttaatcataataatttaacaaggtatat 27669612  T
Q  109 aactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27669611 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 27669569  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 7535003 - 7535136
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||  || |||||||||||    
T  7535003 ctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttacaaataatatcagtcattatttaatcataatacgttaacgaggaataagaccaaaatgatact 7535102  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| | |||| ||  ||||||| |||||    
T  7535103 aataaataaagctagaggactcacataacacaaa 7535136  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 24659366 - 24659479
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || || |||||||||||    
T  24659366 ctcctgtttcacacatacatattaactataacagttagtaataatatcagtcactatttaatcagaataccttaataaggcagaggaccaaaatgatact 24659465  T
Q  124 aataaataatgtta 137  Q
    ||||||||| ||||    
T  24659466 aataaataaagtta 24659479  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1870215 - 1870099
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatc--ataataccttaacaaagcatagaactaaaatgata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||  || |||||||||    
T  1870215 ctcctgtttcacacatacatatgaaccataacggttactaataatatcagtcactatttaatcatataatacattaataaggcataagaccaaaatgata 1870116  T
Q  122 ctaataaataatgttag 138  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1870115 ctaataaataaagttag 1870099  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 1651736 - 1651875
Alignment:
Q  18 cctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaat 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||  || |||||    
T  1651736 cctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataagaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaat 1651835  T
Q  118 gatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  1651836 gatactaacaaataaagttagaggacccacataacacaaa 1651875  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 1740112 - 1740251
Alignment:
Q  18 cctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaat 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||  || |||||    
T  1740112 cctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataagaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaat 1740211  T
Q  118 gatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  1740212 gatactaacaaataaagttagaggacccacataacacaaa 1740251  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 152
Target Start/End: Original strand, 11173858 - 11173932
Alignment:
Q  78 tatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataat 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  11173858 tatttattcataataccttaacaaagcatagaacccaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataat 11173932  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 1646691 - 1646804
Alignment:
Q  38 atacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgtta 137  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  1646691 atacaaatgaaacattacaattacccataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagtta 1646790  T
Q  138 gaagatccacataa 151  Q
    || || ||||||||    
T  1646791 gaggacccacataa 1646804  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 18298410 - 18298481
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatacct 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18298410 ctcctatttcacacatacatatgaatcataacagttactaataatatttgtcactatttaatcataatacct 18298481  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 40660145 - 40660181
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccat 52  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40660145 tacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccat 40660181  T

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Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54752453 - 54752310
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  54752453 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgacca 54752354  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  54752353 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 54752310  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39241648 - 39241505
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  39241648 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataagacca 39241549  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  39241548 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 39241505  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 54108062 - 54108205
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  54108062 ggtacctgagctcctgtttcacacatacctatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgacca 54108161  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  54108162 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 54108205  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 8474011 - 8474149
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  8474011 ctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatg 8474110  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  8474111 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 8474149  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27801779 - 27801642
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  27801779 ggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatagaacca 27801680  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27801679 aaatgatattaataaataaagttagaggatccacataa 27801642  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53716583 - 53716458
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  53716583 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggacca 53716484  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  53716483 aaatgatactaataaataaagttaga 53716458  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 10506108 - 10506251
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  10506108 ggtacctgacctcctgtttcacatatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 10506207  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  10506208 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 10506251  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29818457 - 29818324
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||    
T  29818457 ctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaataaaacatatgaccaaaatgatact 29818358  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  29818357 aataaataaagttagaggatccatataacacaaa 29818324  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24428857 - 24428713
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |    
T  24428857 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaagcataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaagaaggcataggagca 24428758  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24428757 aaatgatactaataaattaagttagaggatccacataacacaaat 24428713  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11256383 - 11256268
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  11256383 ctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatact 11256284  T
Q  124 aataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11256283 aataaataaagttaga 11256268  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 12203711 - 12203854
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  12203711 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaaacatattacca 12203810  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||    
T  12203811 aaatgatactaataaataaagttagaggtcccacataacacaaa 12203854  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22152135 - 22151992
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  22152135 ggtatctgaccttctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaataggacca 22152036  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  22152035 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 22151992  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39951647 - 39951504
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |    
T  39951647 ggtatctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatatgacca 39951548  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| |||||    
T  39951547 aaatgatactaataaataaagttaaaggacccacataacacaaa 39951504  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 51509279 - 51509422
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  51509279 ggtatctgacctcctatttcacacgtacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgacca 51509378  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  51509379 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaa 51509422  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42592069 - 42591931
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||    
T  42592069 ctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatg 42591970  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  42591969 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 42591931  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 26318356 - 26318485
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  26318356 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaata 26318455  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  26318456 aataaagttagaggacccacataacacaaa 26318485  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 39664344 - 39664481
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39664344 ggtacctgacctcttatttcacacatacatatgaactataacatttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatagaacca 39664443  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  39664444 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 39664481  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 32633225 - 32633368
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  || |    
T  32633225 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaatatgacca 32633324  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  32633325 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 32633368  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15986530 - 15986382
Alignment:
Q  8 tatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcata 107  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  15986530 tatgtaggtacctgacctcctgtatcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaac-acgaata 15986432  T
Q  108 gaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||    
T  15986431 ggaccaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacataacacaaa 15986382  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19883530 - 19883406
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaat-aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaact 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||     
T  19883530 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacatttaccaattaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacttagaacc 19883431  T
Q  113 aaaatgatactaataaataatgtta 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  19883430 aaaatgatactaataaataaagtta 19883406  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 47669546 - 47669406
Alignment:
Q  17 acctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaa 116  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  || ||||    
T  47669546 acctgacctcctgtttcacacacacatatgaaccataacagttatcaataatatctatcactatttaatcataatatcttaacaaggaatatgaccaaaa 47669447  T
Q  117 tgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  47669446 tgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 47669406  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 5900583 - 5900726
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  5900583 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaaaaatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggacca 5900682  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  5900683 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 5900726  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16931891 - 16931753
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  || ||||||    
T  16931891 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagctaccaataatatcagtaactatttaatcttaataccttaacaagacatatgaccaaaatg 16931792  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  16931791 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 16931753  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 41835086 - 41835211
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  || |    
T  41835086 ggtacttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcaaaatacattaacaaggaatatgacca 41835185  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41835186 aaatgatactaataaataaagttaga 41835211  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22201895 - 22201763
Alignment:
Q  25 tcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatacta 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  22201895 tcctgtttcatacatacatatgaaccataatagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatacta 22201796  T
Q  125 ataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  22201795 ataaataaagttagaggactcacataacacaaa 22201763  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 1994329 - 1994471
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |    
T  1994329 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatcgctcactatttaatcataat-tcttaacaaggaataggacca 1994427  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  1994428 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 1994471  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21569035 - 21568893
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |    
T  21569035 ggtacttgaccttctgtttcacacatacatatgaaccattatagttaccaataatattagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatatgacca 21568936  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  21568935 aaatgatactaataaataaggttagagga-ccacataacacaaa 21568893  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21969919 - 21969776
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  || |    
T  21969919 ggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataagacca 21969820  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  21969819 aaacgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 21969776  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21992355 - 21992212
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  || |    
T  21992355 ggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataagacca 21992256  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  21992255 aaacgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 21992212  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18464746 - 18464628
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |    
T  18464746 ggtacctgaccttctgtttcacatatacataggaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaaccataataccttaacaatgcatatgacca 18464647  T
Q  114 aaatgatactaataaataa 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18464646 aaatgatactaataaataa 18464628  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 46152898 - 46152778
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||    
T  46152898 ctgacctcctctttcacacgtacatatgaaccataaccgttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatg 46152799  T
Q  119 atactaataaataatgttaga 139  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  46152798 atactaataaataaagttaga 46152778  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44894025 - 44893887
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||  || ||||||    
T  44894025 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaatgatatcagtcactatttgatcataatatcttaacaagacatatgaccaaaatg 44893926  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  44893925 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 44893887  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 47303179 - 47303315
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  |    
T  47303179 ggtatctgacctcctgtttcacatatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaataaggcatatgatca 47303278  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||    
T  47303279 aaatgata-taataaataaagttagaggacccacataa 47303315  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 4757654 - 4757796
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||| | ||||||| |    
T  4757654 ggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttgatcataat-tcttatcaaggaatagaacca 4757752  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  4757753 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 4757796  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4773527 - 4773395
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| || ||||||    
T  4773527 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 4773428  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  4773427 atactaataaataaagttagaggacccacataa 4773395  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 28986320 - 28986395
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcata 89  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986320 ggtatctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcata 28986395  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 1999488 - 1999537
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatca 63  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1999488 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatca 1999537  T

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Target: chr1 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 9006351 - 9006494
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  9006351 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataggacca 9006450  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  9006451 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaa 9006494  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 37284888 - 37285031
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  37284888 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 37284987  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  37284988 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 37285031  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 49140303 - 49140446
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |    
T  49140303 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatataacca 49140402  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  49140403 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 49140446  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 27547829 - 27547965
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  27547829 ggtacctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaatagtatcagtcactatttaatcataatactttaacaaagcatagtacca 27547928  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacata 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  27547929 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacata 27547965  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 23476501 - 23476644
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  23476501 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggacca 23476600  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  23476601 aaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaa 23476644  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 27400597 - 27400727
Alignment:
Q  27 ctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27400597 ctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataagactaaaatgatactaat 27400696  T
Q  127 aaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  27400697 aaataaagttagaggacccacataacacaaa 27400727  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44322950 - 44322816
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  44322950 ggtacgtgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcacaatttaatcataataccttaacaaggcataggacca 44322851  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccaca 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  44322850 aaatgatactaataaataaagttagaggacccaca 44322816  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 45052863 - 45052992
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  45052863 tgtttcacacatacatataaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaata 45052962  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  45052963 aataaagttagaggacccacataacacaaa 45052992  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20306292 - 20306148
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  20306292 ggtacttgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 20306193  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||    
T  20306192 aaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaat 20306148  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25996074 - 25995930
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |    
T  25996074 ggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagccactatttaatcatattaccttaacaaggcataggacca 25995975  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  25995974 aaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaat 25995930  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 26707356 - 26707491
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  26707356 ggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 26707455  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacat 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  26707456 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacat 26707491  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37304313 - 37304175
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  37304313 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 37304214  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  37304213 atactaataaataaagttagaggaccctcataacacaaa 37304175  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 12481219 - 12481362
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  12481219 ggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggacca 12481318  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  12481319 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 12481362  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16024183 - 16024044
Alignment:
Q  18 cctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaat 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||    
T  16024183 cctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataatacctcaacaaggcatatgaccaaaat 16024084  T
Q  118 gatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  16024083 gatactaataaataaagttagaggaccctcataacacaaa 16024044  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31703903 - 31703761
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  31703903 ggtacctgacctcctatttcacacatacat-tgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatagaacca 31703805  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  31703804 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 31703761  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 1762844 - 1762977
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||  || |||||||||||    
T  1762844 ctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcagaacactttaacaaggcatatgaccaaaatgatact 1762943  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  1762944 aataaataaagttagaggacccacataacacaaa 1762977  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 4697042 - 4697167
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |    
T  4697042 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggatca 4697141  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4697142 aaatgatactaataaataaagttaga 4697167  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 6797971 - 6798110
Alignment:
Q  18 cctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaat 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||    
T  6797971 cctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaat 6798070  T
Q  118 gatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||||    
T  6798071 gatactaataaataaaattagaggaccctcataacacaaa 6798110  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37576471 - 37576328
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |    
T  37576471 ggtacctgaccccctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggacca 37576372  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  37576371 aaatgatacttataaataaagttagaggacccacataacacaaa 37576328  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 2064385 - 2064514
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||    
T  2064385 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatagtagtcactatttaatcataataccttaacaagacataagaccaaaatgatactaata 2064484  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  2064485 aataaagttagaggacccacataacacaaa 2064514  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3089618 - 3089489
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||    
T  3089618 tgtttcacatatacatatgaatcataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaagacatatgaccaaaatgatactaata 3089519  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  3089518 aataaagttataggatccacataacacaaa 3089489  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 153
Target Start/End: Original strand, 37585855 - 37585992
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  || |||    
T  37585855 tacctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttactaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatatgaccaaa 37585954  T
Q  116 atgatactaataaataatgttagaagatccacataata 153  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  37585955 ataatactaataaataaagttagaggacccacataata 37585992  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 49643841 - 49643974
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  49643841 ctcctgtttcatacatacatatgaaccatagcagttaccaataatatcactcactatttaatcataataccttaacaaggcataggatcaaaatgatact 49643940  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||    
T  49643941 aataaataaagttagagaacccacataacacaaa 49643974  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 8762562 - 8762701
Alignment:
Q  17 acctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||  || ||||    
T  8762562 acctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataacatttaccaataatatcagttactatttattcataataccttaacaagacatatgaccaaaa 8762661  T
Q  117 tgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaa 156  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  8762662 tgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaa 8762701  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 35612255 - 35612367
Alignment:
Q  27 ctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||    
T  35612255 ctgtttcacacatacatatgaatcataacatttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaat 35612354  T
Q  127 aaataatgttaga 139  Q
    |||||| ||||||    
T  35612355 aaataaagttaga 35612367  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Original strand, 12127239 - 12127356
Alignment:
Q  40 acatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12127239 acatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 12127338  T
Q  140 agatccacataatacaaa 157  Q
     || |||||||| |||||    
T  12127339 ggacccacataacacaaa 12127356  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38127970 - 38127856
Alignment:
Q  43 tatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaaga 142  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38127970 tatgaactataacagttactaataatatcattcactatttaatcataataccttaataaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagga 38127871  T
Q  143 tccacataatacaaa 157  Q
     |||||||| |||||    
T  38127870 cccacataaaacaaa 38127856  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 39486362 - 39486496
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||         |||||| || |    
T  39486362 ggtacctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataatagttactaataatatcaatcactatttaatcataatac---------gcataggacca 39486452  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  39486453 aaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaa 39486496  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 4330043 - 4330140
Alignment:
Q  60 atcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  4330043 atcaatgatatcagccactatttaaccataataccttaacaaggaatatgattaaaatgatactaataaataaagttagaagacccacataacacaaa 4330140  T

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Target: chr7 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 44332679 - 44332816
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  44332679 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacca 44332778  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  44332779 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 44332816  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6357053 - 6356912
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  6357053 tacctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatcaatcactgtttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaa 6356954  T
Q  116 atgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  6356953 atgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 6356912  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 21391352 - 21391493
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||    
T  21391352 tacctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagatcaaa 21391451  T
Q  116 atgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  21391452 atgatactaataaataaagttagatgatccacataacacaaa 21391493  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 31638105 - 31638238
Alignment:
Q  16 tacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaa 115  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  31638105 tacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaa 31638204  T
Q  116 atgatactaataaataatgttagaagatccacat 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31638205 atgatactaataaataaagttagaggatccacat 31638238  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41751930 - 41751797
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  41751930 ctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataacttaacaagacataggaccaaaataatact 41751831  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41751830 aataaataaagttagaagatccacataacacaaa 41751797  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43247705 - 43247568
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  43247705 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataccagttaccagtaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgcataagacca 43247606  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  43247605 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 43247568  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 41453165 - 41453308
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  41453165 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggacca 41453264  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  41453265 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 41453308  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 48626228 - 48626367
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||    
T  48626228 ctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatg 48626327  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  48626328 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaat 48626367  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 7579032 - 7579169
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  7579032 ggtacctgacctcctgttttacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaataagacca 7579131  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  7579132 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 7579169  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36423659 - 36423515
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| || |    
T  36423659 ggtacctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccgatagtatcagtcactatttgatcataataccttaaccaggtataggacca 36423560  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  36423559 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaat 36423515  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33716874 - 33716735
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  33716874 ggtacctgacctcctgtttcacacata----tgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaagacataggacca 33716779  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  33716778 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaa 33716735  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28298109 - 28297966
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  || |    
T  28298109 ggtacttgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataaaagttattaataatatcagtcactatttaatcataataccttaactagtcatatgacca 28298010  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  28298009 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 28297966  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 34037072 - 34037208
Alignment:
Q  15 gtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaa 114  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||    
T  34037072 gtacctgacctcctgttttacacatacatatgaatcataacagttacaaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaaaatatgaccaa 34037171  T
Q  115 aatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||    
T  34037172 aatgatattaataaataaagttagaggacccacataa 34037208  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 28286282 - 28286420
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||  | ||||||    
T  28286282 ctgacctcctgtttcacacatagatatgaaccattacagttgccaataatatcggtcactatttaatcataataccttaagaaggaatagttccaaaatg 28286381  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  28286382 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 28286420  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17359470 - 17359328
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatac----atatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaa 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||    
T  17359470 ctgacctcctctttcacacatacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggaccaa 17359371  T
Q  115 aatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  17359370 aatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 17359328  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 19681665 - 19681798
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||   |||  || |||||||||||    
T  19681665 ctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataatgcattaacaagaaatatgaccaaaatgatact 19681764  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  19681765 aataaataaagttagaggacccacataacacaaa 19681798  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 8937009 - 8937152
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||  || |    
T  8937009 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccaaaacagttaccaataatatcaatcactatttaatcacaataccttaacaaggaatatgacca 8937108  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||  | |||||||| |||||    
T  8937109 acatgatattaataaataaagttagagaacccacataacacaaa 8937152  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10526600 - 10526458
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || |    
T  10526600 ggtacctggcctcttgtttcacaaatacatatgaaacataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaac-aggcattggacca 10526502  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  10526501 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 10526458  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8542784 - 8542646
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||    
T  8542784 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccagtaatatccgtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatg 8542685  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  8542684 atgctaataaataaagttagaagacccacacaacacaaa 8542646  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 35146871 - 35146983
Alignment:
Q  27 ctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaat 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| | ||    
T  35146871 ctgtttcacacttacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatattgat 35146970  T
Q  127 aaataatgttaga 139  Q
    |||||| ||||||    
T  35146971 aaataaagttaga 35146983  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 40673172 - 40673308
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  40673172 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacacttaccaataatatcagtcactatttaattctaatactttaacaaggcatatgactaaaat- 40673270  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
     ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  40673271 -tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 40673308  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 41191842 - 41191988
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaata---atatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaa 110  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||  |    
T  41191842 ggtatctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataataatatcagtcactatttaatcataataccttaataagaaatatga 41191941  T
Q  111 ctaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  41191942 ccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 41191988  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6356570 - 6356432
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| || ||||||    
T  6356570 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 6356471  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  6356470 atactaataaataaagttagaggacccatataacacaaa 6356432  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 17750095 - 17750187
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcat 106  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17750095 ggtacatgacctcttgtttcacacatacatatgaactataaaagttatcaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcat 17750187  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17363523 - 17363437
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatac----atatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaa 101  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17363523 ctgacctcctctttcacacatacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaa 17363437  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1114335 - 1114257
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataata 92  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1114335 ggtacctgacctcctatttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatacccgtcactatttaatcataata 1114257  T

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Target: scaffold0221 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8718 - 8575
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  8718 ggtatctgacctcctgtttcacacatacacatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacca 8619  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  8618 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 8575  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 50636 - 50779
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  50636 ggtacctgacctcctctttcacacatacataagaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacca 50735  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  50736 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 50779  T

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Target: scaffold0072 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15595
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |    
T  15738 ggtacctgacctcctgtttcacatatacatacgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggacaa 15639  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  15638 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 15595  T

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Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 8174045 - 8174188
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |    
T  8174045 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataaaaaca 8174144  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  8174145 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 8174188  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 26181865 - 26182003
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  26181865 ctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttactaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 26181964  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  26181965 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 26182003  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 2148046 - 2148183
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  2148046 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgacca 2148145  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  2148146 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 2148183  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 34735513 - 34735646
Alignment:
Q  24 ctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  34735513 ctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaattatatcagtcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggaccaaaatgatact 34735612  T
Q  124 aataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  34735613 aataaataaagttagaggacccacataacacaaa 34735646  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16305315 - 16305172
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  || |    
T  16305315 ggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaagacataagacca 16305216  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  16305215 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 16305172  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29472531 - 29472389
Alignment:
Q  15 gtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaa 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  29472531 gtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaa 29472432  T
Q  115 aatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  29472431 aatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaa 29472389  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41474367 - 41474229
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  41474367 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaatactatcagtcactatttaattataataccttaacaaggcataggatcaaaatg 41474268  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  41474267 atactaataaataaagttagatgacccacataacacaaa 41474229  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36713875 - 36713735
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36713875 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcacta-ttaatcataataccttaacaaggcatagaacca 36713777  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||  |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  36713776 aaatg--actaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 36713735  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13193278 - 13193135
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  13193278 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatgagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 13193179  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  13193178 aaatgatactaataaataaagttagaggaccaacataacacaaa 13193135  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15744747 - 15744604
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  15744747 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgacca 15744648  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  15744647 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 15744604  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 15405916 - 15406059
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  15405916 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaagacatatgacca 15406015  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  15406016 aaataatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaa 15406059  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 19815869 - 19816001
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||    
T  19815869 ctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgagcaaaatg 19815968  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    |||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  19815969 atactaataaataaagtcagaggacccacataa 19816001  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 24372127 - 24372271
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| || |    
T  24372127 ggtacccgaccttctgtttcacacatacatatgaaccaaaacagttaccaataatatcagtcacaatttaatcataatactttaaaaaggaataggacca 24372226  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaat 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  24372227 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaat 24372271  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7469451 - 7469313
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  7469451 ctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacggttaacaataatatcactaactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatg 7469352  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  7469351 atactagtaaataaagttagaggacccacataacacaaa 7469313  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10992141 - 10991998
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |    
T  10992141 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataatatcttagcaagacataggacca 10992042  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  10992041 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 10991998  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17052344 - 17052205
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||  || |    
T  17052344 ggtacccgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttatctataatatcagtcattatttaatcataataccttaac----gttaagacca 17052249  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  17052248 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 17052205  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 24138710 - 24138809
Alignment:
Q  58 ttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  24138710 ttatcaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 24138809  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Original strand, 19847490 - 19847621
Alignment:
Q  25 tcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatacta 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||  || |||||||| |||    
T  19847490 tcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataat-tcttaacaaggaatatgaccaaaatgatgcta 19847588  T
Q  125 ataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  19847589 ataaataaagttagaggacccacataacacaaa 19847621  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 7496140 - 7496282
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| | |||| || |    
T  7496140 ggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttactcataat-tcttaacaaggaataggacca 7496238  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||    
T  7496239 aaatgatgctaataaataaagttagagaacccacataacacaaa 7496282  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38332946 - 38332851
Alignment:
Q  62 caataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  38332946 caataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaa 38332851  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Original strand, 12860577 - 12860670
Alignment:
Q  64 ataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  12860577 ataatacccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 12860670  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Original strand, 24138229 - 24138282
Alignment:
Q  15 gtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataat 68  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  24138229 gtacatgacctcctgtttcacacatacatatgagccataacagttaccaataat 24138282  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 52
Target Start/End: Original strand, 12860540 - 12860578
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccat 52  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12860540 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccat 12860578  T

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Target: scaffold0340 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18563 - 18420
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  18563 ggtacctgaccgcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgacca 18464  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  18463 aaatgatactaataaataaaattagaggacccacataacacaaa 18420  T

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Target: scaffold0182 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19998 - 19855
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || |    
T  19998 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatccgtcactatttaatcataaaaccttaacaaggaatatgacca 19899  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  19898 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataatacaaa 19855  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 349363 - 349226
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  || |    
T  349363 ggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatatgacca 349264  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  349263 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 349226  T

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Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 113656 - 113519
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  113656 ggtatctgacctcttgtttcacacatacaaatgcactataacaattagcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatagaacca 113557  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  113556 aaatgatactaataaataaagttagaggagccacataa 113519  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 82018 - 82161
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| || |    
T  82018 ggtacctgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaataggacca 82117  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  82118 aaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 82161  T

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Target: scaffold0220 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21040 - 20898
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |    
T  21040 ggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataat-tcttaacaaggaataggacca 20942  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  20941 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 20898  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 14295 - 14438
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  14295 ggtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgacca 14394  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||    
T  14395 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccagataacacaaa 14438  T

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Target: scaffold0186 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24441 - 24309
Alignment:
Q  25 tcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatacta 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||||  ||    
T  24441 tcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaacaggaccaaaatgatgtta 24342  T
Q  125 ataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  24341 ataaataaagttagaggacccacataacacaaa 24309  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 73051 - 72909
Alignment:
Q  14 ggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaacta 113  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||  || |    
T  73051 ggtacctggcctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattggtcactatttaatcataat-tcttaacaaggaataagacca 72953  T
Q  114 aaatgatactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  72952 aaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 72909  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21796 - 21658
Alignment:
Q  19 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatg 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||| || ||||||    
T  21796 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatattttaacgagatataggaccaaaatg 21697  T
Q  119 atactaataaataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  21696 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa 21658  T

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Target: scaffold0037 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 46020 - 45903
Alignment:
Q  40 acatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaataaataatgttaga 139  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  46020 acatataaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgaaactaataagtaaagttaga 45921  T
Q  140 agatccacataatacaaa 157  Q
     || |||||||| |||||    
T  45920 ggacccacataacacaaa 45903  T

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Target: scaffold0246 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6271 - 6145
Alignment:
Q  28 tgtttcacacatacatatgaaccatcacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaactaaaatgatactaata 127  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||||||   |||||    
T  6271 tgtttcacacatccataagaaacataataattatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgatcaaaatga---taata 6175  T
Q  128 aataatgttagaagatccacataatacaaa 157  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  6174 aataaagttagaggatccacataacacaaa 6145  T

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