View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15481_low_4 (Length: 532)

Name: NF15481_low_4
Description: NF15481
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15481_low_4
NF15481_low_4
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (1-516)||(54966823-54967340)
chr4 (154-327)||(17043400-17043571)
chr4 (185-325)||(25463108-25463249)
chr4 (163-323)||(20224947-20225108)
chr4 (163-313)||(37494814-37494966)
chr4 (163-323)||(21646927-21647092)
chr4 (163-312)||(5648222-5648372)
chr4 (154-313)||(49938613-49938771)
chr4 (163-313)||(6430646-6430797)
chr4 (163-313)||(30639343-30639494)
chr4 (163-323)||(47528539-47528700)
chr4 (163-323)||(48598834-48598995)
chr4 (163-323)||(16408610-16408775)
chr4 (163-323)||(23501756-23501915)
chr4 (170-327)||(35567141-35567300)
chr4 (163-303)||(5306694-5306835)
chr4 (175-312)||(40915805-40915942)
chr4 (154-327)||(54175019-54175195)
chr4 (155-322)||(19027804-19027973)
chr4 (155-313)||(20908656-20908817)
chr4 (177-323)||(32478801-32478942)
chr4 (163-313)||(16911525-16911679)
chr4 (154-313)||(39029080-39029241)
chr4 (151-327)||(36589696-36589874)
chr4 (210-312)||(47443968-47444071)
chr4 (165-323)||(11054157-11054316)
chr4 (162-313)||(30581485-30581639)
chr4 (180-323)||(39077805-39077948)
chr4 (175-323)||(44363139-44363291)
chr4 (154-319)||(3580854-3581016)
chr4 (154-297)||(47441566-47441710)
chr4 (163-313)||(10660367-10660520)
chr4 (163-313)||(10874512-10874665)
chr4 (175-313)||(14983810-14983949)
chr4 (191-323)||(29207907-29208039)
chr4 (211-327)||(9987839-9987957)
chr4 (216-323)||(20639667-20639777)
chr4 (168-327)||(30690181-30690349)
chr4 (163-323)||(13256408-13256569)
chr4 (154-252)||(487217-487315)
chr4 (182-310)||(7385499-7385628)
chr4 (177-304)||(9832342-9832468)
chr4 (156-272)||(25343144-25343261)
chr4 (154-254)||(51420528-51420629)
chr4 (230-323)||(25629080-25629175)
chr4 (154-321)||(30496333-30496501)
chr4 (165-321)||(54730214-54730376)
chr4 (165-254)||(42164229-42164317)
chr4 (229-313)||(51865058-51865143)
chr4 (217-307)||(7909307-7909397)
chr4 (163-282)||(14590800-14590922)
chr4 (165-323)||(8473629-8473790)
chr4 (211-313)||(21489099-21489203)
chr4 (154-249)||(23580293-23580388)
chr4 (219-312)||(49796818-49796911)
chr4 (163-243)||(17315389-17315470)
chr4 (152-309)||(32629293-32629447)
chr4 (182-289)||(41018838-41018945)
chr4 (175-254)||(43035224-43035303)
chr4 (262-323)||(38786673-38786735)
chr4 (162-244)||(54640429-54640511)
chr4 (229-313)||(20405116-20405204)
chr4 (244-323)||(20225119-20225202)
chr4 (163-321)||(30352591-30352763)
chr4 (272-323)||(32484307-32484359)
chr4 (153-225)||(50856345-50856417)
chr4 (271-323)||(38755917-38755970)
chr4 (270-314)||(47482869-47482913)
chr4 (269-323)||(11394923-11394978)
chr4 (269-323)||(11404650-11404705)
chr4 (269-327)||(28494222-28494281)
chr4 (199-319)||(9037730-9037852)
chr4 (271-313)||(33836507-33836549)
chr4 (230-323)||(48327772-48327869)
chr4 (161-254)||(49938519-49938612)
chr4 (161-242)||(41549344-41549425)
chr4 (272-323)||(40553946-40553998)
chr4 (154-194)||(51865154-51865194)
chr4 (160-239)||(12257688-12257767)
chr4 (210-288)||(17079696-17079775)
chr4 (272-327)||(21003410-21003465)
chr4 (187-253)||(7038041-7038106)
chr4 (259-309)||(10277781-10277831)
chr4 (190-243)||(10380033-10380086)
chr4 (271-323)||(25388249-25388302)
chr4 (272-313)||(44718641-44718682)
chr4 (271-327)||(50555661-50555718)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (154-324)||(28362154-28362325)
chr7 (155-288)||(23419719-23419853)
chr7 (163-323)||(32758224-32758385)
chr7 (167-323)||(11617597-11617756)
chr7 (163-323)||(2541028-2541192)
chr7 (163-323)||(21172018-21172179)
chr7 (163-312)||(27629597-27629748)
chr7 (163-323)||(48735131-48735293)
chr7 (163-311)||(10693095-10693243)
chr7 (155-325)||(13805058-13805228)
chr7 (155-312)||(19266406-19266564)
chr7 (163-311)||(42798632-42798782)
chr7 (163-323)||(42805487-42805652)
chr7 (155-319)||(48123498-48123663)
chr7 (163-304)||(46354157-46354302)
chr7 (178-323)||(47716438-47716587)
chr7 (156-327)||(19265772-19265943)
chr7 (181-323)||(42391109-42391251)
chr7 (165-312)||(19426911-19427059)
chr7 (168-327)||(14099012-14099172)
chr7 (168-327)||(14409029-14409189)
chr7 (163-323)||(43557435-43557601)
chr7 (210-312)||(7879649-7879752)
chr7 (175-313)||(33871930-33872068)
chr7 (163-313)||(34626228-34626379)
chr7 (163-323)||(35334825-35334986)
chr7 (163-311)||(47077877-47078025)
chr7 (159-313)||(3469195-3469354)
chr7 (157-308)||(7644914-7645066)
chr7 (154-327)||(32233140-32233314)
chr7 (163-312)||(40463840-40463990)
chr7 (210-314)||(18512472-18512576)
chr7 (157-323)||(29907375-29907544)
chr7 (154-327)||(16341233-16341409)
chr7 (179-313)||(28078152-28078286)
chr7 (154-289)||(8148989-8149127)
chr7 (210-322)||(38262206-38262320)
chr7 (175-311)||(42476849-42476984)
chr7 (185-327)||(18747472-18747617)
chr7 (152-327)||(6736843-6737017)
chr7 (163-322)||(14732831-14732994)
chr7 (204-325)||(21566440-21566564)
chr7 (210-323)||(31591118-31591231)
chr7 (155-272)||(12473259-12473378)
chr7 (163-323)||(22698976-22699142)
chr7 (211-304)||(1408469-1408563)
chr7 (218-323)||(38604546-38604653)
chr7 (161-327)||(44123628-44123794)
chr7 (162-252)||(42101967-42102057)
chr7 (163-311)||(2662958-2663103)
chr7 (178-323)||(11741774-11741919)
chr7 (163-254)||(18326997-18327088)
chr7 (215-321)||(23231573-23231681)
chr7 (229-312)||(35787290-35787373)
chr7 (163-254)||(42495916-42496007)
chr7 (259-314)||(27889335-27889390)
chr7 (176-254)||(7193062-7193140)
chr7 (155-254)||(43852006-43852097)
chr7 (154-253)||(5180238-5180338)
chr7 (210-313)||(35203450-35203556)
chr7 (166-314)||(39123857-39124011)
chr7 (157-242)||(4000777-4000862)
chr7 (163-254)||(5814434-5814526)
chr7 (163-254)||(7794584-7794678)
chr7 (230-322)||(23065935-23066029)
chr7 (165-252)||(1423992-1424080)
chr7 (230-313)||(21139768-21139851)
chr7 (156-290)||(22065544-22065679)
chr7 (270-308)||(33500587-33500625)
chr7 (162-191)||(36267902-36267931)
chr7 (259-313)||(45018943-45019001)
chr7 (169-281)||(5653181-5653293)
chr7 (268-327)||(13792155-13792215)
chr7 (236-290)||(17048858-17048914)
chr7 (220-280)||(23604553-23604612)
chr7 (214-254)||(27697452-27697492)
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (159-320)||(18724558-18724720)
chr1 (163-323)||(14617024-14617187)
chr1 (163-323)||(18944629-18944795)
chr1 (155-324)||(44485118-44485288)
chr1 (163-321)||(30395737-30395900)
chr1 (163-323)||(34725107-34725268)
chr1 (163-312)||(32632578-32632728)
chr1 (163-323)||(46991790-46991953)
chr1 (164-328)||(20036208-20036374)
chr1 (154-327)||(6983816-6983989)
chr1 (163-313)||(46247973-46248125)
chr1 (175-313)||(23768340-23768479)
chr1 (175-309)||(41319830-41319965)
chr1 (164-325)||(11596501-11596662)
chr1 (165-311)||(47214499-47214645)
chr1 (154-322)||(2435796-2435967)
chr1 (175-323)||(19414438-19414586)
chr1 (156-327)||(15511153-15511329)
chr1 (175-321)||(6925099-6925247)
chr1 (176-311)||(25468285-25468421)
chr1 (163-323)||(45812546-45812707)
chr1 (163-323)||(10668206-10668376)
chr1 (163-323)||(20004099-20004264)
chr1 (164-327)||(39214963-39215129)
chr1 (154-254)||(22327077-22327177)
chr1 (163-298)||(22930104-22930239)
chr1 (161-327)||(35019215-35019382)
chr1 (163-323)||(38478291-38478452)
chr1 (157-313)||(50811920-50812078)
chr1 (175-313)||(27201646-27201787)
chr1 (155-325)||(19701549-19701722)
chr1 (175-322)||(27474280-27474428)
chr1 (163-323)||(9939446-9939613)
chr1 (154-327)||(10378740-10378905)
chr1 (154-253)||(34679300-34679399)
chr1 (172-325)||(35117772-35117930)
chr1 (190-311)||(35253209-35253329)
chr1 (154-288)||(17470390-17470526)
chr1 (163-311)||(12126859-12127007)
chr1 (160-288)||(27136696-27136826)
chr1 (237-323)||(4349699-4349787)
chr1 (192-323)||(35005139-35005274)
chr1 (199-313)||(45264419-45264535)
chr1 (163-304)||(19932782-19932924)
chr1 (152-329)||(23371100-23371277)
chr1 (218-327)||(23796507-23796618)
chr1 (163-323)||(45402081-45402245)
chr1 (154-244)||(2435983-2436073)
chr1 (154-239)||(25554817-25554902)
chr1 (217-313)||(31382234-31382330)
chr1 (163-313)||(8197029-8197181)
chr1 (163-254)||(25290149-25290243)
chr1 (259-321)||(15505648-15505710)
chr1 (157-254)||(50760306-50760403)
chr1 (155-244)||(52910196-52910285)
chr1 (154-289)||(43207467-43207610)
chr1 (164-284)||(33222971-33223093)
chr1 (218-310)||(34148983-34149076)
chr1 (163-323)||(18741966-18742133)
chr1 (154-276)||(24564321-24564445)
chr1 (270-323)||(50606498-50606552)
chr1 (232-327)||(20999855-20999952)
chr1 (156-323)||(31442398-31442555)
chr1 (269-320)||(30682906-30682957)
chr1 (240-322)||(42304217-42304303)
chr1 (242-327)||(43768205-43768292)
chr1 (267-328)||(4587567-4587629)
chr1 (210-327)||(22324927-22325046)
chr1 (175-279)||(4430080-4430185)
chr1 (240-296)||(21910686-21910743)
chr1 (186-243)||(31272465-31272522)
chr1 (177-288)||(18335333-18335445)
chr1 (177-267)||(18335912-18336003)
chr1 (216-313)||(20169109-20169207)
chr1 (229-323)||(1517320-1517417)
chr1 (154-215)||(6358112-6358173)
chr1 (270-326)||(30555210-30555267)
chr1 (165-283)||(10163747-10163867)
chr1 (163-215)||(28894650-28894702)
chr1 (154-190)||(46859049-46859085)
chr1 (163-225)||(34714609-34714672)
chr1 (259-313)||(4249463-4249517)
chr1 (259-313)||(4249787-4249841)
chr1 (259-313)||(4250111-4250165)
chr1 (268-325)||(33594138-33594196)
chr1 (163-220)||(40424728-40424786)
chr1 (159-217)||(49546024-49546082)
chr1 (153-202)||(21910762-21910811)
chr1 (210-254)||(4251462-4251506)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (163-323)||(46794-46957)
scaffold0057 (163-313)||(24792-24939)
scaffold0057 (212-311)||(43672-43771)
scaffold0057 (246-313)||(46727-46796)
scaffold0057 (154-222)||(46995-47063)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (163-323)||(40272821-40272984)
chr3 (155-327)||(26573105-26573279)
chr3 (157-327)||(53996570-53996743)
chr3 (163-313)||(8247707-8247861)
chr3 (163-313)||(46421055-46421209)
chr3 (176-323)||(39203515-39203662)
chr3 (163-312)||(12914056-12914207)
chr3 (163-323)||(13730611-13730776)
chr3 (154-313)||(34420663-34420824)
chr3 (167-323)||(26869696-26869854)
chr3 (163-313)||(29366740-29366894)
chr3 (158-322)||(45948848-45949017)
chr3 (178-323)||(13628799-13628948)
chr3 (163-312)||(22609752-22609901)
chr3 (163-323)||(1217075-1217236)
chr3 (171-314)||(30928166-30928310)
chr3 (163-323)||(22122926-22123087)
chr3 (155-280)||(45620881-45621008)
chr3 (192-313)||(54374365-54374488)
chr3 (154-327)||(44403560-44403736)
chr3 (163-313)||(9607188-9607342)
chr3 (178-323)||(5173728-5173876)
chr3 (210-323)||(14986990-14987107)
chr3 (157-313)||(25944449-25944607)
chr3 (185-323)||(516417-516560)
chr3 (163-323)||(7696901-7697057)
chr3 (210-323)||(31592882-31592995)
chr3 (163-312)||(16735426-16735576)
chr3 (154-249)||(35417893-35417988)
chr3 (188-327)||(45139483-45139624)
chr3 (163-283)||(4495714-4495836)
chr3 (154-251)||(53062015-53062112)
chr3 (217-323)||(54484730-54484839)
chr3 (151-286)||(29106523-29106659)
chr3 (241-327)||(34771369-34771457)
chr3 (163-313)||(52926239-52926382)
chr3 (154-322)||(829452-829622)
chr3 (210-312)||(10795444-10795549)
chr3 (171-327)||(19730996-19731154)
chr3 (163-321)||(6411833-6411993)
chr3 (163-254)||(10870032-10870123)
chr3 (220-323)||(49013482-49013589)
chr3 (188-283)||(54032609-54032705)
chr3 (188-313)||(33926094-33926220)
chr3 (235-323)||(353358-353450)
chr3 (229-323)||(15797274-15797368)
chr3 (183-324)||(8410876-8411016)
chr3 (229-323)||(45786223-45786321)
chr3 (180-313)||(7942993-7943127)
chr3 (229-313)||(9276316-9276400)
chr3 (265-323)||(24851310-24851369)
chr3 (163-323)||(25517179-25517345)
chr3 (165-313)||(28904931-28905080)
chr3 (175-285)||(33235528-33235641)
chr3 (229-297)||(47624094-47624162)
chr3 (210-313)||(43114888-43114994)
chr3 (154-202)||(55400975-55401023)
chr3 (210-327)||(55401209-55401329)
chr3 (154-240)||(1121319-1121405)
chr3 (184-254)||(12525414-12525484)
chr3 (213-289)||(19751614-19751691)
chr3 (157-306)||(21330273-21330424)
chr3 (154-253)||(39211969-39212066)
chr3 (273-323)||(30452892-30452943)
chr3 (262-312)||(46169988-46170038)
chr3 (215-327)||(50624958-50625072)
chr3 (268-327)||(35417996-35418056)
chr3 (280-327)||(45416939-45416986)
chr3 (267-308)||(26292421-26292462)
chr3 (175-252)||(26782364-26782441)
chr3 (216-284)||(31904906-31904975)
chr3 (155-188)||(43956606-43956639)
chr3 (169-221)||(33075931-33075983)
chr3 (229-284)||(52428526-52428582)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (163-323)||(44530112-44530275)
chr8 (163-323)||(12670259-12670420)
chr8 (163-323)||(35261642-35261805)
chr8 (163-313)||(28817646-28817798)
chr8 (163-313)||(36720759-36720911)
chr8 (154-313)||(44781524-44781686)
chr8 (163-323)||(7136536-7136701)
chr8 (163-323)||(30454106-30454267)
chr8 (163-323)||(39461003-39461168)
chr8 (164-323)||(6760786-6760950)
chr8 (175-313)||(8897784-8897923)
chr8 (167-312)||(13160669-13160815)
chr8 (176-321)||(24365071-24365218)
chr8 (210-327)||(5135295-5135413)
chr8 (164-323)||(17823540-17823702)
chr8 (163-323)||(25250485-25250650)
chr8 (163-328)||(29521689-29521857)
chr8 (160-313)||(8483958-8484112)
chr8 (164-323)||(18164769-18164930)
chr8 (163-312)||(2626482-2626636)
chr8 (175-323)||(12625865-12626016)
chr8 (163-310)||(20869523-20869668)
chr8 (152-297)||(42083734-42083881)
chr8 (175-312)||(45071241-45071378)
chr8 (163-323)||(20284078-20284245)
chr8 (163-323)||(21070706-21070874)
chr8 (175-313)||(26954108-26954250)
chr8 (216-327)||(29877111-29877224)
chr8 (170-308)||(22598128-22598267)
chr8 (154-312)||(14017989-14018149)
chr8 (162-313)||(28407378-28407518)
chr8 (154-323)||(44742527-44742699)
chr8 (217-323)||(20869941-20870051)
chr8 (210-322)||(5689642-5689756)
chr8 (160-250)||(30962857-30962947)
chr8 (210-322)||(389654-389770)
chr8 (181-311)||(31457155-31457285)
chr8 (153-288)||(35105883-35106014)
chr8 (229-323)||(16225049-16225147)
chr8 (241-311)||(19729382-19729453)
chr8 (185-290)||(23000262-23000365)
chr8 (259-323)||(26102578-26102643)
chr8 (209-313)||(17250895-17251002)
chr8 (174-327)||(11000955-11001110)
chr8 (182-304)||(11748282-11748407)
chr8 (229-323)||(10857858-10857955)
chr8 (163-225)||(24245414-24245477)
chr8 (273-323)||(27507985-27508036)
chr8 (177-254)||(36918102-36918179)
chr8 (270-323)||(16013528-16013582)
chr8 (229-289)||(43942354-43942417)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (163-323)||(1354766-1354927)
chr6 (153-327)||(13904986-13905160)
chr6 (149-323)||(1346913-1347088)
chr6 (164-323)||(12221923-12222088)
chr6 (182-323)||(29355864-29356009)
chr6 (176-323)||(2166419-2166570)
chr6 (176-323)||(2178052-2178203)
chr6 (154-313)||(7947391-7947552)
chr6 (174-313)||(9161098-9161239)
chr6 (163-323)||(3815086-3815249)
chr6 (154-296)||(12889381-12889525)
chr6 (185-327)||(23240829-23240971)
chr6 (177-311)||(28007604-28007738)
chr6 (217-323)||(26097178-26097284)
chr6 (163-254)||(8409206-8409298)
chr6 (175-287)||(14553488-14553602)
chr6 (163-323)||(14975099-14975252)
chr6 (163-253)||(20400630-20400721)
chr6 (176-278)||(32728211-32728314)
chr6 (163-308)||(15866064-15866209)
chr6 (184-313)||(18277213-18277343)
chr6 (229-325)||(19340858-19340956)
chr6 (175-313)||(24097557-24097692)
chr6 (217-323)||(25557743-25557849)
chr6 (210-321)||(33138844-33138957)
chr6 (165-244)||(24734598-24734678)
chr6 (163-284)||(1941818-1941941)
chr6 (159-303)||(11849015-11849159)
chr6 (191-254)||(17432332-17432395)
chr6 (177-286)||(32068074-32068182)
chr6 (177-321)||(23930138-23930283)
chr6 (210-313)||(32579437-32579540)
chr6 (271-323)||(12892082-12892135)
chr6 (177-309)||(22967149-22967287)
chr6 (177-309)||(23821106-23821244)
chr6 (261-312)||(13267788-13267839)
chr6 (175-301)||(6024209-6024338)
chr6 (181-258)||(4136593-4136670)
chr6 (271-323)||(6808468-6808521)
chr6 (273-327)||(10734910-10734965)
chr6 (163-225)||(33922937-33923000)
chr6 (270-323)||(12885985-12886039)
chr6 (259-312)||(383781-383834)
chr6 (273-313)||(11395836-11395876)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (163-323)||(8455325-8455488)
chr2 (156-327)||(4516356-4516529)
chr2 (164-327)||(21377079-21377243)
chr2 (163-323)||(21779270-21779431)
chr2 (154-323)||(10543652-10543826)
chr2 (163-323)||(14530281-14530446)
chr2 (154-325)||(32781296-32781468)
chr2 (175-323)||(17667978-17668128)
chr2 (154-325)||(17380245-17380416)
chr2 (163-323)||(9671143-9671305)
chr2 (163-298)||(12023954-12024090)
chr2 (162-327)||(44643485-44643653)
chr2 (163-322)||(11514399-11514560)
chr2 (163-313)||(17896222-17896375)
chr2 (190-323)||(10546153-10546289)
chr2 (163-323)||(25079726-25079890)
chr2 (175-323)||(24200632-24200784)
chr2 (172-327)||(33795258-33795414)
chr2 (147-313)||(99285-99450)
chr2 (163-323)||(23397729-23397890)
chr2 (159-288)||(5450245-5450376)
chr2 (175-313)||(17623540-17623679)
chr2 (163-323)||(25249747-25249909)
chr2 (155-313)||(44521393-44521552)
chr2 (177-321)||(5841006-5841154)
chr2 (163-313)||(19977734-19977886)
chr2 (175-313)||(39914326-39914465)
chr2 (154-253)||(29419970-29420069)
chr2 (175-313)||(26684640-26684781)
chr2 (210-313)||(14444740-14444843)
chr2 (163-297)||(22371020-22371153)
chr2 (175-323)||(40416880-40417030)
chr2 (177-313)||(31158459-31158598)
chr2 (154-313)||(31821363-31821518)
chr2 (153-314)||(15296425-15296590)
chr2 (184-313)||(25641487-25641616)
chr2 (215-323)||(36871509-36871617)
chr2 (177-253)||(44604832-44604907)
chr2 (157-295)||(23145736-23145874)
chr2 (157-295)||(23557526-23557664)
chr2 (219-323)||(40762243-40762349)
chr2 (188-313)||(19614981-19615108)
chr2 (164-322)||(24859998-24860157)
chr2 (163-254)||(17705458-17705550)
chr2 (163-313)||(27573584-27573735)
chr2 (163-313)||(14544026-14544181)
chr2 (214-313)||(30826052-30826150)
chr2 (153-197)||(35010501-35010545)
chr2 (153-197)||(35017771-35017815)
chr2 (175-254)||(7214510-7214589)
chr2 (239-313)||(24890451-24890526)
chr2 (234-323)||(25632544-25632635)
chr2 (272-312)||(41409936-41409976)
chr2 (270-328)||(23488555-23488614)
chr2 (273-323)||(34080176-34080227)
chr2 (265-311)||(4794869-4794915)
chr2 (210-313)||(13245115-13245210)
chr2 (273-313)||(34766330-34766370)
chr2 (272-323)||(40579758-40579810)
chr2 (214-312)||(30864438-30864536)
chr2 (271-313)||(1289095-1289137)
chr2 (204-322)||(17471553-17471675)
chr2 (267-313)||(31523300-31523346)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (163-323)||(38879544-38879709)
chr5 (154-324)||(208935-209107)
chr5 (163-323)||(24448853-24449016)
chr5 (163-323)||(41014282-41014444)
chr5 (163-323)||(4619113-4619278)
chr5 (175-313)||(27328728-27328869)
chr5 (159-309)||(19142967-19143117)
chr5 (153-325)||(39301077-39301251)
chr5 (163-309)||(8170008-8170154)
chr5 (154-313)||(43574552-43574721)
chr5 (186-323)||(32703411-32703548)
chr5 (163-323)||(1565394-1565557)
chr5 (163-323)||(43334165-43334330)
chr5 (163-323)||(35710276-35710437)
chr5 (177-319)||(24323719-24323862)
chr5 (177-319)||(24360343-24360486)
chr5 (182-311)||(1405170-1405300)
chr5 (163-254)||(23974744-23974835)
chr5 (158-328)||(34074568-34074737)
chr5 (210-323)||(13801776-13801893)
chr5 (175-313)||(22600430-22600569)
chr5 (229-313)||(7097780-7097864)
chr5 (214-323)||(7368413-7368522)
chr5 (179-321)||(12006339-12006485)
chr5 (229-323)||(16880656-16880752)
chr5 (154-310)||(2838732-2838890)
chr5 (183-322)||(1850624-1850764)
chr5 (154-254)||(10634226-10634326)
chr5 (172-313)||(28516453-28516596)
chr5 (218-312)||(20135623-20135720)
chr5 (259-323)||(16957375-16957440)
chr5 (155-326)||(24903702-24903875)
chr5 (163-254)||(37024636-37024726)
chr5 (245-323)||(34154823-34154903)
chr5 (153-225)||(39079875-39079947)
chr5 (210-289)||(41425959-41426039)
chr5 (219-327)||(29334415-29334526)
chr5 (154-327)||(3771296-3771469)
chr5 (217-327)||(12575665-12575779)
chr5 (158-254)||(22025505-22025598)
chr5 (158-285)||(22907913-22908037)
chr5 (191-272)||(42924895-42924977)
chr5 (177-311)||(22861691-22861823)
chr5 (165-323)||(30006290-30006451)
chr5 (176-246)||(22187262-22187332)
chr5 (271-322)||(25622533-25622585)
chr5 (270-313)||(10306494-10306537)
chr5 (170-290)||(24313616-24313739)
chr5 (170-290)||(24355953-24356076)
chr5 (274-323)||(16028633-16028683)
chr5 (270-313)||(4654435-4654478)
chr5 (277-327)||(10943850-10943900)
chr5 (268-311)||(21542489-21542532)
chr5 (270-327)||(11657704-11657762)
chr5 (260-325)||(13774927-13774993)
chr5 (274-323)||(30877573-30877623)
chr5 (163-236)||(31299595-31299669)
chr5 (163-207)||(19438712-19438757)
chr5 (165-309)||(31694132-31694277)
chr5 (154-198)||(15173823-15173867)
chr5 (270-321)||(21784343-21784395)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (163-323)||(30542-30703)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (163-313)||(10773-10925)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (163-323)||(13033-13195)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (163-311)||(10072-10220)
scaffold0187 (163-311)||(20400-20548)
scaffold0187 (163-218)||(8908-8964)
scaffold0187 (163-218)||(19236-19292)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (175-313)||(1607-1744)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (163-311)||(11095-11242)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (154-318)||(23558-23719)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (163-313)||(58940-59094)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (176-296)||(4134-4258)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (210-323)||(48643-48756)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (163-282)||(226456-226578)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (247-311)||(24155-24220)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (210-313)||(72887-72992)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (215-321)||(3560-3668)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (175-243)||(8867-8935)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (154-253)||(32885-32984)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (185-288)||(35062-35167)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (163-225)||(83838-83901)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (271-327)||(58635-58691)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (175-243)||(43105-43173)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 54966823 - 54967340
Alignment:
Q  1 atcaaatctataataaccacccataattttctcataagtcacccctgtcaacccctgtcacattgtaactactaattagcacaaagatactacttgctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54966823 atcaaatctataataaccacccataattttctcacaagtcacccctgtcaacccctgtcacattgtaactactaattagcacaaagatactacttgctct 54966922  T
Q  101 ttagaggataaaaacctttaattcttttatgaccattccatattcatcaaatgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54966923 ttagaggataaaaacctttaattcttttatgaccattccatattcatcaaatgaagggggaaccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaa 54967022  T
Q  201 agctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcat 300  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54967023 aggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctacat 54967122  T
Q  301 atgcgggagctttgtgcaccgggctg-ctatatcca-tagatgcttgggagttaatttagagatcagctgcctcactttcaagcaaatagtataggactt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54967123 atgcgggagctttgtgcaccgggctgcccatatccattagatgcttgggagttaatttagagatcagctgcctcactttcaagccaatagtataggactt 54967222  T
Q  399 ggttgcttgcattatttagtactttacagttgacaccattgaaattattaccccaaacatgtgcatttaatgtctgtttgaatcagcccaggtaatatga 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54967223 ggttgcttgcattatttagtactttacagttgacaccattgaaattattaccccaaacatgtgcatttaatgtctgtttgaatcagcccaggtaatatga 54967322  T
Q  499 tagagttatcaatcatct 516  Q
    || |||||||||||||||    
T  54967323 taaagttatcaatcatct 54967340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17043571 - 17043400
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  17043571 aagggggagtcttggcgcaacg---aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaag 17043475  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  17043474 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttatgcaccaggctgc 17043400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463249
Alignment:
Q  185 ttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccc 283  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  284 cttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggct 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccaggct 25463249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 20224947 - 20225108
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  20224947 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 20225044  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20225045 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 20225108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 37494814 - 37494966
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37494814 ccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcata 37494913  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  37494914 caatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagcttt 37494966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 21646927 - 21647092
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  21646927 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgta 21647026  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21647027 caatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 21647092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 5648222 - 5648372
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  5648222 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgta 5648320  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5648321 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 5648372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49938771 - 49938613
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  49938771 aagggggagccctggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacggggtaa 49938673  T
Q  253 ggttgctacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49938672 ggt--gtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagcttt 49938613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6430797 - 6430646
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  6430797 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgta 6430699  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6430698 caatacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 6430646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 30639343 - 30639494
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  30639343 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgta 30639441  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30639442 caatacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 30639494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 47528700 - 47528539
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  47528700 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 47528603  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  47528602 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccggg 47528539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48598995 - 48598834
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  48598995 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 48598898  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  48598897 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccggg 48598834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16408775 - 16408610
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  16408775 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 16408676  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16408675 caatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 16408610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 23501756 - 23501915
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||      | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23501756 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgta 23501849  T
Q  261 caatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23501850 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 23501915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 327
Target Start/End: Original strand, 35567141 - 35567300
Alignment:
Q  170 gcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatatac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  35567141 gcaacggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacac 35567240  T
Q  269 caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35567241 caaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgc 35567300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5306835 - 5306694
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  5306835 ccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagggtaaggttgcgta 5306737  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatg 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5306736 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatg 5306694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Original strand, 40915805 - 40915942
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  40915805 ggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 40915903  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40915904 ggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 40915942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Original strand, 54175019 - 54175195
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctgg-aaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||   |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  54175019 aagggggagccttggcgcaacgataa-gttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 54175116  T
Q  253 ggttgc-tacaatatacc-aaatggtgggacccctt-cccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54175117 ggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgc 54175195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 322
Target Start/End: Original strand, 19027804 - 19027973
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19027804 agggggagtcttgacgcaatggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagg 19027903  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
     ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  19027904 ctgcgtacaatacaccaattggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20908817 - 20908656
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||| | ||||||    
T  20908817 agggggagccttggcacaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaag 20908718  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20908717 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 20908656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478801
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctacaatataccaaatggt 276  Q
    ||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||    |||| ||||||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaa-cagggtaaggctg----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  277 gggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagctttgtgcaccggg 32478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 16911525 - 16911679
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  16911525 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggctgcgta 16911624  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16911625 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagcttt 16911679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39029241 - 39029080
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39029241 aagggggagccttaaggaaacggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 39029142  T
Q  254 gttg-ctacaatatac-caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39029141 gctgtgtacaatacacgaaaatggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagcttt 39029080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Original strand, 36589696 - 36589874
Alignment:
Q  151 atgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  36589696 atgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggt 36589794  T
Q  251 aaggttgct-acaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    || | || | ||| || ||| ||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36589795 aatgctgttgacagtacaccaaaatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgc 36589874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 312
Target Start/End: Original strand, 47443968 - 47444071
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  47443968 gttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcagga 47444067  T
Q  309 gctt 312  Q
    ||||    
T  47444068 gctt 47444071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11054316 - 11054157
Alignment:
Q  165 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-taca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||||  ||| ||||    
T  11054316 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 11054219  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11054218 atacaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 11054157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30581639 - 30581485
Alignment:
Q  162 gccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggttg-ct 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||   ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  30581639 gccttggcgcaacgctaaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgt 30581540  T
Q  260 acaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30581539 acaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagcttt 30581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077805
Alignment:
Q  180 agttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgg 278  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtga 39077851  T
Q  279 gaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39077850 gacatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 39077805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44363291 - 44363139
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||   |||  ||    
T  44363291 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcaccaaaa 44363192  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44363191 atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 44363139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3581016 - 3580854
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| || ||||||    
T  3581016 aagggggagccttggcgcggcagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtc-tggaaa---cctcttgtgtaaaaaccatggtaag 3580921  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcac 319  Q
    | ||  | ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3580920 gctgtgtgcaatacaccaaatgctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctttgtgcac 3580854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47441710 - 47441566
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||    
T  47441710 aaggaggagctttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaag 47441611  T
Q  254 gttg-ctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctg 297  Q
    | ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47441610 gctgtgtacaatacaccaaatggttggaccccttcccggaccctg 47441566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 10660367 - 10660520
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||    
T  10660367 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggctgcata 10660466  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||  ||||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||||||    
T  10660467 caatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagcttt 10660520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 10874512 - 10874665
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||    
T  10874512 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggctgcata 10874611  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||  ||||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||||||    
T  10874612 caatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagcttt 10874665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 14983810 - 14983949
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||   |||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  14983810 ggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcctacaatacactaaat 14983909  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14983910 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 14983949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207907
Alignment:
Q  191 tgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttccc 289  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 29207942  T
Q  290 gtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29207941 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 29207907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987839
Alignment:
Q  211 ttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  310 cttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  9987857 ctttaatgcaccgggctgc 9987839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639667
Alignment:
Q  216 gtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  314 -gtgcaccggg 323  Q
     ||||||||||    
T  20639677 agtgcaccggg 20639667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30690349 - 30690181
Alignment:
Q  168 gcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-------cagggtaaggttgc-t 259  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||       |||||||||| ||| |    
T  30690349 gcgcagcgctaaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcat 30690250  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30690249 acaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgc 30690181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13256569 - 13256408
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13256569 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctggag----cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 13256474  T
Q  261 caatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||  || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13256473 caatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccggg 13256408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 487315 - 487217
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  487315 aaggaggagccttggcgtaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaa 487217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  182 ttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaatggtggga 280  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  281 ccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc 310  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832342
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatgg 275  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 9832371  T
Q  276 tgggaccccttcccgtaccctgcatatgc 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9832370 tgggaccccttcccggaccctgcatatgc 9832342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 272
Target Start/End: Original strand, 25343144 - 25343261
Alignment:
Q  156 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 255  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||     
T  25343144 gggggaggcttggcgcaatggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 25343243  T
Q  256 tgc-tacaatataccaaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  25343244 tgcgtacaatacaccaaa 25343261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 51420528 - 51420629
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatg-ttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||  || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  51420528 aagggggagccttggcgcaacggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaa 51420627  T
Q  253 gg 254  Q
    ||    
T  51420628 gg 51420629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Original strand, 25629080 - 25629175
Alignment:
Q  230 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25629080 ctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtgcaccggg 25629175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30496501 - 30496333
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |   ||||||    
T  30496501 aagggggagacttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaca--cgggtaa 30496404  T
Q  253 ggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  30496403 ggctgcatacaatacaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Original strand, 54730214 - 54730376
Alignment:
Q  165 ttggcgcaa-cggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggttgc-tac 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||     
T  54730214 ttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataaggctgcgtat 54730313  T
Q  262 aatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    |||| |||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54730314 aatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 54730376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42164317 - 42164229
Alignment:
Q  165 ttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42164317 ttggcgcaacggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaagg 42164229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51865143 - 51865058
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51865143 cctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 51865058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909307
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggg 307  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggg 7909307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 282
Target Start/End: Original strand, 14590800 - 14590922
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||| ||| |    
T  14590800 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggctgcat 14590899  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggacc 282  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  14590900 acaatacatcaaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473629
Alignment:
Q  165 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-taca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||| |  |  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||  |||||||||| ||| ||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaa--cagggtaaggctgcataca 8473693  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttccc--gtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8473692 atacaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 8473629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489203
Alignment:
Q  211 ttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 21489198  T
Q  309 gcttt 313  Q
    |||||    
T  21489199 gcttt 21489203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23580388 - 23580293
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacaggg 249  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23580388 aagggagagccttgatgcaacgctaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggg 23580293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796911
Alignment:
Q  219 ctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 49796911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17315470 - 17315389
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  17315470 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaa 17315389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32629447 - 32629293
Alignment:
Q  152 tgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| |||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  32629447 tgaagggggagccttggcgcaacggtaaag---ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgt-aaaaaaacagggta 32629352  T
Q  252 aggttg-ctacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    |||  | |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  32629351 aggccgcctac-atacaccaaattggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggag 32629293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018838
Alignment:
Q  182 ttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtggga 280  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtggga 41018847  T
Q  281 ccccttccc 289  Q
    |||||||||    
T  41018846 ccccttccc 41018838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035303
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaagg 43035303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 323
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786735
Alignment:
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 38786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 54640511 - 54640429
Alignment:
Q  162 gccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  54640511 gccttggcgcaacggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Original strand, 20405116 - 20405204
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20405116 cctcttgtgtaaaaaaacagggtaagattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagcttt 20405204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 323
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225202
Alignment:
Q  244 acagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 20225202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30352763 - 30352591
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-----aaaacagggtaag--- 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||  |||  ||||||||||| | ||||||||||||     |||||||||||||       
T  30352763 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaagtaa 30352664  T
Q  254 -gttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
     | ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30352663 agctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 30352591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484359
Alignment:
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 32484359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50856417 - 50856345
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  50856417 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaa 50856345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755917
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 38755917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47482913 - 47482869
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47482913 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttg 47482869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Original strand, 11394923 - 11394978
Alignment:
Q  269 caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11394923 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 11394978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Original strand, 11404650 - 11404705
Alignment:
Q  269 caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11404650 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 11404705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 327
Target Start/End: Original strand, 28494222 - 28494281
Alignment:
Q  269 caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28494222 caaatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgc 28494281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 319
Target Start/End: Original strand, 9037730 - 9037852
Alignment:
Q  199 aaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacccc-ttcccgtaccct 296  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| || |||||||| | |||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| || ||| || ||    
T  9037730 aaaggtcacatgttcaagtcatagaaataatctcttgtgcataaaatagggtaagactgcatacaatacaccgaatggtaggaccccttttccgaacact 9037829  T
Q  297 gcatatgcgggagctttgtgcac 319  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  9037830 gcgtatgcaggagctttgtgcac 9037852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33836549 - 33836507
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33836549 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 33836507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48327869 - 48327772
Alignment:
Q  230 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  48327869 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccggg 48327772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49938612 - 49938519
Alignment:
Q  161 agccttggcgcaacggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| |||||  | | | |||||| |||||||||||||||    
T  49938612 agccttggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgt-aaaaacagggtaagg 49938519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Original strand, 41549344 - 41549425
Alignment:
Q  161 agccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| | |||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41549344 agccttggcgcaaaggtaaagttgttgacacatgattgaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaa 41549425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553946
Alignment:
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 40553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51865194 - 51865154
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtg 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  51865194 aagggggagccttggtgcaacggtaaagttgctgtcatgtg 51865154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12257767 - 12257688
Alignment:
Q  160 gagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgta 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |||||| |||| |||| | | |||||||||    
T  12257767 gagccttgacgcaacggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17079775 - 17079696
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcc 288  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  17079775 gttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgctaaatggtgggaccctttcc 17079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 327
Target Start/End: Original strand, 21003410 - 21003465
Alignment:
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21003410 atggtgtgacctcttcccagaccctgcgtgtgcgggagctttgtgcaccgggctgc 21003465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 253
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038106
Alignment:
Q  187 gtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcct-gaaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaag 7038106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10277831 - 10277781
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10277831 tacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcgggag 10277781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10380033
Alignment:
Q  190 atgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaa 243  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgtaaaaa 10380033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 323
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388302
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccggg 25388302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 313
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718682
Alignment:
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 44718682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50555718 - 50555661
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  50555718 aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgc 50555661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28362325 - 28362154
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  ||||||    
T  28362325 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaag 28362226  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggc 324  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28362225 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagctttgtgcaccgggc 28362154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23419853 - 23419719
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  23419853 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 23419754  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcc 288  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23419753 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 23419719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 32758224 - 32758385
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-cta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||  ||    
T  32758224 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgtgta 32758321  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32758322 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 32758385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11617756 - 11617597
Alignment:
Q  167 ggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaat 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  11617756 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaat 11617657  T
Q  265 ataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  11617656 acaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccggg 11617597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2541192 - 2541028
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2541192 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgt 2541093  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2541092 actatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 2541028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21172179 - 21172018
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  21172179 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 21172082  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21172081 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 21172018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 27629597 - 27629748
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27629597 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgta 27629696  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  27629697 aaatacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagctt 27629748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48735293 - 48735131
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcct-ggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |    
T  48735293 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacac--ggtaaggctgcgt 48735196  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48735195 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 48735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10693243 - 10693095
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||    
T  10693243 ccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaga--gggtaaggctgcgta 10693146  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10693145 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 10693095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 325
Target Start/End: Original strand, 13805058 - 13805228
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||    
T  13805058 agggggagccttggcgcaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggtaagg 13805156  T
Q  255 ttg-ctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggct 325  Q
     ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13805157 ctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagctttgtgcactgggct 13805228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 19266406 - 19266564
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||    
T  19266406 agggggagccttggtgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaagg 19266505  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
     ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19266506 ctgcgtacaatacaccaaattgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 19266564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 42798632 - 42798782
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  42798632 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 42798731  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42798732 caatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagct 42798782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 42805487 - 42805652
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-cta 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  42805487 ccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgta 42805586  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42805587 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 42805652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48123663 - 48123498
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||      
T  48123663 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaa 48123564  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcac 319  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  48123563 ctgcatacaatacaccaaatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggaggtttgggcac 48123498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 304
Target Start/End: Original strand, 46354157 - 46354302
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  46354157 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 46354256  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgc 304  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46354257 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Original strand, 47716438 - 47716587
Alignment:
Q  178 aaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatg 274  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||    
T  47716438 aaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 47716537  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47716538 gtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccggg 47716587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 327
Target Start/End: Original strand, 19265772 - 19265943
Alignment:
Q  156 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| |||| | | || ||||||| ||||| |||||||||     
T  19265772 gggggagcattggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggc 19265870  T
Q  256 tgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19265871 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgc 19265943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391109
Alignment:
Q  181 gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtggg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggg 42391154  T
Q  280 accccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42391153 accccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 42391109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426911
Alignment:
Q  165 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-taca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagctt 19426911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14099172 - 14099012
Alignment:
Q  168 gcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatat 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||     
T  14099172 gcgctacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatac 14099073  T
Q  267 accaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  14099072 accaaatggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggagatttttgcaccaggctgc 14099012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14409189 - 14409029
Alignment:
Q  168 gcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatat 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||     
T  14409189 gcgctacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatac 14409090  T
Q  267 accaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  14409089 accaaatggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggagatttttgcaccaggctgc 14409029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 43557435 - 43557601
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  43557435 ccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggctgcgta 43557534  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt--gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43557535 caatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccggg 43557601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 312
Target Start/End: Original strand, 7879649 - 7879752
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7879649 gttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 7879748  T
Q  309 gctt 312  Q
    ||||    
T  7879749 gctt 7879752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33872068 - 33871930
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  33872068 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaat 33871970  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||    
T  33871969 ggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagcttt 33871930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34626379 - 34626228
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| |     
T  34626379 ccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtt 34626281  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34626280 caatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 34626228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35334986 - 35334825
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||  ||  ||    
T  35334986 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctc--gtgtaaaaaacagggtaagactgtgta 35334889  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  35334888 caatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 35334825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47078025 - 47077877
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||  |||| || |||| ||||| ||    
T  47078025 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaatagagtaaagttgcgta 47077928  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  47077927 caatacacaaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagct 47077877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3469354 - 3469195
Alignment:
Q  159 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa--aaaacagggtaaggtt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||| |  |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  3469354 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggtt 3469255  T
Q  257 gc-tacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    || ||||||| |||  |||||| ||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  3469254 gcgtacaatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagcttt 3469195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 308
Target Start/End: Original strand, 7644914 - 7645066
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggtt 256  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |     
T  7644914 ggggagccttggcgcagtggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagata 7645013  T
Q  257 gc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    || ||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  7645014 gcgtacaatacaccaaaattgtgggaccccttcctg-accctgcgtatgcggga 7645066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32233314 - 32233140
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||  ||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32233314 aagggggacccttggcgcaacagaaaaattgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaag 32233216  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt-tgtgcaccgggctgc 327  Q
    |  || || | || ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  32233215 gcagcgtatattacaccaaatggtgggattccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgc 32233140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 40463840 - 40463990
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||| |  |||||||||||||| | |||||||| ||| ||    
T  40463840 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaa-ctgggtaaggctgcgta 40463938  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  40463939 taatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctt 40463990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18512576 - 18512472
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18512576 gttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaat-agggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 18512478  T
Q  309 gctttg 314  Q
    ||||||    
T  18512477 gctttg 18512472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 29907375 - 29907544
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgt--catgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  29907375 ggggggccttgtcacaacggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaagg 29907474  T
Q  255 ttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     ||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29907475 ctgcgttcaatacaccaaaatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccggg 29907544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Original strand, 16341233 - 16341409
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||   | |||| ||||  |||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16341233 aaggggcagcgttggagcaacggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 16341332  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    | | | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16341333 gctacgtacaatacaccaaaatggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgc 16341409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28078286 - 28078152
Alignment:
Q  179 aagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtg 277  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||| |  ||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  28078286 aagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgta-aaaaaacagggtaaggttgcatgcaatacaccaaatggtg 28078188  T
Q  278 ggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  28078187 ggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagcttt 28078152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8149127 - 8148989
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggta 251  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8149127 aaggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggta 8149028  T
Q  252 aggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttccc 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8149027 aggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 8148989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38262320 - 38262206
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  38262320 gttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcccgaacactgcgtatgcggga 38262221  T
Q  309 gcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||| |||||||||    
T  38262220 gctttagtgcaccgg 38262206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 311
Target Start/End: Original strand, 42476849 - 42476984
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42476849 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 42476946  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||||||||||    
T  42476947 ggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagct 42476984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 327
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747617
Alignment:
Q  185 ttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacc 282  Q
    |||||| |||||| |||| ||||  | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  283 ccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgc 18747617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 327
Target Start/End: Original strand, 6736843 - 6737017
Alignment:
Q  152 tgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta 251  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  6736843 tgaagggggagccttgacacaacagtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggta 6736941  T
Q  252 aggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    ||  ||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||| ||| || |  ||| ||||||||||||||||||    
T  6736942 agactgcatacaatacaccaaatggt-ggagcctttcccggaccttgcgtacgaaggacctttgtgcaccgggctgc 6737017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14732994 - 14732831
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctac 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||| |||  |    
T  14732994 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggctgcgtc 14732895  T
Q  262 aatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    |||| |||  ||||||||  || |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  14732894 aatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccgg 14732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 325
Target Start/End: Original strand, 21566440 - 21566564
Alignment:
Q  204 tcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcata 301  Q
    ||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21566440 tcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcata 21566539  T
Q  302 tgcgggagcttt-gtgcaccgggct 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  21566540 tgcgggagctttagtgcaccgggct 21566564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31591231 - 31591118
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31591231 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa--cagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcggga 31591134  T
Q  309 gct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||| | ||||||||||    
T  31591133 gctctagtgcaccggg 31591118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Original strand, 12473259 - 12473378
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||   |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12473259 aggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaag 12473358  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaa 272  Q
    | ||| ||||||| ||||||    
T  12473359 gatgcgtacaatacaccaaa 12473378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22699142 - 22698976
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  22699142 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 22699043  T
Q  261 caatatacc--aaatggtgggaccc-cttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  22699042 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 22698976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 304
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408563
Alignment:
Q  211 ttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgc 304  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgc 1408563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 323
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604653
Alignment:
Q  218 cctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt--g 314  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaag 38604644  T
Q  315 tgcaccggg 323  Q
    |||||||||    
T  38604645 tgcaccggg 38604653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44123794 - 44123628
Alignment:
Q  161 agccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  44123794 agccttggtgcaacggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggttgcat 44123696  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
      |||| |||| ||  |||||||| ||| || || |||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  44123695 gaaatacaccatataatgggacccgttctcggacactgcgtatgcaggagctttaagcaacgggctgc 44123628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42102057 - 42101967
Alignment:
Q  162 gccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  42102057 gccttggcacaacggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaa 42101967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2663103 - 2662958
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |   ||| | |||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||    
T  2663103 ccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactggag--tcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggctgcgta 2663008  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  2663007 caatacaccaaatggtgggacccttttcag-accctgcatatgcgggagct 2662958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741919
Alignment:
Q  178 aaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggt 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||| | | ||| |||||||| |  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgtaaaata--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 11741871  T
Q  277 gggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  11741872 gggatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccggg 11741919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 18326997 - 18327088
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  18326997 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaagg 18327088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 321
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231681
Alignment:
Q  215 agtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 23231672  T
Q  314 -gtgcaccg 321  Q
     ||||||||    
T  23231673 agtgcaccg 23231681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35787373 - 35787290
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35787373 cctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctt 35787290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42496007 - 42495916
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  42496007 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtat-aaaaacagggtaagg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27889390 - 27889335
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttg 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27889390 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttg 27889335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 254
Target Start/End: Original strand, 7193062 - 7193140
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||    
T  7193062 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaacaatatggtaagg 7193140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Original strand, 43852006 - 43852097
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43852006 agggggagccttggtgcaacggtaaagttgttgtcatgtga-------gtcacgggttcaagtcct-gaaaaaacctcttctgtaaaaaacagggtaagg 43852097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5180338 - 5180238
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  5180338 aaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaa 5180239  T
Q  253 g 253  Q
    |    
T  5180238 g 5180238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 35203450 - 35203556
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| | || || | |||||||    
T  35203450 gttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcctgaactctacgtatgcgg 35203549  T
Q  307 gagcttt 313  Q
    |||||||    
T  35203550 gagcttt 35203556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 39123857 - 39124011
Alignment:
Q  166 tggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta----aggttgc-ta 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||    ||| ||| ||    
T  39123857 tggcgcaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaa-cagggtagggaaggctgcgta 39123955  T
Q  261 caatataccaaa--tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttg 314  Q
     |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  39123956 aaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttg 39124011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4000862 - 4000777
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| || ||  |||||||| |||||||    
T  4000862 ggggagccttggcgcaacgataaaattgttgtcacgtaacttaaagatcacatgtttaagtcatgaaagcaacctcttatgtaaaa 4000777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 5814434 - 5814526
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaa-cggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||  ||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5814434 ccttggcgcaatcggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaaatagggtaagg 5814526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7794678 - 7794584
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  7794678 ccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaaaacagggtaagg 7794584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23066029 - 23065935
Alignment:
Q  230 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23066029 ctcttgtttaaaaaacaggataaagttgcgtacaatacaccatatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccgg 23065935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1424080 - 1423992
Alignment:
Q  165 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||   ||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  1424080 ttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaa 1423992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139768
Alignment:
Q  230 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagcttt 21139768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 290
Target Start/End: Original strand, 22065544 - 22065679
Alignment:
Q  156 gggggagccttggcg-caacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| | |||  |||   ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22065544 gggggagccttgggggcaatggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgt-aaaaatagggtaaag 22065642  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccg 290  Q
     ||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  22065643 ctgcatacaataaagcaaatagtgagaccccttcccg 22065679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 308
Target Start/End: Original strand, 33500587 - 33500625
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33500587 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36267931 - 36267902
Alignment:
Q  162 gccttggcgcaacggtaaagttgttgtcat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36267931 gccttggcgcaacggtaaagttgttgtcat 36267902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45019001 - 45018943
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaa----tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45019001 tacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 45018943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5653293 - 5653181
Alignment:
Q  169 cgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctacaatatac 268  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||| |||||   || | |||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||| |     
T  5653293 cgcaacgataatattgttgtcacgtgattaaaatgccataagttcaagttctgaaaacaacctcttgtgtttaaaagatagtaaggttgctacaatacat 5653194  T
Q  269 caaatggtgggac 281  Q
    |||||||| ||||    
T  5653193 caaatggtaggac 5653181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13792215 - 13792155
Alignment:
Q  268 ccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc-tttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  13792215 ccaaatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccgagctgc 13792155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17048914 - 17048858
Alignment:
Q  236 tgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccg 290  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  17048914 tgtaaaaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaaaatggtggaaccccttcccg 17048858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23604612 - 23604553
Alignment:
Q  220 tggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctacaatataccaaatggtggga 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||    
T  23604612 tggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaagattgtgacaatacatcaaatggtggga 23604553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Original strand, 27697452 - 27697492
Alignment:
Q  214 aagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27697452 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaagg 27697492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18724720 - 18724558
Alignment:
Q  159 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg- 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18724720 ggagacttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgt 18724621  T
Q  258 ctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcacc 320  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18724620 gtacaatacaccaaatcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttgtgcacc 18724558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 14617024 - 14617187
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  14617024 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaaggttgcgta 14617123  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14617124 caatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 14617187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 18944629 - 18944795
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18944629 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 18944728  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt--gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18944729 caatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccggg 18944795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44485288 - 44485118
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  44485288 agggggagccttggcgcaacagtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaagg 44485189  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggc 324  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44485188 ctgcgtacaatacaccaaatggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagctttgtgcaccgggc 44485118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30395900 - 30395737
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30395900 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 30395801  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30395800 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 30395737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34725268 - 34725107
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  34725268 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 34725171  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34725170 caatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 34725107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32632728 - 32632578
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  32632728 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgta 32632630  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32632629 caatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctt 32632578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 46991790 - 46991953
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-cta 260  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  46991790 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgta 46991889  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  46991890 caatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggg 46991953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Original strand, 20036208 - 20036374
Alignment:
Q  164 cttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||| |||| | |    
T  20036208 cttggcgcaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttc 20036307  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgct 328  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20036308 aatacaccaaatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttgtgcaccgggctgct 20036374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6983989 - 6983816
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||    
T  6983989 aagggagagccttggcgcaatggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaag 6983892  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
      ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  6983891 tatgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgc 6983816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46248125 - 46247973
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  46248125 ccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 46248026  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46248025 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 46247973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23768479 - 23768340
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  23768479 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 23768380  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23768379 ggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 23768340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41319965 - 41319830
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  41319965 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 41319866  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41319865 gatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggag 41319830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Original strand, 11596501 - 11596662
Alignment:
Q  164 cttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-taca 262  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  11596501 cttggcgcaacggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtata 11596599  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggct 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11596600 atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttgtgaacagggct 11596662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Original strand, 47214499 - 47214645
Alignment:
Q  165 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-taca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  47214499 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaa--cagggtaaggttgcgtaca 47214596  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47214597 atacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagct 47214645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2435967 - 2435796
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2435967 aagggggggccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaag 2435868  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
      ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  2435867 cctgcgtacaatacaccaaaatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Original strand, 19414438 - 19414586
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  19414438 ggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgtaaaa--caggttaaggctgcgtacaatacaccaaat 19414535  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19414536 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 19414586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15511329 - 15511153
Alignment:
Q  156 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  15511329 gggggagccttggcgcaatggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 15511230  T
Q  256 tgc---tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||   ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  15511229 tgcggatacaatacaccaaaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgc 15511153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 321
Target Start/End: Original strand, 6925099 - 6925247
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||| |||    
T  6925099 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccgaat 6925198  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6925199 ggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6925247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatg 274  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45812707 - 45812546
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||    
T  45812707 ccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaaga--gggtaaggctgcata 45812610  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45812609 caatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 45812546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 10668206 - 10668376
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtga-----ctaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggtt 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||     || |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10668206 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggtt 10668305  T
Q  257 gc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10668306 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10668376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20004264 - 20004099
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  20004264 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 20004165  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20004164 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 20004099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39215129 - 39214963
Alignment:
Q  164 cttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-taca 262  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  39215129 cttggcacaacagtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtaca 39215030  T
Q  263 atatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||  ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||    
T  39215029 atattccaaaatggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgc 39214963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 22327077 - 22327177
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22327077 aaggtggagccttggcgcaacggcaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 22327176  T
Q  254 g 254  Q
    |    
T  22327177 g 22327177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22930239 - 22930104
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctac 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  22930239 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgtgac 22930141  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgc 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22930140 aatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgc 22930104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Original strand, 35019215 - 35019382
Alignment:
Q  161 agccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||  ||||| ||| |    
T  35019215 agccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcat 35019314  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35019315 acaatacaccaattggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgc 35019382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38478452 - 38478291
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  38478452 ccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 38478355  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38478354 caatacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 38478291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 313
Target Start/End: Original strand, 50811920 - 50812078
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    ||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||    
T  50811920 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggt 50812019  T
Q  256 tgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  50812020 tgcgtacaatacaccaaaatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagcttt 50812078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 27201646 - 27201787
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||    
T  27201646 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 27201745  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  27201746 atggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttt 27201787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 325
Target Start/End: Original strand, 19701549 - 19701722
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||  ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  19701549 agggggagccttggcgcaacagtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaagg 19701648  T
Q  255 -ttgctacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggct 325  Q
     | | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19701649 atgggtacaatacaccaaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggct 19701722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 322
Target Start/End: Original strand, 27474280 - 27474428
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||| ||  |||    
T  27474280 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgt-aaaaacagggcaaagctgcgtacaatacactgaat 27474378  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27474379 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 27474428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 9939446 - 9939613
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  9939446 ccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttgcgt 9939545  T
Q  260 acaatatacc--aaatggtggga-ccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     ||||| |||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9939546 gcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 9939613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10378905 - 10378740
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||  |||||||||||||||||         || | |||||||||||||    
T  10378905 aaggggaagccttggtgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaag---------tg-agaaaacagggtaag 10378816  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10378815 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgc 10378740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34679399 - 34679300
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34679399 aagggggagctttggcgcaacggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 34679300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35117930 - 35117772
Alignment:
Q  172 aacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatatacc- 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||     
T  35117930 aacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacacca 35117831  T
Q  270 -aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcat-atgcgggagcttt-gtgcaccgggct 325  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||    
T  35117830 aaaatgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggct 35117772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253209
Alignment:
Q  190 atgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcc 288  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 35253232  T
Q  289 cgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  35253231 cggaccctgcatatgcgggagct 35253209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17470526 - 17470390
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||   ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17470526 aagggggagccttggtgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 17470427  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcc 288  Q
    | ||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  17470426 gctgcgtacaatacaccaaaatagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12127007 - 12126859
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | | |||| ||||  ||| |||| ||||||| | | ||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  12127007 ccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 12126910  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12126909 caatacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 12126859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27136826 - 27136696
Alignment:
Q  160 gagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc- 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||  |||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27136826 gagccttggcacaacggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcg 27136727  T
Q  259 tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcc 288  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27136726 tacaatacaccaaaatggtgggaccccttcc 27136696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 323
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349787
Alignment:
Q  237 gtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 4349787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 323
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005274
Alignment:
Q  192 gtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa--tggtgggaccccttcc 288  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  289 cgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccggg 35005274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45264535 - 45264419
Alignment:
Q  199 aaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccct 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||    
T  45264535 aaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctcagaccct 45264436  T
Q  297 gcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||    
T  45264435 gcatatgcgggagcttt 45264419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19932924 - 19932782
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19932924 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 19932828  T
Q  261 caatataccaaa--tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgc 304  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19932827 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgc 19932782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 329
Target Start/End: Original strand, 23371100 - 23371277
Alignment:
Q  152 tgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta 251  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| ||| |    
T  23371100 tgaatggggagccttggcgcaacagtaaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggca 23371198  T
Q  252 aggttg-ctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgcta 329  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  23371199 aggttgtgtacaatacaccaaatgctgggaccccttccag-accctgcgtatgtggtagctttagtgcaccgggctgcta 23371277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 327
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796618
Alignment:
Q  218 cctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gt 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagt 23796606  T
Q  316 gcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||||    
T  23796607 gcaccgggctgc 23796618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 45402081 - 45402245
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggt--aaggt-tgc 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||    
T  45402081 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggttcaagttctgc 45402178  T
Q  259 -tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45402179 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 45402245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2436073 - 2435983
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa 244  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2436073 aagggggggccttggtgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25554902 - 25554817
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgta 239  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25554902 aaggaggagccttggcgcaatggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgta 25554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382234
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagcttt 31382234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 8197029 - 8197181
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  8197029 ccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctacgta 8197128  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    || || |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||    
T  8197129 cagtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagcttt 8197181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 25290149 - 25290243
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaa--agaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25290149 ccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 25290243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 321
Target Start/End: Original strand, 15505648 - 15505710
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccg 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15505648 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttgtgcaccg 15505710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50760403 - 50760306
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  50760403 ggggagccttggcgcaaaggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaagg 50760306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Original strand, 52910196 - 52910285
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| || |||||| | ||||||  ||||||||    
T  52910196 agggggagccttggtgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaa 52910285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Original strand, 43207467 - 43207610
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaag------ctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |      |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  43207467 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggacacactcacaggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacag 43207566  T
Q  248 ggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttccc 289  Q
    ||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  43207567 ggtaagacggcatacaatacaccaaattggtgggacctcttccc 43207610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 284
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223093
Alignment:
Q  164 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtac 33223069  T
Q  262 aatatacc-aaatggtgggacccc 284  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  33223070 aatacaccaaaatggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148983
Alignment:
Q  218 cctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc 310  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagaccaaatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagc 34148983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18742133 - 18741966
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctgg-aaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc- 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| || ||| ||| |  || |||| ||||||| |||||||||| |||     
T  18742133 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggctgcg 18742034  T
Q  259 tacaatataccaaa--tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  18742033 tacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 18741966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 24564321 - 24564445
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | |||| || ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24564321 aaggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 24564420  T
Q  253 ggttgc-tacaatataccaaatggt 276  Q
    || ||| ||||||  ||||||||||    
T  24564421 gggtgcgtacaattcaccaaatggt 24564445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 323
Target Start/End: Original strand, 50606498 - 50606552
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50606498 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 50606552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999855
Alignment:
Q  232 cttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgc 20999855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31442555 - 31442398
Alignment:
Q  156 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||| | |||| | ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  31442555 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtga--------------gttcaagtcttagaaacagccttttatgtaaaaaaacagggtaagg 31442470  T
Q  255 ttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  31442469 atgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccggg 31442398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 320
Target Start/End: Original strand, 30682906 - 30682957
Alignment:
Q  269 caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30682906 caaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcgggagctttgtgcacc 30682957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304217
Alignment:
Q  240 aaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa--tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 42304217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 327
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768292
Alignment:
Q  242 aaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgc 43768292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4587629 - 4587567
Alignment:
Q  267 accaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt-tgtgcaccgggctgct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4587629 accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgct 4587567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Original strand, 22324927 - 22325046
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  22324927 gttcaagtcttggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtcccg-accctgcgtatgcgg 22325024  T
Q  307 gagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||| ||||||| ||||||    
T  22325025 gagctttagtgcaccaggctgc 22325046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4430185 - 4430080
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||| ||||| || ||| |   |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  4430185 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 4430086  T
Q  274 ggtggg 279  Q
    ||||||    
T  4430085 ggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21910743 - 21910686
Alignment:
Q  240 aaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccct 296  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21910743 aaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccct 21910686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272465
Alignment:
Q  186 tgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaa 243  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa 31272465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18335445 - 18335333
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatgg 275  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||| | ||||||     
T  18335445 taaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagttgcgtacaatacatcaaatga 18335346  T
Q  276 tgggaccccttcc 288  Q
    |||||||| ||||    
T  18335345 tgggaccctttcc 18335333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18336003 - 18335912
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatata 267  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||| || || |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18336003 taaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaaggctgcgtacaatata 18335912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169109
Alignment:
Q  216 gtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||  ||  |||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 20169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1517417 - 1517320
Alignment:
Q  229 cctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1517417 cctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 1517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 215
Target Start/End: Original strand, 6358112 - 6358173
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||| ||||| ||||||    
T  6358112 aagggggagccttggcgcaacggtaaatttgttttcacatgactgaaaggtcacaggttcaa 6358173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 326
Target Start/End: Original strand, 30555210 - 30555267
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctg 326  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30555210 aaatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctg 30555267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Original strand, 10163747 - 10163867
Alignment:
Q  165 ttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctaca 262  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||| | | |||| |||  ||||    
T  10163747 ttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaaaatatgataagattgtataca 10163846  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccc 283  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  10163847 atacatcaaatggtgggaccc 10163867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28894702 - 28894650
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  28894702 ccttggcgcaacagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacctgttcaa 28894650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 190
Target Start/End: Original strand, 46859049 - 46859085
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtca 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46859049 aagggggagccttggcgcaacagtaaagttgttgtca 46859085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 34714609 - 34714672
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaa 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  34714609 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaa 34714672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4249517 - 4249463
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  4249517 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 4249463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4249841 - 4249787
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  4249841 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 4249787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4250165 - 4250111
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  4250165 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 4250111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33594196 - 33594138
Alignment:
Q  268 ccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggct 325  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  33594196 ccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggct 33594138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 220
Target Start/End: Original strand, 40424728 - 40424786
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcct 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  40424728 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49546082 - 49546024
Alignment:
Q  159 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagt 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||||||||    
T  49546082 ggagctttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtggctgaaaggttacaggttcaagt 49546024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21910811 - 21910762
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaag 202  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21910811 gaagggggagccttaacgcagcggtaaggttgttgtcatgtgattaaaag 21910762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4251506 - 4251462
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  4251506 gttcaagtcctagaaacaaccttttatgtaaaaaacagggtaagg 4251462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46957
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  46894 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 46957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24939 - 24792
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||     || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24939 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 24845  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24844 caacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 24792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43771
Alignment:
Q  212 tcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacccc-ttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggag 43769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46727
Alignment:
Q  246 agggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 46727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47063 - 46995
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctgg 222  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  47063 aagggagagccttggcgcaatagtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgg 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40272984 - 40272821
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  40272984 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 40272885  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40272884 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 40272821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 327
Target Start/End: Original strand, 26573105 - 26573279
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  26573105 agggggacccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaagg 26573204  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
     ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  26573205 ctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgc 26573279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53996743 - 53996570
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggtt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53996743 ggggagccttggcgctacggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 53996644  T
Q  257 gc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  53996643 gcttacaatacaccaaaatggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgc 53996570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8247861 - 8247707
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8247861 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgta 8247762  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8247761 caatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 8247707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46421209 - 46421055
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  46421209 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 46421110  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46421109 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 46421055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Original strand, 39203515 - 39203662
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39203515 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 39203612  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39203613 gtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 39203662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12914207 - 12914056
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  12914207 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcggcgta 12914108  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12914107 caatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctt 12914056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13730776 - 13730611
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-cta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  13730776 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgta 13730677  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13730676 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 13730611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34420824 - 34420663
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34420824 aagggggggccttggcgcaacagtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 34420725  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  34420724 gctgcgtaccatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagcttt 34420663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 323
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869854
Alignment:
Q  167 ggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaat 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaat 26869794  T
Q  265 ataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26869795 acaccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccggg 26869854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29366894 - 29366740
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  29366894 ccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcgta 29366795  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  29366794 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagcttt 29366740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45949017 - 45948848
Alignment:
Q  158 gggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaa---agctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||   || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45949017 gggagccttggcgcaacggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaagg 45948918  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45948917 ctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13628948 - 13628799
Alignment:
Q  178 aaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatg 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||    
T  13628948 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 13628849  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13628848 gtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 13628799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 22609752 - 22609901
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  22609752 ccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtac 22609850  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  22609851 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctt 22609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 1217075 - 1217236
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  1217075 ccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 1217172  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1217173 caatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 1217236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30928310 - 30928166
Alignment:
Q  171 caacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatatacc 269  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||    
T  30928310 caacggtcaagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacacc 30928211  T
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttg 314  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30928210 aattggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctttg 30928166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22123087 - 22122926
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  22123087 ccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 22122990  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22122989 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccggg 22122926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45621008 - 45620881
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  45621008 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaag 45620909  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtggga 280  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  45620908 gctgcgtacaatacaccaattggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374365
Alignment:
Q  192 gtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttccc 289  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  290 gtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagcttt 54374365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44403736 - 44403560
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  44403736 aagggggagccttggtgcaacggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaag 44403637  T
Q  254 gttgc-tacaata-taccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    | |||  | ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  44403636 gctgcggagaataccacaaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgc 44403560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 9607188 - 9607342
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  9607188 ccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 9607287  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
     |||| ||||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9607288 gaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 9607342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5173876 - 5173728
Alignment:
Q  178 aaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aaatg 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||| |||  |||||    
T  5173876 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaaagtaaggttgcatgcaatacaccaaaaatg 5173778  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5173777 gtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 5173728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Original strand, 14986990 - 14987107
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  14986990 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcgg 14987089  T
Q  307 gagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  14987090 gagctttagtgcaccggg 14987107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 313
Target Start/End: Original strand, 25944449 - 25944607
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggtt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| |||| |    
T  25944449 ggggagccttggcgcaacagtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggct 25944548  T
Q  257 g-ctacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  25944549 gagtacaatacaccaaaatggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagcttt 25944607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 323
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516560
Alignment:
Q  185 ttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc---aaatggtggga 280  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||   |||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  281 ccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 516560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7697057 - 7696901
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  7697057 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 7696960  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||     |||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  7696959 caatacaccaaatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccggg 7696901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Original strand, 31592882 - 31592995
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31592882 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcggga 31592979  T
Q  309 gct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||| | ||||||||||    
T  31592980 gctctagtgcaccggg 31592995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 16735426 - 16735576
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||    
T  16735426 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgta 16735524  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  16735525 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagctt 16735576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 249
Target Start/End: Original strand, 35417893 - 35417988
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacaggg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35417893 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 35417988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139483
Alignment:
Q  188 tcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aaatggtgggacccc 284  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  285 ttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaactttgtgcaccgggctgc 45139483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4495836 - 4495714
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4495836 ccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 4495737  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4495736 caatacaccaaatggtgggaccc 4495714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 251
Target Start/End: Original strand, 53062015 - 53062112
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta 251  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  53062015 aagggggaggattggcgcatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484839
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt- 313  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  314 gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||    
T  54484830 gtgcaccggg 54484839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Original strand, 29106523 - 29106659
Alignment:
Q  151 atgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggt 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||  || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  29106523 atgaagggggagctttggcgcaacggtaaaaatgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggat 29106622  T
Q  251 aaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacccctt 286  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  29106623 aaggttacgtacaatacaccaaattgtgggatccctt 29106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771369
Alignment:
Q  241 aaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgc 34771369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52926382 - 52926239
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||         |||||| ||| ||    
T  52926382 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaaggctgcgta 52926292  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  52926291 caatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 52926239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 829622 - 829452
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |  | |||||||| || |||| |||||||||| |||| ||||  ||||     
T  829622 aagggggagttttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacccga-gttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaa 829524  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  829523 gttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10795549 - 10795444
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  10795549 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgg 10795450  T
Q  307 gagctt 312  Q
    ||||||    
T  10795449 gagctt 10795444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 327
Target Start/End: Original strand, 19730996 - 19731154
Alignment:
Q  171 caacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc 269  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||   | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  19730996 caacggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc 19731095  T
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
     | ||||||||||| |||||  || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19731096 tattggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgc 19731154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6411993 - 6411833
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||   ||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  6411993 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgta 6411895  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6411894 caatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10870123 - 10870032
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10870123 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaagg 10870032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013482
Alignment:
Q  220 tggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gt 315  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagt 49013490  T
Q  316 gcaccggg 323  Q
    ||||||||    
T  49013489 gcaccggg 49013482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032609
Alignment:
Q  188 tcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccc 283  Q
    ||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtgggaccc 54032609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 313
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926220
Alignment:
Q  188 tcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca-aatggtgggacccct 285  Q
    |||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccct 33926192  T
Q  286 tcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  33926193 tcctggaccctgcatatgcgagagcttt 33926220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353358
Alignment:
Q  235 gtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 353358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 15797274 - 15797368
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  15797274 cctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccggg 15797368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410876
Alignment:
Q  183 tgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgct-acaatataccaaatggtgggac 281  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||  ||||| ||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggac 8410919  T
Q  282 cccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggc 324  Q
    | |||| |  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  8410918 ctcttctcagaccctgcataggcggaagctttgtgcactgggc 8410876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45786321 - 45786223
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa--tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  45786321 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgcaccggg 45786223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943127
Alignment:
Q  180 agttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgg 278  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  279 gaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    || ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagcttt 7943127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Original strand, 9276316 - 9276400
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  9276316 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttt 9276400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24851369 - 24851310
Alignment:
Q  265 ataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24851369 ataccaaatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 24851310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25517345 - 25517179
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagt--cctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | | | |   |||||||| | |||||||||||||||| || | || || |||    
T  25517345 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagatatggctgc 25517246  T
Q  259 -tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25517245 gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccggg 25517179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 28904931 - 28905080
Alignment:
Q  165 ttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggttg-ctaca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || || |  ||||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||    
T  28904931 ttggtgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtaca 28905030  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
     || |||||||  |||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||    
T  28905031 ttacaccaaat-atgggaccctttcccggaccctgcgtaagcgggaacttt 28905080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 33235528 - 33235641
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgac-taaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||| || ||    
T  33235528 ggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacactaa 33235627  T
Q  272 atggtgggacccct 285  Q
    ||||||||||||||    
T  33235628 atggtgggacccct 33235641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Original strand, 47624094 - 47624162
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctg 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47624094 cctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 47624162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114888
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaagg--ttgctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgta-ccctgcatatgcg 305  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtggga-cccttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  306 ggagcttt 313  Q
    ||||||||    
T  43114895 ggagcttt 43114888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Original strand, 55400975 - 55401023
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaag 202  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55400975 aagggggacccttggcacaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaag 55401023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Original strand, 55401209 - 55401329
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggg 307  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||    
T  55401209 gttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttctcggaccttccgtatgcggg 55401308  T
Q  308 agc-tttgtgcaccgggctgc 327  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  55401309 agcttttttgcaccgggctgc 55401329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1121405 - 1121319
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||| || |||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1121405 aagggggagccttggcgcaacactaaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaa 1121319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Original strand, 12525414 - 12525484
Alignment:
Q  184 gttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12525414 gttgtcatatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaagg 12525484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 19751614 - 19751691
Alignment:
Q  213 caagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttccc 289  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  19751614 caagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctattggtgggaccctttccc 19751691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21330424 - 21330273
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||  ||| |||| |||| |||| ||  |||||| |||||||||    
T  21330424 ggggagccttggcgcaatggtaaagtggttgtcatgtgacttaaag-tcacagtttcaatccctagaaacaaccacttgcgtaaaaaaaatagggtaagg 21330326  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
      || ||||||| ||||||| | ||||||| ||||   ||| |||||||||||    
T  21330325 ccgcatacaatacaccaaattgcgggaccctttcctagaccatgcatatgcgg 21330273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Original strand, 39211969 - 39212066
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||| ||||||||| |   ||||||| || |||||||| |||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39211969 aagggggagctttggcgcaatgt--aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaag 39212066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 323
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452943
Alignment:
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 30452943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46170038 - 46169988
Alignment:
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46170038 aataaaccaaatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctt 46169988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50625072 - 50624958
Alignment:
Q  215 agtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||| |||||| |  |||||| || | |||||||||    
T  50625072 agtcctagaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagcttt 50624973  T
Q  314 -gtgcaccgggctgc 327  Q
     ||||||||||||||    
T  50624972 agtgcaccgggctgc 50624958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Original strand, 35417996 - 35418056
Alignment:
Q  268 ccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  35417996 ccaaatggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcgggctgc 35418056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45416986 - 45416939
Alignment:
Q  280 accccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45416986 accccttcccggaccctgcgtatgcagaagctttgtgcaccgggctgc 45416939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 308
Target Start/End: Original strand, 26292421 - 26292462
Alignment:
Q  267 accaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26292421 accaaatgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcggga 26292462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Original strand, 26782364 - 26782441
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||| ||||   |||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  26782364 ggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaa 26782441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904906
Alignment:
Q  216 gtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacccc 284  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc 31904906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43956639 - 43956606
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgt 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43956639 agggggaaccttggcgcaacggtaaagttgttgt 43956606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33075983 - 33075931
Alignment:
Q  169 cgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctg 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||    
T  33075983 cgcaacggtaaaattgttgtcatgtgattgagaggtcacatgttcaaatcctg 33075931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52428582 - 52428526
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacccc 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  52428582 cctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtggaacccc 52428526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 44530112 - 44530275
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  44530112 ccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 44530211  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44530212 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 44530275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12670420 - 12670259
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  12670420 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 12670323  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12670322 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 12670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 35261642 - 35261805
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35261642 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgta 35261741  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35261742 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 35261805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28817798 - 28817646
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28817798 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 28817699  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28817698 caatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 28817646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 36720759 - 36720911
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36720759 ccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 36720858  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  36720859 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagcttt 36720911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44781686 - 44781524
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44781686 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaag 44781587  T
Q  254 gttg-ctacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||  ||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44781586 gctgtgtacaatacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 44781524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7136701 - 7136536
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  7136701 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgta 7136602  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7136601 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 7136536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30454267 - 30454106
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||    
T  30454267 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggtaaggctgcgta 30454170  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30454169 cgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 30454106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39461168 - 39461003
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  39461168 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggctgcgta 39461069  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39461068 caatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 39461003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 6760786 - 6760950
Alignment:
Q  164 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg-ttgctac 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  6760786 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcttcgtac 6760885  T
Q  262 aatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6760886 aatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 6760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8897923 - 8897784
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  8897923 ggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacaccaaat 8897824  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8897823 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 8897784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 312
Target Start/End: Original strand, 13160669 - 13160815
Alignment:
Q  167 ggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaat 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  13160669 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaat 13160767  T
Q  265 ataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13160768 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 13160815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365071
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgcta-caatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccg 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttgtgcaccg 24365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5135413 - 5135295
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  5135413 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagga 5135314  T
Q  309 gctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5135313 gctttgtgcaccgggctgc 5135295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 17823540 - 17823702
Alignment:
Q  164 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||     
T  17823540 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataagactgcgtaa 17823639  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17823640 aatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccggg 17823702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 25250485 - 25250650
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||| ||    
T  25250485 ccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggctgcgta 25250584  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25250585 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccggg 25250650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29521857 - 29521689
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  29521857 ccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaaggctgcgta 29521758  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgct 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29521757 caatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgct 29521689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8484112 - 8483958
Alignment:
Q  160 gagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc- 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||  |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  8484112 gagccttggcgcaacggtaaagcggttgccacgtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcg 8484013  T
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8484012 tacaatacaccaattggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 8483958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18164930 - 18164769
Alignment:
Q  164 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  18164930 cttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggttgcgtac 18164832  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||| |||||| | || ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18164831 aatacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 18164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 2626482 - 2626636
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt---aaaaaacagggtaaggttgc 258  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||  |||    
T  2626482 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagggtaagactgc 2626581  T
Q  259 -tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2626582 gtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctt 2626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Original strand, 12625865 - 12626016
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaaa 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||   || ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  12625865 ggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaa 12625964  T
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12625965 tggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 12626016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20869668 - 20869523
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-cta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||  ||    
T  20869668 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgtgta 20869571  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc 310  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20869570 caatacaccaa--ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42083881 - 42083734
Alignment:
Q  152 tgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| |    
T  42083881 tgaagggagagccttggcgcaacggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggca 42083782  T
Q  252 aggttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctg 297  Q
    ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42083781 aggctgcgtacagtataccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctg 42083734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Original strand, 45071241 - 45071378
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  45071241 ggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 45071339  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  45071340 ggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctt 45071378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20284245 - 20284078
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggttgc- 258  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| |  |||||| ||||||||| |||     
T  20284245 ccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaaggctgcg 20284146  T
Q  259 tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  20284145 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccggg 20284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21070874 - 21070706
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt---aaaaaacagggtaaggttgc 258  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| |   |||||| ||||||||| |||    
T  21070874 ccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaaggctgc 21070775  T
Q  259 -tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21070774 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccggg 21070706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 26954108 - 26954250
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca-- 270  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||      
T  26954108 ggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 26954207  T
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  26954208 aatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagcttt 26954250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 327
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877224
Alignment:
Q  216 gtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc-ttt 313  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgtta 29877210  T
Q  314 gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||| ||||||    
T  29877211 gtgcaccaggctgc 29877224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Original strand, 22598128 - 22598267
Alignment:
Q  170 gcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg-ttgctacaatatac 268  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||    
T  22598128 gcaacggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacac 22598227  T
Q  269 caaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  22598228 caattggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga 22598267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14018149 - 14017989
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| |||   ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  14018149 aagggggagccttggcgcaacggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgag 14018050  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
      ||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  14018049 actgcgtacaatacactaaattggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagctt 14017989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Original strand, 28407378 - 28407518
Alignment:
Q  162 gccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcta 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||          
T  28407378 gccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaagg------ 28407470  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
          |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  28407471 -----caccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagcttt 28407518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44742699 - 44742527
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |  ||| |||   |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44742699 aagggggaaccttggtgcaacggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc-tttgtgcaccggg 323  Q
    | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||| |  |||||||||| || ||||||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggg 44742527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870051
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  314 -gtgcaccggg 323  Q
     ||||||||||    
T  20870041 agtgcaccggg 20870051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Original strand, 5689642 - 5689756
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  5689642 gttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtggga 5689741  T
Q  309 gcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||| |||||||||    
T  5689742 gctttagtgcaccgg 5689756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30962947 - 30962857
Alignment:
Q  160 gagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30962947 gagccttggcgcaacggaaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggt 30962857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Original strand, 389654 - 389770
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||||     
T  389654 gttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgaccctgcgtatgcga 389753  T
Q  307 gagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||||| |||||||||    
T  389754 gagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457285
Alignment:
Q  181 gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtggg 279  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||| ||||||| | |||||||| ||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaat-aggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagg 31457253  T
Q  280 accccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31457254 accccttcccaaaccctgcgtatgcgggagct 31457285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 288
Target Start/End: Original strand, 35105883 - 35106014
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  35105883 gaagggggagccttggcgcaa------agttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaa 35105976  T
Q  253 ggttgc-tacaatatacca-aatggtgggaccccttcc 288  Q
    || ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  35105977 ggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacctcttcc 35106014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 16225049 - 16225147
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16225049 cctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 16225147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 19729382 - 19729453
Alignment:
Q  241 aaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19729382 aaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagct 19729453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000262
Alignment:
Q  185 ttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccc 283  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||  |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggaccc 23000269  T
Q  284 cttcccg 290  Q
    |||||||    
T  23000268 cttcccg 23000262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 323
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102643
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccggg 26102643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17251002 - 17250895
Alignment:
Q  209 tgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcg 305  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||      
T  17251002 tgttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaa 17250903  T
Q  306 ggagcttt 313  Q
    ||||||||    
T  17250902 ggagcttt 17250895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11001110 - 11000955
Alignment:
Q  174 cggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || |  |||||| | ||| ||| |||||  ||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  11001110 cggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaa 11001011  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  11001010 atggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagcttcgtgcattgggctgc 11000955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 11748282 - 11748407
Alignment:
Q  182 ttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatac--caaatggtgg 278  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||   ||||||| |    
T  11748282 ttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaagacagcgtacaatatacaaaaaatggtag 11748381  T
Q  279 gaccccttcccgtaccctgcatatgc 304  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  11748382 gaccccttcccgaatcctgcatatgc 11748407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 10857858 - 10857955
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgct-acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10857858 cctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10857955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 24245414 - 24245477
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaa 225  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24245414 ccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 24245477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 323
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508036
Alignment:
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 27508036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918179
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaagg 36918179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 323
Target Start/End: Original strand, 16013528 - 16013582
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16013528 aaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccggg 16013582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Original strand, 43942354 - 43942417
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa--tggtgggaccccttccc 289  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  43942354 cctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttccc 43942417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1354927 - 1354766
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  1354927 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 1354830  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1354829 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 1354766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13905160 - 13904986
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13905160 gaagggggaaccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13905061  T
Q  253 ggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    || ||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  13905060 ggctgcatacaattcaccaaatggt-ggaccctttcccgaaccctgcgtatcacggagctttgtgcaccgggctgc 13904986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Original strand, 1346913 - 1347088
Alignment:
Q  149 aaatgaagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacag 247  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||  |||    
T  1346913 aaatggaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgtaaaa--cag 1347010  T
Q  248 ggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1347011 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 1347088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221923
Alignment:
Q  164 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  262 aatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt--gtgcaccggg 323  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccggg 12221923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29356009 - 29355864
Alignment:
Q  182 ttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatggtgg 278  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  29356009 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgg 29355910  T
Q  279 gaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29355909 gaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 29355864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2166570 - 2166419
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aa 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  2166570 gtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacaccaataa 2166471  T
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2166470 tggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccggg 2166419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2178203 - 2178052
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aa 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  2178203 gtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacaccaataa 2178104  T
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2178103 tggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccggg 2178052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7947552 - 7947391
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  7947552 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaag 7947453  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  7947452 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagcttt 7947391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 9161098 - 9161239
Alignment:
Q  174 cggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca-- 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | ||      
T  9161098 cggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagagtaaggctgcgtacaatacatcaat 9161196  T
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  9161197 aatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagcttt 9161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3815249 - 3815086
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||| |  || |||||||||||| | |||| |  ||| ||    
T  3815249 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacgactgcgta 3815150  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3815149 caatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccggg 3815086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 12889381 - 12889525
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||| |||    
T  12889381 aagggggagccttggcacaacggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaag 12889480  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccct 296  Q
    | ||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  12889481 gctgcatacaatacacctaaacgatgggacccctttccggaccct 12889525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240829
Alignment:
Q  185 ttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccc 283  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggaccc 23240874  T
Q  284 cttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||  | ||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23240873 cttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgc 23240829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 311
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007738
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgact--aaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgt--aaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaat 28007701  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    | |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  28007702 gctgggaccccttccc-taacctccatatgcggaagct 28007738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097284
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttg 314  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctag 26097275  T
Q  315 tgcaccggg 323  Q
    |||||||||    
T  26097276 tgcaccggg 26097284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 8409206 - 8409298
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||   |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  8409206 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 8409298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 287
Target Start/End: Original strand, 14553488 - 14553602
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaa- 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||  || |||| ||||||     
T  14553488 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaagg-tcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataatacaccaaaa 14553586  T
Q  273 -tggtgggaccccttc 287  Q
     |||||||||||||||    
T  14553587 ctggtgggaccccttc 14553602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14975252 - 14975099
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctac 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||           |    
T  14975252 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaagg-----------c 14975164  T
Q  262 aatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14975163 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccggg 14975099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 253
Target Start/End: Original strand, 20400630 - 20400721
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20400630 ccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaag 20400721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32728314 - 32728211
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaatg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||     
T  32728314 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatataccaaata 32728215  T
Q  275 gtgg 278  Q
    ||||    
T  32728214 gtgg 32728211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15866209 - 15866064
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctac 261  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| | |||| |||   |||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| | |||       
T  15866209 ccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaaagctgcgt- 15866111  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  15866110 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcggga 15866064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277213
Alignment:
Q  184 gttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaatggtgggacc 282  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  283 ccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||   || || | ||||||||||||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagcttt 18277213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Original strand, 19340858 - 19340956
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgctacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggct 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  19340858 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcaacaatacaccaaaatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagctttagtgcaacgggct 19340956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 24097557 - 24097692
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgct-acaatataccaaat 273  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||    
T  24097557 ggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttacaa----ccaaat 24097652  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  24097653 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagcttt 24097692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557849
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttg 314  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctag 25557840  T
Q  315 tgcaccggg 323  Q
    |||||||||    
T  25557841 tgcaccggg 25557849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 321
Target Start/End: Original strand, 33138844 - 33138957
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||| | |    
T  33138844 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtatgcagta 33138943  T
Q  309 gcttt-gtgcaccg 321  Q
    ||||| ||||||||    
T  33138944 gctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 24734598 - 24734678
Alignment:
Q  165 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24734598 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaa 24734678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 284
Target Start/End: Original strand, 1941818 - 1941941
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |   || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1941818 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 1941917  T
Q  261 caatataccaaatggtgggacccc 284  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1941918 caatacaccgaatggtgggacccc 1941941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Original strand, 11849015 - 11849159
Alignment:
Q  159 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg- 257  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |     |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  11849015 ggagccttagcgcaacggtaaagttattgtcacgtgactgaaatgtttg--gttcaagtccaggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgc 11849112  T
Q  258 ctacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatg 303  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  11849113 ccacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaactctgcgtatg 11849159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 254
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432395
Alignment:
Q  191 tgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagg 17432395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 286
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068182
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatatacc-aaatg 274  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||| |||||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttgga---aacctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaaaatg 32068170  T
Q  275 gtgggacccctt 286  Q
    ||||||||||||    
T  32068171 gtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23930283 - 23930138
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttc-aagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatg 274  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||  |||| ||||| |||||| |  ||| ||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| |||| |||    
T  23930283 taaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagata--gttgcgtacaatacaccagatg 23930186  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23930185 gtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccg 23930138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 32579437 - 32579540
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||||  | ||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32579437 gttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaat-acggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  309 gcttt 313  Q
    |||||    
T  32579536 gcttt 32579540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 323
Target Start/End: Original strand, 12892082 - 12892135
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12892082 aatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 12892135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Original strand, 22967149 - 22967287
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-------tacaatatacc 269  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||       ||||||| |||    
T  22967149 taaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgt-aaaaataggataaggctgcatacaaatacaatacacc 22967247  T
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  22967248 aaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 22967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23821244 - 23821106
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-------tacaatatacc 269  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||       ||||||| |||    
T  23821244 taaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaat-aggataaggctgcatacaaatacaatacacc 23821146  T
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  23821145 aaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 23821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 312
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267839
Alignment:
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctt 13267839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Original strand, 6024209 - 6024338
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--a 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||   ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||  |    
T  6024209 ggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaagactgcgtacaatacaccaata 6024308  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcata 301  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  6024309 atgatgggacctcttcccggaccccgcata 6024338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4136670 - 4136593
Alignment:
Q  181 gttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc 258  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||  |||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4136670 gttgttgccacgtgactaaaatgtcacgggttcaagtcctaaaaacaacatcttgtgtaaaatacagggtaaggttgc 4136593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 323
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808521
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccggg 6808521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10734965 - 10734910
Alignment:
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  10734965 tggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgc 10734910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33923000 - 33922937
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaa 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  33923000 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaa 33922937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 323
Target Start/End: Original strand, 12885985 - 12886039
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  12885985 aaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggg 12886039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 383834 - 383781
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  383834 tacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagctt 383781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 313
Target Start/End: Original strand, 11395836 - 11395876
Alignment:
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11395836 tggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 11395876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8455488 - 8455325
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  8455488 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcgta 8455389  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  8455388 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccggg 8455325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4516529 - 4516356
Alignment:
Q  156 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || |     
T  4516529 gggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgc 4516430  T
Q  256 tgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  4516429 tgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgc 4516356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21377243 - 21377079
Alignment:
Q  164 cttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg-ttgctaca 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  21377243 cttggagcaacggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtaca 21377144  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21377143 atgcaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagctttgtgcaccgagctgc 21377079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21779431 - 21779270
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  21779431 ccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggttgcgta 21779334  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21779333 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 21779270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 323
Target Start/End: Original strand, 10543652 - 10543826
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  10543652 aaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 10543751  T
Q  253 ggttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    || ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10543752 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10543826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 14530281 - 14530446
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| | | ||    
T  14530281 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctacgta 14530380  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14530381 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 14530446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32781468 - 32781296
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||| ||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32781468 aagggggaaccttggcgcaatggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggct 325  Q
      ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32781368 actgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagctttgtgcaccaggct 32781296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Original strand, 17667978 - 17668128
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17667978 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 17668077  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  17668078 ggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccggg 17668128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17380416 - 17380245
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  17380416 aagggggagccttggcgcaatggcgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaag 17380318  T
Q  254 gttg-ctacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggct 325  Q
    ||||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17380317 gttgtgtgcaatacaccaaatgatggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggagctttgtgcaccgggct 17380245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 9671143 - 9671305
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  9671143 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgt 9671240  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9671241 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 9671305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12024090 - 12023954
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  12024090 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgta 12023992  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgc 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12023991 caatacaccaaatggtgggaccccctcccggaccctgc 12023954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 327
Target Start/End: Original strand, 44643485 - 44643653
Alignment:
Q  162 gccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||  || ||||||||| |||||| ||| |    
T  44643485 gccttggcgcaatggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgt 44643584  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag-ctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44643585 acaatgtaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgc 44643653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 322
Target Start/End: Original strand, 11514399 - 11514560
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||    
T  11514399 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaaggctgcgta 11514498  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11514499 caatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 11514560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 17896222 - 17896375
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggttgc-t 259  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  17896222 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgt 17896321  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  17896322 acaatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagcttt 17896375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 323
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546289
Alignment:
Q  190 atgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttc 287  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  288 ccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10546289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25079890 - 25079726
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  25079890 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggatgcgt 25079791  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  25079790 acaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccggg 25079726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24200784 - 24200632
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc--aa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||    
T  24200784 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 24200685  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| | ||||||| ||||||||||    
T  24200684 atggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccggg 24200632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Original strand, 33795258 - 33795414
Alignment:
Q  172 aacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatac-c 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  33795258 aacggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa-atacac 33795356  T
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
      ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33795357 ctatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagctttgtgcacctggctgc 33795414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 99450 - 99285
Alignment:
Q  147 tcaaatgaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaaca 246  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||    
T  99450 tcaaaagaaaggggagccttggcgcaacagtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctct--tgtaaaaaaca 99353  T
Q  247 gggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
     || |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||    
T  99352 tggcaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagcttt 99285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 23397729 - 23397890
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||| | | ||    
T  23397729 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggctacgta 23397826  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  23397827 caatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggg 23397890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 288
Target Start/End: Original strand, 5450245 - 5450376
Alignment:
Q  159 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttg 257  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  5450245 ggagccttggtgcagcgttaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctg 5450344  T
Q  258 c-tacaatataccaaatggtgggaccccttcc 288  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5450345 cgtacaatacaccaaagggtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 17623540 - 17623679
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17623540 ggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 17623639  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| || ||||||    
T  17623640 ggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagcttt 17623679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25249909 - 25249747
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  25249909 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaa-cagggtaaggctgcgta 25249811  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  25249810 caatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccggg 25249747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44521552 - 44521393
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||  |||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  44521552 agggggagccttggcggaacggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 44521453  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
     ||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  44521452 ctgcatataatacaccaaatggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttt 44521393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 321
Target Start/End: Original strand, 5841006 - 5841154
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aat 273  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||  |||    
T  5841006 taaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggatgcgtacaatacatcaataat 5841105  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5841106 ggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 5841154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19977886 - 19977734
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  19977886 ccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataaggttgcgta 19977787  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  19977786 caatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagcttt 19977734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39914465 - 39914326
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaa 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||    
T  39914465 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaatacaccgaa 39914366  T
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  39914365 tggtgggaccccttcctg-accctgcgtatgcgggagcttt 39914326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29420069 - 29419970
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29420069 aagggggagtcttggtccaacggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 29419970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26684781 - 26684640
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaaga-acctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggttgc-tacaatataccaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  26684781 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggtaaggctgcgtacaatatactaa 26684682  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26684681 atggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 26684640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 14444740 - 14444843
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14444740 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 14444838  T
Q  309 gcttt 313  Q
    |||||    
T  14444839 gcttt 14444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 297
Target Start/End: Original strand, 22371020 - 22371153
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   || ||||  |||||||||||||||| | |||| |||   ||||||||||||||| ||| ||    
T  22371020 ccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacagggtaaggctgcgta 22371116  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctg 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22371117 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 22371153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40417030 - 40416880
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| |    
T  40417030 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaatt 40416931  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    | |||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40416930 gatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccggg 40416880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158459
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa--t 273  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttt 31158459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31821518 - 31821363
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||| ||||  ||||||||| | |||| | ||   ||||||||||| ||||||||    
T  31821518 aagggggagccttggcgcaacggtatagttgtt---atgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccg--tgtgtaaaaaatagggtaag 31821424  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||    
T  31821423 gttgtgtacaatacaccaaatgatgggacccctttccgaaacctgtgtatgcgggagcttt 31821363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15296590 - 15296425
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatg--ttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggt 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || |||| |||  ||  ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  15296590 gaagggggagccttggcggaacggtaaagttgttgttacatggctgaaagatcatgtgggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggt 15296491  T
Q  251 aaggttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttg 314  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||| |||| || |||||||    
T  15296490 aaggctgcgtacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtggaagctttg 15296425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 313
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641616
Alignment:
Q  184 gttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacc 282  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | | | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaa-cagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggacc 25641585  T
Q  283 ccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  25641586 ccttcccgaatcctgcgtatgcgagagcttt 25641616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871617
Alignment:
Q  215 agtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagcttt 36871606  T
Q  314 -gtgcaccggg 323  Q
     ||||||||||    
T  36871607 agtgcaccggg 36871617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 253
Target Start/End: Original strand, 44604832 - 44604907
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44604832 taaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23145874 - 23145736
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggtt 256  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||| |||| ||||  ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  23145874 ggggagccttggcgta-cggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggct 23145776  T
Q  257 gc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccc 295  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23145775 gcgtacaatacaccaattggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23557664 - 23557526
Alignment:
Q  157 ggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggtt 256  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||| |||| ||||  ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  23557664 ggggagccttggcgta-cggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggct 23557566  T
Q  257 gc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccc 295  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23557565 gcgtacaatacaccaattggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762243
Alignment:
Q  219 ctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtg 316  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  317 caccggg 323  Q
    |||||||    
T  40762249 caccggg 40762243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 313
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615108
Alignment:
Q  188 tcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatggtgggacccc 284  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  285 ttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagcttt 19615108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859998
Alignment:
Q  164 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tac 261  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| | ||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||| || ||| |||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaa-catggta-ggctgcgtac 24860060  T
Q  262 aatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24860059 aatacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 24859998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 17705458 - 17705550
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17705458 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaagg 17705550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 27573584 - 27573735
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||| || || | |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||    
T  27573584 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgcgta 27573682  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||  |||| |||||||||    
T  27573683 caatacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagcttt 27573735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 14544026 - 14544181
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgta-aaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || || || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |    
T  14544026 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaagactgcgt 14544125  T
Q  260 acaatatacc---aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
     ||||| |||   ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  14544126 gcaata-accaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagcttt 14544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 313
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826150
Alignment:
Q  214 aagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtggaaccc-ttcccagaccctacatatgcgggagctt 30826149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 35010501 - 35010545
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgact 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35010501 gaagggggagccttggtgcaacggtaaagttgttgtcatgtgact 35010545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 35017771 - 35017815
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgact 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017771 gaagagggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgact 35017815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Original strand, 7214510 - 7214589
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  7214510 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaagg 7214589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890526
Alignment:
Q  239 aaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagcttt 24890526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632635
Alignment:
Q  234 tgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccggg 25632635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 312
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409976
Alignment:
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctt 41409976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 328
Target Start/End: Original strand, 23488555 - 23488614
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgct 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  23488555 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgct 23488614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 323
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080227
Alignment:
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccggg 34080227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 311
Target Start/End: Original strand, 4794869 - 4794915
Alignment:
Q  265 ataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4794869 ataccaaatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagct 4794915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13245210 - 13245115
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  13245210 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt---------ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatacggga 13245120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 313
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766370
Alignment:
Q  273 tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 34766370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579758
Alignment:
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccggg 40579758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30864536 - 30864438
Alignment:
Q  214 aagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || || |||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  30864536 aagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaagggtgcgtacaatataccaaatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaagctt 30864438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 313
Target Start/End: Original strand, 1289095 - 1289137
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  1289095 aatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttt 1289137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 322
Target Start/End: Original strand, 17471553 - 17471675
Alignment:
Q  204 tcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcat 300  Q
    ||||| |||||||||   |||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||| |    
T  17471553 tcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctgaccctgcct 17471652  T
Q  301 atgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  17471653 atgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Original strand, 31523300 - 31523346
Alignment:
Q  267 accaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31523300 accaaatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagcttt 31523346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 38879544 - 38879709
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  38879544 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcgta 38879643  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38879644 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 38879709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 209107 - 208935
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  209107 aagggggagccttggcgcagcggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaag 209009  T
Q  254 gttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggc 324  Q
    | ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||    
T  209008 gctgcattcaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccgggc 208935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 24448853 - 24449016
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  24448853 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgta 24448952  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  24448953 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 24449016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 41014282 - 41014444
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  41014282 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgta 41014380  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41014381 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 41014444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4619278 - 4619113
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4619278 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 4619179  T
Q  261 caatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4619178 caatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccggg 4619113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 27328728 - 27328869
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--a 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |    
T  27328728 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaata 27328827  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27328828 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 27328869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19143117 - 19142967
Alignment:
Q  159 ggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19143117 ggagccttggcgcaatggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgc 19143019  T
Q  259 -tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19143018 gtacagtacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggag 19142967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 325
Target Start/End: Original strand, 39301077 - 39301251
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39301077 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaa 39301176  T
Q  253 ggttgc-tacaatatacc-aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggct 325  Q
    || ||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| || ||||||||||||    
T  39301177 ggatgcgtataatgcaccaaaaaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggagtttagtgcaccgggct 39301251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8170154 - 8170008
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  8170154 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 8170057  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8170056 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 8170008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 43574552 - 43574721
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacat---------gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa 244  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||| |         |||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  43574552 aaggggtagccttggcgcaatgataaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacttcggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaa 43574651  T
Q  245 cagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43574652 cagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 43574721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703548
Alignment:
Q  186 tgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacccc 284  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc 32703508  T
Q  285 ttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32703509 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 32703548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 1565394 - 1565557
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||   ||||| ||| |    
T  1565394 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatattaaggctgcgt 1565493  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccggg 323  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1565494 acaatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttagtgcaccggg 1565557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 43334165 - 43334330
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  43334165 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgt 43334264  T
Q  260 acaatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43334265 acaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgc-gatgcgggagctttagtgcaccggg 43334330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 35710276 - 35710437
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||| ||| |     
T  35710276 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggctgcgtt 35710373  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35710374 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 35710437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323719
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatgg 275  Q
    |||||||||| || ||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||  |||||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  276 tgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcac 319  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagctttgtgcac 24323719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360343
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatgg 275  Q
    |||||||||| || ||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||  |||||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  276 tgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcac 319  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagctttgtgcac 24360343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405300
Alignment:
Q  182 ttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtggga 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  281 ccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggagct 1405300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 23974744 - 23974835
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23974744 ccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggtaagg 23974835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34074737 - 34074568
Alignment:
Q  158 gggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg 257  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34074737 gggagccttggcgcagcagtaa-gttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttg 34074639  T
Q  258 c-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgct 328  Q
    | | ||||| |||||||||  || |||||||||  ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  34074638 cgttcaatacaccaaatggcagggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagc-tagtgcaccgggctgct 34074568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13801893 - 13801776
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgg 306  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  13801893 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcga 13801794  T
Q  307 gagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  13801793 gagctttagtgcaccggg 13801776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 22600430 - 22600569
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| | ||  |||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  22600430 ggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 22600529  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22600530 ggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 22600569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7097864 - 7097780
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7097864 cctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 7097780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 323
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368522
Alignment:
Q  214 aagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct- 311  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctc 7368510  T
Q  312 ttgtgcaccggg 323  Q
    | ||||||||||    
T  7368511 tagtgcaccggg 7368522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12006485 - 12006339
Alignment:
Q  179 aagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatg-ttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atg 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||  |||    
T  12006485 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatacaatacaccaataatg 12006387  T
Q  275 gtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12006386 gtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccg 12006339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16880752 - 16880656
Alignment:
Q  229 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16880752 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 16880656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 2838732 - 2838890
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggta 251  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||  | |||||||   |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  2838732 aaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaa-cagggta 2838830  T
Q  252 aggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagc 310  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||    
T  2838831 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  183 tgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggac 281  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggac 1850722  T
Q  282 cccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    | ||||| | |||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  1850723 cacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10634326 - 10634226
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  10634326 aaggaggagccttggcgcaacggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaag 10634227  T
Q  254 g 254  Q
    |    
T  10634226 g 10634226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28516596 - 28516453
Alignment:
Q  172 aacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatata-cc 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| | |     
T  28516596 aacggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatca 28516497  T
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  28516496 aaatggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagcttt 28516453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135720
Alignment:
Q  218 cctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctt 312  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagctt 20135720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 323
Target Start/End: Original strand, 16957375 - 16957440
Alignment:
Q  259 tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16957375 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 16957440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24903875 - 24903702
Alignment:
Q  155 agggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||   |  ||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||     
T  24903875 agggggagctttgacacaacggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaga 24903776  T
Q  255 ttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctg 326  Q
    |||  ||||||  ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  24903775 ttgtgtacaatccaccaattggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgcaccgggctg 24903702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37024726 - 37024636
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37024726 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagg 37024636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154823
Alignment:
Q  245 cagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccggg 34154823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39079947 - 39079875
Alignment:
Q  153 gaagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaa 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  39079947 gaagggtgagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 39079875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 289
Target Start/End: Original strand, 41425959 - 41426039
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttccc 289  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41425959 gttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttccc 41426039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 327
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334526
Alignment:
Q  219 ctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca-aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gt 315  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||  |    
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaat 29334514  T
Q  316 gcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||||    
T  29334515 gcaccgggctgc 29334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Original strand, 3771296 - 3771469
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| || ||| |  ||   |||||||||| ||||||||    
T  3771296 aagggggagcattggcgcaacagtaatgttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtct---gtgtaaaaaaacagggtaa 3771392  T
Q  253 ggttgcta-caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    || ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3771393 ggctgtgaacaatacaccaattggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgc 3771469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575665
Alignment:
Q  217 tcctggaaagaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa-tggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  314 -gtgcaccgggctgc 327  Q
     ||||||||||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgc 12575665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 254
Target Start/End: Original strand, 22025505 - 22025598
Alignment:
Q  158 gggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   | | |||| |||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22025505 gggagccttggtgcaacggtaaagttgtt---acgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 22025598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22908037 - 22907913
Alignment:
Q  158 gggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg 257  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||   |||||||| |||| |||   ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22908037 gggagctttggggcaacagtaaagttgtt---atgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttg 22907942  T
Q  258 c-tacaatataccaaatggtgggacccct 285  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22907941 catacaatacaccaaatggtgggacccct 22907913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924895
Alignment:
Q  191 tgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaa 272  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaa 42924895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22861823 - 22861691
Alignment:
Q  177 taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgct-acaatataccaaatgg 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||| |||  |  ||||||||||||| |    |||||  |||| |||||| | |||||||    
T  22861823 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaa---gtaagactgctcacaatacatcaaatgg 22861727  T
Q  276 tgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22861726 tgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagct 22861691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 323
Target Start/End: Original strand, 30006290 - 30006451
Alignment:
Q  165 ttggcgcaacgg-taaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttg-ctaca 262  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| | ||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||  ||||    
T  30006290 ttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgtgtaca 30006389  T
Q  263 atataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
     || || |||||||||||||||||||||   |||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  30006390 ttacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccggg 30006451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 246
Target Start/End: Original strand, 22187262 - 22187332
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaaca 246  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22187262 gtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 22187332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 322
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622585
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 25622585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10306537 - 10306494
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10306537 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 10306494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24313739 - 24313616
Alignment:
Q  170 gcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaa-cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatata 267  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||||||||| |||||| || || ||| |||| |||||| | ||||||||| | ||||| |    
T  24313739 gcaacgataaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaataca 24313640  T
Q  268 cc-aaatggtgggaccccttcccg 290  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24313639 ccaaaatggtgggaccccttcccg 24313616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24356076 - 24355953
Alignment:
Q  170 gcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaa-cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatata 267  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||||||||| |||||| || || ||| |||| |||||| | ||||||||| | ||||| |    
T  24356076 gcaacgataaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaataca 24355977  T
Q  268 cc-aaatggtgggaccccttcccg 290  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24355976 ccaaaatggtgggaccccttcccg 24355953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028633
Alignment:
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 16028633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4654478 - 4654435
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4654478 aaatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagcttt 4654435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10943900 - 10943850
Alignment:
Q  277 gggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10943900 gggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgc 10943850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21542532 - 21542489
Alignment:
Q  268 ccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  21542532 ccaaatggtgggaccccttcccggactctgcgtatgcgggagct 21542489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11657762 - 11657704
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || |||||||||||    
T  11657762 aaatggtgggaccccttcccgaaccctgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgc 11657704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Original strand, 13774927 - 13774993
Alignment:
Q  260 acaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccgggct 325  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13774927 acaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggct 13774993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30877623 - 30877573
Alignment:
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  30877623 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccggg 30877573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Original strand, 31299595 - 31299669
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgt 236  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  31299595 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgt 31299669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 207
Target Start/End: Original strand, 19438712 - 19438757
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcac 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19438712 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaagatcac 19438757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31694277 - 31694132
Alignment:
Q  165 ttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaa 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || ||| | ||||||||| || ||| |  | || |||||||||| ||| ||| | ||| |||||    
T  31694277 ttggcgcaacagtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaa 31694178  T
Q  264 tataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggag 309  Q
    || ||| | || |||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  31694177 tacacctattgatgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggag 31694132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15173867 - 15173823
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgacta 198  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  15173867 aagggtgagccttggagcgacggtaaagttgttgtcacgtgacta 15173823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21784395 - 21784343
Alignment:
Q  270 aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccg 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  21784395 aaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccg 21784343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Original strand, 30542 - 30703
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| || ||| ||    
T  30542 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtagggctgcgta 30639  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30640 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 30703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 10773 - 10925
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |     
T  10773 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtc 10872  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10873 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 10925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13195 - 13033
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||    
T  13195 ccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 13097  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccggg 323  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13096 caatacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccggg 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 10072
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||    
T  10220 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagactgcgta 10123  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10122 caatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagct 10072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20548 - 20400
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||    
T  20548 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagactgcgta 20451  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20450 caatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagct 20400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 8908 - 8964
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtc 218  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  8908 ccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 19236 - 19292
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtc 218  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  19236 ccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1744 - 1607
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  1744 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcatacaatacaccaaat 1647  T
Q  274 ggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  1646 gatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagcttt 1607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 11095 - 11242
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgct-a 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||  ||||| |||| |    
T  11095 ccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaag--taaggctgctta 11191  T
Q  261 caatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11192 caatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagct 11242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 318
Target Start/End: Original strand, 23558 - 23719
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||   ||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23558 aagggagagccttggcgcaacggtaaagttgt----atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgag 23653  T
Q  254 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgca 318  Q
    | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  23654 gctgcgtacaatgtagcaaatggtgggaccccttcccagaccttgagtatgtgggagctttgtgca 23719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 58940 - 59094
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-ta 260  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||    
T  58940 ccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgta 59039  T
Q  261 caatatacc--aaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  59040 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagcttt 59094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 296
Target Start/End: Original strand, 4134 - 4258
Alignment:
Q  176 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacc---aa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||   ||    
T  4134 gtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacaccaataa 4233  T
Q  272 atggtgggaccccttcccgtaccct 296  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  4234 ttggtgggaccccttcccggaccct 4258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48756 - 48643
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggga 308  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48756 gttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 48659  T
Q  309 gct-ttgtgcaccggg 323  Q
    ||| | ||||||||||    
T  48658 gctctagtgcaccggg 48643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 226578 - 226456
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggttgc-t 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||| ||| |    
T  226578 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggctgcat 226479  T
Q  260 acaatataccaaatggtgggacc 282  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  226478 acaatacatcaaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24155
Alignment:
Q  247 gggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagct 311  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 24155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 72992 - 72887
Alignment:
Q  210 gttcaagtcctggaaagaac-ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcggg 307  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  72992 gttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcctacaatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcggg 72893  T
Q  308 agcttt 313  Q
    ||||||    
T  72892 agcttt 72887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 321
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3668
Alignment:
Q  215 agtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagcttt 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 3659  T
Q  314 -gtgcaccg 321  Q
     ||||||||    
T  3660 agtgcaccg 3668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 8867 - 8935
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8867 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Original strand, 32885 - 32984
Alignment:
Q  154 aagggggagccttggcgcaacggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 253  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||| |||   ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  32885 aagggggagctttggtacaacggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaag 32984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35167 - 35062
Alignment:
Q  185 ttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggttgc-tacaatataccaaatggtgggacc 282  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||| ||| |  |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35167 ttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 35068  T
Q  283 ccttcc 288  Q
    | ||||    
T  35067 ctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 83838 - 83901
Alignment:
Q  163 ccttggcgcaacg-gtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaa 225  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  83838 ccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 83901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 58691 - 58635
Alignment:
Q  271 aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctttgtgcaccgggctgc 327  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  58691 aatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggagctctgtgcaccaggctgc 58635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 43105 - 43173
Alignment:
Q  175 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagctcacatgttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaa 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  43105 ggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University