View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15487_low_3 (Length: 444)

Name: NF15487_low_3
Description: NF15487
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15487_low_3
NF15487_low_3
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (1-434)||(31285193-31285626)
chr6 (1-426)||(26623905-26624330)
chr6 (1-426)||(26729882-26730307)
chr6 (4-434)||(27679587-27680017)
chr6 (4-426)||(26803083-26803505)
chr6 (4-434)||(27697701-27698131)
chr6 (5-404)||(27705549-27705948)
chr6 (6-434)||(27426727-27427155)
chr6 (12-434)||(26647124-26647546)
chr6 (12-434)||(26753092-26753514)
chr6 (12-434)||(26656610-26657032)
chr6 (12-434)||(26762581-26763003)
chr6 (14-434)||(27337210-27337630)
chr6 (14-434)||(27397950-27398370)
chr6 (5-434)||(27717614-27718043)
chr6 (12-426)||(26884715-26885129)
chr6 (4-426)||(28786875-28787297)
chr6 (4-426)||(28792996-28793418)
chr6 (5-434)||(27610235-27610664)
chr6 (4-414)||(27530436-27530846)
chr6 (4-434)||(27592136-27592566)
chr6 (17-434)||(26862230-26862647)
chr6 (17-434)||(25483709-25484126)
chr6 (7-426)||(28781741-28782160)
chr6 (8-434)||(25539184-25539610)
chr6 (12-426)||(26143513-26143927)
chr6 (5-434)||(27676735-27677164)
chr6 (17-426)||(25580372-25580781)
chr6 (4-426)||(27603827-27604249)
chr6 (17-434)||(26056572-26056989)
chr6 (17-434)||(26076542-26076959)
chr6 (12-424)||(25492444-25492856)
chr6 (12-414)||(26824464-26824866)
chr6 (120-434)||(25511645-25511959)
chr6 (46-434)||(27215131-27215519)
chr6 (108-366)||(28140276-28140534)
chr6 (108-411)||(29826727-29827030)
chr6 (108-369)||(29843162-29843428)
chr6 (128-204)||(26937790-26937866)
chr6 (333-414)||(28326444-28326525)
chr6 (333-414)||(28504080-28504161)
chr6 (135-223)||(28227720-28227808)
chr6 (135-223)||(28243563-28243651)
chr6 (119-285)||(26724320-26724486)
chr6 (137-223)||(28186163-28186249)
chr6 (237-369)||(25074737-25074869)
chr6 (17-69)||(25511588-25511640)
chr6 (135-223)||(28235333-28235421)
chr6 (334-370)||(28490735-28490771)
chr6 (334-370)||(29803145-29803181)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (4-428)||(267461-267885)
chr1 (7-434)||(28126790-28127217)
chr1 (48-426)||(28163499-28163876)
chr1 (119-369)||(26136640-26136890)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (2-434)||(29272953-29273385)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (6-434)||(60208-60636)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (6-434)||(18074400-18074828)
chr4 (4-428)||(18698517-18698941)
chr4 (4-428)||(18678677-18679101)
chr4 (4-425)||(18730624-18731045)
chr4 (4-428)||(18723202-18723626)
chr4 (4-428)||(18654594-18655018)
chr4 (252-434)||(5090065-5090247)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (5-434)||(2654-3083)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (4-426)||(8124-8546)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (4-426)||(12798-13220)
scaffold0277 (4-426)||(3835-4257)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (128-366)||(16691628-16691866)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (135-223)||(28218-28306)
scaffold0038 (135-223)||(43725-43813)
scaffold0038 (135-223)||(35495-35583)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (126-328)||(3280418-3280620)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Original strand, 31285193 - 31285626
Alignment:
Q  1 tgtgcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31285193 tgtgcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatg 31285292  T
Q  101 gtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31285293 gtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatg 31285392  T
Q  201 atgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285393 atgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtga 31285492  T
Q  301 ggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggagga 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31285493 gggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggagga 31285592  T
Q  401 cttgattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31285593 cttgattggttcggccgtggaagcagagtcatca 31285626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 26623905 - 26624330
Alignment:
Q  1 tgtgcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatg 100  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||  ||||||||||| | | || || | |||||||| |||    
T  26623905 tgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatg 26624004  T
Q  101 gtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatg 200  Q
    || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26624005 gttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatg 26624104  T
Q  201 atgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtga 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26624105 atgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtga 26624204  T
Q  301 ggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggagga 400  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||     
T  26624205 gggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggaggg 26624304  T
Q  401 cttgattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  26624305 cttgattggttcggacgtggaagcag 26624330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 26729882 - 26730307
Alignment:
Q  1 tgtgcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatg 100  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||  ||||||||||| | | || || | |||||||| |||    
T  26729882 tgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatg 26729981  T
Q  101 gtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatg 200  Q
    || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26729982 gttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatg 26730081  T
Q  201 atgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtga 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26730082 atgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtga 26730181  T
Q  301 ggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggagga 400  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||     
T  26730182 gggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggaggg 26730281  T
Q  401 cttgattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  26730282 cttgattggttcggacgtggaagcag 26730307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 434
Target Start/End: Original strand, 27679587 - 27680017
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  || | |||||||| |||||     
T  27679587 gcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggtt 27679686  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  27679687 ggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatg 27679786  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679787 tgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgaggg 27679886  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27679887 aattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggactt 27679986  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27679987 gattggttcggatgtggaagcagagtcatca 27680017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 26803083 - 26803505
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| | || || | |||||||| |||||     
T  26803083 gcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggtt 26803182  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26803183 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatg 26803282  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||     
T  26803283 tgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggg 26803382  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||||| |    
T  26803383 gattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacct 26803482  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  26803483 gattggtttggccatggaagcag 26803505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27698131 - 27697701
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||||  ||||||||   |||||||||| | | || || | |||||||| |||||     
T  27698131 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggtt 27698032  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  27698031 ggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatg 27697932  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  27697931 tgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacgg 27697832  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||  | |||||||||||||||||     
T  27697831 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactc 27697732  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  27697731 gattggtttggtcctggaagcagagtcatca 27697701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27705948 - 27705549
Alignment:
Q  5 cccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtag 104  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| | || || | |||||||| ||||| |    
T  27705948 cccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttg 27705849  T
Q  105 gactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgt 204  Q
    || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27705848 gaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgt 27705749  T
Q  205 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaa 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||      
T  27705748 gagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgagggg 27705649  T
Q  305 attccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttg 404  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27705648 attccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgataggaagcaactgcatgctttggctgggggacttg 27705549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27427155 - 27426727
Alignment:
Q  6 ccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtagg 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | || || | |||||||| ||||| ||    
T  27427155 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 27427056  T
Q  106 actttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtg 205  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  27427055 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 27426956  T
Q  206 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaa 305  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||  || ||| ||  | || ||||||||||||   |||| ||||||| ||    
T  27426955 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 27426856  T
Q  306 ttccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttga 405  Q
    |  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27426855 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttga 27426756  T
Q  406 ttggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  27426755 ttggttcggtcctggaagccgagtcatca 27426727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 434
Target Start/End: Original strand, 26647124 - 26647546
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  26647124 atgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggacttta 26647223  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  26647224 tggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagag 26647323  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||  | || | |||||||| |  ||| || |||||| ||||||||    
T  26647324 aattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaa 26647423  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26647424 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggtt 26647523  T
Q  412 cggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||| | ||||||||||| |||||    
T  26647524 cggtcctggaagcagagtcatca 26647546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 434
Target Start/End: Original strand, 26753092 - 26753514
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  26753092 atgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggacttta 26753191  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  26753192 tggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagag 26753291  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||  | || | |||||||| |  ||| || |||||| ||||||||    
T  26753292 aattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaa 26753391  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26753392 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggtt 26753491  T
Q  412 cggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||| | ||||||||||| |||||    
T  26753492 cggtcctggaagcagagtcatca 26753514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 434
Target Start/End: Original strand, 26656610 - 26657032
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | | ||| | |||||||||||||||    
T  26656610 atgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggacttta 26656709  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||  |||| ||||||    
T  26656710 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagag 26656809  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||  || || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  26656810 aattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaa 26656909  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  26656910 tcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggtt 26657009  T
Q  412 cggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||  |||||||||||| |||||    
T  26657010 cggttgtggaagcagagtcatca 26657032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 434
Target Start/End: Original strand, 26762581 - 26763003
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | | ||| | |||||||||||||||    
T  26762581 atgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggacttta 26762680  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||  |||| ||||||    
T  26762681 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagag 26762780  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||  || || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  26762781 aattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaa 26762880  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  26762881 tcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggtt 26762980  T
Q  412 cggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||  |||||||||||| |||||    
T  26762981 cggttgtggaagcagagtcatca 26763003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27337630 - 27337210
Alignment:
Q  14 gttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27337630 gttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatg 27337531  T
Q  114 ggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaa 213  Q
    | |   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  27337530 gtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaa 27337431  T
Q  214 ttcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatc 313  Q
    |||||||   || |||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||  | || | |||||||||    |||||  ||||| ||||||||||    
T  27337430 ttcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatc 27337331  T
Q  314 attaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcg 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337330 attaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcg 27337231  T
Q  414 gccgtggaagcagagacatca 434  Q
    | | ||||||||||| |||||    
T  27337230 gtcctggaagcagagtcatca 27337210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27398370 - 27397950
Alignment:
Q  14 gttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27398370 gttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatg 27398271  T
Q  114 ggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaa 213  Q
    | |   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  27398270 gtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaa 27398171  T
Q  214 ttcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatc 313  Q
    |||||||   || |||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||  | || | |||||||||    |||||  ||||| ||||||||||    
T  27398170 ttcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatc 27398071  T
Q  314 attaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcg 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27398070 attaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcg 27397971  T
Q  414 gccgtggaagcagagacatca 434  Q
    | | ||||||||||| |||||    
T  27397970 gtcctggaagcagagtcatca 27397950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27718043 - 27717614
Alignment:
Q  5 cccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtag 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |   | || || | || |||||||||||||    
T  27718043 cccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 27717944  T
Q  105 gactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgt 204  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  ||||    
T  27717943 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27717844  T
Q  205 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaa 304  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||  || |||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||| |    ||||||||||| |    
T  27717843 gagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 27717744  T
Q  305 attccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttg 404  Q
    |||||    || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  27717743 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 27717644  T
Q  405 attggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27717643 attggttcggccgtggaagcaaagtcatca 27717614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 426
Target Start/End: Original strand, 26884715 - 26885129
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26884715 atgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaattta 26884814  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||  |  |||||||||| ||| | || || |||    
T  26884815 tggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcagggag 26884914  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||   |||||||||||| |||||||     
T  26884915 aattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccac 26885014  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    |||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26885015 tcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtt 26885114  T
Q  412 cggccgtggaagcag 426  Q
     || |||||||||||    
T  26885115 tggtcgtggaagcag 26885129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 28786875 - 28787297
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | | || || | || |||| |||||||    
T  28786875 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggta 28786974  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  28786975 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 28787074  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||  | || ||||||||||||    |||||||||||     
T  28787075 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 28787174  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || |||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  28787175 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 28787274  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28787275 gattggttcggccgtggaagcag 28787297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 28792996 - 28793418
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | | || || | || |||| |||||||    
T  28792996 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggta 28793095  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  28793096 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 28793195  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    ||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||  | || ||||||||||||    |||||||||||     
T  28793196 tgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 28793295  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  28793296 aattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 28793395  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28793396 gattggttcggccgtggaagcag 28793418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27610664 - 27610235
Alignment:
Q  5 cccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtag 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||| ||||||||| |||||||||| |   | || || | || |||||||||||||    
T  27610664 cccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 27610565  T
Q  105 gactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgt 204  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  ||||    
T  27610564 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27610465  T
Q  205 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaa 304  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||| |    ||||||||||| |    
T  27610464 gagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 27610365  T
Q  305 attccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttg 404  Q
    |||||    || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  27610364 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 27610265  T
Q  405 attggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27610264 attggttcggccgtggaagcaaagtcatca 27610235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27530846 - 27530436
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||  ||| ||||||| ||||||  || ||||||| |  || || || | | |||||||||||||    
T  27530846 gcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggta 27530747  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |  |||||||||||  |  |||    
T  27530746 ggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatg 27530647  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||    ||||||| |||     
T  27530646 tgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcaggg 27530547  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  | || |||||||||||||||    
T  27530546 aattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggaggactt 27530447  T
Q  404 gattggttcgg 414  Q
    |||||||||||    
T  27530446 gattggttcgg 27530436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27592566 - 27592136
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | | || || | |||||||| |||||     
T  27592566 gcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggtt 27592467  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  27592466 ggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 27592367  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| |||||| ||  | | |||||||||||||    |||||| || |     
T  27592366 tgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaagg 27592267  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    |||||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  27592266 aattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggactt 27592167  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  27592166 gattggttcggtcctggaagcagagtcatca 27592136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 26862230 - 26862647
Alignment:
Q  17 gccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatggga 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26862230 gccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggta 26862329  T
Q  117 taggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 216  Q
      |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  26862330 ctggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattc 26862429  T
Q  217 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcatt 316  Q
    | || | |||| |||||||||||||||  || |||| ||||| |||||| ||  |||| | ||||||||||   ||| |||||||| ||||||| | ||     
T  26862430 aactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttata 26862529  T
Q  317 aaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggcc 416  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | || || |||||||||||||||||||| || |    
T  26862530 aaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtc 26862629  T
Q  417 gtggaagcagagacatca 434  Q
     |||||| |||| |||||    
T  26862630 atggaagtagagtcatca 26862647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 25483709 - 25484126
Alignment:
Q  17 gccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatggga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |  | | ||||| |||||||||||||| ||| |    
T  25483709 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggta 25483808  T
Q  117 taggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25483809 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 25483908  T
Q  217 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcatt 316  Q
    |  | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| | ||  ||| ||   |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||     
T  25483909 aagtcataataacctgaaacatctccaaaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcata 25484008  T
Q  317 aaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggcc 416  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25484009 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25484108  T
Q  417 gtggaagcagagacatca 434  Q
     ||||||||||| |||||    
T  25484109 atggaagcagagtcatca 25484126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 426
Target Start/End: Original strand, 28781741 - 28782160
Alignment:
Q  7 cttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgat-aaggaaactaataaaggggtccacatggtagg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| | | |||| || |||   ||||||||    
T  28781741 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggata-tgataatggagtcaggatggtagg 28781839  T
Q  106 actttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtg 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||||    
T  28781840 actttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtg 28781939  T
Q  206 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaa 305  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||  | || ||||||||||||    ||||||||||| ||    
T  28781940 agagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaa 28782039  T
Q  306 ttccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttga 405  Q
    ||||    || |||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  28782040 ttccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggcaggaggacctga 28782139  T
Q  406 ttggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28782140 ttggttcggccgtggaagcag 28782160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 434
Target Start/End: Original strand, 25539184 - 25539610
Alignment:
Q  8 ttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggac 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  | |||| ||||||||||||||||||||||   ||   || |  | | ||||| |||||||||||    
T  25539184 ttatatgtggccaaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 25539283  T
Q  108 tttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgag 207  Q
    ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||    
T  25539284 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcag 25539383  T
Q  208 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaatt 307  Q
    ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||  ||| ||   |||||||||  |||||||||||| |||     
T  25539384 agagaattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaata 25539483  T
Q  308 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgatt 407  Q
     ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | || ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  25539484 acaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgatt 25539583  T
Q  408 ggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25539584 ggttcggtcctggaagcagagtcatca 25539610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 426
Target Start/End: Original strand, 26143513 - 26143927
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||| | ||   || |  | | ||||| ||||||||||||||     
T  26143513 atgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttt 26143612  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26143613 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 26143712  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    ||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||  |||| |   ||||||||   |||||||||||| |||| |||    
T  26143713 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaa 26143812  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26143813 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtt 26143912  T
Q  412 cggccgtggaagcag 426  Q
    ||| | |||||||||    
T  26143913 cggtcatggaagcag 26143927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27677164 - 27676735
Alignment:
Q  5 cccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtag 104  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| | | | || || | |||||||| ||||| |    
T  27677164 cccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttg 27677065  T
Q  105 gactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgt 204  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  ||||    
T  27677064 gaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27676965  T
Q  205 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaa 304  Q
    || ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| |||||| ||  | | |||||||||||||    |||||| || | |    
T  27676964 gaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaagga 27676865  T
Q  305 attccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttg 404  Q
    ||||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  | |||||||||||| |||| |    
T  27676864 attcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcg 27676765  T
Q  405 attggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  27676764 attggtttggtcctggaagcagagtcatca 27676735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 25580372 - 25580781
Alignment:
Q  17 gccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatggga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |  | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  25580372 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggta 25580471  T
Q  117 taggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  25580472 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttc 25580571  T
Q  217 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcatt 316  Q
    |  |   ||||||||||||||||||||  |  | |||||||| | || | ||  |||  |  |||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||    
T  25580572 aattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcatt 25580671  T
Q  317 aaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggcc 416  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25580672 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25580771  T
Q  417 gtggaagcag 426  Q
     |||||||||    
T  25580772 atggaagcag 25580781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27604249 - 27603827
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |   | || || | || ||||||||||||    
T  27604249 gcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggta 27604150  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  27604149 ggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 27604050  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  | | |||||||||||||    |||||||||||     
T  27604049 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 27603950  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    |||| |    || |||||||||||   |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||  | |||||||| |||| || |    
T  27603949 aatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaacct 27603850  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||| || | |||||||||    
T  27603849 gattggtttgggcttggaagcag 27603827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 26056572 - 26056989
Alignment:
Q  17 gccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatggga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || | || | ||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  26056572 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26056671  T
Q  117 taggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| | ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26056672 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26056771  T
Q  217 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcatt 316  Q
    | ||   || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||  ||| ||   | |||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||     
T  26056772 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattata 26056871  T
Q  317 aaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggcc 416  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26056872 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26056971  T
Q  417 gtggaagcagagacatca 434  Q
     ||||||||||| |||||    
T  26056972 ttggaagcagagtcatca 26056989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 26076542 - 26076959
Alignment:
Q  17 gccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatggga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || | || | ||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  26076542 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26076641  T
Q  117 taggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 216  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| | ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26076642 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26076741  T
Q  217 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcatt 316  Q
    | ||   || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||  ||| ||   | || ||||  |||||||||||| ||| ||||| ||     
T  26076742 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattata 26076841  T
Q  317 aaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggcc 416  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26076842 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26076941  T
Q  417 gtggaagcagagacatca 434  Q
     ||||||||||| |||||    
T  26076942 ttggaagcagagtcatca 26076959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25492856 - 25492444
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| | || |  | | | |||||||||||||||||||    
T  25492856 atgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggacttta 25492757  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
    ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||| |||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||    
T  25492756 tggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgagagag 25492657  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    |||||| ||  ||  ||||||||| ||||||| || || ||||||| |||||   || |||| || |||||||||     ||||||||||| |||| |||    
T  25492656 aattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaattgcaa 25492557  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    |||| ||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||  | | |||||||| |||||||||||||||    
T  25492556 tcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttggctgaaggacttgattggtt 25492457  T
Q  412 cggccgtggaagc 424  Q
    ||| |||||||||    
T  25492456 cggtcgtggaagc 25492444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Original strand, 26824464 - 26824866
Alignment:
Q  12 atgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggacttta 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| || || | | |||||| ||||||||||||||    
T  26824464 atgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggacttta 26824563  T
Q  112 tgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagag 211  Q
     || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||  | ||||| | ||| |||| ||||||| |  || ||||||||| |  | |||||||||    
T  26824564 cggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgagagag 26824663  T
Q  212 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaa 311  Q
    |||||||||||  ||  |||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    ||||||| | |  |||| ||    
T  26824664 aattcagctaagcatggcttggaaaatctccaagagcaactccttttaaaaacaattggagaagaaattaagttaggaggtgttagtcaaggtattcaaa 26824763  T
Q  312 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggtt 411  Q
    |||| || || || ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||  || | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26824764 tcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagcaactagatgctttggctggaggatttgattggtt 26824863  T
Q  412 cgg 414  Q
    |||    
T  26824864 cgg 26824866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 434
Target Start/End: Original strand, 25511645 - 25511959
Alignment:
Q  120 gaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagc 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| | ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  25511645 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaac 25511744  T
Q  220 taaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaag 319  Q
    |   || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||  ||| ||   | || ||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||    
T  25511745 tcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaag 25511844  T
Q  320 gaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtg 419  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || | || ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25511845 gaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctg 25511944  T
Q  420 gaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||| |||||    
T  25511945 gaagcagagtcatca 25511959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 434
Target Start/End: Original strand, 27215131 - 27215519
Alignment:
Q  46 aatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgca 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27215131 aatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgca 27215230  T
Q  146 agagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaag 245  Q
    | |||||| | ||||||  ||| |||||| ||||| || | || ||||||  | ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || || |    
T  27215231 aaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcagg 27215330  T
Q  246 agaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattct 345  Q
    | ||| ||||| |||||||  || |||| ||   ||||||||    |||||||||||  ||| |||  || ||  ||| |||||||  ||||||||||||    
T  27215331 aaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattct 27215430  T
Q  346 tttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |  | || ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||    
T  27215431 tttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatca 27215519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 366
Target Start/End: Original strand, 28140276 - 28140534
Alignment:
Q  108 tttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgag 207  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||  | || |||||||||||| |||||||    
T  28140276 tttatgggatgggagggtcgggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgag 28140375  T
Q  208 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaatt 307  Q
    ||| | |||||||||| ||  |||  || |||||||||| || |||||||  |||||| |||| |||    ||||||| |  ||||| ||||| | |||     
T  28140376 agaaatttcagctaaacatggcttagaagatctccaagaaaaactcctttctaaaacagttggtttgagcgttaagtttggacatgtaagtgaaggaata 28140475  T
Q  308 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttga 366  Q
    ||||| || |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28140476 ccaataataaaggaaaggctacgactaaagaaggttcttttgattctcgatgacgttga 28140534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 411
Target Start/End: Original strand, 29826727 - 29827030
Alignment:
Q  108 tttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgag 207  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |  |||||||| |||||||  | || ||||||||||||||  ||||    
T  29826727 tttatggaattggcggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgcttgtgttttcttcatgacttgag 29826826  T
Q  208 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaatt 307  Q
    ||| | |||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||| |||||| | |||| |||   ||||||  || | ||||    
T  29826827 agaaagttcagctaaacatggcttagaacatctccaacagaagcttctttccaaaacagttgaattggacactaagctaggagatgttaacgaaggaatt 29826926  T
Q  308 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgatt 407  Q
    ||||| || ||| |||||||| |  |||||||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||  ||| || | | | |||| |||||||||||||    
T  29826927 ccaataataaagcaaaggctaggacgaaagaaagtacttttgattcttgacgacgttgacaacatgaggcaattgcaagttatggcgggaggacttgatt 29827026  T
Q  408 ggtt 411  Q
    ||||    
T  29827027 ggtt 29827030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29843428 - 29843162
Alignment:
Q  108 tttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgag 207  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||  | || ||||||||||| || | |||    
T  29843428 tttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttcttcacgacgggag 29843329  T
Q  208 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaatt 307  Q
    ||| | |||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||  ||||| |||||| |||   |||||| ||| | ||||    
T  29843328 agaaagttcagctaaacatggcttagagcatctccaagagaagcttctttccaaaacagttgatttggacattaagctaggagatgttaatgaaggaatt 29843229  T
Q  308 ccaatcattaag-----gaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaa 369  Q
    ||||| || |||      |||||||| |  |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  29843228 ccaataataaagcaaattaaaggctaggacgaaagaaagttcttttgattcttgacgatgttgacaa 29843162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937866
Alignment:
Q  128 ggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataatgt 26937866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 414
Target Start/End: Original strand, 28326444 - 28326525
Alignment:
Q  333 gaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcgg 414  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |  |||| ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28326444 gaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcgg 28326525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 414
Target Start/End: Original strand, 28504080 - 28504161
Alignment:
Q  333 gaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcgg 414  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |  |||| ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28504080 gaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcgg 28504161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 28227720 - 28227808
Alignment:
Q  135 caacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| | |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  28227720 caacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgatgtaagggaaaattcagctaaa 28227808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 28243563 - 28243651
Alignment:
Q  135 caacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   | | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||    
T  28243563 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttcacgatgtaagggaaaattcaactaaa 28243651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 285
Target Start/End: Original strand, 26724320 - 26724486
Alignment:
Q  119 ggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcag 218  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |  ||||| | ||| ||||  ||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||     
T  26724320 ggaggattgggtaaaacgacacttactcgagcagtttatgatttgattgctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcaa 26724419  T
Q  219 ctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagtt 285  Q
     |||| ||  |||  || ||||||||||||||||||| |  |||  ||| ||||||||| |||||||    
T  26724420 ttaaatatggcttagaatatctccaagagaagctcctctccaaattaatcggattggaatttaagtt 26724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Original strand, 28186163 - 28186249
Alignment:
Q  137 acacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  28186163 acacttgcaagagcagtttataattccctagctgatcaatttgatgatttgtgttttcttcacgatgtaaggggaaattcagctaaa 28186249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 369
Target Start/End: Original strand, 25074737 - 25074869
Alignment:
Q  237 atctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaa 336  Q
    |||| |||||| |||| || || ||| |||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| ||| | |||||||||||| |||  ||||||||||  |||    
T  25074737 atcttcaagagcagcttctctttaaatcaatcggatttgaaactaagtttggacatgttaatgaaggaattccaatcataaagcgaaggctatgtcaaaa 25074836  T
Q  337 gaagattcttttgattctcgatgatgttgacaa 369  Q
    |||  || | ||||||||||||||  |||||||    
T  25074837 gaaagttttgttgattctcgatgacattgacaa 25074869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 25511588 - 25511640
Alignment:
Q  17 gccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttct 69  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  25511588 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 28235333 - 28235421
Alignment:
Q  135 caacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   | | ||||||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||| |||||    
T  28235333 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgacgtaagggaaaattcatctaaa 28235421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28490771 - 28490735
Alignment:
Q  334 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaat 370  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28490771 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaat 28490735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29803181 - 29803145
Alignment:
Q  334 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaat 370  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29803181 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaat 29803145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 267885 - 267461
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || || | |||||||||||||||||||||||||||| | | || || | |||||||| |||||     
T  267885 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggtt 267786  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  267785 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatg 267686  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  267685 tgagagaaaattcagctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggg 267586  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  267585 cattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggactt 267486  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagag 428  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  267485 gattggttcggctatggaagcagag 267461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28127217 - 28126790
Alignment:
Q  7 cttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtagga 106  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||  ||   | | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |  | || | | ||||||||||||||||    
T  28127217 cttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28127118  T
Q  107 ctttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtga 206  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||  | |||||||    
T  28127117 ctttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T
Q  207 gagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaat 306  Q
    |||||| |||| ||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||    
T  28127017 gagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28126918  T
Q  307 tccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgat 406  Q
    | ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | || ||  | |||||||||||||||||||||    
T  28126917 tgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgat 28126818  T
Q  407 tggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||    
T  28126817 tggttcggtcgtggaagcaaagtcatca 28126790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28163876 - 28163499
Alignment:
Q  48 tacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaag 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | || | | |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  28163876 tacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 28163777  T
Q  148 agcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagag 247  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||||| ||     
T  28163776 agcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaa 28163677  T
Q  248 aagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttt 347  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||    
T  28163676 gagctctttttg-aaacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttt 28163578  T
Q  348 tgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    ||||||| |||||||| |||||  || | || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28163577 tgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 28163499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 369
Target Start/End: Original strand, 26136640 - 26136890
Alignment:
Q  119 ggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcag 218  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |  ||||| | ||||||||  |||  ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| |||| |||||||    
T  26136640 ggaggattaggtaaaacaacacttactcgagcagtttataatttgattgcggatcaatttgaaggattgtgcttccttcacaatgtgcgagaaaattcag 26136739  T
Q  219 ctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaa 318  Q
     |||| ||  |||  || ||||||||||| ||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  26136740 ttaaatatggcttagaatatctccaagagcagctcctctccaaatcaatcggattggagattaagttaggacatgttagtaaaggaattccaatcataaa 26136839  T
Q  319 ggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaa 369  Q
     |||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  26136840 agaaaggctacatcaaaagaaaattttgttgattctcgatgacgttgacaa 26136890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29273385 - 29272953
Alignment:
Q  2 gtgcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatgg 101  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| || | |||||||||| |||| |||||||||||| | | || || | ||| |||| ||||    
T  29273385 gtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatgg 29273286  T
Q  102 taggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatga 201  Q
    | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  29273285 ttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatga 29273186  T
Q  202 tgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29273185 tgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgag 29273086  T
Q  302 gaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggac 401  Q
    |  |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  29273085 gggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggac 29272986  T
Q  402 ttgattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29272985 atgattggttcggccgtggaagcaaagtcatca 29272953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 434
Target Start/End: Original strand, 60208 - 60636
Alignment:
Q  6 ccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtagg 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | || || | |||||||| ||||| ||    
T  60208 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 60307  T
Q  106 actttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtg 205  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  60308 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 60407  T
Q  206 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaa 305  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||  || ||| ||  | || ||||||||||||   |||| ||||||| ||    
T  60408 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 60507  T
Q  306 ttccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttga 405  Q
    |  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  60508 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttga 60607  T
Q  406 ttggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  60608 ttggttcggtcctggaagccgagtcatca 60636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 434
Target Start/End: Original strand, 18074400 - 18074828
Alignment:
Q  6 ccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtagg 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | || || | |||||||| ||||| ||    
T  18074400 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 18074499  T
Q  106 actttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtg 205  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  18074500 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 18074599  T
Q  206 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaa 305  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||  || ||| ||  | || ||||||||||||   |||| ||||||| ||    
T  18074600 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 18074699  T
Q  306 ttccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttga 405  Q
    |  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18074700 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttga 18074799  T
Q  406 ttggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  18074800 ttggttcggtcctggaagccgagtcatca 18074828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18698941 - 18698517
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| | | || || | || |||| |||| ||    
T  18698941 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgtta 18698842  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  18698841 ggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18698742  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | | | || ||||||||||||    |||||||||||     
T  18698741 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18698642  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |    
T  18698641 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgt 18698542  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagag 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18698541 gattggttcggctgtggaagcagag 18698517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18679101 - 18678677
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |   | || || | || |||| |||||||    
T  18679101 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggta 18679002  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  18679001 ggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18678902  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||  | || ||||||||||||    |||||||||||     
T  18678901 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18678802  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| |    
T  18678801 aattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttggccggaggacgt 18678702  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagag 428  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  18678701 gattggttcggttgtggaagcagag 18678677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18731045 - 18730624
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||   || |||| |||| ||    
T  18731045 gcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgata 18730946  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  18730945 ggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18730846  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | | | || ||||||||||||    |||||||||||     
T  18730845 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18730746  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |    
T  18730745 aattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgt 18730646  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagca 425  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18730645 gattggttcggctgtggaagca 18730624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18723626 - 18723202
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||   || |||| |||| ||    
T  18723626 gcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgata 18723527  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  | |    
T  18723526 ggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacg 18723427  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||  | || ||||||| ||||    ||||||||||      
T  18723426 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagag 18723327  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  18723326 aattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacct 18723227  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagag 428  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  18723226 gattggttcggctctggaagcagag 18723202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18655018 - 18654594
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||   || |||| |||| ||    
T  18655018 gcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgata 18654919  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||| | ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  18654918 ggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18654819  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    ||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||  | || ||||||||||||    |||||||||||     
T  18654818 tgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18654719  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| |||||||||||||||||| |    
T  18654718 aattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgt 18654619  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcagag 428  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  18654618 gattggttcggttgtggaagcagag 18654594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5090247 - 5090065
Alignment:
Q  252 tccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgat 351  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |   || | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||    
T  5090247 tcctttttaaaacaattggattggaaattaggtttggagatatcagtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgat 5090148  T
Q  352 tctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    |||||||||| |||||||  |||| |||||  | | |||||| |||| || ||||||||| || | ||| ||||||| |||||    
T  5090147 tctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatca 5090065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2654
Alignment:
Q  5 cccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggtag 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |   | || || | || |||||||||||||    
T  3083 cccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 2984  T
Q  105 gactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgt 204  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  ||||    
T  2983 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 2884  T
Q  205 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaa 304  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||   | |||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||| |    ||||||||||| |    
T  2883 gagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 2784  T
Q  305 attccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggacttg 404  Q
    |||||    || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  2783 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 2684  T
Q  405 attggttcggccgtggaagcagagacatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2683 attggttcggccgtggaagcaaagtcatca 2654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 8124 - 8546
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | | || || | || ||||||||||||    
T  8124 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggta 8223  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  8224 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 8323  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||  |  | ||| ||||||||    |||||||||||     
T  8324 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgaggg 8423  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || |||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  8424 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 8523  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8524 gattggttcggccgtggaagcag 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13220 - 12798
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | | || || | || ||||||||||||    
T  13220 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggta 13121  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  13120 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 13021  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||  |  | ||| ||||||||    |||||||||||     
T  13020 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgaggg 12921  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    ||||||    || |||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  12920 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 12821  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12820 gattggttcggccgtggaagcag 12798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 3835
Alignment:
Q  4 gcccttatatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtccacatggta 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | | || || | || | ||||||||||    
T  4257 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggta 4158  T
Q  104 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  4157 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 4058  T
Q  204 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagga 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  | | |||||||||||||    |||||||||||     
T  4057 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 3958  T
Q  304 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgtatgctttggctggaggactt 403  Q
    |||| |    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  | |||||||| |||| || |    
T  3957 aatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacct 3858  T
Q  404 gattggttcggccgtggaagcag 426  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  3857 gattggtttggccttggaagcag 3835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 366
Target Start/End: Original strand, 16691628 - 16691866
Alignment:
Q  128 ggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaata 227  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||     
T  16691628 ggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattcatctaaacatg 16691727  T
Q  228 acttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaaggaaaggct 327  Q
     |||  ||||||| ||||| | ||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||  |||||||    
T  16691728 gcttagaacatcttcaagaaaggctcctttccaaaaccattggattagacattaagttaggacatgttagtgaaggaattccaataataaaacaaaggct 16691827  T
Q  328 atgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttga 366  Q
    |     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16691828 acaacaaaaaaaggttcttttgattctcgatgatgttga 16691866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 28218 - 28306
Alignment:
Q  135 caacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| | |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  28218 caacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgatgtaagggaaaattcagctaaa 28306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 43725 - 43813
Alignment:
Q  135 caacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   | | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||    
T  43725 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttcacgatgtaagggaaaattcaactaaa 43813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 35495 - 35583
Alignment:
Q  135 caacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   | | ||||||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||| |||||    
T  35495 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacgacgtaagggaaaattcatctaaa 35583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 328
Target Start/End: Original strand, 3280418 - 3280620
Alignment:
Q  126 tgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttcttggtgatcaatttgatggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaa 225  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||  ||| | ||||||||||  |  |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |    
T  3280418 tgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcagcaaaaca 3280517  T
Q  226 taacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggaaattccaatcattaaggaaagg 325  Q
    |    |  | ||||||||| || |  | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  3280518 tggtctagagcatctccaaaaggattttctttccaaaactgttggattggacattaagttaggagatagtagtgagggaattccaatcataaagcaaagg 3280617  T
Q  326 cta 328  Q
    |||    
T  3280618 cta 3280620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University